Functional diversity: a review on freshwater fish research

Functional diversity is an emergent approach in ecology that has been applied globally to better understand the relationships between organisms and the environment. However, assessing the functional diversity of freshwater fish is a challenge for scientists. Aiming to summarize the evolution of scientific knowledge on fish functional diversity, we performed a systematic review of the literature published from 1945 to 2021 using the Web of Science. Based on the 101 articles reviewed, we found that publications about functional diversity of fishes have increased over time, mainly in Neotropical, Indomalayan and Palearctic regions. Most studies were conducted in lotic ecosystems, especially to assess environmental impacts such as biological invasions and land use. Functional diversity has been assessed mainly by morphological traits that reflect feeding and locomotion dimensions. Functional richness was the most common index used in the studies. Our findings suggest that political neglect and lack of investments may hamper the research development in several places. The missing information about the functional traits of many species may limit the use of the functional approach. We also highlight the need for the incorporation of functional diversity in conservation programs once functional diversity is a key facet of biodiversity to maintain freshwater ecosystem functioning.

A diversidade funcional tem sido avaliada principalmente através de traços funcionais morfológicos que refletem as dimensões da alimentação e locomoção. A Riqueza Funcional foi a métrica mais comumente usada nos estudos. Esses resultados sugerem que a negligência política e a falta de investimentos podem dificultar o desenvolvimento de pesquisas em diversas regiões. A falta de informações sobre os traços funcionais de muitas espécies limita o uso da abordagem funcional. Destaca-se também a necessidade de incorporar a diversidade funcional em programas de conservação, uma vez que a diversidade funcional é uma faceta chave da biodiversidade para manter o funcionamento dos ecossistemas de água doce.

Genetic structure simulation for Hancornia speciosa populations in Northeast Brazil / Simulação da estrutura genética de populações de Hancornia speciosa no nordeste brasileiro

Mangaba tree is a fruit tree species whose natural populations are fragmented by anthropic actions. For this reason, studies assessing the impact of fragmentation on the diversity and genetic structure of these populations are required in order to establish suitable conservation strategies. In our study, we used data from analyzes through microsatellite markers in computer simulations to estimate the rates of migration and selfing of six mangaba populations. The studied populations are located in the northeastern states of Ceará, Pernambuco and Sergipe. We tested different selfing and migration rates and selected the combination that showed values of observed and expected heterozygosity closest to those previously obtained with microsatellite markers. According to our simulations, selfing and migration were moderate. This may have led to an increase in inbreeding and genetic drift, resulting in low genetic diversity. We recommend expanding the area and reducing disturbance to promote the occurrence of pollinators, which play an important role in increasing genetic diversity.

A mangabeira é uma espécie frutífera cujas populações naturais se encontram fragmentadas por ações antrópicas. Desse modo, são necessários estudos sobre a avaliação do impacto da fragmentação sobre a diversidade e estrutura genética dessas populações para o estabelecimento de estratégias de conservação adequadas. No presente estudo, foram utilizados dados de análises com marcadores microssatélites em simulações computacionais para estimar as taxas de migração e autofecundação de seis populações de mangaba. As populações estudadas estão localizadas nos estados nordestinos do Ceará, Pernambuco e Sergipe. Foram testadas diferentes taxas de autofecundação e migração, e selecionada a combinação que apresentou valores de heterozigosidade observada e esperada mais próximos dos obtidos com marcadores microssatélites. Com base nas simulações, a autofecundação foi de 0,3 e a taxa de migração variou de 0,5 a 0,6, valores que podem ter conduzido ao aumento da endogamia e deriva genética, resultando em baixa diversidade genética. Recomenda-se a expansão da área e a redução de perturbações para promover a ocorrência de polinizadores, que desempenham um papel importante no aumento da diversidade genética.

Temporal variation in composition, abundance and biomass of the fish fauna after impact on subtropical transitional water

Transitional waters are characterized by large variations in salinity, temperature, turbidity, among other factors, such as tidal cycle, wind action and rainfall, that are constantly changing over time. The distribution of biota in these environments is regulated by these natural variations and also by human activities, such as pollution, overexploitation of resources, acceleration of urbanization, suppression of habitats and changes in hydrological dynamics. The objective of this study was to analyze the temporal dynamics of the fish fauna of the Saco dos Limões Cove, state of Santa Catarina, Brazil, after the construction of a highway. Fish community was evaluated over five years by annual and monthly variation in species richness, abundance and biomass. A total of 17,993 individuals were collected, distributed in 33 families, 59 genera and 79 species. The evaluated years were similar to each other in species composition. Community descriptors varied over time but did not show seasonal trends. In all years, abundance was higher than biomass, indicating both the disturbance and the ecosystem function as a nursery in the studied area. This was corroborated by the large number of juveniles of dominant species (Genidens genidens, Eucinostomus gula and Eucinostomus argenteus).(AU)

Genetic diversity of Shepherd dog using pedigree analysis / Diversidade genética em cães da raça Pastor Alemão utilizando análise de pedigree

The German Shepherd dog breed is the most popular breed globally and in Brazil. The study of the population structure through pedigree information is an essential tool to understand the history of the Brazilian German Shepherd dog breed. This study evaluated the status of genetic diversity and population structure of the Brazilian German Shepherd dog breed. The pedigree included a total of 77,938 animals born between 1970 and 2014. The average generation interval in this population was 3.91 years. Considering the reference population, 2,183 founders were identified. Approximately 3% of the genetic diversity of the current population (2010-2014) was lost, most of which was due to genetic drift. The effective population size was relatively small, and the pedigree showed bottlenecks indicating a loss of genetic diversity in this breed. These results indicated the need to adopt measures against the excessive increase in inbreeding and monitor effective population size to minimize genetic diversity loss.

