Genetic parameters and association between longevity and milk production in buffaloes using the ssGBLUP method

The objectives of this work were to estimate the genetic parameters for the traits longevity (LG) and accumulated milk yield at 305 days (MY305) using a bitrait animal model and the single-step GBLUP method and estimate the genetic gain for LG through direct and indirect selection for MY305. We used 4,057 records of first lactations of Murrah dairy buffaloes, collected between 1987 and 2020, belonging to six Brazilian herds located in the states Ceará, Rio Grande do Norte, and São Paulo and 960 animals genotyped using the 90K Axiom Buffalo Genotyping (Thermo Fisher Scientific, Santa Clara, CA) to estimate the genetic parameters. The heritability estimate was 0.25 for MY305 and 0.13 for LG. The genetic gain for LG was 0.13 months under direct selection, and 0.14 months under indirect selection, which results in a relative selection efficiency of 11% under selection for MY305 compared with the direct selection. The genetic correlation between the two traits was 0.77, indicating that animals with genetic potential for high MY305 tend to live longer. The genetic trends for MY305 and LG were 0.22 kg/year and 5.20 days/year, respectively, indicating a positive response, which reaffirms its relationship with the high genetic correlation between the two traits.(AU)

Avaliações genéticas para altura de cernelha e funcionalidade da marcha em equinos da raça Campolina / Genetic evaluations for withers height and gait functionality in Campolina horses

As avaliações genéticas permitem compreender a evolução da raça e a importância dos componentes genéticos sobre a variação fenotípica das características de interesse de produção em animais. Objetivou-se, com este trabalho, estimar a tendência genética, a herdabilidade e a correlação genética para altura de cernelha e funcionalidade da marcha em equinos brasileiros da raça Campolina. A Associação Brasileira dos Criadores de Cavalo Campolina disponibilizou 107.630 dados de animais registrados desde 1951 até julho de 2016. As avaliações genéticas foram obtidas por modelo animal uni-característico, para altura de cernelha, com dados de 11.765 indivíduos, e bi-característico, para os atributos de qualidade de marcha, que são: comodidade, desenvolvimento, dissociação, estilo e regularidade, pertencentes a 2.148, 2.148, 2.145, 2.125 e 2.148 equinos, respectivamente. Incremento genético de 3,88cm foi observado para altura de cernelha ao longo dos anos, sugerindo a eficiência de seleção para porte elevado no Campolina. Não foi verificada evolução genética nos atributos de marcha, podendo indicar necessidade de melhoria nos processos de avaliação e seleção dos animais para maior comodidade e desenvoltura desse andamento. Verificou-se herdabilidade igual a 0,37 para altura de cernelha e 0,77 para dissociação, além de herdabilidades de comodidade, desenvolvimento, estilo e regularidade iguais a 0,15, 0,23, 0,22 e 0,28. Os resultados indicam que essas características podem ser utilizadas como critério de seleção para melhor qualidade de marcha. As correlações genéticas verificadas entre a medida linear e todos os atributos de marcha foram de baixa magnitude, variando entre -0,01 e 0,05. Desta forma, é sugerido que a seleção para altura na cernelha exerce baixa influência sobre os ganhos genéticos em atributos de marcha.

Genetic evaluations allow to describe the genetic evolution of a breed and to understand the importance of the genetic variability on the phenotypic variance of a production interesting trait. This study aimed to estimate genetic tendency, heritability and genetic correlation for withers height and gait functionality traits in Brazilian Campolina horses. The Brazilian Association of Campolina Horse Breeders provided 107,630 records from registered animals born from 1951 until July 2016. Genetic evaluations were obtained by uni-trait animal model, for withers height using data from 11,765 individuals, and bi-trait models for attributes of gait quality: comfort, reach, dissociation, style and regularity, belonging to 2,148, 2,148, 2,145, 2,125 and 2,148 horses, respectively. A genetic increase of 3.88cm was observed for withers height over the years, suggesting the efficiency of selection for high height in Campolina. There was no genetic evolution in the gait attributes, which may indicate the need for improvement in the evaluation and selection processes of the animals for greater comfort and range of their gait. Heritability equal to 0.37 and 0.77 was observed for withers height and dissociation. Comfort, reach, style and regularity showed heritabilities of 0.15; 0.23; 0.22 and 0.28, respectively. The results indicate that these characteristics can be used as selection criteria for better gait quality. The genetic correlations observed between the linear measurement and all gait attributes were low varying between -0.01 and 0.05. Therefore, the selection for withers height would have little influence on the genetic gains in gait attributes.

Appropriate mathematical models to describe the lactation curves of milk production traits of Iranian Holstein dairy cattle / Modelos Matemáticos apropriados para descrever as curvas de lactação dos traços de produção de leite do gado leiteiro Holstein Iraniano

The objective of this study was to compare the goodness of fit of lactation curve models; Wood, Wilmink, Linear Splines (SPL), Cubic Splines (SPC), Quadratic Splines (SPQ), Cobby and Le Du, Ali Schaeffer and Legendre Polynomial (LEG), in random regression model (RRM) for milk production traits of Iranian Holstein dairy cattle. For this purpose the records obtained from Test-day (TD) regarding milk (928513), fat (788577) and protein (653317) yields related to their first parity were used. These data collected from the years of 2003 to 2011 by the Karaj breeding center of Iran. The genetic parameters were estimated using REML method using WOMBAT software. Based on obtained results, RRM with SPL6 (6,6), SPC6 (6,6) and LEG (3,5) for milk yield, SPL6 (6,6), SPQ6 (6,6), LEG (3,5) for fat yield and SPL5 (5,5), SPQ4 (4,4) and LEG (3,4) for protein yield, were selected as better model to describe the lactation curves. The estimated heritabilities by best models were lower in the beginning lactation than other during lactation. The genetic trend of milk yields was showed an increasing during the 10 past years, which indicated Iranian Holstein dairy cattle population genetically was improved for milk yields.(AU)

O objetivo deste estudo foi comparar a qualidade de ajustes dos modelos da curva de lactação, Wood Wilmink, Spline Linear (SPL), Spline Cúbico (SPC), Spline Quadrático (SPQ), Cobby e Le Du, Ali Schaeffer e os Polinômios de Legendre (LEG), em um modelo de regressão aleatória (RRM) para as características da produção de leite do gado Holstein iraniano. Para este propósito os registros obtidos no teste, foram referentes ao leite (928513), gordura (788577) e proteína (653317) e os rendimentos relacionados as suas primeiras paridades foram usadas. Estas informações foram coletadas durante 2003 até 2011 por Kraj em um centro de criação no Iran. Os parâmetros genéticos foram estimulados usando o método REML WOMBAT. Baseado nos resultados obtidos, RRM com SPL6 (6.6), SPC6 (6,6) e LEG (3,5) por produção de leite, foram selecionados os melhores modelos para descrever as curvas de lactação. A hereditariedade estimada por esses melhores modelos foi menor no início da lactação do que durante outra lactação. A tendência genética da produção de leite mostrou um aumento ao longo de 10 anos, na qual indicou o melhoramento genético do gado Holstein Iraniano no que diz respeito à produção de leite.(AU)

Appropriate mathematical models to describe the lactation curves of milk production traits of Iranian Holstein dairy cattle / Modelos Matemáticos apropriados para descrever as curvas de lactação dos traços de produção de leite do gado leiteiro Holstein Iraniano

The objective of this study was to compare the goodness of fit of lactation curve models; Wood, Wilmink, Linear Splines (SPL), Cubic Splines (SPC), Quadratic Splines (SPQ), Cobby and Le Du, Ali Schaeffer and Legendre Polynomial (LEG), in random regression model (RRM) for milk production traits of Iranian Holstein dairy cattle. For this purpose the records obtained from Test-day (TD) regarding milk (928513), fat (788577) and protein (653317) yields related to their first parity were used. These data collected from the years of 2003 to 2011 by the Karaj breeding center of Iran. The genetic parameters were estimated using REML method using WOMBAT software. Based on obtained results, RRM with SPL6 (6,6), SPC6 (6,6) and LEG (3,5) for milk yield, SPL6 (6,6), SPQ6 (6,6), LEG (3,5) for fat yield and SPL5 (5,5), SPQ4 (4,4) and LEG (3,4) for protein yield, were selected as better model to describe the lactation curves. The estimated heritabilities by best models were lower in the beginning lactation than other during lactation. The genetic trend of milk yields was showed an increasing during the 10 past years, which indicated Iranian Holstein dairy cattle population genetically was improved for milk yields.

