Comparison of ethylene carbonate and formamide as components of the hybridization mixture in FISH

The protocols for in situ hybridization (ISH) techniques can vary considerably; however, they usually include denaturation and hybridization steps. Denaturing compounds are used to reduce denaturation and hybridization temperature, which keeps the proper morphology of the preparation. Formamide is the most commonly used reagent in in situ hybridization to lower the melting temperature. The substitution of toxic formamide for a non-toxic ethylene carbonate at 20 % and 50% concentration in the hybridization mixture helped obtain a high quality in situ hybridization result with two sequences characteristic for rye, JNK, and Bilby. The results after hybridization, with a duration of 90 min and 16 h, were identical when formamide or ethylene carbonate were used in the mixture. In addition, the toxic formamide was eliminated from the post-hybridization steps and specific hybridization signals for both probes were still obtained.(AU)

Comparison of ethylene carbonate and formamide as components of the hybridization mixture in FISH

The protocols for in situ hybridization (ISH) techniques can vary considerably; however, they usually include denaturation and hybridization steps. Denaturing compounds are used to reduce denaturation and hybridization temperature, which keeps the proper morphology of the preparation. Formamide is the most commonly used reagent in in situ hybridization to lower the melting temperature. The substitution of toxic formamide for a non-toxic ethylene carbonate at 20 % and 50% concentration in the hybridization mixture helped obtain a high quality in situ hybridization result with two sequences characteristic for rye, JNK, and Bilby. The results after hybridization, with a duration of 90 min and 16 h, were identical when formamide or ethylene carbonate were used in the mixture. In addition, the toxic formamide was eliminated from the post-hybridization steps and specific hybridization signals for both probes were still obtained.

Chromosomal distribution of the retroelements Rex 1, Rex 3 and Rex 6 in species of the genus Harttia and Hypostomus (Siluriformes: Loricariidae)

The transposable elements (TE) have been widely applied as physical chromosome markers. However, in Loricariidae there are few physical mapping analyses of these elements. Considering the importance of transposable elements for chromosomal evolution and genome organization, this study conducted the physical chromosome mapping of retroelements (RTEs) Rex1, Rex3 and Rex6 in seven species of the genus Harttia and four species of the genus Hypostomus, aiming to better understand the organization and dynamics of genomes of Loricariidae species. The results showed an intense accumulation of RTEs Rex1, Rex3 and Rex6 and dispersed distribution in heterochromatic and euchromatic regions in the genomes of the species studied here. The presence of retroelements in some chromosomal regions suggests their participation in various chromosomal rearrangements. In addition, the intense accumulation of three retroelements in all species of Harttia and Hypostomus, especially in euchromatic regions, can indicate the participation of these elements in the diversification and evolution of these species through the molecular domestication by genomes of hosts, with these sequences being a co-option for new functions.(AU)

Os elementos transponíveis (TE) têm sido amplamente aplicados como marcadores cromossômicos. Contudo, em Loricariidae, há poucas análises de mapeamento físico destes elementos. Considerando a importância de elementos transponíveis para a evolução cromossômica e organização genômica, este trabalho realizou o mapeamento físico cromossômico dos retroelementos (RTEs) Rex1, Rex3 e Rex6 em sete espécies do gênero Harttia e em quatro espécies do gênero Hypostomus, com o intuito de melhor compreender a organização e dinâmica dos genomas das espécies de Loricariidae. Os resultados evidenciaram um intenso acúmulo dos RTEs Rex1, Rex3 e Rex6 e distribuição dispersa em regiões heterocromáticas e eucromáticas no genoma das espécies estudadas. A presença de retroelementos em algumas regiões cromossômicas sugere sua participação em vários rearranjos cromossômicos. Além disso, o intenso acúmulo dos três retroelementos em todas as espécies de Harttia e Hypostomus, especialmente em regiões eucromáticas, pode indicar a participação destes elementos na diversificação e evolução destas espécies através da domesticação molecular pelo genoma dos hospedeiros, com estas sequências sendo co-optadas paras novas funções.(AU)

Chromosomal distribution of the retroelements Rex 1, Rex 3 and Rex 6 in species of the genus Harttia and Hypostomus (Siluriformes: Loricariidae)

