Genetic parameters and genetic trends for production traits in dairy Gir cattle / Parâmetros genéticos e tendências genéticas de características de produção de bovinos Gir Leiteiro

The objective of this research was to estimate genetic parameters and genetic trends (GT) for 305-day milk yield (MY305) and 305-day fat yield (FY305) of purebred Dairy Gir animals of the National Dairy Gir Breeding Program. The restricted maximum likelihood method was used in an animal model. GT were obtained via linear regression and divided into two periods (1935-1992 and 1993-2013 for PL305; 1935-1992 and 1993-2010 for MY305). The estimated heritabilities were 0.23 (MY305) and 0.10 (FY305). The GT (kg/year) values for MY305 in the 2nd period for measured females (25.49), females (26.11), and males (35.13) were higher than those found in the 1st period (2.52; 2.06, and 1.00, respectively). The heritability estimated for MY305 confirmed the possibility of genetic improvement by selection and indicated a lower additive genetic effect on FY305 of purebred animals. The genetic progress for MY305 in all purebred population is denoted by the more expressive gains found from 1990's, when the first bull catalogs were published.

Objetivou-se estimar os parâmetros genéticos e tendências genéticas (GT) para produção de leite (MY305) e produção de gordura (FY305), ambas em 305 dias, de animais puros Gir Leiteiro, integrantes do Programa Nacional de Melhoramento do Gir Leiteiro. Foi utilizada a metodologia da máxima verossimilhança restrita em modelo animal. As GT foram obtidas via regressão linear e divididas em dois períodos (1935-1992 e 1993-2013 para PL305; 1935-1992 e 1993-2010 para MY305). As herdabilidades foram de 0,23 (MY305) e 0,10 (FY305). Para PL305, as GT (kg/ano) do 2º período para fêmeas mensuradas (25,49), fêmeas (26,11) e, machos (35,13) foram claramente superiores às do 1º período (2,52; 2,06 e 1,00; respectivamente). A estimativa de herdabilidade para MY305 reafirma ser possível melhoramento genético por meio de seleção, enquanto para FY305 sugere uma menor influência genética aditiva em animais puros. O progresso genético para MY305 em toda a população pura está evidenciado pelos ganhos mais expressivos, observados a partir da década de 90, quando foram divulgados os primeiros sumários de touros.

Seleção de touros para reprodução baseada no fenótipo e DEPs / Selection of bulls for reproduction based on EPD and phenotype

A fertilidade pode ser definida como a capacidade de gerar filhos normais, o que é essencial para o progresso genético, desde que os ascendentes tenham capacidade de transmitir características que venham impactar positivamente os índices zootécnicos e econômicos. Apesar do aumento expressivo do uso de biotécnicas reprodutivas, a maior parte das fêmeas bovinas aptas à reprodução no Brasil ainda são acasaladas por meio da monta natural. Torna-se importante então, não somente, a estimativa da saúde reprodutiva do touro, mas também a avaliação da sua qualidade genética que pode ser feita, por exemplo, pelo acesso os índices dos reprodutores nos diversos programas de melhoramento genético nacional ou pela utilização de escores de avaliação visual.(AU)

Fertility can be defined as the ability to generate normal descendants, which is essential for genetic progress, as long as the ancestors have the ability to transmit characteristics that will positively impact zootechnical and economic indices. Despite the significant increase in the use of reproduction biotechniques, most bovine females capable of reproduction in Brazil are still mated through natural mating. Therefore, it becomes important not only to estimate the reproductive health of the bull, but also to evaluate its genetic quality, which can be done, for example, by accessing the indices of the bulls in the various national genetic improvement programs or by using visual assessment scores.(AU)

Biobanks, offspring fitness and the influence of developmental plasticity in conservation biology

Mitigation of the widely known threats to the world's biodiversity is difficult, despite the strategies and actions proposed by international agreements such as the United Nations Framework Convention on Climate Change (UNFCCC) and the Convention on Biological Diversity (CBD). Nevertheless, many scientists devote their time and effort to finding and implementing various solutions to the problem. One potential way forward that is gaining popularity involves the establishment of biobank programs aimed at preserving and storing germplasm from threatened species, and then using it to support the future viability and health of threatened populations. This involves developing and using assisted reproductive technologies to achieve their goals. Despite considerable advances in the effectiveness of reproductive technologies, differences between the reproductive behavior and physiology of widely differing taxonomic groups mean that this approach cannot be applied with equal success to many species. Moreover, evidence that epigenetic influences and developmental plasticity, whereby it is now understood that embryonic development, and subsequent health in later life, can be affected by peri-conceptional environmental conditions, is raising the possibility that cryopreservation methods themselves may have to be reviewed and revised when planning the biobanks. Here, I describe the benefits and problems associated with germplasm biobanking across various species, but also offer some realistic assessments of current progress and applications.(AU)

Lesão na região metacarpiana do membro torácico esquerdo de bezerra Gir decorrente de contenção para pesagem / Injury in the metacarpinal region of the left thoracic limbs resulting from retention for weighing in a Gir calf

