Genetic parameters for growth, reproductive, and carcass traits in Tabapuã cattle

We aimed to estimate genetic parameters for growth, reproductive, and carcass traits in Tabapuã cattle. Phenotypic data were collected between 1990 and 2019 in 1,218 farms, and the pedigree file had 340,868 animals. The traits evaluated were body weight at 120 (W120), 210 (W210), 365 (W365), and 550 (W550) days of age; age at first calving (AFC), scrotal circumference at 365 days of age (SC365), ribeye area (REA), backfat thickness (BF), and rump fat thickness (RF). The (co)variance components were estimated using the restricted maximum likelihood method, considering single and two-traits animal models. For all traits, the models considered fixed, direct additive genetic, and residual random effects. In addition, for W120 and W210, the maternal additive genetic and maternal permanent environmental effects were also included. Heritabilities for W120, W210, W365, W550, SC365, REA, BF, and RF were of moderate magnitude (0.15, 0.16, 0.23, 0.19, 0.22, 0.36, 0.31, and 0.27, respectively). Low heritability was observed for AFC (0.07). The genetic correlations between growth traits were higher than 0.90, while AFC and SC365 presented negative moderate correlation (−0.66). The REA showed low genetic correlations with BF (0.07) and RF (0.07), whereas BF and RF were highly correlated (0.77). Considering the heritability estimates, selection for AFC would result in limited genetic gain, while for the other traits, it would be satisfactory. Based on the high genetic correlations between growth traits, selection of Tabapuã animals can be performed at younger ages. Additionally, animals can be indirectly selected for AFC through SC365, and only one fat thickness trait may be used in the selection process considering the high genetic correlation and similar heritability values for BF and RF.(AU)

Impacto da distribuição de número desigual de progênies por reprodutor na avaliação genética de animais, em ambientes com presença de heterogeneidade de variância ambiental / Impact of the uneven distribution of the number of progenies by sires in the genetic evaluation of animals in environments with presence of heterogeneity of environmental variance

A progeny test representing the milk yield was simulated to evaluate the effect of heterogeneity of environmental variance on genetic evaluation of sires in situations of unequal number of progeny per sire between herds, eliminating, at random, daughters per sires in environments of low and high environmental variability. In all situations involving loss of information in the environment of lower environmental variability, there was larger overestimation of the residual variance component, resulting in lower estimates of heritability. On the other hand, the decrease in the amount of information of herds from high environmental variability led to greater overestimation of additive genetic variance and lower overestimation of environmental variance. Although there were alterations in breeding values regarding sires, Spearman and Pearson correlations between breeding values, in all situations, were higher than 0.90. The uneven number of progeny per sire in the presence of heterogeneity of environmental variance led to the overestimation of variance components and changes in absolute breeding values of the sires, without, however, changing the classification values.

Foi simulado um teste de progênie com o objetivo de avaliar o efeito da heterogeneidade de variância ambiental sobre a avaliação genética de reprodutores, em situações de número desigual de progênie por reprodutor entre rebanhos. A situação do número desigual de progênie por reprodutor foi representada eliminando-se, de forma aleatória, o número de progênies por reprodutor em ambientes de baixa e alta variabilidade ambiental. Nas situações que envolveram perda de informação no ambiente de menor variabilidade ambiental, houve maiores superestimações na estimação da variância residual, ocasionando menores estimativas de herdabilidade. Por outro lado, quando se diminuiu a quantidade de informação proveniente de rebanhos de alta variabilidade ambiental, houve maior superestimação da variância genética aditiva e menor superestimação da variância ambiental. Embora, tenham ocorrido alterações na magnitude dos valores genéticos para os reprodutores, as correlações de Spearman e Pearson entre os valores genéticos dos mesmos, em todas as situações, foram maiores do que 0,90. O número desigual de progênie por reprodutor na presença de heterogeneidade de variância ambiental provoca superestimação das estimativas de componentes de variância e valores absolutos de predição de valores genéticos dos reprodutores, sem, contudo, alterar a classificação dos mesmos.

