Impact of alien fishes on the distribution pattern of indigenous freshwater fishes of Punjab, Pakistan / Impacto de peixes invasores no padrão de distribuição de peixes de água doce em Punjab, Paquistão

Pakistan is the country with mega freshwater fish diversity of native and alien species. In the presence of enormous native fishes varies species of exotic fishes have been introduced into the freshwater bodies of Pakistan which are competing with native freshwater fish fauna and making them deprive of food and habitat as well. Intentional or accidental introductions of animals, plants and pathogens away from their native niche is considered as major leading problem for biodiversity of invaded habitat. Three years study (from January 2017 to December 2019) was conducted in freshwater bodies of Province Punjab, Pakistan. Study was designed to know exotic species impacts on the distribution of native species of fishes. During current survey a total of 68 (indigenous and exotic) fish species belonging to 14 families were recorded from head Qadirabad, head Baloki, Islam headworks and Rasul barrage. Statistical analysis showed that Shannon-Wiener diversity index was the highest (1.41) at both Rasul barrage and Islam headworks but, invasive species were present in very less number in these study sites i.e. Oreochromis mozambicus, O. niloticus, Hypophthalmichthys nobilis, Carassius auratus, Ctenophryngdon idella, Cyprinus carpio and H. molitrix. The diversity index showed that comparatively low diversity was present in both area head Qadirabad (1.30) and head Baloki (1.4) due to high pressure of invasive species. Direct observation of species and statistical analysis showed that aliens’ species produced negative impact on the local fish fauna diversity, evenness, and numbers. It is concluded that many factors are impacts on the diversity of native fishes, but alien (invasive) species also play a major role to reduction of native species, because aliens’ species produce competition for native species. So it is urgent need to analysis the aliens and native food web and roosting sites in Pakistan, in future.

O Paquistão é um país com ampla diversidade de espécies nativas e exóticas de peixes de água doce. Contudo, diversas espécies de peixes exóticos estão sendo introduzidas nos corpos de água doce paquistanês, as quais estão competindo com a fauna nativa de peixes, tornando-os privados de alimento e habitat. A introdução intencional ou acidental de animais, plantas e patógenos fora de seu nicho nativo é considerada o principal problema da biodiversidade do habitat recém-invadido. Assim, foi realizado um estudo de três anos, de janeiro de 2017 a dezembro de 2019, em corpos de água doce na província de Punjab, Paquistão. A pesquisa foi desenvolvida para conhecer os impactos de espécies exóticas na distribuição de espécies nativas de peixes. Durante a pesquisa, foi registrado um total de 68 espécies de peixes (nativas e exóticas), pertencentes a 14 famílias, nas nascentes dos rios Qadirabad, Baloki e Islam e na barragem de Rasul. A análise estatística mostrou que o índice de diversidade de Shannon-Wiener foi mais alto (1,41) na barragem Rasul (RB) e na nascente do rio Islam (IH); e que a maioria das espécies introduzidas estava presente em um número muito menor, isto é, Oreochromis mossambicus, Oreochromis niloticus, Hypophthalmichthys nobilis, Carassius auratus, Ctenopharyngodon idella, Cyprinus carpio e Hypophthalmichthy smolitrix nessa área de estudo. Por outro lado, o índice Shannon-Wiener mostrou que a diversidade estava baixa nas nascentes dos rios Qadirabad (1,30) e Baloki (1,4) em razão da alta pressão de espécies invasoras. A observação direta das espécies e a análise estatística indicaram que as espécies invasoras produziram impacto negativo na diversidade, uniformidade e números de peixes da fauna local. Conclui-se que muitos fatores impactam na diversidade de peixes nativos, mas as espécies exóticas (invasoras) também desempenham um papel importante na redução das espécies nativas, em razão da competição existente entre elas. Portanto, é [...].

Impact of alien fishes on the distribution pattern of indigenous freshwater fishes of Punjab, Pakistan

Abstract Pakistan is the country with mega freshwater fish diversity of native and alien species. In the presence of enormous native fishes varies species of exotic fishes have been introduced into the freshwater bodies of Pakistan which are competing with native freshwater fish fauna and making them deprive of food and habitat as well. Intentional or accidental introductions of animals, plants and pathogens away from their native niche is considered as major leading problem for biodiversity of invaded habitat. Three years study (from January 2017 to December 2019) was conducted in freshwater bodies of Province Punjab, Pakistan. Study was designed to know exotic species impacts on the distribution of native species of fishes. During current survey a total of 68 (indigenous and exotic) fish species belonging to 14 families were recorded from head Qadirabad, head Baloki, Islam headworks and Rasul barrage. Statistical analysis showed that Shannon-Wiener diversity index was the highest (1.41) at both Rasul barrage and Islam headworks but, invasive species were present in very less number in these study sites i.e. Oreochromis mozambicus, O. niloticus, Hypophthalmichthys nobilis, Carassius auratus, Ctenophryngdon idella, Cyprinus carpio and H. molitrix. The diversity index showed that comparatively low diversity was present in both area head Qadirabad (1.30) and head Baloki (1.4) due to high pressure of invasive species. Direct observation of species and statistical analysis showed that aliens species produced negative impact on the local fish fauna diversity, evenness, and numbers. It is concluded that many factors are impacts on the diversity of native fishes, but alien (invasive) species also play a major role to reduction of native species, because aliens species produce competition for native species. So it is urgent need to analysis the aliens and native food web and roosting sites in Pakistan, in future.

Resumo O Paquistão é um país com ampla diversidade de espécies nativas e exóticas de peixes de água doce. Contudo, diversas espécies de peixes exóticos estão sendo introduzidas nos corpos de água doce paquistanês, as quais estão competindo com a fauna nativa de peixes, tornando-os privados de alimento e habitat. A introdução intencional ou acidental de animais, plantas e patógenos fora de seu nicho nativo é considerada o principal problema da biodiversidade do habitat recém-invadido. Assim, foi realizado um estudo de três anos, de janeiro de 2017 a dezembro de 2019, em corpos de água doce na província de Punjab, Paquistão. A pesquisa foi desenvolvida para conhecer os impactos de espécies exóticas na distribuição de espécies nativas de peixes. Durante a pesquisa, foi registrado um total de 68 espécies de peixes (nativas e exóticas), pertencentes a 14 famílias, nas nascentes dos rios Qadirabad, Baloki e Islam e na barragem de Rasul. A análise estatística mostrou que o índice de diversidade de Shannon-Wiener foi mais alto (1,41) na barragem Rasul (RB) e na nascente do rio Islam (IH); e que a maioria das espécies introduzidas estava presente em um número muito menor, isto é, Oreochromis mossambicus, Oreochromis niloticus, Hypophthalmichthys nobilis, Carassius auratus, Ctenopharyngodon idella, Cyprinus carpio e Hypophthalmichthy smolitrix nessa área de estudo. Por outro lado, o índice Shannon-Wiener mostrou que a diversidade estava baixa nas nascentes dos rios Qadirabad (1,30) e Baloki (1,4) em razão da alta pressão de espécies invasoras. A observação direta das espécies e a análise estatística indicaram que as espécies invasoras produziram impacto negativo na diversidade, uniformidade e números de peixes da fauna local. Conclui-se que muitos fatores impactam na diversidade de peixes nativos, mas as espécies exóticas (invasoras) também desempenham um papel importante na redução das espécies nativas, em razão da competição existente entre elas. Portanto, é urgente uma análise futura das espécies invasoras e da teia alimentar nativa no Paquistão..

