Perspectives and challenges on isotopic ecology of terrestrial birds in Brazil

Although stable isotopes have been increasingly used in ornithology since 1980 in many places, Brazil has been slow in adopting this methodology, especially when it comes to terrestrial birds. The most common elements in bird ecology studies are carbon, nitrogen, hydrogen, and oxygen stable isotopes, which provide information on diet, trophic interactions, habitat use, migration, geographic patterns, and physiology. It is important that Brazilian ornithologists become aware of the potential of stable isotope analysis in ecological studies, and the shortcomings of this tool. The use of stable isotopes to study bird ecology has great potential in Brazil, since many ecological questions about Neotropical birds can be addressed by it (e.g., resource and habitat use, migratory routes, isotopic niches, anthropogenic impacts, individual specialization). Brazilian museums and other Natural History collections can provide samples to study long-term temporal dynamics in bird ecology. Additionally, the integration of avian tissue sample information into a database may increase the collaboration among researchers and promote sample reuse in a variety of studies. All biomes in Brazil have been under pressure from anthropogenic impacts (e.g., land-use change, habitat loss, fragmentation, intensive agriculture), affecting several taxa, including terrestrial birds. Considering the negative effects of human expansion over natural areas and that stable isotopes provide useful ecological information, ornithologists in Brazil should increase their use of this tool in the future.(AU)

Behavioral aspects of waterbirds / Aspectos comportamentais de aves aquáticas

Estuaries are used by waterbirds as foraging, resting and nesting sites, serving also as shelter for migratory birds. The dynamics of this avifauna in an aquatic environment may be associated with the differences of time of day, tide height, temperature, wind speed and use of the site by different species. This study had the objective of evaluating behavioral aspects of aquatic birds, relating the influence of environmental variables with their activities. Bird counts were performed at the mouth of two important rivers of the state of Santa Catarina, Brazil, during two-hour intervals throughout the day in monthly samplings between June (2015) and May (2016). A total of 44 species were recorded, ten of which were migratory. The most recorded behaviors were foraging and resting. The Kruskal-Wallis analysis indicated no significant difference in behavior between the sampling intervals. The Bray-Curtis similarity test resulted in three groups: 1) - species that foraged most of the time; 2) - species that rested most of the time; and 3) - same time in both activities. The Indicator Species Analysis showed that 17 species were associated with only one microhabitat and 15 species with more than one. The Canonical Correlation Analysis indicated that only tide height, temperature and rainfall variables were correlated with the behaviors performed and only the resting activity was positively correlated with all variables. This may be associated with thermoregulation and the ability of some species to stay in midlitoral at high tide. The results demonstrate that different waterbird species used the studied areas in different ways. Thus, the heterogeneity of microhabitats in an aquatic environment of extreme importance for the coexistence and maintenance of the diversity of waterbirds.(AU)

Estuários são utilizados por aves aquáticas como locais de forrageio, descanso e nidificação, servindo, também, como pontos de parada para aves migratórias. A dinâmica dessa avifauna em um ambiente pode estar associada a diferenças entre horários do dia, altura da maré, temperatura, velocidade do vento e uso do local. Esse trabalho teve o objetivo de avaliar aspectos comportamentais de aves aquáticas, relacionando a influência de variáveis ambientais com suas atividades. Amostragens mensais foram realizadas na foz de dois importantes rios do Estado de Santa Catarina, Brasil, entre junho de 2015 e maio de 2016, em intervalos de duas horas no decorrer do dia. Um total de 44 espécies foram registradas, dez das quais foram migratórias. Os comportamentos mais observados foram forrageio e descanso. A análise de Kruskall-Wallis não indicou diferenças significativas no comportamento entre os horários de amostragem. O teste de similaridade Bray-Curtis resultou em três agrupamentos: 1) - espécies que forragearam na maior parte do tempo; 2) - espécies que descansaram na maior parte do tempo; e 3) - mesma quantidade de tempo em ambas atividades. A Análise de Espécies Indicadoras mostrou que 17 espécies estiveram associadas com apenas um microhabitat e 15 espécies com mais de um. A Análise de Correlação Canônica indicou que apenas as variáveis maré, temperatura e precipitação foram significativamente correlacionadas com os comportamentos demonstrados e apenas a atividade de descanso foi positivamente correlacionada com as todas as variáveis. Isso pode estar associado com a termorregulação e com a habilidade de algumas espécies de permanecer no mediolitoral durante a maré cheia. Os resultados demonstram que diferentes espécies de aves aquáticas utilizaram as áreas estudadas de diferentes maneiras. Assim, a heterogeneidade de microhabitats em um ambiente aquático é de extrema importância para a coexistência e a manutenção da diversidade de aves.(AU)

