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1.
Ciênc. rural (Online) ; 53(7): e20220089, 2023. tab
Artigo em Inglês | LILACS-Express | VETINDEX | ID: biblio-1404286

Resumo

ABSTRACT: This research studied the genetic control of the traits related to melon fruit quality. The F1, F2, BC1, BC2 generations from the OL x A-16 and OL x PV crossings were evaluated in two separate trials conducted in randomized blocks with three replications. The evaluated traits were: average fruit weight, shape index, pulp thickness, pulp firmness, soluble solids content and cracking rate. The analyses were accomplished through a classic study of generations involving mixed models. The parameters on heritability and number of loci controlling the traits were evaluated in a broad and narrow sense. The inheritance of the evaluated traits is complex, presenting one gene of greater effect and polygenes with additive and dominant effects.


RESUMO: Objetivou-se com este trabalho estudar o controle genético de caracteres relacionados à qualidade do fruto do melão. Foram avaliadas as gerações F1, F2, RC1, RC2 dos cruzamentos OL x A-16 e OL x PV em dois ensaios separados conduzidos em blocos casualizados com três repetições. Os caracteres avaliados foram: peso médio do fruto, índice de formato, espessura da polpa, firmeza da polpa, sólidos solúveis e porcentagem de rachadura. As análises foram feitas por meio de estudo clássico de gerações envolvendo modelos mistos. Foram estimados os parâmetros de herdabilidades nos sentidos amplo e restrito e número de loci que controlam o caráter. A herança dos caracteres estudados é complexa com a presença de gene de efeito maior e poligenes com efeitos aditivos e de dominância.

2.
Sci. agric ; 78(2): e20190179, 2021. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1497936

Resumo

The purpose of this study was to conduct selection, genetic parameter estimation, and prediction of genetic values for 18 S1 families of guava trees using mixed model methodology and simultaneous selection of traits by means of the additive selection index, multiplicative selection index, and mean rank adapted from Mulamba. All families analyzed were obtained by means of self-fertilization of superior genotypes (full siblings) from the genetic breeding program of guava trees at the Universidade Estadual do Norte Fluminense. An experimental randomized block design with 18 S1 families, three replicates, and ten plants per plot was used. A total of 540 genotypes (individual plants) of guava tree were evaluated. Genetic parameter estimation and selection of the best genotypes based on the genetic value were performed using the statistical procedure, from the Selegen-REML/BLUP program. The analyses of the additive selection index, multiplicative selection index, and the sum of rank adapted from Mulamba were also performed under the Selegen program. During the evaluation by the individual BLUPs, families 1, 12, 4, 6, and 8 contributed to most of the genotypes selected for the traits under evaluation, suggesting their significant potential to generate high quality and high yield genotypes. In the selection indexes via mixed models, the multiplicative index showed higher values for genetic gains (74 %), followed by the mean rank index adapted from Mulamba (19 %), and the additive index (2%).


Assuntos
Fenômenos Genéticos , Psidium/genética , Seleção Genética
3.
Sci. agric. ; 78(2): e20190179, 2021. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-27724

Resumo

The purpose of this study was to conduct selection, genetic parameter estimation, and prediction of genetic values for 18 S1 families of guava trees using mixed model methodology and simultaneous selection of traits by means of the additive selection index, multiplicative selection index, and mean rank adapted from Mulamba. All families analyzed were obtained by means of self-fertilization of superior genotypes (full siblings) from the genetic breeding program of guava trees at the Universidade Estadual do Norte Fluminense. An experimental randomized block design with 18 S1 families, three replicates, and ten plants per plot was used. A total of 540 genotypes (individual plants) of guava tree were evaluated. Genetic parameter estimation and selection of the best genotypes based on the genetic value were performed using the statistical procedure, from the Selegen-REML/BLUP program. The analyses of the additive selection index, multiplicative selection index, and the sum of rank adapted from Mulamba were also performed under the Selegen program. During the evaluation by the individual BLUPs, families 1, 12, 4, 6, and 8 contributed to most of the genotypes selected for the traits under evaluation, suggesting their significant potential to generate high quality and high yield genotypes. In the selection indexes via mixed models, the multiplicative index showed higher values for genetic gains (74 %), followed by the mean rank index adapted from Mulamba (19 %), and the additive index (2%).(AU)


Assuntos
Psidium/genética , Seleção Genética , Fenômenos Genéticos
4.
Sci. agric ; 74(6): 481-488, Nov.-Dec.2017. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1497671

Resumo

Maize plants can be N-use efficient or N-stress tolerant. The first have high yields in favorable environments but is drastically affected under stress conditions; whereas the second show satisfactory yields in stressful environments but only moderate ones under optimal conditions. In this context, our aim was to assess the possibility of selecting tropical maize lines that are simultaneously N-stress tolerant and N-use efficient and check for differences between simultaneous selection statistical methods. Sixty-four tropical maize lines were evaluated for Nitrogen Agronomic Efficiency (NAE) and Low Nitrogen Tolerance (LNTI) response indices and two per se selection indices, Low Nitrogen Agronomic Efficiency (LNAE) and Harmonic Mean of Relative Performance (HMRP). We performed eight selection scenarios: LNAE; HMRP; Additive index; Mulamba-Mock index; and Independent culling levels. The last three was predicted by REML/BLUP single-trait and multi-trait using genotypic values of NAE and LNTI. The REML/BLUP multi-trait analysis was superior to the single-trait analysis due to high unfavorable correlation between NAE and LNTI. However, the accuracy and genotypic determination coefficient of NAE and LNTI were too low. Thus, neither single- nor multi-trait analysis achieved a good result for simultaneous selection nor N-use efficiency nor N-stress tolerance. LNAE obtained satisfactorily accurate values and genotypic determination coefficient, but its performance in selection gain was worse than HMRP, particularly in terms of N-use efficiency. Therefore, because of the superior performance in accuracy, genotypic determination coefficient and selection, HMRP was considered the best simultaneous selection methodology of the scenarios tested for N-use efficiency and N-stress tolerance.


Assuntos
Fatores Abióticos/análise , Zea mays/crescimento & desenvolvimento , Zea mays/efeitos adversos , Zea mays/química
5.
Sci. agric. ; 74(6): 481-488, Nov.-Dec.2017. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-15597

Resumo

Maize plants can be N-use efficient or N-stress tolerant. The first have high yields in favorable environments but is drastically affected under stress conditions; whereas the second show satisfactory yields in stressful environments but only moderate ones under optimal conditions. In this context, our aim was to assess the possibility of selecting tropical maize lines that are simultaneously N-stress tolerant and N-use efficient and check for differences between simultaneous selection statistical methods. Sixty-four tropical maize lines were evaluated for Nitrogen Agronomic Efficiency (NAE) and Low Nitrogen Tolerance (LNTI) response indices and two per se selection indices, Low Nitrogen Agronomic Efficiency (LNAE) and Harmonic Mean of Relative Performance (HMRP). We performed eight selection scenarios: LNAE; HMRP; Additive index; Mulamba-Mock index; and Independent culling levels. The last three was predicted by REML/BLUP single-trait and multi-trait using genotypic values of NAE and LNTI. The REML/BLUP multi-trait analysis was superior to the single-trait analysis due to high unfavorable correlation between NAE and LNTI. However, the accuracy and genotypic determination coefficient of NAE and LNTI were too low. Thus, neither single- nor multi-trait analysis achieved a good result for simultaneous selection nor N-use efficiency nor N-stress tolerance. LNAE obtained satisfactorily accurate values and genotypic determination coefficient, but its performance in selection gain was worse than HMRP, particularly in terms of N-use efficiency. Therefore, because of the superior performance in accuracy, genotypic determination coefficient and selection, HMRP was considered the best simultaneous selection methodology of the scenarios tested for N-use efficiency and N-stress tolerance.(AU)


