Resumo
The species of Hypostomus from the Parnaíba River basin were reviewed through molecular and morphological analysis. Five species were found in the basin, including a new species herein described. The distribution of H. pusarum was expanded to this basin, and a closely related species was recorded (H. aff. pusarum), also the presence of H. johnii and H. vaillanti was confirmed. The new species is distinguished from most congeners by its large number of premaxillary and dentary teeth, a wide dental angle of 115° to 135°, presence of a rounded dark spots on a lighter background and anteromedial region of the abdomen depleted of plaques (vs. anteromedial region of the abdomen covered by platelets and odontodes in H. johnii, H. pusarum, H. aff. pusarum and H. vaillanti). Furthermore, an identification key of the species from the Maranhão-Piauí ecoregion and maps with the geographic distribution of these species are presented. The species of Hypostomus in the Parnaíba River basin have different geographic distributions, suggesting different niches or geographical barriers, providing an opportunity for ecological and evolutionary studies.(AU)
As espécies de Hypostomus da bacia do rio Parnaíba foram revisadas por meio de análises moleculares e morfológicas. Cinco espécies foram encontradas na bacia, incluindo uma nova espécie aqui descrita. A distribuição de H. pusarum foi expandida para esta bacia, uma espécie intimamente relacionada foi registrada (H. aff. pusarum), e a presença de H. johnii e H. vaillanti foi confirmada. A nova espécie se distingue da maioria das congêneres por seu grande número de dentes nos pré-maxilares e dentários, um amplo ângulo do dentário de 115° a 135°, presença de manchas escuras arredondadas em um fundo mais claro e região anteromedial do abdômen sem placas (vs. região anteromedial do abdômen coberta por placas e odontódios em H. johnii, H. pusarum, H. aff. pusarum e H. vaillanti). Além disso, é apresentada uma chave de identificação das espécies da ecorregião Maranhão-Piauí e mapas com a distribuição geográfica dessas espécies. As espécies de Hypostomus na bacia do rio Parnaíba apresentam diferentes distribuições geográficas, sugerindo diferentes nichos ou barreiras geográficas, proporcionando oportunidade para estudos ecológicos e evolutivos.(AU)
Assuntos
Animais , Peixes-Gato/classificação , Peixes-Gato/genética , Brasil , Biodiversidade , Código de Barras de DNA Taxonômico/veterinária , Anotação de Sequência MolecularResumo
Life-history, geographical barriers, and damming can shape the genetic diversity of freshwater migratory fish, which are particularly vulnerable to anthropogenic impacts. We investigated the genetic diversity of Salminus brasiliensis, a long-distance migratory species that is recognized as an important provider of ecosystem services. We implemented microsatellite analyses to assess genetic diversity and simulate future scenarios for evaluating the long-term viability of dammed and non-dammed populations from the Uruguay River. High levels of genetic diversity were detected for all sampled populations. However, effective population sizes were lower in the uppermost river stretches, where the landscape is highly fragmented. Population structure analysis indicated two spatial genetic populations. It is suggested that this genetic structure preserves populations partially isolated by an ancient natural barrier, instead of being a result of the presence of dams. The simulated genetic scenarios indicated that genetic variability of S. brasiliensis populations from upstream dams could collapse over the years, mainly due to the reduction in the number of alleles. Therefore, besides helping to better understand issues related to the influence of dams on the genetic diversity of migratory fish, our results are especially relevant for driving local fishery policies and management actions for the species conservation.'
História de vida, barreiras geográficas e barramento dos rios podem moldar a diversidade genética de grandes peixes migratórios de água doce, que são particularmente vulneráveis a impactos antrópicos. Nós investigamos a diversidade genética de Salminus brasiliensis, uma espécie migratória de longa distância que é reconhecida como um importante provedor de serviços ecossistêmicos. Realizamos análises de microssatélites para avaliar a diversidade genética e simular cenários futuros, possibilitando estimar a viabilidade em longo prazo de populações situadas em regiões com e sem represas do rio Uruguai. Altos níveis de diversidade genética foram detectados para todas as populações amostradas. Contudo, os tamanhos populacionais efetivos foram menores nos trechos superiores do rio, onde a paisagem é altamente fragmentada. A análise da estrutura populacional indicou duas populações genéticas espaciais. Sugere-se que esta estrutura genética preserva populações parcialmente isoladas por uma antiga barreira natural, ao invés de ser resultado da presença de barragens. Os cenários genéticos simulados indicaram que a variabilidade genética das populações de S. brasiliensis situadas a montante das barragens entraria em colapso ao longo dos anos, principalmente como resultado da redução do número de alelos. Portanto, além de ajudar a entender melhor questões relacionadas à influência de barragens na diversidade genética de peixes migradores, nossos resultados são especialmente relevantes para a condução de políticas pesqueiras locais e ações de manejo para a conservação das espécies.(AU)
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Animais , Variação Genética , Ecossistema , Caraciformes , Peixes , Previsões , Barragens , Estruturas GenéticasResumo
Life-history, geographical barriers, and damming can shape the genetic diversity of freshwater migratory fish, which are particularly vulnerable to anthropogenic impacts. We investigated the genetic diversity of Salminus brasiliensis, a long-distance migratory species that is recognized as an important provider of ecosystem services. We implemented microsatellite analyses to assess genetic diversity and simulate future scenarios for evaluating the long-term viability of dammed and non-dammed populations from the Uruguay River. High levels of genetic diversity were detected for all sampled populations. However, effective population sizes were lower in the uppermost river stretches, where the landscape is highly fragmented. Population structure analysis indicated two spatial genetic populations. It is suggested that this genetic structure preserves populations partially isolated by an ancient natural barrier, instead of being a result of the presence of dams. The simulated genetic scenarios indicated that genetic variability of S. brasiliensis populations from upstream dams could collapse over the years, mainly due to the reduction in the number of alleles. Therefore, besides helping to better understand issues related to the influence of dams on the genetic diversity of migratory fish, our results are especially relevant for driving local fishery policies and management actions for the species conservation.'
