Production, partial purification, and characterization of a glucoamylase from Epicoccum nigrum

Starch processing industries use amylases, accounting for approximately 30% of the world's enzyme market. Previously, an amylase-producing strain of Epicoccum nigrumwas isolated from maize grains. Although E. nigrumamylase production is already reported in the literature, no published data on production optimization or characterization of the produced enzyme exists. The objectives of this work were to improve the amylase production by theE. nigrumPG 16 strain and to purify and characterize the produced enzyme. The E. nigrumPG 16 amylase production best conditions in submerged culture were: inoculum of 4% (v v-1) of a five-days-old stationary culture homogenate, agitation at 100 rpm, 25°C, natural light, 72 hours of incubation, starch as thecarbon source, and an initial medium pH of 7.0. A molecular exclusion chromatography profile has shown the production of only one amylase, which was partially purified with ammonium precipitation and dialysis. The enzyme optima pH and temperature are 6.0 and 50°C, respectively. The partially purified enzyme lostits activity when incubated for 30 min in temperatures above 40°C, presenting a T50of 46.25°C. The KMand Vmaxof the partially purified enzyme are 1.72 mg mL-1of starch and 0.15 mgmin-1of degraded starch, respectively. The ion Ca2+slightly activated the studied enzyme. The ions Cu2+, Zn2+, and Fe3+and the detergents SDS and Tween 80 acted as inhibitors of the studied enzyme. The partially purified enzyme released glucose from p-nitrophenyl α-D-glucopyranoside (p-NPG). Glucose was the enzyme's main product from starch hydrolysis, as evidenced by thin-layer chromatography. The E. nigrumPG 16 studied enzyme is a glucoamylase and represents an alternative for enzymatic starch hydrolysis.(AU)

Artisanal minas cheese parameters associated with regions of origin in Minas Gerais, Brazil / Determinação de parâmetros do queijo minas artesanal associados com as regiões de origem em Minas Gerais, Brasil

Artisanal cheese production involves a centuries-old tradition in the state of Minas Gerais in Brazil, playing an important historical and social role. The aim of this study was to evaluate the characteristics of artisanal Minas cheeses from seven regions certified for their production in relation to their physical-chemical and centesimal composition to identify parameters that are useful to differentiate them. There were differences among the cheeses from different regions for the soluble nitrogen variables, extension and depth of ripening indexes, ash, oxidation, fat and pH. The highest values for the ripening length and depth index were observed in the Cerrado region. The cheeses from the Canastra region were different due to the higher moisture content, and the cheeses from Campo das Vertentes presented higher pH and nitrogen compound values. Despite the similarities among cheeses in each region, they had dispersed positions in the principal components analysis. There are differences in the physicochemical and centesimal composition among the artisanal Minas cheeses from the distinct regions in Minas Gerais, and the analyzed parameters can be used to differentiate them. The contents of ash, fat, oxidation index, soluble nitrogen and pH were the parameters that were associated with greater differences in cheeses.

A produção artesanal de queijos envolve uma tradição secular no estado de Minas Gerais, no Brasil, exercendo importante papel histórico e social. Objetivou-se, com este estudo, avaliar as características de queijos minas artesanal de sete regiões certificadas para sua produção em relação à sua composição físico-química e centesimal, a fim de se identificarem parâmetros que sejam úteis para diferenciá-los. A composição físico-química e centesimal revelou diferença entre os queijos das diferentes regiões para as variáveis nitrogênio solúvel, índices de extensão e profundidade de maturação, cinzas, oxidação, gordura e pH. Os maiores valores para os índices de extensão e profundidade de maturação foram observados na região do Cerrado. Os queijos da região da Canastra se mostraram diferentes daqueles das demais regiões em razão do maior teor de umidade, assim como os queijos de Campo das Vertentes, que apresentaram maiores valores de pH e compostos nitrogenados. Apesar das semelhanças entre os queijos em cada região, esses apresentaram posicionamentos dispersos na análise de componentes principais. Existem diferenças na composição físico-química e centesimal entre os queijos minas artesanais oriundos das distintas regiões em Minas Gerais, e os parâmetros analisados podem ser utilizados para diferenciá-los. Os teores de cinzas, gordura, índice de oxidação, teores de nitrogênio solúvel e pH foram os parâmetros que estiveram associados a maiores diferenças dos queijos conforme sua região de origem.

Isolation and characterization of bacteria residing in the oral, gut, and fecal samples of different pheasant species / Isolamento e caracterização de bactérias residentes nas amostras orais, intestinais e fecais de diferentes espécies de faisão

There is a paucity of research conducted on microbial prevalence in pheasants. The microbiota of captive birds has zoonotic significance and must be characterize. Present study is therefore planned to assess the microbiota from oral, fecal and gut content of captive avian species. It will be helpful in characterization of harmful microbes. Different samples taken from oral, gut and feces of ring-necked pheasants (Phasianus colchicus), green pheasants (Phasianus versicolor), golden pheasant (Chrysolophus pictus) and silver pheasant (Lophura nycthemera). Samples were collected, diluted, and inoculated onto different agar plates (MacConkey, SS agar, MSA and nutrient agar) for cultivation of bacterial species. Colonies of E.coli, Staphylococcus spp. Brachyspira spp. and Campylobacter spp were observed based on colony morphology. Colony forming unit showed E. coli as frequently found bacteria in fecal, oral and gut contents of all the above pheasants. The overall significance difference was found among bacterial species of golden pheasants, green pheasant, ring-necked pheasant, and silver pheasants. It was concluded that E.coli is predominant isolated from heathy pheasants followed by Campylobacter, Staphylococcus and Brachyspira.

Há uma escassez de pesquisas realizadas sobre a prevalência microbiana em faisões. A microbiota de aves em cativeiro tem significado zoonótico e deve ser caracterizada. O presente estudo está, portanto, planejado para avaliar a microbiota do conteúdo oral, fecal e intestinal de espécies aviárias em cativeiro. Será útil na caracterização de micróbios nocivos. Diferentes amostras retiradas da boca, intestino e fezes de faisões de pescoço redondo (Phasianus colchicus), faisões verdes (Phasianus versicolor), faisões dourados (Chrysolophus pictus) e faisão prateado (Lophura nycthemera). As amostras foram coletadas, diluídas e inoculadas em diferentes placas de ágar (MacConkey, ágar SS, MSA e ágar nutriente) para o cultivo de espécies bacterianas. Colônias de E. coli, Staphylococcus spp., Brachyspira spp. e Campylobacter spp foram observados com base na morfologia da colônia. A unidade formadora de colônia mostrou E. coli como bactéria frequentemente encontrada no conteúdo fecal, oral e intestinal de todos os faisões acima. A diferença de significância geral foi encontrada entre as espécies bacterianas de faisões dourados, faisões verdes, faisões de pescoço anelado e faisões prateados. Verificou-se que a E.coli é predominantemente isolada de faisões saudáveis, seguida por Campylobacter, Staphylococcus e Brachyspira.

Isolation and characterization of bacteria residing in the oral, gut, and fecal samples of different pheasant species

Abstract There is a paucity of research conducted on microbial prevalence in pheasants. The microbiota of captive birds has zoonotic significance and must be characterize. Present study is therefore planned to assess the microbiota from oral, fecal and gut content of captive avian species. It will be helpful in characterization of harmful microbes. Different samples taken from oral, gut and feces of ring-necked pheasants (Phasianus colchicus), green pheasants (Phasianus versicolor), golden pheasant (Chrysolophus pictus) and silver pheasant (Lophura nycthemera). Samples were collected, diluted, and inoculated onto different agar plates (MacConkey, SS agar, MSA and nutrient agar) for cultivation of bacterial species. Colonies of E.coli, Staphylococcus spp. Brachyspira spp. and Campylobacter spp were observed based on colony morphology. Colony forming unit showed E. coli as frequently found bacteria in fecal, oral and gut contents of all the above pheasants. The overall significance difference was found among bacterial species of golden pheasants, green pheasant, ring-necked pheasant, and silver pheasants. It was concluded that E.coli is predominant isolated from heathy pheasants followed by Campylobacter, Staphylococcus and Brachyspira.

