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1.
Braz. j. biol ; 83: 1-7, 2023. tab, ilus, map
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1468880

Resumo

The present study reports the existence of cliff racer, Platyceps rhodorachis from the plains of Punjab, Pakistan. A total of 10 specimens were captured during the field surveys from June to September, 2018 from different sites of Punjab. Platyceps rhodorachis was identify on the basis of morphology and confirmed through COI gene sequences. The obtained DNA sequences have shown reliable and exact species identification. Newly produced DNA sequences of Platyceps rhodorachis were submitted to GenBank and accession numbers were obtained (MK936174.1, MK941839.1 and MT790210.1). N-J tree based on COI sequences of Platyceps rhodorachis clearly separated as out-group with other members of family Colubridae based on p-distance. The intra-specific genetic variation ranges from 12% to 18%. The DNA sequences of Platyceps rhodorachis kashmirensis, Platyceps rhodorachis ladacensis, Platyceps ventromaculatus, Platyceps ventromaculatus bengalensis and Platyceps ventromaculatus indusai are not available at NCBI to validate their taxonomic positions. In our recommendations, a large scale molecular based identification of Pakistan’s herpetofauna is required to report more new or subspecies from country.


O presente estudo relata a existência de um corredor de penhasco, Platyceps rhodorachis, das planícies de Punjab, Paquistão. Um total de 10 espécimes foi capturado durante os levantamentos de campo de junho a setembro de 2018 em diferentes locais de Punjab. Platyceps rhodorachis foi identificada com base na morfologia e confirmada por meio de sequências do gene COI. As sequências de DNA obtidas mostraram identificação de espécies confiável e exata. Sequências de DNA de Platyceps rhodorachis recém-produzidas foram submetidas ao GenBank e os números de acesso foram obtidos (MK936174.1, MK941839.1 e MT790210.1). Árvore N-J baseada em sequências COI de Platyceps rhodorachis claramente separadas como out-group com outros membros da família Colubridae com base na distância-p. A variação genética intraespecífica varia de 12% a 18%. As sequências de DNA de Platyceps rhodorachis kashmirensis, Platyceps rhodorachis ladacensis, Platyceps ventromaculatus, Platyceps ventromaculatus bengalensis e Platyceps ventromaculatus indusai não estão disponíveis no NCBI para validar suas posições taxonômicas. Em nossas recomendações, uma identificação de base molecular em grande escala da herpetofauna do Paquistão é necessária para relatar mais novas ou subespécies do país.


Assuntos
Animais , Serpentes/anatomia & histologia , Serpentes/genética
2.
Braz. j. biol ; 832023.
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1469096

Resumo

Abstract The present study reports the existence of cliff racer, Platyceps rhodorachis from the plains of Punjab, Pakistan. A total of 10 specimens were captured during the field surveys from June to September, 2018 from different sites of Punjab. Platyceps rhodorachis was identify on the basis of morphology and confirmed through COI gene sequences. The obtained DNA sequences have shown reliable and exact species identification. Newly produced DNA sequences of Platyceps rhodorachis were submitted to GenBank and accession numbers were obtained (MK936174.1, MK941839.1 and MT790210.1). N-J tree based on COI sequences of Platyceps rhodorachis clearly separated as out-group with other members of family Colubridae based on p-distance. The intra-specific genetic variation ranges from 12% to 18%. The DNA sequences of Platyceps rhodorachis kashmirensis, Platyceps rhodorachis ladacensis, Platyceps ventromaculatus, Platyceps ventromaculatus bengalensis and Platyceps ventromaculatus indusai are not available at NCBI to validate their taxonomic positions. In our recommendations, a large scale molecular based identification of Pakistans herpetofauna is required to report more new or subspecies from country.


Resumo O presente estudo relata a existência de um corredor de penhasco, Platyceps rhodorachis, das planícies de Punjab, Paquistão. Um total de 10 espécimes foi capturado durante os levantamentos de campo de junho a setembro de 2018 em diferentes locais de Punjab. Platyceps rhodorachis foi identificada com base na morfologia e confirmada por meio de sequências do gene COI. As sequências de DNA obtidas mostraram identificação de espécies confiável e exata. Sequências de DNA de Platyceps rhodorachis recém-produzidas foram submetidas ao GenBank e os números de acesso foram obtidos (MK936174.1, MK941839.1 e MT790210.1). Árvore N-J baseada em sequências COI de Platyceps rhodorachis claramente separadas como out-group com outros membros da família Colubridae com base na distância-p. A variação genética intraespecífica varia de 12% a 18%. As sequências de DNA de Platyceps rhodorachis kashmirensis, Platyceps rhodorachis ladacensis, Platyceps ventromaculatus, Platyceps ventromaculatus bengalensis e Platyceps ventromaculatus indusai não estão disponíveis no NCBI para validar suas posições taxonômicas. Em nossas recomendações, uma identificação de base molecular em grande escala da herpetofauna do Paquistão é necessária para relatar mais novas ou subespécies do país.

3.
Braz. J. Biol. ; 83: 1-7, 2023. tab, ilus, mapas
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-765457

Resumo

The present study reports the existence of cliff racer, Platyceps rhodorachis from the plains of Punjab, Pakistan. A total of 10 specimens were captured during the field surveys from June to September, 2018 from different sites of Punjab. Platyceps rhodorachis was identify on the basis of morphology and confirmed through COI gene sequences. The obtained DNA sequences have shown reliable and exact species identification. Newly produced DNA sequences of Platyceps rhodorachis were submitted to GenBank and accession numbers were obtained (MK936174.1, MK941839.1 and MT790210.1). N-J tree based on COI sequences of Platyceps rhodorachis clearly separated as out-group with other members of family Colubridae based on p-distance. The intra-specific genetic variation ranges from 12% to 18%. The DNA sequences of Platyceps rhodorachis kashmirensis, Platyceps rhodorachis ladacensis, Platyceps ventromaculatus, Platyceps ventromaculatus bengalensis and Platyceps ventromaculatus indusai are not available at NCBI to validate their taxonomic positions. In our recommendations, a large scale molecular based identification of Pakistans herpetofauna is required to report more new or subspecies from country.(AU)


