Molecular detection and prevalence of Rotavirus with acute gastroenteritis among the children of rural and urban areas / Detecção molecular e prevalência de rotavírus com gastroenterite aguda entre as crianças de áreas rurais e urbanas

Rotavirus is the main infective agent of acute gastroenteritis (AGE) in children under the age of five years and causing significant morbidity as well as mortality throughout the world. The study was carried out to detect the prevalence rate, genotypes strain and risk factors of Rotavirus among the children of rural and urban areas of district Bannu Khyber Pakhtunkhwa Pakistan. A total of 180 stool samples were collected from children under the age of 5 years from two major hospitals of Bannu from January to December (2015). The samples were analyzed by Reverse-transcriptase Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) for the detection of Rotavirus, positive samples were further processed for genotyping (G and P type) through specific PCR. Of the total, 41 (23%) samples were positive for Rotavirus. The most prevalent G genotypes found were: G3, G8, G9 (each 29%), followed by G10 (15%), and G11 (10%). Whereas the prevalent P genotypes were: P-8 (25%), P-4 and P-10 (each 20%), P-9 (15%), followed by P-6 and P-11 (each 10%). Moreover, Rotavirus infection was more prevalent in summer (23.73%) and winter (22.7%) than spring (20%) and autumn (21.4%). Rotavirus infection exhibited high frequency in June (14%), October (8%) and November (6%). It is concluded that Rotavirus is more prevalent in children and various genotypes (G and P) of Rotavirus are present in the study area. Lack of studies, awareness and rarer testing of Rotavirus are the principal reasons of virus prevalence in district Bannu, Pakistan.

O rotavírus é o principal agente infeccioso da gastroenterite aguda (AGE) em crianças menores de 5 anos e causa de morbidade e mortalidade significativas em todo o mundo. O estudo foi realizado para detectar a taxa de prevalência, cepa de genótipos e fatores de risco de rotavírus entre as crianças de áreas rurais e urbanas do distrito de Bannu Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão. Um total de 180 amostras de fezes foi coletada de crianças menores de 5 anos de dois grandes hospitais de Bannu de janeiro a dezembro (2015). As amostras foram analisadas por reação em cadeia da polimerase transcriptase reversa (RT-PCR) para detecção de rotavírus; as amostras positivas foram posteriormente processadas para genotipagem (tipo G e P) através de PCR específica. Do total, 41 (23%) amostras foram positivas para rotavírus. Os genótipos G mais prevalentes encontrados foram: G3, G8, G9 (cada 29%), seguidos de G10 (15%) e G11 (10%). Considerando que os genótipos P prevalentes foram: P-8 (25%), P-4 e P-10 (cada 20%), P-9 (15%), seguido por P-6 e P-11 (cada 10%). Além disso, a infecção por rotavírus foi mais prevalente no verão (23,73%) e inverno (22,7%) do que na primavera (20%) e no outono (21,4%). A infecção por rotavírus apresentou alta frequência em junho (14%), outubro (8%) e novembro (6%). Conclui-se que o rotavírus é mais prevalente em crianças e vários genótipos (G e P) do rotavírus estão presentes na área de estudo. A falta de estudos, conhecimento e testes mais raros de rotavírus são as principais razões da prevalência do vírus no distrito de Bannu, Paquistão.

Molecular detection and prevalence of Rotavirus with acute gastroenteritis among the children of rural and urban areas

Abstract Rotavirus is the main infective agent of acute gastroenteritis (AGE) in children under the age of five years and causing significant morbidity as well as mortality throughout the world. The study was carried out to detect the prevalence rate, genotypes strain and risk factors of Rotavirus among the children of rural and urban areas of district Bannu Khyber Pakhtunkhwa Pakistan. A total of 180 stool samples were collected from children under the age of 5 years from two major hospitals of Bannu from January to December (2015). The samples were analyzed by Reverse-transcriptase Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) for the detection of Rotavirus, positive samples were further processed for genotyping (G and P type) through specific PCR. Of the total, 41 (23%) samples were positive for Rotavirus. The most prevalent G genotypes found were: G3, G8, G9 (each 29%), followed by G10 (15%), and G11 (10%). Whereas the prevalent P genotypes were: P-8 (25%), P-4 and P-10 (each 20%), P-9 (15%), followed by P-6 and P-11 (each 10%). Moreover, Rotavirus infection was more prevalent in summer (23.73%) and winter (22.7%) than spring (20%) and autumn (21.4%). Rotavirus infection exhibited high frequency in June (14%), October (8%) and November (6%). It is concluded that Rotavirus is more prevalent in children and various genotypes (G and P) of Rotavirus are present in the study area. Lack of studies, awareness and rarer testing of Rotavirus are the principal reasons of virus prevalence in district Bannu, Pakistan.

Resumo O rotavírus é o principal agente infeccioso da gastroenterite aguda (AGE) em crianças menores de 5 anos e causa de morbidade e mortalidade significativas em todo o mundo. O estudo foi realizado para detectar a taxa de prevalência, cepa de genótipos e fatores de risco de rotavírus entre as crianças de áreas rurais e urbanas do distrito de Bannu Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão. Um total de 180 amostras de fezes foi coletada de crianças menores de 5 anos de dois grandes hospitais de Bannu de janeiro a dezembro (2015). As amostras foram analisadas por reação em cadeia da polimerase transcriptase reversa (RT-PCR) para detecção de rotavírus; as amostras positivas foram posteriormente processadas para genotipagem (tipo G e P) através de PCR específica. Do total, 41 (23%) amostras foram positivas para rotavírus. Os genótipos G mais prevalentes encontrados foram: G3, G8, G9 (cada 29%), seguidos de G10 (15%) e G11 (10%). Considerando que os genótipos P prevalentes foram: P-8 (25%), P-4 e P-10 (cada 20%), P-9 (15%), seguido por P-6 e P-11 (cada 10%). Além disso, a infecção por rotavírus foi mais prevalente no verão (23,73%) e inverno (22,7%) do que na primavera (20%) e no outono (21,4%). A infecção por rotavírus apresentou alta frequência em junho (14%), outubro (8%) e novembro (6%). Conclui-se que o rotavírus é mais prevalente em crianças e vários genótipos (G e P) do rotavírus estão presentes na área de estudo. A falta de estudos, conhecimento e testes mais raros de rotavírus são as principais razões da prevalência do vírus no distrito de Bannu, Paquistão.

