Resumo
Access the genetic variability of endangered and isolated populations has become an important conservation tool. Astyanax scabripinnis is a well-known fish model for genetic studies, forming very isolated populations in headwaters. Besides that, this species frequently presents supernumerary chromosomes, which elevates the interest on genetic studies. Genetic diversity of an Astyanax scabripinnispopulation from the Atlantic Forest (Serra da Mantiqueira region, Brazil) was assessed with microsatellite markers for the first time. Since microsatellite markers are not described for this species, we tested markers described for a related species for transferability to A. scabripinnis. Six polymorphic loci were sufficiently reliable for population genetic analysis. We found that this population passed through a recent bottleneck because of the presence of an excess of heterozygotes, low allelic diversity, heterozygosity excess, and small effective population size. Individuals with and without B chromosomes were previously identified in this population and our study found private alleles in the individuals without B chromosomes. Furthermore, when individuals without B chromosomes were removed from the analysis, the population did not present heterozygosity excess, suggesting that the bottleneck event was driven by individuals with B chromosomes. Our results provide an insight into the value of microsatellite markers as molecular tools and is the first genetic study using molecular data of A. scabripinnis from this area.
Assuntos
Characidae/genética , Repetições de Microssatélites , Variação GenéticaResumo
Trichomycterus is a specious fish genus within Trichomycterinae and displays remarkable karyotype diversity. However, knowledge about their genomic structure and location of repetitive sequence is still limited. In order to better understand the karyotype diversification, we analyzed nine species of Trichomycterus using classical and molecular cytogenetic techniques. Results revealed a conserved diploid chromosome number of 2n=54 chromosomes in all analyzed species, although remarkable differences on the constitutive heterochromatin distribution were observed. In addition, while the 18S rDNA showed a conserved distribution pattern, the 5S rDNA sites showed a quite diverse location considering the analyzed species. Remarkably, both ribosomal genes were co-located in all species, except in T . iheringi , suggesting that co-localization is probably an ancestral condition in Trichomycterus . Finally, three analyzed species showed heterochromatic B chromosomes, reinforcing the intense genomic reorganization occurring in Trichomycterus . Our results showed that chromosomal variations are not restricted to differences in karyotype formula as previously proposed, but also to modifications on the microstructural level of resolution.(AU)
Trichomycterus é um especioso gênero dentro de Trichomycterinae e exibe marcante diversidade cariotípica. No entanto, o conhecimento sobre sua estrutura genômica e localização de seqüências repetitivas ainda é restrita. Para um melhor conhecimento sobre a sua diversificação cariotípica, nós analisamos nove especies de Trichomycterus usando técnicas de citogenética clássica e molecular. Os resultados revelaram um conservado número diploide de 2n = 54 cromossomos em todas as espécies analisadas, embora diferentes marcações na distribuição da heterocromatina constitutiva tenham sido observadas. Além disso, enquanto o DNAr 18S mostrou um padrão de distribuição conservado, os sítios de DNAr 5S mostraram uma localização bastante diversa, considerando as espécies analisadas. Ambos os genes ribossomais foram co-localizados em todas as espécies, exceto em T. iheringi , sugerindo que a co-localização é provavelmente uma condição ancestral em Trichomycterus . Finalmente, três espécies analisadas mostraram cromossomos B heterocromáticos, reforçando uma intensa reoganização genômica ocorrendo em Trichomycterus . Nossos resultados mostraram que variações cromossômicas não estão restritas à diferenças na fórmula cariotípica, como proposto anteriormente, mas também às alterações a níveis de resolução estrutural.(AU)
Assuntos
Animais , Peixes-Gato/classificação , Peixes-Gato/genética , Análise de Sequência de DNA/veterináriaResumo
We cytogenetically analyzed 18 individuals of Cyphocharax modestus, and 41 individuals of Steindachnerina insculpta from the Tibagi River basin (Paraná State, Brazil). All the specimens had 2n = 54 chromosomes, all meta-submetacentric (M-SM). The presence of 1 or 2 B chromosomes was seen in some individuals of C. modestus of the two sampled populations, showing inter- and intra individual variation. In S. insculpta, B chromosomes were also observed but only in one population, also showing inter- and intra individual variation. C-banding was used to show that the identified B chromosomes were totally heterochromatic in the two examined species.
Foram analisados, citogeneticamente, 18 indivíduos de Cyphocharax modestus e 41 indivíduos de Steindachnerina insculpta da bacia do rio Tibagi (Paraná, Brasil). Todos os espécimes apresentaram 2n = 54 cromossomos, todos do tipo meta-submetacêntrico (M-SM). A presença de 1 ou 2 cromossomos B foi detectada em alguns indivíduos de C. modestus de duas populações amostradas, evidenciando uma variação inter e intraindividual. Em S. insculpta, também foram observados cromossomos B, embora em somente uma população, mostrando também uma variação inter e intraindividual. Bandamento C foi usado para mostrar que os cromossomos B identificados apresentaram-se totalmente heterocromáticos nas duas espécies examinadas.
Resumo
We cytogenetically analyzed 18 individuals of Cyphocharax modestus, and 41 individuals of Steindachnerina insculpta from the Tibagi River basin (Paraná State, Brazil). All the specimens had 2n = 54 chromosomes, all meta-submetacentric (M-SM). The presence of 1 or 2 B chromosomes was seen in some individuals of C. modestus of the two sampled populations, showing inter- and intra individual variation. In S. insculpta, B chromosomes were also observed but only in one population, also showing inter- and intra individual variation. C-banding was used to show that the identified B chromosomes were totally heterochromatic in the two examined species.
Foram analisados, citogeneticamente, 18 indivíduos de Cyphocharax modestus e 41 indivíduos de Steindachnerina insculpta da bacia do rio Tibagi (Paraná, Brasil). Todos os espécimes apresentaram 2n = 54 cromossomos, todos do tipo meta-submetacêntrico (M-SM). A presença de 1 ou 2 cromossomos B foi detectada em alguns indivíduos de C. modestus de duas populações amostradas, evidenciando uma variação inter e intraindividual. Em S. insculpta, também foram observados cromossomos B, embora em somente uma população, mostrando também uma variação inter e intraindividual. Bandamento C foi usado para mostrar que os cromossomos B identificados apresentaram-se totalmente heterocromáticos nas duas espécies examinadas.