O presente estudo relata a existência de um corredor de penhasco, Platyceps rhodorachis, das planícies de Punjab, Paquistão. Um total de 10 espécimes foi capturado durante os levantamentos de campo de junho a setembro de 2018 em diferentes locais de Punjab. Platyceps rhodorachis foi identificada com base na morfologia e confirmada por meio de sequências do gene COI. As sequências de DNA obtidas mostraram identificação de espécies confiável e exata. Sequências de DNA de Platyceps rhodorachis recém-produzidas foram submetidas ao GenBank e os números de acesso foram obtidos (MK936174.1, MK941839.1 e MT790210.1). Árvore N-J baseada em sequências COI de Platyceps rhodorachis claramente separadas como out-group com outros membros da família Colubridae com base na distância-p. A variação genética intraespecífica varia de 12% a 18%. As sequências de DNA de Platyceps rhodorachis kashmirensis, Platyceps rhodorachis ladacensis, Platyceps ventromaculatus, Platyceps ventromaculatus bengalensis e Platyceps ventromaculatus indusai não estão disponíveis no NCBI para validar suas posições taxonômicas. Em nossas recomendações, uma identificação de base molecular em grande escala da herpetofauna do Paquistão é necessária para relatar mais novas ou subespécies do país.(AU)


Assuntos
Animais , Serpentes/anatomia & histologia , Serpentes/genética
4.
Acta amaz ; 52(1): 29-37, 2022. mapas, graf, tab, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1437364

Resumo

We explored a 320-km transect in the Tumucumaque mountain range along the border between southern French Guiana and Brazil, sampling all trees and lianas with DBH ≥ 10 cm in seven 25 x 25-m plots installed near seven boundary milestones. We isolated DNA from cambium tissue and sequenced two DNA barcodes (rbcLa and matK) to aid in species identification. We also collected fertile herbarium specimens from other species (trees/shrubs/herbs) inside and outside the plots. The selected DNA barcodes were useful at the family level but failed to identify specimens at the species level. Based on DNA barcoding identification, the most abundant families in the plots were Burseraceae, Fabaceae, Meliaceae, Moraceae, Myristicaceae and Sapotaceae. One third of the images of sampled plants posted on the iNaturalist website were identified by the community to species level. New approaches, including the sequencing of the ITS region and fast evolving DNA plastid regions, remain to be tested for their utility in the identification of specimens at lower taxonomic levels in floristic inventories in the Amazon region.(AU)


Um transecto de 320 km foi explorado na Serra do Tumucumaque, ao longo da fronteira entre o sul da Guiana Francesa e o Brasil por meio da amostragem de todas as árvores e lianas com DAP ≥ 10 cm em sete parcelas de 25 x 25 m instaladas perto de sete marcos fronteiriços. Isolamos DNA de tecido cambial e sequenciamos dois códigos de barra de DNA (rbcLa e matK) para auxiliar na identificação das espécies. Também coletamos espécimes de herbário férteis de outras espécies (árvores/arbustos/ervas) dentro e fora das parcelas. Os códigos de barra de DNA selecionados foram úteis em nível de família, mas não conseguiram identificar espécimes em nível de espécie. Com base na identificação de DNA barcoding, as famílias mais abundantes nas parcelas foram Burseraceae, Fabaceae, Meliaceae, Moraceae, Myristicaceae e Sapotaceae. Um terço das imagens de plantas amostradas postadas no website iNaturalist foram identificadas em nível de espécie. Novas abordagens, incluindo o sequenciamento da região ITS e regiões de DNA plastidial de rápida evolução, ainda precisam ser testadas quanto à sua utilidade na identificação de espécimes até níveis taxonômicos mais baixos em inventários florísticos na região amazônica.(AU)


Assuntos
Árvores/genética , Ecossistema Amazônico , Brasil , Código de Barras de DNA Taxonômico/métodos , Guiana Francesa
5.
Braz. j. biol ; 81(2): 258-267, 2021. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1153355

Resumo

The ichthyofauna diversity of the Jebba Hydroelectric Power (HEP) Dam, Jebba, North-central Nigeria was studied. Fishes were sampled for 24 months using gill net, hook and line, and cast net. Individuals were identified using morphological and molecular (mitochondrial Cytochrome c Oxidase subunit I) data. A total of 9605 freshwater fishes were recorded during the sampling period. The use of an integrative taxonomic approach enabled the identification of 83 species belonging to 42 genera. Additionally, the study recorded three unidentified species ­ Ctenopoma sp, Malapterurus sp., and Protopterus sp. Analyses showed that individuals belonging to families Cichlidae and Mochokidae dominated the dam. The diversity analyses revealed relatively high fish diversity during the rainy season at the downstream section of Jebba HEP dam compared to the upstream section. The study, therefore, showed the presence of a diverse fish community comprising high species richness and diversity across the Jebba HEP dam. Finally, we recommend proper biodiversity monitoring and assessment of freshwater fish diversity across Nigeria. In addition, the use of an integrated taxonomic approach is recommended for appropriate species' identification and studies of freshwater fishes from Nigeria.


A diversidade da ictiofauna da hidrelétrica de Jebba (HEP), Jebba, centro-norte da Nigéria foi estudada. Os peixes foram amostrados por 24 meses, utilizando rede de emalhar, anzol e linha, e rede de arrasto. Os indivíduos foram identificados usando a abordagem combinada morfológica e molecular (citocromo c Oxidase mitocondrial subunidade I). Um total de 9605 peixes de água doce foram registrados durante o período de amostragem. A identificação das espécies utilizando a abordagem taxonômica integrada possibilitou a identificação de 83 espécies pertencentes a 42 gêneros. Além disso, o estudo registrou três espécies não identificadas - Ctenopoma sp, Malapterurus sp e Protopterus sp. Análises mostraram que indivíduos pertencentes às famílias Cichlidae e Mochokidae dominaram a barragem. As análises dos índices de diversidade revelaram uma diversidade de peixes relativamente alta durante a estação chuvosa na seção a jusante da barragem Jebba HEP em comparação com a seção a montante. O estudo mostrou, portanto, a presença de diversas comunidades de peixes, que incluem alta riqueza e diversidade de espécies através da barragem Jebba HEP. Finalmente, recomendamos o monitoramento adequado da biodiversidade e a avaliação da diversidade de peixes de água doce em toda a Nigéria. Além disso, recomenda-se o uso de abordagem taxonômica integrada para a identificação adequada das espécies e estudos de peixes de água doce da Nigéria.


