Optimal plot size in white oat with comparison of three methods / Tamanho ótimo de parcela em aveia branca com comparação de três métodos

The objective of this work was to compare three methods for estimating the optimal plot size to evaluate the fresh matter productivity of white oat (Avena sativa L.), IPR Suprema cultivar. Six uniformity trials (blank experiments) were carried out, three trials on the first sowing date (May 3, 2021) and three trials on the second sowing date (May 26, 2021). Fresh matter productivity was evaluated in 216 basic experimental units (BEU) of 1 m × 1 m (36 BEU per trial). The BEU was formed by five rows of 1.0 m in length, spaced 0.20 m apart, totaling 1.0 m2. The optimal plot size was determined using the methods of modified maximum curvature, linear response and plateau model and quadratic response and plateau model. The optimal plot size differs between the methods and decreases in the following order: quadratic response and plateau model (11.09 m2), linear response and plateau model (7.65 m2) and modified maximum curvature (4.00 m2). The optimal plot size to evaluate the fresh matter productivity of white oat is 7.65 m2 and the experimental precision stabilizes from this size on.

O objetivo deste trabalho foi comparar três métodos de estimação do tamanho ótimo de parcela para avaliar a produtividade de matéria fresca de aveia branca (Avena sativa L.), cultivar IPR Suprema. Foram conduzidos seis ensaios de uniformidade (experimentos em branco), sendo três na primeira data de semeadura (03 de maio de 2021) e três na segunda data de semeadura (26 de maio de 2021). Foi avaliada a produtividade de matéria fresca em 216 unidades experimentais básicas (UEB) de 1 m × 1 m (36 UEB por ensaio). A UEB foi formada por cinco fileiras de 1,0 m de comprimento, espaçadas 0,20 m entre fileiras, totalizando 1,0 m2. Foi determinado o tamanho ótimo de parcela por meio dos métodos da curvatura máxima modificado, do modelo linear de resposta com platô e do modelo quadrático de resposta com platô. O tamanho ótimo de parcela difere entre os métodos e decresce na seguinte ordem: modelo quadrático de resposta com platô (11,09 m2), modelo linear de resposta com platô (7,65 m2) e curvatura máxima modificado (4,00 m2). O tamanho ótimo de parcela para avaliar a produtividade de matéria fresca de aveia branca é 7,65 m2 e a precisão experimental estabiliza a partir desse tamanho.

Mathematical models to describe the growth curves of Vietnamese Ri chicken

Abstract Ri chicken is the most popular backyard chicken breed in Vietnam, but little is known about the growth curve of this breed. This study compared the performances of models with three parameters (Gompertz, Brody, and Logistic) and models containing four parameters (Richards, Bridges, and Janoschek) for describing the growth of Ri chicken. The bodyweight of Ri chicken was recorded weekly from week 1 to week 19. Growth models were fitted using minpack.lm package in R software and Akaikes information criterion (AIC), Bayesian information criterion (BIC), and root mean square error (RMSE) were used for model comparison. Based on these criteria, the models having four parameters showed better performance than the ones with three parameters, and the Richards model was the best one for males and females. The lowest and highest value of asymmetric weights () were obtained by Bridges and Brody models for each of sexes, respectively. Age and weight estimated by the Richard model were 8.46 and 7.51 weeks and 696.88 and 487.58 g for males and for females, respectively. Differences in the growth curves were observed between males and female chicken. Overall, the results suggested using the Richards model for describing the growth curve of Ri chickens. Further studies on the genetics and genomics of the obtained growth parameters are required before using them for the genetic improvement of Ri chickens.

Resumo O frango Ri é a raça de frango de quintal mais popular do Vietnã, mas pouco se sabe sobre a curva de crescimento dessa raça. Este estudo comparou o desempenho de modelos com três parâmetros (Gompertz, Brody e Logistic) e modelos contendo quatro parâmetros (Richards, Bridges e Janoschek) para descrever o crescimento do frango Ri. O peso corporal do frango Ri foi registrado semanalmente da semana 1 à semana 19. Os modelos de crescimento foram ajustados usando o pacote minpack.lm no software R e o critério de informação de Akaike (AIC); critério de informação bayesiano (BIC) e erro quadrático médio (RMSE) foram usados para comparação de modelos. Com base nesses critérios, os modelos com quatro parâmetros apresentaram melhor desempenho do que os com três parâmetros, sendo o modelo de Richards o melhor para homens e mulheres. O menor e o maior valor dos pesos assimétricos () foram obtidos pelos modelos Bridges e Brody para cada um dos sexos, respectivamente. A idade e o peso estimados pelo modelo de Richard foram de 8,46 e 7,51 semanas e 696,88 e 487,58 g para homens e mulheres, respectivamente. Diferenças nas curvas de crescimento foram observadas entre frangos machos e fêmeas. No geral, os resultados sugeriram o uso do modelo de Richards para descrever a curva de crescimento de frangos Ri. Mais estudos sobre a genética e genômica dos parâmetros de crescimento obtidos são necessários antes de usá-los para o melhoramento genético de frangos Ri.

Mathematical models to describe the growth curves of Vietnamese Ri chicken / Modelos matemáticos para descrever as curvas de crescimento do frango Ri vietnamita

Ri chicken is the most popular backyard chicken breed in Vietnam, but little is known about the growth curve of this breed. This study compared the performances of models with three parameters (Gompertz, Brody, and Logistic) and models containing four parameters (Richards, Bridges, and Janoschek) for describing the growth of Ri chicken. The bodyweight of Ri chicken was recorded weekly from week 1 to week 19. Growth models were fitted using minpack.lm package in R software and Akaike’s information criterion (AIC), Bayesian information criterion (BIC), and root mean square error (RMSE) were used for model comparison. Based on these criteria, the models having four parameters showed better performance than the ones with three parameters, and the Richards model was the best one for males and females. The lowest and highest value of asymmetric weights (α) were obtained by Bridges and Brody models for each of sexes, respectively. Age and weight estimated by the Richard model were 8.46 and 7.51 weeks and 696.88 and 487.58 g for males and for females, respectively. Differences in the growth curves were observed between males and female chicken. Overall, the results suggested using the Richards model for describing the growth curve of Ri chickens. Further studies on the genetics and genomics of the obtained growth parameters are required before using them for the genetic improvement of Ri chickens.

O frango Ri é a raça de frango de quintal mais popular do Vietnã, mas pouco se sabe sobre a curva de crescimento dessa raça. Este estudo comparou o desempenho de modelos com três parâmetros (Gompertz, Brody e Logistic) e modelos contendo quatro parâmetros (Richards, Bridges e Janoschek) para descrever o crescimento do frango Ri. O peso corporal do frango Ri foi registrado semanalmente da semana 1 à semana 19. Os modelos de crescimento foram ajustados usando o pacote minpack.lm no software R e o critério de informação de Akaike (AIC); critério de informação bayesiano (BIC) e erro quadrático médio (RMSE) foram usados para comparação de modelos. Com base nesses critérios, os modelos com quatro parâmetros apresentaram melhor desempenho do que os com três parâmetros, sendo o modelo de Richards o melhor para homens e mulheres. O menor e o maior valor dos pesos assimétricos (α) foram obtidos pelos modelos Bridges e Brody para cada um dos sexos, respectivamente. A idade e o peso estimados pelo modelo de Richard foram de 8,46 e 7,51 semanas e 696,88 e 487,58 g para homens e mulheres, respectivamente. Diferenças nas curvas de crescimento foram observadas entre frangos machos e fêmeas. No geral, os resultados sugeriram o uso do modelo de Richards para descrever a curva de crescimento de frangos Ri. Mais estudos sobre a genética e genômica dos parâmetros de crescimento obtidos são necessários antes de usá-los para o melhoramento genético de frangos Ri.