Impact of alien fishes on the distribution pattern of indigenous freshwater fishes of Punjab, Pakistan / Impacto de peixes invasores no padrão de distribuição de peixes de água doce em Punjab, Paquistão

Pakistan is the country with mega freshwater fish diversity of native and alien species. In the presence of enormous native fishes varies species of exotic fishes have been introduced into the freshwater bodies of Pakistan which are competing with native freshwater fish fauna and making them deprive of food and habitat as well. Intentional or accidental introductions of animals, plants and pathogens away from their native niche is considered as major leading problem for biodiversity of invaded habitat. Three years study (from January 2017 to December 2019) was conducted in freshwater bodies of Province Punjab, Pakistan. Study was designed to know exotic species impacts on the distribution of native species of fishes. During current survey a total of 68 (indigenous and exotic) fish species belonging to 14 families were recorded from head Qadirabad, head Baloki, Islam headworks and Rasul barrage. Statistical analysis showed that Shannon-Wiener diversity index was the highest (1.41) at both Rasul barrage and Islam headworks but, invasive species were present in very less number in these study sites i.e. Oreochromis mozambicus, O. niloticus, Hypophthalmichthys nobilis, Carassius auratus, Ctenophryngdon idella, Cyprinus carpio and H. molitrix. The diversity index showed that comparatively low diversity was present in both area head Qadirabad (1.30) and head Baloki (1.4) due to high pressure of invasive species. Direct observation of species and statistical analysis showed that aliens' species produced negative impact on the local fish fauna diversity, evenness, and numbers. It is concluded that many factors are impacts on the diversity of native fishes, but alien (invasive) species also play a major role to reduction of native species, because aliens' species produce competition for native species. So it is urgent need to analysis the aliens and native food web and roosting sites in Pakistan, in future.

O Paquistão é um país com ampla diversidade de espécies nativas e exóticas de peixes de água doce. Contudo, diversas espécies de peixes exóticos estão sendo introduzidas nos corpos de água doce paquistanês, as quais estão competindo com a fauna nativa de peixes, tornando-os privados de alimento e habitat. A introdução intencional ou acidental de animais, plantas e patógenos fora de seu nicho nativo é considerada o principal problema da biodiversidade do habitat recém-invadido. Assim, foi realizado um estudo de três anos, de janeiro de 2017 a dezembro de 2019, em corpos de água doce na província de Punjab, Paquistão. A pesquisa foi desenvolvida para conhecer os impactos de espécies exóticas na distribuição de espécies nativas de peixes. Durante a pesquisa, foi registrado um total de 68 espécies de peixes (nativas e exóticas), pertencentes a 14 famílias, nas nascentes dos rios Qadirabad, Baloki e Islam e na barragem de Rasul. A análise estatística mostrou que o índice de diversidade de Shannon-Wiener foi mais alto (1,41) na barragem Rasul (RB) e na nascente do rio Islam (IH); e que a maioria das espécies introduzidas estava presente em um número muito menor, isto é, Oreochromis mossambicus, Oreochromis niloticus, Hypophthalmichthys nobilis, Carassius auratus, Ctenopharyngodon idella, Cyprinus carpio e Hypophthalmichthy smolitrix nessa área de estudo. Por outro lado, o índice Shannon-Wiener mostrou que a diversidade estava baixa nas nascentes dos rios Qadirabad (1,30) e Baloki (1,4) em razão da alta pressão de espécies invasoras. A observação direta das espécies e a análise estatística indicaram que as espécies invasoras produziram impacto negativo na diversidade, uniformidade e números de peixes da fauna local. Conclui-se que muitos fatores impactam na diversidade de peixes nativos, mas as espécies exóticas (invasoras) também desempenham um papel importante na redução das espécies nativas, em razão da competição existente entre elas. Portanto, é urgente uma análise futura das espécies invasoras e da teia alimentar nativa no Paquistão.

Impact of alien fishes on the distribution pattern of indigenous freshwater fishes of Punjab, Pakistan / Impacto de peixes invasores no padrão de distribuição de peixes de água doce em Punjab, Paquistão

Pakistan is the country with mega freshwater fish diversity of native and alien species. In the presence of enormous native fishes varies species of exotic fishes have been introduced into the freshwater bodies of Pakistan which are competing with native freshwater fish fauna and making them deprive of food and habitat as well. Intentional or accidental introductions of animals, plants and pathogens away from their native niche is considered as major leading problem for biodiversity of invaded habitat. Three years study (from January 2017 to December 2019) was conducted in freshwater bodies of Province Punjab, Pakistan. Study was designed to know exotic species impacts on the distribution of native species of fishes. During current survey a total of 68 (indigenous and exotic) fish species belonging to 14 families were recorded from head Qadirabad, head Baloki, Islam headworks and Rasul barrage. Statistical analysis showed that Shannon-Wiener diversity index was the highest (1.41) at both Rasul barrage and Islam headworks but, invasive species were present in very less number in these study sites i.e. Oreochromis mozambicus, O. niloticus, Hypophthalmichthys nobilis, Carassius auratus, Ctenophryngdon idella, Cyprinus carpio and H. molitrix. The diversity index showed that comparatively low diversity was present in both area head Qadirabad (1.30) and head Baloki (1.4) due to high pressure of invasive species. Direct observation of species and statistical analysis showed that aliens species produced negative impact on the local fish fauna diversity, evenness, and numbers. It is concluded that many factors are impacts on the diversity of native fishes, but alien (invasive) species also play a major role to reduction of native species, because aliens species produce competition for native species. So it is urgent need to analysis the aliens and native food web and roosting sites in Pakistan, in future.(AU)

O Paquistão é um país com ampla diversidade de espécies nativas e exóticas de peixes de água doce. Contudo, diversas espécies de peixes exóticos estão sendo introduzidas nos corpos de água doce paquistanês, as quais estão competindo com a fauna nativa de peixes, tornando-os privados de alimento e habitat. A introdução intencional ou acidental de animais, plantas e patógenos fora de seu nicho nativo é considerada o principal problema da biodiversidade do habitat recém-invadido. Assim, foi realizado um estudo de três anos, de janeiro de 2017 a dezembro de 2019, em corpos de água doce na província de Punjab, Paquistão. A pesquisa foi desenvolvida para conhecer os impactos de espécies exóticas na distribuição de espécies nativas de peixes. Durante a pesquisa, foi registrado um total de 68 espécies de peixes (nativas e exóticas), pertencentes a 14 famílias, nas nascentes dos rios Qadirabad, Baloki e Islam e na barragem de Rasul. A análise estatística mostrou que o índice de diversidade de Shannon-Wiener foi mais alto (1,41) na barragem Rasul (RB) e na nascente do rio Islam (IH); e que a maioria das espécies introduzidas estava presente em um número muito menor, isto é, Oreochromis mossambicus, Oreochromis niloticus, Hypophthalmichthys nobilis, Carassius auratus, Ctenopharyngodon idella, Cyprinus carpio e Hypophthalmichthy smolitrix nessa área de estudo. Por outro lado, o índice Shannon-Wiener mostrou que a diversidade estava baixa nas nascentes dos rios Qadirabad (1,30) e Baloki (1,4) em razão da alta pressão de espécies invasoras. A observação direta das espécies e a análise estatística indicaram que as espécies invasoras produziram impacto negativo na diversidade, uniformidade e números de peixes da fauna local. Conclui-se que muitos fatores impactam na diversidade de peixes nativos, mas as espécies exóticas (invasoras) também desempenham um papel importante na redução das espécies nativas, em razão da competição existente entre elas. Portanto, é [...].(AU)

