Morphological characterization of remaining specimens of the Curraleiro horse in Central Brazil / Caracterização morfológica de espécimes remanescentes do cavalo Curraleiro no Brasil Central

This study aimed to carry out the morphological characterization of the remaining specimens of the Curraleiro horse in municipalities of the state of Goiás, Brazil. Forty male horses were evaluated using the age of five years as a criterion. Sixteen linear measurements and 13 zootechnical indices were obtained. Subsequently, the mean, standard deviation, minimum, maximum, and covariances of these measures and indices were obtained using the software IBM SPSS Statistics for Windows. The measures withers height (WH), croup height (CH), midback height (MH), sternum-to-ground height (SH), chest index (CI), and estimated weight (W) allowed characterizing Curraleiro horses as small-sized, light, and fast, with proportional measures. The dactyl-thoracic index (DTI), body index (BI), conformation index (CFI), load index 1 and 2 (LOI1 and LOI2), and compactness index 1 and 2 (COI1 and COI2) showed that the Curraleiro horse has an intermediate capacity for speed and strength, bearing considerable weight on the back, with saddling aptitude and fast work. These results represent the beginning of the formation of a database that may contribute to future studies and the conservation of the Curraleiro horse in the state of Goiás.(AU)

O objetivo deste trabalho foi a realização da caracterização morfológica de espécimes remanescentes do cavalo Curraleiro em municípios do estado de Goiás, Brasil. Foram avaliados 40 cavalos machos, tendo como critério a idade a partir de cinco anos, dos quais se obteve 16 medidas lineares e 13 índices zootécnicos. Posteriormente, a média, o desvio padrão, o mínimo, o máximo e as covariâncias dessas medidas e índices foram obtidos por meio da utilização do software IBM SPSS Statistics for Windows. As medidas altura da cernelha (AC), altura da garupa (AG), altura do costado (ACost), vazio subesternal (VAZ), índice peitoral (IP) e peso estimado (P) permitiram caracterizar os cavalos Curraleiros como um grupo de pequeno porte, leve, veloz e com medidas proporcionais. Os índices dáctilo-torácico (IDT), corporal (IC), de conformação (ICF), de carga 1 e 2 (ICG1 e ICG2) e de compacidade 1 e 2 (ICO1 e ICO2) demonstraram que o cavalo Curraleiro tem capacidade intermediária para velocidade e força, suportam considerável peso sobre o dorso, e possuem aptidão para sela e tração ligeira. Tais resultados representam o início da formação de uma base de dados que pode contribuir para estudos futuros e a conservação do cavalo Curraleiro no estado de Goiás.(AU)

Identification of a historic horse ecotype analyzing speech content in central Brazil / Resgate de um ecótipo equino histórico mediante análise de conteúdo de discurso no Brasil central

This study represents a first attempt to rescue germplasm of a traditional domestic equine cited in early Iberian and South American literature as Curraleiro horse. As an effort to identify and possibly characterize this type of horse we accessed traditional knowledge in strategic rural areas. Most areas were configured by hinterland settlements founded by runaway slave communities from the sixteenth century. Twenty interviews were conducted and analyzed using classical Speech Content Analysis. As a result, five response categories were recognized: 1) Identification and location of Curraleiro horses; 2) Characterization of Curraleiro horses; 3) Historical aspects; 4) Curraleiro horse conservation prospects and 5) Sanitary and productive aspects of Curraleiro horse breeding. We concluded that although scarce, the Curraleiro horse, cited in literature, still exists and showed phenotypical features which allow fine discrimination from any officially recognized breed in Brazil. Our findings may open the door for the recognition of a genuine animal resource which could play a role in rural development for specific regions and traditional communities. Speech Content Analysis was effective for in loco identification and characterization of rare traditional livestock. Thus, we encourage the usage of this tool as an alternative to subsidize identification and genetic conservation programs worldwide.(AU)

Esse estudo representa uma primeira tentativa de resgate de germoplasma em um equino doméstico tradicional citado em literatura precoce Iberiana e Sul Americana como um cavalo Curraleiro. Num esforço de identificar e possivelmente caracterizar esse tipo de cavalo, acessamos conhecimento tradicional em diversas áreas rurais estratégicas. A maioria consistia em assentamentos rurais fundados por comunidades escravas foragidas no século dezesseis. Vinte entrevistas foram conduzidas e analisadas utilizando análise de conteúdo de discurso clássico. Como resultado, cinco categorias de resposta foram reconhecidas: 1) Identificação e localização de cavalos Curraleiros; 2) Caracterização de cavalos curraleiros; 3) Aspectos históricos, 4) Perspectivas de conservação, e 5) Aspectos sanitários e produtivos da criação de cavalos Curraleiros. Concluímos que, apesar de escasso, o cavalo Curraleiro, citado na literatura, ainda existe e apresenta características fenotípicas que permitem discriminação de raças oficialmente reconhecidas no Brasil. Nossos achados podem abrir alas para o reconhecimento de um recurso animal genuíno que pode ter um papel no desenvolvimento rural em regiões específicas e comunidades tradicionais. Análise de conteúdo de discurso foi eficaz para identificação e caracterização in loco de criação tradicional rara. Desta forma, encorajamos o uso dessa ferramenta como alternativa para subsídio de identificação e programas de conservação genética ao redor do mundo.(AU)

Identification of a historic horse ecotype analyzing speech content in central Brazil / Resgate de um ecótipo equino histórico mediante análise de conteúdo de discurso no Brasil central

This study represents a first attempt to rescue germplasm of a traditional domestic equine cited in early Iberian and South American literature as Curraleiro horse. As an effort to identify and possibly characterize this type of horse we accessed traditional knowledge in strategic rural areas. Most areas were configured by hinterland settlements founded by runaway slave communities from the sixteenth century. Twenty interviews were conducted and analyzed using classical Speech Content Analysis. As a result, five response categories were recognized: 1) Identification and location of Curraleiro horses; 2) Characterization of Curraleiro horses; 3) Historical aspects; 4) Curraleiro horse conservation prospects and 5) Sanitary and productive aspects of Curraleiro horse breeding. We concluded that although scarce, the Curraleiro horse, cited in literature, still exists and showed phenotypical features which allow fine discrimination from any officially recognized breed in Brazil. Our findings may open the door for the recognition of a genuine animal resource which could play a role in rural development for specific regions and traditional communities. Speech Content Analysis was effective for in loco identification and characterization of rare traditional livestock. Thus, we encourage the usage of this tool as an alternative to subsidize identification and genetic conservation programs worldwide.(AU)

