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The objective was to verify the existence of lineages in the Mangalarga Marchador breed using microsatellites and to phenotypically characterize the lineages found using linear morphometric measurements taken at the time the animals were registered to be used as a tool for selecting individuals according to each breeder's selection objective. The genotyping database contained 255,257 Mangalarga Marchador horses born between 2005 and 2021. In addition, a database was used with pedigree information on 622,299 animals born between 1952 and 2020 and a database of phenotypes assessed at the time of definitive registration of these animals, containing 303,248 animals born between 1950 and 2018. The databases used came from the Associação Brasileira dos Criadores do Cavalo Mangalarga Marchador. To verify the existence of genetic differences according to the lineages of the breed, a discriminant analysis of principal components (DAPC) and the Kruskall Wallis test were carried out to perform phenotypic characterization to compare the means of the morphometric measurements, both using the R software. The DAPC analysis showed the genetic differentiation of the Angaí and Herdade lineages in relation to the others. The Herdade lineage showed greater phenotypic differentiation when compared with the three separate genetic groups in this study, demonstrating that the animals of this lineage are smaller and more gathered and have higher scores for gait and morphology. When compared to the historically described Mangalarga Marchador lineages, the breed does not have so many genetic groups, separating it into just three groups (Angaí, Herdade, and General), and when compared to phenotypic characteristics, only the Herdade lineage stood out.(AU)

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Stingrays genus Hypanus currently encompasses nine valid species from the Atlantic and Pacific oceans, though the phylogenetic relationships amongst some of them were based on a single mitochondrial gene and did not involve all putative Hypanus species. To address the monophyly of the genus and its relationship to other Dasyatinae genera, we sequenced the whole mitochondrial genomes of all species that supposedly belong to this genus and representatives of Dasyatinae, Neotrygoninae, and, as an outgroup, Fontitrygon (Urogymninae). Based on phylogenetic analyses, Hypanus is the sister-genus to all other Dasyatinae, and this subfamily is closely-related to Neotrygoninae within the family Dasyatidae. The species F. geijskesi is closely related to H. guttatus rather than to its congeners and should be allocated to Hypanus as H. geijskesi for the genus monophyly. After lineage delimitation analyses, we identified three species complexes composed of H. americanus, H. guttatus, and H. say, with two distinct evolutionary lineages within each, leaving the genus with 13 evolutionary units, of which six are currently under threat and only H. sabinus is of least concern. The urgency in identifying these new lineages lies in the fact they might already be under threat before being formally described.(AU)

As raias com ferrão do gênero Hypanus atualmente compreendem nove espécies válidas nos oceanos Atlântico e Pacífico, embora as relações filogenéticas entre algumas delas tenha sido baseada em apenas um gene mitocondrial e não envolvia todas as possíveis espécies de Hypanus. Para avaliar o monofiletismo do gênero e sua relação com outros Dasyatinae, sequenciamos os genomas mitocondriais de todas as espécies que supostamente compõem o gênero e representantes de Dasyatinae, Neotrygoninae e, como grupo externo, Fontitrygon (Urogymninae). Baseados em análises filogenéticas, Hypanus é o gênero-irmão de todos os outros Dasyatinae e essa subfamília é proximamente relacionada à Neotrygoninae dentro da família Dasyatidae. A espécie F. geijskesi é mais relacionada a H. guttatus que a outras congêneres e deve ser alocada em Hypanus como H. geijskesi para que o gênero seja monofilético. Após análises de delimitações de linhagens, identificamos três complexos de espécies formados por H. americanus, H. guttatus e H. say, com duas linhagens evolutivas distintas em cada, deixando o gênero com 13 unidades evolutivas, das quais seis estão atualmente sob risco de extinção e somente o estado de H. sabinus é pouco preocupante. A urgência na identificação dessas linhagens reside no fato que podem já estar ameaçadas antes de serem formalmente descritas.(AU)

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Cattle trypanosomiasis imposes significant economic burdens on the global livestock industry. The causative agents of this disease belong to the protozoan Trypanosoma genus. This study aims to perform detection (parasitological and molecular) and genetic characterization to analyze Trypanosoma spp. in cattle from 15 municipalities in the state of Rio de Janeiro, focusing on the 18S rDNA and Cathepsin-L (CatL) gene of Trypanosoma vivax and Trypanosoma theileri. A total of 389 blood samples from 15 dairy cattle farms in the state of Rio de Janeiro were collected, and DNA was extracted for subsequent PCR amplification of Trypanosoma spp. 18S rDNA and CatL genes. The resulting amplicons underwent sequencing and alignment for phylogenetic analysis, with comparisons made to GenBank isolates. Concerning parasitological analysis, blood smears presented 4.4% of positive cattle (n=17/389) for T. vivax and did not show any trypomastigote forms of T. theileri. The absolute frequency of Trypanosoma spp. through molecular detection targeting 18S rDNA was 11.6% (45/389). However, when performing species-specific PCRs, the T. vivax frequency, determined through CatL gene PCR, was 12.8%, and the T. theileri frequency was 3.6%. Phylogenetic analysis based on 18S rDNA revealed low diversity among T. vivax sequences, suggesting potential host segregation. This study emphasizes the high frequency of positive samples by PCR when compared to direct parasitological exams. Additionally, T. vivax phylogeny targeting 18S rDNA hints at sequence clustering related to host species. Importantly, this investigation unveils, for the first time in Rio de Janeiro's cattle, the circulation of T. theileri lineage ThI, encompassing genotypes IIB and IF. This discovery expands our understanding of this parasite's geographical distribution and genetic diversity.