Mathematical models to describe the growth curves of Vietnamese Ri chicken / Modelos matemáticos para descrever as curvas de crescimento do frango Ri vietnamita

Ri chicken is the most popular backyard chicken breed in Vietnam, but little is known about the growth curve of this breed. This study compared the performances of models with three parameters (Gompertz, Brody, and Logistic) and models containing four parameters (Richards, Bridges, and Janoschek) for describing the growth of Ri chicken. The bodyweight of Ri chicken was recorded weekly from week 1 to week 19. Growth models were fitted using minpack.lm package in R software and Akaikes information criterion (AIC), Bayesian information criterion (BIC), and root mean square error (RMSE) were used for model comparison. Based on these criteria, the models having four parameters showed better performance than the ones with three parameters, and the Richards model was the best one for males and females. The lowest and highest value of asymmetric weights (α) were obtained by Bridges and Brody models for each of sexes, respectively. Age and weight estimated by the Richard model were 8.46 and 7.51 weeks and 696.88 and 487.58 g for males and for females, respectively. Differences in the growth curves were observed between males and female chicken. Overall, the results suggested using the Richards model for describing the growth curve of Ri chickens. Further studies on the genetics and genomics of the obtained growth parameters are required before using them for the genetic improvement of Ri chickens.(AU)

O frango Ri é a raça de frango de quintal mais popular do Vietnã, mas pouco se sabe sobre a curva de crescimento dessa raça. Este estudo comparou o desempenho de modelos com três parâmetros (Gompertz, Brody e Logistic) e modelos contendo quatro parâmetros (Richards, Bridges e Janoschek) para descrever o crescimento do frango Ri. O peso corporal do frango Ri foi registrado semanalmente da semana 1 à semana 19. Os modelos de crescimento foram ajustados usando o pacote minpack.lm no software R e o critério de informação de Akaike (AIC); critério de informação bayesiano (BIC) e erro quadrático médio (RMSE) foram usados para comparação de modelos. Com base nesses critérios, os modelos com quatro parâmetros apresentaram melhor desempenho do que os com três parâmetros, sendo o modelo de Richards o melhor para homens e mulheres. O menor e o maior valor dos pesos assimétricos (α) foram obtidos pelos modelos Bridges e Brody para cada um dos sexos, respectivamente. A idade e o peso estimados pelo modelo de Richard foram de 8,46 e 7,51 semanas e 696,88 e 487,58 g para homens e mulheres, respectivamente. Diferenças nas curvas de crescimento foram observadas entre frangos machos e fêmeas. No geral, os resultados sugeriram o uso do modelo de Richards para descrever a curva de crescimento de frangos Ri. Mais estudos sobre a genética e genômica dos parâmetros de crescimento obtidos são necessários antes de usá-los para o melhoramento genético de frangos Ri.(AU)

Relationship between body weight and scrotal circumference in growing Pelibuey sheep raised under tropical conditions / Relação entre o peso corporal e a circunferência escrotal em ovinos Pelibuey em crescimento criados em condições tropicais

The body weight (BW) of an animal is a vital economic trait that might help in decision-making in the handling of animals. The objective of the present study was to develop equations for the prediction of BW in Pelibuey sheep using scrotal circumference (SC). The BW (23.40 ± 6.96 kg) and SC (20.25 ± 6.19 cm) have been recorded in 405 male Pelibuey at the Southeastern Center for Ovine Integration, Mexico. Linear, logarithmic, quadratic, exponential, cubic, and power regression models were used for data analysis. Pearson correlation (R), Coefficient of determination (R2), Adjusted coefficient of determination (Adj.R2) Root mean square error (RMSE), Akaike information criterion (AIC), and Bayesian information criterion (BIC) were used to select the best model. Power regression model showed the highest R (0.93), R2 (0.86), Adj.R2 (0.86) and lowest RMSE (0.02), AIC (-989.44) and BIC (-981.44). The current study suggests that SC might be used as the only predictor for BW of growing Pelibuey sheep raised under tropical conditions.

O peso corporal (PC) do animal é uma característica econômica importante, que pode auxiliar na tomada de decisões no manejo dos animais. O objetivo do presente estudo foi desenvolver equações para a predição do PC em ovinos Pelibuey por meio da circunferência escrotal (CE). O PC (23,40±6,96kg) e a CE (20,25±6,19cm) foram registrados em 405 ovinos machos da raça Pelibuey no Centro de Integração Ovina da Região Sudeste do México. Os modelos lineares, logarítmicos, quadráticos, exponenciais, cúbicos e de regressão de potência foram utilizados para a análise dos dados. A correlação de Pearson (R), o coeficiente de determinação (R2), o coeficiente de determinação ajustado (Adj.R2), o erro do quadrado médio (EQM), o critério de informação de Akaike (AIC) e o critério de informação bayesiano (BIC) foram usados para selecionar o melhor modelo. O modelo de regressão de potência apresentou maiores R (0,93), R2 (0,86), Adj.R2 (0,86) e menores EQM (0,02), AIC (-989,44) e BIC (-981,44). O estudo atual sugere que a CE pode ser usada como um único preditor para o PC de ovinos Pelibuey em crescimento criadas em condições tropicais.

The waveless model: clinical and research applications of follicular wave suppression in cattle / Modelo waveless: aplicações clínicas e na pesquisa da supressão das ondas foliculares em bovinos

The follicular growth waves are directly linked to the fluctuations in plasma gonadotrophins, which are controlled by the hypothalamic GnRH release pattern. Therefore, if the actions of the GnRH are inhibited or blocked, the final stages of the antral follicle growth are suppressed, resulting in an induced anestrus (a.k.a. waveless model). In the human medicine, GnRH agonists or antagonists are broadly used in the control of ovarian disfunctions, as well as in the preparation of women for assisted reproductive cycles. In cattle, a similar effect can be obtained by active immunization against GnRH. This was shown to be a viable strategy, for example, for the control of chronic cases of cystic ovarian disease in oocyte donors. However, on shall take into account the substantial individual variation on the immune response and, consequently, the lack of control of the duration of the anestrus induced. The waveless model is also very useful as a research model, once it controls the potential interference of the endogenous FSH and LH, improving the sensitivity of essays with exogenous hormones and consequently reducing the required number of replicas within studies.(AU)

O padrão de crescimento folicular em ondas está diretamente associado às flutuações nas concentrações plasmáticas de gonadotrofinas, controladas por sua vez pelo padrão de liberação de GnRH hipotalâmico. Desta forma, a inibição ou bloqueio da ação do GnRH suprime as etapas finais do crescimento folicular, resultando em anestro induzido (também chamado modelo waveless). Na medicina humana, agonistas ou antagonistas de GnRH são utilizados tanto no controle de disfunções ovarianas quanto na preparação de pacientes para procedimentos de reprodução assistida. Em bovinos, este efeito pode ser obtido pela imunização ativa contra GnRH, e mostrou-se estratégia viável, por exemplo, no controle de casos crônicos de doença ovariana cística em doadoras de oócitos. Contudo, é importante considerar a grande variação individual na resposta à imunização e consequente impossibilidade de controlar a duração do anestro induzido. O modelo waveless também é de grande utilidade na pesquisa, uma vez que elimina a potencial interferência do FSH e LH endógenos, aumentando a sensibilidade nos ensaios com hormônios exógenos e consequentemente reduzindo o número de réplicas necessárias nos estudos.(AU)

