Validation of a one-tube nested real-time PCR assay for the detection of Cryptosporidium spp. in avian fecal samples / Validação da nested PCR em tempo real em um tubo para detecção de Cryptosporidium spp. em amostras fecais de aves

Abstract The aim of this study was to validate a one-tube nested real-time PCR assay followed by genetic sequencing to detect and identify Cryptosporidium species and genotypes in birds. A total of 443 genomic DNA extracted from avian fecal samples were analyzed by one-tube nested real-time PCR and conventional nested PCR. By one-tube nested real-time PCR, 90/443 (20.3%) samples were positive for Cryptosporidium spp. In contrast, 36/443 (8.1%) samples were positive for Cryptosporidium spp. by conventional nested PCR. The analytical sensitivity test showed that one-tube nested real-time PCR detects approximately 0.5 oocyst (2 sporozoites) per reaction. An evaluation of analytical specificity did not reveal amplification of microorganisms that commonly present nonspecific amplification with primers used for the diagnosis of Cryptosporidium spp. The repeatability analysis showed the same result in 27 out of 30 samples (90%). As for the reproducibility of one-tube nested real-time PCR, 24 of the 30 samples examined (80%) showed the same result. All the 90 samples amplified by one-tube real-time nested PCR were successfully sequenced, leading to the identification of C. baileyi, C. galli, C. meleagridis, C. proventriculi, and Cryptosporidium avian genotype I. Genetic sequencing of conventional nested PCR amplicons was successful in 10/36 (27.8%) of positive samples.

Resumo O objetivo deste trabalho foi validar um protocolo de nested PCR em tempo real em um tubo (nPCR-TR-1T) seguida de sequenciamento genético para detectar e caracterizar as espécies e genótipos de Cryptosporidium em aves. Um total de 443 amostras de DNA genômico, extraído de amostras fecais de aves, foi analisado pela nPCR-TR-1T e pela nested PCR convencional. Pela nPCR-TR-1T, foi observada positividade para Cryptosporidium spp. de 20,3% (90/443), em contraste com a nested PCR convencional, que apresentou positividade de 8,1% (36/443). O teste de sensibilidade analítica mostrou que a nPCR-TR-1T detecta aproximadamente 0,5 oocisto (2 esporozoítos) por reação. A avaliação da especificidade analítica não revelou amplificação de microrganismos que comumente apresentam amplificação inespecífica com primers utilizados para o diagnóstico de Cryptosporidium spp. O cálculo da repetibilidade evidenciou o mesmo resultado em 27 de 30 amostras (90%). Em relação à reprodutibilidade da nPCR-TR-1T, foi observado o mesmo resultado em 80% (24/30) das amostras examinadas. Foi possível realizar o sequenciamento em todas as 90 amostras amplificadas pela nPCR-TR-1T, com identificação de C. baileyi, C. galli, C. meleagridis, C. proventriculi e Cryptosporidium genótipo I em aves. O sequenciamento dos fragmentos amplificados pela nested PCR convencional foi possível em 10/36 (27,8%) das amostras positivas.

Zebrafish (Danio rerio) meets bioethics: the 10Rs ethical principles in research / O peixe-zebra (Danio rerio) encontra a bioética: os princípios éticos dos 10Rs na pesquisa

Zebrafish (Danio rerio) is a tropical fish species widely used in research, worldwide. The development of genetically modified animals and the increasing number of zebrafish breeding facilities due to their emerging use in several research fields, opened room for new ethical challenges for research carried out with this species. It is necessary to raise the scientific community's awareness of the ethical standards and laws in force, on animal research. Thus, the aim of the current study is to describe 10 Rs ethical principles by using zebrafish as model system in research. The classical 3 Rs concerning animal welfare, namely replacement, reduction and refinement; and the added 7 Rs related to scientific (registration, reporting, robustness, reproducibility and relevance) and conduct principles (responsibility, and respect) in zebrafish research are herein presented and critically discussed. The use of these 10 Rs by researchers, institutions and the Animal Ethics Committee is recommended to support regulations, decision-making about and the promotion of zebrafish health and welfare in research.

O peixe-zebra (Danio rerio) é um peixe tropical amplamente usado em pesquisas em todo o mundo. Devido ao seu uso emergente em várias áreas de pesquisa, o desenvolvimento de animais geneticamente modificados e o aumento das instalações de peixe-zebra, novos desafos éticos surgem na pesquisa com o peixe-zebra. Além disso, é necessária a conscientização da comunidade científica sobre as normas éticas e leis vigentes na pesquisa com animais. Assim, o presente estudo teve como objetivo descrever os princípios éticos de 10 Rs usando o peixe-zebra como sistema modelo em pesquisa. Os 3 Rs clássicos relativos ao bem-estar animal (substituição, redução e refinamento) e 7 Rs adicionais relacionados aos princípios científicos (registro, relatório, robustez, reprodutibilidade e relevância) e de conduta (responsabilidade e respeito) na pesquisa do peixe-zebra são apresentados e discutido criticamente. Recomendamos o uso desses 10 Rs pelos pesquisadores, instituições e Comitê de Ética Animal na regulamentação, decisão e promoção da saúde e bem-estar do peixe-zebra em pesquisas.

Multiparametric assay of screening for the diagnosis of mycoses of interest in Public Health: standardization of methodology / Ensaio multiparamétrico de triagem para diagnóstico de micoses de interesse em Saúde Pública: padronização da metodologia

The standardization and validation of a multiplex assay requires the combination of important parameters such as sensitivity and specificity, acceptable levels of performance, robustness, and reproducibility. We standardized a multiparametric Dot-blot aimed at the serological screening of paracoccidioidomycosis, histoplasmosis, and aspergillosis. A total of 148 serum were evaluated: 10 from healthy subjects, 36 from patients with paracoccidioidomycosis, 62 from patients with histoplasmosis, and 40 from patients with aspergillosis. It was found that the multiparametric Dot-blot showed a high percentage of cross-reactivity. However, when evaluated individually, in the serological screening of histoplasmosis, a good performance was observed when compared to the double immunodiffusion assay, considered the gold standard test, with 100% co-positivity and 83.3% co-negativity. The performance of serological screening for aspergillosis was not satisfactory when compared to double immunodiffusion, showing 71.4% co-positivity and 100% co-negativity. The evaluation of the stability of nitrocellulose membranes showed that membranes sensitized with H. capsulatum antigen remained stable for 90 days and those sensitized with A. fumigatus antigen for 30 days. We conclude that the use of crude antigens was not suitable for the standardization of the multiparametric Dot-blot assay, due to the high cross-reactivity, and that further tests should be performed with purified proteins (AU).

