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1.
Arq. bras. med. vet. zootec. (Online) ; 69(1): 214-224, jan.-fev. 2017. tab, graf
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-690975

Resumo

O presente trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar a sensibilidade dos valores genéticos dos pesos corporais e as características de carcaças de codornas europeias às mudanças do gradiente ambiental (níveis da relação treonina com a lisina das dietas), do nascimento aos 21 dias de idade, por meio de modelos de regressão aleatória com diferentes classes de variância residual. Os dados utilizados neste estudo são provenientes de 915 codornas de corte da linhagem LF1 e 839 da linhagem LF2, pertencentes ao Programa de Melhoramento Genético da Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri. Foram avaliados os pesos corporais e os rendimentos da carcaça das aves. As sensibilidades dos valores genéticos às mudanças nos níveis da relação treonina:lisina (interação genótipo x ambiente) foram obtidas por modelos de regressão aleatória (utilizando normas de reação) por meio do programa Wombat, que utiliza o princípio da máxima verossimilhança restrita (REML). O modelo de regressão aleatória que considerou duas classes de variância residual foi o mais indicado para a maioria das análises realizadas. Verificaram-se alterações na classificação dos valores genéticos para as duas linhagens de codornas de corte estudadas. Esse comportamento indica sensibilidade de valores genéticos aditivos às mudanças nutricionais, o que caracteriza a existência de interação genótipo x ambiente. A predição dos valores genéticos deve ser feita com o mesmo nível da relação treonina:lisina da dieta com a qual as codornas serão alimentadas no sistema de produção.(AU)


This research was carried out to evaluate the sensitivity of breeding values of body weight and carcass traits in two lines of European quails (LF1 and LF2) to changes in the environment gradient (levels of threonine: lysine ratio of diets) from hatch to 21 days of age in two lines LF1 and LF2 using Random Regression Models with different classes of residual variance. Records are from 915 quails of line LF1 and 839 of line LF2 belonging to the Breeding Improvement Program of Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri. Live body weight and weights and yields of carcass, breast, and thigh and drumstick were measured. The sensitivities of breeding values to changes in threonine: lysine ratios (genotype x environment interaction) of diets were obtained by random regression models (reaction model) using the WOMBAT program using the Restricted Maximum Likelihood principle. Model considering two classes of residual variance showed the best goodness of fit. The Reaction Norms analyses indicated changes in the ranking of breeding values for both lines suggesting quails selected in one level of threonine: lysine ratio will not express all their genetic potential if fed different threonine: lysine ratio diets. This behavior indicates sensitivity of breeding values to changes in the nutrition characterizing the genotype by environment interaction. The prediction of breeding values must be performed using the same level of threonine: lysine ratio in diet the quails will be fed in the production system.(AU)


Assuntos
Animais , Treonina/análise , Lisina/análise , Coturnix/genética , Coturnix/crescimento & desenvolvimento , Heterogeneidade Genética , Dieta/veterinária , Fenômenos Genéticos/genética
2.
Arq. bras. med. vet. zootec ; 69(1): 214-224, jan.-fev. 2017. tab, graf
Artigo em Português | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-836702

Resumo

O presente trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar a sensibilidade dos valores genéticos dos pesos corporais e as características de carcaças de codornas europeias às mudanças do gradiente ambiental (níveis da relação treonina com a lisina das dietas), do nascimento aos 21 dias de idade, por meio de modelos de regressão aleatória com diferentes classes de variância residual. Os dados utilizados neste estudo são provenientes de 915 codornas de corte da linhagem LF1 e 839 da linhagem LF2, pertencentes ao Programa de Melhoramento Genético da Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri. Foram avaliados os pesos corporais e os rendimentos da carcaça das aves. As sensibilidades dos valores genéticos às mudanças nos níveis da relação treonina:lisina (interação genótipo x ambiente) foram obtidas por modelos de regressão aleatória (utilizando normas de reação) por meio do programa Wombat, que utiliza o princípio da máxima verossimilhança restrita (REML). O modelo de regressão aleatória que considerou duas classes de variância residual foi o mais indicado para a maioria das análises realizadas. Verificaram-se alterações na classificação dos valores genéticos para as duas linhagens de codornas de corte estudadas. Esse comportamento indica sensibilidade de valores genéticos aditivos às mudanças nutricionais, o que caracteriza a existência de interação genótipo x ambiente. A predição dos valores genéticos deve ser feita com o mesmo nível da relação treonina:lisina da dieta com a qual as codornas serão alimentadas no sistema de produção.(AU)


