Use of convalescent plasma to treat COVID-19: case studies / Uso de plasma convalescente para tratar COVID-19: estudos de caso

There have been several efforts to minimize the effects caused by the COVID-19 virus around the world. Vaccines were developed in record time and alternative therapies were studied and applied in several countries, such as the use of plasma from recovered patients. Identifying, systematically evaluating and summarizing the best available scientific evidence on the efficacy and safety of using plasma from recovered COVID-19 patients remains the objective of this study. The studies carried out showed that the application of convalescent plasma contributes to the reduction of mortality, viral load and length of hospital stay. However, the effectiveness of the therapy still raises doubts due to the number of patients evaluated in clinical studies, in addition to its high cost and limitations in terms of availability and implementation, with the drug being authorized only for hospital use.

Houve vários esforços para minimizar os efeitos causados pelo vírus COVID-19 em todo o mundo. As vacinas foram desenvolvidas em tempo recorde e terapias alternativas foram estudadas e aplicadas em vários países, como o uso de plasma de pacientes recuperados. Identificar, avaliar sistematicamente e resumir as melhores evidências científicas disponíveis sobre a eficácia e segurança do uso de plasma de pacientes recuperados com COVID-19 continua sendo o objetivo deste estudo. Os estudos realizados mostraram que a aplicação de plasma convalescente contribui para a redução da mortalidade, carga viral e tempo de internação hospitalar. No entanto, a eficácia da terapia ainda gera dúvidas devido ao número de pacientes avaliados em estudos clínicos, além de seu alto custo e limitações em termos de disponibilidade e implementação, sendo o medicamento autorizado apenas para uso hospitalar.

COVID-19 impacts on healthcare access in sub-Saharan Africa: an overview

Abstract This overview aimed to describe the situation of healthcare access in sub-Saharan Africa, excluding South Africa, during the COVID-19 pandemic. A PubMed® search from March 31, 2020, to August 15, 2022, selected 116 articles. Healthcare access and consequences of COVID-19 were assessed based on comparisons with months before its onset or an identical season in previous years. A general reduction of healthcare delivery, associated with the decline of care quality, and closure of many specialty services were reported. The impact was heterogeneous in space and time, with an increase in urban areas at the beginning of the pandemic (March-June 2020). The return to normalcy was gradual from the 3rd quarter of 2020 until the end of 2021. The impact of COVID-19 on the health system and its use was attributed to (a) conjunctural factors resulting from government actions to mitigate the spread of the epidemic (containment, transportation restrictions, closures of businesses, and places of entertainment or worship); (b) structural factors related to the disruption of public and private facilities and institutions, in particular, the health system; and (c) individual factors linked to the increase in costs, impoverishment of the population, and fear of contamination or stigmatization, which discouraged patients from going to health centers. They have caused considerable socio-economic damage. Several studies emphasized some adaptability of the healthcare offer and resilience of the healthcare system, despite its unpreparedness, which explained a return to normal activities as early as 2022 while the COVID-19 epidemic persisted. There appears to be a strong disproportion between the moderate incidence and severity of COVID-19 in sub-Saharan Africa, and the dramatic impact on healthcare access. Several articles make recommendations for lowering the socioeconomic consequences of future epidemics to ensure better management of health issues.

Current understanding of an Emerging Coronavirus using in silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) / Compreensão atual de um coronavírus emergente usando abordagem in silico: síndrome respiratória aguda grave - coronavírus-2 (SARS-CoV-2)

Abstract Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

Resumo O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Death caused by covid-19 in top ten countries in Asia affected by covid-19 pandemic with special reference to Pakistan / Morte causada por covid-19 nos dez principais países da Ásia afetados pela pandemia de covid-19, com referência especial ao Paquistão

Abstract The COVID-19 is a contagious viral disease, was first emerged in Wuhan, China in December 2019 and became the whole world on alert. The mortality rate in top most countries in Asia with special reference to Pakistan has been focused. Since February 26 to September 2020 the total confirmed cases and mortality rate was measured through Wikipedia and the notable journals. Iran is the only country having highest number of deaths (5.73%) followed by Indonesia (3.77%) while Saudi Arabia shows the lowest number of deaths as 1.39%. In Pakistan the first case was confirmed in 26th February, 2020. The nCov-19 has closely related to severe acute respiratory syndrome (SARS) hence SARS COV-2 was named. This virus is responsible for more than 33.9 million deaths in over all the world as of 20th September, 2020. The number of new cases is increasing time to time. Sindh province of Pakistan has reported the highest number of cases till September, 20, 2020 as compared to other parts of the country and has the highest number of death followed by Khyber Pakhtunkhwa. Because of the person to person contact the disease is spreading rapidly. The individuals who has already infected with other diseases like cancer or diabetic etc. are vulnerable. The nCOV-19 is the most contagious due to its mode of transmission. There is still no vaccine is available for the treatment of disease caused by nCoV-2019. It is therefore the only option to control this pandemic is to adopt effective preventive measures.

Resumo A covid-19 é uma doença viral contagiosa, que surgiu pela primeira vez em Wuhan, China, em dezembro de 2019, e deixou o mundo todo em alerta. A taxa de mortalidade na maioria dos principais países da Ásia, com referência especial ao Paquistão, foi enfocada. De 26 de fevereiro a setembro de 2020, o total de casos confirmados e a taxa de mortalidade foram medidos por meio da Wikipedia e de periódicos notáveis. O Irã é o único país com maior número de mortes (5,73%), seguido pela Indonésia (3,77%), enquanto a Arábia Saudita mostra o menor número de mortes, 1,39%. No Paquistão, o primeiro caso foi confirmado em 26 de fevereiro de 2020. O nCov-19 está intimamente relacionado à síndrome respiratória aguda grave (SARS), daí o nome SARS COV-2. Esse vírus é responsável por mais de 33,9 milhões de mortes em todo o mundo em 20 de setembro de 2020. O número de novos casos está aumentando de tempos em tempos. A província de Sindh, no Paquistão, registrou o maior número de casos até 20 de setembro de 2020, em comparação com outras partes do país, e tem o maior número de mortes, seguida por Khyber Pakhtunkhwa. Por causa do contato pessoa a pessoa, a doença está se espalhando rapidamente. Indivíduos que já foram diagnosticados com outras doenças, como câncer ou diabetes, etc. são mais vulneráveis. O nCOV-19 é o mais contagioso devido ao seu modo de transmissão. Ainda não há vacina disponível para o tratamento da doença causada pelo nCoV-2019. Portanto, a única opção para controlar essa pandemia é a adoção de medidas preventivas eficazes.