Assuntos
Zea mays/efeitos adversos , Zea mays/química , Zea mays/crescimento & desenvolvimento , Fatores Abióticos/análise
6.
Tese em Inglês | VETTESES | ID: vtt-219852

Resumo

A literatura relata que os teores de nutrientes são fatores importantes para predizer o consumo de matéria seca (CMS), desempenho animal (GMD) e emissões de metano (CH4) de ruminantes (Capítulo I). Este estudo utilizou dados de ovinos e bovinos em pastejo, coletados em cinco experimentos diferentes. Os critérios para os estudos selecionados foram a disponibilização de dados de CMS, GMD, estrutura do pasto, conteúdo de nutrientes da forragem aparentemente ingerida e medição in vivo das emissões de CH4 dos animais. Os dados foram analisados por meio de regressão e modelos mistos para identificar o nível de importância dos componentes nutritivos da forragem sobre o CMS, GMD e emissões de CH4. Os modelos de regressão foram significativos (P<0.01) em relação aos componentes nutritivos da forragem representados pela proteína bruta (R²: CMS = 0.02; GMD = 0.19; CH4 = 0.07), fibra em detergente neutro (R²: CMS = 0.11; GMD = 0.14; CH4 = 0.01) e fibra em detergente ácido (R²: CMS = 0.10; GMD = 0.10; CH4 = 0.01), porém com baixo coeficiente de determinação. Os resultados mostram que em sistemas pastoris existem outros fatores como a estrutura do pasto, representada pela massa de forragem (R²: CMS = 0.11; GMD = 0.28; CH4 = 0.36), altura do pasto (R²: CMS = 0.27; GMD = 0.39; CH4 = 0.31) e oferta de forragem instantânea (R²: CMS = 0.19; GMD = 0.19; CH4 = 0.35), possuem maior poder explicativo do que os componentes nutritivos da forragem. Foram gerados modelos mistos com a inclusão de efeitos fixos (componentes nutritivos da forragem e estrutura do pasto) e aleatórios (e.g., espécie animal, tipo de pastagem, experimento) que apresentaram R2 de 84.5, 94.9 e 68.0% para CMS, GMD e CH4, respectivamente. Dentro do total explicado pelo modelo, 12.4, 12.0 e 4.6% foram representados pelos teores de nutrientes da forragem, enquanto que 13.7, 8.8 e 18.4% foram explicados pela estrutura do pasto nos modelos para CMS, GMD e CH4, respectivamente. Observou-se maior influência dos efeitos aleatórios (i.e. espécie animal, tipo de pastagem e unidade experimental) nas variáveis estudadas (Capítulo II). Os resultados mostram que em sistemas de pastejo, a estrutura do pasto torna-se semelhante ou mais importante do que o conteúdo de nutrientes da forragem na determinação de CMS, GMD e CH4 em bovinos e ovinos. Além disso, existe uma gama de fatores associados às variáveis aleatórias que não são totalmente compreendidos na literatura, tornando-se um grande potencial a ser estudado, uma vez que o poder explicativo dessas variáveis foi maior do que os efeitos fixos do modelo (componentes nutritivos e estrutura do pasto) (Capítulo III).


The literature reports that nutrients content are important factors to predict dry matter intake (DMI), animal performance (ADG) and methane (CH4) emissions of ruminants (Chapter I). The study used data from five trials with sheep and cattle grazing different grasslands. The criteria for the selected studies were the availability of data on DMI, ADG, sward structure, forage nutrient content and in vivo measurement of animals CH4 emissions. The data were analyzed using regression and mixed models to identify the importance level of forage nutrient content in the results of DMI, ADG and CH4 emissions. The regression models were significant (P< 0.01) in relation to forage nutrient content represented by crude protein (R²: DMI = 0.02; ADG = 0.19; CH4 = 0.07), neutral detergent fiber (R²: DMI = 0.11; ADG = 0.14; CH4 = 0.01) and acid detergent fiber (R²: DMI = 0.10; ADG = 0.10; CH4 = 0.01), but with low explanatory power. The results shows that in grazing ecosystems there are other factors, such as sward structure, represented by the herbage mass (R²: DMI = 0.11; ADG = 0.28; CH4 = 0.36), sward height (R²: DMI = 0.27; ADG = 0.39; CH4 = 0.31) and lastly, herbage allowance (R²: DMI = 0.19; ADG = 0.19; CH4 = 0.35), presenting greater explanatory power than nutrient components of the forage. Mixed models were generated with fixed (forage nutrient content and sward structure) and random effects (animal species, type of pasture, experimental unit) that presented R² of 84.5, 94.9 and 68.0% for DMI, ADG and CH4 emissions, respectively. Within the total explained by the model, 12.4, 12.0 and 4.6% were represented by the forage nutrient content and 13.7, 8.8 and 18.4% explained by sward structure in the models for DMI, ADG and CH4, respectively. There was a greater influence of random (i.e. animal species, type of pasture and experimental unit) on the variables studied (Chapter II). The results show that in grazing systems, the sward structure becomes similar or more important than the nutrient content of the forage in determining CMS, ADG and CH4 in cattle and sheep. Besides, there is a range of factors associated with random variables that are not fully understood in the literature, making it a great potential to be studied, since the explanatory power of these variables was greater than the fixed effects of the model (nutritional components and sward structure) (Chapter III).

7.
Ci. Rural ; 46(3): 411-417, Mar. 2016. tab, graf
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-27642

Resumo

O objetivo foi avaliar os componentes da variância fenotípica e estimar a influência da interação genótipo*ambiente no rendimento de grãos em feijão. Os componentes da variância fenotípica foram estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita e do melhor preditor linear não viesado (REML/BLUP), juntamente com o espaço de inferência específico. As avaliações foram realizadas nas safras agrícolas de 2006/07 a 2011/12 no município de Lages/SC. Durante o período, 104 genótipos foram avaliados. Os dados são desbalanceados, sendo que 13 genótipos permaneceram nos ensaios em todos os anos. Observando os resultados, foi possível visualizar que a grande variação (59,0%) no comportamento dos genótipos ao longo dos anos é atribuída principalmente à variância do ambiente (2a=436.245). Houve diferença significativa entre genótipos para todos os ambientes. Porém, a diferença entre eles foi constante, ou seja, os genótipos não responderam de modo diferenciado frente aos ambientes. A interação genótipo*ambiente (2ga=1.368) responde preponderantemente por uma ínfima alteração (0,2%) na variação fenotípica, não discriminando de genótipos de feijão quanto ao rendimento de grãos em Lages/SC. Este fato favorece programas de melhoramento vegetal, onde a interação genótipo*ambiente poderia dificultar a distinção, seleção e recomendação de constituições genotípicas superiores. Nessa situação, processos de recomendação de cultivares (ensaio de valor de cultivo e uso - VCU) que mantenham os mesmos genótipos dispensam avaliações sucessivas, pois o ranqueamento é paralelo no decorrer dos anos.(AU)


