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The objective of this study was to assess the genetic structure and diversity of six Santa Inês sheep flocks from the Central-Northern Brazil. A panel of 20 highly polymorphic and informative microsatellite loci was selected and amplified. The following parameters were obtained: overall mean of number of alleles = 15.4; expected heterozygosity (He) = 0.89; polymorphism information content (PIC) = 0.88; discriminatory capacity = 0.95; combined probability of identity = 1.50 × 10−34; and probability of exclusion = 1.00. The flocks with the lowest and the highest degrees of genetic variability were Farm 6 (He = 0.70, PIC = 0.653, and allelic richness [Ar] = 3.76) and Farm 1 (He = 0.89, PIC = 0.882, and Ar = 4.39), respectively. Indications of genetic bottleneck were observed in all flocks, as well as moderate genetic differentiation, with FST = 0.053, RST = 0.096, and Dest = 0.169. The migration rate in all flocks was high, with a trend towards Farm 1. This finding was not in agreement with the substructure found with the Bayesian admixture analysis and corroborated the array obtained with the principal component analysis and the clustering analysis. The results revealed moderate structuring and high genetic diversity in the flocks. However, management strategies should be reviewed, as evidence of bottleneck and genetic erosion was observed.(AU)

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This work aimed to verify if it is possible to select soybean genotypes tolerant to diseases and water stress. The experimental design was randomized blocks (RBD), with thirty soybean genotypes, in four replications, totaling 120 experimental units. Evaluations were performed based on crop yield components and disease incidence in thirty soybean cultivars in field conditions. Analysis of variance was performed at 5% probability using the F test. Variables that showed significance were compared using Scott-Knott's grouping of means at 5% probability. Pearson's linear correlation coefficients were calculated between pairs of variables, with significance imposed by the t test at 5% probability. The Euclidean distanceswere calculated and the UPGMA grouping was performed to construct the genetic dissimilarity dendrogram, after which the biplot principal components were used to identify the association trend between variables and cultivars. It was possible to select soybean genotypes for grain production and disease tolerance in an environment with water stress. Cultivars M 5947 IPRO, TEC 6702 IPRO, M 6410 IPRO showed the highest grain yield. The cultivar TEC 6702 IPRO showed the best agronomic performance for morphological and productive characteristics, associated with the lowest incidence of diseases.

Este trabalho teve como objetivo verificar se é possível selecionar genótipos de soja tolerantes a doenças e ao estresse hídrico. O delineamento experimental foi o de blocos casualizados (DBC), com trinta genótipos de soja, em quatro repetições, totalizando 120 unidades experimentais. As avaliações foram realizadas com base nos componentes de rendimento da cultura e na incidência de doenças em trinta cultivares de soja em ambiente de cultivo. A análise de variância foi realizada a 5% de probabilidade pelo teste F. As variáveis que apresentaram significância foram comparadas pelo agrupamento de médias de Scott-Knott a 5% de probabilidade. Os coeficientes de correlação linear de Pearson foram calculados entre pares de variáveis, com significância verificada pelo teste t a 5% de probabilidade. Foram calculadas as distâncias euclidianas e realizado o agrupamento UPGMA para a construção do dendrograma de dissimilaridade genética. Posteriormente, foram utilizados os componentes principais biplot para identificar a tendência de associação entre as variáveis e as cultivares. Foi possível selecionar genótipos de soja para produção de grãos e tolerância a doenças em ambiente com estresse hídrico. As cultivares M 5947 IPRO, TEC 6702 IPRO, M 6410 IPRO apresentaram as maiores produtividades de grãos. A cultivar TEC 6702 IPRO apresentou o melhor desempenho agronômico para características morfológicas e produtivas, associado à menor incidência de doenças.

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The objectives of this work were to estimate the genetic parameters for the traits longevity (LG) and accumulated milk yield at 305 days (MY305) using a bitrait animal model and the single-step GBLUP method and estimate the genetic gain for LG through direct and indirect selection for MY305. We used 4,057 records of first lactations of Murrah dairy buffaloes, collected between 1987 and 2020, belonging to six Brazilian herds located in the states Ceará, Rio Grande do Norte, and São Paulo and 960 animals genotyped using the 90K Axiom Buffalo Genotyping (Thermo Fisher Scientific, Santa Clara, CA) to estimate the genetic parameters. The heritability estimate was 0.25 for MY305 and 0.13 for LG. The genetic gain for LG was 0.13 months under direct selection, and 0.14 months under indirect selection, which results in a relative selection efficiency of 11% under selection for MY305 compared with the direct selection. The genetic correlation between the two traits was 0.77, indicating that animals with genetic potential for high MY305 tend to live longer. The genetic trends for MY305 and LG were 0.22 kg/year and 5.20 days/year, respectively, indicating a positive response, which reaffirms its relationship with the high genetic correlation between the two traits.(AU)

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A onça-pintada encontra-se classificada como "quase ameaçada" na lista vermelha de animais ameaçados da União Internacional para Conservação da Natureza (IUCN), com tendência ao declínio na América Latina, o que pode afetar o fluxo gênico elevando o risco de endogamia. Técnicas de reprodução assistida (TRAs) como colheita de sêmen e inseminação artificial (IA), são ferramentas que podem se tornar essenciais a manutenção da diversidade genética desses animais. A colheita de sêmen pode ser realizada por eletroejaculação (EEJ) ou colheita farmacológica (CF), sendo que podem ser aplicadas individualmente ou associadas, embora EEJ tenha se mostrado mais eficiente em inseminação artificial (IA) com sêmen a fresco. Para realização de IA a utilização de progestina oral (altrenogest), seguida da aplicação de gonadotropinas exógenas (Gonadotropina Coriônica equina-eCG e Hormônio Luteinizante suíno-pLH), tem se mostrado eficiente, promovendo ovulações consistentes. IA intratubárica (IA-IT) mostrou-se eficiente, tendo a vantagem de utilizar sêmen com baixo número de espermatozoides. O sucesso alcançado com o nascimento do primeiro filhote de Panthera onca utilizando TRAs se deve a vários fatores, dentre eles, a utilização de um novo protocolo hormonal ajustado à espécie; e a utilização da IA-IT, que possibilitou a utilização de sêmen com reduzido número de espermatozoides viáveis por inseminação.(AU)