Mathematical model for estimating the leaf area of cured dry tobacco using linear measurements / Modelo matemático para estimar a área foliar do tabaco seco curado por meio de medidas lineares

Leaf area of dried Flue-cured tobacco is a reflection of climate and stage of growth of fresh tobacco in field; it also serves as the foundation for calculating a number of significant physical properties of tobacco. So the purpose of this paper was to establish a model to estimate the leaf area of dried Flue-cured tobacco in China from linear dimensions. Three Hundred eight tobacco leaves from different growing area and stalk position were sampled randomly and separated for model selection among linear, proportional and power model type and external evaluation individually. Results showed that there was a significant and strong correlation between leaf area and length×width , The equation LA = 0.495(L×W), where LA is the leaf area and L×W is the product of leaf length and width, was optimum and adequate for the estimation of leaf area of dried tobacco in China examined by Fisher's test, Akaike delta information criterion (AIC) and Bayesian information criterion (BIC). Growing area and stalk position had minor effect on the parameter before (L×W). The equation can sufficiently predict the area of leaf for external evaluation.

A área foliar do tabaco curado pelo Flue seco é um reflexo do clima e do estágio de crescimento do tabaco fresco no campo; também serve como base para o cálculo de várias propriedades físicas significativas do tabaco. Portanto, o objetivo deste artigo foi estabelecer um modelo para estimar a área foliar do tabaco curado por Flue seco na China a partir de dimensões lineares. Foram amostradas aleatoriamente 308 folhas de tabaco de diferentes áreas de cultivo e posição do colmo e separadas para seleção de modelos entre tipo linear, proporcional e de potência e avaliação externa individualmente. Os resultados mostraram que houve uma correlação significativa e forte entre área foliar e comprimento×largura. A equação LA = 0,495 (L×W), em que LA é a área foliar e L×W é o produto do comprimento e largura da folha, ótima e adequada para a estimativa da área foliar de tabaco seco na China examinada pelo teste de Fisher, critério de informação delta de Akaike (AIC) e critério de informação bayesiana (BIC). A área de cultivo e a posição do caule tiveram efeito menor no parâmetro antes (C×L). A equação pode prever suficientemente a área da folha para avaliação externa.

Validation of the PhenoGlad model and determination of planting dates of the gladiolo / Validação do modelo PhenoGlad e determinação de datas de plantio do gladíolo

Mathematical models that simulate crop development are important tools to help growers plan management practices and harvest time for cut flowers such as gladiolus. This study aimed to validate the gladiolus phenology model, named PhenoGlad for the State of Paraná and determine the planting date for marketing flowers for the All Souls' Day and the quality of the floral stems. The validation of the PhenoGlad model was conducted in 2019 through field tests with different cultivars in five towns in the State of Paraná: Cascavel and Santa Helena (cultivar T704), Dois Vizinhos (cultivar White Goddes), Marechal Cândido Rondon (cultivars White Goddes and T704), and Palotina (cultivars T704 and Red Beauty). To estimate planting dates, the PhenoGlad model was run for 20 towns in different regions of the state, based on the periods of weather data available at each weather station, and for early, intermediate II, and late development cycles. The planting date was determined based on the average of the dates (Julian days) in each simulated year. The variables analyzed were the stages of development according to the phenological scale of the culture, number of leaves, average number of florets, and classification of floral stems according to the quality standards of Veiling Holambra. The PhenoGlad model was accurate in simulating the stages of development of gladiolus culture in the state of Paraná and suitable for predicting the damage caused by extreme temperatures in floral stems, which was confirmed by the damage caused to sepals and petals of gladiolus, cultivar T704, in field experiments in the towns of Cascavel, Palotina, and Santa Helena, and cultivar White Goddess for Dois Vizinhos. The best model performance was observed when simulating the vegetative period of the crop, with a low error of 0.54 leaf. In the state of Paraná, for the production of floral stems for the All Soul's Day, the PhenoGlad model simulated the planting dates for the 20 towns, from August 1 to August 23 for early cycle, July 18 to August 14 for intermediate II cycle, and July 7 to August 6 for late cycle. The towns of Cascavel and Marechal Cândido Rondon presented a higher number of florets and higher quality floral stems than the other towns evaluated.

Modelos matemáticos que simulam o desenvolvimento das culturas são ferramentas importantes para ajudar produtores no planejamento das práticas de manejo e épocas de colheita de flores de corte, como o gladíolo. O objetivo deste trabalho foi validar o modelo fenológico gladiolus, denominado PhenoGlad para o Estado do Paraná, determinar a data de plantio para comercialização de flores para o dia de Finados, e a qualidade das hastes florais. A validação do modelo PhenoGlad foi através de ensaios de campo durante o ano de 2019, com diferentes cultivares em cinco municípios do Estado do Paraná: Cascavel e Santa Helena (cultivar T704), Dois Vizinhos (cultivar White Goddes), Marechal Cândido Rondon (cultivares White Goddes e T704), e Palotina (cultivares T704 e Red Beauty). Para estimar as datas de plantio o modelo PhenoGlad foi rodado para 20 municípios das diferentes regiões do estado, com base nos períodos de dados meteorológicos disponíveis em cada estação meteorológica, e para os ciclos de desenvolvimento precoce, intermediário II e tardio. A data de plantio do gladíolo foi determinada por meio da média das datas (dias julianos) para cada ano simulado. As variáveis analisadas foram os estádios de desenvolvimento de acordo com a escala fenológica da cultura, número de folhas, número médio de floretes e classificação das hastes florais de acordo com os padrões de qualidade de Veiling Holambra. O modelo PhenoGlad apresentou acurácia ao simular os estádios de desenvolvimento da cultura do gladíolo no Estado do Paraná e também é apropriado para predizer os danos por temperaturas extremas nas hastes florais, o que se confirmou com os danos causados nas sépalas e pétalas do gladíolo, cultivar T704, nos experimentos de campo nas cidades de Cascavel, Palotina e Santa Helena, e para cultivar White Goddess em Dois Vizinhos. O melhor desempenho do modelo foi observado ao simular o período vegetativo da cultura, apresentando baixo erro de 0,54 folha. No Estado do Paraná, para produção de hastes na data de Finados, o modelo PhenoGlad simulou as datas de plantio, para as 20 cidades estudadas, de 1 a 23 de agosto para ciclo precoce, 18 de julho a 14 de agosto para o ciclo intermediário II, e 7 de julho a 6 de agosto para o ciclo tardio. As cidades de Cascavel e Marechal Cândido Rondon apresentaram maior número de floretes e qualidade de hastes superior aos demais municípios avaliados.

Mathematical models to describe the growth curves of Vietnamese Ri chicken / Modelos matemáticos para descrever as curvas de crescimento do frango Ri vietnamita

Abstract Ri chicken is the most popular backyard chicken breed in Vietnam, but little is known about the growth curve of this breed. This study compared the performances of models with three parameters (Gompertz, Brody, and Logistic) and models containing four parameters (Richards, Bridges, and Janoschek) for describing the growth of Ri chicken. The bodyweight of Ri chicken was recorded weekly from week 1 to week 19. Growth models were fitted using minpack.lm package in R software and Akaike's information criterion (AIC), Bayesian information criterion (BIC), and root mean square error (RMSE) were used for model comparison. Based on these criteria, the models having four parameters showed better performance than the ones with three parameters, and the Richards model was the best one for males and females. The lowest and highest value of asymmetric weights (α) were obtained by Bridges and Brody models for each of sexes, respectively. Age and weight estimated by the Richard model were 8.46 and 7.51 weeks and 696.88 and 487.58 g for males and for females, respectively. Differences in the growth curves were observed between males and female chicken. Overall, the results suggested using the Richards model for describing the growth curve of Ri chickens. Further studies on the genetics and genomics of the obtained growth parameters are required before using them for the genetic improvement of Ri chickens.

