Resumo
For the first time in Brazil, Contracaecum australe is recorded parasitizing Phalacrocorax brasilianus (Aves, Suliformes, Phalacrocoracidae) from the Marine Extractive Reserve of Soure on Marajó Island, Brazilian Amazon. Its morphology revealed a body with a transversally striated cuticle, smooth or slightly cleft interlabia, lips with auricles, labial papillae, and conspicuous amphids. In males, the presence of the median papilla on the upper lip of the cloaca and spicules that reach almost half of the body of the parasite. These morphological characters, added to the number and distribution of the pre- and postcloacal papillae of the male specimens, and supported by the molecular phylogeny from the analysis of the ITS-1, 5.8S and ITS-2 genes, allowed the identification of these parasites.(AU)
Pela primeira vez no Brasil, Contracaecum australe é registrado parasitando Phalacrocorax brasilianus (Aves, Suliformes, Phalacrocoracidae) da Reserva Extrativista Marinha de Soure na Ilha de Marajó, Amazônia brasileira. Sua morfologia revelou corpo com cutícula estriada transversalmente, interlábios lisos ou levemente fendidos, lábios com aurículas, papilas labiais e anfídeos conspícuos. Nos machos, observa-se a presença da papila mediana no lábio superior da cloaca e espículos que atingem quase a metade do corpo do parasito. Esses caracteres morfológicos, somados ao número e distribuição das papilas pré e pós-cloacais dos espécimes machos, e apoiados pela filogenia molecular a partir da análise dos genes ITS-1, 5.8S e ITS-2, permitiram a identificação desses parasitos.(AU)
Assuntos
Animais , Aves/parasitologia , Nematoides/citologia , Brasil , Microscopia Eletrônica de Varredura/métodosResumo
Abstract For the first time in Brazil, Contracaecum australe is recorded parasitizing Phalacrocorax brasilianus (Aves, Suliformes, Phalacrocoracidae) from the Marine Extractive Reserve of Soure on Marajó Island, Brazilian Amazon. Its morphology revealed a body with a transversally striated cuticle, smooth or slightly cleft interlabia, lips with auricles, labial papillae, and conspicuous amphids. In males, the presence of the median papilla on the upper lip of the cloaca and spicules that reach almost half of the body of the parasite. These morphological characters, added to the number and distribution of the pre- and postcloacal papillae of the male specimens, and supported by the molecular phylogeny from the analysis of the ITS-1, 5.8S and ITS-2 genes, allowed the identification of these parasites.
Resumo Pela primeira vez no Brasil, Contracaecum australe é registrado parasitando Phalacrocorax brasilianus (Aves, Suliformes, Phalacrocoracidae) da Reserva Extrativista Marinha de Soure na Ilha de Marajó, Amazônia brasileira. Sua morfologia revelou corpo com cutícula estriada transversalmente, interlábios lisos ou levemente fendidos, lábios com aurículas, papilas labiais e anfídeos conspícuos. Nos machos, observa-se a presença da papila mediana no lábio superior da cloaca e espículos que atingem quase a metade do corpo do parasito. Esses caracteres morfológicos, somados ao número e distribuição das papilas pré e pós-cloacais dos espécimes machos, e apoiados pela filogenia molecular a partir da análise dos genes ITS-1, 5.8S e ITS-2, permitiram a identificação desses parasitos.
