Prevalence of active HCV infection and genotypic distribution among the general population of district Mardan, Pakistan / Prevalência de infecção HCV ativa a distribuição genotípica entre a população geral do distrito de Mardan, Paquistão

Hepatitis C virus (HCV) is the serious global public health burden of liver disease. Approximately 170 million people in the world are infected with (HCV). In Pakistan, where the disease has high occurrence rate. The present study envisages an up-to-date prevalence of HCV and genotypic distribution in the general population of Mardan District, Khyber Pakhtunkhwa (KP), Pakistan. The blood samples from 6,538 individuals including 3,263 males and 3,275 females were analyzed for hepatitis C surface antigen by Immuno-chromatographic test (ICT), Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), and reverse transcription-polymerase chain reaction (PCR). It was found that 396 (12.13%) out of 3263 individuals contained antibodies in their blood against HCV, while among the different age groups, the highest incidences of HCV antibodies were found in the 31-40 age group (11.01%). The ICT positive samples were further screened by nested PCR to determine the existence of active HCV-RNA. It was identified that 7.11% (3263) of the total population (6538) tested was positive, among which the 461 (14.07%) females possessed antibodies in their blood against HCV. Our data showed total HCV infection in the investigated population was 5.78%. Higher percentage of HCV prevalence was detected in males than females in the age group 31-40 and 41-50. To compare the prevalence of HCV genotypes age-wise in male and female genotype 3a was found most prevalent genotype followed by 1a, 2a and 3b, respectively.

O vírus da hepatite C (HCV) é o grave problema de saúde pública das doenças hepáticas. Aproximadamente 170 milhões de pessoas no mundo estão infectadas com HCV; no Paquistão, a doença tem alto índice de ocorrência. O presente estudo prevê uma prevalência atualizada do HCV e distribuição genotípica na população geral do distrito de Mardan, Khyber Pakhtunkhwa (KP), Paquistão. As amostras de sangue de 6.538 indivíduos, incluindo 3.263 homens e 3.275 mulheres, foram analisadas para o antígeno de superfície da hepatite C por teste imunocromatográfico (ICT), ensaio imunoenzimático (ELISA) e reação em cadeia da polimerase de transcrição reversa (PCR). Verificou-se que 396 (12,13%) de 3.263 indivíduos continham anticorpos no sangue contra o HCV, enquanto entre as diferentes faixas etárias as maiores incidências de anticorpos anti-HCV foram encontradas na faixa etária de 31 a 40 anos (11,01%). As amostras positivas para ICT foram posteriormente rastreadas por nested PCR para determinar a existência de HCV-RNA ativo. Identificou-se que 7,11% (3.263) do total da população (6.538) testada foram positivos, dentre os quais 461 (14,07%) mulheres possuíam anticorpos no sangue contra o HCV. Nossos dados mostraram que a infecção total pelo HCV na população investigada foi de 5,78%. Maior porcentagem de prevalência de HCV foi detectada em homens do que em mulheres nas faixas etárias de 31-40 e 41-50. Para comparar a prevalência de genótipos de HCV com relação à idade no genótipo masculino e feminino 3a foi encontrado o genótipo mais prevalente seguido por 1a, 2a e 3b, respectivamente.

Prevalence of active HCV infection and genotypic distribution among the general population of district Mardan, Pakistan

Abstract Hepatitis C virus (HCV) is the serious global public health burden of liver disease. Approximately 170 million people in the world are infected with (HCV). In Pakistan, where the disease has high occurrence rate. The present study envisages an up-to-date prevalence of HCV and genotypic distribution in the general population of Mardan District, Khyber Pakhtunkhwa (KP), Pakistan. The blood samples from 6,538 individuals including 3,263 males and 3,275 females were analyzed for hepatitis C surface antigen by Immuno-chromatographic test (ICT), Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), and reverse transcription-polymerase chain reaction (PCR). It was found that 396 (12.13%) out of 3263 individuals contained antibodies in their blood against HCV, while among the different age groups, the highest incidences of HCV antibodies were found in the 31-40 age group (11.01%). The ICT positive samples were further screened by nested PCR to determine the existence of active HCV-RNA. It was identified that 7.11% (3263) of the total population (6538) tested was positive, among which the 461 (14.07%) females possessed antibodies in their blood against HCV. Our data showed total HCV infection in the investigated population was 5.78%. Higher percentage of HCV prevalence was detected in males than females in the age group 31-40 and 41-50. To compare the prevalence of HCV genotypes age-wise in male and female genotype 3a was found most prevalent genotype followed by 1a, 2a and 3b, respectively.

Resumo O vírus da hepatite C (HCV) é o grave problema de saúde pública das doenças hepáticas. Aproximadamente 170 milhões de pessoas no mundo estão infectadas com HCV; no Paquistão, a doença tem alto índice de ocorrência. O presente estudo prevê uma prevalência atualizada do HCV e distribuição genotípica na população geral do distrito de Mardan, Khyber Pakhtunkhwa (KP), Paquistão. As amostras de sangue de 6.538 indivíduos, incluindo 3.263 homens e 3.275 mulheres, foram analisadas para o antígeno de superfície da hepatite C por teste imunocromatográfico (ICT), ensaio imunoenzimático (ELISA) e reação em cadeia da polimerase de transcrição reversa (PCR). Verificou-se que 396 (12,13%) de 3.263 indivíduos continham anticorpos no sangue contra o HCV, enquanto entre as diferentes faixas etárias as maiores incidências de anticorpos anti-HCV foram encontradas na faixa etária de 31 a 40 anos (11,01%). As amostras positivas para ICT foram posteriormente rastreadas por nested PCR para determinar a existência de HCV-RNA ativo. Identificou-se que 7,11% (3.263) do total da população (6.538) testada foram positivos, dentre os quais 461 (14,07%) mulheres possuíam anticorpos no sangue contra o HCV. Nossos dados mostraram que a infecção total pelo HCV na população investigada foi de 5,78%. Maior porcentagem de prevalência de HCV foi detectada em homens do que em mulheres nas faixas etárias de 31-40 e 41-50. Para comparar a prevalência de genótipos de HCV com relação à idade no genótipo masculino e feminino 3a foi encontrado o genótipo mais prevalente seguido por 1a, 2a e 3b, respectivamente.

Prevalence of active HCV infection and genotypic distribution among the general population of district Mardan, Pakistan / Prevalência de infecção HCV ativa a distribuição genotípica entre a população geral do distrito de Mardan, Paquistão

Abstract Hepatitis C virus (HCV) is the serious global public health burden of liver disease. Approximately 170 million people in the world are infected with (HCV). In Pakistan, where the disease has high occurrence rate. The present study envisages an up-to-date prevalence of HCV and genotypic distribution in the general population of Mardan District, Khyber Pakhtunkhwa (KP), Pakistan. The blood samples from 6,538 individuals including 3,263 males and 3,275 females were analyzed for hepatitis C surface antigen by Immuno-chromatographic test (ICT), Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), and reverse transcription-polymerase chain reaction (PCR). It was found that 396 (12.13%) out of 3263 individuals contained antibodies in their blood against HCV, while among the different age groups, the highest incidences of HCV antibodies were found in the 31-40 age group (11.01%). The ICT positive samples were further screened by nested PCR to determine the existence of active HCV-RNA. It was identified that 7.11% (3263) of the total population (6538) tested was positive, among which the 461 (14.07%) females possessed antibodies in their blood against HCV. Our data showed total HCV infection in the investigated population was 5.78%. Higher percentage of HCV prevalence was detected in males than females in the age group 31-40 and 41-50. To compare the prevalence of HCV genotypes age-wise in male and female genotype 3a was found most prevalent genotype followed by 1a, 2a and 3b, respectively.

