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1.
Rev. bras. zootec ; 51: e20210188, 2022. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1442767

Resumo

We aimed to estimate genetic parameters for growth, reproductive, and carcass traits in Tabapuã cattle. Phenotypic data were collected between 1990 and 2019 in 1,218 farms, and the pedigree file had 340,868 animals. The traits evaluated were body weight at 120 (W120), 210 (W210), 365 (W365), and 550 (W550) days of age; age at first calving (AFC), scrotal circumference at 365 days of age (SC365), ribeye area (REA), backfat thickness (BF), and rump fat thickness (RF). The (co)variance components were estimated using the restricted maximum likelihood method, considering single and two-traits animal models. For all traits, the models considered fixed, direct additive genetic, and residual random effects. In addition, for W120 and W210, the maternal additive genetic and maternal permanent environmental effects were also included. Heritabilities for W120, W210, W365, W550, SC365, REA, BF, and RF were of moderate magnitude (0.15, 0.16, 0.23, 0.19, 0.22, 0.36, 0.31, and 0.27, respectively). Low heritability was observed for AFC (0.07). The genetic correlations between growth traits were higher than 0.90, while AFC and SC365 presented negative moderate correlation (−0.66). The REA showed low genetic correlations with BF (0.07) and RF (0.07), whereas BF and RF were highly correlated (0.77). Considering the heritability estimates, selection for AFC would result in limited genetic gain, while for the other traits, it would be satisfactory. Based on the high genetic correlations between growth traits, selection of Tabapuã animals can be performed at younger ages. Additionally, animals can be indirectly selected for AFC through SC365, and only one fat thickness trait may be used in the selection process considering the high genetic correlation and similar heritability values for BF and RF.(AU)


Assuntos
Animais , Variação Genética , Bovinos/genética , Brasil , Correlação de Dados
2.
Rev. bras. zootec ; 51: e20210175, 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1442771

Resumo

The objective was to evaluate the existence of heterogeneity of variances and its impact on the genetic evaluation of ponderal performance in sires of the Nellore breed. We used records of adjusted body weights at 210 (W210), 365 (W365), and 450 (W450) days of age. Both W365 and W450 were combined by principal component analyses using the first component (PC). Average daily gain (ADG) was obtained by difference between W450 and W210. The classes of standard deviations (SD) for W210, PC, and ADG were obtained by the standardization of means of herd-year means subclasses, with positive values composing the high SD and values equal and less than zero composing the SD. The model included the fixed effects of contemporary group and age at calving as a covariate, random genetic additive, and maternal genetic (except for PC) effects, and the permanent maternal environment. Variance components were obtained by Gibbs sampling. Posterior means of heritability in analyses without considering heterogeneity of variances ranged from 0.15±0.01 to 0.31±0.01. Posterior means of genetic correlations between the two classes of SD for W210, PC, and ADG were equal to 0.85±0.04, 0.83±0.03, and 0.71±0.08, respectively. Spearman correlation to breeding values of sires for ADG as the selection intensity increased in them, and the correlations between breeding values in general analyses were more correlated with those predicted in the high DP. Therefore, when there is a higher selection intensity on the sires only for the ADG criterion, there is a significant presence of the heterogeneity of variances and impact on the genetic evaluation of the sires. Thus, for ADG, the predictions of breeding values obtained by the genetic evaluation model in which the heterogeneity of variances are not considered are more weighted by the class of greater heterogeneity.(AU)


Assuntos
Animais , Variação Genética , Peso Corporal/genética , Bovinos/anatomia & histologia
3.
Rev. bras. ciênc. avic ; 24(3): eRBCA-2021-1524, 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1382162

Resumo

This study aimed to investigate the effect of tetramethylpyrazine (TMP) supplementation on egg production, nutrient retention and cecal microbiota diversity using 288 commercial Hy-Line brown hens as of wk 75 to 86. Four treatments consisted of TMP addition at 0 (control, basal diet), 100, 150 and 200 mg/kg of diet. The results showed that diets supplemented with TMP addition improved egg-laying rate as of wk 77 compared to the control, which led to an increase (p<0.001) of egg mass by 97-225 g/hen throughout the whole trial, and a linear increase (p=0.003) of egg mass to the incremental TMP doses was found. At wk 86, the apparent digestibilities of dry matter and crude protein were enhanced (p<0.05), exhibiting consistent linear increases (p≤0.033) with the TMP doses. However, TMP did not cause alpha and beta diversity of cecal microbiota. The results suggest that TMP can be an additive to improve egg production and nutrient digestibility of aged laying hens.(AU)


Assuntos
Animais , Pirazinas/efeitos adversos , Galinhas/fisiologia , Suplementos Nutricionais/análise , Microbioma Gastrointestinal/fisiologia , Biodiversidade , Ovos/análise
4.
Ciênc. anim. bras. (Impr.) ; 18: 01-09, 2017. tab, graf
Artigo em Português | VETINDEX | ID: biblio-1473518

Resumo

A progeny test representing the milk yield was simulated to evaluate the effect of heterogeneity of environmental variance on genetic evaluation of sires in situations of unequal number of progeny per sire between herds, eliminating, at random, daughters per sires in environments of low and high environmental variability. In all situations involving loss of information in the environment of lower environmental variability, there was larger overestimation of the residual variance component, resulting in lower estimates of heritability. On the other hand, the decrease in the amount of information of herds from high environmental variability led to greater overestimation of additive genetic variance and lower overestimation of environmental variance. Although there were alterations in breeding values regarding sires, Spearman and Pearson correlations between breeding values, in all situations, were higher than 0.90. The uneven number of progeny per sire in the presence of heterogeneity of environmental variance led to the overestimation of variance components and changes in absolute breeding values of the sires, without, however, changing the classification values.


Foi simulado um teste de progênie com o objetivo de avaliar o efeito da heterogeneidade de variância ambiental sobre a avaliação genética de reprodutores, em situações de número desigual de progênie por reprodutor entre rebanhos. A situação do número desigual de progênie por reprodutor foi representada eliminando-se, de forma aleatória, o número de progênies por reprodutor em ambientes de baixa e alta variabilidade ambiental. Nas situações que envolveram perda de informação no ambiente de menor variabilidade ambiental, houve maiores superestimações na estimação da variância residual, ocasionando menores estimativas de herdabilidade. Por outro lado, quando se diminuiu a quantidade de informação proveniente de rebanhos de alta variabilidade ambiental, houve maior superestimação da variância genética aditiva e menor superestimação da variância ambiental. Embora, tenham ocorrido alterações na magnitude dos valores genéticos para os reprodutores, as correlações de Spearman e Pearson entre os valores genéticos dos mesmos, em todas as situações, foram maiores do que 0,90. O número desigual de progênie por reprodutor na presença de heterogeneidade de variância ambiental provoca superestimação das estimativas de componentes de variância e valores absolutos de predição de valores genéticos dos reprodutores, sem, contudo, alterar a classificação dos mesmos.