The transposable elements (TE) have been widely applied as physical chromosome markers. However, in Loricariidae there are few physical mapping analyses of these elements. Considering the importance of transposable elements for chromosomal evolution and genome organization, this study conducted the physical chromosome mapping of retroelements (RTEs) Rex1, Rex3 and Rex6 in seven species of the genus Harttia and four species of the genus Hypostomus, aiming to better understand the organization and dynamics of genomes of Loricariidae species. The results showed an intense accumulation of RTEs Rex1, Rex3 and Rex6 and dispersed distribution in heterochromatic and euchromatic regions in the genomes of the species studied here. The presence of retroelements in some chromosomal regions suggests their participation in various chromosomal rearrangements. In addition, the intense accumulation of three retroelements in all species of Harttia and Hypostomus, especially in euchromatic regions, can indicate the participation of these elements in the diversification and evolution of these species through the molecular domestication by genomes of hosts, with these sequences being a co-option for new functions.(AU)

Os elementos transponíveis (TE) têm sido amplamente aplicados como marcadores cromossômicos. Contudo, em Loricariidae, há poucas análises de mapeamento físico destes elementos. Considerando a importância de elementos transponíveis para a evolução cromossômica e organização genômica, este trabalho realizou o mapeamento físico cromossômico dos retroelementos (RTEs) Rex1, Rex3 e Rex6 em sete espécies do gênero Harttia e em quatro espécies do gênero Hypostomus, com o intuito de melhor compreender a organização e dinâmica dos genomas das espécies de Loricariidae. Os resultados evidenciaram um intenso acúmulo dos RTEs Rex1, Rex3 e Rex6 e distribuição dispersa em regiões heterocromáticas e eucromáticas no genoma das espécies estudadas. A presença de retroelementos em algumas regiões cromossômicas sugere sua participação em vários rearranjos cromossômicos. Além disso, o intenso acúmulo dos três retroelementos em todas as espécies de Harttia e Hypostomus, especialmente em regiões eucromáticas, pode indicar a participação destes elementos na diversificação e evolução destas espécies através da domesticação molecular pelo genoma dos hospedeiros, com estas sequências sendo co-optadas paras novas funções.(AU)

Micobacteriose em camarão branco do pacífico, Litopenaeus vannamei / Mycobacteriosis white shrimp pacific Litopenaeus vannamei

A infecção por Mycobacterium spp. tem sido constatada em diversos vertebrados, ocasionando doenças em humanos e animais. As espécies responsáveis pela ocorrência de micobacteriose em peixes, a saber, Mycobacterium marinum, M. fortuitum e M. chelonae, também são potencialmente infecciosas para os camarões peneídeos. A micobacteriose que afeta crustáceos corresponde a uma enfermidade sistêmica, granulomatosa, possuindo como agente etiológico bacilos Gram positivos ácido-álcool resistentes. Relata-se neste trabalho a ocorrência de micobacteriose em camarões da espécie Litopenaeus vannamei, sendo identificada a bactéria M. marinum nas amostras teciduais analisadas. Durante a manutenção de juvenis da espécie foram observadas lesões enegrecidas no sexto segmento abdominal de 20 espécimes. A partir das técnicas de Fite-Faraco e Fluorescence In Situ Hybridization (FISH) foi identificado o patógeno, representando uma doença bacteriana com potencial zootécnico que ocorre em ambientes aquáticos, acarretando riscos de contaminação tópica em pessoas envolvidas na manipulação de camarões.(AU)

The Mycobacterium spp. infection they have been documented in many vertebrates, causing known diseases in man and animals. The species responsible for the occurrence of mycobacteriosis in fish, Mycobacterium marinum, M. fortuitum and M. chelonae, are also potentially infectious for penaeid shrimp. The mycobacterial disease that affects shellfish corresponds to a systemic disease, granulomatous, having as an etiological agent Gram-positive bacilli resistant acid-alcohol. We report the occurrence of mycobacteriosis in shrimps of the species Litopenaeus vannamei, and identified the species M. marinum in tissue samples analyzed. During the maintenance of juvenile of the species, blackish lesions were observed in the sixth abdominal segment in 20 specimens. From techniques Fite-Faraco and hybridization in situ with fluorescence (FISH), has identified the pathogen in the analyzed tissue was observed, representing a bacterial disease of aquatic environments with zoonotic potential, causing risks of topical contamination on people involved in handling shrimp.(AU)