A raça Pastor Alemão é uma das raças mais populares no mundo e no Brasil. O estudo da estrutura populacional por meio de informações de pedigree é uma ferramenta essencial para o entendimento da história dessa raça no Brasil. Objetivou-se com o estudo avaliar o status da diversidade genética e da estrutura populacional de cães da raça Pastor Alemão. O pedigree incluiu um total de 77.938 animais nascidos entre 1970 e 2014. O intervalo médio de geração nesta população foi de 3,91 anos. Considerando a população de referência, foram identificados 2.183 fundadores. Cerca de 3% da diversidade genética da população atual (2010-2014) foi perdida, a maior parte devido à deriva genética. O tamanho efetivo da população foi relativamente pequeno e o pedigree apresentou gargalos indicando uma perda de diversidade genética nesta raça. Esses resultados indicam a necessidade de adoção de medidas contra o aumento excessivo da endogamia e do monitoramento do tamanho efetivo da população para minimizar a perda de diversidade genética.

Avian biodiversity assessment studies in a Neotropical wetland - the combination of sampling methods makes the difference

In studies of avian diversity, many different methods have been applied. Since methodological approaches may affect research results, the choice of a given methodology must be consistent with the scientific objectives. The aim of this study was to investigate how different methodologies with their intrinsic limitations help detect and monitor birds to evaluate how they complement each other in the survey of species. Three different assessment methods, mist nets, point counts, and autonomous acoustic recordings were used to serve this purpose in a study of different Pantanal habitats, such as savannas and forests. The point counts detected more species (126 species) than the two other methods autonomous acoustic recordings (113 species) and mist nets (79 species). We observed significant differences in the number of species detected by mist nets and the other two methods. Each survey method identified exclusive species. When comparing habitats, all three methods showed significant differences in bird species composition. Savannas were richer in bird species than forests, and replacement was the main driver responsible for the differences in beta diversity between the habitats. The three methodologies, when applied together, proved to be complementary in avian species detection.

Biodiversity of commercially important finfish species caught by mid-water and bottom trawls from two different coasts of Arabian Sea: Threats and conservation strategies / Biodiversidade de espécies de peixes comercialmente importantes capturadas por redes de arrasto de médio e fundo do Baluchistão e costas de Sindh do mar da Arábia no Paquistão: Ameaças e estratégias de conservação

Abstract This study was conducted to estimate the diversity and the occurrence of commercially important finfish species collected by twenty fish sampling site of Sindh and Baluchistan coasts of the Arabian Sea in Pakistan from January to December 2019. Additionally, physicochemical characteristics of seawater were analyzed from these selected sites and found to be within suitable ranges required for fish growth and survive. A total of 81287 fish individuals were collected and identified as 49 species belonging to 26 families in our study. The most diversified family was Sparidae (13 species) followed by Carangidae and Lutjanidae (4 species), Mullidae, Serranidae, Ariidae (3 species), and Sciaenidae (2 species). The remaining 20 families were represented by only one species. The values of Shannon diversity index calculated for the four selected habitats revealed that high fish diversity was reported at Sonmiani Coast (H'=1.81), while less at Ormara Coast (H'=0.23). Likewise, Evenness index (E) was high at Sonmiani Coast (E=0.50) and less fish diversity was reported at Ormara Coast (E=0.06). Reducing risks to threatened marine species in coastal habitats also requires conservation actions at multiple scales. Thus, it was concluded that our study could be valuable in providing the more information's regarding to the diversity of finfish species and their occurrence along the Pakistan Coast. Further, to better understand the effects, regular monitoring and conservation measures should be taken to mitigate the influence of anthropogenic activities and protect finfish diversity from further decline

Resumo Este estudo foi conduzido para estimar a diversidade e a ocorrência de espécies de peixes comercialmente importantes coletadas por vinte locais de amostragem de peixes nas costas de Sindh e Baluchistão do mar da Arábia, no Paquistão, de janeiro a dezembro de 2019. Além disso, as características físico-químicas da água do mar foram analisadas a partir desses peixes locais selecionados e considerados dentro dos intervalos adequados necessários para o crescimento e sobrevivência dos peixes. Um total de 8.1287 indivíduos de peixes foi coletado e identificado como 49 espécies pertencentes a 26 famílias em nosso estudo. A família mais diversificada foi Sparidae (13 espécies), seguida por Carangidae e Lutjanidae (4 espécies), Mullidae, Serranidae, Ariidae (3 espécies) e Sciaenidae (2 espécies). As 20 famílias restantes foram representadas por apenas uma espécie. Os valores do índice de diversidade de Shannon calculados para os quatro habitats selecionados revelaram que uma alta diversidade de peixes foi relatada na costa Sonmiani (H' = 1,81), enquanto menos na costa Ormara (H' = 0,23). Da mesma forma, o índice de regularidade (E) foi alto na costa de Sonmiani (E = 0,50) e menos diversidade de peixes foi relatada na costa de Ormara (E = 0,06). A redução dos riscos para as espécies marinhas ameaçadas em habitats costeiros também requer ações de conservação em várias escalas. Assim, concluiu-se que nosso estudo pode ser valioso para fornecer mais informações sobre a diversidade de espécies de peixes finos e sua ocorrência ao longo da costa do Paquistão. Além disso, para compreender melhor os efeitos, medidas regulares de monitoramento e conservação devem ser tomadas para mitigar a influência das atividades antropogênicas e proteger a diversidade de peixes finos de um declínio maior.