Impact of Covid-19 on the supply and prices of lettuce, potato and tomato in Minas Gerais / Impacto da pandemia de Covid-19 na oferta e preços de alface, batata e tomate em Minas Gerais

The COVID-19 pandemic hasaffected the dynamics of the production, commercialization and consumption of vegetables. Lettuce, potato and tomato, an herbaceous vegetable, a tuberous vegetable and a fruit vegetable, respectively, are among thegroup of vegetables purchased most frequently. The objective of this studywas to evaluate how the pandemic affected the price and supply of lettuce, potato and tomato in 2020 compared to previous yearsbased on data from CEASA-MG from 2016 to 2021. The supply of lettuce wasconstant in 2020 butlower than the previous year until the month of August, and in December, the price was equal to that of the previous year. The supply of potato was lower throughout 2020 than in previous years. The price of potato was lower in 2020 than the price charged in 2019,until October 2020. The supply of tomato was low throughout 2020. Additionally, with respect to price, there was a decrease from March to July 2020 and a subsequent increase, surpassing the prices of previous years starting in October. In conclusion, both the supply and price of these vegetables were affected by the COVID-19 pandemic.(AU)

A pandemia causada por Covid-19 afetou a dinâmica de produção, comercialização e consumo das hortaliças. Foi realizado um estudo abrangendo uma hortaliça herbácea, uma hortaliça tuberosa e uma hortaliça fruto, sendo elas, alface, batata e tomate, as quais pertencem ao grupo de hortaliças com maior porcentagem de compra. A partir de dados do atacado do CEASA-MG de 2016 a 2021 objetivou-se avaliar como a pandemia do novo coronavírus afetou o preço e oferta de alface, batata e tomate em 2020 comparado aos anos anteriores. A alface teve oferta constante em 2020 e mais baixa que o ano anterior até o mês de agosto, sendo o preço igualado ao do ano anterior em dezembro. A oferta da batata foi inferior ao longo de 2020 quando comparado aos anos anteriores. O preço da batata foi inferior ao preço praticado em 2019 até outubro de 2020. O tomate teve a oferta mais baixa ao longo de 2020. E, com relação ao preço, houve queda de março a julho de 2020 e posteriormente aumento, superando os preços dos anos anteriores a partir de outubro. Conclui-se que tanto a oferta como o preço dessas hortaliças foram afetadas pela pandemia causada por Covid-19.(AU)

Gender-based incidence, recovery period, and mortality rate of COVID-19 among the population of district Attock, Pakistan / Incidência baseada em gênero, período de recuperação e taxa de mortalidade de COVID-19 entre a população do distrito de Attock, Paquistão

Abstract COVID-19 is reported as an extremely contagious disease with common symptoms of fever, dry cough, sore throat, and tiredness. The published literature on incidence and gender-wise prevalence of COVID-19 is scarce in Pakistan. Therefore, the present study was designed to compare the distribution, incubation period and mortality rate of COVID-19 among the male and female population of district Attock. The data were collected between 01 April 2020 and 07 December 2020 from the population of district Attock, Pakistan. A total of 22,962 individuals were screened and 843 were found positive for RT-qPCR for SARS-CoV-2. The confirmed positive cases were monitored carefully. Among the positive cases, the incidence of COVID-19 was 61.7% among males and 38.2% among females. The average recovery period of males was 18.89±7.75 days and females were 19±8.40 days from SARS-CoV-2. The overall mortality rate was 8.06%. The death rate of male patients was significantly higher (P<0.05) compared to female patients. Also, the mortality rate was higher (P<0.05) in male patients of 40-60 years of age compared to female patients of the same age group. Moreover, the mortality rate significantly increased (P<0.05) with the increase of age irrespective of gender. In conclusion, the incidence and mortality rate of COVID-19 is higher in males compared to the female population. Moreover, irrespective of gender the mortality rate was significantly lower among patients aged <40 years.

Resumo Covid-19 é relatada como uma doença extremamente contagiosa com sintomas comuns de febre, tosse seca, dor de garganta e cansaço. A literatura publicada sobre incidência e prevalência de Covid-19 com base no gênero é escassa no Paquistão. Portanto, o presente estudo teve como objetivo comparar a distribuição, o período de incubação e a taxa de mortalidade de Covid-19 entre a população masculina e feminina do distrito de Attock. Os dados foram coletados entre 1 de abril de 2020 e 7 de dezembro de 2020 da população do distrito de Attock, Paquistão. Um total de 22.962 indivíduos foi selecionado, e 843 foram considerados positivos para RT-qPCR para SARS-CoV-2. Os casos positivos confirmados foram monitorados cuidadosamente. Entre os casos positivos, a incidência de Covid-19 foi de 61,7% no sexo masculino e 38,2% no feminino. O período médio de recuperação dos homens foi de 18,89 ± 7,75 dias e das mulheres 19 ± 8,40 dias do SARS-CoV-2. A mortalidade geral foi de 8,06%. A taxa de mortalidade de pacientes do sexo masculino foi significativamente maior (P < 0,05) em comparação com pacientes do sexo feminino. Além disso, a taxa de mortalidade foi maior (P < 0,05) em pacientes do sexo masculino com 40-60 anos de idade em comparação com pacientes do sexo feminino da mesma faixa etária. Além disso, a taxa de mortalidade aumentou significativamente (P < 0,05) com o aumento da idade, independentemente do sexo. Em conclusão, a incidência e a taxa de mortalidade de Covid-19 são maiores no sexo masculino em comparação com a população feminina. E também, independentemente do sexo, a taxa de mortalidade foi significativamente menor entre os pacientes com idade < 40 anos.

A threefold approach including quantum chemical, molecular docking and molecular dynamic studies to explore the natural compounds from Centaurea jacea as the potential inhibitors for COVID-19 / Uma abordagem tríplice incluindo química quântica, docking molecular e estudos dinâmicos moleculares para explorar os compostos naturais de Centaurea jacea como inibidores potenciais para Covid-19

Abstract In the current report, we studied the possible inhibitors of COVID-19 from bioactive constituents of Centaurea jacea using a threefold approach consisting of quantum chemical, molecular docking and molecular dynamic techniques. Centaurea jacea is a perennial herb often used in folk medicines of dermatological complaints and fever. Moreover, anticancer, antioxidant, antibacterial and antiviral properties of its bioactive compounds are also reported. The Mpro (Main proteases) was docked with different compounds of Centaurea jacea through molecular docking. All the studied compounds including apigenin, axillarin, Centaureidin, Cirsiliol, Eupatorin and Isokaempferide, show suitable binding affinities to the binding site of SARS-CoV-2 main protease with their binding energies -6.7 kcal/mol, -7.4 kcal/mol, -7.0 kcal/mol, -5.8 kcal/mol, -6.2 kcal/mol and -6.8 kcal/mol, respectively. Among all studied compounds, axillarin was found to have maximum inhibitor efficiency followed by Centaureidin, Isokaempferide, Apigenin, Eupatorin and Cirsiliol. Our results suggested that axillarin binds with the most crucial catalytic residues CYS145 and HIS41 of the Mpro, moreover axillarin shows 5 hydrogen bond interactions and 5 hydrophobic interactions with various residues of Mpro. Furthermore, the molecular dynamic calculations over 60 ns (6×106 femtosecond) time scale also shown significant insights into the binding effects of axillarin with Mpro of SARS-CoV-2 by imitating protein like aqueous environment. From molecular dynamic calculations, the RMSD and RMSF computations indicate the stability and dynamics of the best docked complex in aqueous environment. The ADME properties and toxicity prediction analysis of axillarin also recommended it as safe drug candidate. Further, in vivo and in vitro investigations are essential to ensure the anti SARS-CoV-2 activity of all bioactive compounds particularly axillarin to encourage preventive use of Centaurea jacea against COVID-19 infections.

