Phenotypical characterization and adhesin identification in Escherichia coli strains isolated from dogs with urinary tract infections

Pathogenic strains of Escherichia coli are the most common bacteria associated with urinary tract infections in both humans and companion animals. Standard biochemical tests may be useful in demonstrating detailed phenotypical characteristics of these strains. Thirteen strains of E. coli isolated from dogs with UTIs were submitted to biochemical tests, serotyping for O and H antigens and antimicrobial resistance testing. Furthermore, the presence of papC, sfa, and afa genes was evaluated by PCR, and genetic relationships were established using enterobacterial repetitive intergenic consensus PCR (ERIC-PCR). The antimicrobial that showed the highest resistance rate among the isolates was nalidixic acid (76.9%), followed by cephalotin (69.2%), sulfamethoxazole + trimethoprim (61.5%), tetracycline (61.5%), streptomycin (53.8%), ciprofloxacin (53.8%), ampicillin (46.2%), gentamicin (30.8%) and chloramphenicol (23.1%). No isolate was resistant either to meropenem or nitrofurantoin. Among the five clusters that were identified using ERIC-PCR, one cluster (A) had only one strain, which belonged to a serotype with zoonotic potential (O6:H31) and showed the genes papC+, sfa+, afa-. Strains with the genes papC-, sfa+, afa- were found in two other clusters (C and D), whereas all strains in clusters B and E possessed papC-, sfa-, afa- genes. Sucrose and raffinose phenotypic tests showed some ability in discriminating clusters A, B and C from clusters D and E.

Biótipos de Staphylococcus aureus isolados de leite in natura de vacas com mastite subclínica / Staphylococcus aureus biotypes isolated from raw milk of cows with subclinical mastitis

O presente estudo objetivou averiguar a origem de trinta cepas de Staphylococcus aureus produtoras e não produtoras de enterotoxinas isoladas de leite de vacas com mastite subclínica. Para isto, as cepas foram submetidas ao sistema de biotipagem proposto por Devriese, verificando o comportamento destas aos testes bioquímicos de produção de estafiloquinase (K), beta-hemólise (ß), coagulação de plasma bovino (CPB) e crescimento na presença de cristal violeta (CV). As 30 cepas de S. aureus foram subdivididas em nove biótipos sendo quatro com hospedeiro especifico classificadas nos biótipos aviário (05), bovino (02), humano (01) e ovino (01), e cinco biótipos hospedeiros não especifico com 21 cepas que apresentaram as seguintes características bioquímicas K-;ß+;CPB-;CV:A (06), K-;ß+;CPB-;CV:C (05), K-;ß+;CPB-;CV:E (04), K-;ß-;CPB-;CV:C (03) e K-;ß-;CPB-;CV:E (03), que podem ser isoladas de humano, bovino, e ave. O biótipo hospedeiro não especifico foi o mais frequente tanto entre as cepas produtoras de enterotoxinas, como das não produtoras. O predomínio deste biótipo sugere que há deficiência, no manejo dos animais com riscos a saúde pública.

The present study aimed to determine the origin of thirty enterotoxin producing and non-producing strains of Staphylococcus aureus isolated from milk of cows with subclinical mastitis. For this, strains were screened by a biotyping method proposed by Devriese, basing on their production of staphylokinase (K), beta ­hemolysis (ß), coagulation of bovine plasma (CPB) and growth on crystal violet (CV). The 30 strains of S. aureus were grouped into nine biotypes and four of them were host-specific biotypes, as follows: aviary (05), bovine (02), human (01) and sheep (01). Twenty-one strains belonged to five non-host-specific biotypes with the following biochemical characteristics: K -ß+;CPB -; CV: A (06),K-ß+; CPB-;CV: C (05), K-ß+; CPB-;CV: E (04), K-ß-; CPB-;CV: C (03) and K-ß-;-CPB;CV: E (03); strains grouped into some of these groups could be isolated from human, bovine, and bird. The non-host-specific was the most frequent biotype among enterotoxin producing and non-producing strains. The predominance of non-host-specific biotypes points to the occurrence of a deficient animal management with risks to public health.

Caracterização de biótipos de Staphylococcus aureus isolados de mastite bovina

Two hundred and eighteen strains of Staphylococcus aureus isolated from bovine intramammary infections, obtained from 44 different dairy herds, were classified in biotypes based on staphylokinase (K) and beta-haemolysin (beta ) production, bovine plasma coagulation (Pl) and growth on crystal violet agar (CV). The strains were assigned to 10 different types, with 63 in the bovine (35), ovine (17), poultry (10) and human (1) ecovars and 155 in non-host specific biotypes. The latter can be isolated from man, goat, rabbit, pig, food, and bovine mastitis. The biotype 1, with reaction pattern K (-), beta (+), Pl (-) and CV (blue), was the most frequently found (37,2%). From seven herds ten or more strains were examined. It was found that in spite of the presence of different biotypes per herd, there was always one prevalent biotype.

