Genetic diversity of Lippia rotundifolia Cham. in Minas Gerais, Brazil

Lippia rotundifolia is an aromatic species, endemic from Campos rupestres and isolated by mountains. We aimed with the research to study the genetic variability of chá-de-pedestre (Lippia rotundifolia Cham.) with natural occurrence in ten places of the State of Minas Gerais, from molecular markers of ISSR type. The places of collection were: Parque Estadual de Serra Nova; Parque Estadual Veredas do Peruaçu; Abóboras community; Gigante community; edge of Rio do Peixe; environmental preservation area of Olhos d´água; private property in Joaquim Felício; Parque Estadual do Rio Preto; São Gonçalo do Rio das Pedras and brook of Rio Tigre. After the establishment of the extraction and amplification of DNA fragments with primers ISSR, an array of genetic distance was built. From this matrix, we analyzed the genetic diversity index as the allelic frequency (Na and Ne), Shannos´s index (H´), polymorphism (PLP), heterozygosity (He) and gene flow (Nm). The result showed higher genetic variability within the population (93%). The genetic diversity index was low (He = 0.132; H´= 0.214; Na = 1.111; Ne = 1.183; PLP = 56.67%). In general the species have low genetic diversity. The greatest diversity in populations occurred with an average temperature of 20°C. The Rio Tigre showed higher genetic distance and isolation.

Genetic diversity of Lippia rotundifolia Cham. in Minas Gerais, Brazil

Lippia rotundifolia is an aromatic species, endemic from Campos rupestres and isolated by mountains. We aimed with the research to study the genetic variability of chá-de-pedestre (Lippia rotundifolia Cham.) with natural occurrence in ten places of the State of Minas Gerais, from molecular markers of ISSR type. The places of collection were: Parque Estadual de Serra Nova; Parque Estadual Veredas do Peruaçu; Abóboras community; Gigante community; edge of Rio do Peixe; environmental preservation area of Olhos d´água; private property in Joaquim Felício; Parque Estadual do Rio Preto; São Gonçalo do Rio das Pedras and brook of Rio Tigre. After the establishment of the extraction and amplification of DNA fragments with primers ISSR, an array of genetic distance was built. From this matrix, we analyzed the genetic diversity index as the allelic frequency (Na and Ne), Shannos´s index (H´), polymorphism (PLP), heterozygosity (He) and gene flow (Nm). The result showed higher genetic variability within the population (93%). The genetic diversity index was low (He = 0.132; H´= 0.214; Na = 1.111; Ne = 1.183; PLP = 56.67%). In general the species have low genetic diversity. The greatest diversity in populations occurred with an average temperature of 20°C. The Rio Tigre showed higher genetic distance and isolation.(AU)

Cross-amplification of heterologous microsatellite markers in Piracanjuba / Amplificação cruzada de marcadores microssatélites heterólogos em piracanjuba

Brycon orbignyanus, popularly known in Brazil as piracanjuba, is a fish with great economic value but whose natural population drastically decreased in number during the last years. In this context, genetic variability studies of natural stocks and in restocking programs are fundamental for the adoption of conservation measures. Current analysis verifies the cross-amplification of heterologous primers in B. orbignyanus. Fifty-two primers of the species Brycon opalinus, Brycon hilarii, Brycon insignis, Prochilodus sp., Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum and Oreochromis niloticus were tested. Primers with the best reproducibility were applied to a sample of 20 individuals and the genetic parameters were calculated. Nine primers provided good results for cross-amplification with B. orbignyanus, involving (BoM5 and BoM13) of Brycon opalinus, (Bh5, Bh6, Bh8, Bh13 and Bh16) of Brycon hilarii, (Bc48-10) of Brycon insignis and (Par80) of Prochilodus argenteus. Primers of Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum and Oreochromis niloticus failed to provide amplification or provided non-specificity. Results demonstrated the possibility of using primers of different species and genera of B. orbignyanus, facilitating genetic studies on the species.

A piracanjuba (Brycon orbignyanus) é um peixe de grande valor econômico que nos últimos anos tem apresentado uma redução drástica em suas populações naturais. Nesse contexto, estudos de variabilidade genética dos estoques naturais e nos programas de repovoamento são fundamentais para adoção de medidas conservacionistas. O objetivo do presente trabalho foi verificar a amplificação cruzada de primers heterologos em B. orbignyanus. Foram avaliados um total de 52 primers das espécies Brycon opalinus, Brycon hilarii, Brycon insignis, Prochilodus sp., Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum e Oreochromis niloticus. Os primers com melhor reprodutibilidade foram aplicados a uma amostra de 20 indivíduos e os parâmetros genéticos foram calculados. Nove primers apresentaram resultados satisfatórios de amplificação cruzada com B. orbignyanus, sendo das espécies Brycon opalinus (BoM5 e BoM13), Brycon hilarii (Bh5, Bh6, Bh8, Bh13 e Bh16), Brycon insignis (Bc48-10) e Prochilodus argenteus (Par80). Os primers de Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum e Oreochromis niloticus não apresentaram amplificação ou apresentaram inespecificidade. Os resultados revelaram a possibilidade da utilização de primers de diferentes espécies e gênero em B. orbignyanus, o que facilita a realização de estudos genéticos nessa espécie.

Cross-amplification of heterologous microsatellite markers in Piracanjuba / Amplificação cruzada de marcadores microssatélites heterólogos em piracanjuba

Brycon orbignyanus, popularly known in Brazil as piracanjuba, is a fish with great economic value but whose natural population drastically decreased in number during the last years. In this context, genetic variability studies of natural stocks and in restocking programs are fundamental for the adoption of conservation measures. Current analysis verifies the cross-amplification of heterologous primers in B. orbignyanus. Fifty-two primers of the species Brycon opalinus, Brycon hilarii, Brycon insignis, Prochilodus sp., Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum and Oreochromis niloticus were tested. Primers with the best reproducibility were applied to a sample of 20 individuals and the genetic parameters were calculated. Nine primers provided good results for cross-amplification with B. orbignyanus, involving (BoM5 and BoM13) of Brycon opalinus, (Bh5, Bh6, Bh8, Bh13 and Bh16) of Brycon hilarii, (Bc48-10) of Brycon insignis and (Par80) of Prochilodus argenteus. Primers of Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum and Oreochromis niloticus failed to provide amplification or provided non-specificity. Results demonstrated the possibility of using primers of different species and genera of B. orbignyanus, facilitating genetic studies on the species.(AU)

A piracanjuba (Brycon orbignyanus) é um peixe de grande valor econômico que nos últimos anos tem apresentado uma redução drástica em suas populações naturais. Nesse contexto, estudos de variabilidade genética dos estoques naturais e nos programas de repovoamento são fundamentais para adoção de medidas conservacionistas. O objetivo do presente trabalho foi verificar a amplificação cruzada de primers heterologos em B. orbignyanus. Foram avaliados um total de 52 primers das espécies Brycon opalinus, Brycon hilarii, Brycon insignis, Prochilodus sp., Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum e Oreochromis niloticus. Os primers com melhor reprodutibilidade foram aplicados a uma amostra de 20 indivíduos e os parâmetros genéticos foram calculados. Nove primers apresentaram resultados satisfatórios de amplificação cruzada com B. orbignyanus, sendo das espécies Brycon opalinus (BoM5 e BoM13), Brycon hilarii (Bh5, Bh6, Bh8, Bh13 e Bh16), Brycon insignis (Bc48-10) e Prochilodus argenteus (Par80). Os primers de Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum e Oreochromis niloticus não apresentaram amplificação ou apresentaram inespecificidade. Os resultados revelaram a possibilidade da utilização de primers de diferentes espécies e gênero em B. orbignyanus, o que facilita a realização de estudos genéticos nessa espécie.(AU)

