Short communication: psychrotrophic microorganism count in raw milk samples preserved with azidiol

The study aimed to evaluate the use of the azidiol® preservative for psychrotrophic microorganism count (PMC) in cooled raw milk. Two studies were carried out, one under controlled conditions (experiment 1) and the other under field conditions (experiment 2), in which samples of raw milk were taken with and without the use of the azidiol® preservative and analyzed at predefined times (0, 6, 12 and 24 hours -experiment 1) and at varying times (experiment 2). Analysis of variance and regression analysis using SAS were applied for data statistical analysis. Milk samples without azidiol®showed higher PMC with increasing time between sampling and analysis, while in samples preserved with azidiol®, this count remained constant. Samples of cooled raw milk intended for PMC should be collected in flasks containing the azidiol®preservative.(AU)

Real-time polymerase chain reaction for detection and enumeration of Staphylococcus aureus and Streptococccus agalactiae using different milk samplings

The objective of the present study was to evaluate the qPCR for detection and enumeration of Staphylococcus aureus and Streptococcus agalactiae using different milk samplings in comparison to the conventional microbiology. Four dairy herds with a history of subclinical mastitis caused by S. aureus and S. agalactiae were selected. Sampling approach included milk samples from bulk tank (BT), cow level (composite samples, CO), and mammary quarter level (MQ) from 785 lactating cows. Three consecutive monthly milk samplings were carried out, totaling 3347 MQ milk samples, 912 CO, and 12 from BT. All collected milk samples were subjected to conventional microbiology and qPCR for detection and enumeration of S. aureus and S. agalactiae. The qPCR showed 71.5% of diagnostic sensitivity for S. aureus isolated from MQ milk samples, 71.8% for CO, and 50% for BT milk samples compared with conventional microbiology methodology. Taken together, the diagnostic sensitivity for S. agalactiae isolated from MQ milk samples was 90.2, 87.7 for CO, and 90.9% for BT milk samples. In general, the qPCR methodology enabled the detection of S. aureus and S. agalactiae, regardless of the type of milk sampling. The direct use of milk samples to estimate the counting of S. aureus by qPCR demonstrated lower sensitivity than the counting of S. agalactiae, which can be explained by the pathogen infection dynamics and differences in milk sample type.

Effect of lactic acid bacteria preparations on calf fecal flora

This experiment was conducted to investigate the effects of lactic acid bacteria preparations on microbial diversity and community structure of calves. On days 1 and 7 of the trial period, feces were collected into sterile tubes and labeled (Day 1: control group D1DZ, experimental group D1SY, and Day 7: control group D7DZ, experimental group D7SY). Twenty Angus calves (150±10 kg) were selected and randomly divided into two groups of 10 calves each. The control group fed a basal diet. In addition to feeding the basal diet, the experimental group was given 15 mL lactobacillus preparation orally at 09:00 and 16:00 h every day. Calves were allowed free feeding and drinking water. All other feeding environments and management conditions remained consistent with the experiment lasting for seven days. At the end of the experiment, the fecal microflora of the calves was analyzed using 16S rRNA sequencing techniques. The 16S rRNA analysis data were processed using the Excel 2007 software and analyzed by the IBM SPSS statistical software (Statistical Analysis System, version 22). The Alpha diversity index analysis showed that the Chao and the Ace indices were significantly different after feeding supplemented with lactic acid bacteria. The PCA analysis showed that the fecal flora structure differed significantly after supplementation with the lactic acid bacteria preparation. Further analysis showed that the lactic acid bacteria increased Firmicutes, Patescibacteria, Rikenellaceae_RC9_gut_group, Clostridium_sensu_stricto_1, and prevotellaceae_UCG-003 in the feces. Therefore, we speculate that lactic acid bacteria preparations play an important role in animal production and are beneficial to the diversity of the fecal microflora of the calves.

The influence of primer choice on archaeal phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene PCR / A influência da escolha de iniciadores na filogenia de Archaea em ensaios de PCR para o gene rRNA 16S

Polymerase chain reaction (PCR) assays targeting 16S rRNA genes followed by DNA sequencing are still important tools to characterize microbial communities present in environmental samples. However, despite the crescent number of deposited archaeal DNA sequences in databases, until now we do not have a clear picture of the effectiveness and specificity of the universal primers widely used to describe archaeal communities from different natural habitats. Therefore, in this study, we compared the phylogenetic profile obtained when Cerrado lake sediment DNA samples were submitted to 16S rDNA PCR employing three Archaea-specific primer sets commonly used. Our findings reveal that specificity of primers differed depending on the source of the analyzed DNA. Furthermore, archaeal communities revealed by each primer pair varied greatly, indicating that 16S rRNA gene primer choice affects the community profile obtained, with differences in both taxon detection and operational taxonomic unit (OTU) estimates.

A amplificação de genes que codificam o rRNA 16S por reação em cadeia da polimerase (PCR) e o seu sub sequentesequenciamento consistem em uma ferramenta importante na caracterização de comunidades microbianas presentes em amostras ambientais. No entanto, apesar do crescente número de sequências de DNA de Archaea depositadas em bancos de dados, a especificidade e efetividade dos iniciadores de PCR descritos como universais e amplamente utilizados na descrição desse grupo ainda não está clara. Neste estudo foram comparados os perfis filogenéticos de comunidades de arqueias obtidos a partir amostras de DNA de sedimentos lacustres do Cerrado submetidas a ensaios de PCR empregando três pares de iniciadores específicos para Archaea, comumente utilizados neste tipo de estudo. Nossos resultados indicam que as comunidades de arqueias detectadas com cada par de iniciadores apresentaram grande variação filogenética, sugerindo que a escolha de iniciadores dirigidos ao gene de rRNA 16S tem efeito significativo no perfil da comunidade descrita, com diferenças tanto em relação aos táxons detectados, como nas estimativas de unidades taxonômicas operacionais (OTU).

