Resumo
Spintherobolus papilliferus is an endangered characid endemic of the Atlantic Rainforest, known from sparse locations in the upper rio Tietê basin around the metropolitan area of São Paulo city, and from an affluent of rio Itapanhaú, a coastal stream in Bertioga, São Paulo State. In 2020, S. papilliferus was sampled from the rio Ribeira de Iguape basin in Juquitiba, São Paulo State, representing a new distributional record. We compared 17 morphometric and six meristic characters from all specimens with data from the rios Tietê and Itapanhaú. An overlap in the morphological data from the three populations was detected, except for five measure whose values are lower in rio Ribeira de Iguape. MANOVA and LDA revealed that this population differs significantly from the other two, showing shallower body and caudal peduncle, among other features. These morphological differences may be due to environmental selective pressures since rio Ribeira de Iguape drainage is marked by fast waters which can influence the shape of fish bodies over time. DNA-barcoding of all Spintherobolus species corroborate that the rio Ribeira de Iguape population belongs to S. papilliferus. We also present a hypothesis for the disjunct distribution of S. papilliferus involving headwater capture and discuss the implications for the conservation of this endangered species.
Spintherobolus papilliferus é um caracídeo endêmico da Mata Atlântica e ameaçado de extinção, conhecido de localidades esparsas na bacia do alto rio Tietê, região metropolitana da cidade de São Paulo, e de um afluente do rio Itapanhaú, um riacho costeiro em Bertioga, Estado de São Paulo. Em 2020, S. papilliferus foi amostrada na bacia do rio Ribeira de Iguape em Juquitiba, São Paulo, representando um novo registro de distribuição. Comparamos 17 caracteres morfométricos e seis merísticos dos exemplares com dados dos rios Tietê e Itapanhaú. Houve sobreposição nos valores dos dados exceto em cinco medidas cujos valores são menores no rio Ribeira de Iguape. MANOVA e LDA revelaram que esta população difere significativamente das demais populações, sendo estes exemplares caracterizados pelas menores alturas do corpo e pedúnculo caudal, dentre outras características. Estas diferenças morfológicas possivelmente decorrem de pressões ambientais, pois a drenagem do rio Ribeira de Iguape possui ambientes de corredeiras velozes que podem influenciar no formato do corpo dos peixes. DNA-barcoding de todas as espécies de Spintherobolus corroborou que a população do rio Ribeira de Iguape pertence à S. papilliferus. Apresentamos também uma hipótese para a distribuição disjunta de S. papilliferus envolvendo captura de cabeceiras e discutimos implicações para a conservação dessa espécie ameaçada.
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Animais , Espécies em Perigo de Extinção , Conservação dos Recursos Naturais , Biodiversidade , CaraciformesResumo
A new species of Rineloricaria is described from the Iguaçu, Magé, Saracuruna, Guapiaçu, Macacu, Macaé, and Paraíba do Sul River basins in southeastern Brazil based on morphological and molecular data. The new species is diagnosed among congeners by the combination of the following characters: absence of plates in most of the ventral surface of pectoral girdle; snout tip with elliptical naked area reaching posteriorly the anteriormost pore of the infraorbital ramus of sensory canal; dorsal-fin spinelet present; supraoccipital and predorsal plates with smooth keels; five series of lateral plates below the dorsal fin; median and mid-ventral series of plates with well-developed keels. The new species is distinguished from congeners that inhabit the rivers draining the Serra do Mar in Rio de Janeiro state by the partial plate coverage of the ventral surface of the pectoral girdle and the abdomen (vs. pectoral girdle and abdomen completely covered by plates in Rineloricaria nigricauda, R. steindachneri,and R. zawadzkii). The new species shares the absence of plates on the abdominal surface with other species from the Paraná, Uruguay, and other Brazilian coastal river basins.(AU)
Uma nova espécie de Rineloricaria é descrita das bacias dos rios Iguaçu, Magé, Saracuruna, Guapiaçu, Macacu, Macaé e Paraíba do Sul, no sudeste do Brasil, com base em caracteres morfológicos e moleculares. A nova espécie é diagnosticada entre as congêneres pela combinação dos seguintes caracteres: ausência de placas na maior parte da superfície ventral da cintura peitoral; extremidade do focinho com área nua elíptica estendida posteriormente, alcançando o poro mais anterior do canal sensorial infraorbital; presença de spinelet na origem da nadadeira dorsal; placas supraoccipitais e pré-dorsais com quilhas pouco proeminentes; cinco séries de placas laterais abaixo da origem da nadadeira dorsal; placas das séries mediana e médio-ventral com quilhas bem desenvolvidas. A nova espécie distingue-se das congêneres que habitam os rios que drenam a Serra do Mar no Estado do Rio de Janeiro pela cobertura parcial de placas da superfície ventral da cintura peitoral e do abdômen (vs. cintura peitoral e abdômen completamente cobertos por placas em Rineloricaria nigricauda, R. steindachneri e R. zawadzkii). A nova espécie compartilha a ausência de placas na superfície abdominal com outras espécies das bacias hidrográficas dos rios Paraná e Uruguai e rios costeiros do Brasil.(AU)