Resumo No presente relatório, estudamos os possíveis inibidores de Covid-19 de constituintes bioativos de Centaurea jacea usando uma abordagem tripla que consiste em técnicas de química quântica, docking molecular e dinâmica molecular. Centaurea jacea é uma erva perene frequentemente usada em remédios populares de doenças dermatológicas e febre. Além disso, as propriedades anticâncer, antioxidante, antibacteriana e antiviral de seus compostos bioativos também são relatadas. A Mpro (proteases principais) foi acoplada a diferentes compostos de Centaurea jacea por meio de docking molecular. Todos os compostos estudados, incluindo apigenina, axilarina, Centaureidina, Cirsiliol, Eupatorina e Isokaempferide, mostram afinidades de ligação adequadas ao sítio de ligação da protease principal SARS-CoV-2 com suas energias de ligação -6,7 kcal / mol, -7,4 kcal / mol, - 7,0 kcal / mol, -5,8 kcal / mol, -6,2 kcal / mol e -6,8 kcal / mol, respectivamente. Dentre todos os compostos estudados, a axilarina apresentou eficiência máxima de inibidor, seguida pela Centaureidina, Isokaempferida, Apigenina, Eupatorina e Cirsiliol. Nossos resultados sugeriram que a axilarina se liga aos resíduos catalíticos mais cruciais CYS145 e HIS41 do Mpro, além disso a axilarina mostra 5 interações de ligações de hidrogênio e 5 interações hidrofóbicas com vários resíduos de Mpro. Além disso, os cálculos de dinâmica molecular em uma escala de tempo de 60 ns (6 × 106 femtossegundos) também mostraram percepções significativas sobre os efeitos de ligação da axilarina com Mpro de SARS-CoV-2 por imitação de proteínas como o ambiente aquoso. A partir de cálculos de dinâmica molecular, os cálculos RMSD e RMSF indicam a estabilidade e dinâmica do melhor complexo ancorado em ambiente aquoso. As propriedades ADME e a análise de previsão de toxicidade da axilarina também a recomendaram como um candidato a medicamento seguro. Além disso, as investigações in vivo e in vitro são essenciais para garantir a atividade anti-SARS-CoV-2 de todos os compostos bioativos, particularmente a axilarina, para encorajar o uso preventivo de Centaurea jacea contra infecções por Covid-19.

Outbreak of leishmaniasis caused by Leishmania enriettii in guinea pigs (Cavia porcellus) / Surto de leishmaniose causada por Leishmania enriettii em cobaias (Cavia porcellus)

We describe an outbreak of leishmaniasis in seven guinea pigs (Cavia porcellus) in which nodular ulcerated skin lesions of varying sizes were observed in the nasal cavity, upper lip, pinnae, vulva, and periarticular region of the limbs. Cytologic exam of collected samples of the lesions in the auricle of one of the animals revealed macrophages containing parasitophorous vacuoles of approximately 4.0μm in diameter in their cytoplasm with morphology suggestive of Leishmania sp. Although skin lesions spontaneously regressed in two of the Guinea pigs, only one survived. All six animals that died were necropsied. Grossly, all animals showed bloody nodular cutaneous lesions with crusts. One of the guinea pigs had distended dark red and firm lungs. Histopathology of the skin lesions revealed histiocytic interstitial acanthotic dermatitis associated with a myriad of Leishmania organisms within macrophages cytoplasm. In the lung, the lesions were characteristic of broncho-interstitial pneumonia with focal infiltrates of neutrophils, epithelioid macrophages, and multinucleated giant cells containing 2µm basophilic amastigotes with morphology compatible with Leishmania spp. A focal granulomatous lesion ,associated with the causal agent in the lung is a novel description of leishmaniasis in guinea pigs caused by L. enriettii. The polymerase chain reaction (PCR) technique with mini-exon primer performed in samples of lesions from two affected guinea pigs was positive and equal to the reference strain, identifying Leishmania enriettii. The cytological, macroscopic, and histological lesions associated with the PCR technique allowed the diagnosis of leishmaniasis and the identification of the specie L. enriettii.

Descrevemos um surto de leishmaniose em sete cobaias (Cavia porcellus), com lesões cutâneas nodulares ulceradas de tamanhos variados observadas na cavidade nasal, lábio superior, pavilhões auriculares, vulva e região periarticular dos membros. No exame citológico foram encontrados macrófagos contendo vacúolos parasitóforos no citoplasma de aproximadamente 4.0μm em diâmetro com morfologia sugestiva de Leishmania sp. Apesar de regressão espontânea das lesões cutâneas terem ocorrido em duas das sete cobaias, apenas um sobreviveu. Seis dos sete animais afetados morreram e foram necropsiados. Macroscopicamente, todos os animais apresentaram lesões cutâneas nodulares, crostosas e sanguinolentas. Uma das cobaias tinha pulmões vermelho-escuros, distendidos e firmes. A histopatologia das lesões cutâneas revelou dermatite acantótica intersticial histiocítica associada a miríades de organismos de Leishmania no citoplasma de macrófagos. Nos pulmões as lesões eram características de pneumonia bronco-intersticial com infiltrado focal de neutrófilos, eosinófilos, macrófagos epitelioides e células gigantes multinucleadas contendo amastigotas basofílicos de 2µm com morfologia compatível com Leishmania spp. Lesões granulomatosas focais associadas ao agente no pulmão são um achado inédito na leishmaniose causada por L. enriettii em cobaias. A técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR) com primer mini-exon realizada em amostras de lesões de duas cobaias afetadas foi positiva, identificando Leishmania enriettii. Os aspectos macroscópicos, citológicos, e histológicos associados à técnica da (PCR), permitiram o diagnóstico da leishmaniose e a identificação da espécie L. enriettii.

