Divergence times of the Rhoadsia clade (Characiformes: Characidae)

The family Characidae is the most diverse group of fishes in the Neotropics with challenging systematics. The three genera Carlana, Parastremma, and Rhoadsia, formerly considered the subfamily Rhoadsiinae, are now included in the subfamily Stethaprioninae. Previous phylogenetic analyses did not include all genera of Rhoadsiinae, specifically Parastremma. Here, we estimated the phylogenetic relationships and divergence times of the genera of Rhoadsiinae (the Rhoadsia clade) relative to the most representative genera of the Characidae. We used six molecular markers from the mitochondrial and nuclear genome to estimate the phylogeny and divergence times. We confirmed the monophyly of the Rhoadsia clade. Furthermore, we estimated that the Central American genus Carlana and the western Colombian genus Parastremma diverged approximately 13 Mya (95% HPD 8.36­18.11), consistent with the early-closure estimates of the Isthmus of Panama (~15 Mya). The genus Rhoadsia, endemic to Western Ecuador and Northern Peru, was estimated to originate at around 20 Mya (95% HPD 14.35­25.43), consistent with the Andean uplift (~20 Mya).(AU)

La familia Characidae es el grupo más diverso de peces en el Neotrópico con una sistemática compleja. Los tres géneros Carlana, Parastremma y Rhoadsia, antes considerados en la subfamilia Rhoadsiinae, ahora se consideran dentro de la subfamilia Stethaprioninae. Los análisis filogenéticos publicados no incluyen todos los géneros de Rhoadsiinae, específicamente Parastremma. Aquí, estimamos las relaciones filogenéticas y los tiempos de divergencia de los géneros de Rhoadsiinae (el clado Rhoadsia) en relación con los géneros más representativos de Characidae. Utilizamos seis marcadores moleculares del genoma mitocondrial y nuclear para estimar la filogenia y el tiempo de divergencia. Confirmamos la monofilia del clado Rhoadsia. Además, estimamos que el género centroamericano Carlana y el género colombiano occidental Parastremma divergieron aproximadamente hace 13 millones de años (95% HPD 8.36­18.11), lo que es consistente con recientes estimaciones del cierre del Istmo de Panamá (~15 millones de años). Se estimó que el género Rhoadsia, endémico del oeste de Ecuador y el norte de Perú, se originó hace alrededor de 20 millones de años (95% HPD 14.35­25.43), consistente con el levantamiento de los Andes (~20 millones de años).(AU)

Molecular identification of Brachygenys and Haemulon species (Perciformes: Haemulidae) from the Brazilian coast

The fishes of the Haemulidae family are currently allocated to 19 genera with a worldwide distribution in the tropical and subtropical waters of the world's oceans. Brachygenys and Haemulon are important genera of reef fish in Brazil, as they occur in large shoals, which are both ecologically and commercially valuable. This study identified the Brazilian species of the genera Brachygenys and Haemulon using DNA barcodes. While we found only a single lineage in Brachygenys chrysargyrea, Haemulon melanurum, H. parra, and H. squamipinna, more than one molecular operational taxonomic unit (MOTU) was identified in H. atlanticus, H. aurolineatum, and H. plumieri, indicating the possible existence of discrete populations or cryptic species.(AU)

Os peixes da família Haemulidae estão atualmente distribuídos em 19 gêneros, com distribuição mundial em águas oceânicas tropicais e subtropicais. Brachygenys e Haemulon são importantes gêneros de peixes recifais do Brasil, visto que ocorrem em grandes cardumes, de valores ecológicos e comerciais. Este estudo identificou as espécies brasileiras dos gêneros Brachygenys e Haemulon usando o código de barras de DNA. Embora apenas uma única linhagem de Brachygenys chrysargyrea, Haemulon melanurum, H. parra e H. squamipinna tenha sido encontrada em nosso conjunto de dados, mais de uma unidade taxonômica operacional molecular (MOTU) foi identificada em H. atlanticus, H. aurolineatum e H. plumieri, indicando a possível existência de populações discretas ou espécies crípticas.(AU)

Molecular identification of Brachygenys and Haemulon species (Perciformes: Haemulidae) from the Brazilian coast

The fishes of the Haemulidae family are currently allocated to 19 genera with a worldwide distribution in the tropical and subtropical waters of the world's oceans. Brachygenys and Haemulon are important genera of reef fish in Brazil, as they occur in large shoals, which are both ecologically and commercially valuable. This study identified the Brazilian species of the genera Brachygenys and Haemulon using DNA barcodes. While we found only a single lineage in Brachygenys chrysargyrea, Haemulon melanurum, H. parra, and H. squamipinna, more than one molecular operational taxonomic unit (MOTU) was identified in H. atlanticus, H. aurolineatum, and H. plumieri, indicating the possible existence of discrete populations or cryptic species.(AU)

Os peixes da família Haemulidae estão atualmente distribuídos em 19 gêneros, com distribuição mundial em águas oceânicas tropicais e subtropicais. Brachygenys e Haemulon são importantes gêneros de peixes recifais do Brasil, visto que ocorrem em grandes cardumes, de valores ecológicos e comerciais. Este estudo identificou as espécies brasileiras dos gêneros Brachygenys e Haemulon usando o código de barras de DNA. Embora apenas uma única linhagem de Brachygenys chrysargyrea, Haemulon melanurum, H. parra e H. squamipinna tenha sido encontrada em nosso conjunto de dados, mais de uma unidade taxonômica operacional molecular (MOTU) foi identificada em H. atlanticus, H. aurolineatum e H. plumieri, indicando a possível existência de populações discretas ou espécies crípticas.(AU)

Molecular characterization of goose parvovirus in geese of Turkey / Caracterização molecular de parvovírus de ganso em gansos da Turquia

Goose parvovirus (GPV), also called Derzsy's disease, is a viral pathogen that causes high morbidity and mortality in goslings and ducklings. In this study, we perform the molecular characterization of the GPV in Turkey. The definition of similarity to the world of GPV isolates in Turkey and construction of a phylogenetic tree was aimed. For this purpose, the presence of GPV in the liver, spleen, and intestine tissues of nine goslings with symptoms such as dysphagia, bilateral ocular swelling, eye discharge, diarrhea, and fatigue were investigated by real-time PCR method and all samples were detected as positive. According to the data obtained by molecular characterization, phylogenetic analysis of GPV has been presented in Turkey. As a result of this study, it was determined that the GPVs available in Turkey are virulent strains.(AU)