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Animais , Peixes-Gato/anatomia & histologia , Peixes-Gato/classificação , Especificidade da Espécie , Brasil , Achados Morfológicos e MicroscópicosResumo
We explored a 320-km transect in the Tumucumaque mountain range along the border between southern French Guiana and Brazil, sampling all trees and lianas with DBH ≥ 10 cm in seven 25 x 25-m plots installed near seven boundary milestones. We isolated DNA from cambium tissue and sequenced two DNA barcodes (rbcLa and matK) to aid in species identification. We also collected fertile herbarium specimens from other species (trees/shrubs/herbs) inside and outside the plots. The selected DNA barcodes were useful at the family level but failed to identify specimens at the species level. Based on DNA barcoding identification, the most abundant families in the plots were Burseraceae, Fabaceae, Meliaceae, Moraceae, Myristicaceae and Sapotaceae. One third of the images of sampled plants posted on the iNaturalist website were identified by the community to species level. New approaches, including the sequencing of the ITS region and fast evolving DNA plastid regions, remain to be tested for their utility in the identification of specimens at lower taxonomic levels in floristic inventories in the Amazon region.(AU)
Um transecto de 320 km foi explorado na Serra do Tumucumaque, ao longo da fronteira entre o sul da Guiana Francesa e o Brasil por meio da amostragem de todas as árvores e lianas com DAP ≥ 10 cm em sete parcelas de 25 x 25 m instaladas perto de sete marcos fronteiriços. Isolamos DNA de tecido cambial e sequenciamos dois códigos de barra de DNA (rbcLa e matK) para auxiliar na identificação das espécies. Também coletamos espécimes de herbário férteis de outras espécies (árvores/arbustos/ervas) dentro e fora das parcelas. Os códigos de barra de DNA selecionados foram úteis em nível de família, mas não conseguiram identificar espécimes em nível de espécie. Com base na identificação de DNA barcoding, as famílias mais abundantes nas parcelas foram Burseraceae, Fabaceae, Meliaceae, Moraceae, Myristicaceae e Sapotaceae. Um terço das imagens de plantas amostradas postadas no website iNaturalist foram identificadas em nível de espécie. Novas abordagens, incluindo o sequenciamento da região ITS e regiões de DNA plastidial de rápida evolução, ainda precisam ser testadas quanto à sua utilidade na identificação de espécimes até níveis taxonômicos mais baixos em inventários florísticos na região amazônica.(AU)
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Árvores/genética , Ecossistema Amazônico , Brasil , Código de Barras de DNA Taxonômico/métodos , Guiana FrancesaResumo
The species of Hypostomus from the Parnaíba River basin were reviewed through molecular and morphological analysis. Five species were found in the basin, including a new species herein described. The distribution of H. pusarum was expanded to this basin, and a closely related species was recorded (H. aff. pusarum), also the presence of H. johnii and H. vaillanti was confirmed. The new species is distinguished from most congeners by its large number of premaxillary and dentary teeth, a wide dental angle of 115° to 135°, presence of a rounded dark spots on a lighter background and anteromedial region of the abdomen depleted of plaques (vs. anteromedial region of the abdomen covered by platelets and odontodes in H. johnii, H. pusarum, H. aff. pusarum and H. vaillanti). Furthermore, an identification key of the species from the Maranhão-Piauí ecoregion and maps with the geographic distribution of these species are presented. The species of Hypostomus in the Parnaíba River basin have different geographic distributions, suggesting different niches or geographical barriers, providing an opportunity for ecological and evolutionary studies.(AU)
As espécies de Hypostomus da bacia do rio Parnaíba foram revisadas por meio de análises moleculares e morfológicas. Cinco espécies foram encontradas na bacia, incluindo uma nova espécie aqui descrita. A distribuição de H. pusarum foi expandida para esta bacia, uma espécie intimamente relacionada foi registrada (H. aff. pusarum), e a presença de H. johnii e H. vaillanti foi confirmada. A nova espécie se distingue da maioria das congêneres por seu grande número de dentes nos pré-maxilares e dentários, um amplo ângulo do dentário de 115° a 135°, presença de manchas escuras arredondadas em um fundo mais claro e região anteromedial do abdômen sem placas (vs. região anteromedial do abdômen coberta por placas e odontódios em H. johnii, H. pusarum, H. aff. pusarum e H. vaillanti). Além disso, é apresentada uma chave de identificação das espécies da ecorregião Maranhão-Piauí e mapas com a distribuição geográfica dessas espécies. As espécies de Hypostomus na bacia do rio Parnaíba apresentam diferentes distribuições geográficas, sugerindo diferentes nichos ou barreiras geográficas, proporcionando oportunidade para estudos ecológicos e evolutivos.(AU)