A principal component analysis required in technical assistance guidance for chilled raw milk producers

The purpose of the present study was to evaluate the principal component analysis (PCA) to guide technical assistance regarding several dairy farms' issues, which includes improving microbiological quality and physical-chemical composition of raw refrigerated milk. Data of monthly analysis of fat, protein, lactose, dry defatted stratum, somatic cell count, total bacterial count, milk temperature of 8,101 samples of milk from expansion tanks and production of 78 farms located in the northern region of Minas Gerais, Brazil were processed. Descriptive statistical measures and Pearson correlation coefficient were estimated involving all evaluated traits during the dry and rainy seasons. In addition, multivariate analyses were performed using PCA. The results showed that two farm sites were negatively related to milk quality in both seasons. One farm stood out positively, being able to be used as a herd management model to drive technical assistance actions. Thus, PCA is efficient in simplifying large amounts of data, allowing simpler and faster technical herd management interpretation.(AU)

Statistical modeling for analyzing grain yield of durum wheat under rainfed conditions in Azad Jammu Kashmir, Pakistan / Modelagem estatística para analisar o rendimento de grãos de trigo durum sob condições de chuva em Azad Jammu Kashmir, Paquistão

One of the most important traits that plant breeders aim to improve is grain yield which is a highly quantitative trait controlled by various agro-morphological traits. Twelve morphological traits such as Germination Percentage, Days to Spike Emergence, Plant Height, Spike Length, Awn Length, Tillers/Plant, Leaf Angle, Seeds/Spike, Plant Thickness, 1000-Grain Weight, Harvest Index and Days to Maturity have been considered as independent factors. Correlation ,regression, and principal component analysis (PCA) are used to identify the different durum wheat traits, which significantly contribute to the yield. The necessary assumptions required for applying regression modeling have been tested and all the assumptions are satisfied by the observed data. The outliers are detected in the observations of fixed traits and Grain Yield. Some observations are detected as outliers but the outlying observations did not show any influence on the regression fit. For selecting a parsimonious regression model for durum wheat, best subset regression, and stepwise regression techniques have been applied. The best subset regression analysis revealed that Germination Percentage, Tillers/Plant, and Seeds/Spike have a marked increasing effect whereas Plant thickness has a negative effect on durum wheat yield. While stepwise regression analysis identified that the traits, Germination Percentage, Tillers/Plant, and Seeds/Spike significantly contribute to increasing the durum wheat yield. The simple correlation coefficient specified the significant positive correlation of Grain Yield with Germination Percentage, Number of Tillers/Plant, Seeds/Spike, and Harvest Index. These results of correlation analysis directed the importance of morphological characters and their significant positive impact on Grain Yield. [...].

Uma das características mais importantes que os produtores de plantas visam melhorar é o rendimento de grãos, que é uma particularidade altamente quantitativa e controlada por várias características agromorfológicas. Foram considerados 12 traços morfológicos como fatores independentes, como Porcentagem de Germinação, Dias para Emergência da Espiga, Altura da Planta, Comprimento da Espiga, Comprimento da Aresta, Perfilhos /Planta, Ângulo da Folha, Sementes /Espiga, Espessura da Planta, Peso de 1000 Grãos, Índice de Colheita e Dias até a Maturidade. A correlação, regressão e análise de componentes principais (em inglês Principal Component Analysis (PCA)) são usadas para identificar as diferentes características do trigo duro, que contribuem significativamente para o rendimento. As suposições necessárias exigidas para a aplicação da modelagem de regressão foram testadas e todas as suposições são adequadas de acordo com os dados observados. Os outliers são detectados nas observações de características fixas e rendimento de grãos. Algumas observações são detectadas como outliers, mas as observações outliers não mostraram qualquer influência no ajuste da regressão. Para selecionar um modelo de regressão parcimonioso para o trigo duro, foram aplicadas tanto a melhor regressão de subconjunto quanto as técnicas de regressão stepwise. A melhor análise de regressão de subconjunto revelou que a porcentagem de germinação, perfilhos /planta e sementes /espiga tem um efeito de aumento acentuado, enquanto a espessura da planta tem um efeito negativo sobre o rendimento do trigo duro. Enquanto a análise de regressão passo a passo identificou que as características, porcentagem de germinação, perfilhos/planta e sementes /espiga contribuem significativamente para aumentar a produtividade do trigo duro. O coeficiente de correlação simples especificou a correlação positiva significativa do [...].

Statistical modeling for analyzing grain yield of durum wheat under rainfed conditions in Azad Jammu Kashmir, Pakistan

Abstract One of the most important traits that plant breeders aim to improve is grain yield which is a highly quantitative trait controlled by various agro-morphological traits. Twelve morphological traits such as Germination Percentage, Days to Spike Emergence, Plant Height, Spike Length, Awn Length, Tillers/Plant, Leaf Angle, Seeds/Spike, Plant Thickness, 1000-Grain Weight, Harvest Index and Days to Maturity have been considered as independent factors. Correlation, regression, and principal component analysis (PCA) are used to identify the different durum wheat traits, which significantly contribute to the yield. The necessary assumptions required for applying regression modeling have been tested and all the assumptions are satisfied by the observed data. The outliers are detected in the observations of fixed traits and Grain Yield. Some observations are detected as outliers but the outlying observations did not show any influence on the regression fit. For selecting a parsimonious regression model for durum wheat, best subset regression, and stepwise regression techniques have been applied. The best subset regression analysis revealed that Germination Percentage, Tillers/Plant, and Seeds/Spike have a marked increasing effect whereas Plant thickness has a negative effect on durum wheat yield. While stepwise regression analysis identified that the traits, Germination Percentage, Tillers/Plant, and Seeds/Spike significantly contribute to increasing the durum wheat yield. The simple correlation coefficient specified the significant positive correlation of Grain Yield with Germination Percentage, Number of Tillers/Plant, Seeds/Spike, and Harvest Index. These results of correlation analysis directed the importance of morphological characters and their significant positive impact on Grain Yield. The results of PCA showed that most variation (70%) among data set can be explained by the first five components. It also identified that Seeds/Spike; 1000-Grain Weight and Harvest Index have a higher influence in contributing to the durum wheat yield. Based on the results it is recommended that these important parameters might be considered and focused in future durum wheat breeding programs to develop high yield varieties.

