Comparison of different diagnostic modalities for isolation of Mycobacterium Tuberculosis among suspected tuberculous lymphadenitis patients

Abstract Tuberculosis is a communicable disease with high morbidity and mortality rates in developing countries. The study's primary objective is to compare conventional methods such as acid-fast bacillus (AFB) culture and microscopy with rapid diagnostic methods. The secondary objective is to compare histopathological and microbiological findings in suspected patients with tubercular lymphadenitis. A total of 111 samples (August 2018 to September 2019) of lymph nodes were processed for AFB microscopy, AFB cultures, drug-susceptibility testing (DST), histopathology, and Xpert Mycobacterium Tuberculosis (MTB)/resistance to Rifampin (RIF) assays. Out of 111 lymph node samples, 6 (5.4%) were positive for AFB smear microscopy, 84 (75.6%) were positive for AFB culture, 80 (70.7%) were positive on Gene Xpert, and 102 (91.8%) were indicative of tuberculosis for histopathology studies. Mycobacteria growth indicator tube (MGIT) culture positivity was 84 (75.6%) higher than solid Lowenstein-Jensen (LJ) culture 74 (66.6%). Positive cultures underwent phenotypic DST. Two cases were Multidrug-resistant (MDR) on DST, while three cases were Rifampicin resistant on Gene Xpert. The sensitivity of Genexpert was (62%) against the conventional AFB culture method. The poor performance of conventional lymphadenitis diagnostic methods requires early and accurate diagnostic methodology. Xpert MTB/RIF test can help in the treatment of multidrug-resistant TB cases. Nonetheless, rapid and conventional methods should be used for complete isolation of Mycobacterium tuberculosis.

Resumo A tuberculose é uma doença transmissível com altas taxas de morbimortalidade nos países em desenvolvimento. O objetivo principal do estudo é comparar métodos convencionais, como cultura de bacilo álcool-ácido resistente (BAAR) e microscopia, com métodos de diagnóstico rápido. O objetivo secundário é comparar os achados histopatológicos e microbiológicos em pacientes com suspeita de linfadenite tubercular. Um total de 111 amostras (agosto de 2018 a setembro de 2019) de gânglios linfáticos foi processado para microscopia de AFB, culturas de AFB, teste de susceptibilidade a drogas (DST), histopatologia e Xpert Mycobacterium tuberculosis (MTB)/ensaios de resistência à rifampicina (RIF). Das 111 amostras de linfonodos, 6 (5,4%) foram positivas para baciloscopia de AFB, 84 (75,6%) foram positivas para cultura de AFB, 80 (70,7%) foram positivas para o GeneXpert e 102 (91,8%) foram indicativas de tuberculose para estudos histopatológicos. A positividade da cultura do tubo indicador de crescimento de micobactérias (MGIT) foi 84 (75,6%), maior que a cultura sólida de Lowenstein-Jensen (LJ), 74 (66,6%). As culturas positivas foram submetidas a DST fenotípico. Dois casos eram multirresistentes (MDR) ao DST, enquanto três casos eram resistentes à rifampicina no GeneXpert. A sensibilidade do GeneXpert foi 62% contra o método convencional de cultura AFB. O fraco desempenho dos métodos convencionais de diagnóstico de linfadenite requer metodologia de diagnóstico precoce e precisa. O teste Xpert MTB/RIF pode ajudar no tratamento de casos de tuberculose multirresistente. No entanto, métodos rápidos e convencionais devem ser usados para o isolamento completo do Mycobacterium tuberculosis.

Occurrence of Salmonella spp. in fecal samples from foals with and without diarrhea in the state of São Paulo: microbiological diagnosis, antimicrobial susceptibility profile, and molecular detection / Ocorrência de Salmonella spp. em amostras fecais de potros com e sem diarreia no estado de São Paulo: diagnóstico microbiológico, perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos e detecção molecular

ABSTRACT: The present study investigated Salmonella spp. in the feces of 200 foals up to one year of age (100 with clinical signs of diarrhea and 100 without clinical signs of diarrhea). Bacteriological culture, serotyping, antimicrobial susceptibility, and real-time PCR (qPCR SYBR® Green or a TaqMan®) for detecting the invA gene (with and without a selective pre-enrichment step in tetrathionate broth) were performed. Bacterial culture revealed 15% (n=30) of positive animals (21 animals with diarrhea and nine without diarrhea). Among the 30 isolates, 13 different serovars were identified: S. Infantis, S. Minnesota, S. I.4,5,12:i:-; S. Anatum, S. Cerro, S. Oranienburg, S. Braenderup, S. Give, S. Newport, S. IIIb 61:c:z35, S. 109:-:1.5, S. I.4.12:d:-, S. I.6.8:-:-. Multidrug resistance was found in 43.33% (n=13) of the isolates, with one isolate obtained from animals without diarrhea and 12 isolates from animals with diarrhea. All qPCR techniques used in the study classified more samples as positive for Salmonella spp. than the bacterial culture of feces. In addition, all qPCR techniques detected more positive animals in the diarrhea group than in the diarrhea-free group. The results confirm the utility of the qPCR method without the pre-enrichment step in tetrathionate as a rapid test for Salmonella spp. in carrier animals. In animals with clinical signs of diarrhea, it can be combined with bacterial culture (antimicrobial susceptibility testing and serotyping). The isolation of Salmonella spp. in nine animals without diarrhea confirms the importance of asymptomatic carrier animals in the epidemiology of the disease. The multidrug resistance observed highlights the importance of rational antimicrobial use in horses and adopting biosecurity protocols that are efficacious in controlling the spread of infections between animals and zoonotic transmission in farms.

RESUMO: O presente estudo investigou a ocorrência de Salmonella spp. em fezes de 200 potros com até um ano de idade (100 com sinais clínicos de diarreia e 100 sem sinais clínicos de diarreia), utilizando as técnicas de cultivo bacteriológico e PCR em tempo real (qPCR) pelos métodos de corante fluorescente (SYBR® Green) e sonda específica (Taqman®) para a detecção do gene invA com e sem etapa de pré-enriquecimento seletivo em caldo de tetrationato. O cultivo bacteriológico revelou 15% (n=30) de animais positivos (21 animais com diarreia e nove animais sem diarreia). Dentre esses 30 isolados, 13 sorovares diferentes foram identificados: S. Infantis, S. Minnesota, S. I.4,5,12:i:-; S. Anatum, S. Cerro, S. Oranienburg, S. Braenderup, S. Give, S. Newport, S. IIIb 61:c:z35, S. 109:-:1.5, S. I.4.12:d:-, S. I.6.8:-:-. Multirresistência foi constatada em 43,33% (n=13) dos isolados, sendo um isolado obtido de animal sem diarreia e 12 isolados de animais com diarreia. Todas as técnicas de qPCR empregadas no estudo apresentaram maior número de amostras classificadas como positivas para Salmonella spp. comparadas ao cultivo bacteriológico de fezes. Adicionalmente, em todas as técnicas de qPCR houve maior número de animais detectados como positivos no grupo de animais com diarreia em relação aos animais sem diarreia. Os resultados confirmaram a utilidade do método qPCR sem a etapa de pré-enriquecimento em tetrationato, como um teste rápido para detecção de Salmonella spp. em animais portadores ou em animais com sinais clínicos de diarreia. O cultivo bacteriológico deve ser associado para a realização do teste de sensibilidade aos antimicrobianos e sorotipificação. O isolamento de Salmonella spp. em nove animais sem diarreia, confirma a importância dos animais portadores assintomáticos na epidemiologia da doença. A multirresistência observada evidencia a importância do uso racional de antimicrobianos em equinos e a importância da adoção de protocolos de biossegurança que sejam eficazes para controlar a disseminação de infecções entre animais e a transmissão zoonótica nas fazendas.