Esse estudo representa uma primeira tentativa de resgate de germoplasma em um equino doméstico tradicional citado em literatura precoce Iberiana e Sul Americana como um cavalo Curraleiro. Num esforço de identificar e possivelmente caracterizar esse tipo de cavalo, acessamos conhecimento tradicional em diversas áreas rurais estratégicas. A maioria consistia em assentamentos rurais fundados por comunidades escravas foragidas no século dezesseis. Vinte entrevistas foram conduzidas e analisadas utilizando análise de conteúdo de discurso clássico. Como resultado, cinco categorias de resposta foram reconhecidas: 1) Identificação e localização de cavalos Curraleiros; 2) Caracterização de cavalos curraleiros; 3) Aspectos históricos, 4) Perspectivas de conservação, e 5) Aspectos sanitários e produtivos da criação de cavalos Curraleiros. Concluímos que, apesar de escasso, o cavalo Curraleiro, citado na literatura, ainda existe e apresenta características fenotípicas que permitem discriminação de raças oficialmente reconhecidas no Brasil. Nossos achados podem abrir alas para o reconhecimento de um recurso animal genuíno que pode ter um papel no desenvolvimento rural em regiões específicas e comunidades tradicionais. Análise de conteúdo de discurso foi eficaz para identificação e caracterização in loco de criação tradicional rara. Desta forma, encorajamos o uso dessa ferramenta como alternativa para subsídio de identificação e programas de conservação genética ao redor do mundo.(AU)

Reproductive characteristics of Crioulo Lageano breed bulls (Bos taurus) at puberty

The aim of this research was to evaluate pubertal development characteristics of Crioulo Lageano breed bulls (n = 10) using morphometric measurements and semen analysis, to identify factors that can be used to estimate age at puberty in this locally adapted breed. Monthly measurement of body weight and fortnightly measurement of scrotal circumference, chest girth, testicular length, width, thickness, and volume were recorded for each of the 10 Crioulo Lageano breed bulls, which were between 10 and 20 months old. During this period, semen samples were collected every two weeks using electro ejaculation method and analyzed physically and morphologically. The ages of the appearance of first spermatozoa in the ejaculate (FSE), the first motile spermatozoa in the ejaculate (FSEM), seminal puberty (PUB) and total detachment between glans penis and prepuce (DPP) were ascertained. Crioulo Lageano bulls reached puberty at 14.1 ± 2.0 months old with lower weight and larger testicles than those of other bovine breeds. Similarly, the period from FSEM to PUB was shorter and the period from FSE to FSEM was longer than those reported for other breeds. The most important characteristics studied in order to estimate puberty age in Crioulo Lageano bulls were the measures of testicular length, width, and volume. These parameters can be used as criteria to select young bulls as sires.

Reproductive characteristics of Crioulo Lageano breed bulls (Bos taurus) at puberty

The aim of this research was to evaluate pubertal development characteristics of Crioulo Lageano breed bulls (n = 10) using morphometric measurements and semen analysis, to identify factors that can be used to estimate age at puberty in this locally adapted breed. Monthly measurement of body weight and fortnightly measurement of scrotal circumference, chest girth, testicular length, width, thickness, and volume were recorded for each of the 10 Crioulo Lageano breed bulls, which were between 10 and 20 months old. During this period, semen samples were collected every two weeks using electro ejaculation method and analyzed physically and morphologically. The ages of the appearance of first spermatozoa in the ejaculate (FSE), the first motile spermatozoa in the ejaculate (FSEM), seminal puberty (PUB) and total detachment between glans penis and prepuce (DPP) were ascertained. Crioulo Lageano bulls reached puberty at 14.1 ± 2.0 months old with lower weight and larger testicles than those of other bovine breeds. Similarly, the period from FSEM to PUB was shorter and the period from FSE to FSEM was longer than those reported for other breeds. The most important characteristics studied in order to estimate puberty age in Crioulo Lageano bulls were the measures of testicular length, width, and volume. These parameters can be used as criteria to select young bulls as sires.(AU)

