Resumo

Fine-fleeced sheep are distinguished by numerous economically valuable traits that constitute the foundation for productive distinctions among breeds, populations, lines, and individuals. Many of these traits have already been mentioned or thoroughly examined during studies on the correlative variability of productivity indicators, blood parameters, characteristics of pulmonary gas exchange, histological structures of the skin, and features of the experimental sheep's coat. The objective of our research was to investigate the correlative variability of key economically valuable traits that characterize the overall functional state of sheep organisms under varying environmental conditions. The study was conducted at the "Sharbulak" breeding farms and the "Samat" peasant farms in the Kazygurt district of the Turkestan region. Our findings reveal that one-year-old rams surpass ewes in terms of live weight by 32-37% and in terms of unwashed wool shearing by 21-23%. Two-year-old rams outperform ewes in live weight by 2.15-2.17 times and in unwashed wool shearing by 2.38-2.44 times. The highest phenotypic variability in relative terms (as indicated by the coefficient of variation) is observed in the shearing of pure wool, with an average coefficient of variation of 18.1% across all sex and age groups of sheep. This is followed by the wool coefficient (17.4%) and the yield of pure fiber (12.5%). For each group of animals, the most substantial phenotypic correlation coefficients were observed between the live weight of sheep and the shearing of unwashed wool. On average, across all groups of sheep at the "Sharbulak" breeding farm, this phenotypic correlation reaches +0.411 ± 0.077. Correspondingly, for the sheep herd at the "Samat" peasant farm, it is +0.326 ± 0.075. The second-highest phenotypic correlation pertains to the cut of unwashed wool and the length of wool (with correlation coefficients of +0.156 ± 0.058 and +0.145 ± 0.057, respectively, for the herds). The third-highest correlation involves live weight and wool length (+0.131 ± 0.085 and +0.105 ± 0.078, respectively). No statistically significant differences were identified in the average correlation coefficients between the live weight of sheep, the shearing of unwashed wool, and the length of the staple among the flocks of sheep at the "Sharbulak" breeding farm and the "Samat" peasant farm.

Ovelhas de lã fina distinguem-se por numerosas características economicamente valiosas que constituem a base para distinções produtivas entre raças, populações, linhagens e indivíduos. Muitas dessas características já foram mencionadas ou examinadas minuciosamente durante estudos sobre a variabilidade correlativa de indicadores de produtividade, parâmetros sanguíneos, características das trocas gasosas pulmonares, estruturas histológicas da pele e características da pelagem experimental da ovelha. O objetivo da nossa pesquisa foi investigar a variabilidade correlativa das principais características economicamente valiosas que caracterizam o estado funcional geral dos organismos ovinos sob diversas condições ambientais. O estudo foi realizado nas fazendas de criação "Sharbulak" e nas fazendas camponesas "Samat" no distrito de Kazygurt, na região do Turquestão. Nossas descobertas revelam que os carneiros com um ano de idade superam as ovelhas em termos de peso vivo em 32-37%, e em termos de tosquia de lã não lavada, em 21-23%. Carneiros de dois anos superam as ovelhas em peso vivo em 2,15-2,17 vezes, e em tosquia de lã não lavada, em 2,38-2,44 vezes. A maior variabilidade fenotípica em termos relativos (conforme indicado pelo coeficiente de variação) é observada na tosquia de lã pura, com um coeficiente de variação médio de 18,1% em todos os sexos e faixas etárias das ovelhas. Seguem-se o coeficiente de lã (17,4%) e o rendimento de fibra pura (12,5%). Para cada grupo de animais, foram observados os coeficientes de correlação fenotípica mais substanciais entre o peso vivo dos ovinos e a tosquia da lã não lavada. Em média, em todos os grupos de ovinos da exploração de criação "Sharbulak", esta correlação fenotípica atinge +0,411 ± 0,077. Correspondentemente, para o rebanho ovino da fazenda camponesa "Samat", é de +0,326 ± 0,075. A segunda maior correlação fenotípica refere-se ao corte da lã não lavada e ao comprimento da lã (com coeficientes de correlação de +0,156 ± 0,058 e +0,145 ± 0,057, respectivamente, para os rebanhos). A terceira maior correlação envolve peso vivo e comprimento da lã (+0,131 ± 0,085 e +0,105 ± 0,078, respectivamente). Não foram identificadas diferenças estatisticamente significativas nos coeficientes de correlação médios entre o peso vivo dos ovinos, a tosquia da lã não lavada e o comprimento do alimento básico entre os rebanhos de ovinos da quinta de criação "Sharbulak" e da quinta camponesa "Samat".

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The knowledge of correlations between multiple characteristics in plant breeding leads to more effective selection strategies. The path analysis allows refining these correlations and partitioning them into direct and indirect effects on the main variable. The path analysis becomes more effective when based on predicted genotypic values rather than phenotypic values. The objective was to evaluate correlations between the main agronomic characteristics of grapevine cultivation and their direct and indirect effects on yield per plant to improve selection strategies to reach superior progenies. A randomized complete block design was installed using four cultivars and two rootstocks, five repetitions, and plots of four plants. Data from three crop seasons were analyzed from a mixed model and genetic correlations were subject to the path analysis. A high and positive significant correlation was found between average fruit production and the number of clusters per plant. On the other hand, the average production per plant showed a low correlation to cluster width and height per grapevine. Wider and higher berries tend to increase berry fresh mass and therefore increase the contents of soluble solids and reducing sugars. Among the features, the number of clusters per plant has the strongest direct effect on fruit production in grape cultivars. Berry fresh mass, berry length, and berry width were indirectly influenced by the number of clusters and showed high heritability compared to yield and number of clusters. These characteristics could be used in indirect selection.

