Relationship of semen quality to inbreeding and gait of Colombian Creole horses / Relação da qualidade do sêmen com endogamia e marcha de cavalos crioulos colombianos

ABSTRACT: High consanguinity among equines has negative effects on semen quality, thus resulting in low motility and high levels of abnormality in the spermatozoa. However, such a relationship has not been studied in Colombian Creole horses, which have been subjected to particular selection practices focusing mainly on their gait. This research assessed the relationship of semen quality to inbreeding and gait of Colombian Creole horses. Semen was collected from 50 horses using the artificial vagina method. Sperm motility and kinematics were assessed with a computerized analysis system (SCA®). Sperm vitality (SV) and abnormal morphology (AM) were assessed via the eosin-nigrosin staining test. Functional membrane integrity (FMI) was assessed via the hypo-osmotic swelling test (HOST). Genealogies and consanguinity analysis was conducted using the Breeders Assistant for Horses program. An average of 3.6 ± 0.4 % was reported for the inbreeding coefficient (Ft). A decrease in sperm motility and kinematics was reported, which was associated with an increase in consanguinity (P < 0.05). Furthermore, differences in consanguinity were found based on gait. Similarly, a relationship between horse gait and semen quality (P < 0.05) was found. Authors concluded that semen quality of Colombian Creole horses has been affected by inbreeding and its relationship with genetic selection based on gait.

RESUMO: A alta consanguinidade entre equinos tem efeitos negativos na qualidade do sêmen, resultando em baixa motilidade e altos níveis de anormalidade nos espermatozóides. No entanto, tal relação não foi estudada em cavalos crioulos colombianos, que tem sido submetidos a práticas de seleção específicas com foco principalmente em sua marcha. O objetivo desta pesquisa foi avaliar o relação da qualidade do sêmen com endogamia e marcha de cavalos crioulos colombianos. O sêmen foi coletado de 50 cavalos pelo método da vagina artificial. A motilidade e a cinética dos espermatozoides foram avaliadas com um sistema de análise computadorizado (SCA®). A vitalidade do esperma (VE) e a morfologia anormal (MA) foram avaliadas por meio do teste de coloração com eosina-nigrosina. A integridade funcional da membrana (IFM) foi avaliada por meio do test hipo-osmótico (HOST). A análise de genealogias e consanguinidade foi conduzida usando o programa Breeders Assistant for Horses. Uma média de 3,6 ± 0,4% foi encontrada para o coeficiente de endogamia (Ft). Uma diminuição na motilidade e cinética dos espermatozoides, que foi associada a um aumento na consanguinidade (P < 0,05). Além disso, diferenças na consanguinidade foram encontradas com base na marcha. Da mesma forma, foi encontrada uma relação entre a marcha do cavalo e a qualidade do sêmen (P < 0,05). Os autores concluíram que a qualidade do sêmen de cavalos crioulos colombianos foi afetada pela endogamia e sua relação com a seleção genética baseada na marcha.

Relationship of semen quality to inbreeding and gait of Colombian Creole horses / Relação da qualidade do sêmen com endogamia e marcha de cavalos crioulos colombianos

High consanguinity among equines has negative effects on semen quality, thus resulting in low motility and high levels of abnormality in the spermatozoa. However, such a relationship has not been studied in Colombian Creole horses, which have been subjected to particular selection practices focusing mainly on their gait. This research assessed the relationship of semen quality to inbreeding and gait of Colombian Creole horses. Semen was collected from 50 horses using the artificial vagina method. Sperm motility and kinematics were assessed with a computerized analysis system (SCA®). Sperm vitality (SV) and abnormal morphology (AM) were assessed via the eosin-nigrosin staining test. Functional membrane integrity (FMI) was assessed via the hypo-osmotic swelling test (HOST). Genealogies and consanguinity analysis was conducted using the Breeders Assistant for Horses program. An average of 3.6 ± 0.4 % was reported for the inbreeding coefficient (Ft). A decrease in sperm motility and kinematics was reported, which was associated with an increase in consanguinity (P < 0.05). Furthermore, differences in consanguinity were found based on gait. Similarly, a relationship between horse gait and semen quality (P < 0.05) was found. Authors concluded that semen quality of Colombian Creole horses has been affected by inbreeding and its relationship with genetic selection based on gait.

A alta consanguinidade entre equinos tem efeitos negativos na qualidade do sêmen, resultando em baixa motilidade e altos níveis de anormalidade nos espermatozóides. No entanto, tal relação não foi estudada em cavalos crioulos colombianos, que tem sido submetidos a práticas de seleção específicas com foco principalmente em sua marcha. O objetivo desta pesquisa foi avaliar o relação da qualidade do sêmen com endogamia e marcha de cavalos crioulos colombianos. O sêmen foi coletado de 50 cavalos pelo método da vagina artificial. A motilidade e a cinética dos espermatozoides foram avaliadas com um sistema de análise computadorizado (SCA®). A vitalidade do esperma (VE) e a morfologia anormal (MA) foram avaliadas por meio do teste de coloração com eosina-nigrosina. A integridade funcional da membrana (IFM) foi avaliada por meio do test hipo-osmótico (HOST). A análise de genealogias e consanguinidade foi conduzida usando o programa Breeders Assistant for Horses. Uma média de 3,6 ± 0,4% foi encontrada para o coeficiente de endogamia (Ft). Uma diminuição na motilidade e cinética dos espermatozoides, que foi associada a um aumento na consanguinidade (P < 0,05). Além disso, diferenças na consanguinidade foram encontradas com base na marcha. Da mesma forma, foi encontrada uma relação entre a marcha do cavalo e a qualidade do sêmen (P < 0,05). Os autores concluíram que a qualidade do sêmen de cavalos crioulos colombianos foi afetada pela endogamia e sua relação com a seleção genética baseada na marcha.

Genetic relationships of the Yucatan black hairless pig with Iberian breeds using single nucleotide polymorfisms / Relações genéticas de porcos pretos calvos de Yucatán com raças ibéricas usando Polimorfismo de nucleotídeos isolados

To conduct ex-situ creole pig conservation programs, it is essential to determine which breeding animals will be used, preferentially those with a more significant Iberian genetic component to preserve their origin. This study used a Yucatan black hairless pigs (YBHP) subpopulation to estimate its genetic diversity and population structure. One hundred four adult pigs were selected for the absence of hair, black skin (without spots), black hoof, and straight snout. The porcine-GGP-50K chip was used for SNP genotyping in YBHP, and information on Iberian and Yucatán hairless pigs from the United States (USYU) was taken from databases. All analysis was performed using PLINK v1.9 and v2.1 software. Inbreeding and fixation index values were lower in YBHP, with high observed heterozygosity and allogamy index values, which agree with those obtained in the populations of Canarias and Chato Murciano. According to the clusters generated by the "Genome-Wide Identity by State" analysis, four groups were identified, one of which included pigs from Guadyerbas, USYU, and YBHP. Between populations, YBHP was closely related to the hairless pigs from Guadyerbas, USYU, and Canarias. Principal component analysis showed the same result. According to the results obtained from the runs of homozygosity investigation, aimed to get pools consensus of regions of overlapping, 119 SNPs associated with genes and biological processes were identified. The BMP7 and NSUN2 genes were associated with epithelial cell differentiation, morphogenesis, and epithelial development. For nutrient metabolism: energy, the HADHA, PPARA, ADD1/SREBF1, and FAT 1genes were identified.(AU)

