Combined agricultural practices in millet and cactus: phyllochron, structural characteristics and relations with yield

Variation in rainfall affects crops; therefore, agricultural practices become essential for forage production in semi-arid regions. This study aimed to evaluate the influence of different agricultural practices on phyllochron, structural characteristics of forage cactus and millet, and their relations with crop yield using the principal component analysis (PCA). The design was in randomized blocks, with six treatments: sole cropped cactus without straw mulching, sole cropped cactus with straw mulching, sole cropped millet without straw mulching, sole cropped millet with straw mulching, and cactus intercropping with millet, with and without straw mulching, each with four replicates. There were three cactus cycles and nine millet cycles (three cycles of cultivars BRS1501 and six of IPA Bulk-1-BF). Biometric parameters were evaluated monthly, while yield was determined after the crop harvest. Phyllochron was determined with the regression analysis. The PCA was applied to structural characteristics and yield. The systems adopted did not influence the structural characteristics of cactus and millet ( p > 0.05), except for cladode thickness, which increased with straw mulching. Phyllochron of the millet reduced when the crop was intercropped. The structural characteristics of cladode length, width, and thickness influenced crop yield, mainly in systems with straw mulching. Straw mulching and intercropping alter phyllochron of cactus and millet. The adoption of straw mulching has a more significant relationship with cactus yield, whereas biometric variables influence crop yield for millet, not the cropping system.(AU)

Influence of essential oils on the quality of Vigna unguiculata L. (Walp.) seeds compared by traditional method, image and multivariate analysis / Influência de óleos essências na qualidade de sementes de Vigna unguiculata L. (Walp.) comparado pelo método tradicional, análise imagem e multivariada

The extracts of medicinal plants are used for the treatment of seeds in order to reduce the action of phytopathogens and increase the vigor of the seeds. Currently, computerized image analysis has been used to assess the physiological quality of seed lots. The objective was to evaluate the efficiency of the Vigor-S® software in the evaluation of the physiological quality of cowpea seeds treated with essential oils, comparing with a traditional test and the principal component analysis. Two cowpea cultivars were analyzed, BRS Tumucumaque and BRS Guariba, treated with doses of natural extracts of Alfavaca, garlic, horsetail, citronella and pyroligneous acid. The traditional method consisted of evaluations for germination, first germination count, seedling emergence, emergence speed index, accelerated aging, fresh matter and dry matter of seedling and the image analysis for: seedling length, growth index, uniformity index, vigor index, and germination. A Principal component analysis was applied to reduce the number of variables. Horsetail, Alfavaca and citronella extracts were efficient in increasing the physiological quality of the seeds of at least one cultivar. The Vigor-S® software proved to be efficient compared to traditional tests to assess the physiological quality of seeds. Principal Component Analysis is an ally to identify the best extracts and doses to be used. The image analysis method proved to be effective when compared to the traditional method and can therefore be used.

Os extratos de plantas medicinais são utilizados para o tratamento de sementes com o objetivo de diminuir a ação de fitopatógenos e aumentar o vigor das sementes. Atualmente, a análise computadorizada de imagens tem sido utilizada para avaliar a qualidade fisiológica de lotes de sementes. O objetivo foi avaliar a qualidade fisiológica de sementes de feijão-caupi tratadas com óleos essenciais, comparado com teste tradicional, análise imagem e a análise de componentes principais. Foram analisadas duas cultivares de feijão-caupi, BRS Tumucumaque e BRS Guariba, tratadas com doses de extratos naturais de alfavaca, alho, cavalinha, citronela e ácido pirolenhoso. O método tradicional consistiu em avaliações de germinação, primeira contagem de germinação, emergência de plântulas, índice de velocidade de emergência, envelhecimento acelerado, matéria fresca e matéria seca da plântula e a análise de imagem para: comprimento da plântula, índice de crescimento, índice de uniformidade, índice de vigor e germinação. Uma análise de componentes principais foi aplicada para reduzir o número de variáveis. Os extratos de cavalinha, alfavaca e citronela foram eficientes em aumentar a qualidade fisiológica das sementes de pelo menos uma cultivar. O software Vigor-S® mostrou-se eficiente em relação aos testes tradicionais para avaliação da qualidade fisiológica de sementes. A Análise de Componentes Principais é uma aliada para identificar os melhores extratos e doses a serem utilizados. O método de análise de imagens mostrou-se eficaz quando comparado ao método tradicional, podendo, portanto, ser utilizado.

Estimation of cropland prices in Rio Grande do Sul by multiple linear regression and principal component analysis / Estimação do preço das lavouras no Rio Grande do Sul por meio de regressão linear múltipla e análise de componentes principais

ABSTRACT: This study aimed to price croplands in Rio Grande do Sul State (southern Brazil) and point which variables had the most significant impact on prices. The main purpose was achieved using multiple linear regression and principal component analysis. The variables used in this study were planted area, production, price, and yield of the commodities soybean, wheat, and corn. The period under analysis was from January 1994 to December 2017 (biannual observations). Multiple linear regression showed that five variables contributed to land pricing, being three related to soybean and two to wheat. Multivariate analysis grouped the investigated variables into clusters and indicated their influence, in addition to providing information on land prices and reducing variable dimensionality from fourteen original variables to three principal components to be analyzed. The two analyses complemented each other so that the croplands' price was explained by three variables, in which two corroborated in constructing the pricing model for croplands.

RESUMO: Este estudo teve como objetivo a precificação de terra para lavouras no Rio Grande do Sul e apresentar quais variáveis possuem maior impacto no preço. O objetivo foi alcançado por meio da aplicação da análise de regressão linear múltipla e de componentes principais. Variáveis relacionadas às commodities soja, trigo e milho, como a área plantada, produção, cotação e rendimento, formaram o banco amostral para as duas metodologias, compreendendo o período de janeiro de 1994 a dezembro de 2017, em observações bianuais. A regressão linear múltipla mostrou que três variáveis relacionadas à soja e duas ao trigo contribuem na precificação das terras. A análise multivariada agrupou as variáveis investigadas, indicando a influência entre as mesmas, fornecendo informações sobre o preço de terras e diminuindo a dimensionalidade do problema de 14 variáveis originais para três componentes a serem analisados. As duas análises se complementaram de forma que o preço de terras foi explicado por três variáveis e duas corroboraram na construção do modelo de precificação das lavouras.

Estimation of cropland prices in Rio Grande do Sul by multiple linear regression and principal component analysis / Estimação do preço das lavouras no Rio Grande do Sul por meio de regressão linear múltipla e análise de componentes principais

This study aimed to price croplands in Rio Grande do Sul State (southern Brazil) and point which variables had the most significant impact on prices. The main purpose was achieved using multiple linear regression and principal component analysis. The variables used in this study were planted area, production, price, and yield of the commodities soybean, wheat, and corn. The period under analysis was from January 1994 to December 2017 (biannual observations). Multiple linear regression showed that five variables contributed to land pricing, being three related to soybean and two to wheat. Multivariate analysis grouped the investigated variables into clusters and indicated their influence, in addition to providing information on land prices and reducing variable dimensionality from fourteen original variables to three principal components to be analyzed. The two analyses complemented each other so that the croplands' price was explained by three variables, in which two corroborated in constructing the pricing model for croplands.