Resumo Uma das características mais importantes que os produtores de plantas visam melhorar é o rendimento de grãos, que é uma particularidade altamente quantitativa e controlada por várias características agromorfológicas. Foram considerados 12 traços morfológicos como fatores independentes, como Porcentagem de Germinação, Dias para Emergência da Espiga, Altura da Planta, Comprimento da Espiga, Comprimento da Aresta, Perfilhos /Planta, Ângulo da Folha, Sementes /Espiga, Espessura da Planta, Peso de 1000 Grãos, Índice de Colheita e Dias até a Maturidade,. A correlação, regressão e análise de componentes principais (em inglês Principal Component Analysis (PCA)) são usadas para identificar as diferentes características do trigo duro, que contribuem significativamente para o rendimento. As suposições necessárias exigidas para a aplicação da modelagem de regressão foram testadas e todas as suposições são adequadas de acordo com os dados observados. Os outliers são detectados nas observações de características fixas e rendimento de grãos. Algumas observações são detectadas como outliers, mas as observações outliers não mostraram qualquer influência no ajuste da regressão. Para selecionar um modelo de regressão parcimonioso para o trigo duro, foram aplicadas tanto a melhor regressão de subconjunto quanto as técnicas de regressão stepwise. A melhor análise de regressão de subconjunto revelou que a porcentagem de germinação, perfilhos /planta e sementes /espiga tem um efeito de aumento acentuado, enquanto a espessura da planta tem um efeito negativo sobre o rendimento do trigo duro. Enquanto a análise de regressão passo a passo identificou que as características, porcentagem de germinação, perfilhos/planta e sementes /espiga contribuem significativamente para aumentar a produtividade do trigo duro. O coeficiente de correlação simples especificou a correlação positiva significativa do rendimento de grãos com a porcentagem de germinação, número de perfilhos/planta, sementes / espiga e índice de colheita. Esses resultados da análise de correlação direcionaram a importância dos caracteres morfológicos e seu impacto positivo e significativo no rendimento de grãos. Os resultados da PCA mostraram que a maior parte da variação (70%) entre o conjunto de dados pôde ser explicada pelos cinco primeiros componentes. Também identificou que Sementes / Espiga, Peso de 1000 Grãos e Índice de Colheita têm uma maior influência na contribuição para o rendimento do trigo duro. Com base nos resultados, recomenda-se que esses importantes parâmetros possam ser considerados e focados em futuros programas de melhoramento de trigo duro para desenvolver variedades de alto rendimento.

Statistical modeling for analyzing grain yield of durum wheat under rainfed conditions in Azad Jammu Kashmir, Pakistan / Modelagem estatística para analisar o rendimento de grãos de trigo durum sob condições de chuva em Azad Jammu Kashmir, Paquistão

One of the most important traits that plant breeders aim to improve is grain yield which is a highly quantitative trait controlled by various agro-morphological traits. Twelve morphological traits such as Germination Percentage, Days to Spike Emergence, Plant Height, Spike Length, Awn Length, Tillers/Plant, Leaf Angle, Seeds/Spike, Plant Thickness, 1000-Grain Weight, Harvest Index and Days to Maturity have been considered as independent factors. Correlation, regression, and principal component analysis (PCA) are used to identify the different durum wheat traits, which significantly contribute to the yield. The necessary assumptions required for applying regression modeling have been tested and all the assumptions are satisfied by the observed data. The outliers are detected in the observations of fixed traits and Grain Yield. Some observations are detected as outliers but the outlying observations did not show any influence on the regression fit. For selecting a parsimonious regression model for durum wheat, best subset regression, and stepwise regression techniques have been applied. The best subset regression analysis revealed that Germination Percentage, Tillers/Plant, and Seeds/Spike have a marked increasing effect whereas Plant thickness has a negative effect on durum wheat yield. While stepwise regression analysis identified that the traits, Germination Percentage, Tillers/Plant, and Seeds/Spike significantly contribute to increasing the durum wheat yield. The simple correlation coefficient specified the significant positive correlation of Grain Yield with Germination Percentage, Number of Tillers/Plant, Seeds/Spike, and Harvest Index. These results of correlation analysis directed the importance of morphological characters and their significant positive impact on Grain Yield. The results of PCA showed that most variation (70%) among data set can be explained by the first five components. It also identified that Seeds/Spike; 1000-Grain Weight and Harvest Index have a higher influence in contributing to the durum wheat yield. Based on the results it is recommended that these important parameters might be considered and focused in future durum wheat breeding programs to develop high yield varieties.

Uma das características mais importantes que os produtores de plantas visam melhorar é o rendimento de grãos, que é uma particularidade altamente quantitativa e controlada por várias características agromorfológicas. Foram considerados 12 traços morfológicos como fatores independentes, como Porcentagem de Germinação, Dias para Emergência da Espiga, Altura da Planta, Comprimento da Espiga, Comprimento da Aresta, Perfilhos /Planta, Ângulo da Folha, Sementes /Espiga, Espessura da Planta, Peso de 1000 Grãos, Índice de Colheita e Dias até a Maturidade,. A correlação, regressão e análise de componentes principais (em inglês Principal Component Analysis (PCA)) são usadas para identificar as diferentes características do trigo duro, que contribuem significativamente para o rendimento. As suposições necessárias exigidas para a aplicação da modelagem de regressão foram testadas e todas as suposições são adequadas de acordo com os dados observados. Os outliers são detectados nas observações de características fixas e rendimento de grãos. Algumas observações são detectadas como outliers, mas as observações outliers não mostraram qualquer influência no ajuste da regressão. Para selecionar um modelo de regressão parcimonioso para o trigo duro, foram aplicadas tanto a melhor regressão de subconjunto quanto as técnicas de regressão stepwise. A melhor análise de regressão de subconjunto revelou que a porcentagem de germinação, perfilhos /planta e sementes /espiga tem um efeito de aumento acentuado, enquanto a espessura da planta tem um efeito negativo sobre o rendimento do trigo duro. Enquanto a análise de regressão passo a passo identificou que as características, porcentagem de germinação, perfilhos/planta e sementes /espiga contribuem significativamente para aumentar a produtividade do trigo duro. O coeficiente de correlação simples especificou a correlação positiva significativa do rendimento de grãos com a porcentagem de germinação, número de perfilhos/planta, sementes / espiga e índice de colheita. Esses resultados da análise de correlação direcionaram a importância dos caracteres morfológicos e seu impacto positivo e significativo no rendimento de grãos. Os resultados da PCA mostraram que a maior parte da variação (70%) entre o conjunto de dados pôde ser explicada pelos cinco primeiros componentes. Também identificou que Sementes / Espiga, Peso de 1000 Grãos e Índice de Colheita têm uma maior influência na contribuição para o rendimento do trigo duro. Com base nos resultados, recomenda-se que esses importantes parâmetros possam ser considerados e focados em futuros programas de melhoramento de trigo duro para desenvolver variedades de alto rendimento.

New insights on the influence of the quality of tomato seedlings on production of fruits cultivated in substracts / Novas descobertas sobre a influência da qualidade de mudas de tomate na produção de frutos cultivados em substrato

This study evaluated the relationships between the biometric characters of tomato seedlings with the production characters obtained at the end of the crop cycle, to determine how the quality of seedlings interferes with tomato productivity. An experiment was carried out in two growing seasons, in a completely randomized design, with four replications and the experimental unit consisting of five plants. The treatments consisted of seedlings with different ages, differentiated by the days after sowing (DAS): (15, 20, 25, 30, 35, and 40 DAS). After each evaluation of the seedlings, they were transplanted to the definitive production site, being evaluated until the end of the cycle. Biometric characters of seedlings and characters of fruit production were evaluated. Pearson correlation analysis and principal components (PCA) were performed to determine the relationships between the characters, path analysis to determine the direct and indirect effects, and analysis of canonical correlations between the groups of characters. In all analyses performed, weak correlation between the biometric characters of the seedlings (which evaluate the quality) with the characters of tomato fruit production in substrate cultivation was identified.

