Simulation of pattern of gene flow in Canjerana fragments in the Brazilian Atlantic Rainforest for evaluating genetic conservation strategies / Simulação do padrão de fluxo gênico em fragmentos de Canjerana no bioma Mata Atlântica para definição de estratégias de conservação genética

Gene flow is important for the conservation of genetic resources to allow connectivity of geographically isolated populations and which genetic variability is reduced. Gene movement is a function of flow rate and model. Understanding how gene flow occurs can contribute to the conservation and selection of priority populations that could benefit from an eventual intervention. Simulation softwares allow making inferences about past events based on current datasets or predict future phenomena under real genetic scenarios. Adverse phenomena can be predicted and actions can be taken to avoid them. The aim of this study was to identify a model and the gene flow rates that could explain genetic structure of eight forest fragments of Cabralea canjerana in development in the Brazilian Atlantic Rainforest. To do this, simulations were performed with the EASYPOP software using a microsatellite marker dataset obtained for the species by Melo and collaborators, in 2012, 2014 and 2016. We tested five models and nine migration rates and we selected the model that produced values closer to those previously obtained for them. Criteria used for selection were the observed and expected heterozygosity and the Wrights F Statistics obtained in the simulations. The gene flow model selected was the isolation by distance model that used a rate of 0.1. We observed high levels of genetic differentiation among the fragments as result of their reproductive isolation. To allow homogenization of the allelic frequencies through gene flow, the solution would be to create ecological corridors with the aim of connecting distant fragments.(AU)

O fluxo gênico, cuja efetividade é função do modelo e da taxa, assume especial importância na conservação de recursos genéticos por permitir a conectividade de populações isoladas geograficamente, sujeitas à redução da variabilidade genética. O entendimento de como o fluxo gênico ocorre pode contribuir no planejamento de ações para a conservação e na seleção de populações prioritárias para uma eventual intervenção. Programas de simulação permitem inferir sobre eventos passados, a partir de dados atuais ou prever fenômenos futuros sob cenários genéticos reais. Fenômenos adversos podem ser previstos e medidas podem ser tomadas para contorná-los. O objetivo deste estudo foi identificar o modelo e a taxa de fluxo gênico que melhor explicam a estrutura genética de oito fragmentos da espécie arbórea florestal Cabralea canjerana, em desenvolvimento na região brasileira do bioma Mata Atlântica. Foram realizadas simulações com o programa EASYPOP usando dados de marcadores microssatélites obtidos por Melo e colaboradores, em 2012, 2014 e 2016, sendo testados cinco modelos e nove taxas de migração, selecionando-se o modelo que apresentou os valores mais próximos daqueles que foram publicados. Os critérios usados para a seleção do modelo foram a heterozigosidade observada e esperada e as estatísticas F de Wright obtidas nas simulações. O modelo de fluxo gênico entre os fragmentos foi o de isolamento por distância a uma taxa de 0.1. Foram observados elevados índices de diferenciação genética entre os fragmentos em decorrência do seu isolamento reprodutivo. Desse modo, sugere-se a construção de corredores ecológicos com vistas a conectar fragmentos distantes e, desta forma, permitir a homogeneização das frequências alélicas por meio do fluxo gênico.(AU)

Diversity of ejaculated sperm proteins in Moxotó bucks (Capra hircus) evaluated by multiple extraction methods

This study aimed to develop protocols for the extraction of sperm proteins from Moxotó goats (Capra hircus) and to compare the resulting proteomic maps. The sperm proteins were isolated using an extraction buffer containing 7 M urea and 2 M thiourea, 20 mM DTT, and one of the following detergents: 1% or 4% CHAPS; 1% or 4% SDS; 1% or 4% Triton X-100; or a combination of CHAPS and SDS. The 1-DE and 2-DE profiles of the isolated proteins revealed that the various isolation methods were efficient. Qualitative and quantitative differences in the 1-DE and 2-DE profiles were observed. 2-DE maps indicated that the amount and diversity of proteins visualized depended on the detergent that was used. Furthermore, this work revealed that the combination of detergents increased the resolution of some spots and retained the characteristics of the individual detergents, depending on their concentrations.