Resumo Há uma escassez de pesquisas realizadas sobre a prevalência microbiana em faisões. A microbiota de aves em cativeiro tem significado zoonótico e deve ser caracterizada. O presente estudo está, portanto, planejado para avaliar a microbiota do conteúdo oral, fecal e intestinal de espécies aviárias em cativeiro. Será útil na caracterização de micróbios nocivos. Diferentes amostras retiradas da boca, intestino e fezes de faisões de pescoço redondo (Phasianus colchicus), faisões verdes (Phasianus versicolor), faisões dourados (Chrysolophus pictus) e faisão prateado (Lophura nycthemera). As amostras foram coletadas, diluídas e inoculadas em diferentes placas de ágar (MacConkey, ágar SS, MSA e ágar nutriente) para o cultivo de espécies bacterianas. Colônias de E. coli, Staphylococcus spp., Brachyspira spp. e Campylobacter spp foram observados com base na morfologia da colônia. A unidade formadora de colônia mostrou E. coli como bactéria frequentemente encontrada no conteúdo fecal, oral e intestinal de todos os faisões acima. A diferença de significância geral foi encontrada entre as espécies bacterianas de faisões dourados, faisões verdes, faisões de pescoço anelado e faisões prateados. Verificou-se que a E.coli é predominantemente isolada de faisões saudáveis, seguida por Campylobacter, Staphylococcus e Brachyspira.

Significant production of vanillin and in vitro amplification of ech gene in local bacterial isolates

Abstract Vanillin is the major component which is responsible for flavor and aroma of vanilla extract and is produced by 3 ways: natural extraction from vanilla plant, chemical synthesis and from microbial transformation. Current research was aimed to study bacterial production of vanillin from native natural sources including sewage and soil from industrial areas. The main objective was vanillin bio-production by isolating bacteria from these native sources. Also to adapt methodologies to improve vanillin production by optimized fermentation media and growth conditions. 47 soil and 13 sewage samples were collected from different industrial regions of Lahore, Gujranwala, Faisalabad and Kasur. 67.7% bacterial isolates produced vanillin and 32.3% were non-producers. From these 279 producers, 4 bacterial isolates selected as significant producers were; A3, A4, A7 and A10. These isolates were identified by ribotyping as A3 Pseudomonas fluorescence (KF408302), A4 Enterococcus faecium (KT356807), A7 Alcaligenes faecalis (MW422815) and A10 Bacillus subtilis (KT962919). Vanillin producers were further tested for improved production of vanillin and were grown in different fermentation media under optimized growth conditions for enhanced production of vanillin. The fermentation media (FM) were; clove oil based, rice bran waste (residues oil) based, wheat bran based and modified isoeugenol based. In FM5, FM21, FM22, FM23, FM24, FM30, FM31, FM32, FM34, FM35, FM36, and FM37, the selected 4 bacterial strains produced significant amounts of vanillin. A10 B. subtilis produced maximum amount of vanillin. This strain produced 17.3 g/L vanillin in FM36. Cost of this fermentation medium 36 was 131.5 rupees/L. This fermentation medium was modified isoeugenol based medium with 1% of isoeugenol and 2.5 g/L soybean meal. ech gene was amplified in A3 P. fluorescence using ech specific primers. As vanillin use as flavor has increased tremendously, the bioproduction of vanillin must be focused.

Resumo A vanilina é o principal componente responsável pelo sabor e aroma do extrato de baunilha e é produzida de três formas: extração natural da planta da baunilha, síntese química e transformação microbiana. A pesquisa atual teve como objetivo estudar a produção bacteriana de vanilina a partir de fontes naturais nativas, incluindo esgoto e solo de áreas industriais. O objetivo principal era a bioprodução de vanilina por meio do isolamento de bactérias dessas fontes nativas. Também para adaptar metodologias para melhorar a produção de vanilina por meio de fermentação otimizada e condições de crescimento. Foram coletadas 47 amostras de solo e 13 de esgoto de diferentes regiões industriais de Lahore, Gujranwala, Faisalabad e Kasur; 67,7% dos isolados bacterianos produziram vanilina e 32,3% eram não produtores. Desses 279 produtores, 4 isolados bacterianos selecionados como produtores significativos foram: A3, A4, A7 e A10. Esses isolados foram identificados por ribotipagem como fluorescência A3 Pseudomonas (KF408302), A4 Enterococcus faecium (KT356807), A7 Alcaligenes faecalis (MW422815) e A10 Bacillus subtilis (KT962919). Os produtores de vanilina foram posteriormente testados para produção aprimorada de vanilina e foram cultivados em diferentes meios de fermentação sob condições de crescimento otimizadas para produção aprimorada de vanilina. Os meios de fermentação (FM) foram: à base de óleo de cravo, à base de resíduos de farelo de arroz (resíduos de óleo), à base de farelo de trigo e à base de isoeugenol modificado. Em FM5, FM21, FM22, FM23, FM24, FM30, FM31, FM32, FM34, FM35, FM36 e FM37, as 4 cepas bacterianas selecionadas produziram quantidades significativas de vanilina. A10 B. subtilis produziu quantidade máxima de vanilina. Essa cepa produziu 17,3 g / L de vanilina em FM36. O custo desse meio de fermentação 36 foi de 131,5 rúpias / L. Esse meio de fermentação foi um meio à base de isoeugenol modificado com 1% de isoeugenol e 2,5 g / L de farelo de soja. O gene ech foi amplificado em A3 P. fluorescence usando primers específicos para ech. Como o uso da vanilina como sabor aumentou tremendamente, a bioprodução da vanilina deve ser focada.

Isolation and characterization of bacteria residing in the oral, gut, and fecal samples of different pheasant species / Isolamento e caracterização de bactérias residentes nas amostras orais, intestinais e fecais de diferentes espécies de faisão

Abstract There is a paucity of research conducted on microbial prevalence in pheasants. The microbiota of captive birds has zoonotic significance and must be characterize. Present study is therefore planned to assess the microbiota from oral, fecal and gut content of captive avian species. It will be helpful in characterization of harmful microbes. Different samples taken from oral, gut and feces of ring-necked pheasants (Phasianus colchicus), green pheasants (Phasianus versicolor), golden pheasant (Chrysolophus pictus) and silver pheasant (Lophura nycthemera). Samples were collected, diluted, and inoculated onto different agar plates (MacConkey, SS agar, MSA and nutrient agar) for cultivation of bacterial species. Colonies of E.coli, Staphylococcus spp. Brachyspira spp. and Campylobacter spp were observed based on colony morphology. Colony forming unit showed E. coli as frequently found bacteria in fecal, oral and gut contents of all the above pheasants. The overall significance difference was found among bacterial species of golden pheasants, green pheasant, ring-necked pheasant, and silver pheasants. It was concluded that E.coli is predominant isolated from heathy pheasants followed by Campylobacter, Staphylococcus and Brachyspira.