The objective of this research was to evaluate the phenotypic variance components and estimate the influence of interaction genotype*environment in grain yield of beans. The variance components were estimated by the method restricted maximum likelihood and best linear unbiased prediction (REML / BLUP), along with the specific space of inference. Data were collected during the crop seasons 2006/07 to 2011/12 in Lages, SC - Brazil. During this period, 104 genotypes were evaluated. The data are unbalanced and 13 genotypes remained presents in all the assays years. Observing the results it was possible to see that the large variation (59.0%) in the performance of genotypes over the years is primarily attributable to the variance of the environment (2a=436245). There were significant differences among genotypes for all environments, but the difference between them were constant, ie, the genotypes did not respond differently in environments. Genotype*environment responds primarily by very small changes (0.2%) in the phenotypic variation (2ga=1368), with no parameters to discriminate the grain yield of genotypes in Lages, SC - Brazil. This fact makes easier the selection in plant breeding programs, where interaction genotype*environment could hinder distinction and selection of superior genotypic constitutions. In this situation, the processes of recommendation from improved lines (assay value for cultivation and use - VCU) that maintain the same genotypes dispense successive evaluations, since the ranking is parallel over the years.(AU)


Assuntos
Melhoramento Vegetal , Phaseolus/genética , Genótipo
8.
Semina ciênc. agrar ; 37(4): 2269-2280, 2016.
Artigo em Inglês | LILACS-Express | VETINDEX | ID: biblio-1500410

Resumo

The aim of this work is to develop a software tool that provides a user-friendly graphical interface of generic and configurable design in order to ease the researchers tasks in data manipulation and analysis. Two primary targets have influenced the design: data preparation for analysis in animal breeding programs and usability increase for those applications that perform important analysis methods, but interact with users only through text files and command lines. The Guaiaca tool was designed as a utility belt in the form of two integrated assistants, and it can be combined with multiple analysis applications. This tool offers facilities to: (a) collect, manipulate, and reorganize data; (b) organize, register, and retrieve analyses through descriptors; and (c) prepare and activate analysis processes. Guaiacas Execution Assistant module is described in this paper, where is also emphasized the parameters to configure, the main data structures to maintain, and the form of the relationship between its generic interface and combined analysis applications. The generic interface has been customized and validated for the peculiarities of two applications, WOMBAT (mixed models) and INTERGEN (Bayesian models). Several data analyses were performed with the interface support to prove its generality and ease of installation, configuration and operation. Data sets from 5,726 quails in


O objetivo deste trabalho foi desenvolver uma ferramenta de software com interface gráfica amigável, genérica e configurável, para facilitar pesquisadores na organização e gerenciamento das atividades de manipulação e análises de dados. A concepção foi baseada nas características de dois focos principais: a preparação de dados para análises em pesquisas de melhoramento genético de animais e o incremento da usabilidade para aplicativos que implementam importantes métodos de análises, mas interagem com o usuário via arquivos de texto e linha de comando. A ferramenta Guaiaca foi modelada como um cinto de utilidades e desenvolvida na forma de dois assistentes integrados. Pode ser combinada com múltiplos aplicativos executores de análises. Oferece facilidades para: coleta, manipulação e reorganização de dados; organização, catalogação e recuperação de análises via descritores; ativação de processos de análise. Apresenta-se uma descrição sobre o Assistente de Execução destacando os parâmetros configuráveis, as estruturas de dados mantidas e a forma de relacionamento entre a interface genérica e os aplicativos de análise combinados. A personalização de sua interface foi testada para peculiaridades dos aplicativos WOMBAT (modelos mistos) e INTERGEN (modelos bayesianos). Foram realizadas diversas análises para comprovar sua generalidade e facilidade de instalação, configuração e opera

9.
Ci. Rural ; 45(6): 993-999, June 2015. tab
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-76311

Resumo

Este trabalho objetivou avaliar diferentes estruturas da matriz de variâncias e covariâncias residual (), quanto ao ajustamento de dados longitudinais via modelos mistos, em experimentos varietais de cana-de-açúcar. A seleção adequada desta matriz garante a escolha de um modelo mais representativo dos dados. Em cada modelagem, variou-se ainda a suposição associada aos efeitos de tratamentos (variedades), como fixos e aleatórios. Quatro ensaios varietais, conduzidos entre 2005 e 2009, em três localidades do Estado de Goiás, foram considerados. Cada experimento foi delineado em blocos casualizados com três ou quatro repetições. A variável resposta analisada foi toneladas de colmos por hectare (TCH). Para avaliar a qualidade de ajustamento dos modelos, foram utilizados o critério de informação de Akaike (AIC) e o teste da razão de verossimilhanças. Este último foi utilizado apenas para comparar modelos hierárquicos, tomados dois a dois. Constatou-se que as análises pelo modelo univariado clássico de parcelas subdivididas oscilaram entre as piores ou entre aquelas de ajustes apenas medianos. As estruturas da matriz com os melhores ajustamentos variaram entre os ensaios, com destaque para a matriz não-estruturada. Tais resultados revelam que a estrutura de erros independentes, em geral, não se mostra adequada para esse tipo de análise e, também, que não é seguro definir previamente uma estrutura específica de para tais ensaios. Pequenas alterações foram observadas na classificação das estruturas ao se assumirem os efeitos de tratamentos como fixos ou aleatórios; porém, sem efeito importante na classificação das melhores estruturas em cada ensaio.(AU)


This study aimed to evaluate different residual structures of variance-covariance matrix (), regarding the fitting of longitudinal data via mixed models in variety trials of sugarcane. The adequate choice of this matrix provides most representative models to the data. In each model was also evaluated the effects of treatments (varieties), either as fixed or as random. Four trials were carried out in three locations in the Goiás State, Brazil, from 2005 to 2009. Each experiment was designed in randomized complete block with three or four repetitions. The response variable analyzed was tons of stalks per hectare (TCH). The goodness of fitting of the different models to the data was assessed by Akaike information criterion (AIC) and by likelihood ratio test (LRT). This last statistic was used only to compare nested models, two by two. It was observed that classic model in split-plot design ranged among the worst or with just median adjustments. The structures of matrix with the best fittings to the data varied among trials, with outstanding for the unstructured matrix. These results show that the structure of independent errors, in general, is not adequate for these analyses, and a prior definition of the co-variance structure can lead to unreliable results for these trials. Small changes were observed in the ranking of these structures by assuming the treatment effects as fixed or random, however, without significant effects on the ranking of the best structures in each trial.(AU)


Assuntos
Análise de Variância , Saccharum , Genótipo
10.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-217792