Resumo O frango Ri é a raça de frango de quintal mais popular do Vietnã, mas pouco se sabe sobre a curva de crescimento dessa raça. Este estudo comparou o desempenho de modelos com três parâmetros (Gompertz, Brody e Logistic) e modelos contendo quatro parâmetros (Richards, Bridges e Janoschek) para descrever o crescimento do frango Ri. O peso corporal do frango Ri foi registrado semanalmente da semana 1 à semana 19. Os modelos de crescimento foram ajustados usando o pacote minpack.lm no software R e o critério de informação de Akaike (AIC); critério de informação bayesiano (BIC) e erro quadrático médio (RMSE) foram usados ​​para comparação de modelos. Com base nesses critérios, os modelos com quatro parâmetros apresentaram melhor desempenho do que os com três parâmetros, sendo o modelo de Richards o melhor para homens e mulheres. O menor e o maior valor dos pesos assimétricos (α) foram obtidos pelos modelos Bridges e Brody para cada um dos sexos, respectivamente. A idade e o peso estimados pelo modelo de Richard foram de 8,46 e 7,51 semanas e 696,88 e 487,58 g para homens e mulheres, respectivamente. Diferenças nas curvas de crescimento foram observadas entre frangos machos e fêmeas. No geral, os resultados sugeriram o uso do modelo de Richards para descrever a curva de crescimento de frangos Ri. Mais estudos sobre a genética e genômica dos parâmetros de crescimento obtidos são necessários antes de usá-los para o melhoramento genético de frangos Ri.

Evaluating tree survival and modeling initial growth for Atlantic Forest restoration / Avaliação da sobrevivência e modelagem do desenvolvimento inicial de árvores para restauração da Mata Atlântica

ABSTRACT: Ecological restoration has become an important complementary practice to protect natural resources and preserve biodiversity. However, native species may be used in restoration programs in ways that do not optimize their performance. This research evaluated the survival and to model the initial growth of 15 native tree species planted in "filling" and "diversity" lines in the post-planting phase of a restoration experiment in the subtropics of the Brazilian Atlantic Forest. We measured survival rate (%) one year after planting and collar diameter (mm), total height (m), crown projection area (m²) and crown volume (m³) in the first 48 months after planting. Growth modeling for each variable and species was based on the non-linear mathematical Logistic, Gompertz, and Chapman-Richards models. Model selection for each variable/species was supported by the Akaike Information Criterion, standard error of the estimate, and coefficient of determination. The highest survival rates were reported for Cordia americana, Gochnatia polymorpha, Inga uruguensis, Peltophorum dubium, Prunus sellowii e Zanthoxylum rhoifolium (91.7%) and for Solanum mauritianum (90.3%). The species with faster growth were, by increasing order, Mimosa scabrella, Trema micrantha, Solanum mauritianum and Croton urucurana. With a better understanding of the initial developmental potential of tree species, it is possible to increase the species and functional diversity of the filling group. There was no single model capable of describing the variables analyzed and different models were needed to describe different characteristics and species.

RESUMO: A restauração ecológica tornou-se uma importante atividade complementar para proteger os recursos naturais e conservar a biodiversidade. No entanto, as espécies nativas podem estar a ser utilizadas em programas de restauração de formas que não otimizam as suas características. O objetivo deste trabalho foi avaliar a sobrevivência e modelar o desenvolvimento inicial de 15 espécies arbóreas nativas plantadas em linhas de "preenchimento" e "diversidade" na fase de pós-plantio numa experiência de restauração nos subtrópicos da Mata Atlântica Brasileira. Avaliou-se a taxa de sobrevivência (%) um ano após o plantio e o diâmetro do colo (mm), a altura total (m), a área de projeção de copa (m²) e o volume de copa (m³) nos primeiros 48 meses após o plantio. A modelagem de crescimento para cada variável e espécie foi baseada nos modelos matemáticos não lineares: Logístico, Gompertz e Chapman-Richards. A seleção do modelo para cada variável/espécie teve como base o Critério de Informação de Akaike, erro padrão da estimativa e coeficiente de determinação. Os percentuais de sobrevivência mais altos foram para Cordia americana, Gochnatia polymorpha, Inga uruguensis, Peltophorum dubium, Prunus sellowii e Zanthoxylum rhoifolium (91,7%) e para Solanum mauritianum (90,3%). As espécies de crescimento mais rápido, por ordem crescente, foram: Mimosa scabrella, Trema micrantha, Solanum mauritianum e Croton urucurana. Com o conhecimento do potencial de desenvolvimento inicial das espécies, é possível aumentar a diversidade de espécies e funcional do grupo de preenchimento. Não houve um modelo único capaz de descrever todas as variáveis de desenvolvimento analisadas. Foram necessários diferentes modelos para descrever as diferentes características e as diferentes espécies.

Metabolic profile, antimicrobial and toxicity evaluation of Azadirachta indica roots / Perfil metabólico, atividade antimicrobiana e de toxicidade das raízes de Azadirachta indica

ABSTRACT: The constituents of the hydroethanolic extract ofAzadiractaindicaroot were investigated using ultra-performance liquid chromatography-quadrupole-time-of-flight mass spectrometry (UPLC-QTOOF-MSE). Acute toxicity was evaluated in an experimental animal model. We investigated the antibacterial activities ofA. indicaroots againstSalmonella typhimuriumandStaphylococcus aureusand the antifungal activities against strains ofTrichophyton rubrum, Candida albicansandCandida tropicalis. We identified nine secondary metabolites in the hydroethanolic extract by UPLC-QTOOF-MSE. The extract was highly effective in inhibiting the growth of T. rubrum strains, so it can be effective in combating the dermatophyte tested,but it had no inhibition potential on any bacterial strains orCandidaspecies evaluated. It was possible to infer that the extract had no acute toxicity in relation to the animal model Danio rerio. Therefore, since neem has a high bioactive potential and adapts well to the climate of semiarid regions, growing this species could become a source of income for farmers by its use to produce naturals fungicide and drug, as alternatives to conventional products, which can cause microbiological resistance and/or are toxic to the environment, besides being expensive.

RESUMO: Os constituintes do extrato hidroetanólico da raiz deA. indicaforam investigados por cromatografia líquida de ultra-alta performance acoplada à espectrometria de massas do tipo quadrupolo-tempo de voo (UPLC-QTOOF-MSE). A toxicidade aguda foi avaliada em modelo animal. Investigamos as atividades antibacterianas contra Salmonella typhimuriumeStaphylococcus aureuse as atividades antifúngicas contra cepas deTrichophyton rubrum, Candida albicanseCandida tropicalis. Identificamos nove metabólitos secundários no extrato etanólico por UPLC-QTOOF-MSE. O extrato foi altamente eficaz na inibição do crescimento de cepas de T. rubrum, podendo ser eficaz no combate ao dermatofito avaliado, mas não apresentou potencial de inibição em nenhuma cepa bacteriana ou espécies deCandidaavaliadas. Também foi possível inferir que o extrato não apresentou toxicidade aguda em relação ao modelo animalDanio rerio. Portanto, como o Neem tem alto potencial bioativo e se adapta bem ao clima das regiões semiáridas, o cultivo dessa espécie pode se tornar uma fonte de renda para os agricultores a partir da utilização da planta para produção de fungicida e/ou fármaco naturais como alternativa aos produtos convencionais, que podem causar resistência microbiológica e/ou são tóxicas ao meio ambiente, além de serem caros.