Assuntos
Animais , Heterogeneidade Genética , Padrões de Referência , Seleção Genética , Variação Genética , Meio Ambiente
5.
Ci. Anim. bras. ; 18: 01-09, 2017. tab, graf
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-15460

Resumo

A progeny test representing the milk yield was simulated to evaluate the effect of heterogeneity of environmental variance on genetic evaluation of sires in situations of unequal number of progeny per sire between herds, eliminating, at random, daughters per sires in environments of low and high environmental variability. In all situations involving loss of information in the environment of lower environmental variability, there was larger overestimation of the residual variance component, resulting in lower estimates of heritability. On the other hand, the decrease in the amount of information of herds from high environmental variability led to greater overestimation of additive genetic variance and lower overestimation of environmental variance. Although there were alterations in breeding values regarding sires, Spearman and Pearson correlations between breeding values, in all situations, were higher than 0.90. The uneven number of progeny per sire in the presence of heterogeneity of environmental variance led to the overestimation of variance components and changes in absolute breeding values of the sires, without, however, changing the classification values.(AU)


Foi simulado um teste de progênie com o objetivo de avaliar o efeito da heterogeneidade de variância ambiental sobre a avaliação genética de reprodutores, em situações de número desigual de progênie por reprodutor entre rebanhos. A situação do número desigual de progênie por reprodutor foi representada eliminando-se, de forma aleatória, o número de progênies por reprodutor em ambientes de baixa e alta variabilidade ambiental. Nas situações que envolveram perda de informação no ambiente de menor variabilidade ambiental, houve maiores superestimações na estimação da variância residual, ocasionando menores estimativas de herdabilidade. Por outro lado, quando se diminuiu a quantidade de informação proveniente de rebanhos de alta variabilidade ambiental, houve maior superestimação da variância genética aditiva e menor superestimação da variância ambiental. Embora, tenham ocorrido alterações na magnitude dos valores genéticos para os reprodutores, as correlações de Spearman e Pearson entre os valores genéticos dos mesmos, em todas as situações, foram maiores do que 0,90. O número desigual de progênie por reprodutor na presença de heterogeneidade de variância ambiental provoca superestimação das estimativas de componentes de variância e valores absolutos de predição de valores genéticos dos reprodutores, sem, contudo, alterar a classificação dos mesmos.(AU)


Assuntos
Animais , Heterogeneidade Genética , Seleção Genética , Variação Genética , Padrões de Referência , Meio Ambiente
6.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-218657

Resumo

Objetivou-se avaliar o efeito de aditivo químico e aditivo microbiano sobre as características fermentativas, perdas, qualidade da silagem, crescimento das populações microbianas e o microbioma de silagens de sorgo. Foi utilizado um delineamento inteiramente casualizado (DIC), em esquema fatorial 4 × 4 (4 tipos de silagem × 4 tempos de abertura), com cinco repetições 3 por tratamento. Os tratamentos foram: sem aditivo (controle); aditivo 1 (silagem inoculada com (Lactobacillus buchneri); aditivo 2 (silagem tratada com aditivo químico: benzoato de sódio) e aditivo 3 (silagem inoculada com L. buchneri e combinada com aditivo químico: benzoato de sódio). Houve interação (P<0,05) entre os fatores analisados uso de aditivo e tempo de abertura do silo, para o crescimento da população de bactérias ácido lácticas (BAL) e leveduras na silagem de sorgo forrageiro. Para a contagem de leveduras a menor população foi observada na abertura do silo aos 60 dias com o uso do aditivo 1 (L. buchneri) de 1,67 Log UFC g-1. Houve interação (P<0,05) para a variável pH entre os fatores analisados uso de aditivo e tempo de abertura do silo, obteve-se maiores valores de pH (3,70) para as silagens abertas aos 90 dias (P<0,05) com o uso do aditivo 2 (benzoato de sódio). O menor teor de pH (3,30), foi encontrado na silagem inoculada com L. buchneri (aditivo 1) aos 60 dias de abertura do silo. O teor de MS (P<0,05) obteve maior valor na silagem com o aditivo 3 (L. buchneri + benzoato de sódio) apresentando teor de 324 g/kg. A FDN da silagem com uso de L. buchneri e benzoato de sódio (aditivo 3) apresentou menor teor com 613,0 g/kg MS na silagem (P<0,05). Em relação as perdas decorrentes do processo de ensilagem aos 120 dias, houve efeito (P<0,05) do uso dos aditivos na silagem de sorgo para perda por gases (PG) das silagens. O aditivo 2 (benzoato de sódio) diferiu em relação aos demais tratamentos, registrando a menor perda por gases. Houve interação (P<0,05) na quebra da estabilidade aeróbia das silagens para uso de aditivos e tempo de abertura do silo, onde as silagens tratadas com o aditivo 3 (L. buchneri + benzoato de sódio) abertas aos 120 dias tiveram maior duração da estabilidade aeróbia (87,8 horas). O uso de L. buchneri afetou a diversidade da comunidade bacteriana com predomínio de lactobacilos quando se utilizou o inoculante microbiano. Houve maior diversidade bacteriana no microbiano (L. buchneri e benzoato de sódio) é positivo, preserva a composição química das silagens, reduz as perdas por gases, eleva o teor de matéria seca, diminui os teores de fibra e melhora satisfatoriamente a estabilidade aeróbia. Além disso, silagens de sorgo abertas aos 120 dias apresentam maior estabilidade aeróbia.


The objective was to evaluate the effect of chemical additive and microbial additive on fermentative characteristics, losses, silage quality, growth of microbial populations and the microbiome of sorghum silages. An entirely randomized design (CID) was used in a 4×4 factorial scheme (4 types of silage × 4 opening times), with five repetitions per treatment. The treatments were: without additive (control); additive 1 (silage inoculated with (Lactobacillus buchneri); additive 2 (silage treated with chemical additive: sodium benzoate) and additive 3 (silage inoculated with L. buchneri and combined with chemical additive: sodium benzoate). There was an interaction (P<0.05) between the analyzed factors additive use and silo opening time, for the growth of lactic acid bacteria (BAL) and yeast population in forage sorghum silage. For yeast count the lowest population was observed at the opening of the silo at 60 days with the use of additive 1 (L. buchneri) of 1.67 Log CFU g-1. There was an interaction (P<0.05) for the variable pH between the analyzed factors use of additive and time of silo opening, obtaining higher pH values (3.70) for silages opened at 90 days (P<0.05) with the use of additive 2 (sodium benzoate). The lowest pH value (3.30) was found in the silage inoculated with L. buchneri (additive 1) at 60 days after opening the silo. The MS content (P<0.05) was higher in silage with additive 3 (L. buchneri + sodium benzoate) with a content of 324 g/kg. The FDN of silage with the use of L. buchneri and sodium benzoate (additive 3) had the lowest content of 613.0 g/kg MS in the silage (P<0.05). Regarding the losses due to the ensiling process at 120 days, there was an effect (P<0.05) of the use of additives in sorghum silage for gas loss (PG) of the silages. Additive 2 (sodium benzoate) differed from the other treatments, recording the lowest gas loss. There was an interaction (P<0.05) in the breakdown of aerobic stability of silages for use of additives and time of silo opening, where silages treated with additive 3 (L. buchneri + sodium benzoate) opened at 120 days had longer duration of aerobic stability (87.8 hours). The use of L. buchneri affected the diversity of the bacterial community with a predominance of lactobacilli when the microbial inoculant was used. There was greater bacterial diversity in the control treatment without the use of additives. The effects of the combined action of chemical additives and microbial inoculant (L. buchneri and sodium benzoate) is positive, preserving the chemical composition of silages, reducing gas losses, increasing dry matter content, decreasing fiber content, and satisfactorily improving aerobic stability. In addition, sorghum silages opened at 120 days show greater aerobic stability.

