Design and optimization of an experimental maintenance system for yellow clam broodstock Amarilladesma mactroides (Reeve, 1854)

Abstract The yellow clam is a sand-burrowing bivalve that inhabits the dissipative beaches from southern Brazil to the north coast of Argentina. In the last decades, populations of this species have been impacted by mass mortality events, overfishing and other anthropogenic activities. The production of juveniles in captivity would allow feasibility studies to be carried out to restore the natural stock as well as the production in aquaculture systems. Given the scarcity of studies on the maintenance of this species in captivity, a culture system and a management protocol were developed and tested. Wild-caught clams (total length 50 mm) were used in a series of 14 day-long trials. Survival was higher in clams that were allowed to bury into the sand. A permanent ink marker covered with a thin layer of a quick-hardening adhesive proved to be a reliable method to tag clams. The maintenance of yellow clams in this system resulted in high survival and growth, increases in the condition factor and oocyte diameter, and a relative advancement of gonadal development.

Resumo O marisco branco é um bivalve de areia que habita as praias dissipativas do sul do Brasil até a costa norte da Argentina. Nas últimas décadas, as populações desta espécie têm sido afetadas por eventos de mortalidade maciça, sobrepesca e outras atividades antropogênicas. A produção de juvenis em cativeiro permitiria a realização de estudos de viabilidade para restaurar o estoque natural, assim como a produção em sistemas de aquicultura. Dada a escassez de estudos sobre a manutenção desta espécie em cativeiro, um sistema de cultivo e um protocolo de manejo foram desenvolvidos e testados. Mariscos branco selvagens (comprimento total 50 mm) foram utilizados em uma série de ensaios de 14 dias de duração. A sobrevivência foi maior nos mariscos que podiam ser enterrados na areia. Um marcador de tinta permanente coberto com uma fina camada de adesivo de endurecimento rápido provou ser um método confiável para marcar os mariscos. A manutenção dos mariscos neste sistema resultou em alta sobrevivência e crescimento, aumento do fator de condição e do diâmetro do ovócito, e um relativo avanço do desenvolvimento gonadal.

Design and optimization of an experimental maintenance system for yellow clam broodstock Amarilladesma mactroides (Reeve, 1854) / Desenvolvimento e otimização de um sistema de manutenção experimental para reprodutores de marisco branco Amarilladesma mactroides (Reeve, 1854)

The yellow clam is a sand-burrowing bivalve that inhabits the dissipative beaches from southern Brazil to the north coast of Argentina. In the last decades, populations of this species have been impacted by mass mortality events, overfishing and other anthropogenic activities. The production of juveniles in captivity would allow feasibility studies to be carried out to restore the natural stock as well as the production in aquaculture systems. Given the scarcity of studies on the maintenance of this species in captivity, a culture system and a management protocol were developed and tested. Wild-caught clams (total length ≥50 mm) were used in a series of 14 day-long trials. Survival was higher in clams that were allowed to bury into the sand. A permanent ink marker covered with a thin layer of a quick-hardening adhesive proved to be a reliable method to tag clams. The maintenance of yellow clams in this system resulted in high survival and growth, increases in the condition factor and oocyte diameter, and a relative advancement of gonadal development.

O marisco branco é um bivalve de areia que habita as praias dissipativas do sul do Brasil até a costa norte da Argentina. Nas últimas décadas, as populações desta espécie têm sido afetadas por eventos de mortalidade maciça, sobrepesca e outras atividades antropogênicas. A produção de juvenis em cativeiro permitiria a realização de estudos de viabilidade para restaurar o estoque natural, assim como a produção em sistemas de aquicultura. Dada a escassez de estudos sobre a manutenção desta espécie em cativeiro, um sistema de cultivo e um protocolo de manejo foram desenvolvidos e testados. Mariscos branco selvagens (comprimento total ≥50 mm) foram utilizados em uma série de ensaios de 14 dias de duração. A sobrevivência foi maior nos mariscos que podiam ser enterrados na areia. Um marcador de tinta permanente coberto com uma fina camada de adesivo de endurecimento rápido provou ser um método confiável para marcar os mariscos. A manutenção dos mariscos neste sistema resultou em alta sobrevivência e crescimento, aumento do fator de condição e do diâmetro do ovócito, e um relativo avanço do desenvolvimento gonadal.

Design and optimization of an experimental maintenance system for yellow clam broodstock Amarilladesma mactroides (Reeve, 1854) / Desenvolvimento e otimização de um sistema de manutenção experimental para reprodutores de marisco branco Amarilladesma mactroides (Reeve, 1854)

The yellow clam is a sand-burrowing bivalve that inhabits the dissipative beaches from southern Brazil to the north coast of Argentina. In the last decades, populations of this species have been impacted by mass mortality events, overfishing and other anthropogenic activities. The production of juveniles in captivity would allow feasibility studies to be carried out to restore the natural stock as well as the production in aquaculture systems. Given the scarcity of studies on the maintenance of this species in captivity, a culture system and a management protocol were developed and tested. Wild-caught clams (total length ≥50 mm) were used in a series of 14 day-long trials. Survival was higher in clams that were allowed to bury into the sand. A permanent ink marker covered with a thin layer of a quick-hardening adhesive proved to be a reliable method to tag clams. The maintenance of yellow clams in this system resulted in high survival and growth, increases in the condition factor and oocyte diameter, and a relative advancement of gonadal development.

O marisco branco é um bivalve de areia que habita as praias dissipativas do sul do Brasil até a costa norte da Argentina. Nas últimas décadas, as populações desta espécie têm sido afetadas por eventos de mortalidade maciça, sobrepesca e outras atividades antropogênicas. A produção de juvenis em cativeiro permitiria a realização de estudos de viabilidade para restaurar o estoque natural, assim como a produção em sistemas de aquicultura. Dada a escassez de estudos sobre a manutenção desta espécie em cativeiro, um sistema de cultivo e um protocolo de manejo foram desenvolvidos e testados. Mariscos branco selvagens (comprimento total ≥50 mm) foram utilizados em uma série de ensaios de 14 dias de duração. A sobrevivência foi maior nos mariscos que podiam ser enterrados na areia. Um marcador de tinta permanente coberto com uma fina camada de adesivo de endurecimento rápido provou ser um método confiável para marcar os mariscos. A manutenção dos mariscos neste sistema resultou em alta sobrevivência e crescimento, aumento do fator de condição e do diâmetro do ovócito, e um relativo avanço do desenvolvimento gonadal.