Este estudo teve como objetivo a precificação de terra para lavouras no Rio Grande do Sul e apresentar quais variáveis possuem maior impacto no preço. O objetivo foi alcançado por meio da aplicação da análise de regressão linear múltipla e de componentes principais. Variáveis relacionadas às commodities soja, trigo e milho, como a área plantada, produção, cotação e rendimento, formaram o banco amostral para as duas metodologias, compreendendo o período de janeiro de 1994 a dezembro de 2017, em observações bianuais. A regressão linear múltipla mostrou que três variáveis relacionadas à soja e duas ao trigo contribuem na precificação das terras. A análise multivariada agrupou as variáveis investigadas, indicando a influência entre as mesmas, fornecendo informações sobre o preço de terras e diminuindo a dimensionalidade do problema de 14 variáveis originais para três componentes a serem analisados. As duas análises se complementaram de forma que o preço de terras foi explicado por três variáveis e duas corroboraram na construção do modelo de precificação das lavouras.

Effect of the diet on performance characteristics and quality of meat fat of lamb by principal component analysis

The objective of this study was to evaluate the effect of use of agroindustrial co-products in the diet of lambs on the performance and nutritional quality of meat fat. Twenty lambs were distributed into four experimental groups: control diet (C) or diets containing cottonseed (CS), sunflower meal (SFM), and castor cake (CC). During the experimental period, data on dry matter consumption (DMC) and total weight gain (TWG) were collected. After slaughter, samples of Logissimus dorsi (LD) muscle were taken for fatty acids and cholesterol analysis. Diets C and CS provided similar characteristics of fat quality and animal performance. However, SFM and CC diets tend to form isolated groups, with different fat and performance characteristics. The SFM diet results in meat with a higher saturated fatty acids and cholesterol content. The CC diet is related to improved performance characteristics and lower cholesterol content. In conclusion, the inclusion of CC in the experimental diets provided, in the proportions used in this experiment, better characteristics of animal performance and meat fat quality.(AU)

Effect of the diet on performance characteristics and quality of meat fat of lamb by principal component analysis

The objective of this study was to evaluate the effect of use of agroindustrial co-products in the diet of lambs on the performance and nutritional quality of meat fat. Twenty lambs were distributed into four experimental groups: control diet (C) or diets containing cottonseed (CS), sunflower meal (SFM), and castor cake (CC). During the experimental period, data on dry matter consumption (DMC) and total weight gain (TWG) were collected. After slaughter, samples of Logissimus dorsi (LD) muscle were taken for fatty acids and cholesterol analysis. Diets C and CS provided similar characteristics of fat quality and animal performance. However, SFM and CC diets tend to form isolated groups, with different fat and performance characteristics. The SFM diet results in meat with a higher saturated fatty acids and cholesterol content. The CC diet is related to improved performance characteristics and lower cholesterol content. In conclusion, the inclusion of CC in the experimental diets provided, in the proportions used in this experiment, better characteristics of animal performance and meat fat quality.

Divergência fenotípica entre éguas Crioulas das linhagens uruguaia "La invernada", argentina "Cardal" e chilena / [Phenotypic divergence between Criollo mares lines of the Uruguayan "La invernada", Argentine "Cardal" and Chilean]

O objetivo do presente estudo foi analisar a dissimilaridade fenotípica de amostras populacionais de três linhagens de éguas Crioulas, uruguaia (La Invernada), argentina (Cardal) e chilena, para caracteres morfológicos, apontando as características de maior variância intra e entre as diferentes linhagens que são passíveis de seleção. Foram avaliadas 22 características morfológicas de 113 éguas da linhagem uruguaia "La Invernada", 38 argentinas "Cardal" e 73 chilenas puras, totalizando 224 éguas de cria pertencentes à raça Crioula. Para determinação das variáveis lineares e de perímetro, foi utilizada fita métrica, prumo, paquímetro e hipômetro. Verificou-se variabilidade nas características morfológicas entre as três linhagens (P<0,05), incluindo as características lineares altura, perímetro de tórax e perímetro de canela (P<0,01), consideradas de caráter impositivo para fins de registro. Maior variação fenotípica foi observada nas éguas da linhagem chilena em relação aos outros dois grupos genéticos (P<0,01). As características morfológicas altura garupa, perímetro rostral pescoço, comprimento metatarso, largura garupa, profundidade do tórax, comprimento dorsal pescoço e comprimento do corpo foram passíveis de seleção entre as éguas Crioulas pertencentes às linhagens argentina (Cardal), uruguaia (La Invernada) e chilena. Em conclusão, não há homogeneidade entre as linhagens estudadas, o que identifica a diversidade entre as linhagens de éguas Crioulas estudadas.(AU)

The aim of the study was to analyze the phenotypic dissimilarity of morphological characteristics of three strains of Criollo mares, Uruguian (La Invernada), Argentine (Cardal), and Chilena, pointing to the characteristics of higher variance within and among the different strains that are selectable. We evaluated 22 morphological characteristics of 113 mares of the Uruguaian line, 38 Argentines and 73 pure Chilean, totaling 224 breeding mares belonging to the criollo breed. For the determination of the linear and perimeter variables, a metric tape, plumb, pachymeter and hypometer were used. There was variability in the morphological characteristics between the three strains (P<0.05), including the linear characteristics of height, chest circumference and perimeter of cinnamon (P<0.01), considered as taxation for registration purposes. Higher phenotypic variation was observed in the mares of the Chilean line in relation to the other two genetic groups (P<0.01). The morphological characteristics of height croup, rostral perimeter neck, metatarsal length, croup width, chest depth, dorsal neck length, and body length were the selectable characteristics among the breeding mares belonging to the Argentine (Cardal), Uruguaian (La Invernada) and Chilena strains. In conclusion, there is no homogeneity between the studied strains, which identifies the diversity among the lines of Criollo mares studied.(AU)

Soil macrofauna as bioindicator of the recovery of degraded cerrado soil / Macrofauna do solo como bio indicador da recuperação de um solo degradado de cerrado

The construction of the hydroelectric power plant of Ilha Solteira, in state of São Paulo, was initiated in the 1960s, when an average, 8.60 m of soil depth was removed, resulting in a degraded area. A plan for the recovery of the area started in 2005 in Selvíria /MS with the use of plant species adapted to the Cerrado biome. This study aimed to evaluate the soil macrofauna of an area under recovery by using different types of soil cover (1- bare soil (control); 2- native Cerrado vegetation; 3- specie Astronium fraxinifolium; 4- Astronium fraxinifolium + Canavalia ensiformis; 5- Astronium fraxinifolium + Raphanus sativus; 6- Astronium fraxinifolium + Brachiaria decumbens + sewage sludge). Soil macrofauna was evaluated in 2005, 2006 and 2007 using the direct collection method and manual counting. Number of species, diversity and uniformity index were determined. Principal component analysis (PCA) and cluster analysis were used for data interpretation. Results showed that treatment 6 (Astronium fraxinifolium+ Brachiaria decumbens+ sewage sludge) increased the soil macrofauna population by approximately 4 to 6 times more than the other types of cover after three years of evaluation. And the PCA and cluster analysis showed the approximation of the data between treatment 6 and Cerrado, which represents the most appropriate treatment for the recovery of the degraded soil.(AU)