A tripanossomíase bovina impõe significativos ônus econômicos à indústria pecuária global. Os agentes causadores dessa doença pertencem a protozoários do gênero Trypanosoma. Objetivou-se, com este estudo, realizar detecção (parasitológica e molecular) e caracterização genética de Trypanosoma spp. em bovinos de 15 municipalidades do estado do Rio de Janeiro, com foco na sequência 18S rDNA e no gene Cathepsin-L (CatL) de Trypanosoma vivax e Trypanosoma theileri. Um total de 389 amostras de sangue de 15 fazendas leiteiras no estado do Rio de Janeiro foram coletadas, e o DNA foi extraído para subsequente amplificação por PCR dos genes 18S rDNA e CatL de Trypanosoma spp. Os amplicons resultantes foram submetidos a sequenciamento e alinhamento para análise filogenética, com comparações realizadas com isolados do GenBank. No que se refere à análise parasitológica, os esfregaços de sangue apresentaram 4,4% de bovinos positivos (n=17/389) para T. vivax e não mostraram nenhuma forma tripomastigota de T. theileri. A frequência absoluta de Trypanosoma spp. através da detecção molecular visando 18S rDNA foi de 11,6% (45/389). No entanto, ao realizar PCRs específicos de espécies, a frequência de T. vivax, determinada por PCR do gene CatL foi de 12,8%, e a frequência de T. theileri foi de 3,6%. A análise filogenética com base no 18S rDNA revelou baixa diversidade entre as sequências de T. vivax, sugerindo uma possível segregação de hospedeiros. Este estudo enfatiza a alta frequência de amostra positiva pela PCR quando comparada com a parasitológica direta. Além disso, a filogenia de T. vivax direcionada ao 18S rDNA sugere agrupamento de sequências relacionado à espécie hospedeira. Importante destacar que esta investigação revela, pela primeira vez no gado do Rio de Janeiro, a circulação da linhagem ThI de T. theileri, abrangendo os genótipos IIB e IF. Esta descoberta amplia nosso entendimento sobre a distribuição geográfica e diversidade genética desse parasito.

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Frequent outbreaks of avian influenza H9N2 virus in Pakistan revealed that this subtype has become endemic in the poultry industry and, besides economic losses, poses a threat to public health. The present study describes the molecular characterization and pathological alterations in naturally infected broiler chickens with the current H9N2 field strain and their phylogenomic dynamics. In this study, tissue samples (trachea, lung, kidney and intestine) from 100 commercial chicken flocks were collected from July 2018 to August 2019. Samples were subjected to molecular detection, phylogeny and subsequent pathological examination. The complete length of the HA gene was successfully amplified in five samples. Nucleotide sequencing revealed positive samples placed in a clade belonging to the B2 sub-lineage of the G1 genotype and categorized as LPAIV based on the amino acid sequence of the HA gene at the cleavage site (PAKSSR/G). Genetic analysis of the haemagglutinin (HA) gene revealed nt: 80.5%-99.5%; aa: 83.8%-98.9% homology to H9N2 strains reported previously from Pakistan, neighbouring countries, and (A/Quail/Hong Kong/G1/97). Gross lesions include a slight airsacculitis, mild hemorrhages, diffuse congestion and purulent exudate in tracheal mucosa, fibrinonecrotic cast in the trachea lumen and mild pulmonary congestion. Histopathological alterations include sloughing of epithelial cells and infiltration of inflammatory cells in the trachea, mononuclear cells (MNCs) infiltration, pulmonary congestion and exudate in the lumen of parabronchi, peritubular congestion in the kidneys with degeneration of tubular epithelial cells and degenerative changes in the intestinal villi epithelial cells and goblet cell hyperplasia. Immunohistochemistry analysis confirmed the presence of AIVH9N2 antigen in the trachea, lungs, kidney and intestine. Electron microscopy revealed ultrastructural changes in the trachea, including degenerated cilia, mitochondrial swelling and enlarged endoplasmic reticulum. Based on all essential analysis, the present study revealed the distribution of the H9N2 virus of G1 genotype in Punjab, Pakistan, with mild to moderate pathogenicity.

Surtos frequentes do vírus da gripe aviária H9N2 no Paquistão revelaram que esse subtipo se tornou endêmico na avicultura e, além das perdas econômicas, representa uma ameaça à saúde pública. O presente estudo descreve a caracterização molecular e as alterações patológicas em frangos de corte naturalmente infectados com a atual cepa H9N2 e sua dinâmica filogenômica. Neste estudo, amostras de tecidos (traqueia, pulmões, rim e intestino) de 100 lotes comerciais de frangos foram coletadas de julho de 2018 a agosto de 2019. As amostras foram submetidas à detecção molecular, filogenia e posterior exame patológico. O comprimento completo do gene HA foi amplificado com sucesso em cinco amostras. O sequenciamento de nucleotídeos revelou amostras positivas colocadas em um clado pertencente à sublinhagem B2 do genótipo G1 e categorizado como LPAIV com base na sequência de aminoácidos do gene da hemaglutinina (HA) no local de clivagem (PAKSSR/G). A análise genética do gene da HA revelou: nt = 80,5%-99,5%; aa = 83,8%-98,9% de homologia com cepas de H9N2 relatadas anteriormente no Paquistão e em países vizinhos (A/Quail/Hong Kong/G1/97). As lesões macroscópicas incluíram aerossaculite leve, hemorragias leves, congestão difusa e exsudato purulento na mucosa traqueal, cilindro fibrinonecrótico no lúmen da traqueia e congestão pulmonar leve. As alterações histopatológicas incluíram descamação de células epiteliais, infiltração de células inflamatórias na traqueia, infiltração de células mononucleares (MNCs), congestão pulmonar e exsudato no lúmen dos parabrônquios, congestão peritubular nos rins com degeneração das células epiteliais tubulares, alterações degenerativas nas células epiteliais das vilosidades intestinais e hiperplasia de células caliciformes. A análise imunoistoquímica confirmou a presença do antígeno AIVH9N2 na traqueia, nos pulmões, no rim e no intestino. A microscopia eletrônica revelou alterações ultraestruturais na traqueia, incluindo cílios degenerados, inchaço mitocondrial e retículo endoplasmático aumentado. Com base em todas as análises, o presente estudo revelou a distribuição do vírus H9N2 do genótipo G1 em Punjab, Paquistão, com patogenicidade de leve a moderada.