Resumo Há uma escassez de pesquisas realizadas sobre a prevalência microbiana em faisões. A microbiota de aves em cativeiro tem significado zoonótico e deve ser caracterizada. O presente estudo está, portanto, planejado para avaliar a microbiota do conteúdo oral, fecal e intestinal de espécies aviárias em cativeiro. Será útil na caracterização de micróbios nocivos. Diferentes amostras retiradas da boca, intestino e fezes de faisões de pescoço redondo (Phasianus colchicus), faisões verdes (Phasianus versicolor), faisões dourados (Chrysolophus pictus) e faisão prateado (Lophura nycthemera). As amostras foram coletadas, diluídas e inoculadas em diferentes placas de ágar (MacConkey, ágar SS, MSA e ágar nutriente) para o cultivo de espécies bacterianas. Colônias de E. coli, Staphylococcus spp., Brachyspira spp. e Campylobacter spp foram observados com base na morfologia da colônia. A unidade formadora de colônia mostrou E. coli como bactéria frequentemente encontrada no conteúdo fecal, oral e intestinal de todos os faisões acima. A diferença de significância geral foi encontrada entre as espécies bacterianas de faisões dourados, faisões verdes, faisões de pescoço anelado e faisões prateados. Verificou-se que a E.coli é predominantemente isolada de faisões saudáveis, seguida por Campylobacter, Staphylococcus e Brachyspira.

Significant production of vanillin and in vitro amplification of ech gene in local bacterial isolates / Produção significativa de vanilina e amplificação in vitro do gene ech em isolados bacterianos locais

Abstract Vanillin is the major component which is responsible for flavor and aroma of vanilla extract and is produced by 3 ways: natural extraction from vanilla plant, chemical synthesis and from microbial transformation. Current research was aimed to study bacterial production of vanillin from native natural sources including sewage and soil from industrial areas. The main objective was vanillin bio-production by isolating bacteria from these native sources. Also to adapt methodologies to improve vanillin production by optimized fermentation media and growth conditions. 47 soil and 13 sewage samples were collected from different industrial regions of Lahore, Gujranwala, Faisalabad and Kasur. 67.7% bacterial isolates produced vanillin and 32.3% were non-producers. From these 279 producers, 4 bacterial isolates selected as significant producers were; A3, A4, A7 and A10. These isolates were identified by ribotyping as A3 Pseudomonas fluorescence (KF408302), A4 Enterococcus faecium (KT356807), A7 Alcaligenes faecalis (MW422815) and A10 Bacillus subtilis (KT962919). Vanillin producers were further tested for improved production of vanillin and were grown in different fermentation media under optimized growth conditions for enhanced production of vanillin. The fermentation media (FM) were; clove oil based, rice bran waste (residues oil) based, wheat bran based and modified isoeugenol based. In FM5, FM21, FM22, FM23, FM24, FM30, FM31, FM32, FM34, FM35, FM36, and FM37, the selected 4 bacterial strains produced significant amounts of vanillin. A10 B. subtilis produced maximum amount of vanillin. This strain produced 17.3 g/L vanillin in FM36. Cost of this fermentation medium 36 was 131.5 rupees/L. This fermentation medium was modified isoeugenol based medium with 1% of isoeugenol and 2.5 g/L soybean meal. ech gene was amplified in A3 P. fluorescence using ech specific primers. As vanillin use as flavor has increased tremendously, the bioproduction of vanillin must be focused.

Resumo A vanilina é o principal componente responsável pelo sabor e aroma do extrato de baunilha e é produzida de três formas: extração natural da planta da baunilha, síntese química e transformação microbiana. A pesquisa atual teve como objetivo estudar a produção bacteriana de vanilina a partir de fontes naturais nativas, incluindo esgoto e solo de áreas industriais. O objetivo principal era a bioprodução de vanilina por meio do isolamento de bactérias dessas fontes nativas. Também para adaptar metodologias para melhorar a produção de vanilina por meio de fermentação otimizada e condições de crescimento. Foram coletadas 47 amostras de solo e 13 de esgoto de diferentes regiões industriais de Lahore, Gujranwala, Faisalabad e Kasur; 67,7% dos isolados bacterianos produziram vanilina e 32,3% eram não produtores. Desses 279 produtores, 4 isolados bacterianos selecionados como produtores significativos foram: A3, A4, A7 e A10. Esses isolados foram identificados por ribotipagem como fluorescência A3 Pseudomonas (KF408302), A4 Enterococcus faecium (KT356807), A7 Alcaligenes faecalis (MW422815) e A10 Bacillus subtilis (KT962919). Os produtores de vanilina foram posteriormente testados para produção aprimorada de vanilina e foram cultivados em diferentes meios de fermentação sob condições de crescimento otimizadas para produção aprimorada de vanilina. Os meios de fermentação (FM) foram: à base de óleo de cravo, à base de resíduos de farelo de arroz (resíduos de óleo), à base de farelo de trigo e à base de isoeugenol modificado. Em FM5, FM21, FM22, FM23, FM24, FM30, FM31, FM32, FM34, FM35, FM36 e FM37, as 4 cepas bacterianas selecionadas produziram quantidades significativas de vanilina. A10 B. subtilis produziu quantidade máxima de vanilina. Essa cepa produziu 17,3 g / L de vanilina em FM36. O custo desse meio de fermentação 36 foi de 131,5 rúpias / L. Esse meio de fermentação foi um meio à base de isoeugenol modificado com 1% de isoeugenol e 2,5 g / L de farelo de soja. O gene ech foi amplificado em A3 P. fluorescence usando primers específicos para ech. Como o uso da vanilina como sabor aumentou tremendamente, a bioprodução da vanilina deve ser focada.

Molecular characterization of carnivore protoparvovirus strains circulating in cats in Turkey / Caracterização molecular de cepas de protoparvovírus carnívoros circulantes em gatos na Turquia

Cats are susceptible to feline panleukopenia virus (FPV) and canine parvovirus type 2 (CPV-2). Therefore, coinfection and superinfection with multiple parvovirus strains may occur, resulting in high heterogeneity and recombination. Considering the importance of cats as a potential source of genetic diversity for parvoviruses, we investigated the frequency of parvovirus infection in cats using their blood and fecal samples and performed molecular characterization of parvovirus strains circulating in cat populations. Accordingly, the fecal and blood samples of 60 cats with gastroenteritis symptoms were collected from Turkey's Burdur, Isparta, and Izmit provinces. Of these 15 fecal samples tested as parvovirus-positive by PCR, 14 were confirmed to have been infected with true FPV strains by sequencing analysis. Through the phylogeny analysis, those were located in the FPV cluster, closely related to CPV-2, and one was discriminated in the CPV-2b cluster. Additionally, sequence analysis of the VP2 gene of CPV and FPV revealed that the FPV strains detected in Turkey and the vaccine strains were highly related to each other, with a nucleotide identity of 97.7- 100%. Furthermore, 13 variable positions were detected in VP2 of the field and reference FPV strains. Three synonymous mutations were determined in the VP2 gene. Some amino acid mutations in the VP2 protein-affected sites were considered responsible for the virus's biological and antigenic properties. The partial sequence analysis of the VP2 gene revealed that four FPV strains detected in Turkey have a single nucleotide change from T to G at the amino acid position 384 between the nucleotides 3939-3941, which was reported for the first time. Therefore, these four isolates formed a different branch in the phylogenetic tree. The results suggest that both FPV and CPV-2b strains are circulating in domestic cats in Turkey and cats should be considered as potential sources of new parvovirus variants for cats, dogs and other animals.

