Resumo
The growth, sexual maturity and fertility-related parameters related of young Nellore bulls with divergent residual feed intake (RFI) raised on pasture were evaluated. After classification of 48 young males as low and high RFI (more and less efficient, respectively), the animals were evaluated for growth and reproductive parameters at 28-day intervals from 14.3 to 24.6 months of age. The semen was cryopreserved in the last sampling and fresh and post-thaw semen samples were evaluated. Low RFI bulls exhibited higher initial and final body weight (P < 0.05), but feed intake, body condition score and growth measures evaluated by carcass ultrasound were unaffected by RFI (P > 0.05). The scrotal circumference, sperm concentration, defects, and quality of fresh semen, and ultrasonographic testicular characteristics were unaffected by RFI (P > 0.05). However, velocity parameters such as average path and curvilinear velocities determined by computer-assisted sperm analysis of thawed semen submitted to the rapid thermoresistance test were improved (P < 0.05) in low RFI bulls, but this improvement in quality did not enhance in vitro sperm fertilizing ability. Our results demonstrated significant differences in metabolism and growth performance between bulls of divergent RFI. In addition, there was slight improvement in the semen quality of bulls with low RFI bulls, but this did not enhance in vitro fertilizing ability. Selection of beef bulls for RFI can be performed, which will result in economic benefits by improving the growth performance of the animals without affecting reproductive parameters.(AU)
Assuntos
Animais , Masculino , Maturidade Sexual/fisiologia , Bovinos/fisiologia , Fertilidade/fisiologia , Sêmen , Criopreservação/veterinária , Ingestão de AlimentosResumo
This study measured milk and solid feed intake in pre- weaning period and feed intake in postweaning period of Nellore calves, and to correlated them with performance traits and ingestive behavior of animals classified as most and least efficient. During pre weaning phase, feed efficiency was evaluated in 51 cow-calf pairs from 21±5 days after calving until weaning. During post-weaning phase, only male calves (n=23) were evaluated. Pre-weaning milk intake of calves was estimated based on cows milk production. Pre-weaning daily metabolizable energy intake (MEI) of calves was estimated as the sum of MEI from milk and solid diet. There was no difference in ADG between calves with negative and positive pre RFI, with a consequent better feed conversion to more efficient calves. The most efficient calves spent less time at the feed bunk, with a shorter feeding duration and higher rate of intake, compared to the least efficient animals. Correlations between feed intake and metabolic body weight of the animals during pre- and postweaning phases were positive, of medium to high magnitude, and significant, while correlation between ADG values was close to zero. Results suggested that part of the animals ranked based on pre weaning feed intake wont maintain their rank during postweaning phase. In conclusion, calves classified as most efficient during pre-weaning phase have similar weight gain but lower milk intake and MEI than least efficient animals. The estimated pre RFI is weakly correlated with post RFI, showing that RFI is not consistent or repeatable across two periods.(AU)
Este estudo teve como objetivo mensurar o consumo de leite e sólidos no período pré-desmama e o consumo alimentar no período pós-desmama, e relacioná-los com características de desempenho e comportamento ingestivo de animais classificados como mais eficientes e menos eficientes. Na fase pré-desmama foram avaliados 51 pares vaca-bezerro da raça Nelore quanto à eficiência alimentar dos 21±5 dias após o parto até a desmama. Na fase pós-desmama, apenas os bezerros machos (n=23) foram avaliados. O consumo de leite dos bezerros na pré-desmama foi estimado pela produção de leite das vacas. O consumo diário de energia metabolizável do bezerro na pré-desmama (CEM), foi estimado pela soma do consumo de energia metabolizável do leite e do consumo diário de energia metabolizável da dieta. Bezerros CARpre negativo não diferiram dos bezerros CARpre positivo quanto ao GMD, resultando em melhor CA dos bezerros mais eficientes. Bezerros mais eficientes ficaram menos tempo no cocho, com menor duração da refeição e com maior taxa de alimentação comparativamente aos animais menos eficientes. As correlações entre o consumo alimentar e peso corporal metabólico dos animais na pré e pós-desmama foram positivas, de média a alta magnitudes e significativas, enquanto que a correlação entre ganho médio diário foi próxima de zero. Os resultados sugerem que parte dos animais classificados pelo consumo alimentar na pré-desmama manterão a classificação na pós-desmama. Na fase pré-desmama bezerros classificados como mais eficientes tem ganho de peso similar, porém com menor consumo de leite e consumo de energia metabolizável do que bezerros menos eficientes. A estimativa do consumo alimentar residual na fase pré-desmama é fracamente relacionada à estimativa do consumo alimentar residual na fase pós-desmama, mostrando que o consumo alimentar residual não é consistente e repetível nos dois períodos.(AU)
Assuntos
Animais , Masculino , Feminino , Bovinos , Dietoterapia/veterinária , Ração Animal , Bovinos/crescimento & desenvolvimento , DesmameResumo
ABSTRACT: This study measured milk and solid feed intake in pre- weaning period and feed intake in postweaning period of Nellore calves, and to correlated them with performance traits and ingestive behavior of animals classified as most and least efficient. During pre weaning phase, feed efficiency was evaluated in 51 cow-calf pairs from 21±5 days after calving until weaning. During post-weaning phase, only male calves (n=23) were evaluated. Pre-weaning milk intake of calves was estimated based on cow's milk production. Pre-weaning daily metabolizable energy intake (MEI) of calves was estimated as the sum of MEI from milk and solid diet. There was no difference in ADG between calves with negative and positive pre RFI, with a consequent better feed conversion to more efficient calves. The most efficient calves spent less time at the feed bunk, with a shorter feeding duration and higher rate of intake, compared to the least efficient animals. Correlations between feed intake and metabolic body weight of the animals during pre- and postweaning phases were positive, of medium to high magnitude, and significant, while correlation between ADG values was close to zero. Results suggested that part of the animals ranked based on pre weaning feed intake won't maintain their rank during postweaning phase. In conclusion, calves classified as most efficient during pre-weaning phase have similar weight gain but lower milk intake and MEI than least efficient animals. The estimated pre RFI is weakly correlated with post RFI, showing that RFI is not consistent or repeatable across two periods.
RESUMO: Este estudo teve como objetivo mensurar o consumo de leite e sólidos no período pré-desmama e o consumo alimentar no período pós-desmama, e relacioná-los com características de desempenho e comportamento ingestivo de animais classificados como mais eficientes e menos eficientes. Na fase pré-desmama foram avaliados 51 pares vaca-bezerro da raça Nelore quanto à eficiência alimentar dos 21±5 dias após o parto até a desmama. Na fase pós-desmama, apenas os bezerros machos (n=23) foram avaliados. O consumo de leite dos bezerros na pré-desmama foi estimado pela produção de leite das vacas. O consumo diário de energia metabolizável do bezerro na pré-desmama (CEM), foi estimado pela soma do consumo de energia metabolizável do leite e do consumo diário de energia metabolizável da dieta. Bezerros CARpre negativo não diferiram dos bezerros CARpre positivo quanto ao GMD, resultando em melhor CA dos bezerros mais eficientes. Bezerros mais eficientes ficaram menos tempo no cocho, com menor duração da refeição e com maior taxa de alimentação comparativamente aos animais menos eficientes. As correlações entre o consumo alimentar e peso corporal metabólico dos animais na pré e pós-desmama foram positivas, de média a alta magnitudes e significativas, enquanto que a correlação entre ganho médio diário foi próxima de zero. Os resultados sugerem que parte dos animais classificados pelo consumo alimentar na pré-desmama manterão a classificação na pós-desmama. Na fase pré-desmama bezerros classificados como mais eficientes tem ganho de peso similar, porém com menor consumo de leite e consumo de energia metabolizável do que bezerros menos eficientes. A estimativa do consumo alimentar residual na fase pré-desmama é fracamente relacionada à estimativa do consumo alimentar residual na fase pós-desmama, mostrando que o consumo alimentar residual não é consistente e repetível nos dois períodos.