O parvovírus do ganso (GPV), também chamado de doença de Derzsy, é um patógeno viral que causa alta morbidade e mortalidade em gansos e patinhos. Neste estudo, objetivou-se a determinação da caracterização molecular do GPV na Turquia, a definição da similaridade com o mundo dos isolados de GPV na Turquia e a construção de uma árvore filogenética. Para tanto, a presença de GPV no fígado, baço e tecidos do intestino de nove gansos com sintomas como disfagia, edema ocular bilateral, secreção ocular, diarreia e fadiga foram investigados pelo método de PCR em tempo real e todas as amostras foram detectadas tão positivo. À luz dos dados obtidos por caracterização molecular, a análise filogenética do GPV foi apresentada na Turquia. Como resultado deste estudo, foi determinado que os GPVs disponíveis na Turquia são cepas virulentas.(AU)

Molecular characterization of goose parvovirus in geese of Turkey / Caracterização molecular de parvovírus de ganso em gansos da Turquia

Goose parvovirus (GPV), also called Derzsy's disease, is a viral pathogen that causes high morbidity and mortality in goslings and ducklings. In this study, we perform the molecular characterization of the GPV in Turkey. The definition of similarity to the world of GPV isolates in Turkey and construction of a phylogenetic tree was aimed. For this purpose, the presence of GPV in the liver, spleen, and intestine tissues of nine goslings with symptoms such as dysphagia, bilateral ocular swelling, eye discharge, diarrhea, and fatigue were investigated by real-time PCR method and all samples were detected as positive. According to the data obtained by molecular characterization, phylogenetic analysis of GPV has been presented in Turkey. As a result of this study, it was determined that the GPVs available in Turkey are virulent strains.(AU)

O parvovírus do ganso (GPV), também chamado de doença de Derzsy, é um patógeno viral que causa alta morbidade e mortalidade em gansos e patinhos. Neste estudo, objetivou-se a determinação da caracterização molecular do GPV na Turquia, a definição da similaridade com o mundo dos isolados de GPV na Turquia e a construção de uma árvore filogenética. Para tanto, a presença de GPV no fígado, baço e tecidos do intestino de nove gansos com sintomas como disfagia, edema ocular bilateral, secreção ocular, diarreia e fadiga foram investigados pelo método de PCR em tempo real e todas as amostras foram detectadas tão positivo. À luz dos dados obtidos por caracterização molecular, a análise filogenética do GPV foi apresentada na Turquia. Como resultado deste estudo, foi determinado que os GPVs disponíveis na Turquia são cepas virulentas.(AU)

Molecular detection of visceral leishmaniasis in dogs from Barão de Melgaço, Pantanal region of Mato Grosso, Brazil / Detecção molecular de leishmaniose visceral em cães do município de Barão de Melgaço, Pantanal Mato-Grossense, Brasil

The increasing expansion of visceral leishmaniasis (VL) in the Brazilian territory evidences the need for studies focused on the main reservoir of this parasite: the dog. This study aimed to conduct an epidemiological survey in the municipality of Barão de Melgaço, Pantanal region of the state of Mato Grosso (MT), Brazil. Conventional polymerase chain reaction (PCR) and qualitative SYBR®Green real-time PCR (qPCR) were used to diagnose canine VL (CVL) and characterize the factors associated with this infection. Of the 402 dogs that had blood samples collected, 31 presented the parasite DNA, representing a prevalence of 7.71% in the population studied. Positivity indices for PCR and qPCR were 3.48 (14/402) and 7.21% (29/402), respectively. Comparison of the results obtained by both techniques showed moderate agreement (Kappa = 0.5364). Of the independent variables analyzed, presence of clinical signs (p≤0.05) was the only one associated with CVL. Based on this study, we conclude that VL is a circulating disease, with relatively low prevalence, in dogs of Barão de Melgaço/MT, and that the presence of clinical signs is the only variable associated with canine infection.(AU)

A crescente expansão da leishmaniose visceral (LV) no território brasileiro evidencia a necessidade de estudos voltados ao principal reservatório doméstico do parasito: o cão. Sendo assim, o objetivo deste estudo foi realizar um inquérito epidemiológico no município de Barão de Melgaço, região do Pantanal Mato-grossense, utilizando as técnicas de reação em cadeia pela polimerase convencional (PCR) e teste qualitativo SYBR®Green real-time PCR (qPCR) para o diagnóstico da LV canina (LVC), além de caracterizar os fatores associados a infecção. Do total de 402 cães que tiveram amostras sanguíneas coletadas, 31 apresentaram o DNA do parasito, perfazendo uma prevalência de 7,71% na população estudada. Os índices de positividade para a PCR e qPCR foram de 3,48% (14/402) e 7,21% (29/402), respectivamente. A comparação dos resultados obtidos por ambas técnicas apresentou moderada concordância (Kappa = 0,5364). Das variáveis independentes analisadas, a presença de sinais clínicos (p≤0,05) foi a única associada a ocorrência de LVC. Com base neste estudo, concluímos que a LV está circulando, com prevalência relativamente baixa, em cães de Barão de Melgaço/MT, sendo a presença de sinais clínicos a única variável associada à infecção canina.(AU)

Molecular detection of visceral leishmaniasis in dogs from Barão de Melgaço, Pantanal region of Mato Grosso, Brazil / Detecção molecular de leishmaniose visceral em cães do município de Barão de Melgaço, Pantanal Mato-Grossense, Brasil

