Resumo
Sunflower (Helianthus annuus) plants showing symptoms of chlorosis, mosaic, chlorotic ringspot, and necrosis on younger leaves were found in a small experimental plot in Piracicaba, in the state of São Paulo, Brazil. Preliminary examinations by transmission electron microscopy of symptomatic leaf tissue revealed flexuous filamentous particles 13-15 nm wide and 700-750 nm long, and cytoplasmatic cylindrical inclusions typical of those found in plant cells infected by members of the Potyvirus genus. Total RNA extracted from symptomatic leaves and subjected to RT-PCR followed by partial nucleotide sequencing confirmed the presence of a potyvirus in the affected plants, which was identified as sunflower chlorotic mottle virus (SuCMoV), a member of the Sunflower chlorotic mottle virus (genus Potyvirus, family Potyviridae) species. Mechanical transmission assays with extracts of symptomatic sunflower leaves reproduced the original symptoms in sunflowers, mosaic symptoms in Zinnia elegans, and chlorotic local lesions in Chenopodium amaranticolor and C. quinoa. Sunflower and zinnia plants became infected after aphid transmission experiments with Myzus persicae. RT-PCR tests using specific primers for SuCMoV confirmed the presence of this virus in experimentally infected plants, meeting the criteria of Koch's postulate. This is the first report of SuCMoV infecting sunflower plants in Brazil.
Assuntos
Doenças das Plantas , HelianthusResumo
Among phytosanitary problems of the grapevine, viruses stand out for their capacity of reducing the quality and yield of grapes. However, detecting and identifying viral infections in grapevines can be challenging. This study performed a high throughput sequencing (HTS) of the viral pathogens present in a vine showing virus-like symptoms to elucidate the etiology. HTS analysis reported in a hybrid grapevine with mild curling down of leaf edges, the presence of four viruses and viroids, which were probably implicated in the observed symptoms. The determined complete genomes showed high genetic identities with previously characterized isolates of homologous pathogens.
Dentre os problemas fitossanitários da videira, os vírus se destacam pela capacidade de reduzir a qualidade e o rendimento da uva. No entanto, detectar e identificar infecções virais em videiras pode ser um desafio. O objetivo do estudo foi realizar um sequenciamento de alto rendimento (HTS) para determinar os patógenos virais presentes em uma videira com sintomas de virose e elucidar a etiologia. Com o HTS foi detectada, em uma videira híbrida com leve enrolamento dos bordos foliares, a presença de quatro vírus e viroides, os quais provavelmente estavam implicados com os sintomas observados. Os genomas completos determinados mostraram altas identidades genéticas com isolados previamente caracterizados de patógenos homólogos.
Assuntos
Doenças das Plantas , Vitis/virologia , ViromaResumo
Maize is the second largest agricultural crop in Brazil. It reaches high yields as supported by the intensive use of technologies, particularly mineral fertilization, which is normally costly. To lower production costs and improve crop productivity on small farms, the present study tested the efficiency of poultry litter biochar as a source of nutrients in the initial growth of BRS 2022 maize by the 'diagnosis by subtraction' method. The study was carried out in a greenhouse, using a completely randomized experimental design with a factorial arrangement (7×3). The following treatments were tested: complete nutrient solution (N, P, K, Ca, Mg, S, B, Cl, Cu, Fe, Mn, and Zn); complete nutrient solutions with omission of only nitrogen (-N), phosphorus (-P), potassium (-K), calcium (-Ca), and magnesium (-Mg); and complete absence of nutrients and three increasing rates of biochar (0, 5, and 10 t ha-1). Absence of nutrients with biochar rates significantly influenced the growth and dry biomass production variables of the maize plants. Except for stem diameter and the ratio between shoot and root dry biomass, all variables were influenced by the interaction between nutrients and biochar rates. Nutrient omission limited maize growth; however, the application of biochar reduced these limitations and significantly improved all analyzed variables. In the treatments without fertilizer, maize growth was very low, with generalized symptoms of deficiency that would decrease with the application of biochar. Even in the treatment with complete fertilization, which showed some slight visual symptoms, these decreased with the application of biochar.(AU)
A cultura do milho é a segunda maior produção agrícola do Brasil. Alcança altos rendimentos, apoiada no uso intensivo de tecnologias, em particular, a adubação mineral, normalmente onerosa. Na visão de baixar custos de produção e melhorar a produtividade da cultura na pequena propriedade rural, neste trabalho foi testado pelo método diagnose por subtração a eficiência do biocarvão da cama de frango como fonte de nutrientes ao crescimento inicial do milho BRS 2022. O estudo foi realizado em casa de vegetação, utilizando delineamento experimental inteiramente casualizado, em esquema fatorial (7x3), com os seguintes tratamentos: solução nutritiva completa (N, P, K, Ca, Mg, S, B, Cl, Cu, Fe, Mn, Zn); soluções nutricionais completas com a omissão de apenas nitrogênio (-N), fósforo (-P), potássio (-K), cálcio (-Ca) e magnésio (-Mg); com ausência completa de nutrientes e três doses crescentes de biochar (0, 5 e 10 t ha-1). As variáveis de crescimento e produção de biomassa seca de plantas de milho foram significativamente influenciadas pela ausência de nutrientes e pelo efeito das doses de biocarvão. Com exceção do diâmetro do caule e da relação entre a parte aérea e a biomassa da raiz seca as interações também foram significativamente afetadas pelos tratamentos. A omissão de nutrientes limitou o crescimento do milho, no entanto, a aplicação do biocarvão diminuiu essas limitações e melhorou significativamente todas as variáveis analisadas. Nos tratamentos sem adubação, o crescimento do milho foi muito baixo, com sintomas generalizados de deficiência que diminuiriam com a aplicação do biocarvão. Até mesmo o tratamento com adubação completa que apresentou alguns leves sintomas visuais, houve redução a aplicação do biocarvão.(AU)
Assuntos
24444 , Carvão Vegetal/efeitos adversos , Zea mays/fisiologiaResumo
O presente trabalho teve como objetivo caracterizar nutricionalmente plantas de pessegueiro na região produtora de Pelotas, RS. Foram amostrados 65 pomares de pessegueiros das cultivares Maciel, Granada, Esmeralda e Sensação nos municípios de Pelotas, Canguçu e Morro Redondo no ciclo produtivo de 2018. As amostras foliares, após secas e moídas, foram analisadas quanto aos seus teores de nitrogênio (N), fósforo (P), potássio (K), cálcio (Ca), magnésio (Mg), boro (B), cobre (Cu), ferro (Fe), manganês (Mn) e zinco (Zn) e os resultados foram apresentados em distribuições de frequência nas classes de suficiência indicadas para a cultura na região além da correlação entre os nutrientes. Observou-se maiores deficiências nos teores de nitrogênio, cobre, ferro e zinco. Entretanto, para a maioria das amostras, os teores de potássio encontraram-se na classe acima do normal, encontrou-se correlações entre P/Ca, P/Cu, Ca/P, Ca/Mg e Ca/B. É possível constatar a carência do uso de ferramentas para avaliar o estado nutricional dos pomares, principalmente a diagnose foliar, o que levou ao uso inadequado de fertilizantes e consequentemente um desbalanço nutricional das plantas.