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Abstract Novel coronavirus (nCoV) namely SARS-CoV-2 is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the SARS-CoV-2 although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among SARS-CoV-2 and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that SARS-CoV-2 has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

Resumo O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente SARS-CoV-2, foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o SARS-CoV-2, embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre SARS-CoV-2 e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que SARS-CoV-2 tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

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The emperor tamarin, Tamarinus imperator, is composed of two subspecies, the nominal type, T. i. imperator, distribut-ed between the Acre and Purus Rivers, whose range is limited between the Brazilian state of Acre and Peru are unbounded, and T. i. subgrisescens, occurring in Peru, Bolivia, and Brazil, in the Brazilian states of Acre and Amazonas. Morphologically, both taxa are easily identifiable by the pelage pattern (chromogenetic fields), and even being easily distinguishable, both lineages are con-sidered subspecies according to the criterion based on the Biological Concept of Species from the 1970s, even without presenting some necessary criteria, such as the intergradation zone. Here we analyzed pelage traits, cranial morphometry, Cytochrome-b di-vergence, and distributional pattern data applying the premises of integrative taxonomy to elucidate the taxonomic status of both lineages. We hypothesize that both lineages are considered full species through a series of criteria for species recognition, such as distinguishability, level of phenotypical divergences of several morphological complexes with congruence among them, and some genetic divergence. The hybridization is unknown and the low or the lack of sampling in target areas does not allow us to determine whether a hybridization or even contact zone between the two lineages exists indeed. All character sets analyzed were congruent with each other and reinforced the high level of divergences between the two subspecies including several pelage differences, mor-phometry (descriptive statistics, PCA, and MANOVA), and mitochondrial DNA Cytochrome-b divergence. Most of the distribution in both lineages are allopatric, and the levels of intra-lineage phenotypical variation are much lower than between the lineages.(AU)

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A new species of Loricaria is described from the upper Amazon River basin, Colombia. The new species is distinguished from its congeners primarily by having the dorsal portion of head with uniform black or dark brown coloration extending to three or four plates posterior to dorsal fin base, or with two longitudinal bands from tip of the snout to origin of dorsal fin; abdominal plates tightly joined and completely covering the median abdominal space and pectoral girdle; and pectoral and dorsal fins totally black or dark brown, without bands, spots, or blotches. The new species is further distinguished by plate counts, and body measurements. An analysis of genetic distances using the cytochrome oxidase c subunit 1 marker of the mitochondrial genome showed a clear differentiation between the new species and Loricaria cataphracta (5.8-7.6%), L. nickeriensis (5.7-6.1%), and L. simillima (2.7-7.0%). Species delimitation analyses were carried out, which further supported the new species as a divergent lineage within the genus. Fish species diversity of the upper Amazon River basin and taxonomic issues related to L. simillima are included as part of the discussion.(AU)

Se describe una nueva especie de Loricaria de la cuenca alta del río Amazonas, Colombia. La nueva especie se distingue de sus congéneres principalmente por presentar la parte dorsal de la cabeza con un color uniforme negro o marrón oscuro que se extiende a tres o cuatro placas posteriores a la base de la aleta dorsal, o con dos franjas longitudinales desde la punta del hocico hasta el origen de la aleta dorsal; placas abdominales unidas y cubriendo completamente la porción central del abdomen y la cintura pectoral; y aletas pectorales y dorsal completamente negras o marrón oscuro, sin bandas ni manchas. La nueva especie se distingue además por conteos de placas y medidas corporales. Un análisis de distancias genéticas utilizando el marcador de la subunidad 1 del citocromo oxidasa c del genoma mitocondrial mostró una clara diferenciación entre la nueva especie y Loricariacataphracta (5,8-7,6%), L. nickeriensis (5,7-6,1%) y L. simillima (2,7-7,0%). Adicionalmente se realizaron análisis de delimitación de especies, lo que mostró información adicional para reconocer la nueva especie como un linaje divergente dentro del género. La diversidad de especies de peces en la parte superior del río Amazonas y cuestiones taxonómicas relacionadas con L. simillima se incluyen como parte de la discusión.(AU)

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Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

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Abstract Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

Resumo O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

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Objective of this study was to test the hypotheses that heifer's behaviour after 12 months (M) are impacted by rearing (feeding/housing) before weaning, seasons of birth, and father lineage. Fifty-one Holstein heifers (born in year seasons SB1, SB2, SB3, and SB4, originating from 4 fathers) were assigned to one of three rearing treatments: restricted suckling (RS), calf in pen with mother to 21st day, suck three times daily, then group pen (6 kg milk) to weaning; unrestricted suckling (US), calf in pen with foster cows (6 kg milk) to weaning; conventional rearing (CR), calf in the hutch to 56th day, then group pen to weaning (milk replacer 6 kg). After weaning at the 84th day, heifers were kept in groups with the same ration. The labyrinth behaviour was tested in the 12th and 19th M of the age. In the evaluation factors rearing and season of birth, groups US and SB3 solved the passage of the labyrinth the fastest (868.0 s, 857.4 s), the slowest were CR and SB1 (1148.2 s, 1257.5 s). The results show that the manner (housing/feeding) used to rear heifers and season of birth may impact their later labyrinth behaviour.