Resumo

Foram realizados dois estudos, sendo um com desempenho e viabilidade nutricional e outro com metanálise, utilizando a palma forrageira na dieta de vacas em lactação. No primeiro estudo, objetivou-se avaliar o efeito de diferentes níveis de concentrado em dietas com palma Orelha de Elefante Mexicana (Opuntia stricta [Haw.] Haw.) sobre o desempenho de vacas da raça Girolando em lactação. Dez vacas (512,62 ± 53,66 kg de peso corporal) com produção de leite média de 13,21 ± 1,94 kg/dia foram distribuídas em dois quadrados Latinos 5x5. As dietas experimentais consistiram em quatro diferentes níveis de concentrado (20, 24, 28 e 32% baseados na matéria seca - MS), associado a palma Orelha de Elefante Mexicana (OEM) e dieta controle (Palma miúda (PM) + 20% concentrado). A dieta controle proporcionou maiores consumos para a maioria dos nutrientes (MS, MO, PB, CNFcp e NDT), com exceção de FDNcp, do que aquelas que receberam dietas com palma OEM, independentemente do nível concentrado. A inclusão de concentrado nas dietas com palma OEM não alterou a digestibilidade dos nutrientes. A PLCG das vacas suplementadas com 32% de concentrado na dieta com palma OEM foi semelhante àquelas que receberam a dieta controle. Com a inclusão de concentrado nas dietas com palma OEM, não influenciou os teores de gordura, proteína, lactose, sólidos totais (ST), caseína, nitrogênio ureico e eficiência alimentar. Para vacas produzindo 14 kg/dia com 3,5% de gordura, recomenda-se a inclusão de 32% de concentrado em dietas com palma Orelha de Elefante Mexicana. O segundo estudo, avaliou-se os efeitos dos níveis de palma forrageira e dos constituintes nutricionais da dieta (fibra em detergente neutro -FDNd, carboidratos não fibrosos - CNFd e nutrientes digestíveis totais - NDTd) sobre a produção de vacas leiteiras, usando o procedimento de meta-análise. Foram coletados dados de experimentos que avaliavam consumo e desempenho de vacas da raça holandês ou holandês x Gir em lactação confinadas. Todos os estudos testavam dietas contendo palma forrageira. O conjunto de dados que atendeu aos critérios para inclusão no estudo, foram compilados de 31 estudos, sendo 16 estudos com vacas da raça Holandês (51,61%) com 72 observações e 15 estudos com vacas da raça Holandês x Gir (48,39%)com 66 observações, publicados em revistas cientificas indexadas no CSIRO Publishing, SciElO, Scopus e Web of Science e no catálogo de teses e dissertações CAPES. A variável resposta analisada foi a PLCOR e as explicativas foram NP e as variáveis nutricionais (VN) (FDNd, CNFd, PBd e NDTd) e suas respectivas interações. Os dados foram analisados de acordo com modelos mistos, levando em consideração os efeitos dos diferentes estudos como fator de efeito aleatório. A seleção dos modelos, foram por meio do critério de informação de Akaike (AIC), com auxílio do algoritmo stepwise nas duas direções (i.e. "backward" e "forward"). O comportamento da PLCOR em relação a NP foi sempre quadrático, independentemente do nível de FDNd. Independentemente do NP a PLCOR sempre apresentou um afeito linear em relação a FDNd. Houve interação entre NP e CNFd, ou seja, o comportamento da PLCOR em relação ao NP altera à medida que o CNFd altera. A meta-análise revelou que a produção máxima de 19,86 kg de leite foi estimada com 21% de palma.


Two studies were carried out, one with performance and nutritional viability and the other with meta-analysis, using cactus cladodes-based diets for lactating cows. In the first study, the objective was to evaluate the effect of different levels of concentrate in cactus cladodes Opuntia-based diets on the performance of lactating Girolando cows. Ten cows (512.62 ± 53.66 kg body weight) with an average milk yield of 13.21 ± 1.94 kg / day were assigned in two simultaneous 5x5 Latin squares. The experimental diets consisted in four different levels of concentrate (20, 24, 28 and 32% based on dry matter - MS), associated with the cactus cladodes Opuntia and the control diet (Nopalea cochenillifera + 20% concentrate). The control diet provided greater intake for most nutrients (DM, OM, CP, NFCcp and TDN), except for NDFap, than those that received diets with cactus Opuntia, independently of concentrated level. The inclusion of concentrate in cactus cladodes Opuntia -based diets did not alter the digestibility of nutrients. The fat-corrected milk yield (FCMY) of cows supplemented with 32% of concentrate in the cactus cladodes Opuntia-based diets was similar to those that received the control diet. The inclusion of concentrate in cactus cladodes Opuntia-based diets did not influence the levels of milk fat, protein, lactose, total solids (ST), casein, urea nitrogen and feed efficiency. For cows producing 14 kg/d with 3.5% of fat, it is recommended 32% of concentrate to be included in cactus Opuntia-based diets. The second study evaluated the effects of cactus cladodes (CC) level and dietary nutritional content (neutral detergent fiber -NDFd, non-fibrous carbohydrates - NFCd and total digestible nutrients - TDNd) on the production of dairy cows, using the meta-analysis procedure. Data were collected from experiments that evaluated intake and performance of feedlot lactating Holstein or Holstein x Gir cows. All studies tested diets containing cactus. The set of data that met the criteria for inclusion in the study were compiled from 31 studies, 16 of which were studies with Holstein cows (51.61%) with 72 observations and 15 studies with Holstein x Gir cows (48.39 %) with 66 observations, published in scientific journals indexed in CSIRO Publishing, SciElO, Scopus and Web of Science and in the catalog of theses and dissertations - CAPES. The response variable analyzed was FCMY and the explanatory variables were CC and the nutritional variables (VN) (NDFd, NFCd, CPd and TDNd) and their respective interactions. The data were analyzed according to mixed models, taking into account the effects of different studies as a random effect factor. The models were selected using the Akaike information criterion (AIC), with the aid of the stepwise algorithm in both directions (i.e. "backward" and "forward"). The behavior of FCMY in relation to CC was always quadratic, irrespective of the level of NDF. irrespective of the CC, FCMY always presented a linear affection in relation to NDF. There was an interaction between CC and NFCd, that is, the behavior of FCMY in relation to CC changes as the NFCd changes. The metaanalysis revealed that the maximum production of 19.86 kg of milk was estimated with 21% cactus.

11.
Semina Ci. agr. ; 35(1): 101-112, Jan.-Feb.2014. tab, graf
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-26001

Resumo

The objective of this work was to select the best sugarcane families to increase productivity (TCH) in T1 stage and monitor their performance in stages T2 and T3 of the sugarcane breeding program (PMGCA / UFPR / RIDESA). The experiments of stages T1 and T2 were performed at the experimental station of Paranavaí (PR) and T3 stage was installed in three locations in the northwestern of Paraná State. In the first phase (T1) 40 full-sib families from bi-parental crosses were evaluated and were correlated with selected families in the next stage of selection (T2), comparing the number of genotypes indicated by BLUPIS, and the number of clones that composed the T2 stage, by bulk selection. Data were analyzed by REML/BLUP methodology. In T1 stage, twenty and two (22) families were selected for T2 stage, and seven families were selected for T3 stage, being results of the crosses RB835486 x RB72454, SP70-1143 x RB855156, RB835054 x SP83-2847, SP80-3280 x RB835054, RB855156 x SP80-1816, SP80-3280 x RB855589, and SP80-3280 x RB835486. The BLUPIS selection procedure allowed the indication of a greater number of potential families and clones within these families. The genotypes with improved performance in subsequent phases were derived from families with positive genotypic values and yield above experimental average in the T1 stage.(AU)