Resumo
Objetivou-se estimar a associação fenotípica entre a eficiência alimentar e o ganho em acabamento de carcaça de touros jovens da raça Nelore. Utilizaram-se informações de 98 touros jovens da raça Nelore, participantes de duas provas de eficiência alimentar que empregaram o sistema de cochos eletrônicos Growsafe®, as quais foram realizadas nos anos de 2015 e 2016, na fazenda Capim Branco, da Universidade Federal de Uberlândia. As provas de eficiência alimentar tiveram duração de 91 dias, sendo 21 dias de adaptação e 70 dias de avaliação. Os animais apresentavam idade média ao início e ao término do confinamento de 19,98 e 22,16 meses e peso inicial e final médio de 428,17 e 542,27kg, respectivamente. Verificou-se que os animais mais eficientes depositaram menos gordura, e os animais menos eficientes depositaram mais gordura durante o período de avaliação em confinamento. Observou-se que há uma associação fenotípica de baixa magnitude (0,29) entre o consumo alimentar residual (CAR) e o ganho em acabamento de carcaça (GACAB). Assim, pode-se inferir que, ao serem selecionados menores valores de CAR, haverá alguma interferência negativa em GACAB. Concluiu-se que animais mais eficientes (CAR negativo) podem apresentar menor deposição de gordura subcutânea, influenciando na qualidade de carcaça de bovinos da raça Nelore.(AU)
This study aimed to estimate the phenotypic association between feed efficiency and gain in carcass finishing of young Nelore bulls. Information from 98 young Nelore bulls participating in two feed efficiency tests using the Growsafe® electronic trough system, carried out in the years 2015 and 2016, at the Capim Branco farm of the Universidade Federal de Uberlândia was used .The feed efficiency tests lasted for 91 days, with 21 days of adaptation and 70 days of evaluation. The animals had a mean age at the beginning and end of the confinement of 19.98 and 22.16 months, and mean weight initial and end of 428.17 and 542.27kg, respectively. It was verified that most efficient animals deposited less fat, and the efficient animals deposited more fat during the evaluation period at the confinement. It was observed that there is a low magnitude phenotypic association (0.29) between the residual feed intake (RFI) and the gain in carcass finishing (GACAB). Thus, it can be inferred that by selecting lower values of residual feed intake there will be some negative interference in GACAB. It was concluded that the most efficient animals (negative RFI) may present lower deposition of subcutaneous fat, influencing the carcass quality of Nelore cattle.(AU)
Assuntos
Animais , Bovinos , Aumento de Peso , Ingestão de Alimentos , Gordura SubcutâneaResumo
Objetivou-se estimar a associação fenotípica entre a eficiência alimentar e o ganho em acabamento de carcaça de touros jovens da raça Nelore. Utilizaram-se informações de 98 touros jovens da raça Nelore, participantes de duas provas de eficiência alimentar que empregaram o sistema de cochos eletrônicos Growsafe®, as quais foram realizadas nos anos de 2015 e 2016, na fazenda Capim Branco, da Universidade Federal de Uberlândia. As provas de eficiência alimentar tiveram duração de 91 dias, sendo 21 dias de adaptação e 70 dias de avaliação. Os animais apresentavam idade média ao início e ao término do confinamento de 19,98 e 22,16 meses e peso inicial e final médio de 428,17 e 542,27kg, respectivamente. Verificou-se que os animais mais eficientes depositaram menos gordura, e os animais menos eficientes depositaram mais gordura durante o período de avaliação em confinamento. Observou-se que há uma associação fenotípica de baixa magnitude (0,29) entre o consumo alimentar residual (CAR) e o ganho em acabamento de carcaça (GACAB). Assim, pode-se inferir que, ao serem selecionados menores valores de CAR, haverá alguma interferência negativa em GACAB. Concluiu-se que animais mais eficientes (CAR negativo) podem apresentar menor deposição de gordura subcutânea, influenciando na qualidade de carcaça de bovinos da raça Nelore.(AU)
This study aimed to estimate the phenotypic association between feed efficiency and gain in carcass finishing of young Nelore bulls. Information from 98 young Nelore bulls participating in two feed efficiency tests using the Growsafe® electronic trough system, carried out in the years 2015 and 2016, at the Capim Branco farm of the Universidade Federal de Uberlândia was used .The feed efficiency tests lasted for 91 days, with 21 days of adaptation and 70 days of evaluation. The animals had a mean age at the beginning and end of the confinement of 19.98 and 22.16 months, and mean weight initial and end of 428.17 and 542.27kg, respectively. It was verified that most efficient animals deposited less fat, and the efficient animals deposited more fat during the evaluation period at the confinement. It was observed that there is a low magnitude phenotypic association (0.29) between the residual feed intake (RFI) and the gain in carcass finishing (GACAB). Thus, it can be inferred that by selecting lower values of residual feed intake there will be some negative interference in GACAB. It was concluded that the most efficient animals (negative RFI) may present lower deposition of subcutaneous fat, influencing the carcass quality of Nelore cattle.(AU)
Assuntos
Animais , Bovinos , Aumento de Peso , Ingestão de Alimentos , Gordura SubcutâneaResumo
Parâmetros sanguíneos, bem como medidas de desempenho, indicam eficiência alimentar dos animais para melhorar a rentabilidade da cadeia produtiva de carne. O objetivo deste estudo foi avaliar a associação entre parâmetros séricos, medidas de desempenho e eficiência de bubalinos de corte terminados em confinamento. Foram utilizados 75 animais de três grupos genéticos (GG: Jafarabadi, Mediterrâneo e Murrah), com média de peso e idade de 314 ± 117 kg e 13 ± 1,2 meses, respectivamente. Peso corporal, consumo de alimentos e de água dos animais foi acompanhado ao longo de todo o período experimental. Um sistema de cochos eletrônicos possibilitou o cálculo das medidas de eficiência [conversão alimentar (CA), eficiência alimentar (EA), consumo alimentar residual (CAR), ganho residual (GR) e consumo e ganho residual (CGR)] considerando 84 dias de experimento. Foram avaliados também ganho médio diário (GMD, kg/dia), consumo de matéria seca (CMS, kg/dia) e espessura de gordura subcutânea (EGS). Os animais apresentavam-se clinicamente saudáveis e tiveram amostras de sangue coletadas da veia jugular nos dias 0, 56 e 84 que foram avaliadas quanto aos níveis séricos de leptina, glicose, insulina, colesterol, triglicérides, lipoproteína de alta densidade (HDL), lipoproteína de baixa densidade (LDL) e lipoproteína de densidade muito baixa (VLDL) por meio de kits comerciais. Os dados foram analisados estatisticamente utilizando o programa SAS. Os GGs diferiram quanto ao desempenho, o grupo Jafarabadi apresentou melhor peso final, GMD, CMS, CA e EA do que os grupos Mediterrâneo e Murrah, porém menor EGS. As concentrações de algumas das variáveis sanguíneas foram influenciadas pelo GG e pela classe de eficiência (alta ou baixa), de acordo com as medidas de eficiência. Foram observadas algumas correlações entre os parâmetros séricos e o desempenho e medidas de eficiência (P0,05), assim como tendências (P0,10), sugerindo que as alterações desses parâmetros séricos ocorrem conforme o desempenho e a eficiência do animal. Além disso, colesterol, triglicérides e lipoproteínas foram os parâmetros mais associados as medidas de eficiência, o que implica na sua utilização como ferramentas para a seleção de bubalinos eficientes em um sistema produtivo de corte.
Blood parameters, as well as performance measures, indicate feed efficiency of animals to improve the profitability of the beef production chain. This study evaluated the association between serum parameters and feedlot performance, and efficiency measures of water buffalo for meat production. Seventy-five animals of three different genetic groups (GG:Jafarabadi, Mediterranean, and Murrah) were used, with initial body weight (BW) and age means of 314±117 kg and 13±1.2 months, respectively. Body weight, feed and water consumption of the animals were monitored throughout the experimental period. An automatic feeder system allowed to calculate the efficiency measures [feed conversion ratio (F:G), feed efficiency (G:F), residual feed intake (RFI), residual gain (RG), and residual intake and gain (RIG)] considering 84 days of experimentation. The average daily gain (ADG, kg/day), dry matter intake (DMI, in kg/day and %BW) were evaluated. Animals clinically healthy had blood samples collected from their jugular vein on days 0, 56, and 84 when serum levels of leptin, glucose, insulin, cholesterol, triglycerides, high-density lipoprotein (HDL), low-density lipoprotein (LDL), and very low-density lipoprotein (VLDL) were evaluated using commercial kits. Data were analyzed using the SAS program. GGs differed regarding performance, Jafarabadi group showed better BW, ADG, DMI, F:G and G:F than the Mediterranean and Murrah groups, but lower SFT. The concentrations of some of the blood variables were influenced by GG and efficiency class (high or low), according to the efficiency measures. Some correlations were observed between serum parameters and performance and efficiency measures (P0.05), as well as trends (P0.10), suggesting that changes in these serum parameters occur according to the performance and efficiency of the animal. Furthermore, cholesterol, triglycerides and lipoproteins were the parameters most associated with efficiency measures, implying their use as tools for the selection of efficient buffaloes in a beef production system.
Resumo
No atual cenário que estamos vivendo de enfrentamento da pandemia do COVID-19 e demanda por alimentos de qualidade e de alto valor agregado relacionando-se com questões de mudanças climáticas, a produção zootécnica deve-se atentar a buscar soluções na eficiência produtiva dos animais sendo mais sustentável. Este estudo teve como objetivo avaliar a emissão do metano entérico (CH4) e parâmetros fermentativos ruminais em ovinos selecionados através de medidas de eficiência alimentar. Para o teste de eficiência alimentar foram utilizados 40 ovinos jovens, machos não castrados, com peso inicial médio de aproximadamente 28,9 Kg e média de 120 dias de idade, confinados em baia coletiva com a presença de cochos eletrônicos (Intergado®). O teste foi realizado em dois períodos consecutivos de 60 e 61 dias, sendo possível a separação dos animais em três classes de acordo com a estimativa do consumo alimentar residual (CAR) e três para o consumo e ganho residual (CGR). Após classificação dos 40 animais pelo CAR, estes foram utilizados para a determinação da emissão de CH4 sendo alocados em câmaras respirométricas semi-abertas individuais, em duas fases ao término de cada período de teste de eficiência alimentar (junho e agosto 2019) onde também coletou-se amostras de líquido ruminal para avaliação dos parâmetros fermentativos. Com a utilização de software estatístico foram realizadas análises de variância e comparação entre as médias, além de análise de correlação entre os dados obtidos, assumindo-se nível de 5% de significância. Não foram encontradas diferenças estatísticas (P > 0,05) na produção de CH4 entérico e nos parâmetros fermentativos ruminais entre as classes de medidas de eficiência alimentar dos animais. Estes resultados indicam que a seleção de animais através das medidas de eficiência alimentar é algo interessante visando maior sustentabilidade no sistema produtivo, pois animais mais eficientes ingerem menos alimento, mantendo níveis satisfatórios de desempenho, sem que isso interfira na emissão de CH4 e nos parâmetros fermentativos ruminais.
In the current COVID-19 pandemic scenario that we are living and increasing global food demand, once again the animal production sector should try to seek solutions to increase its sustainability. The aim of this study was to evaluate the enteric methane (CH4) emissions and ruminal fermentative parameters in sheep selected through feed efficiency measures. For the food efficiency test, 40 non-castrated male sheep (with an initial weight of approximately 28.9 kg and 120 days of age) were confined in a collective pen with automatic feed stations (Intergado®). The study was conducted in two consecutive periods with the animals classified into three classes according to their residual food intake (RFI) and consumption and residual gain (CRG). For the evaluation of CH4 emissions the animals were allocated in individual respirometric chambers, in two phases at the end of each food efficiency experimental period (June and August 2019). In addition, ruminal fluid samples were also collected to evaluate their fermentative parameters. No statistical differences were found (P > 0.05) for the enteric CH4 production and ruminal fermentation parameters among the different classes of feed efficiency. These results indicate that the selection of animals through food efficiency measures is an interesting option to increase the sustainability of the animal production system, because more efficient animals ingest less food maintaining satisfactory levels of performance, without affecting CH4 emission and ruminal fermentative parameters.