A padronização e validação de um ensaio multiplex requer a combinação de parâmetros importantes, como sensibilidade e especificidade, níveis aceitáveis de desempenho, robustez e reprodutibilidade. Este trabalho padronizou um Dot-blot multiparamétrico visando a triagem sorológica da paracoccidioidomicose, histoplasmose e aspergilose. Foram avaliadas 148 amostras de soro: 10 de indivíduos saudáveis, 36 de pacientes com paracoccidioidomicose, 62 de pacientes com histoplasmose e 40 de pacientes com aspergilose. Verificou-se que o Dot-blot multiparamétrico apresentou elevado percentual de reatividade cruzada. Entretanto, quando avaliado individualmente, na triagem sorológica da histoplasmose observou-se bom desempenho quando comparado ao ensaio de imunodifusão dupla, considerado o teste padrão ouro, com 100% de co-positividade e 83,3% de co-negatividade. O desempenho da triagem sorológica da aspergilose não foi satisfatório quando comparado a imunodifusão dupla, apresentando 71,4% de co-positividade e 100% de co-negatividade. A avaliação da estabilidade das membranas de nitrocelulose mostrou que membranas sensibilizadas com antígeno de H. capsulatum permaneceram estáveis por 90 dias e as sensibilizadas com antígeno de A. fumigatus, por 30 dias. Concluímos que o uso de antígenos brutos não foi adequado para a padronização do ensaio de Dot-blot multiparamétrico, devido ao alto índice de reatividade cruzada, e que novos testes devem ser realizados com proteínas purificadas (AU).

Diagrammatic scales for the estimation of black node disease severity in common bean / Escalas diagramáticas para a estimativa da gravidade da doença do nó negro no feijão comum

The objective of this study was to design two diagrammatic scales for the evaluation of black node disease (Stagonosporopsis hortensis and Boeremia spp.) in common bean (Phaseolus vulgaris L.). The developed scales corresponded to logarithmic intervals (SADL) of seven levels and equal intervals (SADE) of nine levels. These scales were compared to the scale developed by the International Center for Tropical Agriculture (CIAT), which corresponds to a descriptive scale (NoSAD). In the scale validation the accuracy, precision, and concordance of repeatability were determined using Lins concordance correlation coefficient, whereas inter-rater reproducibility was determined by the overall concordance correlation coefficient (OCCC). It was observed that with the use of the proposed scales, reproducibility and repeatability were significantly improved for inexperienced raters, and reproducibility was improved in the case of experienced raters. Thus, the designed standard area diagrams with equal and logarithmic intervals are a useful tool for estimating severity under field and experimental conditions as part of the study of this patho-system.(AU)

O objetivo deste estudo foi delinear duas escalas diagramáticas para avaliação da doença do nó preto (Stagonosporopsis hortensis e Boeremia spp.) em feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.). As escalas desenvolvidas corresponderam a intervalos logarítmicos (SADL) de sete níveis e intervalos iguais (SADE) de nove níveis. Essas escalas foram comparadas com a escala desenvolvida pelo Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT), que corresponde a uma escala descritiva (NoSAD). Na validação da escala, a exatidão, precisão e concordância da repetibilidade foram determinadas usando o coeficiente de correlação de concordância de Lin, enquanto a reprodutibilidade entre avaliadores foi determinada pelo coeficiente de correlação de concordância geral (OCCC). Observou-se que, com o uso das escalas propostas, a reprodutibilidade e a repetibilidade foram significativamente melhoradas para os avaliadores inexperientes, e a reprodutibilidade foi melhorada no caso dos avaliadores experientes. Assim, as escalas diagramáticas projetadas são uma ferramenta útil para estimar a severidade em condições experimentais e de campo como parte do estudo desse sistema patológico.(AU)

Development and validation of a simulator for teaching minimally invasive thoracic surgery in Brazil

ABSTRACT Purpose To develop and validate a chest cavity simulator for teaching video-assited thoracic surgery (VATS). Methods The first phase of the study consisted of developing a chest cavity simulator. A quasi-experimental study was performed in the second phase, and 25 surgeons and residents participated in a three-stage pulmonary suture experiment. The videos were recorded and timed. Generalized linear regression models for repeated measures were used to analyze the outcome change over time. Results The chest cavity simulator consists of a console simulating the left hemithorax. Among the participants, 96% rated the design, visual aspect, positioning ergonomics, and triangulation of the portals as very good or excellent (face validity). There was a decrease in suturing time in step 1 from 435.7 ± 105 to 355.6 ± 76.8 seconds compared to step 3 (p = 0.001). The evaluation of the simulation effectiveness and performance (content validity) was rated as very good or excellent by 96% ofparticipants. The most experienced surgeon showed significant reduction in procedure time (p = 0.021) (construct validity). Conclusions The thoracic cavity simulator is realistic, showing content and construct validity, and can be used in VATS training. The simulation model allowed skill gain in the endoscopic suture.

