Real-time polymerase chain reaction for detection and enumeration of Staphylococcus aureus and Streptococccus agalactiae using different milk samplings

The objective of the present study was to evaluate the qPCR for detection and enumeration of Staphylococcus aureus and Streptococcus agalactiae using different milk samplings in comparison to the conventional microbiology. Four dairy herds with a history of subclinical mastitis caused by S. aureus and S. agalactiae were selected. Sampling approach included milk samples from bulk tank (BT), cow level (composite samples, CO), and mammary quarter level (MQ) from 785 lactating cows. Three consecutive monthly milk samplings were carried out, totaling 3347 MQ milk samples, 912 CO, and 12 from BT. All collected milk samples were subjected to conventional microbiology and qPCR for detection and enumeration of S. aureus and S. agalactiae. The qPCR showed 71.5% of diagnostic sensitivity for S. aureus isolated from MQ milk samples, 71.8% for CO, and 50% for BT milk samples compared with conventional microbiology methodology. Taken together, the diagnostic sensitivity for S. agalactiae isolated from MQ milk samples was 90.2, 87.7 for CO, and 90.9% for BT milk samples. In general, the qPCR methodology enabled the detection of S. aureus and S. agalactiae, regardless of the type of milk sampling. The direct use of milk samples to estimate the counting of S. aureus by qPCR demonstrated lower sensitivity than the counting of S. agalactiae, which can be explained by the pathogen infection dynamics and differences in milk sample type.

Sporothrix brasiliensis infecting cats in northeastern Brazil: New emerging areas in Paraíba state / Sporothrix brasiliensis infectando felinos no nordeste do Brasil: novas áreas emergentes no estado da Paraíba

ABSTRACT: Sporotrichosis is a subcutaneous mycosis caused by fungus of the Sporothrix complex, and in Brazil the main species reported is Sporothrix brasiliensis, of which the diseased cat is the transmitter. Although, its occurrence has increased in the state of Paraíba, Brazil, since 2016, data on the disease in this state are limited. Therefore, this research aimed to identify molecularly isolates of Sporothrix spp. from domestic cats from cities in Paraíba, and in this way to expand the understanding of the disease in the state. Thirty-nine samples were analyzed, obtained from skin lesions of domestic felines, from the following cities in Paraíba: João Pessoa, Pilões, Patos, Areia, Bananeiras and Guarabira. Cytological analysis was performed to screen the samples, followed by fungal culture, and the molecular characterization of the isolates was performed, using the species-specific Polymerase Chain Reaction (PCR) or partial sequencing of the calmodulin gene. All isolates were identified as S. brasiliensis. The sequencing showed 100% similarity to the S. brasiliensis CBS 120339 strain. In view of this, it is concluded that in the study areas the species involved in cases of feline sporotrichosis is S. brasiliensis, its presence in Paraíba demonstrated the spread of the agent in regions distant from the epicenters in Brazil, alerting to the possible occurrence of zoonotic outbreaks similar to those found in the South and Southeast regions of the country. In addition, it highlights the emerging role of felines in the transmission of sporotrichosis in new endemic areas of Brazil.

RESUMO: A esporotricose é uma micose subcutânea causada por fungos do complexo Sporothrix, e no Brasil a principal espécie relatada é Sporothrix brasiliensis da qual o transmissor é o gato doente. Embora sua ocorrência tenha aumentado no estado da Paraíba, Brasil, desde 2016, os dados sobre a doença neste estado são limitados. Diante disso, esta pesquisa teve por objetivo identificar, molecularmente, isolados de Sporothrix spp. procedentes de felinos domésticos de cidades da Paraíba, e dessa maneira expandir a compreensão da enfermidade no estado. Foram analisadas 39 amostras, obtidas de lesões cutâneas de felinos domésticos, oriundos das seguintes cidades paraibanas: João Pessoa, Pilões, Patos, Areia, Bananeiras e Guarabira. Realizou-se análise citológica, para triagem das amostras, a seguir cultura fúngica, e posteriormente a caracterização molecular dos isolados, utilizando a Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), espécie-específica ou sequenciamento parcial do gene calmodulina. Todos os isolados foram identificados molecularmente como S. brasiliensis. O sequenciamento demonstrou 100% de similaridade com a cepa S. brasiliensis CBS 120339. Contudo, conclui-se que nas áreas do estudo a espécie envolvida em casos de esporotricose felina é S. brasiliensis, sua presença na Paraíba demonstra a disseminação do agente em regiões distantes dos epicentros no Brasil, alertando para a possível ocorrência de surtos zoonóticos, semelhantes aos encontrados nas regiões Sul e Sudeste do país. Além disso, destaca o papel emergente dos felinos na transmissão da esporotricose em novas áreas endêmicas do Brasil.

Pantoea ananatis in Oryza sativa in Brazil / Pantoea ananatis em Oryza sativa no Brasil

ABSTRACT: The state of Santa Catarina is the second-largest producer of rice seeds in Brazil. Research on phytopathogenicbacterias in this crop is scarce and the high frequency of panicle diseases leads to the hypothesis that seeds may be infected by bacteria. This research quantified the incidence of bacteria in the seeds, verified the bacteria viability during the storage period and characterized the associated bacteria. Seeds from the 2018/19 and 2019/20 seasons were analyzed. To check the incidence, the seeds were disinfected, plated on a nutrient agar + fungicide culture medium, and incubated for seven days at 27 °C. To assess viability, every 45 days, three cultivars stored in a processing unit were subjected to the same detection methodology. To characterize, prevalent colonies were isolated on semi-selective culture medium Pantoea genus-specific agar (PGSA), where the ones that showed growth were subjected to deoxyribonucleic acid (DNA) extraction and Polymerase Chain Reaction (PCR), DNA sequencing, and sequence comparison on GenBank. The hypersensitivity reaction (HR) in tobacco was performed using a bacterial suspension of each isolate. All seed samples had an average incidence of 83%. During storage, the seeds maintained stable bacterial viability, with an average incidence of 95% at the beginning of storage and 99% at the end of it. All isolates that grew in PGSA culture medium were identified by molecular characterization with 100% identity with two specimens of Pantoeaananatis and one of them induced RH in tobacco.