Path analysis and near-infrared spectroscopy in canola crop / Análise de trilha e espectroscopia no infravermelho próximo na cultura da canola

This study measured the effect of the association between agronomic traits related to the yield of canola grains grown at different sowing dates through path analysis. Another objective was to obtain a method to predict the oil content in the grains, fitting a multivariate model through near-infrared (NIR) spectroscopy analysis. The experiment was conducted in the field using a randomized block design in plots subdivided by time, with four plots (sowing dates), six subplots (canola hybrids), and four replicates. In each hybrid, phenological observations were performed, and the grain yield was determined. The data were subjected to analysis of variance in the R environment using the F test at 5% probability. The oil content in the grains was determined by the traditional chemical method, and based on the NIR spectral signature of the grain samples, partial least squares regression (PLS-R) was established to estimate the oil content in the canola grains. The sowing dates influenced the production components and oil content of the grains of all hybrids. The trait number of grains in five plants (0.6857) and their height (0.4943) had greater estimates of positive correlations with grain yield, as well as higher values of positive direct effects on yield (0.2494 and 0.1595, respectively). The NIR technique combined with PLS-R was able to predict the oil content in the grains, resulting in good predictive models (R2 of 0.86 and root mean square error (RMSE) of 1.56 in external validation).

Objetivou-se mensurar o efeito da associação entre caracteres agronômicos relacionados à produtividade de grãos de canola cultivada em diferentes épocas de semeadura, através da análise de trilha. Assim como também objetivou-se obter um método para predizer o teor de óleo nos grãos, ajustando um modelo multivariado através da análise por espectroscopia na região do infravermelho próximo. O experimento foi conduzido em campo, utilizando-se o delineamento de blocos ao acaso, em parcelas subdivididas no tempo, sendo quatro parcelas (épocas de semeadura) e seis subparcelas (híbridos de canola), com quatro repetições. Em cada híbrido foram realizadas observações fenológicas e determinada a produtividade de grãos. Os dados foram submetidos à análise de variância em ambiente R pelo teste F, a cinco de probabilidade. O teor de óleo nos grãos foi determinado pelo método químico tradicional, e com base na assinatura espectral no infravermelho próximo de amostras dos grãos foi estabelecida regressão dos mínimos quadrados parciais (PLS-R) para estimar o teor de óleo nos grãos de canola. As épocas de semeadura influenciaram os componentes de produção e o teor de óleo dos grãos de todos híbridos. Os caracteres número de grãos em cinco plantas (0,6857) e altura (0,4943) apresentaram maiores estimativas de correlação positiva com a produtividade de grãos, assim como os maiores valores de efeito direto positivo sobre a produtividade, 0,2494 e 0,1595 respectivamente. Entretanto, o ciclo total (-0,7848), juntamente com dias em florescimento (-0,4520) apresentou correlação significativa negativa com a produtividade. A técnica NIR associada à PLS-R foi capaz de predizer o teor de óleo nos grãos, resultando em bons modelos preditivos (R2 de 0,86 e RMSE de 1,56 na validação externa) que podem ser usados com sucesso na análise da qualidade das amostras após colheita e nos programas de melhoramento genético.

Endophytic Bacillus subtilis P10 from Prunus cerasifera as a biocontrol agent against tomato Verticillium wilt

Abstract Endophytic bacteria serve key roles in the maintenance of plant health and growth. Few studies to date, however, have explored the antagonistic and plant growth-promoting (PGP) properties of Prunus cerasifera endophytes. To that end, we isolated endophytic bacteria from P. cerasifera tissue samples and used a dual culture plate assay to screen these microbes for antagonistic activity against Verticillium dahliae, Botryosphaeria dothidea, Fusarium oxysporum, F. graminearum, and F. moniliforme. Of the 36 strains of isolated bacteria, four (strains P1, P10, P16, and P20) exhibited antagonistic effects against all five model pathogens, and the P10 strain exhibited the strongest antagonistic to five pathogens. This P10 strain was then characterized in-depth via phenotypic assessments, physiological analyses, and 16s rDNA sequencing, revealing it to be a strain of Bacillus subtilis. Application of a P10 cell suspension (1×108 CFU/mL) significantly enhanced the seed germination and seedling growth of tomato in a greenhouse setting. This P10 strain further significantly suppressed tomato Verticillium wilt with much lower disease incidence and disease index scores being observed following P10 treatment relative to untreated plants in pot-based experiments. Tomato plants that had been treated with strain P10 also enhanced defense-related enzymes, peroxidase, superoxide dismutase, and catalase activity upon V. dahliae challenge relative to plants that had not been treated with this endophytic bacterium. The results revealed that the P10 bacterial strain has potential value as a biocontrol agent for use in the prevention of tomato Verticillium wilt.

Resumo As bactérias endofíticas desempenham papel fundamental na manutenção da saúde e do crescimento das plantas. Poucos estudos até o momento, no entanto, exploraram as propriedades antagônicas e promotoras de crescimento de plantas (PGP) de endófitos de Prunus cerasifera. Para esse fim, isolamos bactérias endofíticas de amostras de tecido de P. cerasifera e usamos um ensaio de placa de cultura dupla para rastrear esses micróbios quanto à atividade antagonista contra Verticillium dahliae, Botryosphaeria dothidea, Fusarium oxysporum, F. graminearum e F. moniliforme. Das 36 cepas de bactérias isoladas, quatro (cepas P1, P10, P16 e P20) exibiram efeitos antagônicos contra todos os cinco patógenos modelo, e a cepa P10 exibiu o antagonista mais forte para cinco patógenos. Essa cepa P10 foi então caracterizada em profundidade por meio de avaliações fenotípicas, análises fisiológicas e sequenciamento de rDNA 16s, revelando ser uma cepa de Bacillus subtilis. A aplicação de uma suspensão de células P10 (1 × 108 UFC / mL) aumentou significativamente a germinação das sementes e o crescimento das mudas de tomate em casa de vegetação. Essa cepa P10 suprimiu ainda mais a murcha de Verticillium do tomate com incidência de doença muito menor e pontuações de índice de doença sendo observadas após o tratamento com P10 em relação a plantas não tratadas em experimentos baseados em vasos. As plantas de tomate que foram tratadas com a cepa P10 também aumentaram as enzimas relacionadas à defesa, peroxidase, superóxido dismutase e atividade da catalase após o desafio de V. dahliae em relação às plantas que não foram tratadas com essa bactéria endofítica. Os resultados revelaram que a cepa bacteriana P10 tem valor potencial como agente de biocontrole para uso na prevenção da murcha de Verticillium em tomate.

