Resumo
Pathogenic Yersinia enterocolitica (Y. enterocolitica) is one of the food-borne entero-pathogen responsible for yersiniosis in humans. The purpose of this research was to survey the prevalence, virulence-associated genes, and antimicrobial resistance of Y. enterocolitica isolated from meat and meat product samples in Egypt. Forty-one (5.9%) out of 700- samples of chicken meat, beef, ground beef, and sausage were positive Y. enterocolitica with a high prevalence in chicken meat (12%). Five virulence genes (ail, inv, ystA, ystB, and yadA) were characterized among 41 Y. enterocolitica isolates with variable frequencies. Among the strains tested, the ystB gene was detected with a high percentage (78.1%), followed by inv gene (70.7%), ail gene (14.6%), ystA gene (12.2%), and yadA gene (2.4%). A high resistance rate was estimated to amoxicillin-clavulanic acid (100%), followed by cefazolin (95%), ampicillin (65.9%), and doxycycline (51.2%), whilst a high sensitivity rate was observed to gentamicin and ciprofloxacin (97.6% each). Interestingly, the multidrug resistance was specified in the 70.7% of strains and showing 13 resistance patterns. Based on nucleotide sequence analysis of the 16s rRNA gene, the phylogenetic tree showed the genetic relatedness amongst Y. enterocolitica isolates. These findings highlighted the emergence of virulent and multidrug-resistant pathogenic Y. entrocolitica in retailed meat and meat products in Egypt.(AU)
A Yersinia enterocolitica patogênica (Y. enterocolitica) é um dos enteropatógenos de origem alimentar responsáveis pela yersiniose no ser humano. O objetivo desta pesquisa foi avaliar a prevalência, genes associados à virulência e resistência antimicrobiana de Y. enterocolitica isolada de amostras de carne e produtos à base de carne no Egito. Quarenta e um (5,9%) de 700 amostras de carne de frango, carne bovina, moída e linguiça foram Y. enterocolitica positivas, com alta prevalência em carne de frango (12%). Cinco genes de virulência (ail, inv, ystA, ystB e yadA) foram caracterizados entre 41 isolados de Y. enterocolitica com frequências variáveis. Entre as cepas testadas, o gene ystB foi detectado com uma alta porcentagem (78,1%), seguido pelo gene inv (70,7%), ail genes (14,6%), gene ystA (12,2%) e gene yadA (2,4%). Foi estimada uma alta taxa de resistência ao ácido amoxicilina-clavulânico (100%), seguida de cefazolina (95%), ampicilina (65,9%) e doxiciclina (51,2%), enquanto uma alta taxa de sensibilidade foi observada para gentamicina e ciprofloxacina (97,6% cada). Curiosamente, a resistência a múltiplas drogas foi especificada em 70,7% das cepas e mostrando 13 padrões de resistência. Com base na análise da sequência nucleotídica do gene rRNA 16s, a árvore filogenética mostrou a relação genética entre isolados de Y. enterocolitica. Esses achados destacaram o surgimento de Y. entrocolitica patogênica virulenta e multirresistente em carnes e produtos à base de carne no Egito.(AU)
Assuntos
Técnicas de Genotipagem , Virulência , Yersinia enterocolitica/isolamento & purificação , Farmacorresistência Bacteriana , Carne , EgitoResumo
Pathogenic Yersinia enterocolitica (Y. enterocolitica) is one of the food-borne entero-pathogen responsible for yersiniosis in humans. The purpose of this research was to survey the prevalence, virulence-associated genes, and antimicrobial resistance of Y. enterocolitica isolated from meat and meat product samples in Egypt. Forty-one (5.9%) out of 700- samples of chicken meat, beef, ground beef, and sausage were positive Y. enterocolitica with a high prevalence in chicken meat (12%). Five virulence genes (ail, inv, ystA, ystB, and yadA) were characterized among 41 Y. enterocolitica isolates with variable frequencies. Among the strains tested, the ystB gene was detected with a high percentage (78.1%), followed by inv gene (70.7%), ail gene (14.6%), ystA gene (12.2%), and yadA gene (2.4%). A high resistance rate was estimated to amoxicillin-clavulanic acid (100%), followed by cefazolin (95%), ampicillin (65.9%), and doxycycline (51.2%), whilst a high sensitivity rate was observed to gentamicin and ciprofloxacin (97.6% each). Interestingly, the multidrug resistance was specified in the 70.7% of strains and showing 13 resistance patterns. Based on nucleotide sequence analysis of the 16s rRNA gene, the phylogenetic tree showed the genetic relatedness amongst Y. enterocolitica isolates. These findings highlighted the emergence of virulent and multidrug-resistant pathogenic Y. entrocolitica in retailed meat and meat products in Egypt.
A Yersinia enterocolitica patogênica (Y. enterocolitica) é um dos enteropatógenos de origem alimentar responsáveis pela yersiniose no ser humano. O objetivo desta pesquisa foi avaliar a prevalência, genes associados à virulência e resistência antimicrobiana de Y. enterocolitica isolada de amostras de carne e produtos à base de carne no Egito. Quarenta e um (5,9%) de 700 amostras de carne de frango, carne bovina, moída e linguiça foram Y. enterocolitica positivas, com alta prevalência em carne de frango (12%). Cinco genes de virulência (ail, inv, ystA, ystB e yadA) foram caracterizados entre 41 isolados de Y. enterocolitica com frequências variáveis. Entre as cepas testadas, o gene ystB foi detectado com uma alta porcentagem (78,1%), seguido pelo gene inv (70,7%), ail genes (14,6%), gene ystA (12,2%) e gene yadA (2,4%). Foi estimada uma alta taxa de resistência ao ácido amoxicilina-clavulânico (100%), seguida de cefazolina (95%), ampicilina (65,9%) e doxiciclina (51,2%), enquanto uma alta taxa de sensibilidade foi observada para gentamicina e ciprofloxacina (97,6% cada). Curiosamente, a resistência a múltiplas drogas foi especificada em 70,7% das cepas e mostrando 13 padrões de resistência. Com base na análise da sequência nucleotídica do gene rRNA 16s, a árvore filogenética mostrou a relação genética entre isolados de Y. enterocolitica. Esses achados destacaram o surgimento de Y. entrocolitica patogênica virulenta e multirresistente em carnes e produtos à base de carne no Egito.