7.
Arq. bras. med. vet. zootec. (Online) ; 68(2): 448-456, mar.-abr. 2016. tab, graf
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-334211

Resumo

Foram utilizados 138.976 registros de informações de pesos corporais variando de 60 a 610 dias de idade, provenientes de 27.327 animais da raça Nelore, oriundos de rebanhos do estado do Mato Grosso, com o objetivo de descrever a variabilidade genética e estimar parâmetros genéticos para o peso corporal em diferentes idades, utilizando-se modelos de regressão aleatória. O modelo empregado incluiu efeitos fixos de grupo de contemporâneos e idade da vaca ao parto como covariáveis, além de efeitos aleatórios genético aditivo direto, genético materno, ambiente permanente de animal, ambiente permanente materno e efeito de ambiente temporário. O modelo de regressão aleatória mais adequado foi o que empregou função de covariância com polinômios de quarta ordem para descrição da variabilidade de todos os efeitos e duas classes de variância residual. As estimativas de variância genética aditiva direta e de ambiente permanente de animal aumentaram com a idade dos animais. As variâncias genética materna e de ambiente permanente materno exibiram comportamento semelhante, com maiores valores na fase de aleitamento. Os coeficientes de herdabilidade estimados variam de 0,25 a 0,43, com maiores valores nas idades mais avançadas na trajetória de crescimento dos animais. Esses resultados indicaram presença de variabilidade genética suficiente para obtenção de ganho genético expressivo por meio da seleção, principalmente após desmama. Os resultados encontrados para a correlação genética aditiva direta exibiram baixas correlações entre pesos nas idades iniciais e finais, porém pesos altamente correlacionados entre idades mais próximas. As correlações genéticas estimadas entre os pesos da desmama com os pesos até 610 dias de idade foram altas e positivas e indicam que os genes responsáveis por maiores pesos nesse período, em sua maioria, são os mesmos.(AU)


In this study 138,976 records of live weight between 60 to 610 days of age, from 27,327 Nellore cattle breed, from herds in Mato Grosso State were used in order to describe the genetic variability and to estimate genetic parameters for the live weight at different ages, using random regression models. The model included the fixed effects of contemporary group and age of cow at calving as covariate, random effects of direct additive genetic, maternal genetic, animal and maternal permanent environmental and temporary environment effect. The most appropriate random regression model employed the covariance function with fourth order polynomials to describe the variability of all effects and two residual variance classes. Estimates of direct additive genetic variance and animal permanent environment increased with the age of the animals. Maternal genetic variances and maternal permanent environment exhibited similar behavior, with higher values in pre weaning. The estimated heritability coefficients ranged from 0.25 to 0.43, with higher values at older ages in the growth trajectory of the animals. These results showed the presence of sufficient genetic variability to obtain significant genetic gain through selection, especially after weaning. The results for the direct additive genetic correlation exhibited low correlations between weights in initial and final ages, however, highly correlated weights between nearest ages. Genetic correlation estimates between weaning with weights up to 610 days of age were high and positive and indicate that most of the genes responsible for higher weights in this period are the same.(AU)


Assuntos
Animais , Bovinos , Variação Genética , Peso Corporal , Anotação de Sequência Molecular , Desmame , Gado , Hereditariedade/genética , Criação de Animais Domésticos
8.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-219109

Resumo

Apesar de um pouco complexa, a formação de animais compostos representa uma alternativa para a solução de diversos problemas encontrados na produção de bovinos de corte no Brasil, dada a diversidade de climas e regiões presentes em nosso país, a criação destes animais compostos auxilia na qualidade dos rebanhos, no que se refere a aspectos produtivos, reprodutivos e de subsistência. Diante de tantas raças, combinações e parâmetros nos modelos de avaliação genética dos animais compostos, surge um problema matemático: a multicolinearidade, ela ocorre quando as variáveis independentes possuem uma alta correlação, levando então a um confundimento dos estimadores dos coeficientes de regressão. Os principais objetivos deste estudo são: avaliar a estrutura populacional e a diversidade genética ao longo do processo de criação e seleção do Composto Montana®; detectar a presença de multicolinearidade em características de crescimento; obter estimativas dos efeitos genéticos aditivos direto e materno, dos efeitos genéticos não aditivos, assim como dos efeitos fixos, pelos modelos sem covariáveis (SC), modelo tradicional com as covariáveis (REML), quadrados mínimos (QM), regressão de cumeeira (RC), análise de fatores (AF) e componentes principais (PCA). O diagnóstico para a multicolinearidade para estas características foi suficientemente grande para provar que existe este fenômeno e merece atenção especial nas análises de estimação dos componentes de variância pelo método dos quadrados mínimos e na predição dos valores genéticos para estas características. As correções para a multicolinearidade efetuadas foram eficientes para ajustar o das covariáveis, para todos os métodos. A AF e PCA apresentaram resultados coerentes com a correção da problemática deste estudo, estas análises tem um potencial elevado para inclusão nas avaliações genéticas de bancos de dados em que há o problema de multicolinearidade. A predição dos valores genéticos dos animais para as características deste estudo foi beneficiada pela análise que consistiu na utilização do fenótipo original, com os componentes ajustados para a análise do QM (QMP). A regressão de cumeeira neste estudo pode não ter trazido grandes benefícios, possivelmente pela empiricidade de estimação do parâmetro k. Apesar da diferença observada entre os métodos nas análises de comparação de modelos, como o ajuste do das covariáveis não interfere na predição dos valores genéticos, recomenda-se a aplicação da correção para a estimação dos componentes de variância e dos parâmetros genéticos, cabe ao pesquisador então um maior detalhamento do seu banco de dados para a escolha do modelo parcimonioso mais adequado.


Although somewhat complex, the formation of composite animals represents an alternative for the solution of several problems found in the production of beef cattle in Brazil, given the diversity of climates and regions present in our country, the creation of these composite animals helps in the quality of herds in terms of productive, reproductive and subsistence aspects. In view of so many races, combinations and parameters in the models of genetic evaluation of composite animals, a mathematical problem arises: multicollinearity, it occurs when the independent variables have a high correlation, leading then to a confusion of the estimators of the regression coefficients. The main objectives of this study are: to evaluate the population structure and genetic diversity throughout the creation and selection process of Composite Montana Tropical® beef cattle. Detect the presence of multicollinearity in growth traits. Obtain estimates of direct and maternal additive genetic effects, non-additive genetic effects, as well as fixed effects, by methods without correction (WC), maximum restricted likelihood (REML), ordinary least squares (OLS), ridge regression (RR), factor analysis (FA) and principal component regression (ACP). The diagnosis for multicollinearity for these traits was large enough to prove that this phenomenon exists and deserves special attention in the analysis of estimation of the components of variance by the method of least squares and in the prediction of genetic values for these traits. The corrections for multicollinearity performed were efficient to adjust the of the covariates, for all methods. The FA and ACP presented results consistent with the correction of the problem of this study, these analyzes have a high potential for inclusion in the genetic evaluations of databases with a multicollinearity problem. The prediction of the genetic values of the animals for the traits of this study was benefited by the analysis that consisted of the use of the original phenotype, with the components adjusted for the analysis of the OLS (QMP). Ridge regression in this study may not have brought great benefits, possibly due to the empirical estimation of the k parameter. As much as the methods showed differences in the model comparison analyzes, as the adjustment of the of the covariates does not interfere in the prediction of genetic values, it is recommended to apply the correction to estimate the variance components and genetic parameters, it is up to the the researcher then gave more details to his database to choose the most appropriate and parsimonious model.