RESUMO: O estado de Santa Catarina é o segundo maior produtor de sementes de arroz do Brasil. As pesquisas com bactérias fitopatogênicas nesta cultura são escassas e a alta frequência de doenças da panícula leva à hipótese de que sementes podem estar infectadas por bactérias. O objetivo desta pesquisa foi quantificar a incidência de bactérias nas sementes, verificar a viabilidade das bactérias durante o período de armazenamento e caracterizar as bactérias associadas. Foram analisadas sementes das safras 2018/19 e 2019/20. Para verificar a incidência, as sementes foram desinfestadas, plaqueadas em meio de cultura ágar nutriente + fungicida e incubadas por sete dias a 27 °C. Para avaliar a viabilidade, a cada 45 dias, três cultivares armazenadas em uma unidade de beneficiamento foram submetidas à mesma metodologia de detecção. Para caracterizar, colônias prevalentes foram isoladas em meio de cultura semisseletivo Pantoea genus-specific ágar (PGSA), onde as que apresentaram crescimento foram submetidas à extração do ácido desoxirribonucléico (DNA) e Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), sequenciamento do DNA e comparação de sequências no GenBank. A reação de hipersensibilidade (HR) em tabaco foi realizada utilizando uma suspensão bacteriana de cada isolado. Todas as amostras de sementes apresentaram incidência média de 83%. Durante o armazenamento, as sementes mantiveram viabilidade bacteriana estável, com incidência média de 95% no início do armazenamento e 99% ao fim. Todos os isolados que cresceram no meio de cultura PGSA, foram identificados por caracterização molecular com 100% de identidade com dois espécimes de Pantoea ananatis e um deles induziu HR em tabaco.

Pantoea ananatis in Oryza sativa in Brazil / Pantoea ananatis em Oryza sativa no Brasil

The state of Santa Catarina is the second-largest producer of rice seeds in Brazil. Research on phytopathogenicbacterias in this crop is scarce and the high frequency of panicle diseases leads to the hypothesis that seeds may be infected by bacteria. This research quantified the incidence of bacteria in the seeds, verified the bacteria viability during the storage period and characterized the associated bacteria. Seeds from the 2018/19 and 2019/20 seasons were analyzed. To check the incidence, the seeds were disinfected, plated on a nutrient agar + fungicide culture medium, and incubated for seven days at 27 °C. To assess viability, every 45 days, three cultivars stored in a processing unit were subjected to the same detection methodology. To characterize, prevalent colonies were isolated on semi-selective culture medium Pantoea genus-specific agar (PGSA), where the ones that showed growth were subjected to deoxyribonucleic acid (DNA) extraction and Polymerase Chain Reaction (PCR), DNA sequencing, and sequence comparison on GenBank. The hypersensitivity reaction (HR) in tobacco was performed using a bacterial suspension of each isolate. All seed samples had an average incidence of 83%. During storage, the seeds maintained stable bacterial viability, with an average incidence of 95% at the beginning of storage and 99% at the end of it. All isolates that grew in PGSA culture medium were identified by molecular characterization with 100% identity with two specimens of Pantoeaananatis and one of them induced RH in tobacco.

O estado de Santa Catarina é o segundo maior produtor de sementes de arroz do Brasil. As pesquisas com bactérias fitopatogênicas nesta cultura são escassas e a alta frequência de doenças da panícula leva à hipótese de que sementes podem estar infectadas por bactérias. O objetivo desta pesquisa foi quantificar a incidência de bactérias nas sementes, verificar a viabilidade das bactérias durante o período de armazenamento e caracterizar as bactérias associadas. Foram analisadas sementes das safras 2018/19 e 2019/20. Para verificar a incidência, as sementes foram desinfestadas, plaqueadas em meio de cultura ágar nutriente + fungicida e incubadas por sete dias a 27 °C. Para avaliar a viabilidade, a cada 45 dias, três cultivares armazenadas em uma unidade de beneficiamento foram submetidas à mesma metodologia de detecção. Para caracterizar, colônias prevalentes foram isoladas em meio de cultura semisseletivo Pantoea genus-specific ágar (PGSA), onde as que apresentaram crescimento foram submetidas à extração do ácido desoxirribonucléico (DNA) e Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), sequenciamento do DNA e comparação de sequências no GenBank. A reação de hipersensibilidade (HR) em tabaco foi realizada utilizando uma suspensão bacteriana de cada isolado. Todas as amostras de sementes apresentaram incidência média de 83%. Durante o armazenamento, as sementes mantiveram viabilidade bacteriana estável, com incidência média de 95% no início do armazenamento e 99% ao fim. Todos os isolados que cresceram no meio de cultura PGSA, foram identificados por caracterização molecular com 100% de identidade com dois espécimes de Pantoea ananatis e um deles induziu HR em tabaco.

Sporothrix brasiliensis infecting cats in northeastern Brazil: New emerging areas in Paraíba state / Sporothrix brasiliensis infectando felinos no nordeste do Brasil: novas áreas emergentes no estado da Paraíba

Sporotrichosis is a subcutaneous mycosis caused by fungus of the Sporothrix complex, and in Brazil the main species reported is Sporothrix brasiliensis, of which the diseased cat is the transmitter. Although, its occurrence has increased in the state of Paraíba, Brazil, since 2016, data on the disease in this state are limited. Therefore, this research aimed to identify molecularly isolates of Sporothrix spp. from domestic cats from cities in Paraíba, and in this way to expand the understanding of the disease in the state. Thirty-nine samples were analyzed, obtained from skin lesions of domestic felines, from the following cities in Paraíba: João Pessoa, Pilões, Patos, Areia, Bananeiras and Guarabira. Cytological analysis was performed to screen the samples, followed by fungal culture, and the molecular characterization of the isolates was performed, using the species-specific Polymerase Chain Reaction (PCR) or partial sequencing of the calmodulin gene. All isolates were identified as S. brasiliensis. The sequencing showed 100% similarity to the S. brasiliensis CBS 120339 strain. In view of this, it is concluded that in the study areas the species involved in cases of feline sporotrichosis is S. brasiliensis, its presence in Paraíba demonstrated the spread of the agent in regions distant from the epicenters in Brazil, alerting to the possible occurrence of zoonotic outbreaks similar to those found in the South and Southeast regions of the country. In addition, it highlights the emerging role of felines in the transmission of sporotrichosis in new endemic areas of Brazil.

A esporotricose é uma micose subcutânea causada por fungos do complexo Sporothrix, e no Brasil a principal espécie relatada é Sporothrix brasiliensis da qual o transmissor é o gato doente. Embora sua ocorrência tenha aumentado no estado da Paraíba, Brasil, desde 2016, os dados sobre a doença neste estado são limitados. Diante disso, esta pesquisa teve por objetivo identificar, molecularmente, isolados de Sporothrix spp. procedentes de felinos domésticos de cidades da Paraíba, e dessa maneira expandir a compreensão da enfermidade no estado. Foram analisadas 39 amostras, obtidas de lesões cutâneas de felinos domésticos, oriundos das seguintes cidades paraibanas: João Pessoa, Pilões, Patos, Areia, Bananeiras e Guarabira. Realizou-se análise citológica, para triagem das amostras, a seguir cultura fúngica, e posteriormente a caracterização molecular dos isolados, utilizando a Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), espécie-específica ou sequenciamento parcial do gene calmodulina. Todos os isolados foram identificados molecularmente como S. brasiliensis. O sequenciamento demonstrou 100% de similaridade com a cepa S. brasiliensis CBS 120339. Contudo, conclui-se que nas áreas do estudo a espécie envolvida em casos de esporotricose felina é S. brasiliensis, sua presença na Paraíba demonstra a disseminação do agente em regiões distantes dos epicentros no Brasil, alertando para a possível ocorrência de surtos zoonóticos, semelhantes aos encontrados nas regiões Sul e Sudeste do país. Além disso, destaca o papel emergente dos felinos na transmissão da esporotricose em novas áreas endêmicas do Brasil.