Micobacteriose em camarão branco do pacífico, Litopenaeus vannamei / Mycobacteriosis white shrimp pacific Litopenaeus vannamei

A infecção por Mycobacterium spp. tem sido constatada em diversos vertebrados, ocasionando doenças em humanos e animais. As espécies responsáveis pela ocorrência de micobacteriose em peixes, a saber, Mycobacterium marinum, M. fortuitum e M. chelonae, também são potencialmente infecciosas para os camarões peneídeos. A micobacteriose que afeta crustáceos corresponde a uma enfermidade sistêmica, granulomatosa, possuindo como agente etiológico bacilos Gram positivos ácido-álcool resistentes. Relata-se neste trabalho a ocorrência de micobacteriose em camarões da espécie Litopenaeus vannamei, sendo identificada a bactéria M. marinum nas amostras teciduais analisadas. Durante a manutenção de juvenis da espécie foram observadas lesões enegrecidas no sexto segmento abdominal de 20 espécimes. A partir das técnicas de Fite-Faraco e Fluorescence In Situ Hybridization (FISH) foi identificado o patógeno, representando uma doença bacteriana com potencial zootécnico que ocorre em ambientes aquáticos, acarretando riscos de contaminação tópica em pessoas envolvidas na manipulação de camarões.

The Mycobacterium spp. infection they have been documented in many vertebrates, causing known diseases in man and animals. The species responsible for the occurrence of mycobacteriosis in fish, Mycobacterium marinum, M. fortuitum and M. chelonae, are also potentially infectious for penaeid shrimp. The mycobacterial disease that affects shellfish corresponds to a systemic disease, granulomatous, having as an etiological agent Gram-positive bacilli resistant acid-alcohol. We report the occurrence of mycobacteriosis in shrimps of the species Litopenaeus vannamei, and identified the species M. marinum in tissue samples analyzed. During the maintenance of juvenile of the species, blackish lesions were observed in the sixth abdominal segment in 20 specimens. From techniques Fite-Faraco and hybridization in situ with fluorescence (FISH), has identified the pathogen in the analyzed tissue was observed, representing a bacterial disease of aquatic environments with zoonotic potential, causing risks of topical contamination on people involved in handling shrimp.

HER-2 gene expression in atypical ductal hyperplasia associated with canine mammary carcinomas / Expressão gênica de HER2 em hiperplasias ductais atípicas associadas a carcinomas mamários caninos

O presente estudo apresenta o comportamento do gene HER2, a partir do uso da técnica de hibridização cromogênica in situ, em hiperplasias ductais atípicas associadas a carcinomas mamários caninos positivos para HER2. Aparentemente, uma fraca expressão da proteína HER2 foi observada nas hiperplasias ductais atípicas, bem como uma ausência de amplificação do seu gene codificador nessas hiperplasias e nos carcinomas mamários associados. O comportamento da proteína HER2 e do seu gene em carcinomas mamários caninos é similar ao observado em alguns subtipos histológicos de tumores mamários humanos, e a ausência dessas alterações sugerem que esse gene poderia aparentemente não estar envolvido com os estágios iniciais de proliferação celular atípica.(AU)

Detection of reticuloendotheliosis virus by immunohistochemistry and in situ hybridization in experimentally infected chicken embryo fibroblasts

Reticuloendotheliosis virus (REV) infection can result in immunosuppression, runting syndrome, high mortality, acute reticular cell neoplasia, or T- and/or B-cell lymphoma, in a variety of domestic and wild birds. Histopathological changes of reticuloendotheliosis (RE) are not sufficient to differentiate it from Avian Leukosis (AL) and Marek's disease (MD). Currently there available diagnostic methods for detection of active REV infection. In order to develop immunohistochemistry (IHC) and in situ hybridization (ISH) assays for detection of REV active infections, experimentally inoculated formalin-fixed and paraffin embedded DF-1 chicken embryo fibroblasts were used as an infection model. IHC and ISH assays proved to be efficient for the detection of several REV strains, and to differentiate those strains from representative strains of the avian leukosis/sarcoma group of retroviruses (ALSV).