Integrative taxonomy: combining molecular and morphological characteristics to identify Lymnaea (Galba) cubensis, intermediate host of Fasciola hepatica / Taxonomia integrativa: combinando características moleculares e morfológicas para identificar Lymnaea (Galba) cubensis, hospedeiro intermediário de Fasciola hepatica

Abstract Despite the epidemiological importance of the Lymnaeidae family regarding transmission of Fasciola hepatica, knowledge about the diversity and distribution of these molluscs and the role of each species in the expansion of fasciolosis remains sparse. Classical morphological (n=10) identification was performed in lymneids from Lagoa Santa, a municipality in the state of Minas Gerais, Brazil, along with molecular and phylogenetic analysis (n=05) based on the partial nucleotide sequences of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I gene (COI mtDNA) and ribosomal internal transcribed spacer II (ITS-2 rDNA). The shell morphology made it possible to distinguish the lymneids of Lagoa Santa from Pseudosuccinea columella. Differences found in the penile complex and prostate shape allowed this species to be distinguished from Galba truncatula. However, the homogeneity of reproductive tract characteristics among Lymnaea (Galba) cubensis, L. viator and L. neotropica confirmed that these characteristics show low taxonomic reliability for identifying cryptic species. Genetic divergence analysis for the COI mtDNA gene and ITS-2 region of rDNA revealed greater similarity to Lymnaea (Galba) cubensis. Thus, correct species differentiation is important for monitoring the epidemiological risk of fasciolosis in the state of Minas Gerais, where cases of the disease have increased over recent years.

Resumo Apesar da importância epidemiológica da família Lymnaeidae na transmissão de Fasciola hepatica, o conhecimento sobre a diversidade e a distribuição desses moluscos e o papel de cada espécie, na expansão da fasciolose, ainda é escasso. Realizou-se a identificação morfológica clássica (n=10) em limneídeos de Lagoa Santa, município do estado de Minas Gerais, Brasil, juntamente com a análise molecular e filogenética (n=05), baseada nas sequências parciais de nucleotídeos do gene mitocondrial da subunidade I do citocromo c oxidase (COI mtDNA) e espaçador interno, transcrito do DNA ribossomal II (ITS-2 rDNA). A morfologia da concha possibilitou distinguir os limneídeos de Lagoa Santa de Pseudosuccinea columella. As diferenças encontradas no complexo peniano e na forma da próstata permitiram que essa espécie fosse distinta de Galba truncatula. No entanto, a homogeneidade das características do trato reprodutivo entre Lymnaea (Galba) cubensis, L. viator e L. neotropica confirmou que essas características apresentam baixa confiabilidade taxonômica para a identificação de espécies crípticas. A análise da divergência genética para o gene COI mtDNA e região ITS-2 do rDNA revelou maior similaridade entre os limneídeos de Lagoa Santa com Lymnaea (Galba) cubensis.

Standardization of blood meal production process at a rendering plant using design of experiments / Padronização do processo de produção de farinha de sangue em uma usina de processamento por meio do planejamento de experimentos

This research focuses on the standardization of the blood meal production process at a Colombian rendering plant through a design of experiments. Initially, 108 samples of blood meal were taken where only 23% achieved the moisture target (7.5% to 8.5%). Therefore, an analysis of the measurement system was performed using a repeatability and reproducibility (R&R) study. Results showed that 39.96% of the observed variability was caused by the measurement system that was out of control. So, it was necessary to improve the method of sampling reducing the participation of the measurement system in the variability of the process to only 3.79%. Later, several experiments were accomplished with a 2k factorial design. Each experiment consisted of a response variable (blood meal moisture), two controllable factors (drying chamber temperature and percentage of rotation of the metering screw), and an uncontrollable factor (initial blood meal moisture). Finally, experiments were carried out and validated observing that, with a drying chamber temperature of 160 °C and a percentage of screw rotation of 29%, more than 97% of the blood meal was according to the moisture target. In conclusion, is confirmed that the design of experiments is a tool that allows a clear path towards optimization and standardization of processes.(AU)

Esta pesquisa se concentra na padronização do processo de produção de farinha de sangue de uma usina de beneficiamento colombiana por meio de um planejamento de experimentos. Em primeiro lugar, foi realizado um estudo de 108 amostras de farinha de sangue onde apenas 23% atingiram a meta de umidade (7.5% a 8.5%). Portanto, uma análise do sistema de medição foi realizada usando um estudo de repetibilidade e reprodutibilidade (R&R). Os resultados mostraram que 39.96% da variabilidade observada foi causada pelo sistema. Assim, foi necessário aprimorar o método de amostragem, reduzindo a participação do sistema na variabilidade para apenas 3.79%. Posteriormente, vários experimentos foram realizados com um planejamento fatorial 2k. Cada experimento consistiu em uma variável de resposta (umidade da farinha de sangue), dois fatores controláveis (temperatura da câmara de secagem e porcentagem de rotação da rosca dosadora) e um fator incontrolável (umidade inicial da farinha de sangue). Finalmente, experimentos foram realizados e validados observando que, com uma temperatura da câmara de secagem de 160 ° C e um percentual de rotação da rosca de 29%, mais de 97% da farinha de sangue estava de acordo com a umidade desejada. Em conclusão, confirma-se que o planejamento de experimentos é uma ferramenta que permite um caminho claro para a otimização e padronização de processos.(AU)

Canal flare index evaluation for different dog breeds / Avaliação do canal flare index femoral de diferentes raças de cães

This study determined the canal flare index (CFI) of four dog breeds using two distinct femoral regions as a reference. Thirty-five radiographs of the hip joints of Golden Retrievers (GRG), German Shepherds (GSG), Labrador Retrievers (LRG), and Rottweilers (RG) of both sexes were used. Seventy experimental units were submitted to CFI calculation. Objective (CFIob) and subjective (CFIsub) values of the CFI of each experimental unit were determined according to the anatomical reference used for the calculation. A significant difference in the CFIob between the Golden Retriever and German Shepherd breeds (1.68 ± 0.16 and 1.49 ± 0.08), and in the CFIsub between Golden Retriever, German Shepherd, and Rottweiler breeds (2.09 ± 0.31, 1.86 ± 0.11, and 1.84 ± 0.18) was reported. The subjective form of measurement showed higher values than the objective form (GRG: 2.09 ± 0.31; GSG: 1.86 ± 0.11; LRG: 2.07 ± 0.12; RG: 1.84 ± 0.18). The CFI values of each breed were similar, suggesting a certain racial pattern. A significant difference in the interobserver assessment for both CFIsub and CFIob, in all races was observed. The CFI analysis identified morphological patterns of the proximal femur in the different races. Results indicated the need for standardization of the anatomical references used to calculate the CFI because there were statistical differences among the measurements among the observers.(AU)