Resumo
Objetivou-se com o presente estudo estimar parâmetros genéticos e fenotípicos em bovinos da raça Nelore (Bos taurus indicus) entre características de eficiência alimentar (CAR: consumo alimentar residual e IMS: ingestão de matéria seca) e de comportamento ingestivo (FR: frequência de refeição; MDR: média da duração da refeição; MCR: média de consumo por refeição; DR: duração da refeição; CR: critério de refeição; e TXC: taxa de consumo). Além disso, objetivou-se entender se o comportamento ingestivo do animal influencia na eficiência alimentar e verificar se as medidas de comportamento podem ser preditivas para CAR e IMS. Foram utilizados registros fenotípicos de 4.840 animais, com uma idade média de 13,54,15 meses. Os animais foram testados para eficiência alimentar entre os anos de 2011 e 2018 em 39 fazendas localizadas em quatro regiões brasileiras. O banco de dados contendo as informações de pedigree de 58.374 animais foi disponibilizado pela Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP, Ribeirão Preto, Brasil). A estimação dos componentes de (co)variância foi realizada em análises multi-características através da metodologia da máxima verossimilhança restrita. Foram estimadas as herdabilidades e correlações genéticas e fenotípicas entre todas as características de eficiência alimentar e comportamento ingestivo. As estimativas de herdabilidade foram de 0,240,01 (CAR), 0,300,01 (IMS), 0,630,01 (FR), 0,470,01 (MDR), 0,240,02 (MCR), 0,750,01 (DR), 0,490,01 (CR) e 0,870,00 (TXC). A DR apresentou as maiores correlações genéticas e fenotípicas estimadas com CAR (0,600,02 e 0,670,01, respectivamente) e fenotípica com IMS (0,780,01). Entre as características de comportamento ingestivo, a maior correlação genética foi observada entre MDR e DR (0,870,01) e fenotípica entre MCR e MDR (0,880,01). As características que tiveram melhor eficiência relativa de seleção com CAR foram CR, FR, MCR e DR, sendo DR a característica de eleição devido a sua estimativa de herdabilidade alta e maior correlação genética com CAR. Para IMS, os resultados indicaram que a resposta à seleção direta para essa característica foi superior a seleção indireta através das características de comportamento ingestivo. Concluiu-se que o comportamento ingestivo tem alta influência na eficiência alimentar dos animais e, portanto, pode ser incluído em programas de melhoramento genético. Além disso, as características de comportamento ingestivo também podem ser utilizadas para predizer o CAR e IMS, diminuindo os custos com mensuração e facilitando a identificação de bovinos da raça Nelore superiores para eficiência alimentar.
The aim of this study was to estimate genetic parameters in Nelore beef cattle (Bos taurus indicus) as well as the genetic and phenotypic correlations between feed efficiency-related traits (RFI: residual feed intake and DMI: dry matter intake) and feeding behavior-related traits (MF: meal frequency; AMD: average meal duration; ACM: average consumption per meal; MD: meal duration; MC: meal criteria; and CR: consumption rate). It also aimed to understand if feeding behavior influences feed efficiency and to verify if the behavior measures can be predictive for RFI and DMI. Phenotypic records from 4,840 animals, with an average of 13.54.15 months of age were used. Animals were tested for feed efficiency between 2011 and 2018 in 39 farms located in four Brazilian geographical regions. The database containing the pedigree information from 58,374 animals was provided by the National Association of Breeders and Researchers (ANCP, Ribeirão Preto, Brazil). The (co)variance components were estimated using the maximum-likelihood estimation in a multi-trait analysis. Heritability and genetic and phenotypic correlations between all traits were estimated. Heritability estimates were 0.240.01 (RFI), 0.300.01 (DMI), 0.630.01 (MF), 0.470.01 (AMD), 0.240.01 (ACM), 0.750.01 (MD), 0.490.01 (MC), and 0.870.00 (CR). The MD showed the highest genetic and phenotypic correlations estimated with RFI (0.600.02 and 0.670.01, respectively) and phenotypic with DMI (0.780.01), respectively. Among the feeding behavior traits, the highest genetic correlation was described between AMD and MD (0.870.01) and phenotypic between ACM and AMD (0.880.01). The traits that had the best relative efficiency of selection with RFI were MC, MF, ACM e MD, with MD being of choice due to its high heritability estimate and greater genetic correlation with RFI. However, for DMI, the results indicated that the response to direct selection for this trait was higher than the indirect selection through feeding behavior-related traits. With the results described herein, it should be noted that feeding behavior traits have a high influence on feeding efficiency-related traits and, therefore, they can be included in breeding programs. Further, feeding behavior traits can also be used to predict RFI and DMI, decreasing its cost and facilitating the identification of feed efficient animals.
Resumo
O objetivo deste estudo foi investigar os efeitos de duas medidas de eficiência alimentar nos índices zoométricos, nas características de carcaça e qualidade de carne. Foram utilizados 40 machos ovinos, não castrados, da raça Santa Inês, com idade inicial média de 187±30 dias e peso inicial médio de 44,5±4,1 kg. O consumo de matéria seca (CMS) foi registrado durante 61 dias e os animais foram pesados a cada 14 dias para obtenção do ganho médio diário (GMD). Foram calculados o peso vivo médio metabólico (PVMM), a taxa de crescimento relativo (TCR), a taxa de Kleiber (TK), a conversão alimentar (CA), o consumo de matéria seca em relação ao peso vivo (CMSPV), o consumo alimentar residual (CAR) e o consumo e ganho residual (CGR). Medidas morfométricas foram registradas no início e no final do experimento para o cálculo dos índices zoométricos. Após o abate foram registrados os pesos dos componentes não carcaça, peso de carcaça quente, pH, temperatura e foram aferidas as medidas do trato gastrointestinal. Após o resfriamento as carcaças foram avaliadas quanto a conformação, escore de acabamento, medidas internas e externas e separação dos cortes comerciais. Em seguida foi registrada a área de olho de lombo, espessura de gordura, perdas por cocção, força de cisalhamento (FC) e análise físico-química da carne. As análises estatísticas foram realizadas pelos procedimentos CORR e GLM (SAS, Inst., Inc.,Care, NC, USA). A análise de correlação (PROC CORR) foi feita pelo método de Pearson e a análise de variância (PROC GLM) foi realizada incluindo no modelo o efeito de classes de CAR ou RIG (SAS, Inst., Inc.,Care, NC, USA). A análise de correlação entre as características de eficiência, características de carcaça, qualidade de carne e índices zoométricos foram feitas pelo método de Pearson pelo PROC CORR (SAS, Inst., Inc., Care, NC, USA). Os animais mais eficientes pelo CAR e CGR tiveram um consumo de matéria seca de 0,700 Kg e 0,400 Kg, respectivamente, menor do que os menos eficientes. Os menores valores de conversão alimentar foram apresentados pelo grupo dos cordeiros mais eficientes, sendo 6,29 e 6,37, para CAR - e CGR +. Apesar destas variações nas medidas de eficiência, o ganho médio diário (0,230 kg/dia) não diferiu entre os grupos (P>0,05), assim como as demais variáveis de desempenho avaliadas. Ao analisar os índices zoométricos, as características de carcaça, os componentes não carcaça, os rendimentos dos cortes e a análise físico-química não foi observado diferença (P>0,05) entre os grupos classificados para CAR e para CGR, com exceção da FC, na qual os animais menos eficientes apresentaram uma carne com menor FC. A utilização de ambas as medidas estudadas são adequadas para identificar animais mais eficientes dentro de um grupo padronizado, sem causar prejuízos no desempenho, nas características de carcaça e qualidade de carne. .
This study aimed to investigate the effects of two feed efficiency measures on zoometric indices, on carcass characteristics and meat quality. Forty non-castrated male Santa Inês sheep were used, with an average initial age of 187±30 days and average starting weight of 44,5±4,1 kg. The dry matter intake (DMI) was recorded for 61 days and the animals were weighed every 14 days to obtain the average daily gain (ADG). There were calculated the metabolic body weight (MBW), relative growth rate (RGR), Kleibers ratio (KR), feed conversion rate (FCR), the dry matter intake in relation to the live weight (DMILW), residual feed intake (RFI) and the residual intake and gain (RIG). Morphometric measurements were recorded at the beginning and at the end of the experiment to calculate the zoometric indices. After slaughter, the weights of the non-carcass components, hot carcass weight, pH, Tº were recorded and the measurements of the gastrointestinal tract were measured. After cooling, the carcasses were classified in terms of conformation, finishing score, internal and external measures and separation of commercial cuts. Then the rib eye area, fat thickness, cooking losses, shear force and physical-chemical analysis of the meat were recorded. Statistical analyzes were performed using the CORR and GLM procedures (SAS, Inst., Inc.,Care, NC, USA). Correlation analysis (PROC CORR) was performed using Pearson's method and analysis of variance (PROC GLM) was performed including the effect of RFI or RIG classes (SAS, Inst., Inc., Care, NC, USA) in the model. The correlation analysis between efficiency characteristics, carcass characteristics, meat quality and zoometrics indices were performed using Persons method by PROC CORR (SAS, Inst., Inc., Care, NC, USA). The most efficient animals by RFI and RIG had a dry matter consumption of 0,700 Kg and 0,400 Kg, respectively, respectively, less than the least efficient. The lowest values of feed conversion were presented by the group of the most efficient lambs, being 6.29 and 6.37, for RFI - and RIG +. Despite these variations in efficiency measures, the average daily gain (0,230 kg / day) did not differ between groups (P> 0.05), as well as the other performance variables evaluated. When analyzing the zoometrics indices, the carcass characteristics, the non-carcass components, the cut yields and the physical-chemical analysis, no difference was observed (P> 0.05) between the groups classified for RFI and for RIG, except for the shear force (SF), in which the less efficient animals presented a meat with greater tenderness. The use of both measures studied are adequate to identify more efficient animals within a standardized group, without causing damage to performance, carcass characteristics and meat quality.