Vasovagal tonus index in dog with myxomatous mitral valve disease / Índice de tônus vasovagal em cães com doença mixomatosa da valva mitral

The vasovagal tonus index (VVTI) is a useful and assessable index, obtained from standard ECG recordings, that is used to estimate heart rate variability (HRV), and may provide valuable information regarding the likelihood of progression into congestive heart failure (CHF). In this paperwork, we investigated how the vasovagal tonus index (VVTI) behaves in dogs with naturally-occurring myxomatous mitral valve disease (MMVD) Electrocardiographic (ECG) recordings and echocardiographic data of 120 patients diagnosed with MMVD were reviewed. The VVTI was calculated from twenty consecutive RR intervals for each dog enrolled in the study. Lower VVTI values were found in MMVD patients in American College of Veterinary Internal Medicine (ACVIM) stage C compared with stages B1 and B2. Values were also lower in patients with severe cardiac remodeling. When a cut-off value of 6.66 is used, VVTI was able to discriminate MMVD patients in stage C from B1 and B2 dogs with a sensitivity of 70 per cent and a specificity of 77 per cent. MMVD dogs in which VVTI is lower than 6.66 are 30% more likely to develop congestive heart failure (CHF).(AU)

O índice de tônus vasovagal (ITVV) é uma ferramenta útil e acessível, obtida por meio de traçados eletrocardiográficos convencionais (ECG), utilizada para calcular a variabilidade da frequência cardíaca (VFC), podendo também fornecer informações valiosas referentes à probabilidade de desenvolvimento de insuficiência cardíaca congestiva (ICC). Neste trabalho, foi investigado como o ITVV se comporta em cães com degeneração mixomatosa da valva mitral (DMVM) de ocorrência natural, ECGs e exames ecocardiográficos de 120 pacientes diagnosticados com DMVM foram avaliados. O ITVV foi calculado a partir de 20 intervalos RR consecutivos para cada cão envolvido. Valores menores de ITVV foram encontrados em pacientes em estágio C de doença mitral pela classificação do American College of Veterinary Internal Medicine (ACVIM), comparado com pacientes em estágio B1 e B2. Valores também foram menores em pacientes com remodelamento cardíaco importante. Quando um valor de corte de 6,66 foi usado, o ITVV foi capaz de distinguir pacientes em estágio C de B1 e B2 com uma sensibilidade de 70 por cento e uma especificidade de 77 por cento. Cães com DMVM cujo ITVV é menor que 6,66 são 30% mais propensos a evoluírem para ICC.(AU)

Vasovagal tonus index in dog with myxomatous mitral valve disease / Índice de tônus vasovagal em cães com doença mixomatosa da valva mitral

The vasovagal tonus index (VVTI) is a useful and assessable index, obtained from standard ECG recordings, that is used to estimate heart rate variability (HRV), and may provide valuable information regarding the likelihood of progression into congestive heart failure (CHF). In this paperwork, we investigated how the vasovagal tonus index (VVTI) behaves in dogs with naturally-occurring myxomatous mitral valve disease (MMVD) Electrocardiographic (ECG) recordings and echocardiographic data of 120 patients diagnosed with MMVD were reviewed. The VVTI was calculated from twenty consecutive RR intervals for each dog enrolled in the study. Lower VVTI values were found in MMVD patients in American College of Veterinary Internal Medicine (ACVIM) stage C compared with stages B1 and B2. Values were also lower in patients with severe cardiac remodeling. When a cut-off value of 6.66 is used, VVTI was able to discriminate MMVD patients in stage C from B1 and B2 dogs with a sensitivity of 70 per cent and a specificity of 77 per cent. MMVD dogs in which VVTI is lower than 6.66 are 30% more likely to develop congestive heart failure (CHF).(AU)

O índice de tônus vasovagal (ITVV) é uma ferramenta útil e acessível, obtida por meio de traçados eletrocardiográficos convencionais (ECG), utilizada para calcular a variabilidade da frequência cardíaca (VFC), podendo também fornecer informações valiosas referentes à probabilidade de desenvolvimento de insuficiência cardíaca congestiva (ICC). Neste trabalho, foi investigado como o ITVV se comporta em cães com degeneração mixomatosa da valva mitral (DMVM) de ocorrência natural, ECGs e exames ecocardiográficos de 120 pacientes diagnosticados com DMVM foram avaliados. O ITVV foi calculado a partir de 20 intervalos RR consecutivos para cada cão envolvido. Valores menores de ITVV foram encontrados em pacientes em estágio C de doença mitral pela classificação do American College of Veterinary Internal Medicine (ACVIM), comparado com pacientes em estágio B1 e B2. Valores também foram menores em pacientes com remodelamento cardíaco importante. Quando um valor de corte de 6,66 foi usado, o ITVV foi capaz de distinguir pacientes em estágio C de B1 e B2 com uma sensibilidade de 70 por cento e uma especificidade de 77 por cento. Cães com DMVM cujo ITVV é menor que 6,66 são 30% mais propensos a evoluírem para ICC.(AU)

A double-antibody sandwich ELISA based on the porcine circovirus type 2 (PCV2) propagated in cell culture for antibody detection / Sandwich ELISA com duplo anticorpo baseado no circovirus suíno tipo 2 (PCV2) produzido em cultivo celular para detecção de anticorpos

Few studies have described enzyme-linked immunosorbent assays (ELISAs) for the detection of antibodies against porcine circovirus type 2 (PCV2) based on antigens produced in cell culture. Furthermore, few articles have described viral purification techniques for members of the family Circoviridae. This occurs because circoviruses are difficult to isolate, noncytopathogenic, and produce low viral titres in cell culture. Thus, for overcoming these difficulties in the cultivation of PCV2, this study aimed to develop a double-antibody sandwich ELISA based on the cell culture antigen PCV2b for the quantification of anti-PCV2 antibodies. A 20% and 50% discontinuous sucrose cushion was used for viral purification, which enabled the separation of cell culture proteins in the 20% sucrose cushion and a greater viral concentration in the 50% sucrose cushion. Following isopycnic centrifugation, PCV2 was concentrated in the band with density values from 1.330 to 1.395g/cm3. Viral purification was assessed using SDS-PAGE, indirect ELISA and electron microscopy. The standardised ELISA revealed a strong linear correlation (r= 0.826, p<0.001) when compared with a commercial ELISA kit. The assay exhibited low variability (inter-assay coefficient of variation of 4.24% and intra-assay of 1.80%) and excellent analytical specificity conferred by the capture antibody produced in rabbit. Thus, this ELISA is a rapid, specific and convenient method for the detection of antibodies against PCV2 in studies of experimental and natural infection, and in monitoring the response to vaccination on commercial farms.(AU)

Há poucos relatos na literatura de métodos de ELISA (Enzyme-linked immunosorbent assay), para a detecção de anticorpos contra o circovírus suíno tipo 2 (PCV2), baseados em antígenos produzidos em cultivo celular, bem como uma escassez de trabalhos descrevendo técnicas de purificação viral para os membros da família Circoviridae. Isso ocorre, pois os circovírus são de difícil isolamento, não causam efeito citopático e produzem um baixo título viral em cultivo celular. Assim, para superar essas dificuldades encontradas no cultivo do PCV2, este estudo objetivou desenvolver um sandwich ELISA com duplo anticorpo, baseado no antígeno de PCV2 produzido em cultivo celular, para a quantificação de anticorpos anti-PCV2. Um colchão de sacarose descontínuo a 20% e 50% foi utilizado para a purificação viral, o qual possibilitou a separação das proteínas oriundas do cultivo celular no colchão de sacarose a 20% e uma maior concentração viral no colchão de sacarose a 50%. Com a ultracentrifugação isopícnica, o PCV2 ficou mais concentrado na banda com valores de densidade de 1,330 a 1,395g/cm3. A purificação viral foi avaliada pelas técnicas de SDS-PAGE, ELISA indireto e microscopia eletrônica. Assim, o método de ELISA padronizado revelou uma forte correlação linear (r = 0,826, p <0,001) quando comparado com um kit de ELISA comercial. O ensaio demonstrou baixa variabilidade (coeficientes de variação inter-teste de 4,24% e intra-teste de 1,80%) e uma excelente especificidade analítica conferida pelo anticorpo de captura produzido em coelho. Portanto, o método de ELISA demonstrou ser rápido, específico e conveniente para a detecção de anticorpos contra o PCV2 em estudos de infecção natural e experimental, além da monitoria da resposta à vacinação contra o PCV2 em granjas comerciais.(AU)

