Resumo
Efficiency of data transformation strategies is evaluated to correct heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies. Four data structures of bovine weaning weights were simulated: herds with and without heterogeneity for means and variances, and herds with and without genetic connectedness. In the genetic evaluations, data were used in the original scale and transformed (Logarithmic, Square root, standardization and ratio by phenotypic standard deviation). The evaluated data transformation strategies were not efficient in eliminating the negative effects of heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies.
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Efficiency of data transformation strategies is evaluated to correct heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies. Four data structures of bovine weaning weights were simulated: herds with and without heterogeneity for means and variances, and herds with and without genetic connectedness. In the genetic evaluations, data were used in the original scale and transformed (Logarithmic, Square root, standardization and ratio by phenotypic standard deviation). The evaluated data transformation strategies were not efficient in eliminating the negative effects of heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies.
O objetivo deste estudo foi avaliar a eficiência de estratégias de transformação de dados para correção da heterogeneidade entre rebanhos na avaliação genética de touros, vacas e progênies. Quatro estruturas de dados relativos a peso à desmama de bovinos foram simuladas: rebanhos com e sem heterogeneidade para médias e variâncias, e rebanhos com e sem conexidade genética. Nas avaliações genéticas, utilizaram-se dados na escala original e transformados (Logarítmica, Raiz quadrada, Padronização e Razão pelo desvio-padrão fenotípico). As estratégias de transformação de dados avaliadas não foram eficientes para eliminar os efeitos negativos da heterogeneidade entre rebanhos sobre a avaliação genética de touros, vacas e progênies.
Assuntos
Animais , Bovinos , Desmame , Pesos e Medidas , Bovinos/genética , GenômicaResumo
O controle das etapas do processo reprodutivo mostra-se importante para a eficiência da cadeia produtiva da ovinocultura, principalmente quando desenvolvidas simultaneamente. Isso significa que em vez de se considerar a seleção dos animais como um primeiro passo e decidir sobre a alocação de companheiro como uma segunda etapa, ambas as atividades devem ser acomodados na Seleção de Acasalamentos. Esta pesquisa investigou a aplicação da Contribuição Genética Ótima e da Seleção de Acasalamentos com diferentes componentes da Função Objetivo, como estratégia de ganho genético na seleção de ovinos Santa Inês. Um algoritmo de Evolução Diferencial foi implementado para otimização combinatória. As análises foram realizadas com auxílio dos softwares DEforOC e DEforMS, para definições da Contribuição Genética Ótima e Seleção de Acasalamentos, respectivamente. No Capítulo I, objetivou-se avaliar diferentes Estratégias de seleção pela Contribuição Genética Ótima, em termos de ganho genético com restrição sobre a coancestria, para característica de desempenho ponderal. Observou-se que a seleção de ovinos pela Contribuição Genética Ótima oferece diferentes níveis de ganho genético atingível a partir de restrições sobre a coancestria, contribuindo para sua redução a níveis controláveis nos rebanhos. Além disso, é possível minimizar a coancestria, ou restringi-la em um valor pré-definido e maximizar o ganho genético simultaneamente com o uso da Contribuição Genética Ótima. Com o desenvolvimento do Capítulo II, objetivou-se investigar os efeitos da otimização de cinco componentes em uma Função para Seleção de Acasalamentos comparando a diferentes situações ideais, otimizadas individualmente. A solução ótima também foi obtida no sentido global. A Função Objetivo que considera somente a otimização da coancestria para Seleção de Acasalamentos não proporcionou incrementos na conectabilidade dos rebanhos. A adoção da Seleção de Acasalamentos exerce impacto sobre os valores genéticos, coancestria, endogamia da futura progênie, variação na progênie e conectabilidade entre os rebanhos, devendo estes componentes serem considerados na análise. Destaca-se que a Seleção de Acasalamentos pode ser utilizada para seleção de reprodutores ovinos Santa Inês e oferece diferentes cenários do ganho genético a partir de restrições de interesse nos componentes da Função Objetivo. Contudo, foi constatada a eficiência do uso dos métodos de Contribuição Genética Ótima e Seleção de Acasalamentos para garantir ganho genético com controle da endogamia nos rebanhos avaliados.