A construção da usina hidrelétrica de Ilha Solteira, no interior de São Paulo, foi iniciada nos anos 1960, quando foi retirado, em média, 8,60 m de solo em profundidade, dando origem a uma área degradada. Com isso, iniciou-se em 2005 um plano de recuperação da área no município de Selvíria/MS com plantio de espécies vegetais adaptadas ao bioma Cerrado. Assim, este trabalho teve como objetivo avaliar a macrofauna do solo de uma área em processo de recuperação com plantio de diferentes tipos de cobertura vegetal (1- solo nu (testemunha); 2- vegetação nativa de Cerrado; 3- espécie arbórea Astronium fraxinifolium; 4- Astronium fraxinifolium + Canavalia ensiformis; 5- Astronium fraxinifolium + Raphanus sativus; 6- Astronium fraxinifolium + Brachiaria decumbens + lodo de esgoto). A macrofauna de solo foi avaliada em 2005, 2006 e 2007 utilizando o método de coleta direta e contagem manual. Foram determinados: quantidade de espécies e índices de diversidade e uniformidade. As análises de componentes principals (PCA) e de cluster foram utilizadas para interpretação de dados. Os resultados mostraram que o tratamento 6 (Astronium fraxinifolium + Brachiaria decumbens + lodo de esgoto) aumentou a população de macrofauna do solo em aproximadamente 4 a 6 vezes mais que os demais tipos de cobertura vegetal após três anos de avaliação. As análises de PCA e de cluster mostraram aproximação dos dados do tratamento 6 às condições ambientais naturais de Cerrado, indicando ser o tratamento mais adequado para a recuperação do solo degradado.(AU)

Qualitative monitoring of corn silage stored in commercial bunker silos and used as feed for dairy cattle in the western region of Santa Catarina State, Brazil / Monitoramento da composição bromatológica de silagens de milho ensiladas em silos do tipo trincheira e utilizadas na alimentação de rebanhos leiteiros no Oeste Catarinense

Corn ensiling is a feed preservation practice used for ruminant production. During the process of making and opening the silos, the quality of the silage may change due to the entrance of air, which can cause damage and decrease the voluntary intake of the animals. The objective of this work was to evaluate the chemical composition of corn silages during their use in commercial bunker silos, as well as to correlate this with qualitative and quantitative characteristics related to the silage making process. Technical data on silage making and samples were collected from 14 bunker silos, with five samples collected along each silo (at 10, 30, 50, 70 and 90% of their lengths); additionally, two sampling methodologies were compared (“W” vs. layer collections in silo panels: top, middle and bottom). The values for the pH and titratable acidity (TA) were significant (p < 0.05) in relation to the sampling method, where the pH of the top was higher (3.8±0.5) than that of the middle and the bottom layers (3.6±0.3 and 3.5±0.3); therefore, the TA was lower in the top of the silos. The dry matter, ashes, crude protein, neutral detergent fiber, acid detergent fiber, pH, TA, as well as the silo sampling method during the unloading of commercial bunker silos did not differ for any of the variables (p < 0.05). Also, the particle size did not differ during the unloading of the commercial bunker silos (p > 0.05). According to the collected technical data, 78.57% of the bunker silos were built directly on the ground, the harvesting equipment was mostly borrowed from municipalities or farmers associations (for 35.7 and 28.5% of the farms, respectively), and in only 64.2% of the farms, the harvester was sharpened before silage cutting. Good practices were applied during the corn silage process and throughout the use of the silos, homogeneous quality was detected in the western region of Santa Catarina. Either “W” or layer collections can be used to sample corn silage.(AU)

A ensilagem de milho é uma prática de conservação de alimento utilizada na produção de ruminantes. Durante o processo de confecção e abertura do silo, a silagem pode ter alterações em sua qualidade em função da entrada de ar, que pode causar prejuízos e diminuir o consumo dos animais. Objetivou-se avaliar a composição bromatológica das silagens de milho ao longo da utilização, de silos comerciais do tipo trincheira, bem como correlaciona-las com as características qualitativas e quantitativas, relacionadas ao processo de confecção das silagens. Os dados técnicos sobre a confecção da silagem, bem como amostras foram coletas à campo em 14 propriedades, em que foram coletadas cinco amostras ao longo de cada silo (relativos à 10, 30, 50, 70 e 90% do seu comprimento), e adicionalmente duas metodologias de amostragem foram comparadas (coletas em “W” vs. coletas em estratos do painel do silo: topo, meio e base). Os valores de pH e AT (p < 0,05), foram significativos em relação ao método de amostragem, em que o pH do topo foi maior (3,8±0,5) que o do meio e o da base (3,6±0,3 e 3,5±0,3); portanto, a AT foi menor no topo dos silos. Os resultados encontrados para MS, MM, PB, FDN e FDA, pH e AT, assim como comparado ao método de amostragem do silo não diferiram entre si para nenhuma das variáveis (p < 0,05). Além disso, o tamanho das partículas não diferiu ao longo da utilização dos silos comerciais tipo trincheira (p > 0.05). O levantamento técnico mostrou que 78,57% dos silos trincheira avaliados foram construídos diretamente no solo, que os equipamentos de colheita utilizados foram emprestados de prefeituras ou associações de agricultores (para 35,7% e 28,5% das fazendas), ou que em somente 64,2% das fazendas o equipamento de colheita foi afiado antes da colheita. Foram observadas boas práticas de ensilagem de milho e homogênea qualidade ao longo do silo. Ambos métodos de coleta, em “W” como em estratos do painel podem ser usados durante amostragem de silagem de milho.(AU)

Qualitative monitoring of corn silage stored in commercial bunker silos and used as feed for dairy cattle in the western region of Santa Catarina State, Brazil / Monitoramento da composição bromatológica de silagens de milho ensiladas em silos do tipo trincheira e utilizadas na alimentação de rebanhos leiteiros no Oeste Catarinense

Corn ensiling is a feed preservation practice used for ruminant production. During the process of making and opening the silos, the quality of the silage may change due to the entrance of air, which can cause damage and decrease the voluntary intake of the animals. The objective of this work was to evaluate the chemical composition of corn silages during their use in commercial bunker silos, as well as to correlate this with qualitative and quantitative characteristics related to the silage making process. Technical data on silage making and samples were collected from 14 bunker silos, with five samples collected along each silo (at 10, 30, 50, 70 and 90% of their lengths); additionally, two sampling methodologies were compared (“W” vs. layer collections in silo panels: top, middle and bottom). The values for the pH and titratable acidity (TA) were significant (p 0.05). According to the collected technical data, 78.57% of the bunker silos were built directly on the ground, the harvesting equipment was mostly borrowed from municipalities or farmers’ associations (for 35.7 and 28.5% of the farms, respectively), and in only 64.2% of the farms, the harvester was sharpened before silage cutting. Good practices were applied during the corn silage process and throughout the use of the silos, homogeneous quality was detected in the western region of Santa Catarina. Either “W” or layer collections can be used to sample corn silage.

A ensilagem de milho é uma prática de conservação de alimento utilizada na produção de ruminantes. Durante o processo de confecção e abertura do silo, a silagem pode ter alterações em sua qualidade em função da entrada de ar, que pode causar prejuízos e diminuir o consumo dos animais. Objetivou-se avaliar a composição bromatológica das silagens de milho ao longo da utilização, de silos comerciais do tipo trincheira, bem como correlaciona-las com as características qualitativas e quantitativas, relacionadas ao processo de confecção das silagens. Os dados técnicos sobre a confecção da silagem, bem como amostras foram coletas à campo em 14 propriedades, em que foram coletadas cinco amostras ao longo de cada silo (relativos à 10, 30, 50, 70 e 90% do seu comprimento), e adicionalmente duas metodologias de amostragem foram comparadas (coletas em “W” vs. coletas em estratos do painel do silo: topo, meio e base). Os valores de pH e AT (p 0.05). O levantamento técnico mostrou que 78,57% dos silos trincheira avaliados foram construídos diretamente no solo, que os equipamentos de colheita utilizados foram emprestados de prefeituras ou associações de agricultores (para 35,7% e 28,5% das fazendas), ou que em somente 64,2% das fazendas o equipamento de colheita foi afiado antes da colheita. Foram observadas boas práticas de ensilagem de milho e homogênea qualidade ao longo do silo. Ambos métodos de coleta, em “W” como em estratos do painel podem ser usados durante amostragem de silagem de milho.