Microbial diversity in artisanal cheese produced and commercialized in Vale do Taquari in southern Brazil / Diversidade microbiana encontrada em queijos artesanais produzidos e comercializados no Vale do Taquari no sul do Brasil

Researchers have been utilizing matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) to identify bacteria and fungi directly from isolates obtained on culture plates; the resulting mass spectrum is then compared with spectra stored in the instrument software. Hence, a fast analytical response is obtained, and the more spectra are known to compare, the safer and more reliable the interpretation of the method will be. Thus, this study sought to identify the diversity of strains found in 10 samples of artisan cheese produced and commercialized in Vale do Taquari (Rio Grande do Sul State, Brazil) using MALDI-TOF MS. From the analyzed cheese, 22 strains were identified at the species level; one sample presented the pathogen Staphylococcus aureus, two showed the presence of lactic acid bacteria (Lactococcus lactis), and the vast majority (68.18%) of strains were composed of species of the Enterobacteriaceae family, with the prevalence of the genera Escherichia, Enterobacter, and Klebsiella. Escherichia coli was present in 50% of the samples analyzed. This demonstrates the need for greater control during all stages of artisanal cheese production and evaluation of the raw material, including safe practices during milking, so that the product meets the identity and quality parameters suitable for human consumption.

MALDI-TOF MS vendo sendo utilizado em laboratórios para identificar bactérias e fungos diretamente de isolados obtidos em placas de cultura. O espectro de massa resultante é então comparado com espectros armazenados no software do equipamento. Assim, obtém-se uma resposta analítica rápida, sendo que, quanto mais espectros forem conhecidos para comparar, mais seguro e confiável será a interpretação do método. Desta maneira, o presente trabalho teve por objetivo, identificar por MALDI-TOF MS, a diversidade de cepas encontrados em 10 amostras de queijos artesanais produzidos e comercializados no Vale do Taquari, Rio Grande do Sul, Brasil. Dos queijos analisados, 22 cepas foram identificadas a nível de espécie, sendo uma (1) amostra apresentou o patógeno Staphylococcus aureus, duas a presença da bactéria ácido láctica (Lactococcus lactis) e a grande maioria (68,18%) das cepas era composta por espécies da família Enterobacteriaceae, com prevalência dos gêneros Escherichia, Enterobacter e Klebsiella. E. coli estava presente em 50% das amostras analisadas. Isso demonstra a necessidade de um maior controle durante todas as etapas de produção do queijo artesanal, bem como a avaliação da matéria-prima, incluindo práticas seguras durante a ordenha para que o produto atenda aos parâmetros de identidade e qualidade, sendo apto ao consumo humano.

Blood glucose profile as a rapid method for observing Koi carp (Cyprinus carpio) health status - case study of ectoparasites in Blitar, Indonesia / Perfil de glicose no sangue como um método rápido para observar o estado de saúde de carpa Koi (Cyprinus carpio) - estudo de caso de ectoparasitos em Blitar, Indonésia

Assessment of fish health is one of the efforts of farmers in minimizing losses due to disease. Rapid tests on fish health can be done through blood observations. This study aimed to determine the blood glucose profile of koi carp due to ectoparasite infestation from the level of blood glucose. The results showed that reported parasites from Blitar's koi carp were Trichodina, Dactylogyrus, Gyrodactylus, Myxobolus, Thelohanellus, Ichthyophthirius, and Argulus. Trichodina showed the highest prevalence (100%) in this case while Thelohanellus was the highest intensity level (93.8±16.3). The results of blood glucose level measurement based on parasite infestation levels showed no significant difference (p>0.05) though the health problems caused by parasites in light, medium or heavy infestation. This research also indicated that the blood glucose profile could be used as a rapid method to detect fish health caused by parasites. We suggest that other variables such as nutritional status, life stage or feeding must be conducted to ensure the glucose role in parasite identification as a rapid method for the future work.(AU)

A avaliação da saúde dos peixes é um dos esforços dos produtores para minimizar as perdas por doenças. Testes rápidos de saúde de peixes podem ser feitos por meio de observações de sangue. Este estudo teve como objetivo determinar o perfil glicêmico de peixes "koi", devido à infestação de ectoparasitos a partir do nível de glicemia. Os resultados mostraram que os parasitas relatados de peixes "koi" de Blitar foram Trichodina, Dactylogyrus, Gyrodactylus, Myxobolus, Thelohanellus, Ichthyophthirius e Argulus. Trichodina apresentou a maior prevalência (100%) neste caso, enquanto Thelohanellus foi o maior em nível de intensidade (93,8±16,3). Os resultados da medição do nível de glicose no sangue, com base nos níveis de infestação parasitária, não mostraram diferença significativa (p>0,05), apesar dos problemas de saúde causados ​​por parasitas em infestação leve, média ou pesada. Esta pesquisa também indicou que o perfil de glicose no sangue pode ser usado como um método rápido, para detectar a saúde dos peixes causada por parasitas. Este estudo também sugere que outras variáveis, como estado nutricional, estágio de vida ou alimentação, devem ser conduzidas para garantir o papel da glicose na identificação do parasita como um método rápido para trabalhos futuros.(AU)

Early life history of two Neotropical Triportheidae fish (Characiformes)

The early ontogeny of Triportheus albus and T. angulatus, two fish species of Triportheidae, is described using morphological, meristic, and morphometric characters. These species are exploited by subsistence fisheries and have potential as an alternative source of fish, given the decline in the natural stocks of other commercially important fish species in the Amazon. The specimens were collected in the open water limnetic zone, under of the macrophyte stands, and in subsurface areas near sandbars in the Amazon basin. Intra and interspecific morphometric analyzes were performed to evaluate growth models between species. The combination of color pattern, body morphology, morphometric proportions and myomeres number distinguishes the species from each other and from other congeners. Some morphometric relationships related to head as snout length and eye diameter as well as length from the snout to the origins of anal and length from the snout to the origins of pelvic, related with standard length were different between the two species of Triportheus, reflecting different growth models between them. An identification key for larvae and juveniles of some species of Triportheus from the Eastern Amazon is presented.(AU)

