Origem e destinação da fauna silvestre: levantamento de dados no estado de Sergipe / Origin and destination of wildlife: survey data in the state of Sergipe

A biodiversidade da Região Nordeste Brasileira encontra-se ameaçada pela ação humana devido a atividades como o desmatamento e a retirada de espécies silvestres do seu ambiente de origem. Assim, objetiva-se, com esta pesquisa, realizar um levantamento descritivo acerca das ações de recebimento e destinação dos animais silvestres realizadas pelo Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais Renováveis (IBAMA) no estado de Sergipe. Para isso, foram utilizados os dados provenientes dos registros de captura realizados pelo IBAMA/SE entre os anos de 2016 e 2020. Os animais que compunham esse banco de dados foram classificados conforme sua classe taxonômica, sendo: aves, répteis ou mamíferos. A origem dos animais que chegaram ao IBAMA foi subdividida da seguinte forma: oriundos de apreensão, de resgate ou de entrega voluntária. Já a destinação desses animais foi classificada como: óbito, soltura, cativeiro ou outros (quando não se enquadravam nas classes anteriores). Foi elaborado um banco de dados utilizando o software Excel®, e os dados foram analisados de maneira descritiva. Dos 5.247 indivíduos apreendidos ao longo do período estudado, a maior parte pertencia à classe das aves (81,9%), seguida pela dos répteis (16,4%) e dos mamíferos (1,7%). A apreensão foi a origem mais comum dos animais recebidos pelo IBAMA/SE em todos os anos avaliados; em segundo e terceiro lugar estão a entrega voluntária e o resgate, respectivamente. Para todas as classes taxonômicas, a principal destinação dos animais foi a soltura, enquanto o envio para cativeiros foi a alternativa menos frequente em todos os anos.

The biodiversity of the Brazilian Northeast region is threatened by human action due to activities such as deforestation and the removal of wild species from their original environment. Thus, this research aims to carry out a descriptive survey about the actions of reception and destination of wild animals performed by the Environment and Renewable Natural Resources Brazilian Institute Environment and Renewable Natural Resources (IBAMA) in the State of Sergipe. For this, data from capture records carried out by IBAMA/SE between 2016 and 2020 were used. The animals that made up this database were classified according to their taxonomic class, being, Birds, Reptiles, or Mammals. The origin of animals that arrived at IBAMA was subdivided as follows: from seizure, rescue, or voluntary delivery. The destination of these animals was classified as: death, release, captivity, or others (when they did not fit into the previous classes). A database was created using Excel® software, and the data were analyzed descriptively. Of the 5247 individuals apprehended over the period studied, most belonged to the bird class (81.9%), followed by reptiles (16.4%) and mammals (1.7%). Seizure was the most common origin of animals received by IBAMA/SE in all evaluated years, in second and third place are voluntary delivery and rescue, respectively. For all taxonomic classes, the main destination of the animals was release, while sending to captivity was the least frequent alternative in all years.

HERBase: A collection of understorey herb vegetation plots from Amazonia / HERBase: Uma coleção de parcelas de ervas de sub-bosque da Amazônia

Understorey herbs form a diverse and understudied plant assemblage in tropical forests. Although several studies and research teams have long been dedicated to the study of this conspicuous vegetation component in Amazonia, no effort to unify the data has been undertaken to date. In contrast to trees and other life forms for which major data compilations already exist, a unified database dedicated to herbs is still lacking. Part of the problem is in defining what is a herb and how to effectively sample herb assemblages. In this article, we describe the database HERBase, an exhaustive compilation of published and unpublished data on herb inventories in Amazonia. We also describe the structure, functioning, and guidelines for data curation and integration in HERBase. We were able to compile information from 1381 plots from all six Amazonian geographic regions. Based on this dataset, we describe and discuss sampling and knowledge gaps, priority areas for new collections, and recommend sampling protocols to facilitate data integration in the future. This novel database provides a unique biodiversity data repository on understorey herbs that will enable new studies on community ecology and biogeography.(AU)

As ervas do sub-bosque formam um componente diversificado e pouco estudado em florestas tropicais. Embora vários estudos e grupos de pesquisa tenham se dedicado ao estudo desse componente conspícuo na Amazônia, nenhum esforço foi feito até o momento para unificar essas informações. Em contraste com árvores e outros grupos de plantas para os quais já existem grandes compilações de dados, uma base de dados unificada dedicada às ervas ainda não existe. Parte do problema está em definir o que é uma erva e como amostrar comunidados de ervas de forma eficiente. Neste artigo descrevemos a base de dados HERBase, uma compilação exaustiva de dados publicados e não publicados sobre inventários de ervas na Amazônia. Também descrevemos a estrutura, funcionamento e diretrizes para curadoria e integração de dados na HERBase. Conseguimos compilar informações de 1381 parcelas de todas as seis regiões geográficas amazônicas. Com base nesses dados, descrevemos e discutimos lacunas de amostragem e conhecimento, apontamos áreas prioritárias para novas coletas e recomendamos protocolos de amostragem para facilitar a integração de dados no futuro. Essa nova base de dados fornece dados únicos de biodiversidade sobre ervas do sub-bosque que permitirão novos estudos sobre ecologia e biogeografia de comunidades.(AU)

Essential oil in the management of the seed bank of infestant plants / Óleo essencial no manejo de banco de sementes de plantas infestantes

The weed seed bank causes damage to agriculture, due to competition with cultivated plants and raising production costs, Cenchrus echinatushas a high seed multiplication and dissemination mechanism and Conyzabonariensisglyphosate resistance mechanism. The objective was to evaluate the potential of Menthaarvensisessential oil by means of fumigation in the weed seed bank. Soil samples (2 kg per treatment) were collected, homogenized and subjected to fumigation for 24 and 48 hours at concentrations of 2.5% and 5.0% of essential oil. The soil was solarized (control) and dried in the shade for three days as a witness. Then, 500 g of soil were distributed in four trays in a completely randomized design, where they received irrigation, identification and registration of emerging seedlings. Data were checked for normality and homogeneity of variance, transformed when necessary and submitted to analysis of variance at a 5% significance level. The averages were performed by Tukey and Dunnet tests at 5% probability. It was concluded that fumigation reduced grass and horseweed emergence regardless of dose and exposure time, with results similar to solarization.(AU)

O banco de sementes de plantas daninhas ocasionadanos a agricultura, devidoa competição com plantas cultivadas e elevando custos de produção, o Cenchrus echinatustemalto mecanismo de multiplicação e disseminação de sementes e a Conyzabonariensis mecanismo de resistência ao glifosato. Objetivou-seavaliar o potencial do óleo essencial de Mentha arvensispor meio da fumigação sobre o banco de sementes de plantas daninhas. As amostras de solo (2 kgpor tratamento) foram coletadas, homogeneizadas e submetidas à fumigação por 24 e 48 horas nas concentrações de 2,5% e 5,0% de óleo essencial, sendo solo solarizado (controle) e solo seco a sombra por três dias como testemunha. Em seguida, 500g de solo foi distribuída em quatro bandejas em delineamento inteiramente ao acaso, onde receberam irrigações,identificação e registros das plântulas emergentes. Os dados foram verificados anormalidade e homogeneidade de variância, transformados quando necessário e submetidos à análise de variância ao nível de significância de 5%. As médias foram realizadas pelos testes deTukey eDunnet a 5% de probabilidade. Conclui-se que a fumigação reduziua emergência docapim carrapichoe buva independente da dose e o tempo de exposição, com resultado similar a solarização.(AU)

Historical highlights regarding glanders, from 2007 to 2017, in the state of Maranhão, Brazil / Destaques históricos do mormo, de 2007 a 2017, no estado do Maranhão, Brasil

