Resumo
Efficiency of data transformation strategies is evaluated to correct heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies. Four data structures of bovine weaning weights were simulated: herds with and without heterogeneity for means and variances, and herds with and without genetic connectedness. In the genetic evaluations, data were used in the original scale and transformed (Logarithmic, Square root, standardization and ratio by phenotypic standard deviation). The evaluated data transformation strategies were not efficient in eliminating the negative effects of heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies.
Resumo
Efficiency of data transformation strategies is evaluated to correct heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies. Four data structures of bovine weaning weights were simulated: herds with and without heterogeneity for means and variances, and herds with and without genetic connectedness. In the genetic evaluations, data were used in the original scale and transformed (Logarithmic, Square root, standardization and ratio by phenotypic standard deviation). The evaluated data transformation strategies were not efficient in eliminating the negative effects of heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies.
O objetivo deste estudo foi avaliar a eficiência de estratégias de transformação de dados para correção da heterogeneidade entre rebanhos na avaliação genética de touros, vacas e progênies. Quatro estruturas de dados relativos a peso à desmama de bovinos foram simuladas: rebanhos com e sem heterogeneidade para médias e variâncias, e rebanhos com e sem conexidade genética. Nas avaliações genéticas, utilizaram-se dados na escala original e transformados (Logarítmica, Raiz quadrada, Padronização e Razão pelo desvio-padrão fenotípico). As estratégias de transformação de dados avaliadas não foram eficientes para eliminar os efeitos negativos da heterogeneidade entre rebanhos sobre a avaliação genética de touros, vacas e progênies.
Assuntos
Animais , Bovinos , Desmame , Pesos e Medidas , Bovinos/genética , GenômicaResumo
The objective of this work was to evaluate the selective mating using distribution of extremes, among other mating strategies, in its ability to benefit favorable setting alleles and delaying the unfavorable seting alleles, as well as optimize the phenotypic level feature under assisted selection by markers. The genetic simulation system (Genesys) was used to simulate of two genomes (each consisting of a single characteristic with heritability 0,10 and 0,40), and the base and original populations. Each initial population was submitted to assisted selection by markers for ten consecutive generations. For evaluation of mating strategies were estimated averages of the values as a percentage of earnings by fixing favorable alleles, percentage values of losses by setting unfavorable alleles and phenotypic values, in different family sizes, for the two characteristics. In all scenarios that used a combination heritability and family sizes, the selective mating was superior to others, having the ability to increase the setting of favorable alleles and delaying the unfavorable seting alleles. Consequently, phenotypic increments above were obtained. This fact signals major detection of quantitative trait loci in the assisted selection by markers for admiting selective mating, due to gradual decrease of genetic variability over the generations as a result of lower characteristics unfavor
Objetivou-se com este trabalho avaliar o acasalamento seletivo mediante utilização da distribuição dos extremos, entre outras estratégias de acasalamento, na capacidade de beneficiar a fixação de alelos favoráveis e retardar a fixação de alelos desfavoráveis, bem como otimizar o incremento fenotípico da característica sob seleção assistida por marcadores. O sistema de simulação genética (Genesys) foi utilizado para a simulação de dois genomas (cada qual constituído de uma única característica com herdabilidade 0,10 e 0,40), e das populações base e inicial. Cada população inicial foi submetida à seleção assistida por marcadores, por dez gerações consecutivas. Para avaliação das estratégias de acasalamento foram estimadas as médias dos valores percentuais dos ganhos por fixação de alelos favoráveis, dos valores percentuais das perdas por fixação de alelos desfavoráveis e dos valores fenotípicos, em diferentes tamanhos de família, para as duas características. Em todos os cenários em que foram combinados herdabilidade e tamanho de família, o acasalamento seletivo foi superior aos demais, na capacidade de aumentar a fixação de alelos favoráveis e retardar a fixação de alelos desfavoráveis. Consequentemente, incrementos fenotípicos superiores foram obtidos. Este fato sinaliza maior detecção de locos de características quantitativas na seleção assistida por marcadores ao admitir o ac