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Animais , Peixes-Gato/classificação , Peixes-Gato/genética , Brasil , Biodiversidade , Código de Barras de DNA Taxonômico/veterinária , Anotação de Sequência MolecularResumo
Snappers are marine fishes, but juveniles of many species migrate to estuaries, using these systems as nursery areas. The purpose of this study was to know the environmental factors mainly related to the migration patterns of lutjanids in La Mancha lagoon inlet. During 19 months, 24-hour cycles were performed monthly, taking samples every two hours (442 samples). Environmental variables recorded in situ and with regional records such as rainfall, atmospheric temperature and day length were considered. Genetic barcoding (COI) was used to validate species identity. Significant differences were evaluated by PERMANOVA and a Canonical Correspondence Analysis was used to determine the importance of environmental variables. Six species were recorded and the most abundant showed significant differences among months, with migration patterns during the warm-rainy season. Day length, salinity and rainfall (two of them with regional incidence) were the variables significantly associated with the distribution of the species. The abundance of Lutjanus analis, L. jocu, and L. cyanopterus was inversely associated with the length of daylight and directly related to rainfall, while L. synagris and L. griseus showed segregation along a salinity gradient. Thus, migration patterns were mainly correlated with factors of regional coverage and greater seasonal influence.(AU)
Los pargos son peces marinos, pero los juveniles de muchas especies migran a los estuarios, utilizándolos como áreas de crianza. El propósito del estudio fue conocer los factores ambientales principalmente relacionados con los patrones de migración de lutjánidos en la boca de la laguna La Mancha. Durante 19 meses se realizaron ciclos de 24 horas, tomando muestras cada dos horas (442 muestras). Se consideraron variables ambientales registradas in situ y con registros regionales tales como lluvias, temperatura atmosférica y duración del día. Se utilizó código de barras genético (COI) para validar la identidad de las especies. Diferencias significativas fueron evaluadas por PERMANOVA y un Análisis de Correspondencia Canónica permitió determinar la importancia de las variables ambientales. Se registraron seis especies y las más abundantes mostraron diferencias significativas entre meses, con patrones de migración durante la época cálida-lluviosa. La duración del día, la salinidad y la precipitación (dos con incidencia regional) fueron las variables asociadas significativamente a la distribución de las especies. La abundancia de Lutjanus analis, L. jocu y L. cyanopterus estuvo inversamente asociada con la duración del día y directamente con las lluvias, mientras que L. synagris y L. griseus mostraron segregación a lo largo de un gradiente de salinidad. Así, los patrones de migración se correlacionaron principalmente con factores de cobertura regional y de mayor influencia estacional.(AU)
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Animais , Perciformes/classificação , Migração Animal/fisiologia , Distribuição Animal/fisiologia , Zooplâncton , Fotoperíodo , Biodiversidade , Código de Barras de DNA Taxonômico/instrumentaçãoResumo
The largehead hairtail, Trichiurus lepturus, is an opportunistic, voracious, and piscivorous predator. Studies of fish feeding behavior based on the analysis of stomach contents are limited by the potential for the visual identification of the ingesta. However, molecular tools, in particular DNA barcoding, have been used successfully to identify stomach contents. When morphological analyses are not possible, molecular tools can precisely identify the components of the diet of a fish based on its stomach contents. This study used mini barcoding to identify food items ingested by T. lepturus off the northern coast of São Paulo State, Brazil. Forty-six sequences were obtained and were diagnosed as belonging to six different fish species: Pimelodus maculatus, Paralonchurus brasiliensis, Isopisthus parvipinnis, Opisthonema oglinum, Harengula clupeola, and Pellona harroweri or as belonging to the genera Lycengraulis and Sardinella. Trichiurus lepturus is an opportunistic predator that will exploit an available prey of an appropriate size. The results indicate that these fish migrate to warmer waters, such as those found in estuarine environments, at certain times of the year, where they exploit prey species that reproduce in this environment. One example was Pimelodus maculatus, which was the prey species most exploited based on the analysis of the material collected.(AU)