A ontogenia inicial de Triportheus albus e T. angulatus, duas espécies de peixes pertencentes a Triportheidae, é descrita usando caracteres morfológicos, merísticos e morfométricos. Essas espécies são exploradas pela pesca de subsistência e têm potencial como fonte alternativa de pescado, dado o declínio nos estoques naturais de outras espécies de peixes comercialmente importantes na Amazônia. Os espécimes foram coletados na zona limnética de águas abertas, sob bancos de macrófitas e em áreas subsuperficiais próximas a bancos de areia na bacia amazônica. Análises morfométricas, intra e interespecíficas, foram realizadas para avaliar modelos de crescimento entre as espécies. A combinação do padrão de coloração, morfologia corporal, proporções morfométricas e número de miômeros distingue as espécies entre si e de outras congêneres. Algumas relações morfométricas relacionadas à cabeça, como comprimento do focinho e diâmetro do olho, assim como o comprimento do focinho à origem da nadadeira anal e o comprimento do focinho à origem da nadadeira pélvica, relacionadas ao comprimento padrão foram diferentes entre as duas espécies de Triportheus, refletindo modelos distintos de crescimento entre elas. Uma chave de identificação para larvas e juvenis de algumas espécies de Triportheus da Amazônia Oriental é apresentada.(AU)

Description of two new species of Bujurquina (Teleostei: Cichlidae) from the Bolivian Amazon

Two new species of Bujurquina are described from the Bolivian Amazon basin. The first new species inhabits the Beni River drainage and is distinguished from its congeners in the combination of the following characters: longer snout, deeper head, body and caudal peduncle, shorter pectoral fin, more scales in the E1 series, discontinuous longitudinal band, bars 5 and 6 not fused, preopercular spot and coloration pattern on flank scales absent. The second new species inhabits the Mamoré and Iténez river drainages, and differs from its congeners in the combination of the following characteristics: longer and deeper head, longer snout and pectoral fin, deeper caudal peduncle, fewer scales in the E1 series and lower lateral line, preopercular spot absent, bars 6 and 7 separated from longitudinal band and discontinuous longitudinal band. An identification key for species reported from Bolivia and complementary morphological data for B. oenolaemus and B. vittata are presented.

Se describen dos especies nuevas de Bujurquina para la cuenca Amazónica de Bolivia. La primera nueva especie habita la cuenca del Río Beni y se distingue de sus congéneres en la combinación de los siguientes caracteres: hocico más largo, cabeza, cuerpo y pedúnculo caudal más bajos, aleta pectoral más corta, mayor número de escamas en la serie E1, banda longitudinal discontinua, barras 5 y 6 no fusionadas, mancha preopercular y patrón de coloración en las escamas de los flancos ausentes. La segunda nueva especie habita las cuencas de los ríos Mamoré e Iténez, y se diferencia de sus congéneres en la combinación de las siguientes características: cabeza más larga y alta, hocico y aleta pectoral más largos, pedúnculo caudal más alto, menor número de escamas de la serie E1 y de la línea lateral inferior, ausencia de la mancha preopercular, barras 6 y 7 separadas de la banda longitudinal y banda longitudinal discontinua. Se presenta una clave de identificación de las especies de Bolivia y datos morfológicos complementarios de B. oenolaemus y B. vittata.

"Revisiting the past": a redescription of Physaloptera retusa (Nemata, Physalopteridae) from material deposited in museums and new material from Amazon lizards / "Revisitando o passado": uma redescrição de Physaloptera retusa (Nemata, Physalopteridae) a partir de material depositado em museus e novo material de lagartos amazônicos

Physaloptera Rudolphi, 1819 is a genus of nematodes that includes approximately 100 species parasitic in vertebrates around the world. From these, approximately 30 occur in the Neotropical region, with nine reported from neotropical reptiles. Physaloptera spp. are recognized by their distinct morphology of the apical end and characters of the reproductive system. However, despite the fact that the morphological characters for species diagnosis have been firmly established, we frequently find identification problems regarding poorly detailed descriptions and poorly preserved specimens. These may lead to taxonomic incongruencies. Physaloptera retusa (Rudolphi, 1819) is the most common species of the genus and has been reported from several species of neotropical reptiles. Based on our reexaminations of nematode specimens identified as P. retusa from different museum collections, we provide a detailed redescription including the type material, voucher specimens and new specimens recovered currently and showed in this study with new morphological data obtained using light and scanning electron microscopy tools.(AU)

Physaloptera Rudolphi, 1819 é um gênero de nematódeos que inclui aproximadamente 100 espécies parasitárias em vertebrados em todo o mundo. Destes, aproximadamente 30 ocorrem na região Neotropical, e nove foram reportados para répteis neotropicais. Physaloptera spp. são reconhecidas por sua morfologia distinta na extremidade apical e por caracteres do sistema reprodutivo, especialmente nos machos. No entanto, embora os caracteres morfológicos para o diagnóstico de espécies tenham sido estabelecidos, frequentemente são encontrados problemas de identificação em relação a descrições pouco detalhadas e espécimes mal preservados. Isto pode levar a incongruências taxonômicas e erros de identificação. Physaloptera retusa (Rudolphi, 1819) é a espécie mais comum do gênero e tem sido reportada para várias espécies de répteis neotropicais. Com base nos estudos das revisões de espécimes de nematódeos, identificados como P. retusa de diferentes coleções de museus, foi providenciada uma redescrição detalhada, incluindo-se o material-tipo, espécimes "voucher" e novos espécimes obtidos neste estudo com novos dados morfológicos, obtidos a partir de microscopia eletrônica de luz e varredura.(AU)

Genetic differentiation of two morphotypes of Piper regnellii (Miq.) C. DC. var. regnellii

Piper regnellii (Miq.) C. DC. var. regnellii, popularly known as "pariparoba", is used for therapeutic purposes. However, the morphological similarity among Piper species can lead to misidentifications, so molecular markers have been used to validate the identification of species and their morphotypes. Among the molecular markers used in plants, the intergenic spacer region trnL-trnF has proven effective in identifying plant species. For this reason, this region was used to evaluate two morphotypes of Piper regnellii var. regnellii. Studies with the trnL-trnF region have shown this region as a good marker for establishing phylogenetic relationships, distinguishing species, and identifying new species. We concluded that the trnL-trnF sequenced region show one indel of difference between the two morphotypes. It would be interesting to analyze these two morphotypes with a more variable region than the one used here, aiming to show intraspecific differences.(AU)

Survey of nematodes associated with sugarcane in the state of Paraná, Brazil

Sugarcane-associated nematodes (Saccharum spp.) can reduce productivity up to 50%. Through the survey, it was possible to identify the main nematodes that occur in a certain region as a tool for designing the best management and control strategies. The aim of this study was to characterize the population of nematodes associated with sugarcane in the North Central, North Pioneiro and Northwest mesoregion of the state of Paraná, Brazil, quantify the nematode genera associated with the crop and identify the species of Pratylenchus and Meloidogyne. A total amount of 89 soil and root composite samples were collected in nine municipalities. Nematodes were extracted and counted in a Peters counting chamber under an optical light microscope. Morphological description followed identification keys. Pratylenchus spp. were identified by morphological characteristics; Meloidogyne spp. were identified by morphological characteristics and isoenzyme electrophoresis. Twelve genera of nematodes associated with sugarcane were identified: Pratylenchus, Meloidogyne, Helicotylenchus, Xiphinema, Mesocriconema, Trichodorus, Aphelenchus, Hoplolaimus, Tylenchus, Tylenchorhynchus, Ditylenchus, and Paratrichodorus. The genera Pratylenchus and Meloidogyne were found with the highest frequencies in the roots. Among the species of Pratylenchus, P. zeae and P. brachyurus were found, with P. zeae being the most frequent. Among the Meloidogyne species, only M. javanica was found. These results are essential to aid decision making in the management of phytonematodes, mainly in the development of new control strategies and in directing genetic breeding programs for development of sugarcane cultivars for the Paraná state.