An RT-rtPCR assay for detection of rabies virus in bovine specimens / Um ensaio RT-rtPCR para detecção de vírus da raiva em espécimes bovinos

ABSTRACT: Bovine rabies is endemic in most Brazilian States, including Rio Grande do Sul (RS), which has faced an unprecedented rabies outbreak between 2011 and 2018. We described a real-time reverse transcription quantitative PCR (RT-rtPCR) for detection of rabies virus (RABV) in bovine samples. The primers were designed targeting a highly conserved region of the nucleoprotein (N) gene of RABV obtained from cattle. The detection limit corresponded to 13 DNA copies and the intra- and inter-run repeatability was adequate (CV<9%) in all dilutions tested. Amplification of other pathogens associated with neurological disease in cattle or cross-contamination was not observed. Brain samples from cattle suspicious of rabies (n=21) were tested in triplicate by the RT-rtPCR and by the gold-standard direct fluorescent antibody test (DFAT), resulting in 100% of sensitivity and specificity of the RT-rtPCR. Testing of additional 41 bovine brain samples submitted to the routine DFAT testing yielded 37 (90.2%) concordant results (30 positive/7 negative) and 4 (9.7%) inconclusive in DFAT and RT-rtPCR positive. These results showed a good concordance between the tests and a higher sensitivity of the RT-rtPCR. This assay represents an alternative for RABV detection, either as a confirmatory test or for large-scale diagnosis in endemic regions.

RESUMO: A raiva bovina é endêmica na maioria dos estados brasileiros, inclusive no Rio Grande do Sul (RS), que enfrentou um surto de raiva sem precedentes entre 2011 e 2018. Descrevemos um PCR quantitativo de transcrição reversa em tempo real (RT-rtPCR) para detecção do vírus da raiva (RABV) em bovinos. Os primers foram desenhados visando uma região altamente conservada do gene da nucleoproteína (N) de RABV obtido de bovinos. O limite de detecção correspondeu a 13 cópias de DNA e a repetibilidade intra e inter-ensaios foi adequada (CV <9%) em todas as diluições testadas. Não foi observada amplificação de outros patógenos associados a doenças neurológicas em bovinos ou contaminação cruzada. Amostras de cérebro de bovinos com suspeita de raiva (n = 21) foram testadas em triplicata no RT-rtPCR e pelo teste de anticorpo fluorescente padrão ouro (DFAT), resultando em 100% de sensibilidade e especificidade do RT-rtPCR. O teste de 41 amostras de cérebro bovino adicionais submetidas ao teste de DFAT de rotina rendeu 37 (90,2%) resultados concordantes (30 positivos / sete negativos) e quatro (9,7%) inconclusivos em DFAT e RT-rtPCR positivo. Esses resultados mostraram boa concordância entre os testes e maior sensibilidade do RT-rtPCR. Este ensaio representa uma alternativa para a detecção do vírus da raiva, seja como teste confirmatório ou para diagnóstico em larga escala em regiões endêmicas.

Outbreaks of philophthalmiasis in ostriches (Struthio camelus) in Northeast Brazil / Surtos de filoftalmíase em avestruzes (Struthio camelus) no Nordeste do Brasil

ABSTRACT: This study discusses the epidemiological, clinical, and pathological characteristics of two outbreaks of ocular infection in ostriches (Struthio camelus) caused by the trematode Philophthalmus sp. The outbreaks occurred in the states of Ceará and Rio Grande do Norte in Northeast Brazil. Ostrich farming was categorized as semi-intensive farming with free access to the weir and river. The clinical symptoms for infection included nictitating membrane inflammation, epiphora (tearing), eyelid edema, ocular congestion, eyeball destruction, emaciation, and death, and the infection period ranged from 8 to 16 months. Macroscopically, thickening of the eyelids and conjunctiva were observed, with orange parasites infestation. Histologically, the lesions were characterized as lymphoplasmacytic and heterophilic, multifocal to coalescing, moderate, chronic conjunctivitis associated with hyperplasia and ectasia of the Harderian gland, and numerous parasites. The parasites were oval and flattened with an oral suction cup, acetabulum, and thick cuticle containing spicules. The diagnosis of philophthalmiasis was based on epidemiological, clinical, and pathological findings associated with the morphological characteristics of the parasites present in the conjunctival sacs which were similar to the trematode Philophthalmus sp. Philophthalmiasis can occur in ostriches raised on urban and rural properties in Northeastern Brazil, probably associated with the contact of birds with contaminated water, and is characterized by severe conjunctivitis that can result in the loss of the eyeball and death of the animals.

RESUMO: Descrevem-se as características epidemiológicas, clínicas e patológicas de dois surtos de infecção ocular pelo trematódeo Philophthalmus sp. em avestruzes ocorridos nos estados do Ceará e Rio Grande do Norte no Nordeste do Brasil. As propriedades tinham em comum, a criação semi-intensiva e livre acesso a açude e rio. Os sinais clínicos incluíam protrusão da membrana nictante, lacrimejamento, edema palpebral, congestão ocular, destruição do globo ocular, emagrecimento e morte. A evolução clínica variou de oito a 16 meses. Macroscopicamente, observou-se espessamento das pálpebras e conjuntivas associado a numerosas estruturas parasitárias alaranjadas. No segundo surto, as lesões eram mais graves e consistiam em perda do globo ocular direito e anexos. Histologicamente, as lesões caracterizavam-se por conjuntivite linfoplasmocítica e heterofílica, multifocal a coalescente, moderada, crônica associada a hiperplasia e ectasia da glândula de Harderian e numerosas estruturas parasitárias. Os parasitas eram ovalados, achatados com ventosa oral e acetábulo e cutícula espessa contendo espículas. O diagnóstico de filoftalmíase foi realizado com base nos achados epidemiológicos, clínicos e patológicos associadas as características morfológicas dos parasitas presentes nos sacos conjuntivais compatíveis com o trematódeo Philophthalmus sp. A filoftalmíase pode ocorrer em avestruzes criados em propriedades urbanas e rurais no Nordeste do Brasil, provavelmente associado ao contato das aves com água contaminada e caracteriza-se por quadros de conjuntivite grave que pode resultar com a perda do globo ocular e morte dos animais.