A double-antibody sandwich ELISA based on the porcine circovirus type 2 (PCV2) propagated in cell culture for antibody detection / Sandwich ELISA com duplo anticorpo baseado no circovirus suíno tipo 2 (PCV2) produzido em cultivo celular para detecção de anticorpos

Few studies have described enzyme-linked immunosorbent assays (ELISAs) for the detection of antibodies against porcine circovirus type 2 (PCV2) based on antigens produced in cell culture. Furthermore, few articles have described viral purification techniques for members of the family Circoviridae. This occurs because circoviruses are difficult to isolate, noncytopathogenic, and produce low viral titres in cell culture. Thus, for overcoming these difficulties in the cultivation of PCV2, this study aimed to develop a double-antibody sandwich ELISA based on the cell culture antigen PCV2b for the quantification of anti-PCV2 antibodies. A 20% and 50% discontinuous sucrose cushion was used for viral purification, which enabled the separation of cell culture proteins in the 20% sucrose cushion and a greater viral concentration in the 50% sucrose cushion. Following isopycnic centrifugation, PCV2 was concentrated in the band with density values from 1.330 to 1.395g/cm3. Viral purification was assessed using SDS-PAGE, indirect ELISA and electron microscopy. The standardised ELISA revealed a strong linear correlation (r= 0.826, p < 0.001) when compared with a commercial ELISA kit. The assay exhibited low variability (inter-assay coefficient of variation of 4.24% and intra-assay of 1.80%) and excellent analytical specificity conferred by the capture antibody produced in rabbit. Thus, this ELISA is a rapid, specific and convenient method for the detection of antibodies against PCV2 in studies of experimental and natural infection, and in monitoring the response to vaccination on commercial farms.(AU)

Há poucos relatos na literatura de métodos de ELISA (Enzyme-linked immunosorbent assay), para a detecção de anticorpos contra o circovírus suíno tipo 2 (PCV2), baseados em antígenos produzidos em cultivo celular, bem como uma escassez de trabalhos descrevendo técnicas de purificação viral para os membros da família Circoviridae. Isso ocorre, pois os circovírus são de difícil isolamento, não causam efeito citopático e produzem um baixo título viral em cultivo celular. Assim, para superar essas dificuldades encontradas no cultivo do PCV2, este estudo objetivou desenvolver um sandwich ELISA com duplo anticorpo, baseado no antígeno de PCV2 produzido em cultivo celular, para a quantificação de anticorpos anti-PCV2. Um colchão de sacarose descontínuo a 20% e 50% foi utilizado para a purificação viral, o qual possibilitou a separação das proteínas oriundas do cultivo celular no colchão de sacarose a 20% e uma maior concentração viral no colchão de sacarose a 50%. Com a ultracentrifugação isopícnica, o PCV2 ficou mais concentrado na banda com valores de densidade de 1,330 a 1,395g/cm3. A purificação viral foi avaliada pelas técnicas de SDS-PAGE, ELISA indireto e microscopia eletrônica. Assim, o método de ELISA padronizado revelou uma forte correlação linear (r = 0,826, p < 0,001) quando comparado com um kit de ELISA comercial. O ensaio demonstrou baixa variabilidade (coeficientes de variação inter-teste de 4,24% e intra-teste de 1,80%) e uma excelente especificidade analítica conferida pelo anticorpo de captura produzido em coelho. Portanto, o método de ELISA demonstrou ser rápido, específico e conveniente para a detecção de anticorpos contra o PCV2 em estudos de infecção natural e experimental, além da monitoria da resposta à vacinação contra o PCV2 em granjas comerciais.(AU)

The effects of rainfall and vegetation on litterfall production in the semiarid region of northeastern Brazil / Efeitos da precipitação e da vegetação sobre a produção de serapilheira em uma área do semiárido do nordeste brasileiro

Litterfall has a strong influence on biodiversity and on the chemical and physical characteristics of the soil. Its production can be quite variable over time and space, and can be influenced by both natural and anthropogenic factors. We evaluated litterfall production and its relationship with rainfall, species richness, and the densities of the arboreal vegetation. Thirty litter traps were constructed with 1.0 m2 nylon mesh (1.0 mm) and randomly installed within a 2000 m × 500 m area of arboreal/shrub Caatinga (dryland) vegetation. Litter samples were collected monthly from November/2010 to June/2012, and the collected material was classified, dried, and weighted. Species richness and tree densities were determined by conducting phytosociological surveys in 20 m × 20 m plots surrounding each of the litter traps. The litterfall accumulation rate was 3.673 Mgha–1yr–1, similar to values from other seasonally dry tropical forests. Litterfall production was continuous, and principally accompanied the rainfall rate, but with a time interval of 2 to 3 months, with the greatest accumulation at the beginning of the dry season and the least during the rainy season. The different fractions of materials demonstrated distinct accumulation rates, with leaves being the principal category. Litterfall production was found to be related to tree density, but no link was found to species richness. The observed temporal heterogeneity of litterfall production demonstrated a strong link between rainfall and the dynamics of nutrient cycling in the semiarid region of Brazil.(AU)

A serapilheira exerce forte influência sobre a biodiversidade e as características físicas e químicas do solo. Sua produção pode ser bastante variável no tempo e no espaço e pode ser influenciada por fatores naturais e antropogênicos. Este estudo buscou avaliar a taxa de produção de serapilheira e a sua relação com a precipitação, riqueza de espécies e densidade da vegetação arbórea. No interior de uma área de 2000 m × 500 m foram sorteados aleatoriamente 30 pontos amostrais e em cada um deles instalado um coletor de aço de 1,0 m2. As coletas ocorreram mensalmente de novembro de 2010 a junho de 2012. O material coletado foi triado, secado e pesado. A riqueza de espécies e a densidade de árvores foram obtidas através de estudo fitossociológico em 30 parcelas de 20 m × 20 m. Foi registrada uma produção de serapilheira de 3,673 Mgha–1yr–1, taxa condizente com os valores encontrados para florestas tropicais sazonalmente secas. A produção de serapilheira foi contínua entre os meses, acompanhando principalmente o efeito tardio da precipitação (dois a três meses anteriores) e apresentou maior deposição no período do início da estação seca e menor no chuvoso. As frações do material apresentaram taxas de contribuição distintas, sendo a de folha a maior contribuinte. A produção de serapilheira também foi relacionada com a densidade de árvores, porém não houve relação com a riqueza de espécies. A heterogeneidade temporal da produção de serapilheira evidencia a forte ligação entre as chuvas e a dinâmica de ciclagem de nutrientes na região semiárida do Brasil.(AU)

How the fluctuations of water levels affect populations of invasive bivalve Corbicula fluminea (Müller, 1774) in a Neotropical reservoir? / Como a flutuação dos níveis da água afetam as populações do bivalve invasor Corbicula fluminea (Müller, 1774) em um reservatório neotropical?