Resumo
Objetivou-se, com este estudo, estimar os parâmetros genéticos para características de eficiência alimentar, crescimento, reprodução e carcaça em rebanhos comerciais de bovinos Nelore, além da resposta correlacionada entre elas. Também objetivou-se realizar um estudo de seleção genômica avaliando métodos de predição, esquemas de validação e pseudo-fenótipos e conduzir um estudo de associação genômica ampla ponderado em passo único e análises de enriquecimento para características relacionadas à eficiência alimentar. Foram avaliados o consumo alimentar residual (CAR), consumo de matéria seca (CMS), conversão alimentar (CA), eficiência alimentar (EA), ganho em peso residual (GPR), consumo e ganho em peso residual (CGR), peso ao nascer (PN), peso aos 120 (P120), 240 (P240), 365 (P365) e 450 (450) dias de idade, perímetro escrotal aos 365 (PE365) e 450 (PE450) dias de idade, área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura (EG) e espessura de gordura na garupa (P8). Foram utilizadas informações de crescimento, reprodução e carcaça de 15.639 bovinos Nelore. Foram utilizados dados de testes de eficiência alimentar realizados entre 2011 e 2018, com informações fenotípicas e genotípicas de 4.329 e 3.594 animais, respectivamente. Os parâmetros genéticos foram estimados utilizando método single-step (ssGBLUP). Seis métodos de predição dos valores genômicos (GEBVs) foram utilizados: ssGBLUP, Bayes A, Bayes B, Bayes C, BLASSO e Bayes R. Três esquemas de validação foram utilizados: 1) aleatório: a base de dados foi aleatoriamente dividida em dez subconjuntos e a validação foi realizada em cada subconjunto por vez; 2) idade: a população foi dividida em treinamento e validação com base no ano de nascimento, sendo o primeiro grupo composto por animais nascidos entre 2010 a 2016 e o segundo nascido em 2017; 3) acurácia de predição do valor genético (EBV): foram divididos em dois grupos, sendo os animais com acurácia acima de 0,45 considerados como a população de treinamento; e abaixo de 0,45 a de validação. Foram avaliadas a acurácia e o viés de predição dos GEBVs. A porcentagem da variância explicada por janelas de 10 SNPs consecutivos foram usados para identificar regiões que explicam mais que 0,5% da variância genética aditiva de cada característica. As características relacionadas à eficiência alimentar apresentaram herdabilidades baixas a moderadas, variando de 0,07 a 0,20. As características relacionadas à eficiência alimentar apresentaram correlação genética baixa com crescimento (-0,19 a 0,24), reprodução (-0,24 a 0,27) e carcaça (-0,17 a 0,27), exceto para crescimento com CMS (0,32 a 0,56) e EA (-0,40). Os resultados demonstram que a habilidade de predição foi similares entre os métodos de predição. A baixa herdabilidade obtida, principalmente para EA (0,07±0,03) e CA (0,09±0,03), limitaram as acurácias dos GEBVs que variaram de baixa a moderada. Os coeficientes de regressão das estimativas foram próximos de 1, e similar entre os métodos de predição, esquemas de validação e pseudo-fenótipos. Em média e apesar da baixa variação (0,0331), a validação cruzada aleatória apresentou maior habilidade de predição, variando de 0,07 a 0,037, comparado a acurácia do EBV e idade. A habilidade de predição foi maior para o fenótipo ajustado para efeitos fixos do que para EBV e EBV desregredido (30,0 e 34,3%, respectivamente). As análises de enriquecimento com a ferramenta The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery (DAVID) revelaram várias vias funcionais como via de sinalização de neuropeptídios (GO: 0007218), regulação negativa da via de sinalização Wnt canônica (GO: 0090090), detecção de estímulos químicos envolvidos na percepção sensorial do sabor amargo (GO: 0001580), atividade do receptor de sabor amargo (GO: 0033038), neuropeptídio atividade hormonal (GO: 0005184), secreção biliar (bta04976), transdução do paladar (bta0742) e via de sinalização de glucagon (bta04922). A seleção para melhorar características de crescimento, reprodução e carcaça pode não alterar CAR, GPR e CGR. Por outro lado, o CMS, EA e CA podem levar a um aumento do peso corporal, além da seleção para CA levar a uma redução no rendimento de carcaça. A natureza genética das características relacionadas à eficiência alimentar pode levar a diferentes respostas genéticas. A escolha do critério de seleção mais adequado depende do sistema e dos objetivos de produção. Os métodos de predição genômica podem fornecer estimativas confiáveis dos valores genômicos para CAR, CMS, GPR e CGR, características que podem ter maior ganho genético e viabilidade de seleção comparada a EA e CA. As análises de enriquecimento mostraram genes associados ao metabolismo de insulina, leptina, glucose, proteína e lipídeo, balanço de energia, estresse oxidativo, sistemas zinc fingers, secreção biliar, saciedade, comportamento alimentar, salivação, digestão e absorção de nutrientes. A identificação das regiões genômicas e seus respectivos genes fornecem informações sobre bases genéticas e regulação biológica da eficiência alimentar em bovinos Nelore.
The aim of this study was to estimate genetic parameters for feed efficiency, growth, reproductive and carcass traits in commercial Nelore cattle herds, and the correlated response between them. It was also aimed perform a study of genomic selection evaluating prediction methods, validation approaches and pseudo-phenotypes, and conduct a weighted single-step genome-wide association study and an enrichment analysis for feed efficiency of feed efficiency related traits. Residual feed intake (RFI), dry matter intake (DMI), feed conversion ratio (FCR), feed efficiency (FE), residual live weight gain (RG), residual intake and live weight gain (RIG), birth weight (BW), weight at 120 (W120), 240 (W240), 365 (W365), and 450 (W450) days of age, scrotal circumference at 365 (SC365) and 450 (SC450) days of age, rib eye area (REA), backfat thickness (BF) and rump fat thickness (RF) were evaluated. The growth, reproductive and carcass traits records from 15,639 Nelore cattle were used. Data from feed efficiency tests carried out between 2011 and 2018, with phenotypic and genotypic information of 4,329 and 3,594 animals, respectively, were considered. The genetic parameters were estimated in a single step approach (ssGBLUP). Six prediction methods of genomic breeding values (GEBVs) were used: ssGBLUP, Bayes A, Bayes B, Bayes C, BLASSO, and Bayes R. Three validation approaches were used: 1) random: the data set was randomly divided into ten subsets and the validation was done in each subset at a time; 2) age: the population was divided into training and validation set based on the year of birth, with the first group consisting of animals born between 2010 and 2016 and the second group born in 2017; 3) genetic breeding value (EBV) accuracy: were divided into two groups, with animals with accuracy above 0.45 considered as the training population, and below 0.45 the validation set. We checked the accuracy and bias of GEBV. The percentage of variance explained by windows of 10 adjacent SNPs was used to identify regions that explained more than 0.5% of the additive genetic variance on each trait. The feed efficiency related traits showed low to moderate heritabilities, ranging from 0.07 to 0.20. Feed efficiency related traits showed low genetic correlations with growth (-0.19 to 0.24), reproductive (-0.24 to 0.27) and carcass (-0.17 to 0.27) traits, except for growth with DMI (0.32 to 0.56) and FE (-0.40). The results showed that the prediction ability were similar between the prediction methods. The low heritability obtained, mainly for FE (0.07±0.03) and FCR (0.09±0.03), limited the GEBVs accuracy, which ranged from low to moderate. The regression coefficient estimates were close to 1, and similar between the prediction methods, validation approaches, and pseudo-phenotypes. On average and despite low variation (0.0331), the random cross-validation presented the most accurate predictions, ranging from 0.07 to 0.037, than EBV accuracy and age. The prediction ability was higher for phenotype adjusted for fixed effects than for EBV and EBV deregressed (30.0 and 34.3%, respectively). Enrichment analysis by The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery (DAVID) revealed several functional vias such as neuropeptide signaling pathway (GO:0007218), negative regulation of canonical Wnt signaling pathway (GO:0090090), detection of chemical stimulus involved in sensory perception of bitter taste (GO:0001580), bitter taste receptor activity (GO:0033038), neuropeptide hormone activity (GO:0005184), bile secretion (bta04976), taste transduction (bta0742), and glucagon signaling pathway (bta04922). The selection to improve growth, reproductive and carcass traits would not change RFI, RG, and RIG. On the other hand, DMI, FE and FCR may lead to an increase in body weight, in addition to the selection for FCR may lead to a reduction in carcass yield. The genetic background of feed efficiency related traits are different, which would lead to different genetic responses. The choice of the most adequate selection criterion depends on the production system and goals. Genomic prediction methods can provide a reliable estimate of genomic breeding values for RFI, DMI, RG and RGI, traits that may have higher genetic gain and selection viability than FE and FCR. Enrichment analyzes showed genes associated with in insulin, leptin, glucose, protein and lipid metabolism, energy balance, heat and oxidative stress, zinc finger system, bile secretion, satiety, feed behavior, salivation, digestion and absorption of nutrients. The identification of these genomic regions and their respective genes provide information about genetic basis and biologic regulation for Nelore feed efficiency related traits.