Ecomorphology and functional diversity of generalist and specialist bird assemblages in Amazonian whitesand ecosystem habitat patches / Ecomorfologia e diversidade funcional de assembleias de aves generalistas e especialistas em manchas de habitat de ecossistema de areia branca na Amazônia

Birds that inhabit white-sand ecosystems (WSE) in the Amazon are adapted to habitats distributed as isolated patches. These environments occur in sandy soils that are extremely poor in nutrients, have low floristic diversity and support bird assemblages restricted to WSE. We investigated whether bird species specialized in WSE have morphological or ecological traits that distinguish them from generalist birds that share the same habitat but are not restricted to WSE. We collected morphological and ecological data from 22 specialist and 102 generalist bird species from WSE and described their ecomorphological diversity using multivariate analyses and measures of functional diversity. Understory insectivorous species that move alone or in pairs, were the group with the most species among specialist birds from WSE. In contrast, canopy frugivorous species that form mono- or heterospecific groups were more frequent among generalist species. Specialist and generalist birds overlapped extensively in ecomorphological space, with specialists occupying a narrower space compared to generalists. Functional diversity, however, was not different between specialist and generalist species when controlling for the number of species within the communities. Further studies comparing the ecomorphological diversity of bird assemblages of other environments in the Amazon may highlight the ecological pressures leading to the functional diversity of specialist species in WSE observed in this study.(AU)

As aves que habitam os ecossistemas de areia branca (EAB) na Amazônia estão adaptadas a habitats distribuídos em manchas isoladas. Esses ambientes ocorrem em solos arenosos extremamente pobres em nutrientes, possuem baixa diversidade florística e suportam assembleias de aves restritas a EAB. Investigamos se espécies de aves especializadas em EAB possuem características morfológicas ou ecológicas que as distinguem de aves generalistas que compartilham o mesmo habitat, mas não estão restritas a EAB. Coletamos dados morfológicos e ecológicos de 22 espécies de aves especialistas e 102 generalistas de EAB, e descrevemos sua diversidade ecomorfológica usando análises multivariadas e medidas de diversidade funcional. Espécies insetívoras do sub-bosque que se movem solitárias ou em pares foram o grupo com maior número de espécies dentro das aves especialistas da EAB. Em contraste, espécies frugívoras de dossel que formam grupos mono ou heteroespecíficos foram mais frequentes entre as espécies generalistas. Aves especialistas e generalistas sobrepuseram-se extensivamente no espaço ecomorfológico, com especialistas ocupando um espaço mais estreito em comparação com generalistas. A diversidade funcional, no entanto, não foi diferente entre espécies especialistas e generalistas ao controlar o número de espécies dentro das comunidades. Estudos futuros comparando a diversidade ecomorfológica de assembleias de aves de outros ambientes na Amazônia podem destacar as pressões ecológicas que levam à diversidade funcional de espécies especialistas em EAB observadas neste estudo.(AU)

Biodiversity of commercially important finfish species caught by mid-water and bottom trawls from two different coasts of Arabian Sea: Threats and conservation strategies

Abstract This study was conducted to estimate the diversity and the occurrence of commercially important finfish species collected by twenty fish sampling site of Sindh and Baluchistan coasts of the Arabian Sea in Pakistan from January to December 2019. Additionally, physicochemical characteristics of seawater were analyzed from these selected sites and found to be within suitable ranges required for fish growth and survive. A total of 81287 fish individuals were collected and identified as 49 species belonging to 26 families in our study. The most diversified family was Sparidae (13 species) followed by Carangidae and Lutjanidae (4 species), Mullidae, Serranidae, Ariidae (3 species), and Sciaenidae (2 species). The remaining 20 families were represented by only one species. The values of Shannon diversity index calculated for the four selected habitats revealed that high fish diversity was reported at Sonmiani Coast (H'=1.81), while less at Ormara Coast (H'=0.23). Likewise, Evenness index (E) was high at Sonmiani Coast (E=0.50) and less fish diversity was reported at Ormara Coast (E=0.06). Reducing risks to threatened marine species in coastal habitats also requires conservation actions at multiple scales. Thus, it was concluded that our study could be valuable in providing the more informations regarding to the diversity of finfish species and their occurrence along the Pakistan Coast. Further, to better understand the effects, regular monitoring and conservation measures should be taken to mitigate the influence of anthropogenic activities and protect finfish diversity from further decline