Comparison of different diagnostic modalities for isolation of Mycobacterium Tuberculosis among suspected tuberculous lymphadenitis patients / Comparação de diferentes modalidades de diagnóstico para isolamento de Mycobacterium tuberculosis entre pacientes com suspeita de linfadenite tuberculosa

Abstract Tuberculosis is a communicable disease with high morbidity and mortality rates in developing countries. The study's primary objective is to compare conventional methods such as acid-fast bacillus (AFB) culture and microscopy with rapid diagnostic methods. The secondary objective is to compare histopathological and microbiological findings in suspected patients with tubercular lymphadenitis. A total of 111 samples (August 2018 to September 2019) of lymph nodes were processed for AFB microscopy, AFB cultures, drug-susceptibility testing (DST), histopathology, and Xpert Mycobacterium Tuberculosis (MTB)/resistance to Rifampin (RIF) assays. Out of 111 lymph node samples, 6 (5.4%) were positive for AFB smear microscopy, 84 (75.6%) were positive for AFB culture, 80 (70.7%) were positive on Gene Xpert, and 102 (91.8%) were indicative of tuberculosis for histopathology studies. Mycobacteria growth indicator tube (MGIT) culture positivity was 84 (75.6%) higher than solid Lowenstein-Jensen (LJ) culture 74 (66.6%). Positive cultures underwent phenotypic DST. Two cases were Multidrug-resistant (MDR) on DST, while three cases were Rifampicin resistant on Gene Xpert. The sensitivity of Genexpert was (62%) against the conventional AFB culture method. The poor performance of conventional lymphadenitis diagnostic methods requires early and accurate diagnostic methodology. Xpert MTB/RIF test can help in the treatment of multidrug-resistant TB cases. Nonetheless, rapid and conventional methods should be used for complete isolation of Mycobacterium tuberculosis.

Resumo A tuberculose é uma doença transmissível com altas taxas de morbimortalidade nos países em desenvolvimento. O objetivo principal do estudo é comparar métodos convencionais, como cultura de bacilo álcool-ácido resistente (BAAR) e microscopia, com métodos de diagnóstico rápido. O objetivo secundário é comparar os achados histopatológicos e microbiológicos em pacientes com suspeita de linfadenite tubercular. Um total de 111 amostras (agosto de 2018 a setembro de 2019) de gânglios linfáticos foi processado ​​para microscopia de AFB, culturas de AFB, teste de susceptibilidade a drogas (DST), histopatologia e Xpert Mycobacterium tuberculosis (MTB)/ensaios de resistência à rifampicina (RIF). Das 111 amostras de linfonodos, 6 (5,4%) foram positivas para baciloscopia de AFB, 84 (75,6%) foram positivas para cultura de AFB, 80 (70,7%) foram positivas para o GeneXpert e 102 (91,8%) foram indicativas de tuberculose para estudos histopatológicos. A positividade da cultura do tubo indicador de crescimento de micobactérias (MGIT) foi 84 (75,6%), maior que a cultura sólida de Lowenstein-Jensen (LJ), 74 (66,6%). As culturas positivas foram submetidas a DST fenotípico. Dois casos eram multirresistentes (MDR) ao DST, enquanto três casos eram resistentes à rifampicina no GeneXpert. A sensibilidade do GeneXpert foi 62% contra o método convencional de cultura AFB. O fraco desempenho dos métodos convencionais de diagnóstico de linfadenite requer metodologia de diagnóstico precoce e precisa. O teste Xpert MTB/RIF pode ajudar no tratamento de casos de tuberculose multirresistente. No entanto, métodos rápidos e convencionais devem ser usados ​​para o isolamento completo do Mycobacterium tuberculosis.

Microbiological properties of soils are sensitive to changes provided by organic cultivation of banana 'BRS Princesa' in the semi-arid region

Soil microbiota has a key role in the dynamics of natural and agro-ecosystems and is sensitive to changes in these environments. This study evaluated changes in the microbiological properties of soils under an organic production system of banana 'BRS Princesa' (Musa spp.). The experimental design consisted of completely randomized blocks, with four replications. Treatments consisted of 1) soil cover with green manure and agricultural gypsum at a dose of 2,820 kg ha−1, 2) soil cover with green manure without gypsum application, 3) soil cover with weeds and agricultural gypsum at a dose of 2,820 kg ha−1, 4) soil cover with spontaneous plants without gypsum application, and two controls: 5) soil under native Caatinga and 6) soil under regenerating forest (capoeira). The evaluated properties were ß-glucosidase, arylsulfatase, acid phosphatase, fluorescein diacetate hydrolysis activities (FDA), carbon and phosphorus contents in microbial biomass, basal soil respiration, microbial and metabolic quotients, and arbuscular mycorrhizal fungi spore density. Soil samples were collected from the 0­0.20m depth layer in two seasons. No parameter could distinguish the treatments. Spontaneous plants provided conditions equivalent to those under green manure. Agricultural gypsum application also did not influence the microbial biomass and microbiota activity, in the analyzed soil depth. However, ß-glucosidase and arylsulfatase activities, the carbon content in microbial biomass, and metabolic and microbial quotients were sensitive to land-use changes and could distinguish areas under organic cultivation from those under native vegetation. Therefore, these properties can be considered good indicators for monitoring the quality of these soils. Furthermore, microbial communities of soils under organic cultivation responded with arylsulfatase activity corresponding to that found in soils under regenerating forest, which may indicate that organic management tends to provide the microbiota with a condition similar to that found under situations that are little disturbing to edaphic living.(AU)

Chemical and microbiological properties of Lake Aygir in Turkey and usage of drinking, fisheries, and irrigation / Propriedades químicas e microbiológicas do lago Aygir na Turquia e uso de bebidas, pescarias e irrigação

Abstract Since water is one of the essentials for life, the presence and quality of water in the habitat is extremely important. Therefore, water quality change and management of Lake Aygır was investigated in this study. For this, water samples collected from the lake and the irrigation pool between May 2015 and May 2016 were analyzed monthly. Spectrophotometric, titrimetric and microbiological methods were used to determine the water quality. According to some water quality regulations, HCO3, NH4, Cu, Mo, Br, fecal coliform and total suspended solid (TSS) values were found above the limit values. The other 29 parameters comply with Turkish national and international legislations. Lake Aygır was negatively affected by the surrounding settlements and agricultural activities. It is thought that the water resource should be monitored periodically and remedial studies should be done to prevent parameters exceeding the limits. However, Lake Aygır was generally suitable for drinking, use, fishing and irrigation.

Resumo Como a água é um dos elementos essenciais para a vida, a presença e a qualidade da água no habitat são extremamente importantes. Portanto, a mudança da qualidade da água e a gestão do lago Aygır foram investigadas neste estudo. Para isso, amostras de água coletadas no lago e na piscina de irrigação entre maio de 2015 e maio de 2016 foram analisadas mensalmente. Métodos espectrofotométricos, titulométricos e microbiológicos foram usados para determinar a qualidade da água. De acordo com alguns regulamentos de qualidade da água, os valores de HCO3, NH4, Cu, Mo, Br, coliformes fecais e total sólido suspenso (TSS) foram encontrados acima dos valores limite. Os outros 29 parâmetros estão em conformidade com as legislações nacionais e internacionais turcas. O lago Aygır foi afetado negativamente pelos assentamentos e atividades agrícolas ao redor. Pensa-se que o recurso hídrico deve ser monitorado periodicamente e estudos corretivos devem ser feitos para evitar que os parâmetros ultrapassem os limites. No entanto, o lago Aygır era geralmente adequado para beber, usar, pescar e irrigar.