Glanders is an infectious disease of equids caused by Burkholderia mallei, a facultative intracellular non-mobile Gram-negative bacterium that can be transmitted to other animals and humans. This study described glanders cases reported in the state of Maranhão, located within an Amazon-Cerrado transition region in northeastern Brazil, from 2007 to 2017. A database in an electronic spreadsheet (Microsoft Excel 2010) was developed containing information on the number of positive animals according to age, sex, purpose, year and month, municipality and mesoregion of origin of the animal. The descriptive analyzis was performed on data provided by the State Agency for Agricultural and Livestock Protection of the state of Maranhão (AGED), and by the official private laboratory. As the database did not have information data about negative animals, possible risk factors could not be evaluated. Among the total of 62,555 equids were evaluated by means of the complement fixation test (CFT), 59,036 were horses, 2,981 mules and 538 donkeys. Thirty-five samples (0.06%) reacted in the CFT. Five additional samples were by the western blot technique and three of them were positive. All the reactive horses (Equuscaballus) were from rural areas. Results presented here indicate that glanders may be endemic in the state of Maranhão and is a public health concern.

O mormo é uma doença infecciosa de equídeos causada por Burkholderia mallei, uma bactéria Gram-negativa intracelular, não móvel e facultativa que pode ser transmitida a outros animais e humanos. O objetivo deste estudo foi descrever os casos de mormo relatados no estado do Maranhão, em uma região de transição Amazônia-Cerrado do Nordeste do Brasil, no período de 2007 a 2017. Um banco de dados em uma planilha eletrônica (Microsoft Excel 2010) foi desenvolvido contendo informações sobre o número de animais positivos de acordo com a idade, sexo, finalidade, ano, mês, municípios e mesorregiões de origem do animal. A análise descritiva foi realizada sobre os dados fornecidos pela Agência Estadual de Defesa Agropecuária do Estado do Maranhão (AGED), e pelo laboratório privado oficial. Como o banco de dados não possui informações sobre animais negativos, possíveis fatores de risco não puderam ser avaliados. Entre o total de 62.555 equídeos foram avaliados com o teste de fixação do complemento (CFT), 59.036 eram cavalos, 2.981 mulas e 538 jumentos. Trinta e cinco (0,06%) amostras reagiram ao CFT. Cinco amostras adicionais foram testadas pela técnica de western blot e três foram positivas. Todos os animais positivos foram cavalos (Equus caballus) da área rural. Os resultados indicam que o mormo pode ser endêmico no estado do Maranhão e uma preocupação de saúde pública.

Inheritance of seedlessness and the molecular characterization of the INO gene in Annonaceae

Abstract The inheritance of the seedless fruit characteristic of Annona squamosa has not yet been explained. Molecular techniques may aid breeding programs, mainly in the assisted selection of the target gene. The INO gene may be related to seed development in these fruits. The objective of the present paper was to investigate the inheritance of seedlessness in the 'Brazilian seedless' sugar apple and INO gene conservation in Annona squamosa and Annona cherimola x Annona squamosa genotypes by assessing their homology with the INO database genes. The F1 generation was obtained by crossing the mutant 'Brazilian seedless' (male genitor) (P1) with the wild-type A. squamosa with seeds (M1 and M2, female genitors). The INO gene was studied in mutant and wild-type A. squamosa (P1, M1, M2 and M3) and in the Gefner atemoya (A. cherimola x A. squamosa) (M4) cultivar. The DNA was extracted from young leaves, and four sets of specific primers flanking the INO gene were amplified. The seedless characteristic was identified as stenospermatic in the fruits of parental P1, suggesting monogenic inheritance with complete dominance. High sequence similarity of the INO gene amplifications in the sugar apple accessions (M1, M2, M3) and the atemoya cultivar Gefner (M4) reinforces the hypothesis of their conservation.

Resumo A herança da característica de fruto sem sementes de Annona squamosa ainda não foi esclarecida. Técnicas moleculares podem auxiliar em programas de melhoramento, principalmente na seleção assistida do gene de interesse. O gene INO pode estar relacionado ao desenvolvimento da semente dessas frutas. O objetivo foi investigar a herança da ausência de sementes em Annona squamosa e a conservação do gene INO nos genótipos Annona squamosa e Annona cherimola x Annona squamosa avaliando sua homologia com banco de dados de genes INO. A geração F1 foi obtida pelo cruzamento do mutante 'Brazilian seedless' (genitor masculino) (P1) com o tipo selvagem com sementes (A. squamosa) (M1 e M2, genitores femininos). O gene INO foi estudado em A. squamosa, mutante e selvagem (P1, M1, M2 e M3) e na cultivar Gefner atemoya (A. cherimola x A. squamosa) (M4). O DNA foi extraído de folhas jovens, e quatro conjuntos de primers específicos flanqueando o gene INO foram amplificados. A característica sem sementes foi identificada como estenospermática nos frutos do parental P1, sugerindo herança monogênica com dominância completa. A alta similaridade de sequência das amplificações do gene INO nos acessos de pinha (M1, M2, M3) e na cultivar de atemóia Gefner (M4) reforça a hipótese de sua conservação.

Energy supplements for beef heifers on cool season pastures: a database analysis / Uso de suplemento energético para novilhas de corte em pastagens de estação fria: análise de banco de dados

Pooled data analysis is an analytical method that combines results from multiple studies. This technique provides a more robust estimate of the effects of an investigation. We performed a database analysis from seventeen experiments developed at Federal University of Santa Maria, Rio Grande do Sul state, Brazil, between 1999 and 2017 to characterize individual performance per area and stocking rate with or without supplementation of replacement heifers grazing winter pastures. Data were separated into two groups: with and without energy supplement provision, and into five subgroups based on supplement levels. Heifers from both groups were maintained under similar forage biomass and leaf blade allowance. Statistical analyses were run on R software using a 'meta' package. Supplement supply increased average daily gain and gain of body condition scores by 11.1% and 20.0%, respectively. Supplement levels higher than 1.2% of body weight resulted in higher weight gain per area, with the stocking rate increasing with higher supplement levels.

Análise conjunta de dados é um método analítico que integra os resultados de muitos estudos. Essa técnica fornece uma estimativa mais robusta sobre os efeitos de uma investigação. Com o objetivo de caracterizar o desempenho individual, por área e a taxa de lotação com uso ou não de suplementos para novilhas de reposição mantidas em pastagem de inverno, foi realizada uma análise de banco de dados de dezessete experimentos conduzidos na Universidade Federal de Santa Maria (UFSM), RS, Brasil, entre 1999 e 2017. Os dados foram estratificados em dois grupos: com e sem suplemento energético e cinco subgrupos de acordo com o nível de suplemento. As novilhas de ambos os grupos foram mantidas em similar massa de forragem e oferta de lâminas foliares. As análises estatísticas foram executadas no software R, pacote 'meta'. O fornecimento de suplemento aumentou o ganho médio diário em 11.1% e em 20.0% o ganho no escore de condição corporal. Níveis de fornecimento maiores que 1.2% do peso corporal proporcionaram o maior ganho de peso por área e a taxa de lotação aumenta à medida que os níveis de suplemento aumentam.