Fraturas ósseas e luxações são mais comuns em animais jovens e, na maioria das vezes, essas fraturas ocorrem devido ao manejo incorreto desses animais, podendo levar a uma queda de produção a curto ou longo prazo, gerando perdas econômicas e produtivas de animais de alto padrão genético. Nesse contexto, o objetivo deste trabalho foi relatar a ocorrência de uma fratura na região metacarpiana do membro torácico esquerdo de uma bezerra Gir de 12 dias de idade, causada por uma contenção ineficaz durante a pesagem. O animal proveniente de uma fazenda em Umirim/CE foi encaminhado ao Hospital Veterinário de Grandes Animais do Centro Universitário INTA em Sobral/CE. Ao passar pelo exame radiográfico, foi constatada a fratura na região metacarpiana do membro torácico esquerdo. O animal foi imobilizado de forma manual, seguindo-se métodos semiológicos para minimizar o estresse. Para a imobilização do membro, foi utilizada a muleta de Thomas modificada e bandagens, associadas ao controle da dor com as drogas Flunixin meglumine (1,1mg/kg) e Fenilbutazona (4,4mg/kg). Depois da imobilização, o animal seguiu internado no HOVET-GA e, após 18 dias, foi realizada uma nova radiografia para ver o progresso a partir do tratamento adotado. Constatou-se a formação de um calo ósseo, com a ossificação da fratura, não sendo necessário o encaminhamento cirúrgico do animal. Assim, o tratamento com muleta de Thomas modificada foi efetivo para a recuperação do membro fraturado, além de ser um tratamento de baixo custo e fácil aplicação, tendo o animal apresentado uma boa resposta ao tratamento terapêutico para controle da dor.

Bone fractures and dislocations are more common in young animals and mostly occur due to incorrect handling of these animals, which can lead to a short or long-term drop in production, generating economic and productive losses of animals of high genetic standard. This study aimed to report the occurrence of a fracture in the metacarpal region of the left thoracic limb of a 12-day-old Gir heifer, caused by an ineffective restraint during weighing. The animal from a farm in Umirim/CE was sent to the Veterinary Hospital of Large Animals of the University Center INTA in Sobral/CE. The radiographic examination found a fracture in the metacarpal region of the left thoracic limb. The animal was manually immobilized following semiological methods to minimize stress. For the limb immobilization, a modified Thomas crutch and bandages associated with pain control with the drugs Flunixin meglumine (1.1mg/kg) and Phenylbutazone (4.4mg/kg) were used. After immobilization, the animal remained hospitalized at HOVET-GA and after 18 days a new radiograph was performed to evaluate the progress achieved with the treatment adopted. It was found the formation of a bone callus with the ossification of the fracture, not requiring the surgical referral of the animal. Thus, the treatment with the modified Thomas crutch was effective for the recovery of the fractured limb, in addition to being a low-cost and easy-to-apply treatment. The animal showed a good response to the therapeutic treatment for pain control.

Avanços na andrologia de animais selvagens / Advances in wild animal andrology

As tecnologias de reprodução assistida (TRA) são de fundamental importância para a conexão de indivíduos em diferentes localidades, facilitando assim o intercâmbio genético e favorecendo a variabilidade genética de uma espécie. Por esta razão, as TRAS podem ser ferramentas importantes para a conservação de espécies ameaçadas de extinção. Apesar dos esforços nas últimas décadas, o avanço no desenvolvimento de tais tecnologias está aquém à urgência de reverter processos de baixa variabilidade genética em algumas espécies. A necessidade de refinamento das técnicas para as particularidades fisiológicas e comportamentais de cada espécie, somada à raridade de acesso aos animais são os principais fatores relacionados as dificuldades em se avançar com as TRAS. As técnicas mais recentes desenvolvidas para a recuperação de espermatozoides em animais selvagens são a colheita farmacológica, com uso de alfa-2-agonistas e a criopreservação / vitrificação testicular com posterior cultivo. Pouco de avançou, no entanto, em relação aos métodos de criopreservação, prevalecendo associação clássica de TRIS-gema-glicerol. Discutimos, então os métodos usados para acesso ao gameta masculino em espécies selvagens e suas aplicações na conservação animal.(AU)

Assisted reproduction technologies (ART) are of fundamental importance for connecting individuals in different locations, thus facilitating genetic exchange and favoring the genetic variability of a species. For this reason, TRAS can be important tools for the conservation of endangered species. Despite efforts in recent decades, the advance in the development of such technologies is short of the urgency of reversing processes of low genetic variability in some species. The need to refine the techniques for the physiological and behavioral particularities of each species, added to the rarity of access to animals, are the main factors related to the difficulties in advancing with TRAS. The most recent techniques developed for sperm collection in wild animals are pharmacological collection, with the use of alpha-2-agonists and testicular cryopreservation / vitrification with subsequent cultivation. Little progress has been made, however, in relation to cryopreservation methods, prevailing the classic association of TRIS-yolk-glycerol. We therefore discuss the methods used to access the male gamete in wild species and their applications in animal conservation.(AU)

Estimation of genetic parameters in dairy production in girolando cattle / Estimação de parâmetros genéticos na produção leiteira em bovinos girolando

Milk production is an important economic activity in Brazil. Dairy farmers would benefit from animal breeding programs that aid in identification and selection of animals with the best cost/benefit ratio to maximize productivity, and additionally provide advice on disposal of less productive animals. This study aims to estimate the heritability and repeatability of milk production corrected for 305 days (PL305) in a herd of Girolando cattle. We analyzed 528 lactations in 251 cows. For the analysis, uniform a priori distribution was defined for systematic effects. Gaussian and inverted Wishart distributions were defined as a priori distributions for random effects. The variance components were estimated based on Bayesian inference using the MCMCglmm function available in the MCMCglmm package of the R software. Convergence was verifed with the Geweke test available in the R software. The heritability and repeatability were estimated from the variance component results. Heritability was at 0.28, suggesting that selection for the milk production trait leads to efficient genetic progress in the herd. Phenotypic variance was mainly due to environmental variance; therefore, the phenotype of individuals should not be considered as indicator for additive genetic variance. Repeatability was at 0.93, indicating that the first performance of the animals based on milk production average is a good indicator of the second, and the data could be used for disposal decisions.(AU)