Resumo
Farlowella is one of the most diverse genera of the Loricariinae, restricted to South America rivers. The taxonomic and phylogenetic relationships among its species are contentious and, while genetic studies would contribute to the understanding of their relationships, the only available datum refer to the karyotype description of only one species. In the present study two Amazonian species, Farlowella cf. amazonum and F. schreitmuelleri, were analyzed using conventional and molecular cytogenetic procedures. Both species had diploid chromosome number 58, but different fundamental numbers (NF) 116 and 112, respectively, indicative of chromosomal rearrangements. C-banding is almost poor, especially in F. cf. amazonum, and occurs predominantly in the centromeric and in some telomeric regions, although genome of F. schreitmuelleri possessed a much larger heterochromatin amount then those of F. cf. amazonum. The chromosomes bearing the NOR sites were likely the same for both species, corresponding to the 1st metacentric pair in F. cf. amazonum and to the 28th acrocentric in F. schreitmuelleri. The location of the 5S rDNA was species-specific marker. This study expanded the available cytogenetic data for Farlowella species and pointed the remarkable karyotype diversity among species/populations, indicating a possible species complex within genus.(AU)
Farlowella é um dos gêneros mais diversos de Loricariinae, restrito aos rios da América do Sul. As relações taxonômicas e filogenéticas entre suas espécies são contenciosas e, enquanto os estudos genéticos contribuem para a compreensão dessas relações, o único dado disponível refere-se à descrição cariotípica de apenas uma espécie. No presente estudo, foram analizadas duas espécies amazônicas Farlowella cf. amazonum e F. schreitmuelleri, empregando procedimentos citogenéticos convencionais e moleculares. Ambas as espécies apresentaram número diploide igual a 58 cromossomos, mas com números fundamentais diferentes (NF) de 116 e 112, respectivamente, indicando rearranjos cromossômicos. Bandas C são poucas, especialmente em F. cf. amazonum, e ocorre predominantemente nas regiões centroméricas e em algumas regiões teloméricas, embora F. schreitmuelleri apresenta uma quantidade de heterocromatina muito maior que F. cf. amazonum. Os cromossomos carreadores dos sítios da NOR foram provavelmente os mesmos para ambas as espécies, correspondendo ao primeiro par metacêntrico em F. cf. amazonum e ao 28º acrocêntrico em F. schreitmuelleri. A localização do DNAr 5S foi espécie-específico. Este estudo expandiu os dados citogenéticos disponíveis para espécies de Farlowella e apontou uma remarcável diversidade cromossômica entre espécies/populações, indicando um possível complexo de espécies neste gênero.(AU)
Assuntos
Animais , Peixes-Gato/classificação , Citogenética , Código de Barras de DNA Taxonômico/veterináriaResumo
Farlowella is one of the most diverse genera of the Loricariinae, restricted to South America rivers. The taxonomic and phylogenetic relationships among its species are contentious and, while genetic studies would contribute to the understanding of their relationships, the only available datum refer to the karyotype description of only one species. In the present study two Amazonian species, Farlowella cf. amazonum and F. schreitmuelleri, were analyzed using conventional and molecular cytogenetic procedures. Both species had diploid chromosome number 58, but different fundamental numbers (NF) 116 and 112, respectively, indicative of chromosomal rearrangements. C-banding is almost poor, especially in F. cf. amazonum, and occurs predominantly in the centromeric and in some telomeric regions, although genome of F. schreitmuelleri possessed a much larger heterochromatin amount then those of F. cf. amazonum. The chromosomes bearing the NOR sites were likely the same for both species, corresponding to the 1st metacentric pair in F. cf. amazonum and to the 28th acrocentric in F. schreitmuelleri. The location of the 5S rDNA was species-specific marker. This study expanded the available cytogenetic data for Farlowella species and pointed the remarkable karyotype diversity among species/populations, indicating a possible species complex within genus.(AU)