O peixe-espada, Trichiurus lepturus, é um predador oportunista, voraz e piscívoro. Os estudos do comportamento alimentar dos peixes com base na análise do conteúdo estomacal são limitados pelo potencial de identificação visual do material ingerido. No entanto, ferramentas moleculares, em particular o DNA barcode, têm sido utilizadas com sucesso para identificar o conteúdo do estômago. Quando as análises morfológicas não são possíveis, essas ferramentas moleculares podem identificar com precisão os componentes da dieta de um peixe com base em seu conteúdo estomacal. Este estudo utilizou o mini barcode (uma sequencia parcial do gene COI do DNA mitocondrial) para identificar alimentos ingeridos por T. lepturus no litoral Norte do estado de São Paulo, Brasil. Quarenta e seis sequências foram obtidas e combinadas com seis espécies diferentes de peixes: Pimelodus maculatus, Paralonchurus brasiliensis, Isopisthus parvipinnis, Opisthonema oglinum, Harengula clupeola e Pellona harroweri ou como pertencente aos gêneros Lycengraulis e Sardinella. Trichiurus lepturus é um predador oportunista que explora qualquer presa disponível que possua tamanho apropriado. Os resultados indicam que esses peixes migram para águas mais quentes em determinadas épocas do ano, como as encontradas em ambientes estuarinos, onde exploram espécies que se reproduzem neste ambiente. Um exemplo foi Pimelodus maculatus, sendo a espécie mais explorada por T. lepturus, a partir da análise do material coletado.(AU)
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Animais , Perciformes/classificação , Perciformes/genética , Fenômenos Ecológicos e Ambientais , Brasil , Análise de Sequência de DNA/veterinária , Ingestão de Alimentos/genéticaResumo
This study aimed to identify species of Astyanax bimaculatus group from four Itaipu Reservoir tributaries (Paraná River Basin) by cytogenetics and molecular markers (COI) to investigate the possible occurrence of cryptic diversity in part of this basin. The four populations showed only one karyotype formula and simple AgNORs. FISH with 18S rDNA probe showed a high variation, and 5S rDNA probes evidenced simple sites in most of the specimens, although multiple sites are present in two specimens. The variations of 5S and 18S cistrons generated 13 cytotypes. The molecular data did not reveal cryptic diversity in the populations; however, its grouping with 82 sequences from other stretches of the Paraná River Basin originated three haplogroups (distances of 3.12% and 8.82%) and 33 haplotypes were identified. DNA Barcode suggests that cytogenetic variations represent a high polymorphism degree, and it identified the analyzed specimens as Astyanax lacustris, which confirms the morphological identification. Our data suggest that the cryptic diversity of this group in the tributaries of the Paraná River Basin is different than the proposed by the synonymizations of A. altiparanae and A. asuncionensis to A. lacustris. This study reinforces the importance of integrative cytogenetics and molecular methods for taxonomy.(AU)
Este trabalho teve como objetivo identificar espécies do complexo Astyanax bimaculatus de quatro afluentes do reservatório de Itaipu (bacia do Rio Paraná) por métodos citogenéticos e moleculares (COI), investigando a possibilidade de ocorrência de diversidade críptica em parte desta bacia. As quatro populações apresentaram apenas uma fórmula cariotípica e AgNORs simples. A FISH com rDNA 18S apresentou alto grau de variação e as sondas de rDNA 5S evidenciaram sítios simples na maioria dos exemplares, embora sítios múltiplos tenham sido evidenciados em dois espécimes. As variações dos cistrons 5S e 18S geraram 13 citótipos. Os dados moleculares não revelaram diversidade críptica nas populações, entretanto, seu agrupamento com 82 sequências de outros trechos da mesma bacia formou três haplogrupos (distâncias de 3,12% e 8,82%) e gerou 33 haplótipos. O DNA Barcode sugere que as variações citogenéticas representam um alto grau de polimorfismo e identificou os espécimes analisados como Astyanax lacustris, confirmando a identificação por caracteres morfológicos. Nossos dados sugerem que a diversidade críptica do grupo nos afluentes da bacia do Rio Paraná é diferente do proposto pelas sinonimizações de A. altiparanae e A. asuncionensis para A. lacustris, reforçando a importância da integração de métodos citogenéticos e moleculares para a taxonomia.(AU)
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Animais , Polimorfismo Genético , Biomarcadores , Characidae/classificação , Characidae/genética , Variação Genética , DNA Ribossômico/análise , Análise Citogenética/veterináriaResumo
Helminths of the genus Oesophagostomum cause enteric diseases and affect domestic animals such as pigs. The aim of this study was to explore the species composition and genetic diversity of Oesophagostomum spp. infecting pigs in close contact with humans in the state of Piauí, Brazil. Eighty-seven fecal samples were collected for parasitological tests and molecular analysis. Through microscopy, the overall positivity rate for strongyliform eggs was 81.6% among the pigs studied. Forty-two strongyliform egg samples were subjected to PCR and six cox1 sequences (637 bp) were identified for the genus Oesophagostomum. The sequences were identified as Oesophagostomum dentatum, O. quadrispinulatum and O. columbianum. In the phylogenetic tree and haplotype network, 89 sequences were separated into seven clusters, which also included reference sequences from GenBank. Oesophagostomum dentatum and O. quadrispinulatum were seen to be closely related species and formed a monophyletic group related to O. aculeatum. Oesophagostomum columbianum showed similarity with sequences from parasites infecting small ruminants and the clade was positioned closer to O. bifurcum. High interspecific diversity was found and intraspecific diversity varied according to the species. This was the first study to characterize Oesophagostomum DNA sequences obtained from pigs in Brazil.(AU)