Assuntos
Humanos , Yersinia enterocolitica/genética , Farmacorresistência Bacteriana/genética , Carne/microbiologia , Produtos da Carne/microbiologia , Filogenia , Virulência/genética , RNA Ribossômico 16S , Egito , Genótipo , Antibacterianos/farmacologiaResumo
Abstract Pathogenic Yersinia enterocolitica (Y. enterocolitica) is one of the food-borne entero-pathogen responsible for yersiniosis in humans. The purpose of this research was to survey the prevalence, virulence-associated genes, and antimicrobial resistance of Y. enterocolitica isolated from meat and meat product samples in Egypt. Forty-one (5.9%) out of 700- samples of chicken meat, beef, ground beef, and sausage were positive Y. enterocolitica with a high prevalence in chicken meat (12%). Five virulence genes (ail, inv, ystA, ystB, and yadA) were characterized among 41 Y. enterocolitica isolates with variable frequencies. Among the strains tested, the ystB gene was detected with a high percentage (78.1%), followed by inv gene (70.7%), ail gene (14.6%), ystA gene (12.2%), and yadA gene (2.4%). A high resistance rate was estimated to amoxicillin-clavulanic acid (100%), followed by cefazolin (95%), ampicillin (65.9%), and doxycycline (51.2%), whilst a high sensitivity rate was observed to gentamicin and ciprofloxacin (97.6% each). Interestingly, the multidrug resistance was specified in the 70.7% of strains and showing 13 resistance patterns. Based on nucleotide sequence analysis of the 16s rRNA gene, the phylogenetic tree showed the genetic relatedness amongst Y. enterocolitica isolates. These findings highlighted the emergence of virulent and multidrug-resistant pathogenic Y. entrocolitica in retailed meat and meat products in Egypt.
Resumo A Yersinia enterocolitica patogênica (Y. enterocolitica) é um dos enteropatógenos de origem alimentar responsáveis pela yersiniose no ser humano. O objetivo desta pesquisa foi avaliar a prevalência, genes associados à virulência e resistência antimicrobiana de Y. enterocolitica isolada de amostras de carne e produtos à base de carne no Egito. Quarenta e um (5,9%) de 700 amostras de carne de frango, carne bovina, moída e linguiça foram Y. enterocolitica positivas, com alta prevalência em carne de frango (12%). Cinco genes de virulência (ail, inv, ystA, ystB e yadA) foram caracterizados entre 41 isolados de Y. enterocolitica com frequências variáveis. Entre as cepas testadas, o gene ystB foi detectado com uma alta porcentagem (78,1%), seguido pelo gene inv (70,7%), ail genes (14,6%), gene ystA (12,2%) e gene yadA (2,4%). Foi estimada uma alta taxa de resistência ao ácido amoxicilina-clavulânico (100%), seguida de cefazolina (95%), ampicilina (65,9%) e doxiciclina (51,2%), enquanto uma alta taxa de sensibilidade foi observada para gentamicina e ciprofloxacina (97,6% cada). Curiosamente, a resistência a múltiplas drogas foi especificada em 70,7% das cepas e mostrando 13 padrões de resistência. Com base na análise da sequência nucleotídica do gene rRNA 16s, a árvore filogenética mostrou a relação genética entre isolados de Y. enterocolitica. Esses achados destacaram o surgimento de Y. entrocolitica patogênica virulenta e multirresistente em carnes e produtos à base de carne no Egito.
Resumo
Milk and its derivatives are good substrates for the proliferation of pathogenic and quality-deteriorating microorganisms, demanding rigorous care with milking, processing, and storage. Among the various bacteria that can grow in raw refrigerated milk, Yersinia enterocolitica, is an invasive enteropathogen of humans. This bacterium can cause a number of intestinal and extraintestinal clinical symptoms, ranging from mild gastroenteritis to mesenteric lymphadenitis, similar to appendicitis. To evaluate the prevalence of pathogenic Yersinia enterocolitica in raw milk from bulk milk tanks located in the State of São Paulo, 102 bovine milk samples (one per dairy farm) were evaluated by microbiological analyses, followed by biochemical tests PCR and genetic sequencing. Microbiological testing did not isolate Y. enterocolitica. However, PCR analysis revealed six samples that were positive for Y. enterocolitica (5.9%), confirmed by genetic sequencing. Only the inv gene was detected, which is present in virulent and avirulent Y. enterocolitica strains. There was great difficulty in microbiological isolation due to the difficulty of competitiveness of Y. enterocolitica in a very rich microbiota of raw milk. Although virulence genes known to be present in potentially pathogenic strains of Y. enterocolitica have not been identified, the presence of this pathogen in milk from expansion tanks...(AU)
O leite e seus derivados possuem substratos que favorecem o desenvolvimento de micro-organismos patogênicos e deteriorantes, devido a isso, cuidados rigorosos são exigindo durante a ordenha, processamento e seu armazenamento. Dentre os vários grupos de bactérias que podem contaminar o leite refrigerado cru está Yersinia enterocolitica. Esta bactéria pode causar a uma série de sintomas clínicos intestinais e extraintestinais, variando de gastroenterite leve a linfadenite mesentérica, semelhante à apendicite. Para avaliar a prevalência de Y. enterocolitica patogênica no leite cru de tanques de expansão localizados no estado de São Paulo, foram avaliadas 102 amostras de leite bovino, por análises microbiológicas, seguido de provas bioquímicas; a Reação em Cadeia de Polimerase (PCR) e sequenciamento genético. Não houve o isolamento de Y. enterocolitica pelas provas microbiológicas clássicas. No entanto, a análise de PCR, realizada diretamente do leite, revelou seis (6) amostras positivas para Y. enterocolitica (5,9%), confirmadas por sequenciamento genético. Somente o gene inv, foi detectado, que pode estar presente em cepas virulentas e avirulentas. Houve dificuldade de isolamento microbiológico devido à dificuldade de competitividade da Y. enterocolitica em uma microbiota muito rica do leite cru. Ainda que não tenham sido identificados os genes de virulência que sabidamente estão...(AU)