O objetivo deste estudo foi comparar a qualidade de ajustes dos modelos da curva de lactação, Wood Wilmink, Spline Linear (SPL), Spline Cúbico (SPC), Spline Quadrático (SPQ), Cobby e Le Du, Ali Schaeffer e os Polinômios de Legendre (LEG), em um modelo de regressão aleatória (RRM) para as características da produção de leite do gado Holstein iraniano. Para este propósito os registros obtidos no teste, foram referentes ao leite (928513), gordura (788577) e proteína (653317) e os rendimentos relacionados as suas primeiras paridades foram usadas. Estas informações foram coletadas durante 2003 até 2011 por Kraj em um centro de criação no Iran. Os parâmetros genéticos foram estimulados usando o método REML WOMBAT. Baseado nos resultados obtidos, RRM com SPL6 (6.6), SPC6 (6,6) e LEG (3,5) por produção de leite, foram selecionados os melhores modelos para descrever as curvas de lactação. A hereditariedade estimada por esses melhores modelos foi menor no início da lactação do que durante outra lactação. A tendência genética da produção de leite mostrou um aumento ao longo de 10 anos, na qual indicou o melhoramento genético do gado Holstein Iraniano no que diz respeito à produção de leite.

Genetic and phenotypic trends of fertility traits for Holstein dairy population in warm and temperate climate

The main objective of this study was to investigate genetic and phenotypic trends for fertility traits in Holstein dairy population under warm and temperate climate. Fertility traits were: success in first service, gestation length, number of inseminations, insemination outcome, calving interval, calving birth weight and days open. The edited data set included up to 23,402 records from 9,486 cows. The mean and standard deviation for fertility traits were 0.32 ± 0.003, 278.2 ± 5.58, 2.73 ± 1.94,0.31 ± 0.001, 415.99 ± 79.62, 40.4 ± 6.08 and 140.36 ± 76.16 for success in first service, gestation length, number of inseminations, insemination outcome, calving interval, calving birth weight and days open, respectively. In general, there were decreasing genetic trends for all traits over the years. On the other hand, there were decreasing phenotypic trend for days open, calving interval, gestation length, number of inseminations and calving birth weight, but estimates of phenotypic trends were positive for success in first service and insemination outcome over the years. It was concluded decreased trend for days open, calving interval, gestation length, number of inseminations and calving birth weight and increased trend for success in first service and insemination outcome traits over time indicated that Holstein dairy producers in warm and temperate climate were successful in managing and improving in nutrition during 1999 to 2013> (AU)

Genetic and phenotypic trends of fertility traits for Holstein dairy population in warm and temperate climate

The main objective of this study was to investigate genetic and phenotypic trends for fertility traits in Holstein dairy population under warm and temperate climate. Fertility traits were: success in first service, gestation length, number of inseminations, insemination outcome, calving interval, calving birth weight and days open. The edited data set included up to 23,402 records from 9,486 cows. The mean and standard deviation for fertility traits were 0.32 ± 0.003, 278.2 ± 5.58, 2.73 ± 1.94,0.31 ± 0.001, 415.99 ± 79.62, 40.4 ± 6.08 and 140.36 ± 76.16 for success in first service, gestation length, number of inseminations, insemination outcome, calving interval, calving birth weight and days open, respectively. In general, there were decreasing genetic trends for all traits over the years. On the other hand, there were decreasing phenotypic trend for days open, calving interval, gestation length, number of inseminations and calving birth weight, but estimates of phenotypic trends were positive for success in first service and insemination outcome over the years. It was concluded decreased trend for days open, calving interval, gestation length, number of inseminations and calving birth weight and increased trend for success in first service and insemination outcome traits over time indicated that Holstein dairy producers in warm and temperate climate were successful in managing and improving in nutrition during 1999 to 2013>

Parâmetros genéticos para características produtivas e reprodutivas em bovinos da raça Sindi

A produtividade dos bovinos de corte apresenta variações dentre diferentes regiões brasileiras, as quais podem ser causadas por diferenças ambientais e tecnológicas. Nesse âmbito, podem ser escolhidas raças que apresentem boa interação entre genótipo e ambiente de modo a tornar a criação mais eficiente. A raça Sindi se destaca quanto a capacidade de se desenvolver em ambientes com poucos recursos e condições climáticas desafiadoras. Portanto, o conhecimento dos parâmetros genéticos da raça, os quais são escassos na literatura, é fundamental para consolidar programas de melhoramento genético eficientes visando aumentar os ganhos genéticos e a importância da raça no cenário atual da bovinocultura de corte. Diante do exposto, objetivou-se estimar parâmetros genéticos para características produtivas e reprodutivas da raça Sindi, por meio de análises multicaracterísticas, via inferência Bayesiana. O conjunto de dados foi fornecido pela Associação Brasileira de Criadores dos Zebu - ABCZ, e contemplou informações de registro dos animais identificados e avaliados fenotipicamente pela associação desde 1955 até 2019. No total, foram utilizadas informações de 49.849 animais no pedrigree; e 6.984, 5.590 e 1.353 animais para idade ao primeiro parto IPP, peso ao desmame P210 e perímetro escrotal ao ano PE365, respectivamente. Foram estimadas herdabilidades e intervalos de credibilidade de 0,14 (0,08; 0,19); 0,22 (0,14; 0,29) e 0,46 (0,26; 0,67) para IPP, P210 e PE365, respectivamente. Também foram estimadas correlações genéticas e intervalos de credibilidade: -0,41 (-0,76; -0,06); -0,61 (-0,86; -0,36); 0,64 (0,45; 0,83) entre IPP e PE365, IPP e P210 e entre P210 e PE365, respectivamente. A h² materna para P210 foi de 0,05 (0,02; 0,08). A tendência genética demonstra ganho genético anual para IPP (-3,04 dias) e redução dos ganhos genéticos para as características P210 (-0,19 kg) e PE365 (-0,31 cm). Os resultados indicam viabilidade de seleção genética das características estudadas, seja pela seleção direta (PE365) ou indireta (IPP e P210).

The productivity of beef cattle varies between different Brazilian regions, which can be caused by environmental and technological differences. In this context, breeds with good interaction between genotype and environment can be chosen in order to make breeding more efficient. The Sindi breed stands out in terms of the ability to develop in environments with few resources and challenging climatic conditions. Therefore, knowledge of the breed's genetic parameters, which are scarce in the literature, is essential to consolidate efficient breeding programs aiming to increase genetic gains and the importance of the breed in the current scenario of beef cattle. In view of the above, the objective was to estimate genetic parameters for productive and reproductive traits in Sindhi cattle, using multi-trait analysis, via Bayesian inference. The data set was provided by the Brazilian Zebu Breeders Association - ABCZ, and included information on registration of animals identified and phenotypically evaluated by the association from 1955 to 2019. In total, information from 49,849 animals was used in the pedrigree; and 6,984, 5,590 and 1,353 animals for age at first calving - IPP, weaning weight - P210 and scrotal perimeter per year - PE365, respectively. Heritabilities and credibility intervals of 0.14 (0.08; 0.19); 0.22 (0.14; 0.29) and 0.46 (0.26; 0.67) were estimated for IPP, P210 and PE365, respectively. Genetic correlations and credibility intervals were also estimated: -0.41 (-0.76; -0.06); -0.61 (-0.86; -0.36); 0.64 (0.45; 0.83) between IPP and PE365, IPP and P210 and between P210 and PE365, respectively. The maternal h² for P210 was 0.05 (0.02; 0.08). The genetic trend shows annual genetic gain for IPP (-3.04 days) and reduction of genetic gains for the characteristics P210 (-0.19 kg) and PE365 (-0.31 cm). The results indicate the feasibility of genetic selection of the studied traits, either by direct (PE365) or indirect (IPP and P210) selection.