A produção de leite é uma das atividades econômicas mais importantes da agropecuária brasileira. Produtores podem usufruir de programas de melhoramento genético que permitem a identificação dos melhores animais e sua seleção para maximizar a produtividade com a melhor relação custo/benefício, além do aconselhamento do descarte de animais menos produtivos. Objetivou-se estimar a herdabilidade e repetibilidade da produção de leite corrigida para 305 dias (PL305) de um rebanho de bovinos da raça Girolando. Foram analisadas 528 lactações de 251 vacas. Para análise foi definida a distribuição uniforme a priori para efeitos sistemáticos. As distribuições de Wishart gaussiana e invertida foram definidas como distribuições a priori para efeitos aleatórios. Os componentes de variância foram estimados utilizando inferência bayesiana pela função MCMCglmm disponível no pacote MCMCglmm do software R. A convergência foi verificada pelo teste de Geweke disponível no software R. Após a obtenção dos componentes de variância foram estimados a herdabilidade e repetibilidade. A herdabilidade observada foi 0,28, o que sugere que a seleção para esta característica resultará em progresso genético eficiente no rebanho. A maior parte da variância fenotípica é devido a variância ambiental, com isso, o fenótipo dos indivíduos não é um bom indicador da variância genética aditiva. A repetibilidade foi de 0,93, indicando que o primeiro desempenho dos animais é considerado um bom indicador do segundo, podendo ser utilizadas em decisões de descarte.(AU)

Genetic parameters and genetic trends of conformation and management traits in Dairy Gir cattle / [Parâmetros genéticos e tendências genéticas de características de conformação e manejo de bovinos Gir Leiteiro]

The objective of this study was to estimate genetic parameters and genetic trends of different conformation and management traits regularly measured within the context of the National Dairy Gir Breeding Program (PNMGL). The estimation of genetic and residual variances for each trait was performed using average information restricted maximum likelihood (AI-REML) procedure in AIREMLF90 program software. The population was divided into three subpopulations constituted by measured females (with phenotype records), all females, and males. Linear regressions were applied for each trait, considering two periods of birth (1st period: 1938-1996; 2nd period: 1997-2012). The estimated heritability of conformation and management traits varied from 0.01 to 0.53, denoting a perspective of genetic improvement through selection and corrective matings for purebred Dairy Gir populations. The average genetic changes in conformation and management traits were, in general, variable and inexpressive, showing that the selection of Dairy Gir may have had been directed essentially to increase milk yield. The analysis of the two periods of birth indicated that some linear traits present progress (although inexpressive) in the 2nd period (more recent period).(AU)

O objetivo deste estudo foi estimar os parâmetros genéticos e as tendências genéticas para diferentes características de conformação e manejo de animais puros da raça Gir Leiteiro, pertencentes ao Programa Nacional de Melhoramento do Gir Leiteiro (PNMGL). A estimativa das variâncias genéticas e residuais para cada característica foi realizada usando-se o procedimento de máxima verossimilhança restrita (AI-REML), por meio do programa AIREMLF90. A população foi dividida em três subpopulações, constituídas por fêmeas mensuradas (com registros de fenótipo), todas fêmeas e machos. As regressões lineares para cada característica foram ainda divididas em dois períodos de anos de nascimento (1º período: 1938 a 1996; 2º período: 1997 a 2012). As herdabilidades estimadas variaram de 0,01 a 0,53 para as características de conformação e manejo, possibilitando a perspectiva de melhoramento mediante seleção e acasalamentos corretivos na população pura da raça Gir Leiteiro. As mudanças genéticas nas características conformação e manejo foram, em geral, variáveis e inexpressivas, sugerindo que a seleção no Gir Leiteiro possa ter sido direcionada essencialmente para maior produção de leite. Ao serem observados os dois períodos distintos de anos de nascimento, infere-se que algumas características lineares apresentaram progresso (embora inexpressivo) no 2º período analisado.(AU)

Inclusion of genomic information in estimation of genetic parameters for body weights and visual scores in Nelore cattle

The aim of this study was to evaluate genomic information inclusion in genetic parameter estimation of standardized body weight at birth and at 240, 365, and 450 days of age, and visual scores for body structure, precocity, and body muscularity, measured as yearlings in Nelore cattle. We compared genetic parameters, (co)variance components (estimated from Bayesian inference and Gibbs sampling), breeding value accuracies, genetic trends, and principal component analysis (PCA) obtained through traditional GBLUP and ssGBLUP methods. For all traits analyzed, part of the phenotypic variation was explained by the additive genetic effect, thus indicating the capacity of traits to respond to the selection process. Estimates of genetic correlation, in both methodologies, between body weights and visual scores were, in general, high and positive, showing that the selection for visual scores can lead to heavier animals. Genetic trends showed genetic progress, both when estimated breeding values and genomic estimated breeding values were used. The PCA, genetic trends, and accuracy estimates on breeding values showed that inclusion of single nucleotide polymorphism information contributed towards slightly better estimates of the genetic variability of evaluated traits. Genomic information did not bring greater gains in genetic estimates, due to redundancy of kinship information from the pedigree, which already had complete animal kinship data.

Genetic parameters and trends for reproductive traits in Blanco Orejinegro cattle from Colombia / Parâmetros e tendências genéticas para características reprodutivas no gado Blanco Orejinegro da Colômbia

The Colombian creole cattle breed Blanco Orejinegro (BON) is an important zoogenetic resource, but there is little knowledge about the genetic parameters and trends of its reproductive traits. Therefore, the aim of this study was to estimate parameters for the reproductive traits calving interval (CI), age at first calving (AFC), gestation duration (GD) and genetic trends for CI in the BON breed. Genealogy information from 7,799 animals was used, and employing the MTDFREML program, the components of the variance, heritability (h2), repeatability (rep), and estimated breeding values (EBV) for CI (n=3308), AFC (n=729), and GD (n=306) were estimated, in addition to the inbreeding coefficient (F) of the population. Genetic trends were established through linear regression using R software. Finally, the animals were classified as inbred (F > 0) and noninbred (F=0), and the effect of inbreeding on reproductive performance was established through a generalized linear model using the R program. An average F value of 4.41%±0.06 was observed. The h2 for CI was 0.11±0.03 with a rep of 0.15±0.04; for AFC, h2 was 0.00±0.05; and for GD, h2 was 0.00±0.08. The genetic trend for CI was -0.01 days/year. Finally, for CI, inbreeding depression was evident; this trait increased when inbreeding increased. These results indicate an important environmental influence on reproductive traits. The heritability estimate for CI suggests that little genetic progress could be achieved through selection. The evidence of inbreeding depression raises the need to control inbreeding to conserve this genetic resource.(AU)