Resumo O vírus da hepatite C (HCV) é o grave problema de saúde pública das doenças hepáticas. Aproximadamente 170 milhões de pessoas no mundo estão infectadas com HCV; no Paquistão, a doença tem alto índice de ocorrência. O presente estudo prevê uma prevalência atualizada do HCV e distribuição genotípica na população geral do distrito de Mardan, Khyber Pakhtunkhwa (KP), Paquistão. As amostras de sangue de 6.538 indivíduos, incluindo 3.263 homens e 3.275 mulheres, foram analisadas para o antígeno de superfície da hepatite C por teste imunocromatográfico (ICT), ensaio imunoenzimático (ELISA) e reação em cadeia da polimerase de transcrição reversa (PCR). Verificou-se que 396 (12,13%) de 3.263 indivíduos continham anticorpos no sangue contra o HCV, enquanto entre as diferentes faixas etárias as maiores incidências de anticorpos anti-HCV foram encontradas na faixa etária de 31 a 40 anos (11,01%). As amostras positivas para ICT foram posteriormente rastreadas por nested PCR para determinar a existência de HCV-RNA ativo. Identificou-se que 7,11% (3.263) do total da população (6.538) testada foram positivos, dentre os quais 461 (14,07%) mulheres possuíam anticorpos no sangue contra o HCV. Nossos dados mostraram que a infecção total pelo HCV na população investigada foi de 5,78%. Maior porcentagem de prevalência de HCV foi detectada em homens do que em mulheres nas faixas etárias de 31-40 e 41-50. Para comparar a prevalência de genótipos de HCV com relação à idade no genótipo masculino e feminino 3a foi encontrado o genótipo mais prevalente seguido por 1a, 2a e 3b, respectivamente.

Prevalence of active HCV infection and genotypic distribution among the general population of district Mardan, Pakistan / Prevalência de infecção HCV ativa a distribuição genotípica entre a população geral do distrito de Mardan, Paquistão

Hepatitis C virus (HCV) is the serious global public health burden of liver disease. Approximately 170 million people in the world are infected with (HCV). In Pakistan, where the disease has high occurrence rate. The present study envisages an up-to-date prevalence of HCV and genotypic distribution in the general population of Mardan District, Khyber Pakhtunkhwa (KP), Pakistan. The blood samples from 6,538 individuals including 3,263 males and 3,275 females were analyzed for hepatitis C surface antigen by Immuno-chromatographic test (ICT), Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), and reverse transcription-polymerase chain reaction (PCR). It was found that 396 (12.13%) out of 3263 individuals contained antibodies in their blood against HCV, while among the different age groups, the highest incidences of HCV antibodies were found in the 31-40 age group (11.01%). The ICT positive samples were further screened by nested PCR to determine the existence of active HCV-RNA. It was identified that 7.11% (3263) of the total population (6538) tested was positive, among which the 461 (14.07%) females possessed antibodies in their blood against HCV. Our data showed total HCV infection in the investigated population was 5.78%. Higher percentage of HCV prevalence was detected in males than females in the age group 31-40 and 41-50. To compare the prevalence of HCV genotypes age-wise in male and female genotype 3a was found most prevalent genotype followed by 1a, 2a and 3b, respectively.(AU)

O vírus da hepatite C (HCV) é o grave problema de saúde pública das doenças hepáticas. Aproximadamente 170 milhões de pessoas no mundo estão infectadas com HCV; no Paquistão, a doença tem alto índice de ocorrência. O presente estudo prevê uma prevalência atualizada do HCV e distribuição genotípica na população geral do distrito de Mardan, Khyber Pakhtunkhwa (KP), Paquistão. As amostras de sangue de 6.538 indivíduos, incluindo 3.263 homens e 3.275 mulheres, foram analisadas para o antígeno de superfície da hepatite C por teste imunocromatográfico (ICT), ensaio imunoenzimático (ELISA) e reação em cadeia da polimerase de transcrição reversa (PCR). Verificou-se que 396 (12,13%) de 3.263 indivíduos continham anticorpos no sangue contra o HCV, enquanto entre as diferentes faixas etárias as maiores incidências de anticorpos anti-HCV foram encontradas na faixa etária de 31 a 40 anos (11,01%). As amostras positivas para ICT foram posteriormente rastreadas por nested PCR para determinar a existência de HCV-RNA ativo. Identificou-se que 7,11% (3.263) do total da população (6.538) testada foram positivos, dentre os quais 461 (14,07%) mulheres possuíam anticorpos no sangue contra o HCV. Nossos dados mostraram que a infecção total pelo HCV na população investigada foi de 5,78%. Maior porcentagem de prevalência de HCV foi detectada em homens do que em mulheres nas faixas etárias de 31-40 e 41-50. Para comparar a prevalência de genótipos de HCV com relação à idade no genótipo masculino e feminino 3a foi encontrado o genótipo mais prevalente seguido por 1a, 2a e 3b, respectivamente.(AU)

Prevalence of gastrointestinal parasite in small ruminants of District Dir Upper Khyber Pakhtunkhwa Province of Pakistan / Prevalência de parasita gastrointestinal em pequenos ruminantes do distrito Upper Dir, da província de Khyber Pakhtunkhwa, no Paquistão

The present research was planned to assess the occurrence of intestinal parasites in small ruminants of Upper Dir of Khyber Pakhtunkhwa Province of Pakistan. For this purpose, the faecal material was collected randomly with gloved fingers directly from the rectum region of sheep and goats and the faecal materials were then put in hygienic plastic bottles with 10% formalin. The overall 315 (n=184 sheep and n= 131 goats) faecal samples were collected out of 315 samples, 281 were found positive for different parasites. Patterns-wise prevalence of GI parasites of the study area was found. Overall Single parasitism 89.20% (281/315) with 94.0% (173/184) in sheep and 82.43% (108/131) in goats. Double parasitic infection in small ruminant recorded in which Fasciola+ Haemonchus. contortus in sheep were found their prevalence was 25.54% (47/184). While in goats, the double parasitic infection in which Haemonchus contortus+Trichuris spp were found and their prevalence were 23.43% (30/131). The species found in the sample of sheep were includes, i.e., Strongyloides papillosus (41.30%), Heamonchus controtus (21.73%), Trichuris ovis (17.39%), and Fasciola hepatica (13.58%), the corresponding value for goat were Strongyloides spp 33.33% (36/108), Haemonchus spp 28.70%, (27/108), Trichuris spp 25.20% (27/184) and Fasciola spp 10.68% (14/184). The sheep of the study area are more infected as compared to goats. This study suggested that gastrointestinal parasites are major health problems of small ruminants in the study area. Therefore, a comprehensive study on species of gastrointestinal parasites circulating in the area, control options, cost-effective strategies and awareness about gastrointestinal parasites among the farmers in the study area should be instituted.

A presente pesquisa foi planejada para avaliar a ocorrência de parasitas intestinais em pequenos ruminantes do distrito Upper Dir, da província de Khyber Pakhtunkhwa, no Paquistão. Para tanto, o material fecal foi coletado aleatoriamente com dedos enluvados diretamente da região do reto de ovelhas e cabras, e os materiais fecais foram colocados em garrafas plásticas higiênicas com formol a 10%. No total, 315 (n = 184 ovelhas e n = 131 cabras) amostras fecais foram coletadas; destas, 281 foram consideradas positivas para diferentes parasitas. A prevalência de padrões de parasitas GI da área de estudo foi encontrada. Parasitismo global único 89,20% (281/315) com 94,0% (173/184) em ovinos e 82,43% (108/131) em cabras. Infecção parasitária dupla em pequenos ruminantes registrada em Fasciola + Haemonchus contortus em ovinos, sua prevalência foi de 25,54% (47/184). Já em caprinos, a dupla infecção parasitária em que Haemonchus contortus + Trichuris spp foram encontrados e sua prevalência foi de 23,43% (30/131). As espécies encontradas na amostra de ovinos foram: Strongyloides papillosus (41,30%), Heamonchus controtus (21,73%), Trichuris ovis (17,39%) e Fasciola hepatica (13,58%), o valor correspondente para cabra foi Strongyloides spp. 33,33% (36/108), Haemonchus spp. 28,70%, (27/108), Trichuris sp 25,20% (27/184) e Fasciola spp. 10,68% (14/184). As ovelhas da área de estudo estão mais infectadas do que as cabras. Este estudo sugeriu que os parasitas gastrointestinais são os principais problemas de saúde dos pequenos ruminantes na área de estudo. Portanto, um estudo abrangente sobre as espécies de parasitas gastrointestinais que circulam na área, opções de controle, estratégias de baixo custo e conscientização sobre parasitas gastrointestinais entre os agricultores na área de estudo deve ser instituído.