Genetic diversity and antimicrobial susceptibility of Staphylococcus aureus isolated from bovine mastitis in Minas Gerais, Brazil / Diversidade genética e susceptibilidade a antimicrobianos em Staphylococcus aureus isoladas de mastite bovina em Minas Gerais, Brasil

ABSTRACT: This study evaluated the genetic diversity and antimicrobial susceptibility of Staphylococcus aureus isolates from dairy cows in Minas Gerais, Brazil. Thirty-seven isolates from five municipalities (8 herds) were genotyped using multi-locus sequence typing (MLST) and susceptibility to 12 antimicrobial agents was tested using the disk diffusion method. High resistance rates for penicillin [75.68% (28/37)], ampicillin [70.27% (26/37)], and tetracycline [70.27% (26/37)] were detected. Multidrug resistance was observed in seven [18.92% (7/37)] isolates, and two were suggestive of Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA). Among the 37 isolates, 33 novel sequence types (ST) and two known STs (ST126 and ST746) were identified in MLST. The clonal complexes more frequently observed were: CC97 [78.38%; (29/37)], CC1 [8.11%; (3/37)] and CC5 [5.40%; (2/37)]. Minimum‐spanning tree (MST) analysis according to data from municipalities, herds, and resistance patterns for all isolates did not show any clustering pattern. However, the MST comparing all Brazilian S. aureus isolates deposited in the PubMLST database and from this study depicted an association between the genotype and strain origin (clinical sample). Isolates from this study that belong to CC97 were close to database isolates from milk and dairy products, while those that belong to CC1 and CC5 were close to database isolates from human sources and the environment of dairy farms or industries. In conclusion, our results showed a high rate of resistance to penicillins and tetracyclines and great genetic diversity among the S. aureus isolates from bovine mastitis genotyped in the present study.

RESUMO: Este estudo teve como objetivo avaliar a diversidade genética e a suscetibilidade a antimicrobianos de cepas de Staphylococcus aureus isoladas de vacas leiteiras em Minas Gerais, Brasil. Trinta e sete cepas provenientes de cinco municípios (oito rebanhos) foram genotipadas usando a técnica multi-locus sequence typing (MLST) e a suscetibilidade a 12 antimicrobianos foi avaliada pelo método de difusão em disco. Foram detectadas altas taxas de resistência para penicilina [75,68% (28/37)], ampicilina [70,27% (26/37)] e tetraciclina [70,27% (26/37)] entre os isolados. A multirresistência foi observada em sete [18,92% (7/37)] isolados e dois foram classificados como sugestivos de Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA). Entre os 37 isolados, 33 novos sequence types (ST) e dois STs conhecidos (ST126 e ST746) foram identificados pelo MLST. Os complexos clonais mais frequentemente observados foram: CC97 [78,38%; (29/37)], CC1 [8,11%; (3/37)] e CC5 [5,40%; (2/37)]. Foi construída uma minimum‐spanning tree (MSTs) com todos isolados estudados e esta não mostrou padrão de agrupamento quando comparada com dados epidemiológicos como municípios e rebanho, do qual foi isolado, e perfis de resistência a antimicrobianos. Uma segunda MST foi construída comparando os isolados deste estudo e todas as cepas de S. aureus depositadas no banco de dados PubMLST provenientes do Brasil, que mostrou associação entre o genótipo, STs e a origem da cepa. Foi possível observar entre os isolados do estudo que, aqueles que pertenciam ao CC97, eram geneticamente mais próximos das cepas depositadas no PubMLST isoladas de leite e de produtos lácteos, enquanto aqueles que pertenciam aos CC1 e CC5 estavam mais próximos a cepas isoladas de humanos ou do ambiente de fazendas e indústrias de laticínios. Em conclusão, nossos resultados mostraram um alto índice de resistência às penicilinas e tetraciclinas e grande diversidade genética entre as cepas de S. aureus isoladas de casos de mastite bovina.

The molecular investigations on the subgenus Artemisia Less. of the genus Artemisia L. (Asteraceae) in Turkey

Abstract The genus Artemisia L. of the family Asteraceae is systematically very complex. The aim of this study was to evaluate taxonomic positions of taxa of the subgenus Artemisia belonging to the genus Artemisia in Turkey using some molecular techniques. In this molecular study, 44 individuals belong to 14 species of the subgenus Artemisia were examined. Analyses were performed on the combined dataset using maximum parsimony, maximum likelihood and Bayesian inference and Molecular parameters obtained from co-evaluations of sequences of the psbA-trnH, ITS and ETS regions of examined individuals were used in the phylogenetic tree drawing. According to the results of this study, two molecular groups have been formed based on the DNA sequence similarity of the species, but there are no obvious morphological characters corresponding to two molecular groups. There is no also agreement between the two molecular groups and the two morphological groups formed according to the hairiness condition of the receptacle of species. Due to the lack of molecular significance of their receptacles with or without hair, dividing of the subgenus Artemisia species into new subgenera or sections was not considered appropriate. Likewise, it has been found that with or without hair on the corolla lobes of the central hermaphrodite disc flowers have no molecular significance. It was found that there were no gene flow and hybridization between the 14 species of the subgenus Artemisia and these 14 species were found completed their speciation. This study is important as it is the first molecular based study relating with belong to subgenus Artemisia species growing naturally in Turkey. In addition, new haplotypes related to the populations of Turkey belonging to the subgenus Artemisia taxa were reported by us for the first time and added to the GenBank database.

Resumo O gênero Artemisia L. da família Asteraceae é sistematicamente muito complexo. O objetivo deste estudo foi avaliar as posições taxonômicas de táxons do subgênero Artemisia pertencentes ao gênero Artemisia na Turquia usando algumas técnicas moleculares. Neste estudo molecular, 44 indivíduos pertencentes a 14 espécies do subgênero Artemisia foram examinados. As análises foram realizadas no conjunto de dados combinado usando máxima parcimônia, máxima verossimilhança e inferência bayesiana e parâmetros moleculares obtidos a partir de coavaliações de sequências das regiões psbA-trnH, ITS e ETS de indivíduos examinados foram usados no desenho da árvore filogenética. De acordo com os resultados deste estudo, dois grupos moleculares foram formados com base na similaridade da sequência de DNA das espécies, mas não há caracteres morfológicos óbvios correspondentes a dois grupos moleculares. Também não há concordância entre os dois grupos moleculares e os dois grupos morfológicos formados de acordo com a condição de pilosidade do receptáculo da espécie. Devido à falta de significado molecular de seus receptáculos com ou sem cabelo, a divisão das espécies do subgênero Artemisia em novos subgêneros ou seções não foi considerada apropriada. Da mesma forma, verificou-se que com ou sem cabelo nos lobos da corola das flores do disco hermafrodita central não tem significado molecular. Constatou-se que não houve fluxo gênico e hibridização entre as 14 espécies do subgênero Artemisia e essas 14 espécies concluíram sua especiação. Este estudo é importante porque é o primeiro estudo de base molecular relacionado com espécies pertencentes ao subgênero Artemisia crescendo naturalmente na Turquia. Além disso, novos haplótipos relacionados às populações da Turquia pertencentes ao subgênero Artemisia taxa foram relatados por nós pela primeira vez e adicionados ao banco de dados do GenBank.

Expression analysis of transcription factors in sugarcane during cold stress

Abstract Transcription factors (TF) are a wide class of genes in plants, and these can regulate the expression of other genes in response to various environmental stresses (biotic and abiotic). In the current study, transcription factor activity in sugarcane was examined during cold stress. Initially, RNA transcript reads of two sugarcane cultivars (ROC22 and GT08-1108) under cold stress were downloaded from SRA NCBI database. The reads were aligned into a reference genome and the differential expression analyses were performed with the R/Bioconductor edgeR package. Based on our analyses in the ROC22 cultivar, 963 TF genes were significantly upregulated under cold stress among a total of 5649 upregulated genes, while 293 TF genes were downregulated among a total of 3,289 downregulated genes. In the GT08-1108 cultivar, 974 TF genes were identified among 5,649 upregulated genes and 283 TF genes were found among 3,289 downregulated genes. Most transcription factors were annotated with GO categories related to protein binding, transcription factor binding, DNA-sequence-specific binding, transcription factor complex, transcription factor activity in RNA polymerase II, the activity of nucleic acid binding transcription factor, transcription corepressor activity, sequence-specific regulatory region, the activity of transcription factor of RNA polymerase II, transcription factor cofactor activity, transcription factor activity from plastid promoter, transcription factor activity from RNA polymerase I promoter, polymerase II and RNA polymerase III. The findings of above results will help to identify differentially expressed transcription factors during cold stress. It also provides a comprehensive analysis of the regulation of the transcription activity of many genes. Therefore, this study provides the molecular basis for improving cold tolerance in sugarcane and other economically important grasses.

