Genetic and environmental factors that affect tick infestation in Nelore x Angus crossbreed cattle / Fatores genéticos e ambientais que afetam a infestação de carrapatos em bovinos cruzados Nelore x Angus

This study evaluated the effects of seasons and latitude on tick counting and determined the best model to estimate genetic parameters for tick count and hair coat. Records of animals naturally exposed to ticks on farms in several Brazilian states and in Paraguay were used. The ANOVA was used to verify the effects of seasons and latitude on the tick count trait. Spring was the season with the highest average, followed by summer and autumn, which showed no differences between them. The winter presented the lowest average values. Latitude -11° had the highest mean value followed by latitude -18°. The Bayesian approach was used to evaluate tick count and hair coat and to identify a suitable model for estimating genetic parameters for use in genetic evaluations. The data were analyzed using an animal model with four different specifications for “fixed” purposes. The inference was based on a Markov chain Monte Carlo (MCMC). The criteria for selection of the Bayesian model indicated that the M1 model, which considered the breed composition in the contemporary group, was superior to the other models, both for tick count and hair coat. Heritability estimates for tick count and hair coat obtained using the M1 model were 0.14 and 0.22, respectively. The rank correlations between the models for tick count and hair coat were estimated and reordering was verified for tick count. The estimated genetic correlation between tick count and hair coat traits was negative (-0.12). These findings suggest that different genes regulate tick count and hair coat.

Os objetivos foram avaliar os efeitos das estações e latitude na contagem de carrapatos e determinar o melhor modelo para estimar parâmetros genéticos para contagem de carrapatos e pelame. Foram utilizados registros de animais expostos naturalmente a carrapatos em fazendas em vários estados brasileiros e no Paraguai. A ANOVA foi utilizada para verificar os efeitos das estações e da latitude na característica de contagem de carrapatos. A primavera foi a estação com a maior média, seguida pelo verão e outono, que não mostraram diferenças entre eles. O inverno apresentou os menores valores médios. A latitude -11° teve o maior valor médio seguido pela latitude -18°. A abordagem bayesiana foi usada para avaliar a contagem de carrapatos e o pelame e identificar o modelo adequado para estimar parâmetros genéticos e para uso em avaliações genéticas. Os dados foram analisados usando um modelo animal com quatro especificações diferentes para efeitos “fixos”. A inferência foi baseada em uma cadeia de Markov Monte Carlo (MCMC). Os critérios de seleção do modelo bayesiano indicaram que o modelo M1, que considerou a composição racial no grupo contemporâneo, foi superior aos demais modelos, tanto na contagem de carrapatos e para pelame. As estimativas de herdabilidade para contagem de carrapatos e pelame obtidas usando o modelo M1 foram de 0,14 e 0,22, respectivamente. As correlações de ranking entre os modelos para a contagem de carrapatos e pelame foram estimadas e a reordenação foi verificada para a contagem de carrapatos. A correlação genética estimada entre a contagem de carrapatos e pelame foi negativa (-0,12). Esses achados sugerem que genes diferentes regulam a contagem de carrapatos e pelame.

Genetic and environmental factors that affect tick infestation in Nelore x Angus crossbreed cattle / Fatores genéticos e ambientais que afetam a infestação de carrapatos em bovinos cruzados Nelore x Angus

This study evaluated the effects of seasons and latitude on tick counting and determined the best model to estimate genetic parameters for tick count and hair coat. Records of animals naturally exposed to ticks on farms in several Brazilian states and in Paraguay were used. The ANOVA was used to verify the effects of seasons and latitude on the tick count trait. Spring was the season with the highest average, followed by summer and autumn, which showed no differences between them. The winter presented the lowest average values. Latitude -11° had the highest mean value followed by latitude -18°. The Bayesian approach was used to evaluate tick count and hair coat and to identify a suitable model for estimating genetic parameters for use in genetic evaluations. The data were analyzed using an animal model with four different specifications for “fixed” purposes. The inference was based on a Markov chain Monte Carlo (MCMC). The criteria for selection of the Bayesian model indicated that the M1 model, which considered the breed composition in the contemporary group, was superior to the other models, both for tick count and hair coat. Heritability estimates for tick count and hair coat obtained using the M1 model were 0.14 and 0.22, respectively. The rank correlations between the models for tick count and hair coat were estimated and reordering was verified for tick count. The estimated genetic correlation between tick count and hair coat traits was negative (-0.12). These findings suggest that different genes regulate tick count and hair coat.(AU)