Farlowella é um dos gêneros mais diversos de Loricariinae, restrito aos rios da América do Sul. As relações taxonômicas e filogenéticas entre suas espécies são contenciosas e, enquanto os estudos genéticos contribuem para a compreensão dessas relações, o único dado disponível refere-se à descrição cariotípica de apenas uma espécie. No presente estudo, foram analizadas duas espécies amazônicas Farlowella cf. amazonum e F. schreitmuelleri, empregando procedimentos citogenéticos convencionais e moleculares. Ambas as espécies apresentaram número diploide igual a 58 cromossomos, mas com números fundamentais diferentes (NF) de 116 e 112, respectivamente, indicando rearranjos cromossômicos. Bandas C são poucas, especialmente em F. cf. amazonum, e ocorre predominantemente nas regiões centroméricas e em algumas regiões teloméricas, embora F. schreitmuelleri apresenta uma quantidade de heterocromatina muito maior que F. cf. amazonum. Os cromossomos carreadores dos sítios da NOR foram provavelmente os mesmos para ambas as espécies, correspondendo ao primeiro par metacêntrico em F. cf. amazonum e ao 28º acrocêntrico em F. schreitmuelleri. A localização do DNAr 5S foi espécie-específico. Este estudo expandiu os dados citogenéticos disponíveis para espécies de Farlowella e apontou uma remarcável diversidade cromossômica entre espécies/populações, indicando um possível complexo de espécies neste gênero.(AU)
Assuntos
Animais , Peixes-Gato/classificação , Citogenética , Código de Barras de DNA Taxonômico/veterináriaResumo
Studies with molecular markers are currently more common for all groups of living organisms. Molecular techniques used in Platyhelminthes parasites of fishes do not merely reveal complex life cycles, but are important for species distinction and the elucidation of the phylogenetic hypothesis. Current research verified which molecular markers were mainly used phylogenetic studies on Platyhelminthes parasites of fish so that subsidies for further phylogenetic studies in Icthyoparasitology could be provided. Data base of CAPES Journals platform was employed for bibliometric analysis comprising the keywords fish and phylogeny associated with Cestoda, Digenea or Monogenea. Information retrieved was quantified and tabulated. Most studies were on Monogenea (43%), followed by Digenea (37%) and Cestoda (18%). Ribosomal molecular markers were the most used in the phylogenetic studies for fish parasites. Due to the advance of molecular biology techniques and of bioinformatics, with more robust phylogenetic analysis, the use of these techniques in other areas such as Ichytioparasitology is on the increase. In fact, molecular phylogenetics and morphological structures analysis have efficiently contributed towards the understanding of phylogenetic relationships among the groups.(AU)
Estudos com marcadores moleculares são cada vez mais comuns em todos os grupos de seres vivos. Para os platelmintes parasitos de peixes, as técnicas moleculares possibilitam desvendar ciclos de vida complexos, sendo importantes também na distinção de espécies e na elucidação de hipóteses filogenéticas. Neste sentido, este trabalho teve como objetivo verificar quais são os principais marcadores moleculares utilizados nos estudos de platelmintos parasitos de peixes, visando fornecer subsídios para futuros estudos filogenéticos na Ictioparasitologia. Para a análise bibliométrica foi utilizado o banco de dados dos Periódicos da CAPES, tendo como palavras-chave fish e phylogeny associadas a Cestoda, Digenea e Monogenea. As informações obtidas nos trabalhos foram tabuladas e quantificadas. Dos 143 trabalhos obtidos 43% foram com monogenéticos, 37% com digenéticos e 18% com cestoides. Os marcadores moleculares ribossomais foram os mais utilizados nos estudos filogenéticos com estes parasitos de peixes. Com o avanço das técnicas de biologia molecular e da bioinformática, com análises filogenéticas mais robustas, é crescente a utilização destas técnicas na Ictioparasitologia. A filogenética molecular, juntamente com a análise de estruturas morfológicas tem contribuído de maneira mais eficiente para o entendimento das relações de parentesco, entre estes grupos de parasitos de p(AU)
Assuntos
Animais , Peixes/genética , Peixes/parasitologia , Platelmintos/genética , Marcadores Genéticos/genéticaResumo
Background More than 200 Scyphozoa species have been described, but few have been properly studied regarding their chemical and genetic characteristics.Catostylus tagi, an edible Scyphozoa and the sole European Catostylidae, occurs in summer at Tagus and Sado estuaries. Neither a systematic comparison between the two Catostyluscommunities nor a chemical approach on their nematocytes had been carried out yet.Methods In order to achieve these purposes, optimisation of DNA extraction and of histochemical staining procedures were developed.Catostylus specimens from Tagus and Sado estuaries were compared by ribosomal 18S, 28S, and ITS1 partial sequencing. The morphochemistry of nematocytes was studied by optical and electronic microscopy.Results Macroscopic and molecular results indicated that both communities belong to the same