Bioinformatics and expression analysis of the Xeroderma Pigmentosum complementation group C (XPC) of Trypanosoma evansi in Trypanosoma cruzi cells / Análises de bioinformática e da expressão do gene Xeroderma Pigmentosum complementation group C (XPC) de Trypanosoma evansi em células de Trypanosoma cruzi

Abstract Nucleotide excision repair (NER) acts repairing damages in DNA, such as lesions caused by cisplatin. Xeroderma Pigmentosum complementation group C (XPC) protein is involved in recognition of global genome DNA damages during NER (GG-NER) and it has been studied in different organisms due to its importance in other cellular processes. In this work, we studied NER proteins in Trypanosoma cruzi and Trypanosoma evansi, parasites of humans and animals respectively. We performed three-dimensional models of XPC proteins from T. cruzi and T. evansi and observed few structural differences between these proteins. In our tests, insertion of XPC gene from T. evansi (TevXPC) in T. cruzi resulted in slower cell growth under normal conditions. After cisplatin treatment, T. cruzi overexpressing its own XPC gene (TcXPC) was able to recover cell division rates faster than T. cruzi expressing TevXPC gene. Based on these tests, it is suggested that TevXPC (being an exogenous protein in T. cruzi) interferes negatively in cellular processes where TcXPC (the endogenous protein) is involved. This probably occurred due interaction of TevXPC with some endogenous molecules or proteins from T.cruzi but incapacity of interaction with others. This reinforces the importance of correctly XPC functioning within the cell.

Resumo O reparo por excisão de nucleotídeos (NER) atua reparando danos no DNA, como lesões causadas por cisplatina. A proteína Xeroderma Pigmentosum complementation group C (XPC) está envolvida no reconhecimento de danos pela via de reparação global do genoma pelo NER (GG-NER) e tem sido estudada em diferentes organismos devido à sua importância em outros processos celulares. Neste trabalho, estudamos proteínas do NER em Trypanosoma cruzi e Trypanosoma evansi, parasitos de humanos e animais, respectivamente. Modelos tridimensionais das proteínas XPC de T. cruzi e T. evansi foram feitos e observou-se poucas diferenças estruturais entre estas proteínas. Durante testes, a inserção do gene XPC de T. evansi (TevXPC) em T. cruzi resultou em crescimento celular mais lento em condições normais. Após o tratamento com cisplatina, T. cruzi superexpressando seu próprio gene XPC (TcXPC) foi capaz de recuperar as taxas de divisão celular mais rapidamente do que T. cruzi expressando o gene TevXPC. Com base nesses testes, sugere-se que TevXPC (sendo uma proteína exógena em T. cruzi) interfere negativamente nos processos celulares em que TcXPC (a proteína endógena) está envolvida. Isso provavelmente ocorreu pois TevXPC é capaz de interagir com algumas moléculas ou proteínas endógenas de T.cruzi, mas é incapaz de interagir com outras. Isso reforça a importância do correto funcionamento de XPC dentro da célula.

Gonadal characterization of the Amazonian fish Serrapinnus kriegi (Characidae: Cheirodontinae)

Abstract The knowledge of the testicular and ovarian morphology of a particular fish species is of paramount importance. Such analyze enables the development of studies and techniques aiming the improvement of their reproduction, management, commercialization and even their conservation. This study performed the ovarian and testicular characterization of the ornamental Amazon fish Serrapinnus kriegi. A total of three males and three females had their gonads analyzed by optical microscopy. Females present ovaries filled with oocytes in asynchronous development, indicating partial spawning in the species. Moreover, the micropyle and micropilar cell formation was observed in primary growing oocytes, representing a precocious oocyte development; and the zona radiata in the final vitellogenic oocytes is thicker than other related species, evidencing the development of a better protection to the embryos in function of the waters turbulence that characterize it spawning sites in the Amazonian streams. The male specimens present anastomosed tubular testes with unrestricted spermatogonia spread along the entire seminiferous tubules. The present data elucidate the dynamic of spermatogenesis and oogenesis of an ornamental Amazonian species, through the description of the male and female germ cells development.

Resumo O conhecimento da morfologia testicular e ovariana de uma determinada espécie de peixe é de suma importância, pois através destas análises é possível o desenvolvimento de estudos e técnicas visando o melhoramento de sua reprodução, manejo e comercialização e até mesmo auxiliar em sua conservação. Este estudo realizou a caracterização ovariana e testicular do peixe Amazônico ornamental Serrapinnus kriegi. Um total de três machos e três fêmeas tiveram suas gônadas analisadas através de microscopia óptica. As fêmeas apresentam ovários preenchidos por oócitos em desenvolvimento assincrônico, indicando desova parcelada da espécie. Além disso, observou-se a formação de micrópila e célula micropilar em oócitos em crescimento primário, representando o desenvolvimento precoce do oócito; a zona radiata nos oócitos vitelogênicos finais é mais espessa em comparação a outras espécies relacionadas, evidenciando o desenvolvimento de uma melhor proteção aos embriões, em função das águas turbulentas que caracterizam seu local de desova nos córregos amazônicos. Os machos apresentam testículos do tipo tubular anastomosado com espermatogônias irrestritas, espalhadas por todo o túbulo seminífero. Os dados apresentados elucidam a dinâmica da espermatogênese e oogênese de uma espécie de peixe ornamental amazônica, por meio da descrição das células germinativas masculinas e femininas.