Assuntos
Yersinia enterocolitica/isolamento & purificação , Leite/microbiologia , Microbiologia de Alimentos , Yersiniose/diagnóstico , Bovinos , Reação em Cadeia da Polimerase/veterináriaResumo
Despite the known importance of Clostridium perfringens as an enteropathogen in small ruminants, little is known about the role of its additional virulence factors or the frequency of the various C. perfringens genotypes in healthy goats; this complicates the laboratory diagnosis of the infections caused by this microorganism. In light of this, the aim of the present study was to isolate and genotype C. perfringens from stool samples from healthy goats in Brazil. Stool samples from 250 apparently healthy adult goats from 17 different herds in Minas Gerais, Brazil were collected, and isolation and genotyping of C. perfringens was performed. C. perfringens type A was isolated from 189 (75.6%) goats, whereas C. perfringens types C and D were each detected in one goat (0.4%). All isolates were negative for enterotoxin-, NetB-, NetE-, and NetF-encoding genes. These results confirmed C. perfringens type A as part of the microbiota in these animals, and they suggested that C. perfringens type C and D are rarely isolated from healthy goats.(AU)
Apesar da reconhecida importância de Clostridium perfringens como enteropatógeno de pequenos ruminantes, pouco se sabe sobre a frequência dos genótipos ou do papel de fatores de virulência adicionais de C. perfringens em cabras saudáveis, dificultando o diagnóstico laboratorial da infecção causada por esse micro-organismo. Dessa forma, o presente estudo teve como objetivo caracterizar C. perfringens de amostras de fezes de cabras adultas saudáveis. Amostras de fezes de 250 cabras saudáveis de 17 rebanhos diferentes em Minas Gerais, Brasil, foram submetidas ao isolamento e genotipagem de C. perfringens. C. perfringens tipo A foi isolado de 189 (75,6%) cabras, enquanto C. perfringens tipos C e D foram detectados em um animal (0.4%) cada. Todos os isolados foram negativos para os genes codificadores das toxinas NetB, NetE, NetF e enterotoxina. Os resultados apresentados confirmam C. perfringens tipo A como parte da microbiota de cabras saudáveis e sugere que C. perfringens tipos C e D são raramente encontrados em caprinos saudáveis.(AU)
Assuntos
Animais , Cabras/microbiologia , Clostridium perfringens/isolamento & purificação , Microbiota , Técnicas de GenotipagemResumo
Background: Escherichia coli (E. coli) is an enteropathogen that commonly causes diarrhea in calves. However, not all E. coli isolates are pathogenic. The aim of this study was to identify E. coli virulence factors derived from fecal samples collected in the southern region of Rio Grande do Sul state (RS) from calves with and without diarrhea, as well as investigate the antimicrobial susceptibility of E. coli isolates from calves with diarrhea.Materials, Methods & Results: Forty stool samples were collected in 12 farms, each one from calves having one day to six months of age, with and without diarrhea. The total DNA of from these isolates was extracted and a PCR using primers specific for the virulence factors Stx1, Eae, F41, F5 and STa was conducted. The susceptibility testing used the disk diffusion method and the susceptibility profile was evaluated against the following antimicrobials: ampicillin, penicillin, chloramphenicol, enrofloxacin, gentamicin, trimethoprim, sulfonamide, tetracycline and streptomycin. From all calves, 15 (15/40, 37.5%) had diarrheal stools and 25 (25/40, 62.5%) had normal or semi-liquid stools. Twelve (12/40; 30%) E. coli isolates showed at least one virulence factor. These factors were found in four isolates (4/15; 26.6%) from diarrheal stools and eight isolates (8/25; 28.5%) from normal stool. The Stx1 factor was identified in five isolates (5
Resumo
Abstract Pathogenic Yersinia enterocolitica (Y. enterocolitica) is one of the food-borne entero-pathogen responsible for yersiniosis in humans. The purpose of this research was to survey the prevalence, virulence-associated genes, and antimicrobial resistance of Y. enterocolitica isolated from meat and meat product samples in Egypt. Forty-one (5.9%) out of 700- samples of chicken meat, beef, ground beef, and sausage were positive Y. enterocolitica with a high prevalence in chicken meat (12%). Five virulence genes (ail, inv, ystA, ystB, and yadA) were characterized among 41 Y. enterocolitica isolates with variable frequencies. Among the strains tested, the ystB gene was detected with a high percentage (78.1%), followed by inv gene (70.7%), ail gene (14.6%), ystA gene (12.2%), and yadA gene (2.4%). A high resistance rate was estimated to amoxicillin-clavulanic acid (100%), followed by cefazolin (95%), ampicillin (65.9%), and doxycycline (51.2%), whilst a high sensitivity rate was observed to gentamicin and ciprofloxacin (97.6% each). Interestingly, the multidrug resistance was specified in the 70.7% of strains and showing 13 resistance patterns. Based on nucleotide sequence analysis of the 16s rRNA gene, the phylogenetic tree showed the genetic relatedness amongst Y. enterocolitica isolates. These findings highlighted the emergence of virulent and multidrug-resistant pathogenic Y. entrocolitica in retailed meat and meat products in Egypt.