Design and optimization of an experimental maintenance system for yellow clam broodstock Amarilladesma mactroides (Reeve, 1854) / Desenvolvimento e otimização de um sistema de manutenção experimental para reprodutores de marisco branco Amarilladesma mactroides (Reeve, 1854)

The yellow clam is a sand-burrowing bivalve that inhabits the dissipative beaches from southern Brazil to the north coast of Argentina. In the last decades, populations of this species have been impacted by mass mortality events, overfishing and other anthropogenic activities. The production of juveniles in captivity would allow feasibility studies to be carried out to restore the natural stock as well as the production in aquaculture systems. Given the scarcity of studies on the maintenance of this species in captivity, a culture system and a management protocol were developed and tested. Wild-caught clams (total length ≥50 mm) were used in a series of 14 day-long trials. Survival was higher in clams that were allowed to bury into the sand. A permanent ink marker covered with a thin layer of a quick-hardening adhesive proved to be a reliable method to tag clams. The maintenance of yellow clams in this system resulted in high survival and growth, increases in the condition factor and oocyte diameter, and a relative advancement of gonadal development.(AU)

O marisco branco é um bivalve de areia que habita as praias dissipativas do sul do Brasil até a costa norte da Argentina. Nas últimas décadas, as populações desta espécie têm sido afetadas por eventos de mortalidade maciça, sobrepesca e outras atividades antropogênicas. A produção de juvenis em cativeiro permitiria a realização de estudos de viabilidade para restaurar o estoque natural, assim como a produção em sistemas de aquicultura. Dada a escassez de estudos sobre a manutenção desta espécie em cativeiro, um sistema de cultivo e um protocolo de manejo foram desenvolvidos e testados. Mariscos branco selvagens (comprimento total ≥50 mm) foram utilizados em uma série de ensaios de 14 dias de duração. A sobrevivência foi maior nos mariscos que podiam ser enterrados na areia. Um marcador de tinta permanente coberto com uma fina camada de adesivo de endurecimento rápido provou ser um método confiável para marcar os mariscos. A manutenção dos mariscos neste sistema resultou em alta sobrevivência e crescimento, aumento do fator de condição e do diâmetro do ovócito, e um relativo avanço do desenvolvimento gonadal.(AU)

Genetic diversity of Tambaqui (Teleostei - Characidae) broodstocks from Northern region of Brazil using microsatellite markers / Diversidade genética de estoque de Tambaqui (Teleostei - Characidae) da região Norte do Brasil usando marcadores microssatélites

The Amazonian fish Tambaqui (Colossoma macropomum) is the most common native species in Brazil. This species has the highest production rate in the Northern region, especially in the State of Rondônia. The genetic evaluation of Tambaqui is an extremely important to increase productivity in fish farms or improve the adaptability in restocking natural populations. The objective of this study was to evaluate the genetic diversity of three Tambaqui broodstocks in Rondônia, Brazil. Six microsatellite markers were used to analyze a total of 89 breeders collected from three fish farms located in Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP) and Presidente Médici (PM). A total of 37 alleles between 140 and 310 bp were found, including the presence of exclusive and low frequency alleles in the three broodstocks. The average values of observed heterozygosity ranged from 0.404 (PM) to 0.499 (JP). The FIS coefficient values were positive for the three broodstocks, demonstrating a deficit of heterozygotes. The Molecular Variance Analysis (AMOVA) showed greater variation within the stocks than between them. The genetic differentiation was moderate and significant between the stocks, with higher differentiation between JP x PM and lower between OP x PM. The Bayesian analysis designated an optimal value of K=3 groupings. Although there is moderate genetic diversity between broodstocks, the high FIS indicates a possible decline of diversity in the next generations, and therefore, the incorporation of new breeders is suggested to increase the genetic diversity in the three stocks.

O peixe amazônico Tambaqui (Colossoma macropomum) é a espécie nativa mais produzida no Brasil. Esta espécie é a mais criada na região Norte, principalmente no Estado de Rondônia. A avaliação genética de Tambaqui é extremamente importante para aumentar a produtividade nas pisciculturas ou melhorar a adaptabilidade no repovoamento de populações naturais. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade genética de três estoques de Tambaqui em Rondônia, Brasil. Seis marcadores microssatélites foram utilizados para analisar um total de 89 reprodutores coletados em três pisciculturas localizadas em Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP) e Presidente Médici (PM). Foram encontrados 37 alelos entre 140 e 310 pb, incluindo a presença de alelos exclusivos e de baixa frequência nas três ninhadas. Os valores médios de heterozigosidade observada variaram de 0,404 (PM) a 0,499 (JP). Os valores do coeficiente de FIS foram positivos para as três ninhadas, demonstrando déficit de heterozigotos. A Análise de Variância Molecular (AMOVA) mostrou maior variação dentro dos estoques do que entre eles. A diferenciação genética foi moderada e significativa entre os estoques, com maior diferenciação entre JPxPM e menor entre OP x PM. A análise bayesiana designou um valor ótimo de K = 3 agrupamentos. Embora exista uma diversidade genética moderada entre os filhotes, o alto SIF indica um possível declínio da diversidade nas próximas gerações e, portanto, sugere-se a incorporação de novos criadores para aumentar a diversidade genética nos três estoques.

Genetic diversity of Tambaqui (Teleostei - Characidae) broodstocks from Northern region of Brazil using microsatellite markers / Diversidade genética de estoque de Tambaqui (Teleostei - Characidae) da região Norte do Brasil usando marcadores microssatélites

The Amazonian fish Tambaqui (Colossoma macropomum) is the most common native species in Brazil. This species has the highest production rate in the Northern region, especially in the State of Rondônia. The genetic evaluation of Tambaqui is an extremely important to increase productivity in fish farms or improve the adaptability in restocking natural populations. The objective of this study was to evaluate the genetic diversity of three Tambaqui broodstocks in Rondônia, Brazil. Six microsatellite markers were used to analyze a total of 89 breeders collected from three fish farms located in Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP) and Presidente Médici (PM). A total of 37 alleles between 140 and 310 bp were found, including the presence of exclusive and low frequency alleles in the three broodstocks. The average values of observed heterozygosity ranged from 0.404 (PM) to 0.499 (JP). The FIS coefficient values were positive for the three broodstocks, demonstrating a deficit of heterozygotes. The Molecular Variance Analysis (AMOVA) showed greater variation within the stocks than between them. The genetic differentiation was moderate and significant between the stocks, with higher differentiation between JP x PM and lower between OP x PM. The Bayesian analysis designated an optimal value of K=3 groupings. Although there is moderate genetic diversity between broodstocks, the high FIS indicates a possible decline of diversity in the next generations, and therefore, the incorporation of new breeders is suggested to increase the genetic diversity in the three stocks.(AU)

O peixe amazônico Tambaqui (Colossoma macropomum) é a espécie nativa mais produzida no Brasil. Esta espécie é a mais criada na região Norte, principalmente no Estado de Rondônia. A avaliação genética de Tambaqui é extremamente importante para aumentar a produtividade nas pisciculturas ou melhorar a adaptabilidade no repovoamento de populações naturais. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade genética de três estoques de Tambaqui em Rondônia, Brasil. Seis marcadores microssatélites foram utilizados para analisar um total de 89 reprodutores coletados em três pisciculturas localizadas em Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP) e Presidente Médici (PM). Foram encontrados 37 alelos entre 140 e 310 pb, incluindo a presença de alelos exclusivos e de baixa frequência nas três ninhadas. Os valores médios de heterozigosidade observada variaram de 0,404 (PM) a 0,499 (JP). Os valores do coeficiente de FIS foram positivos para as três ninhadas, demonstrando déficit de heterozigotos. A Análise de Variância Molecular (AMOVA) mostrou maior variação dentro dos estoques do que entre eles. A diferenciação genética foi moderada e significativa entre os estoques, com maior diferenciação entre JPxPM e menor entre OP x PM. A análise bayesiana designou um valor ótimo de K = 3 agrupamentos. Embora exista uma diversidade genética moderada entre os filhotes, o alto SIF indica um possível declínio da diversidade nas próximas gerações e, portanto, sugere-se a incorporação de novos criadores para aumentar a diversidade genética nos três estoques.(AU)

Genetic characterization of tambaqui stocks from two pisciculture stations in the lower São Francisco River / Caracterização genética de estoques de tambaqui de duas estações de piscicultura no baixo rio São Francisco

Pisciculture has been an important part of the economy in many regions of Brazil, and the tambaqui (Colossoma macropomum) stands out as one of the country's most commercialized native freshwater fish species. Loss of genetic variability can affect characteristics such as reproduction and growth rates, as well as disease resistance and is of great concern in this field. Molecular markers such as mitochondrial DNA genes have been increasingly used to understand genetic variability in species of economic importance. This study aimed to characterize the genetic variability of tambaqui populations reared in two fish farms (Itiúba, AL and Betume, SE) of the lower São Francisco River by analyzing the control region and ATPase genes of mitochondrial DNA. Sequencing of samples from progenies and breeding individuals identified 42 haplotypes (32 unique), of which four haplotypes were shared between the two fish farms as a result of a founder effect, because individuals from Itiúba formed the stock of the Betume fish farming Station. Haplotype diversity was high in both locations. Analysis of Molecular Variance (AMOVA) revealed greater genetic variation within populations (96.76%) than between them (3.24%) and the FST value (0.03) indicated low genetic differentiation between the two populations. The observed high genetic variability can be explained by the number of breeders in the two fish farms (200 in Itiúba and 1400 in Betume) and the breeding management system, which seems to be effective in maintaining stock variability.

