Phenotypic characteristics and genetic diversity of new broccoli (Brassica oleracea var. italica Plenck) varieties in China

Due to its high nutritional value, broccoli (Brassica oleracea var. italica Plenck) is one of the most popular vegetables worldwide. This study assessed 36 phenotypic characteristics of 111 broccoli varieties to understand the phenotypic diversity of new broccoli varieties and improve their breeding speed with advantages and characteristics in China, including 108 new varieties and three varieties of common knowledge. The genetic diversity, the principal component, and the cluster of phenotypic characteristics of broccoli varieties were further investigated. The results showed that the coefficients of variation of 36 characteristics ranged between 11.18 % and 94.99 %, with their diversity index between 0.26 and 1.82. The 111 broccoli varieties were further classified into eight groups, primarily attributed to the differences in phenotypic characteristics, including curd weight, main stem thickness, plant development degree, plant height, and anthocyanin coloration. The cumulative contribution rate of the first five principal components reached 81.186 %, corresponding to 12 representative phenotypic traits. The analysis indicated that the phenotypic characteristics of broccoli were rich in diversity, especially for several characteristics appreciated by the market, such as weight, curd firmness, and anthocyanin coloration. This study revealed the basic information on the genetic diversity of new broccoli varieties in China from 2017 to 2019 and provided potential breeding strategies for broccoli to meet diverse market demands.

Breeding behavioral activities of captive red pandas in Nepal

The red panda (Ailurus fulgens) population is decreasing, with less than 10,000 individuals in the wild because of habitat destruction, fragmentation, and illegal hunting. Captive breeding has become an increasingly crucial strategy for conserving endangered species, but efforts to generate self-sustaining populations have failed despite ample resources being allocated. Animals are often stressed in captivity, and it is necessary to examine reproductive behavior relating to the complexity of habitat requirements, dietary preferences, and, in particular, pregnant mothers and their sensitivity to disruptions. Using videography, we observed the reproductive behavior of two red pandas along with other behavioral activities in the Central Zoo, Kathmandu, Nepal. We collected behavioral data from December 2020 to June 2021 using scan and focal sampling. Reproductive behaviors (e.g., scent-marking, allogrooming, chasing, running, aggressiveness, mating, and feeding feces) were observed, along with behaviors like locomotion, climbing, standing, self-grooming, feeding, sleeping, self-play, and stretching. We observed 1­2% of reproductive behavior from total activity. Copulation was attempted on three occasions suggesting reproduction can be successful if animal husbandry is properly managed. We recommend zoo managers further refine strategies for captive breeding endangered species such as red pandas. Successful captive breeding benefits the zoo, and captive-born animals can mitigate extinction in the wild.

Strategic diagnosis of a property specialized in breeding, rearing and finishing beef cattle in the southern region of Piauí

This study aimed to perform a strategic diagnosis on a property specialized in breeding, rearing and finishing beef cattle in the southern region of Piauí. It was conducted at Agropecuária Alvorada, located in the countryside, municipality of Bom Jesus, PI, Brazil. The farm develops the full cycle of beef cattle production, which is divided into breeding, rearing and finishing. A SWOT analysis (which stands for Strengths, Weaknesses, Opportunities and Threats) was carried out, consisting of an assessment of the property's internal and external environments. To evaluate the internal environment, an interview was held for data collection by means of questionnaires. The evaluation included: breeding management, sanitary management, nutritional management, infrastructure, workforce, technologies used in pasture formation, conservation and recovery, pasture management and zootechnical indices. To analyze the external environment, a group of people (experts) with deep knowledge of the subject addressed during the study was used as source of information. A matrix was generated with all the information from the SWOT analysis, strengths, weaknesses, opportunities and threats, culminating with the establishment of strategies to increase the productive efficiency of the cattle raising activity.(AU)

Repeatability estimates in longitudinal data on guava trees

The use of longitudinal measurements is an essential practice both in Psidium guajava L. breeding and in other perennial crops in which covariance structures can be introduced to explain the form of dependence between measurements. Hence, this study aimed to analyze six covariance structures to identify one that best described the correlation between the repeated measurements in time in traits of guava full-sib families. The repeatability coefficient for each trait was estimated and the minimum number of evaluations required for estimates representing the population was determined. The work was performed based on average data of three yield-related variables from nine harvests of a guava tree population evaluated from 2011 to 2018. The best model was chosen based on the Akaike and Schwarz Bayesian information criterion. The autoregressive covariance structure best represented the dependencies among families between crops for all traits. The number of variables of fruits and total yield per plant presented repeatability estimates higher than 0.5 and may be essential traits for indirect selection of others, such as fruit mass, which had an estimated repeatability of 0.24, proving low regularity in the repetition of the character from one cycle to another. It was also possible to define four harvests as the minimum acceptable number of observations necessary on the same individual for these traits; therefore, the repetitions represented the individuals.(AU)

Estimation of repeatability and genotypic superiority of elephant grass half-sib families for energy purposes using mixed models