Para realizar programas de conservação ex-situ de suínos crioulos, é importante determinar quais animais serão criados, preferencialmente aqueles com maior componente de genética ibérica, para preservar sua origem. Uma subpopulação de porco preto calvo de Yucatán (YBHP) foi usada para estimar sua diversidade genética e estrutura populacional. Um total de 104 suínos adultos foram selecionados levando-se em consideração características como ausência de pelos, pele preta (sem manchas), casco preto e focinho reto. O painel GGP-50K foi utilizado para a genotipagem dos SNPs em animais YBHP, e informações de porcos sem pelos ibéricos e de Yucatán dos Estados Unidos (USYU) foram retiradas de bancos de dados. Todas as análises foram realizadas com o software PLINK v1.9 e v2.1. Os valores dos índices de endogamia e fixação foram menores em YBHP, com altos valores de índice de heterozigosidade e alogamia observados, que concordam com os obtidos nas populações de Canárias e Chato Murciano. De acordo com os clusters gerados pela análise "Genoma-Wide Identity By State", quatro grupos foram identificados, um dos quais incluiu porcos de Guadyerbas, USYU e YBHP. Entre as populações, YBHP estava intimamente relacionado com os porcos sem pelo de Guadyerbas, USYU e Canárias. A análise de componentes principais mostrou o mesmo resultado. De acordo com os resultados obtidos nas corridas de investigação de homozigose, visando obter consenso de pools de regiões de sobreposição, foram identificados 119 SNPs associados a genes e processos biológicos. Os genes BMP7 e NSUN2 foram associados à diferenciação de células epiteliais, morfogênese e desenvolvimento epitelial. Para metabolismo de nutrientes: energia, os genes HADHA, PPARA, ADD1/SREBF1 e FAT1 foram identificados.(AU)

Structure and genetic variability of the mexican Sardo Negro breed / Análise da estrutura e variabilidade genética da raça Sardo Negro do México

This study analyzed the Sardo Negro breed pedigree (41,521 animals registered from 1958 to 2019) to determine its structure, evolution, and genetic variability (GV). The population genetic parameters evaluated were effective number of founders (fe) and ancestors (fa), pedigree integrity, additive genetic relationship (AGR); number of complete generations (NCG), maximum generations traced (NMGT), and equivalent complete generations (NECG); effective population size (Ne), inbreeding coefficient (F), and generation interval (GI). The average GI was 7.45 years. A total of 7,804 founders and 4,856 ancestors were identified for a fe of 185 and a fa of 97. The average and maximum values of NCG, NECG, and NMGT were 1.6 and 5.0, 2.5 and 6.5, 4.3 and 12, with Ne estimates of 15.9, 25.9, and 69.0, respectively. The increase in F, linked to Ne, ranged from 0.72% to 3.1% per generation. The average values for F and AGR were 3.6% and 1.0%, respectively. The proportion of inbred individuals was 32.0%, with F values ranging from 0.01 to 62.2% and an average of 11.3%. The rate of inbred population was 1.3% per year. The annual rate of AGR was 0.04%. For the continuity and projection of the breed, the evolution of F as a function of Ne and the possible implications of the selection schemes must be considered. The genetic variability sustained over time results from the Ne.

Os objetivos deste estudo foram analisar o pedigree (41.521 registros de 1958 a 2019) da raça Sardo Negro para avaliar a estrutura, evolução e variabilidade genética (VG) da população. Os parâmetros genéticos populacionais utilizados foram: número efetivo de fundadores (fe) e ancestrais (fa); integridade do pedigree; relação genética aditiva (RGA); número de gerações completas (NGC), máximo plotado (NGT) e equivalentes (NGE); tamanho efetivo (Ne); consanguinidade (F); intervalo geracional (IG). O IG médio foi de 7,45 anos. Foram identificados 7.804 fundadores e 4.856 ancestrais, para fe 185 e 97 na fa. As médias e máximas para NGC, NGE e NGT foram 1,6 e 5,0, 2,5 e 6,5, 4,3 e 12, com estimativas de Ne 15,9, 25,9 e 69,0, respectivamente. O aumento de F, vinculado ao Ne, ficou na faixa de 0,72% a 3,1% por geração. A média para F 3,6% e 1,0% em RGA; a proporção de consanguíneos foi de 32,0%, com F na faixa de 0,01 a 62,2% e média de 11,3%. A taxa da população consanguínea foi de 1,3% ao ano. No RGA, a taxa ao ano era de 0,04%. Para a continuidade e projeção da raça, deve-se considerar a evolução de F em função de Ne e as possíveis implicações dos esquemas de seleção. A variabilidade genética sustentada ao longo do tempo resulta do Ne.

Genetic parameters and trends for reproductive traits in Blanco Orejinegro cattle from Colombia / Parâmetros e tendências genéticas para características reprodutivas no gado Blanco Orejinegro da Colômbia

The Colombian creole cattle breed Blanco Orejinegro (BON) is an important zoogenetic resource, but there is little knowledge about the genetic parameters and trends of its reproductive traits. Therefore, the aim of this study was to estimate parameters for the reproductive traits calving interval (CI), age at first calving (AFC), gestation duration (GD) and genetic trends for CI in the BON breed. Genealogy information from 7,799 animals was used, and employing the MTDFREML program, the components of the variance, heritability (h2), repeatability (rep), and estimated breeding values (EBV) for CI (n=3308), AFC (n=729), and GD (n=306) were estimated, in addition to the inbreeding coefficient (F) of the population. Genetic trends were established through linear regression using R software. Finally, the animals were classified as inbred (F > 0) and noninbred (F=0), and the effect of inbreeding on reproductive performance was established through a generalized linear model using the R program. An average F value of 4.41%±0.06 was observed. The h2 for CI was 0.11±0.03 with a rep of 0.15±0.04; for AFC, h2 was 0.00±0.05; and for GD, h2 was 0.00±0.08. The genetic trend for CI was -0.01 days/year. Finally, for CI, inbreeding depression was evident; this trait increased when inbreeding increased. These results indicate an important environmental influence on reproductive traits. The heritability estimate for CI suggests that little genetic progress could be achieved through selection. The evidence of inbreeding depression raises the need to control inbreeding to conserve this genetic resource.(AU)

O gado crioulo colombiano Blanco Orejinegro (BON) é um importante recurso zoogenético, mas ainda há desconhecimento sobre os parâmetros e tendências genéticas das características reprodutivas dessa raça. Portanto, o objetivo deste estúdio foi estimar parâmetros e tendências genéticas para características reprodutivas intervalo de partos (IDP), idade ao primeiro parto (IPP) e duração da gestação (DG) na raça BON. A informação da genealogia de 7,799 animais foi usada. Utilizando o programa MTDFREML foram estimados os componentes de variância, herdabilidade (h2), repetibilidade (rep) e valores genéticos (VGE), para IDP (n=3308), IPP (n=729) e DG (n=306), além do coeficiente de endogamia (F) na população. As tendências genéticas foram determinadas por regressão linear usando o software R. Finalmente, os animais foram classificados como endogâmicos (F > 0) e não endogâmicos (F=0) e o efeito da endogamia no desempenho reprodutivo foi determinado usando um modelo linear generalizado usando R. Observouse um F médio de 4,41%+0,06. A h2 para IDP foi 0,11±0,03 com uma repetibilidade de 0,15±0,04; para IPP a h2 foi 0,00 ± 0,05; e para DG a h2 foi 0,00 ± 0,08. A tendência genética para IDP foi -0,01 dias/ano. Finalmente, para o IDP, a depressão por endogamia foi evidente, aumentando o IDP com o aumento da endogamia. Os resultados indicam uma importante influência ambiental nas características reprodutivas. A herdabilidade estimada para o IDP sugere que pouco ganho genético pode ser alcançado através da seleção, embora a depressão endogâmica evidencie a necessidade de controlar a consanguinidade para conservar o recurso genético.(AU)

Amelia de membros torácicos em potro árabe: relato de caso / Amelia thoracic limbs in Arabian foal: case report / Amelia de miembros torácicos en potro árabe: caso clínico

Amelia é uma alteração congênita em que um ou mais membros anteriores estão ausentes, em parte ou totalmente. O presente relato de caso descreve a ocorrência de um caso de amelia bilateral dos membros torácicos de uma potranca, da raça Árabe, oriunda de uma gestação, cujos pais, possuíam grau de consanguinidade de 25%. O diagnóstico foi realizado pela inspeção, exame físico e radiológico, onde foi observada ausência dos ossos distais ao úmero no membro torácico direito e no membro torácico esquerdo havia um pequeno fragmento da diáfise e epífise do rádio e ulna.