Assuntos
Humanos , Animais , Peixes-Gato/genética , Código de Barras de DNA Taxonômico/veterinária , Peixes , Estações do Ano , Centrais Hidrelétricas , Biodiversidade , Água Doce , Nigéria
6.
Braz. J. Biol. ; 81(2): 258-267, Mar.-May 2021. mapas, tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-762742

Resumo

The ichthyofauna diversity of the Jebba Hydroelectric Power (HEP) Dam, Jebba, North-central Nigeria was studied. Fishes were sampled for 24 months using gill net, hook and line, and cast net. Individuals were identified using morphological and molecular (mitochondrial Cytochrome c Oxidase subunit I) data. A total of 9605 freshwater fishes were recorded during the sampling period. The use of an integrative taxonomic approach enabled the identification of 83 species belonging to 42 genera. Additionally, the study recorded three unidentified species Ctenopoma sp, Malapterurus sp., and Protopterus sp. Analyses showed that individuals belonging to families Cichlidae and Mochokidae dominated the dam. The diversity analyses revealed relatively high fish diversity during the rainy season at the downstream section of Jebba HEP dam compared to the upstream section. The study, therefore, showed the presence of a diverse fish community comprising high species richness and diversity across the Jebba HEP dam. Finally, we recommend proper biodiversity monitoring and assessment of freshwater fish diversity across Nigeria. In addition, the use of an integrated taxonomic approach is recommended for appropriate species identification and studies of freshwater fishes from Nigeria.(AU)


A diversidade da ictiofauna da hidrelétrica de Jebba (HEP), Jebba, centro-norte da Nigéria foi estudada. Os peixes foram amostrados por 24 meses, utilizando rede de emalhar, anzol e linha, e rede de arrasto. Os indivíduos foram identificados usando a abordagem combinada morfológica e molecular (citocromo c Oxidase mitocondrial subunidade I). Um total de 9605 peixes de água doce foram registrados durante o período de amostragem. A identificação das espécies utilizando a abordagem taxonômica integrada possibilitou a identificação de 83 espécies pertencentes a 42 gêneros. Além disso, o estudo registrou três espécies não identificadas - Ctenopoma sp, Malapterurus sp e Protopterus sp. Análises mostraram que indivíduos pertencentes às famílias Cichlidae e Mochokidae dominaram a barragem. As análises dos índices de diversidade revelaram uma diversidade de peixes relativamente alta durante a estação chuvosa na seção a jusante da barragem Jebba HEP em comparação com a seção a montante. O estudo mostrou, portanto, a presença de diversas comunidades de peixes, que incluem alta riqueza e diversidade de espécies através da barragem Jebba HEP. Finalmente, recomendamos o monitoramento adequado da biodiversidade e a avaliação da diversidade de peixes de água doce em toda a Nigéria. Além disso, recomenda-se o uso de abordagem taxonômica integrada para a identificação adequada das espécies e estudos de peixes de água doce da Nigéria.(AU)


Assuntos
Animais , Biodiversidade , Barragens , Centrais Hidrelétricas , Peixes/classificação , Nigéria
7.
Neotrop. ichthyol ; 19(1): e200102, 2021. tab, graf, ilus, mapas
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1154969

Resumo

A new species of Hyphessobrycon belonging to the Hyphessobrycon heterorhabdus species-group from the lower rio Tapajós, state of Pará, Brazil, is described. The new species is allocated into the Hyphessobrycon heterorhabdus species-group due to its color pattern, composed by an anteriorly well-defined, horizontally elongated humeral blotch that becomes diffuse and blurred posteriorly, where it overlaps with a conspicuous midlateral dark stripe that becomes blurred towards the caudal peduncle and the presence, in living specimens, of a tricolored longitudinal pattern composed by a dorsal red or reddish longitudinal stripe, a middle iridescent, golden or silvery longitudinal stripe, and a more ventrally-lying longitudinal dark pattern composed by the humeral blotch and dark midlateral stripe. It can be distinguished from all other species of the group by possessing humeral blotch with a straight or slightly rounded ventral profile, lacking a ventral expansion present in all other species of the group. The new species is also distinguished from Hyphessobrycon heterorhabdus by a 9.6% genetic distance in the cytochrome c oxidase I gene. The little morphological distinction of the new species when compared with its most similar congener, H. heterorhabdus, indicates that the new species is one of the first truly cryptic fish species described from the Amazon basin.(AU)


Uma nova espécie de Hyphessobrycon pertencente ao grupo Hyphessobrycon heterorhabdus é descrita da região do baixo rio Tapajós, estado do Pará, Brasil. A nova espécie é incluída no grupo Hyphessobrycon heterorhabdus devido ao seu padrão de coloração, composto por uma mancha umeral alongada, anteriormente bem definida, que se torna difusa e borrada posteriormente, onde se sobrepõe a uma conspícua faixa escura médio-lateral que se torna borrada próxima ao pedúnculo caudal, e pela presença, em exemplares vivos, de um padrão longitudinal tricolor, composto por uma faixa longitudinal vermelha ou avermelhada dorsal, uma faixa média iridescente dourada ou prateada e, mais ventralmente, o padrão longitudinal escuro composto pela faixa escura médio-lateral e mancha umeral. A espécie pode ser distinguida das outras espécies pertencentes ao grupo por possuir uma mancha umeral com região ventral retilínea ou levemente arredondada, sem uma expansão ventral presente nas demais espécies do grupo. A espécie também se diferencia de Hyphessobrycon heterorhabdus por uma distância genética de 9,6% no gene citocromo c oxidase I. A sutil diferença morfológica da nova espécie quando comparada ao seu congênere mais similar, H. heterorhabdus, indica que a nova espécie é uma das primeiras espécies de peixes verdadeiramente crípticas descritas da Bacia Amazônica.(AU)


Assuntos
Animais , DNA , Citocromos c , Biodiversidade , Characidae , Ecossistema Amazônico
8.
Neotrop. ichthyol ; 19(1): e200102, 2021. tab, graf, ilus, mapas
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-31552

Resumo

A new species of Hyphessobrycon belonging to the Hyphessobrycon heterorhabdus species-group from the lower rio Tapajós, state of Pará, Brazil, is described. The new species is allocated into the Hyphessobrycon heterorhabdus species-group due to its color pattern, composed by an anteriorly well-defined, horizontally elongated humeral blotch that becomes diffuse and blurred posteriorly, where it overlaps with a conspicuous midlateral dark stripe that becomes blurred towards the caudal peduncle and the presence, in living specimens, of a tricolored longitudinal pattern composed by a dorsal red or reddish longitudinal stripe, a middle iridescent, golden or silvery longitudinal stripe, and a more ventrally-lying longitudinal dark pattern composed by the humeral blotch and dark midlateral stripe. It can be distinguished from all other species of the group by possessing humeral blotch with a straight or slightly rounded ventral profile, lacking a ventral expansion present in all other species of the group. The new species is also distinguished from Hyphessobrycon heterorhabdus by a 9.6% genetic distance in the cytochrome c oxidase I gene. The little morphological distinction of the new species when compared with its most similar congener, H. heterorhabdus, indicates that the new species is one of the first truly cryptic fish species described from the Amazon basin.(AU)