The influence of primer choice on archaeal phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene PCR

Abstract Polymerase chain reaction (PCR) assays targeting 16S rRNA genes followed by DNA sequencing are still important tools to characterize microbial communities present in environmental samples. However, despite the crescent number of deposited archaeal DNA sequences in databases, until now we do not have a clear picture of the effectiveness and specificity of the universal primers widely used to describe archaeal communities from different natural habitats. Therefore, in this study, we compared the phylogenetic profile obtained when Cerrado lake sediment DNA samples were submitted to 16S rDNA PCR employing three Archaea-specific primer sets commonly used. Our findings reveal that specificity of primers differed depending on the source of the analyzed DNA. Furthermore, archaeal communities revealed by each primer pair varied greatly, indicating that 16S rRNA gene primer choice affects the community profile obtained, with differences in both taxon detection and operational taxonomic unit (OTU) estimates.

Resumo A amplificação de genes que codificam o rRNA 16S por reação em cadeia da polimerase (PCR) e o seu subsequente sequenciamento consistem em uma ferramenta importante na caracterização de comunidades microbianas presentes em amostras ambientais. No entanto, apesar do crescente número de sequências de DNA de Archaea depositadas em bancos de dados, a especificidade e efetividade dos iniciadores de PCR descritos como universais e amplamente utilizados na descrição desse grupo ainda não está clara. Neste estudo foram comparados os perfis filogenéticos de comunidades de arqueias obtidos a partir amostras de DNA de sedimentos lacustres do Cerrado submetidas a ensaios de PCR empregando três pares de iniciadores específicos para Archaea, comumente utilizados neste tipo de estudo. Nossos resultados indicam que as comunidades de arqueias detectadas com cada par de iniciadores apresentaram grande variação filogenética, sugerindo que a escolha de iniciadores dirigidos ao gene de rRNA 16S tem efeito significativo no perfil da comunidade descrita, com diferenças tanto em relação aos táxons detectados, como nas estimativas de unidades taxonômicas operacionais (OTU).

Antibacterial activity of Thymus vulgaris (thyme) essential oil against strains of Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae and Staphylococcus saprophyticus isolated from meat product / Atividade antibacteriana do óleo essencial de Thymus vulgaris (tomilho) contra cepas de Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae e Staphylococcus saprophyticus isoladas de produtos cárneos

Meat products represent an important component of the human diet and are a good source of nutrients. Food-borne microorganisms are the main pathogens that cause human diseases as a result of food consumption, especially products of animal origin. The objective of the present research was to verify the antibacterial activity of the essential oil of Thymus vulgaris against strains of Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus saprophyticus isolated from meat products. For this, the analyses of Minimum Inhibitory Concentration (MIC) and Minimum Bactericidal Concentration (MBC) were performed in microdilution plates. The association of the product with antimicrobials was also studied using disk diffusion. And the anti-adherent activity, which was determined in the presence of sucrose, in glass tubes. Thyme oil showed a strong inhibitory activity against K. pneumoniae, P. aeruginosa and S. saprophyticus, with the MIC values ranging from 64 to 512 µg/mL, and bactericidal effect for most strains, with MBC values ranging from 256 to 1,024 µg/mL. T. vulgaris oil exhibited varied interactions in association with the antimicrobials, with synergistic (41.67%), indifferent (50%) and antagonistic (8.33%) effects. Regarding the anti-adherent activity, the test product was effective in inhibiting the adherence of all bacterial strains under study. Therefore, thyme oil presents itself as an antibacterial and anti-adherent agent against K. pneumoniae, P. aeruginosa and S. saprophyticus, being a natural product that can represent an interesting alternative in the efforts to combat foodborne diseases.

Os produtos cárneos representam um importante componente da dieta humana e constituem uma boa fonte de nutrientes. Microrganismos de origem alimentar são os principais patógenos que causam doenças humanas como resultado do consumo de alimentos, principalmente, produtos de origem animal. O objetivo da presente pesquisa foi verificar a atividade antibacteriana do óleo essencial de Thymus vulgaris frente às cepas de Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa e Staphylococcus saprophyticus isoladas de produtos cárneos. Para isso, foram realizadas as análises de Concentração Inibitória Mínima (CIM) e a Concentração Bactericida Mínima (CBM) em placas de microdiluição. Assim como, o estudo de associação do produto com antimicrobianos, realizado por difusão em disco. E a atividade antiaderente, que foi determinada na presença de sacarose, em tubos de vidro. O óleo de tomilho apresentou uma forte atividade inibitória contra K. pneumoniae, P. aeruginosa e S. saprophyticus, com os valores de CIM variando entre 64 a 512 µg/mL, e efeito bactericida para a maioria das cepas, com valores de CBM entre 256 a 1.024 µg/mL. O óleo de T. vulgaris exibiu interações variadas na associação com os antimicrobianos, com efeitos sinérgicos (41,67%), indiferente (50%) e antagonista (8,33%). Em relação a atividade antiaderente, o produto teste foi eficaz na inibição a aderência de todas cepas bacterianas em estudo. Portanto, o óleo de tomilho apresenta-se como agente antibacteriano e antiaderente frente a K. pneumoniae, a P. aeruginosa e a S. saprophyticus, sendo um produto natural que pode representar uma alternativa interessante nos esforços para combater doenças transmitidas por alimentos.