IDENTIFICATION OF STRUCTURAL VARIANTS AND SELECTION SIGNATURES IN CATTLE

Devido aos impactos causados na produção animal recorrentes das mudanças climáticas, é importante caracterizar o genoma bovino para desvendar os mecanismos genéticos envolvidos na variação fenotípica que foram influenciados pelo ambiente e moldados pela seleção natural. O objetivo deste estudo é descrever os principais efeitos da adaptação e seleção em animais zebuínos e taurinos localmente adaptadas através da identificação de variações estruturais e assinaturas de seleção utilizando dados genotípicos e de sequenciamento de genoma inteiro. No capítulo 2, foram utilizados genótipos imputados (n=735.044 marcadores) de 9,386 animais da raça Nellore e de suas respectivas linhagens a fim de estimar a autozigosidade do genoma baseado nas corridas de homozigose (ROH) por meio do software Plink. Em geral, os coeficientes de endogamia baseados em ROH (FROH) não foram altos, com valores próximos a 2%. As ilhas de autozigosidade foram evidentes em todo o genoma e sua localização não diferiu em grande número dentro das linhagens. Termos enriquecidos (p<0,01) dentro das ilhas de autozigosidade sugeriam uma forte seleção para características relacionadas à resposta imune, podendo explicar uma maior adaptabilidade do gado zebuíno em ambientes severos. O capítulo 3 visou avaliar a autozigosidade de todo o genoma para explorar regiões ricas em ROH que poderiam melhor caracterizar os diferentes tipos biológicos (produtivo ou adaptativo) do gado de corte composto Montana Tropical®. Animais Montana (n=1.436) foram genotipados com o GGP-LD BeadChip (n=30.105 marcadores) e os ROH foram identificados em cada indivíduo usando o software Plink. O número de ilhas de autozigosidade não diferiu consideravelmente entre os tipos biológicos e não foi encontrado nenhum termo enriquecido significativo (p<0,05) compartilhado entre eles. Termos enriquecidos associados à resposta imunológica e homeostase foram descritos para o tipo biológico adaptativo, enquanto aqueles ligados ao sistema imunológico, bem como às funções reprodutivas e produtivas, foram identificados para o tipo biológico produtivo. No capítulo 4, quatro métodos estatísticos foram implementados para detectar regiões genômicas sob pressão seletiva usando dados de sequenciamento de genoma inteiro (~12.4 X) de bovinos das raças Gir (GIR, n=13), Caracu Caldeano (CAR, n=12), Crioulo Lageano (CRL, n=12) e Pantaneiro (PAN, n=12). As estatísticas dentro de população (CLR e iHS) e entre populações (FST e XPEHH) foram combinadas separadamente em um único valor por meio do método de-correlated composite of multiple signals (DCMS). As regiões de varredura seletiva foram identificadas por meio dos valores do limite superior (1%) da distribuição empírica gerada por cada estatística DCMS. As assinaturas de seleção identificadas forneceram uma percepção abrangente de genes candidatos juntamente com QTLs relacionadas a características produtivas e de adaptação ao ambiente hostil no qual estas raças foram expostas. No capítulo 5, o método de leitura baseada em read-depth implementado no software CNVnator foi utilizado para identificar variações no número de cópias (CNVs) utilizando dados de sequenciamento de genoma inteiro (~14.07 X) de bovinos das raças CAR (n=12), CRL (n=12) e PAN (n=12). Regiões de CNV (CNVRs) foram identificadas sobrepondo as CNVs individuais dentro de cada raça. A anotação funcional das CNVRs revelou variantes com elevada consequência na sequência proteica abrangendo genes fortemente associados a resiliência ambiental, dentre os quais podemos destacar o BOLA-DQB, BOLA-DQA5, CD1A, -defensins, PRG3 e ULBP21. A análise de enriquecimento funcional utilizando os genes prospectados nas CNVRs também revelou termos significativos (p<0.01) fortemente associados à imunidade e resistência do gado a ambientes severos. Nossos resultados elucidaram os mecanismos biológicos inerentes as raças bovinas aqui estudadas, fornecendo informações a respeito de genes candidatos e regiões genômicas que abrangem características adaptativas relevantes, bem como informações úteis para futuras abordagens de conservação, estudos de associação ou seleção.

Given the impacts caused by climate change upon livestock production, it is important to characterize the cattle genome to unravel the genetic mechanisms underlying phenotypic variation that were influenced by the environment and shaped by natural selection that allowed them to thrive in distinct ecosystems. Therefore, the objective of this study is to describe the main effects of adaptation and selection in indicine and locally adapted taurine cattle breeds through the identification of structural variants and signatures of selection using genotypic and whole-genome re-sequencing data. In chapter 2, imputed genotypes (n=735,044 markers) were used to assess genome-wide autozygosity based on runs of homozygosity (ROH) in 9,386 Nellore animals and its lineages using the Plink software. Overall, inbreeding coefficients based on ROH (FROH) were not high, with values close to 2%. Autozygosity islands were evident across the genome, and their genomic location did not largely differ within lineages. Enriched terms (p<0.01) within the autozygosity islands suggested a strong selection for immune response-related traits and might explain the greater adaptability of the indicine cattle in harsh environments. Chapter 3 aimed to assess genome-wide autozygosity to explore ROH hotspot regions which could better characterize the different biological types (productive or adaptive) within the composite Montana Tropical® beef cattle. Montana animals (n=1,436) were genotyped with the GGP-LD BeadChip (n=30,105 markers), and ROH were identified in every individual using the Plink software. The number of autozygosity islands did not differ considerably between biological types, and no significant enriched term (p<0.05) was found to be shared between them. Enriched terms associated with the immune response and homeostasis were described for the adaptive biological type, while those linked to the immune system as well as with reproductive and productive functions we identified for the productive biological type. In chapter 4, four statistical methods were implemented to detect genomic regions under selective pressure using whole-genome re-sequencing data from Gir (GIR, n=13), Caracu Caldeano (CAR, n=12), Crioulo Lageano (CRL, n=12), and Pantaneiro (PAN, n=12) cattle breeds. Within-population (CLR and iHS) and cross-population statistics (FST and XPEHH) were combined separately in a single score using the de-correlated composite of multiple signals (DCMS) method, and putative sweep regions were revealed by assessing the top 1% of the empirical distribution generated by each DCMS statistic. The signatures of selection identified herein provided a comprehensive set of putative candidate genes together with QTLs disclosing cattle production traits and adaptation to the challenging environment in which these breeds have been exposed. In chapter 5, the read depth-based method implemented in CNVnator was used for copy number variants (CNV) calling on re sequenced data (~14.07 X) from CAR (n=12), CRL (n=12), and PAN (n=12) cattle breeds. CNV regions (CNVRs) were identified by overlapping individual CNVs within each breed. The functional annotation of the CNVRs revealed variants with high consequence on protein sequence harboring relevant genes with functions strongly linked to environmental resilience (i.e., BOLA-DQB, BOLA-DQA5, CD1A, -defensins, PRG3, and ULBP21). Enrichment analysis based on the gene list retrieved from the CNVRs also disclosed over-represented terms (p<0.01) greatly associated with immunity and cattle resistance to harsh environments. Our findings improve the knowledge about the genome biology of such cattle breeds and provide candidate genes and genomic regions encompassing relevant traits as well as useful information for future conservation, association, or selection approaches.

Comparison between the conventional and automated systems for frozen cooled equine semen

This study aims to compare the efficiency of the automated system (controlled-rate freezer) and the conventional system (manual system) for freezing the equine semen after cooling at 16oC. The parameters evaluated were: motility, strength, plasmatic and acrosomal membrane integrity of spermatozoa from twelve stallions. Ejaculates from stallions were collected three times per week, during four weeks. Gel-free semen was diluted in skim milk extender and cooled at 16ºC for 24 h. After cooling, extended semen was centrifuged at 600 x g for 10 min. The supernatant was removed and sperm pellets were re-suspended using the freezing extender. Samples were then packed into 0.5 ml straws, which were divided into two parts: one for cryopreservation in a controlled-rate freezer (CR) and the other for a manual system (MS). In this study, CR showed higher values for motility (44.6%), viability (57.9%) and plasmatic membrane integrity (29.3%) when compared with MS (20, 35.7 and 5.1%), (P < 0.05), respectively, after 24 h of cooling at 16ºC. The automated system for cryopreservation of cooled semen at 16°C for 24 h was more efficient, with higher values of motility, viability and plasmatic membrane integrity when compared with the manual system.