Diversity of ejaculated sperm proteins in Moxotó bucks (Capra hircus) evaluated by multiple extraction methods

This study aimed to develop protocols for the extraction of sperm proteins from Moxotó goats (Capra hircus) and to compare the resulting proteomic maps. The sperm proteins were isolated using an extraction buffer containing 7 M urea and 2 M thiourea, 20 mM DTT, and one of the following detergents: 1% or 4% CHAPS; 1% or 4% SDS; 1% or 4% Triton X-100; or a combination of CHAPS and SDS. The 1-DE and 2-DE profiles of the isolated proteins revealed that the various isolation methods were efficient. Qualitative and quantitative differences in the 1-DE and 2-DE profiles were observed. 2-DE maps indicated that the amount and diversity of proteins visualized depended on the detergent that was used. Furthermore, this work revealed that the combination of detergents increased the resolution of some spots and retained the characteristics of the individual detergents, depending on their concentrations.(AU)

Effects of a small natural barrier on the spatial distribution of the fish assemblage in the Verde River, Upper Paraná River Basin, Brazil / Efeitos de uma pequena barreira natural sobre a distribuição espacial da assembleia de peixes no rio Verde, bacia do alto rio Paraná, Brasil

Geographical barriers influence species distribution and play an important role in the segregation of fish assemblages. The present study aims to test the influence of a small natural barrier on the spatial distribution of fish species in the Verde River, Upper Paraná River Basin, Brazil, considering two biotopes: upstream and downstream of the Branca Waterfall. We observed the highest species richness downstream of the Branca Waterfall, which also had the highest number of exclusive species. Richness, evenness, and abundance varied significantly among biotopes. The composition and structure of the fish assemblage differed between biotopes, which were characterized by different indicator species, mainly downstream of the Branca Waterfall. Physical and chemical variables and geographical distance between sites were not responsible for the differences observed. Hence, the present study shows that small barriers can also be crucial in structuring fish fauna and play a key role in the segregation of fish assemblages.(AU)

As barreiras geográficas influenciam a distribuição das espécies e desempenham um papel importante na segregação das assembleias de peixes. Dessa forma, o objetivo deste estudo foi avaliar mudanças espaciais na assembleia de peixes do rio Verde, sob a influência de uma pequena barreira geográfica natural, bacia do alto rio Paraná, Mato Grosso do Sul, Brasil. Para isso, seis locais foram amostrados e agrupados em dois biótopos: montante e jusante da cachoeira Branca. Maior riqueza e número de espécies exclusivas foram observadas a jusante da cachoeira Branca. A riqueza, equitabilidade e abundância diferiram significativamente entre os biótopos. Além disso, a composição e a estrutura da assembleia de peixes também diferiram entre os biótopos, os quais foram caracterizados por distintas espécies indicadoras, especialmente a jusante da cachoeira Branca. As variáveis físicas e químicas da água e as distâncias geográficas, entre os locais, não foram responsáveis pelas diferenças observadas. Dessa forma, este estudo demonstrou que pequenas barreiras geográficas podem ser cruciais na estruturação da ictiofauna e desempenhar um papel-chave na segregação de assembleias de peixes.(AU)

Incubation artificial processes associated with the application of different reproductive methods in matrices semi heavy / Processos de incubação artificial associados à aplicação de diferentes métodos reprodutivos em matrizes semipesadas

The objective of this study was different reproductive methods in birds from two semiheavy lineages and evaluate their effects on the processes of artificial incubation of eggs and carcass yield of chicks. The experimental design was completely randomized factorial (2 x 2) with factors: reproductive methods (artificial insemination and natural breeding) and two semi-heavy lineages (Plymouth Barred Rock and Rhode Island Red). Were used 26 matrices (23 females and 3 males) for each factor that led to 62 eggs each, totaling 248 eggs, each egg being a repeat. The eggs were weighed before and after the incubation period to determine weight loss and performing comparative analysis between the egg weight and the weight of chick. During the incubation period was evaluated the reproductive performance of the matrices, and after birth, 8 chicks each factor were killed for analysis of carcass thereof. No significant differences (P> 0.05) were found between reproductive performance and the relationship between chick weight and egg weight. The yolk sac and liver weights were affected (P 0.05) by treatment with a Plymouth Rock Barred strain showed the best results.(AU)