O gado crioulo colombiano Blanco Orejinegro (BON) é um importante recurso zoogenético, mas ainda há desconhecimento sobre os parâmetros e tendências genéticas das características reprodutivas dessa raça. Portanto, o objetivo deste estúdio foi estimar parâmetros e tendências genéticas para características reprodutivas intervalo de partos (IDP), idade ao primeiro parto (IPP) e duração da gestação (DG) na raça BON. A informação da genealogia de 7,799 animais foi usada. Utilizando o programa MTDFREML foram estimados os componentes de variância, herdabilidade (h2), repetibilidade (rep) e valores genéticos (VGE), para IDP (n=3308), IPP (n=729) e DG (n=306), além do coeficiente de endogamia (F) na população. As tendências genéticas foram determinadas por regressão linear usando o software R. Finalmente, os animais foram classificados como endogâmicos (F > 0) e não endogâmicos (F=0) e o efeito da endogamia no desempenho reprodutivo foi determinado usando um modelo linear generalizado usando R. Observouse um F médio de 4,41%+0,06. A h2 para IDP foi 0,11±0,03 com uma repetibilidade de 0,15±0,04; para IPP a h2 foi 0,00 ± 0,05; e para DG a h2 foi 0,00 ± 0,08. A tendência genética para IDP foi -0,01 dias/ano. Finalmente, para o IDP, a depressão por endogamia foi evidente, aumentando o IDP com o aumento da endogamia. Os resultados indicam uma importante influência ambiental nas características reprodutivas. A herdabilidade estimada para o IDP sugere que pouco ganho genético pode ser alcançado através da seleção, embora a depressão endogâmica evidencie a necessidade de controlar a consanguinidade para conservar o recurso genético.(AU)

Selection indexes for Nellore production system in the Brazilian Pantanal

The objective was to develop selection indexes for Nellore cattle raised in full-cycle production system in the Brazilian Pantanal. The resulting offspring are retained as replacements or sold at two years of age. Preliminary analyses explored effects of scale on economic values (EV). However, given the available data, these effects were very small. Presented herein are results from a simulated system consisting of 5,000 cows with all animals maintained on pasture as is typical in Pantanal. The EV were determined by approximating the partial derivatives of the profit function, changing one trait at a time, by one unit, while keeping the other traits constant. Traits in the breeding objective were mature cow weight, direct and maternal weaning weight, postweaning average daily gain, subcutaneous fat depth, longissimus muscle area, and stayability. Economic values were calculated on the basis of number of animals (per head), number of animal units, and arroba of carcasss weight. Regardless of the basis, maternal weaning weight and subcutaneous fat depth made negligible contributions to the breeding objective. Proportions of variation in the breeding objectives (per head, per animal unit, per arroba) explained by cow weight, direct weaning weight, postweaning average daily gain, stayability, and longissimus muscle area were: 13, 13, 17; 6, 1, 5; 3, 3, 4; 67, 67, 61; and 11, 17, 13, respectively. These indexes may aid Nellore breeders in their selection decisions, thus facilitating the genetic progress and increased productivity and profitability of Pantanal herds.

Crown rust on oat genotypes with different levels of resistance: damages and losses / Ferrugem da folha sobre genótipos de aveia com diferentes níveis de resistência: danos e perdas

The evolution in virulence of Puccinia coronata f. sp. avenae has challenged the genetic resistance to crown rust in oat genotypes. New resistance sources are constantly required for yield stabilization and costs reduction. This study aimed to characterize the crown rust resistance of oat genotypes and the disease´s productive and economic impact. Experiments were conducted in two environments, with and without chemical control. Resistance was measured by disease progress, apparent rate of infection, final severity and pustule size. Damages were based on reduction of yield, 1000 grain mass and hectoliter mass. UFRGS16Q6030-2 was immune. In both environments, UFRGS166091-2 and URS Brava exhibited the greatest level of resistance and the smallest grain yield reduction, while URS 22 was highly susceptible, reducing more than 70% of its grain yield. These results surpass the negative impacts of the disease previously reported in oats, particularly related to grain yield. The data presented in this paper highlighted the importance of genetic resistance, particularly partial resistance, for maintaining oat genetic yield potential, reducing environmental contamination with less fungicides, and increasing economic gains with oat cultivation.(AU)

A evolução da virulência de Puccinia coronata f. sp. avenae desafia a resistência genética de cultivares de aveia à ferrugem da folha. Novas fontes de resistência são constantemente necessárias para estabilizar a produção e reduzir custos. Os objetivos desse estudo foram caracterizar a resistência de seis genótipos de aveia à ferrugem da folha e avaliar o impacto produtivo e econômico causado pela doença. Foram conduzidos ensaios em dois ambientes com e sem o controle químico. A resistência foi medida via progresso da doença, taxa aparente de infecção, severidade final e tamanho da pústula. As perdas foram avaliadas em rendimento, massa de mil grãos e massa do hectolitro. UFRGS 16Q6030-2 foi imune. Em ambos os ambientes, UFRGS 166091-2 e URS Brava exibiram os maiores níveis de resistência e as menores reduções no rendimento de grãos, enquanto URS 22 teve a maior suscetibilidade, com redução superior a 70% no rendimento de grãos. Os resultados obtidos superam os impactos negativos da doença previamente relatados em aveia, particularmente em relação ao rendimento de grãos. Os dados apresentados neste trabalho ressaltam a importância da resistência genética, particularmente a parcial, na manutenção do potencial genético produtivo, na redução de contaminações ambientais pelo menor uso de fungicidas e na ampliação dos ganhos econômicos com a cultura da aveia.(AU)