Objetivou-se determinar o canal flare index (CFI) de quatro raças específicas de cães, utilizando-se duas regiões femorais distintas como referência. Foram analisadas 35 radiografias de articulações coxofemorais de cães das raças Golden Retriever (GGR), Pastor Alemão (GPA), Labrador Retriever (GLR) e Rottweiler (GR), de ambos os sexos, configurando 70 unidades experimentais submetidas ao cálculo do CFI. Determinaram-se os valores objetivo (CFIob) e subjetivo (CFIsub) do CFI de cada unidade experimental de acordo com a referência anatômica utilizada para o cálculo. Houve diferença significativa do CFIob entre as raças Golden Retriever e Pastor Alemão (1,68 ± 0,16 e 1,49 ± 0,08), e do CFIsub entre as raças Golden Retriever, Pastor Alemão e Rottweiler (2,09 ± 0,31, 1,86 ± 0,11 e 1,84 ± 0,18). A forma subjetiva de mensuração apresentou valores maiores que a forma objetiva (GGR: 2,09 ± 0,31; GPA: 1,86 ± 0,11; GLR: 2,07 ± 0,12; GR: 1,84 ± 0,18). Os valores de CFI de cada raça se apresentaram similares, sugerindo haver determinado padrão racial. Houve diferença significativa na avaliação interobservadores, tanto do CFIsub quanto CFIob, em todas as raças. A análise do CFI identificou padrões morfológicos do fêmur proximal nas diferentes raças. Os resultados indicaram a necessidade de padronização dos referenciais anatômicos utilizados para o cálculo do CFI, uma vez que houve relevância estatística entre as diferentes mensurações entre os observadores.(AU)

Comparação de métodos de avaliação corpórea de cães da raça labrador e teckel / Comparison of body assessment methods for labrador and teckel dogs / Comparación de métodos de evaluación corporal para perros labrador y teckel

Uma nutrição apropriada é um dos pré-requisitos mais importantes para a saúde e bem-estar animal, e a manutenção do peso ideal pode prevenir inúmeras doenças. Diferentes métodos de avaliação da condição corpórea vêm sendo empregados na medicina veterinária. Apesar da alta reprodutibilidade do escore de condição corpórea (ECC), ainda existem preocupações sobre subjetividade e precisão, e os métodos morfológicos, como o índice de massa corporal canina (IMCC), aparecem como uma alternativa para essa desvantagem, por ser um método quantitativo. O estudo avaliou o IMCC de 50 cães, 30 da raça labrador e 20 da raça teckel e comparou com os ECCs. Informações sobre características dos animais, hábito alimentar e tipo de manejo, também foram analisados quanto à condição corpórea apresentada. A comparação entre os métodos de ECC e IMCC apresentou discrepância de classificação em um elevado número de animais, a característica da morfologia corporal dos cães pode interferir com sua precisão.

Proper nutrition is one of the most important prerequisites for animal health and welfare, and dogs optimal weight maintenance can prevent numerous diseases. Different methods of corporeal condition evaluation have been used in veterinary medicine. Although widely used, the body condition score (BCS) is a test influenced by the evaluator experience and a quantitative method, such as the dog body mass index (IMCC), appears as an alternative to this disadvantage. However, the large variation in the body morphology dogs can interfere with their accuracy. The study evaluated 50 dogs IMCC, 30 Labrador breed and 20 Dachshund breed and compared with the animals ECC. Information on animal characteristics, eating habits and type of management were also analyzed for the body condition presented. The comparison between the ECC and IMCC methods showed a classification discrepancy in a high number of animals, the characteristic of the dogs' body morphology can interfere with its accuracy.

Una nutrición adecuada es uno de los requisitos previos más importantes para la salud y el bienestar de los animales, y el mantenimiento del peso ideal del perro puede prevenir numerosas enfermedades. En medicina veterinaria se han utilizado diferentes métodos para evaluar la condición corporal. Aunque ampliamente utilizado, la puntuación de la condición corporal (PCC) es una prueba influenciada por la experiencia del evaluador y los métodos cuantitativos, como el índice de masa corporal canina (IMCC), aparecen como una alternativa a esta desventaja. Sin embargo, la gran variación en la morfología corporal de los perros puede interferir con su precisión. El estudio evaluó el IMCC de 50 animales, 30 de la raza labrador y 20 de la raza teckel y lo comparó con los ECC. También se analizó la información sobre las características de los animales, los hábitos de alimentación y el tipo de manejo para determinar la condición corporal. La comparación entre los métodos ECC e IMCC mostró una discrepancia de clasificación en un alto número de animales, la característica de la morfología corporal de los perros puede interferir con su precisión.

Comparação de métodos de avaliação corpórea de cães da raça labrador e teckel / Comparison of body assessment methods for labrador and teckel dogs / Comparación de métodos de evaluación corporal para perros labrador y teckel

Uma nutrição apropriada é um dos pré-requisitos mais importantes para a saúde e bem-estar animal, e a manutenção do peso ideal pode prevenir inúmeras doenças. Diferentes métodos de avaliação da condição corpórea vêm sendo empregados na medicina veterinária. Apesar da alta reprodutibilidade do escore de condição corpórea (ECC), ainda existem preocupações sobre subjetividade e precisão, e os métodos morfológicos, como o índice de massa corporal canina (IMCC), aparecem como uma alternativa para essa desvantagem, por ser um método quantitativo. O estudo avaliou o IMCC de 50 cães, 30 da raça labrador e 20 da raça teckel e comparou com os ECCs. Informações sobre características dos animais, hábito alimentar e tipo de manejo, também foram analisados quanto à condição corpórea apresentada. A comparação entre os métodos de ECC e IMCC apresentou discrepância de classificação em um elevado número de animais, a característica da morfologia corporal dos cães pode interferir com sua precisão.(AU)

Proper nutrition is one of the most important prerequisites for animal health and welfare, and dogs optimal weight maintenance can prevent numerous diseases. Different methods of corporeal condition evaluation have been used in veterinary medicine. Although widely used, the body condition score (BCS) is a test influenced by the evaluator experience and a quantitative method, such as the dog body mass index (IMCC), appears as an alternative to this disadvantage. However, the large variation in the body morphology dogs can interfere with their accuracy. The study evaluated 50 dogs IMCC, 30 Labrador breed and 20 Dachshund breed and compared with the animals ECC. Information on animal characteristics, eating habits and type of management were also analyzed for the body condition presented. The comparison between the ECC and IMCC methods showed a classification discrepancy in a high number of animals, the characteristic of the dogs' body morphology can interfere with its accuracy.(AU)