Prevalence of gastrointestinal parasite in small ruminants of District Dir Upper Khyber Pakhtunkhwa Province of Pakistan

Abstract The present research was planned to assess the occurrence of intestinal parasites in small ruminants of Upper Dir of Khyber Pakhtunkhwa Province of Pakistan. For this purpose, the faecal material was collected randomly with gloved fingers directly from the rectum region of sheep and goats and the faecal materials were then put in hygienic plastic bottles with 10% formalin. The overall 315 (n=184 sheep and n= 131 goats) faecal samples were collected out of 315 samples, 281 were found positive for different parasites. Patterns-wise prevalence of GI parasites of the study area was found. Overall Single parasitism 89.20% (281/315) with 94.0% (173/184) in sheep and 82.43% (108/131) in goats. Double parasitic infection in small ruminant recorded in which Fasciola+ Haemonchus. contortus in sheep were found their prevalence was 25.54% (47/184). While in goats, the double parasitic infection in which Haemonchus contortus+Trichuris spp were found and their prevalence were 23.43% (30/131). The species found in the sample of sheep were includes, i.e., Strongyloides papillosus (41.30%), Heamonchus controtus (21.73%), Trichuris ovis (17.39%), and Fasciola hepatica (13.58%), the corresponding value for goat were Strongyloides spp 33.33% (36/108), Haemonchus spp 28.70%, (27/108), Trichuris spp 25.20% (27/184) and Fasciola spp 10.68% (14/184). The sheep of the study area are more infected as compared to goats. This study suggested that gastrointestinal parasites are major health problems of small ruminants in the study area. Therefore, a comprehensive study on species of gastrointestinal parasites circulating in the area, control options, cost-effective strategies and awareness about gastrointestinal parasites among the farmers in the study area should be instituted.

Resumo A presente pesquisa foi planejada para avaliar a ocorrência de parasitas intestinais em pequenos ruminantes do distrito Upper Dir, da província de Khyber Pakhtunkhwa, no Paquistão. Para tanto, o material fecal foi coletado aleatoriamente com dedos enluvados diretamente da região do reto de ovelhas e cabras, e os materiais fecais foram colocados em garrafas plásticas higiênicas com formol a 10%. No total, 315 (n = 184 ovelhas e n = 131 cabras) amostras fecais foram coletadas; destas, 281 foram consideradas positivas para diferentes parasitas. A prevalência de padrões de parasitas GI da área de estudo foi encontrada. Parasitismo global único 89,20% (281/315) com 94,0% (173/184) em ovinos e 82,43% (108/131) em cabras. Infecção parasitária dupla em pequenos ruminantes registrada em Fasciola + Haemonchus contortus em ovinos, sua prevalência foi de 25,54% (47/184). Já em caprinos, a dupla infecção parasitária em que Haemonchus contortus + Trichuris spp foram encontrados e sua prevalência foi de 23,43% (30/131). As espécies encontradas na amostra de ovinos foram: Strongyloides papillosus (41,30%), Heamonchus controtus (21,73%), Trichuris ovis (17,39%) e Fasciola hepatica (13,58%), o valor correspondente para cabra foi Strongyloides spp. 33,33% (36/108), Haemonchus spp. 28,70%, (27/108), Trichuris sp 25,20% (27/184) e Fasciola spp. 10,68% (14/184). As ovelhas da área de estudo estão mais infectadas do que as cabras. Este estudo sugeriu que os parasitas gastrointestinais são os principais problemas de saúde dos pequenos ruminantes na área de estudo. Portanto, um estudo abrangente sobre as espécies de parasitas gastrointestinais que circulam na área, opções de controle, estratégias de baixo custo e conscientização sobre parasitas gastrointestinais entre os agricultores na área de estudo deve ser instituído.

Prevalence of gastrointestinal parasitic infection in cows and buffaloes in Lower Dir, Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan

Abstract Gastrointestinal (GI) Parasitic infection is a hot issue for cattle management. There is variation of GI parasites effects in sex, age of cattle, drinking water condition, nutrition, and severity of infection. Studies on prevalence of GI parasites among cattle population in Dir Lower are lacking. A total of 40 farms were selected randomly in six tehsil namely Tehsil Adenzai, Tehsil Timergara, Tehsil Balambat, Tehsil Munda ,Tehsil Lalqala, Tehsil Khall. Freshly cattle fecal samples were collected randomly from the selected farms during March 2018 till December 2018. Out of 314 buffaloes and cattle examined 58.59% (184/314) were positive for eggs, cyst/oocyst of one or more species of GI Parasites. The prevalence of parasitic infection was higher in Buffaloes 63.55% (75/118) as compared to Cow 55.61% (109/196) but the difference was not significant (p>0.05) Entamoeba,spp, Moniezia spp, Haemonchus spp and Coccidian spp were found in this study. The non-treated animals indicated the highest percentage of infection in cow 57.71% (101/175) and buffalo 68.13% (62/91).GI parasite prevalence in female animal were higher female cow 62.58% (87/139) and female buffalo 77.33% (58/75) as compared to male. But the difference is non-significant (p> 0.05) Yearling calves had the lower rate of GI parasitic infection than adults. Future investigations are necessary to evaluate the economic loss due to GI parasites in cattles.

Resumo A infecção gastrointestinal (GI) parasitária é um assunto importante para o manejo do gado. Existem variações nos efeitos dos parasitas GI quanto a sexo, idade do gado, condição da água potável, nutrição e gravidade da infecção. Faltam estudos sobre a prevalência de parasitas GI entre a população de gado em Lower Dir. Um total de 40 fazendas foi selecionado aleatoriamente em seis tehsil, nomeadamente Tehsil Adenzai, Tehsil Timergara, Tehsil Balambat, Tehsil Munda, Tehsil Lalqala, Tehsil Khall. Amostras fecais de gado fresco foram coletadas aleatoriamente das fazendas selecionadas de março de 2018 até dezembro de 2018. Dos 314 búfalos e bovinos examinados, 58,59% (184/314) foram positivos para ovos, cisto/oocisto de uma ou mais espécies de parasitas GI. A prevalência de infecção parasitária foi maior em Buffaloes 63,55% (75/118) em comparação com vaca 55,61% (109/196), mas a diferença não foi significativa (p > 0,05). Entamoeba spp, Moniezia spp, Haemonchus spp e Coccidian spp foram encontrados neste estudo. Os animais não tratados indicaram a maior porcentagem de infecção em vacas 57,71% (101/175) e búfalos 68,13% (62/91). A prevalência do parasita GI em fêmeas foi maior em vacas fêmeas 62,58% (87/139) e búfalas 77,33% (58/75) em comparação ao masculino. Mas a diferença não é significativa (p > 0,05). A modelagem linear geral mostrou que o tratamento do animal estava significativamente relacionado com a prevalência de parasitas GI. Bezerros de um ano tiveram a maior taxa de infecção parasitária gastrointestinal. Futuras investigações são necessárias para avaliar a perda econômica devido aos parasitas GI em bovinos.

Prevalence of gastrointestinal parasite in small ruminants of District Dir Upper Khyber Pakhtunkhwa Province of Pakistan / Prevalência de parasita gastrointestinal em pequenos ruminantes do distrito Upper Dir, da província de Khyber Pakhtunkhwa, no Paquistão

Abstract The present research was planned to assess the occurrence of intestinal parasites in small ruminants of Upper Dir of Khyber Pakhtunkhwa Province of Pakistan. For this purpose, the faecal material was collected randomly with gloved fingers directly from the rectum region of sheep and goats and the faecal materials were then put in hygienic plastic bottles with 10% formalin. The overall 315 (n=184 sheep and n= 131 goats) faecal samples were collected out of 315 samples, 281 were found positive for different parasites. Patterns-wise prevalence of GI parasites of the study area was found. Overall Single parasitism 89.20% (281/315) with 94.0% (173/184) in sheep and 82.43% (108/131) in goats. Double parasitic infection in small ruminant recorded in which Fasciola+ Haemonchus. contortus in sheep were found their prevalence was 25.54% (47/184). While in goats, the double parasitic infection in which Haemonchus contortus+Trichuris spp were found and their prevalence were 23.43% (30/131). The species found in the sample of sheep were includes, i.e., Strongyloides papillosus (41.30%), Heamonchus controtus (21.73%), Trichuris ovis (17.39%), and Fasciola hepatica (13.58%), the corresponding value for goat were Strongyloides spp 33.33% (36/108), Haemonchus spp 28.70%, (27/108), Trichuris spp 25.20% (27/184) and Fasciola spp 10.68% (14/184). The sheep of the study area are more infected as compared to goats. This study suggested that gastrointestinal parasites are major health problems of small ruminants in the study area. Therefore, a comprehensive study on species of gastrointestinal parasites circulating in the area, control options, cost-effective strategies and awareness about gastrointestinal parasites among the farmers in the study area should be instituted.

