HERBase: A collection of understorey herb vegetation plots from Amazonia / HERBase: Uma coleção de parcelas de ervas de sub-bosque da Amazônia

Understorey herbs form a diverse and understudied plant assemblage in tropical forests. Although several studies and research teams have long been dedicated to the study of this conspicuous vegetation component in Amazonia, no effort to unify the data has been undertaken to date. In contrast to trees and other life forms for which major data compilations already exist, a unified database dedicated to herbs is still lacking. Part of the problem is in defining what is a herb and how to effectively sample herb assemblages. In this article, we describe the database HERBase, an exhaustive compilation of published and unpublished data on herb inventories in Amazonia. We also describe the structure, functioning, and guidelines for data curation and integration in HERBase. We were able to compile information from 1381 plots from all six Amazonian geographic regions. Based on this dataset, we describe and discuss sampling and knowledge gaps, priority areas for new collections, and recommend sampling protocols to facilitate data integration in the future. This novel database provides a unique biodiversity data repository on understorey herbs that will enable new studies on community ecology and biogeography.(AU)

As ervas do sub-bosque formam um componente diversificado e pouco estudado em florestas tropicais. Embora vários estudos e grupos de pesquisa tenham se dedicado ao estudo desse componente conspícuo na Amazônia, nenhum esforço foi feito até o momento para unificar essas informações. Em contraste com árvores e outros grupos de plantas para os quais já existem grandes compilações de dados, uma base de dados unificada dedicada às ervas ainda não existe. Parte do problema está em definir o que é uma erva e como amostrar comunidados de ervas de forma eficiente. Neste artigo descrevemos a base de dados HERBase, uma compilação exaustiva de dados publicados e não publicados sobre inventários de ervas na Amazônia. Também descrevemos a estrutura, funcionamento e diretrizes para curadoria e integração de dados na HERBase. Conseguimos compilar informações de 1381 parcelas de todas as seis regiões geográficas amazônicas. Com base nesses dados, descrevemos e discutimos lacunas de amostragem e conhecimento, apontamos áreas prioritárias para novas coletas e recomendamos protocolos de amostragem para facilitar a integração de dados no futuro. Essa nova base de dados fornece dados únicos de biodiversidade sobre ervas do sub-bosque que permitirão novos estudos sobre ecologia e biogeografia de comunidades.(AU)

Diversity and habitat preference of medium and large-sized mammals in an urban forest fragment of southwestern Amazon / Diversidade e preferência de habitat de uma comunidade de mamíferos de medio e grande porte num fragmento florestal urbano na Amazônia Sul-Ocidental

We assessed the species composition and abundance of medium and large-sized mammals in an urban forest fragment in the Brazilian Amazon, and recorded the preference of some species for particular phytophysiognomies. We placed nine transects with 20 sand plots each in three phytophysiognomies: open rainforest with a dominance of bamboos (OFB), open rainforest with palm trees (OFP), and dense rainforest (DF). We calculated species abundance as the number of records/plot.day, in a total of 2,700 plots.day. We recorded twelve mammal species; Sylvilagus brasiliensis (Linnaeus, 1758) and Dasyprocta fuliginosa (Wagler, 1831) were the most abundant. The results differed among phytophysiognomies: DF presented the highest mammal diversity, whereas the species composition of OFP was less similar than that of other phytophysiognomies. Rodents showed higher preference for OFP and Sylvilagus brasiliensis was more abundant in OFB. The study area showed high species richness, with the occurrence of mesopredators, but there was a predominance of common species adaptable to disturbed environments, which reflects the severe isolation degree of the forest fragment and the hunting pressure that is still present.(AU)