Os gatos são suscetíveis ao vírus da panleucopenia felina (FPV) e ao parvovírus canino tipo 2 (CPV-2). Portanto, coinfecção e superinfecção com múltiplas cepas de parvovírus podem ocorrer, resultando em alta heterogeneidade e recombinação. Considerando a importância dos gatos como uma fonte potencial de diversidade genética para parvovírus, investigamos a frequência da infecção por parvovírus em gatos usando suas amostras de sangue e fezes e realizamos a caracterização molecular de cepas de parvovírus circulantes nas populações de gatos. Amostras fecais e de sangue de 60 gatos com sinais de gastroenterite foram coletadas nas províncias de Burdur, Isparta e Izmit, na Turquia. Destas, 15 amostras fecais testaram positivas para parvovírus por PCR e 14 foram confirmadas como infectadas com cepas verdadeiras de FPV por análise de sequenciamento. Através da análise filogenética, aqueles foram localizados no agrupamento FPV que está intimamente relacionado com o CPV-2, e um foi discriminado no agrupamento CPV-2b. Além disso, a análise da sequência do gene VP2 de CPV e FPV revelou que as cepas de FPV detectadas na Turquia e as cepas vacinais eram altamente relacionadas entre si, com uma identidade de nucleotídeos de 97,7-100%. Além disso, 13 posições variáveis foram detectadas em VP2 das cepas de campo e FPV de referência. Três mutações sinônimas foram determinadas no gene VP2. Algumas mutações de aminoácidos nos locais afetados pela proteína VP2 foram consideradas responsáveis pelas propriedades biológicas e antigênicas do vírus. A análise da sequência parcial do gene VP2 revelou que quatro cepas de FPV detectadas na Turquia têm uma única mudança de nucleotídeo de T para G na posição do aminoácido 384 entre os nucleotídeos 3939-3941, o que foi relatado pela primeira vez. Portanto, esses quatro isolados formaram um ramo diferente na árvore filogenética. Os resultados sugerem que ambas as cepas FPV e CPV-2b estão circulando em gatos domésticos na Turquia e os gatos devem ser considerados como fontes potenciais de novas variantes de parvovírus para gatos, cães e outros animais.

Molecular diversity of Sarcocystis spp. in opossums (Didelphis spp.) from Southeastern and Midwestern Brazil / Diversidade molecular de Sarcocystis spp. em gambás (Didelphis spp.) do Sudeste e Centro-oeste do Brasil

South American opossums (Didelphis spp.) are definitive hosts of Sarcocystis neurona, Sarcocystis speeri, Sarcocystis lindsayi and Sarcocystis falcatula. In Brazil, diverse studies have demonstrated a high frequency of Sarcocystis falcatula-like in sporocysts derived from opossums, and high genetic diversity has been observed in surface antigen-encoding genes (SAGs). In this study, genetic diversity of Sarcocystis spp. derived from Didelphis albiventris and Didelphis aurita from the cities of Campo Grande and São Paulo, was accessed by sequencing SAG2, SAG3, SAG4, the first internal transcribed spacer (ITS-1) and cytochrome c oxidase subunit I (cox1). Molecular identification was performed for 16 DNA samples obtained from sporocyst or culture-derived merozoites. The ITS-1, cox1, and SAG3 fragments were cloned, whereas SAG2 and SAG4 were sequenced directly from PCR products. Four alleles variants were found for SAG2, 13 for SAG3 and seven for SAG4, from which four, 13 and four, respectively, were novel. Twenty-seven allele variants were found for ITS-1, all phylogenetically related to S. falcatula-like previously described in Brazil. Sarcocystis sp. phylogenetically related to Sarcocystis rileyi was evidenced by cox1 in three opossums. Further studies are needed to clarify the role of Didelphis spp. as definitive hosts of Sarcocystis spp. other than that previous described.(AU)

Gambás sul-americanos (Didelphis spp.) são hospedeiros definitivos de Sarcocystis neurona, Sarcocystis speeri, Sarcocystis lindsayi e Sarcocystis falcatula. No Brasil, diversos estudos têm demonstrado alta frequência de Sarcocystis falcatula-like em esporocistos derivados de gambás, com grande diversidade nos genes que codificam antígenos de superfície (SAGs). Neste estudo, a diversidade genética de Sarcocystis spp., oriundos de Didelphis albiventris e Didelphis aurita, dos municípios de Campo Grande e São Paulo, foi acessada por meio do sequenciamento de SAG2, SAG3 e SAG4, da primeira região espaçadora interna transcrita (ITS-1) e citocromo c oxidase subunidade I (cox1). Identificação molecular foi realizada em 16 amostras de DNA, obtidas de esporocistos ou merozoítos derivados de cultivo. Os fragmentos de ITS-1, cox1 e SAG3 foram clonados, enquanto SAG2 e SAG4 foram sequenciados diretamente dos produtos de PCR. Quatro alelos foram observados em SAG2, 13 em SAG3 e sete em SAG4, sendo novos quatro, 13 e quatro, respectivamente. Em ITS-1, 27 alelos foram observados, todos filogeneticamente relacionados à S. falcatula-like, previamente detectados no Brasil. Sarcocystis sp. filogeneticamente relacionado à Sarcocystis rileyi foi evidenciado por cox1 em três gambás. Mais estudos são necessários para entender o papel de Didelphis spp. como hospedeiro definitivo de Sarcocystis spp. diferentes daqueles previamente descritos.(AU)

Isolation and characterization of bacteria residing in the oral, gut, and fecal samples of different pheasant species / Isolamento e caracterização de bactérias residentes nas amostras orais, intestinais e fecais de diferentes espécies de faisão

There is a paucity of research conducted on microbial prevalence in pheasants. The microbiota of captive birds has zoonotic significance and must be characterize. Present study is therefore planned to assess the microbiota from oral, fecal and gut content of captive avian species. It will be helpful in characterization of harmful microbes. Different samples taken from oral, gut and feces of ring-necked pheasants (Phasianus colchicus), green pheasants (Phasianus versicolor), golden pheasant (Chrysolophus pictus) and silver pheasant (Lophura nycthemera). Samples were collected, diluted, and inoculated onto different agar plates (MacConkey, SS agar, MSA and nutrient agar) for cultivation of bacterial species. Colonies of E.coli, Staphylococcus spp. Brachyspira spp. and Campylobacter spp were observed based on colony morphology. Colony forming unit showed E. coli as frequently found bacteria in fecal, oral and gut contents of all the above pheasants. The overall significance difference was found among bacterial species of golden pheasants, green pheasant, ring-necked pheasant, and silver pheasants. It was concluded that E.coli is predominant isolated from heathy pheasants followed by Campylobacter, Staphylococcus and Brachyspira.(AU)

Há uma escassez de pesquisas realizadas sobre a prevalência microbiana em faisões. A microbiota de aves em cativeiro tem significado zoonótico e deve ser caracterizada. O presente estudo está, portanto, planejado para avaliar a microbiota do conteúdo oral, fecal e intestinal de espécies aviárias em cativeiro. Será útil na caracterização de micróbios nocivos. Diferentes amostras retiradas da boca, intestino e fezes de faisões de pescoço redondo (Phasianus colchicus), faisões verdes (Phasianus versicolor), faisões dourados (Chrysolophus pictus) e faisão prateado (Lophura nycthemera). As amostras foram coletadas, diluídas e inoculadas em diferentes placas de ágar (MacConkey, ágar SS, MSA e ágar nutriente) para o cultivo de espécies bacterianas. Colônias de E. coli, Staphylococcus spp., Brachyspira spp. e Campylobacter spp foram observados com base na morfologia da colônia. A unidade formadora de colônia mostrou E. coli como bactéria frequentemente encontrada no conteúdo fecal, oral e intestinal de todos os faisões acima. A diferença de significância geral foi encontrada entre as espécies bacterianas de faisões dourados, faisões verdes, faisões de pescoço anelado e faisões prateados. Verificou-se que a E.coli é predominantemente isolada de faisões saudáveis, seguida por Campylobacter, Staphylococcus e Brachyspira.(AU)

Phyllochron estimates on agronomic potential and physiological quality of millet / Estimativas do filocrono no potencial agronômico e na qualidade fisiológica do milheto