Corbicula fluminea is an invasive bivalve responsible for several environmental and financial problems around the globe. Despite the invasive potential of this species, it suffers certain restrictions in lentic environments due to natural phenomena that significantly affect its population structure (e.g. water column fluctuation and sunlight exposure). The present study addresses how temporal decline of the water level in a Neotropical reservoir and exposure to sunlight affect the population structure of C. fluminea. Samplings were carried out twice in the reservoir of Furnas Hydroelectric Power Station (HPS) (Minas Gerais, Brazil), in 2011 and 2012. Population density, spatial distribution and mean shell length of C. fluminea were estimated for each year after sampling in 51 quadrats (0.0625m2) placed on three transects at different distances along the reservoir margins (0, 10 and 20 m from a fixed-point). We observed a predominance of C. fluminea in both years, with a simultaneous gradual decrease in density and richness of native species in the sampling area. Significant differences in density of C. fluminea were registered at different distances from the margin, and are related to the temporal variability of physical conditions of the sediment and water in these environments. We also registered a trend toward an increase in the density and aggregation of C. fluminea as we moved away from the margin, due to the greater stability of these areas (>10 m). The mean shell length of C. fluminea showed significant difference between the distinct distances from the margin and during the years, as well as the interaction of these factors (Distances vs.Years). These results were associated with the reproductive and invasive capacity of this species. This study reveals that these temporal events (especially water column fluctuation) may cause alterations in density, spatial distribution and mean shell length of C. fluminea and the composition of the native malacofauna in Neotropical lentic environments.(AU)

Corbicula fluminea é um bivalve invasor, responsável por inúmeros problemas ambientais e econômicos ao redor do mundo. Apesar de sua capacidade de invasão, a espécie sofre certas restrições devido a fenômenos naturais em ambientes lênticos, afetando significativamente sua estrutura populacional (e.g. flutuação do nível da água e a exposição à luz solar). O presente trabalho avaliou como o decréscimo temporal do nível da água de um reservatório neotropical e a exposição solar, afeta a estrutura populacional de C. fluminea. Duas amostragens foram realizadas no reservatório da Usina Hidrelétrica (UHE) de Furnas (Minas Gerais, Brasil), em 2011 e 2012. A densidade populacional, o comprimento médio e a distribuição espacial da espécie para cada ano foram estimados após amostragem em 51 quadrats (0,0625m2) dispostos em três transectos em diferentes distâncias das margens do reservatório (0, 10 e 20 m em relação a um ponto fixo). Observou-se o predomínio de C. fluminea em ambos os anos, coincidindo com o decréscimo da densidade e riqueza de espécies nativas nas áreas de amostragem. Foram registradas diferenças significativas na densidade de C. fluminea entre as distâncias da margem, sendo atribuídas principalmente à variabilidade temporal do substrato e da água desses ambientes. Registrou-se também uma tendência em aumento da densidade e agregação com o aumento da distância da margem, devido à maior estabilidade dessas áreas (>10 m). Houveram diferenças significativas no tamanho médio das conchas de C. fluminea entre às distâncias da margem e durante os anos, assim como na interação desses fatores (Distâncias vs. Anos). Tais resultados foram associados à capacidade reprodutiva e invasiva da espécie. Esse estudo revelou que eventos temporais (principalmente, a flutuação do nível da água) em ambientes lênticos neotropicais provocam alterações na densidade, tamanho médio e distribuição de C. fluminea e na composição da malacofauna nativa.(AU)

Variabilidade genética do peso ao nascer e seleção para crescimento em bubalinos do Estado do Pará, Brasil / Genetic variability of birth weight and selection for growth of water buffaloes from State of Pará, Brazil

Birth weight is a performance parameter of great zootechnical importance for both meat and dairy production, as well as for breeding animals, mainly due to its relation to survival rate at weaning, and the weight of animals throughout their developmental and growth phases. Therefore, the objective of this work was to establish heritability estimates, as well as phenotypic and genetic trends of birth weight of water buffaloes from State of Pará, Brazil. Descriptive statistics were calculated and the Shapiro-Wilk Normality test was performed with a Statistical Analysis System package. Heritability estimates were established by Bayesian inference. BW was 36.6 kg in average. The statistical model considered sex, year of birth and breed composition of the animals as fixed effects, and animal, maternal and residual as random effects. Direct heritability was platykurtic (flattened) and with higher asymmetry, presenting a bimodal distribution with the first mode close to 0.10, and the second mode close to 0.30; the maternal heritability was trimodal, with peaks very close to 0.15, and another, less evident, close to 0.20. The direct genetic trend of birth weight was negative (-0.03kg year-1) and maternal genetic trend was close to zero (0.001kg ano-1), even though the phenotypic trend had been positive (0.156 kg year-1). There is genetic variability to be addressed in a breeding program, however, very little was done as far as selection for growth of water buffaloes in the State of Pará.

O peso ao nascer constitui característica produtiva de elevada importância zootécnica, devido à sua relação com a taxa de sobrevivência à desmama e com os pesos nas demais fases de desenvolvimento do animal, quer seja para a produção de carne, leite ou em animais que se destinam à reprodução. O objetivo deste trabalho foi obter estimativas de herdabilidade e tendências fenotípicas e genéticas do peso ao nascer, em bubalinos do Estado do Pará, Brasil. Foram calculadas as estatísticas descritivas e realizado o teste de Normalidade de Shapiro-Wilk por meio do pacote estatístico Statistical Analisys System. As estimativas de herdabilidade foram obtidas por inferência Bayesiana. O peso ao nascer apresentou média de 36,6 kg. O modelo de análise considerou como fixos os efeitos de sexo, ano de nascimento e composição racial do animal e como efeitos aleatórios animal, efeito materno e residual. A distribuição da herdabilidade direta apresentou-se platicúrtica (achatada) e com maior assimetria, tendo uma distribuição bimodal com a primeira moda próxima a 0,10 e a segunda próxima a 0,30; a materna apresentou-se trimodal, com picos bem próximos a 0,15 e outro menos evidente próximo a 0,20. A tendência genética direta do peso ao nascer mostrou-se negativa (-0,03kg ano-1) e a tendência genética materna próxima à zero (0,001 kg ano-1), ainda que a tendência fenotípica tenha sido positiva (0,156kg ano-1). Existe variabilidade genética possível de ser trabalhada em um programa de melhoramento, no entanto, pouco foi feito quanto à seleção para crescimento em búfalos no Estado do Pará.

Variabilidade genética do peso ao nascer e seleção para crescimento em bubalinos do Estado do Pará, Brasil / Genetic variability of birth weight and selection for growth of water buffaloes from State of Pará, Brazil

Birth weight is a performance parameter of great zootechnical importance for both meat and dairy production, as well as for breeding animals, mainly due to its relation to survival rate at weaning, and the weight of animals throughout their developmental and growth phases. Therefore, the objective of this work was to establish heritability estimates, as well as phenotypic and genetic trends of birth weight of water buffaloes from State of Pará, Brazil. Descriptive statistics were calculated and the Shapiro-Wilk Normality test was performed with a Statistical Analysis System package. Heritability estimates were established by Bayesian inference. BW was 36.6 kg in average. The statistical model considered sex, year of birth and breed composition of the animals as fixed effects, and animal, maternal and residual as random effects. Direct heritability was platykurtic (flattened) and with higher asymmetry, presenting a bimodal distribution with the first mode close to 0.10, and the second mode close to 0.30; the maternal heritability was trimodal, with peaks very close to 0.15, and another, less evident, close to 0.20. The direct genetic trend of birth weight was negative (-0.03kg year-1) and maternal genetic trend was close to zero (0.001kg ano-1), even though the phenotypic trend had been positive (0.156 kg year-1). There is genetic variability to be addressed in a breeding program, however, very little was done as far as selection for growth of water buffaloes in the State of Pará.(AU)