Comparison of different diagnostic modalities for isolation of Mycobacterium Tuberculosis among suspected tuberculous lymphadenitis patients / Comparação de diferentes modalidades de diagnóstico para isolamento de Mycobacterium tuberculosis entre pacientes com suspeita de linfadenite tuberculosa

Tuberculosis is a communicable disease with high morbidity and mortality rates in developing countries. The study's primary objective is to compare conventional methods such as acid-fast bacillus (AFB) culture and microscopy with rapid diagnostic methods. The secondary objective is to compare histopathological and microbiological findings in suspected patients with tubercular lymphadenitis. A total of 111 samples (August 2018 to September 2019) of lymph nodes were processed for AFB microscopy, AFB cultures, drug-susceptibility testing (DST), histopathology, and Xpert Mycobacterium Tuberculosis (MTB)/resistance to Rifampin (RIF) assays. Out of 111 lymph node samples, 6 (5.4%) were positive for AFB smear microscopy, 84 (75.6%) were positive for AFB culture, 80 (70.7%) were positive on Gene Xpert, and 102 (91.8%) were indicative of tuberculosis for histopathology studies. Mycobacteria growth indicator tube (MGIT) culture positivity was 84 (75.6%) higher than solid Lowenstein-Jensen (LJ) culture 74 (66.6%). Positive cultures underwent phenotypic DST. Two cases were Multidrug-resistant (MDR) on DST, while three cases were Rifampicin resistant on Gene Xpert. The sensitivity of Genexpert was (62%) against the conventional AFB culture method. The poor performance of conventional lymphadenitis diagnostic methods requires early and accurate diagnostic methodology. Xpert MTB/RIF test can help in the treatment of multidrug-resistant TB cases. Nonetheless, rapid and conventional methods should be used for complete isolation of Mycobacterium tuberculosis.

A tuberculose é uma doença transmissível com altas taxas de morbimortalidade nos países em desenvolvimento. O objetivo principal do estudo é comparar métodos convencionais, como cultura de bacilo álcool-ácido resistente (BAAR) e microscopia, com métodos de diagnóstico rápido. O objetivo secundário é comparar os achados histopatológicos e microbiológicos em pacientes com suspeita de linfadenite tubercular. Um total de 111 amostras (agosto de 2018 a setembro de 2019) de gânglios linfáticos foi processado para microscopia de AFB, culturas de AFB, teste de susceptibilidade a drogas (DST), histopatologia e Xpert Mycobacterium tuberculosis (MTB)/ensaios de resistência à rifampicina (RIF). Das 111 amostras de linfonodos, 6 (5,4%) foram positivas para baciloscopia de AFB, 84 (75,6%) foram positivas para cultura de AFB, 80 (70,7%) foram positivas para o GeneXpert e 102 (91,8%) foram indicativas de tuberculose para estudos histopatológicos. A positividade da cultura do tubo indicador de crescimento de micobactérias (MGIT) foi 84 (75,6%), maior que a cultura sólida de Lowenstein-Jensen (LJ), 74 (66,6%). As culturas positivas foram submetidas a DST fenotípico. Dois casos eram multirresistentes (MDR) ao DST, enquanto três casos eram resistentes à rifampicina no GeneXpert. A sensibilidade do GeneXpert foi 62% contra o método convencional de cultura AFB. O fraco desempenho dos métodos convencionais de diagnóstico de linfadenite requer metodologia de diagnóstico precoce e precisa. O teste Xpert MTB/RIF pode ajudar no tratamento de casos de tuberculose multirresistente. No entanto, métodos rápidos e convencionais devem ser usados para o isolamento completo do Mycobacterium tuberculosis.

Comparison of different diagnostic modalities for isolation of Mycobacterium Tuberculosis among suspected tuberculous lymphadenitis patients / Comparação de diferentes modalidades de diagnóstico para isolamento de Mycobacterium tuberculosis entre pacientes com suspeita de linfadenite tuberculosa

Tuberculosis is a communicable disease with high morbidity and mortality rates in developing countries. The study's primary objective is to compare conventional methods such as acid-fast bacillus (AFB) culture and microscopy with rapid diagnostic methods. The secondary objective is to compare histopathological and microbiological findings in suspected patients with tubercular lymphadenitis. A total of 111 samples (August 2018 to September 2019) of lymph nodes were processed for AFB microscopy, AFB cultures, drug-susceptibility testing (DST), histopathology, and Xpert Mycobacterium Tuberculosis (MTB)/resistance to Rifampin (RIF) assays. Out of 111 lymph node samples, 6 (5.4%) were positive for AFB smear microscopy, 84 (75.6%) were positive for AFB culture, 80 (70.7%) were positive on Gene Xpert, and 102 (91.8%) were indicative of tuberculosis for histopathology studies. Mycobacteria growth indicator tube (MGIT) culture positivity was 84 (75.6%) higher than solid Lowenstein-Jensen (LJ) culture 74 (66.6%). Positive cultures underwent phenotypic DST. Two cases were Multidrug-resistant (MDR) on DST, while three cases were Rifampicin resistant on Gene Xpert. The sensitivity of Genexpert was (62%) against the conventional AFB culture method. The poor performance of conventional lymphadenitis diagnostic methods requires early and accurate diagnostic methodology. Xpert MTB/RIF test can help in the treatment of multidrug-resistant TB cases. Nonetheless, rapid and conventional methods should be used for complete isolation of Mycobacterium tuberculosis.(AU)

A tuberculose é uma doença transmissível com altas taxas de morbimortalidade nos países em desenvolvimento. O objetivo principal do estudo é comparar métodos convencionais, como cultura de bacilo álcool-ácido resistente (BAAR) e microscopia, com métodos de diagnóstico rápido. O objetivo secundário é comparar os achados histopatológicos e microbiológicos em pacientes com suspeita de linfadenite tubercular. Um total de 111 amostras (agosto de 2018 a setembro de 2019) de gânglios linfáticos foi processado para microscopia de AFB, culturas de AFB, teste de susceptibilidade a drogas (DST), histopatologia e Xpert Mycobacterium tuberculosis (MTB)/ensaios de resistência à rifampicina (RIF). Das 111 amostras de linfonodos, 6 (5,4%) foram positivas para baciloscopia de AFB, 84 (75,6%) foram positivas para cultura de AFB, 80 (70,7%) foram positivas para o GeneXpert e 102 (91,8%) foram indicativas de tuberculose para estudos histopatológicos. A positividade da cultura do tubo indicador de crescimento de micobactérias (MGIT) foi 84 (75,6%), maior que a cultura sólida de Lowenstein-Jensen (LJ), 74 (66,6%). As culturas positivas foram submetidas a DST fenotípico. Dois casos eram multirresistentes (MDR) ao DST, enquanto três casos eram resistentes à rifampicina no GeneXpert. A sensibilidade do GeneXpert foi 62% contra o método convencional de cultura AFB. O fraco desempenho dos métodos convencionais de diagnóstico de linfadenite requer metodologia de diagnóstico precoce e precisa. O teste Xpert MTB/RIF pode ajudar no tratamento de casos de tuberculose multirresistente. No entanto, métodos rápidos e convencionais devem ser usados para o isolamento completo do Mycobacterium tuberculosis.(AU)

Urethral obstruction due to seminal vesiculitis in a sheep: case report / Obstrução uretral por vesiculite seminal em ovino: relato de caso

We report a case of urethral obstruction due to seminal vesiculitis in a Dorper sheep, with symptoms of anuria, rectal prolapse, orchitis/epididymitis, and uroperitoneum and biochemical tests indicating severe azotemia. The animal died due to advanced azotemia, and necropsy revealed kidneys with cortical and medullary necrosis, pyelonephritis of renal calyces, hydronephrosis, ruptured and necrotic bladder, and vesicular, bulbourethral, and ampoule accessory sex glands. There was prostate hyperplasia that revealed a large amount of pus in the cross section, which was also observed bilaterally in the epididymis and right testis. Morphotintorial and biochemical analyses of bacteria obtained from microbiological culture revealed Corynebacterium sp. and Escherichia coli. Infection, hyperplasia, and abscessation of accessory sex glands caused urethral compression, resulting in an obstructive condition, similar to urolithiasis, in addition to bacteremia. Hyperplastic seminal vesiculitis, although rare, must be included among the differential diagnoses of obstructive processes in the urinary tract of sheep.