Molecular detection and prevalence of Rotavirus with acute gastroenteritis among the children of rural and urban areas / Detecção molecular e prevalência de rotavírus com gastroenterite aguda entre as crianças de áreas rurais e urbanas

Rotavirus is the main infective agent of acute gastroenteritis (AGE) in children under the age of five years and causing significant morbidity as well as mortality throughout the world. The study was carried out to detect the prevalence rate, genotypes strain and risk factors of Rotavirus among the children of rural and urban areas of district Bannu Khyber Pakhtunkhwa Pakistan. A total of 180 stool samples were collected from children under the age of 5 years from two major hospitals of Bannu from January to December (2015). The samples were analyzed by Reverse-transcriptase Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) for the detection of Rotavirus, positive samples were further processed for genotyping (G and P type) through specific PCR. Of the total, 41 (23%) samples were positive for Rotavirus. The most prevalent G genotypes found were: G3, G8, G9 (each 29%), followed by G10 (15%), and G11 (10%). Whereas the prevalent P genotypes were: P-8 (25%), P-4 and P-10 (each 20%), P-9 (15%), followed by P-6 and P-11 (each 10%). Moreover, Rotavirus infection was more prevalent in summer (23.73%) and winter (22.7%) than spring (20%) and autumn (21.4%). Rotavirus infection exhibited high frequency in June (14%), October (8%) and November (6%). It is concluded that Rotavirus is more prevalent in children and various genotypes (G and P) of Rotavirus are present in the study area. Lack of studies, awareness and rarer testing of Rotavirus are the principal reasons of virus prevalence in district Bannu, Pakistan.(AU)

O rotavírus é o principal agente infeccioso da gastroenterite aguda (AGE) em crianças menores de 5 anos e causa de morbidade e mortalidade significativas em todo o mundo. O estudo foi realizado para detectar a taxa de prevalência, cepa de genótipos e fatores de risco de rotavírus entre as crianças de áreas rurais e urbanas do distrito de Bannu Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão. Um total de 180 amostras de fezes foi coletada de crianças menores de 5 anos de dois grandes hospitais de Bannu de janeiro a dezembro (2015). As amostras foram analisadas por reação em cadeia da polimerase transcriptase reversa (RT-PCR) para detecção de rotavírus; as amostras positivas foram posteriormente processadas para genotipagem (tipo G e P) através de PCR específica. Do total, 41 (23%) amostras foram positivas para rotavírus. Os genótipos G mais prevalentes encontrados foram: G3, G8, G9 (cada 29%), seguidos de G10 (15%) e G11 (10%). Considerando que os genótipos P prevalentes foram: P-8 (25%), P-4 e P-10 (cada 20%), P-9 (15%), seguido por P-6 e P-11 (cada 10%). Além disso, a infecção por rotavírus foi mais prevalente no verão (23,73%) e inverno (22,7%) do que na primavera (20%) e no outono (21,4%). A infecção por rotavírus apresentou alta frequência em junho (14%), outubro (8%) e novembro (6%). Conclui-se que o rotavírus é mais prevalente em crianças e vários genótipos (G e P) do rotavírus estão presentes na área de estudo. A falta de estudos, conhecimento e testes mais raros de rotavírus são as principais razões da prevalência do vírus no distrito de Bannu, Paquistão.(AU)

Neonatal diarrhea and rotavirus A infection in beef and dairy calves, Brazil, 2006-2015 / Diarreia neonatal e infecção por rotavírus A em bezerros de corte e leite, Brasil, 2006-2015

Calf diarrhea causes substantial economic losses in the cattle industry worldwide. Bovine rotavirus A (RVA) is the main viral agent that leads to enteric infection and diarrhea outbreaks in calves throughout the world. The aim of this retrospective (2006-2015) study was to determine the frequency of RVA detection in diarrheic fecal samples from beef and dairy calves from the three main cattle-producing regions of Brazil. Diarrheic fecal samples (n=1,498) of 124 beef and 56 dairy cattle herds from the Midwest, South, and Southeast geographical regions of Brazil were evaluated using the silver-stained polyacrylamide gel electrophoresis (ss-PAGE) technique. RVA double stranded-RNA was identified by the ss-PAGE technique in 410 (27.4%) fecal samples. The frequency of positive samples found in beef calves (31.9%; 328/1,027) was higher than the frequency found in diarrheic fecal samples from dairy calves (17.4%; 82/471). RVA infection was identified in calves from the three Brazilian geographical regions analyzed. However, the frequency of positive diarrheic calves in the Midwest region (39.4%), predominantly beef calves, was higher than in the South (19.4%) and Southeast (17.6%) regions. The temporal distribution of RVA-infected calves evaluated by two five-year periods (2006-2010, 24.5%; 2011-2015, 28.8%) demonstrated a very similar frequency of RVA in both periods. Considering the wide regional and temporal scope of this study, it can be concluded that RVA remains an important etiology of neonatal diarrhea in calves of Brazilian cattle herds.(AU)

A diarreia neonatal ocasiona perdas econômicas importantes na pecuária bovina em todo o mundo. Rotavírus A (RVA) é o principal agente etiológico viral de infecções entéricas e surtos de diarreia em bezerros de rebanhos de corte e leite. O objetivo deste estudo retrospectivo (2006-2015) foi determinar a frequência de detecção de RVA em amostras de fezes diarreicas de bezerros de corte e leite das três principais regiões produtoras de bovinos do Brasil. Amostras de fezes diarreicas (n=1.498) de 124 rebanhos bovinos de corte e 56 rebanhos bovinos de leite das regiões Centro-Oeste, Sul e Sudeste do Brasil foram avaliadas utilizando a técnica de eletroforese em gel de poliacrilamida (EGPA). O genoma segmentado de RVA foi identificado pela técnica de EGPA em 410 (27,4%) amostras de fezes. A frequência de amostras positivas encontrada em bezerros de rebanhos de corte (31,9%; 328/1.027) foi maior que a frequência identificada em amostras de fezes diarreicas de bezerros de rebanhos leiteiros (17,4%; 82/471). A infecção por RVA foi identificada em bezerros das três regiões geográficas brasileiras analisadas. No entanto, a frequência de bezerros com diarreia positivos para RVA na região Centro-Oeste (39,4%), predominantemente de bezerros de rebanhos de corte, foi maior que nas regiões Sul (19,4%) e Sudeste (17,6%). A distribuição temporal dos bezerros infectados com RVA avaliados por dois períodos de cinco anos (2006-2010, 24,5%; 2011-2015, 28,8%) demonstrou uma frequência muito semelhante em ambos os períodos. Considerando a amplitude regional e temporal deste estudo, pode-se concluir que RVA continua sendo uma importante etiologia de diarreia neonatal em bezerros de rebanhos bovinos brasileiros.(AU)