Os objetivos foram avaliar os efeitos das estações e latitude na contagem de carrapatos e determinar o melhor modelo para estimar parâmetros genéticos para contagem de carrapatos e pelame. Foram utilizados registros de animais expostos naturalmente a carrapatos em fazendas em vários estados brasileiros e no Paraguai. A ANOVA foi utilizada para verificar os efeitos das estações e da latitude na característica de contagem de carrapatos. A primavera foi a estação com a maior média, seguida pelo verão e outono, que não mostraram diferenças entre eles. O inverno apresentou os menores valores médios. A latitude -11° teve o maior valor médio seguido pela latitude -18°. A abordagem bayesiana foi usada para avaliar a contagem de carrapatos e o pelame e identificar o modelo adequado para estimar parâmetros genéticos e para uso em avaliações genéticas. Os dados foram analisados usando um modelo animal com quatro especificações diferentes para efeitos “fixos”. A inferência foi baseada em uma cadeia de Markov Monte Carlo (MCMC). Os critérios de seleção do modelo bayesiano indicaram que o modelo M1, que considerou a composição racial no grupo contemporâneo, foi superior aos demais modelos, tanto na contagem de carrapatos e para pelame. As estimativas de herdabilidade para contagem de carrapatos e pelame obtidas usando o modelo M1 foram de 0,14 e 0,22, respectivamente. As correlações de ranking entre os modelos para a contagem de carrapatos e pelame foram estimadas e a reordenação foi verificada para a contagem de carrapatos. A correlação genética estimada entre a contagem de carrapatos e pelame foi negativa (-0,12). Esses achados sugerem que genes diferentes regulam a contagem de carrapatos e pelame.(AU)

AVALIAÇÃO GENÉTICA DE POEDEIRAS UTILIZANDO MODELOS DE REGRESSÃO ALEATÓRIA

O objetivo neste trabalho foi comparar modelos de regressão aleatória, com diferentes ordens de ajuste do polinômio de Legendre e testar diferentes estruturas do arquivo de dados na avaliação genética dos animais de uma linhagem da raça Rhode Island Red. Os registros foram provenientes do Centro Nacional de Pesquisa em Aves e Suínos da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (CNPSA/EMBRAPA). Foram avaliados registros de produção mensal de 4.211 matrizes, da 22ª até a 61ª semana de vida da ave. Para modelar a trajetória da produção de ovos foram utilizados modelos de regressão aleatória, que diferiram na ordem de ajuste dos polinômios de Legendre para os efeitos aleatórios. Adicionalmente, a partir de uma estrutura completa, também foram avaliados seis subarquivos, com diferentes estruturas e quantidades de informações, como segue: estrutura 1 meses ímpares; estrutura 2 meses pares; estrutura 3 e 4 formadas pelos meses que melhor descreveram a curva de produção de ovos (início, pico e persistência); e estruturas 5 e 6 determinadas por análise de componentes principais, os quais foram selecionados os meses de produção responsáveis por explicar a maior parte da variação genética dos dados. Os critérios estatísticos utilizados para a escolha do modelo e estrutura foram: Informação de Akaike (AIC), Informação Bayesiano de Schwarz (BIC), Logaritmo da Função de Máxima Verossimilhança (LMV), resíduo, confiabilidade e correlações de posição de Spearman. O modelo PL24, com estimativas boas de herdabilidade (0,04 a 0,22) e correlação genética (0,28 a 0,99) foi o modelo que promoveu melhor ajuste para a produção de ovos das aves em estudo. A estrutura quatro (que considerou os meses 2, 3, 4, 5 e 10), apresentou maior confiabilidade com a estrutura completa, indicando que é possível reduzir os dados e fazer uma boa avaliação genética das aves poedeiras de uma linhagem da raça Rhode Island Red.

The objective of this work was to compare random regression models with different orders of adjustment of the Legendre polynomial and to test different structures of the data file in the genetic evaluation of the animals of the Rhode Island Red lineage breed. The records came from the Centro Nacional de Pesquisa de Suínos e Aves of the Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (CNPSA/EMBRAPA). Monthly production records of 4,211 matrices were evaluated, from the 22nd to the 61st weeks of bird life. To model the trajectory of egg production, random regression models were used, which differed in the order of adjustment of the Legendre polynomials for the random effects. Additionally, from a complete structure, six sub-files were also evaluated, with different structures and amounts of information, as follow: structure 1 - odd months; structure 2 - even months; structures 3 and 4 - formed by the months that best described the egg production curve (beginning, peak and persistence); and structures 5 and 6 - determined by principal components analysis, which were selected the months of production responsible for explaining most of the genetic variation of the data. The statistical criteria used to choose the model and structure were: Akaike Information (AIC), Bayesian Schwarz Information (BIC), Maximum Likelihood Function Logarithm (LMV), residue, reliability and Spearman's rank correlation. The model PL24, with good estimatives of heritability (0.04 to 0.22) and genetic correlation (0.28 to 0.99) was the model that promoted the best fit for the egg production of the birds under study. The structure four (which considered months 2, 3, 4, 5 and 10) presented greater reliability with the complete structure, indicating that it is possible to reduce the data and make a good genetic evaluation of laying hens of Rhode Island Red lineage breed.