Concentrações de nitrato em águas de abastecimento público de 88 municípios da Rede Regional de Atenção à Saúde 13 do estado de São Paulo, Brasil / Concentrations of nitrate in the public water supply of 88 municipalities of the Regional Health Care Network 13 of the São Paulo State, Brazil

Este trabalho apresenta as concentrações de nitrato e suas correlações com as demais variáveis obtidas da análise de 21 parâmetros físico-químicos em 4.347 amostras de águas de abastecimento público de 88 municípios da região nordeste do Estado de São Paulo, Brasil. Os parâmetros analisados foram temperatura, pH, cloro residual livre, cor aparente, turbidez, condutividade e concentrações de lítio, sódio, amônio, potássio, cálcio, magnésio, fluoreto, clorito, bromato, cloreto, brometo, clorato, nitrato, fosfato e sulfato. Análises de componentes principais, incluindo-se as variáveis condutividade e concentrações de nitrato, cloreto, cálcio e magnésio na água, indicaram um grupo de 15 municípios com concentrações relevantes de nitrato. Foi realizada a análise univariada, e foi sugerido o estabelecimento de estratégias no gerenciamento inicial de contaminações de águas subterrâneas. No planejamento de ações entre os diversos atores envolvidos com a gestão da água subterrânea destinada ao consumo humano da região e no monitoramento de sua qualidade, devem ser considerados os níveis de nitrato, assim como os perfis físico-químicos das águas e a complexidade dos sistemas de abastecimento. Estas ações incluem procedimentos para investigar e mitigar contaminações, para garantir a potabilidade da água consumida pela população.

This paper presents the nitrate concentrations and their correlations with other variables obtained by analyzing 21 physical-chemical parameters in 4,347 samples from public water supply of 88 municipalities in the northeast region of the State of São Paulo, Brazil. The analyzed parameters were temperature, pH, free residual chlorine, apparent color, turbidity, conductivity, and concentrations of lithium, sodium, ammonium, potassium, calcium, magnesium, fluoride, chlorite, bromate, chloride, bromide, chlorate, nitrate, phosphate, and sulfate. The principal component analysis, involving the conductivity and the concentrations of nitrate, chloride, calcium, and magnesium, showed a group of 15 municipalities with relevant concentrations of nitrate. As for the univariate analysis it is suggested to apply strategies in the initial management of groundwater contaminations. It has been suggested to plan the actions among the various actors involved in the management of groundwater, which is intended for human consumption in the region, and for its quality monitoring. It has to consider not only the nitrate levels but also the water physical-chemical profiles and the complexity of the supply systems. These actions include the contaminants investigation and mitigation for ensuring the potability of the water consumed by the population.

Concentrações de nitrato em águas de abastecimento público de 88 municípios da Rede Regional de Atenção à Saúde 13 do estado de São Paulo, Brasil / Concentrations of nitrate in the public water supply of 88 municipalities of the Regional Health Care Network 13 of the São Paulo State, Brazil

Este trabalho apresenta as concentrações de nitrato e suas correlações com as demais variáveis obtidas da análise de 21 parâmetros físico-químicos em 4.347 amostras de águas de abastecimento público de 88 municípios da região nordeste do Estado de São Paulo, Brasil. Os parâmetros analisados foram temperatura, pH, cloro residual livre, cor aparente, turbidez, condutividade e concentrações de lítio, sódio, amônio, potássio, cálcio, magnésio, fluoreto, clorito, bromato, cloreto, brometo, clorato, nitrato, fosfato e sulfato. Análises de componentes principais, incluindo-se as variáveis condutividade e concentrações de nitrato, cloreto, cálcio e magnésio na água, indicaram um grupo de 15 municípios com concentrações relevantes de nitrato. Foi realizada a análise univariada, e foi sugerido o estabelecimento de estratégias no gerenciamento inicial de contaminações de águas subterrâneas. No planejamento de ações entre os diversos atores envolvidos com a gestão da água subterrânea destinada ao consumo humano da região e no monitoramento de sua qualidade, devem ser considerados os níveis de nitrato, assim como os perfis físico-químicos das águas e a complexidade dos sistemas de abastecimento. Estas ações incluem procedimentos para investigar e mitigar contaminações, para garantir a potabilidade da água consumida pela população. (AU)

This paper presents the nitrate concentrations and their correlations with other variables obtained by analyzing 21 physical-chemical parameters in 4,347 samples from public water supply of 88 municipalities in the northeast region of the State of São Paulo, Brazil. The analyzed parameters were temperature, pH, free residual chlorine, apparent color, turbidity, conductivity, and concentrations of lithium, sodium, ammonium, potassium, calcium, magnesium, fluoride, chlorite, bromate, chloride, bromide, chlorate, nitrate, phosphate, and sulfate. The principal component analysis, involving the conductivity and the concentrations of nitrate, chloride, calcium, and magnesium, showed a group of 15 municipalities with relevant concentrations of nitrate. As for the univariate analysis it is suggested to apply strategies in the initial management of groundwater contaminations. It has been suggested to plan the actions among the various actors involved in the management of groundwater, which is intended for human consumption in the region, and for its quality monitoring. It has to consider not only the nitrate levels but also the water physical-chemical profiles and the complexity of the supply systems. These actions include the contaminants investigation and mitigation for ensuring the potability of the water consumed by the population.(AU)

Soil management of sugarcane fields affecting CO2 fluxes

The harvesting system of green sugarcane, characterized by mechanized harvesting and no crop burning, affects soil quality by increasing the remaining straw left on the soil surface after harvesting, thus, contributing to the improvement of physical, chemical, and microbiological soil attributes, influencing CO2 fluxes. This study aimed to evaluate CO2 fluxes and their relation to soil properties in sugarcane crops under different harvesting managements: burned (B), Green harvesting for 5 years (G-5) and Green harvesting for ten years (G-10). For this, a 1 ha sampling grid with 30 points was installed in each area, all located in the Northeast of São Paulo State, Brazil. In each point, CO2 fluxes were measured and the soil was sampled to analyze the microbial biomass, physical (soil moisture and temperature, mean weight diameter, bulk density, clay, macroporosity and microporosity) and chemical characterization (pH, organic C, base saturation and P). The CO2 fluxes were divided into four quantitative criteria: high, moderate, low and very low from the Statistical Division (mean, first quartile, median and third quartile) and the other data were classified according this criterion. The Principal Component Analysis (PCA) was used to identify the main soil attributes that influence CO2 fluxes. The results showed that G-10 CO2 fluxes were 28 and 41 % higher than those in the G-5 and B treatments, respectively. The PCA analysis showed that macroporosity was the main soil attribute that influenced the high CO2 fluxes.