Resumo
Este estudo foi realizado com o objetivo de avaliar o efeito de medidas de eficiência alimentar, desempenho, composição corporal e perfil lipídico de bovinos Nelore. A compilação de três experimentos de terminação e abate realizados no Centro Avançado de Pesquisa de Bovinos de Corte, com o total de 87 machos da raça Nelore, abatidos após período de terminação para ganho de gordura corporal. Os animais foram classificados como eficientes ou não eficientes de acordo com medidas de eficiência alimentar: consumo alimentar residual (CAR), ganho de peso residual (GPR) e consumo e ganho residual (CGR). Foram determinadas medidas de desempenho, composição corporal e perfil de AG da gordura do músculo Longissimus. As composições químicas do corpo vazio e da carcaça foram estimadas de acordo com equações da literatura. Coeficientes de correlação de Pearson foram calculados para investigar a associação entre as variáveis estudas. O modelo estatístico incluiu efeitos fixos, classe de eficiência, rebanho e dieta. Idade ao abate utilizada como co-variável. Ano utilizado como efeito aleatório. As interações entre os efeitos fixos foram testadas, sendo não significativas e retiradas do modelo. As médias foram calculadas pelo método dos quadrados mínimos e comparadas pelo teste t ao nível de 5% de probabilidade. Os efeitos foram considerados significativos quando P 0,05, e tendência quando P 0,10. Animais classificados como eficientes de acordo com o GPR apresentaram maior ganho médio diário de peso (1,16 vs. 0,860kg/d; P <,0001) e maior CGR que os animais não eficientes. Todas as medidas de eficiência alimentar foram correlacionadas entre si. Não houve efeito significativo da classe de CAR sobre o desempenho dos animais, entretanto, animais classificados como eficientes de acordo com o CGR apresentaram menor consumo de matéria seca (6,31 vs. 7,15kg/d; P = 0.004) e maior ganho de peso (1,11 vs. 0,890kg/d; P = 0.002) que os não eficientes. A composição corporal dos animais não foi afetada pela eficiência alimentar em nenhuma das medidas estudadas. Animais classificados como eficientes quanto ao CAR, quando comparados aos não eficientes, apresentaram menor teor dos AG vacênico (1,61 vs. 1,80g/100g; P = 0,010), CLA (0,355 vs. 0,420g/100g; P = 0,087) e docosatetraenóico (0,568 vs. 0,718g/100g; P = 0,044), em contrapartida, apresentam maior teor dos AG eicosadienóico (0,053 vs. 0,042g/100g; P = 0,076) e docosapentaenóico (0,415 vs. 0,294g/100g; P = 0,065). A classificação pela medida GPR exerceu efeito no AG araquídico sendo menor (0,068 vs. 0,077g/100g; P = 0,011) nos animais eficientes, também influenciou o AG esteárico sendo maior (15,0 vs. 13,8g/100g; P = 0,095) nos animais eficientes. A mesma influencia sobre o AG esteárico ocorreu na classificação por CGR (14,9 vs. 13,7g/100g; P = 0,078). Em conclusão as medidas de eficiência utilizadas CAR, GPR e CGR não impactaram negativamente as características da carcaça. A classificação quanto ao CAR foi a que mais teve efeito sobre o perfil de ácidos graxos, influenciando principalmente as famílias -3 e -6. Entretanto, os animais eficientes quanto a GPR e CGR apresentaram influência negativa sobre a atividade da enzima 9 dessaturase 18, o que pode impactar negativamente a qualidade da carne, ao aumentar o ponto de fusão da gordura presente no músculo Longissimus, prejudicando as características sensoriais da carne.
This study was carried out to evaluate the effect of measures of feed efficiency, performance, body composition and lipid profile of Nellore cattle. The compilation of three finishing and slaughtering experiments carried out at the Advanced Center for Research in Beef Cattle, with a total of 87 Nellore males, slaughtered after the finishing period to gain body fat. The animals were classified as efficient or inefficient according to feed efficiency measures: residual feed intake (RFI), residual weight gain (RWG) and consumption and residual gain (RIG). Measures of performance, body composition and FA profile of the Longissimus muscle fat were determined. The chemical compositions of the empty body and carcass were estimated according to equations in the literature. Pearson correlation coefficients were calculated to investigate the association between the studied variables. The statistical model included fixed effects, efficiency class, herd and diet. Age at slaughter used as a covariate. Year was used as a random effect. Interactions between fixed effects were tested, being non-significant and removed from the model. Means were calculated using the least squares method and compared using the t-test at the 5% probability level. The effects were considered significant when P 0.05, and trend when P 0.10. Animals classified as efficient according to the RWG had higher average daily weight gain (1.16 vs. 0.860kg/d; P <.0001) and higher RIG than non-efficient animals. All feed efficiency measures were correlated with each other. There was no significant effect of the RFI class on the performance of the animals, however, animals classified as efficient according to the RIG had lower dry matter intake (6.31 vs. 7.15kg/d; P = 0.004) and higher weight gain (1.11 vs. 0.890kg/d; P = 0.002) than the inefficient ones. Animal body composition was not affected by feed efficiency in any of the measures studied. Animals classified as efficient in terms of RFI, when compared to non-efficient ones, had a lower content of vacenic FA (1.61 vs. 1.80g/100g; P = 0.010), CLA (0.355 vs. 0.420g/100g; P = 0.087) and docosatetraenoic (0.568 vs. 0.718g/100g; P = 0.044), on the other hand, have higher content of eicosadienoic FA (0.053 vs. 0.042g/100g; P = 0.076) and docosapentaenoic (0.415 vs. 0.294g/100g; P = 0.065). The classification by the measure RWG had an effect on arachidic FA being smaller (0.068 vs. 0.077g/100g; P = 0.011) in efficient animals, it also influenced the stearic FA being higher (15.0 vs. 13.8g/100g; P = 0.095) in efficient animals. The same influence on stearic AF occurred in the classification by RIG (14.9 vs. 13.7g/100g; P = 0.078). In conclusion, the efficiency measures used RFI, RWG and RIG did not negatively impact the carcass characteristics. The classification regarding the RFI was the one that had the most effect on the fatty acid profile, influencing mainly the -3 and -6 families. However, RWG and RIG efficient animals had a negative influence on the activity of the enzyme 9 desaturase 18, which can negatively impact meat quality by increasing the melting point of the fat present in the Longissimus muscle, impairing the sensory characteristics of the beef.
Resumo
Primeiramente os dados de consumo voluntário de água de 181 touros Nelore foram utilizados para a identificação dos principais fatores que influenciam a ingestão de água. Mensurações de peso corporal do animal (PC), consumo de matéria seca (CMS) e variáveis do ambiente térmico, no sudeste do Brasil durante os meses de inverno, foram relacionadas com o consumo de água por análise de regressão. As características com maiores correlações com o consumo de água foram utilizadas na análise de regressão múltipla para elaboração de uma equação de predição do consumo de água. As variáveis que mais influenciaram o consumo de água (CA) foram o consumo de matéria seca (CMS), o peso do animal (PM), seguidos pela umidade relativa (UR) e a temperatura mínima. A partir destes dados foi elaborada a equação, CA = 4,719 + 0,979 x CMS + 0,123 x PVM - 0,195 x Tmin 0,079 x UR, R2=0,26 (P<0,001). Evidenciando que 74% da variação do consumo de água pelos touros não foi explicada pelas variáveis consideradas na equação, levantou-se a hipótese da variação individual entre animais. Dessa forma, no segundo estudo objetivou-se propor medidas de eficiência hídrica de bovinos em confinamento e avaliar a relação destas medidas com dados de performance. Foram utilizados dados de 220 touros da raça Nelore de 10 a 24 meses de idade, no sudeste do Brasil. Dados de ingestão de água (IA), consumo de matéria seca (CMS), peso vivo, ganho de peso médio diário (GMD) foram coletados. Foi calculada a conversão hídrica (CH) e o consumo hídrico residual (CHR), à semelhança dos índices de eficiência alimentar. O CHR se baseou em uma estimativa de consumo projetada a partir do peso vivo metabólico e do GMD. Os animais mais eficientes (CHR -) apresentaram consumo alimentar residual (CAR) também negativo, menor ingestão de água e melhores índices de conversão hídrica. Os animais menos eficientes (CHR+) consumiram mais água, mas apresentaram CMS e ganho de peso semelhantes aos animais mais eficientes, na maioria das provas analisadas. O CHR não correlacionou com GMD e com peso vivo metabólico, quando analisados todos os animais e os mais eficientes. A correlação entre o CHR e o consumo alimentar residual (CAR) foi positiva (0,40), indicando que os animais com maior eficiência hídrica também tendem a ser mais eficientes na utilização do alimento consumido. A seleção para CHR buscando animais mais eficientes não deve alterar o ganho de peso de touros jovens da raça Nelore.
First, voluntary water consumption data of 181 Nellore bulls were used to identify the main factors that influence water intake. Measurements of body weight of animals (BW), dry matter intake (DMI) and thermal environment variables, in southeastern Brazil during the winter months, were related to water consumption by regression analysis. The characteristics with the highest correlations with water intake were used in the selected regression analysis to create a water intake prediction equation. The variables that most influence water intake (WI) are dry matter intake (DMI), metabolic body weight (MBW), followed by relative humidity (RH) and minimum temperature. From these data, an equation was created, WI = 4.719 + 0.979 x DMI + 0.123 x MBW - 0.195 x Tmin - 0.079 x RH, R2 = 0.26 (P <0.001). It shows that 74% of the variation in water intake by bulls was not explained by variations in the equation, the hypothesis of individual variation between animals was raised. Thus, no second study aimed to propose water efficiency measures for cattle in feedlots and to evaluate a relationship between these measures and performance data. Data from 220 Nellore bulls from 10 to 24 months of age in southeastern Brazil were used. Data on water intake (WI), dry matter intake (DMI), body weight, average daily gain (ADG) were collected. Water conversion (WC) and residual water intake (RWI) were calculated, similar to the food efficiency indexes. RWI is based on an estimate of consumption projected from metabolic live weight and ADG. The most efficient animals (RWI-) also presented negative residual feed intake (RFI), less water intake and better water conversion rates. The less efficient animals (RWI +) consumed more water, but presented DMI and ADG similar to the more efficient animals, in most of the analyzed tests. RWI did not correlate with ADG and metabolic body weight, when analyzing all animals and the most efficient. The correlation between RWI and residual feed intake (RFI) was positive (0.40), and it was registered that animals with greater water efficiency also proved to be the most efficient in the use of the food consumed. The selection for RWI for more efficient animals should not alter the weight gain of young Nellore bulls.