An outbreak of fatal Pullorum disease (Salmonella Pullorum) in Guinea fowl keets (Numida meleagris) / Surto fatal de pulorose (Salmonella Pullorum) em pintinhos de galinhas-d'Angola (Numida meleagris)

Pullorum disease is described worldwide and is caused by Salmonella enterica subspecies enterica serovar Gallinarum biovar Pullorum (S. Pullorum). S. Pullorum infection is important in commercial poultry, provoking a systemic disease with high mortality rates. Its occurrence requires notification, and when it is diagnosed in commercial breeding flocks, its eradication is demanded. The aim of this study was to report a severe outbreak of Pullorum disease in young Guinea fowl (Numida meleagris), resulting in 100% mortality of keets (n=290) within the first two weeks of age. All examined keets had enlarged liver, kidneys and spleen (5/5), and the affected tissues were submitted to histological and bacteriological examination. On histopathology, random paratyphoid nodules characterized by areas of necrosis with fibrin and a moderate infiltrate of macrophages and heterophils were observed in the liver. In kidneys, discrete areas of necrosis associated with moderate multifocal infiltrates of lymphocytes, and plasma cells were observed. In the spleen, a moderate infiltrate of macrophages was noticed. Isolation of colonies suggestive of S. Pullorum from liver and spleen was performed in selective agars and, after biochemical tests, confirmed by specific duplex-PCR. The antimicrobial susceptibility test of the isolated strain revealed resistance to only sulfamethoxazole + trimethoprim among the tested antimicrobials. The S. Pullorum isolate recovered in the present study was highly pathogenic to N. meleagris and may represent a risk to other avian species, including industrial poultry.

A pulorose é descrita mundialmente e é causada por Salmonella enterica subespécie enterica sorovar Gallinarum biovar Pullorum (S. Pullorum). A infecção por S. Pullorum é importante em aves comerciais, provocando doença sistêmica com altas taxas de mortalidade. Sua ocorrência requer notificação e quando diagnosticada em aves de criação comercial resulta na erradicação do plantel. O objetivo deste estudo foi relatar um surto grave de pulorose em filhotes de galinhas-d'Angola (Numida meleagris), resultando em 100% de mortalidade das aves (n=290) nas primeiras duas semanas de idade. Os pintinhos recebidos tinham hepato, espleno e nefromegalia (5/5). Os tecidos dos cinco indivíduos recebidos foram submetidos a exame histológico e bacteriológico. Na histopatologia, foram observados nódulos paratifoides aleatórios caracterizados por áreas de necrose com fibrina e infiltrado moderado de macrófagos e heterófilos no fígado. Nos rins, foram observadas áreas discretas de necrose associadas a infiltrados multifocais moderados de linfócitos e plasmócitos. No baço, foi observado infiltrado moderado de macrófagos. O isolamento de colônias sugestivas de S. Pullorum de fígados e baços foi realizado em ágares seletivos e, após testes bioquímicos, confirmado por duplex-PCR específico. A susceptibilidade antimicrobiana da cepa isolada revelou resistência apenas ao sulfametoxazol + trimetoprim entre os antimicrobianos testados. O isolado de S. Pullorum recuperado no presente estudo foi altamente patogênico para N. meleagris e pode representar um risco para outras espécies de aves, incluindo aves industriais.

Current understanding of an Emerging Coronavirus using in silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2)

Abstract Novel coronavirus (nCoV) namely SARS-CoV-2 is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the SARS-CoV-2 although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among SARS-CoV-2 and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that SARS-CoV-2 has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

Resumo O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente SARS-CoV-2, foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o SARS-CoV-2, embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre SARS-CoV-2 e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que SARS-CoV-2 tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Death caused by covid-19 in top ten countries in Asia affected by covid-19 pandemic with special reference to Pakistan

Abstract The COVID-19 is a contagious viral disease, was first emerged in Wuhan, China in December 2019 and became the whole world on alert. The mortality rate in top most countries in Asia with special reference to Pakistan has been focused. Since February 26 to September 2020 the total confirmed cases and mortality rate was measured through Wikipedia and the notable journals. Iran is the only country having highest number of deaths (5.73%) followed by Indonesia (3.77%) while Saudi Arabia shows the lowest number of deaths as 1.39%. In Pakistan the first case was confirmed in 26th February, 2020. The nCov-19 has closely related to severe acute respiratory syndrome (SARS) hence SARS COV-2 was named. This virus is responsible for more than 33.9 million deaths in over all the world as of 20th September, 2020. The number of new cases is increasing time to time. Sindh province of Pakistan has reported the highest number of cases till September, 20, 2020 as compared to other parts of the country and has the highest number of death followed by Khyber Pakhtunkhwa. Because of the person to person contact the disease is spreading rapidly. The individuals who has already infected with other diseases like cancer or diabetic etc. are vulnerable. The nCOV-19 is the most contagious due to its mode of transmission. There is still no vaccine is available for the treatment of disease caused by nCoV-2019. It is therefore the only option to control this pandemic is to adopt effective preventive measures.

Resumo A covid-19 é uma doença viral contagiosa, que surgiu pela primeira vez em Wuhan, China, em dezembro de 2019, e deixou o mundo todo em alerta. A taxa de mortalidade na maioria dos principais países da Ásia, com referência especial ao Paquistão, foi enfocada. De 26 de fevereiro a setembro de 2020, o total de casos confirmados e a taxa de mortalidade foram medidos por meio da Wikipedia e de periódicos notáveis. O Irã é o único país com maior número de mortes (5,73%), seguido pela Indonésia (3,77%), enquanto a Arábia Saudita mostra o menor número de mortes, 1,39%. No Paquistão, o primeiro caso foi confirmado em 26 de fevereiro de 2020. O nCov-19 está intimamente relacionado à síndrome respiratória aguda grave (SARS), daí o nome SARS COV-2. Esse vírus é responsável por mais de 33,9 milhões de mortes em todo o mundo em 20 de setembro de 2020. O número de novos casos está aumentando de tempos em tempos. A província de Sindh, no Paquistão, registrou o maior número de casos até 20 de setembro de 2020, em comparação com outras partes do país, e tem o maior número de mortes, seguida por Khyber Pakhtunkhwa. Por causa do contato pessoa a pessoa, a doença está se espalhando rapidamente. Indivíduos que já foram diagnosticados com outras doenças, como câncer ou diabetes, etc. são mais vulneráveis. O nCOV-19 é o mais contagioso devido ao seu modo de transmissão. Ainda não há vacina disponível para o tratamento da doença causada pelo nCoV-2019. Portanto, a única opção para controlar essa pandemia é a adoção de medidas preventivas eficazes.