O objetivo deste trabalho foi selecionar as melhores famílias de cana-de-açúcar para aumento de produtividade (TCH) na fase T1 e acompanhar seu desempenho nas fases T2 e T3 do programa de melhoramento genético da cana-de-açúcar (PMGCA/UFPR/RIDESA). Os experimentos das fases T1 e T2 foram realizados na estação experimental de Paranavaí (PR) e a fase T3 foi instalada em três locais da região noroeste do estado do Paraná. Na primeira fase (T1) foram avaliadas 40 famílias de irmãos-completos oriundos de cruzamentos bi-parentais e foram correlacionados com as famílias selecionadas na etapa seguinte de seleção (T2), comparando o número de genótipos indicado pelo BLUPIS e o número de clones que compuseram o T2, via seleção massal. Os dados foram analisados via metodologia REML/BLUP. Vinte e duas (22) famílias foram selecionadas para a fase T2 e sete famílias foram selecionadas para a fase T3, sendo resultados dos cruzamentos RB835486 x RB72454; RB855156 x SP70-1143; RB835054 x SP83-2847; RB835054 x SP80-3280; SP80-1816 x RB855156; SP80-3280 x RB855589; e SP80-3280 x RB835486. A seleção via procedimento BLUPIS permitiu indicar maior número de famílias potenciais e clones dentro destas famílias. Os genótipos com melhor desempenho nas fases seguintes foram originados das famílias com valores genotípicos positivos e produtividade acima da média experimental em T1.(AU)


Assuntos
Saccharum/crescimento & desenvolvimento , Saccharum/genética , Seleção Genética , Hereditariedade
12.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-212512

Resumo

Objetivou-se verificar a viabilidade da seleção direta, indireta, simultânea e estimar os coeficientes de repetibilidade, e parâmetros genéticos de genótipos do gênero Urochloa ssp. em condições semiáridas. O delineamento foi em blocos ao acaso com três repetições e vinte e sete tratamentos. Foram avaliados 25 genótipos do gênero Urochloa e 2 testemunhas (Urochloa brizantha cv. Marandu e Convert HD-364) em sete colheitas. A repetibilidade foi estimada pela metodologias análise de variância (ANOVA), componentes principais com base em matriz de covariância (CPCOV), componentes principais com base em matriz de correlação (CPCOR), análise estrutural de correlação AECOR e Modelos Mistos. Os genótipos foram selecionados pelos métodos de seleção direto, indireto e pelo índice de seleção simultânea de Mulamba e Mock. A característica massa seca total MST apresentou valores de repetibilidade entre 0,1370 e 0,3421 pelas metodologias Modelos Mistos e CPCOR. Já a característica porcentagem de folha %FOL apresentou valores entre 0,0950 e 0,2993, também para as metodologias de Modelos Mistos e CPCOR. A metodologia CPCOV apresentou maiores valores de repetibilidade para a maioria das características avaliadas com exceção da altura de planta, onde a metodologia por componentes principais com base em matriz de correlação proporcionou maiores valores (0,4422). Os componentes de variância genotípicas foram significativos para todas as caraterísticas agronômicas avaliadas. Foram observados valores de herdabilidade de média variando entre 0,47 para relação folha:colmo (RFC) e 0,78 pra altura (ALT) e rebrota (REB). A seleção simultânea resultou em ganhos mais uniformes em todas as características avaliadas, variando de 3,76% para porcentagem de folhas (%FOL) a 11,70 para a REB. Os genótipos de Urochloa spp apresentam baixas estimativas de repetibilidade para características agronômicas pelas diferentes metodologias. A seleção direta resulta em ganhos elevados na característica principal e ganhos discretos ou negativos na seleção indireta das demais características. A seleção simultânea resulta em ganhos mais uniformes e permitiu identificar os genótipos BARG171, BARG155, T1510, T1709 e BARG153 como sendo os mais adaptados para as condições do estudo.


The objective was to verify the feasibility of direct, indirect, simultaneous selection and to estimate the repeatability coefficients and genetic parameters of genotypes of the genus Urochloa ssp. under semiarid conditions. The design was in randomized blocks with three replications and twenty seven treatments. Twenty-five genotypes of the genus Urochloa and two controls (Urochloa brizantha cv. Marandu and Convert HD-364) were evaluated in seven harvests. Repeatability was estimated by analysis of variance (ANOVA), covariance matrix-based principal components (CPCOV), correlation matrix-based principal components (CPCOR), AECOR structural correlation analysis and Mixed Models. The genotypes were selected by the direct and indirect selection methods and by the simultaneous selection index of Mulamba and Mock. The characteristic total dry mass MST presented repeatability values between 0.1370 and 0.3421 by the Mixed Models and CPCOR methodologies. The% FOL leaf percentage characteristic presented values between 0.0950 and 0.2993, also for the Mixed Models and CPCOR methodologies. The CPCOV methodology presented higher repeatability values for most of the evaluated characteristics except for plant height, where the principal component methodology based on correlation matrix provided higher values (0.4422). Genotypic variance components were significant for all evaluated agronomic characteristics. Mean heritability values ranging from 0.47 for leaf: stem ratio (RFC) to 0.78 for height (ALT) and regrowth (REB) were observed. Simultaneous selection resulted in more uniform gains in all evaluated characteristics, ranging from 3.76% for leaf percentage (% FOL) to 11.70 for REB. Urochloa spp genotypes have low repeatability estimates for agronomic characteristics by different methodologies. Direct selection results in high gains in the main trait and discrete or negative gains in indirect selection of the other traits. Simultaneous selection results in more uniform gains and allowed the identification of BARG171, BARG155, T1510, T1709 and BARG153 genotypes as being the most adapted to the study conditions.

13.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-212427

Resumo

O presente estudo teve como objetivo: 1) estimar parâmetros genéticos para características de produção in vitro de embriões de doadoras da raça Gir Leiteiro considerando as distribuições Gaussiana e Poisson; 2) investigar a existência de regiões cromossômicas que possam estar associadas com essas características. Os dados utilizados totalizaram 12.491 informações de aspirações foliculares provenientes de 5.496 doadoras da raça Gir Leiteiro. As características número de oócitos viáveis (NOV) e número de embriões viáveis (NEV) foram analisadas por meio de modelo animal unicaracterísticas considerando os efeitos sistemáticos de grupo de contemporâneos (data da aspiração folicular e rebanho), idade da doadora (covariável linear e quadrática) e intervalo entre as aspirações (OPU) (covariável linear). Os efeitos de animal e de ambiente permanente, além do residual, foram assumidos como aleatórios. Os componentes de variância foram estimados via modelos lineares generalizados mistos sob o enfoque bayesiano. A herdabilidade estimada para NOV foi de 0,12 para os modelos Gaussiano e Poisson, respectivamente e para NEV, as estimativas de herdabilidade foram de 0,02 e 0,03, respectivamente. Os valores de repetibilidade variaram em função do modelo estudado, de 0,17 a 0,22 para NOV e de 0,08 a 0,37 para NEV, empregando-se os modelos Gaussiano e Poisson, respectivamente. O modelo Poisson ajustou-se melhor para as características estudadas, uma vez que apresentou menores valores para o critério de informação da deviance (DIC). Os valores genéticos preditos para as características obtidos pelos diferentes modelos foram altamente correlacionados, 0,79 para NOV e 0,87 para NEV. Considerando os 10% melhores animais de acordo com o valor genético, observou-se um maior re-ranqueamento para a característica NOV em relação à NEV, indicando que a escolha do modelo adequado é importante para o processo de seleção dos animais. A partir dos valores genéticos preditos via modelo Poisson foram calculados, de forma iterativa, os efeitos dos marcadores ponderados. Os resultados da análise de GWAS via GBLUP foram apresentados com base no percentual de variância explicada por janelas de tamanho de 100 SNPs adjacentes. Apenas SNPs com variância genética aditiva acima de 1% foram considerados. A variância explicada pelas janelas de maior efeito foi de 21,22% e estas estavam localizadas nos cromossomos 1, 2, 3, 4, 5, 8, 13, 14, 17, e 27 para a característica NOV. Para a característica NEV, a variância explicada pelas janelas de maior efeito foi de 13,39% e estas estavam localizadas nos cromossomos 2, 6, 9, 14, 18 e 25. Nessas regiões foram identificados genes relacionados direta ou indiretamente com as características estudadas.