Interação genótipo-ambiente em pesos pós-desmama de bovinos Nelore criados nos Estados do Maranhão, Mato Grosso e Pará / Genotype-environment interaction of post-weaning weights in Nellore from Maranhão, Mato Grosso and Pará States

Variações de ambiente podem influenciar o desempenho genotípico e fenotípico dos animais, assim objetivou-se analisar a interação genótipo-ambiente sobre os pesos pós desmama de bovinos da raça Nelore, criados a pasto, nos Estados do Maranhão (MA), Mato Grosso (MT) e Pará (PA). O estudo foi realizado utilizando-se de dados da raça Nelore cedidos pelo Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN-ANCP), totalizando 23.690 animais registrados desde 1993 a 2010. As estimativas médias e desvios padrão para pesos padronizados aos 365 dias (P365), aos 450 dias (P450) e aos 550 dias (P550) de idade para os estados do MA, MT e PA foram de 213,96±29,70; 244,22±40,76; 245,46±31,67 kg (P365), 241,64±34,15; 285,34±49,15; 280,92±38,76 kg (P450), 274,10±33,58; 339,57±58,12; 337,64±50,34 kg (P550), respectivamente. A variação e os valores encontrados no presente trabalho, para a herdabilidade dos pesos estudados, podem ser considerados coerentes, pois estão dentro da faixa de variação apresentada na literatura. As correlações genéticas entre os desempenhos das progênies de um mesmo reprodutor nos diferentes estados variaram de 0,27 (MA-MT), -0,16 (MA-PA) e 0,37 (MT-PA) para P365; de 0,29 (MA-MT), -0,10 (MA-PA) e 0,38 (MT-PA) para P450; e 0,41 (MA-MT), -0,20 (MA-PA) e -0,05 (MT-PA) para P550. As menores correlações genéticas foram observadas entre Mato Grosso e Pará, seguidas de Maranhão e Pará, estados com condições ambientais mais contrastantes. Os resultados deste estudo reforçam a presença da interação genótipo-ambiente para as características analisadas.

Changes in the environment may influence the genotypic and phenotypic performance of animals. The aimed of the study was of the study was to analyze the genotype-environment interaction about post-weaning weights of Nellore cattle raised in the states of Maranhão (MA), Mato Grosso(MG) and Pará (PA). The study utilized data from PMGRN-ANCP, totaling 23,690 animals registered from 1993 to 2010. The estimates means and standard deviations for weights at 365 days (P365), and 450 days (P450) and weights at 550 days (W550) age for the states of MA, MT and PA were 213.96 ± 29.70, 244.22 ± 40.76, 245.46 ± 31.67 kg (P365), 241.64 ± 34.15, 285.34 ± 49.15, 280.92 ± 38.76 kg (P450), 274.10 ± 33.58, 339.57 ± 58.12, 337.64 ± 50.34 kg (P550), respectively. The estimates of heritability from weight sanalyzed can be considered coherent, because they are within the range of variation presented in the literature. Genetic correlations between the performances of the progeny of the same reproducer in the different states ranged from 0.27 (MA-MT), -0.16 (MA-PA) and 0.37 (MT-PA) for P365, for 0.29 (MA-MT) -0.10 (MA-PA) and 0.38 (MT-PA) to P450, and 0.41 (MT-AM), -0.20 (MA-PA) and -0.05 (MT-PA) to P550. The lowest genetic correlations on both characteristics studied were observed between Mato Grosso and Para followed by Pará and Maranhão, states with contrasting environmental conditions. In conclusion, it was observed genotype-environment interaction among the analyzed characteristics.

Interação genótipo-ambiente em pesos pós-desmama de bovinos Nelore criados nos Estados do Maranhão, Mato Grosso e Pará / Genotype-environment interaction of post-weaning weights in Nellore from Maranhão, Mato Grosso and Pará States

Variações de ambiente podem influenciar o desempenho genotípico e fenotípico dos animais, assim objetivou-se analisar a interação genótipo-ambiente sobre os pesos pós desmama de bovinos da raça Nelore, criados a pasto, nos Estados do Maranhão (MA), Mato Grosso (MT) e Pará (PA). O estudo foi realizado utilizando-se de dados da raça Nelore cedidos pelo Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN-ANCP), totalizando 23.690 animais registrados desde 1993 a 2010. As estimativas médias e desvios padrão para pesos padronizados aos 365 dias (P365), aos 450 dias (P450) e aos 550 dias (P550) de idade para os estados do MA, MT e PA foram de 213,96±29,70; 244,22±40,76; 245,46±31,67 kg (P365), 241,64±34,15; 285,34±49,15; 280,92±38,76 kg (P450), 274,10±33,58; 339,57±58,12; 337,64±50,34 kg (P550), respectivamente. A variação e os valores encontrados no presente trabalho, para a herdabilidade dos pesos estudados, podem ser considerados coerentes, pois estão dentro da faixa de variação apresentada na literatura. As correlações genéticas entre os desempenhos das progênies de um mesmo reprodutor nos diferentes estados variaram de 0,27 (MA-MT), -0,16 (MA-PA) e 0,37 (MT-PA) para P365; de 0,29 (MA-MT), -0,10 (MA-PA) e 0,38 (MT-PA) para P450; e 0,41 (MA-MT), -0,20 (MA-PA) e -0,05 (MT-PA) para P550. As menores correlações genéticas foram observadas entre Mato Grosso e Pará, seguidas de Maranhão e Pará, estados com condições ambientais mais contrastantes. Os resultados deste estudo reforçam a presença da interação genótipo-ambiente para as características analisadas.(AU)