Gonadal characterization of the Amazonian fish Serrapinnus kriegi (Characidae: Cheirodontinae) / Caracterização gonadal do peixe Amazônico Serrapinnus kriegi (Characidae: Cheirodontinae)

Abstract The knowledge of the testicular and ovarian morphology of a particular fish species is of paramount importance. Such analyze enables the development of studies and techniques aiming the improvement of their reproduction, management, commercialization and even their conservation. This study performed the ovarian and testicular characterization of the ornamental Amazon fish Serrapinnus kriegi. A total of three males and three females had their gonads analyzed by optical microscopy. Females present ovaries filled with oocytes in asynchronous development, indicating partial spawning in the species. Moreover, the micropyle and micropilar cell formation was observed in primary growing oocytes, representing a precocious oocyte development; and the zona radiata in the final vitellogenic oocytes is thicker than other related species, evidencing the development of a better protection to the embryos in function of the waters' turbulence that characterize it spawning sites in the Amazonian streams. The male specimens' present anastomosed tubular testes with unrestricted spermatogonia spread along the entire seminiferous tubules. The present data elucidate the dynamic of spermatogenesis and oogenesis of an ornamental Amazonian species, through the description of the male and female germ cells development.

Resumo O conhecimento da morfologia testicular e ovariana de uma determinada espécie de peixe é de suma importância, pois através destas análises é possível o desenvolvimento de estudos e técnicas visando o melhoramento de sua reprodução, manejo e comercialização e até mesmo auxiliar em sua conservação. Este estudo realizou a caracterização ovariana e testicular do peixe Amazônico ornamental Serrapinnus kriegi. Um total de três machos e três fêmeas tiveram suas gônadas analisadas através de microscopia óptica. As fêmeas apresentam ovários preenchidos por oócitos em desenvolvimento assincrônico, indicando desova parcelada da espécie. Além disso, observou-se a formação de micrópila e célula micropilar em oócitos em crescimento primário, representando o desenvolvimento precoce do oócito; a zona radiata nos oócitos vitelogênicos finais é mais espessa em comparação a outras espécies relacionadas, evidenciando o desenvolvimento de uma melhor proteção aos embriões, em função das águas turbulentas que caracterizam seu local de desova nos córregos amazônicos. Os machos apresentam testículos do tipo tubular anastomosado com espermatogônias irrestritas, espalhadas por todo o túbulo seminífero. Os dados apresentados elucidam a dinâmica da espermatogênese e oogênese de uma espécie de peixe ornamental amazônica, por meio da descrição das células germinativas masculinas e femininas.

Gonadal characterization of the Amazonian fish Serrapinnus kriegi (Characidae: Cheirodontinae) / Caracterização gonadal do peixe Amazônico Serrapinnus kriegi (Characidae: Cheirodontinae)

The knowledge of the testicular and ovarian morphology of a particular fish species is of paramount importance. Such analyze enables the development of studies and techniques aiming the improvement of their reproduction, management, commercialization and even their conservation. This study performed the ovarian and testicular characterization of the ornamental Amazon fish Serrapinnus kriegi. A total of three males and three females had their gonads analyzed by optical microscopy. Females present ovaries filled with oocytes in asynchronous development, indicating partial spawning in the species. Moreover, the micropyle and micropilar cell formation was observed in primary growing oocytes, representing a precocious oocyte development; and the zona radiata in the final vitellogenic oocytes is thicker than other related species, evidencing the development of a better protection to the embryos in function of the waters’ turbulence that characterize it spawning sites in the Amazonian streams. The male specimens’ present anastomosed tubular testes with unrestricted spermatogonia spread along the entire seminiferous tubules. The present data elucidate the dynamic of spermatogenesis and oogenesis of an ornamental Amazonian species, through the description of the male and female germ cells development.

O conhecimento da morfologia testicular e ovariana de uma determinada espécie de peixe é de suma importância, pois através destas análises é possível o desenvolvimento de estudos e técnicas visando o melhoramento de sua reprodução, manejo e comercialização e até mesmo auxiliar em sua conservação. Este estudo realizou a caracterização ovariana e testicular do peixe Amazônico ornamental Serrapinnus kriegi. Um total de três machos e três fêmeas tiveram suas gônadas analisadas através de microscopia óptica. As fêmeas apresentam ovários preenchidos por oócitos em desenvolvimento assincrônico, indicando desova parcelada da espécie. Além disso, observou-se a formação de micrópila e célula micropilar em oócitos em crescimento primário, representando o desenvolvimento precoce do oócito; a zona radiata nos oócitos vitelogênicos finais é mais espessa em comparação a outras espécies relacionadas, evidenciando o desenvolvimento de uma melhor proteção aos embriões, em função das águas turbulentas que caracterizam seu local de desova nos córregos amazônicos. Os machos apresentam testículos do tipo tubular anastomosado com espermatogônias irrestritas, espalhadas por todo o túbulo seminífero. Os dados apresentados elucidam a dinâmica da espermatogênese e oogênese de uma espécie de peixe ornamental amazônica, por meio da descrição das células germinativas masculinas e femininas.