The present study aimed to: 1) estimate genetic parameters for in vitro production traits of Dairy Gyr donors considering Gaussian and Poisson distribution; 2) investigate the existence of chromosomal regions that may be associated with these traits. The data totalized 12,491 records of ovum pick-up from 5,496 Dairy Gyr donors. The traits viable oocyte number (VON) and viable embryos number (VEN) were analyzed by unitrait animal model considering systematic effects of contemporary group (ovum pick-up date and herd), age of donor (covariable linear and quadratic) and pick-up interval (OPU) (covariable linear). Additive genetic, permanent environmental and residual effects were assumed as random. The variance components were estimated by generalized linear mixed models under Bayesian approach. The heritability estimated for VON was 0.12 for both models. For VEN estimated heritability was 0.02 and 0.03 for Gaussian and Poisson models, respectively. The repeatability ranged according to the model studied, 0.17 to 0.22 for VON and 0.08 to 0.37 for VEN, employing Gaussian and Poisson models, respectively. Poisson model showed the best fit to the studied traits, according the deviance information criterion (DIC). The predicted breeding values of traits using the different models were high correlated, 0.79 to VON and 0.87 to VEN. Considering the 10% best breeding values the re-ranking of animals for VON was higher when compared to VEN, suggesting that choosing an appropriated model is important for selection process of animals. The results of GWAS analysis through GBLUP were based on the percentage of variance explained by windows of 100 adjacent SNPs. Only SNPs with additive genetic variance above 1% were considered. The variance explained by the window with larger effects was 21.22%, observed on chromosomes 1, 2, 3, 4, 5, 8, 13, 14, 17 and 27 for NOV. For the NEV trait, the variance explained by the windows with larger effects was 13.39%, on chromosomes 2, 6, 9, 14, 18 and 25. In these regions genes directly or indirectly related to the studied traits were identified.

14.
Braz. j. biol ; 73(4): 855-862, 1jan. 2013. map, graf, tab
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1468154

Resumo

Along the Brazilian coast only two haul-outs of South American sea lions (Otaria flavescens) are known: Ilha dos Lobos and Molhe Leste, both located in the southernmost state of Brazil, Rio Grande do Sul. Most sea lions observed in these haul-outs are adult and sub-adult males. It is supposed that the species' presence in these areas is due to food supply and absence of parental assistance by males. This study analysed the use of these haul-outs by O. flavescens between 1993 and 2002 based on counting data of observed individuals. Bayesian generalised linear mixed models were used to evaluate differences in abundance between areas, long term trends and seasonal patterns. Results showed that for O. flavescens abundance had a long term trend of increased average occupancy over the study period, with seasonal variation reaching the highest within-year value in August (Ilha dos Lobos) and October (Molhe Leste). The novel application of this powerful statistical modelling approach resulted in a useful tool to quantify occupancy dynamic.


Ao longo da costa do Brasil apenas duas colônias não-reprodutivas de leões-marinhos-do-sul (Otaria flavescens) são conhecidas: Ilha dos Lobos e Molhe Leste, ambas localizadas no estado do Rio Grande do Sul. A maioria dos leões-marinhos observados nestas colônias são machos adultos e sub-adultos. Supõe-se que a presença da espécie nestas áreas está relacionada ao forrageamento e a ausência de cuidado parental pelos machos. Este estudo analisou a dinâmica de ocupação e abundância de O. flavescens nas colônias não-reprodutivas entre 1993 e 2002, baseado em uma série temporal de dados de contagens de indivíduos. Modelos lineares generalizados mistos Bayesianos foram usados para avaliar diferença na abundância entre áreas, tendência de uso em longo prazo e padrões sazonais. Os resultados mostram que a abundância de O. flavescens variou sazonalmente, atingindo pico intra-anual em agosto (Ilha dos Lobos) e outubro (Molhe Leste), acompanhado de um aumento da ocupação média dos refúgios ao longo do período de estudo. A nova aplicação desta poderosa forma de modelagem estatística mostrou-se útil para quantificar a dinâmica de ocupação.


Assuntos
Animais , Distribuição Animal , Leões-Marinhos/classificação , Modelos Lineares , Brasil
15.
Braz. J. Biol. ; 73(4): 855-862, Nov. 2013. mapas, graf, tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-30922

Resumo

Along the Brazilian coast only two haul-outs of South American sea lions (Otaria flavescens) are known: Ilha dos Lobos and Molhe Leste, both located in the southernmost state of Brazil, Rio Grande do Sul. Most sea lions observed in these haul-outs are adult and sub-adult males. It is supposed that the species' presence in these areas is due to food supply and absence of parental assistance by males. This study analysed the use of these haul-outs by O. flavescens between 1993 and 2002 based on counting data of observed individuals. Bayesian generalised linear mixed models were used to evaluate differences in abundance between areas, long term trends and seasonal patterns. Results showed that for O. flavescens abundance had a long term trend of increased average occupancy over the study period, with seasonal variation reaching the highest within-year value in August (Ilha dos Lobos) and October (Molhe Leste). The novel application of this powerful statistical modelling approach resulted in a useful tool to quantify occupancy dynamic.(AU)


Ao longo da costa do Brasil apenas duas colônias não-reprodutivas de leões-marinhos-do-sul (Otaria flavescens) são conhecidas: Ilha dos Lobos e Molhe Leste, ambas localizadas no estado do Rio Grande do Sul. A maioria dos leões-marinhos observados nestas colônias são machos adultos e sub-adultos. Supõe-se que a presença da espécie nestas áreas está relacionada ao forrageamento e a ausência de cuidado parental pelos machos. Este estudo analisou a dinâmica de ocupação e abundância de O. flavescens nas colônias não-reprodutivas entre 1993 e 2002, baseado em uma série temporal de dados de contagens de indivíduos. Modelos lineares generalizados mistos Bayesianos foram usados para avaliar diferença na abundância entre áreas, tendência de uso em longo prazo e padrões sazonais. Os resultados mostram que a abundância de O. flavescens variou sazonalmente, atingindo pico intra-anual em agosto (Ilha dos Lobos) e outubro (Molhe Leste), acompanhado de um aumento da ocupação média dos refúgios ao longo do período de estudo. A nova aplicação desta poderosa forma de modelagem estatística mostrou-se útil para quantificar a dinâmica de ocupação.(AU)


Assuntos
Animais , Leões-Marinhos/classificação , Distribuição Animal , Modelos Lineares , Brasil
16.
Sci. agric ; 69(3)2012.
Artigo em Inglês | LILACS-Express | VETINDEX | ID: biblio-1497283

