Detection of Pseudomonas sp. in pirarucu (Arapaima gigas): a case report in the Western Amazon / Detecção dePseudomonas sp.em pirarucu (Arapaima gigas): um relato de caso na Amazônia Ocidental

Pirarucu (Arapaima gigas) is one of the most important fish in Amazonian fish farming. However, information about its nutritional, zootechnical and microbiological aspects is still scarce. This is especially true for the juvenile phase due to high mortality rates caused by malnutrition, difficulties in food training, endo and ectoparasite infestations, which in turn lead to immunosuppression, favoring secondary bacterial infections that may be present due to various environmental factors (e.g., sudden temperature variations, water acidity and pollution of the aquatic environment) and the status of fish. The Pseudomonas sp. species studied in this work is part of the aquatic ecosystem and is considered a contaminant or invader because it infects a wide variety of aquatic species, including pirarucu. Given this assumption, the objective of the study was to report a case of Pseudomonas sp. in the viscera and dorsum of a juvenile pirarucu Arapaima gigas (SCHINZ, 1822) detected through bacteriological analysis. In the fish production chain in the Western Amazon, pirarucu is one of the most prominent fish species because of its high zootechnical performance in terms of weight gain and commercial value. However, one of the biggest obstacles in its production chain occurs during the juvenile phase, with high mortality rates caused by mainly bacterial infections, leading to economic

O pirarucu (Arapaima gigas)é um dos peixes de maior interesse para piscicultura amazônica. No entanto, os conhecimentos sob os aspectos nutricional, zootécnico e microbiológico desse peixe ainda são escassos. Sobretudo, na fase juvenil, porque nessa fase ocorrem altas taxas de mortalidade porque são mais susceptíveis à desnutrição, dificuldades no treinamento alimentar, infestações por endo e ectoparasitas, que por sua vez, ocasionam imunossupressão, favorecendo infecções bacterianas secundárias que podem estar presentes em virtude de diversos fatores ambientais e estado imunológico dos peixes. São exemplos, variações bruscas de temperatura, acidez da água e poluição do ambiente aquático. A espécie Pseudomonas sp. estudada nesse trabalho faz parte do ecossistema aquático, sendo considerada como contaminante ou um invasor, porque infecta grande variedade de espécies aquáticas, inclusive o pirarucu. Diante do pressuposto, o objetivo do trabalho foi relatar o caso de detecção de Pseudomonas sp.em vísceras e dorso do pirarucu Arapaima gigas(SCHINZ, 1822) juvenil por meio de análise bacteriológica. Na cadeia produtiva do pescado na Amazônia Ocidental, o pirarucu é um dos peixes de destaque por ser uma espécie com alto desempenho zootécnico em ganho de peso e valor comercial. Porém, um dosmaiores empecilhos da cadeia produtiva se encontra na fase juvenil da espécie havendo altos índices de mortalidade ocasionados por infecções principalmente de origem bacteriana levando a percas econômicas a piscicultura. Neste estudo detectou-se Pseudomonas sp.em amostra de dorso e vísceras de pirarucu em uma piscicultura no município de Ouro Preto do Oeste, Rondônia, Brasil.

Detection of Pseudomonas sp. in pirarucu (Arapaima gigas): a case report in the Western Amazon / Detecção dePseudomonas sp.em pirarucu (Arapaima gigas): um relato de caso na Amazônia Ocidental