Resumo
Foram simuladas diferentes estratégias de seleção para estimar o desempenho fenotípico e a endogamia média na seleção assistida por marcadores, em características quantitativas com valores de herdabilidade de 0,10; 0,40 e 0,70. O sistema de simulação genética (Genesys) foi utilizado para a simulação de três genomas (cada qual constituído de uma única característica cuja distinção estava no valor da herdabilidade), e das populações base e inicial. Cada população inicial foi submetida à seleção assistida por marcadores por 20 gerações consecutivas. Avaliaram-se estratégias de acasalamento entre os genitores selecionados, em diferentes intensidades de seleção (tamanhos populacionais), por meio do acasalamento seletivo entre os melhores e os piores, acasalamento apenas entre os melhores e/ou entre os piores e acasalamento aleatório. Em todos os cenários combinando herdabilidade e intensidade, o acasalamento estratégico utilizando a metodologia da genotipagem seletiva foi superior aos demais, tornando-se mais eficaz na detecção de QTL e, consequentemente, no incremento do valor fenotípico e na minimização das médias endogâmicas ao longo das gerações. Ao utilizar a estratégia seletiva de amostragem, menor tamanho populacional é requerido para otimizar a detecção de QTL à medida que o valor da herdabilidade da característica aumenta.(AU)
Different strategies of selection were simulated to estimate the phenotypic performance and average inbreeding in selection assisted by markers, for quantitative traits with heritability values of 0.10, 0.40, and 0.70. The genetic simulation system (Genesys) was used for the simulation of three genomes (each one consisting of a single characteristic which distinction was the value of heritability) and base and original populations. Each initial population was subjected to selection assisted by markers for 20 consecutive generations. Strategies of mating between the parents selected in different intensities of selection (population size) were evaluated by selective mating between the best and worst, mating only among the best and/or among the worst and random mating. In all scenarios combining heritability and intensity, the strategic mating using the methodology of selective genotyping was superior to the others, becoming more effective in detecting QTL and, consequently, in the increase of phenotypic value and in the minimization of the inbred average over the generations. By using the selective sampling strategy, smaller population size to optimize the detection of QTL is required, since the value of the heritability of the characteristic increases.(AU)
Assuntos
Animais , Mapeamento Cromossômico/métodos , Fenômenos Genéticos , Seleção Genética , Ligação do ParResumo
In order to study the effects of heterogeneity on bovine genetic evaluation, several structures of data were simulated with heterogeneity for different parameters, with and without genetic connexity among herds. The Genesys software was used to generate the data and the MTDFREML metodology was employed to analyze this data. The lowest values of the rank correlations (Spearman correlation) were obtained for the data structure of herds with heterogeneity for all parameters. For the structures of data with similar genetic means and heterogeneity for others parameters, the correlations between breeding values were greater than 70% and near those obtained for data without heterogeneity, which indicates that the heterogeneity for variances and phenotypic mean has little effect on genetic evaluation. The high genetic connexity of data improved the prediction of breeding values of bulls, but this effect was not noted for progenies and, mainly, the genetic evaluation of cows. The rank correlations based on predictions from single and multiple traits analysis were very similar, indicating that the multiple trait analysis was not efficient in eliminating the problems of genetic means heterogeneity.