Resumo

The increasing demand for raw material for multiple uses of forest products and by-products has attracted the interest for fast growing species, such as the Australian Cedar (Toona ciliata), which presents high productive and economic potential. This study aimed at estimating genotypic parameters and values for the species through the use of the BLUP procedure, at individual level, with repeated measures, by means of the conventional evaluation procedures and the introduction of innovative digitalization of the measurements by digital camera with the images provided by the Imagej software system. The main objective is to subsidize the beginning of a breeding program for the species. The assays were carried out in private properties, in plantations located in the state of Rio de Janeiro, Brazil. The results generated by three evaluations revealed that the image digital analysis is adequate to quantify characteristics of Toona ciliata. It is also an effective and accurate alternative to minimize the costs of data collection in evaluations with the species. There was high accuracy for the characters plant height, diameter at breast height and cylindrical volume. Out of the 90 genotypes evaluated, 38 expressed genotypic values predicted for the diameter at breast height higher than the general average of this character, 33 for the cylindrical volume and 49 for height, allowing gains of up to 24.9 % in average for cylindrical volume. The method of mixed models (REML/BLUP) applied via the SELEGEN software system, using the BLUP procedure at individual level and repeated measures in each individual proved to be adequate to estimate the genetic parameters and predict genotypic values in situations of unbalanced data. Therefore, it is very useful and practical for Toona ciliata genetic breeding programs.

17.
Sci. agric. ; 69(3)2012.
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-440673

Resumo

The increasing demand for raw material for multiple uses of forest products and by-products has attracted the interest for fast growing species, such as the Australian Cedar (Toona ciliata), which presents high productive and economic potential. This study aimed at estimating genotypic parameters and values for the species through the use of the BLUP procedure, at individual level, with repeated measures, by means of the conventional evaluation procedures and the introduction of innovative digitalization of the measurements by digital camera with the images provided by the Imagej software system. The main objective is to subsidize the beginning of a breeding program for the species. The assays were carried out in private properties, in plantations located in the state of Rio de Janeiro, Brazil. The results generated by three evaluations revealed that the image digital analysis is adequate to quantify characteristics of Toona ciliata. It is also an effective and accurate alternative to minimize the costs of data collection in evaluations with the species. There was high accuracy for the characters plant height, diameter at breast height and cylindrical volume. Out of the 90 genotypes evaluated, 38 expressed genotypic values predicted for the diameter at breast height higher than the general average of this character, 33 for the cylindrical volume and 49 for height, allowing gains of up to 24.9 % in average for cylindrical volume. The method of mixed models (REML/BLUP) applied via the SELEGEN software system, using the BLUP procedure at individual level and repeated measures in each individual proved to be adequate to estimate the genetic parameters and predict genotypic values in situations of unbalanced data. Therefore, it is very useful and practical for Toona ciliata genetic breeding programs.

18.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-203109

Resumo

Um dos estudos observacionais mais difundidos e usados em epidemiologia veterinária é o estudo do tipo transversal. Sua popularidade ocorre por fatores como baixo custo e rapidez comparados com outros tipos de estudos, além de ajudar a estimar a prevalência de uma doença (desfecho) e postular fatores associados com o desfecho, que poderão ser confirmados como fatores causais em outros tipos de estudos epidemiológicos. Porém, este tipo de estudo apresenta dois importantes desafios: a dependência dos dados, muito frequente dada a típica estrutura populacional de animais dentro do mesmo rebanho ou fazenda e a escolha da medida de associação para desfechos binários, tão frequentes neste modelo de estudo. Com o objetivo de contribuir com a compreensão global da epidemiologia do aborto bovino associado à Neospora caninum tendo em conta a estrutura populacional, construiu-se um modelo misto com os dados de um estudo transversal realizado em duas regiões do Rio Grande do Sul. Usaram-se dados de 60 propriedades amostradas em duas regiões (noroeste e sudeste) e 1256 bovinos. A percentagem de aborto dentro de cada rebanho variou entre 1% e 30%. Vacas soropositivas tiveram 6,63 vezes mais chances de ter histórico de aborto (IC 95%: 4,41-13,20). As chances de uma vaca ter histórico de aborto foram 5,18 vezes maiores na região noroeste em relação à região sudeste (IC 95%: 1,83-20,80). Um coeficiente de correlação intraclasse de 16% foi estimado, indicando que 16% da variação da ocorrência de abortamentos não explicados pelos efeitos fixos foram devido as fazendas. Já na segunda parte deste trabalho, uma revisão sistemática foi realizada considerando um conjunto diverso de revistas e jornais com o objetivo de verificar os métodos estatísticos usados e a adequação das interpretações das medidas de associação estimadas em estudos transversais na área de medicina veterinária. Um total de 62 artigos foi avaliado. A revisão mostrou que, independentemente do nível de prevalência relatado no artigo, 96% deles empregou regressão logística e, portanto, estimaram razão de chances (RC). Nos artigos com prevalência superior a 10%, 23 deles fizeram uma interpretação adequada da RC como uma razão de chances ou simplesmente não fizeram uma interpretação direta da RC, enquanto 23 artigos interpretaram de forma inadequada a RC, considerando-a como risco ou probabilidade. Entre os artigos com prevalência inferior a 10%, apenas três interpretaram a RC como uma razão de chances, cinco interpretaram como risco ou probabilidade e em um, apesar de ter estimado a razão de prevalências (RP), foi interpretado de forma inadequada. Paralelamente, com o objetivo de exemplificar o uso de métodos estatísticos que estimam diretamente a razão de prevalências (RP), medida mais adequada para os estudos transversais, um conjunto de dados obtidos a partir de um estudo transversal sobre a ocorrência de anticorpos (AC) contra o vírus da diarreia viral bovina (BVDV) foi usado. Os AC foram medidos em amostras de tanque de leite de rebanhos leiteiros localizados no estado do Rio Grande do Sul, em que os possíveis fatores associados puderam ser avaliados. Entre os métodos utilizados, as maiores discrepâncias nas medidas de associação estimadas foram observadas com a regressão logística tomando-se como referência a regressão log-binomial. Finalmente, é importante que este tipo de desafio seja atendido pelos pesquisadores que realizam estudos transversais, ou seja, considerar a estrutura das populações nas análises, cuidado ao escolher o tipo de modelo estatístico empregado para desfecho binário e interpretação dos estimadores.


