Resumo
This work evaluated the initial performance and genetic diversity of Coffea canephora genotypes cultivated in environments at contrasting altitudes. Fourteen morphophysiological traits and seven descriptors of the genus Coffea spp. of coffee trees cultivated at altitudes of 140 m and 700 m were evaluated. The design used was Federer's augmented block in a 2 × 112 factorial scheme with six blocks. The first factor was the two environments, and the second was the 112 genotypes, with eight common treatments, being five conilon coffee clones and three arabica coffee cultivars. The data were analyzed by the method of REML/BLUP and genetic correlation method. Genetic diversity was evaluated by estimating the distance matrix, applying the Gower methodology followed by the clustering method by Tocher and UPGMA. The phenotypic means were higher in the environment at an altitude of 700 m, except for plant height, number of leaves, and canopy height (CH). Genotypic effects were significant for most traits except for leaf width, CH, unit leaf area, and total leaf area. A wide genetic diversity was verified, with distances varying from 0.037 to 0.593 for the pairs of genotypes 26 × 93 and T7 × 76, respectively. Most of the traits studied showed high genotypic correlation with the environment and expressive genetic correlation between the evaluated traits thereby demonstrating the possibility of indirect selection. There is an adaptation of conilon coffee genotypes to high altitudes and the possibility of developing a specific cultivar for the southern state of Espírito Santo.
Assuntos
Variação Genética , Coffea/crescimento & desenvolvimento , Coffea/genética , AltitudeResumo
The aim of this study was to assess the goodness of fit for nonlinear models, using the best model to describe body growth curves, comparing the parameters obtained for gender and one meat-type (Coturnix coturnix coturnix) and two laying (Coturnix coturnix japonica) quail strains, as well as nesting via MCMC (Markov chain Monte Carlo processes) methods under a Bayesian approach. A total of 1,350 one-day-old mixed quail were used: 400 of meat-type, 450 of yellow laying, and 500 of red laying strains distributed in a completely randomized design with three treatments (each treatment corresponded to one strain) and five replications. The experimental period consisted of 1 to 42 days of age. At 21 days of age, quail sexing was performed by means of sexual dimorphism, being individually identified at one day of age with numbered rings, allowing determining growth curves by gender. Birds were reared in a conventional system, fed ad libitum with diets formulated to meet nutritional requirements. Body weight was determined weekly and assessed using nonlinear models: Logistic, Brody, Von Bertalanffy, and Gompertz, whose parameters were estimated under a Bayesian approach via MCMC algorithm by means of BRugs package from the software R. DIC (Deviance Information Criterion) criterion was used to select the best nonlinear model, i.e. the lower the DIC value is, the better the model goodness of fit to thedata. Gompertz model was better adjusted to the data regardless the gender or strain. Meat-type quailhad the highest asymptotic weights and the highest age at which growth rate was maximum, followedby red and yellow strains. All nestings presented significant differences (p < 0.05) between gender forcontrasted parameters. Meat-type, yellow, and red females presented values significantly (p < 0.05)higher for asymptotic weight (370, 203, and 215 g, respectively) when compared to males (274, 131,and 143 g, respectively), which were earlier in body growth.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade de ajuste dos modelos não lineares aos dados, utilizando o melhor modelo para descrever as curvas de crescimento corporal, comparando os parâmetros obtidos para gênero e uma linhagem de codornas de corte (Coturnix coturnix coturnix) e duas de postura (Coturnix coturnix japonica), bem como o aninhamento, via método MCMC (Cadeias de Markov em processos de Monte Carlo), sob o enfoque Bayesiano. Foram utilizadas 1.350 codornas mistas, com um dia de idade, sendo: 400 da linhagem de corte, 450 de postura amarela e 500 de postura vermelha, distribuídas por um delineamento inteiramente casualizado, com três tratamentos (cada tratamento corresponde a uma linhagem) e cinco repetições. O período experimental foi de 1 a 42 dias de idade. Aos 21 dias de idade foi realizada a sexagem por dimorfismo sexual, sendo que elas foram identificadas individualmente com um dia com anilhas numeradas, possibilitando a determinação das curvas de crescimento por gênero. As aves foram criadas em um sistema convencional, alimentadas ad libitum com rações formuladas para atender às exigências nutricionais. O peso corporal foi determinado semanalmente e avaliados por meio dos modelos não lineares: Logístico, Brody, Von Bertalanffy e Gompertz. Para a seleção domelhor modelo não linear utilizou-se o critério DIC (Deviance Information Criterion), em que quantomenor o valor de DIC, melhor é a qualidade do ajuste do modelo aos dados. Gompertz melhor se ajustouaos dados, independentemente do gênero ou linhagem. As codornas de corte tiveram os maiores pesosassintóticos e a maior idade em que a taxa de crescimento é máxima, seguido pela vermelha e amarela.Todos aninhamentos apresentaram diferenças significativas (p < 0,05) entre gênero para os parâmetroscontrastados. As fêmeas de corte, amarela e vermelha apresentaram valores significativamente (p <0,05) maiores para o peso assintótico (370, 203 e 215 g, respectivamente), comparados aos...