The increasing expansion of visceral leishmaniasis (VL) in the Brazilian territory evidences the need for studies focused on the main reservoir of this parasite: the dog. This study aimed to conduct an epidemiological survey in the municipality of Barão de Melgaço, Pantanal region of the state of Mato Grosso (MT), Brazil. Conventional polymerase chain reaction (PCR) and qualitative SYBR®Green real-time PCR (qPCR) were used to diagnose canine VL (CVL) and characterize the factors associated with this infection. Of the 402 dogs that had blood samples collected, 31 presented the parasite DNA, representing a prevalence of 7.71% in the population studied. Positivity indices for PCR and qPCR were 3.48 (14/402) and 7.21% (29/402), respectively. Comparison of the results obtained by both techniques showed moderate agreement (Kappa = 0.5364). Of the independent variables analyzed, presence of clinical signs (p≤0.05) was the only one associated with CVL. Based on this study, we conclude that VL is a circulating disease, with relatively low prevalence, in dogs of Barão de Melgaço/MT, and that the presence of clinical signs is the only variable associated with canine infection.(AU)

A crescente expansão da leishmaniose visceral (LV) no território brasileiro evidencia a necessidade de estudos voltados ao principal reservatório doméstico do parasito: o cão. Sendo assim, o objetivo deste estudo foi realizar um inquérito epidemiológico no município de Barão de Melgaço, região do Pantanal Mato-grossense, utilizando as técnicas de reação em cadeia pela polimerase convencional (PCR) e teste qualitativo SYBR®Green real-time PCR (qPCR) para o diagnóstico da LV canina (LVC), além de caracterizar os fatores associados a infecção. Do total de 402 cães que tiveram amostras sanguíneas coletadas, 31 apresentaram o DNA do parasito, perfazendo uma prevalência de 7,71% na população estudada. Os índices de positividade para a PCR e qPCR foram de 3,48% (14/402) e 7,21% (29/402), respectivamente. A comparação dos resultados obtidos por ambas técnicas apresentou moderada concordância (Kappa = 0,5364). Das variáveis independentes analisadas, a presença de sinais clínicos (p≤0,05) foi a única associada a ocorrência de LVC. Com base neste estudo, concluímos que a LV está circulando, com prevalência relativamente baixa, em cães de Barão de Melgaço/MT, sendo a presença de sinais clínicos a única variável associada à infecção canina.(AU)

Macroscopic, histological, and molecular aspects of Sarcocystis spp. infection in tissues of cattle / Aspecto Macroscópico, histológico e molecular de Sarcocystis spp. em tecidos de bovinos e ovinos

The macroscopic, histological, and molecular aspects of Sarcocystis spp. were examined in the tissues of two cattle and four sheep, 16 and eight fragments analyzed respectively, condemned in the slaughterhouse. All 24 samples were collected and analyzed for detecting macrocysts and macroscopic lesions. Subsequently, subdivided for direct examination, polymerase chain reaction and histopathological examination. All sheep tissues samples had grossly white round to oval tissue cysts, ranging from 0.3 to 1 cm in diameter. In contrast, cattle tissues did not present grossly visible cysts but had randomly distributed white-yellow foci with irregular contours. All samples from cattle and sheep had microscopic cysts. In the histological examination of sheep tissues, circular to elongated, encapsulated, basophilic structures ranging from 30 to 3,000 µm in length and 20 to 1,000 µm in width were observed within the skeletal muscle fibers. In cattle tissues, all cardiac muscle four fragments analyzed contained circular to elongated basophilic structures inside cardiomyocytes and in some Purkinje fibers. PCR were performed using the primers: 2L and 3H. In conclusion, all 24 tissues were infected with Sarcocystis spp., and S. gigantea (in sheep) and S. cruzi (in cattle). were the identified species by sequencing.(AU)

Os aspectos macroscópicos, histológicos e moleculares de Sarcocystis spp. foram examinados nos tecidos de dois bovinos e quatro ovinos, 16 e oito fragmentos analisados, respectivamente, condenados no matadouro. Todas as 24 amostras foram coletadas e analisadas para detecção de macrocistos e lesões macroscópicas. Posteriormente, subdivididas para exame direto, reação em cadeia da polimerase e exame histopatológico. Todas as amostras de tecidos de ovelha apresentavam cistos grosseiramente visíveis, caracterizados como brancos, de redondos a ovais e estruturas variando de 0,3 a 1 cm de diâmetro. Em contraste, os tecidos de bovinos não apresentavam cistos grosseiramente visíveis, mas tinham focos branco-amarelos com contornos irregulares, distribuídos aleatoriamente. Todas as amostras de bovinos e ovinos apresentavam cistos microscópicos. No exame histológico de tecidos ovinos foram observadas estruturas basofílicas circulares a alongadas, encapsuladas, variando de 30 a 3.000 µm de comprimento e 20 a 1.000 µm de largura dentro das fibras do músculo esquelético. Nos tecidos de bovinos, todos os quatro fragmentos de músculo cardíaco analisados continham estruturas basofílicas circulares a alongadas, dentro dos cardiomiócitos e em algumas fibras de Purkinje. PCRs foram realizadas utilizando-se os "primers" 2L e 3H. Em conclusão, todos os 24 tecidos estavam infectados com Sarcocystis spp., sendo S. gigantea (em ovinos) e S. cruzi (em bovinos) as espécies identificadas por sequenciamento.(AU)

Evaluation of an active and early surveillance methodology for visceral leishmaniasis by molecular detection in road-killed wild fauna / Avaliação de metodologia de vigilância ativa e precoce da leishmaniosevisceral por detecção molecular em fauna silvestre atropelada

The present study aimed to evaluate a methodology for active surveillance of visceral leishmaniasis by detecting Leishmania DNA in organs of wild road-killed animals from November 2016 to October 2018 in the North of Paraná, Brazil. The collection points of road-killed wild animals were georeferenced. The animals were autopsied and samples of bone marrow, lymph node, liver, spleen, and ear skin were collected. Genomic DNA was extracted and subjected to PCR for amplification of Leishmania spp. 18S, kinetoplastic DNA (kDNA), HSP70, and ITS1 genes, and DNA sequencing was performed. The primers used for the amplification of kDNA, ITS1, and HSP70 genes presented non-specific results. Of the 66 mammals collected from 24 different municipalities, one Southern Tamandua (Tamandua tetradactyla) presented DNA of Leishmania spp. in lymph nodes by 18S PCR. DNA sequencing confirmed the results of the subgenus, Viannia, identification. We suggest using the methodology showed in the present study in the active and early surveillance of visceral leishmaniasis in a non-endemic area.(AU)