The control of the phases of the reproduction process is shown to be important for efficient chain production of sheep breeding, especially when performed simultaneously. This means that instead of considering the selection of animals as a first step and decide on the allocation mate as a second step, two situations must be accommodated in the Mate Selection. This research investigated the application of Optimum Contrinution and Mate Selection with different components of the Objective Function as genetic gain strategy in the selection of Santa Ines sheep. A Differential Evolution Algorithm was implemented to combinatorial optimization. Analyses were performed using the DEforOC and DEforMS softwares, settings for Optimum Contribution and Mate Selection, respectively. In Chapter I, we aimed to evaluate different selection strategies for Optimum Contribution in terms of genetic gain with restriction coancestry for performance characteristic. It was observed that the selection of sheep by Optimum Contribution offers different levels of genetic gain reached from restrictions on coancestry, contributing to reduce it to acceptable levels in herds. In addition, it can minimize the coancestry, or limited to a predefined value and maximize genetic gain while using the Optimum Contribution. With the development of Chapter II aimed to investigate the effects of five components optimization on a function for Mate Selection comparing different ideal situations, optimized individually. The optimal solution was obtained in the global sense. The Objective Function that considers only the optimization of coancestry for Mate Selection did not provide increases in connectedness herds. The adoption of Mate Selection impacts on genetic values, coancestry, inbreeding of future offspring, variation in progeny and connectedness among the flocks, and these components are considered in the analysis. It is noteworthy that the Mate Selection can be used for selecting breeding Santa Ines sheep and offers different scenarios of genetic gain from restrictions of interest in the components of Objective Function. However, the efficiency of the use of the methods of Optimum Contribution and Mate Selection was verified to ensure genetic gain with control of inbreeding in the evaluated herd.
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Efficiency of data transformation strategies is evaluated to correct heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies. Four data structures of bovine weaning weights were simulated: herds with and without heterogeneity for means and variances, and herds with and without genetic connectedness. In the genetic evaluations, data were used in the original scale and transformed (Logarithmic, Square root, standardization and ratio by phenotypic standard deviation). The evaluated data transformation strategies were not efficient in eliminating the negative effects of heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies.
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Efficiency of data transformation strategies is evaluated to correct heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies. Four data structures of bovine weaning weights were simulated: herds with and without heterogeneity for means and variances, and herds with and without genetic connectedness. In the genetic evaluations, data were used in the original scale and transformed (Logarithmic, Square root, standardization and ratio by phenotypic standard deviation). The evaluated data transformation strategies were not efficient in eliminating the negative effects of heterogeneity among cattle in the genetic evaluation of bulls, cows and progenies.
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Data on preweanning gain (GNDa) of Pampiano-Braford animals raised in Rio Grande do sul were analyzed to verify the influence of individual (HI) and maternal (HM) heterosis in GNDa, and to quantify it. Data were adjusted for dam age (IV), julian birth date (DJN)and calf age at weaning,(IT). However, exploratory analysis have suggested that the adjustment factors for IV, DJN, and IT are not doing this adjustment correctly (P 0.01). Because of the structure and connectedness of the major data set, the analysis was done in two different ways. In the first phase, HI and HM were estimated simultaneously, in file 2, compose of 4186 animals, and the values obtained were 31.91 and 33.53kg, respectively. In the second phase, HI was estimated in a subset of file 2 (subset 1) compose of 1507 animals with maternal heterozigosis 0.0000; HM was estimated in subset 2 of file 2 with 2777 animals with individual heterozigozis 0.5000. The values found were 13.79 and 34.08kg, respectively. All the values found for heterosis on GNDa were significant (P 0.01), and the relation between heterosis and heterozigosis for this characteristic was linear (P 0.01). It was show that the Hereford animals, in this study, had greater genetic additive values than crossbreeds, but this difference was not sufficient to supress the effects of heterosis on GNDa. In comparison with the values used in GenSys Method, the HI and HM values, obtained in this study produced a change in the ranking of calves at preweaning, but the number of animals chosen in common by the two methods did not differ much. The cows with 1/2 breed composition had the best performance on GNDa, while the calves with maximum heterosis (breed composition 1/2) were excelled by those 3/8, when HM was included in the performance, emphasizing the importance of HM on GNDa.
Foram analisados dados de ganho de peso do nascimento ao desmame (GNDa) de animais Pampiano-Braford (cruzamento de Nelore X Hereford) criados no Rio Grande do Sul com a finalidade de verificar a influência da heterose individual (HI) e materna (HM) sobre o GNDa e quantificá-la. Os dados foram pré-ajustados para idade da vaca (IV), data juliana de nascimento (DJN) e idade do terneiro ao desmame (IT). Entretanto, análises exploratórias sugeriram que as pré-correções para IV, DJN e IT não estão ajustando corretamente os dados (P 0,01) no período pré-desmame. Em função da estrutura e conexidade do conjunto de dados, as análises foram realizadas de duas maneiras distintas. Em uma primeira etapa, estimou-se simultaneamente HI e HM a partir de um arquivo contendo 4186 animais (arquivo 2), obtendo-se valores de 31,91 e 33,53kg, respectivamente. Na segunda etapa, estimou-se HI a partir de um subconjunto do arquivo 2 (subconjunto 1) com 1507 registros com heterozigose materna 0,0000 e HM de outro subconjunto do arquivo 2 (subconjunto 2) com 2777 registros com heterozigose materna individual 0.5000; os valores estimados foram 13,79 e 34,08kg, respectivamente. Todos os valores de heterose sobre o GNDa encontrados foram significativos (P 0,01), e a relação entre heterose e heterozigose para esta característica apresentou um comportamento linear (P 0,01), considerando-se que o cruzamento estudado foi somente entre uma raça taurina e uma zebuína. Verificou-se que neste trabalho, os animais Hereford possuíam valor genético aditivo superior ao dos cruzados, todavia o mesmo não foi suficiente para contrabalançar os efeitos da heterose sobre o GNDa. Na comparação com os valores utilizados pelo Método GenSys, os valores de HI e HM, obtidos no presente trabalho, produziram diferenças na ordem de classificação de produtos ao desmame, mas o número de animais selecionados em comum pelos dois métodos não sofreu grandes mudanças. As vacas com composição racial 1/2 tiveram o melhor desempenho no GNDa, enquanto os terneiros com heterozigose individual máxima (composição racial 1/2) foram superados pelos 3/8 (filhos de vacas 1/2), quando se inclui a HM no desempenho dos mesmos, salientando a importância da HM sobre o GNDa.