O objetivo deste trabalho foi avaliar as relações entre os caracteres biométricos de mudas de tomate com os caracteres de produção obtidos ao final do ciclo da cultura, para determinar como a qualidade das mudas interfere na produtividade do tomate. O experimento foi conduzido em duas épocas de cultivo, em delineamento inteiramente casualizado, com quatro repetições e a unidade experimental composta por cinco plantas. Os tratamentos foram constituídos por mudas com diferentes idades, diferenciadas pelos dias após a semeadura (DAS): (15, 20, 25, 30, 35 e 40 DAS). Após cada avaliação das mudas, eram transplantadas para o local de produção definitivo, sendo avaliadas até o final do ciclo. Avaliaram-se os caracteres biométricos das mudas e os caracteres da produção de frutos. Análise de correlação de Pearson e componentes principais (PCA) foram realizados para determinar as relações entre os caracteres, análise de trilha para determinar os efeitos diretos e indiretos e análise de correlações canônicas entre os grupos de caracteres. Em todas as análises realizadas, foi identificada correlação fraca entre os caracteres biométricos das mudas (que avaliam a qualidade) com os caracteres da produção de frutos de tomate em cultivo em substrato.

Statistical modeling for analyzing grain yield of durum wheat under rainfed conditions in Azad Jammu Kashmir, Pakistan / Modelagem estatística para analisar o rendimento de grãos de trigo durum sob condições de chuva em Azad Jammu Kashmir, Paquistão

One of the most important traits that plant breeders aim to improve is grain yield which is a highly quantitative trait controlled by various agro-morphological traits. Twelve morphological traits such as Germination Percentage, Days to Spike Emergence, Plant Height, Spike Length, Awn Length, Tillers/Plant, Leaf Angle, Seeds/Spike, Plant Thickness, 1000-Grain Weight, Harvest Index and Days to Maturity have been considered as independent factors. Correlation ,regression, and principal component analysis (PCA) are used to identify the different durum wheat traits, which significantly contribute to the yield. The necessary assumptions required for applying regression modeling have been tested and all the assumptions are satisfied by the observed data. The outliers are detected in the observations of fixed traits and Grain Yield. Some observations are detected as outliers but the outlying observations did not show any influence on the regression fit. For selecting a parsimonious regression model for durum wheat, best subset regression, and stepwise regression techniques have been applied. The best subset regression analysis revealed that Germination Percentage, Tillers/Plant, and Seeds/Spike have a marked increasing effect whereas Plant thickness has a negative effect on durum wheat yield. While stepwise regression analysis identified that the traits, Germination Percentage, Tillers/Plant, and Seeds/Spike significantly contribute to increasing the durum wheat yield. The simple correlation coefficient specified the significant positive correlation of Grain Yield with Germination Percentage, Number of Tillers/Plant, Seeds/Spike, and Harvest Index. These results of correlation analysis directed the importance of morphological characters and their significant positive impact on Grain Yield. [...].(AU)

Uma das características mais importantes que os produtores de plantas visam melhorar é o rendimento de grãos, que é uma particularidade altamente quantitativa e controlada por várias características agromorfológicas. Foram considerados 12 traços morfológicos como fatores independentes, como Porcentagem de Germinação, Dias para Emergência da Espiga, Altura da Planta, Comprimento da Espiga, Comprimento da Aresta, Perfilhos /Planta, Ângulo da Folha, Sementes /Espiga, Espessura da Planta, Peso de 1000 Grãos, Índice de Colheita e Dias até a Maturidade. A correlação, regressão e análise de componentes principais (em inglês Principal Component Analysis (PCA)) são usadas para identificar as diferentes características do trigo duro, que contribuem significativamente para o rendimento. As suposições necessárias exigidas para a aplicação da modelagem de regressão foram testadas e todas as suposições são adequadas de acordo com os dados observados. Os outliers são detectados nas observações de características fixas e rendimento de grãos. Algumas observações são detectadas como outliers, mas as observações outliers não mostraram qualquer influência no ajuste da regressão. Para selecionar um modelo de regressão parcimonioso para o trigo duro, foram aplicadas tanto a melhor regressão de subconjunto quanto as técnicas de regressão stepwise. A melhor análise de regressão de subconjunto revelou que a porcentagem de germinação, perfilhos /planta e sementes /espiga tem um efeito de aumento acentuado, enquanto a espessura da planta tem um efeito negativo sobre o rendimento do trigo duro. Enquanto a análise de regressão passo a passo identificou que as características, porcentagem de germinação, perfilhos/planta e sementes /espiga contribuem significativamente para aumentar a produtividade do trigo duro. O coeficiente de correlação simples especificou a correlação positiva significativa do [...].(AU)

Validation of soil quality index in soil using bioindicator plant / Validação do índice da qualidade do solo com planta bioindicadora

Soils provide a broad set of vital ecosystem services and sustains the production of food and fibers, balancing the ecosystem. Thus, from the perspective of soil quality, it is defined as an ability to balance within the ecosystem to sustain biological productivity, promoting the health of plants and animals, being evaluated by traditional indicators as physical, chemical and biological indicators, so the present work aims to estimate the soil quality index using multivariate models using soil biological attributes and validation with growth variables of the bioindicator plant. The study was developed in the agricultural area in P. Prudente, SP, the points collected were georeferenced, collections in depth of 0 -20 cm, microbiological analysis, microbial carbon and nitrogen biomass, dehydrogenase, respiration and microbial coefficient, having a bioindicator plant curly lettuce (Lucy Brown) as a validator of the soil. The results were discovered using the PCA model for the identification of autos vectors and autos values, grouping and identifying their collinearities, linear regression, r-pearson validation and cluster heuristic analysis. The microbial attributes and the bioindicator plant discriminated the agricultural areas evaluated with establishment and validation of SQI. The metabolic coefficient and N of the microbial biomass dissipation of the highest covariance values by multivariate analysis. The reforestation area with native species (SQI0.782%) and the livestock crop integration system (SQI0.765%) were evaluated as areas with better soil quality.

O solo fornece o conjunto de serviços ambientais vitaise dinâmico que condiciona e sustenta a produção de alimentos e fibras, balanceando o ecossistema, dessa forma, sob a ótica da qualidade do solo é definida como a capacidade de se equilibrar dentro do ecossistema para sustentar a produtividade biológica, promovendo a saúde das plantas e animais, sendo avaliada pelos indicadores tradicionais como indicadores físicos, químicos e biológicos, assim o presente trabalho tem como objetivo estimar índice qualidade do solo com uso de modelos multivariados utilizando-se de atributos biológicos do solo e validação com variáveis de crescimento da planta bioindicadora. O estudo foi desenvolvido na área agrícola da universidade do Oeste Paulista, campus II, os pontos coletados foram georreferenciados, coletatos em profundidade de 0 –20 cm, realizado as análises microbiológicas, biomassa microbiana do carbono e nitrogênio, desidrogenase, respiração e coeficiente microbiano, tendo a planta bioindicadora alface crespa (Lucy Brown) como validador do solo. Os resultados foram submetidos ao modelo de PCA para a identificação dos autos vetores e autos valores agrupando e identificando suas colinearidades, regressão linear, validação r-pearson e análise heurística de cluster. Os atributos microbianos e a planta bioindicadora discriminaram as áreas agrícolas avaliadas com atribuição e validação de SQI. O coeficiente metabólico e N da biomassa microbiana apresentaram os maiores valores de covariância pela análise multivariada. A área de reflorestamentocom espécies nativas (SQI0,782%) e o sistema de integração lavoura pecuária (SQI0,765%) foram consideradas as áreas com melhor qualidade de solo.