Para estudar os efeitos de heterogeneidade sobre a avaliação genética de bovinos, foram simuladas várias estruturas de dados com heterogeneidade para diferentes parâmetros, com e sem conexidade genética entre rebanhos. O software Genesys foi usado para gerar os dados e a metodologia MTDFREML para analisar estes dados. Os valores mais baixos de correlações de ordem (correlação de Spearman) entre valores genéticos verdadeiros e preditos foram obtidos para a estrutura de dados em que os rebanhos apresentavam heterogeneidade para todos os parâmetros. Para as estruturas de dados com médias genéticas similares e heterogeneidade para outros parâmetros, as correlações entre valores genéticos foram superiores a 70% e próximas às obtidas para dados sem heterogeneidade, indicando que a heterogeneidade para variâncias e média fenotípica tem pequeno efeito sobre a avaliação genética. A alta conexidade genética dos dados melhorou a predição dos valores genéticos de touros, mas este efeito não foi notado na avaliação genética das progênies e, principalmente, das vacas. As correlações de ordem calculadas com base nas predições das análises de característica única e de características múltiplas foram muito semelhantes, indicando que a análise de características múltiplas não foi eficiente para eliminar os problemas de heterogeneidade para média genética.
Resumo
Determinou-se o número adequado de repetições na comparação de métodos de seleção tradicionais e associados a marcadores moleculares, com diferentes tamanhos efetivos e sob diferentes sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados, usando simulação com o programa GENESYS. Para comparar os diferentes métodos de seleção utilizaram-se populações com tamanhos efetivos de 18,18 (TE1) e de 66,66 (TE2) e uma, 10 e 30 repetições por geração, avaliando-se os valores fenotípicos médios. Para as situações com apenas uma repetição, os resultados apresentaram incoerências, independentemente do tamanho efetivo (TE1 ou TE2) ou do sistema de acasalamento (RAA - reprodutores acasalados aleatoriamente, EIC - exclusão de irmãos completos ou EICMI - exclusão de irmãos completos e meio-irmãos). Observou-se que a oscilação genética influencia o ganho genético, principalmente, em populações com pequeno tamanho efetivo e que um valor mínimo de 10 repetições por geração é necessário para assegurar a consistência dos resultados obtidos pelos métodos de seleção.(AU)
This work was carried out to determine the required number of replicates for comparison of conventional and molecular marker-associated selection methods in distinct effective population sizes and different mating systems, by simulations using the software GENESYS. Effective populational size of 18.18 (ES1) and 66.66 (ES2), and one, 10, and 30 replicates per generation were used to compare the different selection methods, based on mean phenotypic values. Incongruences results were observed when a single replicate was considered independently of effective size (ES1or ES2) and the mating system (random mating; exclusion of full-sibs or exclusion of both full and half-sibs). Genetic oscillation influenced the genetic gain, mainly in populations of small effective size. Furthermore, at least 10 replicates per generation were required to obtain sound consistent results for both selection methods.(AU)
Assuntos
Deriva Genética , Ligação do Par , Grupos Populacionais/estatística & dados numéricosResumo
Foram utilizados diferentes níveis de significância genômica na seleção assistida por marcadores para estimar a endogamia média e o limite de seleção, assim como os valores fenotípicos, em características quantitativas de baixa, média e alta herdabilidade. Uma comparação entre os níveis de 1 por cento, 5 por cento, 10 por cento e 20 por cento foi realizada por meio do sistema computacional de simulação genética (GENESYS), utilizado para a simulação de três genomas (cada qual constituído de um único caráter de baixa, média ou alta herdabilidade), e das populações base e inicial. Os resultados indicaram superioridade dos níveis de significância de maior magnitude (10 por cento e 20 por cento) com relação aos valores fenotípicos, resultante de menor média endogâmica, além de menor limite de seleção ao longo das gerações sob seleção para estes níveis. Estes resultados foram observados para todas as três características, embora de forma mais expressiva para o caráter de baixa herdabilidade. Assim, apesar de os níveis de 1 por cento e 5 por cento apresentarem maior precisão na detecção de marcadores ligados a quantitative trait loci (QTL), eles conduzem a maiores médias endogâmicas e limite de seleção, propiciando ganhos fenotípicos menores.(AU)