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Owing to rich in vitamins, proteins, mineral elements, and active substances, the highly medicinal and economic value of mung bean seeds have been proven to be beneficial to human. In order to fully identificate and innovative utilization of excellent germplasm resources for mung bean yield and quality breeding, the genetic diversity level of eight seed phenotypic traits of 302 mung bean germplasm resources were comprehensively evaluated by diversity analysis, correlation analysis, principal component analysis (PCA), and cluster analysis. The results showed the genetic diversity of eight seed phenotypic traits of 302 mung bean germplasm resources with a Shannon diversity Index ranging from 0.25 to 2.09. For most traits, their coefficient of variation (CV) were more than 10% with the highest being seed shape (41.51%). Correlation analysis showed that the 100-seed weight had extremely positive correlations with seed size, seed length, seed width, and seed thickness. PCA of seed phenotypic traits showed that the cumulative contribution rate of the first three principal components was 78.551%. These principal components included seed width, seed coat gloss and seed color. The 302 mung bean germplasm resources were divided into eight groups by cluster analysis. A total of 140 germplasm resources with large-seed were selected from group I and group II, of which 9 germplasm resources in group II were likely to be high-yield varieties. Overall, this study not only indicated sufficient variation among the studied germplasm resources, but also provided a theoretical basis for the selection, utilization and hybrid breeding of mung bean germplasm resources.

Devido ao seu caráter rico em vitaminas, proteínas, elementos minerais e substâncias ativas, o valor altamente medicinal e econômico das sementes de feijão-mungo tem provado ser benéfico para o ser humano. A fim de identificar plenamente e utilizar de forma inovadora excelentes recursos de Germoplasma para a produção de feijão-mungo e reprodução de qualidade, o nível de diversidade genética do oito caracteres fenotípicos de sementes de 302 recursos de germoplasma de feijão-mungo foram avaliados de forma abrangente por meio de análise de diversidade, análise de correlação, análise de componentes principais (PCA) e análise de agrupamento. Os resultados mostraram a diversidade genética de oito características fenotípicas de sementes de 302 recursos de germoplasma de feijão-mungo com um Índice de diversidade Shannon variando de 0,25 a 2,09. A análise de correlação mostrou que o peso de 100 sementes apresentou correlações extremamente positivas com tamanho, comprimento, largura e espessura de sementes. A PCA das características fenotípicas das sementes mostrou que a taxa de contribuição cumulativa dos três primeiros componentes principais foi de 78,551%, sendo estes componentes principais a largura da semente, brilho do revestimento e cor da semente. Os 302 recursos de germoplasma de feijão-mungo foram divididos em oito grupos por análise de agrupamento. Foram selecionados 140 recursos de germoplasma com sementes grandes dos grupos I e II, dos quais nove recursos de germoplasma do grupo II provavelmente seriam variedades de alto rendimento. De forma geral, este estudo não só indicou variação suficiente entre os recursos de germoplasma estudados, como também forneceu uma base teórica para a seleção, utilização e melhoramento híbrido dos recursos de germoplasma de feijão-mungo.

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Abstract Local and exotic germplasm of tomato remains a major source for genetic improvement. Assessment of such lines for biotic stresses particularly viral diseases are the most important criteria for selection in Pakistan, where Tomato Yellow Leaf Curl Virus (TYLCV) and Tomato Mosaic Virus (ToMV) are the major diseases/viruses. A set of 40 accessions (including indigenous Pakistani lines and exotic germplasm from Europe, the United States, and Asia) were evaluated for their resistance/infection response to ToMV with artificial inoculation under greenhouse conditions. Infection response was quantified through disease scoring and DAS-ELISA test (for ToMV). A subset of 24 lines, was further screened for TYLCV using disease scoring and TAS-ELISA. The tested lines showed significant variability for resistance to ToMV. Only one accession (Acc-17878) was resistant to the ToMV whereas seven accessions i.e. Acc-17890, AVR-261, CLN-312, AVR-321, EUR-333, CLN-352, and CLN-362 expressed resistance to TYLCV. Correlation between phenotypic evaluation was confirmed by the ELISA results in both diseases, although both tools complemented to assess the viral infection status. In future, tomato breeding programs must consider breeding for ToMV and TYLCV resistance (using identified germplasm in our study) so as to deliver virus resistant tomato varieties.

RESUMO O germoplasma local e exótico do tomate continua sendo uma importante fonte de melhoramento genético. A avaliação de linhagens para estresses bióticos, particularmente as doenças virais, é o critério mais importantes para seleção no Paquistão, onde o vírus da folha amarela do tomate (TYLCV) e o vírus do mosaico do tomateiro (ToMV) são as principais doenças/vírus. Um conjunto de 40 acessos (incluindo linhagens indígenas do Paquistão e germoplasma exótico da Europa, dos Estados Unidos e da Ásia) foi avaliado quanto à resistência/resposta à infecção ao ToMV com inoculação artificial em casa de vegetação. A resposta à infecção foi quantificada por meio de pontuação da doença e de teste DAS-ELISA (para ToMV). Um subconjunto de 24 linhas foi posteriormente rastreado para TYLCV usando pontuação de doença e TAS-ELISA. As linhas testadas apresentaram variabilidade significativa para resistência ao ToMV. Apenas um acesso (Acc-17878) foi resistente ao ToMV, enquanto sete acessos (Acc-17890, AVR-261, CLN-312, AVR-321, EUR-333, CLN-352 e CLN-362) expressaram resistência ao TYLCV. A correlação entre a avaliação fenotípica foi confirmada pelos resultados do ELISA nas duas doenças, embora ambas as ferramentas tenham se complementado para avaliar o estado da infecção viral. No futuro, os programas de melhoramento de tomate devem considerar aperfeiçoamentos para resistência ao ToMV e TYLCV (usando germoplasma identificado em nosso estudo) de modo a fornecer variedades de tomate resistentes a vírus.