The mixed-model methodology is an alternative to select genotypes for traits highly influenced by the environment. In addition, this method allows FOR estimating the repeatability coefficient and predicting the number of assessments needed for a selection process to increase reliability. This study aimed to determine the minimum number of evaluations necessary for a reliable selection process and to estimate the variance components used for predicting genetic gains between and within half-sib families of elephant grass ( Cenchrus purpureus (Schumach.) Morrone ) using the mixed-model methodology. Half-sib families were generated using genotypes from the Active Germplasm Bank of Elephant Grass. The experiment was performed in a randomized block design with nine half-sib families, three replicates, and eight plants per plot. We evaluated 216 genotypes (individual plants) of elephant grass. The deviance analysis was carried out, genetic parameters were estimated, gains between and within families were predicted, and repeatability coefficients were obtained using Selegen software. There was genetic variability for selection within the families evaluated. The reliability values found above 60 % for plant height and number of tillers and above 80 % for dry matter yield suggest that only two evaluations are required to select superior genotypes with outstanding reliability. Sixteen genotypes were identified and selected for their productive potential, which can be used as parents in elephant grass breeding programs for bioenergy production.(AU)

Atuação do médico veterinário especialista em reprodução no manejo de canis / Performance of veterinary specialist in reproduction on kennels management

A criação de cães de raça vem aumentando significativamente, consequentemente a exigência de serviços veterinários no mercado para lidar com essa categoria específica também aumentou. Em especial, temos os serviços de reprodução que crescem devido a procura por melhoria da qualidade de plantel, uma vez que pela incrementação de biotécnicas é possível dinamizar o potencial de crescimento da criação. Logo, é ideal que o profissional que irá prestar este serviço seja altamente capacitado para sua realização, tendo noções não somente de reprodução, mas também de outras necessidades que a criação de cães requer. É importante que o profissional saiba selecionar os animais adequados a reprodução, tanto reprodutores, quanto matrizes, além de quando realizar os procedimentos, assim, evitar protocolos desnecessários e que possam comprometer a criação. Desta forma, o profissional pode fornecer o serviço mais completo possível, fazendo com que esse profissional seja referência no mercado.(AU)

The breeding of purebred dogs has increased significantly, consequently the demand for veterinary services on the market to deal with this specific category has also increased. In particular, we have reproduction services that grow due to the demand for improving the quality of the herd, since by increasing biotechniques it is possible to boost the growth potential of creation. Therefore, it is ideal that the professional who will provide this service is highly qualified for its performance, having notions not only of reproduction, but also of other needs that dog breeding requires. It is important that the professional knows how to select the appropriate animals for reproduction, both breeders and matrices, in addition to when to perform the procedures, thus avoiding unnecessary protocols that could compromise the creation. In this way, the professional can provide the most complete service possible, making this professional a reference on the market.(AU)

Energy values and metabolizability of lipid sources of plant and animal origin in the diet of Japanese quail

The objective of this study was to determine the energy values and metabolizability of different lipid sources in the diet of Japanese quail at the laying phase. The quail were distributed in a completely randomized design with ten replications of seven poultry per treatment, totaling six treatments: basal feed (control) and basal feed containing 10% soybean oil, corn oil, canola oil, sunflower oil, and poultry fat. The values of nitrogen-corrected apparent metabolizable energy (AMEn) and the metabolizability coefficient (MC%) were evaluated. No significant difference was found between the different lipid sources for AMEn (kcal/kg) and MC (%). The value of metabolizable energy corrected for nitrogen for soybean oil was 8,790 kcal/kg; 8,773 kcal/kg for corn oil; 8,784 kcal/kg for canola oil; 8,788 kcal/kg for sunflower oil; and 8,681 kcal/kg for poultry fat in laying Japanese quail. The digestibility coefficients were 93.88% for soybean oil, 93.53% for corn oil, 93.32% for canola oil, 93.74% for sunflower oil, and 93.06% for poultry fat.

A proposed new frame score system for Nellore cattle / Proposta de novo sistema de escore de estrutura corporal para bovinos Nelore

A new frame score system was developed for Nellore cattle, based upon ideal slaughter weights to achieve desired degrees of carcass fat cover. Data consisting of 688 complete records including sex, age, weight, hip height, and subcutaneous fat on growing Nellore cattle (190 males and 498 females) were obtained from the National Association of Breeders and Researchers (ANCP), Ribeirão Preto - SP, Brazil. Weight data were regressed on sex, age, hip height, and fat cover as covariates. Age was then fixed at 550 days and fat cover was set to 6 mm, and new equations for frame scores (1 to 11) in Nellore cattle were developed: FrameNellore (males) = -42.43 + 0.04919 × Age + 0.3368 × Height - 0.0003369 × Age × Height and FrameNellore (females) = -41.76 + 0.04919 × Age + 0.3368 × Height - 0.0003369 × Age × Height (Age and Height in days and cm, respectively). The Nellore equations resulted in average frame of 5.3, ranging from 2.3 to 7.7. Values were similar for males (5.4) and females (5.3). By contrast, previous equations gave higher values, that were very different between males and females. The new Nellore frame scores appear reasonable, particularly regarding body composition.(AU)