Resumo Fatores de transcrição (FT) são uma ampla classe de genes em plantas e podem regular a expressão de outros genes em resposta a vários estresses ambientais (estresses bióticos e abióticos). No presente estudo, a atividade do fator de transcrição na cana-de-açúcar foi examinada durante o estresse pelo frio. Inicialmente, as leituras de transcrição de RNA de duas cultivares de cana-de-açúcar (ROC22 e GT08-1108) sob estresse frio foram baixadas do banco de dados SRA NCBI. As leituras foram alinhadas em um genoma de referência e as análises de expressão diferencial foram realizadas com o pacote R / Bioconductor edgeR. Com base em nossas análises no cultivar ROC22, 963 genes TF foram significativamente regulados positivamente sob estresse pelo frio entre um total de 5.649 genes regulados positivamente, enquanto 293 genes TF foram regulados negativamente entre um total de 3.289 genes regulados negativamente. No cultivar GT08-1108, 974 genes TF foram identificados entre 5.649 genes regulados positivamente e 283 genes TF foram encontrados entre 3.289 genes regulados negativamente. Os fatores de transcrição, em sua maioria, foram anotados com categorias GO relacionadas à ligação de proteína, ligação de fator de transcrição, ligação específica de sequência de DNA, complexo de fator de transcrição, atividade de fator de transcrição em RNA polimerase II, atividade de fator de transcrição de ligação de ácido nucleico, atividade de corepressor de transcrição, sequência específica da região reguladora, atividade do fator de transcrição da RNA polimerase II, atividade do cofator do fator de transcrição, atividade do fator de transcrição do promotor do plastídio, atividade do fator de transcrição do promotor da RNA polimerase I, polimerase II e RNA polimerase III. As descobertas dos resultados acima ajudarão a identificar fatores de transcrição expressos diferencialmente durante o estresse pelo frio. Ele também fornece uma análise abrangente da regulação da atividade de transcrição de muitos genes. Portanto, este estudo fornece base molecular para melhorar a tolerância ao frio em cana-de-açúcar e outras gramíneas economicamente importantes.

Genetic variability of Mycoplasma synoviae detected in commercial layers in southeastern Brazil / Variabilidade genética de Mycoplasma synoviae detectado em poedeiras comerciais do sudeste do Brasil

Este estudo teve como objetivo caracterizar genótipos de M. synoviae circulantes em poedeiras comerciais, na Região Sudeste do Brasil. Para estabelecer a relação evolutiva entre as cepas de MS, foi analisada a sequência genética do gene vlhA de 11 cepas de MS identificadas no Rio de Janeiro e em São Paulo, de 10 outras cepas de MS identificadas no Brasil e cujas sequências foram depositadas no banco de dados GenBank, e da cepa vacinal MSH. O método da máxima verossimilhança e o modelo de Kimura com dois parâmetros foram utilizados para comparar as cepas. As sequências obtidas foram depositadas no Genbank, sob os números de acesso OP279775 a OP279785. Foi possível verificar a presença de diferentes cepas circulantes no Brasil, com alta similaridade entre as cepas do Rio de Janeiro pela análise do gene vlhA. As duas cepas paulistas detectadas no presente estudo possuem o baixo percentual (68%) de similaridade, demonstrando a variabilidade das cepas dessa localidade.

Inheritance of seedlessness and the molecular characterization of the INO gene in Annonaceae / Herança da ausência de sementes e a caracterização molecular do gene INO em Annonaceae

The inheritance of the seedless fruit characteristic of Annona squamosa has not yet been explained. Molecular techniques may aid breeding programs, mainly in the assisted selection of the target gene. The INO gene may be related to seed development in these fruits. The objective of the present paper was to investigate the inheritance of seedlessness in the 'Brazilian seedless' sugar apple and INO gene conservation in Annona squamosa and Annona cherimola x Annona squamosa genotypes by assessing their homology with the INO database genes. The F1 generation was obtained by crossing the mutant 'Brazilian seedless' (male genitor) (P1) with the wild-type A. squamosa with seeds (M1 and M2, female genitors). The INO gene was studied in mutant and wild-type A. squamosa (P1, M1, M2 and M3) and in the Gefner atemoya (A. cherimola x A. squamosa) (M4) cultivar. The DNA was extracted from young leaves, and four sets of specific primers flanking the INO gene were amplified. The seedless characteristic was identified as stenospermatic in the fruits of parental P1, suggesting monogenic inheritance with complete dominance. High sequence similarity of the INO gene amplifications in the sugar apple accessions (M1, M2, M3) and the atemoya cultivar Gefner (M4) reinforces the hypothesis of their conservation.

A herança da característica de fruto sem sementes de Annona squamosa ainda não foi esclarecida. Técnicas moleculares podem auxiliar em programas de melhoramento, principalmente na seleção assistida do gene de interesse. O gene INO pode estar relacionado ao desenvolvimento da semente dessas frutas. O objetivo foi investigar a herança da ausência de sementes em Annona squamosa e a conservação do gene INO nos genótipos Annona squamosa e Annona cherimola x Annona squamosa avaliando sua homologia com banco de dados de genes INO. A geração F1 foi obtida pelo cruzamento do mutante 'Brazilian seedless' (genitor masculino) (P1) com o tipo selvagem com sementes (A. squamosa) (M1 e M2, genitores femininos). O gene INO foi estudado em A. squamosa, mutante e selvagem (P1, M1, M2 e M3) e na cultivar Gefner atemoya (A. cherimola x A. squamosa) (M4). O DNA foi extraído de folhas jovens, e quatro conjuntos de primers específicos flanqueando o gene INO foram amplificados. A característica sem sementes foi identificada como estenospermática nos frutos do parental P1, sugerindo herança monogênica com dominância completa. A alta similaridade de sequência das amplificações do gene INO nos acessos de pinha (M1, M2, M3) e na cultivar de atemóia Gefner (M4) reforça a hipótese de sua conservação.