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Local and exotic germplasm of tomato remains a major source for genetic improvement. Assessment of such lines for biotic stresses particularly viral diseases are the most important criteria for selection in Pakistan, where Tomato Yellow Leaf Curl Virus (TYLCV) and Tomato Mosaic Virus (ToMV) are the major diseases/viruses. A set of 40 accessions (including indigenous Pakistani lines and exotic germplasm from Europe, the United States, and Asia) were evaluated for their resistance/infection response to ToMV with artificial inoculation under greenhouse conditions. Infection response was quantified through disease scoring and DAS-ELISA test (for ToMV). A subset of 24 lines, was further screened for TYLCV using disease scoring and TAS-ELISA. The tested lines showed significant variability for resistance to ToMV. Only one accession (Acc-17878) was resistant to the ToMV whereas seven accessions i.e. Acc-17890, AVR-261, CLN-312, AVR-321, EUR-333, CLN-352, and CLN-362 expressed resistance to TYLCV. Correlation between phenotypic evaluation was confirmed by the ELISA results in both diseases, although both tools complemented to assess the viral infection status. In future, tomato breeding programs must consider breeding for ToMV and TYLCV resistance (using identified germplasm in our study) so as to deliver virus resistant tomato varieties.

O germoplasma local e exótico do tomate continua sendo uma importante fonte de melhoramento genético. A avaliação de linhagens para estresses bióticos, particularmente as doenças virais, é o critério mais importantes para seleção no Paquistão, onde o vírus da folha amarela do tomate (TYLCV) e o vírus do mosaico do tomateiro (ToMV) são as principais doenças/vírus. Um conjunto de 40 acessos (incluindo linhagens indígenas do Paquistão e germoplasma exótico da Europa, dos Estados Unidos e da Ásia) foi avaliado quanto à resistência/resposta à infecção ao ToMV com inoculação artificial em casa de vegetação. A resposta à infecção foi quantificada por meio de pontuação da doença e de teste DAS-ELISA (para ToMV). Um subconjunto de 24 linhas foi posteriormente rastreado para TYLCV usando pontuação de doença e TAS-ELISA. As linhas testadas apresentaram variabilidade significativa para resistência ao ToMV. Apenas um acesso (Acc-17878) foi resistente ao ToMV, enquanto sete acessos (Acc-17890, AVR-261, CLN-312, AVR-321, EUR-333, CLN-352 e CLN-362) expressaram resistência ao TYLCV. A correlação entre a avaliação fenotípica foi confirmada pelos resultados do ELISA nas duas doenças, embora ambas as ferramentas tenham se complementado para avaliar o estado da infecção viral. No futuro, os programas de melhoramento de tomate devem considerar aperfeiçoamentos para resistência ao ToMV e TYLCV (usando germoplasma identificado em nosso estudo) de modo a fornecer variedades de tomate resistentes a vírus.

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Commercial fig tree cultivation in Brazil involves a single cultivar, 'Roxo-de-Valinhos'. The use of a single cultivar results in serious diseases and related problems. The aim of this study was to characterize fig accessions by analyzing the natural root-knot nematode and leaf rust incidence in relation to the epigenomic profile of the plant, since epigenetic variations affect plant-pathogen interactions. All plants were attacked by nematodes, indicating susceptibility; Meloidogyne incognita was the root-knot nematode species involved. Joint analysis of data showed that methylation and leaf rust incidence were correlated when observed in the same phenological phase, presenting initial evidence of the same factorial pressure loads in genotypes, suggesting similar behavior within these genotypes.

O Brasil é o maior produtor de figos da América do Sul, porém o cultivo comercial brasileiro da figueira baseia-se na plantação de uma única cultivar, o Roxo-de-Valinhos, resultando em sérios problemas relativos a pragas e doenças. Uma vez que há variações epigenéticas na interação planta-patógeno, principalmente por meio da regulação gênica, o presente trabalho objetiva realizar a caracterização in vivo de acessos de figo, por meio da análise de incidência natural de nematoides formadores de galha e de incidência natural de ferrugem, correlacionada ao seu perfil epigenômico, a fim de subsidiar trabalhos de conservação, melhoramento genético e produção da cultura. A análise dos componentes principais dos dados da caracterização dos acessos foi realizada por meio da matriz de correlação residual obtida pela análise de variância conjunta utilizando o programa GENES. Pôde-se constatar que todas as plantas foram atacadas por este patógeno, evidenciando que são suscetíveis ao mesmo. Já a análise conjunta dos dados demonstrou que a metilação e a incidência de ferrugem em folhas, quando observadas na mesma fase fenológica da planta, se correlacionam, apresentando evidências iniciais de mesmas cargas fatoriais de pressão nos genótipos, com a premissa de comportamento semelhante nos mesmos, indicando que, além do fator genético, fatores abióticos também são responsáveis pelas alterações no fenótipo das plantas, evidenciando a plasticidade fenotípica das mesmas.

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Drought is a primary ecological stress limiting wheat yield in water-deficient regions. Conducting targeted genetic selection of wheat cultivars can expedite the adaptation process of wheat to the climatic conditions of the region, allowing for the identification of high-yielding varieties with stable genetic traits. This study investigated the impact of the TaGW8 and TaGS3A genes, known for their contribution to wheat productivity. The effective productivity genes TaGW8-B1b/B1a and the TaGS5-3A-T genome exert a 32.8% influence on the variability of the 1000 grain weight (TGW) trait. This influence stems from both individual genes and their interactions, with at least 17.5% of TGW variability explained by the gene combinations examined in the study. Notably, the TaGS5-3A-T gene exhibits a significant positive correlation with total yield, exceeding 63%. The integration of these productivity genes, based on field phenotypic data, has resulted in an overall yield increase of selected samples by 0.8 tons/ha compared to the country's average multi-year indicator.