This study set out to assess the nutritional status of peach trees in the commercial peach-growing region of Pelotas, Rio Grande do Sul. The sample includes 65 peach orchards of the Maciel, Granada, Esmeralda, and Sensação cultivars in the municipalities of Pelotas, Canguçu, and Morro Redondo during the 2018 agricultural cycle. After drying and grinding the leaf samples for an analysis of their nitrogen (N), phosphorus (P), potassium (K), calcium (Ca), magnesium (Mg), boron (B), copper (Cu), iron (Fe), manganese (Mn), and zinc (Zn) content, the results were presented in frequency distributions divided into classes based on the nutrient requirements indicated for the crop in the region, in addition to the correlations between the nutrients. Greater deficiencies were observed in nitrogen, copper, iron, and zinc content. However, potassium content was found in the above normal class for most of the samples, and there were correlations between P/Ca, P/Cu, Ca/P, Ca/Mg, and Ca/B. An insufficient use of the tools to assess the nutritional status of the orchards was observed, especially the leaf diagnosis, which led to the inappropriate use of fertilizers and the consequent nutrient imbalance in the plants.
Assuntos
Esterco , Prunus persica/enzimologia , Prunus persica/fisiologia , Prunus persica/química , Valor NutritivoResumo
O presente trabalho teve como objetivo caracterizar nutricionalmente plantas de pessegueiro na região produtora de Pelotas, RS. Foram amostrados 65 pomares de pessegueiros das cultivares Maciel, Granada, Esmeralda e Sensação nos municípios de Pelotas, Canguçu e Morro Redondo no ciclo produtivo de 2018. As amostras foliares, após secas e moídas, foram analisadas quanto aos seus teores de nitrogênio (N), fósforo (P), potássio (K), cálcio (Ca), magnésio (Mg), boro (B), cobre (Cu), ferro (Fe), manganês (Mn) e zinco (Zn) e os resultados foram apresentados em distribuições de frequência nas classes de suficiência indicadas para a cultura na região além da correlação entre os nutrientes. Observou-se maiores deficiências nos teores de nitrogênio, cobre, ferro e zinco. Entretanto, para a maioria das amostras, os teores de potássio encontraram-se na classe acima do normal, encontrou-se correlações entre P/Ca, P/Cu, Ca/P, Ca/Mg e Ca/B. É possível constatar a carência do uso de ferramentas para avaliar o estado nutricional dos pomares, principalmente a diagnose foliar, o que levou ao uso inadequado de fertilizantes e consequentemente um desbalanço nutricional das plantas.(AU)
This study set out to assess the nutritional status of peach trees in the commercial peach-growing region of Pelotas, Rio Grande do Sul. The sample includes 65 peach orchards of the Maciel, Granada, Esmeralda, and Sensação cultivars in the municipalities of Pelotas, Canguçu, and Morro Redondo during the 2018 agricultural cycle. After drying and grinding the leaf samples for an analysis of their nitrogen (N), phosphorus (P), potassium (K), calcium (Ca), magnesium (Mg), boron (B), copper (Cu), iron (Fe), manganese (Mn), and zinc (Zn) content, the results were presented in frequency distributions divided into classes based on the nutrient requirements indicated for the crop in the region, in addition to the correlations between the nutrients. Greater deficiencies were observed in nitrogen, copper, iron, and zinc content. However, potassium content was found in the above normal class for most of the samples, and there were correlations between P/Ca, P/Cu, Ca/P, Ca/Mg, and Ca/B. An insufficient use of the tools to assess the nutritional status of the orchards was observed, especially the leaf diagnosis, which led to the inappropriate use of fertilizers and the consequent nutrient imbalance in the plants.(AU)
Assuntos
Prunus persica/química , Prunus persica/enzimologia , Prunus persica/fisiologia , Valor Nutritivo , EstercoResumo
Hemoplasmas are bacteria able to adhere themselves loosely to the plasma membrane of erythrocytes and may parasitize several species of mammals. There are three known species of hemoplasmas that parasitize domestic and wild cats: Mycoplasma haemofelis, 'Candidatus Mycoplasma haemominutum' and 'Candidatus Mycoplasma turicensis'. Dogs are infected by at least two species of hemoplasmas: 'Candidatus Mycoplasma haematoparvum' and Mycoplasma haemocanis. The hemoplasmoses are very important in veterinary clinics, either because of its worldwide distribution and severity of clinical signs, depending on parasite species and host immune competence, or due to its zoonotic potential and capability of infecting endangered species. This study set out to investigate which hemoplasmas species parasitize different captive wild carnivores in order to clarify the epidemiology of hemoplasmoses in wild animals. Furthermore, the research intended to characterize the hematological changes caused by different species of hemotropic mycoplasmas infection in order to establish their clinical importance to wild species and the capacity of these species to become a reservoir of studied agents. Samples of 33 wild felids and 18 wild canids were investigated using polymerase chain reaction (PCR) to detect hemoplasmas DNA and it was observed that the occurrence of infection in these species is 45.5% and 83.3%, respectively. Factors such as age, gender or anaemia are not more frequent in animals positive for the infection. Therefore, it is concluded that infection caused by hemoplasmas in wild carnivores has high prevalence, and either agent pathogenicity is low, or chronic stage is more frequent, resulting in a low rate of diagnosis.(AU)