The influence of primer choice on archaeal phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene PCR / A influência da escolha de iniciadores na filogenia de Archaea em ensaios de PCR para o gene rRNA 16S

Abstract Polymerase chain reaction (PCR) assays targeting 16S rRNA genes followed by DNA sequencing are still important tools to characterize microbial communities present in environmental samples. However, despite the crescent number of deposited archaeal DNA sequences in databases, until now we do not have a clear picture of the effectiveness and specificity of the universal primers widely used to describe archaeal communities from different natural habitats. Therefore, in this study, we compared the phylogenetic profile obtained when Cerrado lake sediment DNA samples were submitted to 16S rDNA PCR employing three Archaea-specific primer sets commonly used. Our findings reveal that specificity of primers differed depending on the source of the analyzed DNA. Furthermore, archaeal communities revealed by each primer pair varied greatly, indicating that 16S rRNA gene primer choice affects the community profile obtained, with differences in both taxon detection and operational taxonomic unit (OTU) estimates.

Resumo A amplificação de genes que codificam o rRNA 16S por reação em cadeia da polimerase (PCR) e o seu subsequente sequenciamento consistem em uma ferramenta importante na caracterização de comunidades microbianas presentes em amostras ambientais. No entanto, apesar do crescente número de sequências de DNA de Archaea depositadas em bancos de dados, a especificidade e efetividade dos iniciadores de PCR descritos como universais e amplamente utilizados na descrição desse grupo ainda não está clara. Neste estudo foram comparados os perfis filogenéticos de comunidades de arqueias obtidos a partir amostras de DNA de sedimentos lacustres do Cerrado submetidas a ensaios de PCR empregando três pares de iniciadores específicos para Archaea, comumente utilizados neste tipo de estudo. Nossos resultados indicam que as comunidades de arqueias detectadas com cada par de iniciadores apresentaram grande variação filogenética, sugerindo que a escolha de iniciadores dirigidos ao gene de rRNA 16S tem efeito significativo no perfil da comunidade descrita, com diferenças tanto em relação aos táxons detectados, como nas estimativas de unidades taxonômicas operacionais (OTU).

Microbiological featuring of two neotropical fish species from the quilombola area of maranhão state, Brazil / Caracterização microbiológica de duas espécies de peixes neotropicais oriundas de área quilombola maranhense, Brasil

The aim of study is to feature the microbiological quality of two neotropical fish species from the quilombola area of Maranhão State, Brazil. In order to do so, 21 samples of Hoplerythrinus unitaeniatus and 21 samples of Cichlasoma bimaculatum were captured in flooded environment. Collected fish were euthanized in laboratory environment; muscle fragments were removed for microbiological analyses focused on enumerating molds and yeasts, viable strict and facultative mesophilic microorganisms and coagulase-positive staphylococci; on counting total and thermotolerant coliforms; and on investigating Escherichia coli and Salmonella sp. Microbiological results were compared to the Brazilian legislation, which establishes the list of microbiological standards for food products. Among the assessed fish, 9.52% were classified as non-acceptable for human consumption, based on the Salmonella parameter. Enumerated coagulase-positive staphylococci ranged from < 10 to 3.9 x 104 CFU/g; 9.52% of assessed fish were classified as having intermediate standard for human consumption, whereas 4.76% were classified as non-acceptable for such a purpose. E. coli counting ranged from 3.6 to > 1,100MPN/g; 4.76% of assessed fish were classified as having intermediate standard for human consumption, whereas 4.76% were classified as non-acceptable for such a purpose. Total and thermotolerant coliforms' counting and the enumeration of viable strict and facultative aerobic microorganisms, as well as of molds and yeasts, have evidenced high microbial population rates; this finding suggests poor hygienic conditions at capture site, contaminated raw material and risk of incidence of enteropathogens. This finding has evidenced imbalance in the investigated environment, as well as compromised aquatic biodiversity.(AU)

Objetivou-se caracterizar a qualidade microbiológica de duas espécies de peixes neotropicais oriundas de área qui-lombola maranhense, Brasil. Para isso, foram capturadas 21 amostras de Hoplerythrinus unitaeniatus e 21 amostras de Cichlasoma bimaculatum de ambiente alagável. No laboratório, os peixes foram eutanasiados, procedida a retirada dos fragmentos mus-culares e realizada as análises microbiológicas: enumeração de bolores e leveduras, micro-organismos mesófilos aeróbios estri-tos e facultativos viáveis e de estafilococos coagulase positiva, quantificação de coliformes totais e termotolerantes, pesquisa de Escherichia coli e Salmonella sp. Os resultados microbiológicos obtidos foram comparados com a legislação brasileira que estabelece a lista de padrões microbiológicos para alimentos. Dos peixes avaliados, 9,52% foram considerados inaceitáveis para consumo humano para o parâmetro Salmonella. A enumeração de estafilococos coagulase positivavariou de <10 a 3,9 x 104 UFC/g, sendo 9,52% dos peixes considerados com padrão intermediário e 4,76% inaceitáveis para consumo. A quanti-ficação de E. coli variou de 3,6 a >1.100 NMP/g, sendo 4,76% considerados com padrão intermediário e 4,76% inaceitáveis para consumo. A quantificação de coliformes totais e termotolerantes e a enumeração de micro-organismos aeróbios estritos e facultativos viáveis e bolores e leveduras revelou elevadas populações microbianas o que sugere más condições higiênicas do local de captura, matéria-prima contaminada e risco da presença de enteropatógenos, demonstrando desequilíbrio no ambiente estudado com comprometimento da biodiversidade aquática.(AU)

'Alecrim Pimenta' nanoformulated essential oil (Lippia sidoides) as additive in consortium silages / Óleo essencial nanoformulado de alecrim pimenta (Lippia sidoides) como aditivo em silagens consorciadas