A seca é um estresse ecológico primário que limita o rendimento do trigo em regiões com deficiência hídrica. A realização de seleção genética direcionada de cultivares de trigo pode agilizar o processo de adaptação do trigo às condições climáticas da região, permitindo a identificação de variedades de alto rendimento com características genéticas estáveis. Este estudo investigou o impacto dos genes TaGW8 e TaGS3A, conhecidos por sua contribuição para a produtividade do trigo. Os genes de produtividade efetiva TaGW8-B1b/B1a e o genoma TaGS5-3A-T exercem uma influência de 32,8% na variabilidade da característica de peso de 1000 grãos (TGW). Essa influência decorre de genes individuais e de suas interações, com pelo menos 17,5% da variabilidade do TGW explicada pelas combinações de genes examinadas no estudo. O gene TaGS5-3A-T exibe uma correlação positiva significativa com o rendimento total, excedendo 63%. A integração desses genes de produtividade, com base em dados fenotípicos de campo, resultou em um aumento geral de rendimento de amostras selecionadas em 0,8 toneladas/ha em comparação com o indicador médio multianual do país.

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White oat (Avena sativaL.) is the winter cereal with the highest nutritional quality, offering multifunctional characteristics due to its benefits to human health, animal nutrition and soil cover. In this way, this crop is highly valued in society. The aim of this study were toevaluate agronomic performance and verify whether there is genetic variability in recombinant and mutant segregating progenies of white oat. The study was conducted at Escola Fazenda UNIJUI (IRDeR), located in the municipality of Augusto Pestana, in the state of Rio Grande do Sul, Brazil. The experimental design used followed an augmented block with interspersed controls. A total of 460 white oat progenies were sown and the intercrop control was represented by the cultivar URS Taura, arranged in three replications. The collected datawere subjected to descriptive analysis to identify the number of informative progenies and the maximum, minimum, and average values for the measured variables.Frequency distribution graphs of characters with continuous distribution were generated, stratified by mutant and recombinant progenies. Based on the data obtained, a Bayesian approach was used with generalized mixed models through Monte Carlo and Markov Chains (MCMC). With this information, the genetic (VCV) and phenotypic variance components were estimated with significance based on the 5% probability by χ² (pMCMC). Afterwards, Euclidean distances were calculated and the distance dendrogram was carried out using the UPGMA clustering algorithm. Pearson's linear correlation coefficients were calculated between pairs of variables, with significance verified by the t test at 5% probability. The mutant progenies have greater tillering capacity, while the recombinant progenies have greater tolerance to diseases and lower natural grain threshing. There is a clear genetic variability between recombinant and mutant progenies for the evaluated characters.

A aveia branca (Avena sativaL.) é o cereal de inverno de maior qualidade nutricional, com características multifuncionais devido aos seus benefícios à saúde humana, nutrição animal e cobertura do solo. Desta forma se dá a grande valorização da cultura na sociedade. Os objetivos deste trabalho foram avaliar o desempenho agronômico e verificar se existe variabilidade genética em progênies segregantes recombinantes e mutantes de aveia branca. O trabalho foi desenvolvido na Escola Fazenda UNIJUI (IRDeR), localizada no município de Augusto Pestana, no estado do Rio Grande do Sul, Brasil. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos aumentados com controles intercalados. Foram semeadas 460 progênies de aveia branca e o consórcio controle foi representado pela cultivar URS Taura, disposta em três repetições. Os dados obtidos foram submetidos à análise descritiva, onde foram obtidos o número de progênies informativas, valores máximos, mínimos e médios para as variáveis mensuradas. Foram gerados gráficos de distribuição de frequência de caracteres com distribuição contínua, estratificados por progênies mutantes e recombinantes. Com base nos dados obtidos, foi utilizada uma abordagem Bayesiana com modelos mistos generalizados através de Monte Carlo e Cadeias de Markov (MCMC). Com essas informações, os componentes de variância genética (VCV) e fenotípica foram estimados com significância baseada na probabilidade de 5% pelo χ² (pMCMC). Posteriormente, foram calculadas as distâncias euclidianas e realizado o dendrograma de distâncias utilizando o algoritmo de agrupamento UPGMA. Foram calculados os coeficientes de correlação inear de Pearson entre pares de variáveis, com significância verificada pelo teste t a 5% de probabilidade. As progênies mutantes apresentam maior capacidade de perfilhamento, enquanto as progênies recombinantes apresentam maior tolerância a doenças e menor debulha natural dos grãos. Existe variabilidade genética entre progênies recombinantes e mutantes para os caracteres avaliados.

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The Yellow passion fruit belongs to the Passifloraceae family with great economic, nutritional and social importance in Colombia. It presents a great phenotypic and genotypic diversity, which has not yet been explored or used in genetic improvement programs. The objective of this study was to evaluate the genetic diversity of 84 cultivars of Passiflora edulis f. flavicarpa from nine farms in the municipality of Miraflores, Boyacá, using eight microsatellite markers (SSR). On the basis of this information, estimates of genetic diversity parameters, molecular variance analysis (AMOVA), genetic distances, and cluster of cultivars were obtained. Low levels of genetic differentiation between cultivars were observed in the Bayesian analysis using Structure software, as well as the absence of correlation between genetic and geographic distances. The observed heterozygosity (0.50) was greater than the expected heterozygosity (0.43), suggesting a significant number of heterozygous individuals. The number of alleles per locus varied from 2 to 4, with a mean 2.88. In general, SSR were classified as informative (0.36). The average value of the Shannon Index was 0.71, which shows moderate variability in this cultivar. AMOVA showed higher diversity within cultivars (98%). The gene flow (Nm=28.4) was moderate, this can be explained by the flow of pollen between the different cultivars, the reproduction system of the species, self-incompatibility and the introduction of genotypes from other sites by farmers. The genetic diversity identified in this study is sufficient to initiate breeding programs aimed at identifying cultivars with higher yields.