Taxonomy of the armored catfish genus Aspidoras (Siluriformes: Callichthyidae) revisited, with the description of a new species

Aspidoras comprises 25 species currently considered as valid, being widely distributed in Brazil, occurring from the upper rio Paraná basin in São Paulo to coastal basins of Ceará. After Nijssen, Isbrücker's review more than 40 years ago, no extensive work regarding the taxonomy of Aspidoras was conducted. Our paper presents a comprehensive taxonomic revision of the genus, based primarily on the extensive material that has been collected since then. Considering the new diagnosis plus the available phylogenetic data, A. pauciradiatus and A. virgulatus are transferred to Corydoras and Scleromystax, respectively. New synonymies are proposed: A. eurycephalus and A. taurus with A. albater; A. menezesi and A. spilotus with A. raimundi; and A. microgalaeus and A. marianae with A. poecilus. Additionally, a new species from the Araguaia and Paraguay river basins is described, which can be distinguished from its congeners by the morphology of its complex vertebra and infraorbital 1. Thereby, the number of valid species within Aspidoras was reduced from 25 to 18. Redescriptions for A. albater, A. belenos, A. depinnai, A. fuscoguttatus, A. lakoi, A. maculosus, A. poecilus, A. psammatides, A. raimundi, and A. velites are provided. An identification key to the species of Aspidoras is also provided.

Aspidoras compreende 25 espécies atualmente consideradas como válidas, sendo amplamente distribuído no Brasil, ocorrendo desde a bacia do alto rio Paraná em São Paulo até as bacias costeiras do Ceará. Após a revisão de Nijssen, Isbrücker há mais de 40 anos, nenhum trabalho extensivo sobre a taxonomia de Aspidoras foi conduzido. Nosso trabalho apresenta uma revisão taxonômica abrangente do gênero, baseada principalmente no extenso material que foi coletado desde então. Considerando a nova diagnose mais os dados filogenéticos disponíveis, A. pauciradiatus e A. virgulatus são transferidas para Corydoras e Scleromystax, respectivamente. Novas sinonímias são propostas: A. eurycephalus e A. taurus com A. albater; A. menezesi e A. spilotus com A. raimundi; e A. microgalaeus e A. marianae com A. poecilus. Adicionalmente, uma espécie nova é descrita das bacias dos rios Araguaia e Paraguai, podendo ser distinguida de suas congêneres pela morfologia da vértebra complexa e infraorbital 1. Assim, o número de espécies válidas em Aspidoras foi reduzido de 25 para 18. Redescrições para A. albater, A. belenos, A. depinnai, A. fuscoguttatus, A. lakoi, A. maculosus, A. poecilus, A. psammatides, A. raimundi e A. velites são fornecidas. Uma chave de identificação para as espécies de Aspidoras também é fornecida.

Identification and crop damage assessment of indian crested porcupine (Hystrix indica) in selected zones of Abbottabad, Pakistan / Avaliação de identificação e dano de cultura de porco-espinho indiano (Hystrix indica) em zonas selecionadas de Abbottabad, Paquistão

Indian crested porcupine is the largest rodent pest that damages a wide variety of crops, vegetables, and tree species which ultimately causes huge economic loss in Pakistan, which is an agricultural country. It prefers to live in hilly terrain but common in temperate and tropical forests, shrublands, and grasslands. This study focused on the identification and assessment of crops damaged along with the main precautionary measures used by the local farmers. The data was collected from twenty-four villages of two union councils i.e. Chamhad and Slahad of district Abbottabad. Two types of data (primary and secondary) were collected from the study area. Primary data was collected for identification and estimation calculation of total crop damaged through direct field observation by taking random quadrates in each village of the study area. The damage in the crop was assessed by randomly selecting a quadrate of 1x1 m² for the wheat, pearl millet, and Sorghum fields. While 4x4 m² quadrates were taken for maize and vegetables. At least three quadrate samples were taken from each field including one quadrate taken from the center of the field area. In union council Chamhad, damage to maize (11.31%) and wheat (0.73%) by the Indian crested porcupine while in union council Salhad, damage of maize (6.95%) and wheat (1.6%) was observed. In the entire study area, overall damage to maize crop (8.01%) and wheat (0.88%) was calculated. Based on information obtained from the farmers, the Indian porcupine inflicted damage to potato, tomato, cauliflower, chili pepper, turnip, radish, pea, and onion, etc. Secondary data obtained through a questionnaire survey to explore the human porcupine conflict and precautionary measures used by the farmers and landowners. Open and close ended questionnaires (159) highlighted the presence of Indian crested porcupine in the study area and 96% of the respondents have seen porcupine directly. Many types of precautionary measures [...].

O porco-espinho indiano é a maior praga de roedores que danifica uma grande variedade de culturas, vegetais e espécies de árvores, o que acaba por causar enormes perdas econômicas no Paquistão, que é um país agrícola. Prefere viver em terrenos montanhosos, mas comuns em florestas temperadas e tropicais, arbustos e pastagens. Este estudo concentrou-se na identificação e avaliação das lavouras danificadas, juntamente com as principais medidas de precaução utilizadas pelos agricultores locais. Os dados foram coletados de 24 aldeias de dois conselhos sindicais, ou seja, Chamhad e Slahad, do distrito de Abbottabad. Dois tipos de dados (primário e secundário) foram coletados da área de estudo. Foram coletados dados primários para identificação e cálculo de estimativa do total da cultura danificada por meio da observação direta do campo, tomando quadrantes aleatórios em cada aldeia da área de estudo. O dano na cultura foi avaliado pela seleção aleatória de um quadrante de 1x1 m2 para os campos de trigo, milheto pérola e sorgo, enquanto quadrantes de 4x4 m2 foram tomados para milho e legumes. Pelo menos três amostras de quadrante foram colhidas de cada campo, incluindo um quadrante retirado do centro da área do campo. No Conselho Sindical de Chamhad, houve danos ao milho (11,31%) e ao trigo (0,73%) pelo porco-espinho indiano, enquanto no Conselho Sindical de Salhad, danos ao milho (6,95%) e ao trigo (1,6%) foram observados. Em toda a área do estudo, danos gerais à cultura do milho (8,01%) e ao trigo (0,88%) foram calculados. Com base em informações obtidas dos agricultores, o porco-espinho indiano infligiu danos à batata, tomate, couve-flor, pimenta, nabo, rabanete, ervilha, cebola, etc. Dados secundários foram obtidos por meio de um questionário para explorar o conflito suíno humano e as medidas de precaução utilizadas pelos agricultores e proprietários de terras. Questionários abertos e fechados (159) destacaram a presença de porco-espinho indiano na área [...].