Um novo sistema de escore para estrutura corporal foi desenvolvido para bovinos Nelore, baseado em pesos de abate ideais para atingir os graus desejados de cobertura de gordura da carcaça. Dados de 688 registros completos incluindo sexo, idade, peso, altura do quadril e gordura subcutânea de bovinos Nelore em crescimento (190 machos e 498 fêmeas) foram obtidos da Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP), Ribeirão Preto - SP, Brasil. Os dados de peso foram regredidos por sexo, idade, altura do quadril e cobertura de gordura como covariáveis. A idade foi então fixada em 550 dias e a cobertura de gordura foi fixada em 6 mm, e novas equações para escores de estrutura corporal (1 a 11) em bovinos Nelore foram desenvolvidas: FrameNelore (machos) = -42,43 + 0,04919 × Idade + 0,3368 × Altura - 0,0003369 × Idade × Altura e FrameNellore (fêmeas) = -41,76 + 0,04919 × Idade + 0,3368 × Altura - 0,0003369 × Idade × Altura (Idade e Altura em dias e cm, respectivamente). As equações de Nelore resultaram em estrutura corporal médio de 5,3, variando de 2,3 a 7,7. Os valores foram semelhantes para machos (5,4) e fêmeas (5,3). Por outro lado, as equações anteriores deram valores mais altos, que eram muito diferentes entre machos e fêmeas. As novas pontuações de estruturacorporal no Nelore parecem razoáveis, principalmente em relação à composição corporal.(AU)

Embryo biopsies for genomic selection in tropical dairy cattle

Genomic selection has transformed the livestock industry, enabling early-life selection of animals. Biopsy sampling of pre-implantation embryos has been described since 1968. However, it was only after 2010, with the advancement of molecular biology techniques such as whole genomic amplification and SNP Chips, that next-generation sequencing became commercially available for bovine embryos. It is now possible to make decisions about which embryos to transfer not only based on recipients' availability or embryo morphology but also on genomic estimates. This technology can be implemented for a wide spectrum of applications in livestock. In this review, we discuss the use of embryo biopsy for genomic selection and share our experience with Gir and Girolando Brazilian breeding programs, as well as future goals for implementing it in Brazilian bovine in vitro embryo production practices.(AU)

Interpopulation characterization of quinoa (Chenopodium quinoa Willd) from different agroecological environments of Colombia / Caracterização interpopulacional de quinoa (Chenopodium quinoa Willd) de diferentes ambientes agroecológicos da Colômbia

Chenopodium quinoa Willd. it is an Andean cereal of great importance for human consumption due to its high nutritional value. In Colombia there is a high phenotypic and genotypic variability within quinoa crops, which has not been studied and has been maintained by the same farmers cycle after production cycle. The objective of this study was to carry out an interpopulation characterization of quinoa cultivated in different producing municipalities of the department of Boyacá, in Colombia, for which 19 morphological descriptors were used, which were evaluated in situ in nine municipalities and analyzed through descriptive statistics, principal component analysis, correlation and conglomerates. In the evaluation of the quantitative traits for all the populations, it was observed that the most variable descriptors were Number of teeth lower leaf (DHI), Lower leaf length (LHI), Width upper leaf (AHI) and Number of teeth upper leaf (DHS). Great segregation between and within individuals of Blanca de Jericó and Piartal was observed for panicle and leaf color and shape, stem color, presence of teeth, and axils on upper and lower leaves. A classification key is proposed that allows in the field to be able to morphologically differentiate the genotypes of Piartal and Blanca de Jericó. This research shows that among the most cultivated genotypes in the department of Boyacá, there is still an important phenotypic diversity given at the inter and intra-individual level, due to the phenological state and the agroclimatological conditions of the different producing regions.

Chenopodium quinoa Willd. é um cereal andino de grande importância para a alimentação humana por causa do seu alto valor nutricional. Na Colômbia, existe uma alta variabilidade fenotípica e genotípica nos cultivos de quinoa, que não foi estudada e tem sido mantida pelo mesmo produtor ciclo após ciclo de produção. O objetivo deste estudo foi realizar uma caracterização interpopulacional da quinoa cultivada em diferentes municípios produtores do departamento de Boyacá, na Colômbia. Para tanto, foram utilizados 19 descritores morfológicos, avaliados in situ em nove municípios e analisados por meio de estatísticas descritivas, análise de componentes principais, correlação e conglomerados. Na avaliação dos caracteres quantitativos para todas as populações, observou-se que os descritores mais variáveis foram: número de dentes da folha inferior (DHI), comprimento da folha inferior (LHI), largura da folha superior (AHI) e número de dentes da folha superior (DHS). Entre os indivíduos de Blanca de Jericó e Piartal e dentro deles, observou-se grande segregação quanto à cor, formato da panícula e folha, cor do caule, presença de dentes e axilas nas folhas superiores e inferiores. É proposta uma chave de classificação que permite no campo poder diferenciar morfologicamente os genótipos de Piartal e Blanca de Jericó. Esta pesquisa mostra que, entre os genótipos mais cultivados no departamento de Boyacá, ainda existe uma importante diversidade fenotípica em nível inter e intraindividual, em razão do estado fenológico e das condições agroclimatológicas das diferentes regiões produtoras.

Análise multivariada aplicada na discriminação de genótipos em caracteres do tempo de cozimento em feijão (Phaseolus vulgaris L) / Multivariate analysis applied to the discrimination of genotypes in cooking timetraitsin commonbean (Phaseolus vulgaris L)