The jaguar is classified as "near threatened" according International Union for Conservation of Nature red list, with a decreasing trend in the population of Latin America, increasing the risk of inbreeding. Assisted reproduction techniques (ARTs), such as semen collection and artificial insemination (AI), are tools that can become essential to maintain the genetic diversity of jaguars. Semen collection can be performed by electroejaculation (EEJ) or pharmacological collection (PC); and can be applied individually or associated, however EEJ was more efficient for artificial insemination (AI) with fresh semen. To perform Artificial Insemination (AI), oral progestin (altrenogest) followed exogenous gonadotropins (Gonadotropin Chorionic equine-eCG e Hormone Luteinizing porcine-pLH) application was efficient, promoting consistent ovulations. Similarly, laparoscopic oviductal insemination (IA-IT) was efficient, with the advantage to use low viable spermatozoa number by insemination. The success of jaguar cub birth using ARTs is due to several factors, among than, a new hormonal protocol adjusted to the species; and the use of IA-IT, which allowed the reduction in the number of sperm by insemination.(AU)

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This study aimed to introduce R package pedSimulate, which was built to simulate pedigree, genetic merit, phenotype, and genotype data. These are amongst the most important data types that animal breeders and quantitative geneticists deal with. Twenty pedigrees with ten generations were simulated applying different combinations of three parameters: genetic variance (10 vs. 20), proportion of males selected (10 vs. 20%), and the pattern for selecting females (random, positively, or negatively based on own phenotype or parent average). Males were selected positively based on parent average. Consequently, assortative mating was applied to the pedigrees in which females were positively selected based on their own phenotype or parent average. Disassortative mating was applied to the pedigrees in which females were selected negatively based on phenotype or parent averages. Genetic gain and response to selection over generations were positive for all the pedigrees due to high selection intensity on males, mating each male with multiple females, and moderate to high heritability (0.25 and 0.40 for genetic variances 10 and 20, and the residual variance of 30). Genetic variance showed a slightly increasing trend over generations by assortative mating and lower selection intensity on males. Selection intensity on females was the same in all the pedigrees. This study provided examples of how R package pedSimulate can be adopted for pedigree, genetic merit, phenotype, and genotype data simulation in animal breeding studies. By using different functions and combining different parameters for their arguments, many scenarios can be simulated by R package pedSimulate.(AU)

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In the last decades, a new trend to use more refined analytical procedures, such as artificial neural networks (ANN), has emerged to be most accurate, efficient, and extensively applied for mining and data prediction in different contexts, including plant breeding. Thus, this study was developed to establish a new classification proposal for targeting genotypes in breeding programs to approach classical models, such as a complete diallel and modern prediction techniques. The study was based on the standard deviation values of an interpopulation diallel and it also verified the possibility of training a neural network with the standardized genetic parameters for a discrete scale. We used 12 intercrossed maize populations in a complete diallel scheme (66 hybrids), evaluated during the 2005/2006 crop season in three different environments in southern Brazil. The implemented MLP architecture and other associated parameters allowed the development of a generalist model of genotype classification. The MLP neural network model was efficient in predicting parental and interpopulation hybrid classifications from average genetic components from a complete diallel, regardless of the evaluation environment.(AU)

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The objective of this work was to estimate genetic parameters and evaluate genetic trends over 26 years for morphometric traits in Mangalarga Marchador horses. Twelve morphometric traits were evaluated (withers and croup heights; length of head, body, shoulder, croup, neck, back, and loins; width of head and croup, and cannon bone and thorax perimeters). These traits were evaluated in 38,341 animals born between 1987 and 2012 and with a relationship matrix of 77,719 animals. Gibbs sampler was used to obtain samples of the posterior distributions of genetic parameters under animal models. Genetic trends were estimated by regression of estimated breeding values in function of birth year. The heritabilities of all traits were moderate to high and ranged from 0.27 to 0.48. However, the additive genetic coefficients of variation were low, ranging from 1.23 to 3.82%. The genetic trends of all the studied traits were significant, but of low magnitude. Negative genetic trend was observed for body length, while positive genetic trends were estimated for the other 11 traits. Although additive genetic differences accounted for a significant part of the phenotypic differences, genetic gains in the population were limited by low phenotypic variability. Therefore, it is necessary to develop data collection strategies to increase phenotypic and genetic variability in the population, such as the inclusion of animals that do not meet breed standard, but which have parents registered in the breeders' association, in the database.