Comparison between the conventional and automated systems for frozen cooled equine semen

This study aims to compare the efficiency of the automated system (controlled-rate freezer) and the conventional system (manual system) for freezing the equine semen after cooling at 16oC. The parameters evaluated were: motility, strength, plasmatic and acrosomal membrane integrity of spermatozoa from twelve stallions. Ejaculates from stallions were collected three times per week, during four weeks. Gel-free semen was diluted in skim milk extender and cooled at 16ºC for 24 h. After cooling, extended semen was centrifuged at 600 x g for 10 min. The supernatant was removed and sperm pellets were re-suspended using the freezing extender. Samples were then packed into 0.5 ml straws, which were divided into two parts: one for cryopreservation in a controlled-rate freezer (CR) and the other for a manual system (MS). In this study, CR showed higher values for motility (44.6%), viability (57.9%) and plasmatic membrane integrity (29.3%) when compared with MS (20, 35.7 and 5.1%), (P < 0.05), respectively, after 24 h of cooling at 16ºC. The automated system for cryopreservation of cooled semen at 16°C for 24 h was more efficient, with higher values of motility, viability and plasmatic membrane integrity when compared with the manual system.(AU)

ETOLOGIA DO CUIDADO PARENTAL EM VACAS DA RAÇA PANTANEIRA

A população de bovinos pantaneiros foi originada por meio do cruzamento de raças autóctones espanholas e portuguesas, trazidas durante a colonização da planície pantaneira, na América do Sul. A seleção natural desses animais ocorreu em ambiente de alta temperatura, alagamentos intermitentes e pastagens com valor nutritivo variável ao longo do ano. Essa adaptação ao Pantanal também foi essencial para tornar os animais resistentes a parasitas e aptos a se protegerem de predadores. Até o início do século XX, o rebanho pantaneiro prosperou com milhões de cabeças pastoreando livremente na planície. Todavia, com a introdução de raças modernas, especialmente zebuínas, o gado pantaneiro foi lentamente sendo substituído, restando, atualmente, apenas algumas centenas de animais. Devido ao risco de extinção, é necessário recorrer às ferramentas que possibilitam a conservação dessa raça, sendo, uma delas, o estudo do comportamento animal. A etologia animal possui ramificações que são interligadas entre o animal e o ambiente externo. Nesse caso, este trabalho buscou avaliar o comportamento materno a fim de identificar os cuidados que a mãe tem com sua cria e, com isso, garantir o sucesso no desempenho e sobrevivência do bezerro. Também buscou verificar se existe, no gado pantaneiro, comportamento alo parental ou alo amamentação, ou seja, quando outros indivíduos participam dos cuidados da mãe ou substituem-nos para com sua cria. Sabe-se que a sobrevivência do bezerro ainda pode ser avaliada por meio do seu comportamento ingestivo, devido à fase de transição do neonato até o desenvolvimento dos compartimentos do estômago, de forma a torná-lo um ruminante funcional. Para as vacas, as alterações metabólicas no pós-parto e produção de leite refletem no comportamento ingestivo. Nesse contexto, esta pesquisa inédita objetivou efetuar avaliações etológicas de modo a servir como uma ferramenta para auxiliar na conservação da raça pantaneira e aprimorar os conhecimentos sobre o comportamento materno entre as vacas com suas crias, bem como da alo-amamentação e as respectivas condutas ingestivas de vacas e bezerros durante o período de aleitamento.

The pantaneiro cattle is a cross between Spanish and Portuguese autochthonous breeds, which were brought during the colonization of the Pantanal plain, in South America. The natural selection of these animals occurred in a high temperature environment, intermittent flooding and pastures with variable nutritional value throughout the year. This adaptation to the Pantanal was also essential to make the animals resistant to parasites and able to protect themselves from predators. Until the beginning of the 20th century, the Pantanal herd thrived with millions of cattle freely grazing on the plain. However, with the introduction of modern breeds, especially the Zebu, the pantaneiro cattle were slowly being replaced, with only a few hundred animals left today. Due to the risk of extinction, it is necessary to use tools that enable the conservation of the aforementioned breed, one of which is the study of animal behavior. Animal ethology has ramifications that are interconnected between the animal and the external environment. In this case, this paper aims to evaluate the maternal behavior in order to identify the care that the mother provides her offspring with and, with this, guarantee success in the performance and survival of the calf. It also intends to verify whether, in the pantaneiro cattle, there is alloparental behavior or allosuckling, that is, when other individuals participate in the mother's care or replace the mother's care for her young. It is known that the calf's survival can still be assessed through its ingestive behavior, due to the newborn's transition phase until the development of the stomach compartments, so that it becomes a functional ruminant. For cows, metabolic changes in the postpartum and milk production are reflected on ingestive behavior. In this context, this unprecedented research aims to carry out ethological assessments in order to serve as a tool to assist in the conservation of the Pantanal breed and to improve knowledge about maternal behavior between cows and their calves, as well as allosuckling and respective ingestive behavior of cows and calves during the lactation period.