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Canine transmissible venereal tumor (CTVT) is the oldest known somatic cell lineage. It is a transmissible cancer that propagates naturally in dogs and reportedly contains gene mutations. RASSF1 participates in DNA damage repair, and its downregulation, results in tumor progression. Hence, RASSF1 is a tumor suppressor gene. Its expression was quantified in tumors from seventeen animals and three cell cultures derived from tumors. In general, RASSF1 was underexpressed in 65%, and absent in 35% of tumor samples. Cells from tumor tissue cultures showed decreased expression of RASSF1 in 67% and elevated expression in 33% of samples tested. The tumor tissues showed significantly lower levels of RASSF1 expression compared to cultured cells. Previously we reported that both the tumor microenvironment and the host immune system appear to influence the tumorigenesis and stage of CTVT. This is the first article to demonstrate the expression of RASSF1 in CTVT. Decreased RASSF1 possibly helps tumor progression.

O tumor venéreo transmissível canino (TVTC) é a linhagem de células somáticas mais antiga conhecida. É um câncer transmissível que se propaga naturalmente em cães e mutações genéticas já foram relatadas. O gene RASSF1 atua no reparo de danos ao DNA e presume-se que, quando suprimido ou com expressão gênica reduzida, o TVTC tende a progredir. A expressão do gene supressor de tumor, como RASSF1, foi quantificada em tecidos de dezessete animais e três culturas de células de tecidos tumorais. Em geral, o gene RASSF1 apresentou prevalência de subexpressão (65%) e ausência em 35% dos demais tecidos analisados. Células isoladas de culturas de tecidos tumorais também demonstraram 67% com expressão diminuída e 33% com expressão elevada, com diferença significativa entre os níveis de expressão gênica em amostras de tecido quando comparadas às culturas de células, com tecidos apresentando níveis mais baixos de expressão gênica em comparação com células. Anteriormente, relatamos que tanto o microambiente tumoral quanto o sistema imunológico do hospedeiro parecem influenciar a tumorigênese e o estágio do TVTC. Este é o primeiro artigo a demonstrar a expressão de RASSF1 no TVTC, possivelmente alterando sua tumorigênese e auxiliando no aumento da progressão tumoral.

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The objective of this study was to compare the antimicrobial activity of macrophages and serum in laying hen (MM, CC, and CCc) and broiler chicken lineages (TT and LL). Macrophages were evaluated for phagocytic and antimicrobial activity. Microbicidal serum activity was evaluated by the resistance test for serum and the agar test. The results showed that phagocytic activity was higher in males of the MM strain, with 13% of macrophages presenting phagocytosis, while the other lineages studied, and even female MM, presented a rate of 6% of phagocytic cells. However, antimicrobial activity in macrophages from males of CCc lineage and females of TT lineage were higher, eliminating more than 30% of the Salmonella enterica inoculum, while in the other strains, the results were similar, with inoculum reduction below 30%. In the serum resistance assay, female laying lines presented higher antibacterial activity than female broiler lines. In the trials to evaluate the microbicide activity of the serum, females of both broiler and laying lineages presented higher performance when compared with males of the same lineage. Females of laying hen lines (MM and CC) present a greater antibacterium activity than males. These results can contribute to a better understanding of the immune response in broiler chicken and laying hen lineages, to aid development of lineages of birds more resistant to pathogens.

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The fishes of the Haemulidae family are currently allocated to 19 genera with a worldwide distribution in the tropical and subtropical waters of the world's oceans. Brachygenys and Haemulon are important genera of reef fish in Brazil, as they occur in large shoals, which are both ecologically and commercially valuable. This study identified the Brazilian species of the genera Brachygenys and Haemulon using DNA barcodes. While we found only a single lineage in Brachygenys chrysargyrea, Haemulon melanurum, H. parra, and H. squamipinna, more than one molecular operational taxonomic unit (MOTU) was identified in H. atlanticus, H. aurolineatum, and H. plumieri, indicating the possible existence of discrete populations or cryptic species.(AU)

Os peixes da família Haemulidae estão atualmente distribuídos em 19 gêneros, com distribuição mundial em águas oceânicas tropicais e subtropicais. Brachygenys e Haemulon são importantes gêneros de peixes recifais do Brasil, visto que ocorrem em grandes cardumes, de valores ecológicos e comerciais. Este estudo identificou as espécies brasileiras dos gêneros Brachygenys e Haemulon usando o código de barras de DNA. Embora apenas uma única linhagem de Brachygenys chrysargyrea, Haemulon melanurum, H. parra e H. squamipinna tenha sido encontrada em nosso conjunto de dados, mais de uma unidade taxonômica operacional molecular (MOTU) foi identificada em H. atlanticus, H. aurolineatum e H. plumieri, indicando a possível existência de populações discretas ou espécies crípticas.(AU)