O objetivo deste trabalho foi estudar diferentes métodos reprodutivos em aves de duas linhagens semipesadas e avaliar seus efeitos sobre os processos de incubação artificial dos ovos e do rendimento de carcaça dos pintainhos. O delineamento experimental foi inteiramente casualisado em esquema fatorial (2 x 2) com os fatores: métodos reprodutivos (inseminação artificial e monta natural) e duas linhagens semipesadas (Plymouth Rock Barrada e Rhode Island Red). Foram utilizadas 26 matrizes (23 fêmeas e 3 machos) para cada fator que originaram 62 ovos cada, totalizando 248 ovos, sendo cada ovo uma repetição. Os ovos foram pesados antes e após o período de incubação para determinação da perda de peso e realização de análise comparativa entre o peso do ovo e o peso do pinto. Durante o período de incubação foi avaliado o desempenho reprodutivo das matrizes, e após o nascimento, foram abatidos 8 pintos de cada fator para análise do rendimento de carcaça dos mesmos. Não foram encontradas diferenças significativas (P>0,05) entre o desempenho reprodutivo e a relação entre o peso do pinto e o peso do ovo. O peso do saco vitelino e peso do fígado foram afetados(AU)

Incubation artificial processes associated with the application of different reproductive methods in matrices semi heavy / Processos de incubação artificial associados à aplicação de diferentes métodos reprodutivos em matrizes semipesadas

The objective of this study was different reproductive methods in birds from two semiheavy lineages and evaluate their effects on the processes of artificial incubation of eggs and carcass yield of chicks. The experimental design was completely randomized factorial (2 x 2) with factors: reproductive methods (artificial insemination and natural breeding) and two semi-heavy lineages (Plymouth Barred Rock and Rhode Island Red). Were used 26 matrices (23 females and 3 males) for each factor that led to 62 eggs each, totaling 248 eggs, each egg being a repeat. The eggs were weighed before and after the incubation period to determine weight loss and performing comparative analysis between the egg weight and the weight of chick. During the incubation period was evaluated the reproductive performance of the matrices, and after birth, 8 chicks each factor were killed for analysis of carcass thereof. No significant differences (P> 0.05) were found between reproductive performance and the relationship between chick weight and egg weight. The yolk sac and liver weights were affected (P 0.05) by treatment with a Plymouth Rock Barred strain showed the best results.

O objetivo deste trabalho foi estudar diferentes métodos reprodutivos em aves de duas linhagens semipesadas e avaliar seus efeitos sobre os processos de incubação artificial dos ovos e do rendimento de carcaça dos pintainhos. O delineamento experimental foi inteiramente casualisado em esquema fatorial (2 x 2) com os fatores: métodos reprodutivos (inseminação artificial e monta natural) e duas linhagens semipesadas (Plymouth Rock Barrada e Rhode Island Red). Foram utilizadas 26 matrizes (23 fêmeas e 3 machos) para cada fator que originaram 62 ovos cada, totalizando 248 ovos, sendo cada ovo uma repetição. Os ovos foram pesados antes e após o período de incubação para determinação da perda de peso e realização de análise comparativa entre o peso do ovo e o peso do pinto. Durante o período de incubação foi avaliado o desempenho reprodutivo das matrizes, e após o nascimento, foram abatidos 8 pintos de cada fator para análise do rendimento de carcaça dos mesmos. Não foram encontradas diferenças significativas (P>0,05) entre o desempenho reprodutivo e a relação entre o peso do pinto e o peso do ovo. O peso do saco vitelino e peso do fígado foram afetados