Changes in the environment may influence the genotypic and phenotypic performance of animals. The aimed of the study was of the study was to analyze the genotype-environment interaction about post-weaning weights of Nellore cattle raised in the states of Maranhão (MA), Mato Grosso(MG) and Pará (PA). The study utilized data from PMGRN-ANCP, totaling 23,690 animals registered from 1993 to 2010. The estimates means and standard deviations for weights at 365 days (P365), and 450 days (P450) and weights at 550 days (W550) age for the states of MA, MT and PA were 213.96 ± 29.70, 244.22 ± 40.76, 245.46 ± 31.67 kg (P365), 241.64 ± 34.15, 285.34 ± 49.15, 280.92 ± 38.76 kg (P450), 274.10 ± 33.58, 339.57 ± 58.12, 337.64 ± 50.34 kg (P550), respectively. The estimates of heritability from weight sanalyzed can be considered coherent, because they are within the range of variation presented in the literature. Genetic correlations between the performances of the progeny of the same reproducer in the different states ranged from 0.27 (MA-MT), -0.16 (MA-PA) and 0.37 (MT-PA) for P365, for 0.29 (MA-MT) -0.10 (MA-PA) and 0.38 (MT-PA) to P450, and 0.41 (MT-AM), -0.20 (MA-PA) and -0.05 (MT-PA) to P550. The lowest genetic correlations on both characteristics studied were observed between Mato Grosso and Para followed by Pará and Maranhão, states with contrasting environmental conditions. In conclusion, it was observed genotype-environment interaction among the analyzed characteristics.(AU)

Genotype by environment interaction in Nellore cattle from Amazon Legal region / Interação genótipo-ambiente em rebanhos nelore da Amazônia Legal

Genotype-environment interaction was studied by two different procedures in productive and reproductive traits of Nellore cattle. Data from adjusted weights at 120 (P120), 210 (P210), 450 (P450) days of age, scrotal circumference at 450 days of age (PE450) and age at first calving (IPP) for 211,744 records from Nellore herds located in the Legal Amazon region were used in the analysis. The effect of genotype-environment interaction was studied through heritability estimates and rank correlation, comparing the Legal Amazon animals with the general basis of animals PMGRN Nellore Brazil. Bi-trait analyses considered P120 as anchor-trait with P210, P450 and PE450 as another one. IPP has been analyzed separately in single-trait analysis and considering GCIPP as fixed and additive and residual effects as random. Estimates of heritability for P120, P210, P450, PE450 and IPP on the data of the Legal Amazon were: 0.20 to 0.49; 0.21; 0.48; 0.45; and 0.21, respectively, and in general data of PMGRN Nellore Brazil were: 0.23; 0.25; 0.34; 0.43 and 0.11, respectively. Correlations between rank for P120, P210, P450, PE450 and IPP were equal to 0.77; 0.79; 0.82; 0.78 and 0.38, respectively. The analysis of the genotype-environment interaction, through the heritability estimates, showed larger effects on maternal, weight at 450 days of age and age at first calving, whereas the rank correlations showed strong evidence in almost all traits studied.(AU)

A interação genótipo-ambiente (IGA) foi estudada por meio de dois procedimentos distintos, em características produtivas e reprodutivas de bovinos da raça Nelore. Dados de pesos padronizados aos 120 (P120); 210 (P210); 450 (P450) dias de idade, perímetro escrotal aos 450 dias de idade (PE450) e idade ao primeiro parto (IPP), de 211.744 registros de animais Nelore, criados na região da Amazônia Legal, foram utilizados na análise. O efeito da IGA foi estudado por meio de estimativas de herdabilidade e de correlações entre classificações, comparando os animais da Amazônia Legal com a base geral de animais do PMGRN Nelore Brasil. As análises bi-característica consideraram o P120 como característica-âncora, com P210; P450 e PE450. A característica IPP foi analisada separadamente, em análise de característica única e considerando como efeito fixo o GCIPP e como aleatórios os efeitos aditivos genético e residual. As estimativas de herdabilidade para P120; P210; P450; PE450 e IPP nos dados da Amazônia Legal foram: 0,20 a 0,49; 0,21; 0,48; 0,45 e 0,21, respectivamente, e nos dados gerais do PMGRN Nelore Brasil foram: 0,23; 0,25; 0,34; 0,43 e 0,11, respectivamente. As correlações entre classificações de rank para P120; P210; P450; PE450 e IPP foram iguais a 0,77; 0,79; 0,82; 0,78 e 0,38, respectivamente. As análises da IGA, por meio das estimativas de herdabilidade, evidenciaram maiores efeitos sobre os aspectos maternos, de peso aos 450 dias de idade e idade ao primeiro parto, enquanto que as correlações entre classificações mostraram fortes evidências em quase todas as características estudadas.(AU)