Different levels of genomic significance were used in the selection assisted by molecular markers to estimate the medium endogamy and the selection limit, as well as the phenotypic value, for quantitative traits of low, medium, and high heritability. A comparison among the levels of genomic significance of 1 percent, 5 percent, 10 percent, and 20 percent was accomplished by a computer system of genetic simulation (GENESYS), used to simulate three genomes, each of them constituted by only one character of low, medium and high heritability, and to simulate the base and the initial populations. The results suggest superiority of higher significance levels (10 percent and 20 percent) for all phenotypic values, as a consequence of lower endogamy, and lower selection limit for low, medium, and high heritability traits, but in more expressive way for low heritability trait. Although the significant levels of 1 percent and 5 percent for molecular marker assisted selection showed a high precision in detecting markers related to a quantitative trait loci (QTLs), they lead to higher endogamy and selection limits, resulting in low phenotypic gains.(AU)
Assuntos
Endogamia , Seleção Genética , Marcadores Genéticos , Exercício de Simulação/métodos , Locos de Características Quantitativas , Padrões de HerançaResumo
Utilizou-se o programa GENESYS para simular rebanhos de gado de corte selecionados, durante cinco gerações, por meio da seleção individual ou seleção com base no melhor preditor linear não-viesado (BLUP). Foram comparados os valores fenotípicos médios e a endogamia média, resultantes da aplicação desses métodos. A característica quantitativa simulada foi o ganho de peso diário, com fenótipo médio inicial de 1kg e herdabilidade de 0,35. Os valores da razão sexual nas populações de seleção foram de 1:50 e 1:25 (macho: fêmeas), correspondendo aos tamanhos efetivos da população de 23,53 e 57,69 animais, respectivamente. Os ganhos genéticos individuais foram maiores para a seleção baseada no BLUP, atribuídos à sua mais alta acurácia na predição dos valores genéticos. Considerando-se cada método de seleção, não houve diferenças significativas entre os dois tamanhos efetivos quanto aos valores fenotípicos médios por geração. A endogamia média aumentou em ambos os métodos de seleção e tamanhos efetivos. Maior aumento e oscilação nos valores ocorreram para a seleção baseada no BLUP no menor tamanho. Embora a seleção tenha sido realizada por pequeno número de gerações, os resultados permitiam discriminar as combinações que proporcionaram maior incremento de endogamia.(AU)
The program GENESYS was utilized to simulate herds of beef cattle selected, for five generations, by individual selection or selection based on best linear unbiased prediction (BLUP). Average phenotypic values and inbreeding average of simulated animals from these methods were compared. The simulated quantitative trait was daily weight gain with average initial phenotypic value of 1kg and heritability of .35. The values of sexual ratio in the selection populations were 1:50 and 1:25 (male: females), corresponding to effective population sizes of 23.53 and 57.69 animals, respectively. The individual genetic gains were larger for animals under BLUP selection as a result of higher accuracy of the predicted genetic values. No significant difference between the effective population sizes for average phenotypic values by generation within each selection method was found. The inbreeding coefficient increased within both selection methods and effective sizes. Larger increase and oscillation were observed for selection based on BLUP in the population with smaller effective size. Although a short term selection program was simulated, the results allowed to discriminate combinations which resulted in larger inbreeding increment.(AU)
Assuntos
Simulação por Computador , Aumento de Peso/genética , Hereditariedade/genética , Bases de Dados Genéticas , Endogamia , BovinosResumo
Efficiency of data transformation strategies is evaluated to correct heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies. Four data structures of bovine weaning weights were simulated: herds with and without heterogeneity for means and variances, and herds with and without genetic connectedness. In the genetic evaluations, data were used in the original scale and transformed (Logarithmic, Square root, standardization and ratio by phenotypic standard deviation). The evaluated data transformation strategies were not efficient in eliminating the negative effects of heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies.