Una nutrición adecuada es uno de los requisitos previos más importantes para la salud y el bienestar de los animales, y el mantenimiento del peso ideal del perro puede prevenir numerosas enfermedades. En medicina veterinaria se han utilizado diferentes métodos para evaluar la condición corporal. Aunque ampliamente utilizado, la puntuación de la condición corporal (PCC) es una prueba influenciada por la experiencia del evaluador y los métodos cuantitativos, como el índice de masa corporal canina (IMCC), aparecen como una alternativa a esta desventaja. Sin embargo, la gran variación en la morfología corporal de los perros puede interferir con su precisión. El estudio evaluó el IMCC de 50 animales, 30 de la raza labrador y 20 de la raza teckel y lo comparó con los ECC. También se analizó la información sobre las características de los animales, los hábitos de alimentación y el tipo de manejo para determinar la condición corporal. La comparación entre los métodos ECC e IMCC mostró una discrepancia de clasificación en un alto número de animales, la característica de la morfología corporal de los perros puede interferir con su precisión.(AU)

A standard area diagram set for assessing severity of eucalyptus bacterial blight caused by Erwinia psidii / Uma escala diagramática para a avaliação da severidade da seca-de-ponteiros do eucalipto causada por Erwinia psidii

This study aimed to develop and validate a standard area diagram (SAD) set to estimate the severity of bacterial blight of eucalyptus caused by Erwinia psidii. For this purpose, an eight-level SAD was developed and validated by ten inexperienced raters. Accuracy and precision of the estimates by each rater, with and without the SAD, were determined based on Lin's concordance correlation coefficient. The proposed SAD improved the accuracy and precision of the estimates. The SAD set studied here is a useful tool in assessments of bacterial blight of eucalyptus for epidemiological research and breeding programs.(AU)

Este trabalho objetivou o desenvolvimento de uma escala para estimar a severidade da seca-de-ponteiros do eucalipto causada por Erwinia psidii. Para isso, uma escala de oito níveis foi desenvolvida e validada por dez avaliadores inexperientes. A acurácia e precisão das estimativas de cada avaliador, com e sem a escala, foram determinadas baseadas no coeficiente de correlação concordante de Lin. A escala proposta melhorou a acurácia e a precisão das estimativas. A escala estudada se mostrou uma ferramenta útil na avaliação da seca-de-ponteiros do eucalipto para estudos epidemiológicos e em programas de melhoramento.(AU)

A standard area diagram set for assessing severity of eucalyptus bacterial blight caused by Erwinia psidii / Uma escala diagramática para a avaliação da severidade da seca-de-ponteiros do eucalipto causada por Erwinia psidii

This study aimed to develop and validate a standard area diagram (SAD) set to estimate the severity of bacterial blight of eucalyptus caused by Erwinia psidii. For this purpose, an eight-level SAD was developed and validated by ten inexperienced raters. Accuracy and precision of the estimates by each rater, with and without the SAD, were determined based on Lin's concordance correlation coefficient. The proposed SAD improved the accuracy and precision of the estimates. The SAD set studied here is a useful tool in assessments of bacterial blight of eucalyptus for epidemiological research and breeding programs.(AU)

Este trabalho objetivou o desenvolvimento de uma escala para estimar a severidade da seca-de-ponteiros do eucalipto causada por Erwinia psidii. Para isso, uma escala de oito níveis foi desenvolvida e validada por dez avaliadores inexperientes. A acurácia e precisão das estimativas de cada avaliador, com e sem a escala, foram determinadas baseadas no coeficiente de correlação concordante de Lin. A escala proposta melhorou a acurácia e a precisão das estimativas. A escala estudada se mostrou uma ferramenta útil na avaliação da seca-de-ponteiros do eucalipto para estudos epidemiológicos e em programas de melhoramento.(AU)

Standard area diagram set for scab quantification in trilobed leaves of the sour passion fruit / Escala diagramática para a quantificação da verrugose em folhas trilobadas do maracujazeiro azedo

The study aimed to develop and validate a standard area diagram set (SADs) to improve accuracy, precision, and reproducibility in the assessment of scab severity in trilobed leaves of the sour passion fruit. The SADs comprised six severity levels (1%; 3%; 6%; 11%; 21%; and 33%). The SADs increased the accuracy of the estimates by reducing the constant and systematic errors, and the tendency to overestimate the actual severity, limited the number of evaluators who presented this trend, in addition to increasing the bias correction factor. The inexperienced evaluators were the ones that benefited the most from the SADs use. Once the SADs was introduced, 80% and 100% evaluators gave estimates free from constant and systematic errors, respectively. The improvement in precision was verified by the increase in the coefficient of determination and Lins concordance correlation coefficient, by reducing absolute errors and increasing the reproducibility of the estimates.(AU)

O objetivo deste estudo foi desenvolver e validar uma escala diagramática para melhorar a acurácia, precisão e reprodutibilidade na avaliação da severidade da verrugose em folhas trilobadas do maracujazeiro azedo. A escala apresentou seis níveis de severidade (1; 3; 6; 11; 21 e 33%) e aumentou a acurácia das estimativas, reduzindo os erros constantes e sistemáticos, a tendência de superestimação em relação aos valores de severidade real e o número de avaliadores que apresentavam essa tendência, além de aumentar o fator de correção do desvio. Os avaliadores inexperientes foram os mais beneficiados pela utilização da escala, sendo que 80% e 100% destes avaliadores apresentaram estimativas livres de erros constantes e sistemáticos, respectivamente, quando a escala foi empregada. O aumento da precisão foi verificado pelo incremento dos coeficientes de determinação e de concordância de Lin, redução dos erros absolutos e aumento da reprodutibilidade das estimativas.(AU)