O objetivo do presente estudo foi avaliar uma metodologia de vigilância ativa da leishmaniose visceral por meio da detecção de DNA de Leishmania em órgãos de animais silvestres atropelados, de novembro de 2016 a outubro de 2018, no Norte do Paraná, Brasil. Os pontos de coleta dos animais silvestres atropelados foram georreferenciados. Os animais foram autopsiados e amostras de medula óssea, linfonodo, fígado, baço, e pele de orelha foram coletados. DNA genômico foi extraído e submetido à PCR para amplificação de quatro diferentes regiões de Leishmania spp.: 18S, kDNA, HSP70 e ITS1, sequenciamento de DNA foi realizado. Os iniciadores utilizados para a amplificação dos genes kDNA, ITS1 e HSP70 apresentaram resultados inespecíficos. Dos 66 mamíferos coletados em 24 diferentes municípios, um tamanduá-mirim (Tamandua tetradactyla) apresentou DNA de Leishmania spp. em linfonodo na PCR, que amplificou o gene 18S. O sequenciamento de DNA confirmou o resultado e demonstrou a presença do subgênero Viannia. Sugere-se o uso da metodologia apresentada no presente estudo na vigilância ativa e precoce da leishmaniose visceral em área não endêmica.(AU)

Molecular Evidence of Rickettsia felis in Phereoeca sp / Evidência Molecular de Rickettsia felis em Phereoeca sp

Rickettsia felis is an obligate intracellular bacterium capable of infecting ticks, fleas, lice, and other arthropods. This bacterium is classified as a member of the Transitional Group (TRG) Rickettsia. It is known the evidence of R. felis mutualistic and obligatory relationship with some eukaryote organisms. However, there arent scientific accounts of R. felis and moths of the order Lepidoptera association. The current work reports the first identification of the bacteria R. felis in Phereoeca sp. For that, a polymerase chain reaction (PCR) assay using gltA, ompA, and ompB genes was used. The nucleotide sequences showed 100% of identity with other Rickettsia felis sequences. The genus-level identification of the moth larvae was performed by morphological taxonomic keys and PCR analysis of the cytochrome oxidase I (COI) gene. The nucleotide sequenced showed 94.94% similarity with the species Phereoeca praecox. However, with the low number of sequences deposited in the databases, the species was classified as Phereoeca sp. The results suggest that R. felis may develop in an organism without blood-feeding behavior (Lepidoptera), as it has been demonstrated for booklice (Psocoptera). Further investigation is necessary in order to confirm pathogenic or mutualistic association with moths.(AU)

Rickettsia felis é uma bactéria intracelular obrigatória capaz de infectar carrapatos, pulgas, piolhos e outros artrópodes. Essa bactéria é classificada como um membro do Grupo de Transição (TRG). Há evidência de que R. felis está relacionada a alguns organismos eucariotos em um relacionamento mutualístico e obrigatório. No entanto, nenhum relato científico mostra alguma relação entre R. felis e traças da ordem Lepidoptera. O presente trabalho relata a primeira identificação da bactéria R. felis em Phereoeca sp. Para isso, empregou-se um ensaio de reação em cadeia da polimerase (PCR) utilizando-se os genes gltA, ompA e ompB. As sequências nucleotídicas mostraram 100% de identidade com outras sequências de Rickettsia felis. Utilizando-se chaves taxonômicas morfológicas e análise por PCR do gene da citocromo oxidase I (COI) foi feita a identificação em nível de espécie da forma jovem das traças. O nucleotídeo sequenciado mostrou 94,94% de similaridade com a espécie Phereoeca praecox. Entretanto, com o baixo número de sequências depositadas nos bancos de dados, a espécie foi classificada como Phereoeca sp. Os resultados sugerem que R. felis pode se desenvolver em um organismo sem alimentação de sangue (Lepidoptera), assim como tem sido demonstrado para a espécie Liposcelis bostrychophila (Psocoptera). Mais investigações são necessárias para confirmar uma possível associação patogênica ou mutualística com traças.(AU)

Molecular analysis reveals high diversity in the Hoplias malabaricus (Characiformes, Erythrinidae) species complex from different Amazonian localities / Análise molecular revela alta diversidade no complexo de espécies Hoplias malabaricus (Characiformes, Erythrinidae) de diferentes localidades amazônicas

DNA barcoding proposes that a fragment of DNA can be used to identify species. In fish, a fragment of cytochrome oxidase subunit I (COI) has been effective in many studies with different foci. Here we use this molecular tool to provide new insights into the cryptic diversity found in the Hoplias malabaricus species complex. Popularly known as trahira, H. malabaricus is widely distributed in South America. The clade shows molecular and cytogenetic diversity, and several studies have supported the occurrence of a complex of species. We performed molecular and karyotypic analysis of H. malabaricus individuals from eight Amazonian localities to assess the diversity present in the nominal taxon, and to clarify relationships within this group. We used 12 samples in cytogenetic analyses and found two karyomorphs: 2n = 40 (20m + 20sm) (karyomorph C) and 2n = 42 (22m + 20sm) (karyomorph A). We used 19 samples in molecular analyses with COI as a molecular marker, maximum likelihood analyses, and the Kimura-2-parameter evolutionary model with bootstrap support. We found karyomorph-related differentiation with bootstrap of 100%. However, we found high molecular diversity within karyomorph C. The observed pattern allowed us to infer the presence of cryptic diversity, reinforcing the existence of a species complex.(AU)

O DNA barcoding propõe que um fragmento de DNA possa servir para identificar espécies. Em peixes, um fragmento do gene COI tem se mostrado eficaz em muitos estudos com focos diferentes. Nós usamos essa ferramenta molecular para fornecer novas informações sobre a diversidade críptica encontrada no complexo de espécies Hoplias malabaricus. Popularmente conhecida como traíra, H. malabaricus tem uma ampla distribuição na América do Sul. Esse clado mostra diversidade molecular e citogenética, e vários estudos dão suporte à ocorrência de um complexo de espécies. Realizamos análises molecular e cariotípica em indivíduos de H. malabaricus de oito localidades amazônicas, para acessar a diversidade no taxon nominal e elucidar as relações nesse grupo. Usamos 12 amostras em análises citogenéticas e encontramos dois cariomorfos: 2n = 40 (20m + 20sm) (cariomorfo C) e 2n = 42 (22m + 20sm) (cariomorfo A). Usamos 19 amostras em análise molecular, utilizando COI como marcador molecular, análises de máxima verossimilhança e o modelo evolutivo de Kimura-2-parâmetros com estimativa de bootstrap. Encontramos diferenciação relacionada aos cariomorfos com bootstrap de 100%. No entanto, encontramos alta diversidade molecular no cariomorfo C. O padrão observado nos permitiu inferir a presença de diversidade oculta, reforçando a existência de um complexo de espécies.(AU)