Resumo
Com o objetivo de estudar alguns fatores que influenciam a seleção em longo prazo, foram utilizados dados simulados pelo programa GENESYS, considerando: duas herdabilidades, dois tamanhos de população, três níveis de repetição e 20 gerações, para acasalamento ao acaso, seleção individual e BLUP. Para os dois tamanhos de população estudados e herdabilidade baixa (h2 = 0,10), a seleção pelo BLUP apresentou maior resposta à seleção. A resposta pela seleção individual em populações maiores foi similar à do BLUP em populações menores. Observou-se que a oscilação genética foi maior para as populações submetidas à seleção pelo BLUP. Isso foi mais evidente para as populações de menor tamanho e característica de baixa herdabilidade, devido à maior taxa de endogamia e percentagem de alelos desfavoráveis fixados (AU)
The factors affecting long term selection results were studied in simulated data by GENESYS program, considering two heritability values, two population sizes, 20 generations and three levels of replications in three different populations: random mating, individual selection and BLUP selection. For the two sizes of populations studied and low heritability trait (h2 = 0.10), BLUP selection showed greater selection response. Selection response for individual selection considering large population size was similar to BLUP selection response for small population size. Genetic drift was greater for populations on BLUP selection. These results were more evident for small population size and low heritability traits due to the higher inbreeding rate and the percentage of unfavorably fixation.(AU)
Assuntos
Genética , Endogamia , Seleção Genética , Exercício de SimulaçãoResumo
In order to study the effects of heterogeneity on bovine genetic evaluation, several structures of data were simulated with heterogeneity for different parameters, with and without genetic connexity among herds. The Genesys software was used to generate the data and the MTDFREML metodology was employed to analyze this data. The lowest values of the rank correlations (Spearman correlation) were obtained for the data structure of herds with heterogeneity for all parameters. For the structures of data with similar genetic means and heterogeneity for others parameters, the correlations between breeding values were greater than 70% and near those obtained for data without heterogeneity, which indicates that the heterogeneity for variances and phenotypic mean has little effect on genetic evaluation. The high genetic connexity of data improved the prediction of breeding values of bulls, but this effect was not noted for progenies and, mainly, the genetic evaluation of cows. The rank correlations based on predictions from single and multiple traits analysis were very similar, indicating that the multiple trait analysis was not efficient in eliminating the problems of genetic means heterogeneity.
Para estudar os efeitos de heterogeneidade sobre a avaliação genética de bovinos, foram simuladas várias estruturas de dados com heterogeneidade para diferentes parâmetros, com e sem conexidade genética entre rebanhos. O software Genesys foi usado para gerar os dados e a metodologia MTDFREML para analisar estes dados. Os valores mais baixos de correlações de ordem (correlação de Spearman) entre valores genéticos verdadeiros e preditos foram obtidos para a estrutura de dados em que os rebanhos apresentavam heterogeneidade para todos os parâmetros. Para as estruturas de dados com médias genéticas similares e heterogeneidade para outros parâmetros, as correlações entre valores genéticos foram superiores a 70% e próximas às obtidas para dados sem heterogeneidade, indicando que a heterogeneidade para variâncias e média fenotípica tem pequeno efeito sobre a avaliação genética. A alta conexidade genética dos dados melhorou a predição dos valores genéticos de touros, mas este efeito não foi notado na avaliação genética das progênies e, principalmente, das vacas. As correlações de ordem calculadas com base nas predições das análises de característica única e de características múltiplas foram muito semelhantes, indicando que a análise de características múltiplas não foi eficiente para eliminar os problemas de heterogeneidade para média genética.