Hemoplasmas são bactérias capazes de aderir frouxamente à membrana plasmática de eritrócitos e que podem parasitar diversas espécies de mamíferos. São conhecidas três espécies de hemoplasmas que parasitam felídeos domésticos e selvagens: Mycoplasma haemofelis, 'Candidatus Mycoplasma haemominutum' and 'Candidatus Mycoplasma turicensis'. Cães são infectados por ao menos duas espécies de hemoplasmas: Candidatus Mycoplasma haematoparvum' and Mycoplasma haemocanis. As hemoplasmoses são de grande importância na clínica veterinária, tanto pela sua distribuição ubíqua e severidade dos sinais clínicos, a depender da espécie do parasita e imunocompetência do hospedeiro, quanto pelo seu potencial zoonótico e capacidade de infectar espécies ameaçadas. Este estudo visa investigar quais espécies de hemoplasmas parasitam diferentes carnívoros selvagens de cativeiro, a fim de esclarecer a epidemiologia das hemoplasmoses em animais selvagens. Além disso, o trabalho objetivou caracterizar as alterações hematológicas causadas pela infecção por diferentes espécies de micoplasmas hemotrópicos visando estabelecer sua importância clínica para espécies selvagens e a capacidade destas espécies de se tornar reservatórios dos agentes estudados. Amostras de 33 felídeos selvagens e de 18 canídeos selvagens foram investigadas por meio da reação em cadeia da polimerase (RCP) para detectar o DNA dos agentes e foi observado que a ocorrência da infecção por hemoplasmas nestas espécies é de 45,5% e 83,3%, respectivamente. Fatores como idade, sexo ou anemia não são mais frequentes em animais positivos para a infecção. Dessa forma, conclui-se que a infecção causada por hemoplasmas em carnívoros selvagens possui alta prevalência, no entanto ou a patogenicidade dos agentes é baixa ou o estágio crônico da infecção é mais frequente, resultando em uma baixa frequência diagnóstica.(AU)
Assuntos
Animais , Canidae/microbiologia , Canidae/parasitologia , Felidae/microbiologia , Felidae/parasitologia , Animais Selvagens/microbiologia , Animais Selvagens/parasitologia , Infecções por Mycoplasma/epidemiologia , Anemia/veterináriaResumo
Doenças transmitidas por vetores estão emergindo e reemergindo em todo o mundo, representando um desafio na medicina humana e veterinária. Entre essas doenças estão aquelas causadas pelos agentes da ordem das Rickettsiales, que são bactérias Gram-negativas intracelulares obrigatórias, com capacidade de infectar vários animais e seres humanos. As Rickettsiales das espécies Ehrlichia spp. e Anaplasma spp. são observadas em vacúolos citoplasmáticos de leucócitos e plaquetas. As Rickettsiales da espécie Rickettsia spp. infectam livremente citoplasma ou núcleo de células hospedeiras. O objetivo do presente estudo foi investigar a infecção natural por Ehrlichia canis, Anaplasma platys, Anaplasma phagocytophilum e Rickettsia spp. em felídeos selvagens cativos no Distrito Federal e Goiás, Brasil. Além disso, também objetivou-se relacionar possíveis alterações hematológicas decorrentes da presença desses agentes. Amostras de sangue de 34 animais foram analisadas por meio da PCR para detecção de presença de DNA desses agentes. O DNA de Ehrlichia canis foi detectado em 5,8% (2/34) das amostras, A. platys foi detectado 64,7% (22/34), A. phagocytophilum foi detectado em 5,8% (2/34). O DNA de Rickettsia spp. não foi detectado em nenhuma amostra. Dois felídeos apresentaram coinfecção por E. canis e A. platys e dois apresentaram coinfecção por A. platys e A. phagocytophilum. Não houve diferenças significativas nos dados hematológicos das amostras positivas e negativas. Os dados sugerem que os felídeos selvagens cativos podem servir como potenciais reservatórios para Ehrlichia spp. e Anaplasma spp., a despeito de não ocasionarem alterações hematológicas.(AU)
Vector-borne diseases have been emerging and reemerging all over the world, causing a challenge to veterinary and human medicine. Among these diseases are those caused by agents of the order Rickettsiales, obligatory intracellular Gram-negative bacteria, with ability to infect several animals and humans. Rickettsiales of the species Ehrlichia spp. and Anaplasma spp. residing in cytoplasmic vacuoles of leukocytes and platelets. Rickettsiales of the species Rickettsia spp. freely infect cytoplasm or nucleus of host cells. The aim of the present study was to investigate the natural infection with Ehrlichia canis, Anaplasma platys, Anaplasma phagocytophilum and Rickettsia spp. in captive wild felids at the Federal District and Goiás, Brazil. In addition, it was also aimed to relate possible changes in hemogram with the presence of these agents. Blood samples from 34 animals were analyzed by PCR to detect the presence of DNA from these agents. The DNA of Ehrlichia canis was detected in 5.8% (2/34) of samples. A. platys was detected in 64.7% (22/34), A. phagocytophilum was detected in 5.8% (2/34). The DNA of Rickettsia spp. was not detected in any sample. Two felides presented co-infection with E. canis and A. platys, and two presented co-infection with A. platys and A. phagocytophilum. There were no significant differences in hematological data from positive and negative samples. The data suggest that captive wild felids can serve as potential reservoirs for Ehrlichia spp. and Anaplasma spp., despite hematological abnormalities were not observed.(AU)
Assuntos
Animais , Cães , Rickettsia/patogenicidade , Ehrlichia canis/patogenicidade , Felidae/microbiologia , Anaplasma/patogenicidade , Patologia MolecularResumo