Millet is largely explored for a diversity of applications. The use of millet high-quality seeds is essential to increase grain yield. Accordingly, the purposeof this studywas to evaluate the yield variability of milletplants from higher and lower-quality seeds in the expression of dry matter yield parameters. The studywas conducted in the experimental and didactic area of IFRS -campusIbirubá, Rio Grande do Sul, Brazil, with a completely randomized design. The treatments were plants from seeds of higher (HQS) and lower (LQS) quality and two season crops (2015/16 and 2017/18) in eight replications. Theemergence speed was appliedto identify plants from seeds of different qualities. The phyllochron, leaf number, height, stem diameter, number of nodes, and dry mass yield were the agronomic components evaluatedfor this study. Meteorological information was used to calculate phyllochron, water deficit, and average temperature. The collected data were submitted for analysis of variance and the Tukey test at a 5% probability of error. The HQS expressed lower phyllochron and most significant agronomic components. Furthermore, the 2015/16 crop had the lowest water deficit and obtained the best results.(AU)

O milheto é amplamente explorado para uma diversidade de aplicações. O uso de sementes de milheto de alta qualidade é essencial para aumentar a produtividade de grãos. Nesse sentido, o propósito deste estudo foi avaliar a variabilidade da produtividade de plantas de milheto provenientes de sementes de melhor e de menor qualidade na expressão dos parâmetros de produção de matéria seca. O estudo foi realizado na área experimental e didática do IFRS - campus Ibirubá, Rio Grande do Sul, Brasil, com delineamento inteiramente casualizado. Os tratamentos foram plantas provenientes de sementes de qualidade superior (SAS) e inferior (SQI) e duas safras (2015/16 e 2017/18) em oito repetições. A velocidade de emergência foi aplicada para identificar plantas a partir de sementes de diferentes qualidades. O filocrono, número de folhas, altura, diâmetro do caule, número de nós e rendimento de massa seca foram os componentes agronômicos avaliados para este estudo. As informações meteorológicas foram utilizadas para calcular o filocrono, o déficit hídrico e a temperatura média. Os dados coletados foram submetidos à análise de variância e ao teste de Tukey a 5% de probabilidade de erro. O SQS expressou menor filocrono e componentes agronômicos mais significativos. Ainda, a safra 2015/16 apresentou o menor déficit hídrico e obteve os melhores resultados.(AU)

Characterization and antibacterial activity of raw cotton fabrics treated with date seed extract and silver nanoparticles (AgNPs) / Caracterização e atividade antibacteriana de tecidos de algodão cru tratados com extrato de semente de tâmara e nanopartículas de prata (AgNPs)

Because of their immense economic, wellness, and remedial value, the seeds of palm (Phoenix dactylifera) were selected with synthesized silver nanoparticles (AgNPs) based on their properties for increasing the antibacterial efficacy of medical cotton. This study aimed to be contingent upon the characterisation of raw cotton fabrics treated by AgNPs with date seed extract (DSE) of P. dactylifera both individually and in combination and to investigate their antibacterial activity against various human pathogens. The prepared cotton materials with the synthesized AgNPs and/or DSE were described by both X-ray diffraction (XRD) and scanning electron microscope (SEM). At the same time, gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) and High-performance liquid chromatography (HPLC) were employed to determine the bioactive components in the aqueous date seed extract. The greater antibacterial activity was recorded by cotton treated with DSE and AgNPs mix, in which inhibition zones of all treatments were against Escherichia coli (8 cm), followed by Staphylococcus aureus (2.33-5.87cm) and Bacillus subtilis (2.17-4.63 cm), respectively. Overall, these findings indicate that treated cotton fabrics with synthesised AgNPs and DSE may be widely applied in various potential biological and medical applications, which could enhance environmental sustainability in closed production and consumption.

Devido ao imenso valor econômico, propriedades curativas e de bem-estar, as sementes de palmeira (Phoenix dactylifera) foram selecionadas com nanopartículas de prata sintetizadas (AgNPs), com base em suas propriedades, visando aumentar a eficácia antibacteriana do algodão medicinal. Este estudo teve como objetivo a caracterização de tecidos de algodão cru tratados por AgNPs com extrato de semente de tâmara (DSE) de P. dactylifera tanto individualmente quanto em combinação e investigar sua atividade antibacteriana contra vários patógenos humanos. Os materiais de algodão preparados com os AgNPs sintetizados e/ou DSE foram descritos por difração de raios-X (XRD) e microscópio eletrônico de varredura (SEM). Ao mesmo tempo, cromatografia gasosa-espectrometria de massa (GC-MS) e cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC) foram empregadas para determinar os componentes bioativos no extrato aquoso de sementes de tâmaras. A maior atividade antibacteriana foi registrada pelo algodão tratado com mistura de DSE e AgNPs, em que os halos de inibição de todos os tratamentos foram contra Escherichia coli (8 cm), seguido por Staphylococcus aureus (2,33-5,87 cm) e Bacillus subtilis (2,17-4,63 cm), respectivamente. De modo geral, essas descobertas indicam que os tecidos de algodão tratados com AgNPs sintetizados e DSE podem ser amplamente aplicados em várias aplicações biológicas e médicas potenciais, o que pode aumentar a sustentabilidade ambiental na produção e consumo fechados.

Seedling development of Melochia pyramidata in different substrates and pot sizes / Desenvolvimento de mudas de Melochia pyramidataem diferentes substratos e tamanho de vasos

Native plants such asMelochia pyramidatahave been targeted in various scientific studies due to their potential uses. From this perspective, the present study aimed to separately evaluate the effect of different substrates and pot sizeson the production of seedlings of M. pyramidatagenotypes propagated by cuttings. Theexperimentwas conducted in a plant nursery at the Center of Agricultural Sciences of theFederal University of Paraíba, Areia, PB, Brazil. Theexperimental design was completely randomizedandarranged in a 3 x 2factorialdesignwith three substrate types (sand, commercial substrate Plantmax®, andsand+ manure) and two genotypes(MP1 andMP2), withfive replications. Pot size evaluation used a 2 x 2factorial designwith two pot sizes(V1: 1.8 LandV2: 0.9 L), two genotypes(MP1 andMP2), andfour replications. The evaluations began seven days after the cuttings were planted in tubes and continued weekly for two months by evaluating the number of sprouts and leaves. After two months, these seedlings were transplanted to pots and evaluated for the number of sprouts, leaves, fruits, flower buds, leaf width, and leaf length. The data were subjected to analysis of variance and test of means(Tukey) at5% probability. The cuttings ofM. pyramidatadeveloped best in washed sand and in the commercial substratePlantmax®. The genotypes developed best in 1.8-L pots, showing more leaves, flower buds, and fruits.

As plantas nativas, como a Melochia pyramidata, têm sido alvos de vários estudos científicos devido suas potencialidades de usos. O objetivo deste trabalho foi avaliar, separadamente, o efeito de substratos e tamanhos de vasos na produção de mudas de genótipos de M. pyramidata pelo método da estaquia. O experimento foi conduzido em casa de vegetação no Centro de Ciências Agrárias da Universidade Federal da Paraíba, Areia, PB, Brasil. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado, em esquema fatorial 3 x 2, com três tipos de substratos (areia, substrato comercial Plantmax® e areia + esterco) e 2 genótipos (MP1 e MP2.), com 5 repetições. Para a avaliação feita em diferentes tamanhos de vasos, utilizou-se o esquema fatorial 2 x 2, com 2 tamanhos de vasos (V1: 1,8 Litros e V2: 0,9 Litros) e 2 genótipos (MP1 eMP2), com 4 repetições. As avaliações iniciaram-se após sete dias do plantio das estacas nos tubetes, e continuaram, semanalmente, por dois meses, avaliando o número de brotações e o número de folhas. Após os dois meses, estas mudas foram transplantadas para vasos, onde avaliou número de brotações, número de folhas, número de frutos, número de botões florais, largura da folha e comprimento da folha. Os dados foram submetidos à análise de variância e teste de médias (Tukey) a 5% de probabilidade. As estacasde M. pyramidata apresentaram melhor desenvolvimento em areia lavada e substrato comercial Plantmax®. Os genótipos se desenvolveram melhor em vasos de 1,8 litros, com maiores quantidades de folhas, botões florais e frutos.