Resumo A Yersinia enterocolitica patogênica (Y. enterocolitica) é um dos enteropatógenos de origem alimentar responsáveis pela yersiniose no ser humano. O objetivo desta pesquisa foi avaliar a prevalência, genes associados à virulência e resistência antimicrobiana de Y. enterocolitica isolada de amostras de carne e produtos à base de carne no Egito. Quarenta e um (5,9%) de 700 amostras de carne de frango, carne bovina, moída e linguiça foram Y. enterocolitica positivas, com alta prevalência em carne de frango (12%). Cinco genes de virulência (ail, inv, ystA, ystB e yadA) foram caracterizados entre 41 isolados de Y. enterocolitica com frequências variáveis. Entre as cepas testadas, o gene ystB foi detectado com uma alta porcentagem (78,1%), seguido pelo gene inv (70,7%), ail genes (14,6%), gene ystA (12,2%) e gene yadA (2,4%). Foi estimada uma alta taxa de resistência ao ácido amoxicilina-clavulânico (100%), seguida de cefazolina (95%), ampicilina (65,9%) e doxiciclina (51,2%), enquanto uma alta taxa de sensibilidade foi observada para gentamicina e ciprofloxacina (97,6% cada). Curiosamente, a resistência a múltiplas drogas foi especificada em 70,7% das cepas e mostrando 13 padrões de resistência. Com base na análise da sequência nucleotídica do gene rRNA 16s, a árvore filogenética mostrou a relação genética entre isolados de Y. enterocolitica. Esses achados destacaram o surgimento de Y. entrocolitica patogênica virulenta e multirresistente em carnes e produtos à base de carne no Egito.
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Background: Escherichia coli (E. coli) is an enteropathogen that commonly causes diarrhea in calves. However, not all E. coli isolates are pathogenic. The aim of this study was to identify E. coli virulence factors derived from fecal samples collected in the southern region of Rio Grande do Sul state (RS) from calves with and without diarrhea, as well as investigate the antimicrobial susceptibility of E. coli isolates from calves with diarrhea. Materials, Methods & Results: Forty stool samples were collected in 12 farms, each one from calves having one day to six months of age, with and without diarrhea. The total DNA of from these isolates was extracted and a PCR using primers specific for the virulence factors Stx1, Eae, F41, F5 and STa was conducted. The susceptibility testing used the disk diffusion method and the susceptibility profile was evaluated against the following antimicrobials: ampicillin, penicillin, chloramphenicol, enrofloxacin, gentamicin, trimethoprim, sulfonamide, tetracycline and streptomycin. From all calves, 15 (15/40, 37.5%) had diarrheal stools and 25 (25/40, 62.5%) had normal or semi-liquid stools. Twelve (12/40; 30%) E. coli isolates showed at least one virulence factor. These factors were found in four isolates (4/15; 26.6%) from diarrheal stools and eight isolates (8/25; 28.5%) from normal stool. The Stx1 factor was identified in five isolates (5/40; 12.5%), and the Eae and the Sta factors in one (1/40; 0.2%) and in atypical associations between Stx1 and Eae and also between Eae and F41 in two isolates (2/40; 0.5%). Also, the Eae and Sta factors were identified in one isolate (1/40; 0.2%). The susceptibility test showed resistance to penicillin and tetracycline in 93% and 80% of the tested isolates, respectively. Discussion: The identification of virulence factors is necessary because E. coli is an enterobacterium present in calves gastrointestinal tract, to prove its pathogenicity. [ ](AU)
Assuntos
Animais , Bovinos , Escherichia coli Enteropatogênica/patogenicidade , Fezes/parasitologia , Fatores de Virulência/isolamento & purificaçãoResumo
Background: Escherichia coli (E. coli) is an enteropathogen that commonly causes diarrhea in calves. However, not all E. coli isolates are pathogenic. The aim of this study was to identify E. coli virulence factors derived from fecal samples collected in the southern region of Rio Grande do Sul state (RS) from calves with and without diarrhea, as well as investigate the antimicrobial susceptibility of E. coli isolates from calves with diarrhea. Materials, Methods & Results: Forty stool samples were collected in 12 farms, each one from calves having one day to six months of age, with and without diarrhea. The total DNA of from these isolates was extracted and a PCR using primers specific for the virulence factors Stx1, Eae, F41, F5 and STa was conducted. The susceptibility testing used the disk diffusion method and the susceptibility profile was evaluated against the following antimicrobials: ampicillin, penicillin, chloramphenicol, enrofloxacin, gentamicin, trimethoprim, sulfonamide, tetracycline and streptomycin. From all calves, 15 (15/40, 37.5%) had diarrheal stools and 25 (25/40, 62.5%) had normal or semi-liquid stools. Twelve (12/40; 30%) E. coli isolates showed at least one virulence factor. These factors were found in four isolates (4/15; 26.6%) from diarrheal stools and eight isolates (8/25; 28.5%) from normal stool. The Stx1 factor was identified in five isolates (5/40; 12.5%), and the Eae and the Sta factors in one (1/40; 0.2%) and in atypical associations between Stx1 and Eae and also between Eae and F41 in two isolates (2/40; 0.5%). Also, the Eae and Sta factors were identified in one isolate (1/40; 0.2%). The susceptibility test showed resistance to penicillin and tetracycline in 93% and 80% of the tested isolates, respectively. Discussion: The identification of virulence factors is necessary because E. coli is an enterobacterium present in calves gastrointestinal tract, to prove its pathogenicity. [ ]
Assuntos
Animais , Bovinos , Escherichia coli Enteropatogênica/patogenicidade , Fatores de Virulência/isolamento & purificação , Fezes/parasitologiaResumo
Clostridioides difficile é um enteropatógeno bacteriano que infecta animais e seres humanos, capaz de promover distúrbios intestinais que podem levar o seu hospedeiro ao óbito. A infecção por C. difficile (ICD) representa atualmente uma das principais causas de infecção hospitalar, sendo a antibioticoterapia o principal fator predisponente. Na década de 2000, surtos ocasionados por C. difficile estiveram intimamente relacionados ao uso indiscriminado de antibióticos da classe das fluoroquinolonas. No Brasil, o tratamento da ICD é baseado no uso do metronidazol e da vancomicina. O uso de antimicrobianos parece ter relação direta com a seleção de determinadas estirpes de C. difficile. Nessa perspectiva, estudos epidemiológicos relacionados à resistência antimicrobiana desse patógeno são fundamentais para evitar a emergência de estirpes que podem representar um problema de saúde pública. Entretanto, o teste de sensibilidade antimicrobiana padrão-ouro recomendado para C. difficile é laborioso e de custo