Relata-se um caso de obstrução uretral decorrente de vesiculite seminal em carneiro da raça Dorper, com quadro de anúria, prolapso retal, orquite/epididimite e uroperitôneo, com exames bioquímicos indicativos de severa azotemia. Devido ao quadro avançado de azotemia, o animal faleceu e, na necropsia, foi observado:: rins com necrose de cortical e medular, pielonefrite dos cálices renais e hidronefrose, bexiga rompida e necrosada, assim como glândulas sexuais acessórias vesiculares, bulbouretrais e ampola. Havia hiperplasia de próstata que, ao corte transversal, revelou grande quantidade de pus, que também foi observado bilateralmente no epidídimo e no testículo direito. As análises morfotintoriais e bioquímicas das bactérias obtidas a partir do cultivo microbiológico foram compatíveis com Corynebacterium sp. e Escherichia coli. A infecção, a hiperplasia e a abscedação das glândulas sexuais acessória, causaram compressão uretral, levando a um quadro obstrutivo, semelhante à urolitíase, somado à bacteremia. A vesiculite seminal hiperplásica, apesar de rara, deve ser incluída entre os diagnósticos diferenciais dos processos obstrutivos do trato urinário de carneiros.

Epidemiology of mastitis and interactions of environmental factors on udder health in the compost barn system / Epidemiologia da mastite e interações de fatores ambientais na saúde do úbere no sistema de Compost Barn

This study aimed to describe the epidemiological indexes of mastitis, milk quality and udder hygiene in the Compost Barn system, as well as to search for associations between isolated pathogens from milk with compost characteristics. Three dairy herds participated in the study, and the samples were collected during different periods on each farm. Individual milk samples were collected in duplicate for SCC analysis and microbiological culture. Environmental pathogens caused most cases of clinical mastitis on farm 2, and contagious pathogens caused the most cases on farm 1. Bed moisture was not associated with the incidence of environmental pathogens. Most of the animals remained in good udder hygiene during the study. Poor udder hygiene contributed to the increased incidence of environmental pathogens in one of the farms. A higher number of animals with a hygiene score of ≥ 2 were observed during the warmer and rainfall periods. There was no association between hygiene scores and somatic cell counts. The results suggest that pathogens isolated from milk in animals confined in Compost Barn under tropical climate are like other confinement systems adopted elsewhere. The year period influenced the udder hygiene score, reinforcing the importance of bed management throughout the year.

O objetivo deste estudo foi descrever os índices epidemiológicos da mastite, da qualidade do leite e da higiene do úbere em animais confinados no sistema Compost Barn, bem como buscar associações entre patógenos isolados do leite e características do composto. Três rebanhos leiteiros participaram do estudo e as amostras foram coletadas em diferentes períodos em cada fazenda. Amostras individuais de leite foram coletadas em duplicata para análise de CCS e cultura microbiológica. Patógenos ambientais causaram a maioria dos casos de mastite clínica na fazenda 2, e na fazenda 1 a maioria dos casos foi em decorrência de patógenos contagiosos. Amostras de material da cama foram coletadas em duas fazendas para análise da densidade bacteriana e da umidade. A umidade da cama permaneceu dentro da faixa de controle durante o estudo e não foi associada à incidência de patógenos ambientais. A maioria dos animais permaneceu com boa higiene de úbere durante o estudo. A falta de higiene do úbere contribuiu para o aumento da incidência de patógenos ambientais em uma das fazendas. Durante o período mais quente e mais chuvoso, um número maior de animais com escore de sujidade ≥2 foi observado em todos os rebanhos. Não houve associação entre escore de sujidade e contagem de células somáticas em qualquer uma das três fazendas. Os resultados indicam que o perfil de patógenos isolados do leite em animais confinados em Compost Barn sob clima tropical é semelhante a outros sistemas de confinamento adotados em outros lugares. O período do ano influenciou o escore de higiene do úbere, o que reforça a importância do manejo da cama ao longo do ano.

Chronic superficial infection in a dog caused by multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa

Background: Pseudomonas aeruginosa is a gram-negative aerobic bacterium and non-glucose fermenting, that usually causes opportunistic infections in animals, including humans. It is rarely involved in primary disease. The antibioticresistant bacterial strains are mainly developed due to the inappropriate use of antibiotics, however treating P. aeruginosa infections can be difficult owing to their natural resistance to antibiotics. Furthermorer resistant microorganisms such as P. aeruginosa grow by developing biofilms. Inaccurate diagnoses and absence of adequate microbiological tests can cause difficulties in resolving cases. This report describes a case of chronic superficial infection in a bitch caused by multidrugresistant Pseudomonas aeruginosa (MDR-PA). Case: A 6-year-old bitch Shih Tzu, initially presented with an exudative erythematous lesion in the snout region, which progressed to deep lesions, and spread to the back and limbs; furthermore, the animal always experienced a fever before new wounds emerged. Lesion samples, collected using a swab and processed at the Veterinary Microbiology Laboratory of the Federal University of Jatai (UFJ), revealed the presence of Pseudomonas aeruginosa. The isolate was multidrug-resistant and a carrier of TEM and ppyR genes. In the diffusion disk antibiogram, the isolate was found resistant to 14 different antibiotics belonging to 6 classes. Antimicrobial resistance was also tested using the minimum inhibitory concentration (MIC) test against imipenem, ceftazidime, ciprofloxacin, ticarcillin + clavulanic acid and aztreonam present in the MIC test strip. Treatment with amikacin and muporicin proved to be effective; however, owing to lesions extending to the face and palpebral involvement, the animal lost its eyeballs. Discussion: Pseudomonas aeruginosa is frequently associated with nosocomial infections mainly affecting immunosuppressed patients. Among the antibiotics tested, the group with the highest number of ineffective antibiotics was beta-lactams, where sensitivity was only observed for ticarcillin and ceftazidime. Recent studies have demonstrated that ceftazidime can reduce biofilm volume, inhibit motility, and repress the expression of genes associated with bacterial adhesion in P. aeruginosa. Therefore, the production of biofilm in P. aeruginosa is an important virulence factor as it facilitates a stable environment for the microorganism, which protects the bacteria from contact with antimicrobials. In addition, prolonged exposure to a wide variety of antimicrobials creates an environment of selective pressure between microorganisms, facilitating the emergence of multidrug-resistant strains. Furthermore, it is now well recognized that low doses of antibiotics, administered during continuous and fluctuating treatments, can stimulate biofilm establishment and are partly responsible for biofilm-specific antimicrobial tolerance. The resistance profile of P. aeruginosa isolated from dogs varies considerably, and the presence of isolates with a possible biofilm production capacity represents a challenge for the interpretation of the antimicrobial susceptibility profile. Culture and antibiogram is fundamentally important, both clinically and in environmental monitoring, in addition to the use of antibiogram data for decision making in clinical treatment.