Soil management of sugarcane fields affecting CO2 fluxes

The harvesting system of green sugarcane, characterized by mechanized harvesting and no crop burning, affects soil quality by increasing the remaining straw left on the soil surface after harvesting, thus, contributing to the improvement of physical, chemical, and microbiological soil attributes, influencing CO2 fluxes. This study aimed to evaluate CO2 fluxes and their relation to soil properties in sugarcane crops under different harvesting managements: burned (B), Green harvesting for 5 years (G-5) and Green harvesting for ten years (G-10). For this, a 1 ha sampling grid with 30 points was installed in each area, all located in the Northeast of São Paulo State, Brazil. In each point, CO2 fluxes were measured and the soil was sampled to analyze the microbial biomass, physical (soil moisture and temperature, mean weight diameter, bulk density, clay, macroporosity and microporosity) and chemical characterization (pH, organic C, base saturation and P). The CO2 fluxes were divided into four quantitative criteria: high, moderate, low and very low from the Statistical Division (mean, first quartile, median and third quartile) and the other data were classified according this criterion. The Principal Component Analysis (PCA) was used to identify the main soil attributes that influence CO2 fluxes. The results showed that G-10 CO2 fluxes were 28 and 41 % higher than those in the G-5 and B treatments, respectively. The PCA analysis showed that macroporosity was the main soil attribute that influenced the high CO2 fluxes.(AU)

PESTIVÍRUS EM SUÍNOS E BOVINOS: UMA ABORDAGEM SOROLÓGICA, MOLECULAR E EVOLUTIVA

O gênero Pestivirus, pertencente à família Flaviviridae, compreende vírus de genoma RNA classificados em 11 espécies e na sua grande maioria (10 espécies) estão associadas a infecções em animais ungulados. No Brasil, assim como em vários países, os pestivírus podem afetar a atividades pecuária e gerar prejuízos econômicos, como infecção por Pestivirus C (peste suína clássica) e K (pestivírus atípico porcino) em suínos e por Pestivirus A, B (vírus da diarreia viral bovina 1, 2) e H (pestivírus hobi-like) em bovinos. Com o objetivo de contribuir com mais informações acerca da epidemiologia e diversidade dos pestivírus no Brasil e da caracterização antigênica entre cepas de pestivírus de bovinos, o presente trabalho será apresentado sob a forma de 4 capítulos. O objetivo e resultados alcançados nos trabalhos foram, respectivamente: 1) a caracterização de pestivírus detectados em suínos de criação de fundo de quintal no Rio Grande do Sul, através de soroneutralização para detecção de anticorpos contra vírus da diarreia viral bovina (BVDV) 1 e 2, além de RT-PCR para detecção de pestivírus seguida de sequenciamento e análise filogenética. Como resultado, 28 (4,4%) das amostras foram positivas na sorologia e duas amostras foram positivas na RT-PCR e classificadas como BVDV-1d e BVDV-2a; 2) a primeira descrição de Pestivirus K no Brasil, através de análise de amostras de leitões nascidos com tremores congênitos em duas granjas do Sul do país por RT-PCR. Como resultado, foi obtida a primeira detecção deste vírus na América do Sul;.3) o uso da Análise de Componentes Principais (PCA) como ferramenta estatística para caracterização de cepas de BVDV-1 e 2 através de soroneutralização. Os resultados demonstraram que a PCA gerou gráficos de fácil visualização e interpretação de diferenças e semelhanças entre agrupamentos antigênicos e que não houve mesmo padrão de antigenicidade entre isolados pertencentes a um mesmo subgenótipo; e 4) a caracterização de pestivírus detectados em amostras de bovinos recebidas no Laboratório de Virologia Veterinária-UFRGS entre 2016-2018, bem como inferência temporal (através da ferramenta relógio molecular) dos subgenótipos de pestivírus de bovinos já escritos no Brasil. Como resultado, foram descritas amostras de subgenótipos BVDV-1a, 1b e 2b (mais prevalentes no país) e 1d e 1e (subgenótipos já descritos, porém menos frequentes), e análise temporal da filodinâmica destas cepas e outras representando os subgenótipos já descritos no país pode ser inferida e explicada pela história da pecuária bovina no país. Os resultados aqui apresentados somam novo conhecimento acerca dos pestivírus e podem no futuro contribuir para planos de controle e erradicação das doenças causadas por pestivírus no país.

The genus Pestivirus, belonging to the family Flaviviridae, comprises RNA genome viruses classified into 11 species, from which 10 species are associated with infection in ungulate animal hosts. In Brazil, as in several countries, pestiviruses can affect livestock and generate economic losses, such as Pestivirus C (classical swine fever virus) and K (atypical porcine pestivirus- APPV) swine infection and Pestivirus A, B (bovine viral diarrhea virus 1, 2- BVDV-1, 2) and H (HoBi-like virus) cattle infection. In order to contribute with data about pestiviruses in Brazil and antigenic characterization of bovine pestivirus strains, the present thesis will be presented in 4 chapters. The chapters present 1) the characterization of pestiviruses detected in backyard pigs in Rio Grande do Sul, 2) the first description of Pestivirus K in Brazil, 3) the use of Principal Component Analysis (PCA) as a statistical tool for antigenic characterization of strains of bovine pestiviruses and 4) the characterization of pestiviruses detected in bovine samples sent to the Veterinary Virology Laboratory-UFRGS between 2016-2018, as well as temporal inference (through the molecular clock tool) of subgenotypes detected in Brazil. In the first chapter, swine serum samples from backyard animals from Rio Grande do Sul state were tested through serum neutralization in order to detect antibodies against BVDV-1 and 2, as well as RT-PCR to detect pestivirus followed by sequencing and phylogenetic analysis. As a result, 28 (4.4%) of the samples were positive in serology and two samples were positive in RT-PCR and classified as BVDV-1d and BVDV-2a. In the second chapter, samples of piglets born with congenital tremors from two pig farms in South Brazil were analyzed using RT-PCR in an attempt to first detect the recently described Pestivirus K species in Brazilian swine herds. As a result, this was the first detection of APPV in South America. In the third chapter, PCA was applied to virus neutralization results in order to visualize antigenic relationships between vaccine strains and field isolates from several BVDV subgenotypes. As a result, PCA generated easy interpretation graphics for differences and similarities between antigenic clusters. The results also demonstrated that there are no grouping patterns between isolates belonging to the same subgenotype. In the fourth chapter, phylogeny of pestivirus samples received in the laboratory from 2016 to 2018 resulted in detection of BVDV-1a, 1b and 2b (most prevalent in the country) and 1d and 1e (less frequent) subgenotypes, and temporal analysis of subgenotypes in the country could be inferred. The results presented here contribute to pestiviruses knowledge and may in the future contribute to control and eradication of pestiviruses in the country.