Standardization of molecular techniques for the detection and characterization of intestinal protozoa and other pathogens in humans

Background: The intrinsic sensitivity limitations of basic parasitological methods, along with the particular biological characteristics of parasites, make these methods ineffective to differentiate morphologically indistinguishable species. Molecular detection and characterization techniques could be used to overcome these problems. The purpose of this work was to standardize molecular polymerase chain reaction (PCR) techniques, described in the literature, for the detection and molecular characterization of intestinal protozoa and other pathogens in humans. Methods: DNA was extracted from human or animal feces, previously washed or cultured in Boeck Drbohlav's Modified Medium. DNA extraction was performed with Machery-Nagel extraction kits. The standardization of the PCR, nested-PCR or RFLP techniques was carried out according to the literature. For each molecular technique performed, the sensitivity of the test was determined based on the minimun quantity required of DNA (sensitivity A) and the minimum quantity of life forms that the test detected (sensitivity B). Results: Sensitivity A was 10 fg for G. duodenalis, 12.5 pg for Entamoeba histolytica or Entamoeba dispar, 50 fg for Cryptosporidium spp., 225 pg for Cyclospora spp. and 800 fg or 8 fg for Blastocystis spp. after performing a 1780 bp PCR or 310 bp nested PCR, respectively. The sensitivity B was 100 cysts for G. duodenalis, 500 cysts for E. histolytica or E. dispar, 1000 oocysts for Cyclospora spp. and 3600 or four vegetatives forms for PCR or nested PCR of Blastocystis spp., respectively. Conclusions: The molecular detection of protozoa and chromist was achieved and the molecular characterization allowed the genotyping of some of the parasites such as Giardia duodenalis, Cryptosporidium spp., and Blastocystis spp. This study summarizes the molecular techniques for epidemiological studies in humans and animals, and helps in the investigation of their transmission sources in countries where intestinal parasites are a public health problem.(AU)

Seedling development of Melochia pyramidata in different substrates and pot sizes / Desenvolvimento de mudas de Melochia pyramidataem diferentes substratos e tamanho de vasos

Native plants such asMelochia pyramidatahave been targeted in various scientific studies due to their potential uses. From this perspective, the present study aimed to separately evaluate the effect of different substrates and pot sizeson the production of seedlings of M. pyramidatagenotypes propagated by cuttings. Theexperimentwas conducted in a plant nursery at the Center of Agricultural Sciences of theFederal University of Paraíba, Areia, PB, Brazil. Theexperimental design was completely randomizedandarranged in a 3 x 2factorialdesignwith three substrate types (sand, commercial substrate Plantmax®, andsand+ manure) and two genotypes(MP1 andMP2), withfive replications. Pot size evaluation used a 2 x 2factorial designwith two pot sizes(V1: 1.8 LandV2: 0.9 L), two genotypes(MP1 andMP2), andfour replications. The evaluations began seven days after the cuttings were planted in tubes and continued weekly for two months by evaluating the number of sprouts and leaves. After two months, these seedlings were transplanted to pots and evaluated for the number of sprouts, leaves, fruits, flower buds, leaf width, and leaf length. The data were subjected to analysis of variance and test of means(Tukey) at5% probability. The cuttings ofM. pyramidatadeveloped best in washed sand and in the commercial substratePlantmax®. The genotypes developed best in 1.8-L pots, showing more leaves, flower buds, and fruits.(AU)

As plantas nativas, como a Melochia pyramidata, têm sido alvos de vários estudos científicos devido suas potencialidades de usos. O objetivo deste trabalho foi avaliar, separadamente, o efeito de substratos e tamanhos de vasos na produção de mudas de genótipos de M. pyramidata pelo método da estaquia. O experimento foi conduzido em casa de vegetação no Centro de Ciências Agrárias da Universidade Federal da Paraíba, Areia, PB, Brasil. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado, em esquema fatorial 3 x 2, com três tipos de substratos (areia, substrato comercial Plantmax® e areia + esterco) e 2 genótipos (MP1 e MP2.), com 5 repetições. Para a avaliação feita em diferentes tamanhos de vasos, utilizou-se o esquema fatorial 2 x 2, com 2 tamanhos de vasos (V1: 1,8 Litros e V2: 0,9 Litros) e 2 genótipos (MP1 eMP2), com 4 repetições. As avaliações iniciaram-se após sete dias do plantio das estacas nos tubetes, e continuaram, semanalmente, por dois meses, avaliando o número de brotações e o número de folhas. Após os dois meses, estas mudas foram transplantadas para vasos, onde avaliou número de brotações, número de folhas, número de frutos, número de botões florais, largura da folha e comprimento da folha. Os dados foram submetidos à análise de variância e teste de médias (Tukey) a 5% de probabilidade. As estacasde M. pyramidata apresentaram melhor desenvolvimento em areia lavada e substrato comercial Plantmax®. Os genótipos se desenvolveram melhor em vasos de 1,8 litros, com maiores quantidades de folhas, botões florais e frutos.(AU)

Pseudomonas aeruginosa associated pulmonary infections and in vitro amplification virulent rhamnolipid (rhlR) gene / Infecções pulmonares associadas a Pseudomonas aeruginosa e gene ramnolipídeo virulento (rhlR) da amplificação in vitro

Background: Pseudomonas aeruginosa is a common opportunistic pathogenic bacterium with the ability to develop a strong communication pathway by quorum sensing system and different virulent factors. Among the various important secretions of P. aeruginosa rhamnolipid is important biological detergent, believed to be involved in the development of the biofilm and intercellular communication. It readily dissolves the lung surfactants that are then easily catalyzed by the phospholipases and in this way is involved in the acute pulmonary infection. Objective: research work was designed to investigate virulence and gene associated with virulence in P. aeruginosa responsible for pulmonary infections. Methods: In current study polymerase chain reaction (PCR) was used for the detection of the rhlR (rhamnolipid encoding) gene of isolated strains. A number of assays were performed that ensured its virulent behavior. Disc diffusion method was used to check its antibiotic resistance. Isolated strains were resistant to a number of antibiotics applied. Result: It was found that males are more prone to respiratory infections as compared to females. Male members with age of 44-58 and 59-73 are at a higher risk, while females with age of 44-58 are also at a risk of pulmonary infections. Antibiotic resistance was observed by measuringzone of inhibition in strains GCU-SG-M4, GCU-SG-M3, GCU-SG-M5, GCU-SG-M2, GCU-SG-M1 and GCU-SG-M6. GCU-SG-M2 was resistant to fluconazole (FLU), clarithromycin (CLR), cefixime (CFM) and Penicillin (P10). No zone of inhibition was observed. But it showed unusual diffused zone around the Ak and MEM antibiotic discs. rhl R gene and 16s rRNA gene were characterized and analyzed. Conclusion: Findings from current study would help[...].