Resumo Este estudo foi conduzido para estimar a diversidade e a ocorrência de espécies de peixes comercialmente importantes coletadas por vinte locais de amostragem de peixes nas costas de Sindh e Baluchistão do mar da Arábia, no Paquistão, de janeiro a dezembro de 2019. Além disso, as características físico-químicas da água do mar foram analisadas a partir desses peixes locais selecionados e considerados dentro dos intervalos adequados necessários para o crescimento e sobrevivência dos peixes. Um total de 8.1287 indivíduos de peixes foi coletado e identificado como 49 espécies pertencentes a 26 famílias em nosso estudo. A família mais diversificada foi Sparidae (13 espécies), seguida por Carangidae e Lutjanidae (4 espécies), Mullidae, Serranidae, Ariidae (3 espécies) e Sciaenidae (2 espécies). As 20 famílias restantes foram representadas por apenas uma espécie. Os valores do índice de diversidade de Shannon calculados para os quatro habitats selecionados revelaram que uma alta diversidade de peixes foi relatada na costa Sonmiani (H' = 1,81), enquanto menos na costa Ormara (H' = 0,23). Da mesma forma, o índice de regularidade (E) foi alto na costa de Sonmiani (E = 0,50) e menos diversidade de peixes foi relatada na costa de Ormara (E = 0,06). A redução dos riscos para as espécies marinhas ameaçadas em habitats costeiros também requer ações de conservação em várias escalas. Assim, concluiu-se que nosso estudo pode ser valioso para fornecer mais informações sobre a diversidade de espécies de peixes finos e sua ocorrência ao longo da costa do Paquistão. Além disso, para compreender melhor os efeitos, medidas regulares de monitoramento e conservação devem ser tomadas para mitigar a influência das atividades antropogênicas e proteger a diversidade de peixes finos de um declínio maior.

Molecular characterization of Astyanax species (Characiformes: Characidae) from the upper Paraguaçu River basin, a hydrographic system with high endemism

Molecular tools have been employed to improve the knowledge about freshwater Neotropical fishes. Such approaches supporting studies of groups including species complexes such as Astyanax, one of the most diversified and taxonomically complex genus of the family Characidae. Here, we employed species delimitation analyses in four Astyanax species described for the upper Paraguaçu River basin, a drainage within Northeastern Mata Atlântica freshwater ecoregion with high endemism. We implemented single and multilocus approaches based on two mitochondrial and one nuclear markers. Cytochrome c Oxidase I sequences previously available for Astyanax species were also added to our dataset. The single locus analyses showed A. epiagos, A. rupestris, and A. aff. rupestris as different Molecular Operational Taxonomic Units (MOTUs), while A. brucutu and A. lorien were grouped. However, the multilocus approach distinguished these two species and showed congruence for the remaining single locus results. Astyanax aff. rupestris was separated into two MOTUs using both approaches, highlighting the need for an integrative taxonomic revision including A. aff. rupestris. These findings contribute to a better understanding of the diversity of this fish group in the upper Paraguaçu, identifying hidden diversity and reinforcing the relevance of this hydrographic system as a notable hotspot for ichthyofauna biodiversity endemism.(AU)

Ferramentas moleculares têm sido empregadas para melhorar o conhecimento sobre os peixes Neotropicais. Tais abordagens apoiam estudos de grupos que incluem complexos de espécies, como Astyanax, um dos gêneros mais diversificados e taxonomicamente complexos dentro da família Characidae. Neste estudo, nós empregamos análises de delimitação de espécies em quatro espécies de Astyanax recentemente descritas da bacia do alto rio Paraguaçu, uma drenagem dentro da ecorregião Mata Atlântica Nordeste que apresenta alto endemismo. Nós realizamos abordagens de loco único e multilocos baseadas em dois marcadores mitocondriais e um nuclear. Sequências de Citocromo c Oxidase I anteriormente disponíveis para espécies de Astyanax foram adicionadas ao nosso conjunto de dados. As análises de loco único mostraram A. epiagos, A. rupestris e A. aff. rupestris como diferentes Unidades Taxonômicas Operacionais Moleculares (MOTUs), enquanto A. brucutu e A. lorien foram agrupadas. Entretanto, a abordagem multilocos distinguiu estas duas espécies e mostrou congruência com os demais resultados das análises de loco único. Astyanax aff. rupestris foi separada em duas MOTUs usando ambas as abordagens, sugerindo a necessidade de uma revisão taxonômica integrativa incluindo A. rupestris e ambas A. aff. rupestris. Esses achados contribuem para uma melhor compreensão da diversidade desse grupo de peixes na bacia do rio Paraguaçu, identificando diversidade oculta e reforçando a relevância desse sistema hidrográfico como um notável hotspot de endemismo da biodiversidade da ictiofauna.(AU)

Molecular Phylogenetics of Physa acuta (Pulmonata: Basommatophora): an invasive species in Central Punjab Pakistan / Molecular Phylogenetics of Physa acuta (Pulmonata: Basommatophora): uma espécie invasora no centro de Punjab, Paquistão

Physids belong to Class Gastropoda; belong to Phylum Mollusca and being bioindicators, intermediate hosts of parasites and pests hold a key position in the ecosystem. There are three species of Genus Physa i.e. P. fontinalis, Physa acuta and P. gyrina water bodies of Central Punjab and were characterized on the basis of molecular markers High level of genetic diversity was revealed by polymorphic RAPD, however SSR markers were not amplified. The multivariate analysis revealed polymorphism ranging from 9.09 percent to 50 percent among the three Physid species. Total number of 79 loci were observed for the three species under study and 24 loci were observed to be polymorphic. These RAPD fragment(s) can be developed into co dominant markers (SCAR) by cloning and can be further sequenced for the development of the Physa species specific markers to identify the introduced and native species in Pakistan.