Resumo
The objective of this work was to evaluate the selective mating using distribution of extremes, among other mating strategies, in its ability to benefit favorable setting alleles and delaying the unfavorable seting alleles, as well as optimize the phenotypic level feature under assisted selection by markers. The genetic simulation system (Genesys) was used to simulate of two genomes (each consisting of a single characteristic with heritability 0,10 and 0,40), and the base and original populations. Each initial population was submitted to assisted selection by markers for ten consecutive generations. For evaluation of mating strategies were estimated averages of the values as a percentage of earnings by fixing favorable alleles, percentage values of losses by setting unfavorable alleles and phenotypic values, in different family sizes, for the two characteristics. In all scenarios that used a combination heritability and family sizes, the selective mating was superior to others, having the ability to increase the setting of favorable alleles and delaying the unfavorable seting alleles. Consequently, phenotypic increments above were obtained. This fact signals major detection of quantitative trait loci in the assisted selection by markers for admiting selective mating, due to gradual decrease of genetic variability over the generations as a result of lower characteristics unfavor
Objetivou-se com este trabalho avaliar o acasalamento seletivo mediante utilização da distribuição dos extremos, entre outras estratégias de acasalamento, na capacidade de beneficiar a fixação de alelos favoráveis e retardar a fixação de alelos desfavoráveis, bem como otimizar o incremento fenotípico da característica sob seleção assistida por marcadores. O sistema de simulação genética (Genesys) foi utilizado para a simulação de dois genomas (cada qual constituído de uma única característica com herdabilidade 0,10 e 0,40), e das populações base e inicial. Cada população inicial foi submetida à seleção assistida por marcadores, por dez gerações consecutivas. Para avaliação das estratégias de acasalamento foram estimadas as médias dos valores percentuais dos ganhos por fixação de alelos favoráveis, dos valores percentuais das perdas por fixação de alelos desfavoráveis e dos valores fenotípicos, em diferentes tamanhos de família, para as duas características. Em todos os cenários em que foram combinados herdabilidade e tamanho de família, o acasalamento seletivo foi superior aos demais, na capacidade de aumentar a fixação de alelos favoráveis e retardar a fixação de alelos desfavoráveis. Consequentemente, incrementos fenotípicos superiores foram obtidos. Este fato sinaliza maior detecção de locos de características quantitativas na seleção assistida por marcadores ao admitir o ac
Resumo
Este trabalho objetivou testar se a distribuição normal de probabilidade representa adequadamente a distribuição dos dados de parâmetros avaliados nas características de interesse econômico, em populações sob seleção. Para tal, foi simulado por meio do programa GENESYS 2004, um genoma suíno, com duas características, uma de baixa (h2 0,15) e outra de alta (h2 0,60) herdabilidade, B e A, respectivamente. Após a simulação de uma população base, foi construída uma população inicial, onde se iniciou o processo seletivo com os diversos métodos de seleção em estudo: individual (IND), por meio do BLUP (BLUP) e assistida por gene candidato (CAS). Foram realizados os Testes de Lilliefors e Kolmogorov-Smirnov a fim de verificar a normalidade dos dados para os valores fenotípicos e para os valores genotípicos. Além destes, foram realizados estudos suplementares, visando comparar os ganhos genéticos observados aos ganhos genéticos esperados calculados nas amostras. Para as duas características estudadas (baixa e alta herdabilidade), os parâmetros populacionais observados foram semelhantes. As médias observadas aumentaram com o passar das gerações, sendo o BLUP o que apresentou os maiores valores e a CAS os menores valores. O coeficiente de endogamia aumentou com o passar das gerações. A seleção assistida por genes candidatos foi o método que apresentou os maiores valores de endogamia. A IND apresentou menor queda nas variâncias observadas e maior limite de seleção