Gonadal characterization of the Amazonian fish Serrapinnus kriegi (Characidae: Cheirodontinae) / Caracterização gonadal do peixe Amazônico Serrapinnus kriegi (Characidae: Cheirodontinae)

The knowledge of the testicular and ovarian morphology of a particular fish species is of paramount importance. Such analyze enables the development of studies and techniques aiming the improvement of their reproduction, management, commercialization and even their conservation. This study performed the ovarian and testicular characterization of the ornamental Amazon fish Serrapinnus kriegi. A total of three males and three females had their gonads analyzed by optical microscopy. Females present ovaries filled with oocytes in asynchronous development, indicating partial spawning in the species. Moreover, the micropyle and micropilar cell formation was observed in primary growing oocytes, representing a precocious oocyte development; and the zona radiata in the final vitellogenic oocytes is thicker than other related species, evidencing the development of a better protection to the embryos in function of the waters turbulence that characterize it spawning sites in the Amazonian streams. The male specimens present anastomosed tubular testes with unrestricted spermatogonia spread along the entire seminiferous tubules. The present data elucidate the dynamic of spermatogenesis and oogenesis of an ornamental Amazonian species, through the description of the male and female germ cells development.(AU)

O conhecimento da morfologia testicular e ovariana de uma determinada espécie de peixe é de suma importância, pois através destas análises é possível o desenvolvimento de estudos e técnicas visando o melhoramento de sua reprodução, manejo e comercialização e até mesmo auxiliar em sua conservação. Este estudo realizou a caracterização ovariana e testicular do peixe Amazônico ornamental Serrapinnus kriegi. Um total de três machos e três fêmeas tiveram suas gônadas analisadas através de microscopia óptica. As fêmeas apresentam ovários preenchidos por oócitos em desenvolvimento assincrônico, indicando desova parcelada da espécie. Além disso, observou-se a formação de micrópila e célula micropilar em oócitos em crescimento primário, representando o desenvolvimento precoce do oócito; a zona radiata nos oócitos vitelogênicos finais é mais espessa em comparação a outras espécies relacionadas, evidenciando o desenvolvimento de uma melhor proteção aos embriões, em função das águas turbulentas que caracterizam seu local de desova nos córregos amazônicos. Os machos apresentam testículos do tipo tubular anastomosado com espermatogônias irrestritas, espalhadas por todo o túbulo seminífero. Os dados apresentados elucidam a dinâmica da espermatogênese e oogênese de uma espécie de peixe ornamental amazônica, por meio da descrição das células germinativas masculinas e femininas.(AU)

Early puberty in short-haired Guinea pigs kept in laboratory animal facilities

Lab animals, such as Guinea pigs (Cavia porcellus), are crucial for scientific development, as they play an important role in the development and quality control chain of vaccines and drugs distributed by the Brazilian public health system. Investigating their biological and physiological parameters is fundamental to raise and keep these animals, so the handling of the facilities that hold them can be updated whenever new information comes up, with the well-being of the animals and alignment with the 3 Rs in mind. In the search for understanding reproductive aspects of Guinea pigs, the present study had the main goal of studying puberty by means of estrous cycle analysis in short-haired Guinea pigs. Guinea pigs have a vaginal occlusive membrane that covers the vaginal orifice. Its rupture takes place gradually and naturally, moments before labor and during estrus. The present study followed 42 females as for the presentation of the vaginal occlusive membrane. Once the membranes ruptured spontaneously, a swab was collected to study vaginal cytology. Membrane rupture was observed in 39 females; six females showed membrane rupture with less than 21 days of age (17 to 21 days). Twenty-three females were characterized as being in estrus due to cytology showing a prevalence of anucleated superficial cells. One of these females was younger than 21 days old. The opening of the vaginal occlusive membrane took place most frequently in intervals between 17 and 18 days, and the membrane remained open between one and three consecutive days. It was possible to follow three cycles of membrane opening on six females. The present study showed the need to adapt handling guidelines for C. porcellus kept in research animal facilities. The early age of puberty imposes the need of separate the female daughters from their fathers at 16 days old.(AU)

Avances en el manejo de gametos caninos in vitro / Advance in handling canine gametes in vitro

Las características fisiológicas de los gametos caninos que los hace especiales respecto a los de otras especies han dificultado los estudios tendientes a incrementar los porcentajes de éxito en diversas biotecnologías reproductivas. Entre estas características está el inicio de la meiosis de los ovocitos posterior al nacimiento y la ovulación de un gameto inmaduro como ovocito primario, lo que ha complejizado la maduración in vitro de estos ovocitos y, por parte de los espermatozoides, una gran diferencia en la sobrevivencia de los espermatozoides eyaculados versus los congelados-descongelados, que hace imprescindible evaluar la biología reproductiva de estos gametos tendiente a optimizar nuevos protocolos haciendo énfasis previamente en una adecuada evaluación del crecimiento del ovocito in vivo y de la viabilidad espermática en aquellos sometidos a criopreservación(AU)

The physiological characteristics of canine gametes that make them unique compared to those of other species have hindered studies aimed at increasing the success rates in various reproductive biotechnologies. Among these characteristics is the meiosis of the oocytes after birth and the ovulation of an immature gamete as a primary oocyte, which has made the in vitro maturation of these oocytes more complex and, on the part of the spermatozoa, a significant difference in the viability of ejaculated versus frozen-thawed spermatozoa, which makes it essential to evaluate the reproductive biology of these gametes in order to optimize new protocols, previously emphasizing an adequate evaluation of in vivo oocyte growth and sperm viability in those subjected to cryopreservation.(AU)