Inheritance of seedlessness and the molecular characterization of the INO gene in Annonaceae / Herança da ausência de sementes e a caracterização molecular do gene INO em Annonaceae

The inheritance of the seedless fruit characteristic of Annona squamosa has not yet been explained. Molecular techniques may aid breeding programs, mainly in the assisted selection of the target gene. The INO gene may be related to seed development in these fruits. The objective of the present paper was to investigate the inheritance of seedlessness in the 'Brazilian seedless' sugar apple and INO gene conservation in Annona squamosa and Annona cherimola x Annona squamosa genotypes by assessing their homology with the INO database genes. The F1 generation was obtained by crossing the mutant 'Brazilian seedless' (male genitor) (P1) with the wild-type A. squamosa with seeds (M1 and M2, female genitors). The INO gene was studied in mutant and wild-type A. squamosa (P1, M1, M2 and M3) and in the Gefner atemoya (A. cherimola x A. squamosa) (M4) cultivar. The DNA was extracted from young leaves, and four sets of specific primers flanking the INO gene were amplified. The seedless characteristic was identified as stenospermatic in the fruits of parental P1, suggesting monogenic inheritance with complete dominance. High sequence similarity of the INO gene amplifications in the sugar apple accessions (M1, M2, M3) and the atemoya cultivar Gefner (M4) reinforces the hypothesis of their conservation.(AU)

A herança da característica de fruto sem sementes de Annona squamosa ainda não foi esclarecida. Técnicas moleculares podem auxiliar em programas de melhoramento, principalmente na seleção assistida do gene de interesse. O gene INO pode estar relacionado ao desenvolvimento da semente dessas frutas. O objetivo foi investigar a herança da ausência de sementes em Annona squamosa e a conservação do gene INO nos genótipos Annona squamosa e Annona cherimola x Annona squamosa avaliando sua homologia com banco de dados de genes INO. A geração F1 foi obtida pelo cruzamento do mutante 'Brazilian seedless' (genitor masculino) (P1) com o tipo selvagem com sementes (A. squamosa) (M1 e M2, genitores femininos). O gene INO foi estudado em A. squamosa, mutante e selvagem (P1, M1, M2 e M3) e na cultivar Gefner atemoya (A. cherimola x A. squamosa) (M4). O DNA foi extraído de folhas jovens, e quatro conjuntos de primers específicos flanqueando o gene INO foram amplificados. A característica sem sementes foi identificada como estenospermática nos frutos do parental P1, sugerindo herança monogênica com dominância completa. A alta similaridade de sequência das amplificações do gene INO nos acessos de pinha (M1, M2, M3) e na cultivar de atemóia Gefner (M4) reforça a hipótese de sua conservação.(AU)

Genetic structure and inbreeding in Romney Marsh sheep in Brazil / Estrutura genética e consanguinidade de ovinos Romney Marsh no Brasil

According to the last livestock census, Brazil has 17,976,367 head of sheep. Approximately 23.69% of this herd is located in the south region, where wool or wool and meat-producing breeds are predominately farmed. Inbreeding, or consanguinity, is defined as the mating of related individuals, which tends to occur when herds are small or originate from few parents. This study proposes to investigate the genetic structure and diversity of the Romney Marsh sheep herd in Brazil. The pedigree data used were obtained from the Brazilian Association of Sheep Breeders (ARCO), which keeps the sheep register database. For a more complete analysis, data from the Purebred Register Books were used. The population herein referred to as "total" comprised 22,833 individuals, whereas the population termed "reference" consisted of 17,053 records. Individual and average inbreeding coefficients, as well as overall frequencies, were calculated using SAS software. Demographic indicators were determined using ENDOG software. The average inbreeding coefficient found was 2.90% in the total population and 3.55% in the reference population. The minimum inbreeding value found in the studied population was 0.01% and the maximum was 43.47%. Inbred animals in the complete reference population were 10.31%. In 2018, inbred animals represented 82.55% of the registered population. The average generation interval was 4.0488 years. Due to the intensive use of few breeding lines and the high degree of genetic uniformity in the population, the Romney Marsh breed has narrow pedigree bottlenecks. The current population of the Romney Marsh breed has only two genetic origins, warranting the introduction of new genes to avoid genetic erosion and severe losses due to inbreeding.(AU)

O último censo pecuário informa que o Brasil possui 17.976.367 cabeças de ovinos. Aproximadamente 23,69% desse efetivo está localizado na região sul do país, onde predomina a criação de raças produtoras de lã, ou lã e carne. Endogamia ou consanguinidade é definida como o acasalamento de indivíduos relacionados, e tende a ocorrer quando os rebanhos são pequenos ou provenientes de poucos genitores. Este estudo teve como objetivo estudar a estrutura e a diversidade genética do rebanho ovino da raça Romney Marsh no Brasil. Os dados de pedigree utilizados foram obtidos na Associação Brasileira de Criadores de Ovinos (ARCO), que é a mantenedora do banco de dados de registro de ovinos. Para uma análise mais completa foram utilizados dados dos Livros de Registro Puro de Origem (PO). A população referida como "total" foi composta por 22.833 indivíduos, e a população referida como "referência" composta por 17.053 registros. Os coeficientes de consanguinidade individual e médio, bem como as frequências gerais, foram calculados usando o software SAS. Os indicadores demográficos foram determinados a partir do software ENDOG. O coeficiente de consanguinidade médio encontrado na população total foi de 2,90%, e na população de referência foi de 3,55%. O valor mínimo de consanguinidade encontrado na população estudada foi de 0,01% e o máximo, foi de 43,47%. Animais consanguíneos na população de referência completa foi de 10,31%. Em 2018 os animais consanguíneos representavam 82,55% da população cadastrada. Intervalo médio de gerações 4,0488 anos. Devido ao uso intensivo de poucas linhas de reprodutores e ao alto grau de uniformidade genética da população, a raça Romney Marsh apresenta estreitos gargalos nos pedigrees. A população atual da raça Romney Marsh provém de apenas duas origens genéticas, sendo necessário introduzir genes novos para evitar a erosão genética e perdas por consanguinidade acentuada.(AU)

Expression analysis of transcription factors in sugarcane during cold stress / Análise de expressão de fatores de transcrição em cana-de-açúcar sob estresse por frio

Transcription factors (TF) are a wide class of genes in plants, and these can regulate the expression of other genes in response to various environmental stresses (biotic and abiotic). In the current study, transcription factor activity in sugarcane was examined during cold stress. Initially, RNA transcript reads of two sugarcane cultivars (ROC22 and GT08-1108) under cold stress were downloaded from SRA NCBI database. The reads were aligned into a reference genome and the differential expression analyses were performed with the R/Bioconductor edgeR package. Based on our analyses in the ROC22 cultivar, 963 TF genes were significantly upregulated under cold stress among a total of 5649 upregulated genes, while 293 TF genes were downregulated among a total of 3,289 downregulated genes. In the GT08-1108 cultivar, 974 TF genes were identified among 5,649 upregulated genes and 283 TF genes were found among 3,289 downregulated genes. Most transcription factors were annotated with GO categories related to protein binding, transcription factor binding, DNA-sequence-specific binding, transcription factor complex, transcription factor activity in RNA polymerase II, the activity of nucleic acid binding transcription factor, transcription corepressor activity, sequence-specific regulatory region, the activity of transcription factor of RNA polymerase II, transcription factor cofactor activity, transcription factor activity from plastid promoter, transcription factor activity from RNA polymerase I promoter, polymerase II and RNA polymerase III. The findings of above results will help to identify differentially expressed transcription factors during cold stress. It also provides a comprehensive analysis of the regulation of the transcription activity of many genes. Therefore, this study provides the molecular basis for improving cold tolerance in sugarcane and other economically important grasses.