Physiological variables of equines remaining of the Nordestino Horse breed used in cattle handling / Variáveis fisiológicas de equinos remanescentes do Cavalo Nordestino durante a pega de boi

The aim of this study was to analyse the physiological parameters of horses remnants of the Nordestino Horse breedused in cattle handling in the caatinga bioma,  before and after the working activity. 16  castrated males were used. The animals were evaluated in two stages: At the begin and after the cattle handling. Heart rate, respiratory rate, skin temperature on the rump, side, scapula, neck and mean surface temperature were verified. The experimental design was a completely randomized with two treatments and 16 replications, and the values were submitted to analysis of variance and mean test (Tukey at 5% probability). Except for respiratory frequency and surface temperature of the rump, there was no statistical difference (P 0.05), in all the other variables, which increased its average value after performing the cattle handling. The Nordestino Horse breed showed to be well adapted to cattle handling in the caatinga bioma.(AU)

O objetivo desse estudo foi verificar parâmetros fisiológicos de equinos remanescentes do Cavalo Nordestino usados em pega de bois na Caatinga. Foram utilizados 16 machos castrados. Os animais foram avaliados em dois momentos: Antes do trabalho de busca da rês na caatinga e logo após a ação ter sido concluída. Foram verificadas afrequência cardíaca, respiratória, temperatura superficial na garupa, costado, paleta e pescoço e temperatura superficial média. O delineamento experimental foi um DIC, com dois tratamentos e 16 repetições, sendo os dados submetidos a uma análise de variância e teste de médias (Tukey a 5% de probabilidade). Com exceção da frequência respiratória e da temperatura superficial da garupa, observou-se diferença estatística (P<0,05) em todas as demais variáveis, que aumentaram seu valor médio após a realização do trabalho de campo. Os animais remanescentes do Cavalo Nordestinomostraram-se bem adaptados ao trabalho de lida com o gado na caatinga. (AU)

Physiological variables of equines remaining of the Nordestino Horse breed used in cattle handling / Variáveis fisiológicas de equinos remanescentes do Cavalo Nordestino durante a pega de boi

The aim of this study was to analyse the physiological parameters of horses remnants of the Nordestino Horse breedused in cattle handling in the caatinga bioma,  before and after the working activity. 16  castrated males were used. The animals were evaluated in two stages: At the begin and after the cattle handling. Heart rate, respiratory rate, skin temperature on the rump, side, scapula, neck and mean surface temperature were verified. The experimental design was a completely randomized with two treatments and 16 replications, and the values were submitted to analysis of variance and mean test (Tukey at 5% probability). Except for respiratory frequency and surface temperature of the rump, there was no statistical difference (P 0.05), in all the other variables, which increased its average value after performing the cattle handling. The Nordestino Horse breed showed to be well adapted to cattle handling in the caatinga bioma.

O objetivo desse estudo foi verificar parâmetros fisiológicos de equinos remanescentes do Cavalo Nordestino usados em pega de bois na Caatinga. Foram utilizados 16 machos castrados. Os animais foram avaliados em dois momentos: Antes do trabalho de busca da rês na caatinga e logo após a ação ter sido concluída. Foram verificadas afrequência cardíaca, respiratória, temperatura superficial na garupa, costado, paleta e pescoço e temperatura superficial média. O delineamento experimental foi um DIC, com dois tratamentos e 16 repetições, sendo os dados submetidos a uma análise de variância e teste de médias (Tukey a 5% de probabilidade). Com exceção da frequência respiratória e da temperatura superficial da garupa, observou-se diferença estatística (P<0,05) em todas as demais variáveis, que aumentaram seu valor médio após a realização do trabalho de campo. Os animais remanescentes do Cavalo Nordestinomostraram-se bem adaptados ao trabalho de lida com o gado na caatinga.

DESEMPENHO ZOOTÉCNICO E QUALIDADE DE CARNE DE NOVILHAS NELORE E NELORES X ANGUS RECRIADAS EM DIFERENTES SISTEMAS DE INTEGRAÇÃO LAVOURA-PECUÁRIA CONSORCIADOS COM GUANDU.

Estratégias como a Integração lavoura-pecuária (ILP) tem sido adotadas nos sistemas de produção buscando potencializar a capacidade produtiva da atividade pecuária nas áreas atualmente exploradas, maximizando a eficiência de uso da terra. O sucesso dessa solução tecnológica no âmbito pecuário depende de vários fatores, dentre eles está o uso de recursos genéticos adequados, além do manejo e planejamento nutricional nos diferentes períodos do ano. Neste sentido, é importante avaliar a qualidade do produto final mesmo que esse não esteja vinculado diretamente a rentabilidade, pois com a maior concorrência e o aumento da exigência do mercado, este fator pode ser decisivo para a comercialização do produto. Assim, este trabalho teve como objetivo avaliar o desempenho produtivo e as características de carcaça e da carne de novilhas Nelore e Nelore x Angus (F1) recriadas em dois sistemas de produção de forragem (um com Integração Lavoura-Pecuária, denominado alto investimento, e outro em sistema pecuário exclusivo, denominado de baixo investimento). Dentro de cada sistema foram avaliados três tratamentos diferentes, envolvendo o consórcio com Guandu (Cajanus cajan) em ambos sistemas e o consórcio com milho (Zea mays) no sistema de ILP. Os animais F1 (Nelore x Angus) foram superiores aos animais Nelore para peso de carcaça, rendimento e ganhos de peso. Os animais F1 apresentaram superioridade quanto às características de carcaça e qualidade da carne em relação ao Nelore. Os tratamentos de alto investimento resultaram em maiores pesos de carcaça, ganho total e ganho a pasto. Os sistemas integrados proporcionaram maior produtividade e qualidade de carne. Dentro dos tratamentos do sistema de baixo investimento, o consórcio com Guandu apresentou maior produtividade por área. Conclui-se que o Guandu é uma boa opção de leguminosa forrageira para os sistemas de produção pecuária tendo resultados positivos em ambos os sistemas de produção de forragem. Os animais F1 são um importante recurso genético para o aumento da produtividade do sistema.

Strategies as crop livestock integration (CLI) has been adopted in production systems aiming to enhance the productivity capacity of livestock in the previous explored areas, maximizing the land use efficiency. The success of this technological solution on livestock depends on many factors, as use of adequate genetic resource, management and nutritional planning according to the seasons of the year. Therefore, it is important to evaluate the quality of final product even it is not direct related to economic yield, because this can be a decisive factor to commercialization in a more competitive and demanding market. So, this work aimed to evaluate the production performance and meat and carcass traits of Nellore and Nellore x Angus (F1) heifers reared in two forage production systems (one with crop livestock integration, named as high input, and other as sole livestock system, named as low input). Inside each system, three different treatments were evaluated, involving intercropping with Pigeon pea (Cajanus cajan) in both systems, and intercropping with corn (Zea mays) in CLI system. The F1 animals had higher carcass weight, yield and body weight gain than Nellore animals. F1 animals showed better carcass and meat quality traits compared to Nellore. The high input systems showed higher carcass weights and body weight gains. The integrated systems proportionated higher yield and meat quality. Inside both forage production systems, the intercropping with pigeon pea proportionated higher yield per area. In conclusion, the pigeon pea is an interesting leguminous forage option to livestock production systems, showing positive results in both forage production systems. The F1 animals are an important genetic resource for enhancing the system productivity.