Fowl Aviadenovirus E associated with hepatitis-hydropericardium syndrome in broiler breeders / Síndrome da hepatite-hidropericárdio por Aviadenovirus e em reprodutores de corte

ABSTRACT: Fowl aviadenovirus (FAdV) is an important pathogen in the global poultry industry and the etiology of inclusion body hepatitis-hydropericardium syndrome (HHS) in chickens. Since the 1990s, several outbreaks of HHS have occurred in poultry producing areas, including South America. The coinfection of FAdV and chicken anemia virus (CAV) may markedly impact the incidence of HHS. This study describes an outbreak of HHS in coinfection with CAV in industrial broiler breeders and characterizes the FAdV isolate. The three-week-old male broiler breeders had pale bone marrow, enlarged and yellowish liver, splenomegaly, and atrophied thymus; one chicken was also found with hydropericardium. Virus isolation was performed in SPF chicken embryos of liver and thymus. Tissues of the naturally infected chickens and the inoculated embryos were evaluated by PCR and histopathology. All affected chickens and inoculated embryos were positive for FAdV and CAV. The inoculated embryos had enlarged, greenish and hemorrhagic livers, and 30% died within 7 days of inoculation. Phylogenetic analysis of the FAdV isolate hexon gene partial sequence enabled grouping with E species. The E species has recently become a relevant species in several countries. The association of FAdV with CAV in breeders is of further concern due to both being capable of vertical transmission. Within the last decade, a worldwide upsurge of HHS in broiler breeders owing to failed biosecurity has occurred. In this episode, the failure on biosecurity may have enabled challenge with both FAdV and CAV, with pathological synergism. The CAV-impaired adaptive immunity may have benefited the FAdV infection.

RESUMO: Adenovírus aviário (FAdV) é um importante patógeno na indústria avícola global e a etiologia da síndrome da hepatite por corpúsculo de inclusão-hidropericárdio (SHH) em galinhas. Desde a década de 1990, vários surtos de SHH foram descritos em todas as áreas de produção de aves, incluindo na América do Sul, e a coinfecção entre FAdV e vírus da anemia das galinhas (CAV) pode ser agravante para todos os aspectos da SHH. Objetiva-se descrever um surto de SHH em matrizes de frangos corte, caracterizar a estirpe de FAdV envolvida e destacar a coinfecção com CAV. Foram avaliados machos reprodutores de corte com três semanas de idade, com medula óssea pálida, fígado aumentado e amarelado e esplenomegalia, timo atrofiado e um com hidropericárdio. Fígado e timo foram coletados para isolamento do vírus em embriões de galinhas SPF, PCR e histopatologia. Todas as aves acometidas e embriões inoculados foram positivos para FAdV e CAV. Os embriões inoculados tiveram óbito de 30% em até sete dias após a inoculação e alterações hepáticas por fígados esverdeados e aumentados. A análise filogenética de FAdV com base em parte da sequência do gene que codifica a proteína hexon revelou identidade com a espécie E, que se tornou disseminada em vários países. A coinfecção de FAdV e CAV resulta em maior intensidade de lesões, maior morbidade e mortalidade e em reprodutores tem alta relevância epidemiológica, em razão da transmissão vertical de ambos e da ampla distribuição geográfica das progênies infectadas. Na última década, ocorreu um aumento mundial na ocorrência de SHH em frangos de corte relacionado a falhas em biosseguridade, especialmente em reprodutores, condição que pode ter ocorrido neste episódio. A presença de FAdV e CAV em reprodutores é motivo para preocupação por reflexos negativos à imunidade e viabilidade das progênies.

Fowl Aviadenovirus E associated with hepatitis-hydropericardium syndrome in broiler breeders / Síndrome da hepatite-hidropericárdio por Aviadenovirus e em reprodutores de corte

Fowl aviadenovirus (FAdV) is an important pathogen in the global poultry industry and the etiology of inclusion body hepatitis-hydropericardium syndrome (HHS) in chickens. Since the 1990s, several outbreaks of HHS have occurred in poultry producing areas, including South America. The coinfection of FAdV and chicken anemia virus (CAV) may markedly impact the incidence of HHS. This study describes an outbreak of HHS in coinfection with CAV in industrial broiler breeders and characterizes the FAdV isolate. The three-week-old male broiler breeders had pale bone marrow, enlarged and yellowish liver, splenomegaly, and atrophied thymus; one chicken was also found with hydropericardium. Virus isolation was performed in SPF chicken embryos of liver and thymus. Tissues of the naturally infected chickens and the inoculated embryos were evaluated by PCR and histopathology. All affected chickens and inoculated embryos were positive for FAdV and CAV. The inoculated embryos had enlarged, greenish and hemorrhagic livers, and 30% died within 7 days of inoculation. Phylogenetic analysis of the FAdV isolate hexon gene partial sequence enabled grouping with E species. The E species has recently become a relevant species in several countries. The association of FAdV with CAV in breeders is of further concern due to both being capable of vertical transmission. Within the last decade, a worldwide upsurge of HHS in broiler breeders owing to failed biosecurity has occurred. In this episode, the failure on biosecurity may have enabled challenge with both FAdV and CAV, with pathological synergism. The CAV-impaired adaptive immunity may have benefited the FAdV infection.

Adenovírus aviário (FAdV) é um importante patógeno na indústria avícola global e a etiologia da síndrome da hepatite por corpúsculo de inclusão-hidropericárdio (SHH) em galinhas. Desde a década de 1990, vários surtos de SHH foram descritos em todas as áreas de produção de aves, incluindo na América do Sul, e a coinfecção entre FAdV e vírus da anemia das galinhas (CAV) pode ser agravante para todos os aspectos da SHH. Objetiva-se descrever um surto de SHH em matrizes de frangos corte, caracterizar a estirpe de FAdV envolvida e destacar a coinfecção com CAV. Foram avaliados machos reprodutores de corte com três semanas de idade, com medula óssea pálida, fígado aumentado e amarelado e esplenomegalia, timo atrofiado e um com hidropericárdio. Fígado e timo foram coletados para isolamento do vírus em embriões de galinhas SPF, PCR e histopatologia. Todas as aves acometidas e embriões inoculados foram positivos para FAdV e CAV. Os embriões inoculados tiveram óbito de 30% em até sete dias após a inoculação e alterações hepáticas por fígados esverdeados e aumentados. A análise filogenética de FAdV com base em parte da sequência do gene que codifica a proteína hexon revelou identidade com a espécie E, que se tornou disseminada em vários países. A coinfecção de FAdV e CAV resulta em maior intensidade de lesões, maior morbidade e mortalidade e em reprodutores tem alta relevância epidemiológica, em razão da transmissão vertical de ambos e da ampla distribuição geográfica das progênies infectadas. Na última década, ocorreu um aumento mundial na ocorrência de SHH em frangos de corte relacionado a falhas em biosseguridade, especialmente em reprodutores, condição que pode ter ocorrido neste episódio. A presença de FAdV e CAV em reprodutores é motivo para preocupação por reflexos negativos à imunidade e viabilidade das progênies.