Myxobolus freitasi n. sp. (Myxozoa: Bivalvulida), a parasite of the brain of the electric knifefish in the Brazilian Amazon region / Myxobolus freitasi n. sp. (Myxozoa: Bivalvulida), parasita do cérebro do peixe-faca elétrico na Amazônia brasileira

A total of 30 specimens of the Amazonian electric knifefish, Brachyhypopomus beebei Schultz, 1944 (Gymnotiformes: Hypopomidae), were collected from the Peixe-Boi River in the state of Pará, Brazil (1°0659 S; 47°1826 W). Fragments of the brain tissue were extracted for analysis via optical microscopy, and 18 specimens (60%) presented microparasites of the genus Myxobolus, with unequal capsules. The spores were 18.6 µm (17.7-19.8 µm) long and 8.6 µm (8.4-9.0 µm) wide; the largest polar capsule was 13.0 µm (12.4-13.4 µm) long and 5.6 µm (5.3-6.0 µm) wide, and the smallest capsule was 5.0 µm (4.5-5.3 µm) long and 2.5 µm (2.3-2.6 µm) wide. Infected brain fragments were extracted for histological processing and staining with hematoxylin-eosin and Ziehl-Neelsen. Some fragments were conserved in ethanol for molecular genetics analysis. A partial sequence of the 18S DNA gene was obtained from the spores, which did not correspond to any other sequences deposited in GenBank, although it did form a clade with other Myxobolus parasites of the nervous system. The morphological data, together with molecular phylogeny, supported the designation of a new species Myxobolus freitasi n. sp.(AU)

Um total de 30 espécimes do peixe-faca elétrico da Amazônia, Brachyhypopomus beebei Schultz, 1944 (Gymnotiformes: Hypopomidae), foram coletados no rio Peixe-Mani, no estado do Pará, Brasil (1 ° 06'59 S; 47 ° 18 ' 26 W). Fragmentos de tecido cerebral foram extraídos para análise em microscopia óptica, sendo que 18 espécimes (60%) apresentavam microparasitos do gênero Myxobolus, com cápsulas desiguais. Os esporos apresentavam 18,6 µm (17,7-19,8 µm) de comprimento e 8,6 µm (8,4-9,0 µm) de largura; a maior cápsula polar tinha 13,0 µm (12,4-13,4 µm) de comprimento e 5,6 µm (5,3-6,0 µm) de largura, e a menor cápsula tinha 5,0 µm (4,5-5,3 µm) de comprimento e 2,5 µm (2,3-2,6 µm) de largura. Fragmentos cerebrais infectados foram extraídos para processamento histológico e coloração com hematoxilina-eosina e Ziehl-Neelsen. Alguns fragmentos foram conservados em etanol para análise genética molecular. Dos esporos, foi obtida uma sequência parcial do gene 18S do DNA, que não correspondeu a nenhuma outra sequência depositada no GenBank, embora tenha formado um clado com outros parasitas do gênero Myxobolus do sistema nervoso. Os dados morfológicos, juntamente com a filogenia molecular, apoiaram a designação de uma nova espécie Myxobolus freitasi n. sp.(AU)

Molecular investigation of Toxoplasma gondii in oysters (Crassostrea spp. ) sold on beaches in the State of Pará, Brazil / Investigação molecular de Toxoplasma gondii em ostras (Crassostrea spp. ) comercializadas em praias do estado do Pará, Brasil

The aim of this study was to detect Toxoplasma gondii DNA in oysters (Crassostrea spp.) sold on seven beaches in the State of Pará, Brazil. According to the National Program for Hygiene and Sanitary Control of Bivalve Mollusks, 100 g of the edible part of mollusks is required to analyze contaminating microorganisms. In this study, 12 oysters were assumed to be equivalent to 100 g of edible parts when preparing each pooled sample. In total, 360 oysters were purchased from 30 vendors. From groups of 12 oysters purchased per vendor, 60 pooled samples were obtained, comprising 30 gill tissues and 30 gastrointestinal tracts. For molecular analysis, nested-PCR was conducted to amplify a 155-base-pair product of the B1 gene from T. gondii. All analyzed samples were negative for T. gondii. Our findings indicate that the oyster samples sold on the beaches in the State of Pará were not contaminated by T. gondii.(AU)

O objetivo deste estudo foi detectar DNA de Toxoplasma gondii em ostras (Crassostrea spp.) comercializadas em sete praias do Estado do Pará, Brasil. De acordo com o Programa Nacional de Controle Higiênico Sanitário de Moluscos Bivalves, 100 g da parte comestível dos moluscos são necessários para a análise de microrganismos contaminantes. Neste estudo, 12 ostras foram consideradas equivalentes a 100 g de partes comestíveis na preparação de cada amostra agrupada. No total, 360 ostras foram compradas de 30 vendedores. De grupos de 12 ostras adquiridas por vendedor, foram obtidas 60 amostras agrupadas, compreendendo 30 tecidos branquiais e 30 tratos gastrointestinais. Para a análise molecular, a nested PCR foi realizada para amplificar um produto de 155 pares de bases do gene B1 de T. gondii. Todas as amostras analisadas foram negativas para T. gondii. Os resultados indicam que as amostras de ostras comercializadas em praias do Estado do Pará não foram contaminadas por T. gondii.(AU)

First molecular detection of Haemoproteus spp. and Plasmodium spp. in eared doves (Zenaida auriculata) in Brazil / Primeira detecção molecular de Haemoproteus spp. e Plasmodium spp. em pombos (Zenaida auriculata) no Brasil