Antecedentes: Pseudomonas aeruginosa é uma bactéria patogênica oportunista comum, com a capacidade de desenvolver uma forte via de comunicação pelo sistema de detecção de quorum e diferentes fatores virulentos. Entre as várias secreções importantes de P. aeruginosa rhamnolipid, há um importante detergente biológico, que se acredita estar envolvido no desenvolvimento do biofilme e na comunicação intercelular. Dissolve rapidamente os surfactantes pulmonares que são facilmente catalisados pelas fosfolipases e, dessa maneira, estão envolvidos na infecção pulmonar aguda. Objetivo: O trabalho de pesquisa foi desenhado para investigar a virulência e o gene associado à virulência em P. aeruginosa responsável por infecções pulmonares. Métodos: No presente estudo, a reação em cadeia da polimerase (PCR) foi utilizada para a detecção do gene rhlR (codificação ramnolipídeo) de cepas isoladas. Foram realizados vários ensaios que garantiram seu comportamento virulento. O método de difusão em disco foi utilizado para verificar sua resistência a antibióticos. As estirpes isoladas foram resistentes a vários antibióticos aplicados. Resultado: Verificou-se que os homens são mais propensos a infecções respiratórias em comparação às mulheres. Membros do sexo masculino com idade entre 44 e 58 e 59 e 73 anos correm maior risco, enquanto mulheres com idade entre 44 e 58 anos também correm risco de infecções pulmonares. A resistência aos antibióticos foi observada medindo a zona de inibição nas cepas GCU-SG-M4, GCU-SG-M3, GCU-SG-M5, GCU-SG-M2, GCU-SG-M1 e GCU-SG-M6. O GCU-SG-M2 foi resistente ao fluconazol (FLU), claritromicina (CLR), cefixima (CFM) e penicilina (P10). Nenhuma zona de inibição foi observada. Mas se notou uma zona difusa incomum ao redor dos discos antibióticos Ak e MEM. Os genes rhl R e 16s rRNA foram caracterizados e analisados. Conclusão: As conclusões do presente estudo ajudariam a aumentar a conscientização sobre a resistência a antibióticos de, [...].

Pseudomonas aeruginosa associated pulmonary infections and in vitro amplification virulent rhamnolipid (rhlR) gene

Abstract Background Pseudomonas aeruginosa is a common opportunistic pathogenic bacterium with the ability to develop a strong communication pathway by quorum sensing system and different virulent factors. Among the various important secretions of P. aeruginosa rhamnolipid is important biological detergent, believed to be involved in the development of the biofilm and intercellular communication. It readily dissolves the lung surfactants that are then easily catalyzed by the phospholipases and in this way is involved in the acute pulmonary infection. Objective research work was designed to investigate virulence and gene associated with virulence in P. aeruginosa responsible for pulmonary infections. Methods In current study polymerase chain reaction (PCR) was used for the detection of the rhlR (rhamnolipid encoding) gene of isolated strains. A number of assays were performed that ensured its virulent behavior. Disc diffusion method was used to check its antibiotic resistance. Isolated strains were resistant to a number of antibiotics applied. Result It was found that males are more prone to respiratory infections as compared to females. Male members with age of 44-58 and 59-73 are at a higher risk, while females with age of 44-58 are also at a risk of pulmonary infections. Antibiotic resistance was observed by measuring zone of inhibition in strains GCU-SG-M4, GCU-SG-M3, GCU-SG-M5, GCU-SG-M2, GCU-SG-M1 and GCU-SG-M6. GCU-SG-M2 was resistant to fluconazole (FLU), clarithromycin (CLR), cefixime (CFM) and Penicillin (P10). No zone of inhibition was observed. But it showed unusual diffused zone around the Ak and MEM antibiotic discs. rhl R gene and 16s rRNA gene were characterized and analyzed. Conclusion Findings from current study would help in raising awareness about antibiotic resistance of P. aeruginosa, and also the sequence of rhl R gene can be used as the diagnostic marker sequence to identify the virulent rhl R gene sequence from the samples when isolated from sputum of Pneumonia patients.

Resumo Antecedentes Pseudomonas aeruginosa é uma bactéria patogênica oportunista comum, com a capacidade de desenvolver uma forte via de comunicação pelo sistema de detecção de quorum e diferentes fatores virulentos. Entre as várias secreções importantes de P. aeruginosa rhamnolipid, há um importante detergente biológico, que se acredita estar envolvido no desenvolvimento do biofilme e na comunicação intercelular. Dissolve rapidamente os surfactantes pulmonares que são facilmente catalisados pelas fosfolipases e, dessa maneira, estão envolvidos na infecção pulmonar aguda. Objetivo O trabalho de pesquisa foi desenhado para investigar a virulência e o gene associado à virulência em P. aeruginosa responsável por infecções pulmonares. Métodos No presente estudo, a reação em cadeia da polimerase (PCR) foi utilizada para a detecção do gene rhlR (codificação ramnolipídeo) de cepas isoladas. Foram realizados vários ensaios que garantiram seu comportamento virulento. O método de difusão em disco foi utilizado para verificar sua resistência a antibióticos. As estirpes isoladas foram resistentes a vários antibióticos aplicados. Resultado Verificou-se que os homens são mais propensos a infecções respiratórias em comparação às mulheres. Membros do sexo masculino com idade entre 44 e 58 e 59 e 73 anos correm maior risco, enquanto mulheres com idade entre 44 e 58 anos também correm risco de infecções pulmonares. A resistência aos antibióticos foi observada medindo a zona de inibição nas cepas GCU-SG-M4, GCU-SG-M3, GCU-SG-M5, GCU-SG-M2, GCU-SG-M1 e GCU-SG-M6. O GCU-SG-M2 foi resistente ao fluconazol (FLU), claritromicina (CLR), cefixima (CFM) e penicilina (P10). Nenhuma zona de inibição foi observada. Mas se notou uma zona difusa incomum ao redor dos discos antibióticos Ak e MEM. Os genes rhl R e 16s rRNA foram caracterizados e analisados. Conclusão As conclusões do presente estudo ajudariam a aumentar a conscientização sobre a resistência a antibióticos de P. aeruginosa e, também, a sequência do gene rhl R pode ser usada como sequência de diagnóstico para identificar a sequência virulenta do gene rhl R das amostras quando isoladas do escarro de pacientes com pneumonia.

Avaliação do potencial da madeira de Pinus greggiipara produção depolpa celulósica / Evaluation of the potential of Pinus greggii wood for pulp production

O segmento de produção de papel de fibra longa no Brasil está concentrado na utilização de duas espécies do gênero Pinus (P. taeda e P. elliottii). Assim, éfundamental avaliar novas espécies, visando ampliar as alternativas para esse segmento. Opresente estudo teve como objetivo avaliar as propriedades físicas, químicas e anatômicas da madeira de Pinus greggii visando a produção de polpa celulósica. Foram utilizadas três árvores, com seteanos de idade, das quais foram retirados discos ao longo do fuste. Estes foram utilizados para avaliar as propriedades físicas (densidade básica média e ponderada), químicas (teores de cinza, extrativos, lignina e holocelulose) e anatômicas (dimensões dos traqueídeos e indicadores anatômicos). De acordo com a caracterização físicada madeira, obteve-se um valor médio de densidade básica de 0,346 g.cm-3e ponderadode 0,343 g.cm-3, o que permite classificá-la como leve ou de baixa densidade. Em relação à composição química, a espécie apresentou elevados teores de lignina e extrativos (34,83% e 6,25%, respectivamente) e baixos teores de holocelulose (58,92%) e cinza (0,20%). Para as dimensões dos traqueídeos obtiveram-se valores médios de 2,31 mm de comprimento, 41,30 µm de largura, 34,81 µm de diâmetro do lúmen, e 3,25 µm de espessura da parede celular. Quanto aos resultados dos índices de qualidade, a espécie obteve destaque para a fração parede (15,96%), coeficiente de flexibilidade (84,31%), índice de Runkel (0,19) e índice de enfeltramento (55,15). De modo geral, a madeira de P. greggiiapresenta potencial para produção de polpa celulósica, destacando-se pelos indicadores anatômicos e pelas dimensões dos traqueídeos, que são semelhantes aos valores encontrados para P. taedana mesma idade. Entretanto, possui elevados teores de lignina e extrativos, que podem aumentar o consumo de reagentes e diminuir o rendimento do processo de polpação, o que precisa ser comprovado em estudos com esta temática.(AU)