9.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-218082

Resumo

O aumento da eficiência alimentar é o objetivo-chave para a ciência dos ruminantes, onde requer uma melhor compreensão sobre composição da comunidade microbiana ruminal. Partindo do contexto de que a maior parte da digestão da dieta dos ruminantes é realizada pela comunidade microbiana, objetivou-se utilizar a estratégia de DNA metabarcoding para identificar as bactérias presentes no líquido ruminal de bovinos Nelores alimentados com dietas ricas em concentrado, em resposta ao efeito modulatório dos aditivos tamponantes alga marinha calcária (lithothamnium calcareum) e bicarbonato de sódio. Buscou-se caracterizar os índices de riqueza e diversidade da comunidade bacteriana ruminal, além de investigar o impacto da dieta potencialmente acidótica sobre o pH ruminal, parâmetros sanguíneos e perfil de ácidos graxos de cadeia curta. Para tanto, foram utilizados quatro bovinos Nelore distribuídos em quadrado latino 4 x 4 (quatro tratamentos e quatro períodos). Os tratamentos foram compostos pela mesma dieta basal altamente concentrada, sendo: T1- sem aditivo (CON); T2- inclusão de 90 g de bicarbonato de sódio (BIC); T3- inclusão de 90 g de Lithothamnium calcareum (L90); e T4- inclusão de 45 g Lithothamnium calcareum (L45). Para a construção da biblioteca 16S DNA, o DNA total de amostras de líquido ruminal foi extraído e utilizado para amplificação do gene de interesse por meio do uso de primers específicos. As bibliotecas foram sequenciadas em plataforma de Sequenciamento Miseq, Illumina. As predições das unidades taxonômicas operacionais (OTUs) foram feitas no programa UPARSE e a atribuição das sequências no banco de dados RDP usando o percentual de identidade de 97%. Os dados foram analisados no programa estatístico R, onde a diversidade e abundância a nível de gênero foram analisadas pela ANOVA, utilizando o método não paramétrico, adotando o teste de Freedman com as médias ajustadas pela correção de FDR. Já a análise do pH, parâmetros bioquímicos e AGCC foram analisados pelo método paramétrico, utilizando o teste de Scott-Knott. Para ambos os testes, as médias foram avaliadas a 10% de significância (p<0,10). Um total de mil quatrocentos e setenta e quatro OTUs pertencentes a 52 gêneros e dezesseis filos do domínio Bactéria foram identificadas. Os resultados revelaram que a microbiota bacteriana era dominada pelos filos Firmicutes (44,12%), Bacteroidetes (28,29%) e Proteobactéria (5,88%). Animais alimentados com L90 apresentaram uma maior abundância e diversidade ruminal para as bactérias do gênero Prevotella (p<0,06% e p<0,09%), respectivamente. Bovinos suplementados com L45, resultaram numa maior diversidade do gênero Fibrobacter (p<0,05). Houve uma diferença na proporção molar para os ácidos acético (p<0,07%) e valérico (p<0,03%) no momento que antecede a alimentação. Concentrações mais elevadas de lactato sanguíneo foram observados nos animais sem a inclusão de aditivos (p<0,06%). Mais pesquisas acerca da comunidade microbiana associadas ao perfil metabólico devem ser realizadas, principalmente em resposta às diferentes dietas, afim de otimizar o sistema de produção animal.


Increasing feed efficiency is a key objective for ruminant science, where it requires a better understanding of the composition of the rumen microbial community. Starting from the context that most of the digestion of the ruminant diet is carried out by the microbial community, the objective was to use the DNA metabarcoding strategy to identify the bacteria present in the rumen liquid of Nelores cattle fed diets rich in concentrate, in response to modulatory effect of buffering additives limestone kelp (lithothamnium calcareum) and sodium bicarbonate. We sought to characterize the richness and diversity indexes of the ruminal bacterial community, as well as to investigate the impact of the potentially acidic diet on ruminal pH, blood parameters and short-chain fatty acid profile. For that, four Nellore cattle were used, distributed in a 4 x 4 Latin square (four treatments and four periods). The treatments were composed by the same highly concentrated basal diet, being: T1- without additive (CON); T2- inclusion of 90 g of sodium bicarbonate (BIC); T3- inclusion of 90 g of Lithothamnium calcareum (L90); and T4- inclusion of 45 g Lithothamnium calcareum (L45). For the construction of the 16S DNA library, the total DNA from ruminal fluid samples was extracted and used to amplify the gene of interest through the use of specific primers. The libraries were sequenced on the Miseq Sequencing platform, Illumina. The predictions of the operational taxonomic units (OTUs) were made in the UPARSE program and the assignment of the sequences in the RDP database using the 97% identity percentage. The data were analyzed using the statistical program R, where diversity and abundance at the gender level were analyzed by ANOVA, using the non-parametric method, adopting the Freedman test with the means adjusted by the FDR correction. The analysis of pH, biochemical parameters and AGCC were analyzed by the parametric method, using the Scott-Knott test. For both tests, the averages were assessed at 10% significance (p<0.10). A total of one thousand four hundred and seventy-four OTUs belonging to 52 genera and sixteen phyla from the Bacteria domain were identified. The results revealed that the bacterial microbiota was dominated by the phyla Firmicutes (44.12%), Bacteroidetes (28.29%) and Proteobacteria (5.88%). Animals fed with L90 showed a greater abundance and ruminal diversity for bacteria of the genus Prevotella (p<0.06% and p<0.09%), respectively. Cattle supplemented with L45, resulted in greater diversity of the genus Fibrobacter (p<0.05). There was a difference in the molar ratio for acetic (p<0.07%) and valeric (p<0.03%) acids in the moment before feeding. Higher blood lactate concentrations were observed in the animals without the addition of additives (p<0.06%). More research on the microbial community associated with the metabolic profile should be carried out, mainly in response to different diets, in order to optimize the animal production system.

10.
Semina Ci. agr. ; 36(supl.2): 4613-4626, 2015. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-28832

Resumo

Genotype by environment interaction (GxE) studies are of particular interest in Brazil because of the regional diversity of environmental effects and the wide variety of management systems. The present study evaluates GxE effects on 365 d weight (365W) of Nellore cattle raised on pasture in northern Brazil. The analysis utilized random regression techniques to model the reaction norm. Fixed effects consisted of sex, contemporary group, and the covariate of age of cow at calving. The environmental gradient, defined by the concatenation of a bull and the state in which the calf was born, was modeled by second order Legendre polynomials. Direct additive genetic and residual effects were fit as random. Results showed differences in the magnitude of expression of genotype in proportion to decreasing favorability of the environment. As the environment became more unfavorable, the correlation of breeding value to different environments decreased. The correlations between the intercept and the level slope for 365W feature were of moderate magnitude, predominantly indicating the reclassification of sires in different environments. Reaction standard model was coherent from a technical and biological view point and enabled the perception of GxE in the genetic evaluation of Nellore cattle in the states of Maranhão, Pará and Tocantins.(AU) 


No Brasil, estudos de interações genótipo x ambiente tem atraído cada vez mais atenção em programas de melhoramento devido à variedade de sistemas de produção e à diversidade ambiental. Objetivou-se avaliar o efeito da interação genótipo x ambiente sobre o peso ajustado aos 365 dias de idade de bovinos da raça Nelore criados a pasto na região norte do Brasil. As análises foram realizadas utilizando-se regressão aleatória para modelar a norma de reação. Foi considerado como efeitos fixos o sexo, os grupos de contemporâneos e como covariável a idade da vaca ao parto. A gradiente ambiental, foi definida pela concatenação entre o touro e a respectiva unidade federativa de nascimento do animal, foi modelada por meio de polinômios de Legendre de segunda ordem. Como efeito aleatório, foram considerados os efeitos genéticos aditivos diretos e residuais. Os resultados demonstraram diferenças na magnitude da expressão de seu genótipo à proporção que o ambiente tornava-se desfavorável. Ou seja, à proporção que o ambiente torna-se desfavorável, menores seriam as correlações dos valores genéticos nos diferentes ambientes. As correlações entre o intercepto e o nível de inclinação da reta para a característica P365 foram de magnitude moderada, indicando predominantemente reclassificação dos valores genéticos dos animais nos diferentes ambientes. O modelo de norma de reação foi coerente doponto técnico e biológico de visualizar na avaliação genética da população Nelore criada nos Estados do Maranhão, Pará e Tocantins, a interação genótipo ambiente.(AU)