Resumo A presente pesquisa foi planejada para avaliar a ocorrência de parasitas intestinais em pequenos ruminantes do distrito Upper Dir, da província de Khyber Pakhtunkhwa, no Paquistão. Para tanto, o material fecal foi coletado aleatoriamente com dedos enluvados diretamente da região do reto de ovelhas e cabras, e os materiais fecais foram colocados em garrafas plásticas higiênicas com formol a 10%. No total, 315 (n = 184 ovelhas e n = 131 cabras) amostras fecais foram coletadas; destas, 281 foram consideradas positivas para diferentes parasitas. A prevalência de padrões de parasitas GI da área de estudo foi encontrada. Parasitismo global único 89,20% (281/315) com 94,0% (173/184) em ovinos e 82,43% (108/131) em cabras. Infecção parasitária dupla em pequenos ruminantes registrada em Fasciola + Haemonchus contortus em ovinos, sua prevalência foi de 25,54% (47/184). Já em caprinos, a dupla infecção parasitária em que Haemonchus contortus + Trichuris spp foram encontrados e sua prevalência foi de 23,43% (30/131). As espécies encontradas na amostra de ovinos foram: Strongyloides papillosus (41,30%), Heamonchus controtus (21,73%), Trichuris ovis (17,39%) e Fasciola hepatica (13,58%), o valor correspondente para cabra foi Strongyloides spp. 33,33% (36/108), Haemonchus spp. 28,70%, (27/108), Trichuris sp 25,20% (27/184) e Fasciola spp. 10,68% (14/184). As ovelhas da área de estudo estão mais infectadas do que as cabras. Este estudo sugeriu que os parasitas gastrointestinais são os principais problemas de saúde dos pequenos ruminantes na área de estudo. Portanto, um estudo abrangente sobre as espécies de parasitas gastrointestinais que circulam na área, opções de controle, estratégias de baixo custo e conscientização sobre parasitas gastrointestinais entre os agricultores na área de estudo deve ser instituído.

Prevalence of gastrointestinal parasitic infection in cows and buffaloes in Lower Dir, Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan / Prevalência de infecções parasitárias gastrointestinais em vacas e búfalos em Lower Dir, Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão

Gastrointestinal (GI) Parasitic infection is a hot issue for cattle management. There is variation of GI parasites effects in sex, age of cattle, drinking water condition, nutrition, and severity of infection. Studies on prevalence of GI parasites among cattle population in Dir Lower are lacking. A total of 40 farms were selected randomly in six tehsil namely Tehsil Adenzai, Tehsil Timergara, Tehsil Balambat, Tehsil Munda ,Tehsil Lalqala, Tehsil Khall. Freshly cattle fecal samples were collected randomly from the selected farms during March 2018 till December 2018. Out of 314 buffaloes and cattle examined 58.59% (184/314) were positive for eggs, cyst/oocyst of one or more species of GI Parasites. The prevalence of parasitic infection was higher in Buffaloes 63.55% (75/118) as compared to Cow 55.61% (109/196) but the difference was not significant (p>0.05) Entamoeba,spp, Moniezia spp, Haemonchus spp and Coccidian spp were found in this study. The non-treated animals indicated the highest percentage of infection in cow 57.71% (101/175) and buffalo 68.13% (62/91).GI parasite prevalence in female animal were higher female cow 62.58% (87/139) and female buffalo 77.33% (58/75) as compared to male. But the difference is non-significant (p> 0.05) Yearling calves had the lower rate of GI parasitic infection than adults. Future investigations are necessary to evaluate the economic loss due to GI parasites in cattle's.

A infecção gastrointestinal (GI) parasitária é um assunto importante para o manejo do gado. Existem variações nos efeitos dos parasitas GI quanto a sexo, idade do gado, condição da água potável, nutrição e gravidade da infecção. Faltam estudos sobre a prevalência de parasitas GI entre a população de gado em Lower Dir. Um total de 40 fazendas foi selecionado aleatoriamente em seis tehsil, nomeadamente Tehsil Adenzai, Tehsil Timergara, Tehsil Balambat, Tehsil Munda, Tehsil Lalqala, Tehsil Khall. Amostras fecais de gado fresco foram coletadas aleatoriamente das fazendas selecionadas de março de 2018 até dezembro de 2018. Dos 314 búfalos e bovinos examinados, 58,59% (184/314) foram positivos para ovos, cisto/oocisto de uma ou mais espécies de parasitas GI. A prevalência de infecção parasitária foi maior em Buffaloes 63,55% (75/118) em comparação com vaca 55,61% (109/196), mas a diferença não foi significativa (p > 0,05). Entamoeba spp, Moniezia spp, Haemonchus spp e Coccidian spp foram encontrados neste estudo. Os animais não tratados indicaram a maior porcentagem de infecção em vacas 57,71% (101/175) e búfalos 68,13% (62/91). A prevalência do parasita GI em fêmeas foi maior em vacas fêmeas 62,58% (87/139) e búfalas 77,33% (58/75) em comparação ao masculino. Mas a diferença não é significativa (p > 0,05). A modelagem linear geral mostrou que o tratamento do animal estava significativamente relacionado com a prevalência de parasitas GI. Bezerros de um ano tiveram a maior taxa de infecção parasitária gastrointestinal. Futuras investigações são necessárias para avaliar a perda econômica devido aos parasitas GI em bovinos.

Prevalence of gastrointestinal parasite in small ruminants of District Dir Upper Khyber Pakhtunkhwa Province of Pakistan / Prevalência de parasita gastrointestinal em pequenos ruminantes do distrito Upper Dir, da província de Khyber Pakhtunkhwa, no Paquistão

The present research was planned to assess the occurrence of intestinal parasites in small ruminants of Upper Dir of Khyber Pakhtunkhwa Province of Pakistan. For this purpose, the faecal material was collected randomly with gloved fingers directly from the rectum region of sheep and goats and the faecal materials were then put in hygienic plastic bottles with 10% formalin. The overall 315 (n=184 sheep and n= 131 goats) faecal samples were collected out of 315 samples, 281 were found positive for different parasites. Patterns-wise prevalence of GI parasites of the study area was found. Overall Single parasitism 89.20% (281/315) with 94.0% (173/184) in sheep and 82.43% (108/131) in goats. Double parasitic infection in small ruminant recorded in which Fasciola+ Haemonchus. contortus in sheep were found their prevalence was 25.54% (47/184). While in goats, the double parasitic infection in which Haemonchus contortus+Trichuris spp were found and their prevalence were 23.43% (30/131). The species found in the sample of sheep were includes, i.e., Strongyloides papillosus (41.30%), Heamonchus controtus (21.73%), Trichuris ovis (17.39%), and Fasciola hepatica (13.58%), the corresponding value for goat were Strongyloides spp 33.33% (36/108), Haemonchus spp 28.70%, (27/108), Trichuris spp 25.20% (27/184) and Fasciola spp 10.68% (14/184). The sheep of the study area are more infected as compared to goats. This study suggested that gastrointestinal parasites are major health problems of small ruminants in the study area. Therefore, a comprehensive study on species of gastrointestinal parasites circulating in the area, control options, cost-effective strategies and awareness about gastrointestinal parasites among the farmers in the study area should be instituted.(AU)