Death caused by covid-19 in top ten countries in Asia affected by covid-19 pandemic with special reference to Pakistan / Morte causada por covid-19 nos dez principais países da Ásia afetados pela pandemia de covid-19, com referência especial ao Paquistão

The COVID-19 is a contagious viral disease, was first emerged in Wuhan, China in December 2019 and became the whole world on alert. The mortality rate in top most countries in Asia with special reference to Pakistan has been focused. Since February 26 to September 2020 the total confirmed cases and mortality rate was measured through Wikipedia and the notable journals. Iran is the only country having highest number of deaths (5.73%) followed by Indonesia (3.77%) while Saudi Arabia shows the lowest number of deaths as 1.39%. In Pakistan the first case was confirmed in 26th February, 2020. The nCov-19 has closely related to severe acute respiratory syndrome (SARS) hence SARS COV-2 was named. This virus is responsible for more than 33.9 million deaths in over all the world as of 20th September, 2020. The number of new cases is increasing time to time. Sindh province of Pakistan has reported the highest number of cases till September, 20, 2020 as compared to other parts of the country and has the highest number of death followed by Khyber Pakhtunkhwa. Because of the person to person contact the disease is spreading rapidly. The individuals who has already infected with other diseases like cancer or diabetic etc. are vulnerable. The nCOV-19 is the most contagious due to its mode of transmission. There is still no vaccine is available for the treatment of disease caused by nCoV-2019. It is therefore the only option to control this pandemic is to adopt effective preventive measures.

A covid-19 é uma doença viral contagiosa, que surgiu pela primeira vez em Wuhan, China, em dezembro de 2019, e deixou o mundo todo em alerta. A taxa de mortalidade na maioria dos principais países da Ásia, com referência especial ao Paquistão, foi enfocada. De 26 de fevereiro a setembro de 2020, o total de casos confirmados e a taxa de mortalidade foram medidos por meio da Wikipedia e de periódicos notáveis. O Irã é o único país com maior número de mortes (5,73%), seguido pela Indonésia (3,77%), enquanto a Arábia Saudita mostra o menor número de mortes, 1,39%. No Paquistão, o primeiro caso foi confirmado em 26 de fevereiro de 2020. O nCov-19 está intimamente relacionado à síndrome respiratória aguda grave (SARS), daí o nome SARS COV-2. Esse vírus é responsável por mais de 33,9 milhões de mortes em todo o mundo em 20 de setembro de 2020. O número de novos casos está aumentando de tempos em tempos. A província de Sindh, no Paquistão, registrou o maior número de casos até 20 de setembro de 2020, em comparação com outras partes do país, e tem o maior número de mortes, seguida por Khyber Pakhtunkhwa. Por causa do contato pessoa a pessoa, a doença está se espalhando rapidamente. Indivíduos que já foram diagnosticados com outras doenças, como câncer ou diabetes, etc. são mais vulneráveis. O nCOV-19 é o mais contagioso devido ao seu modo de transmissão. Ainda não há vacina disponível para o tratamento da doença causada pelo nCoV-2019. Portanto, a única opção para controlar essa pandemia é a adoção de medidas preventivas eficazes.

An RT-rtPCR assay for detection of rabies virus in bovine specimens / Um ensaio RT-rtPCR para detecção de vírus da raiva em espécimes bovinos

Bovine rabies is endemic in most Brazilian States, including Rio Grande do Sul (RS), which has faced an unprecedented rabies outbreak between 2011 and 2018. We described a real-time reverse transcription quantitative PCR (RT-rtPCR) for detection of rabies virus (RABV) in bovine samples. The primers were designed targeting a highly conserved region of the nucleoprotein (N) gene of RABV obtained from cattle. The detection limit corresponded to 13 DNA copies and the intra- and inter-run repeatability was adequate (CV<9%) in all dilutions tested. Amplification of other pathogens associated with neurological disease in cattle or cross-contamination was not observed. Brain samples from cattle suspicious of rabies (n=21) were tested in triplicate by the RT-rtPCR and by the gold-standard direct fluorescent antibody test (DFAT), resulting in 100% of sensitivity and specificity of the RT-rtPCR. Testing of additional 41 bovine brain samples submitted to the routine DFAT testing yielded 37 (90.2%) concordant results (30 positive/7 negative) and 4 (9.7%) inconclusive in DFAT and RT-rtPCR positive. These results showed a good concordance between the tests and a higher sensitivity of the RT-rtPCR. This assay represents an alternative for RABV detection, either as a confirmatory test or for large-scale diagnosis in endemic regions.

A raiva bovina é endêmica na maioria dos estados brasileiros, inclusive no Rio Grande do Sul (RS), que enfrentou um surto de raiva sem precedentes entre 2011 e 2018. Descrevemos um PCR quantitativo de transcrição reversa em tempo real (RT-rtPCR) para detecção do vírus da raiva (RABV) em bovinos. Os primers foram desenhados visando uma região altamente conservada do gene da nucleoproteína (N) de RABV obtido de bovinos. O limite de detecção correspondeu a 13 cópias de DNA e a repetibilidade intra e inter-ensaios foi adequada (CV <9%) em todas as diluições testadas. Não foi observada amplificação de outros patógenos associados a doenças neurológicas em bovinos ou contaminação cruzada. Amostras de cérebro de bovinos com suspeita de raiva (n = 21) foram testadas em triplicata no RT-rtPCR e pelo teste de anticorpo fluorescente padrão ouro (DFAT), resultando em 100% de sensibilidade e especificidade do RT-rtPCR. O teste de 41 amostras de cérebro bovino adicionais submetidas ao teste de DFAT de rotina rendeu 37 (90,2%) resultados concordantes (30 positivos / sete negativos) e quatro (9,7%) inconclusivos em DFAT e RT-rtPCR positivo. Esses resultados mostraram boa concordância entre os testes e maior sensibilidade do RT-rtPCR. Este ensaio representa uma alternativa para a detecção do vírus da raiva, seja como teste confirmatório ou para diagnóstico em larga escala em regiões endêmicas.

Mineral contents in bone and liver of sheep with or without periodontitis / Conteúdo de minerais em ossos e no fígado de ovinos com ou sem periodontite

Due to the supposed involvement of minerals in cases of ruminant periodontitis, this study aimed to analyze the concentrations of phosphorus (P) in bone, and cobalt (Co), copper (Co), iron (Fe), zinc (Zn) and selenium (Se) in liver of a cohort of sheep affected or not by periodontitis. From an outbreak of the disease in 2011 in Pará state, Brazil, rib and liver samples were obtained from 22 sheep with periodontitis and seven samples from healthy animals. Based on the concentrations of the different minerals in the tissues, we concluded that there was no relationship between periodontal disease in sheep with any mineral deficiency status. In contrast, most of the minerals in the tissues were above or within the recommended concentrations in bone and liver. Within the various aspects which until now have been studied regarding periodontitis in ruminants, the results obtained here corroborate the fact that periodontal disease in sheep is an infectious disease and it is not a consequence of the deficiency or excess of mineral elements in the diet.