Acid resistance of Salmonella Typhimurium ATCC 14028 after desiccation stress during peanut storage / Avaliação da resistência ácida de Salmonella Typhimurium ATCC 14028 após o estresse dessecativo durante o armazenamento de amendoim

ABSTRACT: Salmonella is a relevant pathogen, which causes foodborne outbreaks associated with both high and low moisture foods (LMF). This study evaluated the effect of previous desiccation stress on the acid resistance of S. Typhimurium ATCC 14028 using blanched peanut kernels as an LMF model. Salmonella was recovered from the peanut samples throughout 180 days of blanched peanut kernels storage at 28 ºC. During this period two death rates were verified, 0.04 log cfu/g/day in the first 30 days and 0.007 log cfu/g/day between 30 and180 days.Regarding acid resistance, there was no difference (P > 0.05) in the Salmonella growth/death kinetics between the undesiccated sample (TSB)and the cells recovered from peanut samples over 180 days of storage after 4 h at pHs 3.0, 3.5, 4.5 and 7.2. The average growth rate observed for pH 7.2 was 0.44 log cfu/ml/h. At pH 4.5, the Salmonella counts did not change significantly over 4 h. In contrast, Salmonella populations declined by 0.14 to 0.29 log cfu/ml/h at pH 3.5. At pH 3.0 declines were estimated to be 0.65 log cfu/ml/h for the undesiccated sample and 2.07 log cfu/ml/h for Salmonella recovered from peanuts stored for 120 days. Therefore, our data indicated that desiccation stress caused during the peanut storagedid not influence the Salmonella acid resistance.

RESUMO: Em alimentos de baixa umidade (LMF), o primeiro desafio encontrado por patógenos como a Salmonella é o estresse de dessecação. Neste estudo, o efeito prévio do estresse de dessecação sobre a resistência ácida de S. Typhimurium ATCC 14028 foi avaliado utilizando amendoim blancheado como um modelo de LMF. Salmonella foi recuperada das amostras de amendoim após 180 dias de estocagem a 28 ºC. Durante este período foram verificadas duas taxas de mortalidade, 0,04 log ufc/g/dia nos primeiros 30 dias e 0,007 log ufc/g/dia entre 30 e 180 dias. Com relação à resistência ácida, não houve diferença (P > 0,05) na cinética de crescimento/morte de Salmonella entre a amostra sem estresse dessecativo (TSB) e as amostras de amendoim após 4 h em pHs 3,0, 3,5, 4,5 e 7,2. A taxa média de crescimento observada para o pH 7,2 foi de 0,44 log cfu/ml/h. No pH 4,5, a contagem de Salmonella não mudou significativamente durante 4 h. Em contraste, a população de Salmonella diminuiu de 0,14 a 0,29 log cfu/ml/h no pH 3,5. No pH 3,0, a queda foi estimada em 0,65 log cfu/ml/h para a amostra sem estresse dessecativo e 2,07 log cfu/ml/h para a Salmonella recuperada das amostras de amendoim estocadas por 120 dias. Portanto, nossos dados indicaram que o estresse dessecativo causado durante a estocagem do amendoim não influenciou a resistência ácida de Salmonella.

Acid resistance of Salmonella Typhimurium ATCC 14028 after desiccation stress during peanut storage / Avaliação da resistência ácida de Salmonella Typhimurium ATCC 14028 após o estresse dessecativo durante o armazenamento de amendoim

Salmonella is a relevant pathogen, which causes foodborne outbreaks associated with both high and low moisture foods (LMF). This study evaluated the effect of previous desiccation stress on the acid resistance of S. Typhimurium ATCC 14028 using blanched peanut kernels as an LMF model. Salmonella was recovered from the peanut samples throughout 180 days of blanched peanut kernels storage at 28 ºC. During this period two death rates were verified, 0.04 log cfu/g/day in the first 30 days and 0.007 log cfu/g/day between 30 and180 days.Regarding acid resistance, there was no difference (P > 0.05) in the Salmonella growth/death kinetics between the undesiccated sample (TSB)and the cells recovered from peanut samples over 180 days of storage after 4 h at pHs 3.0, 3.5, 4.5 and 7.2. The average growth rate observed for pH 7.2 was 0.44 log cfu/ml/h. At pH 4.5, the Salmonella counts did not change significantly over 4 h. In contrast, Salmonella populations declined by 0.14 to 0.29 log cfu/ml/h at pH 3.5. At pH 3.0 declines were estimated to be 0.65 log cfu/ml/h for the undesiccated sample and 2.07 log cfu/ml/h for Salmonella recovered from peanuts stored for 120 days. Therefore, our data indicated that desiccation stress caused during the peanut storagedid not influence the Salmonella acid resistance.

Em alimentos de baixa umidade (LMF), o primeiro desafio encontrado por patógenos como a Salmonella é o estresse de dessecação. Neste estudo, o efeito prévio do estresse de dessecação sobre a resistência ácida de S. Typhimurium ATCC 14028 foi avaliado utilizando amendoim blancheado como um modelo de LMF. Salmonella foi recuperada das amostras de amendoim após 180 dias de estocagem a 28 ºC. Durante este período foram verificadas duas taxas de mortalidade, 0,04 log ufc/g/dia nos primeiros 30 dias e 0,007 log ufc/g/dia entre 30 e 180 dias. Com relação à resistência ácida, não houve diferença (P > 0,05) na cinética de crescimento/morte de Salmonella entre a amostra sem estresse dessecativo (TSB) e as amostras de amendoim após 4 h em pHs 3,0, 3,5, 4,5 e 7,2. A taxa média de crescimento observada para o pH 7,2 foi de 0,44 log cfu/ml/h. No pH 4,5, a contagem de Salmonella não mudou significativamente durante 4 h. Em contraste, a população de Salmonella diminuiu de 0,14 a 0,29 log cfu/ml/h no pH 3,5. No pH 3,0, a queda foi estimada em 0,65 log cfu/ml/h para a amostra sem estresse dessecativo e 2,07 log cfu/ml/h para a Salmonella recuperada das amostras de amendoim estocadas por 120 dias. Portanto, nossos dados indicaram que o estresse dessecativo causado durante a estocagem do amendoim não influenciou a resistência ácida de Salmonella.

Assessments of some trace metals in water samples of nursery pond of Grass Carp (Ctenopharyngodon idella, Valenciennes, 1844) in Bannu Fish Hatchery of Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan

Abstract The present investigation was aimed to examine the concentrations of trace metals including e.g copper (Cu), manganese (Mn), nickel (Ni), and zinc (Zn) in water samples collected from nursery pond of grass carp (Ctenopharyngodon idella) in Bannu Hatchery of Khyber Pakhtunkhwa during the period from April 2018 to January 2019. The temperature and pH of each water sample were measured for the whole study duration. The concentration of Copper (Cu), Manganese (Mn), Nickel (Ni), and Zinc (Zn) in collected water samples were measured in mg/liter by using Atomic Absorption Spectrophotometer. The blank and standard solutions for device calibration Standard solutions i.e., 2.0 mg, 4.0 mg, and 6.0 were used to measure the concentration of these metals in water samples to verify the measurements. The data was statistically analyzed on descriptive statistics (estimation of proportions and standard deviation) used to summarize mean concentration. The results obtained of both temperature and pH of water samples were found in ranged 10 to 36 0C and 7.0 to 8.44; whereas the size of fry stages was ranged from 4.0 to 56.0 mm in total length. The results of investigated metals found in pond water samples are in order of Zn>Mn>Ni>Cu, respectively. As optimum temperature and pH for grass carp were mostly between 15 0C and 30 0C and pH 6.5 to 8.0. It was concluded from obtained results that temperature, pH, and trace metals were found appropriate for the growth of Ctenopharyngodon idella from fry to fingerling stages, but the highest amount of zinc can cause its mortality. It is a preliminary study on grass carp culturing in Bannu fish hatchery so, it would provide useful information for model fish seed production unit in a hatchery.