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The turtle population plays an important role in sustaining the water ecosystem by minimizing pollution from water. The identification and molecular investigation of freshwater fauna is essential for conservation of the species that are near to extinction. The quality of water, type of flora, fauna, and environmental condition are the major factors that directly affect the distribution of freshwater turtles. Two families including eight species of freshwater turtles are found in Pakistan. The Geoemydidae (Geoclemys hamiltonii, Hardella thurjii, Pangshura smithii, and Pangshura tecta) and Trionychidae (Chitra indica, Nilssonia gangetica, Nilssonia hurum, and Lissemys punctata andersoni). Studies on the species diversity and habitat of freshwater turtle have not been focused previously in the region. The present study was the first conducted to estimate the habitat and genetic diversity of freshwater turtles using 12S rRNA (ribosomal RNA) gene in Pakistan. A total of 26 samples were collected from various localities using hand net, cast net, gills net, steel hooks, thick chemical wire, using chicken intestine and small fishes. The collected turtle specimens were morpho-taxonomically categorized into two genera, Lissemys punctata andersoni (n=13, 50%) and Nilssonia gangetica (n=13, 50%). The collected species showed an aggressive and active behavior in captivity during summer. Genomic DNA was extracted from collected specimens and used in PCR reaction by using specific primers for the amplification of short fragments of 12S rRNA gene. Analysis of generated sequences confirmed the existence of L. p. andersoni in the region. The generated sequences of L. p. andersoni correspond to Clad A and showed a close resemblance among different species of the genus Lissemys. The climatic change such as temperature and rainfall have great effects on the occurrence of turtles. Habitat degradation occurred due to various factors such as draining wetlands, deforestation, converting clear water rivers to stagnant multi-purpose reservoirs and mortality on roads when turtles move around to feed. Current study concluded that the freshwater turtles L. p. andersoni and N. gangetica are interested in natural feeds. The analysis of 359 bp of 12S rRNA gene of the genus Lissemys turtles showed relationships of these turtles with cyclanorbines flap shell turtles, which agrees with previous reports. The African taxa are paraphyletic with respect to the Asian Lissemys. The ancestors of the extant genus cyclanorbines spread from North America to Asia [26]. It should be expected that each of the 3 taxa, L. p. andersoni, L. p. punctata and L. scutata represents a distinct genetic lineage. Present molecular investigation concluded that Clad A comprising L. p. punctata, L. scutata, L. cylonensis also include L. p. andersoni species. Clad B also contains one sequence from India, identified as L. p. andersoni. Their classification as conspecific evolutionary lineages are suggested by similar genetic divergences, the observation of mismatches between morphology (spotted vs. unspotted) and mitochondrial haplotypes in clades A and B. The clades A and B provides evidence for gene flow between the spotted subspecies L. p. andersoni and adjacent populations with unspotted flap shell turtles. This study is the first investigation about the habitat and of the endemic turtle species L. p. andersoni and N. gangetica in Pakistan. The genetic identification followed by phylogenetic analysis based on 12S rRNA partial genes revealed a closest similarity with the sequences generated for the same species from the neighboring countries. This study provided information to conduct further molecular studies that are essential to provide significant genetic data about turtle species.(AU)

Resumo

Gymnogeophagus labiatus and G. lacustris have been long recognized as sister species exhibiting different ecological requirements. Gymnogeophagus labiatus occurs in rock bottom rivers in the hydrographic basins of Patos Lagoon (HBP) and Tramandaí River (HBT), while G. lacustris is exclusive from sand bottom coastal lagoons of the HBT. In this study, we used molecular markers, morphological measurements and data from nuptial male coloration to investigate the evolutionary relationship between these species in each hydrographic basin. We found, for all data sets, a closer relationship between G. labiatus and G. lacustris from the HBT than between G. labiatus populations from HBT and HBP. In particular, lip area had a large intraspecific plasticity, being uninformative to diagnose G. lacustris from G. labiatus. Molecular clock-based estimates suggest a recent divergence between species in the HBT (17,000 years ago), but not between G. labiatus from HBP and HBT (3.6 millions of years ago). Finally, we also found a divergent G. labiatus genetic lineage from the Camaquã River, in the HBP. These results show that the current taxonomy of G. labiatus and G. lacustris does not properly represent evolutionary lineages in these species.(AU)

Gymnogeophagus labiatus e G. lacustris vêm sendo consideradas espécies irmãs que possuem diferentes exigências ecológicas. Gymnogeophagus labiatus ocorre em rios de fundo de pedra nas bacias hidrográficas da Laguna dos Patos (HBP) e do rio Tramandaí (HBT), enquanto G. lacustris é exclusivo da HBT, ocorrendo em lagoas costeiras de fundo de arenoso. Nesse estudo, foram usados marcadores moleculares, medidas morfológicas e dados sobre a coloração nupcial em machos para investigar a relação evolutiva entre estas espécies em cada bacia hidrográfica. Para todos os conjuntos de dados foi observada uma relação mais próxima entre G. labiatus e G. lacustris da HBT do que entre as populações de G. labiatus da HBP e HBT. Em particular, a área do lábio teve uma grande plasticidade intraespecífica, não sendo informativa para diagnosticar G. lacustris de G. labiatus. Estimativas baseadas no relógio molecular sugeriram uma divergência recente entre as espécies da HBT (17.000 anos atrás), mas não entre as populações de G. labiatus da HBP e HBT (3,6 milhões de anos atrás). Finalmente, também foi encontrada uma linhagem genética de G. labiatus divergente no rio Camaquã, na HBP. Esses resultados mostram que a taxonomia atual de G. labiatus e G. lacustris não representa adequadamente as linhagens evolutivas nessas espécies.(AU)