Parasitos do gênero Oesophagostomum causam doenças entéricas e podem afetar a criação de animais, como os suínos. O objetivo deste estudo foi identificar as espécies e explorar a diversidade genética de Oesophagostomum spp. infectando suínos em contato próximo com humanos, no estado do Piauí, Brasil. Oitenta e sete amostras fecais foram coletadas para testes parasitológicos, análise morfométrica dos ovos e análises moleculares. A taxa geral de positividade para ovos estrongiliformes foi de 81,6%. Quarenta e duas amostras de ovos estrongiliformes foram submetidas à PCR e seis sequências cox1 (637 bp) foram identificadas para o gênero Oesophagostomum. As sequências foram identificadas como Oesophagostomum dentatum, O. quadrispinulatum e O. columbianum. Na árvore filogenética e na rede haplotípica, 89 sequências foram separadas em sete clusters, incluindo sequências de referência do GenBank. Oesophagostomum dentatum e O. quadrispinulatum são espécies estreitamente relacionadas e formaram um grupo monofilético com O. aculeatum. Oesophagostomum columbianum apresentou semelhança com sequências de parasitas obtidos de pequenos ruminantes e o clado foi posicionado mais próximo de O. bifurcum. Alta diversidade interespecífica foi encontrada e a diversidade intraespecífica variou de acordo com as espécies. Esse foi o primeiro estudo a caracterizar sequências de DNA de Oesophagostomum isoladas de suínos no Brasil.(AU)
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Animais , Oesophagostomum/classificação , Filogenia , Suínos/genética , Variação Genética , Sequência de Bases , Reação em Cadeia da PolimeraseResumo
One aquatic coleopteran species from family Dytiscidae and two aquatic coleopteran genera from family Hydrophilidae were recorded in the summer period and represent first records in the Egyptian lakes. Beetles were collected from two northern lakes, Lake Idku and Lake Burullus. They were identified by morphological characteristics as well as the mtDNA barcoding method. A molecular phylogenetic approach was used to determine the genetic identity of the collected samples based on the mitochondrial cytochrome oxidase I (COI). Prodaticus servillianus (Dytiscidae) from Egypt showed no significant difference in the COI region and they are highly similar to P. servillianus from Madagascar. The phylogenetic analysis revealed that the other two coleopteran genera belong to family Hydrophilidae. Based on COI only, there is no clear evidence for their genetic identity at the species level. So, we defined them to the closest taxon and denoted them as Cymbiodyta type A and B. The results indicated that resolving the molecular identity of the aquatic beetles from northern lakes of Egypt need more considerations in the field of biological conservation. We concluded that utilization of COI as a barcoding region for identifying some coleopteran species is not sufficient and additional molecular markers are required to uncover the molecular taxonomy at deep levels.(AU)
Uma espécie de coleópteros aquático da família Dytiscidae e dois gêneros de coleópteros aquáticos da família Hydrophilidae foram registrados no período de verão e representam os primeiros registros nos lagos egípcios. Os besouros foram coletados em dois lagos do norte, o lago Idku e o lago Burullus, e identificados por características morfológicas e pelo método de código de barras mtDNA. Uma abordagem filogenética molecular foi usada para determinar a identidade genética das amostras coletadas com base no citocromo oxidase I mitocondrial (COI). Prodaticus servillianus (Dytiscidae) do Egito não mostrou diferença significativa na região COI e é altamente semelhante a P. servillianus de Madagascar. A análise filogenética revelou que os outros dois gêneros de coleópteros pertencem à família Hydrophilidae. Com base apenas no COI, não há evidências claras de sua identidade genética no nível da espécie. Assim, nós os agrupamos no táxon mais próximo e os denominamos Cymbiodyta tipo A e B. Os resultados indicaram que a identidade molecular dos besouros aquáticos dos lagos do norte do Egito precisa de mais considerações no campo da conservação biológica. Concluímos que a utilização de COI como região de código de barras para identificar algumas espécies de coleópteros não é suficiente, sendo necessários marcadores moleculares adicionais para descobrir a taxonomia molecular em níveis profundos.(AU)
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Animais , Código de Barras de DNA Taxonômico/veterinária , Besouros/genética , Biodiversidade , EgitoResumo