Behavioral aspects of waterbirds

Abstract Estuaries are used by waterbirds as foraging, resting and nesting sites, serving also as shelter for migratory birds. The dynamics of this avifauna in an aquatic environment may be associated with the differences of time of day, tide height, temperature, wind speed and use of the site by different species. This study had the objective of evaluating behavioral aspects of aquatic birds, relating the influence of environmental variables with their activities. Bird counts were performed at the mouth of two important rivers of the state of Santa Catarina, Brazil, during two-hour intervals throughout the day in monthly samplings between June (2015) and May (2016). A total of 44 species were recorded, ten of which were migratory. The most recorded behaviors were foraging and resting. The Kruskal-Wallis analysis indicated no significant difference in behavior between the sampling intervals. The Bray-Curtis similarity test resulted in three groups: 1) - species that foraged most of the time; 2) - species that rested most of the time; and 3) - same time in both activities. The Indicator Species Analysis showed that 17 species were associated with only one microhabitat and 15 species with more than one. The Canonical Correlation Analysis indicated that only tide height, temperature and rainfall variables were correlated with the behaviors performed and only the resting activity was positively correlated with all variables. This may be associated with thermoregulation and the ability of some species to stay in midlitoral at high tide. The results demonstrate that different waterbird species used the studied areas in different ways. Thus, the heterogeneity of microhabitats in an aquatic environment of extreme importance for the coexistence and maintenance of the diversity of waterbirds.

Resumo Estuários são utilizados por aves aquáticas como locais de forrageio, descanso e nidificação, servindo, também, como pontos de parada para aves migratórias. A dinâmica dessa avifauna em um ambiente pode estar associada a diferenças entre horários do dia, altura da maré, temperatura, velocidade do vento e uso do local. Esse trabalho teve o objetivo de avaliar aspectos comportamentais de aves aquáticas, relacionando a influência de variáveis ambientais com suas atividades. Amostragens mensais foram realizadas na foz de dois importantes rios do Estado de Santa Catarina, Brasil, entre junho de 2015 e maio de 2016, em intervalos de duas horas no decorrer do dia. Um total de 44 espécies foram registradas, dez das quais foram migratórias. Os comportamentos mais observados foram forrageio e descanso. A análise de Kruskall-Wallis não indicou diferenças significativas no comportamento entre os horários de amostragem. O teste de similaridade Bray-Curtis resultou em três agrupamentos: 1) - espécies que forragearam na maior parte do tempo; 2) - espécies que descansaram na maior parte do tempo; e 3) - mesma quantidade de tempo em ambas atividades. A Análise de Espécies Indicadoras mostrou que 17 espécies estiveram associadas com apenas um microhabitat e 15 espécies com mais de um. A Análise de Correlação Canônica indicou que apenas as variáveis maré, temperatura e precipitação foram significativamente correlacionadas com os comportamentos demonstrados e apenas a atividade de descanso foi positivamente correlacionada com as todas as variáveis. Isso pode estar associado com a termorregulação e com a habilidade de algumas espécies de permanecer no mediolitoral durante a maré cheia. Os resultados demonstram que diferentes espécies de aves aquáticas utilizaram as áreas estudadas de diferentes maneiras. Assim, a heterogeneidade de microhabitats em um ambiente aquático é de extrema importância para a coexistência e a manutenção da diversidade de aves.

Occurrence of endo and hemoparasites in Sporophila caerulescens captured in the eastern region of the state of Acre, Brazil / Ocorrência de endo e hemoparasitos em Sporophila caerulescens capturados na região leste do estado do Acre, Brasil

Wild animals are hosts and reservoirs to many infectious agents, often unknown to the Scientific Community, which leads to serious health implications for natural and domestic environments. We conducted this research with the objective of diagnosing the occurrence of parasites of medical and veterinary interest in “coleirinhos” captured in the eastern region of the state of Acre, Brazil. We captured the specimens in August and September of 2017 using ornithological nets at the margins of Caeté river. We visually inspected the birds to evaluate the ectoparasites. Subsequently, we collected blood through a brachial vein puncture and rested the individuals in a cloth bag for 30 minutes to collect feces, after which we released them. Results of the visual inspection to detect and identify the ectoparasites were negative. Blood samples revealed the protozoan Haemoproteus sp., and the feces revealed cysts of Entamoeba histolytica and E. coli, oocysts of coccidia and eggs of Davaineidae. Coccidia was the most prevalent (69.2%) and abundant (34.15%) parasite reported. Parasites diagnosed in this study can promote the emergence of secondary infections in S. caerulescens individuals or other animals that are contaminated with these etiological agents, since, when migrating through different biomes of South America, other animal species can come into contact with these agents.(AU)