The aim of this study was to verify the presence and identify the species of haemosporidian parasites in eared doves (Zenaida auriculata) in Brazil. Two hundred and eleven male and female eared doves were trap-captured in four different regions of Londrina city, in southern Brazil. Whole blood was collected in EDTA tubes through heart puncture after euthanasia in a CO2 chamber. A nested PCR targeting the mitochondrial cytochrome b gene (cyt b) of Haemoproteus spp./Plasmodium spp. was performed, followed by an enzymatic digestion to identify the genus. Phylogenetic trees were constructed to determine the closely related species. Out of 211 eared doves, 209 (99.05%) were positive for Haemoproteus spp. and/or Plasmodium spp. RFLP analysis showed that 72.72% (152/209) of eared doves were positive only for Haemoproteus spp., 6.22% (13/209) were positive only for Plasmodium spp., and 21.05% (44/209) of eared doves had mixed infections. Genetic analysis found four samples that were homologous with Haemoproteus multipigmentatus and one that was homologous with Plasmodium sp. This is the first molecular study of hemoparasites from eared doves in Brazil, and it is also the first description of H. multipigmentatus and Plasmodium spp. infection in eared doves in Brazil.(AU)

O objetivo deste estudo foi verificar a presença e a identificação espécies de parasitas hemosporídeos em pombos (Zenaida auriculata) no Brasil. Duzentos e onze pombos machos e fêmeas foram capturados em quatro regiões diferentes de Londrina, sul do Brasil. Amostra de sangue foi coletada em tubos contendo EDTA por meio de punção cardíaca, após eutanásia em câmara de CO2. Uma nested PCR com alvo no gene mitocondrial citocromo b (cyt b) de Haemoproteus spp./Plasmodium spp. foi realizada, seguida de digestão enzimática para identificar o gênero. A árvore filogenética foi construída para determinar a relação com outras espécies. Das 211 pombas, 209 (99,05%) foram positivas para Haemoproteus spp./Plasmodium spp. A análise RFLP demonstrou que 72,72% (152/209) das pombas foram positivas somente para Haemoproteus spp.; 6,22% (13/209) foram positivas somente para Plasmodium e 21,05% (44/209) das pombas tiveram infecções mistas. A análise genética mostrou quatro amostras homólogas com H. multipigmentatus e uma com Plasmodium spp. Este é o primeiro estudo molecular de hemoparasitas em pombos no Brasil. E é também a primeira descrição da infecção por H. multipigmentatus e Plasmodium spp. em pombos Z. auriculata no Brasil.(AU)

Neoechinorhynchus macrospinosus (Acanthocephala: Neoechinorhynchidae) in Rabbit fish Siganus rivulatus (Siganidae): morphology and phylogeny / Neoechinorhynchus macrospinosus (Acanthocephala: Neoechinorhynchidae) em peixes-coelho Siganus rivulatus (Siganidae): morfologia e filogenia

Siganids are the most important marine fish distributed along the African coast. Therefore, the current study aimed to investigate parasite fauna infects one of the most important mariculture fish species in the Red Sea, the Rabbit fish Siganus rivulatus. One acanthocephalan species has been isolated from the posterior region of fish intestine, belonging to the Neoechinorhynchidae family, and named as Neoechinorhynchus macrospinosus Amin & Nahhas, 1994 based on its morphological and morphometric features. In order to determine the accurate taxonomic position of this acanthocephalan species, molecular phylogenetic analysis was carried out based on the partial sequences of 18S rDNA gene region. The obtained data revealed that this species was associated with a close identity ˃71% for other species belonging to the Neoechinorhynchidae family. In addition, the recovered species deeply embedded in the Neoechinorhynchus genus, closely related to the previously described Neoechinorhynchus sp., N. mexicoensis, and N. golvani with identity percent of 95.14, 93.59, 93.59%, respectively. Therefore, the present study provide a better understanding about the taxonomic status of N. macrospinosus based on 18S rDNA that can be useful for achieving a proper assessment of biodiversity.

Os siganídeos são os peixes marinhos mais importantes distribuídos ao longo da costa africana. Portanto, o presente estudo teve como objetivo investigar a fauna de parasitas infectando uma das espécies mais importantes de peixes para maricultura no Mar Vermelho, o peixe-coelho Siganus rivulatus. Uma espécie de acantocéfalo foi isolada da região posterior do intestino de peixes pertencentes à família Neoechinorhynchidae, e denominadas Neoechinorhynchus macrospinosus Amin & Nahhas, 1994, com base em suas características morfológicas e morfométricas. A fim de determinar a posição taxonômica precisa dessa espécie de acantocéfalo, a análise filogenética molecular foi realizada com base nas sequências parciais da região do gene 18S rDNA e revelou que essa espécie estava associada a uma identidade próxima de até 71% para outras espécies pertencentes a família Neoechinorhynchidae e profundamente enraizada no gênero Neoechinorhynchus, intimamente relacionada a Neoechinorhynchus sp., N. mexicoensis, and N. golvani descrito anteriormente com percentual de identidade de 95,14, 93,59, 93,59%, respectivamente. Portanto, o presente estudo fornece uma melhor compreensão sobre o status taxonômico de N. macrospinosus com base no 18S rDNA que pode ser útil para obter uma avaliação adequada da biodiversidade.