Genotype by environment interaction in Nellore cattle from Amazon Legal region / Interação genótipo-ambiente em rebanhos nelore da Amazônia Legal

Genotype-environment interaction was studied by two different procedures in productive and reproductive traits of Nellore cattle. Data from adjusted weights at 120 (P120), 210 (P210), 450 (P450) days of age, scrotal circumference at 450 days of age (PE450) and age at first calving (IPP) for 211,744 records from Nellore herds located in the Legal Amazon region were used in the analysis. The effect of genotype-environment interaction was studied through heritability estimates and rank correlation, comparing the Legal Amazon animals with the general basis of animals PMGRN Nellore Brazil. Bi-trait analyses considered P120 as anchor-trait with P210, P450 and PE450 as another one. IPP has been analyzed separately in single-trait analysis and considering GCIPP as fixed and additive and residual effects as random. Estimates of heritability for P120, P210, P450, PE450 and IPP on the data of the Legal Amazon were: 0.20 to 0.49; 0.21; 0.48; 0.45; and 0.21, respectively, and in general data of PMGRN Nellore Brazil were: 0.23; 0.25; 0.34; 0.43 and 0.11, respectively. Correlations between rank for P120, P210, P450, PE450 and IPP were equal to 0.77; 0.79; 0.82; 0.78 and 0.38, respectively. The analysis of the genotype-environment interaction, through the heritability estimates, showed larger effects on maternal, weight at 450 days of age and age at first calving, whereas the rank correlations showed strong evidence in almost all traits studied.

A interação genótipo-ambiente (IGA) foi estudada por meio de dois procedimentos distintos, em características produtivas e reprodutivas de bovinos da raça Nelore. Dados de pesos padronizados aos 120 (P120); 210 (P210); 450 (P450) dias de idade, perímetro escrotal aos 450 dias de idade (PE450) e idade ao primeiro parto (IPP), de 211.744 registros de animais Nelore, criados na região da Amazônia Legal, foram utilizados na análise. O efeito da IGA foi estudado por meio de estimativas de herdabilidade e de correlações entre classificações, comparando os animais da Amazônia Legal com a base geral de animais do PMGRN Nelore Brasil. As análises bi-característica consideraram o P120 como característica-âncora, com P210; P450 e PE450. A característica IPP foi analisada separadamente, em análise de característica única e considerando como efeito fixo o GCIPP e como aleatórios os efeitos aditivos genético e residual. As estimativas de herdabilidade para P120; P210; P450; PE450 e IPP nos dados da Amazônia Legal foram: 0,20 a 0,49; 0,21; 0,48; 0,45 e 0,21, respectivamente, e nos dados gerais do PMGRN Nelore Brasil foram: 0,23; 0,25; 0,34; 0,43 e 0,11, respectivamente. As correlações entre classificações de rank para P120; P210; P450; PE450 e IPP foram iguais a 0,77; 0,79; 0,82; 0,78 e 0,38, respectivamente. As análises da IGA, por meio das estimativas de herdabilidade, evidenciaram maiores efeitos sobre os aspectos maternos, de peso aos 450 dias de idade e idade ao primeiro parto, enquanto que as correlações entre classificações mostraram fortes evidências em quase todas as características estudadas.

AVALIAÇÃO GENÉTICA DE LINHAGENS DE POEDEIRAS UTILIZANDO COMPONENTES PRINCIPAIS E FUNÇÃO DISCRIMINANTE LINEAR DE FISHER

O objetivo deste trabalho foi avaliar geneticamente as características de peso e reprodução de aves de postura, qualidade do ovo e taxas de produção de ovos da 19ª a 70ª semana de idade de linhagens de poedeiras das raças Rhode Island Red (GG e MM) e Plymouth Rock White (SS). Os registros foram provenientes do Centro Nacional de Pesquisa em Aves e Suínos da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (CNPSA/EMBRAPA). Os valores genéticos e as estimativas de herdabilidades para cada característica dentro de cada linhagem foram obtidos através de um modelo animal univariado. As características que explicam a maior parte da variação genética deste banco de dados foram identificadas utilizando análise de Componentes Principais, correlação de posição de Spearman e, posteriormente, foram criadas Funções Discriminantes de Fisher. Através da análise de componentes principais, as características de qualidade que explicaram a maior parte da variação genética dos dados foram a densidade (D36), peso (PO36) e relação comprimento x largura (R36) do ovo medidas na 36ª semana de produção. As características produtivas que melhor representaram a taxa de produção total foram: as taxas de produções acumuladas nas 50ª (TA50) e 60ª (TA60) semanas e a taxa de produção parcial da 23ª a 40ª semana (TP23a40). Através da obtenção das funções discriminantes de Fisher (FDFs) para ambos os sexos nas três linhagens estudadas, foi possível observar que as características produtivas (taxas de postura) foram as mais importantes na composição da Função. Observou-se maiores correlações entre a FDF1 e FDF3 (variando de 0,97 a 0,99); seguida da FDF1 e FDF2 (variando de 0,86 a 0,94). Foi realizada seleção de 20% dos animais geneticamente superiores da última geração, e a coincidência de animais selecionados nas diferentes FDFs com a FDF1 foi apresentada em forma de porcentagem. Pode-se observar que a função FDF3 selecionou 100% de machos em comum com os selecionados pela FDF1, nas linhagens MM e SS. A FDF3 apresentou maior coincidência em todas as linhagens e sexos com a FDF1. Dessa forma, as variáveis identificadas como mais representativas são a D36, PO36 e R36 juntamente com a TA60, e a função discriminante de Fisher que considera o conjunto dessas características é eficiente para antecipar a seleção dos animais.