This research was carried out to evaluate the sensitivity of breeding values of body weight and carcass traits in two lines of European quails (LF1 and LF2) to changes in the environment gradient (levels of threonine: lysine ratio of diets) from hatch to 21 days of age in two lines LF1 and LF2 using Random Regression Models with different classes of residual variance. Records are from 915 quails of line LF1 and 839 of line LF2 belonging to the Breeding Improvement Program of Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri. Live body weight and weights and yields of carcass, breast, and thigh and drumstick were measured. The sensitivities of breeding values to changes in threonine: lysine ratios (genotype x environment interaction) of diets were obtained by random regression models (reaction model) using the WOMBAT program using the Restricted Maximum Likelihood principle. Model considering two classes of residual variance showed the best goodness of fit. The Reaction Norms analyses indicated changes in the ranking of breeding values for both lines suggesting quails selected in one level of threonine: lysine ratio will not express all their genetic potential if fed different threonine: lysine ratio diets. This behavior indicates sensitivity of breeding values to changes in the nutrition characterizing the genotype by environment interaction. The prediction of breeding values must be performed using the same level of threonine: lysine ratio in diet the quails will be fed in the production system.(AU)


Assuntos
Animais , Coturnix/genética , Coturnix/crescimento & desenvolvimento , Dieta/veterinária , Heterogeneidade Genética , Lisina/análise , Treonina/análise , Fenômenos Genéticos/genética
3.
Ci. Rural ; 46(9): 1649-1655, Sept. 2016. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-29712

Resumo

The objective of this study was to compare the functions of Wilmink and Ali and Schaeffer with Legendre polynomials in random regression models using heterogeneous residual variances for modeling genetic parameters during the first lactation in the Holstein Friesian breed. Five thousand eight hundred and eighty biweekly records of test-day milk production were used. The models included the fixed effects of group of contemporaries and cow age at calving as covariable. Statistical criteria indicated that the WF.33_HE2, LEG.33_HE2, and LEG.55_HE4 functions best described the changes in the variances that occur throughout lactation. Heritability estimates using WF.33_HE2 and LEG.33_HE2 models were similar, ranging from 0.31 to 0.50. The LEG.55_HE4 model diverged from these models, with higher estimates at the beginning of lactation and lower estimates after the 16th fortnight. The LEG55_HE4, among the three better models indicated by the index, is the one with highest number of parameters (14 vs 34) and resulted in lower estimation of residual variance at the beginning and at the end of lactation, but overestimated heritability in the first fortnight and presented a greater difficulty to model genetic and permanent environment correlations among controls. Random regression models that used the Wilmink and Legendre polynomials functions with two residual variance classes appropriately described the genetic variation during lactation of Holstein Friesians reared in Rio Grande do Sul.(AU)


Objetivou-se comparar as funções de Wilmink e Ali e Schaeffer com polinômios de Legendre em modelos de regressão aleatória, utilizando variâncias residuais heterogêneas, para modelar parâmetros genéticos ao longo da primeira lactação na raça Holandesa. Foram utilizados cinco mil oitocentos e oitenta registros quinzenais de produção de leite no dia do controle. Os modelos incluíram os efeitos fixos de grupo de contemporâneos e a idade da vaca ao parto como covariável. Os critérios estatísticos apontaram as funções WF.33_HE2, LEG.33_HE2 e a LEG.55_HE4 como as melhores em descrever as mudanças nas variâncias que ocorrem ao longo da lactação. As herdabilidades estimadas pelos modelos WF.33_HE2 e LEG.33_HE2 foram semelhantes, variando de 0,31 a 0,50. O LEG.55_HE4 divergiu destes, no início da lactação, com estimativas superiores e, a partir da 16ª quinzena, com estimativas inferiores. O LEG55_HE4, entre os três melhores modelos indicados pelo índice, é o mais parametrizado (14 vs 34) e resultou em menores estimativas de variância residual no início e no final da lactação, mas superestimou a herdabilidade na primeira quinzena e apresentou maior dificuldade em modelar as correlações genéticas e de ambiente permanente entre os controles. Os modelos de regressão aleatória que usaram a função de Wilmink e Polinômios de Legendre com duas classes de variâncias residuais descreveram adequadamente a variação genética ao longo da lactação de vacas da raça Holandesa, criadas no Rio Grande do Sul.(AU)