A piscicultura tem ocupado um lugar de destaque na economia de muitas regiões do Brasil, e o tambaqui (Colossoma macropomum) se sobressai por ser uma das espécies nativas de peixes de água doce mais comercializadas do país. A diminuição da variabilidade genética pode afetar características como as taxas de reprodução e crescimento, bem como resistência a doenças e é de grande preocupação nesse ramo. Marcadores moleculares, como os genes do DNA mitocondrial, vem sendo cada vez mais utilizados para investigar a variabilidade genética em espécies de importância econômica. Assim, este estudo teve como objetivo caracterizar a variabilidade genética de populações de tambaqui cultivados em duas pisciculturas (Itiúba, AL e Betume, SE) do baixo Rio São Francisco, utilizando a região controle e os genes da ATPase do DNA mitocondrial. O sequenciamento de amostras de progênies e reprodutores identificou 42 haplótipos (32 únicos). Destes, quatro haplótipos foram compartilhados entre as duas pisciculturas estudadas, o que é resultado de um efeito fundador, uma vez que indivíduos de Itiúba foram levados para compor o estoque da Estação de Piscicultura de Betume. A diversidade haplotípica foi alta em ambas as localidades. Análise de Variância Molecular (AMOVA) demonstrou maior variação genética dentro das populações (96.76%) do que entre elas (3.24%) e o valor de Fst (0.03) indicou pouca diferenciação genética entre as duas populações analisadas. A alta variabilidade genética encontrada pode ser explicada pelo número de reprodutores nas duas pisciculturas (200 em Itiúba e 1400 em Betume) e o manejo reprodutivo, que parece ser eficaz na manutenção da variabilidade de estoques.

Genetic characterization of tambaqui stocks from two pisciculture stations in the lower São Francisco River / Caracterização genética de estoques de tambaqui de duas estações de piscicultura no baixo rio São Francisco

Pisciculture has been an important part of the economy in many regions of Brazil, and the tambaqui (Colossoma macropomum) stands out as one of the country's most commercialized native freshwater fish species. Loss of genetic variability can affect characteristics such as reproduction and growth rates, as well as disease resistance and is of great concern in this field. Molecular markers such as mitochondrial DNA genes have been increasingly used to understand genetic variability in species of economic importance. This study aimed to characterize the genetic variability of tambaqui populations reared in two fish farms (Itiúba, AL and Betume, SE) of the lower São Francisco River by analyzing the control region and ATPase genes of mitochondrial DNA. Sequencing of samples from progenies and breeding individuals identified 42 haplotypes (32 unique), of which four haplotypes were shared between the two fish farms as a result of a founder effect, because individuals from Itiúba formed the stock of the Betume fish farming Station. Haplotype diversity was high in both locations. Analysis of Molecular Variance (AMOVA) revealed greater genetic variation within populations (96.76%) than between them (3.24%) and the FST value (0.03) indicated low genetic differentiation between the two populations. The observed high genetic variability can be explained by the number of breeders in the two fish farms (200 in Itiúba and 1400 in Betume) and the breeding management system, which seems to be effective in maintaining stock variability.(AU)

A piscicultura tem ocupado um lugar de destaque na economia de muitas regiões do Brasil, e o tambaqui (Colossoma macropomum) se sobressai por ser uma das espécies nativas de peixes de água doce mais comercializadas do país. A diminuição da variabilidade genética pode afetar características como as taxas de reprodução e crescimento, bem como resistência a doenças e é de grande preocupação nesse ramo. Marcadores moleculares, como os genes do DNA mitocondrial, vem sendo cada vez mais utilizados para investigar a variabilidade genética em espécies de importância econômica. Assim, este estudo teve como objetivo caracterizar a variabilidade genética de populações de tambaqui cultivados em duas pisciculturas (Itiúba, AL e Betume, SE) do baixo Rio São Francisco, utilizando a região controle e os genes da ATPase do DNA mitocondrial. O sequenciamento de amostras de progênies e reprodutores identificou 42 haplótipos (32 únicos). Destes, quatro haplótipos foram compartilhados entre as duas pisciculturas estudadas, o que é resultado de um efeito fundador, uma vez que indivíduos de Itiúba foram levados para compor o estoque da Estação de Piscicultura de Betume. A diversidade haplotípica foi alta em ambas as localidades. Análise de Variância Molecular (AMOVA) demonstrou maior variação genética dentro das populações (96.76%) do que entre elas (3.24%) e o valor de Fst (0.03) indicou pouca diferenciação genética entre as duas populações analisadas. A alta variabilidade genética encontrada pode ser explicada pelo número de reprodutores nas duas pisciculturas (200 em Itiúba e 1400 em Betume) e o manejo reprodutivo, que parece ser eficaz na manutenção da variabilidade de estoques.(AU)

Genetic characterization of selected Nile tilapia in Santa Catarina / Caracterização genética de tilápia-do-nilo selecionadas em Santa Catarina

Different Nile tilapia stocks belonging to the fish breeding program of the Epagri (Empresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural de Santa Catarina) were characterized by microsatellite markers. A total of nine stocks (S1 to S9) were evaluated, and for each stock the caudal fin of 30 individuals were sampled. A total of 75 alleles were found at the 11 microsatellite loci used (UNH104, UNH108, UNH160, UNH208, UNH222, UNH848, UNH879, UNH898, UNH952, UNH998). Among the loci used, only UHN160 showed significance for null alleles in stocks S1, S2, S3 and S5. The average number of alleles per loci was 6.8, while the average number of alleles per tilapia stock was 4.4. Five unique alleles were identified between the stock S1 and S5. The observed heterozygosity values (Ho) exceeded the expected heterozygosity (He), resulting in a negative inbreeding coefficient (FIS = -0.092). FST for the total population was 0.109, demonstrating moderate genetic differentiation between the stocks. According to the Euclidean distance, three groups were formed as follows: I - S6, S7 and S9; II - S2, S3 and S4; and III - S1, S5 and S8. However, the existence of two groups can be observed from the PCoA representation: I - S6, S7, S8 and S9; and II - S1, S2, S3, S4 and S5. The formation of these two genetic groups is consistent with the genealogy of stocks. The formation of group III (S1, S5 and S8) in the dendrogram can be explained by the higher average observed heterozygosity values of these stocks. Bayesian analysis revealed the formation of 16 groups with an FST value of 0.2107. This result reinforces the existence of variability existing in the Epagri breeding program, from which it is possible to form heterotic groups to enable the direction of potential crosses to obtain genetic gain. The study enabled genotypic characterization of the tilapia brood stock used in the Epagri breeding program, determining the genetic distance between the stocks, which will enable more accurate selection of individuals for mating for the next generation. It was possible to verify that there is high heterozygosity within the stocks, and moderate genetic differentiation between the stocks. Furthermore, all evaluated markers were polymorphic for this brood stock and will be used to characterize the next generations.(AU)