The objective of this work was to evaluate genetically the individual performance characteristics of laying hens, egg quality and rates of egg production from the 19th to the 70th week of age of lines of hens of the Rhode Island Red (GG and MM) and Plymouth Rock White (SS). The data set used came from the Centro Nacional de Pesquisa de Suínos e Aves of the Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (CNPSA/EMBRAPA). The genetic values and estimates of heritabilities for each trait within each lineage were obtained through a univariate animal model. The characteristics that explain most of the genetic variation of this database were identified using Principal Component analysis, Spearman's position correlation, and later Fisher's Discriminant Functions were created. Through the principal components analysis, the quality characteristics that explained most of the genetic variation of the data were the density (D36), weight (PO36) and length x width ratio (R36) of the egg measured at the 36th week of production. The production characteristics that best represented the total production rate were: the production rates accumulated at the 50th (TA50) and 60th (TA60) weeks and the partial production rate from the 23rd to the 40th week (TP23a40). By obtaining the Fisher's discriminant functions (FDFs) for both sexes in the three lines studied, it was possible to observe that the productive characteristics (posture rates) were the most important in the composition of the Function. Higher correlations were observed between FDF1 and FDF3 (ranging from 0.97 to 0.99); followed by FDF1 and FDF2 (ranging from 0.86 to 0.94). A selection of 20% of the genetically superior animals of the last generation was performed, and the coincidence of selected animals in the different FDFs with FDF1 was presented as a percentage. It can be observed that the FDF3 function selected 100% of males in common with those selected by FDF1, in the MM and SS lines. The FDF3 presented greater coincidence in all lineages and sexes with FDF1. Thus, the variables identified as most representative are D36, PO36 and R36 along with TA60, and the Fisher discriminant function that considers all these characteristics is efficient to anticipate the selection of the animals.

Genomic simulation for the study of data transformation efficiency in the genetic evaluation of cattle in the presence of heterogeneity - 10.4025/actascianimsci.v34i1.10664

Efficiency of data transformation strategies is evaluated to correct heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies. Four data structures of bovine weaning weights were simulated: herds with and without heterogeneity for means and variances, and herds with and without genetic connectedness. In the genetic evaluations, data were used in the original scale and transformed (Logarithmic, Square root, standardization and ratio by phenotypic standard deviation). The evaluated data transformation strategies were not efficient in eliminating the negative effects of heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies.

Genomic simulation for the study of data transformation efficiency in the genetic evaluation of cattle in the presence of heterogeneity / Simulação genômica para estudo da eficiência da transformação de dados para avaliação genética de bovinos na presença de heterogeneidade

Efficiency of data transformation strategies is evaluated to correct heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies. Four data structures of bovine weaning weights were simulated: herds with and without heterogeneity for means and variances, and herds with and without genetic connectedness. In the genetic evaluations, data were used in the original scale and transformed (Logarithmic, Square root, standardization and ratio by phenotypic standard deviation). The evaluated data transformation strategies were not efficient in eliminating the negative effects of heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies.

O objetivo deste estudo foi avaliar a eficiência de estratégias de transformação de dados para correção da heterogeneidade entre rebanhos na avaliação genética de touros, vacas e progênies. Quatro estruturas de dados relativos a peso à desmama de bovinos foram simuladas: rebanhos com e sem heterogeneidade para médias e variâncias, e rebanhos com e sem conexidade genética. Nas avaliações genéticas, utilizaram-se dados na escala original e transformados (Logarítmica, Raiz quadrada, Padronização e Razão pelo desvio-padrão fenotípico). As estratégias de transformação de dados avaliadas não foram eficientes para eliminar os efeitos negativos da heterogeneidade entre rebanhos sobre a avaliação genética de touros, vacas e progênies.