As avaliações rotineiras do caráter tempo de cozimento em feijão (Phaseolus vulgarisL.) podem ser efetuadas de distintas maneiras resultando em diferentes variáveis. Por vez, a análise estatística univariada não considera as interdependêcias entre as variáveis, podendo omitir importantes informações a respeito dos genótipos. Com isso, o objetivo do trabalhofoi dispor uma proposta alternativa para análise do tempo de cozimento em feijão, permitindo a discriminação entre genótipos. O experimento utilizado para esta abordagem foi conduzido em condições de campo na safra agrícola do ano 2017/18em Lages, Santa Catarina, Brasil. Ostratamentos foram compostos por doze genótipos, sendo quatro genitores, estruturados em dois cruzamentos BAF50 x BAF07 e BAF09 x IPR 88 Uirapuru, com suas gerações F2, F3, F8e F9. O delineamento utilizado foi blocos casualizados, com dois blocos e duas observações em cada unidade experimental. Posteriormente a colheita, a variável resposta tempo de cocção dos grãos de feijão foi mensurada com o cozedor Mattson, sendo considerado o tempo de cocção das 13 hastes iniciais. Na análise multivariada, as variáveis tempo de cocção da segunda (TCH2), décima segunda (TCH12) e décima terceira haste (TCH13) foram utilizadas com base em sua significância pelo método de seleção de variáveis passo a passo (stepwise). A análise de variância multivariada demonstrou diferença entre os genótipos (P<0,05). A partir da matriz de dissimilaridade com as distâncias de Mahalanobis e o dendrograma de agrupamento, foi possível verificaras distâncias dos genótipos derivados dos cruzamentos BAF50 x BAF07 e BAF09 x IPR 88 Uirapuru. Comisso, a análise multivariada possibilitou a discriminação dos genótipos, adicionalmente o cruzamento BAF50 x BAF07 demonstrou maiores estimativas de dissimilaridade nas progênies.(AU)

Routine evaluations of cooking time traitin common bean (Phaseolus vulgarisL.) can be performed in different ways resulting in different variables. At the same time, the univariate statistical analysis does not consider the interdependencies between the variables, and may omit important information regarding the genotypes. With this,the objective of this work was to present an alternative proposal foranalysis of the cooking time in common bean, allowing the discrimination between genotypes. The experiment used for this approach was conducted under field conditions in the 2017/18 agricultural season in Lages, Santa Catarina, Brazil. The treatments consisted of twelve genotypes, (fourparents, structured in two crossings BAF50 x BAF07and BAF09 x IPR 88 Uirapuru, with their generations F2, F3, F8and F9). The design used was randomized blocks, with two blocks and two observations in each experimental unit. After the harvest, the response variable cooking time of thegrains was measuredwith a Mattson cooker, considering the cooking time of the 13 initial stems. In the multivariate analysis, the variables cooking time of the second (TCH2), twelfth (TCH12) and thirteenth stem (TCH13) were used based on their significance by the stepwise variable selection method. Multivariate analysis of variance showed differences between genotypes (P<0.05). From the dissimilarity matrix with the Mahalanobis distances and the clustering dendrogram, itwas possible to verify the distances of the genotypes derived from crosses BAF50 x BAF07 and BAF09 x IPR 88 Uirapuru. With that, the multivariate analysis enabled thegenotypes, additionally the crossing BAF50 x BAF07 showed higher estimates of dissimilarity in the progenies.(AU)

Breeding and productive qualities of ducks of the local population in northern Kazakhstan / As qualidades reprodutivas e produtivas dos patos da população local no norte do Cazaquistão

The production of duck meat in the republic was previously based on the use of 4-5 lines and populations of the Beijing breed, where the Medeo cross lines (M-1 paternal and M2-maternal) were the most widespread. At the same time, many domestic lines and populations, such as the cross "Bishkulskaya Tsvetnaya", "Kyzylzharsky", whose livestock is concentrated in the Northern region, represent rich genetic material and can be used to create new crosses. This article describes the productive and breeding qualities of ducks of the local population in the Northern region of Kazakhstan, the data obtained make it possible for further purposeful breeding work to create, preserve highly productive poultry, providing highly efficient production of eggs and meat, adapted to both industrial conditions and conditions of keeping in small-scale and farms. On the basis of "Bishkul Poultry Farm" LLP, we obtained results on the assessment of productive and breeding indicators of ducks of the local population.

A produção de carne de pato na república era anteriormente baseada no uso de 4 a 5 linhas e populações da raça de Pequim, onde as linhas de cruz Medeo (m-1 paterna e M2-materna) eram mais difundidas. No entanto, muitas linhas e populações domésticas, como cross "Bishkul Color" e "Kyzylzharsky", cuja população está concentrada na região Norte, representam um rico material genético e podem ser utilizados em novos cruzamentos. Este artigo descreve as qualidades produtivas e reprodutivas dos patos da população local na região norte do Cazaquistão. Os dados obtidos permitem um trabalho de criação mais focado na criação e preservação de aves altamente produtivas, garantindo a produção altamente eficiente de ovos e carne, adaptada tanto às condições industriais quanto às condições de detenção em pequenas fazendas. Com base na "Bishkul avicultura LLP", obtivemos resultados relacionados à avaliação dos indicadores produtivos e reprodutivos dos patos da população local.