Uma nova espécie de Hyphessobrycon pertencente ao grupo Hyphessobrycon heterorhabdus é descrita da região do baixo rio Tapajós, estado do Pará, Brasil. A nova espécie é incluída no grupo Hyphessobrycon heterorhabdus devido ao seu padrão de coloração, composto por uma mancha umeral alongada, anteriormente bem definida, que se torna difusa e borrada posteriormente, onde se sobrepõe a uma conspícua faixa escura médio-lateral que se torna borrada próxima ao pedúnculo caudal, e pela presença, em exemplares vivos, de um padrão longitudinal tricolor, composto por uma faixa longitudinal vermelha ou avermelhada dorsal, uma faixa média iridescente dourada ou prateada e, mais ventralmente, o padrão longitudinal escuro composto pela faixa escura médio-lateral e mancha umeral. A espécie pode ser distinguida das outras espécies pertencentes ao grupo por possuir uma mancha umeral com região ventral retilínea ou levemente arredondada, sem uma expansão ventral presente nas demais espécies do grupo. A espécie também se diferencia de Hyphessobrycon heterorhabdus por uma distância genética de 9,6% no gene citocromo c oxidase I. A sutil diferença morfológica da nova espécie quando comparada ao seu congênere mais similar, H. heterorhabdus, indica que a nova espécie é uma das primeiras espécies de peixes verdadeiramente crípticas descritas da Bacia Amazônica.(AU)


Assuntos
Animais , DNA , Citocromos c , Biodiversidade , Characidae , Ecossistema Amazônico
9.
Neotrop. ichthyol ; 19(4)2021.
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1485610

Resumo

ABSTRACT A good taxonomic assessment of specimens is an essential task to many biological studies and DNA data have provided additional sources of information to assist in the disentanglement of taxonomic problems among living organisms, as has been the case of some taxa of the megadiverse Neotropical ichthyofauna. Here we assessed all valid species in the Neotropical freshwater fish genera Anodus, Argonectes, Bivibranchia and Micromischodus of the family Hemiodontidae to establish molecular species boundaries among them. All species delimitation methods defined exactly only one MOTU for Anodus elongatus, Argonectes longiceps, A. robertsi, Bivibranchia bimaculata, B. notata, B. velox, and Micromischodus sugillatus, resulting in total congruence between nominal species and MOTUs for these seven taxa. The three species having discordant results across analyses: Anodus orinocensis, Bivibranchia fowleri, and Bivibranchia simulata, matched more than one MOTU per species in some methods, meaning that cryptic diversity may exist within these taxa. Overall, this great correspondence among morphological and molecular boundaries for thae species analysed seem to be indicative of a reasonably stable taxonomy within these Hemiodontidae genera.


RESUMO Uma avaliação taxonômica adequada dos espécimes é uma tarefa essencial para muitos estudos biológicos, e os dados de DNA têm fornecido fontes adicionais de informações para auxiliar no desemaranhamento de muitos grupos taxonômicos, como tem sido o caso de alguns táxons da megadiversa ictiofauna Neotropical. Aqui examinamos todas as espécies válidas dos gêneros de peixes Neotropicais de água doce Anodus, Argonectes, Bivibranchia e Micromischodus (família Hemiodontidae) para estabelecer limites moleculares entre elas. Todos os métodos de delimitação definiram exatamente apenas uma MOTU para Anodus elongatus, Argonectes longiceps, A. robertsi, Bivibranchia bimaculata, B. notata, B. velox e Micromischodus sugillatus, resultando em congruência total entre espécies nominais e MOTUs para estes sete táxons. As três espécies com resultados divergentes entre as análises, a saber, Anodus orinocensis, Bivibranchia fowleri e Bivibranchia simulata, corresponderam a mais de um MOTU por espécie em alguns métodos, mostrando que pode existir uma diversidade críptica dentro desses taxa. No geral, esta grande correspondência entre os limites morfológicos e moleculares para as espécies analisadas parece indicar uma taxonomia relativamente estável para esses gêneros de Hemiodontidae.

10.
Acta amaz ; 51(2)jun. 2021.
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1455400

Resumo

ABSTRACT DNA barcoding proposes that a fragment of DNA can be used to identify species. In fish, a fragment of cytochrome oxidase subunit I (COI) has been effective in many studies with different foci. Here we use this molecular tool to provide new insights into the cryptic diversity found in the Hoplias malabaricus species complex. Popularly known as trahira, H. malabaricus is widely distributed in South America. The clade shows molecular and cytogenetic diversity, and several studies have supported the occurrence of a complex of species. We performed molecular and karyotypic analysis of H. malabaricus individuals from eight Amazonian localities to assess the diversity present in the nominal taxon, and to clarify relationships within this group. We used 12 samples in cytogenetic analyses and found two karyomorphs: 2n = 40 (20m + 20sm) (karyomorph C) and 2n = 42 (22m + 20sm) (karyomorph A). We used 19 samples in molecular analyses with COI as a molecular marker, maximum likelihood analyses, and the Kimura-2-parameter evolutionary model with bootstrap support. We found karyomorph-related differentiation with bootstrap of 100%. However, we found high molecular diversity within karyomorph C. The observed pattern allowed us to infer the presence of cryptic diversity, reinforcing the existence of a species complex.


RESUMO O DNA barcoding propõe que um fragmento de DNA possa servir para identificar espécies. Em peixes, um fragmento do gene COI tem se mostrado eficaz em muitos estudos com focos diferentes. Nós usamos essa ferramenta molecular para fornecer novas informações sobre a diversidade críptica encontrada no complexo de espécies Hoplias malabaricus. Popularmente conhecida como traíra, H. malabaricus tem uma ampla distribuição na América do Sul. Esse clado mostra diversidade molecular e citogenética, e vários estudos dão suporte à ocorrência de um complexo de espécies. Realizamos análises molecular e cariotípica em indivíduos de H. malabaricus de oito localidades amazônicas, para acessar a diversidade no taxon nominal e elucidar as relações nesse grupo. Usamos 12 amostras em análises citogenéticas e encontramos dois cariomorfos: 2n = 40 (20m + 20sm) (cariomorfo C) e 2n = 42 (22m + 20sm) (cariomorfo A). Usamos 19 amostras em análise molecular, utilizando COI como marcador molecular, análises de máxima verossimilhança e o modelo evolutivo de Kimura-2-parâmetros com estimativa de bootstrap. Encontramos diferenciação relacionada aos cariomorfos com bootstrap de 100%. No entanto, encontramos alta diversidade molecular no cariomorfo C. O padrão observado nos permitiu inferir a presença de diversidade oculta, reforçando a existência de um complexo de espécies.