O peso ao nascer constitui característica produtiva de elevada importância zootécnica, devido à sua relação com a taxa de sobrevivência à desmama e com os pesos nas demais fases de desenvolvimento do animal, quer seja para a produção de carne, leite ou em animais que se destinam à reprodução. O objetivo deste trabalho foi obter estimativas de herdabilidade e tendências fenotípicas e genéticas do peso ao nascer, em bubalinos do Estado do Pará, Brasil. Foram calculadas as estatísticas descritivas e realizado o teste de Normalidade de Shapiro-Wilk por meio do pacote estatístico Statistical Analisys System. As estimativas de herdabilidade foram obtidas por inferência Bayesiana. O peso ao nascer apresentou média de 36,6 kg. O modelo de análise considerou como fixos os efeitos de sexo, ano de nascimento e composição racial do animal e como efeitos aleatórios animal, efeito materno e residual. A distribuição da herdabilidade direta apresentou-se platicúrtica (achatada) e com maior assimetria, tendo uma distribuição bimodal com a primeira moda próxima a 0,10 e a segunda próxima a 0,30; a materna apresentou-se trimodal, com picos bem próximos a 0,15 e outro menos evidente próximo a 0,20. A tendência genética direta do peso ao nascer mostrou-se negativa (-0,03kg ano-1) e a tendência genética materna próxima à zero (0,001 kg ano-1), ainda que a tendência fenotípica tenha sido positiva (0,156kg ano-1). Existe variabilidade genética possível de ser trabalhada em um programa de melhoramento, no entanto, pouco foi feito quanto à seleção para crescimento em búfalos no Estado do Pará.(AU)

Parâmetros genéticos de relações de pesos, características de fertilidade e crescimento em vacas da raça Canchim / Genetic parameters for body weight ratio, fertility and growth traits in Canchim breed females

O objetivo neste trabalho foi estimar herdabilidade da idade ao primeiro parto (IPP), do escore de condição corporal ao primeiro parto (EPP), do escore de condição corporal ao parto (ECP), dos pesos à desmama (PD) e aos doze meses de idade (P12) e das relações de peso do bezerro à desmama pelo peso da vaca ao parto (RPP) e peso do primeiro bezerro à desmama pelo peso da vaca ao primeiro parto (RPPP) e as correlações genéticas de IPP, EPP, PD e P12 com RPPP, em um rebanho da raça Canchim. As médias a posteriori dos componentes de (co)variância foram obtidas por inferência bayesiana, em análises uni e bicaracterísticas. Os modelos estatísticos incluíram os efeitos aleatórios genético aditivos direto e materno, de ambiente permanente e residual, e os efeitos fixos de ano e mês de nascimento ou do parto, idade da vaca ao parto e sexo do bezerro, dependendo da característica. As médias a posteriori da herdabilidade, obtidas em análises unicararacterística, foram 0,12 (IPP); 0,36 (EPP); 0,18 (ECP); 0,50 (PD); 0,46 (P12); 0,16 (RPP) e 0,40 (RPPP), indicando que as características possuem variação genética aditiva suficiente para apresentar boa resposta à seleção massal, com exceção de IPP. As correlações genéticas de IPP (-0,61), EPP (-0,36), PD (-0,20) e P12 (-0,05) com RPPP sugerem que a seleção para reduzir a idade e o escore de condição corporal ao primeiro parto deve melhorar a produtividade das fêmeas no primeiro parto, mas a seleção para modificar pesos em idades jovens não promove mudanças na eficiência produtiva das matrizes.

The objective of this study was to estimate the heritability of age at first calving (AFC), body condition score at first calving (BCF), body condition score at calving (BCC), weaning weight (WW), yearling weight (W12), weaning weight of calf/weight of cow at calving (RCC) and weaning weight of first calf/weight of cow at first calving (RCCF) ratios, and genetic correlations of AFC, BCF, WW and W12 with RCCF, in a Canchim beef cattle herd. The variance and covariance components were obtained by bayesian inference with single and two-trait analyses. The statistical models included the additive direct and maternal, the permanent environmental and the residual random effects, and the fixed effects of year and month of birth or of calving, age of cow at calving and sex of calf, depending on the trait. The posterior means of heritability, obtained by single-trait analyses, were 0.12 (AFC), 0.36 (BCF), 0.18 (BCC), 0.50 (WW), 0.46 (W12), 0.16 (RCC) and 0.40 (RCCF) indicating that these traits have enough genetic variability to show response to mass selection with the exception of AFC. The genetic correlations of AFC (-0.61), BCF (-0.36), WW (-0.20) and W12 (-0.05) with RCCF suggest that selection to reduce age and body condition score at first calving should improve the productivity trait of females at first calving, while selection for heavier females at young ages would not promote any change in the productivity of dams.

Parâmetros genéticos de relações de pesos, características de fertilidade e crescimento em vacas da raça Canchim / Genetic parameters for body weight ratio, fertility and growth traits in Canchim breed females

O objetivo neste trabalho foi estimar herdabilidade da idade ao primeiro parto (IPP), do escore de condição corporal ao primeiro parto (EPP), do escore de condição corporal ao parto (ECP), dos pesos à desmama (PD) e aos doze meses de idade (P12) e das relações de peso do bezerro à desmama pelo peso da vaca ao parto (RPP) e peso do primeiro bezerro à desmama pelo peso da vaca ao primeiro parto (RPPP) e as correlações genéticas de IPP, EPP, PD e P12 com RPPP, em um rebanho da raça Canchim. As médias a posteriori dos componentes de (co)variância foram obtidas por inferência bayesiana, em análises uni e bicaracterísticas. Os modelos estatísticos incluíram os efeitos aleatórios genético aditivos direto e materno, de ambiente permanente e residual, e os efeitos fixos de ano e mês de nascimento ou do parto, idade da vaca ao parto e sexo do bezerro, dependendo da característica. As médias a posteriori da herdabilidade, obtidas em análises unicararacterística, foram 0,12 (IPP); 0,36 (EPP); 0,18 (ECP); 0,50 (PD); 0,46 (P12); 0,16 (RPP) e 0,40 (RPPP), indicando que as características possuem variação genética aditiva suficiente para apresentar boa resposta à seleção massal, com exceção de IPP. As correlações genéticas de IPP (-0,61), EPP (-0,36), PD (-0,20) e P12 (-0,05) com RPPP sugerem que a seleção para reduzir a idade e o escore de condição corporal ao primeiro parto deve melhorar a produtividade das fêmeas no primeiro parto, mas a seleção para modificar pesos em idades jovens não promove mudanças na eficiência produtiva das matrizes. (AU)

The objective of this study was to estimate the heritability of age at first calving (AFC), body condition score at first calving (BCF), body condition score at calving (BCC), weaning weight (WW), yearling weight (W12), weaning weight of calf/weight of cow at calving (RCC) and weaning weight of first calf/weight of cow at first calving (RCCF) ratios, and genetic correlations of AFC, BCF, WW and W12 with RCCF, in a Canchim beef cattle herd. The variance and covariance components were obtained by bayesian inference with single and two-trait analyses. The statistical models included the additive direct and maternal, the permanent environmental and the residual random effects, and the fixed effects of year and month of birth or of calving, age of cow at calving and sex of calf, depending on the trait. The posterior means of heritability, obtained by single-trait analyses, were 0.12 (AFC), 0.36 (BCF), 0.18 (BCC), 0.50 (WW), 0.46 (W12), 0.16 (RCC) and 0.40 (RCCF) indicating that these traits have enough genetic variability to show response to mass selection with the exception of AFC. The genetic correlations of AFC (-0.61), BCF (-0.36), WW (-0.20) and W12 (-0.05) with RCCF suggest that selection to reduce age and body condition score at first calving should improve the productivity trait of females at first calving, while selection for heavier females at young ages would not promote any change in the productivity of dams. (AU)