Biochemical, microbiological and technological characteristics of type II sourdoughs produced with lactic acid bacteria single-strains / Características bioquímicas, microbiológicas e tecnológicas de sourdoughs tipo II produzidos com uma única cepa de bactéria ácido lática

The interplay between biochemical characteristics and the generation of volatile compounds in 11 type II sourdough fermented by single strains of lactic acid bacteria (LAB) was studied. Samples were collected at 0, 6, 9, 12, 15, 18 and 24h for analyses of microbial growth, pH, titratable acidity and CO2 production. During the first 12h, the LABs entered the stationary phase, and the formation of organic and carboxyl acids, alcohols, and esters were observed. Although acidity is an important characteristic of sourdough, in this work increasing the acetic acid content decreased yeast growth and the CO2 retention capacity of the doughs. The main carbohydrate consumed by autochthonous yeast was influenced by the LAB added (homo-or heterofermentative), as observed by correlation analysis. Maltose and glucose showed a strong and negative correlation with the yeast cell density in the dough fermented by homo and heterofermentative LAB, respectively. Moreover, LAB had an important effect on the aromatic profile, being the alcohols, aldehydes, alkanes, organics acids and esters mainly groups characterized. Altogether, 100 different volatile compounds were identified; however, each dough had a different volatile profile. This study shows, for the first time, the influence of a single strain of LAB on the characteristics of type II sourdough.(AU)

As características bioquímicas e a produção de compostos voláteis em 11 diferentes sourdough tipo II produzido com uma única cepa de bactérias do ácido láctico (BAL) em foi estudada. As amostras foram coletadas às 0, 6, 9, 12, 15, 18 e 24 h para análises de crescimento microbiano, pH, acidez titulável e produção de CO2. Durante as primeiras 12 h, as BAL entraram em fase estacionária, sendo observada a formação de ácidos orgânicos e carboxílicos, álcoois e ésteres. Embora a acidez seja uma característica importante do sourdough, neste trabalho o aumento do teor de ácido acético diminuiu o crescimento das leveduras e a capacidade de retenção de CO2 nas massas. Também foi observado que o principal carboidrato consumido pelas leveduras autóctones foi influenciado pela BAL adicionada (homo ou heterofermentativas), conforme observado pela análise de correlação. A maltose e a glicose apresentaram uma correlação forte e negativa com a densidade celular de levedura na massa fermentada por BAL homo e heterofermentativas, respectivamente. Além disso, a BAL teve efeito importante no perfil aromático, sendo os álcoois, aldeídos, alcanos, ácidos orgânicos e ésteres os principais compostos caracterizados. Ao todo, foram identificados 100 compostos voláteis diferentes; no entanto, cada massa apresentou um perfil volátil diferente. Este estudo mostra, pela primeira vez, a influência de uma única cepa de BAL nas características de sourdough tipo II.(AU)

Consortium of multifunctional microorganisms in soybean culture / Consórcio de microrganismos multifuncionais na cultura da soja

The use of multifunctional microorganisms (MM) directly benefits the growth and development of plants due to the production of phytohormones and siderophores, supply of nutrients, and assimilation of atmospheric nitrogen (N2), as well as, indirectly, by protecting plants against pathogens. In this way, the search for sustainable agricultural systems is of great importance in searching for cultivation technologiesthat provide productive increments and minimize production costs and negative environmental impacts. The study aimed to determine the effect of multifunctional microorganisms on gas exchange, grain yield, and production components in soybean plants. In the field experiment, 2019/2020 harvest, a randomized block design was used, with 32 replications. Soybean plants were treated with a consortium of microorganisms Serratia marcensens(BRM 32114) + Bacillussp.(BRM63573), and, as a control, soybean plants were treated without intercropping. Soybean plants treated with microorganisms showed an increase in photosynthetic rate (16.65%), stomatal conductance (37.50%), the internal concentration of CO2 (10.36%), a mass of 100 grains (4.04%), and yield of grains (14.83%) about untreated plants. Therefore, using a consortium of multifunctional microorganisms, combining multiple functionalities from different microorganisms, shows the potential to increase the agronomic performance of soybean plants. Co-inoculation technology appears as a strategic component of achieving sustainable agriculture.(AU)

A utilização de microrganismos multifuncionais (MM) beneficia diretamente o crescimento e desenvolvimento de plantas em decorrência da produção de fitormônios e sideróforos, suprimento de nutrientes e assimilação de nitrogênio atmosférico (N2); bem como, indiretamente, por proteger as plantas contra patógenos. Dessa forma, a busca por tecnologias de cultivo que proporcionem incrementos produtivos e minimizem custos de produção e impactos negativos ao ambiente é de grande importância na busca por sistemas agrícolas sustentáveis. O objetivo do estudo foi determinar o efeito de microrganismos multifuncionais, sobre as trocas gasosas, produtividade de grãos e componentes de produção em plantas de soja. No experimento de campo, safra 2019/2020, utilizou-se o delineamento experimental de blocos casualizados, com 32 repetições. As plantas de soja foram tratadas com o consórcio de microrganismos Serratia marcensens(BRM 32114) + Bacillus sp. (BRM63573) e, como controle, plantas de soja tratadas sem o consórcio. Plantas de soja tratadas com microrganismos apresentaram aumento na taxa fotossintética (16,65%), condutância estomática (37,50%), concentração interna de CO2(10,36%), massa de 100 grãos (4,04%) e produtividade de grãos (14,83%) em relação às plantas não tratadas. Portanto, a utilização de consórcio de microrganismos multifuncionais, ou seja, combinação de múltiplas funcionalidades advindas de diferentes microrganismos, mostra potencial em aumentar a performance agronômica de plantas de soja. O uso da tecnologia de co-inoculação figura-se como componente estratégico para alcançar a agricultura sustentável.(AU)

Evaluation of some microbiological attributes of the soil in two different management systems / Avaliação de atributos microbiológicos do solo em dois diferentes sistemas de manejo

The maintenance of organic matter in tropical soils and the use of soil quality indicators that can express its changes in sustainable agricultural systems is very important for monitoring the health of these ecosystems with high productivity and longevity. The aim of this experiment was to evaluate, through enzymatic responses of microbiological activity, variations resulting from different cultivation systems under sandy soil conditions in western of São Paulo State. In this purpose, the measurement of the parameters microbial biomass carbon (MBC), microbial biomass nitrogen (NBM), dehydrogenase (DNSE), basal respiration (BR) and the metabolic quotient (qCO2) in two culture systems characterized by being a succession of annual crops with soybean/corn (annual crops) and the other under perennial pasture of the genus Urochloa (pasture), respectively. It was verified that the two systems presented different behaviors related to the evaluated microbiological attributes, showing higher values in the evaluated microbial attributes in the area where Urochloa grass was cultivated.

A manutenção da matéria orgânica em solos tropicais e o uso de indicadores de qualidade do solo que possam expressar suas alterações em sistemas agrícolas sustentáveis é de grande importância para o monitoramento da saúde desses ecossistemas com alta produtividade e longevidade. Buscou-se neste experimento avaliar dois diferentes sistemas de cultivo sob condições de solos arenosos do oeste paulista, respostas diferentes nas atividades microbiológicas, decorrentes destes manejos. Neste sentido, procedeu-se a mensuração dos parâmetros carbono da biomassa microbiana (CBM), nitrogênio da biomassa microbiana (NBM), desidrogenase (DNASE), respiração basal (RB) e o quociente metabólico (qCO2), em dois sistemas de cultivo agrícola caracterizados por serem sucessão de culturas anuais com soja/milho (cultivos anuais) e o outro sob pastagem perene do gênero Urochloa (pastagens), respectivamente. Verificou-se que os dois sistemas apresentaram comportamentos diferentes relacionados aos atributos microbiológicos avaliados, apresentando maiores valores dos atributos biológicos na área onde havia o cultivo da gramínea do gênero Urochloa.