11.
Acta amaz. ; 51(2): 139-144, abr.-jun. 2021. mapas, tab, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-31401

Resumo

DNA barcoding proposes that a fragment of DNA can be used to identify species. In fish, a fragment of cytochrome oxidase subunit I (COI) has been effective in many studies with different foci. Here we use this molecular tool to provide new insights into the cryptic diversity found in the Hoplias malabaricus species complex. Popularly known as trahira, H. malabaricus is widely distributed in South America. The clade shows molecular and cytogenetic diversity, and several studies have supported the occurrence of a complex of species. We performed molecular and karyotypic analysis of H. malabaricus individuals from eight Amazonian localities to assess the diversity present in the nominal taxon, and to clarify relationships within this group. We used 12 samples in cytogenetic analyses and found two karyomorphs: 2n = 40 (20m + 20sm) (karyomorph C) and 2n = 42 (22m + 20sm) (karyomorph A). We used 19 samples in molecular analyses with COI as a molecular marker, maximum likelihood analyses, and the Kimura-2-parameter evolutionary model with bootstrap support. We found karyomorph-related differentiation with bootstrap of 100%. However, we found high molecular diversity within karyomorph C. The observed pattern allowed us to infer the presence of cryptic diversity, reinforcing the existence of a species complex.(AU)


O DNA barcoding propõe que um fragmento de DNA possa servir para identificar espécies. Em peixes, um fragmento do gene COI tem se mostrado eficaz em muitos estudos com focos diferentes. Nós usamos essa ferramenta molecular para fornecer novas informações sobre a diversidade críptica encontrada no complexo de espécies Hoplias malabaricus. Popularmente conhecida como traíra, H. malabaricus tem uma ampla distribuição na América do Sul. Esse clado mostra diversidade molecular e citogenética, e vários estudos dão suporte à ocorrência de um complexo de espécies. Realizamos análises molecular e cariotípica em indivíduos de H. malabaricus de oito localidades amazônicas, para acessar a diversidade no taxon nominal e elucidar as relações nesse grupo. Usamos 12 amostras em análises citogenéticas e encontramos dois cariomorfos: 2n = 40 (20m + 20sm) (cariomorfo C) e 2n = 42 (22m + 20sm) (cariomorfo A). Usamos 19 amostras em análise molecular, utilizando COI como marcador molecular, análises de máxima verossimilhança e o modelo evolutivo de Kimura-2-parâmetros com estimativa de bootstrap. Encontramos diferenciação relacionada aos cariomorfos com bootstrap de 100%. No entanto, encontramos alta diversidade molecular no cariomorfo C. O padrão observado nos permitiu inferir a presença de diversidade oculta, reforçando a existência de um complexo de espécies.(AU)


Assuntos
Animais , Caraciformes/genética , Biologia Molecular , Biodiversidade , Cariótipo , DNA/análise
12.
Neotrop. ichthyol ; 19(2): e200109, 2021. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-31215

Resumo

The fishes of the Haemulidae family are currently allocated to 19 genera with a worldwide distribution in the tropical and subtropical waters of the world's oceans. Brachygenys and Haemulon are important genera of reef fish in Brazil, as they occur in large shoals, which are both ecologically and commercially valuable. This study identified the Brazilian species of the genera Brachygenys and Haemulon using DNA barcodes. While we found only a single lineage in Brachygenys chrysargyrea, Haemulon melanurum, H. parra, and H. squamipinna, more than one molecular operational taxonomic unit (MOTU) was identified in H. atlanticus, H. aurolineatum, and H. plumieri, indicating the possible existence of discrete populations or cryptic species.(AU)


Os peixes da família Haemulidae estão atualmente distribuídos em 19 gêneros, com distribuição mundial em águas oceânicas tropicais e subtropicais. Brachygenys e Haemulon são importantes gêneros de peixes recifais do Brasil, visto que ocorrem em grandes cardumes, de valores ecológicos e comerciais. Este estudo identificou as espécies brasileiras dos gêneros Brachygenys e Haemulon usando o código de barras de DNA. Embora apenas uma única linhagem de Brachygenys chrysargyrea, Haemulon melanurum, H. parra e H. squamipinna tenha sido encontrada em nosso conjunto de dados, mais de uma unidade taxonômica operacional molecular (MOTU) foi identificada em H. atlanticus, H. aurolineatum e H. plumieri, indicando a possível existência de populações discretas ou espécies crípticas.(AU)


Assuntos
Animais , Perciformes , Distribuição de Produtos , Biologia Molecular , Análise de Sequência de DNA , Peixes
13.
Neotrop. ichthyol ; 19(2): e200109, 2021. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1279484

Resumo

The fishes of the Haemulidae family are currently allocated to 19 genera with a worldwide distribution in the tropical and subtropical waters of the world's oceans. Brachygenys and Haemulon are important genera of reef fish in Brazil, as they occur in large shoals, which are both ecologically and commercially valuable. This study identified the Brazilian species of the genera Brachygenys and Haemulon using DNA barcodes. While we found only a single lineage in Brachygenys chrysargyrea, Haemulon melanurum, H. parra, and H. squamipinna, more than one molecular operational taxonomic unit (MOTU) was identified in H. atlanticus, H. aurolineatum, and H. plumieri, indicating the possible existence of discrete populations or cryptic species.(AU)


Os peixes da família Haemulidae estão atualmente distribuídos em 19 gêneros, com distribuição mundial em águas oceânicas tropicais e subtropicais. Brachygenys e Haemulon são importantes gêneros de peixes recifais do Brasil, visto que ocorrem em grandes cardumes, de valores ecológicos e comerciais. Este estudo identificou as espécies brasileiras dos gêneros Brachygenys e Haemulon usando o código de barras de DNA. Embora apenas uma única linhagem de Brachygenys chrysargyrea, Haemulon melanurum, H. parra e H. squamipinna tenha sido encontrada em nosso conjunto de dados, mais de uma unidade taxonômica operacional molecular (MOTU) foi identificada em H. atlanticus, H. aurolineatum e H. plumieri, indicando a possível existência de populações discretas ou espécies crípticas.(AU)


Assuntos
Animais , Perciformes , Distribuição de Produtos , Biologia Molecular , Análise de Sequência de DNA , Peixes
14.
Braz. J. Biol. ; 81(4): 1054-1060, Oct.-Dec. 2021. mapas, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-762610