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The objective of this study was to estimate the components of variance and genetic parameters of test-day milk yield in first lactation Girolando cows, using a random regression model. A total of 126,892 test-day milk yield (TDMY) records of 15,351 first-parity Holstein, Gyr, and Girolando breed cows were used, obtained from the Associação Brasileira dos Criadores de Girolando. To estimate the components of (co) variance, the additive genetic functions and permanent environmental covariance were estimated by random regression in three functions: Wilmink, Legendre Polynomials (third order) and Linear spline Polynomials (three knots). The Legendre polynomial function showed better fit quality. The genetic and permanent environment variances for TDMY ranged from 2.67 to 5.14 and from 9.31 to 12.04, respectively. Heritability estimates gradually increased from the beginning (0.13) to mid-lactation (0.19). The genetic correlations between the days of the control ranged from 0.37 to 1.00. The correlations of permanent environment followed the same trend as genetic correlations. The use of Legendre polynomials via random regression model can be considered as a good tool for estimating genetic parameters for test-day milk yield records.(AU)

O objetivo deste estudo foi estimar os componentes de variância e os parâmetros genéticos da produção de leite no dia do teste (TDMY) em vacas Girolando de primeira lactação, usando modelo de regressão aleatória. Foram utilizados 126.892 registros de produção de leite no dia controle de 15.351 vacas primíparas das raças Holandesa, Gir e Girolando, obtidas na Associação Brasileira dos Criadores de Girolando. Para estimar os componentes de (co) variância, as funções genéticas aditivas e de covariância ambiental permanente foram estimadas por regressão aleatória em três funções: Wilmink, polinômios de Legendre (terceira ordem) e polinômios splines lineares (três nós). A função polinomial de Legendre apresentou melhor qualidade de ajuste. As variâncias genéticas e de ambiente permanente para produção de leite no dia do controle variaram de 2,67 a 5,14 e de 9,31 a 12,04, respectivamente. As estimativas de herdabilidade aumentaram gradativamente do início (0,13) para o meio da lactação (0,19). As correlações genéticas entre os dias do controle variaram de 0,37 a 1,00. As correlações de ambiente permanente seguiram a mesma tendência das correlações genéticas. A utilização dos polinômios de Legendre via modelos de regressão aleatória pode ser considerada como uma boa ferramenta para estimação de parâmetros genéticos da produção de leite no dia do teste.(AU)

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The Colombian creole cattle breed Blanco Orejinegro (BON) is an important zoogenetic resource, but there is little knowledge about the genetic parameters and trends of its reproductive traits. Therefore, the aim of this study was to estimate parameters for the reproductive traits calving interval (CI), age at first calving (AFC), gestation duration (GD) and genetic trends for CI in the BON breed. Genealogy information from 7,799 animals was used, and employing the MTDFREML program, the components of the variance, heritability (h2), repeatability (rep), and estimated breeding values (EBV) for CI (n=3308), AFC (n=729), and GD (n=306) were estimated, in addition to the inbreeding coefficient (F) of the population. Genetic trends were established through linear regression using R software. Finally, the animals were classified as inbred (F > 0) and noninbred (F=0), and the effect of inbreeding on reproductive performance was established through a generalized linear model using the R program. An average F value of 4.41%±0.06 was observed. The h2 for CI was 0.11±0.03 with a rep of 0.15±0.04; for AFC, h2 was 0.00±0.05; and for GD, h2 was 0.00±0.08. The genetic trend for CI was -0.01 days/year. Finally, for CI, inbreeding depression was evident; this trait increased when inbreeding increased. These results indicate an important environmental influence on reproductive traits. The heritability estimate for CI suggests that little genetic progress could be achieved through selection. The evidence of inbreeding depression raises the need to control inbreeding to conserve this genetic resource.(AU)

O gado crioulo colombiano Blanco Orejinegro (BON) é um importante recurso zoogenético, mas ainda há desconhecimento sobre os parâmetros e tendências genéticas das características reprodutivas dessa raça. Portanto, o objetivo deste estúdio foi estimar parâmetros e tendências genéticas para características reprodutivas intervalo de partos (IDP), idade ao primeiro parto (IPP) e duração da gestação (DG) na raça BON. A informação da genealogia de 7,799 animais foi usada. Utilizando o programa MTDFREML foram estimados os componentes de variância, herdabilidade (h2), repetibilidade (rep) e valores genéticos (VGE), para IDP (n=3308), IPP (n=729) e DG (n=306), além do coeficiente de endogamia (F) na população. As tendências genéticas foram determinadas por regressão linear usando o software R. Finalmente, os animais foram classificados como endogâmicos (F > 0) e não endogâmicos (F=0) e o efeito da endogamia no desempenho reprodutivo foi determinado usando um modelo linear generalizado usando R. Observouse um F médio de 4,41%+0,06. A h2 para IDP foi 0,11±0,03 com uma repetibilidade de 0,15±0,04; para IPP a h2 foi 0,00 ± 0,05; e para DG a h2 foi 0,00 ± 0,08. A tendência genética para IDP foi -0,01 dias/ano. Finalmente, para o IDP, a depressão por endogamia foi evidente, aumentando o IDP com o aumento da endogamia. Os resultados indicam uma importante influência ambiental nas características reprodutivas. A herdabilidade estimada para o IDP sugere que pouco ganho genético pode ser alcançado através da seleção, embora a depressão endogâmica evidencie a necessidade de controlar a consanguinidade para conservar o recurso genético.(AU)