Resumo
The Residual Feed Intake (RFI) is a measure of feed efficiency usually evaluated post-weaning, and according to available evidences in the literature is highly correlated to RFI measured at other ages. The objective of present study was examining the reclassification of RFI in Nellore bulls classified in two post-weaning tests. In post-weaning performance test 127 Nellore males (210 ± 45 days of age) in feedlot collective pens (GrowSafe Systems®) were evaluated. Data of dry matter intake (DMI, 7.23 ± 1.72 kg/day) and mean body weight (BW, 306.72 ± 7.54 kg) were collected during 112 days, and the animals were classified according to RFI. The RFI was estimated as multiple regression error of DMI on average daily gain (ADG) and metabolic weight (BW0.75). Thereafter, a sample of 24 animals (408 ± 45 days old), 12 high (2.34 ± 0.24 kg DM/day) and 12 low RFI animals (-1.48 ± 0.24 kg DM/day) were reclassified after performance post-weaning test in feedlot for 84 days in individual pens. The diet was offered twice daily, contained corn silage (53.6% DM), Urochloa hay (10.0% DM), ground corn (21.8% DM), soybean meal (11.6% DM) and mineral supplement (3.0% DM). The experimental design was completely randomized. Data were analyzed using GLM procedure (SAS Inst., Inc., Cary, NC), fitting a model including the fixed effects of RFI class and the initial weight as linear covariate. Means were
O artigo não apresenta resumo em português.
Resumo
Feed is the most expensive input in any livestock production system including beef cattle, therefore feed efficiency improvements can contribute to cost reduction. Residual feed intake (RFI) is one of the important measures of animal efficiency and can be defined as the difference between actual feed intake (measure at individual or group pens) and predicted feed intake that is required for the observed rate of gain and body weight (BW). The objective here was to evaluate the housing type (individual or group) on variation of traits such as dry matter intake (DMI, kg/d and %BW), average daily gain (ADG), RFI and gain:feed (G:F) in a dataset of Nellore young bulls obtained from performance tests of 83±16 days long after adaptation period, conducted between 2007 and 2013. The animals (273 ± 27 days of age at the beginning of the test) were obtained from selected, traditional and control Nellore lines of Instituto de Zootecnia. The animals were housed in individuals pens (IP) (2007-2012) or group pens (GP) (2012-2013) equipped with the GrowSafe® system (voluntary intake calculated automatically by the system). In IP, animals were fed twice a day and had water available all the time. Voluntary food intake was calculated as the difference between supplied and refused food. Leftovers were collected daily, weighed, and then adjusted to correspond to 10% of the total supplied. A mixed
O artigo não apresenta resumo em português.
Resumo
A alimentação é o principal custo de produção em bovinos de corte. O rebanho de cria demanda 65% de toda a energia alimentar consumida em sistemas de produção de gado de corte. Aumentar a eficiência de utilização do alimento para produção de bezerros ou carne deve ser busca constante. A característica consumo alimentar residual (CAR) vem ganhando importância na seleção de novilhas de reposição pois ajuda a selecionar animais mais eficientes sem carregar o aumento do tamanho adulto destas fêmeas. Este estudo foi desenvolvido com o objetivo de relacionar o CAR e outras medidas de eficiência alimentar com características de desempenho e, principalmente, de composição corporal. Para isso, foi realizado um teste de consumo alimentar, com duração de 70 dias e 21 dias de adaptação, e medidas de ultrassonografia de carcaça em 60 novilhas brangus para geração dos dados. Os animais foram classificados em baixo, médio e alto CAR com base no desvio padrão da característica. Foram estudadas 4 equações de regressão linear para cálculo do CAR, CARegs (com inclusão da EGCf no modelo), CARegsII (com inclusão da EGPf no modelo) e CARegsIII (com inclusão da soma da EGCf e EGPf no modelo). Não houve diferença entre os classificações de CAR, CARegs, CARegsII e CARegsIII e as medidas de composição corporal final (espessura de gordura subcutânea na costela e na picanha, gordura intramuscular e área de olho de lombo). A medida de gordura que mais se relacionou com o CAR foi a EGCf (0,24) e sua inclusão no modelo gerou a equação com o maior R2 (0,25). A classificação de CAR não alterou a composição corporal das novilhas, porém a pequena correlação com EGCf e o aumento do coeficiente de determinação justificam a inclusão de EGCf no modelo para cálculo do CAR.
Feeding animals is the major cost in catlle herds. Cow/calf demands 65% of the total feed energy aported in catlle systems. Improve feed efficiency to produce calves and meat with lower costs has been a constant aim. Residual feed intake (RFI) has been described as an important efficiency trait to select heifers because helps to identify more efficient individuals without carrying heavier mature size. The objective of this studie was the relationship between RFI - and other measures of feed efficiency - and body composition and production traits. The traits were observed in a feed intake test and sequencial mesures of body composition with ultrasound equipment in 60 Brangus heifers. The feed intake test spend 70 days with previous 21 days of adaption period. The heifers were classified in low, medium and high RFI based on it`s standard deviation. Four regression equation were studied to estimate RFI, RFIegs (including EGCf in the model), RFIegsII (including EGPf in the model) and RFIegsIII (including EGCf + EGPf in the model). There were not any differences between RFI, RFIegs, RFIegsII RFIegsIII and final body composition traits. The fat measure that had the higher relationship with RFI was EGCf (0,24) and the regression equation with it`s inclusion in the model had the major R2 (0,25). The RFI level did not change the body composition of brangus heifers, but it`s low correlation with EGCf and the increasing R2 support the inclusion of this trait in the model to predict RFIegs.
Resumo
MARCILLI, G. M. Avaliação da associação entre microbioma fecal e eficiência alimentar em bovinos da raça Angus. 73 f. Dissertação (Mestrado) Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos, Universidade de São Paulo, Pirassununga, 2019. A eficiência alimentar (EA) é uma característica de grande importância para a sustentabilidade do sistema de produção animal. Animais eficientes apresentam melhor aproveitamento de alimentos e redução considerável na emissão de gases poluentes, diminuindo o impacto ambiental da pecuária. Contudo, a EA é uma característica de difícil mensuração. Com a crescente evidência de que hospedeiros e seus microbiomas interagem em associações complexas, o objetivo dessa pesquisa foi avaliar a associação entre o microbioma fecal e a eficiência alimentar em bovinos da raça Angus (Bos taurus). Foram utilizadas amostras de fezes de 64 animais mensurados quanto à ingestão de matéria seca (IMS), conversão alimentar (CA), consumo alimentar residual (CAR), ganho de peso diário (GMD) e características de carcaça. As amostras tiveram DNA total extraído e foram identificados os perfis de bactérias e arquéias presentes e suas possíveis relações com a EA a partir do sequenciamento de regiões específicas do gene 16s. Além disso, foram selecionados animais de alta eficiência alimentar (AEA, n=15) e baixa eficiência alimentar (BEA, n=15), pela medida de CAR, que tiveram os dados de microbioma comparados entre os dois grupos. Foi observado que os grupos de AEA e BEA apresentaram desempenho igual quanto ao ganho de peso, características de carcaça. Por outro lado, os animais de BEA tiveram maior consumo de alimentos e também apresentaram maior presença de micro-organismos metanogênicos. Com base em estudos anteriores e nos resultados encontrados neste estudo criou-se a hipótese de que animais divergentes para eficiência alimentar podem apresentar diferenças no microbioma fecal que podem ser utilizadas como uma forma de se identificar animais superiores para essa característica nos levando a uma melhor compreensão dos mecanismos envolvidos na EA.
MARCILLI, G. M. Evaluation of the association betweeen fecal microbiome and feed efficiency in Angus cattle. 73 f. M.Sc. Dissertation Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos, Universidade de São Paulo, Pirassununga, 2019. Feed efficiency (FE) is a phenotype of great importance for the sustainability of the livestock production system. Efficient animals have better use of food and considerable reduction in greenhouse gas emissions, reducing the environmental impact of livestock. However, FE is a trait difficult to measure. With increasing evidence that the hosts and their microbiomes interact in complex associations, the aim of this study was to evaluate the association between fecal microbiome and feed efficiency in Angus cattle (Bos taurus). Stool samples from 64 animals with phenotype for dry matter intake (DMI), feed conversion ratio (FCR), residual feed intake (RFI), average daily gain (ADG) and carcass characteristics were used. The samples had total DNA extracted and the profiles of bacteria and Arquéia and their possible relationship with EA were identified. In addition, animals with high feed efficiency (HFE, n = 15) and low feed efficiency (LFE, n = 15) were selected by RFI measurement, which had microbiome data compared between the two groups. It was observed that the HFE and LFE groups presented equal performance regarding weight gain and carcass traits. On the other hand, the animals from LFE had higher feed intake and presented higher presence of methanogenic microorganisms. Based on previous studies and the results found in this research, it was hypothesized that animals differing in feed efficiency may present differeces in fecal microbiome that can be used as a way to identify superior animals for this trait. We believe this is a pioneer result in beef cattle that can lead us to a better understanding of the mechanisms involved in FE.