Neonatal diarrhea and rotavirus A infection in beef and dairy calves, Brazil, 2006-2015 / Diarreia neonatal e infecção por rotavírus A em bezerros de corte e leite, Brasil, 2006-2015

Calf diarrhea causes substantial economic losses in the cattle industry worldwide. Bovine rotavirus A (RVA) is the main viral agent that leads to enteric infection and diarrhea outbreaks in calves throughout the world. The aim of this retrospective (2006-2015) study was to determine the frequency of RVA detection in diarrheic fecal samples from beef and dairy calves from the three main cattle-producing regions of Brazil. Diarrheic fecal samples (n=1,498) of 124 beef and 56 dairy cattle herds from the Midwest, South, and Southeast geographical regions of Brazil were evaluated using the silver-stained polyacrylamide gel electrophoresis (ss-PAGE) technique. RVA double stranded-RNA was identified by the ss-PAGE technique in 410 (27.4%) fecal samples. The frequency of positive samples found in beef calves (31.9%; 328/1,027) was higher than the frequency found in diarrheic fecal samples from dairy calves (17.4%; 82/471). RVA infection was identified in calves from the three Brazilian geographical regions analyzed. However, the frequency of positive diarrheic calves in the Midwest region (39.4%), predominantly beef calves, was higher than in the South (19.4%) and Southeast (17.6%) regions. The temporal distribution of RVA-infected calves evaluated by two five-year periods (2006-2010, 24.5%; 2011-2015, 28.8%) demonstrated a very similar frequency of RVA in both periods. Considering the wide regional and temporal scope of this study, it can be concluded that RVA remains an important etiology of neonatal diarrhea in calves of Brazilian cattle herds.(AU)

A diarreia neonatal ocasiona perdas econômicas importantes na pecuária bovina em todo o mundo. Rotavírus A (RVA) é o principal agente etiológico viral de infecções entéricas e surtos de diarreia em bezerros de rebanhos de corte e leite. O objetivo deste estudo retrospectivo (2006-2015) foi determinar a frequência de detecção de RVA em amostras de fezes diarreicas de bezerros de corte e leite das três principais regiões produtoras de bovinos do Brasil. Amostras de fezes diarreicas (n=1.498) de 124 rebanhos bovinos de corte e 56 rebanhos bovinos de leite das regiões Centro-Oeste, Sul e Sudeste do Brasil foram avaliadas utilizando a técnica de eletroforese em gel de poliacrilamida (EGPA). O genoma segmentado de RVA foi identificado pela técnica de EGPA em 410 (27,4%) amostras de fezes. A frequência de amostras positivas encontrada em bezerros de rebanhos de corte (31,9%; 328/1.027) foi maior que a frequência identificada em amostras de fezes diarreicas de bezerros de rebanhos leiteiros (17,4%; 82/471). A infecção por RVA foi identificada em bezerros das três regiões geográficas brasileiras analisadas. No entanto, a frequência de bezerros com diarreia positivos para RVA na região Centro-Oeste (39,4%), predominantemente de bezerros de rebanhos de corte, foi maior que nas regiões Sul (19,4%) e Sudeste (17,6%). A distribuição temporal dos bezerros infectados com RVA avaliados por dois períodos de cinco anos (2006-2010, 24,5%; 2011-2015, 28,8%) demonstrou uma frequência muito semelhante em ambos os períodos. Considerando a amplitude regional e temporal deste estudo, pode-se concluir que RVA continua sendo uma importante etiologia de diarreia neonatal em bezerros de rebanhos bovinos brasileiros.(AU)

Neonatal diarrhea and rotavirus A infection in beef and dairy calves, Brazil, 2006-2015

ABSTRACT: Calf diarrhea causes substantial economic losses in the cattle industry worldwide. Bovine rotavirus A (RVA) is the main viral agent that leads to enteric infection and diarrhea outbreaks in calves throughout the world. The aim of this retrospective (2006-2015) study was to determine the frequency of RVA detection in diarrheic fecal samples from beef and dairy calves from the three main cattle-producing regions of Brazil. Diarrheic fecal samples (n=1,498) of 124 beef and 56 dairy cattle herds from the Midwest, South, and Southeast geographical regions of Brazil were evaluated using the silver-stained polyacrylamide gel electrophoresis (ss-PAGE) technique. RVA double stranded-RNA was identified by the ss-PAGE technique in 410 (27.4%) fecal samples. The frequency of positive samples found in beef calves (31.9%; 328/1,027) was higher than the frequency found in diarrheic fecal samples from dairy calves (17.4%; 82/471). RVA infection was identified in calves from the three Brazilian geographical regions analyzed. However, the frequency of positive diarrheic calves in the Midwest region (39.4%), predominantly beef calves, was higher than in the South (19.4%) and Southeast (17.6%) regions. The temporal distribution of RVA-infected calves evaluated by two five-year periods (2006-2010, 24.5%; 2011-2015, 28.8%) demonstrated a very similar frequency of RVA in both periods. Considering the wide regional and temporal scope of this study, it can be concluded that RVA remains an important etiology of neonatal diarrhea in calves of Brazilian cattle herds.