Breeding ecology of the laughing dove (Streptopelia senegalensis) in the Taif City, Kingdom of Saudi Arabia / Ecologia reprodutiva da rola-do-senegal (Streptopelia senegalensis) na cidade de Taif, Reino da Arábia Saudita

The Laughing Dove (Streptopelia senegalensis) is a columbid bird commonly found throughout most of Africa, the Middle East, Central Asia, India and Australia. Its preferred habitat includes scrubland, agricultural lands, and human settlements. Despite this species' extensive breeding range, very little information is available regarding its breeding ecology. The main objective of this study was to investigate the breeding features of the Laughing Dove in Taif City, Saudi Arabia between March and May 2018 and December 2018 and May 2019. The results indicate that this species constructs its nests at a mean height of 2.74 ± 0.1 m from the ground. The average number of nesting materials used for building a Laughing Dove nest was 109.3 ± 11.25. This study recorded that this species starts breeding in the middle of February. A clutch of two eggs comprised 72% of all the nests, with a mean of 1.75 ± 0.06 eggs per clutch. The average egg size was 25.27 ± 0.43 mm x 20.25 ± 0.19 mm, with an average egg volume of 5.01 ± 0.13 cm3. In total, 39.5% of the eggs hatched, and 64.7% of hatchlings reached the fledgling stage, resulting in an overall breeding success of 25.6%. This study suggested that nest desertion and predation were the major factors contributing to nest failure.

A rola-do-senegal (Streptopelia senegalensis) é uma ave columbídea comumente encontrada na maior parte da África, Oriente Médio, Ásia Central, Índia e Austrália. Seu hábitat preferido inclui cerrado, terras agrícolas e assentamentos humanos. Apesar da extensa gama de reprodução desta espécie, muito pouca informação está disponível sobre sua ecologia reprodutiva. O principal objetivo deste estudo foi investigar as características reprodutivas da rola-do-senegal na cidade de Taif, Arábia Saudita entre março e maio de 2018 e dezembro de 2018 e maio de 2019. Os resultados indicam que esta espécie constrói seus ninhos a uma altura média de 2,74 ± 0,1 m do chão. O número médio de materiais de nidificação usados para a construção de um ninho de rola-do-senegal foi de 109,3 ± 11,25. Este estudo registrou que esta espécie começa a se reproduzir em meados de fevereiro. Uma ninhada de dois ovos compôs 72% de todos os ninhos, com média de 1,75 ± 0,06 ovo por ninhada. O tamanho médio dos ovos foi de 25,27 ± 0,43 mm x 20,25 ± 0,19 mm, com volume médio de ovos de 5,01 ± 0,13 cm3. No total, 39,5% dos ovos eclodiram e 64,7% dos filhotes atingiram a fase de filhote, resultando em um sucesso reprodutivo geral de 25,6%. Este estudo sugeriu que a deserção do ninho e a predação foram os principais fatores que contribuíram para o fracasso do ninho.

Overview of the use of genomic data in animal breeding / Panorama do uso de dados genômicos no melhoramento genético animal

ABSTRACT: The use of molecular information in breeding programs contributed to important advances in the improvement of traits of economic interest in livestock production. The advent of single nucleotide polymorphism (SNP) panels applied to genome-wide selection (GWS) and genome-wide association studies (GWAS), along with computational advances (e.g., use of powerful software and robust analyses) allowed a better understanding of the genetic architecture of farm animals and increased the selection efficiency. In this context, the statistic method single-step GBLUP has been frequently used to perform GWS, and more recently GWAS analyses, providing accurate predictions and QTL detection, respectively. Nevertheless, in developing countries, species such as sheep and goats, whose genomic data are more difficult to be obtained, the use of data simulation has been efficient in the study of the major factors involved in the selection process, such as size of training population, density of SNP chips, and genotyping strategies. The effects of these factors are directly associated with the prediction accuracy of genomic breeding values. In this review we showed important aspects of the use of genomics in the genetic improvement of production traits of animals, the main methods currently used for prediction and estimation of molecular marker effects, the importance of data simulation for validation of those methods, as well as the advantages, challenges and limitations of the use of GWS and GWAS in the current scenario of livestock production.

RESUMO: Em programas de melhoramento genético, o uso de informações moleculares garantiu importantes avanços para a melhoria de características de interesse econômico, no âmbito da produção animal. O advento da tecnologia de painéis de SNPs aplicados à seleção genômica ampla (GWS) e associação genômica ampla (GWAS), aliado ao avanço computacional, com o uso de softwares e análises robustas, permitiram melhor compreensão sobre a arquitetura genética dos animais de produção e, consequentemente, maior eficiência na seleção. Nesse contexto, o método estatístico single-step GBLUP tem sido utilizado, frequentemente, na execução da GWS e, mais recentemente, em GWAS, possibilitando predições acuradas e detecção de QTLs, respectivamente. No entanto, em países em desenvolvimento e, em espécies como os ovinos e caprinos, que existe maior dificuldade para a aquisição de dados genômicos, o uso da simulação de dados tem se mostrado eficiente para estudar os principais fatores envolvidos no processo de seleção, como o tamanho da população de treinamento, densidade de chipde SNPs e estratégias de genotipagem, cujos efeitos estão diretamente associados à acurácia da predição de valores genéticos genômicos. Nesta revisão, serão abordados pontos importantes sobre o uso da genômica no melhoramento genético de características produtivas em animais, principais métodos de predição e estimação de efeitos de marcadores moleculares na atualidade, a importância da simulação de dados para a validação desses métodos, bem como as vantagens, os desafios e as limitações no cenário atual da produção animal com o uso da seleção e associação genômica ampla.