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As avaliações genéticas permitem compreender a evolução da raça e a importância dos componentes genéticos sobre a variação fenotípica das características de interesse de produção em animais. Objetivou-se, com este trabalho, estimar a tendência genética, a herdabilidade e a correlação genética para altura de cernelha e funcionalidade da marcha em equinos brasileiros da raça Campolina. A Associação Brasileira dos Criadores de Cavalo Campolina disponibilizou 107.630 dados de animais registrados desde 1951 até julho de 2016. As avaliações genéticas foram obtidas por modelo animal uni-característico, para altura de cernelha, com dados de 11.765 indivíduos, e bi-característico, para os atributos de qualidade de marcha, que são: comodidade, desenvolvimento, dissociação, estilo e regularidade, pertencentes a 2.148, 2.148, 2.145, 2.125 e 2.148 equinos, respectivamente. Incremento genético de 3,88cm foi observado para altura de cernelha ao longo dos anos, sugerindo a eficiência de seleção para porte elevado no Campolina. Não foi verificada evolução genética nos atributos de marcha, podendo indicar necessidade de melhoria nos processos de avaliação e seleção dos animais para maior comodidade e desenvoltura desse andamento. Verificou-se herdabilidade igual a 0,37 para altura de cernelha e 0,77 para dissociação, além de herdabilidades de comodidade, desenvolvimento, estilo e regularidade iguais a 0,15, 0,23, 0,22 e 0,28. Os resultados indicam que essas características podem ser utilizadas como critério de seleção para melhor qualidade de marcha. As correlações genéticas verificadas entre a medida linear e todos os atributos de marcha foram de baixa magnitude, variando entre -0,01 e 0,05. Desta forma, é sugerido que a seleção para altura na cernelha exerce baixa influência sobre os ganhos genéticos em atributos de marcha.

Genetic evaluations allow to describe the genetic evolution of a breed and to understand the importance of the genetic variability on the phenotypic variance of a production interesting trait. This study aimed to estimate genetic tendency, heritability and genetic correlation for withers height and gait functionality traits in Brazilian Campolina horses. The Brazilian Association of Campolina Horse Breeders provided 107,630 records from registered animals born from 1951 until July 2016. Genetic evaluations were obtained by uni-trait animal model, for withers height using data from 11,765 individuals, and bi-trait models for attributes of gait quality: comfort, reach, dissociation, style and regularity, belonging to 2,148, 2,148, 2,145, 2,125 and 2,148 horses, respectively. A genetic increase of 3.88cm was observed for withers height over the years, suggesting the efficiency of selection for high height in Campolina. There was no genetic evolution in the gait attributes, which may indicate the need for improvement in the evaluation and selection processes of the animals for greater comfort and range of their gait. Heritability equal to 0.37 and 0.77 was observed for withers height and dissociation. Comfort, reach, style and regularity showed heritabilities of 0.15; 0.23; 0.22 and 0.28, respectively. The results indicate that these characteristics can be used as selection criteria for better gait quality. The genetic correlations observed between the linear measurement and all gait attributes were low varying between -0.01 and 0.05. Therefore, the selection for withers height would have little influence on the genetic gains in gait attributes.

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Lower respiratory tract infections (LRTIs) caused by Pseudomonas aeruginosa are the most common infection among hospitalized patients, associated with increased levels of morbidity, mortality and attributable health care costs. Increased resistant Pseudomonas worldwide has been quite meaningful to patients, especially in intensive care unit (ICUs). Different species of Pseudomonas exhibit different genetic profile and varied drug resistance. The present study determines the molecular epidemiology through DNA fingerprinting method and drug resistance of P. aeruginosa isolated from patients with LTRIs admitted in ICU. A total of 79 P. aeruginosa isolated from patients with LRTIs admitted in ICU were characterized by Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP), Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) and Repetitive Extrapalindromic PCR (REP-PCR). Antibiotic resistance was determined by minimum inhibitory concentration (MIC) assay while MDR genes, viz, blaTEM, blaOXA, blaVIM, blaCTX-M-15 were detected by polymerase chain reaction (PCR). Of the 137 Pseudomonas sp isolated from ICU patients, 57.7% of the isolates were reported to be P. aeruginosa. The overall prevalence of P. aeruginosa among the all included patients was 34.5%. The RAPD analysis yielded 45 different patterns with 72 clusters with 57% to 100% similarity level. The RFLP analysis yielded 8 different patterns with 14 clusters with 76% to 100% similarity level. The REP PCR analysis yielded 37 different patterns with 65 clusters with 56% to 100% similarity level. There was no correlation among the different DNA patterns observed between the three different methods. Predominant of the isolates (46.8%) were resistant to amikacin. Of the 79 isolates, 60.8% were positive for blaTEM gene and 39.2% were positive for blaOXA gene. P. aeruginosa was predominantly isolated from patients with LRTIs admitted in ICU. The difference in the similarity level observed between the three DNA fingerprinting methods indicates that there is high inter-strain variability. The high genetic variability and resistance patterns indicates that we should continuously monitor the trend in the prevalence and antibiotic resistance of P. aeruginosa especially in patients with LRTIs admitted in ICU.

Infecções do trato respiratório inferior (ITRIs) são as infecções mais comuns entre pacientes internados em unidade de terapia intensiva (UTI). Pseudomonas aeruginosa é a causa mais comum de ITRIs e está associada ao aumento da mortalidade. Diferentes espécies de Pseudomonas exibem diferentes perfis genéticos e resistência variada as drogas. O presente estudo determina a epidemiologia molecular através do método de fingerprinting de DNA e resistência as drogas de P. aeruginosa isoladas de pacientes com LTRIs internados em UTI. Um total de 79 P. aeruginosa isoladas de pacientes com ITRIs internados em UTI foram caracterizados por Polimorfismo de Comprimento de Fragmentos de Restrição (RFLP), DNA Polimórfico Amplificado ao Acaso (RAPD) e PCR Extrapalindrômico Repetitivo (REP-PCR). A resistência aos antibióticos foram determinadas pelos ensaios de concentrações inibitória mínima (MIC), enquanto os genes MDR, blaTEM, blaOXA, blaVIM, blaCTX-M-15 foram detectados pela reação em cadeia da polimerase (PCR). Das 137 Pseudomonas sp isoladas de pacientes de UTI, 57,7% dos isolados foram relatados como P. aeruginosa. A prevalência geral de P. aeruginosa entre os pacientes incluídos foram de 34,5%. A análise RAPD renderam 45 padrões diferentes com 72 clusters com nível de similaridade de 57% a 100%. A análise RFLP renderam 8 padrões diferentes com 14 clusters com 76% a 100% de similaridade. A análise de PCR do REP produziram 37 padrões diferentes com 65 clusters com nível de similaridade de 56% a 100%. Não houveram correlações entre os diferentes padrões de DNA observados entre os três diferentes métodos. Predominantes dos isolados (46,8%) eram resistentes à amicacina. Dos 79 isolados, 60,8% foram positivos para o gene blaTEM e 39,2% foram positivos para o gene blaOXA. P. aeruginosa foi predominantemente isolado de pacientes com ITRIs internados em UTI. A diferença no nível de similaridade observado entre os três métodos de fingerprinting do DNA indica que há alta variabilidade inter-strain. A alta variabilidade genética e os padrões de resistência indicam que devemos monitorar continuamente a tendência na prevalência e resistência a antibióticos de P. aeruginosa, especialmente em pacientes com ITRIs internados em UTI.