Identification and crop damage assessment of indian crested porcupine (Hystrix indica) in selected zones of Abbottabad, Pakistan

Abstract Indian crested porcupine is the largest rodent pest that damages a wide variety of crops, vegetables, and tree species which ultimately causes huge economic loss in Pakistan, which is an agricultural country. It prefers to live in hilly terrain but common in temperate and tropical forests, shrublands, and grasslands. This study focused on the identification and assessment of crops damaged along with the main precautionary measures used by the local farmers. The data was collected from twenty-four villages of two union councils i.e. Chamhad and Slahad of district Abbottabad. Two types of data (primary and secondary) were collected from the study area. Primary data was collected for identification and estimation calculation of total crop damaged through direct field observation by taking random quadrates in each village of the study area. The damage in the crop was assessed by randomly selecting a quadrate of 1x1 m2 for the wheat, pearl millet, and Sorghum fields. While 4x4 m2 quadrates were taken for maize and vegetables. At least three quadrate samples were taken from each field including one quadrate taken from the center of the field area. In union council Chamhad, damage to maize (11.31%) and wheat (0.73%) by the Indian crested porcupine while in union council Salhad, damage of maize (6.95%) and wheat (1.6%) was observed. In the entire study area, overall damage to maize crop (8.01%) and wheat (0.88%) was calculated. Based on information obtained from the farmers, the Indian porcupine inflicted damage to potato, tomato, cauliflower, chili pepper, turnip, radish, pea, and onion, etc. Secondary data obtained through a questionnaire survey to explore the human porcupine conflict and precautionary measures used by the farmers and landowners. Open and close-ended questionnaires (159) highlighted the presence of Indian crested porcupine in the study area and 96% of the respondents have seen porcupine directly. Many types of precautionary measures were used by the farmers such as fencing, night stay, night firing, and dogs to decrease the crop damage, respondents (63.91%) use guns for hunting. however, due to the largely agricultural area and nocturnal behavior of Indian crested porcupine majority of the respondents (51.57%) did not use any precautionary measure. Biological control of Indian porcupine is recommended in the study area. Farmers should be encouraged and provide incentives and killing through current should be banned while proper hunting license should be issued to overcome overhunting. Scientific studies are required to control the reproduction of porcupine specifically in the more damaged areas.

Resumo O porco-espinho indiano é a maior praga de roedores que danifica uma grande variedade de culturas, vegetais e espécies de árvores, o que acaba por causar enormes perdas econômicas no Paquistão, que é um país agrícola. Prefere viver em terrenos montanhosos, mas comuns em florestas temperadas e tropicais, arbustos e pastagens. Este estudo concentrou-se na identificação e avaliação das lavouras danificadas, juntamente com as principais medidas de precaução utilizadas pelos agricultores locais. Os dados foram coletados de 24 aldeias de dois conselhos sindicais, ou seja, Chamhad e Slahad, do distrito de Abbottabad. Dois tipos de dados (primário e secundário) foram coletados da área de estudo. Foram coletados dados primários para identificação e cálculo de estimativa do total da cultura danificada por meio da observação direta do campo, tomando quadrantes aleatórios em cada aldeia da área de estudo. O dano na cultura foi avaliado pela seleção aleatória de um quadrante de 1x1 m2 para os campos de trigo, milheto pérola e sorgo, enquanto quadrantes de 4x4 m2 foram tomados para milho e legumes. Pelo menos três amostras de quadrante foram colhidas de cada campo, incluindo um quadrante retirado do centro da área do campo. No Conselho Sindical de Chamhad, houve danos ao milho (11,31%) e ao trigo (0,73%) pelo porco-espinho indiano, enquanto no Conselho Sindical de Salhad, danos ao milho (6,95%) e ao trigo (1,6%) foram observados. Em toda a área do estudo, danos gerais à cultura do milho (8,01%) e ao trigo (0,88%) foram calculados. Com base em informações obtidas dos agricultores, o porco-espinho indiano infligiu danos à batata, tomate, couve-flor, pimenta, nabo, rabanete, ervilha, cebola, etc. Dados secundários foram obtidos por meio de um questionário para explorar o conflito suíno humano e as medidas de precaução utilizadas pelos agricultores e proprietários de terras. Questionários abertos e fechados (159) destacaram a presença de porco-espinho indiano na área de estudo e 96% dos entrevistados viram o porco-espinho diretamente. Muitos tipos de medidas de precaução foram utilizados pelos agricultores, como esgrima, estadia noturna, fogo noturno e cães para diminuir os danos na lavoura. Dos entrevistados, 63,91% usaram armas para caçar. No entanto, devido à área ser em grande parte agrícola e ao comportamento noturno da maioria dos porcos-espinhos indianos, 51,57% não usaram nenhuma medida de precaução. O controle biológico do porco-espinho indiano é recomendado na área de estudo. Os agricultores devem ser encorajados e fornecer incentivos, e o uso da corrente para matar os animais deve ser banido, assim como deve ser emitida a licença de caça adequada para superar a caça excessiva. Estudos científicos são necessários para controlar a reprodução de porco-espinho, especificamente nas áreas mais danificadas.