Validation of soil quality index in soil using bioindicator plant / Validação do índice da qualidade do solo com planta bioindicadora

Soils provide a broad set of vital ecosystem services and sustains the production of food and fibers, balancing the ecosystem. Thus, from the perspective of soil quality, it is defined as an ability to balance within the ecosystem to sustain biological productivity, promoting the health of plants and animals, being evaluated by traditional indicators as physical, chemical and biological indicators, so the present work aims to estimate the soil quality index using multivariate models using soil biological attributes and validation with growth variables of the bioindicator plant. The study was developed in the agricultural area in P. Prudente, SP, the points collected were georeferenced, collections in depth of 0 -20 cm, microbiological analysis, microbial carbon and nitrogen biomass, dehydrogenase, respiration and microbial coefficient, having a bioindicator plant curly lettuce (Lucy Brown) as a validator of the soil. The results were discovered using the PCA model for the identification of autos vectors and autos values, grouping and identifying their collinearities, linear regression, r-pearson validation and cluster heuristic analysis. The microbial attributes and the bioindicator plant discriminated the agricultural areas evaluated with establishment and validation of SQI. The metabolic coefficient and N of the microbial biomass dissipation of the highest covariance values by multivariate analysis. The reforestation area with native species (SQI0.782%) and the livestock crop integration system (SQI0.765%) were evaluated as areas with better soil quality.(AU)

O solo fornece o conjunto de serviços ambientais vitaise dinâmico que condiciona e sustenta a produção de alimentos e fibras, balanceando o ecossistema, dessa forma, sob a ótica da qualidade do solo é definida como a capacidade de se equilibrar dentro do ecossistema para sustentar a produtividade biológica, promovendo a saúde das plantas e animais, sendo avaliada pelos indicadores tradicionais como indicadores físicos, químicos e biológicos, assim o presente trabalho tem como objetivo estimar índice qualidade do solo com uso de modelos multivariados utilizando-se de atributos biológicos do solo e validação com variáveis de crescimento da planta bioindicadora. O estudo foi desenvolvido na área agrícola da universidade do Oeste Paulista, campus II, os pontos coletados foram georreferenciados, coletatos em profundidade de 0 –20 cm, realizado as análises microbiológicas, biomassa microbiana do carbono e nitrogênio, desidrogenase, respiração e coeficiente microbiano, tendo a planta bioindicadora alface crespa (Lucy Brown) como validador do solo. Os resultados foram submetidos ao modelo de PCA para a identificação dos autos vetores e autos valores agrupando e identificando suas colinearidades, regressão linear, validação r-pearson e análise heurística de cluster. Os atributos microbianos e a planta bioindicadora discriminaram as áreas agrícolas avaliadas com atribuição e validação de SQI. O coeficiente metabólico e N da biomassa microbiana apresentaram os maiores valores de covariância pela análise multivariada. A área de reflorestamentocom espécies nativas (SQI0,782%) e o sistema de integração lavoura pecuária (SQI0,765%) foram consideradas as áreas com melhor qualidade de solo.(AU)

Principal component analysis on fatty acid composition of the meat deriving from calves, young bull and bull of Maremmana breed slaughtered at different age / Análise de componentes principais na composição de ácidos graxos da carne provenientes de vitelos, novilhos e touros da raça Maremmana abatidos em idades diferentes

This study evaluated the performance at slaughtering of calves; young bull and bull of Maremmana breed, and compared, through Analysis of Variance (ANOVA) and Principal Component Analysis (PCA) on fatty acid composition, the characteristics of the resulting meat categories: veal, young bull meat and bull meat. The Maremmana cattle is a local endangered breed deriving from Tuscany and Latium. The animals of this study were raised under same conditions in pasture with hay and concentrate supplementations. Eighteen calves of 12-14 months, 27 young bulls of 18 months and 14 bulls of 20-24 months were slaughtered in this trial. The performances at slaughtering were considered, and on the meat samples, the chemical analysis and the fatty acid composition were carried out. Results were submitted to ANOVA and PCA, and a Heat map that considered the fatty acid distances among meat typologies was built. Slaughtering performances were better in young bulls and bulls. Chemical composition didnt differ among meat categories. Saturated fatty acids (SFA) were similar among meats, but Monounsaturated (MUFA) and Polyunsaturated fatty acids (PUFA) were lower in veal. Desirable fatty acids and Healthy Indices were better in veal. The results of PCA and Heat map confirmed that veal was quite different from other meats. Maremmana meat deriving from animals of different age has shown overall good characteristics, suitable for the diet of western country population.(AU)

O objetivo deste trabalho foi avaliar o desempenho no abate de bezerros, novilhos e touros da raça Maremmana, e comparar, por meio de Análise de Variância (ANOVA) e Análise de Componentes Principais (PCA), a composição de ácidos graxos e as características da carne das diferentes categorias: bezerro, novilho e touro. Os animais deste estudo foram criados nas mesmas condições em pastagem com suplementação de feno e concentrado. Foram utilizados 18 vitelos abatidos aos 12-14 meses, 27 novilhos abatidos aos 18 meses e 14 touros abatidos aos 20-24 meses. Sucessivamente foi analisado o desempenho ao abate e as características nutricionais e físico-químicas do Musculus longissimus dorsi. Os resultados foram submetidos à análise de variância. Os parâmetros de abate foram melhores em novilhos e touros. A idade ao abate não afetou as características químicas da carne. Não houve diferença em relação à porcentagem de ácidos graxos saturados (SFA), mas a carne de vitela apresentou menor teor de monoinsaturados (MUFA) e poliinsaturados (PUFA). Os ácidos graxos desejáveis e os índices de saúde foram melhores na carne de vitela. A composição de ácidos graxos foi utilizada também, na análise multivariada dos componentes principais e no mapa de calor, como variável discriminatória para os três categorias de carne; essas análises confirmaram que o produto cárneo de vitela é diferente de outros tipos. A carne de Maremmana proveniente de animais de diferentes faixas etárias mostrou boas características gerais, adequadas para a dieta da população do país ocidental.(AU)

Meat quality of Maremmana young bulls

Maremmana is a local Italian breed reared in southern Tuscany and northern Latium. Twenty-two young bulls were reared in pasture system with concentrate supply (PSCS), whereas 20 young bulls were reared in feedlot intensive system (IS) in order test differences between meat typologies. The bulls were slaughtered at 18 months old. The performances at slaughtering were similar between finishing systems. IS bull meat has shown higher cooking loss than PSCS bull meat (p < 0.001), higher moisture content (p < 0.01), and fat (p < 0.001), and lower crude protein (p < 0.001). The SFA, MUFA and PUFA percentage were similar between meat typologies; whereas if considered in mg per 100 gr of muscle MUFA and SFA content was higher in PSCS meat (p < 0.05). Among the Healthy Indices, C18:2/C18:3 was higher in IS System (14.08 vs. 9.77; p < 0.001); the results of the PCA (Principal Component Analysis) of fatty acids composition showed that PSCS meat was characterized by MUFA and SFA, while IS meat was identified by C18:2/C18:3, and ω6/ ω3.(AU)

Meat quality of Maremmana young bulls

Maremmana is a local Italian breed reared in southern Tuscany and northern Latium. Twenty-two young bulls were reared in pasture system with concentrate supply (PSCS), whereas 20 young bulls were reared in feedlot intensive system (IS) in order test differences between meat typologies. The bulls were slaughtered at 18 months old. The performances at slaughtering were similar between finishing systems. IS bull meat has shown higher cooking loss than PSCS bull meat (p < 0.001), higher moisture content (p < 0.01), and fat (p < 0.001), and lower crude protein (p < 0.001). The SFA, MUFA and PUFA percentage were similar between meat typologies; whereas if considered in mg per 100 gr of muscle MUFA and SFA content was higher in PSCS meat (p < 0.05). Among the Healthy Indices, C18:2/C18:3 was higher in IS System (14.08 vs. 9.77; p < 0.001); the results of the PCA (Principal Component Analysis) of fatty acids composition showed that PSCS meat was characterized by MUFA and SFA, while IS meat was identified by C18:2/C18:3, and ω6/ ω3.