Doenças transmitidas por vetores estão emergindo e reemergindo em todo o mundo, representando um desafio na medicina humana e veterinária. Entre essas doenças estão aquelas causadas pelos agentes da ordem das Rickettsiales, que são bactérias Gram-negativas intracelulares obrigatórias, com capacidade de infectar vários animais e seres humanos. As Rickettsiales das espécies Ehrlichia spp. e Anaplasma spp. são observadas em vacúolos citoplasmáticos de leucócitos e plaquetas. As Rickettsiales da espécie Rickettsia spp. infectam livremente citoplasma ou núcleo de células hospedeiras. O objetivo do presente estudo foi investigar a infecção natural por Ehrlichia canis, Anaplasma platys, Anaplasma phagocytophilum e Rickettsia spp. em felídeos selvagens cativos no Distrito Federal e Goiás, Brasil. Além disso, também objetivou-se relacionar possíveis alterações hematológicas decorrentes da presença desses agentes. Amostras de sangue de 34 animais foram analisadas por meio da PCR para detecção de presença de DNA desses agentes. O DNA de Ehrlichia canis foi detectado em 5,8% (2/34) das amostras, A. platys foi detectado 64,7% (22/34), A. phagocytophilum foi detectado em 5,8% (2/34). O DNA de Rickettsia spp. não foi detectado em nenhuma amostra. Dois felídeos apresentaram coinfecção por E. canis e A. platys e dois apresentaram coinfecção por A. platys e A. phagocytophilum. Não houve diferenças significativas nos dados hematológicos das amostras positivas e negativas. Os dados sugerem que os felídeos selvagens cativos podem servir como potenciais reservatórios para Ehrlichia spp. e Anaplasma spp., a despeito de não ocasionarem alterações hematológicas.(AU)
Vector-borne diseases have been emerging and reemerging all over the world, causing a challenge to veterinary and human medicine. Among these diseases are those caused by agents of the order Rickettsiales, obligatory intracellular Gram-negative bacteria, with ability to infect several animals and humans. Rickettsiales of the species Ehrlichia spp. and Anaplasma spp. residing in cytoplasmic vacuoles of leukocytes and platelets. Rickettsiales of the species Rickettsia spp. freely infect cytoplasm or nucleus of host cells. The aim of the present study was to investigate the natural infection with Ehrlichia canis, Anaplasma platys, Anaplasma phagocytophilum and Rickettsia spp. in captive wild felids at the Federal District and Goiás, Brazil. In addition, it was also aimed to relate possible changes in hemogram with the presence of these agents. Blood samples from 34 animals were analyzed by PCR to detect the presence of DNA from these agents. The DNA of Ehrlichia canis was detected in 5.8% (2/34) of samples. A. platys was detected in 64.7% (22/34), A. phagocytophilum was detected in 5.8% (2/34). The DNA of Rickettsia spp. was not detected in any sample. Two felides presented co-infection with E. canis and A. platys, and two presented co-infection with A. platys and A. phagocytophilum. There were no significant differences in hematological data from positive and negative samples. The data suggest that captive wild felids can serve as potential reservoirs for Ehrlichia spp. and Anaplasma spp., despite hematological abnormalities were not observed.(AU)
Assuntos
Animais , Rickettsia/patogenicidade , Ehrlichia canis/patogenicidade , Felidae/microbiologia , Anaplasma/patogenicidade , Animais Selvagens/microbiologia , Reação em Cadeia da PolimeraseResumo
ABSTRACT: Atemoya, an interspecific hybrid belonging to Annonaceae family, is the outcome of a cross between cherimoya (Annona cherimola Mill.) and Custard apple (Annona squamosa L.). In light of the current shortage of scientific data on the nutritional management techniques for this fruit, the need to develop and apply a specific methodology becomes crucial. From the variety of plant diagnostic tools available, the DRIS method was selected, for use in the commercial cultivation of the Thompson cultivar of atemoya located in the São Paulo State, municipalities of Itapetininga, Piedade, Pilar do Sul and Salto de Pirapora. Normal nutrient ranges were determined to interpret the levels of N, P, K, Ca, Mg, S, B, Cu, Fe, Mn and Zn in the culture through statistical regression analysis and samples of leaf dry matter, with their respective DRIS indices. Although the general index of the nutritional balance of DRIS disallowed establishing a link with productivity, this study achieved it based on the standard of determining normal ranges for cognate macronutrients to the ones cited in the literature.
RESUMO: A atemoia é um híbrido interespecífico, da família da Annonaceae, obtido pelo cruzamento da cherimoia (Annona cherimola Mill.) e a fruta-pinha (Annona squamosa L.). Devido a falta de informações científicas disponíveis para a fruta sobre os procedimentos de manejo nutricional, o desenvolvimento e a aplicação de uma metodologia específica são de grande importância. Dentre as ferramentas disponíveis para a realização da diagnose de plantas temos o método DRIS. Este foi empregado em talhões comerciais de atemoia do cultivar Thompson nos municípios do estado de São Paulo: Itapetininga, Piedade, Pilar do Sul e Salto de Pirapora. A determinação das faixas normais de nutrientes para a interpretação dos níveis de N, P, K, Ca, Mg, S, B, Cu, Fe, Mn e Zn na cultura foram obtidas pela análise estatística de regressão relacionando os seus teores, presentes nas matérias secas das amostras foliares com seus respectivos índices DRIS. Embora o índice geral de balanço nutricional do DRIS não tenha permitido estabelecer uma relação com a produtividade, foi possível, com base na norma, determinar faixas normais para macronutrientes semelhantes aos encontrados na literatura.