Identification and crop damage assessment of indian crested porcupine (Hystrix indica) in selected zones of Abbottabad, Pakistan / Avaliação de identificação e dano de cultura de porco-espinho indiano (Hystrix indica) em zonas selecionadas de Abbottabad, Paquistão

Indian crested porcupine is the largest rodent pest that damages a wide variety of crops, vegetables, and tree species which ultimately causes huge economic loss in Pakistan, which is an agricultural country. It prefers to live in hilly terrain but common in temperate and tropical forests, shrublands, and grasslands. This study focused on the identification and assessment of crops damaged along with the main precautionary measures used by the local farmers. The data was collected from twenty-four villages of two union councils i.e. Chamhad and Slahad of district Abbottabad. Two types of data (primary and secondary) were collected from the study area. Primary data was collected for identification and estimation calculation of total crop damaged through direct field observation by taking random quadrates in each village of the study area. The damage in the crop was assessed by randomly selecting a quadrate of 1x1 m2 for the wheat, pearl millet, and Sorghum fields. While 4x4 m2 quadrates were taken for maize and vegetables. At least three quadrate samples were taken from each field including one quadrate taken from the center of the field area. In union council Chamhad, damage to maize (11.31%) and wheat (0.73%) by the Indian crested porcupine while in union council Salhad, damage of maize (6.95%) and wheat (1.6%) was observed. In the entire study area, overall damage to maize crop (8.01%) and wheat (0.88%) was calculated. Based on information obtained from the farmers, the Indian porcupine inflicted damage to potato, tomato, cauliflower, chili pepper, turnip, radish, pea, and onion, etc. Secondary data obtained through a questionnaire survey to explore the human porcupine conflict and precautionary measures used by the farmers and landowners. Open and closeended questionnaires (159) highlighted the presence of Indian crested porcupine in the study area and 96% of the respondents have seen porcupine directly. Many types of precautionary measures were used by the farmers such as fencing, night stay, night firing, and dogs to decrease the crop damage, respondents (63.91%) use guns for hunting. however, due to the largely agricultural area and nocturnal behavior of Indian crested porcupine majority of the respondents (51.57%) did not use any precautionary measure. Biological control of Indian porcupine is recommended in the study area. Farmers should be encouraged and provide incentives and killing through current should be banned while proper hunting license should be issued to overcome overhunting. Scientific studies are required to control the reproduction of porcupine specifically in the more damaged areas.

O porco-espinho indiano é a maior praga de roedores que danifica uma grande variedade de culturas, vegetais e espécies de árvores, o que acaba por causar enormes perdas econômicas no Paquistão, que é um país agrícola. Prefere viver em terrenos montanhosos, mas comuns em florestas temperadas e tropicais, arbustos e pastagens. Este estudo concentrou-se na identificação e avaliação das lavouras danificadas, juntamente com as principais medidas de precaução utilizadas pelos agricultores locais. Os dados foram coletados de 24 aldeias de dois conselhos sindicais, ou seja, Chamhad e Slahad, do distrito de Abbottabad. Dois tipos de dados (primário e secundário) foram coletados da área de estudo. Foram coletados dados primários para identificação e cálculo de estimativa do total da cultura danificada por meio da observação direta do campo, tomando quadrantes aleatórios em cada aldeia da área de estudo. O dano na cultura foi avaliado pela seleção aleatória de um quadrante de 1x1 m2 para os campos de trigo, milheto pérola e sorgo, enquanto quadrantes de 4x4 m2 foram tomados para milho e legumes. Pelo menos três amostras de quadrante foram colhidas de cada campo, incluindo um quadrante retirado do centro da área do campo. No Conselho Sindical de Chamhad, houve danos ao milho (11,31%) e ao trigo (0,73%) pelo porco-espinho indiano, enquanto no Conselho Sindical de Salhad, danos ao milho (6,95%) e ao trigo (1,6%) foram observados. Em toda a área do estudo, danos gerais à cultura do milho (8,01%) e ao trigo (0,88%) foram calculados. Com base em informações obtidas dos agricultores, o porco-espinho indiano infligiu danos à batata, tomate, couve-flor, pimenta, nabo, rabanete, ervilha, cebola, etc. Dados secundários foram obtidos por meio de um questionário para explorar o conflito suíno humano e as medidas de precaução utilizadas pelos agricultores e proprietários de terras. Questionários abertos e fechados (159) destacaram a presença de porco-espinho indiano na área de estudo e 96% dos entrevistados viram o porco-espinho diretamente. Muitos tipos de medidas de precaução foram utilizados pelos agricultores, como esgrima, estadia noturna, fogo noturno e cães para diminuir os danos na lavoura. Dos entrevistados, 63,91% usaram armas para caçar. No entanto, devido à área ser em grande parte agrícola e ao comportamento noturno da maioria dos porcos-espinhos indianos, 51,57% não usaram nenhuma medida de precaução. O controle biológico do porco-espinho indiano é recomendado na área de estudo. Os agricultores devem ser encorajados e fornecer incentivos, e o uso da corrente para matar os animais deve ser banido, assim como deve ser emitida a licença de caça adequada para superar a caça excessiva. Estudos científicos são necessários para controlar a reprodução de porco-espinho, especificamente nas áreas mais danificadas.

Phylogenetic relationships and description of two new species of Diapoma (Characidae: Stevardiinae) from the La Plata River basin

Herein we describe two new species of Diapoma, one from the Negro River, a tributary of the Uruguay River in Brazil and Uruguay, and one from the Iguaçu River, in Brazil and Argentina. The new species from the Negro River basin is distinguished from its congeners by the following combination of characters: a black narrow and conspicuous line restricted to the body horizontal septum, incomplete lateral line, tricuspid teeth in the inner series of the premaxilla, and a lower body depth at vertical through the dorsal-fin origin (29.3-32.8% SL in males and 27.7-33.3% SL in females). The new species from the Iguaçu River basin is distinguished from its congeners by the following combination of characters: a discontinuous lateral line, adipose fin hyaline, longer anal-fin base (26.5-32.4% SL), and a longitudinal black stripe along the median region of caudal-fin rays. Additionally, we updated the molecular phylogeny of the genus, including new sequences from these two new species and Diapoma thauma. An identification key for species of Diapoma is presented, modified from previous study.(AU)

Neste trabalho descrevemos duas espécies novas de Diapoma, uma do rio Negro, afluente do rio Uruguai, Brasil e Uruguai, e a segunda do rio Iguaçu, Brasil e Argentina. A espécie nova do rio Negro é diagnosticada de suas congêneres pela combinação das seguintes características: uma linha preta, estreita e conspícua restrita ao septo horizontal do corpo, linha lateral incompleta, dentes da série interna da pré-maxila tricuspidados, e baixa altura do corpo na vertical que passa pela origem da nadadeira dorsal (29,3-32,8% SL em machos e 27,7-33,3% SL em fêmeas). A espécie nova do rio Iguaçu é diagnosticada de suas congêneres pela combinação das seguintes características: linha lateral descontínua, nadadeira adiposa não pigmentada de preto, base da nadadeira anal longa (26,5-32,4% SL) e raios médios da nadadeira caudal com uma linha preta longitudinal. Adicionalmente, atualizamos a filogenia molecular do gênero, incluindo novas sequências destas duas espécies novas e de Diapoma thauma. Uma chave de identificação para as espécies de Diapoma é apresentada, modificada de estudo anterior.(AU)

A new genus of armored catfish (Siluriformes: Loricariidae) from the Greater Amazon, with a review of the species and description of five new species