The flying fox (Pteropus giganteus) also familiar with the name of the greater Indian fruit Bat belongs to the order Chiroptera and family Pteropodidae. Current research emphasis on the DNA barcoding of P. giganteus in Azad Jammu Kashmir. Bat sequences were amplified and PCR products were sequenced and examined by bioinformatics software. Congeneric and conspecific, nucleotide composition and K2P nucleotide deviation, haplotype diversity and the number of haplotypes were estimated. The analysis showed that all of the five studied samples of P. giganteus had low G contents (G 19.8%) than C (27.8%), A (25.1%) and T (27.3%) contents. The calculated haplotype diversity was 0.60% and the mean intraspecific K2P distance was 0.001% having a high number of transitional substitutions. The study suggested that P. giganteus (R=0.00) do not deviate from the neutral evolution. It was determined from the conclusion that this mtDNA gene is a better marker for identification of Bat species than nuclear genes due to its distinctive characteristics and may serve as a landmark for the identification of interconnected species at the molecular level and in the determination of population genetics.(AU)
A raposa-voadora (Pteropus giganteus), também conhecida como morcego indiano, pertence à ordem dos Chiroptera e à família Pteropodidae. A presente pesquisa dá ênfase ao código de barras de DNA de P. giganteus em Azad Jammu e Caxemira. Sequências genéticas dos morcegos foram amplificadas, e os produtos de PCR foram sequenciados e examinados por software de bioinformática. De espécies congenérica e coespecífica, foram estimados composição nucleotídica e desvio de nucleotídeos K2P, diversidade de haplótipos e número de haplótipos. A análise mostrou que todas as cinco amostras estudadas de P. giganteus apresentaram baixos teores de G (19,8%) em comparação com C (27,8%), A (25,1%) e T (27,3%). A diversidade de haplótipos calculada foi de 0,60%, e a distância média intraespecífica de K2P foi de 0,001%, com um elevado número de substituições transicionais. O estudo sugeriu que P. giganteus (R = 0,00) não se desviou da evolução neutra. É possível concluir que o gene mtDNA é um marcador favorável para identificação de espécies de morcegos do que genes nucleares por causa de suas características distintivas e pode servir como um marco para a identificação de espécies interconectadas em nível molecular e para a determinação genética de populações.(AU)
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Animais , Código de Barras de DNA Taxonômico , Quirópteros/genética , Biodiversidade , Variação Genética , PaquistãoResumo
The ichthyofauna diversity of the Jebba Hydroelectric Power (HEP) Dam, Jebba, North-central Nigeria was studied. Fishes were sampled for 24 months using gill net, hook and line, and cast net. Individuals were identified using morphological and molecular (mitochondrial Cytochrome c Oxidase subunit I) data. A total of 9605 freshwater fishes were recorded during the sampling period. The use of an integrative taxonomic approach enabled the identification of 83 species belonging to 42 genera. Additionally, the study recorded three unidentified species Ctenopoma sp, Malapterurus sp., and Protopterus sp. Analyses showed that individuals belonging to families Cichlidae and Mochokidae dominated the dam. The diversity analyses revealed relatively high fish diversity during the rainy season at the downstream section of Jebba HEP dam compared to the upstream section. The study, therefore, showed the presence of a diverse fish community comprising high species richness and diversity across the Jebba HEP dam. Finally, we recommend proper biodiversity monitoring and assessment of freshwater fish diversity across Nigeria. In addition, the use of an integrated taxonomic approach is recommended for appropriate species' identification and studies of freshwater fishes from Nigeria.
A diversidade da ictiofauna da hidrelétrica de Jebba (HEP), Jebba, centro-norte da Nigéria foi estudada. Os peixes foram amostrados por 24 meses, utilizando rede de emalhar, anzol e linha, e rede de arrasto. Os indivíduos foram identificados usando a abordagem combinada morfológica e molecular (citocromo c Oxidase mitocondrial subunidade I). Um total de 9605 peixes de água doce foram registrados durante o período de amostragem. A identificação das espécies utilizando a abordagem taxonômica integrada possibilitou a identificação de 83 espécies pertencentes a 42 gêneros. Além disso, o estudo registrou três espécies não identificadas - Ctenopoma sp, Malapterurus sp e Protopterus sp. Análises mostraram que indivíduos pertencentes às famílias Cichlidae e Mochokidae dominaram a barragem. As análises dos índices de diversidade revelaram uma diversidade de peixes relativamente alta durante a estação chuvosa na seção a jusante da barragem Jebba HEP em comparação com a seção a montante. O estudo mostrou, portanto, a presença de diversas comunidades de peixes, que incluem alta riqueza e diversidade de espécies através da barragem Jebba HEP. Finalmente, recomendamos o monitoramento adequado da biodiversidade e a avaliação da diversidade de peixes de água doce em toda a Nigéria. Além disso, recomenda-se o uso de abordagem taxonômica integrada para a identificação adequada das espécies e estudos de peixes de água doce da Nigéria.