The commonest study design used in veterinary epidemiology is the cross-sectional study. Its popularity lies on the fact of the short time needed and low costs compared with other types of studies; moreover, this type of study estimates prevalence and associated factors, which may be elucidated as causal in another type of epidemiological studies. However, this type of study presents two major challenges: a very common dependence between data given the typical structure of the animal population, i.e., animals within herds or farms and the choice of measure of association for binary outcomes, frequently used in this type of study. In order to contribute to the understanding of the epidemiology of bovine abortion associated with Neospora caninum, a mixed model accounting for the hierarchical structure of cattle population using data from a cross-sectional study conducted in two regions (northwest and southeast) of Rio Grande do Sul was made. Data from 60 dairy herds and 1256 sampled cattle were used. The percentage of abortions in each herd ranged between 1% and 30%. Seropositive cows were 6.63 times more likely to have a history of abortion (95% CI: 4.41 to 13.20). The chances of a cow have a history of abortion were 5.18 times higher in the northwest comparing with the southeast region (95% CI: 1.83 to 20.80). An intraclass correlation coefficient (ICC) of 16% was estimated which means that 16% of the variation in abortion occurrence not explained by the fixed effects is due to farms. In the second part of this work, a systematic review was conducted considering a range of journals and newspapers in order to verify the statistical methods used and the adequacy of the interpretations of the measures of association estimated in cross-sectional studies from the veterinary medicine field. A total of 62 articles were revised. The review showed that, regardless of the reported prevalence, 96% of them employed logistic regression, therefore estimating odds ratio (OR). From the articles that reported prevalence rates above 10%, 23 of them did a proper interpretation of OR as an odds ratio, or simply did not make a direct interpretation of the OR, while 23 articles interpreted improperly the OR as a risk or probability. Among the articles that reported prevalence rates lower than 10%, only three interpreted the OR as an odds ratio, five interpreted as a risk or probability and only one, despite the estimated prevalence ratio (PR), it was improperly interpreted. Meanwhile, in order to exemplify the use of statistical methods to estimate directly the PR, the more appropriate measure of association in cross-sectional studies, a data set obtained from a cross-sectional study to estimate the occurrence of antibodies (AB) against bovine viral diarrhea virus (BVDV) in milk was used; AB were measured in bulk tank samples from dairy herds located in the state of Rio Grande do Sul, Brazil, and also possible associated factors were estimated. Among the methods used, major discrepancies in the measures of association estimated were observed with the logistic regression, comparing with the log-binomial regression. Finally, it is important that such challenges are met by the researchers that undertake cross-sectional studies.

19.
Ci. Rural ; 38(4): 1085-1091, jul.-ago. 2008. tab
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-4563

Resumo

Uma metanálise foi realizada para avaliar a relação entre a espessura de toicinho e as variáveis nutricionais de porcas gestantes e lactantes. A base de dados contemplou 14 artigos publicados de 2000 a 2006 em revistas indexadas. A metanálise foi realizada através de análises gráfica, de correlação e de variância. A correlação entre espessura de toicinho na gestação (ETg) com consumo de alimento na gestação (CAl G) foi de -0,09 (P=0,04), com CAl na lactação (CAl L) baseado na tabela NRC (1998) foi de -0,09 (P=0,06), com CAl na lactação baseado na tabela Rostagno (2000) foi de -0,08 (P=0,06) e com consumo de proteína bruta na lactação (CAl L PB) foi de -0,08 (P=0,06). A correlação entre espessura de toicinho na lactação (ETl) com CAl na gestação foi de 0,29 (P<0,01), com CAl na gestação NRC (1998) foi de 0,20 (P<0,01), com CAl na gestação Rostagno (2000) foi de 0,20 (P<0,01), com CAl na lactação foi de -0,21 (P<0,01), com consumo na lactação NRC (1998) foi de -0,24 (P<0,01) e com consumo na lactação Rostagno (2000) foi de 0,24 (P<0,01). O CAl de PB na gestação foi de 0,20 (P<0,01) e o CAl de PB na lactação foi de -0,26 (P<0,01). A variação da espessura de toicinho durante a lactação é influenciada pelos níveis de proteína e lisina da dieta e pela gordura e proteína no leite. A variação da espessura de toicinho na gestação e na lactação foi semelhante para as tabelas do NRC (1998) e de Rostagno (2000). Há relação significativa entre espessura de toicinho e variáveis nutricionais em porcas gestantes e lactantes.(AU)


A meta-analysis was undertaken to evaluate the relationship between backfat thickness and nutritional variables of sows during gestation and lactation. The database was developed from 14 studies published between 2000 and 2006. The meta-analysis was carried out trough by graphical analysis, correlation and variance. The correlation between backfat thickness at gestation (BTg) and feed intake (FI) at this phase was -0.09 (P=0.04). The correlation between backfat thickness at gestation (BTg) and lactation FI NRC (1998) was -0.09 (P=0.06); BTg and FI at lactation Rostagno (2000) presented a correlation of-0.08 (P=0.06). In the same way the correlation between BTg and crude protein (CP) intake at lactation was -0.08 (P=0.06). The correlation between backfat thickness at lactation (BTl) and FI at gestation was 0.29 (P<0.01). BTl and FI at gestation NRC (1998) presented a correlation of 0.20 (P<0.01). For BTl and gestation feed intake Rostagno (2000) a correlation of 0.20 (P<0.01) was reported. The correlation between BTl and lactation FI was -0.21 (P<0.01), the correlations between BTl and lactation FI NRC (1998) were -0.24 (P<0.01) and lactation FI Rostagno (2000) 0.24 (P<0.01). Correlations of 0.20 (P<0.01) and -0.26 (P<0.01) were observed between BTl and CP intake at gestation and CP intake at lactation respectively. The backfat thickness variation at lactation is influenced by protein and lysine levels in the diet and fat and protein of the milk. Gestation and lactation backfat thickness variation was similar to NRC (1998) and Rostagno (2000). There is a significant relationship between backfat thickness and nutritional variables in pregnant and farrowing sows.(AU)


Assuntos
Animais , Suínos , Metanálise como Assunto , Fenômenos Fisiológicos da Nutrição Animal
20.
Ci. Rural ; 36(6)2006.
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-705139

Resumo

This research was aimed at evaluating and identifing which type of sum of squares can be more appropriate to test hypotheses and also presenting appropriate alternatives to solution of problems through the analysis of mean square expected values used in the methodology of mixed linear models. The analysis of mean square expected values can be a tool of great importance in analysis of data as incomplete (empty casela) as unbalanced experiment. Therefore, four examples were used each one with its pecualiarity concerning the complete or incomplete experiment with balanced or unbalanced data and in the presence of empty casela. The SAS statistical package, version Learning Edition, was used to analyze the experiments. The result of the analysis of mean square expected values indicated that the sum of squares of the type ‘I can be used only at of condition of completely balanced data. These results indicated on the other hand, that the sum of squares of the type ‘III is the most appropriate type for unbalanced data. The sum of squares of the type ‘II and ‘IV are the most important in the case of empty caselas; fact that supports the idea of a necessity of always evaluating the mean square expected values.


Este trabalho teve como objetivo avaliar e identificar qual o tipo de soma de quadrados mais apropriada para testar hipóteses de interesse, assim como discutir alternativas mais adequadas para a solução de inconvenientes expressos por meio da análise da esperança matemática dos quadrados médios utilizados em modelos lineares mistos. A análise das esperanças matemáticas dos quadrados médios pode ser uma ferramenta de grande importância nas inferências a partir de dados experimentais, tanto incompletos (casela vazia) quanto não-balanceados. Desta forma, foram utilizados quatro exemplos, cada qual com sua peculiaridade em função do experimento ser completo ou incompleto com dados balanceados ou não-balanceados e na presença de casela vazia. O pacote estatístico SAS, versão Learning Edition, foi empregado para analisar os experimentos. O resultado da análise das esperanças matemáticas dos quadrados médios indicou que a soma de quadrados do tipo I somente apresentou condições de ser utilizada em presença de dados completamente balanceados. De modo contrário, os resultados apontam que a soma de quadrados tipo III é a soma de quadrados mais apropriada no caso de dados não-balanceados. As somas de quadrados tipo II e IV são as mais importantes no caso de caselas vazias, fato que corrobora a necessidade de avaliar sempre as esperanças matemáticas dos quadrados médios.

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