Assuntos
Animais , Masculino , Bovinos , Bovinos/anatomia & histologia , Bovinos/fisiologia , Análise de Regressão
11.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-219010

Resumo

A atual busca por produtos naturais e saudáveis está em expansão. O uso de compostos sintéticos está sendo limitado ou até banido por órgãos da saúde, tanto na indústria alimentícia como no uso de promotores de crescimento na produção animal. No sistema de produção de bovinos em confinamento, principalmente quando são utilizadas dietas com alto teor de concentrado, é necessária a adição de compostos para auxiliar na modulação do rúmen. Neste contexto, é necessário o desenvolvimento de substâncias alternativas não invasivas na alimentação animal. Assim sendo, as substâncias naturais se tornaram promissoras substitutas para os sintéticos, por apresentar ação similar e algumas vezes mais efetiva na produção de ruminantes. Entretanto, para sua adição na alimentação animal é necessário caracterizar os vários produtos de plantas, bem como conhecer o modo de ação destas substâncias. Os óleos essenciais, funcionais e seus compostos apresentam ação antimicrobiana, antioxidante, antiviral, entre outras. Essas propriedades provêm principalmente do efeito sinérgico dos seus constituintes que potencializam os efeitos benéficos. O objetivo de desenvolver este estudo foi avaliar o desempenho e eficiência alimentar, microbioma ruminal, comportamento ingestivo, característica de carcaça, qualidade da carne e aceitabilidade sensorial de 40 novilhos mestiços (½Angus - ½Nelore) com 16 ± 2,2 meses de idade, peso corporal inicial médio de 385,8 ± 20,7 kg sem adição ou com diferentes níveis (1,5; 3,0; 4,5 ou 6,0 g/dia/animal) de um blend contendo aditivos naturais, sendo esses, óleo essencial de cravo, óleos funcionais de caju e mamona e compostos microencapsulados (eugenol, timol e vanilina). O período de confinamento foi de 62 dias. O comportamento ingestivo (tempo de ingestão de água, ruminação, alimentação e ócio) foi semelhante entre as dietas (P>0,05). O desempenho animal (ganho médio diário e eficiência alimentar) apresentou aumento linear com inclusão de aditivos naturais (P<0,05). O consumo de matéria seca não apresentou efeitos (P>0,05) de qualquer nível de dosagem, assim como, as características de carcaça (peso de carcaça quente e rendimento de carcaça). Os produtos da fermentação ruminal (ácidos graxos voláteis e amônia ruminal) apresentaram decréscimo significativo (P<0,05). Além disso, o microbioma ruminal apresentou mudanças significativas com a inclusão dos aditivos naturais (P<0,05). Entretanto, o pH ruminal não diferiu entre os tratamentos (P>0,05). Ainda, os parâmetros de qualidade de carne avaliados pH, textura, oxidação lipídica e coloração foram significativamente diferentes entre os tratamentos (P<0,05), entretanto a capacidade de retenção de água não foi influenciada. Para as avaliações de 47 características organolépticas como odor e flavour não foram observadas diferenças significativas, porém, os textura e aceitabilidade geral apresentaram aceitação superior dos animais que receberam adição do blend de acordo com os consumidores avaliados (P<0,05). Os resultados indicam que o blend de aditivos naturais pode melhorar o desempenho animal a partir da manipulação da fermentação ruminal atuar no produto final melhorando características de qualidade de carne de bovinos terminados em confinamento submetidos à dieta alto grão.


The search for natural products is rising. The use of synthetic compounds is being limited or even banned by health agencies in both food and feed industry. The addition of compounds to improve the rumen fermentation are necessary in high-grain diets fed to feedlot cattle diet. Thus, the substances development in animal feed is necessary and natural substances have become promising substitutes for synthetics since they have a similar or even further effectiveness on ruminant production. However, it is necessary to understand the plant products diversity and its mode of action, as many of them remain unknown. The essential and functional oils, and their compounds present antimicrobial, antioxidant, antiviral, and others actions. These properties are mainly from the synergistic effect of the constituents that potentiate their beneficial effects. The aim with this study was to evaluate the animal performance and feed efficiency, rumen microbiome, intake behavior, carcass characteristics, meat quality and beef sensory acceptability from 40 crossbred steers (½Angus - ½Nelore) with 16 ± 2.2 months old, average initial body weight of 385.8 ± 20.7 kg. Diets had no additive, or different levels (1.5, 3.0, 4.5 or 6.0g / day/animal) of a blend containing natural additives such as oil clove essential oil, cashew and castor oil functional oils and commercial microencapsulated compounds (eugenol, thymol and vanillin). The feedlot period lasted 62 days. Intake behavior (water intake, rumination, feed intake and idle time) was similar between diets (P>0.05). Animal performance (average daily gain and feed efficiency) showed a linear increase with the inclusion of natural additives (P<0.05). Dry matter intake had no effects (P>0.05) of any dosage used, as well as carcass characteristics (hot carcass weight and hot carcass dressing). Volatile fatty acids and ruminal ammonia showed a decrease (P<0.05). Also, the ruminal microbiome showed significant changes with the natural additives inclusion 95 (P<0.05). However, ruminal pH did not differ between treatments (P>0.05). Furthermore, the meat quality (pH, shear force, lipid oxidation and meat color) was influenced by diets (P<0.05), while the water losses were not influenced by the natural additives blend addition. The sensory evaluation as odor and flavor were similar between treatments (P>0.05). Tenderness and overall acceptability had higher scores with natural compounds addition (P<0.05). The natural additives blend can improve animal performance through rumen microbiome manipulation, impacting the final product and improving meat quality on cattle finished in feedlot

12.
Semina ciênc. agrar ; 36(supl.2): 4613-4626, 2015. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1500230

Resumo

Genotype by environment interaction (GxE) studies are of particular interest in Brazil because of the regional diversity of environmental effects and the wide variety of management systems. The present study evaluates GxE effects on 365 d weight (365W) of Nellore cattle raised on pasture in northern Brazil. The analysis utilized random regression techniques to model the reaction norm. Fixed effects consisted of sex, contemporary group, and the covariate of age of cow at calving. The environmental gradient, defined by the concatenation of a bull and the state in which the calf was born, was modeled by second order Legendre polynomials. Direct additive genetic and residual effects were fit as random. Results showed differences in the magnitude of expression of genotype in proportion to decreasing favorability of the environment. As the environment became more unfavorable, the correlation of breeding value to different environments decreased. The correlations between the intercept and the level slope for 365W feature were of moderate magnitude, predominantly indicating the reclassification of sires in different environments. Reaction standard model was coherent from a technical and biological view point and enabled the perception of GxE in the genetic evaluation of Nellore cattle in the states of Maranhão, Pará and Tocantins.