Assuntos
Animais , Coturnix/crescimento & desenvolvimento , Teorema de Bayes , Dinâmica não LinearResumo
The aim of this study was to assess the goodness of fit for nonlinear models, using the best model to describe body growth curves, comparing the parameters obtained for gender and one meat-type (Coturnix coturnix coturnix) and two laying (Coturnix coturnix japonica) quail strains, as well as nesting via MCMC (Markov chain Monte Carlo processes) methods under a Bayesian approach. A total of 1,350 one-day-old mixed quail were used: 400 of meat-type, 450 of yellow laying, and 500 of red laying strains distributed in a completely randomized design with three treatments (each treatment corresponded to one strain) and five replications. The experimental period consisted of 1 to 42 days of age. At 21 days of age, quail sexing was performed by means of sexual dimorphism, being individually identified at one day of age with numbered rings, allowing determining growth curves by gender. Birds were reared in a conventional system, fed ad libitum with diets formulated to meet nutritional requirements. Body weight was determined weekly and assessed using nonlinear models: Logistic, Brody, Von Bertalanffy, and Gompertz, whose parameters were estimated under a Bayesian approach via MCMC algorithm by means of BRugs package from the software R. DIC (Deviance Information Criterion) criterion was used to select the best nonlinear model, i.e. the lower the DIC value is, the better the model goodness of fit to thedata. Gompertz model was better adjusted to the data regardless the gender or strain. Meat-type quailhad the highest asymptotic weights and the highest age at which growth rate was maximum, followedby red and yellow strains. All nestings presented significant differences (p < 0.05) between gender forcontrasted parameters. Meat-type, yellow, and red females presented values significantly (p < 0.05)higher for asymptotic weight (370, 203, and 215 g, respectively) when compared to males (274, 131,and 143 g, respectively), which were earlier in body growth.(AU)
O objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade de ajuste dos modelos não lineares aos dados, utilizando o melhor modelo para descrever as curvas de crescimento corporal, comparando os parâmetros obtidos para gênero e uma linhagem de codornas de corte (Coturnix coturnix coturnix) e duas de postura (Coturnix coturnix japonica), bem como o aninhamento, via método MCMC (Cadeias de Markov em processos de Monte Carlo), sob o enfoque Bayesiano. Foram utilizadas 1.350 codornas mistas, com um dia de idade, sendo: 400 da linhagem de corte, 450 de postura amarela e 500 de postura vermelha, distribuídas por um delineamento inteiramente casualizado, com três tratamentos (cada tratamento corresponde a uma linhagem) e cinco repetições. O período experimental foi de 1 a 42 dias de idade. Aos 21 dias de idade foi realizada a sexagem por dimorfismo sexual, sendo que elas foram identificadas individualmente com um dia com anilhas numeradas, possibilitando a determinação das curvas de crescimento por gênero. As aves foram criadas em um sistema convencional, alimentadas ad libitum com rações formuladas para atender às exigências nutricionais. O peso corporal foi determinado semanalmente e avaliados por meio dos modelos não lineares: Logístico, Brody, Von Bertalanffy e Gompertz. Para a seleção domelhor modelo não linear utilizou-se o critério DIC (Deviance Information Criterion), em que quantomenor o valor de DIC, melhor é a qualidade do ajuste do modelo aos dados. Gompertz melhor se ajustouaos dados, independentemente do gênero ou linhagem. As codornas de corte tiveram os maiores pesosassintóticos e a maior idade em que a taxa de crescimento é máxima, seguido pela vermelha e amarela.Todos aninhamentos apresentaram diferenças significativas (p < 0,05) entre gênero para os parâmetroscontrastados. As fêmeas de corte, amarela e vermelha apresentaram valores significativamente (p <0,05) maiores para o peso assintótico (370, 203 e 215 g, respectivamente), comparados aos...(AU)
Assuntos
Animais , Coturnix/crescimento & desenvolvimento , Teorema de Bayes , Dinâmica não LinearResumo