OPTIMIZING THE UTILIZATION OF WHOLE PLANT CORN SILAGE AND SNAPLAGE BY SELECTING HYBRIDS AND MATURITIES

Artigo 1: Dezessete híbridos de milho foram avaliados para verificar como as características agronômicas da planta de milho influenciam a produtividade de matéria seca (PMS) em híbridos usados para silagem de planta inteira e para silagem de espiga. Avaliações agronômicas dos híbridos foram feitas quando as plantas atingiram 35% de MS e quando as espigas atingiram 65% de MS. Análises descritivas foram usadas para caracterizar os híbridos e Análise de Componentes Principais (PCA) foram usadas para identificar as características agronômicas associadas a PMS. A PMS variou de 22,4 a 32,2 ton/ha e em média, a PMS foi de 26,6 ton/ha. A produtividade da porção fibrosa variou de 11,8 a 20,7 ton/ha, enquanto a produtividade de grãos variou de 9,50 a 12,9 ton/ha. O peso individual de planta mínimo, médio e máximo foram; 0,32, 0,38 0,46; kg/MS, respectivamente. A PMS de espigas variou de 12,1 a 20,9 ton/ha, e em média, os híbridos produziram 16,8 ton/ha. A proporção mínima e máxima de grãos na espiga foi de 72,6 e 81,3%, respectivamente. A proporção de sabugo e palha média foi de 11,7 e 11,9%, respectivamente. De acordo a PCA, a PMS de híbridos usados para produção de silagem de planta inteira foi principalmente explicada pelo peso individual de planta e pela produtividade da porção fibrosa. Por outro lado, a produtividade de grãos e o comprimento de espigas foram os principais fatores a explicarem a PMS de espigas. Diferentes características agronômicas determinam PMS em híbridos usados para silagem de planta inteira e silagens de espiga. Os híbridos com alta PMS de planta inteira não necessariamente são as melhores opções para produção de silagem de espiga. Artigo 2: Cinco híbridos de milho foram colhidos em três estágios de maturidade para produzir silagens de espigas. Os híbridos foram colhidos com 600g/kg (M1); 650 g/kg (M2) e 700 g/kg (M3) de MS. Espigas de milho foram fracionadas em grãos, palha e sabugo. Em um segundo momento, as espigas foram processadas e ensiladas por 90d. Foram realizadas avaliações das produtividades de matéria seca (PMS), digestibilidade de fibra em detergente neutro (DFDN30h,), e degradabilidade do amido in situ (DAis) para os componentes da espiga e para as silagens. O experimento foi conduzido em blocos causalizados usando medida repetida no tempo. Os dados foram analisados utilizando o MIXED do SAS, seguido pelo teste de t de Student P 0,05. As concentrações de MS no momento da colheita foram 591, 642 e 683 g/kg para M1, M2 e M3, respectivamente. As concentrações de FDN no sabugo aumentaram (771, 793 e 819 g/kg da MS) e a DFND30h reduziram (261, 244 e 209 g/kg do FDN) para M1, M2 e M3, respectivamente. As concentrações de FDN na palha foram 819, 837 e 841 g/kg da MS e a DFDN30h foram 320, 257 e 246 g/kg da FDN, para M1, M2 e M3, respectivamente. As maiores concentrações de ácido lático (5,90 g/kg da MS) e N-NH3 (38,2 g/kg do N) foram encontradas em M1. As concentrações de amido e a DAis em silagens de espigas foram afetadas pelo híbrido e pela maturidade (P < 0.05). Com o aumento da maturidade a DAis reduziu (783, 731, e 703 g/kg de amido) para MI, M2 e M3, respetivamente. Silagens de espiga devem ser produzidas no intervalo entre 600 e 700 g/kg de MS. Colheitas em estágios de maturidade inferior a 600 g/kg de MS pode comprometer a concentração de amido na silagem, e em concentrações superiores a 700 g/kg de MS pode implicar em restrições na fermentação e sobre a degradabilidade do amido.

Paper 1: Seventeen corn hybrids were evaluated to examine agronomic characteristics that has influence on performance to make whole plant corn silage (WPCS) and snaplage. Hybrids were harvested at the target 35% of DM for WPCS, and ear corn were harvested with 65% of DM for snaplage. The descriptive statistics was used to characterize hybrids. Principal Component Analysis (PCA) was performed to identify traits associated with dry matter yield (DMY) for both type of silage. For WPCS, the DMY ranged from 22.4 to 32.2 ton/ha and on average the hybrids have 26.6 ton/ha. The stover yield ranged from 11.8 to 20.7 ton/ha, while kernel yield ranged from 9.50 to 12.9 ton/ha. The plant weight minimum, average and maximum were 0.32, 0.38 and 0.46, kg of DM, respectively. For snaplage, the ear corn DMY ranged to 12.1 to 20.9 ton/ha, and the average was 16.8 ton/ha. The minimum and maximum kernel proportion were 72.6 and 81.3%, respectively. The husk and cob proportions average were 11.7, and 11.9, respectively. According to PCA, plant weight and stover yield have great contribution to determine DMY in hybrids used by WPCS. The kernels yield and the ear length were the mains factors to determine the ear corn DMY for snaplage. Different agronomic characteristics determine DMY for WPCS and snaplage. Hybrids with great DMY of whole plant not necessarily are the best option to making snaplage. Paper 2: In the second study, five hybrids were harvested at three maturities to make snaplage. Hybrids were harvested at the target maturity levels of 600 g/kg of DM (M1), 650 g/kg of DM (M2), and 700 g/kg of DM (M3). Fresh ears were separated into kernels, husk, and cob. Whole ears were processed and ensiled (snaplage) for 90d. Measurements included dry matter (DM) yield, nutrient analysis, neutral detergent fiber digestibility (NDFD30h,), and in situ starch degradability (isSD) for ear components and snaplage. The experimental design was randomized complete blocks using a mixed repeated measures model. Data were analyzed using the MIXED procedure of SAS, followed by Students t-test at P 0.05. The DM concentrations at harvest were 591, 642, and 683 g/kg for M1, M2 and M3, respectively. The aNDF concentration of cob increased (771, 793, and 819 g/kg of DM) and the NDFD30h decreased (261, 244, and 209 g/kg of NDF) for M1, M2 and M3, respectively. The aNDF concentrations of husk were 819, 837, and 841 g/kg of DM, and the NDFD30h were 320, 257 and 246 g/kg of NDF for M1, M2, and M3, respectively. The greater lactic acid (5.90 g/kg of DM) and NH3-N concentrations (38.2 g/kg of N) were found at M1. The starch concentrations and isSD of snaplage were affected by hybrid and maturity level (P < 0.05). As maturity increased, the isSD decreased (783, 731, and 703 g/kg of starch for M1, M2 and M3, respectively). The NDFD30h of cob and husk and the starch degradability of kernels/snaplage declined from M1 to M3. Snaplage should be produced with 600 to 700 g/kg of DM. Harvesting at DM concentrations lower than 600 g/kg compromised starch concentration; but DM concentrations greater than 700 g/kg impaired starch degradability due to restriction in fermentation.

RELAÇÃO ENTRE UMIDADE, OLEOSIDADE E TEMPERATURA E POPULAÇÃO DE FUNGOS PATOGÊNICOS EM DIFERENTES ÁREAS ANATÔMICAS DE CÃES COM E SEM DERMATOPATIAS

RELAÇÃO ENTRE UMIDADE, OLEOSIDADE E TEMPERATURA E POPULAÇÃO DE FUNGOS PATOGÊNICOS EM DIFERENTES ÁREAS ANATÔMICAS DE CÃES COM E SEM DERMATOPATIAS. Malassezia pachydermatis e fungos dermatófitos são microrganismos associados a dermatopatias em cães, mas que também podem estar presentes no tegumento canino como microrganismos saprofíticos. Os fatores que modulam a migração desses agentes, da condição de saprófita para patógeno, são pouco conhecidos. O presente estudo avaliou a influência da umidade, oleosidade e temperatura da pele de cães sobre a população de leveduras do gênero Malassezia e dermatófitos, em 58 cães com e 69 sem dermatoses, independente de idade, raça e sexo. A umidade e a oleosidade foram medidas por meio de instrumentos de bioimpedância em quatro áreas anatômicas: área frontal da cabeça (AFC), axilar (AA) e área lombossacral (ALS). Nestes mesmos pontos, a temperatura da superfície da pele foi avaliada por termômetro infravermelho e amostras de pele foram coletadas com tiras de carpete estéril e submetidas à cultura quantitativa para Malassezia e dermatófitos, com valores expressos em UFC/ tira. A inter-relação entre os dados foi avaliada por meio da análise de componentes principais (PCA). No AA, a temperatura, umidade e oleosidade foram superiores aos demais. As ACPs revelaram que umidade e oleosidade interagem independentemente da população de patógenos fúngicos, em AFC e ADE. Dermatófitos parecem interagir com a oleosidade da pele na ALS. Cães com doenças de pele têm uma gama mais ampla de resultados e interações no ADE e ALS do que cães sem doenças de pele. Conclui-se que diferentes áreas anatômicas podem apresentar fatores homeostáticos que regulam a população de patógenos fúngicos.