Correlated responses and genetic parameters for performance and carcass traits in a broiler line / Respostas correlacionadas e parâmetros genéticos para características de desempenho e de carcaça em uma linha de frangos de corte

The growth rate of broilers has triplicated in the last decades. The body weight is used as one of the selection criteria whereas the carcass traits are valuable market requirements. Thus, the meat industry like animals with high weights at slaughter and better carcass traits. However, the genetic relation of carcass traits with several body weights is unknown. Therefore, we established genetic associations among performance and carcass traits in a broiler chicken line and estimated genetic gain and trends. We also evaluated what age of selection would lead to a more efficient indirect selection of carcass traits. The data set with information of weights in different ages and carcass traits of 128,459 chickens was used. The pedigree data used contained 132,442 chickens. Genetic analysis were realized using ASREML® software applied a restricted maximum likelihood method. Heritability estimates ranged from moderate to high, which indicates that these traits can have high selection response. Genetic correlations between performance and carcass traits varied from moderate to high, which indicates the presence of a genetic association whereas genetic trends indicated that direct selection is occurring for body weight at different ages. Theselection at 30 and 38 days should be considered instead of the slaughter weight, as it anticipates selection in around 12 days.(AU)

A taxa de crescimento de frangos de corte foi triplicada nas últimas décadas. O peso corporal é utilizado como um dos principais critérios de seleção, enquanto que as características de carcaça são essenciais para o mercado. Assim, a indústria avícola busca animais com pesos altos ao abate e excelentes características de carcaça. Contudo, a associação genética entre as características de carcaça e desempenho é desconhecida. Deste modo, foram estabelecidas associações genéticas entre estas características, além das estimativas do progresso genético e as tendências genéticas para uma linhagem comercial de frango de corte. Avaliou-se a idade ideal para a seleção indireta, visando a melhoraria das características de carcaça. Foram utilizadas informações de pesos em diferentes idades e características de carcaça de 128.459 frangos em diferentes idades ao passo que o pedigree dispunha de 132.442 aves. As análises genéticas foram realizadas por meio do software ASReml®, utilizando o método da máxima verossimilhança restrita, sob o modelo animal. As estimativas de herdabilidade variaram de moderadas a altas, sendo indicativo de que estas características podem ter alta resposta à seleção.(AU)

Correlated responses and genetic parameters for performance and carcass traits in a broiler line

The growth rate of broilers has triplicated in the last decades. The body weight is used as one of the selection criteria whereas the carcass traits are valuable market requirements. Thus, the meat industry like animals with high weights at slaughter and better carcass traits. However, the genetic relation of carcass traits with several body weights is unknown. Therefore, we established genetic associations among performance and carcass traits in a broiler chicken line and estimated genetic gain and trends. We also evaluated what age of selection would lead to a more efficient indirect selection of carcass traits. The data set with information of weights in different ages and carcass traits of 128,459 chickens was used. The pedigree data used contained 132,442 chickens. Genetic analysis were realized using ASREML® software applied a restricted maximum likelihood method. Heritability estimates ranged from moderate to high, which indicates that these traits can have high selection response. Genetic correlations between performance and carcass traits varied from moderate to high, which indicates the presence of a genetic association whereas genetic trends indicated that direct selection is occurring for body weight at different ages. Theselection at 30 and 38 days should be considered instead of the slaughter weight, as it anticipates selection in around 12 days.

A taxa de crescimento de frangos de corte foi triplicada nas últimas décadas. O peso corporal é utilizado como um dos principais critérios de seleção, enquanto que as características de carcaça são essenciais para o mercado. Assim, a indústria avícola busca animais com pesos altos ao abate e excelentes características de carcaça. Contudo, a associação genética entre as características de carcaça e desempenho é desconhecida. Deste modo, foram estabelecidas associações genéticas entre estas características, além das estimativas do progresso genético e as tendências genéticas para uma linhagem comercial de frango de corte. Avaliou-se a idade ideal para a seleção indireta, visando a melhoraria das características de carcaça. Foram utilizadas informações de pesos em diferentes idades e características de carcaça de 128.459 frangos em diferentes idades ao passo que o pedigree dispunha de 132.442 aves. As análises genéticas foram realizadas por meio do software ASReml®, utilizando o método da máxima verossimilhança restrita, sob o modelo animal. As estimativas de herdabilidade variaram de moderadas a altas, sendo indicativo de que estas características podem ter alta resposta à seleção. As correlações genéticas entre as características de desempenho e carcaça variaram de moderadas a altas, indicando a presença de associação genética, ao passo que as tendências genéticas sugerem que a seleção direta está ocorrendo para o peso corporal em diferentes idades. A seleção nas idades 30 e 38 dias deve ser considerada em vez do peso ao abate, uma vez que antecipa a seleção em um período aproximado de 12 dias.

Correlated responses and genetic parameters for performance and carcass traits in a broiler line / Respostas correlacionadas e parâmetros genéticos para características de desempenho e de carcaça em uma linha de frangos de corte

The growth rate of broilers has triplicated in the last decades. The body weight is used as one of the selection criteria whereas the carcass traits are valuable market requirements. Thus, the meat industry like animals with high weights at slaughter and better carcass traits. However, the genetic relation of carcass traits with several body weights is unknown. Therefore, we established genetic associations among performance and carcass traits in a broiler chicken line and estimated genetic gain and trends. We also evaluated what age of selection would lead to a more efficient indirect selection of carcass traits. The data set with information of weights in different ages and carcass traits of 128,459 chickens was used. The pedigree data used contained 132,442 chickens. Genetic analysis were realized using ASREML® software applied a restricted maximum likelihood method. Heritability estimates ranged from moderate to high, which indicates that these traits can have high selection response. Genetic correlations between performance and carcass traits varied from moderate to high, which indicates the presence of a genetic association whereas genetic trends indicated that direct selection is occurring for body weight at different ages. Theselection at 30 and 38 days should be considered instead of the slaughter weight, as it anticipates selection in around 12 days.

A taxa de crescimento de frangos de corte foi triplicada nas últimas décadas. O peso corporal é utilizado como um dos principais critérios de seleção, enquanto que as características de carcaça são essenciais para o mercado. Assim, a indústria avícola busca animais com pesos altos ao abate e excelentes características de carcaça. Contudo, a associação genética entre as características de carcaça e desempenho é desconhecida. Deste modo, foram estabelecidas associações genéticas entre estas características, além das estimativas do progresso genético e as tendências genéticas para uma linhagem comercial de frango de corte. Avaliou-se a idade ideal para a seleção indireta, visando a melhoraria das características de carcaça. Foram utilizadas informações de pesos em diferentes idades e características de carcaça de 128.459 frangos em diferentes idades ao passo que o pedigree dispunha de 132.442 aves. As análises genéticas foram realizadas por meio do software ASReml®, utilizando o método da máxima verossimilhança restrita, sob o modelo animal. As estimativas de herdabilidade variaram de moderadas a altas, sendo indicativo de que estas características podem ter alta resposta à seleção.