Assuntos
Animais , Bovinos , Análise de Regressão , Indústria de Laticínios , Genética , Lactação
4.
Arq. bras. med. vet. zootec. (Online) ; 67(5): 1438-1448, 2015. tab, graf
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-334060

Resumo

Objetivou-se avaliar a sensibilidade dos valores genéticos para características de qualidade da carne em codornas de corte alimentadas com dietas contendo diferentes relações de (metionina + cistina): lisina, do nascimento aos 21 dias de idade, por meio de modelos de normas de reação. Utilizaram-se 9011 informações de qualidade de carne referentes a 1400 progênies de 80 reprodutores e 160 matrizes de duas linhas (LF1 e LF2). Para o ajuste dos modelos de regressão aleatória, foi usado o programa WOMBAT, considerando-se nas análises homogeneidade de variância residual. As codornas foram alimentadas do nascimento aos 21 dias de idade com dietas contendo as relações 0,61; 0,66; 0,71; 0,76 e 0,81 de (metionina + cistina): lisina, mantendo os níveis de proteína bruta de 26,12% e de energia em 2900 kcal EM/kg da dieta. Dos 22 aos 35 dias de idade, todas as codornas foram alimentadas com dieta contendo 22% de proteína bruta e 3050 kcal EM/kg da dieta. As estimativas da variância genética e da herdabilidade foram influenciadas pelo gradiente ambiental e pela linha, com mudanças nessas estimativas com o aumento do gradiente ambiental. Os valores genéticos das características de qualidade de carne referentes a cada uma das linhas se alteraram com o aumento das relações de aminoácidos das dietas em razão das mudanças no ordenamento dos valores genéticos, evidenciando a existência da interação genótipo x nível de relação dos aminoácidos da dieta para características de qualidade de carne. Predições de valores genéticos de características de qualidade de carne com base em determinada relação de (metionina + cistina): lisina da dieta não são válidas para outras relações desses aminoácidos.(AU)


This study aimed to evaluate the sensitivity of breeding values for meat quality traits of European quails fed different (methionine + cystine): lysine ratio diets from hatch to 21 days of age, using reaction norm models. A total of 9011 meat quality records from 1400 progenies of 80 sires and 160 dams from two lines (LF1 and LF2) were used in the analyses considering homogeneity of residual variance. The quails from hatch to 21 days of age were fed diets containing 0.61, 0.66, 0.71, 0.76 and 0.81 (methionine + cystine): lysine ratios, 26.12% of crude protein and 2900 ME/kcal of diet. From 22 to 35 days of age all quail were fed a diet containing 22% of crude protein and 3050 kcal ME/kg of diet. The random regression model analyses was performed using the WOMBAT program considering homogeneity of residual variance. Genetic variance and heritability estimates were affected by the environment gradient of diet and line, increasing these estimates with the increase of the (methionine + cystine): lysine ratio of the diet. The breeding values changed with the increase of the environment gradient of the diet with changes in the rank of genetic breeding values characterizing the existence of genotype by environment interaction for meat quality traits. Predictions of meat quality trait breeding values based on a given (methionine + cystine): lysine ratio are not valid for other levels of the amino acid ratio.(AU)


Assuntos
Animais , Aves Domésticas , Anotação de Sequência Molecular , Genética , Metionina , Cistina , Lisina , Indústria da Carne , Dieta/veterinária , Genótipo
5.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-207368

Resumo

Os modelos de regressão aleatória vêm sendo utilizados para estimar os componentes de variância e parâmetros genéticos de produção de leite e carne de diversas espécies, entre elas os pesos de bovinos de corte e dentre estes os de bovinos da raça Tabapuã, possibilitando trabalhar com características de curvas crescimento que são medidas repetidamente na vida do animal, denominados dados longitudinais. Esses modelos são considerados casos especiais de funções de covariância e permitem estimar diretamente os coeficientes das funções de covariância pelo método da máxima verossimilhança restrita. Foram utilizados 82.578 registros de peso dos animais do nascimento aos (P660) dias de idade de 16.359 animais da raça Tabapuã nascidos entre os anos de 1994 a 2014. O modelo de melhor ajuste de variância residual heterogênea foi o que considerou os efeitos: genético direto, genético materno, de ambiente permanente direto e o de ambiente permanente materno ajustado por polinômios de sexta, terceira, terceira e terceira ordens respectivamente (M6333), com 17 classes de variância residual heterogênea e 56 parâmetros conforme o critério (BIC), que penalizam modelos sobre-parametrizados e mais rigoroso como função do número de parâmetros estimados. O modelo de melhor ajuste para o critério (AIC), foi o que considerou os efeitos: genético direto, genético materno, de ambiente permanente direto e o de ambiente permanente materno ajustado por polinômios de sexta, terceira, quarta e terceira ordens respectivamente (M6343), composto por 17 classes de variância residual heterogênea e 60 parâmetros foi suficiente para ajustar (co)variâncias ao longo da trajetória de crescimento para este estudo. As estimativas de herdabilidade para o efeito genético direto se apresentaram variando de moderada a alta magnitudes e sugerem a possibilidade de ganhos genéticos por meio de seleção, considerando pesos até a idade adulta como critério de seleção para manutenção do tamanho adulto das fêmeas. As estimativas de herdabilidades maternas foram de baixas magnitudes de redução durante todo o intervalo, sugerindo que a seleção para este componente implicará em menor resposta do que a seleção para o efeito direto.