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The aim of this study was to estimate genetic parameters and genetic trends for reproductive traits in Wistar rats. A total of 1,167 data records from 283 females over six generations of monogamous mating pairs was used. Heritability and genetic correlation were estimated through Bayesian inference and genetic trends were calculated by linear regression of breeding values over generations. Heritability estimates for litter size at birth (LS), calving interval (CI), pup mortality (PM) and maternal cannibalism (CAN) presented low magnitude, ranging from 0.01 to 0.13. CAN presented high and positive genetic correlation with LS and PM (0.77 and 0.78, respectively). On the other hand, all the other estimated genetic correlations were not significant. Genetic trend was positive for LS (+0.0900 pups per generation), and negative for PM and CAN (-1.0085 and -0.5217 pups per generation, respectively). For CI the genetic trend was not significant. It is recommended to increase selection intensity on dams in this Wistar rat population in order to accelerate the genetic progress.(AU)

O objetivo deste estudo foi estimar os parâmetros genéticos e as tendências genéticas de características reprodutivas em ratos Wistar. Foram analisados 1.167 registros coletados em 283 fêmeas ao longo de seis gerações de pares de acasalamentos monogâmicos. Herdabilidade e correlação genética foram estimadas por meio de inferência bayesiana, e as tendências genéticas foram calculadas pela regressão linear dos valores genéticos em função das gerações. As estimativas de herdabilidades para as características número de filhotes nascidos (LS), intervalo de parto (CI), mortalidade de filhotes (PM) e canibalismo materno (CAN) foram de baixa magnitude (0,01 a 0,13). CAN apresentou correlação genética alta e positiva com LS e PM, 0,77 e 0,78, respectivamente. As demais correlações genéticas estimadas foram não significativas. A tendência genética foi positiva para LS (+0,0900 filhote por geração) e negativa para PM e CAN (-1,0085 e -0,5217 filhote por geração, respectivamente). A tendência genética não foi significativa para CI. Recomenda-se aumentar a intensidade de seleção nas fêmeas nessa população de ratos Wistar, a,fim de acelerar o progresso genético.(AU)

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The present investigation aimed to evaluate the population structure and inbreeding of Holstein herds in southern Brazil. To carry out the analysis, the Associação Paranaense de Criadores de Bovinos da Raça Holandesa (APCBRH) in Brazil provided the data, which consisted of a pedigree file of 206,796 animals born between 1970 and 2014. Results regarding the following parameters were determined: pedigree integrity, effective number of founders, effective number of ancestors, generation interval, inbreeding coefficient, realized effective population size, and average relatedness coefficient. POPREP and ENDOG v.4.5 software packages were employed to estimate these parameters. Based on the data set, the mean generation interval was found to be 6.3 years, and the average inbreeding coefficient, related to inbred animals, was 4.99%. Furthermore, the realized effective population size varied throughout the time period, ranging from 22 to 114, whereas the rate of inbreeding in this same period showed a decreasing trend towards the later years in the period until 2014. Upon evaluation, average relatedness coefficient was estimated to be 0.71%. Moreover, the effective number of founders and ancestors were estimated as 418 and 400 animals, respectively. According to the level of inbreeding observed, it could be noticed that genetic diversity remains elevated, which will be important to the genetic progress in the Holstein breeding program in Southern Brazil.(AU)

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A defumação é um processo rotineiramente empregado nos alimentos como técnica de conservação, e uma maneira de proporcionar as características sensoriais específicas. Entretanto, o processo pode levar à formação de hidrocarbonetos policíclicos aromáticos (HPAs), que são compostos com dois ou mais anéis aromáticos condensados, alguns deles considerados carcinogênicos, mutagênicos e teratogênicos. Estudos em diversos países indicam que a contaminação de produtos cárneos defumados por diferentes HPAs é elevada e frequente, e desta maneira pode apresentar risco à saúde humana. O Brasil tem sido um dos maiores consumidores de carne no mundo, com tendência de aumentar o consumo de alimentos processados, e não é conhecida a real exposição da população aos HPAs pela ingestão de produtos cárneos defumados. Não há dados nacionais recentes quanto à contaminação destes alimentos com estes produtos. Considerando este panorama, o presente trabalho tem como objetivo realizar a revisão das principais metodologias analíticas, dos aspectos regulatórios e dos níveis de HPAs detectados em produtos cárneos defumados. Ademais, são apresentadas as maneiras de reduzir a contaminação dos alimentos por estes compostos.