A presente pesquisa foi planejada para avaliar a ocorrência de parasitas intestinais em pequenos ruminantes do distrito Upper Dir, da província de Khyber Pakhtunkhwa, no Paquistão. Para tanto, o material fecal foi coletado aleatoriamente com dedos enluvados diretamente da região do reto de ovelhas e cabras, e os materiais fecais foram colocados em garrafas plásticas higiênicas com formol a 10%. No total, 315 (n = 184 ovelhas e n = 131 cabras) amostras fecais foram coletadas; destas, 281 foram consideradas positivas para diferentes parasitas. A prevalência de padrões de parasitas GI da área de estudo foi encontrada. Parasitismo global único 89,20% (281/315) com 94,0% (173/184) em ovinos e 82,43% (108/131) em cabras. Infecção parasitária dupla em pequenos ruminantes registrada em Fasciola + Haemonchus contortus em ovinos, sua prevalência foi de 25,54% (47/184). Já em caprinos, a dupla infecção parasitária em que Haemonchus contortus + Trichuris spp foram encontrados e sua prevalência foi de 23,43% (30/131). As espécies encontradas na amostra de ovinos foram: Strongyloides papillosus (41,30%), Heamonchus controtus (21,73%), Trichuris ovis (17,39%) e Fasciola hepatica (13,58%), o valor correspondente para cabra foi Strongyloides spp. 33,33% (36/108), Haemonchus spp. 28,70%, (27/108), Trichuris sp 25,20% (27/184) e Fasciola spp. 10,68% (14/184). As ovelhas da área de estudo estão mais infectadas do que as cabras. Este estudo sugeriu que os parasitas gastrointestinais são os principais problemas de saúde dos pequenos ruminantes na área de estudo. Portanto, um estudo abrangente sobre as espécies de parasitas gastrointestinais que circulam na área, opções de controle, estratégias de baixo custo e conscientização sobre parasitas gastrointestinais entre os agricultores na área de estudo deve ser instituído.(AU)

Prevalence and diversity of ectoparasites in Wild Rock Pigeon (Columba livia) in Punjab region, Pakistan / Prevalência e diversidade de ectoparasitas em Wild Rock Pigeon (Columba livia) na região de Punjab, Paquistão

The current study was carried out to estimate the prevalence and diversity of ectoparasites in rock pigeons in different regions of Punjab, Pakistan. A total of 120 birds were captured from March 2017 to February 2019. The ectoparasites were collected by standard procedures and preserved in 70% ethanol containing one drop of glycerin. Data related to age, health status, sex, type of area, sampling location and season were collected using a standardized form. Ectoparasites were identified based on morphological characteristics by using identification keys. Ninety-six (80%) birds were infested with ectoparasites. A total of seven families and thirteen species of different ectoparasites were observed. Mainly, seven species of lice, two species of flies, one species of tick and three species of mites were recovered from infested birds. The female pigeons were more often infested (89.02%) than male pigeons (60.52%). The prevalence was found higher during summer (100%) as compared to other seasons. The infestation rate was higher in Industrial area (97.50%) as compared to other regions. The highest prevalence of ectoparasites (100%) was recorded from Sargodha district. There was significant (P < 0.05) variation among number of ectoparasites on wing, chest, tail and neck within age groups, seasons and ecological zones. The occurrence of parasites in relation to area, age, health status, sex and season were significant. The infestation rate of parasites in rock pigeon is high in different districts of Punjab. It is recommended that these wild birds infested with multiple species of ectoparasites could be the potential source of infestations in domesticated birds if they come in contact with them. The contact of domesticated birds should be prevented from wild birds to minimize the chance of cross species transmission of ectoparasites.

O presente estudo foi realizado para estimar a prevalência e diversidade de ectoparasitas em pombos-das-rochas em diferentes regiões de Punjab, Paquistão. Um total de 120 aves foram capturadas de março de 2017 a fevereiro de 2019. Os ectoparasitas foram coletados por procedimentos padrão e preservados em etanol 70% contendo uma gota de glicerina. Os dados relativos à idade, estado de saúde, sexo, tipo de área, local de amostragem e época do ano foram coletados em formulário padronizado. Os ectoparasitas foram identificados com base nas características morfológicas por meio de chaves de identificação. Noventa e seis (80%) aves estavam infestadas com ectoparasitas. Um total de sete famílias e treze espécies de diferentes ectoparasitas foram observados. Principalmente, sete espécies de piolhos, duas espécies de moscas, uma espécie de carrapato e três espécies de ácaros foram recuperadas de aves infestadas. Os pombos fêmeas foram infestados mais frequentemente (89,02%) do que os pombos machos (60,52%). A prevalência encontrada foi maior no verão (100%) em comparação com as outras estações. A taxa de infestação foi maior na área Industrial (97,50%) em relação às demais regiões. A maior prevalência de ectoparasitas (100%) foi registrada no distrito de Sargodha. Houve variação significativa (P <0,05) entre o número de ectoparasitas na asa, tórax, cauda e pescoço dentro das faixas etárias, estações do ano e zonas ecológicas. A ocorrência de parasitas em relação à área, idade, estado de saúde, sexo e estação do ano foi significativa. A taxa de infestação de parasitas em pombo-correio é alta em diferentes distritos de Punjab. Recomenda-se que essas aves selvagens infestadas com várias espécies de ectoparasitas possam ser a fonte potencial de infestações em aves domesticadas se entrarem em contato com elas. O contato de aves domesticadas deve ser evitado com aves selvagens para minimizar a chance de transmissão cruzada de ectoparasitas.

Isolation and characterization of bacteria residing in the oral, gut, and fecal samples of different pheasant species / Isolamento e caracterização de bactérias residentes nas amostras orais, intestinais e fecais de diferentes espécies de faisão

There is a paucity of research conducted on microbial prevalence in pheasants. The microbiota of captive birds has zoonotic significance and must be characterize. Present study is therefore planned to assess the microbiota from oral, fecal and gut content of captive avian species. It will be helpful in characterization of harmful microbes. Different samples taken from oral, gut and feces of ring-necked pheasants (Phasianus colchicus), green pheasants (Phasianus versicolor), golden pheasant (Chrysolophus pictus) and silver pheasant (Lophura nycthemera). Samples were collected, diluted, and inoculated onto different agar plates (MacConkey, SS agar, MSA and nutrient agar) for cultivation of bacterial species. Colonies of E.coli, Staphylococcus spp. Brachyspira spp. and Campylobacter spp were observed based on colony morphology. Colony forming unit showed E. coli as frequently found bacteria in fecal, oral and gut contents of all the above pheasants. The overall significance difference was found among bacterial species of golden pheasants, green pheasant, ring-necked pheasant, and silver pheasants. It was concluded that E.coli is predominant isolated from heathy pheasants followed by Campylobacter, Staphylococcus and Brachyspira.

Há uma escassez de pesquisas realizadas sobre a prevalência microbiana em faisões. A microbiota de aves em cativeiro tem significado zoonótico e deve ser caracterizada. O presente estudo está, portanto, planejado para avaliar a microbiota do conteúdo oral, fecal e intestinal de espécies aviárias em cativeiro. Será útil na caracterização de micróbios nocivos. Diferentes amostras retiradas da boca, intestino e fezes de faisões de pescoço redondo (Phasianus colchicus), faisões verdes (Phasianus versicolor), faisões dourados (Chrysolophus pictus) e faisão prateado (Lophura nycthemera). As amostras foram coletadas, diluídas e inoculadas em diferentes placas de ágar (MacConkey, ágar SS, MSA e ágar nutriente) para o cultivo de espécies bacterianas. Colônias de E. coli, Staphylococcus spp., Brachyspira spp. e Campylobacter spp foram observados com base na morfologia da colônia. A unidade formadora de colônia mostrou E. coli como bactéria frequentemente encontrada no conteúdo fecal, oral e intestinal de todos os faisões acima. A diferença de significância geral foi encontrada entre as espécies bacterianas de faisões dourados, faisões verdes, faisões de pescoço anelado e faisões prateados. Verificou-se que a E.coli é predominantemente isolada de faisões saudáveis, seguida por Campylobacter, Staphylococcus e Brachyspira.