Analysis of variables inherent to the dynamics of the practice of vaquejada to determine its influence on the result obtained in the competition / Análise de variáveis inerentes à dinâmica da prática da vaquejada para determinação de sua influência sobre o resultado obtido na competição

The objective of this work was to evaluate several attempts to knock down neats and to correlate the success obtained with actions performed by the horse/rider sets through an analysis of public domain videos of vaquejadas. Approximately 300 videos were considered, and the groups were evaluated according to the competition category, that is, amateur/aspirant and professional, and the animals used in the test, that is, pulling or tracking of the neat. It was found that for the pull set in the professional competition category, only the characteristics of directing the cow on the track, and the guiding behavior and positioning in the pull were significant (p<0.01), while for the amateur/aspirant category, the characteristics of remaining in the pull after falling of the cattle and of the behavior at the gate had an effect (p<0.01). The characteristic of remaining in the pull after the fall of the neats, in the category of professional pulling athletes, exists in greater prevalence during the competition with 85.3%, while the characteristic of directing the neat to the side of the track is performed by 87.6% of the competitors. For the set used to track the cattle, the values of the dimensions 1 and 2 were 96.56% and 3.43%, respectively, which is 99.9% of the total variance of the data based on those selected for the final result of "earn the ox". The use of multiple diversity analysis in this study of variables associated with the vaquejada set proved to be quite advantageous, and there was not much variation in the elements obtained with a greater weight in the determination of the final result.(AU)

Objetivou-se com este trabalho avaliar por meio de análise de vídeos de domínio público de competições de vaquejadas, diversas tentativas de derrubada de rezes e correlacionar o êxito obtido com ações desempenhadas pelos conjuntos cavalo/ cavaleiro. Foram considerados aproximadamente 300 vídeos, sendo os grupos avaliados quanto à categoria de competição, Amador/Aspirante e Profissional, e aos animais utilizados na prova, Puxar ou Esteirar a rês. Verificou-se que para o conjunto de puxar, da categoria profissional de competição, apenas as características de direcionamento da rês na pista, comportamento na condução e posicionamento na puxada foram significativos (p<0,01), enquanto para a categoria amador/ aspirante houve efeito (p<0,01) para a característica de permanecer ou não na puxada após queda da rês e para o comportamento na porteira. A característica, permanecer na puxada após a queda da rês, na categoria de atletas puxadores profissionais, existe em maior prevalência em ações durante a prova com 85,3% dos casos, enquanto a característica de direcionar a rês para a lateral da pista é realizada por 87,6% dos competidores. Para o conjunto utilizado para esteirar a rês, os valores das dimensões 1 e 2 foram de 96,56% e 3,43%, respectivamente, totalizando 99,9% da variância total dos dados com base nos critérios selecionados para o resultado final de "Valeu o boi". O uso da análise de correspondência múltipla no estudo de variáveis associadas ao sucesso em competições de vaquejada mostrou-se bastante eficaz, no que tange a diminuição do universo de elementos com maior peso de determinação no resultado final obtido.(AU)

Morpho-agronomic and leaf anatomical traits in Coffeacanephora genotypes / Caracteres morfoagronômicos e anatômicos foliares em genótipos de Coffea canephora

ABSTRACT: Genetic variability is the basis for coffee genetic breeding. This study evaluated the potential of leaf anatomy and morpho-agronomic traits in studies of genetic variability in C. canephoracultivars. Ten genotypes were distributed in randomized block designs with three replicates. Significant differences among genotypes were detected by F-test (P < 0.05) for 13 of 15 evaluated traits. These results evidenced the heterogeneity of the studied cultivars, which is essential in composition of genetic basis in breeding programs. The Scott-Knott test detected variability among genotypes, grouped into up to four mean groups. Leaf anatomy traits presented the largest variations. Five out of seven leaf anatomy traits presented heritability higher than 80%, with emphasis on stomatal density (95.69%) and stomatal pore length (92.72%). Positive correlations were observed among morpho-agronomic and anatomic traits. Cluster analysis used the Mahalanobis general distance (D2) as a measure of genetic dissimilarity and divided the genotypes into two distinct groups. The inclusion of leaf anatomic traits to characterize C. canephoragenotypes may assist plant breeders with better genetic discrimination and with greater security in plant selection when composing cultivars.

RESUMO: A variabilidade genética é a base para o progresso genético em café. Este estudo teve como objetivo, avaliar o potencial de caracteres morfoagronômicos e anatômicos foliares em estudos de variabilidade genética entre cultivares de Coffea canephora. Dez genótipos foram distribuídos em um experimento seguindo delineamento em blocos ao acaso com três repetições. Foram detectadas diferenças significativas entre os genótipos pelo teste F (P < 0,05) para 13 dos 15 caracteres avaliados. Esses resultados evidenciaram a heterogeneidade entre as cultivares estudadas, o que é essencial para a composição da base genética e avanço dos programas de melhoramento. O teste de Scott e Knott detectou as diferenças entre os genótipos, separando-os em quatro grupos. Os caracteres anatômicos foliares apresentaram as maiores variações. Cinco, dentre os sete caracteres anatômicos foliares, apresentaram estimativas de herdabilidade superiores a 80% com destaque para a densidade estomática (95,69%) e comprimento do poro estomático (92,72%). Correlações positivas foram observadas entre caracteres morfoagronômicos e anatômicos foliares. A análise de agrupamento, considerando a distância de Mahalanobis como medida de dissimilaridade (D²), apontou a distinção de dois grupos de genótipos. A inclusão de caracteres anatômicos foliares na caracterização de genótipos de C. canephora pode auxiliar os melhoristas de plantas na melhor discriminação entre genótipos e maior segurança na seleção de clones para geração de novas cultivares.