Assuntos
Humanos , Animais , Peixes-Gato/genética , Código de Barras de DNA Taxonômico/veterinária , Peixes , Estações do Ano , Centrais Hidrelétricas , Biodiversidade , Água Doce , NigériaResumo
Although the giant mottled eel, Anguilla marmorata Quoy & Gaimard, 1824, is widely distributed in the Indo-Pacific region, few ecological studies have been conducted on the species. We investigated the stomach contents of A. marmorata visually and used the DNA-barcode region of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (CO1) to confirm the species' identification. The stomach content analysis revealed that teleosts and crustaceans are the major prey items of A. marmorata. Interestingly, the stomach content of one of the specimens, which was 1029 mm in total length (TL), contained an eel-like fish identified as A. marmorata measuring 510 mm in TL. This study is the first to record cannibalism in the diet of A. marmorata. Although the diet of anguillid eels is generally selective for a single prey species, larger eels are more likely to adopt a diverse feeding habit that includes cannibalism in the tropical river ecosystems.(AU)
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Animais , Canibalismo , Análise de Sequência de DNA/veterinária , Enguias/fisiologia , EcossistemaResumo
Species of Trichogramma Westwood, 1833 (Hymenoptera: Trichogrammtidae) are frequently used as biological control agents against Lepidoptera, but practical application of these egg endoparasitoids are complicated because of their complex taxonomy. This study aimed to compare sequences of internal transcribed spacer regions of ribosomal DNA (ITS2-rDNA) of Trichogramma accessions with those deposited in GenBank in order to access the reliability of the ITS2 as a barcode for discriminating species and evaluating the genetic diversity. ITS2-rDNA sequences obtained from seventeen specimens of Trichogramma confirmed previous identifications based on morphological characteristics. Multiple sequence alignment revealed the existence of highly conserved regions in ITS2 sequences while the neighbour-joining dendrogram indicated that the specimens formed three clusters comprising T. manicobai and T. marandobai (group I), T. galloi (group II) and T. pretiosum (group III). The ITS2 marker was shown to be a powerful DNA barcode for discriminating Trichogramma species and could be used to complement the morphological approach.(AU)
Espécies de Trichogramma Westwood, 1833 (Hymenoptera: Trichogrammatidae) são freqüentemente usadas como agentes de controle biológico contra Lepidoptera, esses endoparasitóides de ovos apresentam taxonomia complexa, o que dificulta sua aplicação prática. Este estudo teve como objetivo comparar seqüências de regiões espaçadoras internas transcritas de DNA ribossômico (ITS2-rDNA) de acessos de Trichogramma com aquelas depositadas no GenBank, a fim de avaliar a confiabilidade do ITS2 barcode para discriminar espécies e avaliar a diversidade genética. As seqüências de ITS2-rDNA obtidas de dezessete espécimes de Trichogramma confirmaram identidades anteriores com base em características morfológicas. O alinhamento de múltiplas sequências revelou a existência de regiões altamente conservadas nas sequências ITS2, enquanto o dendrograma indicou que os espécimes formavam três grupos compreendendo T. manicobai e T. marandobai (grupo I), T. galloi (grupo II) e T. pretiosum (grupo III). O marcador ITS2 mostrou ser um poderoso DNA barcode para discriminar espécies de Trichogramma podendo ser usado como complemento da abordagem morfológica.(AU)
Assuntos
Sequência de Bases , Lepidópteros/genética , Variação Genética , Controle Biológico de VetoresResumo
ABSTRACT Although the giant mottled eel, Anguilla marmorata Quoy & Gaimard, 1824, is widely distributed in the Indo-Pacific region, few ecological studies have been conducted on the species. We investigated the stomach contents of A. marmorata visually and used the DNA-barcode region of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (CO1) to confirm the species identification. The stomach content analysis revealed that teleosts and crustaceans are the major prey items of A. marmorata. Interestingly, the stomach content of one of the specimens, which was 1029 mm in total length (TL), contained an eel-like fish identified as A. marmorata measuring 510 mm in TL. This study is the first to record cannibalism in the diet of A. marmorata. Although the diet of anguillid eels is generally selective for a single prey species, larger eels are more likely to adopt a diverse feeding habit that includes cannibalism in the tropical river ecosystems.
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Abstract The Labridae is a species-rich family of colorful fishes distributed globally in different habitats. Polylepion cruentum was described based on type material collected from the Gulf of California, and Quepos, Pacific coast of Costa Rica. It has since been reported from several other localities, including Mexico to Nicaragua and the Cocos Island. Recent collecting efforts in Northern Peru yielded an unusual species of labrid with uncertain taxonomic identity. Measurements, counts, coloration (in life and preserved) and DNA barcoding of the specimen agrees well with Polylepion cruentum. This represents the first record of the species from Northern Peru (Acapulco, Tumbes Department) and South America. The expansion of the distribution range of this species is perhaps due to the input of warm waters to Northern Peru, increasing especially during El Niño events. This new record is important to include in future marine checklists and consequently evaluate the conservation status of this species in Peru.
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Abstract The Labridae is a species-rich family of colorful fishes distributed globally in different habitats. Polylepion cruentum was described based on type material collected from the Gulf of California, and Quepos, Pacific coast of Costa Rica. It has since been reported from several other localities, including Mexico to Nicaragua and the Cocos Island. Recent collecting efforts in Northern Peru yielded an unusual species of labrid with uncertain taxonomic identity. Measurements, counts, coloration (in life and preserved) and DNA barcoding of the specimen agrees well with Polylepion cruentum. This represents the first record of the species from Northern Peru (Acapulco, Tumbes Department) and South America. The expansion of the distribution range of this species is perhaps due to the input of warm waters to Northern Peru, increasing especially during El Niño events. This new record is important to include in future marine checklists and consequently evaluate the conservation status of this species in Peru.