Diferentes plantéis de tilápia-do-nilo pertencentes ao programa de melhoramento genético de peixes da Epagri (Empresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural de Santa Catarina) foram caracterizados por meio de marcadores microssatélites. Ao total foram avaliados nove plantéis (S1 a S9), e para cada foram amostrados nadadeira caudal de 30 indivíduos. O total de 75 alelos foram encontrados nos 11 loci microssatélites utilizados (UNH104, UNH108, UNH160, UNH208, UNH222, UNH848, UNH868, UNH879, UNH898, UNH952, UNH998). Entre os loci utilizados, apenas o UHN160 apresentou significância para alelos nulos nos estoques S1, S2, S3 e S5.A média do número de alelos por loci foi 6,8, enquanto a média do número de alelos por plantel de reprodutores foi 4,4. Foram encontrados cinco alelos exclusivos entre os plantéis S1 e S5. Os valores de heterozigosidade observada (Ho) foi maior do que a esperada (He), resultando em um coeficiente de endogamia (FIS) médio negativo (-0,092). O FST encontrado para a população total foi de 0,109, evidenciando moderada diferenciação genética entre os plantéis. De acordo com a distância euclidiana, três grupos foram formados da seguinte forma: I - S6, S7 e S9; II - S2, S3 e S4; e III - S1, S5 e S8. Porém, a partir da representação do PCoA, observa-se a existência de dois grupos: I - S6, S7, S8 e S9; e II - S1, S2, S3, S4 e S5. A formação desses dois grupos genéticos é consistente com a genealogia dos plantéis de reprodutores. A formação do grupo III (S1, S5 e S8) no dendrograma pode ser explicada pelos maiores valores médios de heterozigosidade observados desses plantéis. A análise bayesiana mostrou a formação de 16 grupos com um valor de Fst de 0,2107. Esse resultado reforça a existência de variabilidade existente no programa de melhoramento Epagri, a partir do qual é possível formar grupos heteróticos para permitir cruzamentos potenciais para obter ganho genético. O estudo permitiu a caracterização genotípica dos plantéis de reprodutores de tilápia utilizado no programa de melhoramento Epagri, determinando a distância genética entre eles, o que permitirá a seleção mais precisa dos indivíduos para os acasalamentos da próxima geração. Foi possível verificar que há alta heterozigosidade entre os plantéis de reprodutores e moderada diferenciação genética entre eles. Além disso, todos os marcadores avaliados foram polimórficos para este estoque de matrizes e serão utilizados para caracterizar as próximas gerações.(AU)

Genetic diversity of tambaqui broodstocks in stock enhancement programs / Diversidade genética de estoques de reprodutores de tambaqui utilizados em programas de repovoamento

Natural populations of tambaqui (Colossoma macropomum) have significantly decreased in recent decades especially due to human extraction activities. So that the environmental impact may be reduced, the restocking of fish and increase in fish production are enhanced. Genetic evaluations using molecular markers are essential for this purpose. Current study evaluates the genetic variability of two tambaqui broodstocks used in restocking programs. Sixty-five samples (33 samples from broodstock A and 32 samples from broodstock B) were collected. DNA was extracted from caudal fin samples, with the amplification of four microsatellite loci: Cm1A11 (EU685307) Cm1C8 (EU685308) Cm1F4 (EU685311) and Cm1H8 (EU685315). Fourteen alleles in the stock of broodstock A were produced, five alleles for Cm1A11 locus (230, 255, 260, 270 and 276 bp), three alleles Cm1C8 (239, 260, and 273 bp), two alleles Cm1F4 (211 and 245 bp), four alleles for Cm1H8 (275, 290, 320 and 331 bp) and two unique alleles were found for Cm1A11 loci (alleles 270 and 276 bp) and Cm1H8 (alleles 275 and 331 bp). In broodstock B, ten alleles were produced, the same alleles of the first stock except for alleles 270 and 276 bp in Cm1A11 locus and 275 and 331 bp in Cm1H8 locus. Broodstock A revealed low frequency alleles in Cm1A11 loci, Cm1C8, Cm1F4 and Cm1H8, whereas broodstock B had no locus with low allelic frequency. Loci Cm1A11, Cm1C8 and Cm1H8 exhibited significant deficit of heterozygotes in both broodstocks, revealing changes in Hardy-Weinberg equilibrium. Genetic diversity between stocks was 0.1120, whilst genetic similarity was 0.894, with FST rate = 0.05, and Nm = 3.93, indicating gene flow between the two broodstocks. Results show that broodstocks are genetically closely related, with no great genetic variability...(AU)

A população natural do tambaqui (Colossoma macropomum) está reduzindo significativamente nas últimas décadas devido às ações antrópicas, como o extrativismo. Para diminuir este impacto ambiental, o repovoamento de peixes e aumento da produção piscícola estão sendo realizados. Para tanto, avaliações genéticas por meio de marcadores moleculares são fundamentais. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de dois estoques de reprodutores de tambaqui utilizados em programas de repovoamento. Foram coletadas 65 amostras (33 amostras do estoque A e 32 amostras do estoque B). O DNA foi extraído de amostras da nadadeira caudal, com a amplificação de quatro loci microssatélite: Cm1A11 (EU685307), Cm1C8 (EU685308), Cm1F4 (EU685311) e Cm1H8 (EU685315). Foram produzidos 14 alelos no estoque de reprodutores A, cinco alelos para o locus Cm1A11 (230, 255, 260, 270 e 276 pb), três alelos para Cm1C8 (239, 260 e 273 pb), dois alelos para Cm1F4 (211 e 245 pb), quatro alelos para Cm1H8 (275, 290, 320 e 331 pb) e dois alelos exclusivos foram encontrados para os loci Cm1A11 (alelos 270 e 276 pb) e Cm1H8 (alelos 275 e 331 pb). Para o estoque de reprodutores B foram produzidos 10 alelos, os mesmos alelos do primeiro estoque, exceto para os alelos 270 e 276 pb no locus Cm1A11 e 275 e 331 pb no locus Cm1H8. No estoque de reprodutores A foi observado alelos de baixa frequência nos loci Cm1A11, Cm1C8, Cm1F4 e Cm1H8. Já o estoque de reprodutores B não apresentou locus com baixa frequência alélica. Os loci Cm1A11, Cm1C8 e Cm1H8 exibiram significativo défict de heterozigotos em ambos os estoques de reprodutores, indicando alteração no equilíbrio de Hardy-Weinberg. A divergência genética foi de 0,1120 entre os estoques, enquanto a similaridade genética foi de 0,894, com o valor de FST igual a 0,05, e o Nm igual a 3,93 indicando fluxo gênico entre os dois estoques de reprodutores...(AU)

Genetic diversity of tambaqui broodstocks in stock enhancement programs / Diversidade genética de estoques de reprodutores de tambaqui utilizados em programas de repovoamento