O maracujá-amarelo pertence à família Passifloraceae e tem grande importância econômica, nutricional e social na Colômbia. Apresenta uma grande diversidade fenotípica e genotípica que ainda não foi explorada ou utilizada em programas de melhoramento genético. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade genética de 84 cultivares de Passiflora edulis f. flavicarpa de nove fazendas do município de Miraflores, Boyacá, Colômbia, utilizando oito marcadores microssatélites (SSR). Com base nessas informações, foram determinadas estimativas de parâmetros de diversidade genética, análise de variância molecular (AMOVA), distâncias genéticas e conjuntos de cultivares. Baixos níveis de diferenciação genética entre cultivares foram observados na análise Bayesiana pelo software Structure, bem como ausência de correlação entre distâncias genéticas e geográficas. A heterozigosidade observada (0,50) foi maior que a esperada (0,43), sugerindo um número significativo de indivíduos heterozigotos. O número de alelos por locus variou de 2 a 4, com média de 2,88. Em geral, os SSR foram classificados como informativos (0,36). O valor médio do Índice de Shannon foi de 0,71, o que demonstra variabilidade moderada nesta cultivar. AMOVA apresentou maior diversidade dentro das cultivares (98%). O fluxo gênico (Nm=28,4) foi moderado e isso pode ser explicado pelo fluxo de pólen entre as diferentes cultivares, pelo sistema de reprodução da espécie, pela autoincompatibilidade e pela introdução de genótipos de outros locais pelos agricultores. A diversidade genética identificada neste estudo é suficiente para iniciar programas de melhoramento visando identificar cultivares com maiores produtividades.

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This study aimed to propose and compare metrics ofaccuracy and bias of genomic prediction of breeding values for traits with censored data. Genotypic andcensored-phenotypic information were simulated for four traitswith QTL heritability and polygenic heritability, respectively: C1: 0.07-0.07, C2: 0.07-0.00, C3: 0.27-0.27, and C4: 0.27-0.00. Genomic breedingvalues were predicted using the Mixed Cox and Truncated Normal models. The accuracy of the models was estimated based on the Pearson (PC), maximal (MC),and Pearson correlation for censored data (PCC) while the genomic bias was calculated via simple linear regression (SLR) and Tobit (TB). MC and PCCwere statistically superior to PC for the traitC3 with 10and 40% censored information, for 70% censorship, PCC yielded better results than MC and PC. For the other traits, the proposed measures were superior or statistically equal to the PC. The coefficients associated with the marginal effects (TB) presented estimates close to those obtained for the SLRmethod, while the coefficient related to the latent variable showed almost unchanged pattern with the increase in censorship in most cases. From a statistical point of view, the use of methodologiesfor censored data should be prioritized, even for low censoringpercentages.(AU)

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Chenopodium quinoa Willd. it is an Andean cereal of great importance for human consumption due to its high nutritional value. In Colombia there is a high phenotypic and genotypic variability within quinoa crops, which has not been studied and has been maintained by the same farmers cycle after production cycle. The objective of this study was to carry out an interpopulation characterization of quinoa cultivated in different producing municipalities of the department of Boyacá, in Colombia, for which 19 morphological descriptors were used, which were evaluated in situ in nine municipalities and analyzed through descriptive statistics, principal component analysis, correlation and conglomerates. In the evaluation of the quantitative traits for all the populations, it was observed that the most variable descriptors were Number of teeth lower leaf (DHI), Lower leaf length (LHI), Width upper leaf (AHI) and Number of teeth upper leaf (DHS). Great segregation between and within individuals of Blanca de Jericó and Piartal was observed for panicle and leaf color and shape, stem color, presence of teeth, and axils on upper and lower leaves. A classification key is proposed that allows in the field to be able to morphologically differentiate the genotypes of Piartal and Blanca de Jericó. This research shows that among the most cultivated genotypes in the department of Boyacá, there is still an important phenotypic diversity given at the inter and intra-individual level, due to the phenological state and the agroclimatological conditions of the different producing regions.

Chenopodium quinoa Willd. é um cereal andino de grande importância para a alimentação humana por causa do seu alto valor nutricional. Na Colômbia, existe uma alta variabilidade fenotípica e genotípica nos cultivos de quinoa, que não foi estudada e tem sido mantida pelo mesmo produtor ciclo após ciclo de produção. O objetivo deste estudo foi realizar uma caracterização interpopulacional da quinoa cultivada em diferentes municípios produtores do departamento de Boyacá, na Colômbia. Para tanto, foram utilizados 19 descritores morfológicos, avaliados in situ em nove municípios e analisados por meio de estatísticas descritivas, análise de componentes principais, correlação e conglomerados. Na avaliação dos caracteres quantitativos para todas as populações, observou-se que os descritores mais variáveis foram: número de dentes da folha inferior (DHI), comprimento da folha inferior (LHI), largura da folha superior (AHI) e número de dentes da folha superior (DHS). Entre os indivíduos de Blanca de Jericó e Piartal e dentro deles, observou-se grande segregação quanto à cor, formato da panícula e folha, cor do caule, presença de dentes e axilas nas folhas superiores e inferiores. É proposta uma chave de classificação que permite no campo poder diferenciar morfologicamente os genótipos de Piartal e Blanca de Jericó. Esta pesquisa mostra que, entre os genótipos mais cultivados no departamento de Boyacá, ainda existe uma importante diversidade fenotípica em nível inter e intraindividual, em razão do estado fenológico e das condições agroclimatológicas das diferentes regiões produtoras.