A new genus of Hypopopomatinae armored catfish is described from the northern portions of South America, namely the Amazon, Orinoco and Guianan coastal drainages. The new genus is diagnosed from all remaining hypoptopomatines by having the canal cheek plate on the ventral surface of the head posteriorly elongated and contacting the cleithrum, in addition to other features that distinguish the new genus from specific genera. Five new species are described and 18 species currently allocated in Parotocinclus, Hisonotus, and Curculionichthys are transferred to the new genus and rediagnosed. Parotocinclus amazonensis and P. aripuanensis are considered junior synonyms of P. britskii. The secondary sexual dimorphism of the members of the new genus is detailed and illustrated. Morphological characters are used to delimit four phenotypic groups of species that might have phylogenetic significance, which still have to be properly tested. A key to the species is offered and diagnoses, illustrations, and distribution maps are provided for all species.(AU)

Um novo gênero de cascudo da subfamília Hypopopomatinae é descrito das porções do norte da América do Sul, a saber, as drenagens costeiras da Amazônia, Orinoco e Guiana. O novo gênero é diagnosticado de todos os demais hypoptopomatineos por possuir a placa com canal da bochecha na superfície ventral da cabeça, alongada posteriormente e em contato com o cleitro, além de outras características que distinguem o novo gênero de gêneros específicos. Cinco novas espécies são descritas e 18 espécies atualmente alocadas em Parotocinclus, Hisonotus e Curculionichthys são transferidas para o novo gênero e rediagnosticadas. Parotocinclus amazonensis e P. aripuanensis são considerados sinônimos juniores de P. britskii. O dimorfismo sexual secundário dos membros do novo gênero é detalhado e ilustrado. Caracteres morfológicos são usados para delimitar quatro grupos fenotípicos de espécies que podem ter significado filogenético, que ainda precisam ser devidamente testados. Uma chave para as espécies é apresentada e diagnoses, ilustrações e mapas de distribuição são fornecidos para todas as espécies.(AU)

A new species of Harttia from the rio São Francisco basin (Siluriformes: Loricariidae)

The genus Harttia belongs to the subfamily Loricariinae and has to date 27 described species, distributed in the drainages of Guiana Shield, Amazon and southeastern Brazil. The new species is distinguished from its congeners by the combination of: canal plate present; abdominal plates absent; trapezoid preanal plates; males with elongated and conspicuous odontodes on the first pectoral-fin ray and on the lateral region of the head, close to the canal plate; and dorsal-fin spinelet present. An identification key for the species of the rio São Francisco basin and a comparison between the new taxon and all other species of the genus are presented.

O gênero Harttia pertence à subfamília Loricariinae e possui 27 espécies descritas, distribuídas nas drenagens do Escudo das Guianas, Amazônica e do sudeste brasileiro. A nova espécie distingue-se das congêneres pela combinação de: placa do canal presente; placas abdominais ausentes; placas pré-anais trapezóides; machos com odontódeos alongados e conspícuos no primeiro raio da nadadeira peitoral e na região lateral da cabeça, próximo a placa do canal; e spinelet da nadadeira dorsal presente. Apresenta-se uma chave de identificação para as espécies da bacia do rio São Francisco e a comparação com todas as demais espécies do gênero.

Identification and crop damage assessment of indian crested porcupine (Hystrix indica) in selected zones of Abbottabad, Pakistan / Avaliação de identificação e dano de cultura de porco-espinho indiano (Hystrix indica) em zonas selecionadas de Abbottabad, Paquistão

Indian crested porcupine is the largest rodent pest that damages a wide variety of crops, vegetables, and tree species which ultimately causes huge economic loss in Pakistan, which is an agricultural country. It prefers to live in hilly terrain but common in temperate and tropical forests, shrublands, and grasslands. This study focused on the identification and assessment of crops damaged along with the main precautionary measures used by the local farmers. The data was collected from twenty-four villages of two union councils i.e. Chamhad and Slahad of district Abbottabad. Two types of data (primary and secondary) were collected from the study area. Primary data was collected for identification and estimation calculation of total crop damaged through direct field observation by taking random quadrates in each village of the study area. The damage in the crop was assessed by randomly selecting a quadrate of 1x1 m² for the wheat, pearl millet, and Sorghum fields. While 4x4 m² quadrates were taken for maize and vegetables. At least three quadrate samples were taken from each field including one quadrate taken from the center of the field area. In union council Chamhad, damage to maize (11.31%) and wheat (0.73%) by the Indian crested porcupine while in union council Salhad, damage of maize (6.95%) and wheat (1.6%) was observed. In the entire study area, overall damage to maize crop (8.01%) and wheat (0.88%) was calculated. Based on information obtained from the farmers, the Indian porcupine inflicted damage to potato, tomato, cauliflower, chili pepper, turnip, radish, pea, and onion, etc. Secondary data obtained through a questionnaire survey to explore the human porcupine conflict and precautionary measures used by the farmers and landowners. Open and close ended questionnaires (159) highlighted the presence of Indian crested porcupine in the study area and 96% of the respondents have seen porcupine directly. Many types of precautionary measures [...].(AU)

O porco-espinho indiano é a maior praga de roedores que danifica uma grande variedade de culturas, vegetais e espécies de árvores, o que acaba por causar enormes perdas econômicas no Paquistão, que é um país agrícola. Prefere viver em terrenos montanhosos, mas comuns em florestas temperadas e tropicais, arbustos e pastagens. Este estudo concentrou-se na identificação e avaliação das lavouras danificadas, juntamente com as principais medidas de precaução utilizadas pelos agricultores locais. Os dados foram coletados de 24 aldeias de dois conselhos sindicais, ou seja, Chamhad e Slahad, do distrito de Abbottabad. Dois tipos de dados (primário e secundário) foram coletados da área de estudo. Foram coletados dados primários para identificação e cálculo de estimativa do total da cultura danificada por meio da observação direta do campo, tomando quadrantes aleatórios em cada aldeia da área de estudo. O dano na cultura foi avaliado pela seleção aleatória de um quadrante de 1x1 m2 para os campos de trigo, milheto pérola e sorgo, enquanto quadrantes de 4x4 m2 foram tomados para milho e legumes. Pelo menos três amostras de quadrante foram colhidas de cada campo, incluindo um quadrante retirado do centro da área do campo. No Conselho Sindical de Chamhad, houve danos ao milho (11,31%) e ao trigo (0,73%) pelo porco-espinho indiano, enquanto no Conselho Sindical de Salhad, danos ao milho (6,95%) e ao trigo (1,6%) foram observados. Em toda a área do estudo, danos gerais à cultura do milho (8,01%) e ao trigo (0,88%) foram calculados. Com base em informações obtidas dos agricultores, o porco-espinho indiano infligiu danos à batata, tomate, couve-flor, pimenta, nabo, rabanete, ervilha, cebola, etc. Dados secundários foram obtidos por meio de um questionário para explorar o conflito suíno humano e as medidas de precaução utilizadas pelos agricultores e proprietários de terras. Questionários abertos e fechados (159) destacaram a presença de porco-espinho indiano na área [...].(AU)