Fatores de transcrição (FT) são uma ampla classe de genes em plantas e podem regular a expressão de outros genes em resposta a vários estresses ambientais (estresses bióticos e abióticos). No presente estudo, a atividade do fator de transcrição na cana-de-açúcar foi examinada durante o estresse pelo frio. Inicialmente, as leituras de transcrição de RNA de duas cultivares de cana-de-açúcar (ROC22 e GT08-1108) sob estresse frio foram baixadas do banco de dados SRA NCBI. As leituras foram alinhadas em um genoma de referência e as análises de expressão diferencial foram realizadas com o pacote R / Bioconductor edgeR. Com base em nossas análises no cultivar ROC22, 963 genes TF foram significativamente regulados positivamente sob estresse pelo frio entre um total de 5.649 genes regulados positivamente, enquanto 293 genes TF foram regulados negativamente entre um total de 3.289 genes regulados negativamente. No cultivar GT08-1108, 974 genes TF foram identificados entre 5.649 genes regulados positivamente e 283 genes TF foram encontrados entre 3.289 genes regulados negativamente. Os fatores de transcrição, em sua maioria, foram anotados com categorias GO relacionadas à ligação de proteína, ligação de fator de transcrição, ligação específica de sequência de DNA, complexo de fator de transcrição, atividade de fator de transcrição em RNA polimerase II, atividade de fator de transcrição de ligação de ácido nucleico, atividade de corepressor de transcrição, sequência específica da região reguladora, atividade do fator de transcrição da RNA polimerase II, atividade do cofator do fator de transcrição, atividade do fator de transcrição do promotor do plastídio, atividade do fator de transcrição do promotor da RNA polimerase I, polimerase II e RNA polimerase III. As descobertas dos resultados acima ajudarão a identificar fatores de transcrição expressos diferencialmente durante o estresse pelo frio. Ele também fornece uma análise abrangente da regulação da atividade [...].

Expression analysis of transcription factors in sugarcane during cold stress / Análise de expressão de fatores de transcrição em cana-de-açúcar sob estresse por frio

Transcription factors (TF) are a wide class of genes in plants, and these can regulate the expression of other genes in response to various environmental stresses (biotic and abiotic). In the current study, transcription factor activity in sugarcane was examined during cold stress. Initially, RNA transcript reads of two sugarcane cultivars (ROC22 and GT08-1108) under cold stress were downloaded from SRA NCBI database. The reads were aligned into a reference genome and the differential expression analyses were performed with the R/Bioconductor edgeR package. Based on our analyses in the ROC22 cultivar, 963 TF genes were significantly upregulated under cold stress among a total of 5649 upregulated genes, while 293 TF genes were downregulated among a total of 3,289 downregulated genes. In the GT08-1108 cultivar, 974 TF genes were identified among 5,649 upregulated genes and 283 TF genes were found among 3,289 downregulated genes. Most transcription factors were annotated with GO categories related to protein binding, transcription factor binding, DNA-sequence-specific binding, transcription factor complex, transcription factor activity in RNA polymerase II, the activity of nucleic acid binding transcription factor, transcription corepressor activity, sequence-specific regulatory region, the activity of transcription factor of RNA polymerase II, transcription factor cofactor activity, transcription factor activity from plastid promoter, transcription factor activity from RNA polymerase I promoter, polymerase II and RNA polymerase III. The findings of above results will help to identify differentially expressed transcription factors during cold stress. It also provides a comprehensive analysis of the regulation of the transcription activity of many genes. Therefore, this study provides the molecular basis for improving cold tolerance in sugarcane and other economically important grasses.(AU)

Fatores de transcrição (FT) são uma ampla classe de genes em plantas e podem regular a expressão de outros genes em resposta a vários estresses ambientais (estresses bióticos e abióticos). No presente estudo, a atividade do fator de transcrição na cana-de-açúcar foi examinada durante o estresse pelo frio. Inicialmente, as leituras de transcrição de RNA de duas cultivares de cana-de-açúcar (ROC22 e GT08-1108) sob estresse frio foram baixadas do banco de dados SRA NCBI. As leituras foram alinhadas em um genoma de referência e as análises de expressão diferencial foram realizadas com o pacote R / Bioconductor edgeR. Com base em nossas análises no cultivar ROC22, 963 genes TF foram significativamente regulados positivamente sob estresse pelo frio entre um total de 5.649 genes regulados positivamente, enquanto 293 genes TF foram regulados negativamente entre um total de 3.289 genes regulados negativamente. No cultivar GT08-1108, 974 genes TF foram identificados entre 5.649 genes regulados positivamente e 283 genes TF foram encontrados entre 3.289 genes regulados negativamente. Os fatores de transcrição, em sua maioria, foram anotados com categorias GO relacionadas à ligação de proteína, ligação de fator de transcrição, ligação específica de sequência de DNA, complexo de fator de transcrição, atividade de fator de transcrição em RNA polimerase II, atividade de fator de transcrição de ligação de ácido nucleico, atividade de corepressor de transcrição, sequência específica da região reguladora, atividade do fator de transcrição da RNA polimerase II, atividade do cofator do fator de transcrição, atividade do fator de transcrição do promotor do plastídio, atividade do fator de transcrição do promotor da RNA polimerase I, polimerase II e RNA polimerase III. As descobertas dos resultados acima ajudarão a identificar fatores de transcrição expressos diferencialmente durante o estresse pelo frio. Ele também fornece uma análise abrangente da regulação da atividade [...].(AU)

Descriptive cross-sectional study on major bovine diseases and associated risk factors in north-eastern Ecuadorian Amazon / Estudo transversal descritivo sobre as principais doenças bovinas e fatores de risco associados no nordeste da Amazônia equatoriana

Cattle raising is a crucial element of production systems in the tropics and subtropics. However, in recent years, global public health security has been threatened by disease emergence. In Orellana Province, livestock is the most important activity to generate economic income. Nevertheless, there is no available data about Animal Health status. With this objective, a study was performed to describe the major Bovine diseases recorded between 2011 to 2019, and the main Risk factors associated. Data on main Bovine diseases were retrieved from the World Animal Health Information System database. Whereas Bovine population data used to calculate the prevalence rates and confidence intervals were obtained from Ecuador's Ministry of Agriculture. By contrast, the Risk factors identified with an epidemiological questionnaire were applied to 300 livestock farmers. As a result, from 2011 to 2019 in Orellana has been confirmed: 90 cases of Infectious Bovine Rhinotracheitis (31.58%), Bovine Rabies by hematophagous bats (Desmodus rotundus), 83 cases (29.12%), Bovine viral diarrhea with 43 cases (15.10%), Brucellosis by Brucella abortus 35 cases, which was (12.28%), and 34 cases related to Enzootic bovine leukosis (11.92%). Overall, the prevalence rates ranged from (0.24 to 15.37%). In addition, farm size, presence of forest, herd, and paddock sizes, cutting frequency of forages, and other animal species were involved as Risk factors (OR = 3.15 to 11.75; 95% CI, 0.01 to 0.69). In conclusion, there are animal diseases with reproductive and neurologic symptomology and high-Risk factors implicated in the transmission. Consequently, space-temporal and seroprevalence epidemiological studies should be performed in Orellana.

A criação de gado é um elemento crucial dos sistemas de produção nos trópicos e subtrópicos. No entanto, nos últimos anos, a segurança da saúde pública global tem sido ameaçada pelo surgimento de doenças. Na província de Orellana, a pecuária é a atividade mais importante para gerar renda econômica. Contudo, não há dados disponíveis sobre o estado de saúde animal. Com este objetivo, foi realizado um estudo para descrever as principais doenças dos bovinos registradas entre 2011 e 2019, além dos principais fatores de risco associados. Os dados sobre as principais doenças bovinas foram recuperados do banco de dados do World Animal Health Information System. Os dados da população bovina usados para calcular as taxas de prevalência e os intervalos de confiança foram obtidos do Ministério da Agricultura do Equador. Por outro lado, os fatores de risco identificados com um questionário epidemiológico foram aplicados a 300 criadores de gado. Como resultado, de 2011 a 2019 em Orellana foram confirmados: 90 casos (31,58%) de rinotraqueíte infecciosa bovina, 83 casos (29,12%) de raiva bovina por morcegos hematófagos (Desmodus rotundus), 43 casos (15,10%) de diarreia viral bovina, 35 casos (12,28%) de brucelose por Brucella abortus e 34 casos relacionados à leucose enzoótica bovina (11,92%). No geral, as taxas de prevalência variaram de 0,24 a 15,37%. Além disso, tamanho da fazenda, presença de floresta, tamanho do rebanho e dos piquetes, frequência de corte de forragens e outras espécies animais estiveram envolvidos como fatores de risco (OR = 3,15-11,75; IC 95% 0,01-0,69). Em conclusão, existem doenças animais com sintomatologia reprodutiva e neurológica e fatores de alto risco implicados na transmissão. Portanto, estudos epidemiológicos espaço-temporais e de soroprevalência devem ser realizados em Orellana.