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ABSTRACT: This research reports the use of different diagnostic tests in cattle, naturally infected by Rabies lyssavirus (RABV), and correlates the positivity of the tests with the clinical moment of euthanasia, the intensity of the inflammatory lesion and viral load. It also highlights the possibility of euthanasia in early stages of the disease as a way to improve animal welfare. For that, samples of 34 bovine brains were collected for analysis, preserved in 10% buffered formaline and refrigerated with subsequent freezing. The samples were subjected to direct immunofluorescence antibody technique (DFAT) tests, viral isolation in cell culture (VICC), histopathology with hematoxylin and eosin staining (HE), immunohistochemistry (IHC), Shorr stainied neural tissue smears (DSS), Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and polymerase chain reaction by quantitative reverse transcriptase (qRT-PCR). The areas used for analysis were the cerebellum, parietal telencephalon and thalamus. Samples with Negri bodies (NBs) or immunostaining in at least one of the analyzed areas were considered positive. For the study of the intensity of histological lesions, the lesions were classified into grades 0, 1, 2 and 3 and the positivity of the test in the presence or absence of NBs in one of the three areas analyzed. To verify the influence of the disease clinical evolution, 4-four groups of analysis were created according to the animals clinical status at moment of the euthanasia, being: M1 = animal euthanized while standing, M2 = euthanized when in sternal recumbence, M3 = euthanized when in lateral recumbence, M4 = animal with natural death. Of the 34 brains evaluated, IHC was positive in 100% of cases, DFAT was positive in 97.05% of them, and in this negative sample the presence of RABV was confirmed by VICC. NBs ere seen in 88.23% of the cases, and the DSS test was positive in 82.35% of them. All diagnostic techniques showed positive cases in all groups analyzed. Each case was positive in at least two diagnostic methods. All cases that contained NBs were positive for rabies in the other tests. In this study, it was observed that the variables analyzed (intensity of injury and clinical evolution at the moment of euthanasia) had an influence only on HE and DSS techniques, which are based on NB research to form the diagnosis, but did not interfere with the effectiveness of the diagnosis performed by detecting the viral antigen performed by DFAT and IHC. All isolated RABV samples included in the present study have a genetic lineage characteristic of hematophagous bats Desmodus rotundus. The evaluation of qRT-PCR showed that the amount of virus did not interfere in the positivity of the tests. This work shows that IHC and DFAT are safe diagnostic techniques. They are capable of detecting RABV even in euthanized animals in the early stages of clinical evolution with mild intensities of histological lesions.

RESUMO: Esta pesquisa relata a utilização de diferentes testes de diagnóstico em bovinos, naturalmente infectados pelo Rabies lyssavirus (RABV), e correlaciona a positividade dos testes com o momento clínico da eutanásia, a intensidade da lesão inflamatória, e a carga viral. Salienta também a possibilidade da eutanásia em estágios precoces da doença como forma de melhorar o bem-estar animal. Para isso amostras de 34 encéfalos bovinos foram coletados para análise, conservadas em formol tamponado 10% e sob refrigeração com posterior congelamento. As amostras foram submetidas aos testes de imunofluorescência direta (IFD), isolamento viral em cultivo de células (IVCC), histopatologia com coloração de hematoxilina e eosina (HE), imuno-histoquímica (IHQ), esfregaço direto com coloração de Shorr (EDS), reação da polimerase em cadeia por transcriptase reversa (RT-PCR) e reação da polimerase em cadeia por transcriptase reversa quantitativo (qRT-PCR). As áreas utilizadas para análise foram o cerebelo, telencéfalo parietal e tálamo. Foram consideradas positivas as amostras que apresentaram Corpúsculo de Negri (CNs) ou imuno-marcação em ao menos uma das áreas analisadas. Para o estudo da intensidade das lesões histológicas, as lesões foram classificadas em graus 0, 1, 2 e 3 e a positividade do teste na presença ou ausência de CN em uma das três áreas analisadas. Para verificar a influência da evolução clínica da doença foram criados 4 grupos de análise conforme o estado clínico do animal no momento da eutanásia, sendo: M1 = animal eutanasiado em estação, M2 = eutanasiado em decúbito esternal, M3 = eutanasiado em decúbito lateral, M4 = animal com morte natural. Dos 34 encéfalos avaliados a IHQ foi positiva em 100% dos casos, a IFD foi positiva em 97,05%, sendo que na amostra negativa a presença de RABV foi confirmada por IVCC. A histologia com HE, através da visualização das CNs, foi positiva em 88,23 % dos casos, e o teste de EDS, foi positivo em 82,35%. Todas as técnicas de diagnóstico apresentaram casos positivos em todos os grupos analisados. Cada caso foi positivo em, pelo menos, dois métodos de diagnóstico. Todos os casos que continham CN foram positivos para raiva nos demais testes. Nesse estudo observou-se que as variáveis analisadas intensidade de lesão e evolução clínica no momento da eutanásia tiveram influência somente nas técnicas de HE e EDS, que se baseiam na pesquisa do CN para formação do diagnóstico, mas não interferiram na eficácia do diagnóstico realizado através da detecção do antígeno viral realizado por IFD e IHQ. Todas as amostras RABV isoladas incluídas no presente estudo apresentam linhagem genética característica de morcegos hematófagos Desmodus rotundus. A avaliação de qRT-PCR demostrou que a quantidade de vírus não interferiu na positividade dos testes. Esse trabalho mostra que a IHQ e a IFD são técnicas seguras de diagnóstico e que mesmo em animais eutanasiados em estágios iniciais de evolução clínica com intensidades leve de lesões histológicas, são capazes de detectar o RABV.

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The impact of pig farming on the worldwide economy causes production to be directed at an industrial scale, requiring the control of diseases that affect economic performance. Urinary infection (UI), for example, has a high prevalence in current production systems, causing economic losses due to the predisposition to reproductive failures, leading to an increase in disposal of sows and replacement rates. In this context, the objective of this work was to evaluate the prevalence of urinary tract infection (UTI) and possible changes in the urine sediment examination of pregnant sows to survey changes compatible with inflammation of the lower urinary tract. The samples were collected, randomly, from 43 sows of commercial genetic lineage, in different stages of gestation, and that belonged to a pig farm located in Guapimirim-RJ. The pig farm’s herd consisted of 200 sows, 90 of which were in the gestation phase. The samples were collected by spontaneous urination, using the first morning urine, before feeding, which happened around 7 am. The presence of UTI was identified in 12 of the 43 sows analyzed, with 21.5% of the herd being evaluated. A prevalence of 27.9% was observed with animals showing compatible UTI changes. This data was considered severe. The urine sediment examination is the best way to diagnose UTI with sedimentcopy being the most conclusive part. Despite this, it is necessary to relate the laboratory data with the zootechnical management used, as well as the environmental conditions.

