Resumo
Cultivated strawberry (Fragaria × ananassa Duch.) is a high value horticultural crop. In this study, the genetic diversity of 160 strawberry accessions was determined using five highly polymorphic simple sequence repeat (SSR) markers. Sixty different alleles were identified, with allele frequencies in the range of 0.006 to1. Similarity scores were in the range of 0.034 to 0.963 (average: 0.507). The accessions were categorized into five groups. Group 1 contained two diploid Fragaria vesca species and one unknown accession. Group 2 contained one accession (F x ananassa). Group 3 contained 20 F × ananassa accessions and six unknown accessions. Group 4 contained 48 F. × ananassa accessions, one octaploid Fragaria chiloensis species, and six unknown accessions while Group 5 contained 69 F. × ananassa accessions and six unknown accessions. Accessions within a pedigree were frequently grouped together. A total of 30 novel accessions were categorized alongside existing accessions. These results will allow breeders to develop strategies which incorporate more genetic diversity into new cultivars.
Assuntos
Fragaria/genética , Sequências Repetitivas de Ácido Nucleico , Variação Genética , Marcadores Genéticos , ReproduçãoResumo
Cultivated strawberry (Fragaria × ananassa Duch.) is a high value horticultural crop. In this study, the genetic diversity of 160 strawberry accessions was determined using five highly polymorphic simple sequence repeat (SSR) markers. Sixty different alleles were identified, with allele frequencies in the range of 0.006 to1. Similarity scores were in the range of 0.034 to 0.963 (average: 0.507). The accessions were categorized into five groups. Group 1 contained two diploid Fragaria vesca species and one unknown accession. Group 2 contained one accession (F x ananassa). Group 3 contained 20 F × ananassa accessions and six unknown accessions. Group 4 contained 48 F. × ananassa accessions, one octaploid Fragaria chiloensis species, and six unknown accessions while Group 5 contained 69 F. × ananassa accessions and six unknown accessions. Accessions within a pedigree were frequently grouped together. A total of 30 novel accessions were categorized alongside existing accessions. These results will allow breeders to develop strategies which incorporate more genetic diversity into new cultivars.(AU)
Assuntos
Variação Genética , Fragaria/genética , Sequências Repetitivas de Ácido Nucleico , Reprodução , Marcadores GenéticosResumo
One of the greatest problems in Coffea arabica breeding is identifying precisely any inbred line, based only on botanical and agronomical descriptors, because of the reduced genetic variability of the species, close pedigree origin, which results in small phenotypic variation. Recently, molecular markers have been used for plant germplasm characterization and identification in several commercial species. This work evaluates the reliability of three marker systems: RAPD, AFLP and SSR, to characterize the genetic variability of commercially-used Coffea inbred lines developed by the Instituto Agronômico (IAC), and their potential for cultivar identification. All methods identified polymorphisms among the cultivars. The genetic diversity recognized by the methods is very similar, although is very narrow. RAPD and SSR marker systems grouped more efficiently the evaluated cultivars according to parental origin. None of the methods allowed inbred line identification. Therefore for varietal protection, it would be necessary using a combination of botanical, agronomical and molecular markers descriptors for precise cultivar identification.
A identificação de linhagens de Coffea arabica a partir de descritores botânicos e agronômicos é um problema para o desenvolvimento de cultivares. Basicamente, a limitada variação fenotípica observada em cultivares é o resultado de uma estreita variabilidade genética em C. arabica associada com uma origem genealógica próxima. Recentemente, os uso de marcadores moleculares tem contribuído para a caracterização e identificação de várias espécies de interesse comercial. O objetivo deste trabalho foi comparar a confiabilidade de três tipos de marcadores moleculares, RAPD, AFLP e SSR, para a caracterização da variabilidade genética e uma possível identificação de linhagens comerciais de Coffea desenvolvidas pelo IAC. Os métodos avaliados permitiram identificar polimorfismos entre cultivares. A variabilidade genética detectada por eles é muito semelhante, ainda que reduzida. Marcadores do tipo RAPD e SSR foram mais eficientes em análises de parentesco, e o agrupamento das linhagens correspondeu à sua origem genealógica. No entanto, nenhum dos métodos testados permitiu a identificação individual de linhagens. Neste caso, a utilização conjunta de descritores botânicos, agronômicos e marcadores moleculares é recomendada para a identificação precisa de linhagens, visando processos de proteção legal de cultivares de Coffea.