ao final do processo seletivo. Os três métodos de seleção estudados não influenciaram os parâmetros descritos. As estatísticas dos testes realizados apresentaram-se não significativos para os valores fenotípicos da característica B (baixa herdabilidade), independente do método de seleção. Exceção foi observada para a repetição número 5 da 20ª geração, na população submetida à seleção pelo BLUP. Semelhante ao ocorrido para a característica B; os testes estatísticos realizados para a característica A, apresentaram-se na maioria não significativos. Para os valores genotípicos da característica B, observou-se significância nos Testes de Lilliefors e Kolmogorov-Smirnov para algumas repetições dentro das gerações amostradas e para todas as repetições dentro das gerações amostradas, respectivamente. O mesmo foi observado para a característica A. Os tipos de métodos de seleção aplicados nas populações não influenciaram nas soluções dos testes. No estudo suplementar visando comparar os ganhos genéticos observados aos ganhos genéticos esperados, observou-se que aqueles apresentaram valores muito diferentes destes, apesar da distribuição de probabilidade dos dados avaliados, em sua maioria, seguirem a distribuição normal. Para IND e BLUP, todos ganhos genéticos observados foram maiores que os ganhos genéticos esperado. Já, para CAS, em algumas amostras o ganho genético observado foi superior e, em outras não. Concluímos assim, neste trabalho, que: os resultados apresentados pelos Testes de Lilliefors e Kolmogorv-Smirnov, concordam com a suposição de que a distribuição de probabilidade dos dados paramétricos é a normal e os ganhos genéticos observados ou reais são maiores que os ganhos genéticos esperados quando se utilizam os métodos de seleção individual e seleção pelo BLUP
Resumo
Este trabalho objetivou testar se a distribuição normal de probabilidade representa adequadamente a distribuição dos dados de parâmetros avaliados nas características de interesse econômico, em populações sob seleção. Para tal, foi simulado por meio do programa GENESYS 2004, um genoma suíno, com duas características, uma de baixa (h2 0,15) e outra de alta (h2 0,60) herdabilidade, B e A, respectivamente. Após a simulação de uma população base, foi construída uma população inicial, onde se iniciou o processo seletivo com os diversos métodos de seleção em estudo: individual (IND), por meio do BLUP (BLUP) e assistida por gene candidato (CAS). Foram realizados os Testes de Lilliefors e Kolmogorov-Smirnov a fim de verificar a normalidade dos dados para os valores fenotípicos e para os valores genotípicos. Além destes, foram realizados estudos suplementares, visando comparar os ganhos genéticos observados aos ganhos genéticos esperados calculados nas amostras. Para as duas características estudadas (baixa e alta herdabilidade), os parâmetros populacionais observados foram semelhantes. As médias observadas aumentaram com o passar das gerações, sendo o BLUP o que apresentou os maiores valores e a CAS os menores valores. O coeficiente de endogamia aumentou com o passar das gerações. A seleção assistida por genes candidatos foi o método que apresentou os maiores valores de endogamia. A IND apresentou menor queda nas variâncias observadas e maior limite de seleção ao final do processo seletivo. Os três métodos de seleção estudados não influenciaram os parâmetros descritos. As estatísticas dos testes realizados apresentaram-se não significativos para os valores fenotípicos da característica B (baixa herdabilidade), independente do método de seleção. Exceção foi observada para a repetição número 5 da 20ª geração, na população submetida à seleção pelo BLUP. Semelhante ao ocorrido para a característica B; os testes estatísticos realizados para a característica A, apresentaram-se na maioria não significativos. Para os valores genotípicos da característica B, observou-se significância nos Testes de Lilliefors e Kolmogorov-Smirnov para algumas repetições dentro das gerações amostradas e para todas as repetições dentro das gerações amostradas, respectivamente. O mesmo foi observado para a característica A. Os tipos de métodos de seleção aplicados nas populações não influenciaram nas soluções dos testes. No estudo suplementar visando comparar os ganhos genéticos