RESUMO: A diarreia neonatal ocasiona perdas econômicas importantes na pecuária bovina em todo o mundo. Rotavírus A (RVA) é o principal agente etiológico viral de infecções entéricas e surtos de diarreia em bezerros de rebanhos de corte e leite. O objetivo deste estudo retrospectivo (2006-2015) foi determinar a frequência de detecção de RVA em amostras de fezes diarreicas de bezerros de corte e leite das três principais regiões produtoras de bovinos do Brasil. Amostras de fezes diarreicas (n=1.498) de 124 rebanhos bovinos de corte e 56 rebanhos bovinos de leite das regiões Centro-Oeste, Sul e Sudeste do Brasil foram avaliadas utilizando a técnica de eletroforese em gel de poliacrilamida (EGPA). O genoma segmentado de RVA foi identificado pela técnica de EGPA em 410 (27,4%) amostras de fezes. A frequência de amostras positivas encontrada em bezerros de rebanhos de corte (31,9%; 328/1.027) foi maior que a frequência identificada em amostras de fezes diarreicas de bezerros de rebanhos leiteiros (17,4%; 82/471). A infecção por RVA foi identificada em bezerros das três regiões geográficas brasileiras analisadas. No entanto, a frequência de bezerros com diarreia positivos para RVA na região Centro-Oeste (39,4%), predominantemente de bezerros de rebanhos de corte, foi maior que nas regiões Sul (19,4%) e Sudeste (17,6%). A distribuição temporal dos bezerros infectados com RVA avaliados por dois períodos de cinco anos (2006-2010, 24,5%; 2011-2015, 28,8%) demonstrou uma frequência muito semelhante em ambos os períodos. Considerando a amplitude regional e temporal deste estudo, pode-se concluir que RVA continua sendo uma importante etiologia de diarreia neonatal em bezerros de rebanhos bovinos brasileiros.

Enteropatógenos de potencial zoonótico identificados em aves silvestres / Enteric pathogens with zoonotic potential identified in wild birds / Patógenos entéricos de potencial zoonótico identificados en aves silvestres

Os enteropatógenos podem ser considerados um dos principais grupos de micro-organismos patogênicos para humanos e animais. Podem estabelecer infecção nos suscetíveis devido a contaminação de água, alimentos ou pelo contato estreito com animais, incluindo as aves silvestres ou com o ambiente de criação. O acesso das aves da fauna silvestre ao ambiente próximo aos domicílios favorece a contaminação peridomiciliar pelas fezes dos passeriformes e psitaciformes. Locais como parques e praças podem se tornar propícios para veiculação destes patógenos devido a deficiente higienização e livre acesso destas aves silvestres. Neste artigo foram revisados alguns enteropatógenos de origem bacteriana e viral que podem ser considerados de alto risco para infecção humana levando-se em consideração a relevância das aves silvestres neste contexto.(AU)

Entheric pathogens can be considered one of the main pathogenic groups of microorganisms in humans and animals. It can stablish infection in susceptible due to contamination of water, food, or by close contact with animals, including wild birds or the breeding environment. The access of wild birds to the environment close to residences predispose peridomestic contamination by feces of passeriforms and psittaciformes. Places like parks and squares can become propitious for propagation of these pathogens due to poor hygiene and free access of wild birds. In this article some enteric pathogens of bacterial and viral origin was revised, which can be considered of high risk for human infection considering the relevance of wild birds in this context.(AU)

Los patógenos entéricos pueden ser considerados como uno de los grupos principales de microorganismos patogénicos para el ser humano y los animales. Pueden establecer la infección en susceptibles debido a la contaminación del agua, los alimentos o por el contacto cercano con los animales, incluyendo los pájaros salvajes o con el ambiente de la creación. El acceso a las aves de vida silvestre para el medio ambiente cerca de los hogares peridomésticos favorece la contaminación por heces de aves paseriformes y psitaciformes. Los lugares como parques y plazas pueden llegar a ser propicio para la propagación de estos patógenos debido a la falta de higiene y el libre acceso de las aves silvestres. En este artículo algunos patógenos entéricos del origen bacteriano y viral fueron revisados que pueden ser considerados de alto riesgo de contaminación humana, teniendo en cuenta la relevancia de las aves silvestres en este contexto.(AU)

Enteropatógenos de potencial zoonótico identificados em aves silvestres / Enteric pathogens with zoonotic potential identified in wild birds / Patógenos entéricos de potencial zoonótico identificados en aves silvestres

Os enteropatógenos podem ser considerados um dos principais grupos de micro-organismos patogênicos para humanos e animais. Podem estabelecer infecção nos suscetíveis devido a contaminação de água, alimentos ou pelo contato estreito com animais, incluindo as aves silvestres ou com o ambiente de criação. O acesso das aves da fauna silvestre ao ambiente próximo aos domicílios favorece a contaminação peridomiciliar pelas fezes dos passeriformes e psitaciformes. Locais como parques e praças podem se tornar propícios para veiculação destes patógenos devido a deficiente higienização e livre acesso destas aves silvestres. Neste artigo foram revisados alguns enteropatógenos de origem bacteriana e viral que podem ser considerados de alto risco para infecção humana levando-se em consideração a relevância das aves silvestres neste contexto.

Entheric pathogens can be considered one of the main pathogenic groups of microorganisms in humans and animals. It can stablish infection in susceptible due to contamination of water, food, or by close contact with animals, including wild birds or the breeding environment. The access of wild birds to the environment close to residences predispose peridomestic contamination by feces of passeriforms and psittaciformes. Places like parks and squares can become propitious for propagation of these pathogens due to poor hygiene and free access of wild birds. In this article some enteric pathogens of bacterial and viral origin was revised, which can be considered of high risk for human infection considering the relevance of wild birds in this context.

Los patógenos entéricos pueden ser considerados como uno de los grupos principales de microorganismos patogénicos para el ser humano y los animales. Pueden establecer la infección en susceptibles debido a la contaminación del agua, los alimentos o por el contacto cercano con los animales, incluyendo los pájaros salvajes o con el ambiente de la creación. El acceso a las aves de vida silvestre para el medio ambiente cerca de los hogares peridomésticos favorece la contaminación por heces de aves paseriformes y psitaciformes. Los lugares como parques y plazas pueden llegar a ser propicio para la propagación de estos patógenos debido a la falta de higiene y el libre acceso de las aves silvestres. En este artículo algunos patógenos entéricos del origen bacteriano y viral fueron revisados que pueden ser considerados de alto riesgo de contaminación humana, teniendo en cuenta la relevancia de las aves silvestres en este contexto.