DINÂMICA DE INFECÇÃO DE Mycoplasma hyopneumoniae EM LEITOAS DE REPOSIÇÃO

A infecção por Mycoplasma (M.) hyopneumoniae é responsável por perdas econômicas significativas na suinocultura, causando uma pneumonia crônica que normalmente afeta clinicamente suínos de crescimento e terminação. Considerando-se a importância das matrizes de menor ordem de parto na transmissão de M. hyopneumoniae e que uma grande quantidade de leitoas é introduzida nos planteis anualmente, este projeto teve como objetivo compreender aspectos pouco conhecidos da dinâmica de infecção de M. hyopneumoniae em leitoas de reposição. O primeiro estudo avaliou a dinâmica e persistência da infecção por M. hyopneumoniae em leitoas em condições naturais de campo. Quarenta e quatro leitoas foram selecionadas aos 20 dias de idade (ddi) e a detecção de M. hyopneumoniae por PCR foi avaliada mensalmente por suabe de laringe, resultando em um total de 12 coletas. Além disso, 220 leitões filhos dessas matrizes foram amostrados um dia antes do desmame para avaliação da transmissão vertical. Os resultados deste estudo demonstraram que o início da detecção ocorreu aos 110 ddi e um aumento significativo foi observado aos 140 ddi (p<0,05). Ao desmame, apenas 2,3% das fêmeas foi positiva e não foram detectados leitões desmamados positivos. Adicionalmente, 77,2% das leitoas foi detectada positiva por um a três meses, 4,6% por quatro a cinco meses e 18,2% nunca foi detectada positiva, indicando a presença de subpopulações de animais negativos em granjas positivas. Em um segundo estudo, avaliou-se a detecção de M. hyopneumoniae por PCR em leitoas de reposição interna e a variabilidade genética entre granjas foi avaliada por MLVA (Multiple Locus Variable-number tandem repeats Analysis). Um total de 298 leitoas provenientes de três multiplicadoras positivas foram selecionadas e coletadas uma vez para realização de ELISA e duas a três vezes para PCR em um estudo longitudinal. Ainda, a transmissão vertical foi avaliada em 425 leitões pré-desmame. Aos 150 ddi, 47 a 67,4% das leitoas foi detectada positiva por PCR, decréscimos foram observados até a última amostragem nas três granjas avaliadas (p<0,05), e nenhum leitão foi positivo pré-desmame. Ainda, 30,7% das leitoas não foi detectada positiva em nenhuma nas amostragens e os resultados de MLVA indicaram um ampla variabilidade genética de M. hyopneumoniae em leitoas aos 150 ddi. No terceiro estudo, 210 leitoas de reposição negativas para M. hyopneumoniae introduzidas em três granjas positivas foram selecionadas e avaliadas longitudinalmente por PCR e ELISA com o objetivo de comparar dois tipos de fluxo de aclimatação (all-in all-out ou fluxo contínuo). Ainda, a variabilidade genética foi analisada por MLVA. Observou-se um aumento significativo (p<0,05) nas prevalências de leitoas positivas para M. hyopneumoniae por PCR na segunda coleta e um decréscimo ao longo do tempo independentemente do tipo de fluxo de aclimatação utilizado. Os resultados de ELISA revelaram que as três granjas avaliadas tiveram um aumento significativo na prevalência de leitoas positivas da primeira para a segunda coleta (p<0,05), que se manteve alta até o fim do experimento. Ainda, baixa variabilidade genética de M. hyopneumoniae foi observada por MLVA. Um quarto estudo também foi conduzido com o objetivo de avaliar a absorção e detecção de M. hyopneumoniae utilizando-se suabes de nylon flocados e de ponta de rayon. Os resultados deste experimento indicaram uma maior absorção e uma maior detecção de M. hyopneumoniae por PCR (p<0,05) utilizando-se suabes de nylon flocados.

Mycoplasma (M.) hyopneumoniae infection is responsible for important economic losses to pig production, causing a chronic pneumonia that usually affects growing and finishing pigs. Regarding the importance of low parity dams on M. hyopneumoniae transmission and that a high proportion of gilts is introduced in the farms every year, this project aimed to better understand unknown aspects about the infection dynamics of M. hyopneumoniae in replacement gilts. The first study assessed the dynamics and persistence of M. hyopneumoniae infection in gilts in natural conditions. Forty-four gilts were selected at 20 days of age (doa) and M. hyopneumoniae detection was evaluated using laryngeal swabs for PCR testing every month, resulting in 12 samplings. Additionally, 220 piglets born from the selected dams were sampled one day prior to weaning to evaluate vertical transmission. The results of this study showed that the first detection occurred at 110 doa and a significant increase was observed at 140 doa (p<0.05). A small proportion (2.3%) of positive gilts was detected one day prior to weaning and no piglets were detected positive at the same sampling moment. Moreover, 77.2% of the gilts was detected positive for one to three months, 4.6% for four to five months, and a lack of detection was observed in 18.2% of the gilts, indicating the presence of negative subpopulations in positive farms. A second study assessed the M. hyopneumoniae detection in self-replacement gilts longitudinally. A total of 298 gilts from three positive multiplier farms were selected and sampled once for ELISA testing and two or three times for PCR. Moreover, vertical transmission was evaluated in 425 piglets one day prior to weaning, and the genetic variability within farms was assessed in gilts by MLVA (Multiple Locus Variable-number tandem repeats Analysis). The prevalence of positive gilts at 150 doa ranged from 47 to 67.4% within farms by PCR, decreases were observed up to the last sampling in all farms (p<0.05), and no positive piglets were detected prior to weaning. A lack of detection was observed in 30.7% of the gilts during the study, and high genetic variability was detected within farms. In the third study, 210 M. hyopneumoniae negative purchased gilts were introduced in three farms with two types of acclimation flow (all-in all-out or continuous flow). The gilts were selected for ELISA and PCR testing in a longitudinal study, which aimed to compare the infection dynamics regarding the type of flow. Also, genetic variability was assessed by MLVA. The results showed a significant increase (p<0.05) in the prevalence of M. hyopneumoniae positive gilts by PCR in the second sampling, and a decrease over time regardless the type of flow. The ELISA results revealed a significant increase in the prevalence of positive gilts in the three farms (p<0.05) from the first to the second sampling, which remained high up to the completion of the study. Moreover, limited genetic variability of M. hyopneumoniae was observed by MLVA testing. A fourth study was also performed, which aimed to assess the absorption and detection of M. hyopneumoniae using two types of swabs (nylon-flocked and rayon-bud). The results indicated a higher absorption and M. hyopneumoniae detection by PCR using nylon-flocked swabs (p<0.05).