The presence of spoilage microorganisms in forage interferes with the fermentation process of silage, due to competition with lactic acid bacteria for substrate, generating losses and influencing the nutritional value of the ensiled material. Thus, the objective is to evaluate the effect of "Alecrim Pimenta" essential oil (Lippia sidoides) and nanoformulated thymol on microbiological, fermentative and aerobic stability profile of sorghum (Sorghum bicolor cv. BRS Ponta Negra) silage intercropped with Paiaguás grass (Urochloa brizantha cv. BRS Paiaguás). A 4 x 3 factorial design was adopted, with four additives applied to the silages (control treatment; nanoformulated "Alecrim Pimenta" essential oil (OEN); 62% nanoformulated thymol; and 100% pure nanoformulated thymol), associated with three silo period times (15, 30 and 45 days), with five replications per treatment, totaling 60 mini silos. The Clostridium population was higher in the control treatment and in the OEN. The Lactobacillus population decreased with the increase in silo opening time. Higher aerobic stabilities were recorded in silages with 100% nanoformulated thymol with opening at 15 days; and silages with 62% nanoformulated Thymol (opening period at 30 and 45 days). Silages with 100% thymol provided higher losses of dry matter, gases and effluents, while the use of OEN provided lower losses of dry matter and gases. Silos opened at 45 days showed higher losses of dry matter, gases and effluents. Sorghum and Paiaguás grass silages that received nanoformulated thymol were more efficient in controlling Clostridium and Lactobacillus populations, and this additive improved the aerobic stability of the silage.

A presença de microrganismos deterioradores na forragem interfere no processo fermentativo da silagem, devido a competição com as bactérias ácido láticas por substrato, gerando perdas e influenciando o valor nutritivo do material ensilado. Assim, objetiva-se avaliar o efeito do óleo essencial de Alecrim pimenta (Lippia sidoides) e do timol nanoformulado sobre perfil microbiológico, fermentativo e estabilidade aeróbia de silagem do consórcio de Sorgo (Sorghum bicolor var. Ponta Negra) com capim Paiaguás (Urochloa brizantha cv. Paiaguás). Foi adotado esquema fatorial 4 x 3, quatro aditivos aplicados nas silagens (tratamento controle; óleo essencial de Alecrim pimenta nanoformulado (OEN); timol nanoformulado 62%; e timol nanoformulado 100% de pureza), associados a três tempos de abertura do silo (15, 30 e 45 dias), com cinco repetições por tratamento, totalizando 60 mini silos. A população de Clostridium foi maior no tratamento controle e no OEN. A população de Lactobacillus reduziu com o aumento no tempo de abertura do silo. Maiores estabilidades aeróbica foram registradas em silagens com timol nanoformulado 100% com abertura aos 15 dias; e silagens com Timol nanoformulado 62% (tempos de abertura aos 30 e 45 dias). Silagens com timol 100% proporcionaram maiores perdas de matéria seca, gases e efluentes, enquanto que o uso de OEN proporcionou menores perdas de matéria seca e gases. Silos com abertura aos 45 dias apresentaram maiores perdas de matéria seca, gases e efluentes. Silagens de Sorgo e capim Paiaguás que recebram timol nanoformulado foram mais eficientes em controlar as populações de Clostridium e Lactobacillus, bem como este aditivo melhorou a estabilidade aeróbica da silagem.

The influence of primer choice on archaeal phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene PCR / A influência da escolha de iniciadores na filogenia de Archaea em ensaios de PCR para o gene rRNA 16S

Polymerase chain reaction (PCR) assays targeting 16S rRNA genes followed by DNA sequencing are still important tools to characterize microbial communities present in environmental samples. However, despite the crescent number of deposited archaeal DNA sequences in databases, until now we do not have a clear picture of the effectiveness and specificity of the universal primers widely used to describe archaeal communities from different natural habitats. Therefore, in this study, we compared the phylogenetic profile obtained when Cerrado lake sediment DNA samples were submitted to 16S rDNA PCR employing three Archaea-specific primer sets commonly used. Our findings reveal that specificity of primers differed depending on the source of the analyzed DNA. Furthermore, archaeal communities revealed by each primer pair varied greatly, indicating that 16S rRNA gene primer choice affects the community profile obtained, with differences in both taxon detection and operational taxonomic unit (OTU) estimates.(AU)

A amplificação de genes que codificam o rRNA 16S por reação em cadeia da polimerase (PCR) e o seu sub sequentesequenciamento consistem em uma ferramenta importante na caracterização de comunidades microbianas presentes em amostras ambientais. No entanto, apesar do crescente número de sequências de DNA de Archaea depositadas em bancos de dados, a especificidade e efetividade dos iniciadores de PCR descritos como universais e amplamente utilizados na descrição desse grupo ainda não está clara. Neste estudo foram comparados os perfis filogenéticos de comunidades de arqueias obtidos a partir amostras de DNA de sedimentos lacustres do Cerrado submetidas a ensaios de PCR empregando três pares de iniciadores específicos para Archaea, comumente utilizados neste tipo de estudo. Nossos resultados indicam que as comunidades de arqueias detectadas com cada par de iniciadores apresentaram grande variação filogenética, sugerindo que a escolha de iniciadores dirigidos ao gene de rRNA 16S tem efeito significativo no perfil da comunidade descrita, com diferenças tanto em relação aos táxons detectados, como nas estimativas de unidades taxonômicas operacionais (OTU).(AU)

Evaluation of the antimicrobial effect of the Origanum vulgare L essential oil on strains of Klebsiella pneumoniae / Avaliação do efeito antimicrobiano do óleo essencial de Origanum vulgare L. sobre cepas de Klebsiella pneumoniae