Resumo

One aquatic coleopteran species from family Dytiscidae and two aquatic coleopteran genera from family Hydrophilidae were recorded in the summer period and represent first records in the Egyptian lakes. Beetles were collected from two northern lakes, Lake Idku and Lake Burullus. They were identified by morphological characteristics as well as the mtDNA barcoding method. A molecular phylogenetic approach was used to determine the genetic identity of the collected samples based on the mitochondrial cytochrome oxidase I (COI). Prodaticus servillianus (Dytiscidae) from Egypt showed no significant difference in the COI region and they are highly similar to P. servillianus from Madagascar. The phylogenetic analysis revealed that the other two coleopteran genera belong to family Hydrophilidae. Based on COI only, there is no clear evidence for their genetic identity at the species level. So, we defined them to the closest taxon and denoted them as Cymbiodyta type A and B. The results indicated that resolving the molecular identity of the aquatic beetles from northern lakes of Egypt need more considerations in the field of biological conservation. We concluded that utilization of COI as a barcoding region for identifying some coleopteran species is not sufficient and additional molecular markers are required to uncover the molecular taxonomy at deep levels.(AU)


Uma espécie de coleópteros aquático da família Dytiscidae e dois gêneros de coleópteros aquáticos da família Hydrophilidae foram registrados no período de verão e representam os primeiros registros nos lagos egípcios. Os besouros foram coletados em dois lagos do norte, o lago Idku e o lago Burullus, e identificados por características morfológicas e pelo método de código de barras mtDNA. Uma abordagem filogenética molecular foi usada para determinar a identidade genética das amostras coletadas com base no citocromo oxidase I mitocondrial (COI). Prodaticus servillianus (Dytiscidae) do Egito não mostrou diferença significativa na região COI e é altamente semelhante a P. servillianus de Madagascar. A análise filogenética revelou que os outros dois gêneros de coleópteros pertencem à família Hydrophilidae. Com base apenas no COI, não há evidências claras de sua identidade genética no nível da espécie. Assim, nós os agrupamos no táxon mais próximo e os denominamos Cymbiodyta tipo A e B. Os resultados indicaram que a identidade molecular dos besouros aquáticos dos lagos do norte do Egito precisa de mais considerações no campo da conservação biológica. Concluímos que a utilização de COI como região de código de barras para identificar algumas espécies de coleópteros não é suficiente, sendo necessários marcadores moleculares adicionais para descobrir a taxonomia molecular em níveis profundos.(AU)


Assuntos
Animais , Código de Barras de DNA Taxonômico/veterinária , Besouros/genética , Biodiversidade , Egito
15.
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-746045

Resumo

Abstract The ichthyofauna diversity of the Jebba Hydroelectric Power (HEP) Dam, Jebba, North-central Nigeria was studied. Fishes were sampled for 24 months using gill net, hook and line, and cast net. Individuals were identified using morphological and molecular (mitochondrial Cytochrome c Oxidase subunit I) data. A total of 9605 freshwater fishes were recorded during the sampling period. The use of an integrative taxonomic approach enabled the identification of 83 species belonging to 42 genera. Additionally, the study recorded three unidentified species Ctenopoma sp, Malapterurus sp., and Protopterus sp. Analyses showed that individuals belonging to families Cichlidae and Mochokidae dominated the dam. The diversity analyses revealed relatively high fish diversity during the rainy season at the downstream section of Jebba HEP dam compared to the upstream section. The study, therefore, showed the presence of a diverse fish community comprising high species richness and diversity across the Jebba HEP dam. Finally, we recommend proper biodiversity monitoring and assessment of freshwater fish diversity across Nigeria. In addition, the use of an integrated taxonomic approach is recommended for appropriate species identification and studies of freshwater fishes from Nigeria.


Resumo A diversidade da ictiofauna da hidrelétrica de Jebba (HEP), Jebba, centro-norte da Nigéria foi estudada. Os peixes foram amostrados por 24 meses, utilizando rede de emalhar, anzol e linha, e rede de arrasto. Os indivíduos foram identificados usando a abordagem combinada morfológica e molecular (citocromo c Oxidase mitocondrial subunidade I). Um total de 9605 peixes de água doce foram registrados durante o período de amostragem. A identificação das espécies utilizando a abordagem taxonômica integrada possibilitou a identificação de 83 espécies pertencentes a 42 gêneros. Além disso, o estudo registrou três espécies não identificadas - Ctenopoma sp, Malapterurus sp e Protopterus sp. Análises mostraram que indivíduos pertencentes às famílias Cichlidae e Mochokidae dominaram a barragem. As análises dos índices de diversidade revelaram uma diversidade de peixes relativamente alta durante a estação chuvosa na seção a jusante da barragem Jebba HEP em comparação com a seção a montante. O estudo mostrou, portanto, a presença de diversas comunidades de peixes, que incluem alta riqueza e diversidade de espécies através da barragem Jebba HEP. Finalmente, recomendamos o monitoramento adequado da biodiversidade e a avaliação da diversidade de peixes de água doce em toda a Nigéria. Além disso, recomenda-se o uso de abordagem taxonômica integrada para a identificação adequada das espécies e estudos de peixes de água doce da Nigéria.

16.
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-759738

Resumo

Abstract One aquatic coleopteran species from family Dytiscidae and two aquatic coleopteran genera from family Hydrophilidae were recorded in the summer period and represent first records in the Egyptian lakes. Beetles were collected from two northern lakes, Lake Idku and Lake Burullus. They were identified by morphological characteristics as well as the mtDNA barcoding method. A molecular phylogenetic approach was used to determine the genetic identity of the collected samples based on the mitochondrial cytochrome oxidase I (COI). Prodaticus servillianus (Dytiscidae) from Egypt showed no significant difference in the COI region and they are highly similar to P. servillianus from Madagascar. The phylogenetic analysis revealed that the other two coleopteran genera belong to family Hydrophilidae. Based on COI only, there is no clear evidence for their genetic identity at the species level. So, we defined them to the closest taxon and denoted them as Cymbiodyta type A and B. The results indicated that resolving the molecular identity of the aquatic beetles from northern lakes of Egypt need more considerations in the field of biological conservation. We concluded that utilization of COI as a barcoding region for identifying some coleopteran species is not sufficient and additional molecular markers are required to uncover the molecular taxonomy at deep levels.