In-depth transcriptome reveals the potential biotechnological application of Bothrops jararaca venom gland

Lack of complete genomic data of Bothrops jararaca impedes molecular biology research focusing on biotechnological applications of venom gland components. Identification of full-length coding regions of genes is crucial for the correct molecular cloning design. Methods: RNA was extracted from the venom gland of one adult female specimen of Bothrops jararaca. Deep sequencing of the mRNA library was performed using Illumina NextSeq 500 platform. De novo assembly of B. jararaca transcriptome was done using Trinity. Annotation was performed using Blast2GO. All predicted proteins after clustering step were blasted against non-redundant protein database of NCBI using BLASTP. Metabolic pathways present in the transcriptome were annotated using the KAAS-KEGG Automatic Annotation Server. Toxins were identified in the B. jararaca predicted proteome using BLASTP against all protein sequences obtained from Animal Toxin Annotation Project from Uniprot KB/Swiss-Pro database. Figures and data visualization were performed using ggplot2 package in R language environment. Results: We described the in-depth transcriptome analysis of B. jararaca venom gland, in which 76,765 de novo assembled isoforms, 96,044 transcribed genes and 41,196 unique proteins were identified. The most abundant transcript was the zinc metalloproteinase-disintegrin-like jararhagin. Moreover, we identified 78 distinct functional classes of proteins, including toxins, inhibitors and tumor suppressors. Other venom proteins identified were the hemolytic lethal factors stonustoxin and verrucotoxin. Conclusion: It is believed that the application of deep sequencing to the analysis of snake venom transcriptomes may represent invaluable insight on their biotechnological potential focusing on candidate molecules.(AU)

Neoechinorhynchus macrospinosus (Acanthocephala: Neoechinorhynchidae) in Rabbit fish Siganus rivulatus (Siganidae): morphology and phylogeny / Neoechinorhynchus macrospinosus (Acanthocephala: Neoechinorhynchidae) em peixes-coelho Siganus rivulatus (Siganidae): morfologia e filogenia

Siganids are the most important marine fish distributed along the African coast. Therefore, the current study aimed to investigate parasite fauna infects one of the most important mariculture fish species in the Red Sea, the Rabbit fish Siganus rivulatus. One acanthocephalan species has been isolated from the posterior region of fish intestine, belonging to the Neoechinorhynchidae family, and named as Neoechinorhynchus macrospinosus Amin & Nahhas, 1994 based on its morphological and morphometric features. In order to determine the accurate taxonomic position of this acanthocephalan species, molecular phylogenetic analysis was carried out based on the partial sequences of 18S rDNA gene region. The obtained data revealed that this species was associated with a close identity ˃71% for other species belonging to the Neoechinorhynchidae family. In addition, the recovered species deeply embedded in the Neoechinorhynchus genus, closely related to the previously described Neoechinorhynchus sp., N. mexicoensis, and N. golvani with identity percent of 95.14, 93.59, 93.59%, respectively. Therefore, the present study provide a better understanding about the taxonomic status of N. macrospinosus based on 18S rDNA that can be useful for achieving a proper assessment of biodiversity.(AU)

Os siganídeos são os peixes marinhos mais importantes distribuídos ao longo da costa africana. Portanto, o presente estudo teve como objetivo investigar a fauna de parasitas infectando uma das espécies mais importantes de peixes para maricultura no Mar Vermelho, o peixe-coelho Siganus rivulatus. Uma espécie de acantocéfalo foi isolada da região posterior do intestino de peixes pertencentes à família Neoechinorhynchidae, e denominadas Neoechinorhynchus macrospinosus Amin & Nahhas, 1994, com base em suas características morfológicas e morfométricas. A fim de determinar a posição taxonômica precisa dessa espécie de acantocéfalo, a análise filogenética molecular foi realizada com base nas sequências parciais da região do gene 18S rDNA e revelou que essa espécie estava associada a uma identidade próxima de até 71% para outras espécies pertencentes a família Neoechinorhynchidae e profundamente enraizada no gênero Neoechinorhynchus, intimamente relacionada a Neoechinorhynchus sp., N. mexicoensis, and N. golvani descrito anteriormente com percentual de identidade de 95,14, 93,59, 93,59%, respectivamente. Portanto, o presente estudo fornece uma melhor compreensão sobre o status taxonômico de N. macrospinosus com base no 18S rDNA que pode ser útil para obter uma avaliação adequada da biodiversidade.(AU)

Molecular detection of Cercopithifilaria bainae and other tick-borne pathogens in Rhipicephalus sanguineus s.l. isolated from dogs in Midwest Brazil / Detecção molecular de Cercopithifilaria bainae e outros patógenos transmitidos por carrapatos em Rhipicephalus sanguineus s.l. isolados de cães no Centro-Oeste do Brasil

The aim of the present study was to detect Cercopithifilaria bainae and other tick-borne pathogens and to perform molecular characterization of the tick Rhipicephalus sanguineus s.l. collected from dogs. Ticks (n = 432, including 8 larvae, 59 nymphs, and 365 adults) were sampled from domiciled dogs (n = 73) living in Campo Grande, Mato Grosso do Sul (Midwest Brazil). All ticks were morphologically identified as R. sanguineus. Genomic DNA was extracted in pools (three to five ticks per animal) and was used for definition of R. sanguineus haplotypes (based on 16S rRNA analysis) and pathogen identification (Cercopithifilaria sp., Ehrlichia canis, Anaplasma platys, Hepatozoon canis, Babesia vogeli and Rickettsia spp.). Rhipicephal us sanguineus specimens were identified as haplotypes A and B. DNA of Cercopithifilaria bainae (43.83%; 32/73), Ehrlichia canis (24.65%; 18/73), Anaplasma platys (19.17%; 14/73), and Hepatozoon canis (5.47%; 4/73) was detected. The identity of pathogens was confirmed by DNA sequence analysis. The present study confirms the presence of haplotypes A and B of R. sanguineus in the state of Mato Grosso do Sul and its importance as a vector of several pathogens of veterinary concern. Finally, this is the first report to identify C. bainae in ticks in the Midwestern region of Brazil.(AU)

O objetivo do presente estudo foi detectar Cercopithifilaria bainae e outros patógenos transmitidos por carrapatos e realizar a caracterização molecular do carrapato Rhipicephalus sanguineus s.l. coletado em cães. Carrapatos (n = 432, incluindo 8 larvas, 59 ninfas e 365 adultos) foram amostrados de cães domiciliados (n = 73) residentes no município de Campo Grande, Mato Grosso do Sul (centro-oeste do Brasil). Todos os carrapatos foram identificados morfologicamente como R. sanguineus. O DNA genômico foi extraído em pools (três a cinco carrapatos por animal), seguido pela definição de haplótipos (com base no gene 16S rRNA) e pela investigação de patógenos (Cercopithifilaria sp., Ehrlichia canis, Anaplasma platys, Hepatozoon canis, Babesia vogeli e Rickettsia spp.). Os espécimes coletados foram identificados como haplótipos A e B de R. sanguineus. Foram detectados DNA de Cercopithifilaria bainae (43,83%; 32/73), Ehrlichia canis (24,65%; 18/73), Anaplasma platys (19,17%; 14/73) e Hepatozoon canis (5,47%; 4/73). A identidade dos patógenos foi confirmada por análise de sequência de DNA. O presente estudo confirma a circulação dos haplótipos A e B de R. sanguineus no estado de Mato Grosso do Sul e sua importância como vetor de vários patógenos de interesse veterinário. Finalmente, este é o primeiro relato de C. bainae em carrapatos na região centro-oeste do Brasil.(AU)