Banco Brasileiro de Germoplasma Animal: desafios e perspectivas da conservação de caprinos no Brasil / Brazilian Animal Gene Bank: challenges and perspectives of caprine conservation in Brazil

Em um cenário que aponta para mudanças climáticas globais, a conservação de recursos genéticos animais voltada a raças localmente adaptadas aos diferentes biomas brasileiros tem ganhado importância. Neste contexto, estratégias de conservação in situ e ex situ vêm sendo utilizadas para assegurar a variabilidade genética de caprinos das raças Azul, Canindé, Marota, Moxotó, Nambi e Repartida. Dentre as estratégias de conservação ex situ, está a criopreservação de sêmen e embriões caprinos para o enriquecimento de bancos de germoplasma que visam à conservação a longo prazo. O objetivo deste trabalho foi discutir aspectos importantes da conservação dos recursos genéticos animais, abordando estratégias de enriquecimento do Banco Brasileiro de Germoplasma Animal com sêmen e embriões caprinos e destacando desafios e perspectivas da conservação de raças localmente adaptadas aos biomas brasileiros.(AU)

In a scenario that indicate to global climate changes, animal genetic resources conservation focused on local breeds adapted to different biomes has increase importance. In this context, strategies for In situ and Ex situ conservation has been used to ensure the genetic diversity of goat breeds Azul, Canindé, Marota, Moxotó, Nambi e Repartida. Among the Ex situ conservation strategies is the cryopreservation of ovine semen and embryos to the enrichment of gene banks aiming at long-term conservation. The purpose of this paper was to discuss important aspects of the animal genetic resources conservation, approaching strategies for enrichment of Brazilian Animal Gene Bank with goat semen and embryos and highlighting challenges and perspectives for conservation of locally adapted breeds to brazilian biomes.(AU)

VARIABILIDADE GENÉTICA E CARACTERIZAÇÃO MORFOLÓGICA, PRODUTIVA E QUALITATIVA DE ACESSOS DE DESMANTHUS SPP.

Estudos de variabilidade genética de plantas forrageiras são importantes para conservação de seus recursos. Objetivou-se estudar a variabilidade genética, através da técnica de polimorfismo de comprimento de fragmentos amplificados (AFLP) de acessos de Desmanthus spp. Foram utilizadas sementes de quatro acessos de Desmanthus pernambucanus (43F, 89F, 100C e 7G), provenientes do banco de germoplasma da UFRPE, em Serra Talhada-PE, e um acesso Desmanthus pubescens (AusTRC), proveniente da Embrapa Tabuleiros Costeiros - Sergipe. Das 38 combinações de iniciadores testadas para caracterizar cinco indivíduos do gênero, 32 combinações amplificaram 707 fragmentos, dos quais 436 (62%) foram polimórficos e 271 (38%) monomórficos, evidenciando a grande variabilidade existente entre os acessos avaliados. A matriz de distância genética de NEI (1978), revelou que os acessos 89F e AusTRC pertencentes a espécies distintas e oriundos de locais diferentes, Bom Jardim e Saint Croix (EUA), respectivamente, apresentaram menor distância genética (33,5%). Acessos 43F e 100C pertencentes à mesma espécie oriundas dos municípios de Bom Jardim e Sertânia, respectivamente, apresentam maior distância genética (57%). Os acessos mais próximos geograficamente (43F e 89F) e pertencentes à espécie de D. pernambucanus apresentam alta distância genética (0,6303), o que está associada a uma variação intraespecífica. O conhecimento da variabilidade genética, apresentada pelos acessos 7G, 100C, 89F, 43F e AusTRC através do alto polimorfismo, evidencia a eficiência da técnica de AFLP em espécies de Desmanthus spp., trazendo uma contribuição útil para futuros estudos de programa de cruzamentos e confirma a importância da conservação desses genes.

Forage genetic variability studies are important for the conservation of these resources. The objective was to study the genetic variability through amplified fragment length polymorphism (AFLP), of Desmanthus pernabucanus (43F, 89F, 100C, and 7G) from the UFRPE germplasm bank in Serra Talhada-PE, and Desmanthus pubescens AusTRC, from Embrapa Tabuleiros Costeiros Sergipe. Of the 38 primers tested, 32 combinations amplified 707 fragments, of which 436 (62%) were polymorphic and 271 (38%) monomorphic, indicating a wide variability among the five accessions. NEI genetic distance matrix indicated that 89F and AusTRC, distinct species collected from different locations (Bom Jardim and Saint Croix, USA, respectively), had less genetic distance (33.5%) compared to 43F and 100C belonging to D. pernambucanus but collected in Bom Jardim and Sertânia, with 57% distance. The geographically closest D. pernambucanus accessions, 43F and 89F, had the greatest genetic distance (63%). Understanding the genetic variability among these accessions from the polymorphism provides a basis for future breeding programs and confirms the importance of the conservation of these genes.

Banco Brasileiro de Germoplasma Animal: desafios e perspectivas da conservação de caprinos no Brasil / Brazilian Animal Gene Bank: challenges and perspectives of caprine conservation in Brazil

Em um cenário que aponta para mudanças climáticas globais, a conservação de recursos genéticos animais voltada a raças localmente adaptadas aos diferentes biomas brasileiros tem ganhado importância. Neste contexto, estratégias de conservação in situ e ex situ vêm sendo utilizadas para assegurar a variabilidade genética de caprinos das raças Azul, Canindé, Marota, Moxotó, Nambi e Repartida. Dentre as estratégias de conservação ex situ, está a criopreservação de sêmen e embriões caprinos para o enriquecimento de bancos de germoplasma que visam à conservação a longo prazo. O objetivo deste trabalho foi discutir aspectos importantes da conservação dos recursos genéticos animais, abordando estratégias de enriquecimento do Banco Brasileiro de Germoplasma Animal com sêmen e embriões caprinos e destacando desafios e perspectivas da conservação de raças localmente adaptadas aos biomas brasileiros.