Bacteria may be the initial cause of certain pathologies as well as a secondary agent responsible for the development of complications such as pressure ulcer infections. Pressure ulcers are a persistent health problem, especially in immunocompromised patients, and associated with infection by opportunistic microorganisms with antimicrobial resistance, such as Klebsiella pneumoniae, highlight the need for the development of new antimicrobial approaches. Thus, the aim of this study was to evaluate the antibacterial and anti-adherent activity of Origanum vulgare L. (oregano) essential oil against Klebsiella pneumoniae strains, as well as the effect of its association with synthetic antimicrobials. To this end, the Minimum Inhibitory Concentration (MIC) and Minimum Bactericidal Concentration (MBC) analyses were performed on microdilution plates. The assay of the Minimum Inhibitory Adherence Concentration (MIAC), with test tubes. As well as, the association study through the infusion disc method containing ampicillin (AMP), gentamicin (GEN), ciprofloxacin (CIP) and ceftriaxone (CEF). Therefore, it was possible to obtain that the essential oil of oregano presents antimicrobial and bactericidal activity, with MIC ranging between 128µg/mL and 256 µg/mL and MBC between 256 µg/mL and 512 µg/mL, on the tested K. pneumoniae strains. When used in association with ampicillin and gentamicin, oregano essential oil showed synergistic effect for some strains. Therefore, it is observed that the tested essential oil can act as a promising antibacterial in the treatment of diseases caused by K. pneumoniae.

As bactérias podem ser a causa inicial de determinadas patologias como também um agente secundário responsável pelo desenvolvimento de complicações como as infecções das lesões por pressão. As lesões por pressão configuram um problema de saúde persistente, principalmente em pacientes imunocomprometidos, e associadas a infecção por microrganismos oportunistas com resistência antimicrobiana, como por exemplo a Klebisiella pneumoniae, ressaltam a necessidade do desenvolvimento de novas abordagens antimicrobianas. Assim, o objetivo deste estudo foi avaliar a atividade antibacteriana e antiaderente do óleo essencial de Origanum vulgare L. (orégano) contra cepas da Klebisiella pneumoniae, bem como o efeito da sua associação com antimicrobianos sintéticos. Para isso foram realizadas as análises da Concentração Mínima Inibitória (CIM) e Concentração Bactericida Mínima (CBM) em placas de micro diluição. O ensaio da Concentração Mínima de Aderência (CIMA), com tubos de ensaio. Como também, o estudo de associação através do método de disco de infusão contendo ampicilina, gentamicina, ciprofloxacino e ceftriaxona. Assim sendo, foi possível obter que o óleo essencial de orégano apresenta atividade antimicrobiana e bactericida, com CIM variando entre 128µg/mL e 256 µg/mL e CBM entre 256 µg/mL e 512 µg/mL, sobre as cepas de K. pneumoniae testadas. Quando utilizado em associação com a ampicilina e gentamicina, o óleo essencial de orégano demonstrou efeito sinérgico para algumas cepas. Portanto, observa-se que o óleo essencial testado pode atuar como um promissor antibacteriano no tratamento de doenças causadas por K. pneumoniae.

Physicochemical and microbiological quality of refrigerated raw bovine milk commercialized in Presidente Médici, Rondônia state, Western Amazon, Brazil / Qualidade físico-química e microbiológica de leite bovino cru refrigerado comercializado em Presidente Médici, estado de Rondônia, Amazônia Ocidental, Brasil

The aimed of the study was to evaluate the quality of raw milk from some suppliers in rural and urban areas and to test the hypothesis that it is unsafe for direct consumption. The study was conducted with suppliers in rural and urban areas in Presidente Médici municipality, Rondônia state. The method of the Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (MAPA), was used, which consists of titrating a portion of the sample with a sodium hydroxide solution of known concentration, using phenolphthalein as an indicator. According to Brazilian legislation and literature, stability of Alizarol, foreign substances, Chloride, Hypochlorite, Hydrogen Peroxide and Colostrum were analyzed. Microbiological analysis, standard plate count (SPC) and quantification of thermotolerant coliforms were also performed using the most probable number (MPN) technique. Values above the limits established by legislation were found, mainly for temperature and titleable acidity, in addition to stability results against Alizarol and the presence of colostrum. There were high microbial contents with regard to SPC, and, in this case, the presence of pathogenic microorganisms cannot be disregarded. The presence of thermotolerant coliforms may indicate probable contact of milk with feces. Therefore, it is considered that the samples analyzed here are not safe for ingestion in the raw form.(AU)

O objetivo do estudo foi avaliar a qualidade do leite cru de alguns fornecedores da zona rural e urbana e tes-tar a hipótese de que não são seguros para o consumo direto. O estudo foi conduzido em fornecedores da zona rural e urbana do município de Presidente Médici, estado de Rondônia. Empregou-se o método do Ministério da Agricultura Pecuária e Abastecimento (MAPA), que consiste na titulação de uma porção da amostra por uma solução hidróxido de sódio de concentração conhecida, utilizando como indicador a fenolftaleína. Conforme a legislação brasileira e a lite-ratura, foram analisados estabilidade do Alizarol, substâncias estranhas, Cloreto, Hipoclorito, peróxido de Hidrogênio e Colostro. Foram realizadas também análises microbiológicas, contagem Padrão em Placa (CPP) e quantificação dos coliformes termotolerantes através da técnica do número mais provável (NMP). Foram encontrados valores acima dos limites estabelecidos pela legislação, principalmente para temperatura e acidez titulável, além dos resultados de estabili-dade frente ao Alizarol e da presença de colostro. Houve altos teores microbianos no que se refere à CPP, e, nesse caso, a presença de microrganismos patogênicos não pode ser desconsiderada. A presença de coliformes termotolerantes pode indicar provável contato do leite com fezes. Portanto, considera-se que as amostras aqui analisadas não são seguras para ingestão na forma crua.(AU)

Responses of Broiler Chickens Fed Low or High Non-Starch Polysaccharide Diets and the Addition of Humic Substances from a Worm Compost