Reprodutibilidade e repetibilidade de mensuração radiográfica da silhueta cardíaca em cães da raça poodle / Reproducibility and repeatability of radiographic measurement of the cardiac silhouette in poodles

Avaliou-se o potencial de reprodutibilidade e repetibilidade de um sistema semiautomático de mensuração radiográfica. Para isto foram mensurados, por intermédio de um software o vertebral heart score (VHS) e a área cardíaca normalizada (ACN) em imagens radiográficas de cães da raça poodle clinicamente normais e portadores de insuficiência valvar mitral. Dada a subjetividade da análise da silhueta cardíaca por diferentes observadores, acredita-se que mesmo com um sistema semiautomático essa avaliação poderia ser afetada pela experiência prévia do observador em radiodiagnóstico. Foram analisadas cinquenta e sete imagens radiográficas torácicas de cães atendidos em um hospital veterinário. As imagens foram analisadas por dois grupos de observadores com diferentes níveis de experiência em radiologia: (A) sem experiência (n = 2) e (B) com experiência (n = 2). Demonstrou-se boa repetibilidade e reprodutibilidade para o VHS independente da experiência em radiodiagnóstico, e para a ACN em observadores experientes e com familiaridade com o software.

The potential of reproducibility and repeatability of a semi-automatic system of radiographic measurement was evaluated. For this purpose, the vertebral heart score (VHS) and normalized cardiac area (NCA) were evaluated in radiographs of healthy poodles and of patients with mitral regurgitation. Considering the subjective aspect of the cardiac silhouette analysis by different observers, it is believed that even with a semi-automatic system this evaluation could be affected by the previous experience of the observer in radiodiagnosis. Fifty seven thoracic images were analyzed by two groups of observers with different levels of experience in radiology: (A) without experience (n = 2) and (B) with experience (n = 2). Regardless of radiodiagnostic experience it was observed good repeatability and reproducibility for VHS, and also for ACN in observers with experience in radiodiagnostics and previous familiarity with the software.

Reprodutibilidade e repetibilidade de mensuração radiográfica da silhueta cardíaca em cães da raça poodle / Reproducibility and repeatability of radiographic measurement of the cardiac silhouette in poodles

Avaliou-se o potencial de reprodutibilidade e repetibilidade de um sistema semiautomático de mensuração radiográfica. Para isto foram mensurados, por intermédio de um software o vertebral heart score (VHS) e a área cardíaca normalizada (ACN) em imagens radiográficas de cães da raça poodle clinicamente normais e portadores de insuficiência valvar mitral. Dada a subjetividade da análise da silhueta cardíaca por diferentes observadores, acredita-se que mesmo com um sistema semiautomático essa avaliação poderia ser afetada pela experiência prévia do observador em radiodiagnóstico. Foram analisadas cinquenta e sete imagens radiográficas torácicas de cães atendidos em um hospital veterinário. As imagens foram analisadas por dois grupos de observadores com diferentes níveis de experiência em radiologia: (A) sem experiência (n = 2) e (B) com experiência (n = 2). Demonstrou-se boa repetibilidade e reprodutibilidade para o VHS independente da experiência em radiodiagnóstico, e para a ACN em observadores experientes e com familiaridade com o software.(AU)

The potential of reproducibility and repeatability of a semi-automatic system of radiographic measurement was evaluated. For this purpose, the vertebral heart score (VHS) and normalized cardiac area (NCA) were evaluated in radiographs of healthy poodles and of patients with mitral regurgitation. Considering the subjective aspect of the cardiac silhouette analysis by different observers, it is believed that even with a semi-automatic system this evaluation could be affected by the previous experience of the observer in radiodiagnosis. Fifty seven thoracic images were analyzed by two groups of observers with different levels of experience in radiology: (A) without experience (n = 2) and (B) with experience (n = 2). Regardless of radiodiagnostic experience it was observed good repeatability and reproducibility for VHS, and also for ACN in observers with experience in radiodiagnostics and previous familiarity with the software.(AU)

Development and validation of a standard area diagram set to assess powdery mildew severity on watermelon leaves / Desenvolvimento e validação de uma escala diagramática para avaliar a severidade do oídio em folhas de melancia

The development and validation of a standard area diagram set (SADs) was proposed in this study to assess the severity of powdery mildew (Podosphaera xanthii) in watermelon (Citrullus lanatus) leaves. The SADs proposed has twelve levels of severity, varying from 0.07 to 100%. The SADs were validated by 16 raters who had no previous experience in evaluating plant disease severity. Initially, the estimation of severity was performed without the use of the SADs in leaves with different levels of severity. In a second moment, the same raters estimated the disease severity using the SADs proposed. By Lins concordance correlation analysis, there was an improvement in precision (coefficient of correlation, r = 0.878 and r = 0.959, without and with SADs, respectively) and accuracy (bias correction factor, Cb = 0.830 and 0.982, without and with SADs, respectively) using SADs when compared to the non-use of SADs. The agreement (Lins concordance correlation coefficient, c = 0.734 and 0.952 without and with SADs, respectively) also improved using SADs. Severity estimates inter-rater were more reliable when using SADs (coefficient of determination, R2 = 0.681 without and R2 = 0.864 with SADs; Intra-class correlation coefficient, = 0.759 and = 0.928, without and with SADs, respectively). Therefore, SADs improved precision, accuracy and reliability of powdery mildew severity on watermelon leaves.(AU)

Neste estudo foi proposto o desenvolvimento e validação de uma escala diagramática (ED) para avaliar a severidade do oídio (Podosphaera xanthii) em folhas de melancia (Citrullus lanatus). A ED proposta possui 12 níveis de severidade, variando de 0,07 a 100%. A ED foi validada por 16 avaliadores inexperientes em avaliação de severidade de doenças de plantas. Inicialmente, as estimativas de severidade foram realizadas sem o uso da ED em folhas com diferentes níveis de severidade. No segundo momento, os mesmos avaliadores estimaram a severidade da doença usando a ED proposta. Pela análise da correlação concordante de Lin, houve melhoria na precisão (coeficiente de correlação, r = 0,787 e r = 0,959, sem e com o uso da ED, respectivamente) e acurácia (fator de correção do desvio, Cb = 0,830 e 0,982, sem e com o uso da ED, respectivamente) usando a ED quando comparado ao não uso da ED. O coeficiente de correlação concordante de Lin, c = 0,734 e 0,952 sem e com o uso da ED, respectivamente) também melhorou com o uso da ED. As estimativas de severidade tiveram melhoria na reprodutibilidade quando a ED foi usada (coeficiente de determinação, R2=0,681 e R2 = 0,864 sem e com o uso da ED, respectivamente; coeficiente de correlação intra-classe, = 0,759 e = 0,928, sem e com o uso da ED, respectivamente). Portanto, a ED melhorou a precisão, acurácia e reprodutibilidade das estimativas de severidade do oídio em folhas de melancia.(AU)