Molecular detection and prevalence of Rotavirus with acute gastroenteritis among the children of rural and urban areas / Detecção molecular e prevalência de rotavírus com gastroenterite aguda entre as crianças de áreas rurais e urbanas

Rotavirus is the main infective agent of acute gastroenteritis (AGE) in children under the age of five years and causing significant morbidity as well as mortality throughout the world. The study was carried out to detect the prevalence rate, genotypes strain and risk factors of Rotavirus among the children of rural and urban areas of district Bannu Khyber Pakhtunkhwa Pakistan. A total of 180 stool samples were collected from children under the age of 5 years from two major hospitals of Bannu from January to December (2015). The samples were analyzed by Reverse-transcriptase Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) for the detection of Rotavirus, positive samples were further processed for genotyping (G and P type) through specific PCR. Of the total, 41 (23%) samples were positive for Rotavirus. The most prevalent G genotypes found were: G3, G8, G9 (each 29%), followed by G10 (15%), and G11 (10%). Whereas the prevalent P genotypes were: P-8 (25%), P-4 and P-10 (each 20%), P-9 (15%), followed by P-6 and P-11 (each 10%). Moreover, Rotavirus infection was more prevalent in summer (23.73%) and winter (22.7%) than spring (20%) and autumn (21.4%). Rotavirus infection exhibited high frequency in June (14%), October (8%) and November (6%). It is concluded that Rotavirus is more prevalent in children and various genotypes (G and P) of Rotavirus are present in the study area. Lack of studies, awareness and rarer testing of Rotavirus are the principal reasons of virus prevalence in district Bannu, Pakistan.

O rotavírus é o principal agente infeccioso da gastroenterite aguda (AGE) em crianças menores de 5 anos e causa de morbidade e mortalidade significativas em todo o mundo. O estudo foi realizado para detectar a taxa de prevalência, cepa de genótipos e fatores de risco de rotavírus entre as crianças de áreas rurais e urbanas do distrito de Bannu Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão. Um total de 180 amostras de fezes foi coletada de crianças menores de 5 anos de dois grandes hospitais de Bannu de janeiro a dezembro (2015). As amostras foram analisadas por reação em cadeia da polimerase transcriptase reversa (RT-PCR) para detecção de rotavírus; as amostras positivas foram posteriormente processadas para genotipagem (tipo G e P) através de PCR específica. Do total, 41 (23%) amostras foram positivas para rotavírus. Os genótipos G mais prevalentes encontrados foram: G3, G8, G9 (cada 29%), seguidos de G10 (15%) e G11 (10%). Considerando que os genótipos P prevalentes foram: P-8 (25%), P-4 e P-10 (cada 20%), P-9 (15%), seguido por P-6 e P-11 (cada 10%). Além disso, a infecção por rotavírus foi mais prevalente no verão (23,73%) e inverno (22,7%) do que na primavera (20%) e no outono (21,4%). A infecção por rotavírus apresentou alta frequência em junho (14%), outubro (8%) e novembro (6%). Conclui-se que o rotavírus é mais prevalente em crianças e vários genótipos (G e P) do rotavírus estão presentes na área de estudo. A falta de estudos, conhecimento e testes mais raros de rotavírus são as principais razões da prevalência do vírus no distrito de Bannu, Paquistão.

Prevalence and diversity of ectoparasites in Wild Rock Pigeon (Columba livia) in Punjab region, Pakistan

Abstract The current study was carried out to estimate the prevalence and diversity of ectoparasites in rock pigeons in different regions of Punjab, Pakistan. A total of 120 birds were captured from March 2017 to February 2019. The ectoparasites were collected by standard procedures and preserved in 70% ethanol containing one drop of glycerin. Data related to age, health status, sex, type of area, sampling location and season were collected using a standardized form. Ectoparasites were identified based on morphological characteristics by using identification keys. Ninety-six (80%) birds were infested with ectoparasites. A total of seven families and thirteen species of different ectoparasites were observed. Mainly, seven species of lice, two species of flies, one species of tick and three species of mites were recovered from infested birds. The female pigeons were more often infested (89.02%) than male pigeons (60.52%). The prevalence was found higher during summer (100%) as compared to other seasons. The infestation rate was higher in Industrial area (97.50%) as compared to other regions. The highest prevalence of ectoparasites (100%) was recorded from Sargodha district. There was significant (P 0.05) variation among number of ectoparasites on wing, chest, tail and neck within age groups, seasons and ecological zones. The occurrence of parasites in relation to area, age, health status, sex and season were significant. The infestation rate of parasites in rock pigeon is high in different districts of Punjab. It is recommended that these wild birds infested with multiple species of ectoparasites could be the potential source of infestations in domesticated birds if they come in contact with them. The contact of domesticated birds should be prevented from wild birds to minimize the chance of cross species transmission of ectoparasites.

Resumo O presente estudo foi realizado para estimar a prevalência e diversidade de ectoparasitas em pombos-das-rochas em diferentes regiões de Punjab, Paquistão. Um total de 120 aves foram capturadas de março de 2017 a fevereiro de 2019. Os ectoparasitas foram coletados por procedimentos padrão e preservados em etanol 70% contendo uma gota de glicerina. Os dados relativos à idade, estado de saúde, sexo, tipo de área, local de amostragem e época do ano foram coletados em formulário padronizado. Os ectoparasitas foram identificados com base nas características morfológicas por meio de chaves de identificação. Noventa e seis (80%) aves estavam infestadas com ectoparasitas. Um total de sete famílias e treze espécies de diferentes ectoparasitas foram observados. Principalmente, sete espécies de piolhos, duas espécies de moscas, uma espécie de carrapato e três espécies de ácaros foram recuperadas de aves infestadas. Os pombos fêmeas foram infestados mais frequentemente (89,02%) do que os pombos machos (60,52%). A prevalência encontrada foi maior no verão (100%) em comparação com as outras estações. A taxa de infestação foi maior na área Industrial (97,50%) em relação às demais regiões. A maior prevalência de ectoparasitas (100%) foi registrada no distrito de Sargodha. Houve variação significativa (P 0,05) entre o número de ectoparasitas na asa, tórax, cauda e pescoço dentro das faixas etárias, estações do ano e zonas ecológicas. A ocorrência de parasitas em relação à área, idade, estado de saúde, sexo e estação do ano foi significativa. A taxa de infestação de parasitas em pombo-correio é alta em diferentes distritos de Punjab. Recomenda-se que essas aves selvagens infestadas com várias espécies de ectoparasitas possam ser a fonte potencial de infestações em aves domesticadas se entrarem em contato com elas. O contato de aves domesticadas deve ser evitado com aves selvagens para minimizar a chance de transmissão cruzada de ectoparasitas.

Isolation and characterization of bacteria residing in the oral, gut, and fecal samples of different pheasant species

Abstract There is a paucity of research conducted on microbial prevalence in pheasants. The microbiota of captive birds has zoonotic significance and must be characterize. Present study is therefore planned to assess the microbiota from oral, fecal and gut content of captive avian species. It will be helpful in characterization of harmful microbes. Different samples taken from oral, gut and feces of ring-necked pheasants (Phasianus colchicus), green pheasants (Phasianus versicolor), golden pheasant (Chrysolophus pictus) and silver pheasant (Lophura nycthemera). Samples were collected, diluted, and inoculated onto different agar plates (MacConkey, SS agar, MSA and nutrient agar) for cultivation of bacterial species. Colonies of E.coli, Staphylococcus spp. Brachyspira spp. and Campylobacter spp were observed based on colony morphology. Colony forming unit showed E. coli as frequently found bacteria in fecal, oral and gut contents of all the above pheasants. The overall significance difference was found among bacterial species of golden pheasants, green pheasant, ring-necked pheasant, and silver pheasants. It was concluded that E.coli is predominant isolated from heathy pheasants followed by Campylobacter, Staphylococcus and Brachyspira.