RELATIONSHIP BETWEEN HUMIDITY, OILINESS AND TEMPERATURE AND POPULATION OF PATHOGENIC FUNGI IN DIFFERENT ANATOMICAL AREAS OF DOG WITH AND WITHOUT DERMATOPATHIES Malassezia pachydermatis and dermatophyte fungi are fungal microorganisms associated with dermatopathies in dogs, but which can also be present in the canine integument as saprophytic microorganisms. The factors that modulate the migration of these agents, from the condition of saprophyte to pathogen, are little known. The present study evaluated the influence of moisture, oiliness and skin temperature of dogs on the population of yeasts of the genus Malassezia and dermatophytes, in 58 dogs with and 69 without skin diseases, regardless of age, race and sex. Moisture and oiliness were measured by bioimpedance instrumenr in four anatomical areas: frontal area of the head (AFC), left and right axillae (AED) and lumbosacral area (ALS). At these same points, the temperature of the skin surface was assessed by infrared thermometer and skin samples were collected with sterile carpet strips and subjected to quantitative culture for Malassezia and dermatophytes, with values expressed in CFU / strip. The interrelation between the data was assessed by principal component analysis (PCA). In the ADE, temperature, humidity and oiliness were higher than the others. ACPs revealed that moisture and oilness interact independently of the population of fungal pathogens, in AFC and ADE. In ALS, dermatophytes appear to interact with skin oilness. Dogs with skin disorders have a wider range of results and interactions in the ADE and ALS than dogs without skin diseases. It is concluded that different anatomical areas may present homeostatic factors that regulate the population of fungal pathogens.

Water quality monitoring of the Pirapó River watershed, Paraná, Brazil

This study aimed to evaluate the water quality of the Pirapó River watershed in Paraná, Brazil, and identify the critical pollution sites throughout the drainage basin. The water quality was monitored during the period from January 2011 to December 2012. Nine points distributed throughout the main channel of the Pirapó River were sampled for a total of 17 samplings. The water quality was evaluated based on the determination of 14 physical, chemical and microbiological parameters. Analysis of the variables monitored in the Pirapó River watershed using factor analysis/principal components analysis (FA/PCA) indicated the formation of three distinct groups of parameters: water temperature (Twater), dissolved oxygen (DO) and a group composed of total suspended solids (TSS), turbidity and nitrite (NO2). The parameters Twater and DO exhibited a relationship with the seasonality, and the TSS, turbidity, and NO2 levels were correlated with surface runoff caused by rainfall events. Principal component analysis (PCA) of the sampling points enabled the selection of the 10 most important variables from among the 14 evaluated parameters. The results showed that the nitrate (NO3), NO2, TSS, turbidity and total phosphorous (TP) levels were related to the soil type, and the parameters DO, electrical conductivity (EC), ammoniacal nitrogen (N-NH3) and thermotolerant coliforms (TC) were related to organic matter pollution, with the P5 sampling site being the most critical site. The ordination diagram of the sampling points as a function of the PCA indicated a reduction from 9 to 5 sampling points, indicating the potential for decreasing the costs associated with monitoring.

Resumo O objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade da água na bacia hidrográfica do rio Pirapó, Paraná-Brasil, e identificar os pontos críticos de poluição ao longo da bacia. O monitoramento da qualidade da água foi realizado no período de Jan/2011 a Dez/2012, em nove pontos de amostragem distribuídos ao longo do canal principal do rio Pirapó, totalizando 17 coletas. A qualidade da água foi avaliada por meio da determinação de 14 parâmetros físicos, químicos e microbiológicos. A aplicação da Análise Fatorial/Análise das Componentes Principais (AF/ACP) nas variáveis monitoradas na bacia do rio Pirapó indicou a formação de três grupos distintos: Temperatura da água (Tágua), oxigênio dissolvido (OD) e um grupo composto por sólidos suspensos totais (SST), Turbidez e Nitrito (NO2). Os parâmetros Tágua e OD demonstraram relação com a sazonalidade, e os parâmetros SST, Turbidez e NO2 com o escoamento superficial provocado por eventos de precipitação. A análise dos pontos de amostragem por componentes principais (ACP) permitiu selecionar 10 variáveis com maior importância entre as 14 avaliadas. Verificou-se que os parâmetros nitrato (NO3), NO2, SST, Turbidez e Fósforo Total (FT) estão relacionados ao tipo de solo, e os parâmetros OD, condutividade elétrica (CE), nitrogênio amoniacal (N-NH3) e coliformes termotolerantes (CT) à poluição por matéria orgânica, sendo o ponto P5 de amostragem o trecho mais crítico. O diagrama de ordenação dos pontos de amostragem em função da ACP indicou a redução de 9 para 5 pontos de amostragem, o que implica redução de custos associados ao monitoramento.

ANÁLISE MULTIVARIADA NA AVALIAÇÃO DE CARCAÇA DE SUÍNOS

As técnicas multivariadas podem ser aplicadas a dados de carcaça e de cortes de suínos medidos em plantas frigoríficas, visando a identificação das variáveis mais relevantes no conjunto de dados e, portanto, contribuindo para otimização da fenotipagem. Objetiva-se identificar as variáveis mais relevantes relacionadas aos cortes comerciais de carcaça através da análise de componentes principais e avaliar a eficiência da análise discriminante para a classificação de duas linhas macho com diferentes idades ao abate utilizando dados de carcaça e cortes comerciais de carne suína. O experimento foi conduzido em uma granja comercial de ciclo completo, localizada na zona rural do município de Ponte Nova do Estado de Minas Gerais. Foi utilizado sêmen de reprodutores de duas linhas macho distintas (L1 e L2) em fêmeas Camborough. Foram realizadas três inseminações por fêmea, utilizando sempre machos da mesma linha (L1 ou L2), totalizando 167 coberturas experimentais direcionadas durante 11 dias. Os animais foram identificados após o nascimento por meio de tatuagem nas duas orelhas e foram criados seguindo o sistema de produção da granja, utilizando mesma dieta e manejo para todos os animais. O abate de animais foi realizado no Frigorífico Industrial Vale do Piranga S/A localizado no município de Oratórios do Estado de Minas Gerais. Foram abatidos 433 animais por amostragem, sendo 213 progênies da L1 e 220 da L2, com idades variando entre 145 a 191 dias. Os animais foram divididos em dois grupos de acordo com a idade em que foram abatidos: animais abatidos entre 145 e 170 dias (1) e entre 185 e 191 dias (2). Sendo assim, foram formados quatro grupos (k = 4), representado pela combinação das duas linhagens (L1 e L2) e de duas idades de abates (1 e 2). Foram mensuradas as variáveis espessura de toucinho (ET), espessura de músculo (EM), percentual de carne magra (CM), peso de carcaça quente automático (PCQAut), peso de carcaça quente (PCQ), peso da carcaça resfriada (PCResf), peso de pernil para presunto (PerPresunto), peso de pernil para picanha (PerPicanha), peso de pernil para alcatra (PerAlcatra), peso do pernil para bacon (PerBacon), peso do pernil inteiro (Pernil), peso da paleta para presunto (PaPresunto), peso da paleta para bacon (PaBacon), peso da paleta inteira (Paleta), peso do lombo (Lombo), peso do toucinho do carré (toucinho), peso do carré (Carre), peso da barriga (barriga), Peso da barriga e costela inteiro (BarCost), peso da costela (costela), peso da fraldinha (fraldinha), peso da sobrepaleta inteira (sobrepaleta), peso do filé limpo (FileLimpo), peso do filé (File) e peso da papada (Papada). Os dados foram processados e submetidos as análises de componentes principais e discriminante utilizando o software R. Os dois primeiros componentes foram capazes de explicar 67,28% da variação total dos dados, sendo necessários pelo menos 9 componentes para explicar mais de 90% da variabilidade. Somente 5 componentes principais apresentaram autovalores maiores que 0,7, assim as variáveis com maior valor absoluto dentro desses componentes foram identificadas como as variáveis mais relevantes nesse conjunto de dados originais estudadas (PCResf, CM, PaPresunto, EM e Papada. A análise visual do gráfico de scores em relação aos componentes principais 1 e 2, revela que não ocorreu a formação de clusters e que não é possível, a partir desses componentes, separar os indivíduos pertencentes aos quatro grupos avaliados (combinação de idade de abate e linha). A análise discriminante foi realizada utilizando somente as cinco variáveis identificadas como mais importantes na análise de componentes principais. Utilizando populações de treinamento e validação verificou-se que de modo geral o percentual de acertos de classificação utilizando a análise discriminante foi maior para a idade de abate mais jovem (145-170 dias), consequentemente, as maiores taxas de erro foram observadas para os animais com maiores pesos ao abate. A coleta de dados das variáveis PCResf, CM, PaPresunto, EM e Papada em frigoríficos é recomendada, permitindo, portanto, a otimização da fenotipagem apesar de não possibilitar a diferenciação entre os grupos avaliados. Além disso, uma grande taxa de erro foi observada na classificação das amostras, sendo mais difícil classificar animais abatidos mais velhos.