Farm microbiological milk culture: study case on cow performance, financial and economic aspects / Cultivo microbiológico de leite na fazenda: estudo de caso sobre desempenho de vacas, aspectos financeiros e econômicos

This study evaluated the use of microbiological culture of milk from cows with clinical mastitis (CM), and the performance and economic results after implementing this procedure. The 18-month data were obtained from a farm in Minas Gerais State, Brazil, with an average daily production of 23.1 L of milk from cows milked twice daily under a semi-intensive regime. After a case of CM was identified, a milk sample from the affected quarter was collected and sent to the farm's laboratory. First, a bi-plate containing selective growth medium was used for isolation of Gram-positive and negative bacteria (Plate 1). Subsequently, a tri-plate with selective growth medium was used for isolation of Gram-positive and negative bacteria, and bacteria of the genus Streptococcus (Plate 2). Finally, a tri-plate containing three chromogenic culture media capable of identifying 18 bacterial species was used (Plate 3). Clinical cases of mastitis were treated once a day based on the results of the microbiological culture. Two economic scenarios were evaluated (scenarios 1 and 2). Scenario 1 compared the situation if all cases of CM were treated (not using on-farm culture) vs. the use of on-farm culture (real data) and the generated savings for one year. Data from 1,582 lactations of 1,227 cows were evaluated, with 1,917 cases of CM from 636 cows recorded. The average annual incidence of CM was 48.2%. Of all cases evaluated, 76.8% were classified as grade 1 mastitis; 20% as grade 2, and 3.2% as grade 3. The incidence of new clinical cases of mastitis was 4.17% per month. From the samples analyzed on the three plates, 27.8% of the cases received a recommendation to not be treated and 72.2% received a recommendation of treatment. However, only 18.6% were not treated, making a total of 81.4% treated cases. Of the clinical cases that did not receive intramammary antibiotic therapy, 84.3% had a clinical cure. Conversely, the clinical cure rate reached 84% for the cases that received intramammary antibiotic therapy. In scenario 1, the total operational cost of the clinical case decreased by 10.3% after the implementation of the on-farm culture, with an 18.4% reduction in the use of antibiotics. In scenario 2, there was a 5.5% reduction in the cost of the clinical case and an 11.8% reduction in the use of antibiotics. Thus, the implementation of on-farm culture and the applied methodology, enhanced treatment accuracy of CM cases, reducing the total operating cost of the case and the use of antibiotics on the farm.

O objetivo deste estudo foi avaliar a utilização da cultura microbiológica de leite de vacas com mastite clínica (MC), os resultados zootécnicos e econômicos após implementação desse procedimento. Dados de 18 meses foram obtidos em uma fazenda em Minas Gerais com produção média de 23,1 L de leite/vaca/dia, em duas ordenhas diárias em regime semi-intensivo. Após a identificação da MC, uma amostra de leite do quarto afetado foi coletada e encaminhada para laboratório da fazenda. Primeiramente foi utilizada placa bipartida em meio de cultura seletivo para crescimento de bactérias Gram-positivas e negativas (Placa 1), seguindo-se para a utilização da placa tri-partida com meios de cultura seletivos para crescimento de bactérias Gram-positivas e negativas e bactérias do gênero Streptococcus (Placa 2) e posteriormente para placa tripartida, contendo três meios de cultura cromogênicos, capazes de identificar 18 espécies bacterianas (Placa 3). Foram avaliados dados de 1.227 vacas em 1.582 lactações, sendo registrados 1.917 casos de MC. Os casos clínicos de mastite foram tratados uma vez ao dia com base nos resultados da cultura microbiológica. Foram realizadas duas avaliações financeiras (cenário 1 e 2). O cenário 1 comparou a situação se todos os casos de MC fossem tratados (ausência de cultura na fazenda), comparado com a utilização da cultura na fazenda (dados reais) e as economias de recursos geradas durante o período de um ano. O cenário 2 utilizou os resultados reais após a economia de recursos gerados pela cultura, seguindo a recomendação ideal de tratamento. Foram avaliados 1.917 casos de MC (636 animais), totalizando incidência média anual de 48,2%. Do total dos casos avaliados, 76,8% foram classificados como mastite grau 1; 20% grau 2 e 3,2% grau 3. A incidência de novos casos clínicos de mastite foi de 4,17% ao mês. Das amostras analisadas nas três placas, 27,8% dos casos receberam a recomendação de não serem tratados e 72,2% de tratamento. Entretanto, apenas 18,6% realmente não foram tratados, totalizando 81,4% de tratamentos. Dos casos clínicos que não receberam antibioticoterapia intramamária, 84,3% apresentaram cura clínica. Já os casos que passaram por antibioticoterapia intramamária, a taxa de cura clínica foi de 84,0%. No primeiro cenário, após a implementação da cultura na fazenda, o custo operacional total do caso clínico reduziu em 10,3%, com redução de 18,4% de utilização de antibióticos. Já no segundo cenário, houve redução de 5,5% no custo do caso clínico e redução de 11,8% na utilização de antibióticos. A implementação da cultura na fazenda e a metodologia aplicada, promoveu maior assertividade dos tratamentos dos casos de MC, com redução do custo operacional total do caso e da utilização de antibióticos na propriedade.

Quality assessment of amazonian fish from fish farming stored on ice / Avaliação da qualidade de pescados amazônicos provenientes de piscicultura armazenados em gelo

The cultivation of natives Amazonian fish such as tambaqui (Colossoma macropomum), pirapitinga (Piaractus brachypomus), tambatinga (female, Colossoma macropomum X Piaractus brachypomus, male) and Pintando da Amazônia (female, Pseudoplatystoma sp. X Leiarius marmoratus, male) temmoratus, increased in recent years, making studies related to the validity of these foods after processing necessary. Therefore, the aimed of the study was to evaluate the sensory, microbiological (Staphylococcus coagulase positive count and presence of Salmonella spp.) and chemical (pH and Total Volatile Bases (TVB) quality of fresh gutted fish stored on ice. Nine specimens of each species were used, all cultivated in an excavated tanks. The fasting time ranged from 16 to 48 hours, depending on the species, the fish was slaughtered by means of cold shock. The fish was gutted and stored in the fish fridge. Sensory analysis was performed by a trained team available. For other analyses, it was sent to a laboratory specializing in food analysis. The sensory analysis of fresh eviscerated tambaqui was characteristic of the species until the 15th day of storage. Fresh eviscerated pirapitinga presented until the 16th day. The fresh eviscerated tambatinga hybrid was kept until the 14th day of storage. And for the Pintado da Amazônia, the organoleptic characteristics were presentable until the 12th day of storage. The microbiological and physical-chemical analyzes were in accordance with Brazilian legislation in all specimens of the analyzed species. It was observed that the longer the fasting period, there was a numerical increase in the pH of the fish meat.(AU)

O cultivo de peixes nativos da Amazônia como tambaqui (Colossoma macropomum), pirapitinga (Piaractus brachypomus), tambatinga (fêmea, Colossoma macropomum X Piaractus brachypomus, macho) e o pintado da Amazônia (fêmea, Pseudoplatystoma sp. X Leiarius marmoratus, macho) tem aumentado nos últimos anos, fazendo com que estudos relacionados a validade desses alimentos após o processamento sejam necessários. Por isso, o objetivo do estudo foi avaliar os parâmetros de qualidade senso-rial, microbiológica (contagem de Staphylococcus coagulase positiva e presença de Salmonella spp.) e química (pH e Bases Voláteis Totais (BVT)) deses pescados eviscerados frescos armazenados em gelo. Foram utilizados 9 exemplares de cada espécie, todos de origem de cultivo em viveiro escavado. O tempo de jejum variou de 16 a 48 horas, dependendo da espécie, o abate do pescado foi por meio de choque térmico. O pescado foi eviscerado e armazenado no frigorifico de pescado. Analise sensorial foi realizada por uma equipe treinada disponível. Para as demais análises foi enviado para um laboratório especializado em análises de alimentos. A análise sensorial do tambaqui eviscerado fresco estava característica da espécie até o 15°dia de estocagem. A pirapitinga evisce-rado fresco apresentou até o 16°dia. O hibrido tambatinga eviscerado fresco foi até o 14°dia de estocagem. E para o pintado da Amazônia as características organolépticas estavam apresentáveis até o dia 12° dia de armazenamento. As analises microbiológicas e físico químicas estavam de acordo com a legislação brasileira em todos os exemplares das espécies analisadas. Foi observado que quanto maior o tempo de jejum, houve um aumento numérico no pH da carne dos pescados.(AU)

Indirect ELISA as a complementary diagnostic method of bovine tuberculosis / ELISA indreto como método complementar de diagnóstico da tuberculose bovina