Natural populations of tambaqui (Colossoma macropomum) have significantly decreased in recent decades especially due to human extraction activities. So that the environmental impact may be reduced, the restocking of fish and increase in fish production are enhanced. Genetic evaluations using molecular markers are essential for this purpose. Current study evaluates the genetic variability of two tambaqui broodstocks used in restocking programs. Sixty-five samples (33 samples from broodstock A and 32 samples from broodstock B) were collected. DNA was extracted from caudal fin samples, with the amplification of four microsatellite loci: Cm1A11 (EU685307) Cm1C8 (EU685308) Cm1F4 (EU685311) and Cm1H8 (EU685315). Fourteen alleles in the stock of broodstock A were produced, five alleles for Cm1A11 locus (230, 255, 260, 270 and 276 bp), three alleles Cm1C8 (239, 260, and 273 bp), two alleles Cm1F4 (211 and 245 bp), four alleles for Cm1H8 (275, 290, 320 and 331 bp) and two unique alleles were found for Cm1A11 loci (alleles 270 and 276 bp) and Cm1H8 (alleles 275 and 331 bp). In broodstock B, ten alleles were produced, the same alleles of the first stock except for alleles 270 and 276 bp in Cm1A11 locus and 275 and 331 bp in Cm1H8 locus. Broodstock A revealed low frequency alleles in Cm1A11 loci, Cm1C8, Cm1F4 and Cm1H8, whereas broodstock B had no locus with low allelic frequency. Loci Cm1A11, Cm1C8 and Cm1H8 exhibited significant deficit of heterozygotes in both broodstocks, revealing changes in Hardy-Weinberg equilibrium. Genetic diversity between stocks was 0.1120, whilst genetic similarity was 0.894, with FST rate = 0.05, and Nm = 3.93, indicating gene flow between the two broodstocks. Results show that broodstocks are genetically closely related, with no great genetic variability...

A população natural do tambaqui (Colossoma macropomum) está reduzindo significativamente nas últimas décadas devido às ações antrópicas, como o extrativismo. Para diminuir este impacto ambiental, o repovoamento de peixes e aumento da produção piscícola estão sendo realizados. Para tanto, avaliações genéticas por meio de marcadores moleculares são fundamentais. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de dois estoques de reprodutores de tambaqui utilizados em programas de repovoamento. Foram coletadas 65 amostras (33 amostras do estoque A e 32 amostras do estoque B). O DNA foi extraído de amostras da nadadeira caudal, com a amplificação de quatro loci microssatélite: Cm1A11 (EU685307), Cm1C8 (EU685308), Cm1F4 (EU685311) e Cm1H8 (EU685315). Foram produzidos 14 alelos no estoque de reprodutores A, cinco alelos para o locus Cm1A11 (230, 255, 260, 270 e 276 pb), três alelos para Cm1C8 (239, 260 e 273 pb), dois alelos para Cm1F4 (211 e 245 pb), quatro alelos para Cm1H8 (275, 290, 320 e 331 pb) e dois alelos exclusivos foram encontrados para os loci Cm1A11 (alelos 270 e 276 pb) e Cm1H8 (alelos 275 e 331 pb). Para o estoque de reprodutores B foram produzidos 10 alelos, os mesmos alelos do primeiro estoque, exceto para os alelos 270 e 276 pb no locus Cm1A11 e 275 e 331 pb no locus Cm1H8. No estoque de reprodutores A foi observado alelos de baixa frequência nos loci Cm1A11, Cm1C8, Cm1F4 e Cm1H8. Já o estoque de reprodutores B não apresentou locus com baixa frequência alélica. Os loci Cm1A11, Cm1C8 e Cm1H8 exibiram significativo défict de heterozigotos em ambos os estoques de reprodutores, indicando alteração no equilíbrio de Hardy-Weinberg. A divergência genética foi de 0,1120 entre os estoques, enquanto a similaridade genética foi de 0,894, com o valor de FST igual a 0,05, e o Nm igual a 3,93 indicando fluxo gênico entre os dois estoques de reprodutores...

Genetic characteristics of Tambaqui broodstocks in the state of Rondônia, Brazil: implications on production and conservation / Caracterização genética de estoques de Tambaqui do Estado de Rondônia (Brasil): implicações na produção e na conservação

In recent years, the genetic monitoring of broodstocks in fish farming has been greatly highlighted due to its importance in the management and improvement of their production and conservation. Current study evaluates the genetic diversity of four Tambaqui broodstocks (Colossoma macropomum) in the state of Rondônia (Brazil) and discusses activities towards the species´s correct production management and conservation. Nine primers were employed to analyze 94 specimens from four fish farms in the municipalities of Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP), Presidente Médici (PM) and Rolim de Moura (RM). Differences in the frequency of 38 fragments, with an exclusive fragment in JP and OP, were reported. High polymorphism (52.40 to 64.60%) and Shannon Index (0.313 to 0.382) rates were observed. The analysis of molecular variance (AMOVA) demonstrated that most variation is within each stock. The identity and genetic distance between the groups ranged between 0.927 and 0.954 and between 0.047 and 0.076 respectively, with shortest distance between the OPxPM and JPxRM groups. Genetic differentiation ranged from moderate to high (Fst = 0.081 to 0.179) and the number of migrants per generation was moderate (Nm = 3.83 to 6.24). As a rule, stocks showed high genetic variability and moderate / high differentiation and genetic distance between them. The results allowed direct conservation pr

Nos últimos anos, o monitoramento genético de estoques na piscicultura tem recebido grande destaque devido a sua importância no gerenciamento e melhora da sua produção e conservação. Dessa forma, o objetivo deste estudo foi avaliar de forma inédita a diversidade genética de quatro estoques de reprodutores Tambaqui (Colossoma macropomum) do estado de Rondônia (Brasil) e através dela, discutir ações que contribuam com o correto manejo produtivo e conservação dessa espécie. Utilizaram-se nove iniciadores para analisar 94 indivíduos de quatro pisciculturas dos municípios Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP), Presidente Medici (PM) e Rolim de Moura (RM). Foram encontradas diferenças nas frequências de 38 fragmentos, com um fragmento exclusivo em JP e OP. Altos valores de polimorfismo (52,40 a 64,60%) e índice de Shannon (0,313 a 0,382) foram observados. A análise de variância molecular (AMOVA) demostrou que a maior parte da variação está dentro de cada estoque. A identidade e distância genética entre os agrupamentos variou de 0,927 a 0,954 e 0,047 a 0,076, respectivamente, com menor distância entre os agrupamentos OPxPM e JPxRM. A diferenciação genética variou de moderada a alta (Fst = 0,081 a 0,179) e o número de migrantes por geração foi moderado (Nm = 3,83 a 6,24). De forma geral, os estoques apresentaram alta variabilidade genética e moderada/alta diferenciação e distancia g

Genetic characteristics of Tambaqui broodstocks in the state of Rondônia, Brazil: implications on production and conservation / Caracterização genética de estoques de Tambaqui do Estado de Rondônia (Brasil): implicações na produção e na conservação

In recent years, the genetic monitoring of broodstocks in fish farming has been greatly highlighted due to its importance in the management and improvement of their production and conservation. Current study evaluates the genetic diversity of four Tambaqui broodstocks (Colossoma macropomum) in the state of Rondônia (Brazil) and discusses activities towards the species´s correct production management and conservation. Nine primers were employed to analyze 94 specimens from four fish farms in the municipalities of Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP), Presidente Médici (PM) and Rolim de Moura (RM). Differences in the frequency of 38 fragments, with an exclusive fragment in JP and OP, were reported. High polymorphism (52.40 to 64.60%) and Shannon Index (0.313 to 0.382) rates were observed. The analysis of molecular variance (AMOVA) demonstrated that most variation is within each stock. The identity and genetic distance between the groups ranged between 0.927 and 0.954 and between 0.047 and 0.076 respectively, with shortest distance between the OPxPM and JPxRM groups. Genetic differentiation ranged from moderate to high (Fst = 0.081 to 0.179) and the number of migrants per generation was moderate (Nm = 3.83 to 6.24). As a rule, stocks showed high genetic variability and moderate / high differentiation and genetic distance between them. The results allowed direct conservation...