Era-like GTP protein gene expression in rice

Abstract The mutations are genetic changes in the genome sequences and have a significant role in biotechnology, genetics, and molecular biology even to find out the genome sequences of a cell DNA along with the viral RNA sequencing. The mutations are the alterations in DNA that may be natural or spontaneous and induced due to biochemical reactions or radiations which damage cell DNA. There is another cause of mutations which is known as transposons or jumping genes which can change their position in the genome during meiosis or DNA replication. The transposable elements can induce by self in the genome due to cellular and molecular mechanisms including hypermutation which caused the localization of transposable elements to move within the genome. The use of induced mutations for studying the mutagenesis in crop plants is very common as well as a promising method for screening crop plants with new and enhanced traits for the improvement of yield and production. The utilization of insertional mutations through transposons or jumping genes usually generates stable mutant alleles which are mostly tagged for the presence or absence of jumping genes or transposable elements. The transposable elements may be used for the identification of mutated genes in crop plants and even for the stable insertion of transposable elements in mutated crop plants. The guanine nucleotide-binding (GTP) proteins have an important role in inducing tolerance in rice plants to combat abiotic stress conditions.

Resumo Mutações são alterações genéticas nas sequências do genoma e têm papel significativo na biotecnologia, genética e biologia molecular, até mesmo para descobrir as sequências do genoma de um DNA celular junto com o sequenciamento do RNA viral. As mutações são alterações no DNA que podem ser naturais ou espontâneas e induzidas devido a reações bioquímicas ou radiações que danificam o DNA celular. Há outra causa de mutações, conhecida como transposons ou genes saltadores, que podem mudar sua posição no genoma durante a meiose ou a replicação do DNA. Os elementos transponíveis podem induzir por si próprios no genoma devido a mecanismos celulares e moleculares, incluindo hipermutação que causou a localização dos elementos transponíveis para se moverem dentro do genoma. O uso de mutações induzidas para estudar a mutagênese em plantas cultivadas é muito comum, bem como um método promissor para a triagem de plantas cultivadas com características novas e aprimoradas para a melhoria da produtividade e da produção. A utilização de mutações de inserção por meio de transposons ou genes saltadores geralmente gera alelos mutantes estáveis que são marcados quanto à presença ou ausência de genes saltadores ou elementos transponíveis. Os elementos transponíveis podem ser usados para a identificação de genes mutados em plantas de cultivo e até mesmo para a inserção estável de elementos transponíveis em plantas de cultivo mutadas. As proteínas de ligação ao nucleotídeo guanina (GTP) têm papel importante na indução de tolerância em plantas de arroz para combater as condições de estresse abiótico.

Correlation between productive and interior traits of steers of different genotypes / Correlação entre traços produtivos e interiores de bois de diferentes genótipos

The objective was to study the productive and biological traits of young cattle of the Kalmyk breed and its crosses. The experiment was conducted on 4 groups of steers, 10 heads each, at OAO Shurupovskoe, Frolovsky District, Volgograd Region. The experimental steers were kept in rooms separately in groups on a deep bed of straw and had free access to walking yards with mounds. The hemoglobin content and the numbers of erythrocytes and leukocytes were determined on a Medonic CA 530 hematological analyzer. The total protein in blood serum and protein fractions were found on an automatic biochemical analyzer Stat Faks 1904. The digital experimental data were processed by the variation statistics method in terms of the significance of the compared parameters using the Student's test accepted in biology and animal science. The study evidenced that the contents of morphological elements and proteins in blood reflected the metabolism and potential for crossbred steers to gain muscle mass.

O objetivo era estudar os traços produtivos e biológicos do gado jovem da raça Kalmyk e seus cruzamentos. A experiência foi conduzida em 4 grupos de bois, 10 cabeças cada, na OAO Shurupovskoe, Distrito de Frolovsky, Região de Volgograd. Os bois experimentais foram mantidos em quartos separados em grupos em uma cama de palha profunda e tiveram livre acesso a pátios de caminhada com montes. O conteúdo de hemoglobina e o número de eritrócitos e leucócitos foram determinados em um analisador hematológico Medonic CA 530. A proteína total em soro sanguíneo e frações proteicas foram encontradas em um analisador bioquímico automático Stat Faks 1904. Os dados experimentais digitais foram processados pelo método de estatística de variação em termos da significância dos parâmetros comparados usando o teste de Student aceito em biologia e ciência animal. O estudo evidenciou que o conteúdo de elementos morfológicos e proteínas no sangue refletia o metabolismo e o potencial de bois cruzados para ganhar massa muscular.