História de vida, barreiras geográficas e barramento dos rios podem moldar a diversidade genética de grandes peixes migratórios de água doce, que são particularmente vulneráveis a impactos antrópicos. Nós investigamos a diversidade genética de Salminus brasiliensis, uma espécie migratória de longa distância que é reconhecida como um importante provedor de serviços ecossistêmicos. Realizamos análises de microssatélites para avaliar a diversidade genética e simular cenários futuros, possibilitando estimar a viabilidade em longo prazo de populações situadas em regiões com e sem represas do rio Uruguai. Altos níveis de diversidade genética foram detectados para todas as populações amostradas. Contudo, os tamanhos populacionais efetivos foram menores nos trechos superiores do rio, onde a paisagem é altamente fragmentada. A análise da estrutura populacional indicou duas populações genéticas espaciais. Sugere-se que esta estrutura genética preserva populações parcialmente isoladas por uma antiga barreira natural, ao invés de ser resultado da presença de barragens. Os cenários genéticos simulados indicaram que a variabilidade genética das populações de S. brasiliensis situadas a montante das barragens entraria em colapso ao longo dos anos, principalmente como resultado da redução do número de alelos. Portanto, além de ajudar a entender melhor questões relacionadas à influência de barragens na diversidade genética de peixes migradores, nossos resultados são especialmente relevantes para a condução de políticas pesqueiras locais e ações de manejo para a conservação das espécies.(AU)
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Animais , Variação Genética , Ecossistema , Caraciformes , Peixes , Previsões , Barragens , Estruturas GenéticasResumo
Titi monkeys (family Pitheciidae) are Neotropical primates highly diversified in morphology, ecology and genetics, with a wide geographic distribution, including the Amazon, Atlantic Forest, Cerrado, Pantanal and Caatinga. This diversity, together with knowledge gaps, generates uncertainties in titi monkey taxonomy and distribution. An example is Plecturocebus baptista, with only 14 occurrence records and an ill-defined distribution based on untested geographical barriers. Here, we report the occurrence of this species at a new locality outside its known range, across the Paraná-Urariá River, which was considered a distributional limit for the species. The new record implies an overlap of P. baptista with the range of P. hoffmannsi. We document the sighting of an apparent hybrid animal. Our observations suggest that i) the distribution of P. baptista needs to be reviewed, and ii) the evolutionary relationships between P. baptista and P. hoffmannsi may be more complex than previously assumed. Since both species share contiguous areas of potential hybridization, we question whether the two species arose via allopatric speciation.(AU)
Macacos zogue-zogue (família Pitheciidae) são primatas neotropicais altamente diversificados em morfologia, ecologia e genética, com distribuição geográfica abrangente, incluindo a Floresta Amazônica, Mata Atlântica, Cerrado, Pantanal e a Caatinga. Essa diversificação, juntamente com lacunas de conhecimento, gera incertezas na taxonomia e distribuição das espécies. Um exemplo é Plecturocebus baptista, com apenas 14 registros de ocorrência e distribuição indefinida, baseada em barreiras geográficas não testadas. Aqui nós relatamos a ocorrência da espécie em uma nova localidade, fora de sua área conhecida de distribuição, que transpõe uma suposta barreira geográfica, o Rio Paraná-Urariá. O novo registro de P. baptista se sobrepõe à distribuição de P. hoffmannsi e, neste contexto, observamos um indivíduo aparentemente híbrido entre as duas espécies. Nossas observações sugerem que i) a distribuição de P. baptista necessita ser revisada, e ii) a relação evolutiva entre P. baptista e P. hoffmannsi pode ser mais complexa do que se pensava. Como ambas espécies compartilham áreas contínuas de potencial hibridização, questionamos se as duas espécies resultaram de especiação alopátrica.(AU)
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Animais , Pitheciidae , Distribuição Animal , Hibridização Genética , Ecossistema AmazônicoResumo
Background: Enzootic bovine leukosis (EBL) is a viral and lymphoproliferative disease that attributes negative economicimpacts to dairy farming. The immunosuppressive condition of these bovines favors the development of bacterial diseases such as tuberculosis, brucellosis, and bovine leptospirosis, which implications to the public health given that theyare zoonosis. Diagnosis and control of EBL are neglected in cattle rearing, allowing their dissemination, especially indeveloping countries. In this sense, the objective of this study was to analyze the risk factors of EBL in dairy cattle fromthe Brazilian Amazon.Materials, Methods & Results: In order to identify the BLV-infected animals (527 serological samples), we used theagarose gel immunodiffusion serological test (IDGA) to diagnose the EBL and characterize the risk factors through theapplication of epidemiological questionnaires. We used the logistic regression test to evaluate the existence of a significantassociation between the variables. The EBL frequency in the study area was 14.42%. We detected seroreagent bovines inall municipalities evaluated with 95% of the properties showing outbreaks of the disease. The reuse of needles was therisk factor with the most significant statistical association (P < 0.01; OR = 2.16).Discussion: The origin of EBL in the Brazilian Amazon is probably related to the expansion of dairy cattle in the 1980s,which, at first, demanded the importation of cattle for the fast formation of the herds, without complying with the sanitarycriteria of animal commercialization. The frequency of EBL in the Rio Branco microregion is below the estimated nationalaverage, as well as the regional level. The reduced influx of animals due to the geographical situation of Acre, since itis an area of greater physical isolation due to forest and river barriers, may influence the observed frequency. Differentenvironmental...