Coffea canephora breeding: estimated and achieved gains from selection in the Western Amazon, Brazil / Melhoramento do Coffea canephora: ganhos de seleção estimados e realizados na Amazônia Ocidental

Gain from selection is an important criterion in quantifying the efficiency of breeding programs. This study quantified the selection gain estimated under experimental conditions and realized gain achieved in the field, seeking to interpret the efficiency of the Coffea canephora selection. For that purpose, we considered experiments that began in 2004 with directed hybridizations to obtain new hybrid progenies. From a breeding population composed of 288 hybrid individuals, 12 genotypes were selected in experimental conditions from 2005 to 2012, with amplitude in the estimated gains from 127.70 to19.19%. Those genotypes were evaluated from 2012 to 2018 in clonal tests in four environments of the Western Amazon. The environment that exhibited the greatest correlation between the predicted genetic values and the realized genetic gain observed in the field was the environment of Ouro Preto do Oeste, RO (0.67), the location in which the plants were selected, followed by the environments of Alta FlorestaD´Oeste, RO (0.44), Rio Branco, AC (0.43), and Porto Velho, RO (0.37).Experimental conditions showed that the effect due to dominance deviations was approximately three times greater than the additive effect. Nine clones exhibited higher genetic gains in the experimental conditions and at field, and two clones exhibited lower estimated gains and lower field performance.The clone G17-P7 exhibited high genetic gain under experimental conditions and low field performance. The selection in experimental conditions was positively correlated with plant performance in the field (r=0.55), which allows reduction of the original breeding population to a set of more promising clones to be grown in multiple environments, optimizing time and resources.(AU)

O ganho com a seleção é um dos critérios mais importantes para avaliar a eficiência de programas de melhoramento de plantas. O objetivo desse trabalho é quantificar a associação entre o ganho de seleção estimado em condições experimentais e o ganho de seleção realizado em campo, buscando quantificar a eficiência do melhoramento do Coffea canephora. Para isso, foram considerados experimentos iniciados com a hibridação direcionada para obtenção de progênies no ano de 2004, a avaliação de testes de progênies em condições experimentais no período de 2005 a 2012, e avaliações em diferentes ambientes da Amazônia Ocidental no período de 2012 a 2018. De uma população composta por 288 indivíduos estruturados em nove progênies de irmãos completos foram selecionados 12 genótipos com amplitude de 127,70 a -19,19% em suas estimativas de ganho com a seleção, para serem avaliados em quatro ambientes da Amazônia Ocidental. O ambiente que apresentou maior correlação entre os valores genéticos preditos e o ganho realizado foi Ouro Preto do Oeste - RO (0,67), local em que as plantas foram selecionadas, seguido pelos ambientes de Alta Floresta D´Oeste - RO (0,44), Rio Branco - AC (0,43) e Porto Velho - RO (0,37). Avaliações em condições experimentais mostraram que os efeitos devido aos desvios de dominância foram aproximadamente três vezes maiores do que os efeitos aditivos. Nove clones apresentaram maiores estimativas de ganho em condições experimentais e nos ensaios de campo, e dois clones apresentaram menores estimativas em ambas condições. O clone G17-P7 apresentou altas estimativas de ganho em condições experimentais e baixo desempenho em campo. A seleção em único ambiente esteve positivamente correlacionada com o desempenho dos cafeeiros em campo (r=0,55), permitindo reduzir a população de melhoramento original em um conjunto de clones de maior potencial agronômico.(AU)

Genetic parameter and genetic trend estimates for reproductive traits in Wistar rats / [Estimativas de parâmetros genéticos e tendências genéticas de características reprodutivas em ratos Wistar]

The aim of this study was to estimate genetic parameters and genetic trends for reproductive traits in Wistar rats. A total of 1,167 data records from 283 females over six generations of monogamous mating pairs was used. Heritability and genetic correlation were estimated through Bayesian inference and genetic trends were calculated by linear regression of breeding values over generations. Heritability estimates for litter size at birth (LS), calving interval (CI), pup mortality (PM) and maternal cannibalism (CAN) presented low magnitude, ranging from 0.01 to 0.13. CAN presented high and positive genetic correlation with LS and PM (0.77 and 0.78, respectively). On the other hand, all the other estimated genetic correlations were not significant. Genetic trend was positive for LS (+0.0900 pups per generation), and negative for PM and CAN (-1.0085 and -0.5217 pups per generation, respectively). For CI the genetic trend was not significant. It is recommended to increase selection intensity on dams in this Wistar rat population in order to accelerate the genetic progress.(AU)

O objetivo deste estudo foi estimar os parâmetros genéticos e as tendências genéticas de características reprodutivas em ratos Wistar. Foram analisados 1.167 registros coletados em 283 fêmeas ao longo de seis gerações de pares de acasalamentos monogâmicos. Herdabilidade e correlação genética foram estimadas por meio de inferência bayesiana, e as tendências genéticas foram calculadas pela regressão linear dos valores genéticos em função das gerações. As estimativas de herdabilidades para as características número de filhotes nascidos (LS), intervalo de parto (CI), mortalidade de filhotes (PM) e canibalismo materno (CAN) foram de baixa magnitude (0,01 a 0,13). CAN apresentou correlação genética alta e positiva com LS e PM, 0,77 e 0,78, respectivamente. As demais correlações genéticas estimadas foram não significativas. A tendência genética foi positiva para LS (+0,0900 filhote por geração) e negativa para PM e CAN (-1,0085 e -0,5217 filhote por geração, respectivamente). A tendência genética não foi significativa para CI. Recomenda-se aumentar a intensidade de seleção nas fêmeas nessa população de ratos Wistar, a,fim de acelerar o progresso genético.(AU)