No Brasil, estudos de interações genótipo x ambiente tem atraído cada vez mais atenção em programas de melhoramento devido à variedade de sistemas de produção e à diversidade ambiental. Objetivou-se avaliar o efeito da interação genótipo x ambiente sobre o peso ajustado aos 365 dias de idade de bovinos da raça Nelore criados a pasto na região norte do Brasil. As análises foram realizadas utilizando-se regressão aleatória para modelar a norma de reação. Foi considerado como efeitos fixos o sexo, os grupos de contemporâneos e como covariável a idade da vaca ao parto. A gradiente ambiental, foi definida pela concatenação entre o touro e a respectiva unidade federativa de nascimento do animal, foi modelada por meio de polinômios de Legendre de segunda ordem. Como efeito aleatório, foram considerados os efeitos genéticos aditivos diretos e residuais. Os resultados demonstraram diferenças na magnitude da expressão de seu genótipo à proporção que o ambiente tornava-se desfavorável. Ou seja, à proporção que o ambiente torna-se desfavorável, menores seriam as correlações dos valores genéticos nos diferentes ambientes. As correlações entre o intercepto e o nível de inclinação da reta para a característica P365 foram de magnitude moderada, indicando predominantemente reclassificação dos valores genéticos dos animais nos diferentes ambientes. O modelo de norma de reação foi coerente doponto técnico e biológico de visualizar na avaliação genética da população Nelore criada nos Estados do Maranhão, Pará e Tocantins, a interação genótipo ambiente.


Assuntos
Masculino , Animais , Bovinos , Análise de Regressão , Bovinos/anatomia & histologia , Bovinos/fisiologia
13.
Ciênc. anim. bras. (Impr.) ; 15(4): 414-419, Out-Dez. 2014. tab
Artigo em Português | VETINDEX | ID: biblio-1473351

Resumo

The aim of this study was to estimate the heritability and genetic correlation coefficients between weights at birth (BW) and weaning (WW) in Suffolk crossbred lambs, which belonged to an experimental herd. Thus, four different animal models were fitted, including the direct additive genetic effect (Model 1), the direct additive genetic and maternal permanent environmental effects (Model 2), the direct additive, permanent environmental and maternal genetic effects (cova,m=0) (Model 3), and in Model 4, in addition to those in Model 3, cova,m?0 was considered. After comparing the models through the likelihood ratio test (LRT), Model 3 was chosen as the most appropriate, being the heritability estimates low in magnitude for BW and WW, equal to 0.08±0.009 and 0.24±0.17, respectively, which indicates low possibility of response to direct selection. Likewise, the correlation coefficient between these traits, 0.43±0.39, implies low possibility of correlated response. The inclusion of maternal effects is necessary for the accurate estimation of genetic parameters for the evaluated traits.


Objetivou-se estimar os coeficientes de herdabilidade e correlação genética entre os pesos ao nascer (PN) e à desmama (PD) de cordeiros mestiços Suffolk, pertencentes a rebanho experimental. Assim, foram testados quatro modelos, os quais consideraram o efeito genético aditivo direto (Modelo 1), os efeitos genético direto e de ambiente permanente materno (Modelo 2), os efeitos aditivo direto, de ambiente permanente e genético materno (cova,m=0) (Modelo 3), e no Modelo 4, além daqueles contemplados no Modelo 3, foi considerada cova,m?0. Após comparar os modelos por meio do teste de razão de verossimilhança (LRT), observou-se que o 3 foi o mais adequado, sendo que as estimativas de herdabilidade foram de baixa magnitude para PN e PD, iguais a 0,08±0,009 e 0,24±0,17, respectivamente, indicando pequena possibilidade de resposta à seleção direta. Da mesma maneira, o coeficiente de correlação genética entre estas características foi 0,43±0,39, resultado que implica pequena possibilidade de resposta correlacionada. A inclusão dos efeitos maternos é necessária para a estimação adequada de parâmetros genéticos para as características avaliadas.


Assuntos
Animais , Ovinos/genética , Pesos e Medidas Corporais , Técnicas Genéticas/veterinária , Variação Genética/genética , Funções Verossimilhança , Hereditariedade
14.
Ci. Anim. bras. ; 15(4): 414-419, Out-Dez. 2014. tab
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-381334

Resumo

The aim of this study was to estimate the heritability and genetic correlation coefficients between weights at birth (BW) and weaning (WW) in Suffolk crossbred lambs, which belonged to an experimental herd. Thus, four different animal models were fitted, including the direct additive genetic effect (Model 1), the direct additive genetic and maternal permanent environmental effects (Model 2), the direct additive, permanent environmental and maternal genetic effects (cova,m=0) (Model 3), and in Model 4, in addition to those in Model 3, cova,m?0 was considered. After comparing the models through the likelihood ratio test (LRT), Model 3 was chosen as the most appropriate, being the heritability estimates low in magnitude for BW and WW, equal to 0.08±0.009 and 0.24±0.17, respectively, which indicates low possibility of response to direct selection. Likewise, the correlation coefficient between these traits, 0.43±0.39, implies low possibility of correlated response. The inclusion of maternal effects is necessary for the accurate estimation of genetic parameters for the evaluated traits.(AU)


Objetivou-se estimar os coeficientes de herdabilidade e correlação genética entre os pesos ao nascer (PN) e à desmama (PD) de cordeiros mestiços Suffolk, pertencentes a rebanho experimental. Assim, foram testados quatro modelos, os quais consideraram o efeito genético aditivo direto (Modelo 1), os efeitos genético direto e de ambiente permanente materno (Modelo 2), os efeitos aditivo direto, de ambiente permanente e genético materno (cova,m=0) (Modelo 3), e no Modelo 4, além daqueles contemplados no Modelo 3, foi considerada cova,m?0. Após comparar os modelos por meio do teste de razão de verossimilhança (LRT), observou-se que o 3 foi o mais adequado, sendo que as estimativas de herdabilidade foram de baixa magnitude para PN e PD, iguais a 0,08±0,009 e 0,24±0,17, respectivamente, indicando pequena possibilidade de resposta à seleção direta. Da mesma maneira, o coeficiente de correlação genética entre estas características foi 0,43±0,39, resultado que implica pequena possibilidade de resposta correlacionada. A inclusão dos efeitos maternos é necessária para a estimação adequada de parâmetros genéticos para as características avaliadas.(AU)


Assuntos
Animais , Variação Genética/genética , Técnicas Genéticas/veterinária , Pesos e Medidas Corporais , Ovinos/genética , Funções Verossimilhança , Hereditariedade
15.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-212746