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Feminino , Animais , Bovinos , Fatores de Risco , Leucose Enzoótica Bovina/etiologia , Brasil , Inquéritos Epidemiológicos , Modelos LogísticosResumo
Background: Enzootic bovine leukosis (EBL) is a viral and lymphoproliferative disease that attributes negative economicimpacts to dairy farming. The immunosuppressive condition of these bovines favors the development of bacterial diseases such as tuberculosis, brucellosis, and bovine leptospirosis, which implications to the public health given that theyare zoonosis. Diagnosis and control of EBL are neglected in cattle rearing, allowing their dissemination, especially indeveloping countries. In this sense, the objective of this study was to analyze the risk factors of EBL in dairy cattle fromthe Brazilian Amazon.Materials, Methods & Results: In order to identify the BLV-infected animals (527 serological samples), we used theagarose gel immunodiffusion serological test (IDGA) to diagnose the EBL and characterize the risk factors through theapplication of epidemiological questionnaires. We used the logistic regression test to evaluate the existence of a significantassociation between the variables. The EBL frequency in the study area was 14.42%. We detected seroreagent bovines inall municipalities evaluated with 95% of the properties showing outbreaks of the disease. The reuse of needles was therisk factor with the most significant statistical association (P < 0.01; OR = 2.16).Discussion: The origin of EBL in the Brazilian Amazon is probably related to the expansion of dairy cattle in the 1980s,which, at first, demanded the importation of cattle for the fast formation of the herds, without complying with the sanitarycriteria of animal commercialization. The frequency of EBL in the Rio Branco microregion is below the estimated nationalaverage, as well as the regional level. The reduced influx of animals due to the geographical situation of Acre, since itis an area of greater physical isolation due to forest and river barriers, may influence the observed frequency. Differentenvironmental...(AU)
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Animais , Feminino , Bovinos , Leucose Enzoótica Bovina/etiologia , Fatores de Risco , Inquéritos Epidemiológicos , Modelos Logísticos , BrasilResumo
Geographical barriers influence species distribution and play an important role in the segregation of fish assemblages. The present study aims to test the influence of a small natural barrier on the spatial distribution of fish species in the Verde River, Upper Paraná River Basin, Brazil, considering two biotopes: upstream and downstream of the Branca Waterfall. We observed the highest species richness downstream of the Branca Waterfall, which also had the highest number of exclusive species. Richness, evenness, and abundance varied significantly among biotopes. The composition and structure of the fish assemblage differed between biotopes, which were characterized by different indicator species, mainly downstream of the Branca Waterfall. Physical and chemical variables and geographical distance between sites were not responsible for the differences observed. Hence, the present study shows that small barriers can also be crucial in structuring fish fauna and play a key role in the segregation of fish assemblages.(AU)
As barreiras geográficas influenciam a distribuição das espécies e desempenham um papel importante na segregação das assembleias de peixes. Dessa forma, o objetivo deste estudo foi avaliar mudanças espaciais na assembleia de peixes do rio Verde, sob a influência de uma pequena barreira geográfica natural, bacia do alto rio Paraná, Mato Grosso do Sul, Brasil. Para isso, seis locais foram amostrados e agrupados em dois biótopos: montante e jusante da cachoeira Branca. Maior riqueza e número de espécies exclusivas foram observadas a jusante da cachoeira Branca. A riqueza, equitabilidade e abundância diferiram significativamente entre os biótopos. Além disso, a composição e a estrutura da assembleia de peixes também diferiram entre os biótopos, os quais foram caracterizados por distintas espécies indicadoras, especialmente a jusante da cachoeira Branca. As variáveis físicas e químicas da água e as distâncias geográficas, entre os locais, não foram responsáveis pelas diferenças observadas. Dessa forma, este estudo demonstrou que pequenas barreiras geográficas podem ser cruciais na estruturação da ictiofauna e desempenhar um papel-chave na segregação de assembleias de peixes.(AU)
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Animais , Isolamento Reprodutivo , Distribuição Animal , PeixesResumo
Abstract The Iguazu river is a tributary of the left margin of the Paraná river, isolated from this basin about 22 million years ago with the appearance of the Iguazu Falls. The Iguazu river is characterized by high endemism due to two factors: its rugged topography and the old isolation caused by formation of the Iguazu Falls. This study analyzed cytogenetically a population of Glanidium ribeiroi collected in a region at the final stretch of this basin, by Giemsa staining, C-banding, impregnation by silver nitrate, and FISH with probes of 5S rDNA, 18S rDNA, telomeric sequence [TTAGGG]n, and [GATA]n repeats. The diploid number was equal to 58 chromosomes. The heterochromatin was present in the terminal region of almost all chromosomes. The Ag-NORs were simple and presented interstitially on the short arm of the submetacentric pair 14, which was confirmed by FISH with 18S rDNA probe. The 5S rDNA-FISH marked only the submetacentric pair 16 on the long arm in interstitial position. The FISH with [TTAGGG]n probe presented all telomeres labeled as expected, with an absence of Interstitial Telomeric Sequence (ITS). The repetitive [GATA]n sequence was dispersed throughout the genome, with preferential location in the terminal region of all chromosomes. The data obtained are discussed herein with other species of Auchenipteridae, and other previously analyzed populations of G. ribeiroi from the Iguazu river, verifying differences among these populations, which should be mainly related to the rugged topography of this basin.
Resumo O rio Iguaçu é um afluente da margem esquerda do rio Paraná, que foi separado desta bacia a aproximadamente 22 milhões de anos com o surgimento das Cataratas do Iguaçu. Esse rio é caracterizado por elevado endemismo, o que se deve a dois fatores: sua acidentada topografia e ao antigo isolamento proporcionado pela formação das cataratas. No presente trabalho foi analisado cromossomicamente uma população de Glanidium ribeiroi coletada em uma região que corresponde ao trecho final desse rio, através de coloração com Giemsa, bandamento-C, impregnação pelo nitrato de prata e FISH com sondas de rDNA 5S, rDNA 18S, sequência telomérica [TTAGGG]n e repetições [GATA]n. O número diploide encontrado foi igual a 58 cromossomos. A heterocromatina se mostrou dispersa na região terminal de quase todos os cromossomos. As Ag-RONs são simples e presentes no braço curto em posição intersticial do par submetacêntrico 14, o que foi confirmado pela FISH com rDNA 18S. O rDNA 5S marcou apenas o par submetacêntrico 16 no braço longo em posição intersticial. A hibridização com sonda [TTAGGG]n revelou todos os telômeros marcados conforme esperado e ausência de Sequência Telomérica Intersticial (ITS). As repetições [GATA]n se apresentaram dispersas no genoma da espécie, com preferencial localização na região terminal de todos os cromossomos. Os dados aqui obtidos são discutidos com os de outras espécies de Auchenipteridae, especialmente de G. ribeiroi anteriormente analisados do rio Iguaçu. Diferenças populacionais são constatadas em decorrência do isolamento geográfico ocasionado pelas inúmeras cachoeiras existentes no curso do rio Iguaçu.