Genetic parameter and genetic trend estimates for reproductive traits in Wistar rats / [Estimativas de parâmetros genéticos e tendências genéticas de características reprodutivas em ratos Wistar]

The aim of this study was to estimate genetic parameters and genetic trends for reproductive traits in Wistar rats. A total of 1,167 data records from 283 females over six generations of monogamous mating pairs was used. Heritability and genetic correlation were estimated through Bayesian inference and genetic trends were calculated by linear regression of breeding values over generations. Heritability estimates for litter size at birth (LS), calving interval (CI), pup mortality (PM) and maternal cannibalism (CAN) presented low magnitude, ranging from 0.01 to 0.13. CAN presented high and positive genetic correlation with LS and PM (0.77 and 0.78, respectively). On the other hand, all the other estimated genetic correlations were not significant. Genetic trend was positive for LS (+0.0900 pups per generation), and negative for PM and CAN (-1.0085 and -0.5217 pups per generation, respectively). For CI the genetic trend was not significant. It is recommended to increase selection intensity on dams in this Wistar rat population in order to accelerate the genetic progress.(AU)

O objetivo deste estudo foi estimar os parâmetros genéticos e as tendências genéticas de características reprodutivas em ratos Wistar. Foram analisados 1.167 registros coletados em 283 fêmeas ao longo de seis gerações de pares de acasalamentos monogâmicos. Herdabilidade e correlação genética foram estimadas por meio de inferência bayesiana, e as tendências genéticas foram calculadas pela regressão linear dos valores genéticos em função das gerações. As estimativas de herdabilidades para as características número de filhotes nascidos (LS), intervalo de parto (CI), mortalidade de filhotes (PM) e canibalismo materno (CAN) foram de baixa magnitude (0,01 a 0,13). CAN apresentou correlação genética alta e positiva com LS e PM, 0,77 e 0,78, respectivamente. As demais correlações genéticas estimadas foram não significativas. A tendência genética foi positiva para LS (+0,0900 filhote por geração) e negativa para PM e CAN (-1,0085 e -0,5217 filhote por geração, respectivamente). A tendência genética não foi significativa para CI. Recomenda-se aumentar a intensidade de seleção nas fêmeas nessa população de ratos Wistar, a,fim de acelerar o progresso genético.(AU)

Adaptability and stability of Coffea canephora Pierre ex Froehner genotypes in the Western Amazon / Adaptabilidade e estabilidade de genótipos de Coffea canephora Pierre ex Froehner na Amazônia Ocidental

The development of Coffea canephora cultivars is based on the characterization of genotype × environment interaction, which is interpreted to quantify the differential behavior of clones at different cultivation sites. The objective of this research was to study the genotype x environment interaction aiming to select clones of broad and specific adaptation to different environments of the Western Amazon. Twelve clones with hybrid characteristics of the botanical varieties Conilon and Robusta and four open pollinated clones, had their performance evaluated in comparison with four controls. The genotype × environment interaction was interpreted based on the environmental quality index, the non-parametric estimator of Lin and Binns, 1988 and on the dispersion of the centroid method. Effects of the genotypes, environment, and genotype × environment interaction were all significant (p<0.01). The environmental quality index (Ij) classified three environments as favorable for coffee production. In terms of the Lin and Binns estimator (Pi), hybrid genotypes 16, 10, 13, 09 and 14 presented lower Pi indices than others, and were classified as being more stable. Five clones of low adaptability, seven clones of specific adaptability to favorable or unfavorable environments and two clones of broad adaptability to all environments were identified interpreting the dispersion of the centroid method.(AU)

O desenvolvimento de novas cultivares de Coffea canephora fundamenta-se na caracterização do comportamento diferenciado dos clones em diferentes locais de cultivo. O objetivo deste trabalho foi estudar a interação genótipo x ambientes visando selecionar clones de adaptação ampla e específica à diferentes ambientes da Amazônia Ocidental. Doze clones com características híbridas das variedades botânicas Conilon e Robusta e quatro clones provenientes de polinização aberta tiveram seu desempenho avaliado em comparação com quatro testemunhas. Os métodos utilizados para quantificar a interação genótipo x ambientes foram o estimador não paramétrico de Lin & Binns e a dispersão do método centroide. A análise de variância indicou que os efeitos de genótipos, de ambiente e da interação G x A foram significativos (p<0,01). O índice de qualidade ambiental (Ij) permitiu classificar três ambientes favoráveis em relação a sua contribuição para o desempenho das plantas. Os genótipos híbridos 16, 10, 13, 9 e 14 apresentaram menores índices de Pi, tendo sido ranqueados como mais estáveis, apresentando produtividade média superior ao desempenho das testemunhas. Cinco clones de baixa adaptabilidade, sete clones de adaptabilidade específica a ambientes favoráveis ou desfavoráveis e dois clones de ampla adaptabilidade foram identificados interpretando a dispersão no plano do método centroide.(AU)

Population structure and inbreeding of Holstein cattle in southern Brazil

The present investigation aimed to evaluate the population structure and inbreeding of Holstein herds in southern Brazil. To carry out the analysis, the Associação Paranaense de Criadores de Bovinos da Raça Holandesa (APCBRH) in Brazil provided the data, which consisted of a pedigree file of 206,796 animals born between 1970 and 2014. Results regarding the following parameters were determined: pedigree integrity, effective number of founders, effective number of ancestors, generation interval, inbreeding coefficient, realized effective population size, and average relatedness coefficient. POPREP and ENDOG v.4.5 software packages were employed to estimate these parameters. Based on the data set, the mean generation interval was found to be 6.3 years, and the average inbreeding coefficient, related to inbred animals, was 4.99%. Furthermore, the realized effective population size varied throughout the time period, ranging from 22 to 114, whereas the rate of inbreeding in this same period showed a decreasing trend towards the later years in the period until 2014. Upon evaluation, average relatedness coefficient was estimated to be 0.71%. Moreover, the effective number of founders and ancestors were estimated as 418 and 400 animals, respectively. According to the level of inbreeding observed, it could be noticed that genetic diversity remains elevated, which will be important to the genetic progress in the Holstein breeding program in Southern Brazil.(AU)