Resumo
Objetivou-se com esse estudo avaliar a utilização da termografia infravermelho e a relação e interações entre medidas de eficiência e desempenho, de diferentes grupos genéticos de bubalinos na fase de crescimento em confinamento. Foram utilizados 75 bubalinos (Bubalus bubalis) machos não castrados de 3 diferentes grupos genéticos (Jafarabadi, Mediterrâneo e Murrah). De modo que 25 animais de cada raça (390 + 32 dias de idade, 310 + 61,27 kg) foram alojados em baias coletivas e alimentados de forma ad libitum. Foram avaliadas: conversão alimentar (CA), eficiência alimentar (EA), consumo alimentar residual (CAR), ganho residual (GR) e consumo ganho residual (CGR). Os animais foram classificados para cada medida de eficiência em três grupos: baixo (<0,5 DP média), médio (dentro de ± 0,5 DP) e alto (> 0,5 DP média), e em seguida, alto e baixo foram comparados utilizando Proc MIXED (SAS). As imagens de infravermelho foram coletadas nas regiões do olho, face, costelas, escroto, patas e peito. Significância foi considerada se P < 0,05. Houve interação entre os grupos genéticos para o CAR (P < 0,01), permitindo classificar os bubalinos Jafarabadi de baixo CAR como mais eficientes, e uma tendência foi encontrada (P = 0,08) para a classe alto CGR apresentando os melhores índices. As medidas de eficiência presentaram efeito no qual animais de baixo CAR apresentaram maior IMS e maior EA (P < 0,01), enquanto que animais das classes alto GR e alto CGR apresentaram os melhores índices de desempenho. Foi observada correlação entre os critérios de eficiência CAR e CGR para as temperaturas na região do peito (0,18 e -0,17, respectivamente). A menor temperatura encontrada nos olhos permitiu classificar os animas Jafarabadi como mais eficientes segundo o baixo CAR (P < 0,01), enquanto que para a medida de eficiência CGR as medidas térmograficas foram eficientes em classificar o grupo Jafarabadi do alto CGR com menores temperaturas no olho (P < 0,01) e nariz (P = 0,03). Houve efeito de grupo genético em determinadas regiões de análise da termografia infravermelho. A temperatura na região do peito permitiu classificar os animais de baixo CAR com menores temperaturas (30,29 oC; P = 0,04) e a região do nariz com menores temperaturas na classe alto CGR (26,23 oC; P = 0,04). Portanto, a melhor região para análise de termografia para predizer a eficiência alimentar segundo o CAR é o peito e para o CGR, a região do nariz de bubalinos confinados em condições tropicais.
The aim of this study was evaluate the use of infrared thermography and the relation and interaction with efficiency measures and performance of different genetic groups of water buffaloes during the growth phase in feedlot. 75 male non-castrated water buffaloes (Bubalus bubalis) of 3 genetic groups (Jafarabadi, Mediterranean and Murrah) were used. Thus, 25 animals of each breed (390 + 32 days of age, 310 + 61.27 kg) were allocated in collective pens and fed ad libitum. The following variables were evaluated: feed conversion (FC), feed efficiency (FE), residual feed intake (RFI), residual BW gain(RG) and residual intake and BW gain (RIG). The animals were classified for each measures of efficiency as Low (<0.5 SD mean), Medium (within ± 0.5 SD), and High (>0.5 SD mean) groups, and then High and Low groups were compared using Proc MIXED (SAS). Infrared thermography images were collected from regions of the eye, snout, face, ribs, scrotum, forelegs and breast. Significance was considered if P <0.05. There was interaction between the genetic groups for RFI (P < 0.01), classify low RFI Jafarabadi as more efficient and a trend was observed (P = 0.08) for Jabarabadi high RIG with the best indexes. The efficiency measure had an effect in animals with low CAR presented higher DMI and higher FE (P <0.01), while animals from the high RG and high RIG presented the best performance index. Correlation between the RFI and RIG efficiency for temperatures in the breast (0.18 and -0.17, respectively) was observed. The lower temperature found in the eyes classify the Jafarabadi more efficient according to the Low CAR (P < 0.01), while for the RIG efficiency measure the thermographic measurements were efficient in classifying the Jafarabadi group of the high RIG with lower temperatures presented in the eye (P < 0.01) and snout (P = 0.03). There was a genetic group effect in certain regions of infrared thermography analysis. When the temperatures were analyzed according to efficiency measures, the chest region allowed to classify the animals of the low RFI class with lower temperatures (30.29 oC; P = 0.04) and the nose region showed lower temperatures in the RIG class(26.23 °C, P = 0.04). Therefore, the best region for thermography analysis to predict feed efficiency according to the RFI is the chest and the RIG, the nose region of buffaloes confined under tropical conditions.
Resumo
Este trabalho foi conduzido com o objetivo de avaliar e quantificar as relações existentes entre o consumo alimentar residual (CAR), inclusão de glicerina bruta na dieta, características de carcaça e qualidade de carne em bovinos Nelore. Foram utilizados 28 animais não castrados, avaliados previamente quanto ao CAR, terminados em confinamento, com dietas formuladas com silagem de milho, milho moído, casca de soja, farelo de girassol e núcleo mineral, incluindo ou não o ingrediente glicerina em substituição ao milho. Os animais foram abatidos quando atingiram o tempo de 96 dias de confinamento. Após o abate, foram determinados peso de carcaça quente, rendimento de carcaça, peso de alguns componentes não- carcaça, peso de carcaça resfriada e de seus respectivos cortes primários, área de olho de lombo, espessura de gordura subcutânea, peso de cortes cárneos comerciais e coletadas amostras do músculo Longissimus para análises de composição química, cor, perfil de ácidos graxos, força de cisalhamento, perdas por cocção e índice de fragmentação miofibrilar da carne não maturada e após 7 e 14 dias de maturação. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado com arranjo fatorial com 2 fatores, as análises de variância foram realizadas pelo procedimento MIXED do programa SAS, considerando como efeitos fixos classe de CAR e dieta, e como efeito aleatório o grupo genético. As médias foram calculadas pelo método dos quadrados mínimos e comparadas pelo teste de t ao nível de 5% de probabilidade. Dentre todas as variáveis estudadas, diferenças significativas entre as classes de CAR foram detectadas para força de cisalhamento na carne não maturada (4,68 vs 3,69 kg, P = 0,0237 para CAR negativo e positivo, respectivamente, e concentração do ácido graxo cis-vacênico (1,62 vs 1,81 g/100g, P = 0,0062 para CAR negativo e positivo, respectivamente). Foi detectado efeito significativo da presença do ingrediente glicerina na dieta no percentual de proteína (30,4 vs 37,6 g/100g, P = 0,0368 para dieta sem e com glicerina, respectivamente) e gordura (31,3 vs 27,2 g/100g, P = 0,0485 para dieta sem e com glicerina, respectivamente) do músculo Longissimus. No perfil de ácidos graxos foi observada diferença entre as dietas, principalmente nos ácidos pentadecanoico (0,366 vs 0,540 g/100g, P = 0,0052), palmítico (26,1 vs 24,7 g/100g, P = 0,0386), heptadecanoico (1,06 vs 1,53 g/100g, P = 0,0235), heptadecenoico (0,984 vs 1,52 g/100g, P = 0,0285) e esteárico (12,5 vs 11,6 g/100g, P = 0,0441), respectivamente para animais alimentados sem e com glicerina. Bovinos Nelore de diferentes fenótipos de CAR e alimentados com glicerina apresentam boas características de carcaça e de qualidade de carne, enfatizando a importância do uso de características de eficiência alimentar e do subproduto em rebanhos bovinos de corte.
This work was conducted with the objective of evaluating and quantifying the relationships among residual feed intake (RFI), crude glycerin, carcass traits and meat quality in young Nellore bulls. Twenty-eight non-castrated Nellore bulls, previously evaluated for RFI, finished in feedlot, with diets composed by corn silage, ground corn, soybean hull, sunflower meal and mineral nucleus, including or not the ingredient glycerin in place of ground corn. Animals were slaughtered when they reached 480 kg of average body weight. After slaughter, hot carcass weight, carcass yield, weight of non-carcass components, cold carcass weight and their respective primary cuts, rib eye area, subcutaneous fat thickness, commercial meat cuts weight were determined and Longissimus muscle samples were collected for analysis of chemical composition, color, fatty acid profile, shear force, cooking losses and myofibrillar fragmentation index of the unaged meat and aged after 7, 14 and 21 days. The experimental design was completely randomized with factorial arrangement of 2 factors. Analysis of variance was performed using SAS MIXED procedure, considering as fixed effects diet and RFI classes and as random effect the genetic group. Least square means were calculated and compared by the t test at 5% of probability. Among all the studied variables, significant differences between RFI classes were detected for shear force of unaged meat (4.68 vs 3.69 kg, P = 0.0237 for negative and positive RFI, respectively), myofibrillar fragmentation index of meat aged for 14 days (72.0 vs 70.9%, P = 0.0481 for negative and positive RFI, respectively), and cis-vaccinic fatty acid concentration (1.62 vs 1.81 g/100g, P = 0.0062 for negative and positive RFI, respectively). Significant effect of glycerin presence was detected in percentage of protein (30.4 vs 37.6 g/100g, P = 0.0368 for for animals fed without and with glycerin, respectively) and fat (31.3 vs 27.2 g/100g, P = 0.0485 for animals fed without and with glycerin, respectively) of Longissimus muscle. Glycerin-fed animals showed a difference in the fatty acid profile, mainly in pentadecanoic (0.366 vs 0.540 g/100g, P = 0.0052), palmitic (26.1 vs 24.7 g/100g, P = 0,0386), heptadecanoic (1.06 vs 1.53 g/100g, P = 0.0235), heptadecenoic (0.984 vs 1.52 g / 100g, P = 0.0285) and stearic (12.5 vs 11.6 g/100g, P = 0.0441) fatty acids, respectively for animals fed without and with glycerin. Nellore cattle of different RFI phenotypes and diet glycerin inclusion have good carcass and meat quality characteristics, emphasizing the importance of the use of feed efficiency traits in beef cattle, so that meat production is increasingly competitive and sustainable.