Nos últimos anos, o monitoramento genético de estoques na piscicultura tem recebido grande destaque devido a sua importância no gerenciamento e melhora da sua produção e conservação. Dessa forma, o objetivo deste estudo foi avaliar de forma inédita a diversidade genética de quatro estoques de reprodutores Tambaqui (Colossoma macropomum) do estado de Rondônia (Brasil) e através dela, discutir ações que contribuam com o correto manejo produtivo e conservação dessa espécie. Utilizaram-se nove iniciadores para analisar 94 indivíduos de quatro pisciculturas dos municípios Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP), Presidente Medici (PM) e Rolim de Moura (RM). Foram encontradas diferenças nas frequências de 38 fragmentos, com um fragmento exclusivo em JP e OP. Altos valores de polimorfismo (52,40 a 64,60%) e índice de Shannon (0,313 a 0,382) foram observados. A análise de variância molecular (AMOVA) demostrou que a maior parte da variação está dentro de cada estoque. A identidade e distância genética entre os agrupamentos variou de 0,927 a 0,954 e 0,047 a 0,076, respectivamente, com menor distância entre os agrupamentos OPxPM e JPxRM. A diferenciação genética variou de moderada a alta (Fst = 0,081 a 0,179) e o número de migrantes por geração foi moderado (Nm = 3,83 a 6,24). De forma geral, os estoques apresentaram alta variabilidade genética e moderada/alta diferenciação e distancia...

Genetic characteristics of Tambaqui broodstocks in the state of Rondônia, Brazil: implications on production and conservation / Caracterização genética de estoques de Tambaqui do Estado de Rondônia (Brasil): implicações na produção e na conservação

In recent years, the genetic monitoring of broodstocks in fish farming has been greatly highlighted due to its importance in the management and improvement of their production and conservation. Current study evaluates the genetic diversity of four Tambaqui broodstocks (Colossoma macropomum) in the state of Rondônia (Brazil) and discusses activities towards the species´s correct production management and conservation. Nine primers were employed to analyze 94 specimens from four fish farms in the municipalities of Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP), Presidente Médici (PM) and Rolim de Moura (RM). Differences in the frequency of 38 fragments, with an exclusive fragment in JP and OP, were reported. High polymorphism (52.40 to 64.60%) and Shannon Index (0.313 to 0.382) rates were observed. The analysis of molecular variance (AMOVA) demonstrated that most variation is within each stock. The identity and genetic distance between the groups ranged between 0.927 and 0.954 and between 0.047 and 0.076 respectively, with shortest distance between the OPxPM and JPxRM groups. Genetic differentiation ranged from moderate to high (Fst = 0.081 to 0.179) and the number of migrants per generation was moderate (Nm = 3.83 to 6.24). As a rule, stocks showed high genetic variability and moderate / high differentiation and genetic distance between them. The results allowed direct conservation...(AU)

Nos últimos anos, o monitoramento genético de estoques na piscicultura tem recebido grande destaque devido a sua importância no gerenciamento e melhora da sua produção e conservação. Dessa forma, o objetivo deste estudo foi avaliar de forma inédita a diversidade genética de quatro estoques de reprodutores Tambaqui (Colossoma macropomum) do estado de Rondônia (Brasil) e através dela, discutir ações que contribuam com o correto manejo produtivo e conservação dessa espécie. Utilizaram-se nove iniciadores para analisar 94 indivíduos de quatro pisciculturas dos municípios Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP), Presidente Medici (PM) e Rolim de Moura (RM). Foram encontradas diferenças nas frequências de 38 fragmentos, com um fragmento exclusivo em JP e OP. Altos valores de polimorfismo (52,40 a 64,60%) e índice de Shannon (0,313 a 0,382) foram observados. A análise de variância molecular (AMOVA) demostrou que a maior parte da variação está dentro de cada estoque. A identidade e distância genética entre os agrupamentos variou de 0,927 a 0,954 e 0,047 a 0,076, respectivamente, com menor distância entre os agrupamentos OPxPM e JPxRM. A diferenciação genética variou de moderada a alta (Fst = 0,081 a 0,179) e o número de migrantes por geração foi moderado (Nm = 3,83 a 6,24). De forma geral, os estoques apresentaram alta variabilidade genética e moderada/alta diferenciação e distancia...(AU)

Genética molecular como ferramenta para auxiliar o manejo reprodutivo e a implantação de centros de reprodução de Tambaqui (Colossoma macropomum Cuvier, 1818) no Brasil

ste trabalho avaliou a diversidade genética em populações cultivadas de Tambaqui, um peixe nativo de grande relevância na piscicultura nacional. Nossos resultados evidenciam que a baixa diversidade genética em populações de piscicultura de Tambaqui já vem sendo reportada há pelo menos duas décadas, consequência do processo de domesticação, já que a maioria dos peixes utilizados para fundar o plantel de reprodutores dos centros de reprodução de Tambaqui no Brasil, foram provenientes do estoque do Centro de Pesquisas Ictiológicas Rodolpho von Ihering, DNOCS, Pentecoste, Estado do Ceará, desenvolvido a partir de 74 alevinos capturados no alto Amazonas, Iquitos, Peru, em 1972. Soma-se a essa origem comum, a ausência de manejos genéticos eficientes nos centros de reprodução. Analisamos a influência do repovoamento com indivíduos de centros de reprodução de diferentes regiões do Brasil, aliado a cruzamentos não endogâmicos, sobre a diversidade genética de um centro de reprodução de Tambaqui. Para isso, foram feitas análises comparativas com base em sequências da Região Controle do DNA mitocondrial de espécimes de populações naturais e cativas. Recuperamos apenas dois haplótipos nas três populações do centro de reprodução (97 amostras), enquanto nas populações selvagens (35 amostras), encontramos 31 haplótipos. Um dos haplótipos recuperados nas populações deste centro foi reportado como sendo o único presente em pisciculturas do estado de Rondônia, Piauí, Amapá e Pará. Concluímos que a estratégia de repovoamento, mesmo que aliada a cruzamentos não endogâmicos, não se mostrou eficiente, visto que a diversidade genética continua em níveis críticos nas amostras do centro de reprodução analisado. Levantamos o questionamento sobre a relação dos baixos índices de diversidade genética com a queda na produção desta espécie que vem ocorrendo há pelo menos seis anos em uma média anual aproximada de 6,4 toneladas. Deste modo, é urgente o repovoamento dos centros de reprodução com indivíduos de ambiente natural, especialmente de áreas de hot spots de diversidade e a adoção de manejo genético dos reprodutores, no sentido de renovar e manter melhores índices de variabilidade, garantindo o potencial adaptativo das populações. Por fim, geramos uma cartilha elencando nossos achados de forma didática com o intuito de popularizá-los principalmente entre os produtores, contribuindo desta maneira para a adoção de boas práticas de manejos genéticos reprodutivos nos centros de reprodução de Tambaqui.