Outbreak of neonatal diarrhea caused by multiple genotypes of rotavirus A in a beef calves herd / Surto de diarreia neonatal por múltiplos genótipos de rotavírus A em um rebanho de bovinos de corte

Calf diarrhea causes substantial economic losses to beef cattle production worldwide. It is a complex multifactorial pathological condition influenced by infectious, nutritional and environmental factors. The present study focused on analyzing the pathological and molecular characterization of bovine rotavirus A (BoRVA) during a diarrhea outbreak in a beef cattle herd located in the state of Mato Grosso, central-western region, Brazil. The outbreak caused high morbidity (80%) and mortality (12%) among 1,100 calves up to 30 days of age. The BoRVA was identified in 53.3% (16/30) of the diarrheic fecal samples analyzed using the silver-stained polyacrylamide gel electrophoresis (ss-PAGE) technique. The nucleotide sequence analysis of VP7 (G genotype) and VP4 (P genotype) via RT-PCR from eight BoRVA-positive fecal samples showed the genotypes G6P[5] (n = 6), G6P[11] (n = 1) and G6P[X] (n = 1). Three calves were necropsied and the gross findings included edema and thickened, wrinkled bowel mucosa in the small intestine. Microscopic lesions were confined to the villi of the small intestine, characterized mainly by villus fusion and moderate multifocal lymphoplasmacytic enteritis. Immunohistochemical examination of three cases was positive for BoRVA. The 53.3% of the diarrheic fecal samples that were positive for BoRVA in this study suggested that RV was the etiological agent involved in this neonatal calf diarrhea outbreak.(AU)

A diarreia neonatal provoca perdas econômicas substanciais na produção de bovinos em todo o mundo. É uma condição patológica multifatorial complexa influenciada por fatores infecciosos, nutricionais e ambientais. O presente estudo teve por objetivo caracterizar o rotavírus tipo A (BoRVA) através da análise patológica e molecular durante um surto de diarreia em um rebanho bovino localizado no estado de Mato Grosso, região centro-oeste, no Brasil. O surto causou alta morbidade (80%) e letalidade (12%) em um rebanho composto 1.100 bezerros até 30 dias de idade. O BoRVA foi identificado em 53,3% (16/30) das amostras fecais diarreicas analisadas usando a técnica de eletroforese em gel de poliacrilamida corada com prata (ss-PAGE). A análise da sequência nucleotídica de VP7 (genótipo G) e VP4 (genótipo P) via RT-PCR a partir de oito amostras fecais BoRVA-positivas mostrou os genótipos G6P [5] (n = 6), G6P [11] (n = 1) e G6P [X] (n = 1). Três bezerros foram submetidos à necropsia e os achados macroscópicos incluíram edema e espessamento da mucosa do intestino delgado. As lesões microscópicas foram observadas nas vilosidades do intestino delgado, sendo caracterizadas principalmente por fusiosamento de vilosidades e enterite linfoplasmocitária multifocal moderada. O exame imunohistoquímico dos três casos foram positivos para o BoRVA. As 53,3% das amostras fecais diarreicas positivas para o BoRVA sugeriram que o rotavírus é o agente etiológico envolvido neste surto de diarreia neonatal em bezerros.(AU)

Outbreak of neonatal diarrhea caused by multiple genotypes of rotavirus A in a beef calves herd / Surto de diarreia neonatal por múltiplos genótipos de rotavírus A em um rebanho de bovinos de corte

Calf diarrhea causes substantial economic losses to beef cattle production worldwide. It is a complex multifactorial pathological condition influenced by infectious, nutritional and environmental factors. The present study focused on analyzing the pathological and molecular characterization of bovine rotavirus A (BoRVA) during a diarrhea outbreak in a beef cattle herd located in the state of Mato Grosso, central-western region, Brazil. The outbreak caused high morbidity (80%) and mortality (12%) among 1,100 calves up to 30 days of age. The BoRVA was identified in 53.3% (16/30) of the diarrheic fecal samples analyzed using the silver-stained polyacrylamide gel electrophoresis (ss-PAGE) technique. The nucleotide sequence analysis of VP7 (G genotype) and VP4 (P genotype) via RT-PCR from eight BoRVA-positive fecal samples showed the genotypes G6P[5] (n = 6), G6P[11] (n = 1) and G6P[X] (n = 1). Three calves were necropsied and the gross findings included edema and thickened, wrinkled bowel mucosa in the small intestine. Microscopic lesions were confined to the villi of the small intestine, characterized mainly by villus fusion and moderate multifocal lymphoplasmacytic enteritis. Immunohistochemical examination of three cases was positive for BoRVA. The 53.3% of the diarrheic fecal samples that were positive for BoRVA in this study suggested that RV was the etiological agent involved in this neonatal calf diarrhea outbreak.(AU)

A diarreia neonatal provoca perdas econômicas substanciais na produção de bovinos em todo o mundo. É uma condição patológica multifatorial complexa influenciada por fatores infecciosos, nutricionais e ambientais. O presente estudo teve por objetivo caracterizar o rotavírus tipo A (BoRVA) através da análise patológica e molecular durante um surto de diarreia em um rebanho bovino localizado no estado de Mato Grosso, região centro-oeste, no Brasil. O surto causou alta morbidade (80%) e letalidade (12%) em um rebanho composto 1.100 bezerros até 30 dias de idade. O BoRVA foi identificado em 53,3% (16/30) das amostras fecais diarreicas analisadas usando a técnica de eletroforese em gel de poliacrilamida corada com prata (ss-PAGE). A análise da sequência nucleotídica de VP7 (genótipo G) e VP4 (genótipo P) via RT-PCR a partir de oito amostras fecais BoRVA-positivas mostrou os genótipos G6P [5] (n = 6), G6P [11] (n = 1) e G6P [X] (n = 1). Três bezerros foram submetidos à necropsia e os achados macroscópicos incluíram edema e espessamento da mucosa do intestino delgado. As lesões microscópicas foram observadas nas vilosidades do intestino delgado, sendo caracterizadas principalmente por fusiosamento de vilosidades e enterite linfoplasmocitária multifocal moderada. O exame imunohistoquímico dos três casos foram positivos para o BoRVA. As 53,3% das amostras fecais diarreicas positivas para o BoRVA sugeriram que o rotavírus é o agente etiológico envolvido neste surto de diarreia neonatal em bezerros.(AU)

Investigation of enteric viruses in the feces of neotropical migratory birds captured on the coast of the State of Pará, Brazil