Resumo
ABSTRACT: Pseudorabies (PR) is a highly contagious viral disease of great animal health and economic importance in swine industry. The aim of this study was to evaluate different genomic regions, real-time PCR chemistries and equipment for the molecular diagnosis of PR. Eight primer pairs targeting four genes (gB, gC, gE, gD), three different qPCR chemistries (SybrGreen, hydrolysis probes and plexor) and two equipment (ABI7500, Rotorgene 3000) were evaluated. Oligonucleotides targeting gB using hydrolysis probes showed the best performance after evaluating efficiency (99%), the detection limit (10-1.5 TCID50 mL-1) and diagnostic sensitivity and; therefore, those primers were selected for performance verification factors such as repeatability, reproducibility and robustness (1.39% variance between days, 24% variance between analysts and 4.07% variance in analysis error). The qPCR standardized and validated in this research proved to be reliable for the diagnosis of PR and may be used in diagnostic laboratories that follow ISO 17025 and ISO 16140.
RESUMO: Pseudorraiva (PR) é uma doença viral altamente contagiosa de grande importância sanitária e econômica na indústria suína. O objetivo deste estudo foi avaliar diferentes regiões genômicas, químicas de PCR em tempo real e equipamentos para o diagnóstico molecular de PR. Foram avaliados quatro genes (GB, GC, GE, gD), três diferentes produtos químicos (SybrGreen, sondas de hidrólise e plexor) e dois equipamentos (ABI7500, Rotorgene 3000). Oligonucleotídeos com alvo para gB baseados na química de sondas de hidrólise apresentaram o melhor desempenho nos testes de eficiência (99%), de limite de detecção (10-1.5 TCID50 mL-1) e sensibilidade diagnóstica. Portanto, estes foram selecionados para fatores de verificação de desempenho, tais como a repetibilidade, reprodutibilidade e robustez (1,39% de variância entre dias, 24% variância entre analistas e 4,07% de variância por erro de análise). A qPCR, padronizada e validada neste trabalho, mostrou-se confiável para o diagnóstico de PR e pode ser utilizada em laboratórios de diagnóstico que se seguem normas internacionais como ISO 17025 e ISO 16140.
Resumo
Pseudorabies (PR) is a highly contagious viral disease of great animal health and economic importance in swine industry. The aim of this study was to evaluate different genomic regions, real-time PCR chemistries and equipment for the molecular diagnosis of PR. Eight primer pairs targeting four genes (gB, gC, gE, gD), three different qPCR chemistries (SybrGreen, hydrolysis probes and plexor) and two equipment (ABI7500, Rotorgene 3000) were evaluated. Oligonucleotides targeting gB using hydrolysis probes showed the best performance after evaluating efficiency (99%), the detection limit (10-1.5 TCID50 mL-1) and diagnostic sensitivity and; therefore, those primers were selected for performance verification factors such as repeatability, reproducibility and robustness (1.39% variance between days, 24% variance between analysts and 4.07% variance in analysis error). The qPCR standardized and validated in this research proved to be reliable for the diagnosis of PR and may be used in diagnostic laboratories that follow ISO 17025 and ISO 16140.
Pseudorraiva (PR) é uma doença viral altamente contagiosa de grande importância sanitária e econômica na indústria suína. O objetivo deste estudo foi avaliar diferentes regiões genômicas, químicas de PCR em tempo real e equipamentos para o diagnóstico molecular de PR. Foram avaliados quatro genes (GB, GC, GE, gD), três diferentes produtos químicos (SybrGreen, sondas de hidrólise e plexor) e dois equipamentos (ABI7500, Rotorgene 3000). Oligonucleotídeos com alvo para gB baseados na química de sondas de hidrólise apresentaram o melhor desempenho nos testes de eficiência (99%), de limite de detecção (10-1.5 TCID50 mL-1) e sensibilidade diagnóstica. Portanto, estes foram selecionados para fatores de verificação de desempenho, tais como a repetibilidade, reprodutibilidade e robustez (1,39% de variância entre dias, 24% variância entre analistas e 4,07% de variância por erro de análise). A qPCR, padronizada e validada neste trabalho, mostrou-se confiável para o diagnóstico de PR e pode ser utilizada em laboratórios de diagnóstico que se seguem normas internacionais como ISO 17025 e ISO 16140.
Assuntos
Métodos , Pseudorraiva , Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real , Vírus , Diagnóstico , Herpesvirus Suídeo 1Resumo
Atemoya, an interspecific hybrid belonging to Annonaceae family, is the outcome of a cross between cherimoya (Annona cherimola Mill.) and Custard apple (Annona squamosa L.). In light of the current shortage of scientific data on the nutritional management techniques for this fruit, the need to develop and apply a specific methodology becomes crucial. From the variety of plant diagnostic tools available, the DRIS method was selected, for use in the commercial cultivation of the Thompson cultivar of atemoya located in the São Paulo State, municipalities of Itapetininga, Piedade, Pilar do Sul and Salto de Pirapora. Normal nutrient ranges were determined to interpret the levels of N, P, K, Ca, Mg, S, B, Cu, Fe, Mn and Zn in the culture through statistical regression analysis and samples of leaf dry matter, with their respective DRIS indices. Although the general index of the nutritional balance of DRIS disallowed establishing a link with productivity, this study achieved it based on the standard of determining normal ranges for cognate macronutrients to the ones cited in the literature.