Use of computed radiology as a screening test for the identification of congenital heart disease in dogs / Utilização da radiologia computadorizada como exame de triagem na identificação de cardiopatias congênitas em cães

The objectives of this study were to evaluate the accuracy of thoracic radiology as a screening test for congenital heart diseases in dogs, to identify the main contributions and limitations of this modality, and to verify the reproducibility of the evaluations by three observers with different levels of training. An interobserver, observational, retrospective and prospective study was carried out, including ninety dogs: thirty healthy animals, thirty with acquired heart diseases and thirty with congenital heart diseases, which all had thoracic radiographs and a confirmed echocardiographic diagnosis. The cases were separated and randomized by a mediator who did not participate in the reading of the radiographic examinations, and no evaluator had access to the patients' data. Sensitivity, specificity, positive predictive value (PPV), negative predictive value (NPV) and accuracy of each observer were calculated in relation to the correct classification of dogs to groups of normal or acquired and congenital heart diseases, as well as identification of enlargement of the cardiac silhouette and large vessels of dogs with congenital heart diseases. Finally, the Kappa coefficient was obtained between the observers to verify the reproducibility of the radiological evaluations performed. In general, sensitivity, PPV and accuracy were unsatisfactory ( 70%), and the agreement ranged from poor to reasonable (between 0 and 0.39). Although greater accuracy was achieved in the differentiation of healthy dogs from those with acquired and congenital heart diseases by thoracic radiography, when compared to the other studies, the modality was able only to identify healthy patients, and could not differentiate the individuals with different forms of heart disease or define the cardiac malformations. In addition, there was low reproducibility between observers, therefore, this technique should not be used as a sole screening method in dogs with suspected congenital heart diseases.(AU)

Os objetivos do estudo foram avaliar a acurácia da técnica radiográfica de tórax como exame de triagem nas cardiopatias congênitas em cães, identificar as principais contribuições e limitações dessa modalidade, e verificar a reprodutibilidade das avaliações realizadas por três observadores com diferentes graus de treinamento. Realizou-se um estudo interobservador, observacional, retrospectivo e prospectivo, o qual foram selecionados 90 cães, sendo 30 saudáveis, 30 com cardiopatias adquiridas e 30 com cardiopatias congênitas, que possuíam radiografia de tórax e diagnóstico ecocardiográfico confirmado. Os casos foram separados e randomizados por um mediador que não participou da leitura dos exames radiográficos, sendo que nenhum avaliador obteve acesso aos dados dos pacientes. Calculou-se os índices de sensibilidade, especificidade, valor preditivo positivo (VPP), valor preditivo negativo (VPN) e acurácia de cada observador em relação a identificação dos pacientes saudáveis, com cardiopatias adquiridas e congênitas, bem como para identificação de aumento da silhueta cardíaca e região de grandes vasos dos cães com cardiopatias congênitas. Por fim, foi obtido o coeficiente de Kappa entre os observadores a fim de verificar a reprodutibilidade das avaliações radiográficas realizadas. De modo geral, a sensibilidade, VPP e acurácia foram insatisfatórios (< 70%), enquanto a especificidade e VPN foram satisfatórios (> 70%), sendo que a concordância variou de ruim a razoável (entre 0 e 0,39). Apesar de ter sido alcançado acurácia maior na identificação de cães saudáveis, com cardiopatias adquiridas e congênitas pela radiografia de tórax quando comparado aos demais estudos, confirma-se que essa modalidade se mostrou capaz apenas de identificar o paciente saudável, não de diferenciar os indivíduos cardiopatas entre si ou de definir com maior detalhe as malformações cardíacas especificamente. Além disso, o exame radiográfico de tórax apresentou baixa reprodutibilidade entre os observadores, portanto, essa técnica não deve ser considerada como método único de triagem na suspeita de cães com cardiopatias congênitas.(AU)

Equipamentos automatizados na criação e crescimento do zebrafish / Automated equipment in the breeding and growth of zebrafish

Roedores, primatas não humanos e coelhos são os animais mais importantes para as pesquisas cientificas, principalmente pela sua semelhança genética e facilidade no manuseio em uma instituição de pesquisa. Outros modelos animais não convencionais podem apresentar vantagens, como menor custo, maior facilidade no manuseio e maior reprodutibilidade da pesquisa. Por isso, cada vez mais se tem utilizado e trabalhado com modelos animais experimentais não experimentais na pesquisa cientifica. O Zebrafish (Danio rerio) também chamado no Brasil de “paulistinha” é um peixe nativo do Himalaia que possui vantagens que o tornam um ótimo modelo experimental, como: tamanho pequeno, baixo custo, alta taxa de fecundidade, genoma completamente sequenciado, desenvolvimento comportamental e embriológico bem conhecido, apresenta respostas à testes de toxicidade similar à modelos humanos e sistema imune relativamente conservado entre o Zebrafish e humanos (o que leva à diferentes modelos específicos de Zebrafish para algumas doenças infecciosas bacterianas, parasitarias e virais que afetam os humanos, como, por exemplo Tuberculose e Zika). Porém o seu uso depende do uso de sistemas mais modernos de monitoramento especializados nesses animais e começaram a aparecer cada vez mais racks automatizados. Desta forma, equipamentos automatizados que facilitam o trabalho do manipulador e diminui a possibilidade de erro no cuidado com os animais são extremamente importantes para que o animal não se infecte ou transmite doenças entre os aquários em um sistema de monitoramento conectado.