Migratory birds can become long-distance vectors for a wide range of microorganisms and can cause human disease, being the Brazilian coast a gateway for northern migratory birds. These animals are considered natural reservoirs of different viruses that cause important diseases, being relevant research of viral pathogens in migratory birds to epidemiology surveillance. The objective of the study was to investigate the presence of avian rotavirus (AvRV), avian reovirus (ARV) and picobirnavirus (PBV) in Neotropical migratory birds captured on the coast of Brazil. A total of 23 individual fecal samples of the migratory birds species Calidris pusilla (20 birds), Numenius phaeopus (1 bird) and Charadrius semipalmatus (2 birds) were collected. Fecal suspensions were prepared from the collected samples for subsequent extraction of double-stranded RNA (dsRNA), which was subjected to polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) and reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). The electrophoretic profiles were not detected by PAGE, and the amplification for the studied viruses PBV, ARV and AvRV (specie D, gene VP6 and NSP4) were negative. Positivity for AvRVD, VP7 gene was of 4.35% (1/23) for the migratory bird Calidris pusilla. After sequencing and building the tree of phylogenetic relationships avian Rotavirus Group D identified in this study was phylogenetically related and grouped into one branch, together to previously reported AvRVD from Brazil in chicken flocks with 99.8% nucleotide and 100% amino acid similarities.(AU)

Investigation of enteric viruses in the feces of neotropical migratory birds captured on the coast of the State of Pará, Brazil

Migratory birds can become long-distance vectors for a wide range of microorganisms and can cause human disease, being the Brazilian coast a gateway for northern migratory birds. These animals are considered natural reservoirs of different viruses that cause important diseases, being relevant research of viral pathogens in migratory birds to epidemiology surveillance. The objective of the study was to investigate the presence of avian rotavirus (AvRV), avian reovirus (ARV) and picobirnavirus (PBV) in Neotropical migratory birds captured on the coast of Brazil. A total of 23 individual fecal samples of the migratory birds species Calidris pusilla (20 birds), Numenius phaeopus (1 bird) and Charadrius semipalmatus (2 birds) were collected. Fecal suspensions were prepared from the collected samples for subsequent extraction of double-stranded RNA (dsRNA), which was subjected to polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) and reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). The electrophoretic profiles were not detected by PAGE, and the amplification for the studied viruses PBV, ARV and AvRV (specie D, gene VP6 and NSP4) were negative. Positivity for AvRVD, VP7 gene was of 4.35% (1/23) for the migratory bird Calidris pusilla. After sequencing and building the tree of phylogenetic relationships avian Rotavirus Group D identified in this study was phylogenetically related and grouped into one branch, together to previously reported AvRVD from Brazil in chicken flocks with 99.8% nucleotide and 100% amino acid similarities.

Immunohistochemical detection of viral etiopathogenesis in lambs and goat kids with neonatal diarrhea

Background: Neonatal enteritis is an important disease that causes deaths of animals before 3 weeks of age, and results in significant economic losses. Viral agents can predispose the young animals to secondary infections in the gastrointestinal tract, especially in lambs and goat kids younger than 21 days. Although the neonatal diarrhea is common in calves, there is still little knowledge about pathology, pathogenesis and immunohistochemical localization of viral agents that cause neonatal enteritis in lambs and goat kids. In this study, we carried out investigations with the aim of detecting adenovirus, rotavirus, coronavirus and herpes virus in the guts of goat kids and lambs with viral enteritis.Materials, Methods & Results: Adenovirus, rotavirus, coronavirus and herpes virus antisera were applied to paraffinembedded intestinal tissue from neonatal lambs and kids that had died from enteritis. In addition, viral agents in the gut cells were detected and evaluated by electron microscopy. The study material consisted of 15 lambs and 15 goat kids that were presented for diagnosis. Viral agents were detected by immunohistochemically in 20 out of 30 animals. Rotavirus was diagnosed in 10 animals, adenovirus in five, herpes virus in three and coronavirus in two animals; and these results were supported by the electron microscopy. This study showed that viral agents play an important role in neonatal enteritis in lambs and kids.Discussion: Bacteria, viruses and protozoa may have a role in the etiology of neonatal enteritis and identifying the etiological agents is not always possible without laboratory studies. In addition, the immune system of the animal and environmental factors are important factors for to occurrence of the disease.[...]

Immunohistochemical detection of viral etiopathogenesis in lambs and goat kids with neonatal diarrhea

Background: Neonatal enteritis is an important disease that causes deaths of animals before 3 weeks of age, and results in significant economic losses. Viral agents can predispose the young animals to secondary infections in the gastrointestinal tract, especially in lambs and goat kids younger than 21 days. Although the neonatal diarrhea is common in calves, there is still little knowledge about pathology, pathogenesis and immunohistochemical localization of viral agents that cause neonatal enteritis in lambs and goat kids. In this study, we carried out investigations with the aim of detecting adenovirus, rotavirus, coronavirus and herpes virus in the guts of goat kids and lambs with viral enteritis.Materials, Methods & Results: Adenovirus, rotavirus, coronavirus and herpes virus antisera were applied to paraffinembedded intestinal tissue from neonatal lambs and kids that had died from enteritis. In addition, viral agents in the gut cells were detected and evaluated by electron microscopy. The study material consisted of 15 lambs and 15 goat kids that were presented for diagnosis. Viral agents were detected by immunohistochemically in 20 out of 30 animals. Rotavirus was diagnosed in 10 animals, adenovirus in five, herpes virus in three and coronavirus in two animals; and these results were supported by the electron microscopy. This study showed that viral agents play an important role in neonatal enteritis in lambs and kids.Discussion: Bacteria, viruses and protozoa may have a role in the etiology of neonatal enteritis and identifying the etiological agents is not always possible without laboratory studies. In addition, the immune system of the animal and environmental factors are important factors for to occurrence of the disease.[...](AU)

Identification of co-infection by rotavirus and parvovirus in dogs with gastroenteritis in Mexico

ABSTRACT This is the first report on circulating canine rotavirus in Mexico. Fifty samples from dogs with gastroenteritis were analyzed used polymerase chain reaction and reverse transcription polymerase chain reaction in order to identify parvovirus and rotavirus, respectively; 7% of dogs were infected with rotavirus exclusively, while 14% were co-infected with both rotavirus and parvovirus; clinical signs in co-infected dogs were more severe.(AU)