Molecular characteristics of polysulfated fractions from the green seaweed Caulerpa cupressoides and actions on thrombin generation in vitro

Caulerpa cupressoides produces sulfated polysaccharides (Cc-SPs) with serpin-dependent anticoagulant effect, but their actions on thrombin generation (TG) are unknown. This study aimed to partially characterize Cc-SPs and examine their potential as modulators of TG. Infrared analysis characterized extract containing three ulvan fractions (Cc-SP1, -SP2 and -SP3) separated by DEAEcellulose chromatography, with differences in the relative proportions of sulfate (10.99-18.38%) and total sugars (46.59-51.12%), without presenting proteins. Charge density patterns and nonSPs varying from 8 to > 100 kDa on agarose and polyacrylamide gel electrophoresis by sequential staining with toluidine blue and stains-all were also confirmed by gel permeation chromatography. The molecular weight of Cc-SP2 was not altered after treatment with 0.4 M HCl up to 5 h. Only Cc-SP2 altered the activated partial thromboplastin time (15 ± 0.3 IU) vs. heparin (193 IU) and abolished at high concentrations (> 4.1 μg) TG by intrinsic pathway in 60-fold diluted human plasma, while at 4.1 μg attenuated TG by 33.87% delaying the lag phase (32 min.) vs. control (28 min.). Cc-SP2 induced concentration-dependent TG in system without cephalin. Heparin abolished TG at 4.15-fold lower amount, but did not stimulate TG. Therefore, Cc-SPs express dual effects on thrombosis in vitro.

Spatiotemporal expression pattern of alpha, beta, and gamma genes during BoHV-5 infection / Expressão temporal de genes alfa, beta e gama durante ainfecção pelo BoHV-5

Bovine herpesvirus 5 is an alphaherpesvirus that causes nonsuppurative meningoencephalitis in cattle. This disease occurs naturally in either outbreaks or isolated cases, and exhibits low morbidity and high lethality. Although previous studies elucidated crucial aspects involved in the pathogenesis of the disease, there is a paucity of information regarding the molecular events contributing to infection and replication of BoHV-5. The objective of the present study was to determine the in vitro gene expression pattern of BoHV-5 (e.g., alpha, beta, and gamma genes) and host cells genes (GAPDH and 18S) over time utilizing different quantities of inoculated virus. Three BoHV-5 genes (bICP0, UL9, US4) and one structural bovine cell gene had their expression accessed by real-time PCR. While the expression of BoHV-5 genes increased during the course of infection, GAPDH gene expression decreased in the host cells, evidencing the effect of viral infection on the expression of bovine cell genes. The 18S ribosomal RNA (rRNA) gene was constitutively expressed throughout BoHV-5 infection. Our data clearly demonstrates that GAPDH gene should not be used as a reference gene in studies of BoHV-5 infection because it was influenced by viral infection. However, 18S rRNA was constitutively expressed and, therefore, is recommended for normalization of BoHV-5 infection studies in bovine cells. The expression of viral genes transcripts was not altered by increasing number of viral particles added to the culture. All viral genes included here demonstrated the same expression pattern over time and there was no difference in the expression of viral genes among the various time points. Our data show important differences comparing to classical studies regarding herpesvirus alpha, beta, and gamma genes expression. More research is necessary to improve our understanding about the BoHV-5 biology during infection. Studies employing next-generation sequencing (i.e., RNA-seq), using both in vitro and in vivo models, would be the next logical step to grasp the virus and host cell's transcriptome changes over the course of infection.(AU)

Herpesvirus bovino 5 é um alfaherpesvírus causador de meningoencefalite não supurativa em bovinos. Esta doença possui ocorrência natural em surtos ou casos isolados, associadas a baixa morbidade e alta letalidade. Embora estudos anteriores tenham elucidado aspectos relacionados a patogenia da doença, há uma lacuna de conhecimento relacionado aos eventos moleculares que contribuem para a infecção e replicação do BoHV-5. O objetivo do presente estudo foi determinar a expressão gênica in vitro de genes virais (i.e., alfa, beta e gama) e das células hospedeiras (GAPDH e 18S) durante a infecção considerando diferentes momentos de infecção e quantidade de vírus utilizado. Três genes do BoHV-5 (bICP0, UL9, US4), um gene estrutural (GAPDH) e um gene constitutivo (18S) da célula bovina tiveram suas expressões avaliadas por PCR quantitativa (qPCR). Enquanto os genes virais tiveram sua expressão aumentada ao longo do tempo de infecção, o gene hospedeiro teve sua expressão diminuída, demonstrando a ação do vírus na expressão gênica de células bovinas in vitro. O gene constitutivo 18S teve sua expressão mantida durante todos os momentos do experimento. Nossos resultados claramente demonstraram que o GAPDH não deve ser usado como gene de referência em estudos com infecção por BoHV-5 pois é influenciado pela infecção viral. Entretanto, o 18S rRNA foi constitutivamente expresso e pode ser recomendado para normalização em células bovinas infectadas pelo vírus. A expressão de mRNA viral não foi alterada pela quantidade de vírus usada. Todos os genes virais demonstraram o mesmo padrão de expressão ao longo do tempo de infecção. Nossos resultados trazem importantes diferenças comparando aos estudos clássicos que avaliaram a expressão de genes alfa, beta e gama. Mais estudos são necessários para aumentar o conhecimento da biologia molecular do BoHV-5. Estudo utilizando sequenciamento de última geração (i.e., RNA-seq), usando modelos in vitro e in vivo, aparentam ser o próximo passo lógico para acessar as alterações do transcriptoma do hospedeiro e viral ao longo do curso da infecção.(AU)