ESTIMAÇÃO DE PARÂMETROS GENÉTICOS E AVALIAÇÃO DO PROGRESSO GENÉTICO E FENOTÍPICO DE CARACTERÍSTICAS DE PRODUÇÃO E DE QUALIDADE DE LEITE EM BUBALINOS LEITEIROS

A espécie bubalina (Bubalus bubalis) é originária do continente Asiático e hoje encontra-se difundida mundialmente. Os criadores têm optado pela atividade leiteira nessa espécie, destinando a produção leiteira à elaboração de produtos lácteos. A espécie tem como atrativo econômico a alta produção de proteína e gorgura, que aliada a boa capacidade de produção leiteira, resulta em alto rendimento queijeiro. A crescente demanda pelos derivados do leite bubalino nos últimos anos incentivou os produtores a incrementarem a produção iniciando à seleção de animais superiores. O termo repetibilidade é uma estimativa que sugere que as produções anteriores podem ser utilizadas como indicadoras de produções futuras, auxiliando no descarte de fêmeas do rebanho. As estimativas de herdabilidade determina a resposta a seleção e a correlação genética nos informa como as características estão associadas em um nível genético, ambas as estimativas tendo impacto nas estimativas de tendência genética apresentados pelas características. Objetivou-se nesse estudo a avaliação dos parâmetros genéticos e dos progressos fenotípico e genético para produção total de leite truncada aos 305 dias (PL), de gordura (PTG) e de proteína (PTP), em 13 rebanhos que fazem parte do programa de controle leiteiro mantido pelo Departamento de Zootecnia da FCAV/UNESP. As análises foram realizadas considerando um modelo multicaracterística, cujos efeitos fixos considerados foram os grupos de contemporâneos (GC), formados por rebanho, estação do ano (seca: de abril a outubro; e águas: de novembro a março) e ano do parto, além da duração da lactação e número de ordenhas, e idade da vaca ao parto como efeito linear e quadrático, como (co)variável idade da vaca ao parto com efeito linear e quadrático, como efeitos aleatórios foram considerados o efeito genético aditivo, de ambiente permanente e o efeito residual. Um número mínimo de 4 animais por GC foi considerado. A tendência fenotípica e genética foi estimada por meio de regressão do valor fenotípico e dos valores genéticos dos animais sobre o ano de nascimento. O coeficiente angular foi submetido ao teste t. A PL, PTG e PTP, foram respectivamente, 2111,65 kg, 134,30 kg e 93,42 Kg. As estimativas de herdabilidade para PL, PTG e PTP, foram respectivamente, 0,24, 0,20 e 0,20. As estimativas de herdabilidade para PL, PTG e PTP, foram respectivamente 0,45, 0,31 e 0,40. A correlação genética entre PL e PTG, PTP, foi 0,96 e 1,0, respectivamente. Os ganhos fenotípicos e genéticos foram 11,67 kg (p-valor< 0,001) e 5,987 kg (p-valor< 0,001) de leite por ano, 0,17 kg (p-valor = 0,76) e 0,052 kg (p-valor = 0,161) de gordura por ano, 0,032 kg (p-valor = 0,92) e 0,0566 kg (p-valor = 0,04525) de proteína por ano. O ganho genético e fenotípico mais expressivo foi para produção de leite. As estimativas de herdabilidade para PL, PTG PTP sugerem que é possível os animais responderem a programas de seleção.

The bubaline species (Bubalus bubalis) originates from the Asian continent and is now widespread worldwide. The breeders have opted for the dairy activity in this species, destining the dairy production to the elaboration of dairy products. The species has as economical attraction the high protein and weevil production, which allied to the good milk production capacity, results in high cheese yield. The increasing demand for buffalo milk derivatives in recent years has encouraged producers to increase production by starting to select superior animals. The term repeatability is an estimate that suggests that previous productions can be used as indicators of future productions, assisting in the discarding of females from the herd. Heritability estimates determine the selection response and genetic correlation informs us how traits are associated at a genetic level, both estimates having an impact on genetic trend estimates presented by traits. The objective of this study was to evaluate the genetic parameters and the phenotypic and genetic progress for total truncated milk yield at 305 days (MY), fat (FY) and protein (PY) in 13 herds that are part of the breeding program. dairy control maintained by the Department of Animal Science of FCAV / UNESP. The analyzes were performed considering a multivariate model, whose fixed effects considered were the groups of contemporaries (CG), formed by herd, season (drought: from April to October; and waters: from November to March) and year of calving. In addition to the duration of lactation and number of milkings, and age of cow at calving as linear and quadratic effect, as (co) variable age of cow at calving with linear and quadratic effect, as random effects were considered the additive genetic effect of environment. permanent and residual effect. A minimum number of 4 animals per GC was considered. Phenotypic and genetic trends were estimated by regression of phenotypic value and genetic values of animals over year of birth. The angular coefficient was submitted to the t test. The MY, FY and PY, respectively, were 2111.65 kg, 134.30 kg and 93.42 Kg. The heritability estimates for MY, FY and PY were, respectively, 0.24, 0.20 and 0.20. The heritability estimates for MY, FY and PY were respectively 0.45, 0.31 and 0.40. The genetic correlation between MY, FY and PY, was 0.96 and 1.0, respectively. Phenotypic and genetic gains were 11.67 kg (p-value <0.001) and 5.987 kg (p-value <0.001) of milk per year, 0.17 kg (p-value = 0.76) and 0.052 kg (p -value = 0.161) of fat per year, 0.032 kg (p-value = 0.92) and 0.0566 kg (p-value = 0.04525) of protein per year. The most significant genetic and phenotypic gain was for milk production. Heritability estimates for MY, FY and PY suggest that animals may respond to selection programs.

USO DE INFORMAÇÃO GENÔMICA PARA ESTIMAÇÃO DE PARÂMETROS GENÉTICOS PARA CARACTERÍSTICAS DE CRESCIMENTO E CARCAÇA EM BOVINOS NELORE

A seleção tradicional para características quantitativas de importância econômica é realizada geralmente com base nos valores genéticos preditos a partir de registros fenotípicos de um indivíduo e de seus parentes. Com a disponibilidade da informação genômica, a predição do valor genético para características complexas tem sido amplamente aperfeiçoada. A utilização da predição genômica poderá levar a um ganho genético mais rápido do que o alcançado com métodos tradicionais de seleção, com base apenas em dados de pedigree e fenotípicos. O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência da inclusão da informação genômica nas estimativas dos parâmetros genéticos e tendências genéticas para ganho de peso diário do nascimento aos 120 dias de idade (GP1), dos 120 aos 210 dias de idade (GP2), dos 210 aos 365 dias de idade (GP3), dos 365 aos 450 dias de idade (GP4), área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS) e espessura de gordura subcutânea na garupa (EGP8) em bovinos da raça Nelore. Além disso, avaliou-se a associação genética entre as características estudadas e, por meio das análises de agrupamento não-hierárquicas, verificou-se quais os grupos de animais mais indicados para atender aos objetivos de seleção, visando contribuir para o processo de seleção do programa de melhoramento da raça Nelore. As estimativas de parâmetros genéticos foram obtidas com base em registros de pedigree de 192.483 animais, nascidos entre 1934 e 2016, registros fenotípicos de 80.114 animais e genótipos de 8.652 animais, os quais foram cedidos pela Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP). Os componentes de (co)variância foram obtidos por meio de metodologia bayesiana via amostragem de Gibbs. Os valores genéticos (EBVs) foram estimados por meio do modelo animal, via equações de modelos mistos (o qual utiliza apenas a matriz A) e os valores genéticos genômicos (GEBVs) por meio da metodologia single-step genomic BLUP (ssGBLUP) (a qual utiliza a matriz H). As tendências genéticas foram estimadas por meio de regressão linear considerando-se a variação dos EBVs e dos GEBVs médios anuais em função do ano de nascimento. As análises multivariadas de agrupamento foram utilizadas para agrupar os animais com base nos EBVs e GEBVs para as características estudadas e explorar o padrão genético em cada agrupamento obtido. Essas análises foram divididas em dois cenários, sendo um cenário considerando somente as fêmeas e outro somente os machos. Utilizando somente a matriz A, construída com base apenas em registros de pedigree, as médias das estimativas de herdabilidade direta ( ) foram 0,14±0,02, 0,18±0,01, 0,14±0,02, 0,12±0,02, 0,37±0,03, 0,17±0,02, 0,28±0,02, respectivamente para GP1, GP2, GP3, GP4, AOL, EGS e EGP8. Com a inclusão de informação genômica, utilizando a matriz H, as estimativas de para GP1, GP2, GP3, GP4, AOL, EGS e EGP8 foram 0,17±0,02, 0,19±0,01, 0,15±0,02, 0,11±0,01, 0,32±0,02, 0,18±0,02 e 0,25±0,02, respectivamente. As correlações genéticas médias obtidas pelos dois métodos foram muito semelhantes. As maiores médias de correlações genéticas obtidas (matriz A/matriz H) foram entre AOL e as características GP1 (0,34±0,10/0,40±0,08), GP2 (0,52±0,06/0,48±0,06) e GP3 (0,37±0,09/0,39±0,07) e entre EGS e EGP8 (0,69±0,05/0,66±0,04). Com a inclusão de informações genômicas, as acurácias dos valores genéticos apresentaram pequeno aumento e maiores mudanças nas acurácias foram observadas para os touros com poucos filhos. Para as tendências genéticas foram obtidos coeficientes angulares significativos (p<0,05) para a maioria das características estudadas, exceto aquela obtida com o uso do GEBV para EGP8. Evidenciou-se o progresso genético para as características estudadas, tanto para os GEBVs como para os EBVs. A quantidade de animais por grupo nos dois cenários indica grande diferença entre grupos com EBV e com GEBV. A inclusão de informação genômica resultou em pequeno aumento nas estimativas de acurácia dos valores genéticos para as características estudadas, em relação aqueles obtidos com base apenas no fenótipo e no pedigree. Touros mais jovens, com poucos filhos, apresentaram maiores acurácias dos GEBVs se comparadas as dos EBVs para GP1, GP4, AOL e EGS, portanto, a seleção desses touros pode favorecer a redução do intervalo de gerações. As características de crescimento, em geral, apresentaram associação genética favorável com as características de carcaça, portanto essa associação poderá ser considerada no programa de melhoramento genético de bovinos de corte da raça Nelore, de modo a auxiliar na seleção para tais características. As análises de agrupamento não-hierárquicas podem ajudar a visualizar as associações genéticas existentes entre as características estudadas, definir quais os animais mais indicados para atender aos objetivos de seleção e observar as diferenças nos valores genéticos dos animais, preditos com e sem o uso de informação genômica.