Resumo A presente investigação teve como objetivo examinar as concentrações de metais traço, incluindo cobre (Cu), manganês (Mn), níquel (Ni) e zinco (Zn) em amostras de água coletadas de viveiro de carpa-capim (Ctenopharyngodon idella) em Incubatório de Bannu de Khyber Pakhtunkhwa durante o período de abril de 2018 a janeiro de 2019. A temperatura e o pH de cada amostra de água foram medidos durante todo o período do estudo. A concentração de cobre (Cu), manganês (Mn), níquel (Ni) e zinco (Zn) nas amostras de água coletadas foi medida em mg / litro usando espectrofotômetro de absorção atômica. As soluções em branco e padrão para as soluções padrão de calibração do dispositivo, ou seja, 2,0 mg, 4,0 mg e 6,0, foram usadas para medir a concentração desses metais em amostras de água para verificar as medições. Os dados foram analisados estatisticamente em estatística descritiva (estimativa de proporções e desvio padrão) usada para resumir a concentração média. Os resultados obtidos tanto de temperatura quanto de pH das amostras de água variaram de 10 a 36 0C e 7,0 a 8,44, enquanto o tamanho dos estágios de alevinos variou de 4,0 a 56,0 mm no comprimento total. Os resultados dos metais investigados encontrados em amostras de água de lagoas são da ordem de Zn > Mn > Ni > Cu, respectivamente. A temperatura e o pH ótimos para a carpa-capim foram principalmente entre 15 0C e 30 0C e pH 6,5 a 8,0. Concluiu-se, a partir dos resultados obtidos, que temperatura, pH e traços de metais foram considerados adequados para o crescimento de Ctenopharyngodon idella desde os estágios de alevinos até alevinos, mas a maior quantidade de zinco pode causar sua mortalidade. É um estudo preliminar sobre a cultura da carpa-capim em incubatório de peixes Bannu, portanto forneceria informações úteis para modelo de unidade de produção de sementes de peixes em um incubatório.

Metabolic profile, antimicrobial and toxicity evaluation of Azadirachta indica roots / Perfil metabólico, atividade antimicrobiana e de toxicidade das raízes de Azadirachta indica

The constituents of the hydroethanolic extract ofAzadiractaindicaroot were investigated using ultra-performance liquid chromatography-quadrupole-time-of-flight mass spectrometry (UPLC-QTOOF-MSE). Acute toxicity was evaluated in an experimental animal model. We investigated the antibacterial activities ofA. indicaroots againstSalmonella typhimuriumandStaphylococcus aureusand the antifungal activities against strains ofTrichophyton rubrum, Candida albicansandCandida tropicalis. We identified nine secondary metabolites in the hydroethanolic extract by UPLC-QTOOF-MSE. The extract was highly effective in inhibiting the growth of T. rubrum strains, so it can be effective in combating the dermatophyte tested,but it had no inhibition potential on any bacterial strains orCandidaspecies evaluated. It was possible to infer that the extract had no acute toxicity in relation to the animal model Danio rerio. Therefore, since neem has a high bioactive potential and adapts well to the climate of semiarid regions, growing this species could become a source of income for farmers by its use to produce naturals fungicide and drug, as alternatives to conventional products, which can cause microbiological resistance and/or are toxic to the environment, besides being expensive.

Os constituintes do extrato hidroetanólico da raiz deA. indicaforam investigados por cromatografia líquida de ultra-alta performance acoplada à espectrometria de massas do tipo quadrupolo-tempo de voo (UPLC-QTOOF-MSE). A toxicidade aguda foi avaliada em modelo animal. Investigamos as atividades antibacterianas contra Salmonella typhimuriumeStaphylococcus aureuse as atividades antifúngicas contra cepas deTrichophyton rubrum, Candida albicanseCandida tropicalis. Identificamos nove metabólitos secundários no extrato etanólico por UPLC-QTOOF-MSE. O extrato foi altamente eficaz na inibição do crescimento de cepas de T. rubrum, podendo ser eficaz no combate ao dermatofito avaliado, mas não apresentou potencial de inibição em nenhuma cepa bacteriana ou espécies deCandidaavaliadas. Também foi possível inferir que o extrato não apresentou toxicidade aguda em relação ao modelo animalDanio rerio. Portanto, como o Neem tem alto potencial bioativo e se adapta bem ao clima das regiões semiáridas, o cultivo dessa espécie pode se tornar uma fonte de renda para os agricultores a partir da utilização da planta para produção de fungicida e/ou fármaco naturais como alternativa aos produtos convencionais, que podem causar resistência microbiológica e/ou são tóxicas ao meio ambiente, além de serem caros.

Impact of urbanization on agricultural ecological efficiency: evidence from China / Impacto da urbanização na eficiência ecológica agrícola: evidência da China

Agricultural ecological efficiency is of great value to the government's agricultural policy formulation. Research on the factors affecting agricultural ecological efficiency can provide support for the formation of countermeasures to improve agricultural ecological efficiency. Existing research has not conducted an in-depth analysis of the impact of urbanization on agricultural ecological efficiency, and there is a lack of relevant research on the impact of urbanization on agricultural ecological efficiency. This article is based on the data of 30 provinces and cities in China from 2009 to 2018, using the SBM model that considers undesired output, entropy method, Tobit model and other models and methods to measure agricultural ecological efficiency and urbanization comprehensive index, and analyze the impact of urbanization comprehensive index and urbanization indicators on agricultural ecological efficiency. The research results are as follows: 1) The overall agricultural ecological efficiency in China's 30 provinces and cities has been increasing from 2009 to 2018. The eastern region has the highest agricultural ecological efficiency, followed by the western region, and the central and northeastern regions have relatively low values; 2) The comprehensive urbanization index of China's 30 provinces and cities continued to grow from 2009 to 2018.The level of urbanization in the eastern region is the highest, in the central region has increased rapidly from 2009 to 2018, and in the western and northeastern regions is relatively low; 3) The overall increase in urbanization can promote the improvement of agricultural ecological efficiency. The impact of specific urbanization indicators on agricultural ecological efficiency is complex. Therefore, discussing the impact of urbanization on agricultural ecological efficiency cannot be considered from a single aspect, but should be analyzed from multiple perspectives.

A eficiência ecológica agrícola é de grande valor para a formulação da política agrícola do governo. A pesquisa sobre os fatores que afetam a eficiência ecológica agrícola pode fornecer suporte para a formação de contramedidas para melhorar a eficiência ecológica agrícola. A pesquisa existente não conduziu uma análise aprofundada do impacto da urbanização na eficiência ecológica agrícola, e há uma falta de pesquisas relevantes sobre o impacto da urbanização na eficiência ecológica agrícola. Este artigo é baseado em dados de 30 províncias e cidades na China de 2009 a 2018, usando o modelo SBM que considera produção indesejada, método de entropia, modelo Tobit e outros modelos e métodos para medir a eficiência ecológica agrícola e índice abrangente de urbanização, e analisar o impacto do índice abrangente de urbanização e dos indicadores de urbanização na eficiência ecológica agrícola. Os resultados da pesquisa são os seguintes: 1) A eficiência ecológica agrícola geral nas 30 províncias e cidades da China aumentou de 2009 a 2018. A região leste apresenta a maior eficiência ecológica agrícola, seguida pela região oeste, e as regiões centro e nordeste apresentam valores relativamente baixos; 2) O índice de urbanização abrangente das 30 províncias e cidades da China continuou a crescer de 2009 a 2018. O nível de urbanização na região leste é o mais alto, na região central aumentou rapidamente de 2009 a 2018, e no oeste e no nordeste regiões é relativamente baixo; 3) O aumento geral da urbanização pode promover a melhoria da eficiência ecológica agrícola. O impacto de indicadores específicos de urbanização na eficiência ecológica agrícola é complexo. Portanto, discutir o impacto da urbanização na eficiência ecológica da agricultura não pode ser considerado sob um único aspecto, mas deve ser analisado sob múltiplas perspectivas.