Rodents, non-human primates and rabbits are the most important animals for scientific research, mainly for their genetic similarity and ease of handling in a research institution. Other unconventional animal models may have advantages, such as lower cost, easier handling and greater reproducibility of the research. Therefore, more and more experimental and non-experimental animal models have been used and worked in scientific research. Zebrafish (Danio rerio) also called “paulistinha” in Brazil is a fish native to the Himalayas that has advantages that make it a great experimental model, such as: small size, low cost, high fertility rate, completely sequenced genome, behavioral development and well-known embryological, it presents responses to toxicity tests similar to human models and relatively conserved immune system between Zebrafish and humans (which leads to different specific models of Zebrafish for some bacterial, parasitic and viral infectious diseases that affect humans, such as , for example Tuberculosis and Zika). However, its use depends on the use of more modern monitoring systems specialized in these animals and more and more automated racks have started to appear. Thus, automated equipment that facilitates the manipulator’s work and reduces the possibility of error in caring for animals is extremely important so that the animal does not become infected or transmit diseases between aquariums in a connected monitoring system.

Equipamentos automatizados na criação e crescimento do zebrafish / Automated equipment in the breeding and growth of zebrafish

Roedores, primatas não humanos e coelhos são os animais mais importantes para as pesquisas cientificas, principalmente pela sua semelhança genética e facilidade no manuseio em uma instituição de pesquisa. Outros modelos animais não convencionais podem apresentar vantagens, como menor custo, maior facilidade no manuseio e maior reprodutibilidade da pesquisa. Por isso, cada vez mais se tem utilizado e trabalhado com modelos animais experimentais não experimentais na pesquisa cientifica. O Zebrafish (Danio rerio) também chamado no Brasil de “paulistinha” é um peixe nativo do Himalaia que possui vantagens que o tornam um ótimo modelo experimental, como: tamanho pequeno, baixo custo, alta taxa de fecundidade, genoma completamente sequenciado, desenvolvimento comportamental e embriológico bem conhecido, apresenta respostas à testes de toxicidade similar à modelos humanos e sistema imune relativamente conservado entre o Zebrafish e humanos (o que leva à diferentes modelos específicos de Zebrafish para algumas doenças infecciosas bacterianas, parasitarias e virais que afetam os humanos, como, por exemplo Tuberculose e Zika). Porém o seu uso depende do uso de sistemas mais modernos de monitoramento especializados nesses animais e começaram a aparecer cada vez mais racks automatizados. Desta forma, equipamentos automatizados que facilitam o trabalho do manipulador e diminui a possibilidade de erro no cuidado com os animais são extremamente importantes para que o animal não se infecte ou transmite doenças entre os aquários em um sistema de monitoramento conectado.(AU)

Rodents, non-human primates and rabbits are the most important animals for scientific research, mainly for their genetic similarity and ease of handling in a research institution. Other unconventional animal models may have advantages, such as lower cost, easier handling and greater reproducibility of the research. Therefore, more and more experimental and non-experimental animal models have been used and worked in scientific research. Zebrafish (Danio rerio) also called “paulistinha” in Brazil is a fish native to the Himalayas that has advantages that make it a great experimental model, such as: small size, low cost, high fertility rate, completely sequenced genome, behavioral development and well-known embryological, it presents responses to toxicity tests similar to human models and relatively conserved immune system between Zebrafish and humans (which leads to different specific models of Zebrafish for some bacterial, parasitic and viral infectious diseases that affect humans, such as , for example Tuberculosis and Zika). However, its use depends on the use of more modern monitoring systems specialized in these animals and more and more automated racks have started to appear. Thus, automated equipment that facilitates the manipulators work and reduces the possibility of error in caring for animals is extremely important so that the animal does not become infected or transmit diseases between aquariums in a connected monitoring system.(AU)

Distraction index measurement on the dog's hip joint using a dedicated software / [Medição do índice de distração da anca do cão usando um software especial]

The aim of this study was to test the accuracy of a new automated computer software tool for the assessment of passive hip laxity. The hip laxity was estimated using the dedicated computer software by two blinded evaluators, one previously trained and one without specific training for distraction index measurement, in two independent sessions using 230 hip joints from 115 dogs that underwent screening for passive hip laxity using the distraction view. Previously, all of these radiographs were sent to PennHIP Analysis Center for an official distraction index record. The measurement repeatability of the two sessions was adequate for both evaluators. The reproducibility of the official distraction index measurement, mean distraction index±standard deviation 0.44±0.15, was adequate (P>0.05) for the trained evaluator, 0.44±0.15, and non-adequate (P<0.05), for the non-trained evaluator 0.47±0.17. The distraction index measurement tool proposed can be used with confidence for hip laxity evaluation by trained evaluators, as it provided good repeatability and reproducibility of official reports. The simplicity of the process described leads to a less time-consuming and more affordable procedure.(AU)

O objetivo deste estudo foi testar a viabilidade de uma nova ferramenta de software informático para avaliação da lassitude articular passiva da articulação coxofemoral. A lassitude articular da articulação coxofemoral foi estimada usando-se um programa informático especial, desenvolvido para o efeito, por dois avaliadores, um com treino prévio e outro não treinado, na medição do índice de distração, em duas sessões independentes, utilizando-se 230 articulações coxofemorais de 115 cães, as quais efetuaram o rastreio de displasia coxofemoral realizando a projeção de distração da articulação coxofemoral. Previamente, todas as radiografias foram enviadas para o PennHIP Analysis Center, para se obter uma medida oficial do índice de distração. A repetibilidade das medições das duas sessões foi adequada para ambos os avaliadores. A reprodutibilidade do índice de distração oficial, média±desvio-padrão 0,44±0,15, foi adequada (P>0,05) para o avaliador treinado, 0,44±0,15, e não adequada (P>0,05) para o avaliador não treinado, 0,47±0,17. A ferramenta de medição do índice de distração proposta pode ser usada com segurança na medição do índice de distração por avaliadores treinados, uma vez que mostra uma adequada repetibilidade e reprodutibilidade das medições oficiais do índice de distração. A simplicidade do processo apresentado torna-o menos demorado e mais econômico.(AU)