Resumo
The Amazon tree boa Corallus hortulanus is known for featuring a wide variation in color pattern and design markings. Although there are studies on its polychromatism, none of them addresses the geographic variation in the color pattern of this species. The aim of this study was to describe the chromatic variation found in the populations of C. hortulanus from the southern Amazon Basin and its relationship with geographic distribution of the species. Analysis of both design markings and color patterns on 112 C. hortulanus specimens from the southern Amazon Basin interfluves resulted in the identification of six distinct morphotypes. Grayish-brown coloration and elongated diamond-shaped patterns were the most frequent patterns. Two morphotypes showed a tendency of correlation with the geographical distribution of those species found in Madeira and Juruá Rivers. The small sample size does not allow for a robust conclusion on the possible cause of geographic variation. The distribution of morphological patterns of C. hortullanus in the Amazon Basin suggest that there is gene flow between populations, regardless of geographical distance and natural barriers. The variation in color pattern and markings may represent a phenotypic response to the characteristics of different habitats occupied by the species.(AU)
Corallus hortulanus é uma serpente conhecida por apresentar grande variação no padrão de coloração e desenho. Apesar de estudos relacionados ao seu policromatismo, nenhum deles abordou a variação geográfica no padrão de cor desta espécie. O objetivo deste estudo foi descrever a variação cromática das populações de C. hortulanus na Calha sul do Rio Amazonas e verificar a correlação entre a distribuição geográfica e a variação encontrada. A partir da análise do padrão de desenho e cor de 112 espécimes de C. hortulanus procedentes dos interflúvios (área entre dois rios) da Calha Sul foram descritos seis morfotipos. Dos seis morfotipos descritos, a cor marrom-acinzentado e o padrão de desenho losango alongado foram os mais comuns entre as populações analisadas. Dois morfotipos apresentaram uma tendência de correlação com a distribuição geográfica, estando relacionados aos rios Madeira e Juruá, embora o número de amostras tenha sido pequeno. A distribuição dos padrões morfológicos de C. hortullanus na Bacia Amazônica revelou que existe fluxo gênico entre as populações, independentemente da distância geográfica e das barreiras naturais. Provavelmente, o padrão de cor e desenho seja uma resposta fenotípica às pressões nos diferentes ambientes ocupados pela espécie.(AU)
Assuntos
Animais , Boidae/anatomia & histologia , Cor , Pigmentação da Pele , Distribuição Animal , SerpentesResumo
The Amazon tree boa Corallus hortulanus is known for featuring a wide variation in color pattern and design markings. Although there are studies on its polychromatism, none of them addresses the geographic variation in the color pattern of this species. The aim of this study was to describe the chromatic variation found in the populations of C. hortulanus from the southern Amazon Basin and its relationship with geographic distribution of the species. Analysis of both design markings and color patterns on 112 C. hortulanus specimens from the southern Amazon Basin interfluves resulted in the identification of six distinct morphotypes. Grayish-brown coloration and elongated diamond-shaped patterns were the most frequent patterns. Two morphotypes showed a tendency of correlation with the geographical distribution of those species found in Madeira and Juruá Rivers. The small sample size does not allow for a robust conclusion on the possible cause of geographic variation. The distribution of morphological patterns of C. hortullanus in the Amazon Basin suggest that there is gene flow between populations, regardless of geographical distance and natural barriers. The variation in color pattern and markings may represent a phenotypic response to the characteristics of different habitats occupied by the species.
Corallus hortulanus é uma serpente conhecida por apresentar grande variação no padrão de coloração e desenho. Apesar de estudos relacionados ao seu policromatismo, nenhum deles abordou a variação geográfica no padrão de cor desta espécie. O objetivo deste estudo foi descrever a variação cromática das populações de C. hortulanus na Calha sul do Rio Amazonas e verificar a correlação entre a distribuição geográfica e a variação encontrada. A partir da análise do padrão de desenho e cor de 112 espécimes de C. hortulanus procedentes dos interflúvios (área entre dois rios) da Calha Sul foram descritos seis morfotipos. Dos seis morfotipos descritos, a cor marrom-acinzentado e o padrão de desenho losango alongado foram os mais comuns entre as populações analisadas. Dois morfotipos apresentaram uma tendência de correlação com a distribuição geográfica, estando relacionados aos rios Madeira e Juruá, embora o número de amostras tenha sido pequeno. A distribuição dos padrões morfológicos de C. hortullanus na Bacia Amazônica revelou que existe fluxo gênico entre as populações, independentemente da distância geográfica e das barreiras naturais. Provavelmente, o padrão de cor e desenho seja uma resposta fenotípica às pressões nos diferentes ambientes ocupados pela espécie.