Os animais silvestres são hospedeiros e reservatórios de vários agentes infecciosos, muitas vezes desconhecidos para a comunidade científica, o que leva a sérias implicações na saúde dos ambientes naturais e domésticos. Esta pesquisa teve como objetivo diagnosticar a ocorrência de parasitos de interesse médico e veterinário em “coleirinhos” capturados no leste do Estado do Acre, Brasil. Os espécimes foram capturados nos meses de agosto e setembro de 2017 em redes ornitológicas as margens do Rio Caeté. Para a pesquisa de ectoparasitos, as aves foram inspecionadas visualmente. Após a inspeção, o sangue foi coletado por meio de punção da veia braquial e para coletas das fezes os indivíduos foram postos em descanso em saco de pano por 30min e depois foram soltos na natureza. As fezes, quando presentes, foram coletadas e acondicionadas em recipientes de plástico estéreis. A inspeção visual dos espécimes para detectar e identificar ectoparasitos resultou negativo. Nas amostras sanguíneas foi identificado o protozoário Haemoproteus sp.. Nas fezes foram encontrados os seguintes endoparasitos: cisto de Entamoeba histolytica e E. coli, oocisto de coccídeos e ovos de Davaineidae. Coccideos foram os endoparasitos mais prevalentes (69,2%) e os mais abundantes (34,15%). Os parasitos diagnosticados neste estudo podem propiciar o aparecimento de infecções secundárias nos indivíduos de S. caerulescens ou em outros animais que venham se contaminar com esses agentes etiológicos, pois com a migração dos mesmos, por diferentes biomas da América do Sul outras espécies de animais podem se infectar com esses agentes.(AU)

Behavioral aspects of waterbirds

Abstract Estuaries are used by waterbirds as foraging, resting and nesting sites, serving also as shelter for migratory birds. The dynamics of this avifauna in an aquatic environment may be associated with the differences of time of day, tide height, temperature, wind speed and use of the site by different species. This study had the objective of evaluating behavioral aspects of aquatic birds, relating the influence of environmental variables with their activities. Bird counts were performed at the mouth of two important rivers of the state of Santa Catarina, Brazil, during two-hour intervals throughout the day in monthly samplings between June (2015) and May (2016). A total of 44 species were recorded, ten of which were migratory. The most recorded behaviors were foraging and resting. The Kruskal-Wallis analysis indicated no significant difference in behavior between the sampling intervals. The Bray-Curtis similarity test resulted in three groups: 1) - species that foraged most of the time; 2) - species that rested most of the time; and 3) - same time in both activities. The Indicator Species Analysis showed that 17 species were associated with only one microhabitat and 15 species with more than one. The Canonical Correlation Analysis indicated that only tide height, temperature and rainfall variables were correlated with the behaviors performed and only the resting activity was positively correlated with all variables. This may be associated with thermoregulation and the ability of some species to stay in midlitoral at high tide. The results demonstrate that different waterbird species used the studied areas in different ways. Thus, the heterogeneity of microhabitats in an aquatic environment of extreme importance for the coexistence and maintenance of the diversity of waterbirds.

Resumo Estuários são utilizados por aves aquáticas como locais de forrageio, descanso e nidificação, servindo, também, como pontos de parada para aves migratórias. A dinâmica dessa avifauna em um ambiente pode estar associada a diferenças entre horários do dia, altura da maré, temperatura, velocidade do vento e uso do local. Esse trabalho teve o objetivo de avaliar aspectos comportamentais de aves aquáticas, relacionando a influência de variáveis ambientais com suas atividades. Amostragens mensais foram realizadas na foz de dois importantes rios do Estado de Santa Catarina, Brasil, entre junho de 2015 e maio de 2016, em intervalos de duas horas no decorrer do dia. Um total de 44 espécies foram registradas, dez das quais foram migratórias. Os comportamentos mais observados foram forrageio e descanso. A análise de Kruskall-Wallis não indicou diferenças significativas no comportamento entre os horários de amostragem. O teste de similaridade Bray-Curtis resultou em três agrupamentos: 1) - espécies que forragearam na maior parte do tempo; 2) - espécies que descansaram na maior parte do tempo; e 3) - mesma quantidade de tempo em ambas atividades. A Análise de Espécies Indicadoras mostrou que 17 espécies estiveram associadas com apenas um microhabitat e 15 espécies com mais de um. A Análise de Correlação Canônica indicou que apenas as variáveis maré, temperatura e precipitação foram significativamente correlacionadas com os comportamentos demonstrados e apenas a atividade de descanso foi positivamente correlacionada com as todas as variáveis. Isso pode estar associado com a termorregulação e com a habilidade de algumas espécies de permanecer no mediolitoral durante a maré cheia. Os resultados demonstram que diferentes espécies de aves aquáticas utilizaram as áreas estudadas de diferentes maneiras. Assim, a heterogeneidade de microhabitats em um ambiente aquático é de extrema importância para a coexistência e a manutenção da diversidade de aves.