Multivariate techniques may be applied to carcass and pig meat cuts data measured in slaughterhouses for the identification of the most relevant variables in the data set and, therefore, contributing to the phenotyping optimization. Therefore, we aimed to apply principal components for the identification of the most relevant carcass and pork cut variables measured at slaughter and to evaluate the efficiency of linear discriminant analysis on the classification of two male lines slaughtered at different ages using carcass and meat cut data. The trial was conducted in a commercial pig farm located at Ponte Nova, Minas Gerais state. Semen from two male lines (L1 and L2) was used in the insemination of Camborough sows. Each sow was inseminated three times using the same male line. In total 167 sows were inseminated in eleven days. After birth, the piglets were tattooed on the ear and raised following the pig farm protocols. All animals received the same diet and management. The animals were slaughtered at Frigorífico Industrial Vale do Piranga S/A, located at Oratórios, Minas Gerais state. A sample of 433 pigs with age ranging from 145 to 191 days were slaughtered, being 213 progenies of L1 and 220 progenies of L2. The animals were split in two groups according to the slaughter age: group 1 from 145 to 170 days and group 2 from 185 to 191 days. Thus, four groups were considered in the analysis, which correspond to the combination of male line (L1 and L2) and slaughter age. The variables measured were backfat thickness (ET), muscle depth (EM), percentage of lean meat (CM), automatic carcass weight (PCQAut), hot carcass weight (PCQ), chilled carcass weight (PCResf), pork leg weight for ham (PerPresunto), pork rump cap weight (PerPicanha), pork rump steak (PerAlcatra), pork leg weight for bacon (PerBacon), pork leg weight (Pernil), shoulder weight for ham (PaPresunto), shoulder weight for bacon (PaBacon), shoulder weight (Paleta), loin weight (Lombo), loin backfat weight (toucinho), pork rib chop weight (Carre), belly weight (barriga), rib and belly weight (BarCost), rib weight (costela), pork flank steak (fraldinha), pork boston butt weight (sobrepaleta), tenderloin weight without fat (FileLimpo), tenderloin weight (File) and jowl weight (Papada). All analysis was done using R software. The first and second principal components explained 67,28% of the total data variability, being necessary at least nine components to explain more than 90% of the variability. Only five principal components presented eigenvalues higher than 0.7, thus variables with the highest absolute coefficients on these components were identified as the most important for this dataset (PCResf, CM, PaPresunto, EM e Papada). Visual inspection of the first and second principal components score plot did not allows the identification of clusters. Therefore, using these components is not possible to separate individuals from the four groups evaluated (combination of line and age). Discriminant analysis was done using only the five most important variables identified in the principal components analysis. Using training and validation populations it was verified that the classification hits were higher for the young slaughter age group (145-170 days) than for the age group two. Thus, highest misclassification was observed for older animals, which have higher slaughter weight. The slaughterhouse should register the variables PCResf, CM, PaPresunto, EM e Papada. Although those variables did not allow group identification they will optimize the phenotyping. High error rate was observed in sample classification according to line and slaughter age group, being more difficult classify older animals.

Water quality monitoring of the Pirapó River watershed, Paraná, Brazil / Monitoramento da qualidade da água na bacia hidrográfica do Rio Pirapó, Paraná, Brasil

This study aimed to evaluate the water quality of the Pirapó River watershed in Paraná, Brazil, and identify the critical pollution sites throughout the drainage basin. The water quality was monitored during the period from January 2011 to December 2012. Nine points distributed throughout the main channel of the Pirapó River were sampled for a total of 17 samplings. The water quality was evaluated based on the determination of 14 physical, chemical and microbiological parameters. Analysis of the variables monitored in the Pirapó River watershed using factor analysis/principal components analysis (FA/PCA) indicated the formation of three distinct groups of parameters: water temperature (Twater), dissolved oxygen (DO) and a group composed of total suspended solids (TSS), turbidity and nitrite (NO2–). The parameters Twater and DO exhibited a relationship with the seasonality, and the TSS, turbidity, and NO2levels were correlated with surface runoff caused by rainfall events. Principal component analysis (PCA) of the sampling points enabled the selection of the 10 most important variables from among the 14 evaluated parameters. The results showed that the nitrate (NO3–), NO2–, TSS, turbidity and total phosphorous (TP) levels were related to the soil type, and the parameters DO, electrical conductivity (EC), ammoniacal nitrogen (N-NH3) and thermotolerant coliforms (TC) were related to organic matter pollution, with the P5 sampling site being the most critical site. The ordination diagram of the sampling points as a function of the PCA indicated a reduction from 9 to 5 sampling points, indicating the potential for decreasing the costs associated with monitoring.(AU)

O objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade da água na bacia hidrográfica do rio Pirapó, Paraná-Brasil, e identificar os pontos críticos de poluição ao longo da bacia. O monitoramento da qualidade da água foi realizado no período de Jan/2011 a Dez/2012, em nove pontos de amostragem distribuídos ao longo do canal principal do rio Pirapó, totalizando 17 coletas. A qualidade da água foi avaliada por meio da determinação de 14 parâmetros físicos, químicos e microbiológicos. A aplicação da Análise Fatorial/Análise das Componentes Principais (AF/ACP) nas variáveis monitoradas na bacia do rio Pirapó indicou a formação de três grupos distintos: Temperatura da água (Tágua), oxigênio dissolvido (OD) e um grupo composto por sólidos suspensos totais (SST), Turbidez e Nitrito (NO2–). Os parâmetros Tágua e OD demonstraram relação com a sazonalidade, e os parâmetros SST, Turbidez e NO2com o escoamento superficial provocado por eventos de precipitação. A análise dos pontos de amostragem por componentes principais (ACP) permitiu selecionar 10 variáveis com maior importância entre as 14 avaliadas. Verificou-se que os parâmetros nitrato (NO3–), NO2–, SST, Turbidez e Fósforo Total (FT) estão relacionados ao tipo de solo, e os parâmetros OD, condutividade elétrica (CE), nitrogênio amoniacal (N-NH3) e coliformes termotolerantes (CT) à poluição por matéria orgânica, sendo o ponto P5 de amostragem o trecho mais crítico. O diagrama de ordenação dos pontos de amostragem em função da ACP indicou a redução de 9 para 5 pontos de amostragem, o que implica redução de custos associados ao monitoramento.(AU)