MATHEMATICAL MODELLING OF SOIL DIVERSITY INDICES UNDER DIFFERENT USES AND MANAGEMENTS

Soil is the habitat for a number of living organisms that perform essential functions to the ecosystem. The present work aimed to determine the edaphic diversity in large groups under different uses and management of the soil in Cerrado Biome. The study was developed in the city of Mata Roma (3º 70 '80.88' 'S and 43º 18' 71.27 '' W), in the eastern region of Maranhão state, Brazil. It were installed 130 pitfall traps in five areas with different management (millet, soybean, maize, eucalyptus, and pasture) and two reference areas with natural vegetation with different uses (anthropized Cerrado and preserved Cerrado). The traps remained in the field for a period of seven days, after this, the contents were maintained in plastic bottles and taken to the laboratory, where they were sampled and identified in large groups (orders and family). After identification, the biodiversity indexes were determined: (Shanon index, Pielou, Average and total richness and abundance). The data were analyzed using descriptive statistics and multivariate techniques using group dissimilarity. The geostatistical analysis was evaluated by a semivariogram, adjusted to a geostatistical, spherical, gaussian or exponential model. The multifractality was analyzed by the current method, in successive segments of different sizes of 2k, k=0 a k= 7 in the range of q = +10 to q = -10. 20,995 arthropods were collected throughout the study. The highest abundance was found for millet (9,974 individuals), and the lowest abundance values were reported for soybean (222) and maize (824), respectively. The highest biodiversity index is reported for the soybean area (2.69), although there is less abundance, in this area, the groups are evenly distributed due to the homogeneous management in the study area. The main axis in the analysis of the main components (PCA) explained 50.9% of the correlation of the groups with the sampled areas. The dendrogram had demonstrated that the area of soybean and maize are similar and had isolated the area of millet with the most dissimilar in relation to the others. The use and management of the soil in the study areas determine the occurrence of soil arthropods in function of food availability. For the areas of millet, maize, eucalyptus, anthropized Cerrado and pasture the Shanon diversity index obtained pure nugget effect. For the areas of millet, maize, anthropized Cerrado and pasture, the total diversity index was adjusted to the gaussian model. Only for the areas of soybean and pasture the staggered semivariograms showed similarity in the spatial variability of indexes, indicating that they behave similarly. The multifractality generated generalized dimension, D0, for all the indexes in the millet area, with invariant values, D0 = 1.000 ± 0.000. The singularity spectra were curves in concave parables with greater or smaller asymmetry for all areas sampled. In general, the fauna of soil presented spatial variability and multifractal parameters.

Soil is the habitat for a number of living organisms that perform essential functions to the ecosystem. The present work aimed to determine the edaphic diversity in large groups under different uses and management of the soil in Cerrado Biome. The study was developed in the city of Mata Roma (3º 70 '80.88' 'S and 43º 18' 71.27 '' W), in the eastern region of Maranhão state, Brazil. It were installed 130 pitfall traps in five areas with different management (millet, soybean, maize, eucalyptus, and pasture) and two reference areas with natural vegetation with different uses (anthropized Cerrado and preserved Cerrado). The traps remained in the field for a period of seven days, after this, the contents were maintained in plastic bottles and taken to the laboratory, where they were sampled and identified in large groups (orders and family). After identification, the biodiversity indexes were determined: (Shanon index, Pielou, Average and total richness and abundance). The data were analyzed using descriptive statistics and multivariate techniques using group dissimilarity. The geostatistical analysis was evaluated by a semivariogram, adjusted to a geostatistical, spherical, gaussian or exponential model. The multifractality was analyzed by the current method, in successive segments of different sizes of 2k, k=0 a k= 7 in the range of q = +10 to q = -10. 20,995 arthropods were collected throughout the study. The highest abundance was found for millet (9,974 individuals), and the lowest abundance values were reported for soybean (222) and maize (824), respectively. The highest biodiversity index is reported for the soybean area (2.69), although there is less abundance, in this area, the groups are evenly distributed due to the homogeneous management in the study area. The main axis in the analysis of the main components (PCA) explained 50.9% of the correlation of the groups with the sampled areas. The dendrogram had demonstrated that the area of soybean and maize are similar and had isolated the area of millet with the most dissimilar in relation to the others. The use and management of the soil in the study areas determine the occurrence of soil arthropods in function of food availability. For the areas of millet, maize, eucalyptus, anthropized Cerrado and pasture the Shanon diversity index obtained pure nugget effect. For the areas of millet, maize, anthropized Cerrado and pasture, the total diversity index was adjusted to the gaussian model. Only for the areas of soybean and pasture the staggered semivariograms showed similarity in the spatial variability of indexes, indicating that they behave similarly. The multifractality generated generalized dimension, D0, for all the indexes in the millet area, with invariant values, D0 = 1.000 ± 0.000. The singularity spectra were curves in concave parables with greater or smaller asymmetry for all areas sampled. In general, the fauna of soil presented spatial variability and multifractal parameters.

Genetic divergence among Dimorphandra spp. accessions using RAPD markers

The genus Dimorphandra has distinguish relevance considering either medicinal or biodiversity aspects because it includes two species that are economically important flavonoids sources for pharmachemical industry (D. mollis Benth. and D. gardneriana Tul.), and species endemic to Brazil, such as D. jorgei Silva and D. wilsonii Rizz., threatened by extinction. In order to evaluate variability among accessions of D. mollis (fava-d'anta), D. gardneriana and D. wilsonii, it was collected fruit from individual plants from three Brazilian states in a total of 57 accessions, which were analyzed with RAPD markers. It was used 20 seeds per progeny; the DNA was extracted from fully-formed young leaves, which were collected in bulk. The data were analyzed using a binary matrix, in which the score one represented presence of a band and zero, absence. The similarity matrix was developed by using the arithmetic complement of the Jaccard index, later grouped based on the Neighbor Joining algorithm. It was found considerable intra and inter specific variability in Dimorphandra spp., which were separated into four groups. Though genetic variability was found, the collecting trips showed that most of these areas are subject to loss of genetic resources of fava-d'anta due to the following factors: continuous anthropic activity, propensity for natural fires, and loss of natural seed dispersers (large fruit-eating mammals). Therefore, protections of these areas and ex situ conservation are essentials for the maintenance of genetic variability of these species.

O gênero Dimorphandra tem grande relevância, sobretudo nos aspectos medicinais e de biodiversidade, por incluir duas espécies que são importantes economicamente como fontes de flavonoides para indústria farmacoquímica (D. mollis Benth. e D. gardneriana Tull.), e espécies endêmicas do Brasil, como a D. jorgei Silva e D. wilsonii Rizz., sendo esta ameaçada de extinção. Objetivando avaliar a variabilidade entre acessos de D. mollis, D. gardneriana e D. wilsonii, foram realizadas coletas de frutos separados por planta em três estados brasileiros em um total de 57 acessos que foram analisados por meio da técnica RAPD. Utilizaram-se vinte sementes por progênie e o DNA, extraído de folhas definitivas, jovens, e coletadas em bulk. Os dados foram analisados utilizando-se uma matriz de dados binários. Para formação da matriz de dissimilaridade, foi utilizado o complemento aritmético do Índice de Jaccard e posteriormente o agrupamento pelo algoritmo de Neighbor Joining. O estudo revelou que existe variabilidade entre e dentro das espécies de Dimorphandra spp., o qual formou quatro grupos. Apesar da variabilidade genética constatada, as expedições de coleta demonstraram que a maioria das áreas amostradas está sujeita a perdas de recursos genéticos de fava-d'anta devido aos seguintes fatores: ocorrência de ação antrópica contínua; propensão a incêndios naturais; e diminuição dos dispersores naturais de sementes (grandes mamíferos frugíveros). Assim, a proteção destas áreas e a conservação ex situ, são primordiais para manutenção da variabilidade genética dessas espécies.

Genetic divergence among Dimorphandra spp. accessions using RAPD markers

The genus Dimorphandra has distinguish relevance considering either medicinal or biodiversity aspects because it includes two species that are economically important flavonoids sources for pharmachemical industry (D. mollis Benth. and D. gardneriana Tul.), and species endemic to Brazil, such as D. jorgei Silva and D. wilsonii Rizz., threatened by extinction. In order to evaluate variability among accessions of D. mollis (fava-d'anta), D. gardneriana and D. wilsonii, it was collected fruit from individual plants from three Brazilian states in a total of 57 accessions, which were analyzed with RAPD markers. It was used 20 seeds per progeny; the DNA was extracted from fully-formed young leaves, which were collected in bulk. The data were analyzed using a binary matrix, in which the score one represented presence of a band and zero, absence. The similarity matrix was developed by using the arithmetic complement of the Jaccard index, later grouped based on the Neighbor Joining algorithm. It was found considerable intra and inter specific variability in Dimorphandra spp., which were separated into four groups. Though genetic variability was found, the collecting trips showed that most of these areas are subject to loss of genetic resources of fava-d'anta due to the following factors: continuous anthropic activity, propensity for natural fires, and loss of natural seed dispersers (large fruit-eating mammals). Therefore, protections of these areas and ex situ conservation are essentials for the maintenance of genetic variability of these species.