Assuntos
Animais , Boidae/anatomia & histologia , Cor , Distribuição Animal , Pigmentação da Pele , SerpentesResumo
The Iguazu river is a tributary of the left margin of the Paraná river, isolated from this basin about 22 million years ago with the appearance of the Iguazu Falls. The Iguazu river is characterized by high endemism due to two factors: its rugged topography and the old isolation caused by formation of the Iguazu Falls. This study analyzed cytogenetically a population of Glanidium ribeiroi collected in a region at the final stretch of this basin, by Giemsa staining, C-banding, impregnation by silver nitrate, and FISH with probes of 5S rDNA, 18S rDNA, telomeric sequence [TTAGGG]n, and [GATA]n repeats. The diploid number was equal to 58 chromosomes. The heterochromatin was present in the terminal region of almost all chromosomes. The Ag-NORs were simple and presented interstitially on the short arm of the submetacentric pair 14, which was confirmed by FISH with 18S rDNA probe. The 5S rDNA-FISH marked only the submetacentric pair 16 on the long arm in interstitial position. The FISH with [TTAGGG]n probe presented all telomeres labeled as expected, with an absence of Interstitial Telomeric Sequence (ITS). The repetitive [GATA]n sequence was dispersed throughout the genome, with preferential location in the terminal region of all chromosomes. The data obtained are discussed herein with other species of Auchenipteridae, and other previously analyzed populations of G. ribeiroi from the Iguazu river, verifying differences among these populations, which should be mainly related to the rugged topography of this basin.(AU)
O rio Iguaçu é um afluente da margem esquerda do rio Paraná, que foi separado desta bacia a aproximadamente 22 milhões de anos com o surgimento das Cataratas do Iguaçu. Esse rio é caracterizado por elevado endemismo, o que se deve a dois fatores: sua acidentada topografia e ao antigo isolamento proporcionado pela formação das cataratas. No presente trabalho foi analisado cromossomicamente uma população de Glanidium ribeiroi coletada em uma região que corresponde ao trecho final desse rio, através de coloração com Giemsa, bandamento-C, impregnação pelo nitrato de prata e FISH com sondas de rDNA 5S, rDNA 18S, sequência telomérica [TTAGGG]n e repetições [GATA]n. O número diploide encontrado foi igual a 58 cromossomos. A heterocromatina se mostrou dispersa na região terminal de quase todos os cromossomos. As Ag-RONs são simples e presentes no braço curto em posição intersticial do par submetacêntrico 14, o que foi confirmado pela FISH com rDNA 18S. O rDNA 5S marcou apenas o par submetacêntrico 16 no braço longo em posição intersticial. A hibridização com sonda [TTAGGG]n revelou todos os telômeros marcados conforme esperado e ausência de Sequência Telomérica Intersticial (ITS). As repetições [GATA]n se apresentaram dispersas no genoma da espécie, com preferencial localização na região terminal de todos os cromossomos. Os dados aqui obtidos são discutidos com os de outras espécies de Auchenipteridae, especialmente de G. ribeiroi anteriormente analisados do rio Iguaçu. Diferenças populacionais são constatadas em decorrência do isolamento geográfico ocasionado pelas inúmeras cachoeiras existentes no curso do rio Iguaçu.(AU)
Assuntos
Animais , Masculino , Feminino , /genética , Variação Genética , Cariótipo , Brasil , RiosResumo
Existe um grande número de agentes patogênicos com ciclos de transmissão complexos, envolvendo hospedeiros amplificadores, vetores e condições ambientais particulares. Esses sistemas complexos apresentam desafios quanto a modelagem e desenvolvimento de políticas públicas. A Febre Maculosa Brasileira (FMB) é a doença transmitida por carrapatos mais letal do mundo e é um claro exemplo de um sistema complexo. O aumento atual de casos humanos de BSF tem sido associado à presença e expansão de capivaras Hydrochoerus hydrochaeris, hospedeiros amplificadores do agente Rickettsia rickettsii e hospedeiros primários do carrapato vetor Amblyomma sculptum. O objetivo desta tese foi analisar a dinâmica da FMB com o propósito de fornecer bases para o delineamento de estratégias de prevenção de casos em humanos. Diferentes abordagens foram propostas para avaliar: i) a contribuição específica de hospedeiros e vetores na transmissão da FMB, ii) os parâmetros antropogênicos associados com a ocorrência dos casos e potenciais áreas de risco, iii) o padrão e a velocidade de propagação espacial e da doença, e iv) os fatores climáticos e paisagísticos que poderiam estar relacionados à distribuição do vetor. Os modelos propostos elucidaram que as estratégias de controle e prevenção da FMB podem estar focadas em práticas de manejo das populações de hospedeiros amplificadores. Uma vez que uma associação positiva entre ocorrência de casos humanos e o incremento de cultura de cana-de-açúcar foi determinada, assim como uma maior velocidade de propagação da FMB em locais com alta quantidade desta cultura, barreiras geográficas geradas, por exemplo, por zonas de reflorestamento ciliar, poderiam impedir a disseminação da FMB. Esta tese foi interdisciplinar e exigiu, por um lado, conhecimentos em biologia, epidemiologia computacional, matemática e estatística e, em contrapartida, um ambiente rico em dados biológicos como o Laboratório de Parasitologia do VPS/USP. Os resultados desta tese poderão ser utilizados na planificação de políticas de saúde pública enfocadas à prevenção da FMB. Complementarmente, este trabalho abrirá o caminho para futuros estudos matemáticos e computacionais orientados no estudo da dinâmica e prevenção de outras doenças infecciosas transmitidas por vetores. Amblyomma sculptum; Brazilian spotted fever; Computational simulations; Spatial analysis; Stochastic modeling;
There are a huge number of pathogens with multi-component transmission cycles, involving ampli_er hosts, vectors, complex pathogen life cycles and particular environmental conditions. These complex systems present challenges in terms of modeling and policy development. The deadliest tick-borne infectious disease in the world, the Brazilian Spotted Fever (BSF), is a relevant example of that. The current increase of human cases of BSF has been associated with the presence and expansion of capybaras Hydrochoerus hydrochaeris, amplifer host for the agent Rickettsia rickettsii and primary host for the tick vector Amblyomma sculptum. The objective of this thesis was to analyze the dynamics of the FMB with the purpose of providing bases for the planning of strategies focused on the prevention of human cases. We proposed diferent approaches to evaluating: i) the contribution of hosts and vectors in the transmission of BSF, ii) potential risk areas and anthropogenic parameters associated with the occurrence of human cases, iii) the pattern and the spatial propagation velocity of BSF, and iv) climatic and landscape factors that could be related to the distribution of the vector. The proposed approaches elucidated how BSF control and prevention strategies can be focused on the management of amplifier hosts populations. We found that geographical barriers generated, for example, by areas of riparian reforestation, could prevent the spatial spread of BSF, since a positive association between the occurrence of human cases and the increment of sugarcane crop was determined, as well as a higher propagation velocity of BSF in places with higher carrying capacity. This thesis was interdisciplinary and required, on one hand, expertise in biology, computational epidemiology, mathematics and statistics and on the other hand, a datarich environment such as the Laboratory of Parasitology of the VPS/FMVZ/USP. The results of this thesis can be usefulness in the planning of public health policies related to the prevention of BSF. Furthermore, this work will open the path to further mathematical and computational studies focused on the dynamics and prevention of other vector-borne infectious diseases.