Padrões de reflectância foliar de eucalipto em diferentes dias e períodos do dia / Eucalyptus leaf reflectance patterns on different days and periods of the day

Diante da complexa relação entre reflectância foliar e aspectos fisiológicos da planta em dias e diferentes horários do dia, a pesquisa foi desenvolvida para averiguar e mensurar o grau da influência do dia e o período do dia em espectros de reflectância foliar de árvores de eucalipto. O experimento foi conduzido em um plantio de eucalipto clonal, híbrido espontâneo de Eucalyptus grandis com centroide nas coordenadas 18º 12' 12",19"S e 43º 34' 20,28"O. Em cada uma das cinco árvores-amostra escolhidas aleatoriamente, amostraram-se quatro folhas distribuídas em cada ponto cardeal. Todas as folhas selecionadas foram avaliadas nos dias 7, 8, 9 e 10 de dezembro de 2013, em dois períodos do dia: entre 8 e 9 horas e entre 15 e 16 horas. A leitura da reflectância foliar foi realizada utilizando um mini-espectrometro com posterior suavização e dessa forma realizou-se a análise de componentes principais e com posterior análise de agrupamento por dendrograma. No geral, a média das reflectâncias foliares no segundo dia foram as menores e as médias do terceiro dia maiores. Em média a reflectância foliar foi menor no período da manhã do que no período da tarde. O dia e o período do dia em que foi realizada a leitura influenciaram de forma aleatória na reflectância foliar de eucalipto. A reflectância foliar do eucalipto pode se alterar em um curto período de tempo, inclusive em um mesmo dia, o que indica a importância da padronização no horário de coleta para futuros estudos.

Faced with the complex relationship between leaf reflectance and physiological aspects of the plant on days and at different times of the day, the research was developed to ascertain and measure the influence of day and period of the day on leaf reflectance of eucalyptus trees. The experiment was carried out in a clonal eucalyptus stand, spontaneous Eucalyptus grandis hybrid with centroid at 18º 12 '12,19"S and 43º 34' 20,28"W. In each of the five sample trees randomly selected, four leaves were sampled at each cardinal point. All selected leaves were evaluated on days 7, 8, 9 and 10 of December 2013, in two periods of the day: between 8 and 9 hours and between 15 and 16 hours. The leaf reflectance was measured using a mini-spectrometer with subsequent smoothing and the analysis of principal components and subsequent analysis of dendrogram cluster were performed. In general, the average leaf reflectance on the second day was the lowest and the third day average was higher. Leaf reflectance was lower in the morning than in the afternoon. The day and period of the day of reading were randomly influenced by eucalypt leaf reflectance. The leaf reflectance of eucalyptus can change in a short time, even in the same day, which indicates the importance of the standardization in the collection schedule for future studies.

Padrões de reflectância foliar de eucalipto em diferentes dias e períodos do dia / Eucalyptus leaf reflectance patterns on different days and periods of the day

Diante da complexa relação entre reflectância foliar e aspectos fisiológicos da planta em dias e diferentes horários do dia, a pesquisa foi desenvolvida para averiguar e mensurar o grau da influência do dia e o período do dia em espectros de reflectância foliar de árvores de eucalipto. O experimento foi conduzido em um plantio de eucalipto clonal, híbrido espontâneo de Eucalyptus grandis com centroide nas coordenadas 18º 12' 12",19"S e 43º 34' 20,28"O. Em cada uma das cinco árvores-amostra escolhidas aleatoriamente, amostraram-se quatro folhas distribuídas em cada ponto cardeal. Todas as folhas selecionadas foram avaliadas nos dias 7, 8, 9 e 10 de dezembro de 2013, em dois períodos do dia: entre 8 e 9 horas e entre 15 e 16 horas. A leitura da reflectância foliar foi realizada utilizando um mini-espectrometro com posterior suavização e dessa forma realizou-se a análise de componentes principais e com posterior análise de agrupamento por dendrograma. No geral, a média das reflectâncias foliares no segundo dia foram as menores e as médias do terceiro dia maiores. Em média a reflectância foliar foi menor no período da manhã do que no período da tarde. O dia e o período do dia em que foi realizada a leitura influenciaram de forma aleatória na reflectância foliar de eucalipto. A reflectância foliar do eucalipto pode se alterar em um curto período de tempo, inclusive em um mesmo dia, o que indica a importância da padronização no horário de coleta para futuros estudos.(AU)

Faced with the complex relationship between leaf reflectance and physiological aspects of the plant on days and at different times of the day, the research was developed to ascertain and measure the influence of day and period of the day on leaf reflectance of eucalyptus trees. The experiment was carried out in a clonal eucalyptus stand, spontaneous Eucalyptus grandis hybrid with centroid at 18º 12 '12,19"S and 43º 34' 20,28"W. In each of the five sample trees randomly selected, four leaves were sampled at each cardinal point. All selected leaves were evaluated on days 7, 8, 9 and 10 of December 2013, in two periods of the day: between 8 and 9 hours and between 15 and 16 hours. The leaf reflectance was measured using a mini-spectrometer with subsequent smoothing and the analysis of principal components and subsequent analysis of dendrogram cluster were performed. In general, the average leaf reflectance on the second day was the lowest and the third day average was higher. Leaf reflectance was lower in the morning than in the afternoon. The day and period of the day of reading were randomly influenced by eucalypt leaf reflectance. The leaf reflectance of eucalyptus can change in a short time, even in the same day, which indicates the importance of the standardization in the collection schedule for future studies.(AU)

Genetic and taxonomic relationships of five species of Rallidae (Aves: Gruiformes) based on mitochondrial cytochrome oxidase subunit I sequences / Relações genéticas e taxonômicas de cinco espécies de Rallidae (Aves: Gruiformes) com base em sequências de subunidade I da citocromo oxidase mitochondrial

This is the first study to detection the genetic relationship between Porphyrio alleni and four Rallidae species: Fulica atra, Gallinulla angulata, Gallinulla chloropus and Porphyrio porphyrio. Mitochondrial cytochrome oxidase subunit I (COI) sequences were used as an effective marker in this study. DNA of Rallidae species were extracted, amplified using polymerase chain reaction (PCR) and then sequenced. The results obtained from information based on COI sequences revealed that Gallinulla angulata and Gallinulla chloropus fall into two separate clades and they are not monophyletic. This suggests that, two moorhens could not be laid into the same genus. In addition, Porphyrio porphyrio was included in the same genus with Porphyrio alleni but they were situated in two different clades. Porphyrio alleni was more related to Gallinulla angulate, Gallinulla chloropus and Fulica atra than Porphyrio porphyrio. It was concluded that, the mitochondrial gene COI can aid in the differentiation of studied species and finding genetic relationships between them.(AU)