Molecular characterization of vanA-containing Enterococcus from migratory birds: song thrush (Turdus philomelos)

Vancomycin-resistant enterococci (VRE) were detected in two faecal samples (1.3%) of song thrush in Portugal. vanA isolates showed high level vancomycin/teicoplanin resistance, as well as resistance to ciprofloxacin, quinupristin-dalfopristin and cloranfenicol. Thrush can be a reservoir of VRE and transmit these resistant bacteria to other animals including humans.

Investigação de vírus de impacto na sanidade avícola em aves silvestres no Rio Grande do Sul

O Brasil é o segundo produtor mundial de carne de frango, com produção de 13,14 milhões de toneladas em 2015, sendo em torno de 4 milhões de toneladas destinadas à exportação. Aves silvestres de vida livre, devido as suas características biológicas, são capazes de carrear microrganismos patogênicos de forma biológica ou mecânica, podendo atuar como disseminadores de diferentes enfermidades na produção industrial, comercial ou doméstica de aves. O objetivo deste estudo é investigar a exposição aos vírus da Doença de Newcastle (NDV), Doença de Marek e Doença Infecciosa da Bolsa de Fabrício (IBDV) em aves silvestres residentes próximo a uma criação de aves coloniais, e em aves migratórias (Calidris fuscicollis e Thalassarche melanophris) que ocorrem no litoral do Rio Grande do Sul. A metodologia empregada foi a detecção de material genético viral por RT-PCR e PCR em suabes de orofaringe e cloaca, e pesquisa de anticorpos por ELISA em amostras de soro e sangue total colhido em papel filtro. Não foi detectada a presença de NDV e vírus da Doença de Marek por métodos moleculares nas aves silvestres pesquisadas (n=24), nem anticorpos contra NDV e IBDV nos ensaios imunoenzimáticos (n=30). Todas as amostras de soro de Calidris fuscicollis testadas (n=58) mostraram resultados negativos para anticorpos contra NDV e IBDV. No entanto, 50% (4/8) apresentaram positividade para anticorpos contra vírus da Doença de Marek. Em Thalassarche melanophris, 100% das amostras foram negativas para IBVD e positivas para o vírus da Doença de Marek. Os resultados obtidos reforçam a importância da vigilância contínua dos vírus potencialmente patogênicos aos plantéis avícolas através do monitoramento de aves migratórias, dada a importante posição do Brasil no mercado produtor e exportador de frangos de corte.

Brazil is the second largest producer of chicken meat, with a 13.14 millions of tons production in 2015 and, about 4 millions of tons were for export. Wild birds, of free life, due to its biological characteristics are capable of carrying pathogenic microorganisms both biologically or mechanically, may thus act as disseminators of several different diseases in industrial, commercial and even domestic poultry production. This study aims at investigating the exposure to Newcastle Disease Virus (NDV), Mareks Disease and Infectious Bursal Disease (IBDV) in wild birds living near a colonial poultry breeding and, in migratory birds (Calidris fuscicollis and Thalassarche melanophris) that are present on the coast of Rio Grande do Sul. The methodology used was the viral genetic material detection using RT-PCR and PCR in cloacal and oropharynx swabs and, ELISA serology in total blood samples collected in filter paper. It was not detected the presence of NDV or Mareks Disease Virus by molecular methods in the wild birds investigated (n=24), NDV and IBDV antibodies were also not detect in immunoenzymatic assays (n=30). All serum samples of Calidris fuscicollis tested (n=58) were negative for NDV and IBDV antibodies. However, 50% (4/8) presented positive results for Mareks Disease virus antibodies. In Thalassarche melanophris, 100% of the samples returned negative for IBDV and positive for Mareks Disease Virus. The findings reinforce the importance of continuous surveillance of viruses potentially pathogenic to poultry breeding flock by monitoring migratory birds, especially considering the important position Brazil has in chicken meat production and export market.

