First description of Adenovirus, Enterovirus, Rotavirus and Torque teno virus in water samples collected from the Arroio Dilúvio, Porto Alegre, Brazil

Adenovirus (AdV), enterovirus (EV), genogroup A rotaviruses (GARV) and Torque teno virus (TTV) are non-enveloped viral agents excreted in feces and so may contaminate water bodies. In the present study, the molecular detection of these viruses was performed in samples of surface water collected from the Arroio Dilúvio, a waterstream that crosses the city of Porto Alegre, RS, Brazil, receiving great volumes of non-treated sewage from a large urban area. Sampling was performed during 2009, in three different occasions (January, April and September). The highest detection rate was observed for EV (64.28%), followed by TTV (28.57%) and AdV (21.43%). Rotaviruses were not detected. More than on kind of tested virus was detected in five (35. 71%) of 14 samples. January was the month with the highest viral detection rate, being all samples, collected in this month, positive for at least one group of tested virus. The correlation between the detection of these different viral agents and environmental factors is discussed. To the knowledge of the authors, this is the first description of viral genomes in water samples taken from the Arroio Dilúvio, Porto Alegre (Brazil).

Adenovírus (AdV), enterovírus (EV), rotavírus (GARV) e Torque teno vírus (TTV) são vírus não envelopados, excretados nas fezes, podendo, assim, contaminar corpos hídricos. No presente estudo, a detecção molecular desses agentes foi realizada em amostras de águas superficiais provenientes do Arroio Dilúvio, o qual cruza a cidade de Porto Alegre-RS, Brasil. As amostras foram coletadas em três meses diferentes (janeiro, abril e setembro) do ano de 2009. A maior taxa de detecção viral foi observada para EV (64,28%), seguida por TTV (28,57%) e AdV (21,43%). Rotavírus não foi detectado. Foi verificada presença simultânea de dois grupos virais em cinco (35,71%) das 14 amostras analisadas. Janeiro foi o mês com a maior taxa de detecção viral, sendo todas as amostras, coletadas nesse mês, positivas para, no mínimo, um grupo viral em estudo. A correlação entre a detecção desses diferentes agentes virais e os fatores ambientais é discutida. Conforme conhecimento dos autores, essa é a primeira descrição de genomas virais em amostras de água provenientes do Arroio Dilúvio, Porto Alegre, Brasil.

Detecção do vírus da cinomose canina por RT-PCR utilizando-se oligonucleotídeos para os genes da fosfoproteína, hemaglutinina e neuraminidase

The reverse transcription-polymerase chain reaction was used to detect canine distemper virus (CDV). Four oligonucleotide pairs were selected (P1, P2, N1, H1), based on the sequences of the phosphoprotein, hemagglutinin and nuraminidase genes for assay standardization, and three CDV vaccine strains were used as positive controls. Three viral isolates from dogs with canine distemper and four samples from animals clinically suspected of distemper were analysed. No amplification was detected in suspected samples. Results obtained by using P1 and N1 oligonucleotides were superior to those with H1 ones. P2 oligonucleotides were considered inadequate for CDV detection. Amplicons resulting from amplification of P1, N1 and H1 oligonucleotides were submitted to cleavage by restriction endonucleases and restriction patterns of viral samples were compared to that of Lederle strain used as reference. A similar restriction pattern was observed in all analysed samples.

Empregou-se a técnica de reação em cadeia pela polimerase precedida de transcrição reversa para detecção do vírus da cinomose canina (CC). Para a padronização da técnica foram selecionados quatro pares de oligonucleotídeos (P1, P2, N1, H1), baseados em seqüências dos genes da fosfoproteína, neuraminidase e hemaglutinina, sendo utilizadas três cepas vacinais de vírus da CC como controles positivos. Foram analisadas três amostras isoladas de cães com cinomose e quatro amostras provenientes de cães com suspeita clínica de cinomose. Não houve amplificação nas amostras com suspeita clínica da doença. Os resultados obtidos com os oligonucleotídeos P1 e N1 foram superiores aos de H1. Os oligonucleotídeos P2 foram considerados inapropriados para a detecção do vírus da CC. Os amplicons obtidos com os oligonucleotídeos P1, N1 e H1 foram clivados com endonucleases de restrição, sendo os perfis das amostras virais comparados aos da amostra vacinal Lederle, utilizada como referência. Um padrão similar de restrição foi observado em todas as amostras analisadas.

Soroneutralização como teste sorológico diferencial entre infecções pelo vírus da peste suína clássica e outros pestivírus

Serum neutralization tests (SN) were performed against classical swine fever virus (CSFV), bovine viral diarrhea virus (BVDV) and border disease virus (BDV) on samples of swine serum collected for screening of antibodies to CSFV, in order to determine the SN value as a differential serological test. Ninety-nine sera out of a sample of 16,664 were positive for antibodies to pestiviruses in an ELISA test which did not distinguish antibodies to different pestiviruses. When submitted to SN, 81 sera were positive for CSFV antibodies only. In 17 sera, crossreactive antibodies to either CSFV, BVDV or BDV were detected. In most of these sera (13 out of 17) the differences between SN titres against the three viruses were not sufficient to estimate which was the most likely antibody-inducing virus. It was concluded that, for the SN to be useful in such differentiation, it is essential to examine a sample which must include a representative number of sera from the same farm where suspect animals were detected. When isolated serum samples are examined, such as those obtained with the sampling strategy adopted here, the SN may give rise to inconclusive results.

Testes de soroneutralização (SN) foram realizados para detecção de anticorpos contra os vírus da peste suína clássica (VPSC), da diarréia viral bovina (VDVB) e do vírus da doença da fronteira ou "border disease" dos ovinos (VBDO) em amostras de soros suínos coletadas para triagem de anticorpos antiVPSC, com o objetivo de determinar o valor da SN como prova sorológica diferencial. Noventa e nove soros de uma amostragem de 16.664 foram positivos em um teste de ELISA policlonal, incapaz de diferenciar anticorpos induzidos contra os diferentes pestivírus. Quando submetidos à SN, 81 apresentaram anticorpos somente contra o VPSC. Dezessete soros apresentaram anticorpos com reatividade cruzada contra os VPSC, VDVB ou VBDO, e na maioria deles (13/17) as diferenças entre os títulos obtidos pela SN não permitiram inferir qual seria o vírus provável indutor dos anticorpos detectados. Concluiu-se que a prova requer cuidados ao ser usada com essa finalidade, pois quando amostras isoladas de soro são examinadas a variação entre os títulos de anticorpos pode ser insuficiente para permitir essa diferenciação, necessitando uma amostragem que inclua um número significativo de animais dentro do criatório ou da granja suspeita.