Os físidos pertencem à classe Gastropoda; pertencem ao filo Mollusca e, sendo bioindicadores, hospedeiros intermediários de parasitas e pragas, ocupam uma posição-chave no ecossistema. Existem três espécies do gênero Physa, ou seja, P. fontinalis, Physa acuta e P. gyrina em corpos d’água do Punjab Central e foram caracterizadas com base em marcadores moleculares. Alto nível de diversidade genética foi revelado por RAPD polimórfico, no entanto os marcadores SSR não foram amplificados. A análise multivariada revelou polimorfismo variando de 9,09% a 50% entre as três espécies de Physid. Um número total de 79 loci foi observado para as três espécies em estudo e 24 loci foram observados como polimórficos. Esses fragmentos RAPD podem ser desenvolvidos em marcadores codominantes (SCAR) por clonagem e podem ser posteriormente sequenciados para o desenvolvimento de marcadores específicos da espécie Physa para identificar as espécies introduzidas e nativas no Paquistão.

Genetic diversity of Shepherd dog using pedigree analysis / Diversidade genética em cães da raça Pastor Alemão utilizando análise de pedigree

ABSTRACT: The German Shepherd dog breed is the most popular breed globally and in Brazil. The study of the population structure through pedigree information is an essential tool to understand the history of the Brazilian German Shepherd dog breed. This study evaluated the status of genetic diversity and population structure of the Brazilian German Shepherd dog breed. The pedigree included a total of 77,938 animals born between 1970 and 2014. The average generation interval in this population was 3.91 years. Considering the reference population, 2,183 founders were identified. Approximately 3% of the genetic diversity of the current population (2010-2014) was lost, most of which was due to genetic drift. The effective population size was relatively small, and the pedigree showed bottlenecks indicating a loss of genetic diversity in this breed. These results indicated the need to adopt measures against the excessive increase in inbreeding and monitor effective population size to minimize genetic diversity loss.

RESUMO: A raça Pastor Alemão é uma das raças mais populares no mundo e no Brasil. O estudo da estrutura populacional por meio de informações de pedigree é uma ferramenta essencial para o entendimento da história dessa raça no Brasil. Objetivou-se com o estudo avaliar o status da diversidade genética e da estrutura populacional de cães da raça Pastor Alemão. O pedigree incluiu um total de 77.938 animais nascidos entre 1970 e 2014. O intervalo médio de geração nesta população foi de 3,91 anos. Considerando a população de referência, foram identificados 2.183 fundadores. Cerca de 3% da diversidade genética da população atual (2010-2014) foi perdida, a maior parte devido à deriva genética. O tamanho efetivo da população foi relativamente pequeno e o pedigree apresentou gargalos indicando uma perda de diversidade genética nesta raça. Esses resultados indicam a necessidade de adoção de medidas contra o aumento excessivo da endogamia e do monitoramento do tamanho efetivo da população para minimizar a perda de diversidade genética.

Molecular Phylogenetics of Physa acuta (Pulmonata: Basommatophora): an invasive species in Central Punjab Pakistan / Molecular Phylogenetics of Physa acuta (Pulmonata: Basommatophora): uma espécie invasora no centro de Punjab, Paquistão

Physids belong to Class Gastropoda; belong to Phylum Mollusca and being bioindicators, intermediate hosts of parasites and pests hold a key position in the ecosystem. There are three species of Genus Physa i.e. P. fontinalis, Physa acuta and P. gyrina water bodies of Central Punjab and were characterized on the basis of molecular markers High level of genetic diversity was revealed by polymorphic RAPD, however SSR markers were not amplified. The multivariate analysis revealed polymorphism ranging from 9.09 percent to 50 percent among the three Physid species. Total number of 79 loci were observed for the three species under study and 24 loci were observed to be polymorphic. These RAPD fragment(s) can be developed into co dominant markers (SCAR) by cloning and can be further sequenced for the development of the Physa species specific markers to identify the introduced and native species in Pakistan.(AU)

Os físidos pertencem à classe Gastropoda; pertencem ao filo Mollusca e, sendo bioindicadores, hospedeiros intermediários de parasitas e pragas, ocupam uma posição-chave no ecossistema. Existem três espécies do gênero Physa, ou seja, P. fontinalis, Physa acuta e P. gyrina em corpos dágua do Punjab Central e foram caracterizadas com base em marcadores moleculares. Alto nível de diversidade genética foi revelado por RAPD polimórfico, no entanto os marcadores SSR não foram amplificados. A análise multivariada revelou polimorfismo variando de 9,09% a 50% entre as três espécies de Physid. Um número total de 79 loci foi observado para as três espécies em estudo e 24 loci foram observados como polimórficos. Esses fragmentos RAPD podem ser desenvolvidos em marcadores codominantes (SCAR) por clonagem e podem ser posteriormente sequenciados para o desenvolvimento de marcadores específicos da espécie Physa para identificar as espécies introduzidas e nativas no Paquistão.(AU)

Genetic structure simulation for Hancornia speciosa populations in Northeast Brazil / Simulação da estrutura genética de populações de Hancornia speciosa no nordeste brasileiro

ABSTRACT: Mangaba tree is a fruit tree species whose natural populations are fragmented by anthropic actions. For this reason, studies assessing the impact of fragmentation on the diversity and genetic structure of these populations are required in order to establish suitable conservation strategies. In our study, we used data from analyzes through microsatellite markers in computer simulations to estimate the rates of migration and selfing of six mangaba populations. The studied populations are located in the northeastern states of Ceará, Pernambuco and Sergipe. We tested different selfing and migration rates and selected the combination that showed values of observed and expected heterozygosity closest to those previously obtained with microsatellite markers. According to our simulations, selfing and migration were moderate. This may have led to an increase in inbreeding and genetic drift, resulting in low genetic diversity. We recommend expanding the area and reducing disturbance to promote the occurrence of pollinators, which play an important role in increasing genetic diversity.