Resumo Uma espécie de coleópteros aquático da família Dytiscidae e dois gêneros de coleópteros aquáticos da família Hydrophilidae foram registrados no período de verão e representam os primeiros registros nos lagos egípcios. Os besouros foram coletados em dois lagos do norte, o lago Idku e o lago Burullus, e identificados por características morfológicas e pelo método de código de barras mtDNA. Uma abordagem filogenética molecular foi usada para determinar a identidade genética das amostras coletadas com base no citocromo oxidase I mitocondrial (COI). Prodaticus servillianus (Dytiscidae) do Egito não mostrou diferença significativa na região COI e é altamente semelhante a P. servillianus de Madagascar. A análise filogenética revelou que os outros dois gêneros de coleópteros pertencem à família Hydrophilidae. Com base apenas no COI, não há evidências claras de sua identidade genética no nível da espécie. Assim, nós os agrupamos no táxon mais próximo e os denominamos Cymbiodyta tipo A e B. Os resultados indicaram que a identidade molecular dos besouros aquáticos dos lagos do norte do Egito precisa de mais considerações no campo da conservação biológica. Concluímos que a utilização de COI como região de código de barras para identificar algumas espécies de coleópteros não é suficiente, sendo necessários marcadores moleculares adicionais para descobrir a taxonomia molecular em níveis profundos.

17.
Acta amaz. ; 49(3): 197-207, July-Sept. 2019. ilus, mapas, tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-24124

Resumo

Despite its importance in biogeographical, ecological, and commercial terms, the fish fauna of the northern Brazilian coast is still poorly known, representing the least sampled portion of the Brazilian Exclusive Economic Zone. We collected Tonkin weakfish, Cynoscion similis specimens during extensive surveys of the northern Brazilian coast and concluded that C. similis is common in this region. While the species had not previously been reported for the northern Brazilian state of Pará, it may have been recorded in studies of industrial fisheries, being identified only as Cynoscion sp. or by the common name pescada negra. This reinforces the need for the reliable taxonomical identification of species, to guarantee the collection of accurate data on ecology and fisheries, and ultimately, support the development of effective conservation strategies. Here we provide additional morphological and molecular data to distinguish Cynoscion similis from the closely related Cynoscion jamaicensis, and other congeners.(AU)


Apesar de sua importância em termos biogeográficos, ecológicos e comerciais, a ictiofauna da costa norte do Brasil ainda é pouco conhecida, representando a porção menos amostrada da Zona Econômica Exclusiva Brasileira. Durante extensivo esforço de inventário na costa norte do Brasil, nós obtivemos uma série de espécimes de Cynoscion similis e concluímos que a espécie é comum nesta região. Embora a espécie não tenha sido relatada anteriormente para o estado do Pará, ela pode ter sido registrada em estudos sobre a pesca industrial, sendo identificada apenas como Cynoscion sp. ou pelo nome comum pescada negra. Isso reforça a necessidade de identificação taxonômica confiável de espécies, com objetivo de garantir dados precisos de ecologia e pesca, e apoiar o desenvolvimento de estratégias efetivas de conservação. Aqui, nós fornecemos novos dados morfológicos e moleculares importantes para a diferenciação de Cynoscion similis e C. jamaicensis, a espécie mais próxima morfologicamente, assim como de outros congêneres.(AU)


Assuntos
Animais , Perciformes/anatomia & histologia , Perciformes/classificação , Pesqueiros , Especificidade da Espécie
18.
Ciênc. rural (Online) ; 48(5): 1-6, 2018. tab, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1480127

Resumo

Atta sexdens rubropilosa (leaf-cutter ants) has a symbiotic association with a fungus and has a negative interaction with other fungi due to parasitism of the fungus cultivated by ants; also, there are several other fungi with no exact known role occurring in their cultivated fungus garden. In the present study, we use the ITS region (internal transcribed spacer) to identify fungi in colonies treated with toxic baits. Experiments using two toxic baits were carried out: 0.75g of sulfluramid [0.3%] and 0.75g fipronil [0.003%]. Samples of fungi were collected and cultured in Czapek medium for seven days to allow fungal growth and subsequent identification. Total DNA was isolated from 100-150 mg of mycelium using the CTAB method and using PCR, with the universal primers (ITS4 and ITS5), to amplify the ITS region. Sequencing was performed using the Sanger method. Sequences were subjected to BLAST, allowing the identification of nine different species of the orders Agaricales, Eurotiales, Hypocreales, Pleosporales, Saccharomycetales and Tremellales showing a variation in identity of 96-100%. Using "The Automatic Barcode Gap Discovery" analysis, nine groups were identified, corresponding to species described in NCBI. The K2P distances were used to generate a tree using Neighbour-joining, demonstrating that the species were grouped according to phylogenetic groups. We concluded that leaf-cutter ant colonies exhibited a wide variety of fungi and this study suggested that there is no correlation between the species of fungi isolated with the control method used on the ant nest.


Atta sexdens rubropilosa (cortadeira de folha) possui associação simbiótica com fungos e interação negativa com outros fungos devido ao parasitismo do fungo cultivado pelas formigas. Quando colônias da formiga cortadeira de folhas são submetidas ao tratamento com iscas tóxicas, diversas espécies de fungos surgem dentro da colônia, podendo contribuir com a morte ou sobrevivência da colônia. Para entender os relacionamentos ecológicos em colônias de formigas, a identificação de espécie de fungos se torna muito importante e, o uso de DNA barcoding tem sido um método rápido e eficiente para identificação de espécies usando métodos moleculares. No presente trabalho, usamos a região ITS (internal transcribed spacer) para identificar fungos em colônias tratadas com iscas tóxicas. Dois experimentos com iscas tóxicas foram aplicados: 0.75g de Fipronil [0.003%] e 0.75g de Sulfluramid [0.3%]. As amostras, contendo os possíveis fungos, foram coletadas e cultivadas em meio Czaped durante sete dias para o crescimento do fungo e posterior identificação. O DNA total foi isolado de 100-150mg de micélio usando o método CTAB, usado para amplificar a região ITS por PCR empregando primers universais (ITS5 e ITS4). O sequenciamento foi realizado utilizando o método de Sanger. As sequências foram submetidas ao BLAST, permitindo identificar nove diferentes espécies das ordens Agaricales, Eurotiales, Hypocreales, Pleosporales, Saccharomycetales e Tremellales, mostrando variação 96-100% de identidade. Empregando a análise "The Automatic Barcode Gap Discovery", identificou-se nove grupos, correspondendo as espécies descritas no NCBI. As distâncias K2P foram usadas para gerar uma árvore usando Neighbour-Joining, apresentando que as espécies foram agrupadas de acordo com as filogenias dos grupos. Conclui-se que as colônias de formigas cortadeira de folhas apresentam grande diversidade de fungos e que DNA barcoding é eficiente para identificação destes.