Traditional selection for economically important quantitative traits is generally performed on the basis of breeding values predicted from phenotypic records of an individual and their relatives. With the availability of genomic information, the prediction of breeding values for complex traits has been vastly improved. The use of genomic prediction may lead to a faster genetic gain compared to that achieved by traditional pedigree-based selection methods. The aim of this study was to evaluate the influence of the inclusion of genomic information on the genetic parameters estimates and the genetic trends for daily weight gain from birth to 120 days of age (GP1), from 120 to 210 days of age (GP2), from 210 to 365 days of age (GP3), from 365 to 450 days of age (GP4), ribeye area (AOL), subcutaneous backfat thickness (EGS) and rump fat (EGP8) in Nelore cattle. Further, the genetic associations between the studied traits were evaluated and, by using non-hierarchical clustering analyses it was verified which groups of animals were most suitable for meeting the selection objectives, in order to contribute to the selection process of the breeding program of the Nelore breed. The genetic parameters estimates were obtained based on the pedigree records of 192,483 animals born between 1934 and 2016, phenotypic records of 80,114 animals and genotypes of 8,652 animals, which were provided by the Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP). The (co) variance components were obtained by Bayesian methodology via Gibbs sampling. The expected breeding values (EBVs) were estimated through the animal model, using the mixed model equations (which uses only matrix A), whereas the genomic EBVs (GEBVs) were obtained through the single-step genomic BLUP methodology (ssGBLUP) (which uses the matrix H). The genetic trends were estimated using a linear regression considering the mean variation of the EBVs and GEBVs according to the year of birth. The multivariate clustering analyses were used for grouping the animals according to the EBVs and GEBVs for the traits studied and to explore the genetic pattern in each grouping obtained. These analyses were divided into two scenarios, one scenario considering only the females and the other only the males. Using the A matrix, built based only on pedigree records, the average estimates for direct heritability ( ) were 0.14±0.02, 0.18±0.01, 0.14±0, 02, 0.12±0.02, 0.37±0.03, 0.17±0.02, 0.28±0.02 for GP1, GP2, GP3, GP4, AOL, EGS and EGP8, respectively. With the inclusion of the genomic information using the H matrix, the average estimates of for GP1, GP2, GP3, GP4, AOL, EGS and EGP8 were 0.17±0.02, 0.19±0.01, 0.15±0.02, 0.11±0.01, 0.32±0.02, 0.18±0.02 and 0.25±0.02, respectively. The average genetic correlations obtained by the two methods were very similar. The highest genetic correlations (matrix A/matrix H) were between AOL and GP1 (0.34±0.10/0.40±0.08), GP2 (0.52±0.06/0.48±0.06) and GP3 (0.37±0.09/0.39±0.07) and between EGS and EGP8 (0.69±0.05/0.66±0.04). Including the genomic information, slight increases in the breeding values accuracy were obtained, with the greater changes in accuracy observed for sires with few offspring. For the genetic trends, significant angular coefficients (p<0.05) were obtained for most of the studied traits, excepting for EGP8 using the GEBV. It was shown that genetic progress for the traits studied was achieved with both GEBVs and EBVs. The number of animals per group in the two scenarios indicates a large difference between groups with EBV and GEBV. The inclusion of the genomic information resulted in a small increase in the breeding values accuracy estimates for the studied traits, in comparison to those obtained with the phenotype and pedigree only based models. Younger sires, with few offspring, presented greater accuracies of the GEBVs when compared to the EBVs for GP1, GP4, AOL, and EGS, so that the selection of these sires may favor the reduction of the generation interval. In general, the growth traits presented a favorable genetic association with the carcass traits, thus, this association could be considered in the Nelore beef cattle breeding program, in order to assist in the selection for such traits. The non-hierarchical clustering analyzes can help to depict the genetic associations between the traits studied, to define the most suitable animals to meet the selection objectives and to observe the differences in the breeding values of the animals predicted with and without using the genomic information.

INCORPORAÇÃO DE INFORMAÇÃO GENÔMICA PARA ESTIMAÇÃO DE PARÂMETROS GENÉTICOS DE PESO CORPORAL E ESCORES VISUAIS NA RAÇA NELORE

Programas de melhoramento genético na bovinocultura de corte são importantes para o progresso genético do rebanho e consequentemente para a economia do país. Os avanços nas tecnologias de genotipagem permitiram estimativas de parâmetros genéticos a partir de informações genômicas por meio dos painéis de marcadores do tipo SNP (single nucleotidepolymorphism). Estes avanços permitem estimativas de parâmetros genéticos, a partir de informações genômicas mais acuradas, acelerando o progresso genético dos rebanhos brasileiros. O objetivo deste trabalhofoi a estimação de parâmetros genéticos, tendência genética e análise de componentes principais de características de peso corporal ao nascer (PN), aos 210 (P210), 365 (P365), e 450 (P450) dias de idade e escores visuais de Estrutura (ES), Precocidade (PS) e Musculosidade (MS), medidas ao sobreano. Os dados utilizados nesse estudo foram obtidos junto ao Programa Nelore Brasil, mantido pela Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP). As estimativas foram obtidas com base em registros de pedigree de 192.483 animais, 80.114 registros fenotípicos e 8.652 registros de animais genotipados. Os valores genéticos preditos (EBV) foram estimados a partir da equação dos modelos mistos e metodologia bayesiana, enquanto os valores genéticos genômicos preditos (GEBV) foram obtidos a partir do melhor preditor genômico linear não-viesado de único estágio(ssGBLUP). As estimativas de herdabilidade (h2) para as características de PN, P210, P365, P450, ES, PS e MS foram respectivamente de 0,81±0,01, 0,38±0,02, 0,34±0,02, 0,35±0,02, 0,31±0,04, 0,38±0,05, 0,39±0,05, com a inclusão de informações de SNPs e para estimativas apenas com informações de pedigree e fenótipos, as h2foram de 0,82±0,01, 0,33±0,02, 0,31±0,02, 0,32±0,02, 0,32±0,05, 0,37±0,05, 0,38±0,05, respectivamente. A análise de componentes principais dos EBVs e GEBVs médios evidenciaram que a utilização de informações genômicas resultou em melhor identificação de variabilidade genética das características, sendo o componente principal 1 responsável por 66,08% da variabilidade utilizando informações de SNPs, enquanto que pela metodologia bayesiana, 64,74%. As tendências genéticas das médias dos EBVs e GEBVs por ano de nascimento dos animais indicaram que houve progresso genético para todas as características deste estudo. Conclui-se que a análise de componentes principais mostrou que a variabilidade das características foi melhor identificada quando se têm as informações de genótipos dos animais. Os resultados das tendências genéticas indicaram que o rebanho estudado está respondendo de forma favorável a seleção em todas as características segundo os critérios adotados pelo programa de melhoramento genético Nelore Brasil.