Para se estabelecer um modelo para a produção diária de ovos de 308, 374 e 378 codornas de postura, respectivamente, das distintas linhagens L1, L2 e L3, avaliou-se, em um período de 90 dias de produção inicial, a utilização de três modelos distintos, em uma abordagem Bayesiana. Observou-se que um modelo do tipo log-linear condicional não é adequado para ajustar os dados para nenhuma das três linhagens analisadas. Alternativamente, que os dados podem ser ajustados de forma mais adequada quando se utiliza um modelo de efeitos aleatórios com função de ligação logística, considerando-se que θij é a probabilidade de postura da ave i no dia tj, na forma θij = exp(αi + βitj)/[1 + exp(αi + βitj)], em que os parâmetros α e βrepresentam, respectivamente, o início da postura e a evolução da postura da ave. Considerando-se os efeitos de dois níveis de eclosão e de dieta no modelo, observou-se que as mesmas não apresentaram ser significantes. Por meio de contrastes Bayesianos, verificaram-se diferenças significativas entre linhagens em favor de L1, considerando-se os parâmetros das curvas de probabilidade de postura média. A superioridade da linhagem L1 deve-se ao início precoce da postura e à maior persistência média de produção.(AU)
In order to establish a model for the daily egg production of 308, 374 and 378 laying quails from strains L1, L2 and L3, respectively, this study evaluated, during a 90-day period of initial production, the use of three distinct models in a Bayesian approach. It was observed that a model of the conditional log-linear type is not appropriate to adjust the data for any of the three analyzed strains. Alternatively, that data can be adjusted more adequately using a random effects model with a logistic linking function, considering that θij is the laying probability of the bird i in tj days, as θij = exp(αi + βitj)/[1 + exp(αi + βitj)], in which the parameters α and β represent, respectively, the beginning of the laying and the quails laying evolution. Considering the effects of two levels of hatching and of diet, it was observed that they were not significant. Through Bayesian contrast, significant differences between strains in favor of L1 were noticed, considering the parameters of laying average probability curves. The superiority of line L1 is due to the precocious beginning of the laying and the higher average persistence in the production. (AU)
Assuntos
Animais , Coturnix , Indústria Agropecuária/métodos , Melhoramento Genético , Aves/crescimento & desenvolvimento , ProbabilidadeResumo
Para se estabelecer um modelo para a produção diária de ovos de 308, 374 e 378 codornas de postura, respectivamente, das distintas linhagens L1, L2 e L3, avaliou-se, em um período de 90 dias de produção inicial, a utilização de três modelos distintos, em uma abordagem Bayesiana. Observou-se que um modelo do tipo log-linear condicional não é adequado para ajustar os dados para nenhuma das três linhagens analisadas. Alternativamente, que os dados podem ser ajustados de forma mais adequada quando se utiliza um modelo de efeitos aleatórios com função de ligação logística, considerando-se que θij é a probabilidade de postura da ave i no dia tj, na forma θij = exp(αi + βitj)/[1 + exp(αi + βitj)], em que os parâmetros α e βrepresentam, respectivamente, o início da postura e a evolução da postura da ave. Considerando-se os efeitos de dois níveis de eclosão e de dieta no modelo, observou-se que as mesmas não apresentaram ser significantes. Por meio de contrastes Bayesianos, verificaram-se diferenças significativas entre linhagens em favor de L1, considerando-se os parâmetros das curvas de probabilidade de postura média. A superioridade da linhagem L1 deve-se ao início precoce da postura e à maior persistência média de produção.
In order to establish a model for the daily egg production of 308, 374 and 378 laying quails from strains L1, L2 and L3, respectively, this study evaluated, during a 90-day period of initial production, the use of three distinct models in a Bayesian approach. It was observed that a model of the conditional log-linear type is not appropriate to adjust the data for any of the three analyzed strains. Alternatively, that data can be adjusted more adequately using a random effects model with a logistic linking function, considering that θij is the laying probability of the bird i in tj days, as θij = exp(αi + βitj)/[1 + exp(αi + βitj)], in which the parameters α and β represent, respectively, the beginning of the laying and the quails laying evolution. Considering the effects of two levels of hatching and of diet, it was observed that they were not significant. Through Bayesian contrast, significant differences between strains in favor of L1 were noticed, considering the parameters of laying average probability curves. The superiority of line L1 is due to the precocious beginning of the laying and the higher average persistence in the production.