Resumo Há uma escassez de pesquisas realizadas sobre a prevalência microbiana em faisões. A microbiota de aves em cativeiro tem significado zoonótico e deve ser caracterizada. O presente estudo está, portanto, planejado para avaliar a microbiota do conteúdo oral, fecal e intestinal de espécies aviárias em cativeiro. Será útil na caracterização de micróbios nocivos. Diferentes amostras retiradas da boca, intestino e fezes de faisões de pescoço redondo (Phasianus colchicus), faisões verdes (Phasianus versicolor), faisões dourados (Chrysolophus pictus) e faisão prateado (Lophura nycthemera). As amostras foram coletadas, diluídas e inoculadas em diferentes placas de ágar (MacConkey, ágar SS, MSA e ágar nutriente) para o cultivo de espécies bacterianas. Colônias de E. coli, Staphylococcus spp., Brachyspira spp. e Campylobacter spp foram observados com base na morfologia da colônia. A unidade formadora de colônia mostrou E. coli como bactéria frequentemente encontrada no conteúdo fecal, oral e intestinal de todos os faisões acima. A diferença de significância geral foi encontrada entre as espécies bacterianas de faisões dourados, faisões verdes, faisões de pescoço anelado e faisões prateados. Verificou-se que a E.coli é predominantemente isolada de faisões saudáveis, seguida por Campylobacter, Staphylococcus e Brachyspira.

Molecular detection and prevalence of Rotavirus with acute gastroenteritis among the children of rural and urban areas

Abstract Rotavirus is the main infective agent of acute gastroenteritis (AGE) in children under the age of five years and causing significant morbidity as well as mortality throughout the world. The study was carried out to detect the prevalence rate, genotypes strain and risk factors of Rotavirus among the children of rural and urban areas of district Bannu Khyber Pakhtunkhwa Pakistan. A total of 180 stool samples were collected from children under the age of 5 years from two major hospitals of Bannu from January to December (2015). The samples were analyzed by Reverse-transcriptase Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) for the detection of Rotavirus, positive samples were further processed for genotyping (G and P type) through specific PCR. Of the total, 41 (23%) samples were positive for Rotavirus. The most prevalent G genotypes found were: G3, G8, G9 (each 29%), followed by G10 (15%), and G11 (10%). Whereas the prevalent P genotypes were: P-8 (25%), P-4 and P-10 (each 20%), P-9 (15%), followed by P-6 and P-11 (each 10%). Moreover, Rotavirus infection was more prevalent in summer (23.73%) and winter (22.7%) than spring (20%) and autumn (21.4%). Rotavirus infection exhibited high frequency in June (14%), October (8%) and November (6%). It is concluded that Rotavirus is more prevalent in children and various genotypes (G and P) of Rotavirus are present in the study area. Lack of studies, awareness and rarer testing of Rotavirus are the principal reasons of virus prevalence in district Bannu, Pakistan.

Resumo O rotavírus é o principal agente infeccioso da gastroenterite aguda (AGE) em crianças menores de 5 anos e causa de morbidade e mortalidade significativas em todo o mundo. O estudo foi realizado para detectar a taxa de prevalência, cepa de genótipos e fatores de risco de rotavírus entre as crianças de áreas rurais e urbanas do distrito de Bannu Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão. Um total de 180 amostras de fezes foi coletada de crianças menores de 5 anos de dois grandes hospitais de Bannu de janeiro a dezembro (2015). As amostras foram analisadas por reação em cadeia da polimerase transcriptase reversa (RT-PCR) para detecção de rotavírus; as amostras positivas foram posteriormente processadas para genotipagem (tipo G e P) através de PCR específica. Do total, 41 (23%) amostras foram positivas para rotavírus. Os genótipos G mais prevalentes encontrados foram: G3, G8, G9 (cada 29%), seguidos de G10 (15%) e G11 (10%). Considerando que os genótipos P prevalentes foram: P-8 (25%), P-4 e P-10 (cada 20%), P-9 (15%), seguido por P-6 e P-11 (cada 10%). Além disso, a infecção por rotavírus foi mais prevalente no verão (23,73%) e inverno (22,7%) do que na primavera (20%) e no outono (21,4%). A infecção por rotavírus apresentou alta frequência em junho (14%), outubro (8%) e novembro (6%). Conclui-se que o rotavírus é mais prevalente em crianças e vários genótipos (G e P) do rotavírus estão presentes na área de estudo. A falta de estudos, conhecimento e testes mais raros de rotavírus são as principais razões da prevalência do vírus no distrito de Bannu, Paquistão.

Prevalence and diversity of ectoparasites in Wild Rock Pigeon (Columba livia) in Punjab region, Pakistan / Prevalência e diversidade de ectoparasitas em Wild Rock Pigeon (Columba livia) na região de Punjab, Paquistão

Abstract The current study was carried out to estimate the prevalence and diversity of ectoparasites in rock pigeons in different regions of Punjab, Pakistan. A total of 120 birds were captured from March 2017 to February 2019. The ectoparasites were collected by standard procedures and preserved in 70% ethanol containing one drop of glycerin. Data related to age, health status, sex, type of area, sampling location and season were collected using a standardized form. Ectoparasites were identified based on morphological characteristics by using identification keys. Ninety-six (80%) birds were infested with ectoparasites. A total of seven families and thirteen species of different ectoparasites were observed. Mainly, seven species of lice, two species of flies, one species of tick and three species of mites were recovered from infested birds. The female pigeons were more often infested (89.02%) than male pigeons (60.52%). The prevalence was found higher during summer (100%) as compared to other seasons. The infestation rate was higher in Industrial area (97.50%) as compared to other regions. The highest prevalence of ectoparasites (100%) was recorded from Sargodha district. There was significant (P < 0.05) variation among number of ectoparasites on wing, chest, tail and neck within age groups, seasons and ecological zones. The occurrence of parasites in relation to area, age, health status, sex and season were significant. The infestation rate of parasites in rock pigeon is high in different districts of Punjab. It is recommended that these wild birds infested with multiple species of ectoparasites could be the potential source of infestations in domesticated birds if they come in contact with them. The contact of domesticated birds should be prevented from wild birds to minimize the chance of cross species transmission of ectoparasites.

Resumo O presente estudo foi realizado para estimar a prevalência e diversidade de ectoparasitas em pombos-das-rochas em diferentes regiões de Punjab, Paquistão. Um total de 120 aves foram capturadas de março de 2017 a fevereiro de 2019. Os ectoparasitas foram coletados por procedimentos padrão e preservados em etanol 70% contendo uma gota de glicerina. Os dados relativos à idade, estado de saúde, sexo, tipo de área, local de amostragem e época do ano foram coletados em formulário padronizado. Os ectoparasitas foram identificados com base nas características morfológicas por meio de chaves de identificação. Noventa e seis (80%) aves estavam infestadas com ectoparasitas. Um total de sete famílias e treze espécies de diferentes ectoparasitas foram observados. Principalmente, sete espécies de piolhos, duas espécies de moscas, uma espécie de carrapato e três espécies de ácaros foram recuperadas de aves infestadas. Os pombos fêmeas foram infestados mais frequentemente (89,02%) do que os pombos machos (60,52%). A prevalência encontrada foi maior no verão (100%) em comparação com as outras estações. A taxa de infestação foi maior na área Industrial (97,50%) em relação às demais regiões. A maior prevalência de ectoparasitas (100%) foi registrada no distrito de Sargodha. Houve variação significativa (P <0,05) entre o número de ectoparasitas na asa, tórax, cauda e pescoço dentro das faixas etárias, estações do ano e zonas ecológicas. A ocorrência de parasitas em relação à área, idade, estado de saúde, sexo e estação do ano foi significativa. A taxa de infestação de parasitas em pombo-correio é alta em diferentes distritos de Punjab. Recomenda-se que essas aves selvagens infestadas com várias espécies de ectoparasitas possam ser a fonte potencial de infestações em aves domesticadas se entrarem em contato com elas. O contato de aves domesticadas deve ser evitado com aves selvagens para minimizar a chance de transmissão cruzada de ectoparasitas.