Vacinação pré-parto de vacas Nelore contra diarreia neonatal

A diarreia neonatal dos bezerros (DNB) é um dos eventos de saúde mais importantes durante o período de criação de bezerros de corte, sendo responsável por grande parte da morbidade e mortalidade nesta fase. Entre as medidas para mitigar o risco de surtos de DNB, a vacinação da vaca na última fase da gestação é uma das mais importantes. O objetivo desta pesquisa foi avaliar a eficácia da vacinação pré-parto contra DNB, especialmente Rotavírus Bovino tipo A (BoRVA) e Coronavírus Bovino (BCoV), em animais da raça Nelore. Um total de 117 animais, divididos em vacas (n=81) e novilhas (n=36) foram distribuídos em dois grupos experimentais, sendo estes: grupo de animais vacinados (VAC: vacas=40; novilhas=19) e grupo de animais não vacinados (NVAC: vacas=41; novilhas=17). O tratamento dos animais ocorreu entre 60 a 50 dias antes da data prevista para o parto, sendo aplicado no grupo VAC uma única dose de uma vacina comercial (2mL), administrado por via intramuscular, e no grupo NVAC uma dose de solução salina 0,9%. Amostras de sangue foram coletadas imediatamente antes da vacinação e após 30 dias, para avaliar a resposta de anticorpos específicos (IgG1) contra BoRVA e BCoV. O nascimento dos bezerros foi monitorado e a transferência de imunidade passiva foi avaliada entre o segundo e o terceiro dias de vida. A diarreia foi monitorada nos primeiros 30 dias de idade, e amostras de fezes foram coletadas para identificação do agente etiológico em animais com diarreia. Como controle, amostras de fezes de bezerros saudáveis com idade semelhante à dos animais com diarreia, também foram coletadas. Os anticorpos específicos (IgG1) contra BoRVA e BCoV foram medidos usando a técnica Enzyme Linked Immuno Sorbent Assay (ELISA). A comparação de médias pelo teste T de Student mostrou títulos mais elevados de IgG1 contra BoRVA e BCoV no grupo VAC quando comparado ao grupo NVAC na categoria de vacas (P<0,0001) e no total de animais (P<0,0001). Em relação aos bezerros, não houve diferenças (P>0,05) entre os grupos para a concentração de proteína total sérica (PTS) e taxa (%) de falha da transferência imune passiva (FTIP). O título de IgG1 específico no soro de bezerros refletiu a resposta das mães, observando títulos mais elevados de IgG1 para BoRVA (P<0,0016) e BCoV (P<0,0095) nos bezerros nascidos da categoria de vacas do grupo VAC; e títulos mais elevados de IgG1 para BoRVA (P<0,0171) e BCoV (P<0,0200) nos bezerros nascidos do total de animais do grupo VAC. A incidência geral de diarreia observada foi de 18,6% (11/59) e 29,3% (17/58) nos bezerros nascidos do grupo VAC e NVAC, respectivamente. Apesar da diferença observada, o pequeno tamanho amostral não permitiu detectar diferenças estatísticas entre os grupos experimentais para diarreia (P>0,05). Entre bezerros com diarreia, o agente mais prevalente foi o BoRVA. A vacinação pré-parto com uma única dose da vacina testada aumentou os títulos de IgG1 contra BCoV e BoRVA, podendo ser utilizada como estratégia preventiva para diminuir a ocorrência de DNB em animais da raça Nelore.

Neonatal calf diarrhea (NCD) is one of the most important health events during the rearing period of beef calves, accounting for much of the morbidity and mortality at this stage. Among the measures to mitigate the risk of NCD outbreaks, cow vaccination in the last stage of pregnancy is one of the most important. The objective of this research was to evaluate the effectiveness of prepartum vaccination against NCD, especially Bovine Rotavirus type A (BoRVA) and Bovine Coronavirus (BCoV), in Nelore animals. A total of 117 animals, divided into cows (n=81) and heifers (n=36) were divided into two experimental groups, namely: vaccinated animal group (VAC: cows=40; heifers=19) and animal group unvaccinated (NVAC: cows=41; heifers=17). The treatment of the animals occurred between 60 to 50 days before the expected date of calving, with a single dose of a commercial vaccine (2mL) being applied to the VAC group, administered intramuscularly, and to the NVAC group a dose of saline solution 0, 9%. Blood samples were collected immediately before vaccination and after 30 days to assess the specific antibody response (IgG1) against BoRVA and BCoV. The calf birth was monitored and the transfer of passive immunity was evaluated between the second and third days of life. Diarrhea was monitored in the first 30 days of age, and stool samples were collected to identify the etiologic agent in animals with diarrhea. As a control, fecal samples from healthy calves with age similar to that of animals with diarrhea were also collected. Specific antibodies (IgG1) against BoRVA and BCoV were measured using the Enzyme Linked Immuno Sorbent Assay (ELISA) technique. Comparison of means by Student's t test showed higher IgG1 titers against BoRVA and BCoV in the VAC group when compared to the NVAC group in the cows category (P<0.0001) and in total animals (P<0.0001) . In relation to calves, there were no differences (P>0.05) between groups for serum total protein concentration (STP) and rate (%) of passive immune transfer failure (PITF). The specific IgG1 titer in the serum of calves reflected the response of the dams, observing higher IgG1 titers for BoRVA (P<0.0016) and BCoV (P<0.0095) in calves born from the category of cows in the VAC group; and higher IgG1 titers for BoRVA (P<0.0171) and BCoV (P<0.0200) in calves born from the total number of animals in the VAC group. The overall incidence of diarrhea observed was 18.6% (11/59) and 29.3% (17/58) in calves born in the VAC and NVAC groups, respectively. Despite the observed difference, the small sample size did not allow detecting statistical differences between the experimental groups for diarrhea (P>0.05). Among calves with diarrhea, the most prevalent agent was BoRVA. Prepartum vaccination with a single dose of the tested vaccine increased IgG1 titers against BCoV and BoRVA, and can be used as a preventive strategy to reduce the occurrence of NCD in Nelore animals.