RESUMO: A mangabeira é uma espécie frutífera cujas populações naturais se encontram fragmentadas por ações antrópicas. Desse modo, são necessários estudos sobre a avaliação do impacto da fragmentação sobre a diversidade e estrutura genética dessas populações para o estabelecimento de estratégias de conservação adequadas. No presente estudo, foram utilizados dados de análises com marcadores microssatélites em simulações computacionais para estimar as taxas de migração e autofecundação de seis populações de mangaba. As populações estudadas estão localizadas nos estados nordestinos do Ceará, Pernambuco e Sergipe. Foram testadas diferentes taxas de autofecundação e migração, e selecionada a combinação que apresentou valores de heterozigosidade observada e esperada mais próximos dos obtidos com marcadores microssatélites. Com base nas simulações, a autofecundação foi de 0,3 e a taxa de migração variou de 0,5 a 0,6, valores que podem ter conduzido ao aumento da endogamia e deriva genética, resultando em baixa diversidade genética. Recomenda-se a expansão da área e a redução de perturbações para promover a ocorrência de polinizadores, que desempenham um papel importante no aumento da diversidade genética.

Initial performance and genetic diversity of coffee trees cultivated under contrasting altitude conditions

This work evaluated the initial performance and genetic diversity of Coffea canephora genotypes cultivated in environments at contrasting altitudes. Fourteen morphophysiological traits and seven descriptors of the genus Coffea spp. of coffee trees cultivated at altitudes of 140 m and 700 m were evaluated. The design used was Federer's augmented block in a 2 × 112 factorial scheme with six blocks. The first factor was the two environments, and the second was the 112 genotypes, with eight common treatments, being five conilon coffee clones and three arabica coffee cultivars. The data were analyzed by the method of REML/BLUP and genetic correlation method. Genetic diversity was evaluated by estimating the distance matrix, applying the Gower methodology followed by the clustering method by Tocher and UPGMA. The phenotypic means were higher in the environment at an altitude of 700 m, except for plant height, number of leaves, and canopy height (CH). Genotypic effects were significant for most traits except for leaf width, CH, unit leaf area, and total leaf area. A wide genetic diversity was verified, with distances varying from 0.037 to 0.593 for the pairs of genotypes 26 × 93 and T7 × 76, respectively. Most of the traits studied showed high genotypic correlation with the environment and expressive genetic correlation between the evaluated traits thereby demonstrating the possibility of indirect selection. There is an adaptation of conilon coffee genotypes to high altitudes and the possibility of developing a specific cultivar for the southern state of Espírito Santo.

Identification of terrestrial gastropods families found in district Swat, Pakistan / Identificação de famílias de gastropódeos terrestres encontradas no distrito Swat, Paquistão

Very little is known about the malacofauna in district Swat of Khyber Pakhtunkhwa province, situated in the Northern part of Pakistan. The Swat valley possesses a variety of suitable environmental conditions, providing different types of habitats for both flora and fauna. Taken into consideration these points, the present study was conducted to explore the terrestrial snails diversity in agricultural and non-agricultural fields in the lower Swat valley. A total of 417 shells were collected from three sites: Kokarai, Kanju Township, and Deolai. Based on conchological features, three families: Bradybaenidae, Hygromiidae, and Zonitidae were identified using different terrestrial snail keys. In Kokarai and Deolai, shells of members of all the above-mentioned families were found from agricultural fields. In Kanju Township, shells of members of the family Bradybaenidae and Zonitidae were found. From these findings, it was concluded that district Swat possesses a significant malacofauna which was unexplored before and aided more to the existing literature on malacofauna. It also supports the idea that the agroecosystem is rich in species diversity. Further in-depth and extensive study is recommended to be carried out for a detailed taxonomy of the described terrestrial gastropod families.

Muito pouco se sabe sobre a malacofauna no distrito de Swat, na província de Khyber Pakhtunkhwa, situada na parte norte do Paquistão. O vale do Swat possui uma variedade de condições ambientais adequadas, proporcionando diferentes tipos de habitats para a flora e a fauna. Levando em consideração esses pontos, o presente estudo foi conduzido para explorar a diversidade dos caracóis terrestres em campos agrícolas e não agrícolas no vale inferior de Swat. Um total de 417 conchas foram coletadas em três locais: Kokarai, Kanju Township e Deolai. Com base em características concológicas, três famílias: Bradybaenidae, Hygromiidae e Zonitidae foram identificadas usando diferentes chaves de caramujos terrestres. Em Kokarai e Deolai, conchas de membros de todas as famílias mencionadas acima foram encontradas em campos agrícolas. No município de Kanju, foram encontradas conchas de membros da família Bradybaenidae e Zonitidae. A partir dessas constatações, concluiu-se que o distrito de Swat possui uma malacofauna significativa que antes era inexplorada e ajudava mais a literatura existente sobre a malacofauna. Também apoia a ideia de que o agroecossistema é rico em diversidade de espécies. Recomenda-se a realização de um estudo mais aprofundado e extenso para uma taxonomia detalhada das famílias de gastrópodes terrestres descritas.