Knockdown of CPT1A Induce Chicken Adipocyte Differentiation to Form Lipid Droplets

Lipid metabolism dysfunction is closely related to obesity, inflammation, diabetes, lipodystrophy, cardiovascular disease. Along with having a positive effect on energy homeostasis during fasting or prolonged exercise through mitochondrial fatty acid oxidation (FAO), more than two dozen enzymes and transport proteins are involved in the activation and transport of fatty acids into the mitochondrial, providing insights into their critical roles in metabolism. CPT1A has been reported to be expressed ubiquitously in the body and associated with dire consequences affecting fat deposition as the key rate-limiting enzyme of FAO. However, there is a dearth of data on the specific role of CPT1A on adipogenic differentiation and adipocyte lipolysis on chicken. This study assessed CPT1A's function in adipocyte differentiation andadipocyte lipolysis, and the mechanisms were investigated. We found that CPT1A knockdown (KD) promotes the differentiation of chicken preadipocytes into mature adipocytes. CPT1A KD increased PPARγ protein expression level. Expression levels of lipid synthesis-related genes were increased, and lipolysis genes were reduced. Also, CPT1A KD can encourage the formation of lipid droplets. So our results confirmed that knockdown of CPT1A induced the lipid differentiation and inhibited the ß-oxidation process to promote the formation of lipid droplets. These findings may deepen our understanding on CPT1A function, especially its regulatory role in adipocyte biology.(AU)

Era-like GTP protein gene expression in rice / Expressão do gene da proteína GTP semelhante à era no arroz

The mutations are genetic changes in the genome sequences and have a significant role in biotechnology, genetics, and molecular biology even to find out the genome sequences of a cell DNA along with the viral RNA sequencing. The mutations are the alterations in DNA that may be natural or spontaneous and induced due to biochemical reactions or radiations which damage cell DNA. There is another cause of mutations which is known as transposons or jumping genes which can change their position in the genome during meiosis or DNA replication. The transposable elements can induce by self in the genome due to cellular and molecular mechanisms including hypermutation which caused the localization of transposable elements to move within the genome. The use of induced mutations for studying the mutagenesis in crop plants is very common as well as a promising method for screening crop plants with new and enhanced traits for the improvement of yield and production. The utilization of insertional mutations through transposons or jumping genes usually generates stable mutant alleles which are mostly tagged for the presence or absence of jumping genes or transposable elements. The transposable elements may be used for the identification of mutated genes in crop plants and even for the stable insertion of transposable elements in mutated crop plants. The guanine nucleotide-binding (GTP) proteins have an important role in inducing tolerance in rice plants to combat abiotic stress conditions.

Mutações são alterações genéticas nas sequências do genoma e têm papel significativo na biotecnologia, genética e biologia molecular, até mesmo para descobrir as sequências do genoma de um DNA celular junto com o sequenciamento do RNA viral. As mutações são alterações no DNA que podem ser naturais ou espontâneas e induzidas devido a reações bioquímicas ou radiações que danificam o DNA celular. Há outra causa de mutações, conhecida como transposons ou genes saltadores, que podem mudar sua posição no genoma durante a meiose ou a replicação do DNA. Os elementos transponíveis podem induzir por si próprios no genoma devido a mecanismos celulares e moleculares, incluindo hipermutação que causou a localização dos elementos transponíveis para se moverem dentro do genoma. O uso de mutações induzidas para estudar a mutagênese em plantas cultivadas é muito comum, bem como um método promissor para a triagem de plantas cultivadas com características novas e aprimoradas para a melhoria da produtividade e da produção. A utilização de mutações de inserção por meio de transposons ou genes saltadores geralmente gera alelos mutantes estáveis que são marcados quanto à presença ou ausência de genes saltadores ou elementos transponíveis. Os elementos transponíveis podem ser usados para a identificação de genes mutados em plantas de cultivo e até mesmo para a inserção estável de elementos transponíveis em plantas de cultivo mutadas. As proteínas de ligação ao nucleotídeo guanina (GTP) têm papel importante na indução de tolerância em plantas de arroz para combater as condições de estresse abiótico.

Era-like GTP protein gene expression in rice / Expressão do gene da proteína GTP semelhante à era no arroz

The mutations are genetic changes in the genome sequences and have a significant role in biotechnology, genetics, and molecular biology even to find out the genome sequences of a cell DNA along with the viral RNA sequencing. The mutations are the alterations in DNA that may be natural or spontaneous and induced due to biochemical reactions or radiations which damage cell DNA. There is another cause of mutations which is known as transposons or jumping genes which can change their position in the genome during meiosis or DNA replication. The transposable elements can induce by self in the genome due to cellular and molecular mechanisms including hypermutation which caused the localization of transposable elements to move within the genome. The use of induced mutations for studying the mutagenesis in crop plants is very common as well as a promising method for screening crop plants with new and enhanced traits for the improvement of yield and production. The utilization of insertional mutations through transposons or jumping genes usually generates stable mutant alleles which are mostly tagged for the presence or absence of jumping genes or transposable elements. The transposable elements may be used for the identification of mutated genes in crop plants and even for the stable insertion of transposable elements in mutated crop plants. The guanine nucleotide-binding (GTP) proteins have an important role in inducing tolerance in rice plants to combat abiotic stress conditions.