elevado. Dessa forma, o teste de disco difusão torna-se uma opção mais atrativa, uma vez que o método é simples de executar, mais barato e eficaz. O estudo teve como objetivo avaliar o perfil de sensibilidade ao metronidazol, à vancomicina e à moxifloxacina através do método de disco difusão de 120 estirpes de C. difficile isoladas de animais e seres humanos no Brasil. De acordo com pontos de corte já estabelecidos em estudos anteriores, as estirpes consideradas resistentes nesse teste foram submetidas ao método E-test para confirmação do fenótipo através da concentração inibitória mínima (CIM), mediante os critérios preconizados pelos órgãos de referência. Adicionalmente, três isolados classificados como resistentes à moxifloxacina foram sequenciados (gene gyrA) para detectar mutações que poderiam indicar o mecanismo genotípico de resistência à droga. Nenhum isolado foi resistente à vancomicina e somente uma estirpe (0,8%), considerada não toxigênica (RT010, clado 1), apresentou resistência ao metronidazol (CIM > 256 g/mL). Em relação à moxifloxacina, 14% (n = 17) das estirpes avaliadas foram resistentes, as quais obtiveram CIM > 32 g/mL. O ribotipo RT126 (clado 5) foi o único a apresentar associação estatística positiva de resistência à moxifloxacina (P < 0,0001), bem como os isolados das espécies equina e suína (P = 0,0139 e P = 0,0228, respectivamente). A mutação do tipo Thr82Ile foi encontrada nos três isolados sequenciados. O estudo revelou uma baixa frequência de resistência ao metronidazol e à vancomicina, enquanto a resistência à moxifloxacina foi superior a trabalhos anteriores realizados no Brasil
Clostridioides difficile is a bacterial enteropathogen that infects animals and humans, able to promote intestinal disorders that can lead to its host's death. Infection with C. difficile (CDI) currently represents one of the main causes of nosocomial infection, with antibiotic therapy being the main predisposing factor. In the 2000s, outbreaks caused by C. difficile were closely related to the indiscriminate use of antibiotics of the fluoroquinolone class. In Brazil, the treatment of CDI is based on the use of metronidazole and vancomycin. The use of antimicrobials seems to have a direct relationship with the selection of certain strains of C. difficile. In this perspective, epidemiological studies related to the antimicrobial resistance of this pathogen are essential to avoid the emergence of strains that may represent a public health problem. However, the gold standard antimicrobial susceptibility test recommended for C. difficile is laborious and expensive. Thus, the diffusion disk test becomes a more attractive option, since the method is simple to perform, cheaper and more effective. The study aimed to evaluate the sensitivity profile to metronidazole, vancomycin and moxifloxacin using the disk diffusion method from 120 strains of C. difficile from animals and humans isolated in Brazil. According to cutoff points already established in previous studies, strains considered resistant in this test were submitted to the E-test method to confirm the phenotype through the minimum inhibitory concentration (MIC), according to the criteria recommended by the reference institution. In addition, three isolates classified as resistant to moxifloxacin were sequenced (gyrA gene) to detect mutations that could indicate the genotypic mechanism of drug resistance. There was no vancomycin-resistant isolate and one strain (0.8%), non-toxigenic (RT010, clade 1), was resistant to metronidazole (MIC > 256 g/mL). Regarding moxifloxacin, 14% (n = 17) of the strains evaluated were resistant, which obtained MIC > 32 g/mL. The ribotype RT126 (clade 5) was the only one to present a positive statistical association of resistance to moxifloxacin (P < 0.0001), as well as isolates of the equine and swine species (P = 0.0139 and P = 0.0228, respectively). The Thr82Ile mutation was found in the three sequenced isolates. The study revealed a low frequency of resistance to metronidazole and vancomycin, while resistance to moxifloxacin was superior to previous studies carried out in Brazil.
Resumo
Clostridium perfringenstype A has been incriminated as the etiologic agent in jejunal hemorrhage syndrome (JHS), which is a disease that affects dairy cattle. Although this microorganism is considered an important enteropathogen the pathogenesis of JHS is still not clear, and there have been no reports of its occurrence in Brazil so far. The aim of this study was to describe the occurrence of JHS by infection with a C. perfringenstype A strain carrying the beta-2 toxin gene in a zebu cow in Brazil, for the first time.(AU)
Clostridium perfringens tipo A tem sido considerado agente etiológico da síndrome do jejuno hemorrágico (SJH), que é uma doença que afeta comumente os rebanhos de gado. Embora este microrganismo seja considerado um importante enteropatógeno, a patogênese da SJH ainda não foi elucidada, e não havia sido reportada no Brasil até então. O alvo deste estudo foi descrever pela primeira vez a ocorrência da SJH causadapor C. perfringenstipo A, carreador do gene da toxina beta-2, em um zebuíno no Brasil.(AU)
Assuntos
Animais , Bovinos , Doenças dos Bovinos , Doenças do Jejuno/veterinária , Clostridium perfringens , Infecções por Clostridium/veterináriaResumo
Escherichia coli é uma das principais causas de diarreia em bezerros neonatos e a intensificação da bovinocultura tem aumentado a sua incidência. O objetivo do estudo é caracterização molecular e fenotípica da amostra de E. coli isolada de um surto de diarreia em bezerros neonatos na Região Oeste de São Paulo, Brasil, no ano de 2016. As amostras de E. coli foram analisadas por PCR para a presença dos seguintes genes de virulência: cnf1, cnf2, lt1, lt2, sta, stx1, stx2, F5(k99), F41. Testes em cultura de células HeLa foram realizados e observou-se grande poder invasor nessas amostras. Testes de sensibilidade a drogas antimicrobianas revelaram resistência a múltiplas drogas. Pela análise do sequenciamento gênico detectou-se que a amostra em questão apresenta o gene fdeC e ausência dos demais genes característicos das categorias de E. coli já descritas. No anatomopatológico observou-se septicemia, com congestão passiva do fígado e do rim com necrose multifocal dos hepatócitos e inflamação da alça intestinal. Esses dados indicam que se trata de uma nova categoria de E. coli aqui denominada calf invasive E. coli - CIEC. De acordo com a literatura o papel do gene fdeC está relacionado com a capacidade invasora de amostras de E. coli patogênicas enquanto que a proteína FdeC vem sendo descrita como forte candidato para ser utilizada como antígeno para a construção de uma vacina de amplo espectro contra E. coli de origem intestinal e extra intestinal.