Resumo
One of the greatest problems in Coffea arabica breeding is identifying precisely any inbred line, based only on botanical and agronomical descriptors, because of the reduced genetic variability of the species, close pedigree origin, which results in small phenotypic variation. Recently, molecular markers have been used for plant germplasm characterization and identification in several commercial species. This work evaluates the reliability of three marker systems: RAPD, AFLP and SSR, to characterize the genetic variability of commercially-used Coffea inbred lines developed by the Instituto Agronômico (IAC), and their potential for cultivar identification. All methods identified polymorphisms among the cultivars. The genetic diversity recognized by the methods is very similar, although is very narrow. RAPD and SSR marker systems grouped more efficiently the evaluated cultivars according to parental origin. None of the methods allowed inbred line identification. Therefore for varietal protection, it would be necessary using a combination of botanical, agronomical and molecular markers descriptors for precise cultivar identification.
A identificação de linhagens de Coffea arabica a partir de descritores botânicos e agronômicos é um problema para o desenvolvimento de cultivares. Basicamente, a limitada variação fenotípica observada em cultivares é o resultado de uma estreita variabilidade genética em C. arabica associada com uma origem genealógica próxima. Recentemente, os uso de marcadores moleculares tem contribuído para a caracterização e identificação de várias espécies de interesse comercial. O objetivo deste trabalho foi comparar a confiabilidade de três tipos de marcadores moleculares, RAPD, AFLP e SSR, para a caracterização da variabilidade genética e uma possível identificação de linhagens comerciais de Coffea desenvolvidas pelo IAC. Os métodos avaliados permitiram identificar polimorfismos entre cultivares. A variabilidade genética detectada por eles é muito semelhante, ainda que reduzida. Marcadores do tipo RAPD e SSR foram mais eficientes em análises de parentesco, e o agrupamento das linhagens correspondeu à sua origem genealógica. No entanto, nenhum dos métodos testados permitiu a identificação individual de linhagens. Neste caso, a utilização conjunta de descritores botânicos, agronômicos e marcadores moleculares é recomendada para a identificação precisa de linhagens, visando processos de proteção legal de cultivares de Coffea.
Resumo
SUMMARY aiming to facilitate the identification of beans (Phaseolus vulgaris L.) cultivars a characterization of legumes and seeds was conducted on 24 genotypes included on experiment of the State Yield Trial Nursery located atthe Federal University of Santa Maria, during the 1992/93 growing season. On the legumes were evaluated the average length, color and profile form, and its extremity, as well as the average number of seeds per legume. On the seeds were determined size, form, weight, color and tegument brilliance, color of strials, hilum and halum. The traits analised varied as a function of genotypes and environmental conditions. Therefore the differences observed within each commercial group did not eliminate the difficulties related to visual identification of seeds and legumes.
RESUMO Com o objetivo de facilitar a identificação de cultivares, realizou-se a caracterização das vagens e sementes de 24 genótipos incluídos no Ensaio Estadual (RS) de Produtividade de Feijão (Phaseolus vulgaris L.), o qual foi instalado na área experimental do Departamento de Fitotecnia, Universidade Federal de Santa Maria, na safra 1992/93. Nas vagens foram avaliados o comprimento médio, cor e as formas do perfil, da extremidade e do dente apical, mais o número médio de sementes por vagem. Para as sementes determinou-se a cor e o brilho do tegumento, as cores das estrias, do hilo e halo, tamanho, forma e peso. As características analisadas variaram em função dos genótipos e das condições ambientais, assim as diferenças detectadas, dentro de cada grupo comercial, não eliminam a dificuldade de identificação visual das vagens e sementes.
Resumo
SUMMARY aiming to facilitate the identification of beans (Phaseolus vulgaris L.) cultivars a characterization of legumes and seeds was conducted on 24 genotypes included on experiment of the State Yield Trial Nursery located atthe Federal University of Santa Maria, during the 1992/93 growing season. On the legumes were evaluated the average length, color and profile form, and its extremity, as well as the average number of seeds per legume. On the seeds were determined size, form, weight, color and tegument brilliance, color of strials, hilum and halum. The traits analised varied as a function of genotypes and environmental conditions. Therefore the differences observed within each commercial group did not eliminate the difficulties related to visual identification of seeds and legumes.
RESUMO Com o objetivo de facilitar a identificação de cultivares, realizou-se a caracterização das vagens e sementes de 24 genótipos incluídos no Ensaio Estadual (RS) de Produtividade de Feijão (Phaseolus vulgaris L.), o qual foi instalado na área experimental do Departamento de Fitotecnia, Universidade Federal de Santa Maria, na safra 1992/93. Nas vagens foram avaliados o comprimento médio, cor e as formas do perfil, da extremidade e do dente apical, mais o número médio de sementes por vagem. Para as sementes determinou-se a cor e o brilho do tegumento, as cores das estrias, do hilo e halo, tamanho, forma e peso. As características analisadas variaram em função dos genótipos e das condições ambientais, assim as diferenças detectadas, dentro de cada grupo comercial, não eliminam a dificuldade de identificação visual das vagens e sementes.