observados aos ganhos genéticos esperados, observou-se que aqueles apresentaram valores muito diferentes destes, apesar da distribuição de probabilidade dos dados avaliados, em sua maioria, seguirem a distribuição normal. Para IND e BLUP, todos ganhos genéticos observados foram maiores que os ganhos genéticos esperado. Já, para CAS, em algumas amostras o ganho genético observado foi superior e, em outras não. Concluímos assim, neste trabalho, que: os resultados apresentados pelos Testes de Lilliefors e Kolmogorv-Smirnov, concordam com a suposição de que a distribuição de probabilidade dos dados paramétricos é a normal e os ganhos genéticos observados ou reais são maiores que os ganhos genéticos esperados quando se utilizam os métodos de seleção individual e seleção pelo BLUP
Resumo
Com o objetivo de avaliar o efeito de quatro tamanhos efetivos e quatro tipos de acasalamento sobre o coeficiente de endogamia, em curto, médio e longo prazos, foram utilizados dados simulados por meio do programa GENESYS (EUCLYDES, 1996). A partir de um genoma constituído por 30 pares de cromossomos autossômicos, com 400 loci quantitativos e dialélicos, e permitindo apenas efeitos aditivos de genes, simulou-se duas populações-base, com característica quantitativa de herdabilidade 0,10 e 0,50. Com essas populações foram obtidas duas populações iniciais, que deram origem às populações de seleção, nas quais os indivíduos escolhidos foram acasalados, em todas as gerações, segundo um dos tipos de acasalamento: reprodutores acasalados aleatoriamente (RAA), exclusão de acasalamentos entre irmãos completos e meio-irmãos (EICMI), melhores machos com melhores fêmeas (MMMF) e acasalamento compensatório (AC). As populações foram selecionadas com base na seleção individual (S.I.) e na melhor predição linear não-viesada (BLUP) do valor genético e tiveram a seguinte estrutura de dados: valores de razão sexual (d): 3, para os quais foram selecionados, por geração, os seguintes números de machos (Nm): 10, 20, 40 e 80 e o de fêmeas (Nf): 30, 60, 120 e 240, respectivamente. Esses valores originaram, respectivamente, os tamanhos efetivos de população (Ne): TE1=30,00; TE2=60,00; TE3=120,00; e TE4=240,00, bem como as intensidades de seleção dos machos im=1,51 e das fêmeas de if=0,80.. Cada casal produziu quatro descendentes, totalizando 120, 240, 480 e 960 indivíduos por geração, respectivamente. A seleção foi conduzida por 30 gerações consecutivas, com 20 repetições por geração, para reduzir os efeitos de flutuação gênica. Os parâmetros genéticos avaliados em todas as populações, ao longo das gerações, foram: coeficiente de endogamia média; valores fenotípicos médios e eficiência do BLUP. Concluiu-se que. O BLUP foi o método de seleção que levou a maiores ganhos genéticos sendo também o que apresentou os maiores coeficientes de endogamia média para todas combinações de tamanhos efetivos, métodos de seleção e herdabilidades até 30 gerações de seleção. A eficiência do BLUP, em relação a seleção individual, foi maior até a quinta e décima gerações de seleção, principalmente na herdabilidade baixa (h²=0,10). A herdabilidade foi o fator mais importante para a diferenciação da seleção individual, quanto ao valor fenotípico médio, em maiores valores na herdabilidade alta (h²=0,50) e menores valores na herdabilidade baixa (h²=0,10). O tamanho efetivo da população foi o fator que mais influenciou o coeficiente de endogamia, onde, os incrementos de endogamia diminuiram a medida que o tamanho aumentou, atingido valores mínimos nas populações de tamanho efetivo Ne=240, após 30 gerações de seleção. O sistema de acasalamento de melhores machos com melhores fêmeas classificadas (MMMF) foi o que proporcionou maiores valores de endogamia média, ao final de trinta gerações de seleção pelo BLUP, seguido do sistema de reprodutores acasalados aleatoriamente (RAA) e logo após pelo sistema que exclui o acasalamento entre irmãos completos e meio-irmãos (EICMI). O sistema de acasalamento compensatório (AC) foi o que se mostrou mais eficiente em diminuir o coeficiente de endogamia média, principalmente utilizando a metodologia do BLUP na característica de alta herdabilidade (h²=0,50), apresentando pequena diminuição no valor fenotípico médio em relação aos outros sistemas de acasa