Genetic correlation between feed efficiency and carcass traits in Nellore cattle in Brazil / Correlação genética entre características de eficiência alimentar e de carcaça em bovinos da raça Nelore no Brasi

The aim was to estimate the genetic correlations between residual feed intake (RFI) and dry matter intake (DMI) with carcass finish (CF), rib eye area (REA), and marbling (MAR) of Nellore cattle. Data from 7,808 animals were considered. In addition, data from 2,261 females included in the complete database were also considered. Estimates of variance and covariance components, as well as heritabilities and genetic correlations were obtained by means of two-character analysis under animal model. Heritability estimates were found to be moderate for the RFI (0.22) and DMI (0.29) traits. It was observed that genetic correlation was close to zero for all traits, except between RFI and REA (-0.11). However, considering the female population, there was an increase in the estimated genetic correlation between RFI and DMI, although still a favorable genetic association of low magnitude (-0.30). There was also an increase in the genetic association of REA with RFI (-0.21). It can be concluded that the direct selection for RFI and DMI will not influence the CF, MAR, or REA of Nellore cattle. However, this selection may generate some favorable responses in MAR and REA in Nellore females.

Objetivou-se estimar as correlações genéticas entre consumo alimentar residual (CAR) e ingestão de matéria seca com acabamento de carcaça (ACAB), área de olho de lombo (AOL) e marmoreio (MAR) para bovinos da raça Nelore. Foram consideradas informações de 7.808 animais. Além disso foram consideradas informações de 2.261 animais fêmeas que compunham o banco de dados completo. As estimativas dos componentes de variâncias e covariâncias, bem como das herdabilidades e correlações genéticas foram obtidas por meio de análises bicaracterísticas sob modelo animal. Verificou-se que as estimativas de herdabilidade foram moderadas para as características de CAR (0,22) e IMS (0,29). Observou-se que as estimativas de correlação genética foram próximos a zero para todas as Características, exceto entre CAR e AOL (-0,11). No entanto, considerando a população de fêmeas, houve um aumento na estimativa de correlação genética com CAR e IMS, apesar de ainda ser uma associação genética favorável de baixa magnitude (-0,30). Também houve um aumento na associação genética da AOL com o CAR (-0,21). Conclui-se, assim, que a seleção direta para o CAR e IMS não influenciará no ACAB, MAR e AOL de bovinos da raça Nelore. No entanto, essa seleção poderá gerar alguma resposta favorável em MAR e AOL em fêmeas Nelore.

Inheritance of seedlessness and the molecular characterization of the INO gene in Annonaceae / Herança da ausência de sementes e a caracterização molecular do gene INO em Annonaceae

Abstract The inheritance of the seedless fruit characteristic of Annona squamosa has not yet been explained. Molecular techniques may aid breeding programs, mainly in the assisted selection of the target gene. The INO gene may be related to seed development in these fruits. The objective of the present paper was to investigate the inheritance of seedlessness in the 'Brazilian seedless' sugar apple and INO gene conservation in Annona squamosa and Annona cherimola x Annona squamosa genotypes by assessing their homology with the INO database genes. The F1 generation was obtained by crossing the mutant 'Brazilian seedless' (male genitor) (P1) with the wild-type A. squamosa with seeds (M1 and M2, female genitors). The INO gene was studied in mutant and wild-type A. squamosa (P1, M1, M2 and M3) and in the Gefner atemoya (A. cherimola x A. squamosa) (M4) cultivar. The DNA was extracted from young leaves, and four sets of specific primers flanking the INO gene were amplified. The seedless characteristic was identified as stenospermatic in the fruits of parental P1, suggesting monogenic inheritance with complete dominance. High sequence similarity of the INO gene amplifications in the sugar apple accessions (M1, M2, M3) and the atemoya cultivar Gefner (M4) reinforces the hypothesis of their conservation.

Resumo A herança da característica de fruto sem sementes de Annona squamosa ainda não foi esclarecida. Técnicas moleculares podem auxiliar em programas de melhoramento, principalmente na seleção assistida do gene de interesse. O gene INO pode estar relacionado ao desenvolvimento da semente dessas frutas. O objetivo foi investigar a herança da ausência de sementes em Annona squamosa e a conservação do gene INO nos genótipos Annona squamosa e Annona cherimola x Annona squamosa avaliando sua homologia com banco de dados de genes INO. A geração F1 foi obtida pelo cruzamento do mutante 'Brazilian seedless' (genitor masculino) (P1) com o tipo selvagem com sementes (A. squamosa) (M1 e M2, genitores femininos). O gene INO foi estudado em A. squamosa, mutante e selvagem (P1, M1, M2 e M3) e na cultivar Gefner atemoya (A. cherimola x A. squamosa) (M4). O DNA foi extraído de folhas jovens, e quatro conjuntos de primers específicos flanqueando o gene INO foram amplificados. A característica sem sementes foi identificada como estenospermática nos frutos do parental P1, sugerindo herança monogênica com dominância completa. A alta similaridade de sequência das amplificações do gene INO nos acessos de pinha (M1, M2, M3) e na cultivar de atemóia Gefner (M4) reforça a hipótese de sua conservação.

Retrospective evaluation of canine anal sac carcinoma (260 cases) in Brazil: late detection and failures in lymph node evaluation / Avaliação retrospectiva do carcinoma de saco anal canino (260 casos) no Brasil: detecção tardia e falhas na avaliação dos linfonodos

Anal sac neoplasms are common in companion animals, and the epidemiological profile has been extensively described in international studies; however, national data are still lacking. Data on the Brazilian reality of anal sac carcinoma cases' diagnosis and treatment are also scarce. The purpose of this study was to retrospectively evaluate cases of canine anal sac carcinoma and assess the profile of involvement, tumor size, and lymphatic invasion at the time of diagnosis. Information was obtained from Vetpat laboratory database, from 260 cases spanning a 12-year period (2010-2021). In histopathological evaluation at the time of diagnosis, data on sex, age, and race were described, as well as tumor size and lymphatic invasion. The presence of metastasis was also assessed in cases where lymph nodes were sampled. Simple descriptive statistical analysis was used to evaluate the data. Adult and elderly, female, and mixed-breed animals were more involved, indicating differences from international studies that can be attributed to sociocultural factors. In terms of tumor size, it was observed that 93% of the cases had the largest diameter above 2.5cm. Only 7% of the cases had the largest diameter below 2.5cm, demonstrating the often late diagnosis and the importance of rectal palpation examination during the general physical assessment of canine patients, particularly at an advanced age. Regarding lymphatic invasion and affected lymph nodes, 50% of the cases had lymphatic invasion described in the histopathological examination. However, only 5% of the lymph nodes were sent along with the primary tumor, indicating the disease's aggressive behavior but with possible metastases underdiagnosed.