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Abstract The bat genus Sturnira is widely distributed in the Neotropical region, from northwestern Mexico to northern Argentina, and four species occur in Brazil: Sturnira lilium, Sturnira giannae, Sturnira magna, and Sturnira tildae. The present study is the first to record Sturnira tildae in the state of Maranhão, Brazil, based on morphological and molecular diagnoses. The specimen was identified based on its cranial and morphometric traits. The diagnostic traits include discreetly bilobed inner upper incisors with a broad base, lower first and second molars with lingual cusps separated by shallow grooves, and forearm longer than 45 mm. The molecular sequences of Cytochrome C Oxidase Subunit 1 (COI) and 16S rRNA genes confirmed the morphological identification and thus the occurrence of Sturnira tildae in the Amazon biome of Maranhão. This record represents an eastward extension of the known distribution of the species in the Amazonia, to Cândido Mendes, Maranhão, within an area dominated by dense rainforest and influenced by tides.
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Abstract The bat genus Sturnira is widely distributed in the Neotropical region, from northwestern Mexico to northern Argentina, and four species occur in Brazil: Sturnira lilium, Sturnira giannae, Sturnira magna, and Sturnira tildae. The present study is the first to record Sturnira tildae in the state of Maranhão, Brazil, based on morphological and molecular diagnoses. The specimen was identified based on its cranial and morphometric traits. The diagnostic traits include discreetly bilobed inner upper incisors with a broad base, lower first and second molars with lingual cusps separated by shallow grooves, and forearm longer than 45 mm. The molecular sequences of Cytochrome C Oxidase Subunit 1 (COI) and 16S rRNA genes confirmed the morphological identification and thus the occurrence of Sturnira tildae in the Amazon biome of Maranhão. This record represents an eastward extension of the known distribution of the species in the Amazonia, to Cândido Mendes, Maranhão, within an area dominated by dense rainforest and influenced by tides.
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Although the giant mottled eel, Anguilla marmorata Quoy & Gaimard, 1824, is widely distributed in the Indo-Pacific region, few ecological studies have been conducted on the species. We investigated the stomach contents of A. marmorata visually and used the DNA-barcode region of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (CO1) to confirm the species identification. The stomach content analysis revealed that teleosts and crustaceans are the major prey items of A. marmorata. Interestingly, the stomach content of one of the specimens, which was 1029 mm in total length (TL), contained an eel-like fish identified as A. marmorata measuring 510 mm in TL. This study is the first to record cannibalism in the diet of A. marmorata. Although the diet of anguillid eels is generally selective for a single prey species, larger eels are more likely to adopt a diverse feeding habit that includes cannibalism in the tropical river ecosystems.(AU)
Assuntos
Animais , Enguias/classificação , Enguias/genética , DNA , Ecossistema , CanibalismoResumo
DNA barcoding proposes that a fragment of DNA can be used to identify species. In fish, a fragment of cytochrome oxidase subunit I (COI) has been effective in many studies with different foci. Here we use this molecular tool to provide new insights into the cryptic diversity found in the Hoplias malabaricus species complex. Popularly known as trahira, H. malabaricus is widely distributed in South America. The clade shows molecular and cytogenetic diversity, and several studies have supported the occurrence of a complex of species. We performed molecular and karyotypic analysis of H. malabaricus individuals from eight Amazonian localities to assess the diversity present in the nominal taxon, and to clarify relationships within this group. We used 12 samples in cytogenetic analyses and found two karyomorphs: 2n = 40 (20m + 20sm) (karyomorph C) and 2n = 42 (22m + 20sm) (karyomorph A). We used 19 samples in molecular analyses with COI as a molecular marker, maximum likelihood analyses, and the Kimura-2-parameter evolutionary model with bootstrap support. We found karyomorph-related differentiation with bootstrap of 100%. However, we found high molecular diversity within karyomorph C. The observed pattern allowed us to infer the presence of cryptic diversity, reinforcing the existence of a species complex.(AU)
O DNA barcoding propõe que um fragmento de DNA possa servir para identificar espécies. Em peixes, um fragmento do gene COI tem se mostrado eficaz em muitos estudos com focos diferentes. Nós usamos essa ferramenta molecular para fornecer novas informações sobre a diversidade críptica encontrada no complexo de espécies Hoplias malabaricus. Popularmente conhecida como traíra, H. malabaricus tem uma ampla distribuição na América do Sul. Esse clado mostra diversidade molecular e citogenética, e vários estudos dão suporte à ocorrência de um complexo de espécies. Realizamos análises molecular e cariotípica em indivíduos de H. malabaricus de oito localidades amazônicas, para acessar a diversidade no taxon nominal e elucidar as relações nesse grupo. Usamos 12 amostras em análises citogenéticas e encontramos dois cariomorfos: 2n = 40 (20m + 20sm) (cariomorfo C) e 2n = 42 (22m + 20sm) (cariomorfo A). Usamos 19 amostras em análise molecular, utilizando COI como marcador molecular, análises de máxima verossimilhança e o modelo evolutivo de Kimura-2-parâmetros com estimativa de bootstrap. Encontramos diferenciação relacionada aos cariomorfos com bootstrap de 100%. No entanto, encontramos alta diversidade molecular no cariomorfo C. O padrão observado nos permitiu inferir a presença de diversidade oculta, reforçando a existência de um complexo de espécies.(AU)