Resumo
O consumo alimentar residual (CAR) é uma característica de eficiência alimentar que expressa a diferença entre o consumo observado e o predito, e identifica animais que consomem menor quantidade de alimento independente de características de mantença e produção. O objetivo do presente estudo foi avaliar a eficiência alimentar de vacas Nelore em lactação, e o efeito da classe de eficiência alimentar no desempenho e produtividade das vacas, do nascimento à desmama dos bezerros. Foram avaliadas 53 vacas contemporâneas, com peso médio inicial de 484±43 kg e idade média de 1120±37 dias, submetidas a teste de desempenho no GrowSafe® Systems, dos 22±5 até os 190±13 dias em lactação, para obtenção do consumo de matéria seca (CMS) diário. A dieta foi volumosa, com relação volumoso:concentrado de 90:10. Vacas e bezerros foram pesados a cada 23 dias, para o cálculo da eficiência produtiva (EP). Foram também obtidos o ganho médio diário (GMD) e o peso corporal médio metabólico (PV0,75), utilizados no cálculo do CAR das vacas e avaliação do desempenho dos bezerros. A produção de leite das vacas foi avaliada aos 63±5, 84±5 e 152±5 dias em lactação por meio de ordenha mecânica. O leite foi analisado quanto aos teores de gordura, proteína e lactose, constituintes utilizados para o cálculo da produção de leite corrigida (PLC) para energia. Aos 21±5, 82±5, 143±8 e 184±12 dias em lactação as vacas foram avaliadas quanto à espessura de gordura subcutânea (EGS) por ultrassonografia. Aos 15±5, 41±5, 62±5 e 124±5 dias após o parto, foram coletadas amostras de sangue para análises dos metabólitos de status energético (glicose, colesterol, triglicérides e -hidroxibutirato), status proteico (albumina, ureia e creatinina), status mineral (cálcio, fósforo e magnésio) e status hormonal (insulina e cortisol). O CAR das vacas foi calculado considerando CMS, GMD e PV0,75 obtidos na primeira fase de lactação (dos 22±5 aos 102±7 dias em lactação), e as vacas foram classificadas em CAR negativo (mais eficientes) ou CAR positivo (menos eficientes). O modelo de CAR explicou 53% da variação do CMS. As médias de CMS, GMD, PLC, EGS e EP foram de 12,47±2,70 kg MS/dia, 0,632±0,323 kg/dia, 10,47±3,23 kg/dia, 8,85±3,43 mm e 36,61±5,39 %, respectivamente, com média de peso dos bezerros à desmama de 225±32 kg. Vacas CAR negativo consumiram 11,5% menos MS que vacas CAR positivo, com desempenho e perfil metabólico similar, exceto pela menor quantidade de proteína no leite e maior concentração de colesterol no sangue que vacas CAR positivo. Em conclusão, vacas CAR negativo (mais eficientes) consumiram menor quantidade de matéria seca, sem diferenças na quantidade de leite corrigido para energia e na espessura de gordura subcutânea, apresentaram perfil metabólico similar e desmamaram bezerros com desempenho semelhante quando comparadas às vacas CAR positivo (menos eficientes). Portanto, o CAR se torna útil na seleção das matrizes do rebanho, pois os animais mais eficientes consomem menores quantidades de alimento sem perdas em produtividade, produzindo bezerros com desempenho semelhante aos de vacas com maior consumo de alimento por dia.
Residual feed intake (RFI) is a trait of feed efficiency that expresses the difference between observed and predicted intake, and identifies animals that consume less, independently of maintenance and production. The objective of the present study was to evaluate feed efficiency of lactating Nellore cows, characterizing the performance and productivity of primiparous cows, from birth to calf weaning. A total of 53 contemporary cows, with an initial mean weight of 484±43 kg and mean age of 1120±37 days, were submitted to a performance test at GrowSafe® Systems, at 22±5 up to 190±13 days of lactation, during which dry matter intake (DMI) was obtained. The roughage:concentrate ratio of diet was 90:10. Cows and calves were weighed every 23 days, for calculation of productive efficiency (PE). The average daily gain (ADG) and metabolic body weight (BW0.75) were also obtained, to calculate RFI of cows and the performance of the calves. The milk production of cows was evaluated at 63±5, 84±5 and 152±5 days of lactation by milking machine. The milk was analyzed for fat, protein and lactose content to calculate energy-corrected milk production (ECMP). At 21±5, 82±5, 143±8 and 184±12 days of lactation cows were evaluated for subcutaneous fat thickness (BFT) by ultrasound. At 15±5, 41±5, 62±5 and 124±5 days postpartum, blood samples were obtained to analyze metabolic indicators of energy status (glucose, cholesterol, triglycerides and -hydroxybutyrate), protein status (albumin, urea and creatinine), mineral status (calcium, phosphorus and magnesium) and hormonal status (insulin and cortisol). The RFI was calculated considering DMI, ADG and BW0.75 obtained during the first lactation phase (from 22±5 up to 102±7 days of lactation), and the cows were classified as negative RFI (more efficient) or positive RFI (less efficient). The RFI model explained 53% of the DMI variation. The average of DMI, ADG, ECMP, BFT and PE were 12.47±2.70 kg DM/day, 0.632±0.323 kg/day, 10.47±3.23 kg/day, 8.85±3.43 mm and 36.61±5.39 %, respectively, and the average of calves weaning weight was 225±32 kg. Negative RFI cows consumed 11.5% less DM than positive RFI cows, with similar performance and metabolic profile, except for the lower amount of protein in milk and higher concentration of blood cholesterol than positive RFI cows. In conclusion, negative RFI cows (more efficient) consumed less dry matter, with no difference in the amount of milk corrected for energy and subcutaneous fat thickness, similar metabolic profile and similar weaning weight of calves, when compared to positive RFI cows (less efficient). Therefore, RFI becomes useful in the selection of the cows of the herd, since the more efficient animals consume less amounts of food without losses in productivity.
Resumo
ALEXANDRE, P. A. Abordagem de biologia de sistemas para a determinação de mecanismos moleculares associados à eficiência alimentar de bovinos Nelore. XXX f. Tese (Doutorado) Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos, Universidade de São Paulo, Pirassununga, 2018. A eficiência alimentar (EA) é um fenótipo complexo, controlado por diversos processos biológicos. Determinar e entender esses processos é fundamental para selecionar animais superiores ou mesmo orientar decisões de manejo com o objetivo de aumentar a produtividade e diminuir o impacto ambiental da pecuária. Neste trabalho, propusemos analisar a EA através de uma abordagem de biologia de sistemas, baseada em transcriptômica multitecidual, a fim de gerar um entendimento sistêmico dessa característica. Para isso, 18 animais extremos para consumo alimentar residual foram selecionados a partir de um grupo de 98 bovinos Nelore machos inteiros e tiveram seu transcriptoma de hipotálamo, pituitária, adrenal, músculo e fígado sequenciado (RNAseq). Os reads gerados foram alinhados com o genoma de referência bovino (UMD3.1), filtrados e a expressão de cada gene foi estimada. A partir desses dados três abordagens de análises de dados foram desenvolvidas. Na primeira, cinco critérios de inclusão foram definidos para selecionar genes e construir uma rede de co-expressão para os cinco tecidos, de forma que além de indicarmos diversos genes e processos associados à EA, também fomos capazes de determinar dois genes reguladores, o NR2F6 e o TGFB1. Na segunda abordagem focamos no eixo hipotálamo-pituitária-adrenal, também utilizando análises de co-expressão, mas dessa vez sem partir de prévia seleção de genes e concluímos que o sistema de recompensa do cérebro pode estar envolvido no estímulo para maior consumo de alimentos observado no grupo de baixa EA. Finalmente, com a terceira abordagem, identificamos RNAs longos não codificadores (lncRNAs) expressos nos cinco tecidos e encontramos 30 transcritos expressos diferencialmente entre a alta e baixa EA na pituitária, músculo e adrenal, sendo que alguns deles se mostraram relacionados a processos já previamente demostrados como sendo associados a essa característica. Concluímos que, apesar de não conseguirmos determinar nesse momento o papel da maior susceptibilidade ao estresse, reportado na literatura para animais de baixa EA, no estímulo para maior ingestão de alimentos desse grupo, o sistema de recompensa hipotalâmico parece estar envolvido nesse processo. A maior ingestão pode ser a causa da resposta inflamatória observada no fígado, sendo ela de origem bacteriana, indicada pela maior concentração de endotoxina sérica nos animais menos eficientes. O maior turnover de proteínas no músculo de animais de baixa EA já havia sido indicado como um dos fatores que levam ao maior gasto energético nesses indivíduos e foi confirmado nesse trabalho. Além de alguns fatores de transcrição serem indicados como reguladores centrais desse fenótipo, lncRNAs também parecem ter função regulatória importante na EA.
ALEXANDRE, P. A. Systems biology approach for determination of molecular mechanisms associated with feed efficiency in Nellore cattle. 143 f. PhD Thesis Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos, Universidade de São Paulo, Pirassununga, 2018. Feed efficiency (FE) is a complex phenotype, controlled by several biological processes. Determining and understanding these processes is fundamental to select superior animals or even guide management decisions, aiming to increase productivity and reduce the environmental impact of livestock. In this work, we propose to analyze FE through a systems biology approach, based on multi-tissue transcriptomics, in order to generate a systemic understanding of this trait. For this purpose, 18 extreme animals for residual feed intake were selected from a group of 98 male Nellore cattle and had their hypothalamus, pituitary, adrenal gland, muscle and liver transcriptome sequenced (RNAseq). Reads generated were aligned with the bovine reference genome (UMD3.1), filtered and the expression of each gene was estimated. From these data three experiments were developed. In the first one, five inclusion criteria were defined to select genes and to construct a network of coexpression for the five tissues, so that besides indicating several genes and processes associated with EA, we were also able to determine two regulatory genes, NR2F6 and TGFB1. In the second experiment, we focused on the hypothalamic-pituitary-adrenal axis, also using co-expression analysis, but this time without starting from previous selected genes. We conclude that the reward system of the brain might be involved in the stimulus for higher feed intake observed in the low EA group. Finally, in the third experiment, we identified long noncoding RNAs (lncRNAs) expressed in the five tissues and found 30 transcripts differentially expressed between the high and low FE in the pituitary, muscle and adrenal, and some of them were related to previously demonstrated processes associated to this trait. We conclude that although we cannot determine at this time the role of higher susceptibility to stress, reported in the literature for animals of low FE, in the stimulus for higher feed intake of this group, the hypothalamic reward system seems to be involved in this process. The higher ingestion might be the cause of the inflammatory response observed in the liver of, being of bacterial origin, indicated by the higher concentration of serum endotoxin in less efficient animals. The higher turnover of proteins in the muscle of low FE animals had already been indicated as one of the factors that lead to higher energy expenditure in these individuals and it was confirmed in this study. In addition to some transcription factors being indicated as central regulators of this phenotype, lncRNAs also appear to play an important regulatory role in FE.