Molecular and phenotypical characterization of Escherichia coli isolated from diarrhea in calves Escherichia coli is a major cause of diarrhea in newborn calves and the intensification of cattle raising has increased its incidence. The objective of this study is to characterize the molecular and phenotypic characterization of the E. coli sample isolated from a diarrhea outbreak in neonatal calves in the western region of São Paulo, Brazil, in 2016. The E. coli samples were analyzed by PCR for presence of the following virulence genes: cnf1, cnf2, lt1, lt2, sta, stx1, stx2, F5 (k99), F41. HeLa cell culture tests were performed and great invasive power was observed in these samples. Antimicrobial drug susceptibility testing revealed resistance to multiple drugs. The analysis of gene sequencing revealed that the sample in question presents the fdeC gene and absence of the other characteristic genes of the E. coli categories already described. Pathological examination revealed septicemia, with passive congestion of the liver and kidney with multifocal hepatocyte necrosis and inflammation of the intestinal loop. These data indicate that this is a new category of E. coli here called calf invasive E. coli - CIEC. According to the literature, the role of the fdeC gene is related to the invasive capacity of pathogenic E. coli samples, while the FdeC protein has been described as a strong candidate for use as an antigen for the construction of a broad-spectrum E vaccine. coli of intestinal and extra - intestinal origin.
Resumo
Porcine group A rotavirus (PoRVA) is a major cause of neonatal diarrhea in suckling and recently weaned piglets worldwide. The involvement of non-group A rotavirus in cases of neonatal diarrhea in piglets are sporadic. In Brazil there are no reports of the porcine rotavirus group C (PoRVC) as etiologic agent of the diarrhea outbreaks in piglets. The aim of this study was to describe the identification of rotavirus group C in single and in mixed infection with rotavirus groups A and B in three neonatal diarrhea outbreaks in suckling (<21-day-old) piglets, with 70 percent to 80 percent and 20 percent to 25 percent of morbidity and lethality rates, respectively, in three pig herds located in the state of Santa Catarina, Brazil. The diagnosis of PoRV in the diarrheic fecal samples was performed using polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) to identify the presence of porcine rotavirus groups A, B (PoRVB), and C, and by RT-PCR (PoRVA and PoRVC) and semi-nested (SN)-PCR (PoRVB) to partially amplify the VP4 (VP8*)-VP7, NSP2, and VP6 genes of PoRVA, PoRVB, and PoRVC, respectively. [ ] The PoRVB strains (first and second outbreaks) and the PoRVC strains (first, second, and third outbreaks) showed higher nt identity and clustered in the phylogenetic tree with PoRVB and PoRVC strains that belong to the N4 and I1 genotypes, respectively. This is the first description in Brazil of the involvement of PoRVC in the etiology of diarrhea outbreaks in suckling piglets. The results of this study demonstrated that PoRVC, in both single and mixed infections, is an important enteropathogen involved in neonatal diarrhea outbreaks in piglets and that the use of more sensitive diagnostic techniques allows the identification of mixed infections involving two or even three groups of PoRV, which may be more common than previously reported.(AU)
O rotavírus suíno grupo A (PoRVA) é uma das principais causas de diarreia neonatal em leitões lactentes e recém-desmamados em todo o mundo. As descrições do envolvimento de rotavírus não-grupo A em quadros de diarreia neonatal em leitões são esporádicas. No Brasil não há relatos do envolvimento do rotavírus suíno grupo C (PoRVC) na etiologia dos surtos de diarreia em leitões. O objetivo deste estudo foi descrever a identificação de rotavírus grupo C em infecções singulares e mistas com os rotavírus grupos A e B em três surtos de diarreia neonatal em leitões lactentes (<21 dias de idade), com taxas de morbidade de 70 por cento a 80 por cento e de letalidade de 20 por cento a 25 por cento, em três rebanhos suínos localizados no estado de Santa Catarina, Brasil. O diagnóstico de PoRV nas amostras de fezes diarreicas foi realizado por eletroforese em gel de poliacrilamida (PAGE) para identificar a presença dos grupos A, B (PoRVB), e C de rotavírus suíno e por RT-PCR (PoRVA e PoRVC) e semi-nested (SN)-PCR (PoRVB) com a amplificação parcial dos genes VP4 (VP8*)-VP7, NSP2 e VP6 de PoRVA, PoRVB e PoRVC, respectivamente. [...] As cepas de PoRVB (primeiro e segundo surtos) e as cepas de PoRVC (primeiro, segundo e terceiro surtos) mostraram maior identidade de nt com cepas de PoRVB e PoRVC que pertencem aos genotipos N4 e I1, respectivamente. Esta é a primeira descrição realizada no Brasil do envolvimento de PoRVC na etiologia de surtos de diarreia em leitões lactentes. Os resultados deste estudo demonstram que o PoRVC, tanto em infecções singulares quanto em infecções mistas, é um importante enteropatógeno envolvido em surtos de diarreia neonatal em leitões e que o uso de técnicas de diagnóstico mais sensíveis permite caracterizar que infecções mistas, com dois ou até mesmo com três grupos de PoRV, podem ser mais comuns do que anteriormente relatado.(AU)
Assuntos
Animais , Lactente , Suínos/virologia , Rotavirus/isolamento & purificação , Infecções por Rotavirus/veterinária , Vírus da Diarreia Epidêmica Suína , Reação em Cadeia da Polimerase/veterináriaResumo