Mutações são alterações genéticas nas sequências do genoma e têm papel significativo na biotecnologia, genética e biologia molecular, até mesmo para descobrir as sequências do genoma de um DNA celular junto com o sequenciamento do RNA viral. As mutações são alterações no DNA que podem ser naturais ou espontâneas e induzidas devido a reações bioquímicas ou radiações que danificam o DNA celular. Há outra causa de mutações, conhecida como transposons ou genes saltadores, que podem mudar sua posição no genoma durante a meiose ou a replicação do DNA. Os elementos transponíveis podem induzir por si próprios no genoma devido a mecanismos celulares e moleculares, incluindo hipermutação que causou a localização dos elementos transponíveis para se moverem dentro do genoma. O uso de mutações induzidas para estudar a mutagênese em plantas cultivadas é muito comum, bem como um método promissor para a triagem de plantas cultivadas com características novas e aprimoradas para a melhoria da produtividade e da produção. A utilização de mutações de inserção por meio de transposons ou genes saltadores geralmente gera alelos mutantes estáveis que são marcados quanto à presença ou ausência de genes saltadores ou elementos transponíveis. Os elementos transponíveis podem ser usados para a identificação de genes mutados em plantas de cultivo e até mesmo para a inserção estável de elementos transponíveis em plantas de cultivo mutadas. As proteínas de ligação ao nucleotídeo guanina (GTP) têm papel importante na indução de tolerância em plantas de arroz para combater as condições de estresse abiótico.

Era-like GTP protein gene expression in rice / Expressão do gene da proteína GTP semelhante à era no arroz

The mutations are genetic changes in the genome sequences and have a significant role in biotechnology, genetics, and molecular biology even to find out the genome sequences of a cell DNA along with the viral RNA sequencing. The mutations are the alterations in DNA that may be natural or spontaneous and induced due to biochemical reactions or radiations which damage cell DNA. There is another cause of mutations which is known as transposons or jumping genes which can change their position in the genome during meiosis or DNA replication. The transposable elements can induce by self in the genome due to cellular and molecular mechanisms including hypermutation which caused the localization of transposable elements to move within the genome. The use of induced mutations for studying the mutagenesis in crop plants is very common as well as a promising method for screening crop plants with new and enhanced traits for the improvement of yield and production. The utilization of insertional mutations through transposons or jumping genes usually generates stable mutant alleles which are mostly tagged for the presence or absence of jumping genes or transposable elements. The transposable elements may be used for the identification of mutated genes in crop plants and even for the stable insertion of transposable elements in mutated crop plants. The guanine nucleotide-binding (GTP) proteins have an important role in inducing tolerance in rice plants to combat abiotic stress conditions.(AU)

Mutações são alterações genéticas nas sequências do genoma e têm papel significativo na biotecnologia, genética e biologia molecular, até mesmo para descobrir as sequências do genoma de um DNA celular junto com o sequenciamento do RNA viral. As mutações são alterações no DNA que podem ser naturais ou espontâneas e induzidas devido a reações bioquímicas ou radiações que danificam o DNA celular. Há outra causa de mutações, conhecida como transposons ou genes saltadores, que podem mudar sua posição no genoma durante a meiose ou a replicação do DNA. Os elementos transponíveis podem induzir por si próprios no genoma devido a mecanismos celulares e moleculares, incluindo hipermutação que causou a localização dos elementos transponíveis para se moverem dentro do genoma. O uso de mutações induzidas para estudar a mutagênese em plantas cultivadas é muito comum, bem como um método promissor para a triagem de plantas cultivadas com características novas e aprimoradas para a melhoria da produtividade e da produção. A utilização de mutações de inserção por meio de transposons ou genes saltadores geralmente gera alelos mutantes estáveis que são marcados quanto à presença ou ausência de genes saltadores ou elementos transponíveis. Os elementos transponíveis podem ser usados para a identificação de genes mutados em plantas de cultivo e até mesmo para a inserção estável de elementos transponíveis em plantas de cultivo mutadas. As proteínas de ligação ao nucleotídeo guanina (GTP) têm papel importante na indução de tolerância em plantas de arroz para combater as condições de estresse abiótico.(AU)

Validation of Alternative Methods of Detection of Salmonella Spp. in Experimentally Contaminated Poultry Environmental Samples

The analysis of Salmonella in the feces and the birds environment is a way of monitoring the colonization in the flocks and verifying the need for the introduction of stricter controls, in such a way that the results of the tests should be known before being sent for slaughter. The polymerase chain reaction (PCR), as well as other rapid methods represent alternatives increasingly used to detect enteric pathogens, but they need proof of effectiveness for their wide use. The aim of this study was to evaluate the equivalence between the results obtained by the methods: real-time PCR (BAX® System), Modified Rappaport-Vassiliadis Semi-solid Medium (MSRV) (ISO 6579) and the traditional method of official reference in Brazil for research of S. Typhimurium and S. Enteritidis in poultry samples. Two hundred and fifty-two samples of disposable shoe covers (DSC) and 252 samples of feces were infected with an average of 2 to 3 log CFU/g of each serovar, and the same samples without fortification were evaluated by the three methods. Five hundred and four diagnoses were obtained with satisfactory results in terms of repeatability (greater than 80%), reproducibility (mean 83,1%), sensitivity (81% to 100%), specificity (95% to 100%), and accuracy (90% to 100%). The compliance test verified that there was not a significant difference between the alternative and the official methods, allowing us to state that the methodologies have had equivalent performances.(AU)

Validation of Alternative Methods of Detection of Salmonella Spp. in Experimentally Contaminated Poultry Environmental Samples