Pirarucu (Arapaima gigas) is one of the most important fish in Amazonian fish farming. However, information about its nutritional, zootechnical and microbiological aspects is still scarce. This is especially true for the juvenile phase due to high mortality rates caused by malnutrition, difficulties in food training, endo and ectoparasite infestations, which in turn lead to immunosuppression, favoring secondary bacterial infections that may be present due to various environmental factors (e.g., sudden temperature variations, water acidity and pollution of the aquatic environment) and the status of fish. The Pseudomonas sp. species studied in this work is part of the aquatic ecosystem and is considered a contaminant or invader because it infects a wide variety of aquatic species, including pirarucu. Given this assumption, the objective of the study was to report a case of Pseudomonas sp. in the viscera and dorsum of a juvenile pirarucu Arapaima gigas (SCHINZ, 1822) detected through bacteriological analysis. In the fish production chain in the Western Amazon, pirarucu is one of the most prominent fish species because of its high zootechnical performance in terms of weight gain and commercial value. However, one of the biggest obstacles in its production chain occurs during the juvenile phase, with high mortality rates caused by mainly bacterial infections, leading to economic

O pirarucu (Arapaima gigas)é um dos peixes de maior interesse para piscicultura amazônica. No entanto, os conhecimentos sob os aspectos nutricional, zootécnico e microbiológico desse peixe ainda são escassos. Sobretudo, na fase juvenil, porque nessa fase ocorrem altas taxas de mortalidade porque são mais susceptíveis à desnutrição, dificuldades no treinamento alimentar, infestações por endo e ectoparasitas, que por sua vez, ocasionam imunossupressão, favorecendo infecções bacterianas secundárias que podem estar presentes em virtude de diversos fatores ambientais e estado imunológico dos peixes. São exemplos, variações bruscas de temperatura, acidez da água e poluição do ambiente aquático. A espécie Pseudomonas sp. estudada nesse trabalho faz parte do ecossistema aquático, sendo considerada como contaminante ou um invasor, porque infecta grande variedade de espécies aquáticas, inclusive o pirarucu. Diante do pressuposto, o objetivo do trabalho foi relatar o caso de detecção de Pseudomonas sp.em vísceras e dorso do pirarucu Arapaima gigas(SCHINZ, 1822) juvenil por meio de análise bacteriológica. Na cadeia produtiva do pescado na Amazônia Ocidental, o pirarucu é um dos peixes de destaque por ser uma espécie com alto desempenho zootécnico em ganho de peso e valor comercial. Porém, um dosmaiores empecilhos da cadeia produtiva se encontra na fase juvenil da espécie havendo altos índices de mortalidade ocasionados por infecções principalmente de origem bacteriana levando a percas econômicas a piscicultura. Neste estudo detectou-se Pseudomonas sp.em amostra de dorso e vísceras de pirarucu em uma piscicultura no município de Ouro Preto do Oeste, Rondônia, Brasil.(AU)

Survival of Pseudomonas marginalis pv. marginalis in garlic cloves / Sobrevivência de Pseudomonas marginalis pv. marginalis em bulbilhos de alho

Bacterial soft rot of garlic caused by Pseudomonas marginalis pv. marginalis is one of the crops main leaf diseases, and little is known about its dynamics of survival in the clove. Accordingly, this study set out to determine this bacteriums survival in the clove with and without asepsis during storage. Garlic cloves of the Chonan cultivar were inoculated with an isolated rifampicin-resistant mutant of P. marginalis pv. marginalis to distinguish them from other bacteria and were transplanted in the field. The population present in the clove was evaluated at the end of the crop cycle and then on a monthly basis until the sixth month in storage. To quantify the bacterial population, three replications were conducted with ten grams each of cloves with and without asepsis by sodium hypochlorite for three minutes. Serial dilution was then used for isolation, followed by plating in a King B culture medium with rifampicin for selective isolation of the bacterium. After 48 hours of incubation at 28 ºC, the colonies were counted on a monthly basis to analyze their survival in the clove. The results indicate that the bacterium is unable to survive in cloves subjected to asepsis during storage, but it can survive without asepsis for up to three months.