Amelia is a congenital condition in which one or more forelimbs are missing, either in part or totally. This case report describes the occurrence of a case of bilateral amelia of the forelimbs of an Arabian foal, coming from a pregnancy, whose parents had a degree of consanguinity of 25%. The diagnosis was made by inspection, physical examination and radiology, where it was observed the absence of the distal humerus bone in the right forelimb and the left forelimb was a small fragment of the diaphysis and epiphysis of the radius and ulna.

Amelia es una alteración congénita de un o más miembros anteriores siendo ausentes en parte o totalmente. Este caso describe la ocurrencia de un caso de amelia bilateral de las extremidades delanteras de una potra, de raza árabe, procedente de un embarazo, donde los padres tenían un grado de consanguinidad de un 25%. El diagnóstico se realizó mediante la inspeción, examen fisico, la disección y la radiología, donde se observó la ausencia de los huesos distales al húmero en miembro superior derecho y miembro torácico izquierdo había un pequeño fragmento de la diáfisis y epífisis del radio y el cúbito.

Condrodisplasia tipo Dexter em fetos bovinos abortados / Chondrodysplasia Dexter type in aborted bovine fetuses

Background: Chondrodysplasia is a congenital anomaly related to defects of the genes that control the chondrogenesis. This anomaly is described in many breeds of cattle and consanguineous matings increases the likelihood of developing defective traits. There are three distinct syndromes known: Dexter, Telemark and Brachycephalic type. The chondrodysplasia Dexter type syndrome is associated to an incompletely dominant gene, which occurs in Dexter and Holstein breeds more frequently, yet Charolais and Jersey can also be affected. There are three recognized phenotypes in this form of disease: severe achondroplasia, with abortion before the seventh month of gestation (monster Dexter), when related to dominant homozygous; chondrodisplasia with limbs shortening, when heterozygous; and normal animals, when recessive homozygous. The objective of this paper is to describe Dexter chondrodysplasia observed in two bovine fetuses examined by the Setor de Patologia Veterinária from Universidade Federal do Rio Grande do Sul (SPV-UFRGS). Case: The necropsy of two aborted bovine calves was performed by the SPV-UFRGS. The Fetus 1 did not have data, neither clinical history. The Fetus 2, a Jersey breed calf, was in the last third of gestation and came from a property with Jersey and mini-Jersey herd. Natural mating was used for reproduction, with only one bull. Macroscopic alterations observed in both fetuses were characterized by shortened limbs, rounded and disproportionate skull, short snout, undershot jaw, tongue protrusion and abdominal hernia with eventration. In the second fetus was also observed spina bifida and palatoschisis. Microscopically, in both fetuses were observed extensive areas of immature cartilage, chondrocytes of the femur's bone tissue were not organized in recognizable growth plates, the metaphysis was markedly shortened and consisted in short bone trabeculae with occasional cartilage isles. Immunohistochemistry (IHC) to detect bovine viral diarrhea virus (BVDV) was negative. Discussion: The macroscopic and microscopic alterations in both fetuses were compatible with chondrodysplasia "monster Dexter" type. Such alterations, associated with dominant homozygotes, are due to defective endochondral ossifi cation with little growth in the length of long bones, meanwhile intramembranous ossification beneath the periosteum keeps growing and contributing to the abnormal volume and growth of the bones. Such difference is clearly observed when the size of the head is compared with the rest of the body. As the skull bones depends basically on intramembranous ossification, they are generally bigger than the rest of the body. The negative result of IHC to BVDV shows that this agent, known as the cause of congenital malformation did not have association with the anomalies observed. According to other researchers, this low frequency of viral agents as responsible for congenital anomalies was observed previously in cattle from the south of Brazil. Although Dexter chondrodysplasia can be considered of occasional occurrence, it can be responsible for considerable damage. As an abnormality with hereditary nature and consanguinity is the main reason to its occurrence, prevention is the main method to be adopted by the producer to avoid bigger loses.

Chondrodysplasia dexter type in aborted bovine fetuses / Condrodisplasia tipo Dexter em fetos bovinos abortados

Background: Chondrodysplasia is a congenital anomaly related to defects of the genes that control the chondrogenesis. This anomaly is described in many breeds of cattle and consanguineous matings increases the likelihood of developing defective traits. There are three distinct syndromes known: Dexter, Telemark and Brachycephalic type. The chondrodysplasia Dexter type syndrome is associated to an incompletely dominant gene, which occurs in Dexter and Holstein breeds more frequently, yet Charolais and Jersey can also be affected. There are three recognized phenotypes in this form of disease: severe achondroplasia, with abortion before the seventh month of gestation (monster Dexter), when related to dominant homozygous; chondrodisplasia with limbs shortening, when heterozygous; and normal animals, when recessive homozygous. The objective of this paper is to describe Dexter chondrodysplasia observed in two bovine fetuses examined by the Setor de Patologia Veterinária from Universidade Federal do Rio Grande do Sul (SPV-UFRGS).Case: The necropsy of two aborted bovine calves was performed by the SPV-UFRGS. The Fetus 1 did not have data, neither clinical history. The Fetus 2, a Jersey breed calf, was in the last third of gestation and came from a property with Jersey and mini-Jersey herd. Natural mating was used for reproduction, with only one bull. Macroscopic alterations observed in

Background: Chondrodysplasia is a congenital anomaly related to defects of the genes that control the chondrogenesis. This anomaly is described in many breeds of cattle and consanguineous matings increases the likelihood of developing defective traits. There are three distinct syndromes known: Dexter, Telemark and Brachycephalic type. The chondrodysplasia Dexter type syndrome is associated to an incompletely dominant gene, which occurs in Dexter and Holstein breeds more frequently, yet Charolais and Jersey can also be affected. There are three recognized phenotypes in this form of disease: severe achondroplasia, with abortion before the seventh month of gestation (monster Dexter), when related to dominant homozygous; chondrodisplasia with limbs shortening, when heterozygous; and normal animals, when recessive homozygous. The objective of this paper is to describe Dexter chondrodysplasia observed in two bovine fetuses examined by the Setor de Patologia Veterinária from Universidade Federal do Rio Grande do Sul (SPV-UFRGS).Case: The necropsy of two aborted bovine calves was performed by the SPV-UFRGS. The Fetus 1 did not have data, neither clinical history. The Fetus 2, a Jersey breed calf, was in the last third of gestation and came from a property with Jersey and mini-Jersey herd. Natural mating was used for reproduction, with only one bull. Macroscopic alterations observed in

Efeito da endogamia sobre características morfométricas em cavalosda raça Mangalarga Marchador / Effect of inbreeding on morfhometric traits in Mangalarga Marchador horses

Estimou-se o coeficiente de endogamia e avaliou-se seu efeito sobre características morfométricas dos animais em um criatório no norte de Minas Gerais. As características estudadas foram alturas da cernelha e da garupa, comprimentos da cabeça, do pescoço, do dorso-lombo, da garupa e do corpo, larguras do peito e da garupa. O arquivo continha 2186 informações de parentesco de animais do arquivo zootécnico da fazenda, desde o início da formação da raça, 1951, até o ano de 2006. Calculou-se o coeficiente de endogamia (F) e avaliou-se seu efeito por meio de regressão linear simples sobre as medidas morfométricas. Do total de animais, 27,6% mostraram-se endogâmicos, sendo o F médio da população igual a 1,4%. Considerando-se apenas os animais endogâmicos, a consanguinidade média atingiu 5,3%, mínimo de 0,1 e máximo de 28,1%. Não se verificaram efeitos negativos da endogamia sobre as características morfométricas, exceto para largura da garupa, em que se observou que para cada 10% de acréscimo de F houve aumento de 0,576cm na largura da garupa. Possivelmente, devido ao baixo valor encontrado, a endogamia não influenciou as demais características avaliadas.(AU)