O impacto da suinocultura na economia mundial, faz com que a produção seja dirigida para a escala industrial, exigindo o controle de doenças que afetam o rendimento econômico. A infecção urinária (IU), por exemplo, apresenta alta prevalência nos sistemas atuais de produção, causando perdas econômicas em função da predisposição para falhas reprodutivas, levando a um aumento dos descartes de matrizes e das taxas de reposição. Neste contexto, o objetivo desse trabalho foi avaliar a prevalência de IU e possíveis alterações no EAS de porcas gestantes, para levantamento de alterações compatíveis com infla-mação de trato urinário inferior. Foram analisadas 43 amostras de urina de porcas de linhagem genética comercial, em fases distintas de gestação, colhidas de forma aleatória, em uma granja localizada no município de Guapimirim-RJ. O plantel da granja era constituído por 200 matrizes, sendo 90 delas na fase de gestação. As amostras foram coletadas por micção espontâ-nea, sendo utilizadas as primeiras urinas da manhã, antes do arraçoamento, que acontecia por volta das 7 horas. A presença de infecção urinária foi identificada em 12 das 43 porcas analisadas, sendo avaliados 21,5% do rebanho. Observou-se uma pre-valência de 27,9%, com os animais apresentando alterações compatíveis de IU, constatando-se que este nível foi considerado grave. O EAS é a melhor forma de diagnosticar IU, sendo a sedimentoscopia a parte mais conclusiva, apesar disto, é necessário relacionar os dados laboratoriais com o manejo zootécnico utilizado, bem como as condições ambientais.

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This research reports the use of different diagnostic tests in cattle, naturally infected by Rabies lyssavirus (RABV), and correlates the positivity of the tests with the clinical moment of euthanasia, the intensity of the inflammatory lesion and viral load. It also highlights the possibility of euthanasia in early stages of the disease as a way to improve animal welfare. For that, samples of 34 bovine brains were collected for analysis, preserved in 10% buffered formaline and refrigerated with subsequent freezing. The samples were subjected to direct immunofluorescence antibody technique (DFAT) tests, viral isolation in cell culture (VICC), histopathology with hematoxylin and eosin staining (HE), immunohistochemistry (IHC), Shorr stainied neural tissue smears (DSS), Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and polymerase chain reaction by quantitative reverse transcriptase (qRT-PCR). The areas used for analysis were the cerebellum, parietal telencephalon and thalamus. Samples with Negri bodies (NBs) or immunostaining in at least one of the analyzed areas were considered positive. For the study of the intensity of histological lesions, the lesions were classified into grades 0, 1, 2 and 3 and the positivity of the test in the presence or absence of NBs in one of the three areas analyzed. To verify the influence of the disease clinical evolution, 4-four groups of analysis were created according to the animal's clinical status at moment of the euthanasia, being: M1 = animal euthanized while standing, M2 = euthanized when in sternal recumbence, M3 = euthanized when in lateral recumbence, M4 = animal with natural death. Of the 34 brains evaluated, IHC was positive in 100% of cases, DFAT was positive in 97.05% of them, and in this negative sample the presence of RABV was confirmed by VICC. NBs ere seen in 88.23% of the cases, and the DSS test was positive in 82.35% of them. All diagnostic techniques showed positive cases in all groups analyzed. Each case was positive in at least two diagnostic methods. All cases that contained NBs were positive for rabies in the other tests. In this study, it was observed that the variables analyzed (intensity of injury and clinical evolution at the moment of euthanasia) had an influence only on HE and DSS techniques, which are based on NB research to form the diagnosis, but did not interfere with the effectiveness of the diagnosis performed by detecting the viral antigen performed by DFAT and IHC. All isolated RABV samples included in the present study have a genetic lineage characteristic of hematophagous bats Desmodus rotundus. The evaluation of qRT-PCR showed that the amount of virus did not interfere in the positivity of the tests. This work shows that IHC and DFAT are safe diagnostic techniques. They are capable of detecting RABV even in euthanized animals in the early stages of clinical evolution with mild intensities of histological lesions.(AU)