A queima-bacteriana-do-alho causada por Pseudomonas marginalis pv. marginalis é uma das principais doenças foliares da cultura e pouco se conhece de sua dinâmica de sobrevivência no bulbilho. Dentro deste aspecto, o objetivo deste trabalho foi avaliar a sobrevivência desta bactéria no bulbilho com e sem assepsia durante o armazenamento. Bulbilhos de alho do cultivar Chonan foram inoculados com isolado mutante a rifampicina de P. marginalis pv. marginalis para diferenciar de outras bactérias e foram transplantados a campo. Ao final do ciclo da cultura foi avaliada a população presente no bulbilho e mensalmente até o sexto mês de armazenamento. Para quantificação da população bacteriana foram realizadas três repetições composta de dez gramas cada de bulbilhos sem e com assepsia com hipoclorito de sódio por três minutos, seguida do isolamento pela técnica de diluição seriada seguida de plaqueamento em meio de cultura King-B com rifampicina para isolamento seletivo da bactéria. Após incubação de 48 horas a 28 ºC, as colônias foram contadas para analisar mensalmente a sua sobrevivência no bulbilho. Mediante aos resultados obtidos, a bactéria não tem capacidade de sobreviver nos bulbilhos submetidos à assepsia durante o armazenamento, mas consegue sobreviver sem assepsia por até três meses.

Survival of Pseudomonas marginalis pv. marginalis in garlic cloves / Sobrevivência de Pseudomonas marginalis pv. marginalis em bulbilhos de alho

Bacterial soft rot of garlic caused by Pseudomonas marginalis pv. marginalis is one of the crops main leaf diseases, and little is known about its dynamics of survival in the clove. Accordingly, this study set out to determine this bacteriums survival in the clove with and without asepsis during storage. Garlic cloves of the Chonan cultivar were inoculated with an isolated rifampicin-resistant mutant of P. marginalis pv. marginalis to distinguish them from other bacteria and were transplanted in the field. The population present in the clove was evaluated at the end of the crop cycle and then on a monthly basis until the sixth month in storage. To quantify the bacterial population, three replications were conducted with ten grams each of cloves with and without asepsis by sodium hypochlorite for three minutes. Serial dilution was then used for isolation, followed by plating in a King B culture medium with rifampicin for selective isolation of the bacterium. After 48 hours of incubation at 28 ºC, the colonies were counted on a monthly basis to analyze their survival in the clove. The results indicate that the bacterium is unable to survive in cloves subjected to asepsis during storage, but it can survive without asepsis for up to three months.(AU)

A queima-bacteriana-do-alho causada por Pseudomonas marginalis pv. marginalis é uma das principais doenças foliares da cultura e pouco se conhece de sua dinâmica de sobrevivência no bulbilho. Dentro deste aspecto, o objetivo deste trabalho foi avaliar a sobrevivência desta bactéria no bulbilho com e sem assepsia durante o armazenamento. Bulbilhos de alho do cultivar Chonan foram inoculados com isolado mutante a rifampicina de P. marginalis pv. marginalis para diferenciar de outras bactérias e foram transplantados a campo. Ao final do ciclo da cultura foi avaliada a população presente no bulbilho e mensalmente até o sexto mês de armazenamento. Para quantificação da população bacteriana foram realizadas três repetições composta de dez gramas cada de bulbilhos sem e com assepsia com hipoclorito de sódio por três minutos, seguida do isolamento pela técnica de diluição seriada seguida de plaqueamento em meio de cultura King-B com rifampicina para isolamento seletivo da bactéria. Após incubação de 48 horas a 28 ºC, as colônias foram contadas para analisar mensalmente a sua sobrevivência no bulbilho. Mediante aos resultados obtidos, a bactéria não tem capacidade de sobreviver nos bulbilhos submetidos à assepsia durante o armazenamento, mas consegue sobreviver sem assepsia por até três meses.(AU)

Modelagem da formação de biofilmes de Pseudomonas fluorescens e Pseudomonas aeruginosa em aço inoxidável através da metodologia de superfície de resposta / Modeling Pseudomonas luorescens and Pseudomonas aeruginosa biofilm formation on stainless steel by response surface methodology