The coefficient of inbreeding was estimate and its effect on linear traits of the Mangalarga Marchador horses reared in a ranch in the North of Minas Gerais was evaluated. The characteristics studied were morphometric traits such as wither and hip height, length of head, neck, back-loin, hip and body, as well as chest and hip width. The archive had 2186 data on the genealogy of animals from the herd register of the Catuni Farm. The coefficient of inbreeding (F) was calculated and its effect was evaluated by means of simple linear regression on the linear traits. Of all animals, 27.6% showed inbreeding, with an F average of 1.4% in the population. Considering only the inbred animals, the average consanguinity reached 5.3% minimum of 0.1 and maximum of 28.1%. Negative effects of inbreeding on the morphometric traits were not seen, except for hip width, where for each 10% increase in F there was increase of 0.576cm. Possibly due to the low value found, inbreeding did not influence the other evaluated characteristics.(AU)

ENDOGAMIA EM REBANHOS DE CAPRINOS DA RAÇA SAANEN

A raça de caprinos Saanen está presente em todos os países que têm uma caprinocultura leiteira razoavelmente desenvolvida, sendo a raça predominante nos criatórios e de maior média de produção de leite. Objetivou-se com este estudo avaliar a estrutura populacional e o efeito da endogamia sobre a produção de leite até os 305 dias de lactação e a duração da lactação em cabras da raça Saanen pertencentes a rebanhos participantes do Programa de Melhoramento Genético de Caprinos Leiteiros (Capragene®). Os parâmetros populacionais avaliados foram o número efetivo de fundadores (fe) e ancestrais (fa), tamanho efetivo (Ne), coeficiente de endogamia (F), incremento individual de endogamia (Fi), coeficiente médio de parentesco (AR), a integridade dos pedigrees e as estatísticas F de Wright. O efeito da endogamia foi verificado pelo teste t, avaliando-se contraste por meio de uma sub-rotina do aplicativo MTDFREML. Foram utilizados dados de pedigree de 7.640 animais e informações de 3.548 lactações pertencentes a 2.154 cabras. Os coeficientes de F e AR médios da população foram de 1,48% e 0,78%, respectivamente. Já o tamanho efetivo foi de 39,69, considerando a geração equivalente completa. O número efetivo de animais fundadores (fe) e de ancestrais (fa) foi de 123 e 101 respectivamente, o que indica perda de genes de origem. De todos os ancestrais, apenas 39 foram responsáveis por explicar 50% da variabilidade genética da população. Quanto à integridade dos pedigrees foram identificados 80,13% de animais como pais (reprodutores) e 79,02% como mães. As estatísticas F de Wright, FIS, FST e FIT, foram -0,017, 0,028 e 0,011 respectivamente, indicando a ausência de subestruturação da população. Não houve efeito significativo da endogamia sobre a duração da lactação (P>0,05). A produção de leite até os 305 dias de lactação foi afetada significativamente pela endogamia, havendo uma redução de 2,31 kg na produção de leite com o incremento de 1% na endogamia individual.

The Saanen goat breed is present in all countries that have a fairly developed dairy goat and the predominant race in farms and with higher milk production average. The objective of this study was to evaluate the population structure and the effect of inbreeding on the production of milk up to 305 days of lactation and duration of lactation in Saanen goats belonging to participating flocks of Breeding Program of Dairy Goats (Capragene®). The evaluated population parameters were the effective number of founders (fe) and ancestors (fa), effective size (Ne), inbreeding coefficient (F), individual increase in inbreeding (Fi), average coefficient of relatedness (AR), the integrity of pedigrees and Wright's F statistics. The effect of inbreeding was verified by t test evaluating contrast through a subroutine MTDFREML application. We used pedigree data from 7,640 animals and 3,548 lactation information pertaining to 2,154 goats. The mean AR and F coefficients of the population were 1.48% and 0.78%, respectively. But the effective size was 39,69, from complete equivalent generation. The effective number of founder animals (fe) and ancestors (fa) was 123 and 101 respectively, and fiam all ancestors only 39 were responsible for explaining 50% of the genetic variability within the population, which indicates loss of source genes. As for the integrity of pedigrees were identified 80.13% animals as sires (breeders) and 79.02% as mothers. For subdivision of the population of the values obtained for FIS, FST and FIT were -0.017, 0.028 and 0.011 respectively, indicating the absence of the population structuring. There was no significant effect of inbreeding on the duration of lactation (P>0.05). The production of milk up to 305 days of lactation was significantly affected by inbreeding, with a reduction of 2.31 kg with the increase of 1% in the individual inbreeding.

ESTRUTURA POPULACIONAL E ANÁLISE DE VARIABILIDADE GENÉTICA EM REBANHOS OVINOS BRASILEIROS

As raças ovinas deslanadas são parte do patrimônio genético do Brasil, formado por animais adaptados ao semiárido nordestino e com potencial de produção de carne e pele. No entanto tratam-se de raças de recente formação, ainda com poucos programas de melhoramento genético, e consequentemente, carente de estudos da estrutura populacional, variabilidade genética, endogamia e grau de conservação. Diante disso este trabalho teve dois objetivos: 1) analisar a variabilidade genética da raça Santa Inês no Brasil com base em informações de pedigree utilizando registros de animais da raça Santa Inês, provenientes da Associação Sergipana de Criadores de Caprinos e Ovinos (ASCCO) criados na Região Nordeste do Brasil e 2) avaliar a estrutura genética e variabilidade genética do núcleo de conservação da Embrapa Caprinos e Ovinos, localizada na cidade de Sobral, região do norte do estado do Ceará, controlado pelo Sistema de Gerenciamento de rebanho (SGR) dentro do dentro do programa de melhoramento genético de caprinos e ovinos de corte GENECOC®. O arquivo de pedigree da raça Santa Inês (ASCCO) continha 29080 animais e os arquivos de dados genealógicos pertencentes ao GENECOC 904 indivíduos da raça Santa Inês, 972 indivíduos da raça Somalis e 1372 indivíduos da raça Morada Nova. Para a primeira análise dos animais Santa Inês a média da integridade do pedigree nas últimas quatro gerações foi maior que 50% e o número de gerações completas equivalente foi igual a 4,89. O valor do coeficiente endogâmico (F) foi de 0,32% e o coeficiente de parentesco obtido foi de 3,1%. O intervalo de geração foi de 5,75 anos. Os resultados dos parâmetros com base na probabilidade de origem do gene: número de fundadores (Nf), número efetivo de fundadores (fe), número efetivo de ancestrais (fa) e número efetivo de genomas remanescentes (fg) foram: (Nf) > (fe) > (fa) > (fg). A razão (fe)/ (fa) foi próxima de 1, indicando que não houve gargalo genético, já a razão (fg)/ (fe) foi de 0,30 e mais distante de 1, indica um processo rápido de deriva genética, pois quantifica a perda de alelos fundadores entre gerações. Enquanto que para os indivíduos Santa Inês, Somalis e Morada Nova o coeficiente de parentesco médio (AR) foram de 5,17%, 4,98% e 4,98 e consanguinidade (F) foram de 1,81%, 0,78% e 0,78 respectivamente. O intervalo de gerações (IEG) foi de 3,54, 3,40 e 4,08 anos e o tamanho efetivo médio (Ne) por geração foi de 30, 15 e 35 animais, sendo que o número efetivo de animais fundadores ( fe ) de 29,54, 38,60 e 29,43 e de ancestrais ( fa ) foi igual a (17, 13 e 19 respectivamente). Dentre os ancestrais, apenas 7 Santa Inês, 5 Somalis e 10 Morada Nova foram responsáveis por 50% da variabilidade genética das populações, o que indica perda de genes de origem. Concluindo-se que na população de ovinos da raça Santa Inês (ASCCO) a variabilidade genética permitirá a obtenção de ganhos genéticos adequados nas características de importância econômica. Enquanto que nas populações de conservação do GENECOC observa-se baixa contribuição dos animais fundadores ao longo das gerações. Os valores do coeficiente de endogamia de Wright indicam subdivisão da população em linhagens. Em geral, a consanguinidade e os valores médios do coeficiente de parentesco foram baixos e a variabilidade genética foi considera alta.