This work evaluated the genetic diversity in cultivated populations of Tambaqui, a native fish of great importance in national fish farming. Our results show that the low genetic diversity in fish farming populations in Tambaqui has been reported for at least two decades, a consequence of the domestication process, since most of the fish used to found the breeding stock of the Tambaqui breeding centers in the Brazil, came from the stock of the Centro de Pesquisas Ictiológicas Rodolpho von Ihering, DNOCS, Pentecoste, State of Ceará, developed from 74 fingerlings captured in the upper Amazon, Iquitos, Peru, in 1972. In addition to this common origin, the absence of efficient genetic management in breeding centers. We analyzed the influence of repopulation with individuals from breeding centers in different regions of Brazil, combined with non-inbred crosses, on the genetic diversity of a breeding center in Tambaqui. For this, comparative analyzes were performed based on sequences from the Control Region of mitochondrial DNA from specimens from natural and captive populations. We recovered only two haplotypes in the three populations of the breeding center (97 samples), while in the wild populations (35 samples), we found 31 haplotypes. One of the haplotypes recovered in the populations of this center was reported to be the only one present in fish farms in the states of Rondônia, Piauí, Amapá and Pará. We conclude that the repopulation strategy, even when combined with non-inbred crosses, was not efficient, since the genetic diversity remains at critical levels in the samples from the breeding center analyzed. We raise the question about the relationship of low levels of genetic diversity with the fall in production of this species that has been occurring for at least six years at an approximate annual average of 6.4 tons. In this way, it is urgent to repopulate breeding centers with individuals from the natural environment, especially in areas of hot spots of diversity, and to adopt genetic management of breeding stock, in order to renew and maintain better rates of variability, guaranteeing the adaptive potential of the species. populations. Finally, we generated a booklet listing our findings in a didactic way in order to popularize them mainly among producers, thus contributing to the adoption of good practices of reproductive genetic management in the breeding centers of Tambaqui.

Genetic diversity of pacu and piapara broodstocks in restocking programs in the rivers Paraná and Paranapanema (Brazil) / Diversidade genética de estoques de Pacu e Piapara em programas de repovoamento nos rios Paraná e Paranapanema (Brasil)

The genetic diversity of Piaractus mesopotamicus (pacu) and Leporinus elongatus (piapara) broodstocks used in restocking programs in the rivers Paraná and Paranapanema is analyzed. One hundred and twenty specimens (two broodstocks of each species) from fish ponds in Palotina PR Brazil and in Salto Grande SP Brazil were assessed. Ten primers produced 96 fragments, comprising 68 (70.83%) and 94 (97.92%) polymorphic fragments for P. mesopotamicus and L. elongatus broodstocks, respectively. Differences (p 0.05) in the frequency of 15 and 27 fragments were detected for each species, without exclusive fragments. Shannon Index (0.347 - 0.572) and the percentage of polymorphic fragments (57.3% - 94.8%) revealed high intra-population genetic variability for all broodstocks. Results of molecular variance analyses (AMOVA) showed that most variations do not lie between the broodstocks but within each broodstock (89%). Genetic (0.088 and 0.142) and identity (0.916 and 0.868) distance rates demonstrated similarity between the broodstocks of each species, corroborated by Fst (0.1023 and 010.27) and Nm (4.18 and 4.33) rates, with a slight genetic difference due to genic flux. High intrapopulation genetic variability and similarity between the broodstocks of each species was also detected, proving a common ancestry.

O objetivo da pesquisa foi analisar a diversidade genética de estoques de Pacu (Piaractus mesopotamicus) e Piapara (Leporinus elongatus) utilizados em programas de repovoamento dos rios Paraná e Paranapanema. Foram analisados 120 exemplares (dois estoques de cada espécie) de pisciculturas das cidades de Palotina (Paraná) e da cidade de Salto Grande (São Paulo). Os 10 iniciadores produziram 96 fragmentos, dos quais 68 (70,83%) e 94 (97,92%) foram polimórficos para os estoques de P. mesopotamicus e L. elongatus, respectivamente. Foram observadas diferenças (P 0,05) na frequência de 15 e 27 fragmentos para cada espécie, sem a presença de fragmentos exclusivos. Os valores do índice de Shannon (0,347 a 0,572) e da porcentagem de fragmentos polimórficos (57,3% a 94,8%) mostraram uma alta variabilidade genética intra-populacional para todos os estoques. Os resultados das análises de variância molecular (AMOVA) mostraram que a maior parte da variação está dentro de cada estoque (89%) e não entre os estoques. Os valores da distância (0,088 e 0,142) e identidade (0,916 e 0,868) genética demonstraram que existe similaridade entre os estoques de cada espécie, sendo corroborado pelos valores de Fst (0,1023 e 010,27) e Nm (4,18 e 4,33) que mostraram uma moderada diferenciação genética com presença de fluxo gênico. Foi observada alta variabilidade genética intra-populacional e similarida

Genetic diversity of pacu and piapara broodstocks in restocking programs in the rivers Paraná and Paranapanema (Brazil) / Diversidade genética de estoques de Pacu e Piapara em programas de repovoamento nos rios Paraná e Paranapanema (Brasil)

The genetic diversity of Piaractus mesopotamicus (pacu) and Leporinus elongatus (piapara) broodstocks used in restocking programs in the rivers Paraná and Paranapanema is analyzed. One hundred and twenty specimens (two broodstocks of each species) from fish ponds in Palotina PR Brazil and in Salto Grande SP Brazil were assessed. Ten primers produced 96 fragments, comprising 68 (70.83%) and 94 (97.92%) polymorphic fragments for P. mesopotamicus and L. elongatus broodstocks, respectively. Differences (p 0.05) in the frequency of 15 and 27 fragments were detected for each species, without exclusive fragments. Shannon Index (0.347 - 0.572) and the percentage of polymorphic fragments (57.3% - 94.8%) revealed high intra-population genetic variability for all broodstocks. Results of molecular variance analyses (AMOVA) showed that most variations do not lie between the broodstocks but within each broodstock (89%). Genetic (0.088 and 0.142) and identity (0.916 and 0.868) distance rates demonstrated similarity between the broodstocks of each species, corroborated by Fst (0.1023 and 010.27) and Nm (4.18 and 4.33) rates, with a slight genetic difference due to genic flux. High intrapopulation genetic variability and similarity between the broodstocks of each species was also detected, proving a common ancestry...

O objetivo da pesquisa foi analisar a diversidade genética de estoques de Pacu (Piaractus mesopotamicus) e Piapara (Leporinus elongatus) utilizados em programas de repovoamento dos rios Paraná e Paranapanema. Foram analisados 120 exemplares (dois estoques de cada espécie) de pisciculturas das cidades de Palotina (Paraná) e da cidade de Salto Grande (São Paulo). Os 10 iniciadores produziram 96 fragmentos, dos quais 68 (70,83%) e 94 (97,92%) foram polimórficos para os estoques de P. mesopotamicus e L. elongatus, respectivamente. Foram observadas diferenças (P 0,05) na frequência de 15 e 27 fragmentos para cada espécie, sem a presença de fragmentos exclusivos. Os valores do índice de Shannon (0,347 a 0,572) e da porcentagem de fragmentos polimórficos (57,3% a 94,8%) mostraram uma alta variabilidade genética intra-populacional para todos os estoques. Os resultados das análises de variância molecular (AMOVA) mostraram que a maior parte da variação está dentro de cada estoque (89%) e não entre os estoques. Os valores da distância (0,088 e 0,142) e identidade (0,916 e 0,868) genética demonstraram que existe similaridade entre os estoques de cada espécie, sendo corroborado pelos valores de Fst (0,1023 e 010,27) e Nm (4,18 e 4,33) que mostraram uma moderada diferenciação genética com presença de fluxo gênico. Foi observada alta variabilidade genética intra-populacional e...