Determining the performance of alfalfa population collected from a narrow agroeceological zone of Turkey / Determinação da população de alfafa coletada em uma estreita zona agroecológica da Turquia

This study was carried out to determine the yield and quality characteristics of some alfalfa village populations cultivated by producers in Bingol province of Turkey. Alfalfa seeds were obtained from 23 different locations in 2015. A three replicated, randomised complete block designed field trial was established in 2016 including these genotypes and four registered varieties. As a result of three year trials, it was determined that the populations obtained from the villages of Servi, Mutluca, Garip, Sarçiçek-1 and Bagliisa produced highest green herbage and hay yields. When we compare the quality results, Kumgecit, Küçüktekõren and enkõy-1 populations stands out in terms of crude protein ratio. Highest crude protein yield was obtained from Servi population. In terms of relative feed value, it was observed that the varieties were better qualfied than the populations. It is concluded that the populations of Servi, Mutluca, Garip, Sarçiçek-1 and Bagliisa can be used in breeding studies especially to obtain genetic progress in yield of alfalfa for feed and bioenergy production. For the genetic improvement of current genotypes with higher crude protein ratio, Kumgecit, Küçüktekõren and enkõy-1 populations can be used as a source. This study showed that, East Anatolia region is not just live-conserving highly diversified species but also covering special intra-species genetic diversity in microclimatic zones of Turkey to be used to improve the global forage and bioenergy cropproduction.(AU)

Este estudo foi realizado para determinar as características de rendimento e qualidade de algumas populações de alfafa cultivadas por produtores na província de Bingol, na Turquia. As sementes de alfafa foram obtidas de 23 locais diferentes em 2015. Em 2016, foi estabelecido um ensaio de campo com três repetições, aleatórias e desenvolvido em bloco, incluindo esses genótipos e quatro variedades registradas. Com o resultado de testes de três anos, determinou-se que as populações obtidas nas aldeias de Servi, Mutluca, Garip, Sarçiçek-1 e Bagliisa produziam maiores colheitas de forragem verde e feno. Quando comparamos os resultados de qualidade, as populações Kumgecit, Küçüktekõren e enkõy-1 se destacam em termos de proporção de proteína bruta. O maior rendimento de proteína bruta foi obtido da população de Servi. Em termos de valor relativo de ração, observou-se que as variedades eram mais qualificadas do que as populações. Conclui-se que as populações de Servi, Mutluca, Garip, Sarçiçek-1 e Bagliisa podem ser utilizadas em estudos de melhoramento, especialmente para obter progresso genético no rendimento de alfafa para produção de ração e bioenergia. Para o aprimoramento genético dos genótipos atuais com maior proporção de proteína bruta, as populações Kumgecit, Küçüktekõren e enkõy-1 podem ser usadas como fonte. Este estudo mostrou que, a região da Anatólia Oriental não é apenas espécies altamente diversificadas conservadoras de vida, mas também abrange diversidade genética intraespécie especial em zonas microclimáticas da Turquia, a ser usada para melhorar a produção global de forragem e bioenergia.(AU)

Genetic parameters of girolando crossbred cows in dairy herds in the State of Acre, Brazil / Parâmetros genéticos de vacas mestiças girolando em rebanhos leiteiros no Estado do Acre, Brasil / Parámetros genéticos de vacas cruzadas girolando en ganados lecheros en el Estado de Acre, Brasil

This study aimed at estimating genetic parameters for milk production and conformation characteristics in Girolando crossbred dairy cows reared in the High and Low Acre region using the restricted maximum likelihood methodology, under an animal model. We estimated the variance components and genetic parameters using the REML/BLUP procedure (Restricted Maximum Likelihood Methodology/Best Linear Unbiased Prediction). The estimated average for milk production for 305 days of lactation (P305) was of 1523.25 ± 481.11 kg, with a heritability of 0.38 for this characteristic. The conformation characteristics showed no significant correlation with milk production. The phenotypical correlations between the linear characteristics of type were, in general, positive and moderate. The P305 obtained in this study can be considered low and indicates that there is a possibility of increasing milk production through selection in herds along with the use of tested and proven bulls. The heritability estimate found (0.38) indicates that there is genetic variability for milk production, demonstrating that selection for this characteristic would result in genetic progress.(AU)

Este estudo teve como objetivo estimar parâmetros genéticos para produção de leite e características de conformação em vacas leiteiras mestiças Girolando criadas na região do Alto e Baixo Acre, utilizando a metodologia da máxima verossimilhança restrita, sob modelo animal. As estimativas dos componentes de variância e dos parâmetros genéticos foram realizadas pelo procedimento REML/BLUP (Máxima verossimilhança restrita/Melhor predição linear não viesada). A média estimada para produção de leite aos 305 dias de lactação (P305) foi de 1.523,25 ± 481 kg e a herdabilidade para esta característica foi de 0,38. As características de conformação não apresentaram correlação significativa com a produção de leite. As correlações fenotípicas entre as características lineares de tipo foram em geral positivas e de magnitude moderada. A P305 obtida neste estudo pode ser considerada baixa e indica que existe a possibilidade de aumento da produção de leite através de seleção nos rebanhos, juntamente com a utilização de touros testados e provados. A estimativa de herdabilidade encontrada (0,38) indica que há variabilidade genética para produção de leite, demonstrando que a seleção para esta característica resultaria em progresso genético.(AU)