The wooless sheep breeds are part of the genetic heritage of Brazil, formed by animals highly adapted to semi-arid Northeast and high capacity of production of meat and skin. However it is of recent formation breeds, still few breeding programs, and consequently lacking in studies of population structure, genetic variability, inbreeding and degree of conservation. Therefore this study had two objectives: 1) to analyze the genetic variability of Santa Ines in Brazil based on pedigree information using animal records Santa Ines, from the Goat Breeders of Sergipana Association and Sheep (ASCCO) created in Northeast of Brazil and 2) evaluate the genetic structure and genetic variability conservation nucleus of Embrapa goats and sheep, located in Sobral, northern region of the state of Ceará, compiled by Management System for Livestock, part of the within the Breeding Program of Goats and sheep - GENECOC®. Santa Inês breed pedigree file (ASCCO) contained 29080 animals and genealogical data files belonging to GENECOC 904 individuals Santa Ines, 972 individuals of Somalis breed and 1372 individuals of Morada Nova breed. For the first analysis of animal Santa Inês the average pedigree integrity in the last four generations was greater than 50% and the number of full generations equivalent was equal to 4.89. The value of endogamic coefficient (F) was 0.32% and the obtained relationship coefficient was 3.1%. The generation interval was 5.75 years. For the results of the parameters based on the probability of gene origin: number of founders (Nf), effective number of founders (fe), effective number of ancestors (fa) and effective number of remaining genomes (fg): (Nf)> (fe)> (fa)> (fg). The ratio (fg) / (fa) was close to 1, indicating no genetic bottleneck, as the ratio (fg) / (fe) was 0.30 and more distant from 1, indicating a rapid process of genetic drift, it quantifies the loss of founder alleles between generations. While for individuals Santa Inês, Morada Nova Somalis and the average relatedness coefficient (AR) were 5.17%, 4.98% and 4.98% and inbreeding (F) were 1.81%, 0.78 and 0.78% respectively. The generation interval (IEG) was 3.54, 3.40 and 4.08 years and the mean effective size (Ne) per generation was 30, 15 and 35 animals, with the effective number of founder animals (fe) of 29.54, 38.60 and 29.43 and ancestors (fa) is equal to (17, 13 and 19 respectively). Among the ancestors, only 7 Santa Ines, 5 Somalis and 10 Morada Nova accounted for 50% of the genetic variability of populations, indicating loss of original genes. Concluding that the population of sheep Santa Inês (ASCCO) genetic variability will allow obtaining appropriate genetic gains in traits of economic importance. While in GENECOC conservation populations observed low contribution of animal founders over the generations. The values of Wright's inbreeding coefficient indicates subdivision of the population lineages. In general, inbreeding and the mean values of inbreeding coefficient were low and the genetic variability considered high.

Estimação de parâmetros genéticos e fenotípicos para peso e altura ao nascimento de potros da raça Crioula

Nas últimas décadas houve um grande crescimento na comercialização de equinos da raça Crioula no Brasil. Após anos de seleção tornou-se necessária a determinação de características biométricas que caracterizem o desenvolvimento do potro crioulo, de forma a auxiliar tecnicamente o criador, proporcionando maior embasamento técnico-científico à técnicos e criadores desta raça. Para que a seleção possa ser efetiva há a necessidade da estimação de componentes de variância e covariância e parâmetros genético. Com base nisto, e considerando que características avaliadas no início da vida animal afetam o desenvolvimento futuro este estudo teve por objetivo avaliar efeito do ano e mês do nascimento, sexo, idade da mãe e consanguinidade (ajustadas como covariáveis) sobre a altura na cernelha e peso ao nascer. Ao mesmo tempo da avaliação dos efeitos fixos foram estimados os componentes de variância genético direto e herdabilidade para estas características. Foram avaliados 482 potros da raça crioula (machos e fêmeas), nascidos entre os anos de 2009 e 2013, de agosto a março. Estes animais foram gerados a partir de 34 garanhões e 231 éguas. Os dados foram obtidos de um criatório localizado no estado do Rio Grande do Sul. A medição da altura da cernelha foi realizada com o auxílio de um hipômetro posicionado ao lado direito, em piso plano e a massa corporal através da pesagem em balança (zero a mil quilogramas). Dados referentes a idade das reprodutoras, pedigrees das éguas e garanhões foram obtidos através dos registros junto ao serviço genealógico da Associação Brasileira de Criadores de Cavalos Crioulos (ABCCC). Parâmetros genético, incluindo componentes de variância foram estimados usando procedimento máxima verossimilhança restrita (REML) baseado no modelo animal. Foram avaliados 3 modelos de análises diferindo com relação a composição dos efeitos aleatórios. O modelo I, apenas com efeito aleatório genético direto foi que melhor se ajustou aos dados segundo o teste de LRT. As estimativas de herdabilidade dos efeitos genotípicos (h2 g) e respectivos erros padrão obtidas com a análise bivariada para altura a cernelha e peso ao nascer foram 0,63 (±0,14) e 0,45 (± 0,12), respectivamente. As correlações genéticas e fenotípicas foram 0,92 (± 0,10) e 0,20 (±0,10), respectivamente. Em virtude da moderada a alta herdabilidade estimadas para peso e altura da cernelha ao nascer, as quais indicam a existência de variabilidade genética aditiva pode-se concluir que a seleção para qualquer uma destas características será efetiva. Devido a alta correlação entre estas características, uma seleção para peso pode produzir uma razoável resposta a seleção na altura do animal e vice-versa.

In recent decades there has been a boom in the sale of Crioulo horses breed in Brazil. After years of selection it became necessary to determine morphometric traits that characterize the development of Crioulo foal in order to technically assist the breeding plans, providing greater technical and scientific support to technicians and farmers of this breed. To make the selection effective it is necessary to estimate the (co)variance components and genetic parameters. On this basis, and considering that traits evaluated at the beginning of animal life affect its future development this study was carried out to evaluate the effect of year and month of birth, sex, age of dam and inbreeding (adjusted as covariates) on the wither height and weight at birth. At the same time estimates of direct genetic variance components and heritability for these traits were obtained. Five hundred and seven Crioulo foals (males and females) born between the years 2009 and 2013 from August to March were evaluated. These animals were generated from 34 stallions and 231 mares. Data were obtained from a farm located in the state of Rio Grande do Sul. The measurement of the wither height was performed with the aid of a hipometer positioned at the right side on level ground and the body weight by weighing the foals with the in scale ( 0- 1000 kg). Data regarding the age of dam, pedigrees of the mares and stallions were collected from genealogical service of the Associação Brasileira de Criadores de Cavalos Crioulo (ABCCC). Genetic parameters including variance components and proportions were estimated using restricted maximum likelihood procedure (REML) based on the animal model. We evaluated three models of differing analyzes regarding the composition of the random effects. The model I, only direct genetic random effect was that best fit the data according to the LRT test. Heritability estimates of genotypic effects (h 2 ) and their standard errors obtained with bivariate analysis to the withers height and birth weight were 0.63 (± 0.14) and 0.45 (± 0.12), respectively. The genetic and phenotypic correlations were 0.92 (± 0.10) and 0.20 (± 0.10), respectively. Because of the moderate to high heritability estimates for weight and wither height at birth, which indicate the existence of genetic variability additive it can be concluded that the selection of any of these traits will be effective. Due to the high correlation between these characteristics the selection of weight can produce a reasonable response in the wither height, and vice-versa.