species, C. tagi. The hematoxylin and eosin staining allowed the visualisation of nematocyst genesis and indicated a basic character for the macromolecules on the shaft of euryteles and on the tubule of isorhizae and birhopaloids. By Massons trichrome procedure, the basic properties of the tubules were confirmed and a collagenous profile for the toxins was suggested. Results of the alcian blue staining showed that the outer membrane of nematocyte may consist of macromolecules with acidic polysaccharides, consistent with NOWA and nematogalectin glycoproteins detected in Hydra, but also with poly-gamma-glutamate complex, chitin-like polysaccharides and hyaluronic acids. Through the von Kossa assays, calcium was detected; its position suggested interactions with polysaccharides of the membrane, with proteins of the contractile system or with both.Conclusions The optimisation of sample preparation for DNA extraction may facilitate further studies on little known jellyfish species. The improvement of the smear procedure simplified the use of stained reactions in zooplankton. Moreover, it was shown that good slide images might be acquired manually. The development of specific reactions, with traditional dyes and others, can give important contributions to clarify the chemical nature of the components of nematocytes. The characterisation of nematocyst toxins by staining tests is a goal to achieve.(AU)
Assuntos
Animais , Cifozoários/química , Cifozoários/genética , Nematocisto/anatomia & histologia , DNA RibossômicoResumo
Abstract The Iguazu river is a tributary of the left margin of the Paraná river, isolated from this basin about 22 million years ago with the appearance of the Iguazu Falls. The Iguazu river is characterized by high endemism due to two factors: its rugged topography and the old isolation caused by formation of the Iguazu Falls. This study analyzed cytogenetically a population of Glanidium ribeiroi collected in a region at the final stretch of this basin, by Giemsa staining, C-banding, impregnation by silver nitrate, and FISH with probes of 5S rDNA, 18S rDNA, telomeric sequence [TTAGGG]n, and [GATA]n repeats. The diploid number was equal to 58 chromosomes. The heterochromatin was present in the terminal region of almost all chromosomes. The Ag-NORs were simple and presented interstitially on the short arm of the submetacentric pair 14, which was confirmed by FISH with 18S rDNA probe. The 5S rDNA-FISH marked only the submetacentric pair 16 on the long arm in interstitial position. The FISH with [TTAGGG]n probe presented all telomeres labeled as expected, with an absence of Interstitial Telomeric Sequence (ITS). The repetitive [GATA]n sequence was dispersed throughout the genome, with preferential location in the terminal region of all chromosomes. The data obtained are discussed herein with other species of Auchenipteridae, and other previously analyzed populations of G. ribeiroi from the Iguazu river, verifying differences among these populations, which should be mainly related to the rugged topography of this basin.
Resumo O rio Iguaçu é um afluente da margem esquerda do rio Paraná, que foi separado desta bacia a aproximadamente 22 milhões de anos com o surgimento das Cataratas do Iguaçu. Esse rio é caracterizado por elevado endemismo, o que se deve a dois fatores: sua acidentada topografia e ao antigo isolamento proporcionado pela formação das cataratas. No presente trabalho foi analisado cromossomicamente uma população de Glanidium ribeiroi coletada em uma região que corresponde ao trecho final desse rio, através de coloração com Giemsa, bandamento-C, impregnação pelo nitrato de prata e FISH com sondas de rDNA 5S, rDNA 18S, sequência telomérica [TTAGGG]n e repetições [GATA]n. O número diploide encontrado foi igual a 58 cromossomos. A heterocromatina se mostrou dispersa na região terminal de quase todos os cromossomos. As Ag-RONs são simples e presentes no braço curto em posição intersticial do par submetacêntrico 14, o que foi confirmado pela FISH com rDNA 18S. O rDNA 5S marcou apenas o par submetacêntrico 16 no braço longo em posição intersticial. A hibridização com sonda [TTAGGG]n revelou todos os telômeros marcados conforme esperado e ausência de Sequência Telomérica Intersticial (ITS). As repetições [GATA]n se apresentaram dispersas no genoma da espécie, com preferencial localização na região terminal de todos os cromossomos. Os dados aqui obtidos são discutidos com os de outras espécies de Auchenipteridae, especialmente de G. ribeiroi anteriormente analisados do rio Iguaçu. Diferenças populacionais são constatadas em decorrência do isolamento geográfico ocasionado pelas inúmeras cachoeiras existentes no curso do rio Iguaçu.