Assuntos
Biota , Código de Barras de DNA Taxonômico , Formigas , Fungos , Controle de Pragas/estatística & dados numéricos , DNA Intergênico
19.
Ci. Rural ; 48(5): 1-6, maio 21, 2018. tab, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-732637

Resumo

Atta sexdens rubropilosa (leaf-cutter ants) has a symbiotic association with a fungus and has a negative interaction with other fungi due to parasitism of the fungus cultivated by ants; also, there are several other fungi with no exact known role occurring in their cultivated fungus garden. In the present study, we use the ITS region (internal transcribed spacer) to identify fungi in colonies treated with toxic baits. Experiments using two toxic baits were carried out: 0.75g of sulfluramid [0.3%] and 0.75g fipronil [0.003%]. Samples of fungi were collected and cultured in Czapek medium for seven days to allow fungal growth and subsequent identification. Total DNA was isolated from 100-150 mg of mycelium using the CTAB method and using PCR, with the universal primers (ITS4 and ITS5), to amplify the ITS region. Sequencing was performed using the Sanger method. Sequences were subjected to BLAST, allowing the identification of nine different species of the orders Agaricales, Eurotiales, Hypocreales, Pleosporales, Saccharomycetales and Tremellales showing a variation in identity of 96-100%. Using "The Automatic Barcode Gap Discovery" analysis, nine groups were identified, corresponding to species described in NCBI. The K2P distances were used to generate a tree using Neighbour-joining, demonstrating that the species were grouped according to phylogenetic groups. We concluded that leaf-cutter ant colonies exhibited a wide variety of fungi and this study suggested that there is no correlation between the species of fungi isolated with the control method used on the ant nest.(AU)


Atta sexdens rubropilosa (cortadeira de folha) possui associação simbiótica com fungos e interação negativa com outros fungos devido ao parasitismo do fungo cultivado pelas formigas. Quando colônias da formiga cortadeira de folhas são submetidas ao tratamento com iscas tóxicas, diversas espécies de fungos surgem dentro da colônia, podendo contribuir com a morte ou sobrevivência da colônia. Para entender os relacionamentos ecológicos em colônias de formigas, a identificação de espécie de fungos se torna muito importante e, o uso de DNA barcoding tem sido um método rápido e eficiente para identificação de espécies usando métodos moleculares. No presente trabalho, usamos a região ITS (internal transcribed spacer) para identificar fungos em colônias tratadas com iscas tóxicas. Dois experimentos com iscas tóxicas foram aplicados: 0.75g de Fipronil [0.003%] e 0.75g de Sulfluramid [0.3%]. As amostras, contendo os possíveis fungos, foram coletadas e cultivadas em meio Czaped durante sete dias para o crescimento do fungo e posterior identificação. O DNA total foi isolado de 100-150mg de micélio usando o método CTAB, usado para amplificar a região ITS por PCR empregando primers universais (ITS5 e ITS4). O sequenciamento foi realizado utilizando o método de Sanger. As sequências foram submetidas ao BLAST, permitindo identificar nove diferentes espécies das ordens Agaricales, Eurotiales, Hypocreales, Pleosporales, Saccharomycetales e Tremellales, mostrando variação 96-100% de identidade. Empregando a análise "The Automatic Barcode Gap Discovery", identificou-se nove grupos, correspondendo as espécies descritas no NCBI. As distâncias K2P foram usadas para gerar uma árvore usando Neighbour-Joining, apresentando que as espécies foram agrupadas de acordo com as filogenias dos grupos. Conclui-se que as colônias de formigas cortadeira de folhas apresentam grande diversidade de fungos e que DNA barcoding é eficiente para identificação destes.(AU)


Assuntos
Fungos , Formigas , Código de Barras de DNA Taxonômico , Biota , DNA Intergênico , Controle de Pragas/estatística & dados numéricos
20.
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1467441

Resumo

Abstract The ichthyofauna diversity of the Jebba Hydroelectric Power (HEP) Dam, Jebba, North-central Nigeria was studied. Fishes were sampled for 24 months using gill net, hook and line, and cast net. Individuals were identified using morphological and molecular (mitochondrial Cytochrome c Oxidase subunit I) data. A total of 9605 freshwater fishes were recorded during the sampling period. The use of an integrative taxonomic approach enabled the identification of 83 species belonging to 42 genera. Additionally, the study recorded three unidentified species Ctenopoma sp, Malapterurus sp., and Protopterus sp. Analyses showed that individuals belonging to families Cichlidae and Mochokidae dominated the dam. The diversity analyses revealed relatively high fish diversity during the rainy season at the downstream section of Jebba HEP dam compared to the upstream section. The study, therefore, showed the presence of a diverse fish community comprising high species richness and diversity across the Jebba HEP dam. Finally, we recommend proper biodiversity monitoring and assessment of freshwater fish diversity across Nigeria. In addition, the use of an integrated taxonomic approach is recommended for appropriate species identification and studies of freshwater fishes from Nigeria.


Resumo A diversidade da ictiofauna da hidrelétrica de Jebba (HEP), Jebba, centro-norte da Nigéria foi estudada. Os peixes foram amostrados por 24 meses, utilizando rede de emalhar, anzol e linha, e rede de arrasto. Os indivíduos foram identificados usando a abordagem combinada morfológica e molecular (citocromo c Oxidase mitocondrial subunidade I). Um total de 9605 peixes de água doce foram registrados durante o período de amostragem. A identificação das espécies utilizando a abordagem taxonômica integrada possibilitou a identificação de 83 espécies pertencentes a 42 gêneros. Além disso, o estudo registrou três espécies não identificadas - Ctenopoma sp, Malapterurus sp e Protopterus sp. Análises mostraram que indivíduos pertencentes às famílias Cichlidae e Mochokidae dominaram a barragem. As análises dos índices de diversidade revelaram uma diversidade de peixes relativamente alta durante a estação chuvosa na seção a jusante da barragem Jebba HEP em comparação com a seção a montante. O estudo mostrou, portanto, a presença de diversas comunidades de peixes, que incluem alta riqueza e diversidade de espécies através da barragem Jebba HEP. Finalmente, recomendamos o monitoramento adequado da biodiversidade e a avaliação da diversidade de peixes de água doce em toda a Nigéria. Além disso, recomenda-se o uso de abordagem taxonômica integrada para a identificação adequada das espécies e estudos de peixes de água doce da Nigéria.

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