Incidência do primeiro molar em cavalos Crioulos e sua correlação com a genética

A valorização de animais com alto desempenho funcional e alto valor zootécnico, fez com que a criação desses animais fosse conduzida em alta escala, concentrando muitas vezes uma mesma linhagem, a fim de acelerar o melhoramento e valorizar seus produtos. Com isso, a consanguinidade é uma realidade dentro das criações. Além disso, deu-se a modificação dos hábitos alimentares naturais do cavalo, alterando substancialmente o padrão de mastigação. Com isso, as mais variadas alterações odontológicas passaram a ter influência no desenvolvimento e performance. A odontologia equina não está incluída nos critérios de seleção de animais para a reprodução, principalmente devido a ausência de estudos correlacionando anormalidades odontológicas com a genealogia e desempenho. Entretanto, isto é muito importante, pois orientará o criador para evitar efeitos indesejáveis da endogamia. Entre as anormalidades odontológicas o dente de lobo ou pré-molar 1 (PM1) é a mais frequente. Com base nisto, este estudo teve o objetivo de avaliar a incidência do PM1 e identificar os fatores que contribuem para sua variação em uma amostra de 443 equinos, machos e fêmeas da raça Crioula examinados clinicamente, entre os anos de 2013 e 2014. Um total de 223 (50,34%) de animais apresentaram o primeiro pré-molar. Avaliações usando qui-duadrado (2) não identificaram nenhuma associação significativa (P=0,4648) entre sexo e a presença do primeiro pré-molar. As percentagens de ocorrência de acordo com a posição 105, 205 e ambas (105-205) foram respectivamente, 6,32%, 7,00% e 37,02%. Houve uma associação significativa (P < 0,0001) entre a idade do animal (grupos de I, II e III) e a presença de dente de lobo. A maior frequência de dente de lobo foi observada em animais do grupo I (idade de 1 a 3 anos) e a menor em animais do grupo III (acima de 10 anos). Houve uma associação também significativa entre linhagens (brasileira, uruguaia e chilena) e a presença de dente de lobo. A maior incidência de dente de lobo ocorreu na linhagem uruguaia (66,67%) e a menor na linhagem brasileira (46,35%). A consanguinidade avaliada na população analisada variou entre 0,0 e 0,2812. A consanguinidade média (erro padrão) em machos foi de 0,015 (0,026) e em fêmeas 0,009 (0,021). As consanguinidades entre 9 animais sem e com dente de lobo foram: 0,011 (0,025) e 0,015 (0,024) respectivamente. As consanguinidade média e erros padrão de acordo com os grupos de idade (I, II e III) foram: 0,016 (0,021), 0,014 (0,027) e 0,007 (0,019) respectivamente. As médias de consanguinidade e desvio padrão de acordo com as linhagens (brasileira, chilena e uruguaia) foram: 0,009 (0,019), 0,011 (0,012) e 0,023 (0,032) respectivamente.Dos 443 animais coletados foram escolhidos 50 para análise do gene MSX1, sendo 25 com presença de dente de lobo e 25 sem esta alteração. Estas 50 amostras foram submetidas a análise de SSCP e sequenciamento para verificação de polimorfismo no primeiro exon do gene MSX1. Embora nenhuma relação de causa tenha sido estabelecida entre o exon I do gene MSX1 e a presença de dente de lobo, esta é a primeira tentativa de relacionar este tipo de alteração dentária e gene homeobox em equinos. Podemos concluir neste estudo que há uma forte relação entre dente de lobo com idade e linhagem, mas não há influência do sexo sobre esta alteração dentária. Uma grande influência genética também existe, pois há uma expressão mais forte (ocorrência) desta anomalia na arcada dentária superior. De forma especulativa podemos dizer que estas associações observadas neste trabalho sejam em parte devido aos níveis de consanguinidades apresentados pelos animais avaliados.

The placement values in high functional performance animals and high value livestock, made the breeding of these individuals wascarried out in high scale, focusing often the same lineages in order to accelerate the improvement and enhance their products. So, inbreeding is a reality within the creations. In addition, there was the modification of natural horse eating habits, substantially altering the pattern of chewing. With this, the most varied dental disorders started to have an influence in the performance. Equine dentistry is not included in the selection criteria of animals for reproduction, mainly due to lack of studies correlating dental abnormalities with genealogy and athletic performance. However, this is very important, as it will guide the breeder to avoid undesirable effects of inbreeding. Among the dental abnormalities wolf tooth or premolar 1 (PM1) is the most frequent. On this basis, this study aimed to assess the impact of PM1 and identify the factors contributing to the variation in a sample of 443 horses, male and female of the Criollo breed examined clinically, between the years 2013 and 2014. Two hundred and twenty three out of 443 animals, (approximately 50.34%), showed the first premolar. Assessments using chi-square (2) did not identify any significant association (P = 0.4648) between sex and the presence of the first premolar. The percentages of occurrence in accordance with the position 105, 205 and both (105-205) were, respectively 6.32%, 7.00% and 37.02%. There was a significant association (P <0.0001) between the age of the animal (groups 1-3) and the presence of wolf tooth. The highest frequency of wolf tooth wasobserved in animals from group I (age 1-3 years) and the lowest in animals of group III (above 10 years). There was also a significant association (P=0.0004) between lineages (Brazilian, Uruguayan and Chilean) and the presence of wolf tooth. The highest incidence of wolf tooth occurred in the Uruguayan lineage (66.67%) and the lowest in the Brazilian strain (46.35%). Inbreeding evaluated in the study population ranged from 0.0 to 0.2812. The average inbreeding (standard error) in males was 0.015 (0.026) and females 0.009 (0.021). The inbreeding among animals with and without wolf tooth were 0.011 (0.025) and 0.015 (0.024) respectively. The mean and standard errors from inbreeding 11 coefficientin accordance with age groups (I, II and III) were 0.016 (0.021) 0.014 (0.027) and 0.007 (0.019), respectively. The mean and standard deviation of consanguinity according to the lineages (Brazilian, Chilean and Uruguayan) were 0.009 (0.019) 0.011 (0.012) and 0.023 (0.032), respectively. Fifty out of 443 animals were selected for genetic analysis, 25 with the presence of wolf tooth and 25 without this change. Genomic DNA was extracted from whole blood and checked on 1% agarose gel. These 50 samples were subjected to SSCP analysis and sequencing to check polymorphism in the first exon of the gene MSX1. Although no causal relationship has been established between exon I of MSX1 gene and the presence of wolf tooth, this is the first attempt to relate this kind of change and homeobox gene in horses. We can conclude from this study that there is a strong relationship between wolf tooth with age and lineage, but there is no influence of gender on this dental anomaly. A large genetic influence also exists because there is a stronger expression (occurrence) of this anomaly in the upper dental arch. Speculatively,we can say that these associations observed in this study are partly due to inbrreding levels presented by the evaluated animals.

SELEÇÃO GENÔMICA EM BOVINOS DE CORTE

Objetivou-se com este trabalho: (1) avaliar parâmetros de diversidade genética e de estrutura populacional com base nas raças Angus, Devon, Hereford e Shorthorn. Taxa de endogamia (F), tamanho efetivo (Ne), grau de parentesco, entre outros parâmetros, foram estimados para fornecer subsídios aos programas de melhoramento. Os parâmetros indicaram adequada diversidade genética, com Ne variando entre 128 no Devon e 303 no Shorthorn e F variando entre 1,50 no Angus e 3,92 no Devon; (2) avaliar estratégias de imputação de genótipos utilizando dados de Braford e Hereford através de painéis de baixa densidade (3K, 6K, 8K, 15K e 20K) para os painéis de 50K e 777K. Para o painel de 777K, também foram utilizados na imputação os painéis de 50K, 90iK e 90tK. Os resultados indicaram que, com exceção do painel de 3K, todos os demais painéis de baixa densidade poderiam ser utilizados como base visando à imputação para o painel de 50K e também que os painéis de média densidade (50K, 90iK e 90tK), poderiam ser utilizados como base na imputação para o painel de 777K. Esses painéis mostraram-se eficientes e possuem, em geral, custos compatíveis com a atividade pecuária; (3) avaliar a acurácia de predição dos valores genômicos utilizando alguns painéis de baixa densidade (8K e 15K) imputados para o painel de 50K, relacionando os resultados com o uso do painel original de 50K. A acurácia do valor genômico direto (DGV) e do valor genético genômico (GEBV) com o valor genético (EBV) utilizando painéis imputados ou não, indicaram que não houveram diferenças em acurácia e as perdas em acurácia por utilizar os painéis imputados ficaram entre -0,0002 e -0,0021 dependendo do painel, do cenário e da característica analisada; (4) usar marcadores moleculares na seleção genômica testando dois métodos BLUP (procedimento de passo único ou de multi passo) com dados simulados de bovinos de corte. Os resultados demonstraram, com base nos parâmetros estudados, igualdade de resultados entre os dois procedimentos; (5) avaliar a viabilidade do uso da seleção genômica usando dados de campo de animais Braford e Hereford, testando os dois métodos BLUP (passo único e multi passo). Os resultados com base nos parâmetros estudados, mostraram que as acurácias de predição do DGV e do GEBV foram iguais nos dois procedimentos, porém no método multi passo as predições genômicas foram menos viesadas.