Resumo
Entre as vantagens da criopreservação seminal, destacam-se a otimização do uso de garanhões com comprovada superioridade genética, pela possibilidade do armazenamento de sêmen mesmo fora da estação de monta e a quebra das barreiras geográficas, que torna possível a remessa deste material para qualquer parte do mundo. Contudo, o processo de congelação de sêmen causa danos à célula espermática, sendo a peroxidação lipídica e o estresse oxidativo, ocasionada pela produção anormal de espécies reativas de oxigênio (EROs), as principais injúrias. Desta maneira, para se obter uma melhor qualidade seminal após a descongelação, é necessário adicionar aos diluentes seminais elementos que desempenhem função antioxidante, visando conter o aumento dos níveis dos agentes oxidantes. Coenzima Q10 (CoQ10) é um agente lipossolúvel promotor de energia, tendo como principal função transportar prótons e elétrons no processo de síntese de ATP na membrana mitocondrial interna, através da cadeia de transporte de elétrons. Ainda, a CoQ10 atua como um potente antioxidante em diversos sistemas biológicos, tais como, lipoproteínas e membranas, protegendo-os contra a oxidação, inibindo a formação de hidroperóxidos e, consequentemente, prevenindo a peroxidação lipídica. Desta forma, o objetivo deste estudo foi avaliar a ação da coenzima Q10 (CoQ10) no espermatozoide de garanhões resistentes (RC) e sensíveis (SC) a congelação. Cada ejaculado (n=24) foi dividido em nove tratamentos e submetido à congelação, sendo a CoQ10 adicionada ao diluente de centrifugação, nas concentrações de 25 µmol/L (CE25), 50 µmol/L (CE50), 75 µmol/L (CE75) e 100 µmol/L (CE100), ou ao de congelação nas mesmas concentrações, 25 µmol/L (FE25), 50 µmol/L (FE50), 75 µmol/L (FE75) e 100 µmol/L (FE100). No grupo controle não houve adição da CoQ10 em nenhum dos meios diluentes. O processo de descongelação foi realizado à 37ºC/30 segundos (T0) e, para avaliação após estresse térmico, 37ºC/30minutos (T30). Posteriormente, as células espermáticas foram avaliadas quanto a cinética, integridade da membrana plasmática (IMP), desestabilização da membrana (NCAP), produção de espécies reativas ao oxigênio (H2O2 e O2-), atividade mitocondrial e peroxidação lipídica. De acordo com os resultados, não houve diferença significativa entre os grupos, tanto no momento T0 quanto no momento T30, para os garanhões classificados como RC (p>0,05), com exceção da peroxidação lipídica, que em ambos os momentos, os grupos tratados apresentaram valores menores quando comparados ao controle (p<0,05). Já para os animais classificados como SC, houve uma superioridade das células espermáticas tratadas com a CoQ10 (p<0,05), com exceção da concentração de O2- e potencial mitocondrial no T0, em que não apresentaram diferença entre os grupos (p>0,05). As células espermáticas do grupo CE75 se mostraram superiores aos parâmetros avaliados em relação aos demais grupos. Podemos concluir que a CoQ10 promove uma diminuição do estresse oxidativo e maior viabilidade ao espermatozoide de garanhões sensíveis ao processo de congelação espermática.
Among the advantages of seminal cryopreservation, the optimization of using stallions with proven genetic superiority, the possibility of storing semen even outside the breeding season and the breaking of geographical barriers, which makes it possible to send this material to any part of the world can de highlighted. However, the process of semen freezing causes damage to the sperm cell, and the abnormal production of reactive oxygen species is caused by lipid peroxidation of the sperm membrane, which is a major cause of such injury. Thus, in order to obtain a better seminal quality after thawing, it is necessary to add to the diluents substances that play an antioxidant function, limiting levels of the oxidizing agents increase. Coenzyme Q10 is a liposoluble energy-promoting agent, whose main function is to transport protons and electrons in the process of ATP synthesis in the internal mitochondrial membrane, through the electron transport chain. Furthermore, CoQ10 (ubiquinol) acts as a potent antioxidant in several biological systems, such as lipoproteins and membranes, protecting them against oxidation, inhibiting the hydroperoxides formation and, consequently, preventing lipid peroxidation. In this way, the objective of this study was to discuss how CoQ10 may help reducing the oxidative stress caused by seminal cryopreservation process. This form, the objective of this study was to evaluate the antioxidant action of coenzyme Q10 (CoQ10) on spermatozoa from good freezers (GF) and bad freezers (BF) stallions. Each ejaculate (n=15) was divided into nine treatments and subject to freezing process. The CoQ10 was added to centrifugation extender at concentrations 25 µmols/L (CE25), 50 µmols/L (CE50), 75 µmols/L (CE75) and 100 µmols/L (CE100), or at the freezer extender at the same concentrations, 25 µmols/L (FE25), 50 µmols/L (FE50), 75 µmols/L (FE75) and 100 µmols/L (FE100). In the control group there was no addition of CoQ10 in any of the extenders. The thawing process was performed at 37ºC/30 seconds (T0) and at 37ºC/30 minutes (T30). Posteriorly, sperm cells were evaluated for kinetics, plasma membrane integrity (PMI), membrane desestabilization (NCAP), reactive oxygen species production (H2O2 and O2-), mitochondrial activity and lipid peroxidation. According to the results, there was no significant difference between the groups, as well T0 moment as T30 moment, for good freezer stallions (p>0.05). However for bad freezer stallions, there was a superiority of the sperm cells that came into contact with CoQ10 (p <0.05), except for the O2- concentration and mitochondrial potential (T0) in which there was no significant difference between the Groups (p> 0.05). The sperm cells of the CE75 group were superior in the evaluated parameters in relation to the other groups. We can conclude that CoQ10 promotes a reduction of oxidative stress and greater viability to the spermatozoa from bad freezer stallions at the freezing process.