Genetic parameters and selection gain in tropical wheat populations via Bayesian inference / Parâmetros genéticos e ganho de seleção em populações tropicais de trigo via inferência bayesiana

ABSTRACT: The development process of a new wheat cultivar requires time between obtaining the base population and selecting the most promising line. Estimating genetic parameters more accurately in early generations with a view to anticipating selection means important advances for wheat breeding programs. Thus, the present study estimated the genetic parameters of F2 populations of tropical wheat and the genetic gain from selection via the Bayesian approach. To this end, the authors assessed the grain yield per plot of 34 F2 populations of tropical wheat. The Bayesian approach provided an adequate fit to the model, estimating genetic parameters within the parametric space. Heritability (h2) was 0.51. Among those selected, 11 F2 populations performed better than the control cultivars, with genetic gain of 7.80%. The following populations were the most promising: TbioSossego/CD 1303, CD 1303/TbioPonteiro, BRS 254/CD 1303, Tbio Duque/Tbio Aton, and Tbio Aton/CD 1303. Bayesian inference can be used to significantly improve tropical wheat breeding programs.

RESUMO: O processo de desenvolvimento de uma nova cultivar de trigo requer tempo entre a obtenção da população base e a seleção da linhagem mais promissora. Estimar parâmetros genéticos com mais precisão nas primeiras gerações com vistas a antecipar a seleção significa avanços importantes para os programas de melhoramento de trigo. Assim, o presente estudo estima os parâmetros genéticos de populações F2 de trigo tropical e o ganho genético da seleção via abordagem Bayesiana. Para tanto, os autores avaliaram a produtividade de grãos por parcela de 34 populações F2 de trigo tropical. A abordagem Bayesiana proporcionou um ajuste adequado ao modelo, estimando parâmetros genéticos dentro do espaço paramétrico. A herdabilidade (h2) foi de 0,51. Dentre as selecionadas, 11 populações F2 obtiveram desempenho superior às cultivares controle, com ganho genético de seleção de 7,80%. As seguintes populações foram as mais promissoras: Tbio Sossego/CD 1303, CD 1303/Tbio Ponteiro, BRS 254/CD 1303, Tbio Duque/Tbio Aton e Tbio Aton/CD 1303. A inferência Bayesiana pode ser usada para melhorar significativamente programas de melhoramento de trigo tropical.

Occurrence of intersexuality in Mugil curema from an estuary of the North coast of Santa Catarina, Brazil - case report / Ocorrência de intersexualidade em Mugil curema em estuário do litoral norte catarinense, Brasil - relato de caso

This study describes the occurrence of reproductive changes in a mullet (Mugil curema) from the Babibtonga Bay, Santa Catarina. Gross and microscopic findings indicated changes in the reproductive system that were characterized by the presence of both male and female gonads, nearing sexual maturity, which was compatible with the diagnosis of intersex. It was not possible to identify predisposing factors that may have contributed to the development of this condition. However, as this species of fish may have their reproductive development affected by anthropogenic influence, it is important to permanently monitor this kind of environment. Considering the number of fish belonging to this species that was examined (n=433), the estimated prevalence for intersexuality was 0.23% (confidence interval: 0.00 to 0.68%, with confidence level of 95%). The findings in this study support the diagnosis of intersexuality in M. curema from the Babitonga Bay, which is the first documented case of this condition in this species on the coast of Santa Catarina, Brazil.

Este estudo descreve a ocorrência de alteração reprodutiva em peixe da espécie Mugil curema, procedente da Baía da Babitonga, Santa Catarina. Macro e microscopicamente, foi identificada alteração no sistema reprodutivo, caracterizada pela presença de gônadas masculina e feminina, próximas da maturidade sexual, caracterizando um caso de intersexo. Não foi possível determinar os fatores que possam ter contribuído para o desenvolvimento dessa alteração reprodutiva, porém, como a espécie animal pode ter suas características de vida e reprodutiva influenciadas pela ação antrópica, é importante um estudo contínuo desses peixes nesse ambiente. Considerando o número de peixes dessa espécie que foram examinados (n=433), a prevalência estimada de intersexualidade foi de 0,23% (intervalo de confiança: 0,00 a 0,68%, com nível de confiança de 95%). Os achados deste estudo suportam o diagnóstico de intersexualidade em M. curema proveniente da Baía da Babitonga, sendo o primeiro caso documentado dessa condição nessa espécie na costa de Santa Catarina, Brasil.

Characterization of new late-spring-frost-tolerant apricot hybrids: physical and biochemical fruit quality attributes, volatile aroma compounds / Caracterização de novos híbridos de damasco tolerantes a geadas tardias: atributos físicos e bioquímicos de qualidade do fruto, compostos aromáticos voláteis

Late spring frosts is one of the most important restricting abiotic stress factors of apricot growing worldwide. In this study; some physical, biochemical fruit quality characteristics and volatile aroma compounds were determined in fresh fruit samples of thirteen late spring frost tolerant apricot hybrids recently obtained from Turkish apricot breeding programme. A wide variation was reported among apricot genotypes in all of the evaluated physical and biochemical fruit characteristics and also volatile aroma compounds.Fruit size varied between 27.2 and 60.5 g, total soluble solids between 13.6 and 17.4 %, total carotene 26.6 and 42.8 (mg.100 g-1), and total phenolics content 354.2 and 673.1 (GAE.100 g-1). A total of 42 flavor components belonging to various flavor compound groups were identified. The main volatile aroma compound groups detected in the assessed apricot genotypes were; aldehydes, ketones, esters, alcohols, terpenes, acids, and other compounds. Among the detected compounds; Hexanal, 2-Hexenal, 1-Hexanol, 2-Hexen-1-ol, Limonene were the most abundant compounds in terms of concentration. Hexanal varied between 55.8 and 528.5 µg.kg-1, and 2-Hexen-1-ol changed between 25.7 and 297.9 µg.kg-1 fresh weight. Correlation analysis revealed significant correlations among some aroma compounds and biochemical fruit quality characteristics. Significant correlations were reported for esters with titratable acidity (r=0.79) and total carotene (r=-0.61) and aldehydes were found as highly correlated with total soluble solids (r=-0.69). The results of the study will be beneficial in terms of food analysis, cultivation, and breeding studies of apricot.