As neoplasias de saco anal possuem incidência importante nos animais de companhia, tendo o seu perfil epidemiológico de acometimento amplamente descrito em estudos internacionais, entretanto dados nacionais ainda são escassos. De modo semelhante, dados acerca da realidade brasileira, associados ao diagnóstico e conduta desses casos, são inexistentes. O objetivo do presente trabalho foi avaliar, de forma retrospectiva, os casos de carcinoma de saco anal canino, avaliando o perfil de acometimento, o tamanho tumoral e a invasão linfática no momento do diagnóstico. Foi obtido informações de 260 casos, respectivo a um período de 12 anos (2010-2021), proveniente do banco de dados do laboratório Vetpat. Foram descritos os dados acerca do sexo, idade e raça, bem como o tamanho tumoral e presença de invasão linfática em avaliação histopatológica no momento do diagnóstico. Os casos que cursavam com envio dos linfonodos também foram avaliados quanto a presença de metástase. Os dados foram avaliados mediante análise estatística descritiva simples. Foi encontrado um maior acometimento em animais adultos a idosos, do sexo feminino e sem raça definida, evidenciando diferenças em relação a estudos internacionais, que podem ser atribuídas a fatores socioculturais. Em relação ao tamanho tumoral, observou-se que 93% dos casos apresentavam o maior diâmetro acima de 2,5cm e apenas 7% dos casos apresentavam o maior diâmetro abaixo de 2,5cm, evidenciando o diagnostico frequentemente tardio, bem como a importância do exame de palpação retal durante a avaliação física geral de pacientes caninos, principalmente em idade avançada. Quanto a avaliação da invasão linfática e linfonodos acometidos, 50% dos casos cursavam com invasão linfática descrita em exame histopatológico, entretanto em apenas 5% dos casos os linfonodos foram enviados junto ao tumor primário, evidenciando o comportamento agressivo da doença, porém com metástases possivelmente subdiagnosticadas.

Caracterização pelvimétrica de matrizes caprinas anglonubianas / Pelvimetric characterization of anglo nubian goatdares / Caracterización pelvimétrica de cabras de raza anglonubia

Atualmente, poucos estudos se dedicam a pesquisas mais aprofundadas de aspectoselementares da pelvimetria, sendo estes, ainda mais escassos com a espécie caprina enestesentido, o presente estudo tem como objetivo caracterizar as medidas externas corpóreasdematrizes caprinas e de sua pelve. Foram utilizadas 30 matrizes caprinas da raça Anglonubianaem idade reprodutiva, manejadas em sistema intensivo, pertencentes ao setor decaprinocultura da Universidade Federal do Piauí (UFPI), Campus Professora CinobelinaElvas (CPCE), Bom Jesus, Piauí, Brasil. Durante todo o ciclo produtivo, foramrealizadasmensurações pélvicas das matrizes durante a gestação e no pós-parto, suas medidas corporaise peso vivo. As análises estatísticas foram realizadas pelo Statistical Analysis Softwareabrangendo análise discriminante, correlação, regressão e comparação de médias. Osresultados obtidos para as características de AC (altura de cernelha), CC(comprimentocorporal), PT (perímetro torácico), BII (biilíaca externa), BISQ (biisquiática externa) e ILIOQ(ilioisquiática externa) apresentaram um baixo coeficiente de variação (C.V), o que demonstrauma estabilidade do rebanho com relação a essas características, ocorrendo poucas variaçõesentre os animais. Não foram verificadas diferenças significativas para as medidas de Biilíacaea Ilioisquiática externas com relação ao estágio fisiológico. Já com relação a Biisquiática, foi observado um aumento durante a gestação. De acordo com os dados observados, nãoocorreram diferenças significativas entre as características avaliadas entre cabras primíparasemultíparas. A incorporação de bancos de dados com as medidas corporais e pélvicas de cabrasauxiliam no desenvolvimento de programas de melhoramento genético de diferentes raçascaprinas, reduzindo a ocorrência de eventos de distocia e /ou dificuldade ao parto de modogeral. As amostragens foram incorporadas em um banco de dados, que está sendo construídopara controle e análise genética dos animais do Colégio Técnico de BomJesus, Piauí. Asinformações de produção e reprodução do rebanho também estarão disponíveis nesse bancode dados.(AU)

Currently, few studies are dedicated to more in-depth research of elementary aspectsofpelvimetry, which are even scarcer with the goat species and in this sense, the present studyaims to characterize the external body measurements of goat matrices and their pelvis. ThirtyAnglonubian goats at reproductive age, managed in an intensive system, belonging tothegoat sector of the Federal University of Piauí (UFPI), Campus Professora Cinobelina Elvas (CPCE), Bom Jesus, Piauí, Brazil, were used. During the entire production cycle, pelvicmeasurements of the goats were performed during pregnancy and postpartum, their bodymeasurements and live weight. Statistical analyzes were performed by the Statistical AnalysisSoftware covering discriminant analysis, correlation, regression and comparison of means. The results obtained for the characteristics of AC (height at the withers), CC(bodylength), PT (chest circumference), BII (external biiliac), BISQ (external bischial) and ILIOQ(external ilioschiatic) showed a low coefficient of variation (C.V), which demonstrates a stabilityof theherd in relation to these characteristics, with little variation between animals. No significant differences were found for the external Biiliac and Ilioischiatic measurements in relationtothe physiological stage. Biischiatica, on the other hand, was observed to increase duringpregnancy. According to the observed data, there were no significant differences betweenthecharacteristics evaluated between primiparous and multiparous goats. The incorporationofdatabases with body and pelvic measurements of goats helps in the development of geneticimprovement programs for different goat breeds, reducing the occurrence of dystocia eventsand/or delivery difficulties in general. The samples were incorporated into a database, whichis being built for control and genetic analysis of the animals of the Colégio TécnicodeBomJesus, Piauí. Herd production and reproduction information will also be available inthisdatabase.(AU)

Actualmente, pocos estudios se dedican a la investigación más profunda de los aspectoselementales de la pelvimetría, que son aún más escasos con la especie caprina y, enestesentido, el presente estudio tiene como objetivo caracterizar las medidas corporales externasde las matrices caprinas y su pelvis. Se utilizaron 30 cabras anglonubias en edad reproductiva, manejadas en sistema intensivo, pertenecientes al sector caprino de la Universidad Federal dePiauí (UFPI), Campus Professora Cinobelina Elvas (CPCE), Bom Jesus, Piauí, Brasil. Durante todo el ciclo de producción se realizaron mediciones pélvicas de las cabras durantelagestación y posparto, sus medidas corporales y peso vivo. Las análisis estadísticasserealizaron mediante el software de análisis estadístico que abarca el análisis discriminante, lacorrelación, la regresión y la comparación de medias. Los resultados obtenidos paralascaracterísticas AC (altura a la cruz), CC (longitud corporal), PT (circunferencia torácica), BII(bilia externa), BISQ (bisquial externa) e ILIOQ (iliosquiática externa) mostraronunbajocoeficiente de variación (C.V), lo que demuestra una estabilidad del rebaño en relaciónaestascaracterísticas, con pocas variaciones entre animales. No hubo diferencias significativas paralas medidas externas Bilíaca e Ilioisquiática en relación al estadio fisiológico. Biischiatica, por otro lado, se observó que aumenta durante el embarazo. De acuerdo con los datosobservados, no hubo diferencias significativas entre las características evaluadas entre cabrasprimíparas y multíparas. La incorporación de bases de datos con medidas corporalesypélvicas de caprinos ayuda en el desarrollo de programas de mejoramiento genéticoparadiferentes razas caprinas, reduciendo la ocurrencia de eventos de distocia y/o dificultadesdeparto en general. Las muestras fueron incorporadas a una base de datos, que está siendoconstruida para el control y análisis genético de los animales del Colégio Técnico deBomJesus, Piauí. La información sobre producción y reproducción del rebaño tambiénestarádisponible en esta base de datos.(AU)