Resumo
Background More than 200 Scyphozoa species have been described, but few have been properly studied regarding their chemical and genetic characteristics.Catostylus tagi, an edible Scyphozoa and the sole European Catostylidae, occurs in summer at Tagus and Sado estuaries. Neither a systematic comparison between the two Catostyluscommunities nor a chemical approach on their nematocytes had been carried out yet.Methods In order to achieve these purposes, optimisation of DNA extraction and of histochemical staining procedures were developed.Catostylus specimens from Tagus and Sado estuaries were compared by ribosomal 18S, 28S, and ITS1 partial sequencing. The morphochemistry of nematocytes was studied by optical and electronic microscopy.Results Macroscopic and molecular results indicated that both communities belong to the same species, C. tagi. The hematoxylin and eosin staining allowed the visualisation of nematocyst genesis and indicated a basic character for the macromolecules on the shaft of euryteles and on the tubule of isorhizae and birhopaloids. By Masson's trichrome procedure, the basic properties of the tubules were confirmed and a collagenous profile for the toxins was suggested. Results of the alcian blue staining showed that the outer membrane of nematocyte may consist of macromolecules with acidic polysaccharides, consistent with NOWA and nematogalectin glycoproteins detected in Hydra, but also with poly-gamma-glutamate complex, chitin-like polysaccharides and hyaluronic acids. Through the von Kossa assays, calcium was detected; its position suggested interactions with polysaccharides of the membrane, with proteins of the contractile system or with both.Conclusions The optimisation of sample preparation for DNA extraction may facilitate further studies on little known jellyfish species. The improvement of the smear procedure simplified the use of stained reactions in zooplankton. Moreover, it was shown that good slide images might be acquired manually. The development of specific reactions, with traditional dyes and others, can give important contributions to clarify the chemical nature of the components of nematocytes. The characterisation of nematocyst toxins by staining tests is a goal to achieve.(AU)
Assuntos
Animais , DNA Ribossômico , Nematocisto , CifozoáriosResumo
The Iguazu river is a tributary of the left margin of the Paraná river, isolated from this basin about 22 million years ago with the appearance of the Iguazu Falls. The Iguazu river is characterized by high endemism due to two factors: its rugged topography and the old isolation caused by formation of the Iguazu Falls. This study analyzed cytogenetically a population of Glanidium ribeiroi collected in a region at the final stretch of this basin, by Giemsa staining, C-banding, impregnation by silver nitrate, and FISH with probes of 5S rDNA, 18S rDNA, telomeric sequence [TTAGGG]n, and [GATA]n repeats. The diploid number was equal to 58 chromosomes. The heterochromatin was present in the terminal region of almost all chromosomes. The Ag-NORs were simple and presented interstitially on the short arm of the submetacentric pair 14, which was confirmed by FISH with 18S rDNA probe. The 5S rDNA-FISH marked only the submetacentric pair 16 on the long arm in interstitial position. The FISH with [TTAGGG]n probe presented all telomeres labeled as expected, with an absence of Interstitial Telomeric Sequence (ITS). The repetitive [GATA]n sequence was dispersed throughout the genome, with preferential location in the terminal region of all chromosomes. The data obtained are discussed herein with other species of Auchenipteridae, and other previously analyzed populations of G. ribeiroi from the Iguazu river, verifying differences among these populations, which should be mainly related to the rugged topography of this basin.(AU)
O rio Iguaçu é um afluente da margem esquerda do rio Paraná, que foi separado desta bacia a aproximadamente 22 milhões de anos com o surgimento das Cataratas do Iguaçu. Esse rio é caracterizado por elevado endemismo, o que se deve a dois fatores: sua acidentada topografia e ao antigo isolamento proporcionado pela formação das cataratas. No presente trabalho foi analisado cromossomicamente uma população de Glanidium ribeiroi coletada em uma região que corresponde ao trecho final desse rio, através de coloração com Giemsa, bandamento-C, impregnação pelo nitrato de prata e FISH com sondas de rDNA 5S, rDNA 18S, sequência telomérica [TTAGGG]n e repetições [GATA]n. O número diploide encontrado foi igual a 58 cromossomos. A heterocromatina se mostrou dispersa na região terminal de quase todos os cromossomos. As Ag-RONs são simples e presentes no braço curto em posição intersticial do par submetacêntrico 14, o que foi confirmado pela FISH com rDNA 18S. O rDNA 5S marcou apenas o par submetacêntrico 16 no braço longo em posição intersticial. A hibridização com sonda [TTAGGG]n revelou todos os telômeros marcados conforme esperado e ausência de Sequência Telomérica Intersticial (ITS). As repetições [GATA]n se apresentaram dispersas no genoma da espécie, com preferencial localização na região terminal de todos os cromossomos. Os dados aqui obtidos são discutidos com os de outras espécies de Auchenipteridae, especialmente de G. ribeiroi anteriormente analisados do rio Iguaçu. Diferenças populacionais são constatadas em decorrência do isolamento geográfico ocasionado pelas inúmeras cachoeiras existentes no curso do rio Iguaçu.(AU)