The random regression models have been used to estimate the components of variance and genetic parameters of milk and meat production of several species, among them the weights of beef cattle and of these of Tabapuã cattle, allowing to work with characteristics of Growth curves that are measured repeatedly in animal life, termed longitudinal data. These models are considered special cases of covariance functions and allow direct estimation of coefficients of covariance functions by the restricted maximum likelihood method. We used 82,578 birth weight records at (P660) days of age of 16,359 Tabapuã animals born between 1994 and 2014. The model of best fit of heterogeneous residual variance was what considered the effects: direct genetic (M6333), with 17 classes of heterogeneous residual variance and 56 parameters according to the criterion (BIC), which penalize Over-parameterized models and more rigorous as a function of the number of estimated parameters. The best fit model for the criterion (AIC) was the effects of direct genetic, maternal genetic, direct permanent environment and permanent maternal environment adjusted by sixth, third, fourth and third order polynomials respectively (M6343), Composed of 17 classes of heterogeneous residual variance and 60 parameters was sufficient to adjust (co) variances along the growth trajectory for this study. Inheritance estimates for the direct genetic effect varied from moderate to high magnitudes and suggest the possibility of genetic gains through selection, considering weights until adulthood as a selection criterion for maintenance of the adult size of the females. Estimates of maternal heritabilities were of low magnitudes of reduction over the entire range, suggesting that selection for this component will imply less response than selection for direct effect.

6.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-208773

Resumo

Há evidências na literatura que a uniformidade das características fenotípicas dos peixes, entre outros animais, pode ser afetada por componentes genéticos, além de fatores ambientais. Maior uniformidade na despesca é desejada, a fim de reduzir a competição entre os animais e, assim, ter uma produção mais homogênea, visando maior retorno financeiro da atividade. O objetivo deste estudo foi estimar se as variâncias residuais do peso e comprimento à despesca de tilápias do Nilo (Oreochromis niloticus) são afetadas por componentes genéticos, para avaliar a possibilidade de seleção para uniformidade de produção. Empregou-se o modelo hierárquico linear generalizado duplo (DHGLM) para calcular os componentes de variância, os parâmetros de herdabilidade, coeficientes de variação e correlações genéticas para peso (não transformado e com transformação Box-Cox) e comprimento à despesca. Foi utilizado um total de 8.725 informações fenotípicas de tilápias provenientes de 271 famílias da linhagem GIFT (Malásia), criados na estação experimental de piscicultura da Universidade Estadual de Maringá. Os resultados apoiaram a hipótese de heterogeneidade genética da variância residual para peso e comprimento à despesca, e a oportunidade de seleção medida através do coeficiente genético de variação da variância residual. Além disso, observou-se a necessidade de um grande número de filhos para a obtenção de estimativas precisas do mérito genético para variação residual, conforme indicado pelas estimativas de baixa herdabilidade. A transformação de Box-Cox foi capaz de diminuir a dependência entre a variância e a média do peso à despesca. A transformação reduziu, mas não eliminou toda a heterogeneidade genética da variância residual, destacando sua presença além do efeito da escala.