El objetivo del estudio fue estimar los parámetros genéticos para la producción de leche y las características de conformación en vacas lecheras cruzadas Girolando criadas en la región de Alto y Bajo Acre utilizando el método de máxima verosimilitud restringida, con un modelo animal. Estimamos los componentes de la varianza y los parámetros genéticos mediante el procedimiento REML / BLUP (metodología de máxima verosimilitud restringida / mejor predicción lineal insesgada). El promedio estimado para la producción de leche para los 305 días de lactancia (P305) fue de 1523.25 ± 481.11 kg, con una heredabilidad de 0.38 para esta característica. Las características de conformación no mostraron correlación significativa con la producción de leche. Las correlaciones fenotípicas entre las características lineales de tipo fueron, en general, positivas y moderadas. El P305 obtenido en este estudio puede considerarse bajo y muestra que existe la posibilidad de incrementar la producción de leche a través de la selección en rebaños, junto con el uso de toros probados y comprobados. La estimación de heredabilidad encontrada (0,38) indica que existe variabilidad genética para la producción de leche, lo que demuestra que la selección de esta característica daría lugar a un progreso genético.(AU)

Genetic parameters of girolando crossbred cows in dairy herds in the State of Acre, Brazil / Parâmetros genéticos de vacas mestiças girolando em rebanhos leiteiros no Estado do Acre, Brasil / Parámetros genéticos de vacas cruzadas girolando en ganados lecheros en el Estado de Acre, Brasil

This study aimed at estimating genetic parameters for milk production and conformation characteristics in Girolando crossbred dairy cows reared in the High and Low Acre region using the restricted maximum likelihood methodology, under an animal model. We estimated the variance components and genetic parameters using the REML/BLUP procedure (Restricted Maximum Likelihood Methodology/Best Linear Unbiased Prediction). The estimated average for milk production for 305 days of lactation (P305) was of 1523.25 ± 481.11 kg, with a heritability of 0.38 for this characteristic. The conformation characteristics showed no significant correlation with milk production. The phenotypical correlations between the linear characteristics of type were, in general, positive and moderate. The P305 obtained in this study can be considered low and indicates that there is a possibility of increasing milk production through selection in herds along with the use of tested and proven bulls. The heritability estimate found (0.38) indicates that there is genetic variability for milk production, demonstrating that selection for this characteristic would result in genetic progress.(AU)

Este estudo teve como objetivo estimar parâmetros genéticos para produção de leite e características de conformação em vacas leiteiras mestiças Girolando criadas na região do Alto e Baixo Acre, utilizando a metodologia da máxima verossimilhança restrita, sob modelo animal. As estimativas dos componentes de variância e dos parâmetros genéticos foram realizadas pelo procedimento REML/BLUP (Máxima verossimilhança restrita/Melhor predição linear não viesada). A média estimada para produção de leite aos 305 dias de lactação (P305) foi de 1.523,25 ± 481 kg e a herdabilidade para esta característica foi de 0,38. As características de conformação não apresentaram correlação significativa com a produção de leite. As correlações fenotípicas entre as características lineares de tipo foram em geral positivas e de magnitude moderada. A P305 obtida neste estudo pode ser considerada baixa e indica que existe a possibilidade de aumento da produção de leite através de seleção nos rebanhos, juntamente com a utilização de touros testados e provados. A estimativa de herdabilidade encontrada (0,38) indica que há variabilidade genética para produção de leite, demonstrando que a seleção para esta característica resultaria em progresso genético.(AU)

El objetivo del estudio fue estimar los parámetros genéticos para la producción de leche y las características de conformación en vacas lecheras cruzadas Girolando criadas en la región de Alto y Bajo Acre utilizando el método de máxima verosimilitud restringida, con un modelo animal. Estimamos los componentes de la varianza y los parámetros genéticos mediante el procedimiento REML / BLUP (metodología de máxima verosimilitud restringida / mejor predicción lineal insesgada). El promedio estimado para la producción de leche para los 305 días de lactancia (P305) fue de 1523.25 ± 481.11 kg, con una heredabilidad de 0.38 para esta característica. Las características de conformación no mostraron correlación significativa con la producción de leche. Las correlaciones fenotípicas entre las características lineales de tipo fueron, en general, positivas y moderadas. El P305 obtenido en este estudio puede considerarse bajo y muestra que existe la posibilidad de incrementar la producción de leche a través de la selección en rebaños, junto con el uso de toros probados y comprobados. La estimación de heredabilidad encontrada (0,38) indica que existe variabilidad genética para la producción de leche, lo que demuestra que la selección de esta característica daría lugar a un progreso genético.(AU)

In vitro embryo production in buffaloes: from the laboratory to the farm

Transvaginal follicular aspiration technique together with in vitro embryo production are the biotechnological alternatives currently available to support genetic improvement breeding programs in buffalo species. However, aspects related to animal management, lack of knowledge of the metabolic needs and biochemical peculiarities of gametes and embryos, as well as the reproductive physiology characteristics have hampered progress in the results. Despite the low availability of good quality oocytes collected after OPU in donors as a physiological characteristic of buffalo species, high rates of oocyte maturation, modest embryo cleavage, blastocyst production and pregnancy rates after transvaginal embryo transfer in recipients could be obtained in buffalo in vitro embryo production programs. The results of implementing an in vitro embryo production program in buffaloes in the northern region of Pará state, Brazil, and results published by other groups demonstrate the feasibility of implementing this biotechnology in the routine of breeding programs. Nevertheless, in order to achieve better and consistent results, it is necessary to deepen the knowledge on the peculiarities of reproductive biology in this specie. Selection of donor animals based on ovarian size and ovarian follicular reserve and on the rate of blastocyst production is presented as an effective alternative to increase the efficiency of the in vitro embryo production technique applied to the buffalo species.