Devido ao suposto envolvimento de minerais em casos de periodontite em ruminantes, este trabalho teve como objetivo analisar as concentrações de fósforo (P) nos ossos, além de cobalto (Co), cobre (Co), ferro (Fe), zinco (Zn) e selênio (Se), no fígado de ovelhas afetadas ou não por periodontite. De um surto da doença em 2011, no estado do Pará, Brasil, foram obtidas amostras de costelas e fígado de 22 ovelhas com periodontite e sete amostras de animais saudáveis. Com base nas concentrações dos diferentes minerais nos tecidos, conclui-se que não houve relação entre a doença periodontal em ovinos com qualquer estado de deficiência mineral. A maioria dos minerais estava acima ou dentro das concentrações recomendadas, seja no tecido ósseo, seja no hepático. Entre os diversos aspectos até agora estudados sobre a periodontite em ruminantes, os resultados obtidos corroboram o fato de a doença periodontal em ovinos ser uma doença infecciosa e não decorrente da deficiência ou do excesso de elementos minerais na dieta.

Death caused by covid-19 in top ten countries in Asia affected by covid-19 pandemic with special reference to Pakistan / Morte causada por covid-19 nos dez principais países da Ásia afetados pela pandemia de covid-19, com referência especial ao Paquistão

The COVID-19 is a contagious viral disease, was first emerged in Wuhan, China in December 2019 and became the whole world on alert. The mortality rate in top most countries in Asia with special reference to Pakistan has been focused. Since February 26 to September 2020 the total confirmed cases and mortality rate was measured through Wikipedia and the notable journals. Iran is the only country having highest number of deaths (5.73%) followed by Indonesia (3.77%) while Saudi Arabia shows the lowest number of deaths as 1.39%. In Pakistan the first case was confirmed in 26th February, 2020. The nCov-19 has closely related to severe acute respiratory syndrome (SARS) hence SARS COV-2 was named. This virus is responsible for more than 33.9 million deaths in over all the world as of 20th September, 2020. The number of new cases is increasing time to time. Sindh province of Pakistan has reported the highest number of cases till September, 20, 2020 as compared to other parts of the country and has the highest number of death followed by Khyber Pakhtunkhwa. Because of the person to person contact the disease is spreading rapidly. The individuals who has already infected with other diseases like cancer or diabetic etc. are vulnerable. The nCOV-19 is the most contagious due to its mode of transmission. There is still no vaccine is available for the treatment of disease caused by nCoV-2019. It is therefore the only option to control this pandemic is to adopt effective preventive measures.(AU)

A covid-19 é uma doença viral contagiosa, que surgiu pela primeira vez em Wuhan, China, em dezembro de 2019, e deixou o mundo todo em alerta. A taxa de mortalidade na maioria dos principais países da Ásia, com referência especial ao Paquistão, foi enfocada. De 26 de fevereiro a setembro de 2020, o total de casos confirmados e a taxa de mortalidade foram medidos por meio da Wikipedia e de periódicos notáveis. O Irã é o único país com maior número de mortes (5,73%), seguido pela Indonésia (3,77%), enquanto a Arábia Saudita mostra o menor número de mortes, 1,39%. No Paquistão, o primeiro caso foi confirmado em 26 de fevereiro de 2020. O nCov-19 está intimamente relacionado à síndrome respiratória aguda grave (SARS), daí o nome SARS COV-2. Esse vírus é responsável por mais de 33,9 milhões de mortes em todo o mundo em 20 de setembro de 2020. O número de novos casos está aumentando de tempos em tempos. A província de Sindh, no Paquistão, registrou o maior número de casos até 20 de setembro de 2020, em comparação com outras partes do país, e tem o maior número de mortes, seguida por Khyber Pakhtunkhwa. Por causa do contato pessoa a pessoa, a doença está se espalhando rapidamente. Indivíduos que já foram diagnosticados com outras doenças, como câncer ou diabetes, etc. são mais vulneráveis. O nCOV-19 é o mais contagioso devido ao seu modo de transmissão. Ainda não há vacina disponível para o tratamento da doença causada pelo nCoV-2019. Portanto, a única opção para controlar essa pandemia é a adoção de medidas preventivas eficazes.(AU)

Vitamin A deficiency as a cause of blindness in feedlot calves / Deficiência de vitamina A como causa de cegueira em bezerros confinados

Vitamin A is an essential micronutrient to reproduction, development, normal growth, and function of the nervous system and vision, especially in growing animals. Hypovitaminosis A can affect any of these functions. The aim of this study was to describe the epidemiology, clinical signs, pathological aspects, and diagnostic approach in an outbreak of blindness in feedlot calves fed only grain. Five of 57 ten-month-old calves became blind after eight months at the feedlot. Clinical signs were mydriasis, absent pupillary and menace reflexes, bilaterally. Hypovitaminosis A was suspected and subsequently confirmed by low serum levels of vitamin A. One calf was euthanized and necropsied, and no gross findings were present. Histopathological lesions were restricted to the retina and characterized by degeneration and atrophy of the photoreceptor layer and some retinal scars. The calves were treated with intramuscular vitamin A injection at a dose of 5,000 international units (IU) per kilogram of body weight (kg BW) every 60 days until slaughter. Affected calves did not recover visual capacity, but no other cases occurred.

Vitamina A é um micronutriente essencial para reprodução, desenvolvimento, crescimento normal, além de participar do funcionamento do sistema nervoso central e visão, especialmente em animais em crescimento. Hipovitaminose A pode afetar qualquer uma dessas funções. O objetivo desse artigo é descrever a epidemiologia, sinais clínicos, aspectos patológicos e abordagem diagnóstica em um surto de cegueira em bezerros confinados alimentados apenas com grãos. De 57 bezerros de dez meses de idade, cinco ficaram cegos após oito meses no confinamento. Os sinais clínicos eram midríase, ausência de reflexo pupilar a luz e de ameaça, bilateralmente. Suspeitou-se de hipovitaminose A, que foi subsequentemente confirmada pelos baixos níveis séricos de vitamina A. Um bezerro foi eutanasiado e necropsiado, e alterações macroscópicas não foram encontradas. Lesões histopatológicas estavam restritas a retina e caracterizavam-se por degeneração e atrofia da camada de fotorreceptores, além de cicatrizes na retina. Os bezerros foram tratados com injeção intramuscular de vitamina A, na dose de 5.000 unidades internacionais (UI) por quilograma de peso vivo (Kg PV) a cada 60 dias, até o dia do abate. Os bezerros afetados não recuperaram a capacidade visual, mas novos casos não ocorreram.