Genetic improvement programs of Brazilian beef cattle are important for herds genetic progress and consequently for the countrys economy. With the advances in sequencing and genotyping technologies, high density panels with SNP (single nucleotide polymorphism) type polymorphic markers are available on the market. These advances allow genetic parameters estimation from genomic information to be more accurate, leading to a faster genetic progress of Brazilian herds. The aim of this study was the genetic parameters estimation, genetic trend and principal components analysis for body weight measured at birth (PN), 210 (P210), 365 (P365) and 450 (P450) days of age and visual scores of Structure (ES), Precocity (PS) and Musculoskeletal (MS), measured in yearling period (from 12 to 20 months of age). The data were obtained from the Nelore Brazil breeding program maintained by the National Association of Breeders and Researchers (ANCP). The estimates were obtained on pedigree records of 192,483 animals, 80,114 phenotypic records and 8,652 records of genotyped animals. The genomic estimated breeding value (GEBV) and estimated breeding value (GEBV) were obtained from the single step best genomic linear unbiased predictor (ssGBLUP), mixed models equation and bayesianmethodology, respectively. The (co)variance components were estimated from Bayesian methodology.The heritability estimates (h2) for PN, P210, P365, P450, ES, PS and MS were respectively 0.81±0.01. 0.38±0.02. 0.34±0.02. 0.35±0.02. 0.31±0.04. 0.38±0.05. 0.39±0.05, with information from SNPs and for estimates only with pedigree and phenotypes information, h2 were 0.82±0.01. 0.33±0.02. 0.31±0.02. 0.32±0.02. 0.32±0.05. 0.37±0.05. 0.38±0.05, respectively. The principal components analysis for the mean values for EBVs and GEBVs showed that the use of genomic information resulted in a greater capture of variability for the traits. The principal component 1 was responsible for 66.08% of the variability using information from SNPs, whereas for the analysis with only from pedigree and phenotype, 64.74%.The genetic trends for EBVs and GEBVs by year of birth of the animals indicated that there was genetic progress for all traits of this study. It is concluded that all the principal component analysis showed that the genotypes information provides better identification on traits variability. Genetic trends indicated genetic progress made by the Nelore Brazil breeding program for all traits.

Avaliação de desempenho e estimação de Parâmetros genéticos para peso aos 210 e aos 365 dias de idade, em bovinos da raça Purunã

A estimação de parâmetros genéticos para o peso em diferentes idades e metodologias vem sendo muito estudadas. As características de crescimento como, o peso corporal e medidas na fase inicial do desenvolvimento do animal são importantes economicamente para qualquer sistema de produção de bovinos e podem ser usadas como critérios de seleção. O objetivo do presente trabalho foi avaliar o desempenho de bovinos de corte da raça Purunã para diferentes idades, aos 120 dias, ao desmame (210 dias), ao ano e ao sobreano e, propiciar a avaliação genética de bovinos da Raça Purunã com modelo que inclui o desempenho anterior ao da característica em análise, idade da vaca ao parto e grupos de contemporâneos. Os dados foram fornecidos pelo Instituto Agronômico do Paraná (IAPAR), e pela Associação Brasileira dos Criadores de Purunã (ABCP). Foram consideradas características de desempenho: peso ao nascimento, peso maternal (peso aos 120 dias de idade), peso à desmama (peso aos 210 dias), peso ao ano (peso aos 365 dias) e peso ao sobreano (peso aos 540 dias) como informações utilizadas para desempenho em bovinos da raça Purunã. Os dados foram categorizados por sexo e data de nascimento. O intervalo obtido com os desempenhos foi do ano de 1997 até o ano de 2014. Os animais foram criados predominantemente a pasto sem suplementação. Os desempenhos foram avaliados por meio do software estatístico R e SAS 9.0. Os desempenhos foram avaliados por meio de análise unicaracter. Para a realização das estimativas, foi utilizado um modelo animal que inclui efeito genético direto, efeito materno e efeito fixo por meio de grupos de contemporâneos. Verificou-se uma tendência genética positiva e crescente em função dos anos avaliados, demonstrando que houve ganho em todas as características analisadas durante o período avaliado. Foi demonstrado também que todos os caracteres avaliados são suficientes para obter as melhores respostas, quando utilizando programas de melhoramento genético ou uso de seleções, mantendo assim a melhor variabilidade genética dentro do rebanho. Observaram-se influência do dimorfismo sexual, apresentando diferenças entre os desempenhos de machos e fêmeas. Para a avaliação genética, verificou-se variabilidade genética por meio das estimativas dos parâmetros genéticos nos desempenhos avaliados (peso ao desmame - 210 dias de idade) e ao ano (365 dias de idade). O modelo considerando como co-variáveis o desempenho anterior, a idade da vaca ao parto e os grupos de contemporâneos, demonstrou-se eficiente para realização da avaliação genética dos pesos ao desmame e ao ano de bovinos da raça Purunã, apresentando-se como uma alternativa para avaliação genética de bovinos oriundos de linhagens sintéticas.

The estimation of genetic parameters for weight at different ages and methodologies has been very studied. Growth characteristics such as body weight and measures at the initial stage of animal development are economically important for any bovine production system and can be used as selection criteria. To achieve efficiency in screening programs, assessing genetic progress over time is critical to adjust the program. The objective of this study was to verify the performance of Purunã breed cattle at different ages, at 120 days, at weaning (210 days), per year and at the overhead, and to provide genetic evaluation of Purunã breed cattle with a model that includes the performance prior to the characteristic under analysis, the age of the cow at birth and groups of contemporaries. The data were provided by the Agronomic Institute of Paraná - IAPAR, and by the Brazilian Association of Purunã Breeders - ABCP. Performance characteristics (kg), birth weight, maternal weight (weight at 120 days of age), weaning weight (at 210 days), weight at 365 days and weight at 540 days) as information used for performance in Purunã cattle. Data were categorized by year, or sex, or both. The range obtained with the performances was from year 1997 to the year 2014. The animals were raised predominantly on pasture without supplementation. The animals were predominantly grazed without supplementation. The performances were evaluated using statistical software R and SAS 9.0. The performances were evaluated by means of unicaracter analysis. For the estimation, an animal model was used that includes direct genetic effect, maternal effect and fixed effect through groups of contemporaries. There was a positive and increasing genetic tendency in relation to the evaluated years, demonstrating that there was gain in all characteristics analyzed during the period evaluated. It has also been shown that all the characters evaluated are sufficient to obtain the best responses when using breeding programs or use of selections, thus maintaining the best genetic variability within the herd. It was observed the influence of sexual dimorphism, presenting differences between male and female performances. For genetic evaluation, genetic variability was verified by means of estimates of the genetic parameters in the evaluated performances (weaning weight - 210 days of age) and year (365 days of age). The model considering as co-variables the previous performance, the age of the cow at calving and the groups of contemporaries, was efficient to perform the genetic evaluation of weaning weights and year of Purunã cattle, presenting as a alternative for the genetic evaluation of cattle from synthetic strains.