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This work evaluated the initial performance and genetic diversity of Coffea canephora genotypes cultivated in environments at contrasting altitudes. Fourteen morphophysiological traits and seven descriptors of the genus Coffea spp. of coffee trees cultivated at altitudes of 140 m and 700 m were evaluated. The design used was Federer's augmented block in a 2 × 112 factorial scheme with six blocks. The first factor was the two environments, and the second was the 112 genotypes, with eight common treatments, being five conilon coffee clones and three arabica coffee cultivars. The data were analyzed by the method of REML/BLUP and genetic correlation method. Genetic diversity was evaluated by estimating the distance matrix, applying the Gower methodology followed by the clustering method by Tocher and UPGMA. The phenotypic means were higher in the environment at an altitude of 700 m, except for plant height, number of leaves, and canopy height (CH). Genotypic effects were significant for most traits except for leaf width, CH, unit leaf area, and total leaf area. A wide genetic diversity was verified, with distances varying from 0.037 to 0.593 for the pairs of genotypes 26 × 93 and T7 × 76, respectively. Most of the traits studied showed high genotypic correlation with the environment and expressive genetic correlation between the evaluated traits thereby demonstrating the possibility of indirect selection. There is an adaptation of conilon coffee genotypes to high altitudes and the possibility of developing a specific cultivar for the southern state of Espírito Santo.

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We aimed to estimate genetic parameters for growth, reproductive, and carcass traits in Tabapuã cattle. Phenotypic data were collected between 1990 and 2019 in 1,218 farms, and the pedigree file had 340,868 animals. The traits evaluated were body weight at 120 (W120), 210 (W210), 365 (W365), and 550 (W550) days of age; age at first calving (AFC), scrotal circumference at 365 days of age (SC365), ribeye area (REA), backfat thickness (BF), and rump fat thickness (RF). The (co)variance components were estimated using the restricted maximum likelihood method, considering single and two-traits animal models. For all traits, the models considered fixed, direct additive genetic, and residual random effects. In addition, for W120 and W210, the maternal additive genetic and maternal permanent environmental effects were also included. Heritabilities for W120, W210, W365, W550, SC365, REA, BF, and RF were of moderate magnitude (0.15, 0.16, 0.23, 0.19, 0.22, 0.36, 0.31, and 0.27, respectively). Low heritability was observed for AFC (0.07). The genetic correlations between growth traits were higher than 0.90, while AFC and SC365 presented negative moderate correlation (−0.66). The REA showed low genetic correlations with BF (0.07) and RF (0.07), whereas BF and RF were highly correlated (0.77). Considering the heritability estimates, selection for AFC would result in limited genetic gain, while for the other traits, it would be satisfactory. Based on the high genetic correlations between growth traits, selection of Tabapuã animals can be performed at younger ages. Additionally, animals can be indirectly selected for AFC through SC365, and only one fat thickness trait may be used in the selection process considering the high genetic correlation and similar heritability values for BF and RF.(AU)

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This study aimed at analyzing and comparing the phenotypic characteristics of height, body length, and fleece wool fineness with the liquidity and final price sold in auctions in the city of Uruguaiana, RS, Brazil, for three consecutive years (2015 to 2017). A total of 412 one-year-old (two teeth) male sheep, of the Australian Merino (n = 50), Polwarth (n = 130), and Corriedale (n = 232) breeds were evaluated. Height and length of the animals were measured on the day of the auction with a measuring tape, and animals were grouped into small or tall and short or long categories, as defined in this study. Wool fineness was measured using an Optical-based Fibre Diameter Analyser (FDA 2000) device and classified according to official wool classification standards (the Bradford System). There was no statistical difference in the average selling price of different breeds. There was a correlation between the breed and liquidity, in which Corriedale lambs were sold more than the Polwarth lambs, as expected; however, there was no such correlation for Merino lambs. The tall Merino lambs were sold at a higher selling price (R$ 2,449.11) than the small ones (R$ 1,826.59). Polwarth lambs exhibited positive correlations among height, length, and liquidity. Long and tall Corriedale lambs had a higher selling price (R$ 1,963.40 and R$ 1,915.02) than the short (R$ 1,656.38) and small (R$ 1,698.20) ones, respectively. In the case of Corriedale lambs, there was a positive correlation between length and liquidity. Wool fineness did not influence the selling price and liquidity in the three studied breeds. Conclusively, buyers of the Polwarth and Corriedale lambs prefer tall and long animals, regardless of the fleece wool fineness; only the height (taller lambs) seems to be a relevant factor for choosing the Merino breeders.(AU)

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Andropogon lateralis Nees is a native grass of southern Brazil and is one of the most frequent specie found in native grasslands. The species is widely distributed and has a high degree of phenotypic plasticity, which makes it highly adaptable to different edaphoclimatic conditions and management. This study aimed to evaluate the behavior of twelve ecotypes of A. lateralis, collected in different regions of the state of Rio Grande do Sul and cut to three different heights and subjected to two different defoliation frequencies. From September to February, the ecotypes were evaluated for total dry matter, leaf and stem yields. In addition, total, vegetative and reproductive tillers and plant height were measured. These characteristics are important for the selection of superior genotypes in terms of genetic variability and forage production. Total dry matter and leaf dry matter are characteristics with agronomic importance and they showed the highest correlation (r = 0.77), enabling an indirect selection for one of these characteristics. The natural selection of plants resulted in distinct structural, morphological and productive characteristics with heterogeneity that allows the selection and grouping according to the characteristics, ecotypes with superior agronomic characteristics can be included in breeding programs.