A diarreia é uma das doenças mais frequentes de bezerros com até 30 dias de idade e é uma importante causa de perdas econômicas. Sua etiologia é complexa e envolve a interação de diversos fatores infecciosos, nutricionais, imunológicos, gerenciais e ambientais. Os principais sinais clínicos são a diarreia, desidratação progressiva, acidose metabólica, desequilíbrio de eletrólitos e balanço energético negativo com ou sem hipoglicemia, que se não tratados, levam à morte do animal. Escherichia coli se destaca como um importante enteropatógeno envolvido na síndrome diarreica. Cepas de E. coli patogênicas são classificadas em grupos ou patotipos, de acordo com a produção de fatores de virulência e mecanismos pelos quais causam doença. Já foram identificados cinco patotipos de E. coli associados à diarreia em bezerros: E. coli enterotoxigênica (ETEC), E. coli enteropatogênica (EPEC), E. coli enterohemorrágica (EHEC), E. coli produtora de toxina Shiga (STEC) e E. coli necrotoxigênica (NTEC). Nesse artigo apresentamos as principais características e os atuais conhecimentos sobre os patotipos de E. coli causadores de diarreia em bezerros.(AU)
Diarrhea is one of the most frequent diseases in calves up to 30 days of age and is a major cause of economic losses. Its etiology is complex and involves the interaction of various infectious, nutritional, immunological, environmental and managerial factors. The main clinical signs are diarrhea, progressive dehydration, metabolic acidosis, electrolyte imbalance and negative energy balance with or without hypoglycemia, which if left untreated, results in death of the animal. Escherichia coli stands as an important enteropathogen involved in diarrheal syndrome. Pathogenic E. coli strains are classified into groups or pathotypes based on the production of virulence factors and on the mechanisms by which they cause diarrhea. There are five E. coli pathotypes associated with diarrhea in calves: enterotoxigenic E. coli (ETEC), enteropathogenic E. coli (EPEC), enterohemorrhagic E. coli (EHEC), Shiga toxin - producing E. coli (STEC) and necrotoxigenic E. coli (NTEC). In this article, we present the main characteristics and an update on E. coli pathotypes causing calf diarrhea.(AU)
Assuntos
Animais , Bovinos , Bovinos/microbiologia , Escherichia coli/isolamento & purificação , Disenteria/veterinária , Escherichia coli/classificação , Rotavirus , Desidratação/veterináriaResumo
Clostridium difficile is an emerging enteropathogen of humans and domestic animals. The bacterium was recently confirmed to be present in foals and dogs in Brazil, with some recent studies suggesting that C. difficile is one of the most important causes of piglet diarrhea in the country. Moreover, some reports also suggest the transmission of this microorganism between animals and humans, raising the possibility that C. difficile is a zoonotic disease. Therefore, the aim of the present review is to describe the main features of C. difficile infection in domestic animals and outline the occurrence of the disease in horses, dogs and pigs in Brazil.
Clostridium difficile é considerado um enteropatógeno emergente que acomete humanos e animais domésticos. A presença da doença em equinos e cães já foi relatada no Brasil e trabalhos sugerem que atualmente C. difficile seja um dos principais causadores de diarreia neonatal em suínos no país. Além disso, relatos recentes sugerem a transmissão do agente entre o homem e animais, gerando a hipótese de C. difficile ser um agente zoonótico. Com isso, o presente trabalho tem como objetivo revisar as principais características da doença, além de fornecer dados recentes sobre a ocorrência no Brasil da infecção por C. difficile nas principais espécies de animais domésticos.
Resumo
Clostridium difficile is an emerging enteropathogen of humans and domestic animals. The bacterium was recently confirmed to be present in foals and dogs in Brazil, with some recent studies suggesting that C. difficile is one of the most important causes of piglet diarrhea in the country. Moreover, some reports also suggest the transmission of this microorganism between animals and humans, raising the possibility that C. difficile is a zoonotic disease. Therefore, the aim of the present review is to describe the main features of C. difficile infection in domestic animals and outline the occurrence of the disease in horses, dogs and pigs in Brazil.
Clostridium difficile é considerado um enteropatógeno emergente que acomete humanos e animais domésticos. A presença da doença em equinos e cães já foi relatada no Brasil e trabalhos sugerem que atualmente C. difficile seja um dos principais causadores de diarreia neonatal em suínos no país. Além disso, relatos recentes sugerem a transmissão do agente entre o homem e animais, gerando a hipótese de C. difficile ser um agente zoonótico. Com isso, o presente trabalho tem como objetivo revisar as principais características da doença, além de fornecer dados recentes sobre a ocorrência no Brasil da infecção por C. difficile nas principais espécies de animais domésticos.
Resumo
Clostridium difficile is an emerging enteropathogen of humans and domestic animals. The bacterium was recently confirmed to be present in foals and dogs in Brazil, with some recent studies suggesting that C. difficile is one of the most important causes of piglet diarrhea in the country. Moreover, some reports also suggest the transmission of this microorganism between animals and humans, raising the possibility that C. difficile is a zoonotic disease. Therefore, the aim of the present review is to describe the main features of C. difficile infection in domestic animals and outline the occurrence of the disease in horses, dogs and pigs in Brazil.