There is evidence in the literature that the uniformity of phenotypic traits of fish, among other animals, can be affected by genetic components, as well as environmental factors. Greater uniformity is desired in order to reduce competition among animals and thus have a more uniform production, aiming a greater financial return of the activity. The objective of this study was to assess if the residual variance of the weight and harvest length of the Nile tilapia (Oreochromis niloticus) is affected by a genetic component, to evaluate the possibility of selection for uniformity of production. The double hierarchical generalized linear model was used to estimate the components of variance, heritability, coefficients of variation and genetic correlation for weight (untransformed and with Box-Cox transformation) and harvest length. Phenotypic records of 8,725 individuals from 271 families were analyzed. The results supported the existence of genetic heterogeneity of residual variance on harvest weight and length, and the opportunity to select for increasing uniformity. Moreover, the low heritability estimates showed the necessity of high number of progeny for an accurate estimate of the genetic merit for the residual variance. The Box-Cox transformation of harvest weight reduced the dependency among its mean and variance. The transformation reduced but did not eliminate the genetic heterogeneity of residual variance, highlighting its presence beyond the scale effect.

7.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-200843

Resumo

Esta pesquisa foi realizada para determinar a exigência nutricional e avaliar o efeito da interação genótipo x relações (metionina+cistina):lisina das dietas sobre pesos corporais e características de carcaça de duas linhagens de codornas de corte (LF1 e LF2), em diferentes fases do crescimento. O experimento foi constituído de duas fases sendo que na primeira as codornas foram alimentadas do nascimento aos 21 dias de idade com dietas contento as relações (metionina+cistina):lisina iguais a 0,61, 0,66, 0,71, 0,76 e 0,81 e na segunda fase alimentadas do 22º ao 35º dia de idade, com dietas contendo as relações 0,68, 0,73, 0,78, 0,83 e 0,88 de (metionina+cistina):lisina. As codornas foram pesadas ao nascimento, 7, 14, 21, 28 e 35 dias de idade. Foram também registrados os pesos corporais ao abate, pesos e rendimentos da carcaça, do peito e da coxa+sobrecoxa. Modelos que consideram duas classes de variância residual foram mais adequados para avaliação genética de codornas de corte alimentadas com dietas contendo diferentes relações (metionina+cistina):lisina. As melhores codornas da linhagem LF1 e LF2, selecionadas em dietas com determinada relação (metionina+cistina):lisina, não apresentarão desempenho semelhante quando alimentadas com dietas contendo diferentes relações (metionina+cistina):lisina, evidenciando expressiva interação genótipo x ambiente (relações (metionina+cistina):lisina. A seleção deve ser praticada em codornas alimentadas com dietas que as codornas serão alimentadas no sistema comercial de produção. Na primeira fase a exigência de (metionina+cistina):lisina para maiores peso corporal, pesos da carcaça, do peito e da coxa+sobrecoxa foi 0,88, e para o melhor rendimento da carcaça a relação foi estimada em 0,75. De modo geral, as fêmeas e a linhagem LF1 apresentaram os melhores desempenhos. Na segunda fase, codornas alimentadas com dieta contendo a relação (metionina+cistina):lisina 0,81, fornecida do nascimento ao 21º dia de idade, apresentaram melhores resultados, sem contudo atingirem máximo desempenho.


This research was carried out to estimate the nutritional requirement and to evaluate the effect of genotype x (methionine+cystine):lysine ratio on body weight and carcass traits of two strains of European quails (LF1 and LF2) in two phases of the growth. The experiment was composed of two phases, in the first one, from hatch to 21 days of age, quails were fed diet containing (methionine+cystine):lysine ratios: 0.61, 0.66, 0.71, 0.76 and 0.81 and during the second experimental phase, quails were fed from 22 to 35 days of age diets containing (methionine+cystine):lysine ratios of 0.68, 0.73, 0.78, 0.83 and 0.88. The quails were weighed at hatch, 7, 14, 21, 28 and 35 days of age. Body weight at slaughter and weights and yields of carcass, breast, and thigh + drumstick were also recorded. Models with two classes of residual variance were more adequate for genetic evaluation of quails fed different (methionine+cystine):lysine ratio diets. Best quails of LF1 and LF2 strains selected in diets containing specific (methionine+cystine):lysine ratio will not present the same performance if fed different diet showing a significant genotype x environment interaction. Selection should be performed in quails fed diets with the same (methionine+cystine):lysine ratio as the quails will be fed in the commercial production system. In the first phase the (methionine+cystine):lysine requirement for maximum body weight and weights of carcass and thigh + drumstick is 0.88 and for carcass the relation is estimated in 0.75. In general females and strain LF1 showed the best performance. In the second phase quails fed diets containing 0.81 of (methionine+cystine):lysine ratio showed the best results without reaching maximum performance.

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