Parâmetros genéticos para idade ao primeiro parto estimados por diferentes modelos para rebanhos da raça Nelore / Genetic parameters for age at first calving estimated by different models for Nellore breed herds

Com objetivo de estimar parâmetros genéticos e estudar a utilização de diferentes efeitos em avaliações genéticas para idade ao primeiro parto (IPP) por diferentes modelos, foram utilizados registros de IPP de animais da raça Nelore, nascidos entre os anos de 1990 e 2005. Foram considerados os seguintes modelos (M): M1, incluindo o efeito fixo de GC1 (constituído pelos animais nascidos na mesma fazenda e ano), além da covariável, peso aos 365 dias de idade (efeito linear e quadrático), totalizando 24.263 registros de IPP; M2, considerando os efeitos fixos de GC1, ano e estação de parição, totalizando 59.792 registros de IPP e M3, incluindo os efeitos fixos de GC2 (agrupando os animais nascidos na mesma fazenda, ano e que conceberam no mesmo manejo reprodutivo), ano e estação de parição, totalizando 59.792 registros de IPP. As estimativas dos componentes de variância e herdabilidade e os valores genéticos (VG) foram obtidos pelo método da máxima verossimilhança restrita, com a inclusão da matriz de parentesco disponível. As diferenças esperadas na progênie (DEPs) foram obtidas dividindo os VG por dois. Após a obtenção desses resultados, foram realizadas correlações entre os VG e o ranqueamento das DEPs dos reprodutores para IPP, utilizando-se o procedimento PROC CORR (SAS, 2003). Ao se considerar o ano e a estação de parto nos modelos de análise (M2 e M3), esses produziram um maior R², indicando que tais modelos conseguiram explicar, em maior grau, as diferenças existentes entre os animais para IPP. As herdabilidades estimadas foram de baixa magnitude (0,14 e 0,15). As correlações entre os VG obtidas por diferentes modelos foram 0,73 (M1 x M2); 0,91 (M2 x M3) e 0,66 (M1 x M3).(AU)

With the objective of estimate genetic parameters and study the utilization of different effects on the genetic evolution for the age of the first calving (AFC) by different models, they were used AFC records from Nellore breed animals, born from 1990 to 2005. They were considered the following models (M): M1, including the fixed effect of the contemporary group (CG), CG1 (grouping the animals that were born at the same farm and year), besides the co variable, weight at 365 days of age (linear and quadratic effects), totalizing 24,263 records of AFC; M2, considering the effects of CG1, year and season of the calving, totalizing 59,792 records of AFC and M3, including effects CG2 (grouping the animals born at the same farm, year and submitted at the same reproductive management), year and season of calving totalizing 59,792 records of AFC. The components of variance and Genetic Value (GV) were obtained by Restricted Maximun Likelihood Method, with the inclusion for the relationship matrix. The Differences Expected on the Progeny (DEPs) were obtained by dividing the GV by two, after this they were estimated the correlations between GV and ranks of the reproductor's DEPs for AFC, utilizing the procedure CORR (SAS, 2003). While considering year and season of calving in the analysis models (M2 and M3), it was produced a bigger R², indicating that those models could explain, in a larger scale, the existing differences between the animals for AFC. The heritabilities estimated were of low magnitude (0,14 and 0,15). The correlations between the GV obtained by the different models were .73 (M1 x M2); .91 (M2 x M3) and .66 (M1 x M3).(AU)

Estimativas da trajetória genética do crescimento de codornas de corte utilizando modelos de regressão aleatória / Genetic trajectory estimates of meat type quail lines using random regression models

Avaliou-se a trajetória genética do crescimento de codornas de corte (pesos corporais nos dias 1, 7, 14, 21, 28, 35 e 42 de idade) de dois grupos genéticos, por modelos de regressão aleatória, sob modelo animal, obtendo-se estimativas de parâmetros genéticos visando definir a idade que resultaria em maior resposta à seleção. Foram pesadas 2.432 e 2.478 codornas, respectivamente, dos grupos genéticos EV1 e EV2, obtidas em três gerações de seleção. Os parâmetros genéticos foram estimados utilizando-se a sub-rotina Dxmrr do DFReml. As estimativas de herdabilidade dos pesos corporais variaram, respectivamente, de 0,01 a 0,50, para o grupo genético EV1, e de 0,01 a 0,10, para o EV2, sendo as maiores estimativas obtidas para peso corporal no 42º dia de idade, em ambos os grupos genéticos. As correlações genéticas entre o peso a um dia e os demais pesos corporais, em ambos os grupos, foram negativas, e as correlações de ambiente permanente, de modo geral, foram maiores para EV2. Pode-se concluir que, para ambos os grupos, a seleção é mais eficiente se realizada no 42º dia de idade, porém respostas poderiam ser obtidas se as codornas fossem selecionadas em idades mais jovens para o grupo EV1.(AU)

Growth genetic trajectories of two quail meat type lines for body weights at hatch and 7, 14, 21, 28, 35, and 42 days of age were evaluated using random regression model, under animal model analysis. Genetic parameters estimates were obtained to establish the most adequate age for efficient selection. Body weights of 2,432 and 2,478 quails from EV1 and EV2 genetic lines, respectively, from three generations of selection were recorded. Genetic parameter estimates were obtained using Dxmrr subroutine of the DFReml software. Heritability estimates ranged from .01 to .50 for EV1 and from .01 to .10 for EV2. For both genetic lines the highest heritability estimates were obtained for body weight at 42 days of age and genetic correlations between body weight at hatch and body weights recorded in other ages were all negatives and permanent environment correlations were higher for EV2 genetic line. The results suggest that selection to increase body weight for both genetic lines is more efficient when undertaken at 42 days of age, but reasonable responses to selection can also be obtained in younger ages for EV1 genetic line.(AU)