The analysis of Salmonella in the feces and the birds environment is a way of monitoring the colonization in the flocks and verifying the need for the introduction of stricter controls, in such a way that the results of the tests should be known before being sent for slaughter. The polymerase chain reaction (PCR), as well as other rapid methods represent alternatives increasingly used to detect enteric pathogens, but they need proof of effectiveness for their wide use. The aim of this study was to evaluate the equivalence between the results obtained by the methods: real-time PCR (BAX® System), Modified Rappaport-Vassiliadis Semi-solid Medium (MSRV) (ISO 6579) and the traditional method of official reference in Brazil for research of S. Typhimurium and S. Enteritidis in poultry samples. Two hundred and fifty-two samples of disposable shoe covers (DSC) and 252 samples of feces were infected with an average of 2 to 3 log CFU/g of each serovar, and the same samples without fortification were evaluated by the three methods. Five hundred and four diagnoses were obtained with satisfactory results in terms of repeatability (greater than 80%), reproducibility (mean 83,1%), sensitivity (81% to 100%), specificity (95% to 100%), and accuracy (90% to 100%). The compliance test verified that there was not a significant difference between the alternative and the official methods, allowing us to state that the methodologies have had equivalent performances.

Regulation of HIF-1 and p53 in stress responses in the subterranean rodents Lasiopodomys mandarinus and Lasiopodomys brandtii (Rodentia: Cricetidae)

ABSTRACT The response mechanism and interaction patterns of HIF-1 and p53 in animals in an hypoxic environment are crucial for their hypoxic tolerance and adaptation. Many studies have shown that underground rodents have better hypoxic adaptation characteristics. However, the mechanism by which HIF-1 and p53 in underground rodents respond to hypoxic environments compared with in ground rodents remains unclear. Further, whether a synergy between HIF-1 and p53 enables animals tolerate extremely hypoxic environments is unclear. We studied HIF-1 and p53 expression in the brain tissue and cell apoptosis in the hippocampal CA1 region during 6 hours of acute hypoxia (5% oxygen) in Lasiopodomys mandarinus (Milne-Edwards, 1871) and Lasiopodomys brandtii (Radde, 1861), two closely related small rodents with different life characteristics (underground and aboveground, respectively), using a comparative biology method to determine the mechanisms underlying their adaptation to this environment. Our results indicate that HIF-1 and p53 expression is more rapid in L. mandarinus than in L. brandtii under acute hypoxic environments, resulting in a significant synergistic effect in L. mandarinus. Correlation analysis revealed that HIF-1 expression and the apoptotic index of the hippocampal CA1 regions of the brain tissues of L. mandarinus and L. brandtii, both under hypoxia, were significantly negatively and positively correlated, respectively. Long-term existence in underground burrow systems could enable better adaptation to hypoxia in L. mandarinus than in L. brandtii. We speculate that L. mandarinus can quickly eliminate resulting damage via the synergistic effect of p53 and HIF-1 in response to acute hypoxic environments, helping the organism quickly return to a normal state after the stress.

Regulation of HIF-1α and p53 in stress responses in the subterranean rodents Lasiopodomys mandarinus and Lasiopodomys brandtii (Rodentia: Cricetidae)

The response mechanism and interaction patterns of HIF-1α and p53 in animals in an hypoxic environment are crucial for their hypoxic tolerance and adaptation. Many studies have shown that underground rodents have better hypoxic adaptation characteristics. However, the mechanism by which HIF-1α and p53 in underground rodents respond to hypoxic environments compared with in ground rodents remains unclear. Further, whether a synergy between HIF-1α and p53 enables animals tolerate extremely hypoxic environments is unclear. We studied HIF-1α and p53 expression in the brain tissue and cell apoptosis in the hippocampal CA1 region during 6 hours of acute hypoxia (5% oxygen) in Lasiopodomys mandarinus (Milne-Edwards, 1871) and Lasiopodomys brandtii (Radde, 1861), two closely related small rodents with different life characteristics (underground and aboveground, respectively), using a comparative biology method to determine the mechanisms underlying their adaptation to this environment. Our results indicate that HIF-1α and p53 expression is more rapid in L. mandarinus than in L. brandtii under acute hypoxic environments, resulting in a significant synergistic effect in L. mandarinus. Correlation analysis revealed that HIF-1α expression and the apoptotic index of the hippocampal CA1 regions of the brain tissues of L. mandarinus and L. brandtii, both under hypoxia, were significantly negatively and positively correlated, respectively. Long-term existence in underground burrow systems could enable better adaptation to hypoxia in L. mandarinus than in L. brandtii. We speculate that L. mandarinus can quickly eliminate resulting damage via the synergistic effect of p53 and HIF-1α in response to acute hypoxic environments, helping the organism quickly return to a normal state after the stress.

Regulation of HIF-1α and p53 in stress responses in the subterranean rodents Lasiopodomys mandarinus and Lasiopodomys brandtii (Rodentia: Cricetidae)