Avaliação genética para peso corporal em um rebanho Nelore / Genetic evaluation for body weight in a Nellore herd

Estimaram-se as herdabilidades para os efeitos genéticos direto e materno e as correlações genéticas entre essas variáveis para os pesos ao desmame (P205), ao ano (P365) e ao sobreano (P550) em um rebanho Nelore do norte de Minas Gerais. O modelo estatístico incluiu os efeitos aditivos direto e materno, os efeitos fixos de grupo de contemporâneos (fazenda, sexo, regime alimentar, estação (seca e água) e ano de nascimento do animal) e o efeito da covariável idade da vaca ao parto (linear e quadrático). Os componentes de variância e os valores genéticos foram estimados utilizando-se o método REML. A tendência genética foi obtida utilizando-se a regressão do valor genético médio anual em relação ao ano de nascimento dos animais. As estimativas de herdabilidade do efeito aditivo direto (H2O) para P205, P365 e P550 foram 0,60, 0,69 e 0,75, respectivamente. Estes coeficientes de H2O são de alta magnitude, indicando que o rebanho apresenta variabilidade genética aditiva relativa e, portanto, espera-se progresso genético considerável utilizando a seleção. Pela análise da tendência genética, verificou-se que houve evolução nos valores genéticos dos animais ao longo dos anos estudados.(AU)

The heritabilities for direct and maternal genetic effects and genetic correlations between these effects were estimated for weight at 205 (P205), 365 (P365), and 550 days (P550) in a Nelore herd in northern Minas Gerais. The statistical model included direct and maternal additive effects, in addition to the fixed effects of contemporary group (farm, gender, diet, season - dry and water -, and year of birth) and the covariate age of cow at calving (linear and quadratic effects). The variance components and genetic values were estimated by REML method. The genetic trend was obtained using the regression of the annual mean genetic value in relation to the year birth. The heritability estimates for the direct additive effect (H2O) for P205, P365, and P550 were equal to 0.60, 0.69, and 0.75, respectively. These coefficients showed high magnitude, indicating that the herd in question presents a great additive genetic variability and therefore it is expected a great progress using genetic selection. By the analysis of genetic trend, it was verified a development in animals genetic values over the years studied.(AU)

Impacto da seleção genética na morfometria e desempenho de tilápias do Nilo

Objetivou-se estimar parâmetros genéticos e fenotípicos, respostas à seleção, bem como tendências genéticas de características corporais e de desempenho e, verificar o avanço genético obtido com o programa de melhoramento genético de tilápias do Nilo, da variedade Tilamax, produzidas em tanques-rede no período de 2008 a 2015. Foram estimados componentes de variâncias para as características corporais e de desempenho pela metodologia Bayesiana, além de tendências genéticas e taxa de endogamia. As herdabilidades foram de média magnitude, com valores entre 0,14 a 0,28. As tendências genéticas evidenciaram incrementos dos valores genéticos no decorrer das gerações, com os maiores ganhos nas características área do corpo, peso à despesca, ganho em peso diário e volume de filé, sendo 1,27, 2,35, 2,29 e 1,90% por geração. A taxa de endogamia apresentou pequeno incremento, contudo o maior incremento foi de 0,36%. Os valores de herdabilidades e variâncias genéticas no decorrer das gerações evidenciaram o progresso genético e resposta à seleção, com principais ganhos nas características área do corpo, peso à despesca, ganho em peso diário e volume de filé, sem reduzir a variabilidade genética e com baixo incremento de endogamia, possibilitando ganhos genéticos nas futuras gerações desta variedade.

This study aimed to estimate the variance and covariance components, genetic parameters and genetic associations of body traits and performance of Nile tilapia, Tilamax variety, grown in cages, and evaluate responses to selection and genetic evolution between generations, as well as verify the impact of selection on traits, when selecting fish based on daily weight gain. The data set used in the first study contained information of male and female tilapia grown in cages in 2011-12, 2013 and 2014. Estimates were made of variances and covariances components, genetic trends for height and tail width, trunk length, body area, harvest weight, daily weight gain and fillet volume by Bayesian Inference. An animal model considering random effects additive, residual and common family was used in additional to the fixed effects of sex and cages, in single-trait and bi-characteristics analysis. Genetic correlations between traits were positive and higher than 0.82, showing increase in traits, mainly body area and fillet volume. The heritabilities of body traits and performance were of moderate magnitude. Genetic gains were increasing to all traits, specially for daily weight gain, harvest weight, body area and fillet volume with values of 4.15, 4.59, 2.30 and 3.65% per generation, respectively. The selection based on daily weight gain resulted in indirect genetic gains in trait over the generations, changing body shape, increasing body weight with trends changing the fillet weight, as well as in the taking advantage of different cuts to the consumer market. The data set used in the second study contained information of male and female tilapia of Tilamax variety, produced in cages from 2008 to 2015. Estimates were made of variances components for total, standard and trunk length; height and width of the body, body area, harvest weight, daily weight gain and fillet volume by Bayesian inference, using single-trait analysis, in additional to genetic trends and rate of inbreeding. The heritabilities were of moderate magnitude with values between 0.14 to 0.28. The genetic trends showed increases of genetic values over the generations, with annual rates gains of 1.440 cm2 in body area, 12.90 g in harvest weight, 0.04 g day-1 in daily weight gain and 3.317 cm3 in fillet volume, representing 1.27, 2.35, 2.29 and 1.90% per generation, respectively. The rate of inbreeding showed small increment, with value of 0.36% for generation eight. The heritabilities values and genetic variances over the generations showed the genetic progress and response to selection, with the main gains in traits body area, harvest weight, daily weight gain and fillet volumes without reducing the genetic variability and with small increment of inbreeding, which enables genetic gains on future generations.

History of registered Gyr breed in Brazilian Northeast: population structure and genetic improvement of growth traits

This paper provides an evaluation of the population structure, phenotype and genetic trends of registered Gyr herd cattle in northeast Brazil. The study provides important baseline information for the management, conservation and potential population expansion of this economically and culturally important cattle breed. Pedigree data were analyzed for individuals born between 1964 and 2006. Body weight values were adjusted to 205 and 365 days of age for animals born between 1978 and 2006. Phenotypic change of zebu Gyr in northeast Brazil is solely due to environmental improvement. However, there is potential for artificial selection for weight gain in young cattle. Effective population size decreased during the 1990s and the average inbreeding coefficient increased during the studied period. An increase of the effective population size of Gyr in northeast Brazil is strongly recommended, along with an increase in the management of the mating process to prevent inbreeding and to maintain the genetic variability of the breed.

Com o intuito de fornecer subsídios para programas de conservação, seleção e expansão da raça Gir no Nordeste do Brasil, objetivou-se avaliar o histórico do rebanho Gir registrado no nordeste brasileiro, com base na sua estrutura populacional e no progresso genético e fenotípico de características de desenvolvimento ponderal. Foram utilizadas informações de pedigree de animais nascidos no período de 1964 a 2006 e dados dos pesos ajustados aos 205 e 365 dias de idade de bovinos nascidos de 1978 a 2006. O progresso genético para a raça no Nordeste foi ocasionado exclusivamente pelo melhoramento ambiental. O tamanho efetivo da população reduziu a partir da década de 90, e o coeficiente de endogamia médio aumentou durante o período estudado. É imprescindível que o tamanho efetivo da raça Gir do nordeste seja ampliado e que haja maior controle de acasalamentos entre indivíduos aparentados, para prevenção da endogamia e conservação da variabilidade genética e viabilidade da raça.

History of registered Gyr breed in Brazilian Northeast: population structure and genetic improvement of growth traits

This paper provides an evaluation of the population structure, phenotype and genetic trends of registered Gyr herd cattle in northeast Brazil. The study provides important baseline information for the management, conservation and potential population expansion of this economically and culturally important cattle breed. Pedigree data were analyzed for individuals born between 1964 and 2006. Body weight values were adjusted to 205 and 365 days of age for animals born between 1978 and 2006. Phenotypic change of zebu Gyr in northeast Brazil is solely due to environmental improvement. However, there is potential for artificial selection for weight gain in young cattle. Effective population size decreased during the 1990s and the average inbreeding coefficient increased during the studied period. An increase of the effective population size of Gyr in northeast Brazil is strongly recommended, along with an increase in the management of the mating process to prevent inbreeding and to maintain the genetic variability of the breed.

Com o intuito de fornecer subsídios para programas de conservação, seleção e expansão da raça Gir no Nordeste do Brasil, objetivou-se avaliar o histórico do rebanho Gir registrado no nordeste brasileiro, com base na sua estrutura populacional e no progresso genético e fenotípico de características de desenvolvimento ponderal. Foram utilizadas informações de pedigree de animais nascidos no período de 1964 a 2006 e dados dos pesos ajustados aos 205 e 365 dias de idade de bovinos nascidos de 1978 a 2006. O progresso genético para a raça no Nordeste foi ocasionado exclusivamente pelo melhoramento ambiental. O tamanho efetivo da população reduziu a partir da década de 90, e o coeficiente de endogamia médio aumentou durante o período estudado. É imprescindível que o tamanho efetivo da raça Gir do nordeste seja ampliado e que haja maior controle de acasalamentos entre indivíduos aparentados, para prevenção da endogamia e conservação da variabilidade genética e viabilidade da raça.