A atemoia é um híbrido interespecífico, da família da Annonaceae, obtido pelo cruzamento da cherimoia (Annona cherimola Mill.) e a fruta-pinha (Annona squamosa L.). Devido a falta de informações científicas disponíveis para a fruta sobre os procedimentos de manejo nutricional, o desenvolvimento e a aplicação de uma metodologia específica são de grande importância. Dentre as ferramentas disponíveis para a realização da diagnose de plantas temos o método DRIS. Este foi empregado em talhões comerciais de atemoia do cultivar Thompson nos municípios do estado de São Paulo: Itapetininga, Piedade, Pilar do Sul e Salto de Pirapora. A determinação das faixas normais de nutrientes para a interpretação dos níveis de N, P, K, Ca, Mg, S, B, Cu, Fe, Mn e Zn na cultura foram obtidas pela análise estatística de regressão relacionando os seus teores, presentes nas matérias secas das amostras foliares com seus respectivos índices DRIS. Embora o índice geral de balanço nutricional do DRIS não tenha permitido estabelecer uma relação com a produtividade, foi possível, com base na norma, determinar faixas normais para macronutrientes semelhantes aos encontrados na literatura.
Assuntos
Annonaceae/crescimento & desenvolvimento , Nutrientes/análise , Plantas/anatomia & histologia , Interpretação Estatística de DadosResumo
Pseudorabies (PR) is a highly contagious viral disease of great animal health and economic importance in swine industry. The aim of this study was to evaluate different genomic regions, real-time PCR chemistries and equipment for the molecular diagnosis of PR. Eight primer pairs targeting four genes (gB, gC, gE, gD), three different qPCR chemistries (SybrGreen, hydrolysis probes and plexor) and two equipment (ABI7500, Rotorgene 3000) were evaluated. Oligonucleotides targeting gB using hydrolysis probes showed the best performance after evaluating efficiency (99%), the detection limit (10-1.5 TCID50 mL-1) and diagnostic sensitivity and; therefore, those primers were selected for performance verification factors such as repeatability, reproducibility and robustness (1.39% variance between days, 24% variance between analysts and 4.07% variance in analysis error). The qPCR standardized and validated in this research proved to be reliable for the diagnosis of PR and may be used in diagnostic laboratories that follow ISO 17025 and ISO 16140. (AU)
Pseudorraiva (PR) é uma doença viral altamente contagiosa de grande importância sanitária e econômica na indústria suína. O objetivo deste estudo foi avaliar diferentes regiões genômicas, químicas de PCR em tempo real e equipamentos para o diagnóstico molecular de PR. Foram avaliados quatro genes (GB, GC, GE, gD), três diferentes produtos químicos (SybrGreen, sondas de hidrólise e plexor) e dois equipamentos (ABI7500, Rotorgene 3000). Oligonucleotídeos com alvo para gB baseados na química de sondas de hidrólise apresentaram o melhor desempenho nos testes de eficiência (99%), de limite de detecção (10-1.5 TCID50 mL-1) e sensibilidade diagnóstica. Portanto, estes foram selecionados para fatores de verificação de desempenho, tais como a repetibilidade, reprodutibilidade e robustez (1,39% de variância entre dias, 24% variância entre analistas e 4,07% de variância por erro de análise). A qPCR, padronizada e validada neste trabalho, mostrou-se confiável para o diagnóstico de PR e pode ser utilizada em laboratórios de diagnóstico que se seguem normas internacionais como ISO 17025 e ISO 16140. (AU)
Assuntos
Métodos , Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real , Vírus , Pseudorraiva , Diagnóstico , Diagnóstico , Herpesvirus Suídeo 1Resumo
Atemoya, an interspecific hybrid belonging to Annonaceae family, is the outcome of a cross between cherimoya (Annona cherimola Mill.) and Custard apple (Annona squamosa L.). In light of the current shortage of scientific data on the nutritional management techniques for this fruit, the need to develop and apply a specific methodology becomes crucial. From the variety of plant diagnostic tools available, the DRIS method was selected, for use in the commercial cultivation of the Thompson cultivar of atemoya located in the São Paulo State, municipalities of Itapetininga, Piedade, Pilar do Sul and Salto de Pirapora. Normal nutrient ranges were determined to interpret the levels of N, P, K, Ca, Mg, S, B, Cu, Fe, Mn and Zn in the culture through statistical regression analysis and samples of leaf dry matter, with their respective DRIS indices. Although the general index of the nutritional balance of DRIS disallowed establishing a link with productivity, this study achieved it based on the standard of determining normal ranges for cognate macronutrients to the ones cited in the literature.(AU)
A atemoia é um híbrido interespecífico, da família da Annonaceae, obtido pelo cruzamento da cherimoia (Annona cherimola Mill.) e a fruta-pinha (Annona squamosa L.). Devido a falta de informações científicas disponíveis para a fruta sobre os procedimentos de manejo nutricional, o desenvolvimento e a aplicação de uma metodologia específica são de grande importância. Dentre as ferramentas disponíveis para a realização da diagnose de plantas temos o método DRIS. Este foi empregado em talhões comerciais de atemoia do cultivar Thompson nos municípios do estado de São Paulo: Itapetininga, Piedade, Pilar do Sul e Salto de Pirapora. A determinação das faixas normais de nutrientes para a interpretação dos níveis de N, P, K, Ca, Mg, S, B, Cu, Fe, Mn e Zn na cultura foram obtidas pela análise estatística de regressão relacionando os seus teores, presentes nas matérias secas das amostras foliares com seus respectivos índices DRIS. Embora o índice geral de balanço nutricional do DRIS não tenha permitido estabelecer uma relação com a produtividade, foi possível, com base na norma, determinar faixas normais para macronutrientes semelhantes aos encontrados na literatura.(AU)
Assuntos
Annonaceae/crescimento & desenvolvimento , Plantas/anatomia & histologia , Nutrientes/análise , Interpretação Estatística de DadosResumo
There is no molecular characterization of Brazilian isolates of Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV), except for those infecting peach. In this research, the causal agent of rose mosaic was determined and the movement (MP) and coat (CP) protein genes of a PNRSV isolate from rose were molecularly characterized for the first time in Brazil. The nucleotide and deduced amino acid sequences of MP and CP complete genes were aligned and compared with other isolates. Molecular analysis of the MP and CP nucleotide sequences of a Brazilian PNRSV isolate from rose and others from this same host showed highest identities of 96.7% and 98.6%, respectively, and Rose-Br isolate was classified in PV32 group.