The aim of this work were: (1) to evaluate parameters of genetic diversity and population structure based on Angus, Devon, Hereford and Shorthorn breeds. Inbreeding rate (F), effective size (Ne), relatedness, among other parameters, were estimated to provide subsidies for breeding programs. The parameters indicated a good genetic diversity, with Ne ranging from 128 in Devon to 303 in Shorthorn and F ranging from 1.50 in Angus to 3.92 in Devon; (2) to evaluate strategies of genotype imputation with Braford and Hereford beef data using low density panels (3K, 6K, 8K, 15K and 20K) for 50K and 777K panels. For imputation to the 777K panel were also used the 50K, 90iK and 90tK panels. The results indicated that, except for the 3K panel, all other low density panels could be used of imputation the 50K panel and also the medium density panels (50K, 90iK and 90tK), could be used of imputation the 777K panel. These panels have been efficient and have, in general, compatible costs of the beef cattle operation; (3) to evaluate the accuracy of genomic prediction using some low density panels (8K and 15K) imputed to the 50K panel, relating the results with 50K original panel. The accuracy of direct genomic value (DGV) and genomic estimated breeding value (GEBV) with estimated breeding value (EBV) using imputed or not panels, indicated that there were no differences in accuracy and the losses in accuracy by using the imputed panels ranged from -0.0002 to -0.0021 depending on the panel, the scenario and the trait; (4) to use molecular markers in genomic selection testing two BLUP methods (single and two steps) with simulated beef cattle data. The results showed, based on the parameters studied, equality of results between the two methods; (5) to evaluate the viability of using the genomic selection using Braford and Hereford beef cattle and testing the two BLUP methods (single and two steps). The results, based on the parameters studied, showed that DGV and GEBV accuracies were similar in both methods, but the genomic predictions were less biased with then two-step method.

Demografia e estrutura populacional da raça caprina murciano-granadina na Espanha com base em análise de pedigree

Com o objetivo de estudar a estrutura de populações e a demografia da raça caprina Murciano-Granadina, foram avaliadas 24.444 informações de pedigree, pertencentes ao banco de dados da Asociación Nacional de Criadores de Caprino de Raza Murciano-Granadina - CAPRIGRAN. Para compor a estrutura da população, foram avaliados os seguintes parâmetros populacionais: número de gerações completas; número de gerações equivalentes; número efetivo de animais fundadores (fe); número efetivo de ancestrais (fa); coeficiente de consanguinidade (estatísticas F de Wright) e coeficiente médio de parentesco (AR), concluindo-se que a existência de variabilidade genética nas populações estudadas da raça caprina Murciano-Granadina da Espanha encontra-se em níveis satisfatórios, permitindo sua utilização em programas de melhoramento e de conservação de recursos genéticos. Para o censo demográfico, foram analisadas informações quantitativas sobre número de macho e fêmeas; intervalo médio de gerações (IG); tamanho efetivo da população (Ne), resultando na baixa profundidade dos pedigrees limitante na obtenção de parâmetros mais acurados e mais precisos. Os rebanhos menores apresentaram taxa sexual inferior ao recomendado, ao passo que o IG médio observado (2,77 anos) demonstra que a população está sob intenso trabalho de melhoramento genético, o que pode comprometer a variabilidade genética no futuro

Aiming at studying the structure of population and demography of Murciano-Granadina goat breed, 24,444 data on pedigree, from Asociación Nacional de Criadores de Caprino de Raza Murciano-Granadina CAPRIGRAN, were analyzed. In order to set population structure the following population data were analyzed: complete generations; complete generation equivalent; effective number of founders (fe); effective number of ancestors (fa); inbreed coefficient (F-statistics) and average relatedness coefficient (AR). The conclusion was that the levels of genetic variability in the studied population of Murciano-Granadina goat breed were in satisfactory level, allowing its utilization in programs of genetic improvement and conservation of genetic resources. As for demographic census, quantitative data were studied regarding: number of males and females; medium generation intervals (GI); effective number (Ne). The conclusion was that low depth of pedigrees limits getting more precise parameters. Smaller herds presented sex rate under recommended and the medium GI observed (2.77 years) demonstrates that population is under intense improvement work that can compromise genetic variability in the future

Estrutura populacional da raça ovina segureña e os efeitos da endogamia sobre características de crescimento

Objetivou-se, com esse trabalho, verificar o estado de conservação genética da raça espanhola de ovinos Segureño e avaliar os principais fatores envolvidos na determinação das características de crescimento em cordeiros da raça. Os dados usados neste estudo são provenientes da Asociación Nacional de Criadores de Ovino Segureño- ANCOS, sediada na província de Granada-Espanha. As informações sobre a variabilidade genética e a estrutura populacional foram obtidas utilizando as informações genealógicas de 37.459 animais registrados entre os anos de 1984 a 2007. Para avaliação dos efeitos da endogamia sobre o crescimento dos cordeiros, foram utilizadas as informações de pesagens de cordeiros, entre os anos de 1992 a 2007, e avaliados os pesos ao nascer (PN), aos 30 dias (P30), aos 45 dias (P45) e aos 75 dias (P75) de idade, além dos ganhos médios medidos entre 0-45, 0-75, e 45-75 dias de idade. Os parâmetros utilizados na avaliação da diversidade genética foram: número efetivo de fundadores , número efetivo de ancestrais , tamanho efetivo (Ne), coeficiente de consanguinidade (F), coeficiente de parentesco médio (AR), intervalo de gerações (IG) e índices de fixação ou estatística-F . Para análise dos efeitos dos níveis de endogamia sobre as características de crescimento, foram considerados os valores de endogamia individual e os fatores ambientais de sexo, ano-estação-rebanho, tipo de nascimento e idade da ovelha. Não foram observadas perdas de variabilidade genética significativas nos rebanhos estudados. Os índices de fixação indicam que não está ocorrendo subdivisão dentro da raça e os níveis de endogamia para as características de crescimento são considerados satisfatórios. Não foram identificados rebanhos núcleo, fato que pode ter contribuído para ausência de subestruturação dentro da raça. Entre os fatores ambientais considerados, o grupo de contemporâneos, formado por animais nascidos no mesmo ano-estação-rebanho, o tipo de nascimento e o sexo do cordeiro foram os que mais influenciaram os pesos e os ganhos médios de peso estudados

The goals of this thesis were to verify the conservation genetic status of the Segureño Spanish sheep breed and to evaluate the principal factors involved in the determination of growth traits in this breed. The data used n this study was provided by the Asociación Nacional de Criadores de Ovino Segureño ANCOS, located in Granada province, Spain. The information about genetic variability and population structure were obtained using genealogical records from 37.459 animals registered between the years 1984 2007. To evaluate the inbreeding effects on growth traits, weight measurements taken between the years 1992 2007 were considered. The traits evaluated were: birth weight (BW), weight at 30 (W30), 45 (W45) and 75 (W75) days of age and also the average daily gains between 0-45 (ADG0-45), 0-75 (ADG0-75) and 45-75 (ADG45-75) days of age. The parameters used to evaluate the genetic diversity were: effective number of founders , effective number of ancestors , effective population size , inbreeding coefficient , average relatedness coefficient , generation interval , and the fixation indexes . To analyze the effect of the inbreeding on growth traits, were considered the individual inbreeding estimates and the environmental effects of sex, year-season-herd, birth type and age of the ewe. For the herds studied, a significant loss of genetic variability was not observed. The fixation indexes suggest that there is no population subdivision within the breed and the inbreeding level can be considered satisfactory for growth traits. Nucleus herds were not observed which may have contributed for the absence of within breed substructure. Among the environmental factors considered, the contemporary group (formed by individuals born in the same year-season-herd), the birth type and the sex of the lamb were the most important factors affecting the weights and average weight gains studied