Duzentos e dezoito amostras de Staphylococcus aureus, isoladas de infecção intramamária de vacas de 44 rebanhos leiteiros, foram classificadas em biótipos de acordo com os testes de produção de estafiloquinase (K), beta-hemolisina (beta ), coagulação do plasma bovino (Pl) e crescimento na presença de cristal violeta (CV). As amostras foram distribuídas em 10 biótipos e 63 delas foram classificadas nas ecovariedades bovina (35), ovina (17), aviária (10) e humana (1) e 155 não apresentaram características específicas de hospedeiro. Estas últimas podem ser isoladas de homem, cabra, coelho, suíno, alimentos e de mastite bovina. O biótipo 1, encontrado com maior freqüência (37,2%), apresentou o padrão K (-), beta (+), Pl (-) e CV (azul). Em sete rebanhos nos quais se examinaram 10 ou mais amostras, verificou-se que, apesar da ocorrência simultânea de mais de um biótipo por rebanho, houve predominância de um sobre os demais.

Comparison of electrophoretic protein profiles of Campylobacter jejuni subsp. jejuni isolated from different animal species

Electrophoretic protein profiles of Campylobacter jejuni subsp. jejuni strains isolated from feces of seven animal species, including man, were compared. Fourteen strains (two from each species) plus two human strains and the reference one, were ruptured by ultrasound and their total soluble proteins were analyzed by SDS-PAGE technique in a 12% polyacrylamide gel with computerized densitometric reading by the molecular analyst software. All the strains had bands in common that correspond to 45 and 66 Kda molecular weight. The disagreement corresponded to a 97 to 200 Kda molecular weight region. From the 17 strains, 13 (76.5%), were classified as biotype I, three (17.6%) as biotype II and one (5.8%) as biotype III. Since protein extracts were obtained from cells grown under identical conditions, and thus, able to express the same phenotype, this disagreement region could be related to different genotypes or serotypes.

Perfis eletroforéticos de proteínas de cepas Campylobacter jejuni subsp. jejuni isoladas de fezes de diferentes espécies animais, inclusive o homem, foram comparados. Quatorze cepas (duas de cada espécie) mais duas cepas de origem humana e a cepa de referência foram rompidas por ultra-som e suas proteínas solúveis totais analisadas através das técnicas de SDS-PAGE em gel de poliacrilamida a 12% e análise densitométrica. Todas as cepas tinham em comum bandas que migraram em regiões que correspondiam ao peso molecular de 45 e 66 Kda. As regiões discordantes correspondiam principalmente às regiões entre 97 e 200 Kda. Das 17 cepas, 13 (76.5%), foram classificadas como biotipo I, três (17.6%) como biotipo II e uma (5.8%) como biotipo III. Uma vez que os extratos de proteínas foram obtidos de células que se desenvolveram sob condições idênticas, possibilitando a expressão do mesmo fenótipo, estas regiões protéicas discordantes poderiam estar relacionadas a diferentes sorotipos ou genótipos.

Phylo-geographic analysis of whitefly on the basis of mitochondrial cytochrome oxidase 1 gene

Abstract Bemisia tabaci is a species complex that causes damage to its broad range of plant hosts through serious feeding. It transmits plant viruses of different groups to important agricultural crops. Some important cash crops of Pakistan are sugar cane, rice, tobacco and seed oil. It shows high genetic variability and is differentiated as races or biotypes. Biotypes are, biotype Q, biotype B, biotype B2, biotype M, biotype L, biotype A, biotype H, biotype C, biotype K, biotype N, biotype R, biotype E, biotype P, biotype J, biotype S, biotype AN. Although the current report based on the Bayesian study of mitochondrial cytohrome oxidase gene1 (CO1) DNA sequences has classified the different populations of whiteflies into twelve genetic groups which are Mediterranean, Sub-Saharan Africa silverleafing, Indian Ocean, Asia II, Asia I, Australia, New World, Italy, China, Sub-Saharan Africa non-silverleafing, Mediterranean/Asia Minor/Africa and Uganda sweet potato. Begomoviruses is largest group of viruses transmitted by B. tabaci and cause major diseases of crops such as tomato and chili leaf curl disease, cassava mosaic disease; yellow mosaic disease of legumes and cotton leaf curl disease. The main objective of current study is to inculpate knowledge regarding genetic diversity of whitefly in cotton fields across Pakistan via analysis of partial DNA sequence of mitochondrial gene Cytochrom Oxidase I (mtCO1).