The long fiber paper production segment in Brazil is restrict on the use of only two species of the Pinusgenus (P. taedaand P. elliottii), therefore, it is essential to evaluate new species, aiming to expand the alternatives for this segment. In this sense, the present study aimed to evaluate the physical, chemical and anatomical properties of Pinus greggiiwood aiming at the pulp production. For this, three 7-year-old trees were used, from which disks were removed along the stem. These were used to evaluate physical (average and weighted basic density), chemical (ash, extractive, lignin and holocellulose) and anatomical (tracheid dimensions and anatomical indicators) properties. According to the physical characterization, an average value of basic density of 0.346 g.cm-3and weighted of 0.343 g.cm-3was obtained, which allows classifying it as light or low density. Regarding the chemical composition, the species showed high levels of lignin and extractives (34.83% and 6.25%, respectively) and low levels of holocellulose (58.92%) and ash (0.20%). For the tracheids dimensions, mean values of 2.31 mm in length,41.30 µm in width, 34.81 µm in lumen diameter, and 3.25 µm in cell wall thickness were obtained. As for the results of the quality index, the species stood out for the wall fraction (15.96%), flexibility coefficient (84.31%), Runkel index (0.19) and felting index (55.15). In general, the P. greggiiwood presents potential for the pulp production, standing out for its anatomical indicators and for the tracheids dimensions, which are similar to the values found for P. taedaat the same age. However, it has high levels of lignin and extractives, which can increase the consumption of reagents and decrease the yield of the pulping process, which needs to be proven in studies on this topic.(AU)

Morphological and molecular evidences of Ascaridia galli in migratory quail Coturnix coturnix japonica from Baluchistan Pakistan / Evidências morfológicas e moleculares de Ascaridia galli em codornas migratórias Coturnix coturnix japonica, do Baluchistão, Paquistão

The current study was conducted to examine the point prevalence of gastrointestinal parasites of migratory quails. Due to its economic importance, the control of ascaridiosis is critical. Migration of birds is considered to enhance the global spread and cross-species transmission of pathogens. The current study was aimed to detect A.galli in migratory quails, a potential contributory risk factor for transmission of this parasite to local birds. A total of 230 migratory quails were trapped using nets from migratory routes in Balochistan and examined under the compound microscope for the presence of A. galli. Conventionally, A. galli was identified by its morphology with the presence of three large lips and absence of posterior esophageal bulb. Results revealed that out of 230, 120 (52.17%) quails were positive for A. galli by targeting COX1 gene (533 bp) by using conventional PCR. Further, the amplicon was sequenced which showed 99% similarity with A. galli publically available in NCBI Gen Bank. Phylogenetic analysis of sequences of our isolated parasite indicated the close relationship with A.galli isolated from chickens. In conclusion migratory quails and other migratory birds may play a key role in spreading and transmission of these parasites and other pathogens to domestic chicken. Therefore, strict biosecurity measures should be adopted especially for commercial poultry farms.

O presente estudo foi conduzido para examinar a prevalência pontual de parasitas gastrointestinais de codornas migratórias. Devido à sua importância econômica, o controle da ascaridiose é fundamental. Considera-se que a migração de aves aumenta a disseminação global e a transmissão entre espécies de patógenos. O presente estudo teve como objetivo detectar A. galli em codornas migratórias, um potencial fator de risco contributivo para a transmissão desse parasita para aves locais. Um total de 230 codornas migratórias foi capturado, usando redes de rotas migratórias no Baluchistão e examinadas sob o microscópio composto para a presença de A. galli. Convencionalmente, o A. galli foi identificado por sua morfologia com a presença de três grandes lábios e ausência de bulbo esofágico posterior. Os resultados revelaram que de 230, 120 (52,17%) codornas foram positivas para A. galli por direcionamento do gene COX1 (533 pb) usando PCR convencional. Além disso, o amplicon foi sequenciado, que mostrou 99% de similaridade com A. galli publicamente disponível no NCBI Gen Bank. A análise filogenética das sequências do nosso parasita isolado indicou a estreita relação com A. galli isolado de galinhas. Em conclusão, codornas migratórias e outras aves migratórias podem desempenhar papel fundamental na disseminação e transmissão desses parasitas e outros patógenos para as galinhas domésticas. Portanto, medidas rigorosas de biossegurança devem ser adotadas, especialmente para granjas comerciais.

Phenolic profiling, organic acids and sugars composition of feijoa (Acca sellowiana (O. Berg) Burret) and uvaia (Eugenia pyriformis Cambess) from the southern Brazilian highlands / Perfil fenólico, composição de ácidos orgânicos e de açúcares de feijoa (Acca sellowiana (O. Berg) Burret) e uvaia (Eugenia pyriformis Cambess) do planalto sul brasileiro

Brazil is a large country with high biodiversity in its different regions. However, species of native fruits widely reported in the southern Brazil have not been properly explored so far, remaining underutilized by the food industry. This study evaluated the polyphenolic profile, as well as the composition of organic acids and sugars of the pulps of the feijoa, and the uvaia from southern brazilian highlands. The uvaia pulp showed the highest total polyphenol content and the highest antioxidant capacity by the methods used. The polyphenol (+)-catechin (6.54 mg 100g-1) was the major phenolic compound in uvaia pulp, which has not yet been reported in the literature for fruits of other regions. In addition, the feijoa pulp stood out for the presence of (-)-epicatechin (18.29 mg 100g-1). The pulps of native fruits in this study only quantified values for citric and malic acids. Malic acid (553.00 mg 100g-1) was the main acid in the uvaia pulp, and citric acid (455.60 mg 100g-1) was the main acid in the feijoa pulp. It is possible to note that the feijoa pulp showed the highest total sugar content (11.14 g 100g-1) and was the only pulp that contained sucrose. The uvaia pulp, conversely, showed fructose (3.10 g 100g-1) as the main sugar. The results obtained in this study contributed to the valuation and conservation of the species investigated, representing a promising alternative for the use of these native fruits in the development of new products.

O Brasil é um grande país e com elevada biodiversidade em suas diferentes regiões. Entretanto, espécies de frutas nativas amplamente encontradas no sul do Brasil ainda não foram devidamente exploradas, permanecendo desconhecidas e subutilizadas pela indústria de alimentos. Nesse sentido, o objetivo deste estudo foi avaliar o perfil fenólico, bem como a composição de ácidos orgânicos e de açúcares de polpas de feijoa (Acca sellowiana) e de uvaia (Eugenia pyriformis) provenientes do planalto sul brasileiro. A polpa de uvaia apresentou o maior teor de polifenóis totais e a maior capacidade antioxidante pelos métodos utilizados. A (+)-catequina (6.54 mg 100g-1) foi o principal composto fenólico da polpa da uvaia, o que ainda não foi relatado na literatura para frutas de outras regiões. Além disso, a polpa da feijoa se destacou pela presença de (-)-epicatequina (18.29 mg 100g-1). Dentre os ácidos orgânicos avaliados, as polpas de frutas nativas apresentaram valores para os ácidos cítrico e málico, sendo o ácido málico (553.00 mg 100g-1) o principal na polpa de uvaia, e o cítrico (455.60 mg 100g-1) na polpa de feijoa. Em relação aos açúcares, a polpa da feijoa apresentou o maior teor de açúcar total (11.14 g 100g-1) e foi a única polpa que continha sacarose. Já a polpa da uvaia apresentou a frutose (3.10 g 100g-1) como principal açúcar. Os resultados obtidos neste estudo contribuem para a valorização e conservação das espécies investigadas, representando uma alternativa promissora para a utilização dessas frutas nativas no desenvolvimento de novos produtos.