Genetic diversity of pacu and piapara broodstocks in restocking programs in the rivers Paraná and Paranapanema (Brazil) / Diversidade genética de estoques de Pacu e Piapara em programas de repovoamento nos rios Paraná e Paranapanema (Brasil)

The genetic diversity of Piaractus mesopotamicus (pacu) and Leporinus elongatus (piapara) broodstocks used in restocking programs in the rivers Paraná and Paranapanema is analyzed. One hundred and twenty specimens (two broodstocks of each species) from fish ponds in Palotina PR Brazil and in Salto Grande SP Brazil were assessed. Ten primers produced 96 fragments, comprising 68 (70.83%) and 94 (97.92%) polymorphic fragments for P. mesopotamicus and L. elongatus broodstocks, respectively. Differences (p 0.05) in the frequency of 15 and 27 fragments were detected for each species, without exclusive fragments. Shannon Index (0.347 - 0.572) and the percentage of polymorphic fragments (57.3% - 94.8%) revealed high intra-population genetic variability for all broodstocks. Results of molecular variance analyses (AMOVA) showed that most variations do not lie between the broodstocks but within each broodstock (89%). Genetic (0.088 and 0.142) and identity (0.916 and 0.868) distance rates demonstrated similarity between the broodstocks of each species, corroborated by Fst (0.1023 and 010.27) and Nm (4.18 and 4.33) rates, with a slight genetic difference due to genic flux. High intrapopulation genetic variability and similarity between the broodstocks of each species was also detected, proving a common ancestry...(AU)

O objetivo da pesquisa foi analisar a diversidade genética de estoques de Pacu (Piaractus mesopotamicus) e Piapara (Leporinus elongatus) utilizados em programas de repovoamento dos rios Paraná e Paranapanema. Foram analisados 120 exemplares (dois estoques de cada espécie) de pisciculturas das cidades de Palotina (Paraná) e da cidade de Salto Grande (São Paulo). Os 10 iniciadores produziram 96 fragmentos, dos quais 68 (70,83%) e 94 (97,92%) foram polimórficos para os estoques de P. mesopotamicus e L. elongatus, respectivamente. Foram observadas diferenças (P 0,05) na frequência de 15 e 27 fragmentos para cada espécie, sem a presença de fragmentos exclusivos. Os valores do índice de Shannon (0,347 a 0,572) e da porcentagem de fragmentos polimórficos (57,3% a 94,8%) mostraram uma alta variabilidade genética intra-populacional para todos os estoques. Os resultados das análises de variância molecular (AMOVA) mostraram que a maior parte da variação está dentro de cada estoque (89%) e não entre os estoques. Os valores da distância (0,088 e 0,142) e identidade (0,916 e 0,868) genética demonstraram que existe similaridade entre os estoques de cada espécie, sendo corroborado pelos valores de Fst (0,1023 e 010,27) e Nm (4,18 e 4,33) que mostraram uma moderada diferenciação genética com presença de fluxo gênico. Foi observada alta variabilidade genética intra-populacional e...(AU)

Genetic monitoring by rapd markers for repopulation programs of Salminus brasiliensis (Pisces, Characiformes) / Monitoramento genético utilizando marcadores RAPD em programas de criação em cativeiro de Dourado

The preservation of the genetic variability of hatchery stocks used to supplement natural populations is a priority. Current study employed RAPD markers to examine the genetic diversity of dourado samples from the middle Paranapanema river and from the broodstock used in the stock enhancement program of the Aquaculture and Hydrobiology Station at the Salto Grande Hydroelectric Power Plant. Nineteen RAPD primers were analyzed, which generated 299 bands and the latter were used for genetic analysis. The percentage of polymorphic fragments was higher in stock captured in the Paranapanema river than from fry stocks. The genetic diversity was lower in the broodstock than in natural population. Amova results showed that most inter-population genetic variation lay within stocks (83.9%) and not between them (16.1%). Moderate genetic differentiation (FST = 0.16) was reported. Nevertheless, differentiation decreased when the four fry stocks were mixed and analyzed as a single population (FST = 0.07). Instead of releasing each lot separately into the water, mixing specimens produced in the various fry stocks before releasing them in the river would be more feasible. The restocked population will have a genetic structure closer to natural populations.

Conservar a variabilidade genética dos estoques de alevinos de peixes para suplementar populações naturais é uma prioridade. O objetivo deste estudo foi examinar a diversidade genética por meio dos marcadores de RAPD de amostras de peixes reprodutores de dourado do médio Paranapanema (população natural) e alevinos usados no programa de repovoamento da estação de aquicultura da UHE de Salto Grande. Foram analisados 19 primers de RAPD, que geraram 299 bandas, as quais foram utilizadas para as análises genéticas. A porcentagem de fragmentos polimórficos foi mais elevada na população natural do que nos estoques. A diversidade genética também foi mais baixa nos alevinos. Os resultados da Amova mostraram que a maior parte de variação genética interpopulacional está dentro dos estoques (83,9%) e não entre eles (16,1%). Foi observada uma diferenciação genética moderada (FST = 0.16). Esta diferenciação diminuiu quando os quatro estoques de alevinos eram misturados e analisados como uma única população (FST = 0.07). Em vez de liberar cada lote separadamente no ambiente, seria melhor misturar todos os indivíduos produzidos nos vários estoques de alevinos antes de liberá-los no rio. Desta maneira, a população reintroduzida terá uma estrutura genética mais perto da população natural.

Genetic monitoring by rapd markers for repopulation programs of Salminus brasiliensis (Pisces, Characiformes) / Monitoramento genético utilizando marcadores RAPD em programas de criação em cativeiro de Dourado

The preservation of the genetic variability of hatchery stocks used to supplement natural populations is a priority. Current study employed RAPD markers to examine the genetic diversity of dourado samples from the middle Paranapanema river and from the broodstock used in the stock enhancement program of the Aquaculture and Hydrobiology Station at the Salto Grande Hydroelectric Power Plant. Nineteen RAPD primers were analyzed, which generated 299 bands and the latter were used for genetic analysis. The percentage of polymorphic fragments was higher in stock captured in the Paranapanema river than from fry stocks. The genetic diversity was lower in the broodstock than in natural population. Amova results showed that most inter-population genetic variation lay within stocks (83.9%) and not between them (16.1%). Moderate genetic differentiation (FST = 0.16) was reported. Nevertheless, differentiation decreased when the four fry stocks were mixed and analyzed as a single population (FST = 0.07). Instead of releasing each lot separately into the water, mixing specimens produced in the various fry stocks before releasing them in the river would be more feasible. The restocked population will have a genetic structure closer to natural populations.(AU) 

Conservar a variabilidade genética dos estoques de alevinos de peixes para suplementar populações naturais é uma prioridade. O objetivo deste estudo foi examinar a diversidade genética por meio dos marcadores de RAPD de amostras de peixes reprodutores de dourado do médio Paranapanema (população natural) e alevinos usados no programa de repovoamento da estação de aquicultura da UHE de Salto Grande. Foram analisados 19 primers de RAPD, que geraram 299 bandas, as quais foram utilizadas para as análises genéticas. A porcentagem de fragmentos polimórficos foi mais elevada na população natural do que nos estoques. A diversidade genética também foi mais baixa nos alevinos. Os resultados da Amova mostraram que a maior parte de variação genética interpopulacional está dentro dos estoques (83,9%) e não entre eles (16,1%). Foi observada uma diferenciação genética moderada (FST = 0.16). Esta diferenciação diminuiu quando os quatro estoques de alevinos eram misturados e analisados como uma única população (FST = 0.07). Em vez de liberar cada lote separadamente no ambiente, seria melhor misturar todos os indivíduos produzidos nos vários estoques de alevinos antes de liberá-los no rio. Desta maneira, a população reintroduzida terá uma estrutura genética mais perto da população natural.(AU)