Analysis of bovine rotavirus strains circulating in diarrheic dairy calves in Uberaba, Minas Gerais, Brazil, during 2008-2009 / Análise de cepas de rotavírus bovino circulantes em bezerros leiteiros com diarreia em Uberaba, Minas Gerais, Brasil, durante 2008-2009

O objetivo deste estudo foi detectar rotavírus em fezes de bezerros com diarreia em Uberaba, MG, e caracterizar os genes VP7 e VP4 por meio da genotipagem e da análise filogenética. Setenta e quatro amostras foram coletadas entre novembro de 2008 e setembro de 2009. A detecção do vírus foi feita por teste de aglutinação e as amostras positivas foram submetidas à transcrição reversa, seguida de reação em cadeia da polimerase (RT-PCR), tipagem por PCR e sequenciamento. A taxa de detecção de rotavírus foi de 6,8% e todas as amostras apresentaram o genótipo G6P[5]. A análise filogenética mostrou que as amostras do genótipo G6 pertencem à linhagem IV e que, para ambos os genes (VP7 e VP4), as amostras deste estudo compõem um sub-cluster à parte daquele das cepas referências e das amostras campo mais similares. O alinhamento das sequências de aminoácidos deduzidas mostrou substituições em regiões antigênicas quando comparadas com as sequências das cepas bovinas UK e NCDV, presentes nas vacinas disponíveis no Brasil. Uma nova sublinhagem genética de G6P[5] foi evidenciada neste estudo. Substituições de aminoácidos nas regiões antigênicas dos rotavírus e a circulação de novas variantes podem representar desafios para as vacinas utilizadas atualmente. O presente estudo contribui para a compreensão da epidemiologia dos rotavírus bovinos no Brasil.(AU)

Analysis of bovine rotavirus strains circulating in diarrheic dairy calves in Uberaba, Minas Gerais, Brazil, during 2008-2009 / Análise de cepas de rotavírus bovino circulantes em bezerros leiteiros com diarreia em Uberaba, Minas Gerais, Brasil, durante 2008-2009

O objetivo deste estudo foi detectar rotavírus em fezes de bezerros com diarreia em Uberaba, MG, e caracterizar os genes VP7 e VP4 por meio da genotipagem e da análise filogenética. Setenta e quatro amostras foram coletadas entre novembro de 2008 e setembro de 2009. A detecção do vírus foi feita por teste de aglutinação e as amostras positivas foram submetidas à transcrição reversa, seguida de reação em cadeia da polimerase (RT-PCR), tipagem por PCR e sequenciamento. A taxa de detecção de rotavírus foi de 6,8% e todas as amostras apresentaram o genótipo G6P[5]. A análise filogenética mostrou que as amostras do genótipo G6 pertencem à linhagem IV e que, para ambos os genes (VP7 e VP4), as amostras deste estudo compõem um sub-cluster à parte daquele das cepas referências e das amostras campo mais similares. O alinhamento das sequências de aminoácidos deduzidas mostrou substituições em regiões antigênicas quando comparadas com as sequências das cepas bovinas UK e NCDV, presentes nas vacinas disponíveis no Brasil. Uma nova sublinhagem genética de G6P[5] foi evidenciada neste estudo. Substituições de aminoácidos nas regiões antigênicas dos rotavírus e a circulação de novas variantes podem representar desafios para as vacinas utilizadas atualmente. O presente estudo contribui para a compreensão da epidemiologia dos rotavírus bovinos no Brasil.(AU)

Enteropatógenos associados a diarreia em potros

Estudos epidemiológicos apontam a diarreia como a segunda doença mais incidente em sistemas de criação de potros, atrás apenas das afecções respiratórias. No Brasil, estudos de diarreia associada a infecção por enteropatógenos em potros são limitados e destacam os mecanismos de coinfecção entérica e identificam os principais fatores de virulência de alguns patógenos. O objetivo desta dissertação é apresentar um artigo em formato de revisão bibliográfica a respeito dos principais enteropatógenos associados a diarreia em potros e um segundo artigo em formato de relato de caso abordando dois casos clínicos isolados de dois potros com diarreia associada a infecção por rotavírus em dois Haras de criação de equinos Puro Sangue Inglês na região de Bagé-RS. Apesar da ampla distribuição do Rotavírus em haras de criação de equino e a importância do agente associado a diarreia em potros, não existem relatos que demonstrem os indicies de infecção por Rotavírus em potros na região de Bagé, sendo este o primeiro relato de caso desta afecção na região. Os casos isolados de diarreia por Rotavírus ocorreram em potros com 3 meses de idade, no período do ano caracterizado por temperaturas elevadas e alta densidade populacional, associado a fatores predisponentes que favorecem o desenvolvimento desta afecção.

Epidemiological studies point to diarrhea as the second most common disease in foal breeding systems, behind only respiratory disorders. In Brazil, studies of diarrhea associated with infection by enteropathogens in foals are limited and highlight the mechanisms of enteric co-infection and identified the main virulence factors of some pathogens. The aim of this dissertation is to present an article in bibliographic review format about the main enteropathogens associated with diarrhea in foals and a second article in a case report format addressing two isolated clinical cases of two foals with diarrhea associated with rotavirus infection from two thoroughbred breeding farms in the region of Bagé-RS. Despite the wide distribution of Rotavirus in horse breeding farms and the importance of the agent associated with diarrhea in foals, there are no reports showing Rotavirus infection in foals in Bagé region, this being the first case report of this condition in the location. Isolated cases of Rotavirus diarrhea occurred in foals of 3 months of age, in the period of the year characterized by high temperatures and high population density, associated with predisposing factors that favor the development of this condition.

Diversity of group A rotavirus genes detected in the Triângulo Mineiro region, Minas Gerais, Brazil

Group A rotaviruses are the main causative agent of infantile gastroenteritis. The segmented nature of the viral genome allows reassortment of genome segments, which can generate genetic variants. In this study, we characterized the diversity of the VP7, VP4 (VP8*), VP6, NSP4, and NSP5 genes of the rotaviruses that circulated from 2005 to 2011 in the Triângulo Mineiro (TM) region of Brazil. Samples with genotypes G2 (sublineages IVa-1 and IVa-3), G1 (sublineage I-A), G9 (lineage III), G12 (lineages II and III), G8 (lineage II), G3 (lineage III), P[4] (sublineages IVa and IVb), P[8] (sublineages P[8]-3.6, P[8]-3.3, and P[8]-3.1), I2 (lineage VII), E2 (lineages VI, XII, and X), and H2 (lineage III) were identified. The associations found in the samples were G1, G9, or G12 with P[8]-I1-E1-H1; G2 or G8 with P[4]-I2-E2-H2; G12 with I3-E3-H6; and G3 with P[4]-I2-E3-H3 (previously unreported combination). Reassortment events in G2P[4] strains and an apparent pattern of temporal segregation within the lineages were observed. Five TM samples contained genes that exhibited high nucleotide and amino acid identities with strains of animal origin. The present study includes a period of pre- and post-introduction of rotavirus vaccination in all Brazilian territories, thereby serving as a basis for monitoring changes in the genetic constitution of rotaviruses. The results also contribute to the understanding of the diversity and evolution of rotaviruses in a global context.(AU)