Nós avaliamos a composição e abundância de mamíferos de médio e grande porte em um fragmento florestal urbano na Amazônia brasileira, além de registrar a preferência de habitat de algumas espécies a determinadas fitofisionomias. Nove transectos com 20 parcelas de areia cada foram dispostas de forma igualitária em três fitofisionomias: Floresta Ombrófila Aberta com Bambu Dominante (FAB), Floresta Ombrófila Aberta com Palmeira (FAP) e Floresta Ombrófila Densa (FD). A abundância das espécies foi obtida pelo numero de registros da espécie/parcelas.dia, totalizando 2700 parcelas.dia. Doze espécies de mamíferos foram registradas, sendo Sylvilagus brasiliensis (Linnaeus, 1758) e Dasyprocta fuliginosa (Wagler, 1831) as mais abundantes. Nossos resultados apresentaram diferenciação em termos de espécies para as fitofisionomias: a FD apresentou maior diversidade de mamíferos, enquanto a composição de espécies da FAP apresentou maior dissimilaridade com relação às demais. Os roedores tiveram maior preferência pela FAP e Sylvilagus brasiliensis apresentou maior abundância na FAB. A área apresentou riqueza de espécies relevante, com a ocorrência de mesopredadores, mas há o predomínio de espécies comuns e adaptáveis a ambientes perturbados, refletindo o acentuado grau de isolamento do fragmento florestal e a pressão de caça ainda existente.(AU)

Diversity and habitat preference of medium and large-sized mammals in an urban forest fragment of southwestern Amazon / Diversidade e preferência de habitat de uma comunidade de mamíferos de medio e grande porte num fragmento florestal urbano na Amazônia Sul-Ocidental

We assessed the species composition and abundance of medium and large-sized mammals in an urban forest fragment in the Brazilian Amazon, and recorded the preference of some species for particular phytophysiognomies. We placed nine transects with 20 sand plots each in three phytophysiognomies: open rainforest with a dominance of bamboos (OFB), open rainforest with palm trees (OFP), and dense rainforest (DF). We calculated species abundance as the number of records/plot.day, in a total of 2,700 plots.day. We recorded twelve mammal species; Sylvilagus brasiliensis (Linnaeus, 1758) and Dasyprocta fuliginosa (Wagler, 1831) were the most abundant. The results differed among phytophysiognomies: DF presented the highest mammal diversity, whereas the species composition of OFP was less similar than that of other phytophysiognomies. Rodents showed higher preference for OFP and Sylvilagus brasiliensis was more abundant in OFB. The study area showed high species richness, with the occurrence of mesopredators, but there was a predominance of common species adaptable to disturbed environments, which reflects the severe isolation degree of the forest fragment and the hunting pressure that is still present.

Nós avaliamos a composição e abundância de mamíferos de médio e grande porte em um fragmento florestal urbano na Amazônia brasileira, além de registrar a preferência de habitat de algumas espécies a determinadas fitofisionomias. Nove transectos com 20 parcelas de areia cada foram dispostas de forma igualitária em três fitofisionomias: Floresta Ombrófila Aberta com Bambu Dominante (FAB), Floresta Ombrófila Aberta com Palmeira (FAP) e Floresta Ombrófila Densa (FD). A abundância das espécies foi obtida pelo numero de registros da espécie/parcelas.dia, totalizando 2700 parcelas.dia. Doze espécies de mamíferos foram registradas, sendo Sylvilagus brasiliensis (Linnaeus, 1758) e Dasyprocta fuliginosa (Wagler, 1831) as mais abundantes. Nossos resultados apresentaram diferenciação em termos de espécies para as fitofisionomias: a FD apresentou maior diversidade de mamíferos, enquanto a composição de espécies da FAP apresentou maior dissimilaridade com relação às demais. Os roedores tiveram maior preferência pela FAP e Sylvilagus brasiliensis apresentou maior abundância na FAB. A área apresentou riqueza de espécies relevante, com a ocorrência de mesopredadores, mas há o predomínio de espécies comuns e adaptáveis a ambientes perturbados, refletindo o acentuado grau de isolamento do fragmento florestal e a pressão de caça ainda existente.