O objetivo deste trabalho foi verificar a influência do tempo e da temperatura na formação de biofilmes de P. fluorescens e P. aeruginosa em superfície de aço inoxidável através de um delineamento composto central rotacional (DCCR). Os biofilmes foram avaliados nas temperaturas de 7; 13; 27; 41 e 47 °C e nos tempos de contato de 0; 1,2; 4; 6,8 e 8 dias. As superfícies de resposta mostraram que P. fluorescens foi capaz de formar biofilme entre 0,9 e 8 dias em temperaturas entre 9,8 e 47 °C. P. aeruginosa foi capaz de formar biofilme entre0,7 a 8 dias e entre 11 e 47 °C. É importante destacar que estas condições são frequentemente encontradas durante todo o processamento de queijo Minas frescal, comprometendo a segurança do alimento.(AU)

Modelagem da formação de biofilmes de Pseudomonas fluorescens e Pseudomonas aeruginosa em aço inoxidável através da metodologia de superfície de resposta / Modeling Pseudomonas luorescens and Pseudomonas aeruginosa biofilm formation on stainless steel by response surface methodology

O objetivo deste trabalho foi verificar a influência do tempo e da temperatura na formação de biofilmes de P. fluorescens e P. aeruginosa em superfície de aço inoxidável através de um delineamento composto central rotacional (DCCR). Os biofilmes foram avaliados nas temperaturas de 7; 13; 27; 41 e 47 °C e nos tempos de contato de 0; 1,2; 4; 6,8 e 8 dias. As superfícies de resposta mostraram que P. fluorescens foi capaz de formar biofilme entre 0,9 e 8 dias em temperaturas entre 9,8 e 47 °C. P. aeruginosa foi capaz de formar biofilme entre0,7 a 8 dias e entre 11 e 47 °C. É importante destacar que estas condições são frequentemente encontradas durante todo o processamento de queijo Minas frescal, comprometendo a segurança do alimento.

Investigação de Salmonella spp., Listeria spp., Campylobacter spp. e Pseudomonas spp. no trato intestinal de avestruzes (Struthio camelus) criados no estado do Rio de Janeiro, Brasil / Investigation of Salmonella spp., Listeria spp., Campylobacter spp. and Pseudomonas spp. in ostriches (Struthio camelus) intestine from Rio de Janeiro State, Brazil

Na estrutiocultura, pesquisas relacionadas com a prevalência de micro-organismos patogênicos para esses animais e de importância em saúde pública ainda são escassas. O objetivo deste trabalho foi investigar a presença de Salmonella spp., Listeria spp., Campylobacter spp. e Pseudomonas spp. a partir de 60 amostras de suabes cloacais, provenientes de quatro criatórios de avestruzes e avaliar o perfil de susceptibilidade destes micro-organismos frente aos antimicrobianos. Os micro-organismos dos gêneros Salmonella, Listeria e Campylobacter não foram encontrados nas amostras analisadas. Pseudomonas aeruginosa foi isolado a partir de 17 amostras (28,3,%), provenientes de animais de diferentes faixas etárias, oriundos dos quatro criatórios investigados. Adicionalmente, Escherichia coli foi isolado de 57 amostras (95%), Klebsiella spp., de cinco amostras (8,33%), Proteus mirabilis, Proteus vulgaris e Enterobacter spp. de uma amostra (1,66%). Das 17 cepas de P. aeruginosa submetidas ao teste de susceptibilidade aos antimicrobianos, todas (100%) apresentaram sensibilidade à Amicacina e à Ciprofloxacina e todas (100%) foram resistentes ao Sulfametoxazol/Trimetoprim e à Tetraciclina. Foram encontrados cinco perfis diferentes de resistência aos antimicrobianos, indicando uma variação da resistência entre as cepas de Pseudomonas isoladas, inclusive em animais do mesmo criatório e mantidos no mesmo piquete.(AU)