Smoking is a common process employed in food as a conservation technique, as well as to provide the specific sensory characteristics. However, the process can lead to the formation of polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs), which are composed of two or more fused aromatic rings, and some of them are considered carcinogenic, mutagenic and teratogenic. Studies conducted in several countries indicate that contamination of smoked meat products by different PAHs is high and frequent, and it may cause a risk to human health. Although Brazil has been one of the largest consumers of meat in the world, with a trend to increase the consumption of processed foods, it has not known the real population exposure to PAHs by consuming the smoked meat products. There is no recent national data on the contamination of these foods. Considering this scenario, this study aimed at reviewing the main analytical methodologies, the regulatory aspects and the levels of PAHs found in the smoked meat products. In addition, the forms to reduce the contamination by these compounds are presented.

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This study aimed to estimate the components of (co)variance, genetic and phenotypic parameters and trends for birth weight. We used 783 birth weight records, between 2012 to 2016, of Texel sheep reared in extensive system. The components of (co)variance and the genetic parameters were estimated using six different animal models, using the restricted maximum likelihood method (REML). The model that best fit the data was Model 3, with estimates of direct additive genetic variance of 0.004, maternal permanent environment variance of 0.164, heritability coefficient of 0.011 and phenotypic variation attributed to the maternal permanent environment of 0.394. For the genetic trend, we observed a genetic gain of 0.413% and for the phenotypic trend, a phenotypic gain of 0.159 kg, between 2012 and 2016 were found. Estimates of direct heritability and proportion of the phenotypic variance explained by the maternal permanent environment presented lower and higher values, respectively, in comparison to other studies. For trends, both genetic and phenotypic, there were gains in birth weight between 2012 and 2016.

Este trabalho foi realizado para estimar os componentes de (co)variância, parâmetros e tendências genéticas e fenotípicas do peso de ovinos da raça Texel, ao nascimento. Foram utilizados 783 registros de peso ao nascimento, entre os anos de 2012 a 2016, de ovinos criados em sistema extensivo. Foram estimados os componentes de (co)variância e os parâmetros genéticos com seis diferentes modelos animais, utilizando o método da máxima verossimilhança restrita (REML - Restricted Maximum Likelihood). O modelo que melhor se ajustou aos dados foi o modelo 3, com estimativas de variância genética aditiva direta de 0,004, variância do ambiente permanente materno de 0,164, coeficiente de herdabilidade de 0,011 e variação fenotípica atribuída ao ambiente permanente materno de 0,394. Foram constatados para a tendência genética um ganho genético de 0,413% e um ganho fenotípico de 0,159 kg para a tendência fenotípica, entre os anos de 2012 a 2016. As estimativas de herdabilidade direta e da proporção da variância fenotípica explicada pelo ambiente permanente materno apresentaram valores inferiores e superiores, respectivamente, em comparação a outros estudos. Para as tendências, tanto genética, como fenotípica, houve ganho no peso ao nascimento, entre os anos de 2012 a 2016.

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A região Centro-Oeste tem se destacado como produtora de carne bovina e, para tanto, produzir com eficiência tem sido a meta dos produtores. Nesse sentido, objetivou-se estimar parâmetros e tendências genéticas para pesos aos 240 (P240) e 420 (P420) dias de idade em bovinos da raça Nelore, criados na região de Goiás, Brasil. Utilizaram-se 48.580 dados para P240 e 28.685 para P420. Os parâmetros genéticos foram obtidos por análises univariadas em que o modelo continha os efeitos fixos de grupo de contemporâneos (estação de nascimento - águas e seca -, ano de nascimento, sexo e fazenda) e a covariável idade da vaca. Como efeito aleatório, utilizou-se o efeito aditivo direto e materno para P240 e apenas direto para P420. As tendências genéticas foram obtidas por meio da análise de regressão do valor genético do animal sobre ano de nascimento. Os resultados obtidos de herdabilidade direta foram 0,15 ± 0,02 para P240 e 0,24 ± 0,00 para P420. O ganho genético anual foi de 0,274 kg para P240 e de 0,506 kg P420. Os resultados indicam a possibilidade de se obterem maiores ganhos genéticos por meio da seleção, que está sendo mais eficiente sobre o P420.

The Midwest region has excelled as a beef producer and producing efficiently has been the goal of livestock farmers. This study aimed to estimate the genetic parameters and trends for weights at 240(W240) and 420(W420) days of age in Nellore cattle, reared in Goias state, Brazil. A total of 48,580 data for W240 and 28,685 for W420 were used. Genetic parameters were obtained by univariate analysis. The model included the fixed effects of contemporary group (birth season-dry and wet-, year of birth, sex and farm) and covariate age of cow. Direct and maternal effects were used as random effect for W240 and the direct effect for W420. The genetic trends were obtained by regression analysis of the genetic value of the animal on the year of birth. The results of direct heritability were 0.15 ± 0.02 for W240 and 0.24 ± 0.00 for W420. The annual genetic gain was 0.311 kg for W240 and 0.511 kg for 420 days of age (W420). The results indicate the possibility of obtaining higher genetic gains through selection; however, the selection is being more efficient at W420.

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The objective of this study was to compare the goodness of fit of lactation curve models; Wood, Wilmink, Linear Splines (SPL), Cubic Splines (SPC), Quadratic Splines (SPQ), Cobby and Le Du, Ali Schaeffer and Legendre Polynomial (LEG), in random regression model (RRM) for milk production traits of Iranian Holstein dairy cattle. For this purpose the records obtained from Test-day (TD) regarding milk (928513), fat (788577) and protein (653317) yields related to their first parity were used. These data collected from the years of 2003 to 2011 by the Karaj breeding center of Iran. The genetic parameters were estimated using REML method using WOMBAT software. Based on obtained results, RRM with SPL6 (6,6), SPC6 (6,6) and LEG (3,5) for milk yield, SPL6 (6,6), SPQ6 (6,6), LEG (3,5) for fat yield and SPL5 (5,5), SPQ4 (4,4) and LEG (3,4) for protein yield, were selected as better model to describe the lactation curves. The estimated heritabilities by best models were lower in the beginning lactation than other during lactation. The genetic trend of milk yields was showed an increasing during the 10 past years, which indicated Iranian Holstein dairy cattle population genetically was improved for milk yields.