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Data on preweanning gain (GNDa) of Pampiano-Braford animals raised in Rio Grande do sul were analyzed to verify the influence of individual (HI) and maternal (HM) heterosis in GNDa, and to quantify it. Data were adjusted for dam age (IV), julian birth date (DJN)and calf age at weaning,(IT). However, exploratory analysis have suggested that the adjustment factors for IV, DJN, and IT are not doing this adjustment correctly (P 0.01). Because of the structure and connectedness of the major data set, the analysis was done in two different ways. In the first phase, HI and HM were estimated simultaneously, in file 2, compose of 4186 animals, and the values obtained were 31.91 and 33.53kg, respectively. In the second phase, HI was estimated in a subset of file 2 (subset 1) compose of 1507 animals with maternal heterozigosis 0.0000; HM was estimated in subset 2 of file 2 with 2777 animals with individual heterozigozis 0.5000. The values found were 13.79 and 34.08kg, respectively. All the values found for heterosis on GNDa were significant (P 0.01), and the relation between heterosis and heterozigosis for this characteristic was linear (P 0.01). It was show that the Hereford animals, in this study, had greater genetic additive values than crossbreeds, but this difference was not sufficient to supress the effects of heterosis on GNDa. In comparison with the values used in GenSys Method, the HI and HM values, obtained in this study produced a change in the ranking of calves at preweaning, but the number of animals chosen in common by the two methods did not differ much. The cows with 1/2 breed composition had the best performance on GNDa, while the calves with maximum heterosis (breed composition 1/2) were excelled by those 3/8, when HM was included in the performance, emphasizing the importance of HM on GNDa.
Foram analisados dados de ganho de peso do nascimento ao desmame (GNDa) de animais Pampiano-Braford (cruzamento de Nelore X Hereford) criados no Rio Grande do Sul com a finalidade de verificar a influência da heterose individual (HI) e materna (HM) sobre o GNDa e quantificá-la. Os dados foram pré-ajustados para idade da vaca (IV), data juliana de nascimento (DJN) e idade do terneiro ao desmame (IT). Entretanto, análises exploratórias sugeriram que as pré-correções para IV, DJN e IT não estão ajustando corretamente os dados (P 0,01) no período pré-desmame. Em função da estrutura e conexidade do conjunto de dados, as análises foram realizadas de duas maneiras distintas. Em uma primeira etapa, estimou-se simultaneamente HI e HM a partir de um arquivo contendo 4186 animais (arquivo 2), obtendo-se valores de 31,91 e 33,53kg, respectivamente. Na segunda etapa, estimou-se HI a partir de um subconjunto do arquivo 2 (subconjunto 1) com 1507 registros com heterozigose materna 0,0000 e HM de outro subconjunto do arquivo 2 (subconjunto 2) com 2777 registros com heterozigose materna individual 0.5000; os valores estimados foram 13,79 e 34,08kg, respectivamente. Todos os valores de heterose sobre o GNDa encontrados foram significativos (P 0,01), e a relação entre heterose e heterozigose para esta característica apresentou um comportamento linear (P 0,01), considerando-se que o cruzamento estudado foi somente entre uma raça taurina e uma zebuína. Verificou-se que neste trabalho, os animais Hereford possuíam valor genético aditivo superior ao dos cruzados, todavia o mesmo não foi suficiente para contrabalançar os efeitos da heterose sobre o GNDa. Na comparação com os valores utilizados pelo Método GenSys, os valores de HI e HM, obtidos no presente trabalho, produziram diferenças na ordem de classificação de produtos ao desmame, mas o número de animais selecionados em comum pelos dois métodos não sofreu grandes mudanças. As vacas com composição racial 1/2 tiveram o melhor desempenho no GNDa, enquanto os terneiros com heterozigose individual máxima (composição racial 1/2) foram superados pelos 3/8 (filhos de vacas 1/2), quando se inclui a HM no desempenho dos mesmos, salientando a importância da HM sobre o GNDa.