The objective was to evaluate the productivity, microbiology and histopathology of the jejunum, ceca and liver in broilers fed a control or a high non-starch polysaccharide (HNSPs) diet added with an extract of humic substances (EHS). 240 broilers individually allocated, from 21-42 d of age were assigned to a factorial arrangement of 2 types of diets: 1) A corn/soybean meal diet (Control) and 2) As Control plus 7% distillers dried grain with solubles and 12% of wheat bran (HNSPs), and 3 growth promoters: 1) Antibiotic growth promoters (AGP); 2) without AGP (NAGP) and C) with 0.5% of EHS. At the end of the trial, the breast and carcass were weighed and samples of the intestine, ceca and liver were taken for microbial and histopathology analysis. Results were subjected to ANOVA. EHS-fed broilers had lower feed conversion ratio (FCR) and total aerobic bacterial (TAB) counts in the liver and higher ashes digestibility with the Control diet, but negative responses were seen with the HNSPs diet (Type of diet and growth promoter interaction, p≤0.05). The lesion scores in the jejunum were lower in EHS-fed broilers with the Control and HNSPs diet (p≤0.05). The TAB and E. coli were lower in the jejunum and ceca of AGP-fed broilers (p<0.01) compared to NAGP and EHS groups. EHS-fed broilers showed improved FCR and ileal ashes digestibility and lower TAB in the liver with the Control diet and had lower lesion score in the jejunum and similar weight gain compared to the AGP-fed broilers.(AU)

Análise microbiológica e físico-química do gelo utilizado na conservação de pescado em supermercados de Rio Branco - AC / Microbiological and physicochemical analysis of ice used in fish conservation in supermarkets in Rio Branco - AC

O gelo é fundamental para a conservação adequada do pescado, pois retarda o crescimento microbiano, preservando a qualidade físico-química, microbiológicas e características organolépticas. No entanto, o gelo pode ser fonte de risco para a saúde dos consumidores quando produzido sob más condições sanitárias. Pontos críticos devem ser controlados durante a etapa de produção e armazenagem do gelo, como, uso de água potável e condições higiênicas-sanitárias. A presença de altas populações de microrganismos heterotróficos e coliformes e a má qualidade físico-química do gelo utilizado para conservação de pescado pode representar um risco potencial ao consumidor, podendo ser veiculador de doenças como Salmonelose, infecção por Escherichia coli e intoxicação por Staphylococcus aureus, além de reduzir a vida útil de prateleira do produto. Neste contexto, a realização deste estudo teve como objetivo avaliar a qualidade microbiológica e físico-química do gelo utilizado na conservação de pescados comercializados em Rio Branco - AC. Foram analisadas 15 amostras de gelo coletadas em três diferentes supermercados. Foi preconizado a coleta de gelo fabricado com maquinário próprio e que fossem utilizados na comercialização do pescado fresco, que seriam expostos e resfriados em bancas de gelo no local. Foram colhidas 300g de gelo manualmente com uso de luvas e acondicionadas em frascos de vidros esterilizados, em caixa isotérmica. A qualidade microbiológica destas amostras foi analisada pela contagem de microrganismos heterotróficos mesófilos e psicrotróficos. Além disso, foi realizada a determinação do número mais provável de coliformes totais á 30°C, termotolerantes e a quantificação do pH e cloro residual livre das amostras. Com relação a determinação de microrganismos mesófilos, foram registrados valores entre 1,0x10¹ e 9,15x103 UFC/mL com amostras fora do padrão estabelecido pela Portaria MG/MS n°888/2021. A quantidade de psicrotróficos variou entre 1,0x10¹ e 89,8x10³ UFC/mL. Foi registrada a presença de coliformes totais á 30°C em 6 amostra e de termotolerantes em 4 amostras. Portanto, foi registrado variação nos padrões de qualidade dos gelos fabricados nos supermercados para conservação do pescado, constituindo risco potencial para a saúde dos consumidores.

The ice is essential for the proper conservation of fish, as it delays microbial growth, preserving the physical-chemical, microbiological and organoleptic characteristics. However, ice can be a source of health risk for consumers when produced under poor sanitary conditions. Critical points must be controlled during the ice production and storage stage, such as the of potable water and hygienic-sanitary conditions. The presence of high populations of heterotrophic and coliform microorganisms and the poor physicochemical quality of the ice used for fish conservation can represent a potential risk to the consumer, which can be a carrier of diseases such as Salmonellosis, Escherichia coli infection and Staphylococcus aureus poisoning, in addition to reducing the shelf life of the product. In this context, this study aimed to evaluate the microbiological and physical-chemical quality of the ice used in the conservation of fish marketed in Rio Branco - AC. 15 ice samples collected in three different supermarkets were analyzed. It was recommended the collection of ice manufactured with its own machinery and that it be used in the commercialization of fresh fish, which would be exposed and cooled in ice stalls on site 300g ice manually with the use of gloves and packed in sterilized glass bottles, in an isothermal box. The microbiological quality of these samples was analyzed by counting mesophilic and psychrotrophic heterotrophic microorganisms. In addition, the determination of the most probable number of total coliforms at 30°C, thermotolerant and the quantification of pH and free residual chlorine of the samples were performed. Regarding the determination of mesophilic microorganisms, values between 1,00x10¹ and 9,15x10³ UFC/mL were recorded with samples (60%) out of the standard established by Ordinance MG/MS No. 888/2021. The amount of psychrotrophs varied between 1,00x10¹ and 8,98x103 CFU/mL. The presence of total coliforms at 30°C was recorded in 6 samples and of thermotolerants in 4 samples. Therefore, there was a variation in the quality standards of ices manufactured in supermarkets for fish conservation, constituting a potential risk to the health of consumers.