Andropogon lateralis Nees é uma gramínea nativa do sul do Brasil e uma das espécies mais frequentes na flora dos campos nativos da região. Possui ampla distribuição e alto grau de plasticidade fenotípica, tornando-o adaptável as condições edafoclimáticas e a práticas de desfolha. Este estudo teve como objetivo avaliar a dissimilaridade entre doze ecótipos de A. lateralis N., coletados em diferentes regiões do Rio Grande do Sul, submetidos a duas frequências de desfolha e três alturas de corte. No período de setembro a fevereiro, os ecótipos foram avaliados quanto à produção de matéria seca total, de lâminas foliares e de colmo. Além disso, foram medidos o número de perfilhos totais, vegetativos e reprodutivos e a altura das plantas. Essas características são importantes para a seleção de genótipos superiores em termos de variabilidade genética e produção de forragem. A matéria seca total e a matéria seca foliar são características com importância agronômica e apresentaram a maior correlação (r = 0,77), possibilitando uma seleção indireta para uma dessas características. A seleção natural das plantas resultou em características estruturais, morfológicas e produtivas distintas com uma heterogeneidade que permite a seleção e agrupamento de acordo com as características, ecótipos com características agronômicas superiores podem ser incluídos em programas de melhoramento.

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In this study, milk yield, reproductive yield, and type traits of 533 Holstein cows in the first lactation raised in 54 farms were examined. In the three-year study, phenotypic (rP) and genetic (rG) correlations between type traits and milk yield were estimated based on the variance elements and heritability of the type traits of Holstein cows in the first lactation. Linear identification and scoring systems have been applied to classify the cows according to type traits. Heritability and correlations were estimated with ASREML models. The type traits included stature, angularity, rump width, hocks, rear udder height, central ligament, teat length, body capacity, feet and legs, udder composite and final score for genetic correlations with 305-day milk yield were estimated as -0.49, -0.14, -0.93, 0.35, 0.40, 0.11, -0.65, 0.70, 0.31, 0.54, and 0.70, for phenotypic correlations were estimated as 0.28, 0.28, 0.30, 0.21, 0.35, 0.39, -0.06, 0.46, 0.48, 0.56, and 0.58 respectively. Among the phenotypic correlations between the type traits, especially the phenotypic correlations between the final score and various type traits were found to be high and significant. The fact that these traits are in high correlation with other traits and milk yield may enable these to be used as indirect selection criteria in the selection for milk yield.(AU)

Neste estudo, foram examinadas a produção de leite, a produção reprodutiva e as características de tipo de 533 vacas Holstein na primeira lactação criadas em 54 fazendas. No estudo trienal, as correlações fenotípicas (rP) e genéticas (rG) entre características de tipo e produção de leite foram estimadas com base nos elementos de variação e hereditariedade das características de tipo das vacas Holstein na primeira lactação. Sistemas de identificação linear e de pontuação foram aplicados para classificar as vacas de acordo com os traços de tipo. A hereditariedade e correlações foram estimadas com os modelos ASREML. Os traços de tipo incluíam estatura, angularidade, largura da alcatra, jarretes, altura do úbere traseiro, ligamento central, comprimento das tetas, capacidade corporal, pés e patas, composição do úbere e pontuação final para correlações genéticas com a produção de leite de 305 dias foram estimados como -0. 49, -0,14, -0,93, 0,35, 0,40, 0,11, -0,65, 0,70, 0,31, 0,54, e 0,70, para correlações fenotípicas foram estimadas como 0,28, 0,28, 0,30, 0,21, 0,35, 0,39, -0,06, 0,46, 0,48, 0,56, e 0,58 respectivamente. Dentre as correlações fenotípicas entre os traços de tipo, especialmente as correlações fenotípicas entre a pontuação final e vários traços de tipo foram encontradas como altas e significativas. O fato destes traços estarem em alta correlação com outros traços e a produção de leite pode permitir que sejam usados como critérios de seleção indiretos na seleção para a produção de leite.(AU)

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ABSTRACT: The genotype × environment (G×E) interaction plays an essential role in phenotypic expression and can lead to difficulties in genetic selection. Thus, the present study aimed to estimate genetic parameters and to compare different selection strategies in the context of mixed models for soybean breeding. For this, data referring to the evaluation of 30 genotypes in 10 environments, regarding the grain yield trait, were used. The variance components were estimated through restricted maximum likelihood (REML) and genotypic values were predicted through best linear unbiased prediction (BLUP). Significant effects of genotypes and G×E interaction were detected by the likelihood ratio test (LRT). Low genotypic correlation was obtained across environments, indicating complex G×E interaction. The selective accuracy was very high, indicating high reliability. Our results showed that the most productive soybean genotypes have high adaptability and stability.

RESUMO: A interação genótipo × ambiente (G × E) desempenha um papel essencial na expressão fenotípica e pode provocar dificuldades na seleção genética. Assim, o presente estudo teve como objetivo estimar parâmetros genéticos e comparar diferentes estratégias de seleção no contexto de modelos mistos para melhoramento da soja. Para isso, foram utilizados dados referentes à avaliação de 30 genótipos em dez ambientes, referentes à característica produtividade de grãos. Os componentes de variância foram estimados pela máxima verossimilhança restrita (REML) e os valores genotípicos foram preditos pela melhor previsão imparcial linear (BLUP). Efeitos significativos dos genótipos e interação G × E foram detectados pelo teste da razão de verossimilhança (LRT). Correlação genotípica baixa foi obtida entre os ambientes indicando interação G × E do tipo complexa. A acurácia seletiva foi muito alta, indicando alta confiabilidade. Os resultados mostraram que os genótipos de soja mais produtivos apresentam alta adaptabilidade e estabilidade.