In a scenario that indicate to global climate changes, animal genetic resources conservation focused on local breeds adapted to different biomes has increase importance. In this context, strategies for In situ and Ex situ conservation has been used to ensure the genetic diversity of goat breeds Azul, Canindé, Marota, Moxotó, Nambi e Repartida. Among the Ex situ conservation strategies is the cryopreservation of ovine semen and embryos to the enrichment of gene banks aiming at long-term conservation. The purpose of this paper was to discuss important aspects of the animal genetic resources conservation, approaching strategies for enrichment of Brazilian Animal Gene Bank with goat semen and embryos and highlighting challenges and perspectives for conservation of locally adapted breeds to brazilian biomes.

Genetic divergence among Dimorphandra spp. accessions using RAPD markers

The genus Dimorphandra has distinguish relevance considering either medicinal or biodiversity aspects because it includes two species that are economically important flavonoids sources for pharmachemical industry (D. mollis Benth. and D. gardneriana Tul.), and species endemic to Brazil, such as D. jorgei Silva and D. wilsonii Rizz., threatened by extinction. In order to evaluate variability among accessions of D. mollis (fava-d'anta), D. gardneriana and D. wilsonii, it was collected fruit from individual plants from three Brazilian states in a total of 57 accessions, which were analyzed with RAPD markers. It was used 20 seeds per progeny; the DNA was extracted from fully-formed young leaves, which were collected in bulk. The data were analyzed using a binary matrix, in which the score one represented presence of a band and zero, absence. The similarity matrix was developed by using the arithmetic complement of the Jaccard index, later grouped based on the Neighbor Joining algorithm. It was found considerable intra and inter specific variability in Dimorphandra spp., which were separated into four groups. Though genetic variability was found, the collecting trips showed that most of these areas are subject to loss of genetic resources of fava-d'anta due to the following factors: continuous anthropic activity, propensity for natural fires, and loss of natural seed dispersers (large fruit-eating mammals). Therefore, protections of these areas and ex situ conservation are essentials for the maintenance of genetic variability of these species.

O gênero Dimorphandra tem grande relevância, sobretudo nos aspectos medicinais e de biodiversidade, por incluir duas espécies que são importantes economicamente como fontes de flavonoides para indústria farmacoquímica (D. mollis Benth. e D. gardneriana Tull.), e espécies endêmicas do Brasil, como a D. jorgei Silva e D. wilsonii Rizz., sendo esta ameaçada de extinção. Objetivando avaliar a variabilidade entre acessos de D. mollis, D. gardneriana e D. wilsonii, foram realizadas coletas de frutos separados por planta em três estados brasileiros em um total de 57 acessos que foram analisados por meio da técnica RAPD. Utilizaram-se vinte sementes por progênie e o DNA, extraído de folhas definitivas, jovens, e coletadas em bulk. Os dados foram analisados utilizando-se uma matriz de dados binários. Para formação da matriz de dissimilaridade, foi utilizado o complemento aritmético do Índice de Jaccard e posteriormente o agrupamento pelo algoritmo de Neighbor Joining. O estudo revelou que existe variabilidade entre e dentro das espécies de Dimorphandra spp., o qual formou quatro grupos. Apesar da variabilidade genética constatada, as expedições de coleta demonstraram que a maioria das áreas amostradas está sujeita a perdas de recursos genéticos de fava-d'anta devido aos seguintes fatores: ocorrência de ação antrópica contínua; propensão a incêndios naturais; e diminuição dos dispersores naturais de sementes (grandes mamíferos frugíveros). Assim, a proteção destas áreas e a conservação ex situ, são primordiais para manutenção da variabilidade genética dessas espécies.

Genetic divergence among Dimorphandra spp. accessions using RAPD markers

The genus Dimorphandra has distinguish relevance considering either medicinal or biodiversity aspects because it includes two species that are economically important flavonoids sources for pharmachemical industry (D. mollis Benth. and D. gardneriana Tul.), and species endemic to Brazil, such as D. jorgei Silva and D. wilsonii Rizz., threatened by extinction. In order to evaluate variability among accessions of D. mollis (fava-d'anta), D. gardneriana and D. wilsonii, it was collected fruit from individual plants from three Brazilian states in a total of 57 accessions, which were analyzed with RAPD markers. It was used 20 seeds per progeny; the DNA was extracted from fully-formed young leaves, which were collected in bulk. The data were analyzed using a binary matrix, in which the score one represented presence of a band and zero, absence. The similarity matrix was developed by using the arithmetic complement of the Jaccard index, later grouped based on the Neighbor Joining algorithm. It was found considerable intra and inter specific variability in Dimorphandra spp., which were separated into four groups. Though genetic variability was found, the collecting trips showed that most of these areas are subject to loss of genetic resources of fava-d'anta due to the following factors: continuous anthropic activity, propensity for natural fires, and loss of natural seed dispersers (large fruit-eating mammals). Therefore, protections of these areas and ex situ conservation are essentials for the maintenance of genetic variability of these species.

O gênero Dimorphandra tem grande relevância, sobretudo nos aspectos medicinais e de biodiversidade, por incluir duas espécies que são importantes economicamente como fontes de flavonoides para indústria farmacoquímica (D. mollis Benth. e D. gardneriana Tull.), e espécies endêmicas do Brasil, como a D. jorgei Silva e D. wilsonii Rizz., sendo esta ameaçada de extinção. Objetivando avaliar a variabilidade entre acessos de D. mollis, D. gardneriana e D. wilsonii, foram realizadas coletas de frutos separados por planta em três estados brasileiros em um total de 57 acessos que foram analisados por meio da técnica RAPD. Utilizaram-se vinte sementes por progênie e o DNA, extraído de folhas definitivas, jovens, e coletadas em bulk. Os dados foram analisados utilizando-se uma matriz de dados binários. Para formação da matriz de dissimilaridade, foi utilizado o complemento aritmético do Índice de Jaccard e posteriormente o agrupamento pelo algoritmo de Neighbor Joining. O estudo revelou que existe variabilidade entre e dentro das espécies de Dimorphandra spp., o qual formou quatro grupos. Apesar da variabilidade genética constatada, as expedições de coleta demonstraram que a maioria das áreas amostradas está sujeita a perdas de recursos genéticos de fava-d'anta devido aos seguintes fatores: ocorrência de ação antrópica contínua; propensão a incêndios naturais; e diminuição dos dispersores naturais de sementes (grandes mamíferos frugíveros). Assim, a proteção destas áreas e a conservação ex situ, são primordiais para manutenção da variabilidade genética dessas espécies.