Clostridium difficile é considerado um enteropatógeno emergente que acomete humanos e animais domésticos. A presença da doença em equinos e cães já foi relatada no Brasil e trabalhos sugerem que atualmente C. difficile seja um dos principais causadores de diarreia neonatal em suínos no país. Além disso, relatos recentes sugerem a transmissão do agente entre o homem e animais, gerando a hipótese de C. difficile ser um agente zoonótico. Com isso, o presente trabalho tem como objetivo revisar as principais características da doença, além de fornecer dados recentes sobre a ocorrência no Brasil da infecção por C. difficile nas principais espécies de animais domésticos.
Resumo
Clostridium perfringens type A (CPA) has been recognized as one of the most important cause of neonatal diarrhea in piglets. Despite its importance, the pathogenesis of CPA-associated disease is still unclear and data regarding its occurrence in Brazil is scarce. In light of this, the aim of this study was to report a case of neonatal diarrhea in piglets by CPA encoding beta-2 toxin gene (cpb-2). Three three-day-old piglets from a 2000-sow herd with history of diarrhea were necropsied and intestinal samples were collected for histology, immunohistochemistry, and feces samples were collected for bacteriologic and molecular procedures. Gross and histopathology revealed superficial necrotic enteritis associated with colonies of bacilli adhered to the exposed lamina propria. These ileal and jejunum fragments were positive for C. perfringens by immunohistochemistry, while anaerobic colonies were identified by PCR multiplex as CPA with the cpb-2. No other enteropathogen was identified from intestinal samples. The C. perfringens isolated strains were susceptible to penicillin, metronidazole and vancomicyn and resistant to eritromycin, enrofloxacin, oxitetracyclin and lincomycin.
Assuntos
Animais , Animais Recém-Nascidos/anormalidades , Clostridium perfringens/patogenicidade , Diarreia/veterinária , Doenças dos SuínosResumo
Clostridium perfringens type A (CPA) has been recognized as one of the most important cause of neonatal diarrhea in piglets. Despite its importance, the pathogenesis of CPA-associated disease is still unclear and data regarding its occurrence in Brazil is scarce. In light of this, the aim of this study was to report a case of neonatal diarrhea in piglets by CPA encoding beta-2 toxin gene (cpb-2). Three three-day-old piglets from a 2000-sow herd with history of diarrhea were necropsied and intestinal samples were collected for histology, immunohistochemistry, and feces samples were collected for bacteriologic and molecular procedures. Gross and histopathology revealed superficial necrotic enteritis associated with colonies of bacilli adhered to the exposed lamina propria. These ileal and jejunum fragments were positive for C. perfringens by immunohistochemistry, while anaerobic colonies were identified by PCR multiplex as CPA with the cpb-2. No other enteropathogen was identified from intestinal samples. The C. perfringens isolated strains were susceptible to penicillin, metronidazole and vancomicyn and resistant to eritromycin, enrofloxacin, oxitetracyclin and lincomycin.(AU)
Assuntos
Animais , Doenças dos Suínos , Diarreia/veterinária , Clostridium perfringens/patogenicidade , Animais Recém-Nascidos/anormalidadesResumo
O leite e seus derivados são bons meios para o desenvolvimento de micro-organismos patogênicos e deteriorantes, exigindo cuidados rigorosos com a ordenha, processamento e armazenamento. Entre os vários grupos de bactérias que podem ser desenvolvidas em leite refrigerado cru, Yersinia enterocolitica, um enteropatógeno invasivo para humanos, é uma delas. Esta bactéria pode causar a uma série de sintomas clínicos intestinais e extraintestinais, variando de gastroenterite leve a linfadenite mesentérica, semelhante a apendicite. Para avaliar a prevalência de Yersinia enterocolitica patogênica no leite cru de tanques de expansão localizados no estado de São Paulo, foram avaliadas 102 amostras de leite bovino, pelas análises microbiológicas, seguido de provas bioquímicas; a Reação em Cadeia de Polimerase (PCR) e sequenciamento genético. Não houve o isolamento de Yersinia enterocolitica pelas provas microbiológicas. A análise de PCR revelou seis (6) amostras positivas para Yersinia enterocolitica (5,9%), confirmadas por sequenciamento genético. Somente o gene inv, foi detectado, presente em cepas virulentas e avirulentas. Portanto, ainda que o patógeno estudado não represente um risco potencial nas amostras de leite analisadas neste estudo, foram observados diversos fatores de risco nas fazendas visitadas e uma grande contaminação da microbiota presente no leite, podendo-se afirmar que a qualidade do leite cru em tanques de expansão das fazendas avaliadas é de risco para a saúde pública.
Milk and its byproducts are good means for the development of pathogenic and deteriorating microorganisms, demanding rigorous care with milking, processing and storage. Among the various groups of bacteria that can be grown in raw refrigerated milk, Yersinia enterocolitica, an invasive enteropathogen for humans, is one of them. This bacterium can cause a number of intestinal and extraintestinal clinical symptoms, ranging from mild gastroenteritis to mesenteric lymphadenitis, similar to appendicitis. To evaluate the prevalence of pathogenic Yersinia enterocolitica in raw milk from bulk tanks milk located in the state of São Paulo, 102 bovine milk samples were evaluated by microbiological analysis, followed by biochemical tests; the Polymerase Chain Reaction (PCR) and genetic sequencing. There was no isolation of Yersinia enterocolitica by microbiological tests. PCR analysis revealed six (6) positive samples for Yersinia enterocolitica (5.9%), confirmed by genetic sequencing and later, identification of virulence genes by PCR. Only the inv gene, present in virulent and avirulent strains, was found. Therefore, although the pathogen studied does not present a potential risk in the milk samples analyzed in this study, several risk factors were observed in the farms visited and a great contamination of the microbiota present in the milk, and it can be stated that the quality of raw milk in tanks of the farms evaluated is a risk to public health.