Diversity of avian species, their ecosystems and climate conditions in two zones of High Atlas (central Morocco) for ecotouristic purposes

The analysis of avian diversity and their natural ecosystems at a regional scale is the first step to understanding and classifying a specific region's ecological importance and, therefore, adopting sustainable economic activities and implementing suitable conservation measures. This study investigated the avian richness and natural ecosystems in Eastern and central High Atlas between 2015 and 2021. Transects and point-count methods were used to identify and estimate populations of birds and to delimit the nature of ecosystems. A total of 175 bird species among resident-breeders, migrantbreeders, migrant-winterers, and accidental-visitors were documented. These birds belong to 19 orders and are grouped into 51 families. Among recorded birds, 20 species were categorized as species of ectouristic interest due to their roles in birdwatching, hunting, racing sports, and trade activities. These species were observed in natural and human-made ecosystems, with the majority in wetlands. The abundance of a wide range of ecosystems and various bioclimatic stages is suggested to be behind the avian richness of these mountainous areas. Finally, these natural landscapes and their avian richness could be used for ecotouristic purposes. Visitors could profit from the view of landscapes and observation of the most iconic and rare animal species, which is suggested to increase the income for local populations and ensure the sustainable use of natural resources.

Rhizosphere bacterial and fungal communities of healthy and wilted pepper (Capsicum annuum L.) in an organic farming system / Comunidades bacterianas e fúngicas da rizosfera de pimentão sadio e murcho(Capsicum annuum L.) em sistema de cultivo orgânico

ABSTRACT: Rhizosphere microorganisms play an important role in the growth and health of plants. Around the world, diverse soil-borne pathogens attack Capsicum annuum causing significant damage and economic losses. This study determined whether the diversity and composition of microbial communities in the rhizosphere soil of C. annuum plants is significantly changed by wilt disease. We used the 16S rRNA gene for bacteria and the internal transcribed spacer region for fungi to characterize the rhizosphere microbiomes of healthy and wilted plants. The most abundant bacterial phyla were Proteobacteria and Gemmatimonadetes, while the most abundant fungal phyla were Ascomycota and Mucoromycota. The bacterial α-diversity did not show significant differences in richness and diversity, but did show a significant difference in evenness and dominance of species. Rare taxa were present in both healthy and wilted conditions with relative abundances < 1%. In the fungi, all evaluated estimators showed a significant reduction in the wilted condition. The β-diversity showed significant differences in the structure of bacterial and fungal communities, which were segregated according to plant health conditions. The same occurred when comparing the alpha and beta diversity of this study based on organic agriculture with that of other studies based on conventional agriculture. We observed a significant difference with estimators analyzed by segregating rhizosphere communities depending on the farming method used. Finally, the differential abundance analysis did not show significant results in the bacterial communities; however, in the fungal communities, Fusarium, Thanatephorus, Rhizopus, Curvularia, Cladosporium, and Alternaria were more abundant in the rhizosphere of wilted than healthy plants. Species from these genera have been previously reported as phytopathogens of several plants, including C. annuum.

RESUMO: Microrganismos na rizosfera desempenham um papel importante no crescimento e saúde das plantas. Em todo o mundo, vários patógenos do solo atacam o Capsicum annuum causando danos significativos e perdas econômicas. Este estudo teve como objetivo determinar se a diversidade e composição das comunidades microbianas no solo da rizosfera de plantas de C. annuum é alterada significativamente pela murcha. Usamos o gene 16S rRNA para bactérias e a região espaçadora transcrita interna para fungos para caracterizar os microbiomas da rizosfera de plantas saudáveis e plantas com murcha. Os filos bacterianos mais abundantes foram Proteobacteria e Gemmatimonadetes, enquanto os filos fúngicos foram Ascomycota e Mucoromycota. A diversidade alfa bacteriana não mostrou diferenças significativas na riqueza e diversidade, mas mostrou uma diferença significativa na uniformidade e dominância das espécies. Táxons raros estavam presentes em condições saudáveis e murchas com abundância relativa < 1%. Em fungos, todos os estimadores avaliados apresentaram redução significativa na condição de murcha. A diversidade beta apresentou diferenças significativas na estrutura das comunidades bacterianas e fúngicas, que foram segregadas de acordo com as condições fitossanitárias. O mesmo aconteceu ao comparar a diversidade alfa e beta deste estudo baseado na agricultura orgânica com a de outros estudos baseados na agricultura convencional. Uma diferença significativa foi observada com os estimadores analisados segregando as comunidades da rizosfera dependendo do método de cultivo utilizado. Por fim, a análise de abundância diferencial não apresentou resultados significativos nas comunidades bacterianas; entretanto, nas comunidades fúngicas, os gêneros Fusarium, Thanatephorus, Rhizopus, Curvularia, Cladosporium e Alternaria foram mais abundantes na rizosfera de plantas murchas do que saudáveis. Várias espécies desses gêneros foram previamente relatadas como fitopatógenos de várias plantas, incluindo C. annuum.