There has been limited research on the prevalence of ostrich intestinal pathogens and on the role of these animals as foodborne pathogens source. This study was conducted to estimate the frequence of Salmonella spp., Listeria spp., Campylobacter spp. and Pseudomonas spp. from intestinal swabs of ostriches and to investigate the antibiotic resistance of the isolates. Sixty samples collected from four ostrich farms were examined. Salmonella, Listeria and Campylobacter were not isolated from the samples investigated and Pseudomonas aeruginosa was isolated from 17 (28.3%) samples. Additionally, Escherichia coli was isolated from 57 samples, (95%), Klebsiella spp. from five (8.33%), and Proteus mirabilis, Proteus vulgaris and Enterobacter spp. from one sample (1,66%). All Pseudomonas isolates were susceptible to Amicacin and Ciprofloxacin, and all of them (100%) were resistant to Trimethoprin/Sulfametox and to Tetracicline. Five antimicrobial resistance profiles were found, showing a resistance diversity among the Pseudomonas isolates, even in the same farm and raised at the same pen.(AU)

Investigação de Salmonella spp., Listeria spp., Campylobacter spp. e Pseudomonas spp. no trato intestinal de avestruzes (Struthio camelus) criados no estado do Rio de Janeiro, Brasil / Investigation of Salmonella spp., Listeria spp., Campylobacter spp. and Pseudomonas spp. in ostriches (Struthio camelus) intestine from Rio de Janeiro State, Brazil

Na estrutiocultura, pesquisas relacionadas com a prevalência de micro-organismos patogênicos para esses animais e de importância em saúde pública ainda são escassas. O objetivo deste trabalho foi investigar a presença de Salmonella spp., Listeria spp., Campylobacter spp. e Pseudomonas spp. a partir de 60 amostras de suabes cloacais, provenientes de quatro criatórios de avestruzes e avaliar o perfil de susceptibilidade destes micro-organismos frente aos antimicrobianos. Os micro-organismos dos gêneros Salmonella, Listeria e Campylobacter não foram encontrados nas amostras analisadas. Pseudomonas aeruginosa foi isolado a partir de 17 amostras (28,3,%), provenientes de animais de diferentes faixas etárias, oriundos dos quatro criatórios investigados. Adicionalmente, Escherichia coli foi isolado de 57 amostras (95%), Klebsiella spp., de cinco amostras (8,33%), Proteus mirabilis, Proteus vulgaris e Enterobacter spp. de uma amostra (1,66%). Das 17 cepas de P. aeruginosa submetidas ao teste de susceptibilidade aos antimicrobianos, todas (100%) apresentaram sensibilidade à Amicacina e à Ciprofloxacina e todas (100%) foram resistentes ao Sulfametoxazol/Trimetoprim e à Tetraciclina. Foram encontrados cinco perfis diferentes de resistência aos antimicrobianos, indicando uma variação da resistência entre as cepas de Pseudomonas isoladas, inclusive em animais do mesmo criatório e mantidos no mesmo piquete.

There has been limited research on the prevalence of ostrich intestinal pathogens and on the role of these animals as foodborne pathogens source. This study was conducted to estimate the frequence of Salmonella spp., Listeria spp., Campylobacter spp. and Pseudomonas spp. from intestinal swabs of ostriches and to investigate the antibiotic resistance of the isolates. Sixty samples collected from four ostrich farms were examined. Salmonella, Listeria and Campylobacter were not isolated from the samples investigated and Pseudomonas aeruginosa was isolated from 17 (28.3%) samples. Additionally, Escherichia coli was isolated from 57 samples, (95%), Klebsiella spp. from five (8.33%), and Proteus mirabilis, Proteus vulgaris and Enterobacter spp. from one sample (1,66%). All Pseudomonas isolates were susceptible to Amicacin and Ciprofloxacin, and all of them (100%) were resistant to Trimethoprin/Sulfametox and to Tetracicline. Five antimicrobial resistance profiles were found, showing a resistance diversity among the Pseudomonas isolates, even in the same farm and raised at the same pen.