Impacto da distribuição de número desigual de progênies por reprodutor na avaliação genética de animais, em ambientes com presença de heterogeneidade de variância ambiental / Impact of the uneven distribution of the number of progenies by sires in the genetic evaluation of animals in environments with presence of heterogeneity of environmental variance

A progeny test representing the milk yield was simulated to evaluate the effect of heterogeneity of environmental variance on genetic evaluation of sires in situations of unequal number of progeny per sire between herds, eliminating, at random, daughters per sires in environments of low and high environmental variability. In all situations involving loss of information in the environment of lower environmental variability, there was larger overestimation of the residual variance component, resulting in lower estimates of heritability. On the other hand, the decrease in the amount of information of herds from high environmental variability led to greater overestimation of additive genetic variance and lower overestimation of environmental variance. Although there were alterations in breeding values regarding sires, Spearman and Pearson correlations between breeding values, in all situations, were higher than 0.90. The uneven number of progeny per sire in the presence of heterogeneity of environmental variance led to the overestimation of variance components and changes in absolute breeding values of the sires, without, however, changing the classification values.(AU)

Foi simulado um teste de progênie com o objetivo de avaliar o efeito da heterogeneidade de variância ambiental sobre a avaliação genética de reprodutores, em situações de número desigual de progênie por reprodutor entre rebanhos. A situação do número desigual de progênie por reprodutor foi representada eliminando-se, de forma aleatória, o número de progênies por reprodutor em ambientes de baixa e alta variabilidade ambiental. Nas situações que envolveram perda de informação no ambiente de menor variabilidade ambiental, houve maiores superestimações na estimação da variância residual, ocasionando menores estimativas de herdabilidade. Por outro lado, quando se diminuiu a quantidade de informação proveniente de rebanhos de alta variabilidade ambiental, houve maior superestimação da variância genética aditiva e menor superestimação da variância ambiental. Embora, tenham ocorrido alterações na magnitude dos valores genéticos para os reprodutores, as correlações de Spearman e Pearson entre os valores genéticos dos mesmos, em todas as situações, foram maiores do que 0,90. O número desigual de progênie por reprodutor na presença de heterogeneidade de variância ambiental provoca superestimação das estimativas de componentes de variância e valores absolutos de predição de valores genéticos dos reprodutores, sem, contudo, alterar a classificação dos mesmos.(AU)

IMPACTO DA DISTRIBUIÇÃO DE NÚMERO DESIGUAL DE PROGÊNIES POR REPRODUTOR NA AVALIAÇÃO GENÉTICA DE ANIMAIS, EM AMBIENTES COM PRESENÇA DE HETEROGENEIDADE DE VARIÂNCIA AMBIENTAL

Abstract A progeny test representing the milk yield was simulated to evaluate the effect of heterogeneity of environmental variance on genetic evaluation of sires in situations of unequal number of progeny per sire between herds, eliminating, at random, daughters per sires in environments of low and high environmental variability. In all situations involving loss of information in the environment of lower environmental variability, there was larger overestimation of the residual variance component, resulting in lower estimates of heritability. On the other hand, the decrease in the amount of information of herds from high environmental variability led to greater overestimation of additive genetic variance and lower overestimation of environmental variance. Although there were alterations in breeding values regarding sires, Spearman and Pearson correlations between breeding values, in all situations, were higher than 0.90. The uneven number of progeny per sire in the presence of heterogeneity of environmental variance led to the overestimation of variance components and changes in absolute breeding values of the sires, without, however, changing the classification values.

Resumo Foi simulado um teste de progênie com o objetivo de avaliar o efeito da heterogeneidade de variância ambiental sobre a avaliação genética de reprodutores, em situações de número desigual de progênie por reprodutor entre rebanhos. A situação do número desigual de progênie por reprodutor foi representada eliminando-se, de forma aleatória, o número de progênies por reprodutor em ambientes de baixa e alta variabilidade ambiental. Nas situações que envolveram perda de informação no ambiente de menor variabilidade ambiental, houve maiores superestimações na estimação da variância residual, ocasionando menores estimativas de herdabilidade. Por outro lado, quando se diminuiu a quantidade de informação proveniente de rebanhos de alta variabilidade ambiental, houve maior superestimação da variância genética aditiva e menor superestimação da variância ambiental. Embora tenham ocorrido alterações na magnitude dos valores genéticos para os reprodutores, as correlações de Spearman e Pearson entre os valores genéticos dos mesmos, em todas as situaçãoes, foram maiores do que 0,90. O número desigual de progênie por reprodutor na presença de heterogeneidade de variância ambiental provoca superestimação das estimativas de componentes de variância e valores absolutos de predição de valores genéticos dos reprodutores, sem, contudo, alterar a classificação dos mesmos.