O gênero Dimorphandra tem grande relevância, sobretudo nos aspectos medicinais e de biodiversidade, por incluir duas espécies que são importantes economicamente como fontes de flavonoides para indústria farmacoquímica (D. mollis Benth. e D. gardneriana Tull.), e espécies endêmicas do Brasil, como a D. jorgei Silva e D. wilsonii Rizz., sendo esta ameaçada de extinção. Objetivando avaliar a variabilidade entre acessos de D. mollis, D. gardneriana e D. wilsonii, foram realizadas coletas de frutos separados por planta em três estados brasileiros em um total de 57 acessos que foram analisados por meio da técnica RAPD. Utilizaram-se vinte sementes por progênie e o DNA, extraído de folhas definitivas, jovens, e coletadas em bulk. Os dados foram analisados utilizando-se uma matriz de dados binários. Para formação da matriz de dissimilaridade, foi utilizado o complemento aritmético do Índice de Jaccard e posteriormente o agrupamento pelo algoritmo de Neighbor Joining. O estudo revelou que existe variabilidade entre e dentro das espécies de Dimorphandra spp., o qual formou quatro grupos. Apesar da variabilidade genética constatada, as expedições de coleta demonstraram que a maioria das áreas amostradas está sujeita a perdas de recursos genéticos de fava-d'anta devido aos seguintes fatores: ocorrência de ação antrópica contínua; propensão a incêndios naturais; e diminuição dos dispersores naturais de sementes (grandes mamíferos frugíveros). Assim, a proteção destas áreas e a conservação ex situ, são primordiais para manutenção da variabilidade genética dessas espécies.

Genetic divergence among Dimorphandra spp. accessions using RAPD markers

The genus Dimorphandra has distinguish relevance considering either medicinal or biodiversity aspects because it includes two species that are economically important flavonoids sources for pharmachemical industry (D. mollis Benth. and D. gardneriana Tul.), and species endemic to Brazil, such as D. jorgei Silva and D. wilsonii Rizz., threatened by extinction. In order to evaluate variability among accessions of D. mollis (fava-d'anta), D. gardneriana and D. wilsonii, it was collected fruit from individual plants from three Brazilian states in a total of 57 accessions, which were analyzed with RAPD markers. It was used 20 seeds per progeny; the DNA was extracted from fully-formed young leaves, which were collected in bulk. The data were analyzed using a binary matrix, in which the score one represented presence of a band and zero, absence. The similarity matrix was developed by using the arithmetic complement of the Jaccard index, later grouped based on the Neighbor Joining algorithm. It was found considerable intra and inter specific variability in Dimorphandra spp., which were separated into four groups. Though genetic variability was found, the collecting trips showed that most of these areas are subject to loss of genetic resources of fava-d'anta due to the following factors: continuous anthropic activity, propensity for natural fires, and loss of natural seed dispersers (large fruit-eating mammals). Therefore, protections of these areas and ex situ conservation are essentials for the maintenance of genetic variability of these species.

O gênero Dimorphandra tem grande relevância, sobretudo nos aspectos medicinais e de biodiversidade, por incluir duas espécies que são importantes economicamente como fontes de flavonoides para indústria farmacoquímica (D. mollis Benth. e D. gardneriana Tull.), e espécies endêmicas do Brasil, como a D. jorgei Silva e D. wilsonii Rizz., sendo esta ameaçada de extinção. Objetivando avaliar a variabilidade entre acessos de D. mollis, D. gardneriana e D. wilsonii, foram realizadas coletas de frutos separados por planta em três estados brasileiros em um total de 57 acessos que foram analisados por meio da técnica RAPD. Utilizaram-se vinte sementes por progênie e o DNA, extraído de folhas definitivas, jovens, e coletadas em bulk. Os dados foram analisados utilizando-se uma matriz de dados binários. Para formação da matriz de dissimilaridade, foi utilizado o complemento aritmético do Índice de Jaccard e posteriormente o agrupamento pelo algoritmo de Neighbor Joining. O estudo revelou que existe variabilidade entre e dentro das espécies de Dimorphandra spp., o qual formou quatro grupos. Apesar da variabilidade genética constatada, as expedições de coleta demonstraram que a maioria das áreas amostradas está sujeita a perdas de recursos genéticos de fava-d'anta devido aos seguintes fatores: ocorrência de ação antrópica contínua; propensão a incêndios naturais; e diminuição dos dispersores naturais de sementes (grandes mamíferos frugíveros). Assim, a proteção destas áreas e a conservação ex situ, são primordiais para manutenção da variabilidade genética dessas espécies.

Morphoagronomic variation in natural populations of Trifolium riograndense (Burkart)

Several species of Trifolium are widely cultivated as forage for animals and green manure. This work aimed to characterize and estimate through morphological and agronomic traits the genetic diversity of natural populations of T. riograndense, an important forage legume from native pastures of the state of Rio Grande do Sul, Brazil. Plant height and diameter, number of primary and secondary stolons, stolon length, number of nodes per primary stolon, internode length, primary stolon diameter, leaf area, petiole length and dry matter production were analyzed in 29 accessions. The first five attributes and dry matter production were evaluated twice. A broad phenotypic variability was observed for almost all characteristics. Positive correlations occurred between petiole length and leaf area (r = 0.68), petiole length and plant height in the first evaluation (0.63), stolon length and plant height (0.58), total dry matter and plant diameter (0.61), and total dry matter and plant height in the second evaluation (0.55). The two most divergent accessions were collected in the same physiographic region and the two less divergent ones in different regions. A dissimilarity dendrogram separated four groups. Accessions collected in a region where T. riograndense is abundant were found to belong to different groups outlining the great variability of this native forage legume. Dry matter production in the first cut was the characteristic that most contributed (20.80%) to accessions divergence followed by number of secondary stolons (12.30%), leaf area (11.07%), and number of nodes per primary stolon (10.93%).

Várias espécies de Trifolium são extensivamente cultivadas como forragem ou adubo verde. Caracterizaram-se e estimaram-se, por meio de atributos morfológicos e agronômicos, a diversidade genética de populações naturais de T. riograndense, importante leguminosa forrageira nativa dos campos naturais do Rio Grande do Sul. Estatura e diâmetro das plantas, número de estolões primários e secundários, comprimento do estolão primário, número de nós por estolão, comprimento dos entrenós, diâmetro de estolão, área foliar, tamanho do pecíolo e produção de massa seca foram avaliados em 29 acessos. Os cinco primeiros atributos e a produção de massa seca foram avaliados duas vezes. Ampla variabilidade fenotípica foi observada para quase todas as características. Ocorreram correlações positivas entre tamanho do pecíolo e área foliar (r = 0,68), tamanho do pecíolo e estatura (0,63) na primeira avaliação, e comprimento do estolão e estatura (0,58), massa seca total e diâmetro da planta (0,61) e massa seca total e estatura (0,55) na segunda avaliação. Os dois acessos mais divergentes foram coletados na mesma região fisiográfica e os dois menos divergentes em regiões diferentes. O dendrograma de dissimilaridade genética separou quatro grupos. Acessos coletados em uma região onde T. riograndense é abundante pertenciam a diferentes grupos, o que realça a grande variabilidade dessa leguminosa forrageira nativa. A produção de massa seca no primeiro corte foi a característica que mais contribuiu (20,80%) para a divergência dos acessos, seguida pelo número de estolões secundários (12,30%), área foliar (11,07%), e número de nós por estolão (10,93%).