O objetivo deste estudo foi comparar a qualidade de ajustes dos modelos da curva de lactação, Wood Wilmink, Spline Linear (SPL), Spline Cúbico (SPC), Spline Quadrático (SPQ), Cobby e Le Du, Ali Schaeffer e os Polinômios de Legendre (LEG), em um modelo de regressão aleatória (RRM) para as características da produção de leite do gado Holstein iraniano. Para este propósito os registros obtidos no teste, foram referentes ao leite (928513), gordura (788577) e proteína (653317) e os rendimentos relacionados as suas primeiras paridades foram usadas. Estas informações foram coletadas durante 2003 até 2011 por Kraj em um centro de criação no Iran. Os parâmetros genéticos foram estimulados usando o método REML WOMBAT. Baseado nos resultados obtidos, RRM com SPL6 (6.6), SPC6 (6,6) e LEG (3,5) por produção de leite, foram selecionados os melhores modelos para descrever as curvas de lactação. A hereditariedade estimada por esses melhores modelos foi menor no início da lactação do que durante outra lactação. A tendência genética da produção de leite mostrou um aumento ao longo de 10 anos, na qual indicou o melhoramento genético do gado Holstein Iraniano no que diz respeito à produção de leite.

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Viveiros e tanques-rede são os sistemas de cultivo mais comuns utilizados para a criação de tilápias do Nilo. Entretanto, problemas como escassez de água, predadores e baixa qualidade da água são recorrentes nesse tipo de ambiente. RAS e BFT existem como opção de sistemas de cultivo fechados pouco afetados pelas variações ambientais, que permitem maior controle dos parâmetros de qualidade da água, biossegurança além de provocar menos impacto ambiental. Programas de melhoramento genético em BFT e RAS surgem como necessidade para se ajustar aos requisitos cada vez mais incidentes no âmbito de produção sustentável. Características relacionados ao peso de tilápias são o principal critério de seleção em programas de melhoramento de tilápias. Informações sobre parâmetros genéticos para rendimento de carcaça são escassos até o momento. A resposta indireta é uma estratégia utilizada para obter ganhos genéticos em fenótipos que não são critérios de seleção por meio de correlações genéticas existentes, herdabilidade e intensidade de seleção. A tendência genética dos pesos corporais nas idades padrão foi crescente para todas as características de pesos. Para rendimentos de carcaça as respostas apresentaram-se próximas a zero. A tendência genética representa ganho genético acumulado ao longo do período estudado de 56% para P56, 45% para P168BFT, 16% para P168RAS, 43% para P224BFT, 9% para P224RAS e nulos para RCARBFT e RCARRAS. Para P56, P168 e P224 as respostas indicaram que a mudança genética está sendo alcançada na direção pretendida em BFT e RAS, e que estas são opções de cultivo sustentáveis e promissoras para o ganho de peso de tilápias do Nilo cultivadas até 224 dias de idade O critério de seleção não deve ser o peso aos 168 dias quando o objetivo for a resposta correlacionada em rendimento de carcaça em sistemas BFT ou RAS.

Ponds and net cages are the most common farming systems used to raise Nile tilapia. However, problems such as water scarcity, predators and low water quality are recurrent in this type of environment. RAS and BFT exist as an option for closed cropping systems little affected by environmental variations, which allow greater control of water quality parameters, biosecurity, in addition to causing less environmental impact. Genetic improvement programs in BFT and RAS emerge as a need to adjust to the requirements increasingly incident in the scope of sustainable production. Characteristics related to tilapia weight are the main selection criteria in tilapia breeding programs. Information on genetic parameters for carcass yield is scarce so far. The indirect response is a strategy used to obtain genetic gains in phenotypes that are not selection criteria through existing genetic correlations, heritability and selection intensity. The genetic trend of body weights at standard ages was increasing for all weight traits. For carcass yields, the responses were close to zero. The genetic trend represents accumulated genetic gain over the studied period of 56% for P56, 45% for P168BFT, 16% for P168RAS, 43% for P224BFT, 9% for P224RAS and null for RCARBFT and RCARRAS. For P56, P168 and P224 the responses indicated that the genetic change is being achieved in the intended direction in BFT and RAS, and that these are sustainable and promising culture options for the weight gain of Nile tilapia cultivated up to 224 days of age. Selection criterion should not be weight at 168 days when the objective is the correlated response in carcass yield in BFT or RAS systems