Inexiste caracterização molecular de isolados brasileiros de Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV), exceto aqueles de pessegueiros. Neste trabalho, o agente causal do mosaico da roseira foi determinado e os genes das proteínas de movimento (MP) e capsidial (CP) de um isolado de PNRSV de roseira foram molecularmente caracterizados pela primeira vez no Brasil. As sequências completas de nucleotídeos e de aminoácidos deduzidos da MP e da CP foram alinhadas e comparadas com outros isolados. Análises das sequências de nucleotídeos da MP e da CP do isolado brasileiro de PNRSV de roseira e outros isolados da mesma hospedeira revelaram altas identidades de 96,7% e 98,6%, respectivamente, sendo o isolado Rose-Br classificado no grupo PV32.
Assuntos
Doenças das Plantas , Prunus , Rosa , Vírus do Mosaico/isolamento & purificação , Vírus do Mosaico/patogenicidadeResumo
Erwinia psidii causes bacterial blight of guava ( Psidium guajava ), an important disease of this crop in Brazil. The pathogen affects branches and twigs of guava trees, reducing yield significantly. Bacterial dissemination often occurs through contaminated but asymptomatic propagating plant material. The objectives of this research were to evaluate the use of BIO-PCR and conventional PCR to detect E. psidii in inoculated guava plants grown in a greenhouse and in symptomatic and asymptomatic trees from guava orchards. Erwinia psidii strain IBSBF 1576 was inoculated (107CFU mL-1) into young guava shoots and plant tissue was analysed at 0, 5, 10, and 15 days after inoculation. Symptoms were observed after 5 days and all inoculated shoots were PCR positive at all times, by both BIO-PCR and conventional PCR. Under natural infection conditions, 40 samples were tested by BIO-PCR from each of three guava orchards, 20 showing symptoms and 20 asymptomatic. PCR was positive for 58 out of 60 symptomatic samples (96.7%) and for 6.7% of asymptomatic samples, showing that the method can be used to detect the pathogen at early stages of infection. This PCR method may be used as a diagnostic tool to assess bacterial survival, dissemination and disease outbreaks.(AU)
Erwinia psidii é o agente causal da seca dos ponteiros da goiabeira ( Psidium guajava ), uma importante doença dessa cultura no Brasil. O patógeno afeta folhas, frutos, ramos e brotações, reduzindo significativamente a produtividade da cultura. A disseminação do patógeno ocorre por meio de material propagativo contaminado, porém assintomático. Os objetivos do trabalho foram avaliar o uso da BIO-PCR e da PCR convencional para detectar E. psidii em plantas inoculadas em casa de vegetação e em plantas sintomáticas e assintomáticas em pomares de goiabeira. A estirpe IBSBF 1576 de E. psidii foi inoculada (107UFC mL-1) em brotações novas de mudas de goiabeira e o tecido foi analisado nos tempos 0, 5, 10, e 15 dias após a inoculação. Sintomas foram observados após 5 dias e todas as plantas inoculadas foram positivas por PCR em todos os tempos avaliados, pelos dois métodos (BIO-PCR e PCR convencional). Sob condições de infecção natural em campo, três pomares foram avaliados por BIO-PCR. De cada pomar, foram coletadas 40 amostras, sendo 20 com e 20 sem sintomas. PCR foi positiva para 58 das 60 amostras sintomáticas (96,7%) e para 6,7% das amostras assintomáticas, demonstrando que o método pode ser usado para detectar o patógeno nos estágios iniciais da infecção. Este método poderá ser útil como uma ferramenta para a diagnose e para monitorar a sobrevivência e disseminação da bactéria e, consequentemente, novos focos da doença.(AU)
Assuntos
Erwinia , Doenças das Plantas , Psidium , Patologia MolecularResumo
There is no molecular characterization of Brazilian isolates of Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV), except for those infecting peach. In this research, the causal agent of rose mosaic was determined and the movement (MP) and coat (CP) protein genes of a PNRSV isolate from rose were molecularly characterized for the first time in Brazil. The nucleotide and deduced amino acid sequences of MP and CP complete genes were aligned and compared with other isolates. Molecular analysis of the MP and CP nucleotide sequences of a Brazilian PNRSV isolate from rose and others from this same host showed highest identities of 96.7% and 98.6%, respectively, and Rose-Br isolate was classified in PV32 group.(AU)
Inexiste caracterização molecular de isolados brasileiros de Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV), exceto aqueles de pessegueiros. Neste trabalho, o agente causal do mosaico da roseira foi determinado e os genes das proteínas de movimento (MP) e capsidial (CP) de um isolado de PNRSV de roseira foram molecularmente caracterizados pela primeira vez no Brasil. As sequências completas de nucleotídeos e de aminoácidos deduzidos da MP e da CP foram alinhadas e comparadas com outros isolados. Análises das sequências de nucleotídeos da MP e da CP do isolado brasileiro de PNRSV de roseira e outros isolados da mesma hospedeira revelaram altas identidades de 96,7% e 98,6%, respectivamente, sendo o isolado Rose-Br classificado no grupo PV32.(AU)
Assuntos
Prunus , Rosa , Doenças das Plantas , Vírus do Mosaico/isolamento & purificação , Vírus do Mosaico/patogenicidadeResumo
The viruses Apple stem grooving virus (ASGV), Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV), Apple stem pitting virus (ASPV) and Apple mosaic virus (ApMV) are common in apples and pears and main targets of detection in propagation materials. This study aimed at demonstrating the usefulness of the hybridization method with a non-radioactive probe for simultaneous detection of these four viruses. The sensitivity of this method was sufficiently high enabling the detection of ASGV, ACLSV, ASPV and ApMV in total RNA extracted from infected samples. The probe specificity was confirmed by reaction with homologous viral cDNA, individually cloned for each virus.