Effects of Medium Chain Fatty Acid Supplementation in Broiler Diet on Microbiological Quality of Litter

In our experiment, coconut and palm oil supplementation was added to the diet of broiler chickens to prove the hypothesis that medium chain fatty acids (MCFAs) can reduce the occurrence of potential pathogens (Clostridium perfingens, Coliform) in gut microflore and therefore improve bird welfare. Cobb 500 cockerels were divided in five groups. Control birds were fed commercial broiler diet, while birds in the four treatment group diets were supplemented with coconut, palm oil, or a combination of the two, respectively. As a positive control, sunflower oil supplementation was included in the diet of the fifth group. During the 28 days of the study (from 14 to 42 days of life), 5 samplings were scheduled, when excreta samples were taken from the litter to analyse total microbial count and the number of Clostridia, Coliforms, and Salmonella. According to the results of microbiological analysis, coconut oil supplementation led to the continuous decline of Clostridium perfringens numbers until they vanished by the end of the experimental period. A similar but faster decline was found as a result of palm oil and the combined (palm oil+coconut oil) treatment. However, the number of Coliforms and total microbial count changed only slightly by the end of the study. No Salmonella spp. was present in the samples throughout the experiment. Altogether, coconut and palm oil supplementation has a beneficial effect on the microbiological composition of poultry litter.(AU)

Effects of Medium Chain Fatty Acid Supplementation in Broiler Diet on Microbiological Quality of Litter

In our experiment, coconut and palm oil supplementation was added to the diet of broiler chickens to prove the hypothesis that medium chain fatty acids (MCFAs) can reduce the occurrence of potential pathogens (Clostridium perfingens, Coliform) in gut microflore and therefore improve bird welfare. Cobb 500 cockerels were divided in five groups. Control birds were fed commercial broiler diet, while birds in the four treatment group diets were supplemented with coconut, palm oil, or a combination of the two, respectively. As a positive control, sunflower oil supplementation was included in the diet of the fifth group. During the 28 days of the study (from 14 to 42 days of life), 5 samplings were scheduled, when excreta samples were taken from the litter to analyse total microbial count and the number of Clostridia, Coliforms, and Salmonella. According to the results of microbiological analysis, coconut oil supplementation led to the continuous decline of Clostridium perfringens numbers until they vanished by the end of the experimental period. A similar but faster decline was found as a result of palm oil and the combined (palm oil+coconut oil) treatment. However, the number of Coliforms and total microbial count changed only slightly by the end of the study. No Salmonella spp. was present in the samples throughout the experiment. Altogether, coconut and palm oil supplementation has a beneficial effect on the microbiological composition of poultry litter.

Wooden sticks for plaque streaking and microbiological inoculation might be more cost- effective, but is its large scale use feasible? Quality control methods and proof of concept / Métodos de controle de qualidade e prova de conceito para a utilização de palitos de madeira em microbiologia podem ser mais econômicas, mas seu uso em larga escala é viável? Método de controle de qualidade e prova de conceito

The loop is a material classically used in the laboratory for the purpose of plate streaking and handling biological materials. However, metal loops techniques might be time consuming, considering the amount of time spent to guarantee its cooling process through each inoculation. Furthermore, plastic loops may also represent environmental issues during its production and discard process and can also represent higher costs for the laboratory. Thus, in situations of limited resources, even the simplest materials can be restricted due to logistical and budgetary issues, especially in developing countries. Inspired by demands like these, facing an occasional shortage of supply of laboratory plastic handles, we hereby present a quality control for sterilization methods and cost-effectiveness studies towards the use of wooden sticks in a Latin American country and we discuss the possibility of the large-scale use of this technique.

A alça calibrada é um material usado classicamente em laboratório para fins de inoculação em placas e manuseio de materiais biológicos. No entanto, as técnicas de alças metálicas podem consumir muito tempo, considerando a quantidade de tempo gasto para garantir seu processo de resfriamento a cada inoculação. Além disso, alças de plástico também podem representar questões ambientais durante o processo de produção e descarte e também podem representar custos mais altos para o laboratório. Assim, em situações de recursos limitados, até os materiais mais simples podem ser restringidos devido a questões logísticas e orçamentárias, especialmente nos países em desenvolvimento. Inspirados por demandas como essas, diante de uma escassez ocasional de suprimentos de alças de plástico de laboratório, apresentamos um controle de qualidade para métodos de esterilização e estudos de custo-efetividade para o uso de varas de madeira em um país latino-americano e discutimos a possibilidade de grande uso em escala dessa técnica.

Wooden sticks for plaque streaking and microbiological inoculation might be more cost- effective, but is its large scale use feasible? Quality control methods and proof of concept

Abstract The loop is a material classically used in the laboratory for the purpose of plate streaking and handling biological materials. However, metal loops techniques might be time consuming, considering the amount of time spent to guarantee its cooling process through each inoculation. Furthermore, plastic loops may also represent environmental issues during its production and discard process and can also represent higher costs for the laboratory. Thus, in situations of limited resources, even the simplest materials can be restricted due to logistical and budgetary issues, especially in developing countries. Inspired by demands like these, facing an occasional shortage of supply of laboratory plastic handles, we hereby present a quality control for sterilization methods and cost-effectiveness studies towards the use of wooden sticks in a Latin American country and we discuss the possibility of the large-scale use of this technique.

Resumo A alça calibrada é um material usado classicamente em laboratório para fins de inoculação em placas e manuseio de materiais biológicos. No entanto, as técnicas de alças metálicas podem consumir muito tempo, considerando a quantidade de tempo gasto para garantir seu processo de resfriamento a cada inoculação. Além disso, alças de plástico também podem representar questões ambientais durante o processo de produção e descarte e também podem representar custos mais altos para o laboratório. Assim, em situações de recursos limitados, até os materiais mais simples podem ser restringidos devido a questões logísticas e orçamentárias, especialmente nos países em desenvolvimento. Inspirados por demandas como essas, diante de uma escassez ocasional de suprimentos de alças de plástico de laboratório, apresentamos um controle de qualidade para métodos de esterilização e estudos de custo-efetividade para o uso de varas de madeira em um país latino-americano e discutimos a possibilidade de grande uso em escala dessa técnica.