Assuntos
Animais , Coturnix , Indústria Agropecuária/métodos , Melhoramento Genético , Aves/crescimento & desenvolvimento , ProbabilidadeResumo
The aim of this study was to assess the goodness of fit for nonlinear models, using the best model to describe body growth curves, comparing the parameters obtained for gender and one meat-type (Coturnix coturnix coturnix) and two laying (Coturnix coturnix japonica) quail strains, as well as nesting via MCMC (Markov chain Monte Carlo processes) methods under a Bayesian approach. A total of 1,350 one-day-old mixed quail were used: 400 of meat-type, 450 of yellow laying, and 500 of red laying strains distributed in a completely randomized design with three treatments (each treatment corresponded to one strain) and five replications. The experimental period consisted of 1 to 42 days of age. At 21 days of age, quail sexing was performed by means of sexual dimorphism, being individually identified at one day of age with numbered rings, allowing determining growth curves by gender. Birds were reared in a conventional system, fed ad libitum with diets formulated to meet nutritional requirements. Body weight was determined weekly and assessed using nonlinear models: Logistic, Brody, Von Bertalanffy, and Gompertz, whose parameters were estimated under a Bayesian approach via MCMC algorithm by means of BRugs package from the software R. DIC (Deviance Information Criterion) criterion was used to select the best nonlinear model, i.e. the lower the DIC value is, the better the model goodnes
O objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade de ajuste dos modelos não lineares aos dados, utilizando o melhor modelo para descrever as curvas de crescimento corporal, comparando os parâmetros obtidos para gênero e uma linhagem de codornas de corte (Coturnix coturnix coturnix) e duas de postura (Coturnix coturnix japonica), bem como o aninhamento, via método MCMC (Cadeias de Markov em processos de Monte Carlo), sob o enfoque Bayesiano. Foram utilizadas 1.350 codornas mistas, com um dia de idade, sendo: 400 da linhagem de corte, 450 de postura amarela e 500 de postura vermelha, distribuídas por um delineamento inteiramente casualizado, com três tratamentos (cada tratamento corresponde a uma linhagem) e cinco repetições. O período experimental foi de 1 a 42 dias de idade. Aos 21 dias de idade foi realizada a sexagem por dimorfismo sexual, sendo que elas foram identificadas individualmente com um dia com anilhas numeradas, possibilitando a determinação das curvas de crescimento por gênero. As aves foram criadas em um sistema convencional, alimentadas ad libitum com rações formuladas para atender às exigências nutricionais. O peso corporal foi determinado semanalmente e avaliados por meio dos modelos não lineares: Logístico, Brody, Von Bertalanffy e Gompertz, cujos parâmetros foram estimados sob enfoque Bayesiano via algoritmo MCMC, utilizando o pacote BRugs do programa R. Par
Resumo
The aim of this study was to assess the goodness of fit for nonlinear models, using the best model to describe body growth curves, comparing the parameters obtained for gender and one meat-type (Coturnix coturnix coturnix) and two laying (Coturnix coturnix japonica) quail strains, as well as nesting via MCMC (Markov chain Monte Carlo processes) methods under a Bayesian approach. A total of 1,350 one-day-old mixed quail were used: 400 of meat-type, 450 of yellow laying, and 500 of red laying strains distributed in a completely randomized design with three treatments (each treatment corresponded to one strain) and five replications. The experimental period consisted of 1 to 42 days of age. At 21 days of age, quail sexing was performed by means of sexual dimorphism, being individually identified at one day of age with numbered rings, allowing determining growth curves by gender. Birds were reared in a conventional system, fed ad libitum with diets formulated to meet nutritional requirements. Body weight was determined weekly and assessed using nonlinear models: Logistic, Brody, Von Bertalanffy, and Gompertz, whose parameters were estimated under a Bayesian approach via MCMC algorithm by means of BRugs package from the software R. DIC (Deviance Information Criterion) criterion was used to select the best nonlinear model, i.e. the lower the DIC value is, the better the model goodnes
O objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade de ajuste dos modelos não lineares aos dados, utilizando o melhor modelo para descrever as curvas de crescimento corporal, comparando os parâmetros obtidos para gênero e uma linhagem de codornas de corte (Coturnix coturnix coturnix) e duas de postura (Coturnix coturnix japonica), bem como o aninhamento, via método MCMC (Cadeias de Markov em processos de Monte Carlo), sob o enfoque Bayesiano. Foram utilizadas 1.350 codornas mistas, com um dia de idade, sendo: 400 da linhagem de corte, 450 de postura amarela e 500 de postura vermelha, distribuídas por um delineamento inteiramente casualizado, com três tratamentos (cada tratamento corresponde a uma linhagem) e cinco repetições. O período experimental foi de 1 a 42 dias de idade. Aos 21 dias de idade foi realizada a sexagem por dimorfismo sexual, sendo que elas foram identificadas individualmente com um dia com anilhas numeradas, possibilitando a determinação das curvas de crescimento por gênero. As aves foram criadas em um sistema convencional, alimentadas ad libitum com rações formuladas para atender às exigências nutricionais. O peso corporal foi determinado semanalmente e avaliados por meio dos modelos não lineares: Logístico, Brody, Von Bertalanffy e Gompertz, cujos parâmetros foram estimados sob enfoque Bayesiano via algoritmo MCMC, utilizando o pacote BRugs do programa R. Par