Os vírus Apple stem grooving virus (ASGV), Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV), Apple stem pitting virus (ASPV) e Apple mosaic virus (ApMV) são comuns em macieiras e pereiras e alvos prioritários da detecção em materiais propagativos. Este trabalho objetivou demonstrar a viabilidade do método de hibridização com uma sonda não-radioativa para a detecção simultânea desses quatro vírus. A sensibilidade deste teste foi suficientemente alta para permitir a detecção do ASGV, ACLSV, ASPV e ApMV em RNA total extraído de amostras infectadas. A especificidade da sonda foi confirmada pela reação com cDNA viral homólogo, individualmente clonado, para cada vírus.
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Doenças das Plantas , Malus/virologia , Pyrus/virologia , Técnicas de Sonda Molecular , VirosesResumo
The viruses Apple stem grooving virus (ASGV), Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV), Apple stem pitting virus (ASPV) and Apple mosaic virus (ApMV) are common in apples and pears and main targets of detection in propagation materials. This study aimed at demonstrating the usefulness of the hybridization method with a non-radioactive probe for simultaneous detection of these four viruses. The sensitivity of this method was sufficiently high enabling the detection of ASGV, ACLSV, ASPV and ApMV in total RNA extracted from infected samples. The probe specificity was confirmed by reaction with homologous viral cDNA, individually cloned for each virus.(AU)
Os vírus Apple stem grooving virus (ASGV), Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV), Apple stem pitting virus (ASPV) e Apple mosaic virus (ApMV) são comuns em macieiras e pereiras e alvos prioritários da detecção em materiais propagativos. Este trabalho objetivou demonstrar a viabilidade do método de hibridização com uma sonda não-radioativa para a detecção simultânea desses quatro vírus. A sensibilidade deste teste foi suficientemente alta para permitir a detecção do ASGV, ACLSV, ASPV e ApMV em RNA total extraído de amostras infectadas. A especificidade da sonda foi confirmada pela reação com cDNA viral homólogo, individualmente clonado, para cada vírus.(AU)
Assuntos
Doenças das Plantas , Malus/virologia , Pyrus/virologia , Técnicas de Sonda Molecular , VirosesResumo
Intercropping could efficiently prevent soil nutrient losses caused by extensive agriculture. The present study aimed to assess the effect of green manure on the nutritional status of orange trees cultivar 'Pera' (Citrus sinensis (L.) Osbeck). The plants were grafted on 'Cravo' lime trees and were then planted in a 7x4m space. Four different treatments corresponding to the evaluated green manures were employed: jack bean (JB) (Canavalia ensiformis DC), lablab (LL) (Dolichos lablab L.), pigeon pea (PP) (Cajanus cajan L. Millsp), and Brachiaria (BQ) (Brachiaria brizantha Hochst ex A. Rich. Stapf) as control. The experimental design was in randomized blocks, in split-plot time, with six replicates, with four treatments (green manures) and two plants per evaluation. The nutritional status was assessed by using the DRIS method (Diagnosis and Recommendation Integrated System); the yield and the macro and micronutrient levels contained in green manures and in the control was also determined. The nutritional diagnosis indicated that, in the two years of experiment, plants treated with green manure showed better nutritional balance index compared to Brachiaria. This suggests that, over time, green manure can lead to better nutritional balance. Pigeon pea treatment showed the highest yields, compared to control, in the two evaluated crop cycles (2004/05 and 2005/06).(AU)
O manejo de culturas intercalares poderia prevenir eficientemente as perdas de nutrientes do solo, causadas pelo cultivo extensivo. O trabalho teve como objetivo avaliar o efeito da utilização de adubos verdes no estado nutricional de plantas de laranjeira 'Pêra' (Citrus sinensis (L.) Osbeck). O solo da área de cultivo é denominado Neossolo Quartzarênico. As plantas estavam enxertadas em limoeiro 'Cravo' e foram plantadas num espaçamento de sete por quatro metros. Foram empregados quatro tratamentos correspondentes aos adubos verdes avaliados, sendo eles: feijão de porco (FP) (Canavalia ensiformis DC), labe-labe (LL) (Dolichus lablab L.), feijão guandu anão (GA) (Cajanus cajan L. Millsp) e braquiária (BQ) (Brachiaria brizantha Hochst ex A. Rich. Stapf). Conduziu-se o experimento em delineamento de blocos casualizados em esquema de parcelas subdivididas no tempo, com seis repetições, quatro tratamentos (adubos verdes) e duas plantas úteis para as avaliações. Avaliou-se o estado nutricional pelo método DRIS (Sistema Integrado de Diagnose e Recomendação), bem como a produção e o teor de macro e micronutrientes contidos nos adubos verdes e na testemunha. O diagnóstico nutricional demonstrou que, nos dois anos de experimentação, houve um melhor índice de balanço nutricional para os adubos verdes, quando comparados com a braquiária (testemunha). Esta constatação permite inferir sobre a disponibilidade de, ao longo do tempo, os adubos verdes permitirem um melhor equilíbrio nutricional para as plantas. O tratamento com feijão de porco apresentou as maiores produções, quando comparado com a testemunha, nos dois ciclos agrícolas de avaliação (2004/05 e 2005/06).(AU)