Resumo

Os objetivos do estudo foram analisar os resultados de corridas de velocidade de cavalos Quarto de Milha (QM) no Brasil, priorizando discussões do padrão das corridas, diversidade genética, principais ancestrais, parâmetros e tendências genéticas das características derivadas da rentabilidade monetária, tempo final e velocidade. Os dados continham 23.482 registros de corridas de velocidade, pertencentes a 5.861 animais (42,2% machos) e um pedigree total de 11.425 cavalos. Foram avaliadas cinco distâncias 275, 301, 320, 365 e 402 metros (m), apresentaram 1.072, 6.579, 2.726, 5.682 e 7.423 registros, respectivamente. As alterações da diversidade genética dos animais, foram avaliadas por meio de 3 subpopulações em três décadas completas, de 1980 (sP80), 1990 (sP90) e 2000 (sP00), avaliando 84,5% dos dados totais. As características rentabilidade monetária aos dois anos de idade hípica (RM2), melhor tempo final (best time) e classe de tempo nas distância 301 e 402 m, (BT301, BT402, CT301 e CT402), foram utilizadas nas estimativas dos parâmetros genéticos. O início da carreira esportiva dos 5.861 cavalos indicou que 29,4% e 27,9% dos animais realizarem a sua 1ª corrida nas distâncias de 301 m e 402 m, respectivamente e, 75,2 % dos animais, iniciaram aos 2 anos de idade hípica. Na principal distancia (402 m) os animais machos, não reprodutores, que iniciaram as corridas aos 4 anos foram os mais rápidos e os que mais contribuíram para a evolução fenotípica das características tempo final e velocidade. Os coeficientes de endogamia e parentesco foram baixos, variaram de 0,49% a 1,60% e de 1,12% a 2,56%, respetivamente. Os valores do tamanho efetivo da população (Ne) variaram de 144 a 369 (Fi) e de 41 a 117 (geração). A totalidade da diversidade genética foi explicada por 1.587 ancestrais (fundadores ou não), considerado elevado, mas com somente 50 (sP80) e 9 (sP00) ancestrais é possível explicar 50% da diversidade genética total. A perda de diversidade genética na linhagem de corridas da raça QM no Brasil é evidente e inegável, sendo necessário a implementação de programas de avaliação regulares, precavendo com isso, a continuidade da perda de diversidade genética observada nos animais nascidos no século 21. As estimativas de herdabilidade obtidas nas uni caraterísticas foram de baixas a moderadas magnitudes e as médias variaram de 0,11 ± 0,05 (R2) a 0,35 ± 0,05 (CT301). As estimativas das bi características, foram moderadas a altas e, superiores aos valores das uni características, as bi variaram de 0,19 ± 0,06 (CT301) a 0,76±0,02 (BT402) na interação com RM2. As correlações genéticas aditivas, residuais e fenotípicas, apresentaram valores positivos entre RM2 com CT301 e CT301 e negativas entre o RM2 com BT301. O estudo revelou-se um bom indicador para acompanhar as alterações das características ligadas a rentabilidade monetária, tempo final e velocidade, fornecendo informações da diversidade genética, bem como, modelos animais que podem ser utilizados na avaliação e seleção de reprodutores para os programas de melhoramento animal da linhagem de corridas da raça Quarto de Milha no Brasil.


The aim of the study was to analyze the results of Quarter Horse (QM) speed racing in Brazil, prioritizing discussions of race pattern, genetic diversity, main ancestors, parameters and genetic trends of the characteristics derived from earning, final time and velocity. The data contained 23,482 sprint records, belonging to 5,861 animals (42.2% males) and a total pedigree of 11,425 horses. Five distances 275, 301, 320, 365 and 402 meters (m) were evaluated, with 1,072, 6,579, 2,726, 5,682 and 7,423 records, respectively. Changes in animal genetic diversity were evaluated by 3 subpopulations in three complete decades, from 1980 (sP80), 1990 (sP90) and 2000 (sP00), evaluating 84.5% of the total data. The characteristics monetary profitability at the age of two horse age (RM2), best time and distance class 301 and 402 m (BT301, BT402, CT301 and CT402) were used to estimate genetic parameters. The beginning of the career of the 5,861 horses indicated that 29.4% and 27.9% of the animals performed their first race in the distances of 301 m and 402 m, respectively, and 75.2% of the animals started at 2 years of age. horse riding. At the main distance (402 m), the non-breeding male animals that started the races at 4 years were the fastest and the ones that contributed the most to the phenotypic evolution of the final time and speed characteristics. Inbreeding and kinship coefficients were low, ranging from 0.49% to 1.60% and from 1.12% to 2.56%, respectively. The effective population size (Ne) values ranged from 144 to 369 (Fi) and 41 to 117 (generation). The totality of genetic diversity was explained by 1,587 ancestors (founders or not), considered high, but with only 50 (sP80) and 9 (sP00) ancestors it is possible to explain 50% of the total genetic diversity. The loss of genetic diversity in the QM race lineage in Brazil is evident and undeniable, and regular evaluation programs are necessary to prevent the continuation of the loss of genetic diversity observed in animals born in the 21st century. The heritability traits obtained in the traits were low to moderate in magnitude and the means ranged from 0.11 ± 0.05 (R2) to 0.35 ± 0.05 (CT301). The estimates of the bi-characteristics were moderate to high and, higher than the uni values, the bi-characteristics ranged from 0.19 ± 0.06 (CT301) to 0.76 ± 0.02 (BT402) in the interaction with RM2. The additive genetic, residual and phenotypic correlations showed positive values between RM2 with CT301 and CT301 and negative between RM2 with BT301. The study proved to be a good indicator for tracking changes in traits earnings, best time and speed, providing information on genetic diversity as well as animal models that can be used in breeding evaluation and selection for breeding programs of the Quarter Horse racing line in Brazil.

16.
Sci. agric ; 71(2): 139-145, Mar-Abr. 2014. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1497397

Resumo

High yield stability and adaptability of yellow passion fruit varieties (Passiflora edulis Sims. f. flavicarpa Deg.) are highly desirable attributes when exploring different environments. This study aimed to evaluate the adaptability and yield stability of yellow passion fruit varieties using AMMI (additive main effects and multiplicative interaction) and other ancillary statistics. Twelve varieties were evaluated in eight environments. Analysis of variance showed effects attributable to the varieties (G), environment (E) and their interaction (G × E). The first two multiplicative components of the interaction accounted for 69% of the sum of squares. The scores of the principal interaction components showed high variability for the environments relative to the variety effects. High varietal phenotypic stability was observed in three environments; which can be used in yellow passion fruit breeding programs for initial selection trials. A biplot-AMMI analysis and yield stability index incorporating the AMMI stability value and yield capacity in a single non-parametric index were useful for discriminating genotypes with superior and stable fruit yield. AMMI analysis also allowed for the identification of more productive varieties in specific environments, leading to significant increase in passion fruit productivity.


Assuntos
Adaptação a Desastres , Modelos Estatísticos , Passiflora/genética , Variação Genética
17.
Sci. Agric. ; 71(2): 139-145, Mar-Abr. 2014. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-27510

Resumo

High yield stability and adaptability of yellow passion fruit varieties (Passiflora edulis Sims. f. flavicarpa Deg.) are highly desirable attributes when exploring different environments. This study aimed to evaluate the adaptability and yield stability of yellow passion fruit varieties using AMMI (additive main effects and multiplicative interaction) and other ancillary statistics. Twelve varieties were evaluated in eight environments. Analysis of variance showed effects attributable to the varieties (G), environment (E) and their interaction (G × E). The first two multiplicative components of the interaction accounted for 69% of the sum of squares. The scores of the principal interaction components showed high variability for the environments relative to the variety effects. High varietal phenotypic stability was observed in three environments; which can be used in yellow passion fruit breeding programs for initial selection trials. A biplot-AMMI analysis and yield stability index incorporating the AMMI stability value and yield capacity in a single non-parametric index were useful for discriminating genotypes with superior and stable fruit yield. AMMI analysis also allowed for the identification of more productive varieties in specific environments, leading to significant increase in passion fruit productivity.(AU)


Assuntos
Passiflora/genética , Variação Genética , Modelos Estatísticos , Adaptação a Desastres
18.
Arq. bras. med. vet. zootec ; 66(4): 1179-1188, 08/2014. tab, graf
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-11100