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As avaliações genéticas permitem compreender a evolução da raça e a importância dos componentes genéticos sobre a variação fenotípica das características de interesse de produção em animais. Objetivou-se, com este trabalho, estimar a tendência genética, a herdabilidade e a correlação genética para altura de cernelha e funcionalidade da marcha em equinos brasileiros da raça Campolina. A Associação Brasileira dos Criadores de Cavalo Campolina disponibilizou 107.630 dados de animais registrados desde 1951 até julho de 2016. As avaliações genéticas foram obtidas por modelo animal uni-característico, para altura de cernelha, com dados de 11.765 indivíduos, e bi-característico, para os atributos de qualidade de marcha, que são: comodidade, desenvolvimento, dissociação, estilo e regularidade, pertencentes a 2.148, 2.148, 2.145, 2.125 e 2.148 equinos, respectivamente. Incremento genético de 3,88cm foi observado para altura de cernelha ao longo dos anos, sugerindo a eficiência de seleção para porte elevado no Campolina. Não foi verificada evolução genética nos atributos de marcha, podendo indicar necessidade de melhoria nos processos de avaliação e seleção dos animais para maior comodidade e desenvoltura desse andamento. Verificou-se herdabilidade igual a 0,37 para altura de cernelha e 0,77 para dissociação, além de herdabilidades de comodidade, desenvolvimento, estilo e regularidade iguais a 0,15, 0,23, 0,22 e 0,28. Os resultados indicam que essas características podem ser utilizadas como critério de seleção para melhor qualidade de marcha. As correlações genéticas verificadas entre a medida linear e todos os atributos de marcha foram de baixa magnitude, variando entre -0,01 e 0,05. Desta forma, é sugerido que a seleção para altura na cernelha exerce baixa influência sobre os ganhos genéticos em atributos de marcha.

Genetic evaluations allow to describe the genetic evolution of a breed and to understand the importance of the genetic variability on the phenotypic variance of a production interesting trait. This study aimed to estimate genetic tendency, heritability and genetic correlation for withers height and gait functionality traits in Brazilian Campolina horses. The Brazilian Association of Campolina Horse Breeders provided 107,630 records from registered animals born from 1951 until July 2016. Genetic evaluations were obtained by uni-trait animal model, for withers height using data from 11,765 individuals, and bi-trait models for attributes of gait quality: comfort, reach, dissociation, style and regularity, belonging to 2,148, 2,148, 2,145, 2,125 and 2,148 horses, respectively. A genetic increase of 3.88cm was observed for withers height over the years, suggesting the efficiency of selection for high height in Campolina. There was no genetic evolution in the gait attributes, which may indicate the need for improvement in the evaluation and selection processes of the animals for greater comfort and range of their gait. Heritability equal to 0.37 and 0.77 was observed for withers height and dissociation. Comfort, reach, style and regularity showed heritabilities of 0.15; 0.23; 0.22 and 0.28, respectively. The results indicate that these characteristics can be used as selection criteria for better gait quality. The genetic correlations observed between the linear measurement and all gait attributes were low varying between -0.01 and 0.05. Therefore, the selection for withers height would have little influence on the genetic gains in gait attributes.

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We aimed to evaluate the effects of sex and the linear and quadratic components of age of dam at calving, as well as apply a mixed model including maternal effect for the genetic evaluation of weaning (WW) and yearling (YW) weights. The phenotypic database was composed by Charolais, Caracu, Aberdeen Angus, and Canchim purebred and crossbred animals. Single-trait analyses were performed using models that included the maternal effect for WW and YW traits, and a model ignoring this effect on YW (YWNM). The Deviance Information Criterion (DIC), model posterior probabilities (MPP), accuracy of breeding values (ACC), and Spearman's rank correlation were applied to compare the models including and ignoring the maternal effect on YW. Sex and age of dam at calving had significant effects on WW and YW. The direct heritability estimates were 0.21±0.03 and 0.05±0.02, and the maternal heritabilities were 0.11±0.02 and 0.02±0.01 for WW and YW, respectively. The heritabilities estimated for YW may have been influenced by the several genetic groups in the population and by used conventional animal model, which may not have been the better fit model to evaluate YW in this population. The DIC, MPP, and ACC values indicated that YW outperformed the YWNM model, but the rank correlation and percentages of individuals selected in common suggested that the best animals would be selected independently of the model chosen.

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The aim of this study was to evaluate genomic information inclusion in genetic parameter estimation of standardized body weight at birth and at 240, 365, and 450 days of age, and visual scores for body structure, precocity, and body muscularity, measured as yearlings in Nelore cattle. We compared genetic parameters, (co)variance components (estimated from Bayesian inference and Gibbs sampling), breeding value accuracies, genetic trends, and principal component analysis (PCA) obtained through traditional GBLUP and ssGBLUP methods. For all traits analyzed, part of the phenotypic variation was explained by the additive genetic effect, thus indicating the capacity of traits to respond to the selection process. Estimates of genetic correlation, in both methodologies, between body weights and visual scores were, in general, high and positive, showing that the selection for visual scores can lead to heavier animals. Genetic trends showed genetic progress, both when estimated breeding values and genomic estimated breeding values were used. The PCA, genetic trends, and accuracy estimates on breeding values showed that inclusion of single nucleotide polymorphism information contributed towards slightly better estimates of the genetic variability of evaluated traits. Genomic information did not bring greater gains in genetic estimates, due to redundancy of kinship information from the pedigree, which already had complete animal kinship data.