Resumo
In recent years, many studies investigated how density-dependent factors, such as shortages in microhabitat and food availability influence the structure of reef fish assemblages. Most of what is currently known, however, comes from comparisons of isolated patch reefs and from correlations between fish abundance and one or few microhabitat variables. In addition, most studies were done in the Caribbean and Indo-Pacific regions, whereas the South Atlantic region has been, to date, understudied. The present study evaluated spatial and temporal variations in reef fish abundance and species richness in a continuous rocky reef and adjacent unconsolidated habitats in a Southwestern Atlantic reef, using underwater techniques to assess both fish numbers and microhabitat variables (depth, rugosity, number of crevices and percent cover of live benthic organisms, bare rock, sand, and limestone). Higher species richness was observed at consolidated substratum stations on both sampling periods (May and October), but fish abundance did not show a significant spatial variation. Topographical complexity and percent cover of algae (except coralline algae) were amongst the most important determinants of species richness, and correlations between fish size and refuge crevice size were observed. The non-random patterns of spatial variation in species richness, and to a lesser extent, fish abundance, were related to differences in substratum characteristics and the inherent characteristics of fishes (i.e. habitat preferences) and not to geographical barriers restraining fish movement. This study highlights the importance of concomitantly assessing several microhabitat variables to determine their relative influence in reef fish assemblages.(AU)
Em anos recentes, vários estudos investigaram como os fatores dependentes da densidade, por exemplo, a diminuição na disponibilidade de microhabitats e alimento, influenciam a estrutura das assembleias de peixes. A maior parte do que é atualmente conhecida, no entanto, é oriunda de comparações de recifes isolados e de correlações entre abundância de peixes e uma ou poucas variáveis relacionadas ao microhabitat. Ainda, a maior parte dos estudos foi realizada nas regiões do Caribe e do Indo-Pacífico, enquanto a região do Atlântico Sul tem sido, até o momento, subestimada. O presente estudo avaliou as variações espaciais e temporais da abundância de peixes recifais e da riqueza de espécies em um recife rochoso contínuo e em habitats não-consolidados adjacentes em um recife do Atlântico Sudoeste, utilizando técnicas subaquáticas para avaliar tanto os valores dos peixes como as variáveis do microhabitat (profundidade, rugosidade, número de fendas e porcentagem de cobertura de organismos bênticos vivos, rocha nua, areia e cascalho). Uma maior riqueza de espécies foi observada nos pontos de substrato consolidado em ambos os períodos de amostragem (maio e outubro), mas a abundância de peixes não mostrou uma variação espacial significativa. A complexidade topográfica e a porcentagem de cobertura de alga (exceto alga coralinácea) foram as determinantes da riqueza de espécies e correlações entre tamanho dos peixes e tamanho das fendas de refúgio mais importantes observadas. Os padrões não-randômicos de variação espacial na riqueza de espécies e, em menor grau, abundância de peixes, relacionaram-se com diferenças nas características do substrato e as características inerentes dos peixes (i.e. preferências de habitat) e não a barreiras geográficas restringindo o movimento dos peixes. Este estudo destaca a importância de avaliar concomitantemente diversas variáveis de microhabitat para determinar suas influências relativas sobre as assembleias de peixes.(AU)
Assuntos
Animais , Peixes/crescimento & desenvolvimento , Ingestão de Alimentos , Biota/análise , Biota/métodosResumo
Shigella spp., the human pathogen responsible for shigellosis, is highly infectious even at low levels. The incidence rate of shigellosis varies with geographical distribution, location human development index, and age groups, being higher among children aged under 5 years. In Brazil, a few works indicate that shigellosis cases are underestimated, with S. flexneri and S. sonnei strains being the major agents responsible for the shigellosis cases. The present study used pulsed field gel electrophoresis (PFGE) to investigate the molecular epidemiology of 119 strains of S. sonnei and S. flexneri isolated from shigellosis cases that occurred in the metropolitan areas of Ribeirão Preto and Campinas Cities, São Paulo Sate, southeast Brazil. The results indicated (i) the existence of just a few strain clusters for both species, but with genotype variability with either a high speed of genetic change or constant introduction of several genotypes, considering the intense migration to these two metropolitan areas, and (ii) the prevalence of specific genotypes in each geographical area, which suggests the successful adaptation of some genotypes to the local environmental conditions. Our results indicate the need of more efficacious sanitary barriers to prevent Shigella spp. outbreaks and epidemics.