Bovine tuberculosis is an economic and health problem, requiring precise diagnostic methods for its control and eradication. The aim of this study was to evaluate the performance of a commercial enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) test for the diagnosis of bovine tuberculosis. A total of 1,644 cattle from eight dairy herds were evaluated using the comparative cervical tuberculin test (CCTT). Three of the herds had no recent tuberculosis infection, and the other five had shown positive results in a previous tuberculin test. For the serological diagnosis of tuberculosis, a commercial ELISA antibody test kit for Mycobacterium bovis was used. Serum samples from 846 cattle from the eight herds were evaluated using ELISA for M. bovis. Animals that were positive based on either CCTT or ELISA for M. bovis or both were sent to slaughter. Samples of their lungs, livers, and lymph nodes were collected and stored under refrigeration for microbiological culture and subsequent confirmation by polymerase chain reaction. Samples from the same tissues were also fixed with 10% formaldehyde in bottles for histopathological examination and stained with hematoxylin and eosin (HE). Of the 1,644 cattle, 61 were considered positive and 65 inconclusive based on CCTT. Retesting of the inconclusive samples identified an additional 19 positive cases, totaling 80 (4.8%) CCTT-positive animals from five herds. ELISA for M. bovis identified 4.2% (36/846) positive cattle, of which 35 were considered negative and one inconclusive based on CCTT. Of the 36 positive cases identified by ELISA for M. bovis, 27 were euthanized, 11% (3/27) showed suggestive lesions of tuberculosis on macroscopic examination, and two were confirmed by histological, microbiological, and PCR methods. The weak association of ELISA for M. bovis with the results obtained by macroscopic, histological, and microbiological isolation indicates the fragility of ELISA performance in field conditions. Therefore, it is suggested that its use as a complementary method for herd sanitation be based on the local epidemiological situation.

A tuberculose bovina é um problema econômico mundial e de saúde, que requer métodos de diagnóstico precisos para controle e erradicação. Objetivou-se com este estudo avaliar o desempenho de um teste comercial de ELISA no diagnóstico da tuberculose bovina. Foram avaliados pelo teste cervical comparativo (TCC) 1644 bovinos, provenientes de oito rebanhos de exploração leiteira, sendo três deles sem histórico recente da doença, e outros cinco com resultados positivos no último exame de tuberculinização. Para o diagnóstico sorológico da tuberculose utilizou-se um kit comercial de ELISA Mycobacterium bovis antibody test (ELISA M. bovis). Amostras de soro sanguíneo de 846 bovinos provenientes dos mesmos rebanhos foram também avaliadas no ELISA M. bovis. Os bovinos positivos no TCC e/ou ELISA M. bovis foram encaminhados para o abate sanitário. Dos positivos no ELISA para M. bovis foi realizado o exame macroscópico das carcaças e classificação das mesmas em: com presença ou ausência de lesões. Amostras de pulmão, fígado, e linfonodos, foram colhidas em duplicata para realização dos exames de cultivo microbiológico com posterior confirmação por PCR, e exame histopatológico com coloração de hematoxilina e eosina (HE). Dos 1,644 bovinos, 61 foram considerados positivos e 65 inconclusivos no TCC. O reteste dos inconclusivos identificou mais 19 positivos. No total, 80 (4,8%) bovinos positivos no TCC, provenientes de 5 rebanhos foram encaminhados para abate. O ELISA para M. bovis identificou 4,2% (36/846) de bovinos positivos, sendo 36 considerados negativos e um inconclusivo no exame de tuberculinização. Dos positivos no ELISA para M. bovis, 27 foram eutanasiados, e no exame macroscópico das carcaças 11% (3/27) dos animais apresentaram lesões sugestivas de tuberculose, e em apenas dois houve confirmação da doença pelos métodos histológico, microbiológico e PCR. A baixa associação dos resultados obtidos no ELISA para M. bovis com os exames macroscópico, histológico e isolamento microbiológico apontam para a fragilidade do desempenho do ELISA para o diagnóstico de tuberculose. Sugere-se assim que seu uso como método complementar para saneamento de rebanhos, seja adotado com cautela e considere a situação epidemiológica local.

Detection of Salmonella spp. in eggs for human consumption from poultry farms in municipalities of Alagoas State, Brazil / Detecção de Salmonella spp. em ovos destinados ao consumo humano de propriedades familiares avícolas em municípios do Estado de Alagoas, Brasiil

Salmonellosis is a disease that worries poultry farmers and can seriously impact the food safety of the population that consumes products of animal origin. The present study sought to detect the presence of Salmonella spp. in eggs intended for consumption from family poultry farms in municipalities of Alagoas State. The study was carried out from eight farms, where the sample from each farm was obtained by making pools of shell and internal contents of six randomly selected eggs. The pools were submitted to microbiological culture and the colonies were characterized and evaluated by means of laboratory tests. To this end, 50% (4/8) of the shell samples and 75% (6/8) of the internal contents of the eggs were positive for Salmonella spp. In addition, Klebsiella pneumoniae 12.5% (1/8) and Proteus spp. 25% (2/8) were found in the shell samples, and Yersinia spp. 12.5% (1/8) in the internal contents of the eggs. Salmonella spp. and other enterobacteria were confirmed to occur in eggs intended for consumption. The way the birds were raised did not seem to have a significant influence on the results obtained, and the presence of passerines on the farms may have contributed to the existence of bacteria there. Being aware of the risk to public health that some of these bacteria can present, it is necessary to take decisions that support the small producer in search of food safety for all.(AU)

A Salmonelose é uma doença que preocupa os criadores de aves e pode impactar seriamente a segurança alimentar da população que consome produtos de origem animal. O presente estudo buscou detectar a presença de Salmonella spp. em ovos destinados ao consumo provindos de aviculturas familiares de municípios do Estado de Alagoas. O estudo foi realizado a partir de oito granjas, onde a amostra de cada uma delas foi obtida pela confecção de pools de casca e de conteúdo interno de seis ovos selecionados aleatoriamente. Os pools foram submetidos a cultivo microbiológico e as colônias caracterizadas e avaliadas por meio de testes laboratoriais. Para tanto, 50% (4/8) das amostras de casca e 75% (6/8) das amostras de conteúdo interno dos ovos foram positivos para Salmonella spp. Além disso, também fora constatada a presença de Klebsiella pneumoniae12.5% (1/8) e Proteus spp. 25% (2/8) nas amostras de casca, e a presença de Yersinia spp. 12.5% (1/8) no conteúdo interno dos ovos. Foi confirmada a ocorrência de Salmonella spp. e outras enterobactérias em ovos destinados ao consumo. O modo de criação das aves não parece ter influenciado significativamente nos resultados obtidos e a presença de passeriformes nas granjas podem ter contribuído com a existência das bactérias no local. Tendo ciência do risco à saúde pública que algumas dessas bactérias podem apresentar, se faz necessária a tomada de decisões que apoiem o pequeno produtor em busca de uma segurança alimentar para todos.(AU)

Mannheimia varigena as the etiologic agent of lameness and coronary band lesion in cattle / Mannheimia varigena como agente etiológico de claudicação e lesão na banda coronária em bovinos

Mannheimia varigena was identified as the etiologic agent of lameness and coronary band lesion in 30% of cattle in a farm located in Rio Grande do Sul, Brazil. Swab samples from the lesions were cultured in McConkey Agar and Blood Agar for microbiological identification. Culture growth was submitted to Gram staining and Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) identification. Antimicrobial susceptibility test based on disc diffusion was performed for three antibiotics: ceftiofur, gentamicin and florfenicol. Furthermore, molecular characterization of 16S rDNA gene sequencing was performed and the data was used in a phylogenetic analysis. For that purpose, total DNA was extracted by thermo extraction directly from the bacterial colonies and the polymerase chain reaction (PCR) was performed. Gram-negative Mannheimia varigena strain LBV010/22 was identified as the causative of the lesions. The strain was susceptible to all antibiotics tested. The phylogenetic analysis demonstrated that the analyzed strain is closely related to M. varigena strains from pyelonephritis and respiratory tract. Overall, this is the first report of M. varigena as the causative agent of coronary band injury in bovine. Therefore, our findings show the importance of an accurate microbiological identification of infectious agent in lameness cases in order to prevent the occurrence and perform an appropriate treatment in the future.