Isolation and characterization of bacteria residing in the oral, gut, and fecal samples of different pheasant species / Isolamento e caracterização de bactérias residentes nas amostras orais, intestinais e fecais de diferentes espécies de faisão

Abstract There is a paucity of research conducted on microbial prevalence in pheasants. The microbiota of captive birds has zoonotic significance and must be characterize. Present study is therefore planned to assess the microbiota from oral, fecal and gut content of captive avian species. It will be helpful in characterization of harmful microbes. Different samples taken from oral, gut and feces of ring-necked pheasants (Phasianus colchicus), green pheasants (Phasianus versicolor), golden pheasant (Chrysolophus pictus) and silver pheasant (Lophura nycthemera). Samples were collected, diluted, and inoculated onto different agar plates (MacConkey, SS agar, MSA and nutrient agar) for cultivation of bacterial species. Colonies of E.coli, Staphylococcus spp. Brachyspira spp. and Campylobacter spp were observed based on colony morphology. Colony forming unit showed E. coli as frequently found bacteria in fecal, oral and gut contents of all the above pheasants. The overall significance difference was found among bacterial species of golden pheasants, green pheasant, ring-necked pheasant, and silver pheasants. It was concluded that E.coli is predominant isolated from heathy pheasants followed by Campylobacter, Staphylococcus and Brachyspira.

Resumo Há uma escassez de pesquisas realizadas sobre a prevalência microbiana em faisões. A microbiota de aves em cativeiro tem significado zoonótico e deve ser caracterizada. O presente estudo está, portanto, planejado para avaliar a microbiota do conteúdo oral, fecal e intestinal de espécies aviárias em cativeiro. Será útil na caracterização de micróbios nocivos. Diferentes amostras retiradas da boca, intestino e fezes de faisões de pescoço redondo (Phasianus colchicus), faisões verdes (Phasianus versicolor), faisões dourados (Chrysolophus pictus) e faisão prateado (Lophura nycthemera). As amostras foram coletadas, diluídas e inoculadas em diferentes placas de ágar (MacConkey, ágar SS, MSA e ágar nutriente) para o cultivo de espécies bacterianas. Colônias de E. coli, Staphylococcus spp., Brachyspira spp. e Campylobacter spp foram observados com base na morfologia da colônia. A unidade formadora de colônia mostrou E. coli como bactéria frequentemente encontrada no conteúdo fecal, oral e intestinal de todos os faisões acima. A diferença de significância geral foi encontrada entre as espécies bacterianas de faisões dourados, faisões verdes, faisões de pescoço anelado e faisões prateados. Verificou-se que a E.coli é predominantemente isolada de faisões saudáveis, seguida por Campylobacter, Staphylococcus e Brachyspira.

Molecular detection and prevalence of Rotavirus with acute gastroenteritis among the children of rural and urban areas / Detecção molecular e prevalência de rotavírus com gastroenterite aguda entre as crianças de áreas rurais e urbanas

Rotavirus is the main infective agent of acute gastroenteritis (AGE) in children under the age of five years and causing significant morbidity as well as mortality throughout the world. The study was carried out to detect the prevalence rate, genotypes strain and risk factors of Rotavirus among the children of rural and urban areas of district Bannu Khyber Pakhtunkhwa Pakistan. A total of 180 stool samples were collected from children under the age of 5 years from two major hospitals of Bannu from January to December (2015). The samples were analyzed by Reverse-transcriptase Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) for the detection of Rotavirus, positive samples were further processed for genotyping (G and P type) through specific PCR. Of the total, 41 (23%) samples were positive for Rotavirus. The most prevalent G genotypes found were: G3, G8, G9 (each 29%), followed by G10 (15%), and G11 (10%). Whereas the prevalent P genotypes were: P-8 (25%), P-4 and P-10 (each 20%), P-9 (15%), followed by P-6 and P-11 (each 10%). Moreover, Rotavirus infection was more prevalent in summer (23.73%) and winter (22.7%) than spring (20%) and autumn (21.4%). Rotavirus infection exhibited high frequency in June (14%), October (8%) and November (6%). It is concluded that Rotavirus is more prevalent in children and various genotypes (G and P) of Rotavirus are present in the study area. Lack of studies, awareness and rarer testing of Rotavirus are the principal reasons of virus prevalence in district Bannu, Pakistan.(AU)

O rotavírus é o principal agente infeccioso da gastroenterite aguda (AGE) em crianças menores de 5 anos e causa de morbidade e mortalidade significativas em todo o mundo. O estudo foi realizado para detectar a taxa de prevalência, cepa de genótipos e fatores de risco de rotavírus entre as crianças de áreas rurais e urbanas do distrito de Bannu Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão. Um total de 180 amostras de fezes foi coletada de crianças menores de 5 anos de dois grandes hospitais de Bannu de janeiro a dezembro (2015). As amostras foram analisadas por reação em cadeia da polimerase transcriptase reversa (RT-PCR) para detecção de rotavírus; as amostras positivas foram posteriormente processadas para genotipagem (tipo G e P) através de PCR específica. Do total, 41 (23%) amostras foram positivas para rotavírus. Os genótipos G mais prevalentes encontrados foram: G3, G8, G9 (cada 29%), seguidos de G10 (15%) e G11 (10%). Considerando que os genótipos P prevalentes foram: P-8 (25%), P-4 e P-10 (cada 20%), P-9 (15%), seguido por P-6 e P-11 (cada 10%). Além disso, a infecção por rotavírus foi mais prevalente no verão (23,73%) e inverno (22,7%) do que na primavera (20%) e no outono (21,4%). A infecção por rotavírus apresentou alta frequência em junho (14%), outubro (8%) e novembro (6%). Conclui-se que o rotavírus é mais prevalente em crianças e vários genótipos (G e P) do rotavírus estão presentes na área de estudo. A falta de estudos, conhecimento e testes mais raros de rotavírus são as principais razões da prevalência do vírus no distrito de Bannu, Paquistão.(AU)

Isolation and characterization of bacteria residing in the oral, gut, and fecal samples of different pheasant species / Isolamento e caracterização de bactérias residentes nas amostras orais, intestinais e fecais de diferentes espécies de faisão

There is a paucity of research conducted on microbial prevalence in pheasants. The microbiota of captive birds has zoonotic significance and must be characterize. Present study is therefore planned to assess the microbiota from oral, fecal and gut content of captive avian species. It will be helpful in characterization of harmful microbes. Different samples taken from oral, gut and feces of ring-necked pheasants (Phasianus colchicus), green pheasants (Phasianus versicolor), golden pheasant (Chrysolophus pictus) and silver pheasant (Lophura nycthemera). Samples were collected, diluted, and inoculated onto different agar plates (MacConkey, SS agar, MSA and nutrient agar) for cultivation of bacterial species. Colonies of E.coli, Staphylococcus spp. Brachyspira spp. and Campylobacter spp were observed based on colony morphology. Colony forming unit showed E. coli as frequently found bacteria in fecal, oral and gut contents of all the above pheasants. The overall significance difference was found among bacterial species of golden pheasants, green pheasant, ring-necked pheasant, and silver pheasants. It was concluded that E.coli is predominant isolated from heathy pheasants followed by Campylobacter, Staphylococcus and Brachyspira.(AU)

Há uma escassez de pesquisas realizadas sobre a prevalência microbiana em faisões. A microbiota de aves em cativeiro tem significado zoonótico e deve ser caracterizada. O presente estudo está, portanto, planejado para avaliar a microbiota do conteúdo oral, fecal e intestinal de espécies aviárias em cativeiro. Será útil na caracterização de micróbios nocivos. Diferentes amostras retiradas da boca, intestino e fezes de faisões de pescoço redondo (Phasianus colchicus), faisões verdes (Phasianus versicolor), faisões dourados (Chrysolophus pictus) e faisão prateado (Lophura nycthemera). As amostras foram coletadas, diluídas e inoculadas em diferentes placas de ágar (MacConkey, ágar SS, MSA e ágar nutriente) para o cultivo de espécies bacterianas. Colônias de E. coli, Staphylococcus spp., Brachyspira spp. e Campylobacter spp foram observados com base na morfologia da colônia. A unidade formadora de colônia mostrou E. coli como bactéria frequentemente encontrada no conteúdo fecal, oral e intestinal de todos os faisões acima. A diferença de significância geral foi encontrada entre as espécies bacterianas de faisões dourados, faisões verdes, faisões de pescoço anelado e faisões prateados. Verificou-se que a E.coli é predominantemente isolada de faisões saudáveis, seguida por Campylobacter, Staphylococcus e Brachyspira.(AU)