Assuntos
Animais , Masculino , Feminino , /genética , Variação Genética , Cariótipo , Brasil , RiosResumo
Background More than 200 Scyphozoa species have been described, but few have been properly studied regarding their chemical and genetic characteristics.Catostylus tagi, an edible Scyphozoa and the sole European Catostylidae, occurs in summer at Tagus and Sado estuaries. Neither a systematic comparison between the two Catostyluscommunities nor a chemical approach on their nematocytes had been carried out yet.Methods In order to achieve these purposes, optimisation of DNA extraction and of histochemical staining procedures were developed.Catostylus specimens from Tagus and Sado estuaries were compared by ribosomal 18S, 28S, and ITS1 partial sequencing. The morphochemistry of nematocytes was studied by optical and electronic microscopy.Results Macroscopic and molecular results indicated that both communities belong to the same species, C. tagi. The hematoxylin and eosin staining allowed the visualisation of nematocyst genesis and indicated a basic character for the macromolecules on the shaft of euryteles and on the tubule of isorhizae and birhopaloids. By Massons trichrome procedure, the basic properties of the tubules were confirmed and a collagenous profile for the toxins was suggested. Results of the alcian blue staining showed that the outer membrane of nematocyte may consist of macromolecules with acidic polysaccharides, consistent with NOWA and nematogalectin glycoproteins detected in Hydra, but also with poly-gamma-glutamate complex, chitin-like polysaccharides and hyaluronic acids. Through the von Kossa assays, calcium was detected; its position suggested interactions with polysaccharides of the membrane, with proteins of the contractile system or with both.Conclusions The optimisation of sample preparation for DNA extraction may facilitate further studies on little known jellyfish species. The improvement of the smear procedure simplified the use of stained reactions in zooplankton. Moreover, it was shown that good slide images might be acquired manually. The development of specific reactions, with traditional dyes and others, can give important contributions to clarify the chemical nature of the components of nematocytes. The characterisation of nematocyst toxins by staining tests is a goal to achieve.
Assuntos
Animais , Cifozoários/genética , Cifozoários/química , DNA Ribossômico , Nematocisto/anatomia & histologiaResumo
Twenty four bacterial strains from four different regions of mud volcano and lime cave were isolated to estimate their diversity, plant growth promoting and biocontrol activities to use them as inoculant strains in the fields. An excellent antagonistic effect against four plant pathogens and plant growth promoting properties such as IAA production, HCN production, phosphate solubilization, siderophore production, starch hydrolysis and hydrolytic enzymes syntheses were identified in OM5 (Pantoea agglomerans) and EM9 (Exiguobacterium sp.) of 24 studied isolates. Seeds (Chili and tomato) inoculation with plant growth promoting strains resulted in increased percentage of seedling emergence, root length and plant weight. Results indicated that co-inoculation gave a more pronounced effects on seedling emergence, secondary root numbers, primary root length and stem length, while inoculation by alone isolate showed a lower effect. Our results suggest that the mixed inocula of OM5 and EM9 strains as biofertilizers could significantly increase the production of food crops in Andaman archipelago by means of sustainable and organic agricultural system.
Assuntos
Bacillales/isolamento & purificação , Capsicum/microbiologia , Microbiologia Ambiental , Solanum lycopersicum/microbiologia , Desenvolvimento Vegetal , Pantoea/isolamento & purificação , Reguladores de Crescimento de Plantas/metabolismo , Biomassa , Bacillales/classificação , Capsicum/fisiologia , DNA Bacteriano/química , DNA Ribossômico/química , Índia , Ilhas , Solanum lycopersicum/fisiologia , Dados de Sequência Molecular , Pantoea/classificação , Raízes de Plantas/crescimento & desenvolvimentoResumo
Some species belonging to the genus Aspergillus are potential producers of ochratoxin A (OA), a mycotoxin with nephrotoxic, immunosuppressive, teratogenic and carcinogenic effects. The aim of the present study was to identify the species of Aspergillus that contaminate the inside of coffee beans collected in the stage of maturation and drying, from 16 producing areas located in the northern region of the State of Paraná, in the South of Brazil. A total of 108 isolates of Aspergillus spp. was identified at the species level, by sequencing the internal transcribed spacer (ITS1-5.8S-ITS2) of ribosomal DNA (rDNA). The results revealed the presence of potentially ochratoxigenic species in 82% of the geographic regions studied, among which Aspergillus niger was the species most frequently detected, followed by A. ochraceus and A. carbonarius. The presence of A. carbonarius in immature coffee fruits harvested from trees is reported for the first time.