Esta pesquisa relata a utilização de diferentes testes de diagnóstico em bovinos, naturalmente infectados pelo Rabies lyssavirus (RABV), e correlaciona a positividade dos testes com o momento clínico da eutanásia, a intensidade da lesão inflamatória, e a carga viral. Salienta também a possibilidade da eutanásia em estágios precoces da doença como forma de melhorar o bem-estar animal. Para isso amostras de 34 encéfalos bovinos foram coletados para análise, conservadas em formol tamponado 10% e sob refrigeração com posterior congelamento. As amostras foram submetidas aos testes de imunofluorescência direta (IFD), isolamento viral em cultivo de células (IVCC), histopatologia com coloração de hematoxilina e eosina (HE), imuno-histoquímica (IHQ), esfregaço direto com coloração de Shorr (EDS), reação da polimerase em cadeia por transcriptase reversa (RT-PCR) e reação da polimerase em cadeia por transcriptase reversa quantitativo (qRT-PCR). As áreas utilizadas para análise foram o cerebelo, telencéfalo parietal e tálamo. Foram consideradas positivas as amostras que apresentaram Corpúsculo de Negri (CNs) ou imuno-marcação em ao menos uma das áreas analisadas. Para o estudo da intensidade das lesões histológicas, as lesões foram classificadas em graus 0, 1, 2 e 3 e a positividade do teste na presença ou ausência de CN em uma das três áreas analisadas. Para verificar a influência da evolução clínica da doença foram criados 4 grupos de análise conforme o estado clínico do animal no momento da eutanásia, sendo: M1 = animal eutanasiado em estação, M2 = eutanasiado em decúbito esternal, M3 = eutanasiado em decúbito lateral, M4 = animal com morte natural. Dos 34 encéfalos avaliados a IHQ foi positiva em 100% dos casos, a IFD foi positiva em 97,05%, sendo que na amostra negativa a presença de RABV foi confirmada por IVCC. A histologia com HE, através da visualização das CNs, foi positiva em 88,23 % dos casos, e o teste de EDS, foi positivo em 82,35%. Todas as técnicas de diagnóstico apresentaram casos positivos em todos os grupos analisados. Cada caso foi positivo em, pelo menos, dois métodos de diagnóstico. Todos os casos que continham CN foram positivos para raiva nos demais testes. Nesse estudo observou-se que as variáveis analisadas intensidade de lesão e evolução clínica no momento da eutanásia tiveram influência somente nas técnicas de HE e EDS, que se baseiam na pesquisa do CN para formação do diagnóstico, mas não interferiram na eficácia do diagnóstico realizado através da detecção do antígeno viral realizado por IFD e IHQ. Todas as amostras RABV isoladas incluídas no presente estudo apresentam linhagem genética característica de morcegos hematófagos Desmodus rotundus. A avaliação de qRT-PCR demostrou que a quantidade de vírus não interferiu na positividade dos testes. Esse trabalho mostra que a IHQ e a IFD são técnicas seguras de diagnóstico e que mesmo em animais eutanasiados em estágios iniciais de evolução clínica com intensidades leve de lesões histológicas, são capazes de detectar o RABV.(AU)

Resumo

The typical long-snouted species of Corydoras from the río de La Plata basin were reviewed herein, and the previously proposed synonymy of Corydoras ellisae was corroborated. Corydoras areio and C. aurofrenatus are diagnosed from their congeners, excluding those in lineage 1, by the following features: temporal sensory canal in sphenotic with two pores; upper tooth plate of branchial arch with three or four series of teeth; fleshy flap at mouth corner. Corydoras areio differs from all lineage 1 congeners by having infraorbital 2 with relatively wider posterior laminar expansion; absence of large patches of black pigmentation on the body and absence of conspicuous concentration of dark brown or black chromatophores on anterior portion of the dorsal fin; and presence of blotches on flanks not aligned in longitudinal series. Corydoras aurofrenatus differs from all lineage 1 congeners by having ventral surface of head and trunk densely covered by small, not coalescent platelets; middle portion of flank with two or three dark brown or black patches (below the dorsal-fin, below the adipose-fin base, and on the caudal peduncle base, diffuse and variably present), patches decreasing in size posteriorly; poorly developed fleshy flap at the corner of mouth; anteroventral portion of cleithrum exposed.(AU)

As espécies típicas de focinho longo de Corydoras da bacia do río de La Plata foram revisadas, e a sinonímia proposta anteriormente de Corydoras ellisae foi corroborada. Corydoras areio e C. aurofrenatus são diagnosticadas de seus congêneres, excluindo aquelas da linhagem 1, pelas seguintes características: canal sensorial temporal no esfenótico com dois poros; placa dentária superior do arco branquial com três ou quatro séries de dentes; aba carnosa no canto da boca. Corydoras areio difere de todos os congêneres da linhagem 1 pelo infraorbital 2 com expansão laminar posterior relativamente mais ampla; ausência de grandes manchas de pigmentação preta no corpo e ausência de concentração conspícua de cromatóforos marrom-escuros ou pretos na porção anterior da nadadeira dorsal; presença de manchas laterais não alinhadas em série longitudinal. Corydoras aurofrenatus difere de todas as congêneres da linhagem 1 pela superfície ventral da cabeça e do tronco densamente coberta por pequenas plaquetas não coalescentes; porção média lateral com duas ou três manchas marrom-escuras ou pretas (abaixo da nadadeira dorsal, abaixo da base da nadadeira adiposa, e na base do pedúnculo caudal, difusa e variavelmente presente), manchas diminuindo de tamanho posteriormente; aba carnosa pouco desenvolvida no canto da boca; porção anteroventral do cleitro exposta.(AU)

Resumo

This study aimed to establish criteria for eliminating redundant variables, to know the magnitude of the data relationship, and to provide information that helps researchers in the use of the technique to analyze and interpret production data and egg quality. The data used in this work was obtained from four successive generations of the quail lineage developed by the Department of Animal Science of the Federal University of Pelotas. The characteristics were measured from the 42nd day of age, when the egg production period began, until 126 days of production, obtaining three 28 day periods (cycles) in the four successive generations, totaling 545 females. Of the twelve original variables, only seven demonstrated potential to be maintained in future experiments, representing a 42% exclusion. The main philosophy of this study was the analysis of the studied variables and made possible the understanding of the relationship and the correlations.(AU)

O objetivo do presente trabalho foi estabelecer critérios para eliminação de variáveis redundantes, conhecer a magnitude das relações dos dados, além de fornecer informações que auxiliem pesquisadores na utilização da técnica para analisar e interpretar dados de produção e qualidade de ovos de codornas. Os dados utilizados neste trabalho são provenientes de quatro gerações sucessivas da linhagem de codornas de corte desenvolvida pelo Departamento de Zootecnia da Universidade Federal de Pelotas. As características foram mensuradas do 42º dia de idade até o 126º dia de produção, totalizando 545 fêmeas. Das 12 variáveis originais analisadas, apenas sete demonstraram potencial para serem mantidas em experimentos futuros, representando uma exclusão de 42%. A análise de componentes principais foi efetiva para a redução das variáveis estudadas e possibilitou a compreensão da relação e correlação dessas.(au)