Identification of terrestrial gastropods families found in district Swat, Pakistan / Identificação de famílias de gastropódeos terrestres encontradas no distrito Swat, Paquistão

Very little is known about the malacofauna in district Swat of Khyber Pakhtunkhwa province, situated in the Northern part of Pakistan. The Swat valley possesses a variety of suitable environmental conditions, providing different types of habitats for both flora and fauna. Taken into consideration these points, the present study was conducted to explore the terrestrial snails diversity in agricultural and non-agricultural fields in the lower Swat valley. A total of 417 shells were collected from three sites: Kokarai, Kanju Township, and Deolai. Based on conchological features, three families: Bradybaenidae, Hygromiidae, and Zonitidae were identified using different terrestrial snail keys. In Kokarai and Deolai, shells of members of all the above-mentioned families were found from agricultural fields. In Kanju Township, shells of members of the family Bradybaenidae and Zonitidae were found. From these findings, it was concluded that district Swat possesses a significant malacofauna which was unexplored before and aided more to the existing literature on malacofauna. It also supports the idea that the agroecosystem is rich in species diversity. Further in-depth and extensive study is recommended to be carried out for a detailed taxonomy of the described terrestrial gastropod families.(AU)

Muito pouco se sabe sobre a malacofauna no distrito de Swat, na província de Khyber Pakhtunkhwa, situada na parte norte do Paquistão. O vale do Swat possui uma variedade de condições ambientais adequadas, proporcionando diferentes tipos de habitats para a flora e a fauna. Levando em consideração esses pontos, o presente estudo foi conduzido para explorar a diversidade dos caracóis terrestres em campos agrícolas e não agrícolas no vale inferior de Swat. Um total de 417 conchas foram coletadas em três locais: Kokarai, Kanju Township e Deolai. Com base em características concológicas, três famílias: Bradybaenidae, Hygromiidae e Zonitidae foram identificadas usando diferentes chaves de caramujos terrestres. Em Kokarai e Deolai, conchas de membros de todas as famílias mencionadas acima foram encontradas em campos agrícolas. No município de Kanju, foram encontradas conchas de membros da família Bradybaenidae e Zonitidae. A partir dessas constatações, concluiu-se que o distrito de Swat possui uma malacofauna significativa que antes era inexplorada e ajudava mais a literatura existente sobre a malacofauna. Também apoia a ideia de que o agroecossistema é rico em diversidade de espécies. Recomenda-se a realização de um estudo mais aprofundado e extenso para uma taxonomia detalhada das famílias de gastrópodes terrestres descritas.(AU)

Phenotypic characteristics and genetic diversity of new broccoli (Brassica oleracea var. italica Plenck) varieties in China

Due to its high nutritional value, broccoli (Brassica oleracea var. italica Plenck) is one of the most popular vegetables worldwide. This study assessed 36 phenotypic characteristics of 111 broccoli varieties to understand the phenotypic diversity of new broccoli varieties and improve their breeding speed with advantages and characteristics in China, including 108 new varieties and three varieties of common knowledge. The genetic diversity, the principal component, and the cluster of phenotypic characteristics of broccoli varieties were further investigated. The results showed that the coefficients of variation of 36 characteristics ranged between 11.18 % and 94.99 %, with their diversity index between 0.26 and 1.82. The 111 broccoli varieties were further classified into eight groups, primarily attributed to the differences in phenotypic characteristics, including curd weight, main stem thickness, plant development degree, plant height, and anthocyanin coloration. The cumulative contribution rate of the first five principal components reached 81.186 %, corresponding to 12 representative phenotypic traits. The analysis indicated that the phenotypic characteristics of broccoli were rich in diversity, especially for several characteristics appreciated by the market, such as weight, curd firmness, and anthocyanin coloration. This study revealed the basic information on the genetic diversity of new broccoli varieties in China from 2017 to 2019 and provided potential breeding strategies for broccoli to meet diverse market demands.

Amphibian Diversity: Where everything starts to flood, Cáceres Municipality, North Pantanal, Central­West Brazil

Faunal inventories contribute to our understanding of regional diversity, and are fundamental for policy and de-cision-making regarding the management and conservation of large natural areas. This study aimed to inventory and com-pile information on amphibian species occurring in the North Pantanal region, in the municipal limits of Cáceres, Mato Grosso, Brazil. We used three methods to inventory amphibian species: (1) fieldwork, (2) analysis of specimens deposited in scientif-ic collections, and (3) literature reviews. We registered 49 amphibian species in Cáceres. Of them, 48 species belonged to the Anura order and were distributed across eight families and 20 genera, and one species belonged to the Gymnophiona order (Siphonops paulensis). The families Leptodactylidae (20 spp.) and Hylidae (17 spp.) were dominant in terms of richness, ac-counting for 75.5% of all species found in Cáceres. The remaining families had between four and one species each. The mu-nicipality is strongly influenced by non-forested formations (e.g., the Cerrado and Pantanal) and presents a high species rich-ness for a non-forested location in Brazil. Our findings highlight Cáceres as one of the richest areas in amphibian species in the North Pantanal region, expanding our knowledge regarding frog diversity. This study provides a foundation for future conser-vation strategies and additional assessments of amphibian species in light of potential population declines and other emerg-ing threats.(AU)