Algumas espécies pertencentes ao gênero Aspergillus possuem potencial para produção de Ocratoxina A (OA), uma micotoxina de efeitos nefrotóxicos, imunossupressivos, teratogênicos e carcinogênicos. Com o objetivo de identificar as espécies de Aspergillus que contaminam o interior de grãos de café, foram coletadas amostras em diferentes estádios de maturação do produto, em 16 propriedades produtoras do norte do estado do Paraná. Um total de 108 isolados de Aspergillus spp. foram identificados ao nível de espécie, pelo sequenciamento dos espaços internos transcritos (ITS1-5,8S-ITS2) do DNA ribossomal (rDNA). Os resultados revelaram a presença de espécies potencialmente ocratoxigênicas em 82% das regiões analisadas, sendo dentre estas, Aspergillus niger a espécie mais freqüentemente detectada,seguida por A. ochraceus, e A. carbonarius. É relatada pela primeira vez a presença de A. carbonarius em frutos de café coletados na árvore.
Resumo
Some species belonging to the genus Aspergillus are potential producers of ochratoxin A (OA), a mycotoxin with nephrotoxic, immunosuppressive, teratogenic and carcinogenic effects. The aim of the present study was to identify the species of Aspergillus that contaminate the inside of coffee beans collected in the stage of maturation and drying, from 16 producing areas located in the northern region of the State of Paraná, in the South of Brazil. A total of 108 isolates of Aspergillus spp. was identified at the species level, by sequencing the internal transcribed spacer (ITS1-5.8S-ITS2) of ribosomal DNA (rDNA). The results revealed the presence of potentially ochratoxigenic species in 82% of the geographic regions studied, among which Aspergillus niger was the species most frequently detected, followed by A. ochraceus and A. carbonarius. The presence of A. carbonarius in immature coffee fruits harvested from trees is reported for the first time.
Algumas espécies pertencentes ao gênero Aspergillus possuem potencial para produção de Ocratoxina A (OA), uma micotoxina de efeitos nefrotóxicos, imunossupressivos, teratogênicos e carcinogênicos. Com o objetivo de identificar as espécies de Aspergillus que contaminam o interior de grãos de café, foram coletadas amostras em diferentes estádios de maturação do produto, em 16 propriedades produtoras do norte do estado do Paraná. Um total de 108 isolados de Aspergillus spp. foram identificados ao nível de espécie, pelo sequenciamento dos espaços internos transcritos (ITS1-5,8S-ITS2) do DNA ribossomal (rDNA). Os resultados revelaram a presença de espécies potencialmente ocratoxigênicas em 82% das regiões analisadas, sendo dentre estas, Aspergillus niger a espécie mais freqüentemente detectada,seguida por A. ochraceus, e A. carbonarius. É relatada pela primeira vez a presença de A. carbonarius em frutos de café coletados na árvore.
Resumo
Fusarium solani fungus (teleomorph Haematonectria haematococca) is of relevance for agriculture, producing a disease that causes significant losses for many cultivars. Moreover, F. solani is an opportunistic pathogen to animals and humans. The complexity associated to its correct identification by traditional methods justifies the efforts of using molecular markers for isolates characterization. In this work, three PCR-based methods (one PCR-ribotyping and two PCR-fingerprinting) were used to investigate the molecular variability of eighteen F. solani isolates from four Brazilian States, collected from different substrates. Genetic analysis revealed the intraspecific variability within the F. solani isolates, without any correlation to their geographical origin and substrate. Its polymorphism was observed even in the very conserved sequence of rDNA locus, and the SPAR marker (GTG)5 showed the highest polymorphism. Together, those results may contribute to understand the relation between fungal genetic variability and cultivars resistance phenotypes to fungal-caused diseases, helping plant-breeding programs.
O fungo Fusarium solani (teleomorfo Haematonectria haematococca) apresenta uma expressiva importância na agricultura por ser considerado patógeno para várias culturas de interesse econômico causando doença conhecida por podridão das raízes, além de ser patógeno aos animais e ao homem, provocando nestes últimos, micoses superficiais e sistêmicas. A complexidade associada a sua identificação correta através de métodos tradicionais justifica os esforços de usar marcadores moleculares para caracterização dos isolados. Neste trabalho, três métodos baseados na tecnologia da PCR (um por ribotipagem por PCR e dois por impressão genética por PCR) foram utilizados para investigar a variabilidade molecular de dezoito isolados de F. solani de quatro Estados brasileiros, coletados de diferentes substratos. A análise genética revelou a variabilidade intraespecífica dos isolados de F. solani, sem qualquer correlação para a origem geográfica e substrato. Seu polimorfismo foi observado até mesmo na seqüência conservada do locus do rDNA, e o marcador SPAR (GTG)5 mostrou o mais alto polimorfismo. Em conjunto, estes resultados poderão auxiliar nos estudos da relação entre variabilidade do perfil genético de isolados e os fenótipos de resistência de determinados cultivares às doenças provocadas pelo fungo, orientando programas de melhoramento vegetal.