Shigella spp., o patógeno humano responsável pela shiguelose, apresenta grande poder infeccioso, mesmo em pequenas doses. A incidência de shiguelose varia de acordo com a distribuição geográfica, o índice de desenvolvimento humano local e a faixa de idade, sendo alto entre crianças com menos de 5 anos de idade. No Brasil, alguns trabalhos indicam que os casos de shiguelose são subnotificados sendo, S. flexneri e S. sonnei os principais agentes responsáveis pelos casos ocorridos. O presente estudo usou a técnica de eletroforese em campo pulsado (PFGE) para investigar a epidemiologia molecular de 119 linhagens de S. flexneri e S. sonnei, isoladas de casos de shiguelose que ocorreram nas regiões metropolitanas das cidades de Ribeirão Preto e Campinas, estado de São Paulo, na região Sudeste do Brasil. Os resultados indicam (i) a existência de apenas alguns grupos clonais para ambas as espécies, mas com variabilidade de genótipos indicando ou um alto índice de variação genética, ou a constante introdução de vários genótipos, considerando o movimento migratório intenso de pessoas nestas duas áreas metropolitanas, e (ii) a prevalência de genótipos específicos em cada área geográfica, o que sugere a existência de genótipos com maior capacidade de adaptação às condições ambientais locais. Os resultados indicam a necessidade de barreiras sanitárias mais eficientes para prevenir surtos e epidemias de Shigella spp.
Resumo
The red snapper, Lutjanus purpureus Poey (Perciformes, Lutjanidae), is captured along the North and Northeast coast of Brazil. It consists of one of the main fishing resources of these areas, being considered economically important as source of exchange value. This work has verified the occurrence of intro-specific diversification of the red snapper in the North and Northeast of Brazil. A total of 556 individuals were investigated among Amapá (319), Pará (176) and Maranhão (61). Sex ratio has shown that 43.71% were male and 56.29% female. The higher proportion of females is statistically significant according to 2 test. The results of ANOVA showed significant differences of morphometrical variables in all areas studied. In order to show which averages presented significant difference, the Tukeys test was used, and revealed that from the 48 comparative analyses, 100% were shown significant. Each area (AP, PA and MA) presented significant difference for each one of the morphometrical variables. To calculate the overlap degree, the method was used by comparison of averages for morphometrical characters. Out of 112 analyses, 46.43% presented diversification process at the intro-specific level, possibly suggesting the existence of natural barriers and/or geographical isolation. This information may be considered very important for the correct formulation of environmental policies.
O pargo, Lutjanus purpureus Poey (Perciformes, Lutjanidae), é capturado em toda a costa Norte e Nordeste do Brasil, constituindo um dos principais recursos pesqueiros da região, sendo reconhecido como fonte de divisa importante para a economia. Este trabalho verifica a ocorrência de diversificação intra-específica do pargo no Norte e Nordeste do Brasil. Foi amostrado um total de 556 indivíduos entre os Estados do AP (319), PA (176) e MA (61). Na análise das proporções entre sexos, verificou-se que dos indivíduos amostrados, 43,71% eram machos e 56,29% fêmeas. Essa vantagem de fêmeas é estatisticamente significativa de acordo com o teste do 2. Os resultados da ANOVA mostraram diferenças significativas das variáveis morfométricas em todas as subáreas. Para mostrar quais médias apresentavam contrastes significativos foi usado o teste de Tukey, que revelou que das 48 análises comparativas, 100% mostraram-se significativas. Cada subárea (AP, PA e MA) apresentou diferença significativa para cada uma das variáveis morfométricas testadas. Para estimar o grau de sobreposição, utilizou-se o método por comparação de médias para caracteres morfométricos. Do total de 112 análises, 46,43% apresentaram processo de diversificação intra-específica, sugerindo possíveis barreiras naturais e/ou isolamento geográfico. Informações dessa natureza são imprescindíveis para a correta formulação de uma
Resumo
The red snapper, Lutjanus purpureus Poey (Perciformes, Lutjanidae), is captured along the North and Northeast coast of Brazil. It consists of one of the main fishing resources of these areas, being considered economically important as source of exchange value. This work has verified the occurrence of intro-specific diversification of the red snapper in the North and Northeast of Brazil. A total of 556 individuals were investigated among Amapá (319), Pará (176) and Maranhão (61). Sex ratio has shown that 43.71% were male and 56.29% female. The higher proportion of females is statistically significant according to 2 test. The results of ANOVA showed significant differences of morphometrical variables in all areas studied. In order to show which averages presented significant difference, the Tukeys test was used, and revealed that from the 48 comparative analyses, 100% were shown significant. Each area (AP, PA and MA) presented significant difference for each one of the morphometrical variables. To calculate the overlap degree, the method was used by comparison of averages for morphometrical characters. Out of 112 analyses, 46.43% presented diversification process at the intro-specific level, possibly suggesting the existence of natural barriers and/or geographical isolation. This information may be considered very important for the correct formulation of environmental policies.
O pargo, Lutjanus purpureus Poey (Perciformes, Lutjanidae), é capturado em toda a costa Norte e Nordeste do Brasil, constituindo um dos principais recursos pesqueiros da região, sendo reconhecido como fonte de divisa importante para a economia. Este trabalho verifica a ocorrência de diversificação intra-específica do pargo no Norte e Nordeste do Brasil. Foi amostrado um total de 556 indivíduos entre os Estados do AP (319), PA (176) e MA (61). Na análise das proporções entre sexos, verificou-se que dos indivíduos amostrados, 43,71% eram machos e 56,29% fêmeas. Essa vantagem de fêmeas é estatisticamente significativa de acordo com o teste do 2. Os resultados da ANOVA mostraram diferenças significativas das variáveis morfométricas em todas as subáreas. Para mostrar quais médias apresentavam contrastes significativos foi usado o teste de Tukey, que revelou que das 48 análises comparativas, 100% mostraram-se significativas. Cada subárea (AP, PA e MA) apresentou diferença significativa para cada uma das variáveis morfométricas testadas. Para estimar o grau de sobreposição, utilizou-se o método por comparação de médias para caracteres morfométricos. Do total de 112 análises, 46,43% apresentaram processo de diversificação intra-específica, sugerindo possíveis barreiras naturais e/ou isolamento geográfico. Informações dessa natureza são imprescindíveis para a correta formulação de uma