Endophytic Bacillus subtilis P10 from Prunus cerasifera as a biocontrol agent against tomato Verticillium wilt / Bacillus subtilis P10 endofítico de Prunus cerasifera como agente de biocontrole contra murcha de Verticillium de tomate

Abstract Endophytic bacteria serve key roles in the maintenance of plant health and growth. Few studies to date, however, have explored the antagonistic and plant growth-promoting (PGP) properties of Prunus cerasifera endophytes. To that end, we isolated endophytic bacteria from P. cerasifera tissue samples and used a dual culture plate assay to screen these microbes for antagonistic activity against Verticillium dahliae, Botryosphaeria dothidea, Fusarium oxysporum, F. graminearum, and F. moniliforme. Of the 36 strains of isolated bacteria, four (strains P1, P10, P16, and P20) exhibited antagonistic effects against all five model pathogens, and the P10 strain exhibited the strongest antagonistic to five pathogens. This P10 strain was then characterized in-depth via phenotypic assessments, physiological analyses, and 16s rDNA sequencing, revealing it to be a strain of Bacillus subtilis. Application of a P10 cell suspension (1×108 CFU/mL) significantly enhanced the seed germination and seedling growth of tomato in a greenhouse setting. This P10 strain further significantly suppressed tomato Verticillium wilt with much lower disease incidence and disease index scores being observed following P10 treatment relative to untreated plants in pot-based experiments. Tomato plants that had been treated with strain P10 also enhanced defense-related enzymes, peroxidase, superoxide dismutase, and catalase activity upon V. dahliae challenge relative to plants that had not been treated with this endophytic bacterium. The results revealed that the P10 bacterial strain has potential value as a biocontrol agent for use in the prevention of tomato Verticillium wilt.

Resumo As bactérias endofíticas desempenham papel fundamental na manutenção da saúde e do crescimento das plantas. Poucos estudos até o momento, no entanto, exploraram as propriedades antagônicas e promotoras de crescimento de plantas (PGP) de endófitos de Prunus cerasifera. Para esse fim, isolamos bactérias endofíticas de amostras de tecido de P. cerasifera e usamos um ensaio de placa de cultura dupla para rastrear esses micróbios quanto à atividade antagonista contra Verticillium dahliae, Botryosphaeria dothidea, Fusarium oxysporum, F. graminearum e F. moniliforme. Das 36 cepas de bactérias isoladas, quatro (cepas P1, P10, P16 e P20) exibiram efeitos antagônicos contra todos os cinco patógenos modelo, e a cepa P10 exibiu o antagonista mais forte para cinco patógenos. Essa cepa P10 foi então caracterizada em profundidade por meio de avaliações fenotípicas, análises fisiológicas e sequenciamento de rDNA 16s, revelando ser uma cepa de Bacillus subtilis. A aplicação de uma suspensão de células P10 (1 × 108 UFC / mL) aumentou significativamente a germinação das sementes e o crescimento das mudas de tomate em casa de vegetação. Essa cepa P10 suprimiu ainda mais a murcha de Verticillium do tomate com incidência de doença muito menor e pontuações de índice de doença sendo observadas após o tratamento com P10 em relação a plantas não tratadas em experimentos baseados em vasos. As plantas de tomate que foram tratadas com a cepa P10 também aumentaram as enzimas relacionadas à defesa, peroxidase, superóxido dismutase e atividade da catalase após o desafio de V. dahliae em relação às plantas que não foram tratadas com essa bactéria endofítica. Os resultados revelaram que a cepa bacteriana P10 tem valor potencial como agente de biocontrole para uso na prevenção da murcha de Verticillium em tomate.

Endophytic Bacillus subtilis P10 from Prunus cerasifera as a biocontrol agent against tomato Verticillium wilt / Bacillus subtilis P10 endofítico de Prunus cerasifera como agente de biocontrole contra murcha de Verticillium de tomate

Endophytic bacteria serve key roles in the maintenance of plant health and growth. Few studies to date, however, have explored the antagonistic and plant growth-promoting (PGP) properties of Prunus cerasifera endophytes. To that end, we isolated endophytic bacteria from P. cerasifera tissue samples and used a dual culture plate assay to screen these microbes for antagonistic activity against Verticillium dahliae, Botryosphaeria dothidea, Fusarium oxysporum, F. graminearum, and F. moniliforme. Of the 36 strains of isolated bacteria, four (strains P1, P10, P16, and P20) exhibited antagonistic effects against all five model pathogens, and the P10 strain exhibited the strongest antagonistic to five pathogens. This P10 strain was then characterized in-depth via phenotypic assessments, physiological analyses, and 16s rDNA sequencing, revealing it to be a strain of Bacillus subtilis. Application of a P10 cell suspension (1×108 CFU/mL) significantly enhanced the seed germination and seedling growth of tomato in a greenhouse setting. This P10 strain further significantly suppressed tomato Verticillium wilt with much lower disease incidence and disease index scores being observed following P10 treatment relative to untreated plants in pot-based experiments. Tomato plants that had been treated with strain P10 also enhanced defense-related enzymes, peroxidase, superoxide dismutase, and catalase activity upon V. dahliae challenge relative to plants that had not been treated with this endophytic bacterium. The results revealed that the P10 bacterial strain has potential value as a biocontrol agent for use in the prevention of tomato Verticillium wilt.

As bactérias endofíticas desempenham papel fundamental na manutenção da saúde e do crescimento das plantas. Poucos estudos até o momento, no entanto, exploraram as propriedades antagônicas e promotoras de crescimento de plantas (PGP) de endófitos de Prunus cerasifera. Para esse fim, isolamos bactérias endofíticas de amostras de tecido de P. cerasifera e usamos um ensaio de placa de cultura dupla para rastrear esses micróbios quanto à atividade antagonista contra Verticillium dahliae, Botryosphaeria dothidea, Fusarium oxysporum, F. graminearum e F. moniliforme. Das 36 cepas de bactérias isoladas, quatro (cepas P1, P10, P16 e P20) exibiram efeitos antagônicos contra todos os cinco patógenos modelo, e a cepa P10 exibiu o antagonista mais forte para cinco patógenos. Essa cepa P10 foi então caracterizada em profundidade por meio de avaliações fenotípicas, análises fisiológicas e sequenciamento de rDNA 16s, revelando ser uma cepa de Bacillus subtilis. A aplicação de uma suspensão de células P10 (1 × 108 UFC / mL) aumentou significativamente a germinação das sementes e o crescimento das mudas de tomate em casa de vegetação. Essa cepa P10 suprimiu ainda mais a murcha de Verticillium do tomate com incidência de doença muito menor e pontuações de índice de doença sendo observadas após o tratamento com P10 em relação a plantas não tratadas em experimentos baseados em vasos. As plantas de tomate que foram tratadas com a cepa P10 também aumentaram as enzimas relacionadas à defesa, peroxidase, superóxido dismutase e atividade da catalase após o desafio de V. dahliae em relação às plantas que não foram tratadas com essa bactéria endofítica. Os resultados revelaram que a cepa bacteriana P10 tem valor potencial como agente de biocontrole para uso na prevenção da murcha de Verticillium em tomate.