GENETIC ANALYSIS OF FEET AND LEGS IN NELORE CATTLE

O objetivo deste estudo foi estimar os componentes de variância para a característica aprumo em bovinos da raça Nelore, e realizar estudos de associação genômica ampla para identificar possíveis regiões genômicas relacionadas com sua expressão. Os registros de aprumo foram obtidos pela atribuição de escores visuais em dois momentos diferentes: FL1) característica binária medida ao sobreano, com o objetivo de identificar se o animal apresenta (FL1=1) ou não (FL1=0) defeito de aprumo; FL2) escores de aprumo variando de 1 (menos desejável) a 5 (mais desejável), foram designados aos animais top 20% para o índice de seleção adotado pelo programa de melhoramento genético de bovinos de corte PAINT (CRV Lagoa), e foram medidos em torno de 2 a 5 meses após a avaliação de sobreano. As características FL1 e FL2 foram avaliadas em conjunto com peso ao sobreano (YW). Os componentes de variância e covariância e os valores genéticos foram estimados por inferência Bayesiana, por meio de modelo animal bi-característica (três análises: FL1-FL2, YW- FL1 e YW-FL2). O estudo de associação genômica ampla (GWAS) para FL1 e FL2 foi realizado utilizando o método weighted single-step GBLUP, a partir do qual foram estimados os efeitos dos SNPs. As janelas top 10 de 1 Mb que explicam a maior proporção da variância genética foram observadas para cada característica. As médias (erros padrão) a posteriori das estimativas de herdabilidade foram iguais a 0,18 (0,04) e 0,39 (0,07), para FL1 e FL2, respectivamente. A estimativa de correlação genética entre FL1 e FL2 (-0,47) foi de moderada magnitude e negativa, conforme esperado, considerando que o escore de classificação que favorece cada característica corresponde a valores numéricos atribuídos em sentidos opostos. A correlação genética estimada entre FL2 e YW (0,39) sugere que a média do peso ao sobreano da população em estudo não é alta a ponto de causar associação negativa com a qualidade de aprumo. Os valores de tendência genética estimados para FL1 e FL2 (-0,043 e 0,021 desvio-padrão genético/ano, respectivamente) foram favoráveis e indicam que a estratégia de descarte independente para problemas de aprumo está contribuindo para o progresso genético destas características na população em estudo. A proporção da variância explicada pelas janelas top 10 foi igual a 8,96% para FL1 e FL2. Importantes regiões genômicas foram identificadas nos cromossomos: BTA 1, BTA 2, BTA 6, BTA 7, BTA 8, BTA 10 e BTA 14 para FL1; e BTA 1, BTA 7, BTA 10, BTA 11, BTA 18, BTA 20, BTA 22, BTA 28 e BTA 29 para FL2. A janela 64 do BTA 8 e 40 do BTA 22 explicaram a maior proporção da variância para FL1 e FL2, respectivamente. Os cromossomos BTA 2, BTA 8 e BTA 11, apresentaram importantes genes candidatos para aprumo em bovinos Nelore: cytochrome b reductase 1, cathepsin L, interleukin - 1 beta e interleukin - 1, alpha.

The aim of this study was to estimate variance components of two traits associated to feet and legs in Nelore cattle and identify putative genomic regions underlying the expression of these traits through genome-wide association (GWA) analyses. Feet and legs was evaluated by the assignment of visual scores at two different moments: FL1) binary trait measured at yearling (about 550 days of age), aimed to identify whether an animal had defects related to feet and legs (FL1=1) or not (FL1=0); FL2) feet and legs score ranging from 1 (less desirable) to 5 (more desirable) was assigned to the top 20% animals for the selection index adopted by the beef cattle breeding program PAINT (CRV Lagoa), which were measured around 2-5 months after the evaluation of yearling. The FL1 and FL2 traits were evaluated together with yearling weight (YW). The components of variance and covariance and breeding values were estimated by Bayesian inference, using two- trait animal models (three analyses: FL1-FL2, YW-FL1 and YW-FL2). The genome-wide association (GWA) analyses for FL1 and FL2 was performed using the weighted single-step GBLUP method, from which were estimated the SNP effects. Functional annotation was focused on the ten 1Mb windows explaining the largest fraction of the genetic variance for each trait. Posterior means (standard errors) of heritability estimates were equal to 0.18 (0.04) and 0.39 (0.07), for FL1 and FL2, respectively. The estimate of genetic correlation between FL1 and FL2 (-0.47) was of moderate magnitude and negative, as expected considering that the classification score that favors each trait represents numerical values assigned in opposite directions. The genetic correlation estimated between FL2 and YW (0.39) suggests that the average yearling weight of the studied population is currently not high enough to cause a negative association with feet and legs problems. The genetic trends estimated for FL1 and FL2 (-0.043 and 0.021 genetic SD/year, respectively) were favorable and indicated that the independent culling strategy for feet and legs problems is contributing to the genetic progress of these traits, in the population under study. The proportion of variance explained by the top 10 windows was equal to 8.96% for both FL1 and FL2. Highly significant chromosome regions include: BTA 1, BTA 2, BTA 6, BTA 7, BTA 8, BTA 10 and BTA 14 for FL1 and BTA 1, BTA 7, BTA 10, BTA 11, BTA 18, BTA 20, BTA 22, BTA 28 and BTA 29 for FL2. The window 64 of BTA 8 and 40 of BTA 22 explained the highest proportion of variance for FL1 and FL2, respectively. BTA 2, BTA 8 and BTA 11 presented important candidate genes for feet and legs related traits in Nelore cattle: cytochrome b reductase 1, cathepsin L, interleukin - 1 beta and interleukin - 1, alpha.

Estimação de tendência genética para produção de leite na raça Holandesa no estado de Minas Gerais / Estimate of genetic trend for milk production in Holstein in the State of Minas Gerais

Utilizaram-se 75.567 registros de produção de leite, de 40.941 vacas da raça Holandesa, distribuídos em 561 rebanhos e obtidos no período de 1980 a 2002. Valores genéticos de vacas e touros, obtidos por meio de modelo animal, foram usados para estimação de tendências genéticas, considerando-se as quatro trilhas de seleção conectando duas gerações. Estimativas de componentes de variância e valores genéticos previstos foram obtidos por meio do sistema MTDFREML. O modelo de análise incluiu os efeitos fixos de rebanho-ano-estação de parto, grupo genético, idade da vaca ao parto como covariável (efeitos linear e quadrático) e os efeitos aleatórios de animal, permanente de meio e erro. O maior valor de ganho genético anual, 57,7kg/ano, foi para a trilha touros pais de touros no período de 1986 a 1991. Para a trilha vacas mães de touros, os valores foram negativos e para vacas mães de vacas passou de negativo de 1970 a 1985 para 16,9kg/ano, de 1986 a 1999. Quando as trilhas de seleção foram combinadas, o ganho genético anual estimado no período 1970 a 1999 foi 6,71± 3,78kg, correspondendo a 0,1% da média. As estimativas de tendência genética obtidas estão muito aquém do teoricamente possível.(AU)

Production records from 75,567 lactations of 40,941 Holstein cows in 561 herds from 1980 to 2002 were used. Predicted cow and sire breeding values from an animal model were used to estimate genetic trend considering the four selection paths connecting two generations. The variance component estimates and breeding value predictions were obtained using the MTDFREML program package. The model of analysis accounted for the fixed effects of herd-year-season of calving, genetic group, age of calving as covariate (linear and quadratic) and the random effects of animal, permanent environment and error. The greatest annual genetic gain estimate was 57.7kg/yr for the path of sires of bulls from 1986 to 1991. For the path of dams of bulls, estimates were negative and for dams of cows changed from negative from 1970 to 1985 to 16.9kg/yr, from 1986 to 1999. When all paths of selection were combined, estimated annual genetic gain from 1970 to 1999 was 6.71± 3.78kg, corresponding to 0.1% of the average production. Estimates of genetic trend were much less than theoretically possible.(AU)