The response mechanism and interaction patterns of HIF-1α and p53 in animals in an hypoxic environment are crucial for their hypoxic tolerance and adaptation. Many studies have shown that underground rodents have better hypoxic adaptation characteristics. However, the mechanism by which HIF-1α and p53 in underground rodents respond to hypoxic environments compared with in ground rodents remains unclear. Further, whether a synergy between HIF-1α and p53 enables animals tolerate extremely hypoxic environments is unclear. We studied HIF-1α and p53 expression in the brain tissue and cell apoptosis in the hippocampal CA1 region during 6 hours of acute hypoxia (5% oxygen) in Lasiopodomys mandarinus (Milne-Edwards, 1871) and Lasiopodomys brandtii (Radde, 1861), two closely related small rodents with different life characteristics (underground and aboveground, respectively), using a comparative biology method to determine the mechanisms underlying their adaptation to this environment. Our results indicate that HIF-1α and p53 expression is more rapid in L. mandarinus than in L. brandtii under acute hypoxic environments, resulting in a significant synergistic effect in L. mandarinus. Correlation analysis revealed that HIF-1α expression and the apoptotic index of the hippocampal CA1 regions of the brain tissues of L. mandarinus and L. brandtii, both under hypoxia, were significantly negatively and positively correlated, respectively. Long-term existence in underground burrow systems could enable better adaptation to hypoxia in L. mandarinus than in L. brandtii. We speculate that L. mandarinus can quickly eliminate resulting damage via the synergistic effect of p53 and HIF-1α in response to acute hypoxic environments, helping the organism quickly return to a normal state after the stress.(AU)

Preparation and process optimization of microbial organic copper as a feed additive / Preparação e otimização do processo de cobre orgânico microbiano como aditivo alimentar

As an essential trace element for animals, copper significantly contributes to the growth and health of animals. Compared to inorganic trace elements, organic trace elements are better supplements; notably, they are acquired through microbial transformation. Therefore, we screened for copper-enriched microorganisms from high copper content soil to obtain organic copper. Sodium diethyldithio carbamate trihydrate was applied as a chromogenic agent for determining micro amounts of intracellular copper through spectrophotometry. In total, 50 fungi were isolated after the successful application of the screening platform for copper-rich microbes. Following morphological and molecular biology analyses, the N-2 strain, identified as Aspergillus niger sp. demonstrated showed better copper enrichment potential than others. Notably, the strain tolerance to copper was nearly thrice that of Saccharomyces cerevisiae, up to 1600mg/L. The content of the organic bound copper was 22.84mg Cu/g dry cell. Using the Central Composite Design (CCD) response surface method, we optimized the fermentation condition (inoculation amount, 13%; temperature, 28(C; pH, 5.0). Compared to the original strain results under the single factor fermentation condition, we reported an increase by 24.18% under the optimized conditions. Collectively, these findings provide a reference for uncovering new and low-cost organic copper additives.(AU)

Como elemento traço essencial para os animais, o cobre contribui significativamente para o crescimento e saúde dos animais. Comparado aos oligoelementos inorgânicos, os oligoelementos orgânicos são melhores suplementos; notavelmente, eles são adquiridos através de transformação microbiana. Portanto, nós selecionamos microorganismos enriquecidos com cobre de solos com alto teor de cobre para obter cobre orgânico. O carbamato de sódio diethyldithio trihidratado foi aplicado como agente cromogênico para a determinação de micro quantidades de cobre intracelular através da espectrofotometria. No total, 50 fungos foram isolados após a aplicação bem sucedida da plataforma de triagem para micróbios ricos em cobre. Após análises morfológicas e de biologia molecular, a cepa N-2, identificada como Aspergillus niger sp. demonstrou um melhor potencial de enriquecimento de cobre do que outras. Notavelmente, a tolerância da estirpe ao cobre foi quase três vezes maior que a da Saccharomyces cerevisiae, até 1600mg/L. O conteúdo de cobre ligado orgânico era de 22,84mg Cu/g de célula seca. Usando o método de superfície de resposta Central Composite Design (CCD), nós otimizamos a condição de fermentação (quantidade de inoculação, 13%; temperatura, 28C; pH, 5,0). Em comparação com os resultados da deformação original sob a condição de fermentação de fator único, relatamos um aumento de 24,18% sob as condições otimizadas. Coletivamente, estas descobertas fornecem uma referência para descobrir novos aditivos de cobre orgânico de baixo custo.(AU)

Estudo pioneiro para a determinação de padrões citohematológicos da medulá óssea de primatas Cebus apella / Pioneer study for determination of cytohematological standard os primate bone marrow Cebus apella

Objetivo. Sugerir parâmetros quantitativos para elementos medulares de Cebus apella. Material e Métodos. Foram estudados 06 animais, machos, com 2Kg e 5Kg, que passaram por contenção física e química para punção aspirativa de 1mL da medula óssea da tíbia de cada animal; confecção dos esfregaços; coloração hematológica e contagem de 500 células/lâmina (estudo duplo-cego). Resultados. Não houve diferença morfológica entre células hematopoiéticas de humanos e Cebus apella. A análise quantitativa mostrou série eritrocítica aumentada e séries granulocítica e linfomonoplasmocitica reduzidas em relação à humanos. Conclusão. Os resultados deste estudo pioneiro servem de apoio para futuras pesquisas com Cebus apella.(AU)

Objetive. Suggest quantitative parameters for Cebus apella medullary elements. Material and Methods. Six male animals were studied, with 2Kg and 5Kg, which underwent physical and chemical restraint for aspiration puncture of 1mL of the bone marrow of each animal's tibia; making smears; hematological staining and 500 cell / slide count (double-blind study). Results. There was no morphological difference between human hematopoietic cells and Cebus apella. Quantitative analysis showed an increased erythrocytic series and reduced granulocytic and lymphomonoplasmocytic series in relation to humans. Conclusion. The results of this pioneering study support future research with Cebus paella.(AU)