Análise temporal da endogamia e do tamanho efetivo da população de eqüinos da raça Mangalarga Marchador / Inbreeding and effective population size of the Brazilian Mangalarga Marchador horse breed

A partir de informações de 286.047 animais registrados na Associação Brasileira dos Criadores do Cavalo Mangalarga Marchador, desde a sua fundação, em 1949, até dezembro de 1999, verificaram-se o coeficiente de endogamia e o tamanho efetivo da raça Mangalarga Marchador. A média do coeficiente de endogamia para toda a população foi de 1,3% e diferente de zero para 22,6% dos animais. Considerando apenas os animais endogâmicos, o coeficiente médio de endogamia foi de 5,7%, mínimo de 0,001 e máximo de 46,9%. Observou-se que 50% da população endogâmica apresentou coeficiente de endogamia entre 0,0001 e 10%. Na população atual a média de endogamia foi 3,8%, enquanto a média nos pais foi de 7,3%. O tamanho efetivo da população variou entre os períodos bianuais de nascimentos, sendo de 9.174,24 animais para o período de 1998-1999. O valor máximo para a razão entre o tamanho efetivo e o número de animais da população foi quase sempre inferior a 0,50, variando de 0,39 em 1980-1981 a 0,79 em 1954-1955.(AU)

Data on 286,047 Mangalarga Marchador horses from the studbook of the Associação Brasileira dos Criadores do Cavalo Mangalarga Marchador, born between 1949 and 1999 were used to describe the population genetic structure of the breed. Average inbreeding coefficient was 1.3% for all population and 22.6% of all animals were inbred with average inbreeding coefficient of 5.7%, varying from 0.001 to 46.9%. For the actual population, average inbreeding coefficient was 3.8% for offspring and 7.3% for their parents. Variation between two-year periods was observed for effective population size which was 9, 174, 24 for animals born in the 1998-1999 period. The ratios between effective population size and observed number of animals were mostly less than .50, varying from .39 in 1980-1981 to .79 in 1954-1955.(AU)

Efeitos da seleção individual e da seleção baseada no BLUP em populações diferentes, quanto ao tipo de acasalamento / Individual selection and selection based on BLUP effects in different populations, according to mating design

Dados simulados foram utilizados para avaliar o desempenho da seleção individual e da seleção baseada no melhor preditor linear não-viesado (BLUP), em populações que diferiam entre si, quanto ao tipo de acasalamento, no decorrer de 50 gerações. Estudou-se uma característica quantitativa com herdabilidade igual a 0,10, em populações de 600 indivíduos, que apresentaram a seguinte estrutura: valores de razão sexual (d), de 10 e 50, tamanhos efetivos de população (Ne), de 36,36 e 7,84 e intensidade de seleção dos machos (im), de 2,23 e 2,82. Em cada valor de d, formaram-se populações correspondentes ao tipo de acasalamento, em todas as gerações: acasalamentos preferenciais de meios-irmãos e irmãos completos, acasalamentos preferenciais entre meios-irmãos, acasalamentos ao acaso, exclusão de acasalamentos entre irmãos completos e exclusão de acasalamentos de meios-irmãos e irmãos completos. As características avaliadas ao longo das gerações foram: valores fenotípicos médios, consangüinidade média, perda percentual por fixação de alelos desfavoráveis e limite da seleção. Observou-se que o BLUP, o tipo de acasalamento, excluindo acasalamentos entre irmãos e a menor razão sexual, juntos, proporcionaram os melhores resultados de valores fenotípicos, durante 45 gerações de seleção. Nessa estratégia de seleção, verificou-se também atraso no número de gerações necessárias para se atingir determinado nível de consangüinidade.(AU)

The performance of individual selection and of selection based on best linear unbiased prediction (BLUP) for simulated data of a low heritability trait (h2=.10) selected for fifty generation in a population of 600 animals with different mating structures were evaluated. The mating structures evaluated were: mating ratio (d) of 10 and 50, population size (Ne) 36.36 and 7.84 and male selection intensity (im ) of 2.23 and 2.82. For each d level half and full sib matings, half sib matings, random mating systems and the exclusion of full sib and of half and full sib matings were also evaluated. The average phenotypic value, average inbreeding, percentage of loss by fixation of undesirable alleles and selection limit were studied. The results suggested that BLUP, mating systems with exclusion of between sib matings, and the smallest mating ratio resulted in higher phenotypic value along the 45 generation of selection and the number of generations to reach a specific inbreeding coefficient considering this selection strategy increased.(AU)

AMELIA DE MEMBROS TORÁCICOS EM POTRO ÁRABE: RELATO DE CASO

Amelia é uma alteração congênita em que um ou mais membros anteriores estão ausentes, em parte ou totalmente. O presente relato de caso descreve a ocorrência de um caso de amelia bilateral dos membros torácicos de uma potranca, da raça Árabe, oriunda de uma gestação, cujos pais, possuíam grau de consangüinidade de 25%. O diagnóstico foi realizado através da inspeção, exame físico e radiológico, onde foi observada ausência dos ossos distais ao úmero no membro torácico direito e no membro torácico esquerdo havia um pequeno fragmento da diáfise e epífise do rádio e ulna.

Chondrodysplasia dexter type in aborted bovine fetuses / Condrodisplasia tipo Dexter em fetos bovinos abortados

Background: Chondrodysplasia is a congenital anomaly related to defects of the genes that control the chondrogenesis. This anomaly is described in many breeds of cattle and consanguineous matings increases the likelihood of developing defective traits. There are three distinct syndromes known: Dexter, Telemark and Brachycephalic type. The chondrodysplasia Dexter type syndrome is associated to an incompletely dominant gene, which occurs in Dexter and Holstein breeds more frequently, yet Charolais and Jersey can also be affected. There are three recognized phenotypes in this form of disease: severe achondroplasia, with abortion before the seventh month of gestation (monster Dexter), when related to dominant homozygous; chondrodisplasia with limbs shortening, when heterozygous; and normal animals, when recessive homozygous. The objective of this paper is to describe Dexter chondrodysplasia observed in two bovine fetuses examined by the Setor de Patologia Veterinária from Universidade Federal do Rio Grande do Sul (SPV-UFRGS).Case: The necropsy of two aborted bovine calves was performed by the SPV-UFRGS. The Fetus 1 did not have data, neither clinical history. The Fetus 2, a Jersey breed calf, was in the last third of gestation and came from a property with Jersey and mini-Jersey herd. Natural mating was used for reproduction, with only one bull. Macroscopic alterations observed in

Background: Chondrodysplasia is a congenital anomaly related to defects of the genes that control the chondrogenesis. This anomaly is described in many breeds of cattle and consanguineous matings increases the likelihood of developing defective traits. There are three distinct syndromes known: Dexter, Telemark and Brachycephalic type. The chondrodysplasia Dexter type syndrome is associated to an incompletely dominant gene, which occurs in Dexter and Holstein breeds more frequently, yet Charolais and Jersey can also be affected. There are three recognized phenotypes in this form of disease: severe achondroplasia, with abortion before the seventh month of gestation (monster Dexter), when related to dominant homozygous; chondrodisplasia with limbs shortening, when heterozygous; and normal animals, when recessive homozygous. The objective of this paper is to describe Dexter chondrodysplasia observed in two bovine fetuses examined by the Setor de Patologia Veterinária from Universidade Federal do Rio Grande do Sul (SPV-UFRGS).Case: The necropsy of two aborted bovine calves was performed by the SPV-UFRGS. The Fetus 1 did not have data, neither clinical history. The Fetus 2, a Jersey breed calf, was in the last third of gestation and came from a property with Jersey and mini-Jersey herd. Natural mating was used for reproduction, with only one bull. Macroscopic alterations observed in