Genetic divergence among Dimorphandra spp. accessions using RAPD markers

The genus Dimorphandra has distinguish relevance considering either medicinal or biodiversity aspects because it includes two species that are economically important flavonoids sources for pharmachemical industry (D. mollis Benth. and D. gardneriana Tul.), and species endemic to Brazil, such as D. jorgei Silva and D. wilsonii Rizz., threatened by extinction. In order to evaluate variability among accessions of D. mollis (fava-d'anta), D. gardneriana and D. wilsonii, it was collected fruit from individual plants from three Brazilian states in a total of 57 accessions, which were analyzed with RAPD markers. It was used 20 seeds per progeny; the DNA was extracted from fully-formed young leaves, which were collected in bulk. The data were analyzed using a binary matrix, in which the score one represented presence of a band and zero, absence. The similarity matrix was developed by using the arithmetic complement of the Jaccard index, later grouped based on the Neighbor Joining algorithm. It was found considerable intra and inter specific variability in Dimorphandra spp., which were separated into four groups. Though genetic variability was found, the collecting trips showed that most of these areas are subject to loss of genetic resources of fava-d'anta due to the following factors: continuous anthropic activity, propensity for natural fires, and loss of natural seed dispersers (large fruit-eating mammals). Therefore, protections of these areas and ex situ conservation are essentials for the maintenance of genetic variability of these species.

O gênero Dimorphandra tem grande relevância, sobretudo nos aspectos medicinais e de biodiversidade, por incluir duas espécies que são importantes economicamente como fontes de flavonoides para indústria farmacoquímica (D. mollis Benth. e D. gardneriana Tull.), e espécies endêmicas do Brasil, como a D. jorgei Silva e D. wilsonii Rizz., sendo esta ameaçada de extinção. Objetivando avaliar a variabilidade entre acessos de D. mollis, D. gardneriana e D. wilsonii, foram realizadas coletas de frutos separados por planta em três estados brasileiros em um total de 57 acessos que foram analisados por meio da técnica RAPD. Utilizaram-se vinte sementes por progênie e o DNA, extraído de folhas definitivas, jovens, e coletadas em bulk. Os dados foram analisados utilizando-se uma matriz de dados binários. Para formação da matriz de dissimilaridade, foi utilizado o complemento aritmético do Índice de Jaccard e posteriormente o agrupamento pelo algoritmo de Neighbor Joining. O estudo revelou que existe variabilidade entre e dentro das espécies de Dimorphandra spp., o qual formou quatro grupos. Apesar da variabilidade genética constatada, as expedições de coleta demonstraram que a maioria das áreas amostradas está sujeita a perdas de recursos genéticos de fava-d'anta devido aos seguintes fatores: ocorrência de ação antrópica contínua; propensão a incêndios naturais; e diminuição dos dispersores naturais de sementes (grandes mamíferos frugíveros). Assim, a proteção destas áreas e a conservação ex situ, são primordiais para manutenção da variabilidade genética dessas espécies.

Distribuição da diversidade isoenzimática e morfológica da mandioca na agricultura autóctone de Ubatuba

Phenotypic diversity of four isozymes systems and twelve morphological traits of cassava (Manihot esculenta Crantz) were quantified using the Shannon-Weaver diversity index for four cassava gardens of two traditional farmers of Ubatuba,SP, Brazil. The total diversity was partitioned within and among gardens, showing that most of the diversity is concentrated within gardens. Interviews were carried out in order to verify if farmers recognize the existance of cassava plants originated from seeds and seed banks with the surveyed farmers in order to identify, in the present case, mechanisms of genetic diversity amplification.

A diversidade fenotípica de quatro sistemas isoenzimáticos e doze caracteres morfológicos em mandioca (Manihot esculenta Crantz) foi quantificada através do índice de Shannon-Weaver para quatro roças de mandioca pertencentes a dois agricultores autóctones no município de Ubatuba-SP. A diversidade total foi repartida entre diversidade dentro de roças e diversidade entre roças, mostrando que a maior parte da diversidade se concentra dentro de roças para a maioria dos caracteres. Entrevistas foram realizadas para verificar se os agricultores reconhecem a existência de plantas de mandioca originadas por semente e a existência de bancos de semente.

Distribuição da diversidade isoenzimática e morfológica da mandioca na agricultura autóctone de Ubatuba

Phenotypic diversity of four isozymes systems and twelve morphological traits of cassava (Manihot esculenta Crantz) were quantified using the Shannon-Weaver diversity index for four cassava gardens of two traditional farmers of Ubatuba,SP, Brazil. The total diversity was partitioned within and among gardens, showing that most of the diversity is concentrated within gardens. Interviews were carried out in order to verify if farmers recognize the existance of cassava plants originated from seeds and seed banks with the surveyed farmers in order to identify, in the present case, mechanisms of genetic diversity amplification.

A diversidade fenotípica de quatro sistemas isoenzimáticos e doze caracteres morfológicos em mandioca (Manihot esculenta Crantz) foi quantificada através do índice de Shannon-Weaver para quatro roças de mandioca pertencentes a dois agricultores autóctones no município de Ubatuba-SP. A diversidade total foi repartida entre diversidade dentro de roças e diversidade entre roças, mostrando que a maior parte da diversidade se concentra dentro de roças para a maioria dos caracteres. Entrevistas foram realizadas para verificar se os agricultores reconhecem a existência de plantas de mandioca originadas por semente e a existência de bancos de semente.