Mannheimia varigena foi identificada como agente etiológico de claudicação e lesão de banda coronária em 30% dos bovinos de uma fazenda localizada no Rio Grande do Sul, Brasil. Amostras de swab das lesões foram cultivadas em Ágar McConkey e Ágar Sangue para identificação microbiológica. O crescimento da cultura foi submetido à coloração de Gram e identificação por Espectrometria de Massa de Ionização por Dessorção a Laser Assistida por Matriz (MALDI-TOF MS). O teste de suscetibilidade antimicrobiana baseado na difusão em disco foi realizado para três antibióticos: ceftiofur, gentamicina e florfenicol. Além disso, foi realizada a caracterização molecular do sequenciamento do gene 16S rDNA e o resultado utilizado para análise filogenética. Para tanto, o DNA total foi extraído por termoextração diretamente das colônias bacterianas e uma reação em cadeia da polimerase (PCR) foi realizada. Foi identificada como causadora das lesões a cepa gram-negativa de Mannheimia varigenaLBV010/22. Ela foi suscetível a todos os antibióticos testados. A análise filogenética demonstrou que a cepa analisada está intimamente relacionada às M. varigena presentes em pielonefrite e no trato respiratório. No geral, este é o primeiro relato de M. varigenacomo agente causador de lesão de banda coronária em bovinos. Portanto, nossos achados mostram a importância de uma identificação microbiológica precisa do agente infeccioso nos casos de claudicação, a fim de prevenir a ocorrência e realizar um tratamento adequado no futuro.

Use of ozone in the culture medium of zebrafish (Danio rerio) embryos / Uso do ozônio no meio de cultura para embriões de zebrafish (Danio rerio)

In this study, we sought to demonstrate the toxicity of different concentrations of ozonated water in zebrafish embryos up to 120 hours postfertilization (hpf ) and their antimicrobial activity advantages. For the test, we placed 40 embryos per treatment in Petri dishes containing 30 ml of solution to be tested. The ozone concentrations used were calculated from an initial concentration of 72 µg/ml using the O&L 1.5 RM ozone generator (Ozone & Life, Brazil). Five serial dilutions 1:1 was performed in egg water to produce the ozone treatments. We also analyzed a treatment with 30 ml of egg water without ozone, with only the addition of methylene blue, and a treatment with 30 ml of egg water without the addition of any antifungal agent. The plates were incubated at 28 ± 1°C, and the embryos were analyzed daily until 120 hpf. The survival rate, incubation period, and possible deformities were analyzed. In addition, egg water microbiological analyses were performed to detect total coliforms and fungi and yeasts. The data were tested for normality, and analysis of variance was performed within Minitab®version 1.8 software. The results showed that there was no significant difference in embryo survival or hatching rate between treatments with different ozone concentrations (p > 0.05), and no embryonic deformities were found under any of the ozone concentrations evaluated. It can be concluded that ozone within the concentrations analyzed is not toxic to zebrafish embryos and has antifungal and antimicrobial action.(AU)

Neste estudo, procuramos demonstrar a toxicidade de diferentes concentrações de água ozonizada em embriões de zebrafish até 120 horas pós-fertilização (hpf ) e suas vantagens na atividade antimicrobiana. Para o teste, colocamos 40 embri-ões por tratamento em placas de Petri contendo 30 ml da solução a ser testada. As concentrações de ozônio utilizadas foram calculadas a partir de uma concentração inicial de 72 µg/ml usando o gerador de ozônio O&L 1,5 RM (Ozone & Life, Brasil). Foram realizadas cinco diluições seriadas 1:1 em Egg Water. Também analisamos um tratamento com 30 ml de Egg Water sem ozônio, apenas com adição de azul de metileno, e um tratamento com 30 ml de Egg Water sem adição de nenhum agente antifúngico. As placas foram incubadas a 28 ± 1°C e os embriões foram analisados diariamente até 120 hpf. A taxa de sobrevi-vência, período de incubação e possíveis deformidades foram analisados. Além disso, foram realizadas análises microbiológicas da Egg Water para detectar coliformes totais, fungos e leveduras. Os dados foram testados quanto à normalidade e a análise de variância foi realizada no software Minitab® versão 1.8. Os resultados mostraram que não houve diferença significativa na sobrevivência de embriões ou taxa de eclosão entre os tratamentos com diferentes concentrações de ozônio (p > 0,05), e não foram encontradas deformidades embrionárias sob nenhuma das concentrações de ozônio avaliadas. Pode-se concluir que o ozônio dentro das concentrações analisadas não é tóxico para embriões de zebrafish e possui ação antifúngica e antimicrobiana.(AU)

Streptococcus spp. in equines - infection and antimicrobial susceptibility profiles

Background: Empirical antimicrobial prescribing is commonly used in equine veterinary. Therefore, professionals can obtain information about antimicrobial susceptibility profile of the bacterial strains based on veterinary literature. Considering equine infections, Streptococcus spp. are important pathogens that can cause serious damage in horses. Therefore, the aim of this study was to describe the antimicrobial susceptibility testing (AST) and infection profiles of Streptococcus spp. strains isolated from equines with infectious diseases subjected to microbiological analysis. Materials, Methods & Results: Veterinarians sent 13 samples and culture in Blood and MacConkey Agar were performed. After the incubation period, suspected colonies, which showed significative growth, were analyzed by Gram-staining, biochemical tests, and subjected to confirmatory identification in Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight Mass Spectrometry. In vitro AST analysis were performed by disc diffusion method, in accordance with the veterinarians' request. The antimicrobials tested in this study were: ceftiofur, gentamicin, ampicillin, enrofloxacin, amikacin, penicillin, trimethoprim-sulfamethoxazole, ciprofloxacin, doxycycline, vancomycin and metronidazole. The samples included uterine exudate, hock fistula, osteosynthesis exudate, exudate from the guttural pouch, and were originated from animals located in different and distant geographical regions in the cities of Porto Alegre, Pelotas, and Bagé, Rio Grande do Sul, Brazil. Streptococcus dysgalactiae, Streptococcus equi and Streptococcus thoraltensis were the Streptococcus species identified in the samples. S. dysgalactiae was the mainly species found in the uterus samples, while S. thoraltensis, an unusual Streptococcus species, was identified as etiological agent of endometritis in 2 of the analyzed animals. On the other hand, S. equi was found in both the guttural pouch, representing the etiological agent of the strangle case, and in the osteosynthesis exudate, as infectious agent of post-osteosynthesis surgery. The majority of streptococci strains were susceptible to ceftiofur drug. Amikacin and ciprofloxacin, however, were the drugs for which the strains were mainly resistant according to the results. Discussion: The present study provided the AST and infection profile of Streptococcus species related to equine infectious diseases. S. dysgalactiae is considered an unusual bacterium isolated from horses that can be related to endometritis, S. equi is the causative agent of strangles, and S. thoraltensis is unusual in equines. Generally, the observed susceptibility to ceftiofur of the strains analyzed was in agreement with previous results reported in the literature. However, ceftiofur is a third-generation cephalosporin and is considered a critically important antibiotic for human health and its use in veterinary medicine should be cautious. Considering the resistance profile found, Streptococcus spp. can be intrinsically resistant to low drug concentrations of aminoglycosides. Moreover, the emergence and spread of fluoroquinolones resistance may also be due to the acquisition of resistance via horizontal gene transfer. Therefore, the present study described both infection and antimicrobial susceptibility patterns of Streptococcus strains related to equine infectious diseases. Considering the findings, the results found in this study might contribute to the decision-making by veterinarians to further equine treatments.