Spray chilling on carcass weight loss, and physicochemical and microbiological quality of beef cuts during storage / Efeitos da aspersão de carcaças na perda de peso e na qualidade físico-química e microbiológica de cortes cárneos bovinos durante estocagem

Different chilling treatments are used before meat storage. The effect of spray chilling (SC) on meat quality appears to vary. Here, we investigated the effects of SC on beef carcass weight loss and meat quality during subsequent storage. The 2-h SC program tested involved 180-s initial spraying, followed by 60-s spray cycles at 540-s intervals. Deboned chuck tender (IMPS 116B) beef cuts were vacuum-packaged and stored for up to 60 d. Purge and cooking losses, Warner-Bratzler shear force, meat colour [CIE L*, a*, b*], and microbiological quality were evaluated. SC reduced carcass weight loss (P<0.001) compared with conventional chilling. However, storage time affected the purge and cooking losses, and Warner-Bratzler shear force. CIE a* and b* values increased (P<0.05) after 30-d aging in both chilling treatments. Pronounced psychrotrophic growth was observed during storage after both treatments. In conclusion, SC can be used to reduce the economic losses associated with meat chilling, without affecting meat quality attributes.

Diferentes tratamentos de resfriamento são utilizados antes da estocagem das carnes. O efeito da aspersão de carcaças (SC) na qualidade da carne parece variar. Neste estudo, investigou-se os efeitos da aspersão de carcaças bovinas na perda de peso e na qualidade da carne durante subsequente estocagem. O programa de aspersão testado foi de um tempo total de 2 h, com uma aspersão inicial de 180 s, seguida por ciclos de aspersão de 60 s em intervalos de 540 s. Os cortes comerciais desossados "Peixinho" (IMPS 116B) foram embalados a vácuo e estocados por até 60 dias. Foram avaliadas as perdas por exsudação e cozimento, força de cisalhamento por Warner-Bratzler, cor da carne (CIE L*, a*, b*) e qualidade microbiológica. SC reduziu a perda de peso da carcaça (P < 0,001) em comparação com o resfriamento convencional. No entanto, o tempo de estocagem influenciou a perda por exsudação, por cozimento e força de cisalhamento. Os valores de CIE a* e b* aumentaram (P < 0,05) após 30 dias de maturação em ambos os tratamentos de resfriamento. O crescimento pronunciado de psicrotróficos foi observado durante a estocagem em ambos os tratamentos. Em conclusão, o SC pode ser usado para reduzir as perdas econômicas associadas ao resfriamento da carne, sem afetar os atributos de qualidade da carne.

Bactérias resistentes a antibióticos em ambiente aquático: efeito na produção animal / Antibiotic resistant bacteria in aquatic environment: effect on animal production

Objetivou-se discorrer sobre bactérias resistentes a antibióticos veiculadas em ambientes aquáticos, considerando os mecanismos, formas de aquisição e os efeitos à produção animal. A utilização de antibióticos para fins profiláticos, terapêuticos e agropecuários cresceu em larga escala nos últimos anos, levando à perda de eficiência no combate a patógenos. A crise atual dos antibióticos é decorrente de uma falha geral em compreender de forma abrangente a evolução, as fontes, a disseminação e os mecanismos moleculares da resistência, pois os reservatórios ambientais potenciais e suas diversidades genéticas de resistência associadas geralmente não são considerados no desenvolvimento de drogas. Assim, a pressão de seleção aplicada pelos antibióticos em diversos ambientes tem promovido a evolução e disseminação de genes de resistência bacteriana em escala mundial, nos mais variados tipos de ambientes. Resíduos antibióticos persistem no solo e em ambientes aquáticos, este último, atuando como importante reservatório de bactérias, facilitando a troca de material genético entre bactérias ambientais e patogênicas e permitindo a disseminação de genes e modificações no resistoma ambiental. Desta forma, existe uma preocupação tanto para a medicina humana quanto a veterinária devido a diversidade de doenças causadas em humanos e animais domésticos por bactérias multirresistentes. Entender as origens, diversidade e mecanismos de resistência com potencial para impactar animais de produção é de grande importância para identificar os riscos associados a interação entre bactérias de diferentes ecossistemas e o impacto destas à produção animal, seja pelo comprometimento da saúde dos animais e/ou pela contaminação dos produtos produzidos por estes e consequentes danos à saúde humana.

The present review aimed to discuss antibiotic-resistant bacteria transmitted in aquatic environments, regarding the mechanisms, forms of acquisition, and the effects on animal production. The use of antibiotics for prophylactic, therapeutic, and agricultural purposes has grown on a large scale in recent years, leading to a loss of efficiency in combating pathogens. The current antibiotic crisis arises from a general failure to comprehensively understand the evolution, sources, dissemination, and molecular mechanisms of resistance, as potential environmental reservoirs and their associated resistance genetic diversity are generally not considered in drug development. Thus, the selection pressure applied by antibiotics in different environments has promoted the evolution and dissemination of bacterial resistance genes on a worldwide scale, in the most varied types of environments. Antibiotic residues persist in soil and aquatic environments, the latter acting as an important reservoir of bacteria, facilitating the exchange of genetic material between environmental and pathogenic bacteria and allowing the dissemination of genes and modifications in the environmental resistome. Thus, there is a concern for both human and veterinary medicine due to the diversity of diseases caused in humans and domestic animals by multiresistant bacteria. Understanding the origins, diversity, and resistance mechanisms with the potential to impact farm animals is of great importance to identify the risks associated with the interaction between bacteria from different ecosystems and their impact on animal production, either by compromising the health of animals and/or by the contamination of products produced by them and consequent damage to human health.