Vírus da influenza aviária: monitoramento em aves de subsistência criadas no entorno de sítios de aves migratórias no Brasil

A influenza aviária é uma enfermidade viral causada por vírus influenza A que acomete várias espécies de aves. No Brasil, a influenza aviária é considerada uma doença exótica, uma vez que os subtipos H5 e H7 nunca foram detectados. O Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento realiza vigilância permanente para esta enfermidade nos plantéis comerciais de produção avícola e também em aves de subsistência criadas no entorno de sítios de aves migratórias com o intuito de detectar precocemente a introdução dos subtipos H5 e H7 no país. No entanto, se desconhece a situação sanitária das aves de subsistência no que se refere à infecção por outros subtipos do vírus da influenza aviária. Considerando a importância deste tipo de criação como fonte de alimentos e de rendimentos em comunidades de baixa renda e o risco que provavelmente representa para a introdução da influenza aviária no Brasil, o objetivo deste trabalho foi monitorar as criações de aves de subsistência criadas no entorno de sítios de aves migratórias no período de 2011 a 2015, a fim de verificar a circulação de todos os subtipos do vírus da influenza aviária (AIV). Foram colhidas amostras de soro e suabes de traqueia e cloaca de 2816 aves criadas em onze diferentes sítios de aves migratórias localizados em sete estados brasileiros, totalizando 391 explorações de fundo de quintal amostradas. As amostras de soro (n = 2716) foram submetidas a triagem para pesquisa de anticorpos para a proteína NP do influenza A utilizando-se um kit comercial de ELISA competitivo, com posterior subtipificação das amostras positivas pela técnica de inibição da hemaglutinação para os dezesseis subtipos do vírus influenza A. Os suabes de cloaca e traqueia foram submetidos à prova de PCR em tempo real para detecção do RNA do vírus influenza A. Não foram detectados anticorpos para os subtipos H5 e H7 do AIV, mas anticorpos para os subtipos H1, H3, H4, H6, H8, H9, H10, H12, H13 e H16 foram identificados em aves oriundas de nove dos onze sítios. O RNA do AIV foi detectado em apenas três amostras pertencentes a uma mesma propriedade e nenhum vírus hemaglutinante foi isolado a partir deste material. Os resultados obtidos permitem concluir que os vírus de influenza aviária de baixa patogenicidade circulam em aves de subsistência criadas no entorno de sítios de aves migratórias no Brasil e alertam para a importância da ampliação da vigilância ativa nesta população.

Avian influenza is a viral disease caused by an influenza A virus and affects various avian species. Avian influenza is considered an exotic disease in Brazil, since H5 and H7 notifiable subtypes have never been detected. The Ministry of Agriculture, Livestock and Food Supply carries out permanent surveillance for avian influenza in commercial poultry production flocks and also in backyard poultry raised in the vicinity of concentration areas of migratory birds with the purpose of detecting the early introduction of H5 and H7 subtypes in the country. However, the health status of backyard poultry in relation to infection by other avian influenza subtypes is unknown. Considering the importance of this kind of family production system as a source of food and revenue for low-income communities and the risk it probably represents for the introduction of avian influenza in Brazil, the aim of this work was monitoring backyard poultry raised in the vicinity of concentration areas of migratory birds from 2011 to 2015 to verify the circulation of all avian influenza virus (AIV) subtypes. Serum samples and cloacal and tracheal swabs were sampled from 2816 birds raised in eleven migratory birds concentration areas located in seven Brazilian states, totaling 391 backyard poultry flocks harvested. Serum samples (n = 2716) were screened using a commercial competitive ELISA kit to detect specific antibodies for the NP protein of the influenza A virus and afterwards the positive samples were subtyped through inhibition hemagglutination assay for the sixteen subtypes of influenza A viruses. Cloacal and tracheal swabs were tested by real-time PCR for detection of the influenza A virus RNA. No antibodies for H5 and H7 subtypes were detected, but antibodies for subtypes H1, H3, H4, H6, H8, H9, H10, H12, H13 e H16 have been identified in birds from nine out of eleven areas. The influenza A vírus RNA was detected only in three samples from one flock and no hemagglutinating viruses were isolated from these specimens. Results obtained in this work suggest that low pathogenic avian influenza viruses are circulating in backyard poultry flocks raised in concentration areas of migratory birds in Brazil and alert to the importance of the expansion of active surveillance in this population.