Manejo da adubação e seus efeitos na ocorrência de algas e na produtividade de arroz irrigado em áreas com residual de imidazolinonas

Several rice producing areas where soil residuals of imidazolinone herbicides are present have shown the development of algae blooms, which, depending on density, may affect rice plant development. This study aimed to evaluate the effects of different fertilizer management systems on the composition and structure of algae communities and also on rice yield in irrigated areas with imidazolinone soil residuals. The experiment was carried out in the crop year of 2008/09, at the Federal University of Santa Maria, where a field had been treated with imazethapyr + imazapic (120+40g i.a. ha-1) in the crop year 2 of 2007/08. The treatments included two different fertilizer management systems and two rice cultivars. The 'IRGA 417' showed greater phytotoxicity, but in the same way as the fertilizer managements, it did not affect rice productivity or the development of algae. Thus, the two fertilizer management systems tested and also the phytotoxicity of rice plants did not cause changes on the development of planktonic and periphytic algae, neither did it affect the yield of rice cultivars 'IRGA 422 CL' and 'IRGA 417'.

Em determinadas áreas de arroz, ocorre o desenvolvimento de algas que, dependendo da quantidade e associadas com presença de residual no solo de herbicidas do grupo das imidazolinonas, afetam o desenvolvimento do arroz na fase inicial. O objetivo do trabalho foi avaliar manejos da adubação de arroz na composição e estrutura das comunidades de algas e na produtividade de arroz irrigado em áreas com residual de herbicidas do grupo das imidazolinonas. O experimento foi conduzido na safra 2008/09, na Universidade Federal de Santa Maria, onde havia sido aplicado imazethapyr + imazapic na dose de (120+40g i.a. ha-1), na safra 2007/08. Os tratamentos foram compostos por manejos de adubação e duas cultivares de arroz irrigado. A cultivar 'IRGA 417' apresentou maior fitotoxicidade, mas, da mesma forma que os manejos de adubação, esta não interferiu na produtividade de grãos e no desenvolvimento de algas. Os manejos de adubação utilizados e a fitotoxicidade de plantas não influenciam no desenvolvimento de microalgas no fitoplâncton e no perifíton, bem como na produtividade das cultivares de arroz irrigado 'IRGA 422 CL' e 'IRGA 417'.

Manejo da adubação e seus efeitos na ocorrência de algas e na produtividade de arroz irrigado em áreas com residual de imidazolinonas

Several rice producing areas where soil residuals of imidazolinone herbicides are present have shown the development of algae blooms, which, depending on density, may affect rice plant development. This study aimed to evaluate the effects of different fertilizer management systems on the composition and structure of algae communities and also on rice yield in irrigated areas with imidazolinone soil residuals. The experiment was carried out in the crop year of 2008/09, at the Federal University of Santa Maria, where a field had been treated with imazethapyr + imazapic (120+40g i.a. ha-1) in the crop year 2 of 2007/08. The treatments included two different fertilizer management systems and two rice cultivars. The 'IRGA 417' showed greater phytotoxicity, but in the same way as the fertilizer managements, it did not affect rice productivity or the development of algae. Thus, the two fertilizer management systems tested and also the phytotoxicity of rice plants did not cause changes on the development of planktonic and periphytic algae, neither did it affect the yield of rice cultivars 'IRGA 422 CL' and 'IRGA 417'.

Em determinadas áreas de arroz, ocorre o desenvolvimento de algas que, dependendo da quantidade e associadas com presença de residual no solo de herbicidas do grupo das imidazolinonas, afetam o desenvolvimento do arroz na fase inicial. O objetivo do trabalho foi avaliar manejos da adubação de arroz na composição e estrutura das comunidades de algas e na produtividade de arroz irrigado em áreas com residual de herbicidas do grupo das imidazolinonas. O experimento foi conduzido na safra 2008/09, na Universidade Federal de Santa Maria, onde havia sido aplicado imazethapyr + imazapic na dose de (120+40g i.a. ha-1), na safra 2007/08. Os tratamentos foram compostos por manejos de adubação e duas cultivares de arroz irrigado. A cultivar 'IRGA 417' apresentou maior fitotoxicidade, mas, da mesma forma que os manejos de adubação, esta não interferiu na produtividade de grãos e no desenvolvimento de algas. Os manejos de adubação utilizados e a fitotoxicidade de plantas não influenciam no desenvolvimento de microalgas no fitoplâncton e no perifíton, bem como na produtividade das cultivares de arroz irrigado 'IRGA 422 CL' e 'IRGA 417'.