Resumo

O objetivo deste trabalho foi estimar herdabilidades, correlações genéticas e fenotípicas e tendências genéticas das características morfológicas e de tipo de caprinos da raça Saanen nascidos no Brasil de 1979 a 2009. Dados de 1243 caprinos, 197 machos e 1046 fêmeas, foram utilizados para estimar parâmetros genéticos e tendência das características: perímetro torácico, comprimento corporal, altura na cernelha, altura, largura e comprimento da garupa, bem como as principais características que definem o padrão racial e a aptidão do animal (paleta e linha superior, membros e pés, tipo leiteiro, capacidade de corpo, úbere, ligamento traseiro e dianteiro, textura do úbere, tetos e nota). Os componentes de variância foram estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita em análise multicaracterística. A tendência genética foi obtida por meio da regressão dos valores genéticos médios por ano de nascimento. As estimativas de herdabilidade das características morfofuncionais variaram de 0,08 a 0,45, as correlações genéticas de -0,58 a 0,89 e fenotípicas de -0,11 a 0,87. A tendência foi de um leve declínio ao longo dos anos para a maior parte das características avaliadas, o que evidencia a existência de variabilidade genética aditiva entre os animais, mas demonstra que a seleção praticada tem sido pouco efetiva.(AU)


The aim of this study was to estimate heritability, genetic and phenotypic correlations and genetic trends of morphological characteristics and type of Saanen goats born in Brazil from 1979 to 2009. Data from 1243 goats, 197 males and 1046 females were used to estimate genetic parameters and trends for the following traits: girth, body length, wither height, height, width and rump length, and the main traits that define the breed standard and ability of the animal (shoulder and topline, limbs and feet, dairy type, body capacity, mammary gland, linking front and rear, texture of the udder, teats and note). Variance components were estimated by Restricted Maximum Likelihood multi-trait analysis. Genetic trends were obtained by regression of mean breeding values by year of birth. The heritability estimates of morphological and functional traits ranged from 0.08 to 0.45, the genetic correlations from -0.58 to 0.89 and phenotypes from -0.11 to 0.87. The trend was a slight decline over the years for most traits, which shows the existence of additive genetic variability among animals, but it demonstrates that the selection practiced has been ineffective.(AU)


Assuntos
Animais , Masculino , Feminino , Cabras/genética , Hereditariedade/fisiologia , Fenótipo , Genótipo , Biometria , Variação Genética
19.
R. bras. Saúde Prod. Anim. ; 15(4): 846-853, out.-dez. 2014.
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-16657

Resumo

Registros de peso ao nascer (PN) e pesos padronizados para 210 (P210); 365 (P365) e 550 (P550) dias de idade na raça Nelore foram usados com o objetivo de estimar componentes de variância dos efeitos genéticos e predição de valores genéticos dos reprodutores. O modelo incluiu os efeitos fixos de grupo contemporâneo e idade da vaca ao parto, como covariável, além dos efeitos aleatórios genético aditivo direto e genético materno, de ambiente permanente materno e ambiente temporário. As estimativas das médias e desvios-padrão para PN; P210; P365 e P550 foram iguais a 32,76 ± 3,74; 184,30 ± 29,02; 240,31 ± 41,85 e 322,12 ± 60,77, respectivamente. Em todos os pesos, verificou-se considerável variabilidade genética aditiva. A variância de ambiente permanente materno apresentou maior relevância sobre o peso a desmama, sendo praticamente inexistente após o desmame. Para a variância genética materna, a estimativa para o peso ao nascer foi mais significativa quando comparada com o peso a desmama. Os valores estimados de herdabilidade para PN; P210; P365 e P550 foram iguais a 0,37 ± 0,02; 0,36 ± 0,03; 031 ± 0,01 e 0,38 ± 0,02, respectivamente. As correlações genéticas entre peso ao nascer e outros pesos foram de baixa magnitude, com altos valores dos pesos em outras idades.(AU)


Records of birth weight (BW) and weights standardized to 210 (W210); 365 (W365) and 550 (W550) of age in the Nellore breed were used to estimate variance components of genetic effects and predict genetic values of sires. The model included the fixed effects of contemporary group and cow age at calving as co-variable, and the additive and maternal genetic, permanent maternal environmental, and temporary environmental random effects. Estimates of means and standard deviations for BW, W210; W365 and W550 were 32.76 ± 3.74; 184.30 ± 29.02; 240.31 ± 41.85 and 322.12 ± 60.77, respectively. A significant additive genetic variability was detected for all weights. The permanent maternal environmental variance showed greater relevance on weaning weight, and it was practically inexistent after weaning. For the maternal genetic variance, the estimate for birth weight was more significant as compared with weaning weight. The estimated heritability values for BW, W210; W365 and W550 were 0.37 ± 0.02; 0.36 ± 0.03; 031 ± 0.01 and 0.38 ± 0.02, respectively. Genetic correlations between birth weight and other weights were of low magnitude, with high values of weights at other ages.(AU)


Assuntos
Animais , Bovinos , Bovinos/crescimento & desenvolvimento , Bovinos/genética , Variação Genética
20.
Rev. bras. saúde prod. anim ; 15(4): 846-853, out.-dez. 2014.
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1493375

Resumo

Registros de peso ao nascer (PN) e pesos padronizados para 210 (P210); 365 (P365) e 550 (P550) dias de idade na raça Nelore foram usados com o objetivo de estimar componentes de variância dos efeitos genéticos e predição de valores genéticos dos reprodutores. O modelo incluiu os efeitos fixos de grupo contemporâneo e idade da vaca ao parto, como covariável, além dos efeitos aleatórios genético aditivo direto e genético materno, de ambiente permanente materno e ambiente temporário. As estimativas das médias e desvios-padrão para PN; P210; P365 e P550 foram iguais a 32,76 ± 3,74; 184,30 ± 29,02; 240,31 ± 41,85 e 322,12 ± 60,77, respectivamente. Em todos os pesos, verificou-se considerável variabilidade genética aditiva. A variância de ambiente permanente materno apresentou maior relevância sobre o peso a desmama, sendo praticamente inexistente após o desmame. Para a variância genética materna, a estimativa para o peso ao nascer foi mais significativa quando comparada com o peso a desmama. Os valores estimados de herdabilidade para PN; P210; P365 e P550 foram iguais a 0,37 ± 0,02; 0,36 ± 0,03; 031 ± 0,01 e 0,38 ± 0,02, respectivamente. As correlações genéticas entre peso ao nascer e outros pesos foram de baixa magnitude, com altos valores dos pesos em outras idades.


Records of birth weight (BW) and weights standardized to 210 (W210); 365 (W365) and 550 (W550) of age in the Nellore breed were used to estimate variance components of genetic effects and predict genetic values of sires. The model included the fixed effects of contemporary group and cow age at calving as co-variable, and the additive and maternal genetic, permanent maternal environmental, and temporary environmental random effects. Estimates of means and standard deviations for BW, W210; W365 and W550 were 32.76 ± 3.74; 184.30 ± 29.02; 240.31 ± 41.85 and 322.12 ± 60.77, respectively. A significant additive genetic variability was detected for all weights. The permanent maternal environmental variance showed greater relevance on weaning weight, and it was practically inexistent after weaning. For the maternal genetic variance, the estimate for birth weight was more significant as compared with weaning weight. The estimated heritability values for BW, W210; W365 and W550 were 0.37 ± 0.02; 0.36 ± 0.03; 031 ± 0.01 and 0.38 ± 0.02, respectively. Genetic correlations between birth weight and other weights were of low magnitude, with high values of weights at other ages.


Assuntos
Animais , Bovinos , Bovinos/crescimento & desenvolvimento , Bovinos/genética , Variação Genética
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