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A raça Braford possui uma boa adaptação ao ambiente próprio de países com climas subtropicais, o que a torna apta, pelas características de rusticidade e resistência, a parasitas, principalmente a carrapatos. Desde a criação e a disseminação da raça, a seleção feita por parte do homem foi causando mudanças na estrutura genética da população base. Assim, é de suma importância avaliar o pedigree dos animais para estimar o grau de variabilidade genética na população e auxiliar na tomada de decisões no planejamento de acasalamentos entre indivíduos. O objetivo deste estudo consiste em analisar a evolução da estrutura populacional e a diversidade genética dos animais da raça Braford pertencentes aos países da Argentina, do Uruguai, do Paraguai e da Austrália nascidos entre os anos 1949 e 2019. A base de dados genealógicos foi dividida em três populações: a população histórica com 358,041 animais vivos e mortos, a população atual com 115,757 animais vivos e a população de referência com 16,704 animais com a primeira geração conhecida. As análises do pedigree mostraram que a porcentagem de touros aumentou historicamente. O intervalo geracional médio diminuiu para 11,78 anos na população atual. A endogamia média (F) e a coancestria (C) foram baixas e mostraram uma tendência historicamente crescente (0,001% a 0,002%, respectivamente). O grau de acasalamento não aleatório () aumentou de -0,0001 para 0,0001, denotando uma mudança na tendência de acasalamento entre indivíduos semelhantes. O coeficiente de parentesco médio (R) aumentou no período atual de 0,002% para 0,004%. Um único ancestral explicou 4,55% a 7,22% do pool genético da população. Enquanto o tamanho efetivo da população com base na taxa de endogamia individual (NeFi) foi de 462,963, quando foi baseado na taxa de coancestria individual (NeCi), foi de 420,168. A perda de diversidade genética foi pequena e atribuída principalmente a gargalos (0,12%) e a contribuições desiguais dos fundadores (0,02%). Mesmo que níveis adequados de diversidade possam ser encontrados, práticas que considerem o uso excessivo de touros individuais (condicionados pela natureza ou não) podem levar a uma redução da diversidade a longo prazo. Os presentes resultados permitem adequar estratégias de manejo genético adaptadas às necessidades que a população demanda nos diferentes países.

The Braford breed has a good adaptation to the environment of countries with subtropical climates, which makes it suitable for the characteristics of rusticity and resistance to parasites, mainly to ticks. Since the creation and dissemination of the breed, the selection made by man has caused changes in the genetic structure of the base population, it is of paramount importance to evaluate the pedigree of the animals to estimate the degree of genetic variability in the population and to assist in the decision making when time to plan mating between individuals. The objective of this study is to analyze the evolution of the population structure and genetic diversity of Braford animals from the countries of Argentina, Uruguay, Paraguay and Australia born between the years 1949 to 2019. The genealogical database was divided into three populations; the historical population with 358,041 live and dead animals, the current population with 115,757 living animals and the reference population with 16,704 animals with the first known generation. Pedigree analyzes have shown that the percentage of bulls has historically increased. The average generational gap has decreased to 11.78 years for the current population. Mean inbreeding (F) and coancestry (C) were low and showed a historically increasing trend (0.001% to 0.002%, respectively). The degree of nonrandom mating () increased from -0.0001 to 0.0001, denoting a change in the mating tendency between similar individuals. The average kinship coefficient (R) increased in the current period from 0.002% to 0.004%. A single ancestor explained 4.55% to 7.22% of the population gene pool. While the effective population size based on the individual inbreeding rate (NeFi) was 462,963, when based on the individual coancestry rate (NeCi), it was 420,168. The loss of genetic diversity was small and mainly attributed to bottlenecks (0.12%) and uneven contributions from founders (0.02%). Even if adequate levels of diversity can be found, practices that consider the excessive use of individual bulls (conditioned by nature or not) can lead to a reduction in diversity in the long term. The present results allow adapting genetic management strategies adapted to the needs that the population demands in different countries.

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A necrose da cabeça do fêmur está presente em grande parte dos plantéis avícolas, impactando tanto o campo quanto a indústria, tendo em vista alguns fatores de risco potenciais no surgimento da lesão em aves de corte, como desafio sanitário e baixo desempenho zootécnico. Com o objetivo de quantificar o aparecimento da lesão de necrose femoral nos frangos pesados e analisar quais variáveis sanitárias e zootécnicas dos lotes têm maior impacto para ocorrência dessa patologia, foram avaliados 229 lotes de frango de corte durante 12 meses. Os dados coletados foram examinados e submetidos a uma classificação de escores de 0 (ausente) a 3 (necrose femoral grave bilateral) em cada frango, conforme grau de lesão apresentado. Na sequência, foram realizadas análises descritivas (média e desvio padrão) e distribuições de normalidade e frequência foram geradas para caracterizar a ocorrência da lesão de necrose da cabeça do fêmur (procedimento UNIVARIATE e FREQ). Foram realizadas regressão logística e análise caminhos para determinar a associação da lesão de NCF com as demais variáveis zootécnicas e sanitárias. A significância foi definida como P 0,05 para todos os testes considerados uma tendência estatística. As condenações por artrite e septicemia tiveram resultado de maior relevância, assim como a contaminação bacteriana e idade das matrizes. Os demais indicadores sanitários e zootécnicos não interferiram na intensidade de escore de lesão. Isto sugere que haja interferência de fatores genéticos ou nutricionais que, apesar não serem analisados neste estudo, potencialmente tem um importante papel na ocorrência dessa patologia osteoarticular.

Femoral head necrosis is present in most poultry farms, impacting both the field and the industry, considering some potential risk factors for the appearance of this lesion in broilers, such as sanitary challenge and low zootechnical performance. In order to quantify the occurrence of femoral necrosis in heavy broilers and analyse which sanitary and zootechnical have the greatest impact on the occurrence of this pathology, 229 broiler flocks were evaluated during 12 months. The collected data were examined and submitted to a score classification from 0 (absent) to 3 (bilateral severe femoral necrosis), according to the degree of lesion. Descriptive statistics were performed and normality and frequency distributions were generated to characterize the occurrence of femoral head necrosis lesion (UNIVARIATE and FREQ procedure). Logistic regression and path analysis were performed to determine the association of NCF injury with other zootechnical and health variables. Significance was defined as P 0.05 for all tests considered a statistical trend. Condemnation due to arthritis and septicemia were variables with relevant results, as well as bacterial contamination and age of matrices. Other sanitary and zootechnical indicators did not significantly interfered in the severity of femoral lesions This data suggests that other variables related to genetic or nutritional factors, although not analysed in this study, it, it may potentially have an important role in the occurrence of this osteoarticular pathology.