Genomic simulation for the study of data transformation efficiency in the genetic evaluation of cattle in the presence of heterogeneity - 10.4025/actascianimsci.v34i1.10664

Efficiency of data transformation strategies is evaluated to correct heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies. Four data structures of bovine weaning weights were simulated: herds with and without heterogeneity for means and variances, and herds with and without genetic connectedness. In the genetic evaluations, data were used in the original scale and transformed (Logarithmic, Square root, standardization and ratio by phenotypic standard deviation). The evaluated data transformation strategies were not efficient in eliminating the negative effects of heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies.

Estudo de modelo alternativo para estimação de componentes de (co)variância e predição de valores genéticos de características de crescimento em bovinos da raça Nelore / Alternative model to estimate (co)variance components and to predict breeding values for growth traits in Nelore cattle

Foram obtidas estimativas de parâmetros genéticos e preditas DEP's (diferença esperada na progênie) para pesos não-padronizados aos 120 dias de idade (PR120), à desmama (PR240), ao ano de idade (PR365), aos 15 meses (PR455) e ao sobreano (PR550), de 29.769 animais Nelore, adotando-se o método REML, sob modelo animal. Para características PR120, PR240, PR365 e PR455, o modelo completo incluiu efeitos aleatórios de animal, aditivo materno, de ambiente permanente da vaca e de resíduo, efeitos fixos de grupo de contemporâneos (GC) aos 120 dias de idade, ou à desmama, classe de idade da vaca ao parto (CIVP), e como covariável a idade do animal à época da pesagem. Para características pós-desmama (PR365, PR455 e PR550), consideraram-se dois modelos de análise: um sem efeito permanente da vaca, com efeitos aleatórios de animal, aditivo materno e de resíduo, efeitos fixos de GC ao ano de idade, aos 15 meses ou ao sobreano e CIVP, e como covariável a idade do animal à época da pesagem, e outro com efeitos aleatórios de animal e de resíduo, efeitos fixos de GC ao ano de idade, aos 15 meses ou ao sobreano e CIVP, e como covariável a idade do animal à época da pesagem. As médias observadasñdesvios-padrao foram 127+25kg (PR120); 191ñ34kg (PR240); 225ñ42kg (PR365); 266ñ51kg (PR455) e 310ñ56kg (PR550). Resultantes das análises de característica única sob modelo completo, as estimativas de herdabilidade direta e materna para PR120, PR240, PR365 e PR455 foram 0,23 e 0,08; 0,19 e 0,10; 0,24 e 0,04; 0,30 e 0,04, respectivamente. As estimativas de herdabilidade direta foram 0,39; 0,44 e 0,43, respectivamente, para PR365, PR455 e PR550. A partir do modelo sem efeito de ambiente permanente, as estimativas de herdabilidade direta e materna foram, respectivamente para PR365, PR455 e PR550, 0,25 e 0,08; 0,32 e 0,07; 0,38 e 0,03. Quando comparadas às estimativas de herdabilidade das características padronizadas, houve pouca diferença em magnitude entre elas. Importante mudança de...(AU)

The objectives of this study were to estimate genetic parameters for non-standardized weights at nursing (PR120), at weaning (PR240), at yearling (PR365) and at post yearling (PR550), and to predict EPDs (expected progeny differences) for these traits using records from 29,769 Nellores. Covariance components and genetic parameters were estimated by mixed-model methodology, REML, using an animal model. Models for PR120, PR240, PR365 and PR455 included the random direct and maternal animal effects, the dam permanent environmental effect and the error. Fixed effects were contemporary group (CG) and age of cow at parturition (CIVP) and the covariate age of the calf at measuring. Two additional models for PR365, PR455 and PR550 analyses were used: the first included CG and CIVP, animal and maternal direct effect, residual and age of the calf (as covariate), and the second included CG and CIVP (as fixed effects), animal direct effect, residual and age of calf at measuring. Observed means±standard deviations were: 127±25kg (PR120); 191±34kg (PR240); 225±42kg (PR365); 266±51kg (PR455) and 310±56kg (PR550). From single-trait analyses, direct and maternal heritabilities for PR120, PR240, PR365 and PR455 were, respectively, .23 and .08; .19 and .10; .24 and .04; .30 and .04. Direct heritabilities were .39; .44 and .43, respectively, for PR365, PR455 and PR550. In the model without permanent effect, direct and maternal heritabilities for PR365, PR455 and PR550 were .25 and .08; .32 and .07; .38 and .03, respectively. When the estimates for standardized traits at the same period were compared, no differences in magnitude were found. Rank correlation had important changes when standardized and non-standardized traits were compared.(AU)