Este é o primeiro estudo para a detecção da relação genética entre Porphyrio alleni e quatro espécies de Rallidae: Fulica atra, Gallinulla angulata, Gallinulla chloropus e Porphyrio porphyrio. As seqüências desubunidade i (COI) do citocromo oxidase foram usadas como marcador efetivo neste estudo. O DNA dasespécies Rallidae foi extraído, amplificado e usado na reação de cadeia da polimerase (polymerase chainreaction- PCR) e sequenciado então. Os resultados obtidos a partir de informações baseadas em sequênciasCOI revelaram que Gallinulla angulata e Gallinulla chloropus caem em dois clades separados e eles não sãomonofiléticos. Isto sugere que duas galinhas dágua não puderam ser colocadas no mesmo gênero. Alémdisso, Porphyrio porphyrio incluído no mesmo gênero que Porphyrio alleni, mas eles estavam situados em doisclades diferentes. Porphyrio alleni estava mais relacionado com Gallinulla angulata, Gallinulla chloropus e Fulicaatra do que com Porphyrio porphyrio. Concluiu-se que o gene mitocondrial COI pode ajudar na diferenciação de espécies estudadas e encontrar relações genéticas entre elas.(AU)

Genetic and taxonomic relationships of five species of Rallidae (Aves: Gruiformes) based on mitochondrial cytochrome oxidase subunit I sequences / Relações genéticas e taxonômicas de cinco espécies de Rallidae (Aves: Gruiformes) com base em sequências de subunidade I da citocromo oxidase mitochondrial

This is the first study to detection the genetic relationship between Porphyrio alleni and four Rallidae species: Fulica atra, Gallinulla angulata, Gallinulla chloropus and Porphyrio porphyrio. Mitochondrial cytochrome oxidase subunit I (COI) sequences were used as an effective marker in this study. DNA of Rallidae species were extracted, amplified using polymerase chain reaction (PCR) and then sequenced. The results obtained from information based on COI sequences revealed that Gallinulla angulata and Gallinulla chloropus fall into two separate clades and they are not monophyletic. This suggests that, two moorhens could not be laid into the same genus. In addition, Porphyrio porphyrio was included in the same genus with Porphyrio alleni but they were situated in two different clades. Porphyrio alleni was more related to Gallinulla angulate, Gallinulla chloropus and Fulica atra than Porphyrio porphyrio. It was concluded that, the mitochondrial gene COI can aid in the differentiation of studied species and finding genetic relationships between them.

Este é o primeiro estudo para a detecção da relação genética entre Porphyrio alleni e quatro espécies de Rallidae: Fulica atra, Gallinulla angulata, Gallinulla chloropus e Porphyrio porphyrio. As seqüências desubunidade i (COI) do citocromo oxidase foram usadas como marcador efetivo neste estudo. O DNA dasespécies Rallidae foi extraído, amplificado e usado na reação de cadeia da polimerase (polymerase chainreaction- PCR) e sequenciado então. Os resultados obtidos a partir de informações baseadas em sequênciasCOI revelaram que Gallinulla angulata e Gallinulla chloropus caem em dois clades separados e eles não sãomonofiléticos. Isto sugere que duas galinhas d’água não puderam ser colocadas no mesmo gênero. Alémdisso, Porphyrio porphyrio incluído no mesmo gênero que Porphyrio alleni, mas eles estavam situados em doisclades diferentes. Porphyrio alleni estava mais relacionado com Gallinulla angulata, Gallinulla chloropus e Fulicaatra do que com Porphyrio porphyrio. Concluiu-se que o gene mitocondrial COI pode ajudar na diferenciação de espécies estudadas e encontrar relações genéticas entre elas.

Molecular and morphological approaches for species delimitation and hybridization investigations of two Cichla species / Abordagens morfológicas e moleculares para delimitação de espécie e investigações de hibridação de duas espécies de Cichla

The hybridization is a widely-discussed issue in several studies with fish species. For some authors, hybridization may be related with diversification and speciation of several groups, or also with the extinction of populations or species. Difficulties to differentiate species and hybrids may be a problem to correctly apply a management of wild species, because hybrid lineages, especially the advanced ones, may resemble the parental species. The genus Cichla Bloch & Schneider, 1801 constitutes an interesting experimental model, considering that hybridization and taxonomic uncertainties hinder a correct identification. Considering these problems, in this study, we developed genetic methodologies and applied meristic and morphometric approaches in wild samples in order to identify species and for test a possible hybridization between Cichla kelberi Kullander & Ferreira, 2006 and Cichla piquiti Kullander & Ferreira, 2006. For this, C. kelberi, C. piquiti and potential hybrid ( carijó) individuals were collected in Paraná and Tietê rivers (SP, Brazil). For meristic and morphometric methods, the individuals were analyzed using the statistical software Pcord 5:31, while for molecular methods, primers for PCR-multiplex were designed and enzyme for PCR-RFLP were selected, under the species-specific nucleotide. All results indicated that the carijó is not an interspecific hybrid, because it presented identical genetic pattern and morphology closed to C. piquiti. Thus, we propose that carijó is a C. piquiti morphotype. In addition, this study promotes a new molecular tool that could be used in future research, monitoring and management programs of the genus Cichla.(AU)

A hibridação é uma questão amplamente discutida em vários estudos com espécies de peixes. Para alguns autores, hibridações podem estar relacionadas à diversificação e especiação de muitos grupos, ou à extinção de populações ou espécies. Dificuldades para diferenciar espécies e híbridos podem ser um problema para aplicar corretamente o manejo de espécies selvagens, porque linhagens híbridas, especialmente as mais avançadas, podem assemelhar-se aos parentais. O gênero Cichla Bloch & Schneider, 1801 constitui um interessante modelo experimental, considerando que a hibridação e as incertezas taxonômicas dificultam a correta identificação. Considerando estes problemas, neste estudo foram desenvolvidas metodologias genéticas e aplicadas abordagens merísticas e morfométricas em amostras selvagens para identificar espécies e para testar uma possível hibridação entre Cichla kelberi Kullander & Ferreira, 2006 e Cichla piquiti Kullander & Ferreira, 2006. Para isto, C. kelberi, C. piquiti e indivíduos do híbrido em potencial ( carijó) foram coletados nos rios Paraná e Tietê (SP, Brasil). Para os métodos merístico e morfométrico, os indivíduos foram analisados, utilizando-se o software estatístico Pcord 5:31, enquanto que para os métodos moleculares, primers para PCR-multiplex foram desenhados e enzimas para PCR-RFLP foram selecionadas, sob nucleotídeos espécie-específicos. Todos os resultados indicaram que o carijó não é um híbrido interespecífico, porque apresentou padrão genético idêntico e morfologia próxima à C. piquiti. Assim, propomos que o carijó é um morfotipo de C. piquiti. Além disso, este estudo promove uma nova ferramenta molecular que poderá ser utilizada em futuras pesquisas, monitoramento e manejo do gênero Cichla.(AU)