As geadas do final da primavera são um dos fatores de estresse abiótico restritivos mais importantes do cultivo de damasco em todo o mundo. Neste estudo, algumas características físicas e bioquímicas de qualidade da fruta e compostos aromáticos voláteis foram determinados em amostras de frutas frescas de 13 híbridos de damasco tolerantes à geada da primavera, recentemente obtidos do programa de melhoramento de damasco turco. Uma grande variação foi encontrada entre os genótipos de damasco em todas as características físicas e bioquímicas dos frutos avaliados e também nos compostos aromáticos voláteis. O tamanho dos frutos variou entre 27.2 e 60.5 g, sólidos solúveis entre 13.6 e 17.4 %, caroteno total 26.6 e 42.8 (mg.100 g-1) e teor de fenólicos totais 354.2 e 673.1 (GAE.100 g-1). Um total de 42 componentes aromatizantes pertencentes a vários grupos de compostos aromatizantes foram identificados. Os principais grupos de compostos aromáticos voláteis detectados nos genótipos de damasco avaliados foram: aldeídos, cetonas, ésteres, álcoois, terpenos, ácidos e outros compostos. Os compostos: Hexanal, 2-Hexenal, 1-Hexanol, 2-Hexen-1-ol e Limoneno foram os mais abundantes em termos de concentração. O hexanal variou entre 55.8 e 528.5 µg.kg-1, e o 2-Hexen-1-ol variou entre 25.7 e 297.9 µg.kg-1 demassa fresca . A análise de correlação revelou correlações significativas entre alguns compostos aromáticos e características bioquímicas de qualidade do fruto. Correlações significativas foram encontradas para ésteres com acidez titulável (r=0.79) e caroteno total (r=-0.61) e aldeídos foram encontrados como altamente correlacionados com sólidos solúveis totais (r=-0.69). Os resultados do estudo serão benéficos em termos de análise de alimentos, cultivo e estudos de melhoramento de damasco.

Overview of the use of genomic data in animal breeding / Panorama do uso de dados genômicos no melhoramento genético animal

The use of molecular information in breeding programs contributed to important advances in the improvement of traits of economic interest in livestock production. The advent of single nucleotide polymorphism (SNP) panels applied to genome-wide selection (GWS) and genome-wide association studies (GWAS), along with computational advances (e.g., use of powerful software and robust analyses) allowed a better understanding of the genetic architecture of farm animals and increased the selection efficiency. In this context, the statistic method single-step GBLUP has been frequently used to perform GWS, and more recently GWAS analyses, providing accurate predictions and QTL detection, respectively. Nevertheless, in developing countries, species such as sheep and goats, whose genomic data are more difficult to be obtained, the use of data simulation has been efficient in the study of the major factors involved in the selection process, such as size of training population, density of SNP chips, and genotyping strategies. The effects of these factors are directly associated with the prediction accuracy of genomic breeding values. In this review we showed important aspects of the use of genomics in the genetic improvement of production traits of animals, the main methods currently used for prediction and estimation of molecular marker effects, the importance of data simulation for validation of those methods, as well as the advantages, challenges and limitations of the use of GWS and GWAS in the current scenario of livestock production.

Em programas de melhoramento genético, o uso de informações moleculares garantiu importantes avanços para a melhoria de características de interesse econômico, no âmbito da produção animal. O advento da tecnologia de painéis de SNPs aplicados à seleção genômica ampla (GWS) e associação genômica ampla (GWAS), aliado ao avanço computacional, com o uso de softwares e análises robustas, permitiram melhor compreensão sobre a arquitetura genética dos animais de produção e, consequentemente, maior eficiência na seleção. Nesse contexto, o método estatístico single-step GBLUP tem sido utilizado, frequentemente, na execução da GWS e, mais recentemente, em GWAS, possibilitando predições acuradas e detecção de QTLs, respectivamente. No entanto, em países em desenvolvimento e, em espécies como os ovinos e caprinos, que existe maior dificuldade para a aquisição de dados genômicos, o uso da simulação de dados tem se mostrado eficiente para estudar os principais fatores envolvidos no processo de seleção, como o tamanho da população de treinamento, densidade de chipde SNPs e estratégias de genotipagem, cujos efeitos estão diretamente associados à acurácia da predição de valores genéticos genômicos. Nesta revisão, serão abordados pontos importantes sobre o uso da genômica no melhoramento genético de características produtivas em animais, principais métodos de predição e estimação de efeitos de marcadores moleculares na atualidade, a importância da simulação de dados para a validação desses métodos, bem como as vantagens, os desafios e as limitações no cenário atual da produção animal com o uso da seleção e associação genômica ampla.