Resumo
Yeasts of the genus Candida are of clinical importance and also have many industrial applications, mainly in the food industry. The yeast Candida guilliermondii FTI 20037 has been extensively studied in order to establish a biotechnological process for the production of xylitol. The goal of this study was to verify the taxonomic classification of this strain based on the analysis of rDNA sequences and the xyl1 gene. DNA fragments from these sequences were amplified by PCR and BLAST analysis revealed strong identity with the corresponding sequences from Candida tropicalis. Based on these results, we propose that C. guilliermondii FTI 20037 must be reclassified as C. tropicalis.
As leveduras do gênero Candida possuem tanto importância clínica como diversas aplicações industriais, principalmente na indústria de alimentos. A levedura Candida guilliermondii FTI 20037 tem sido exaustivamente estudada pois pretende-se utilizá-la no estabelecimento de um processo biotecnológico para a produção de xilitol. O objetivo deste trabalho foi verificar a classificação taxonômica desta levedura por análise de sequências do rDNA e do gene xyl1. Fragmentos correspondentes a estas regiões foram amplificados por PCR e a análise destas sequências por BLAST revelou alta identidade com sequências correspondentes de Candida tropicalis. Estes resultados nos levam a propor que C. guilliermondii FTI 20037 deva ser reclassificada como C. tropicalis.
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Yeasts of the genus Candida are of clinical importance and also have many industrial applications, mainly in the food industry. The yeast Candida guilliermondii FTI 20037 has been extensively studied in order to establish a biotechnological process for the production of xylitol. The goal of this study was to verify the taxonomic classification of this strain based on the analysis of rDNA sequences and the xyl1 gene. DNA fragments from these sequences were amplified by PCR and BLAST analysis revealed strong identity with the corresponding sequences from Candida tropicalis. Based on these results, we propose that C. guilliermondii FTI 20037 must be reclassified as C. tropicalis.
As leveduras do gênero Candida possuem tanto importância clínica como diversas aplicações industriais, principalmente na indústria de alimentos. A levedura Candida guilliermondii FTI 20037 tem sido exaustivamente estudada pois pretende-se utilizá-la no estabelecimento de um processo biotecnológico para a produção de xilitol. O objetivo deste trabalho foi verificar a classificação taxonômica desta levedura por análise de sequências do rDNA e do gene xyl1. Fragmentos correspondentes a estas regiões foram amplificados por PCR e a análise destas sequências por BLAST revelou alta identidade com sequências correspondentes de Candida tropicalis. Estes resultados nos levam a propor que C. guilliermondii FTI 20037 deva ser reclassificada como C. tropicalis.
Resumo
Yeasts of the genus Candida are of clinical importance and also have many industrial applications, mainly in the food industry. The yeast Candida guilliermondii FTI 20037 has been extensively studied in order to establish a biotechnological process for the production of xylitol. The goal of this study was to verify the taxonomic classification of this strain based on the analysis of rDNA sequences and the xyl1 gene. DNA fragments from these sequences were amplified by PCR and BLAST analysis revealed strong identity with the corresponding sequences from Candida tropicalis. Based on these results, we propose that C. guilliermondii FTI 20037 must be reclassified as C. tropicalis.
As leveduras do gênero Candida possuem tanto importância clínica como diversas aplicações industriais, principalmente na indústria de alimentos. A levedura Candida guilliermondii FTI 20037 tem sido exaustivamente estudada pois pretende-se utilizá-la no estabelecimento de um processo biotecnológico para a produção de xilitol. O objetivo deste trabalho foi verificar a classificação taxonômica desta levedura por análise de sequências do rDNA e do gene xyl1. Fragmentos correspondentes a estas regiões foram amplificados por PCR e a análise destas sequências por BLAST revelou alta identidade com sequências correspondentes de Candida tropicalis. Estes resultados nos levam a propor que C. guilliermondii FTI 20037 deva ser reclassificada como C. tropicalis.