Resumo Bemisia tabaci é um complexo de espécies que causa danos a uma ampla gama de hospedeiros vegetais por meio de alimentação séria. Ele transmite vírus de plantas de diferentes grupos para importantes safras agrícolas. Algumas safras comerciais importantes do Paquistão são cana-de-açúcar, arroz, tabaco e óleo de semente. Apresenta alta variabilidade genética e é diferenciado em raças ou biótipos. Os biótipos são: biótipo Q, biótipo B, biótipo B2, biótipo M, biótipo L, biótipo A, biótipo H, biótipo C, biótipo K, biótipo N, biótipo R, biótipo E, biótipo P, biótipo J, biótipo S, biótipo AN . Embora o relatório atual baseado no estudo bayesiano das sequências de DNA do gene 1 da oxidase do citocromo mitocondrial (CO1) tenha classificado as diferentes populações de moscas-brancas em doze grupos genéticos, que são Mediterrâneo, África Subsaariana com folha de prata, Oceano Índico, Ásia II, Ásia I, Austrália, Novo Mundo, Itália, China, África Subsaariana sem folha prateada, Batata-doce Mediterrâneo / Ásia Menor / África e Uganda. Os begomovírus são o maior grupo de vírus transmitidos por B. tabaci e causam as principais doenças de culturas, como a doença do cacho do tomate e da pimenta-malagueta, doença do mosaico da mandioca, doença do mosaico amarelo de leguminosas e doença do enrolamento da folha do algodão. O principal objetivo do presente estudo é inculpar conhecimento sobre a diversidade genética da mosca-branca em campos de algodão em todo o Paquistão por meio da análise da sequência parcial de DNA do gene mitocondrial Citocromo Oxidase I (mtCO1).

Phylo-geographic analysis of whitefly on the basis of mitochondrial cytochrome oxidase 1 gene / Análise filogeográfica da mosca-branca com base no gene citocromo oxidase 1 mitocondrial

Bemisia tabaci is a species complex that causes damage to its broad range of plant hosts through serious feeding. It transmits plant viruses of different groups to important agricultural crops. Some important cash crops of Pakistan are sugar cane, rice, tobacco and seed oil. It shows high genetic variability and is differentiated as races or biotypes. Biotypes are, biotype Q, biotype B, biotype B2, biotype M, biotype L, biotype A, biotype H, biotype C, biotype K, biotype N, biotype R, biotype E, biotype P, biotype J, biotype S, biotype AN. Although the current report based on the Bayesian study of mitochondrial cytohrome oxidase gene1 (CO1) DNA sequences has classified the different populations of whiteflies into twelve genetic groups which are Mediterranean, Sub-Saharan Africa silverleafing, Indian Ocean, Asia II, Asia I, Australia, New World, Italy, China, Sub-Saharan Africa non-silverleafing, Mediterranean/Asia Minor/Africa and Uganda sweet potato. Begomoviruses is largest group of viruses transmitted by B. tabaci and cause major diseases of crops such as tomato and chili leaf curl disease, cassava mosaic disease; yellow mosaic disease of legumes and cotton leaf curl disease. The main objective of current study is to inculpate knowledge regarding genetic diversity of whitefly in cotton fields across Pakistan via analysis of partial DNA sequence of mitochondrial gene Cytochrom Oxidase I (mtCO1).

Bemisia tabaci é um complexo de espécies que causa danos a uma ampla gama de hospedeiros vegetais por meio de alimentação séria. Ele transmite vírus de plantas de diferentes grupos para importantes safras agrícolas. Algumas safras comerciais importantes do Paquistão são cana-de-açúcar, arroz, tabaco e óleo de semente. Apresenta alta variabilidade genética e é diferenciado em raças ou biótipos. Os biótipos são: biótipo Q, biótipo B, biótipo B2, biótipo M, biótipo L, biótipo A, biótipo H, biótipo C, biótipo K, biótipo N, biótipo R, biótipo E, biótipo P, biótipo J, biótipo S, biótipo AN . Embora o relatório atual baseado no estudo bayesiano das sequências de DNA do gene 1 da oxidase do citocromo mitocondrial (CO1) tenha classificado as diferentes populações de moscas-brancas em doze grupos genéticos, que são Mediterrâneo, África Subsaariana com folha de prata, Oceano Índico, Ásia II, Ásia I, Austrália, Novo Mundo, Itália, China, África Subsaariana sem folha prateada, Batata-doce Mediterrâneo / Ásia Menor / África e Uganda. Os begomovírus são o maior grupo de vírus transmitidos por B. tabaci e causam as principais doenças de culturas, como a doença do cacho do tomate e da pimenta-malagueta, doença do mosaico da mandioca, doença do mosaico amarelo de leguminosas e doença do enrolamento da folha do algodão. O principal objetivo do presente estudo é inculpar conhecimento sobre a diversidade genética da mosca-branca em campos de algodão em todo o Paquistão por meio da análise da sequência parcial de DNA do gene mitocondrial Citocromo Oxidase I (mtCO1).