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1.
Braz. j. biol ; 832023.
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1469083

Resumo

Abstract Physids belong to Class Gastropoda; belong to Phylum Mollusca and being bioindicators, intermediate hosts of parasites and pests hold a key position in the ecosystem. There are three species of Genus Physa i.e. P. fontinalis, Physa acuta and P. gyrina water bodies of Central Punjab and were characterized on the basis of molecular markers High level of genetic diversity was revealed by polymorphic RAPD, however SSR markers were not amplified. The multivariate analysis revealed polymorphism ranging from 9.09 percent to 50 percent among the three Physid species. Total number of 79 loci were observed for the three species under study and 24 loci were observed to be polymorphic. These RAPD fragment(s) can be developed into co dominant markers (SCAR) by cloning and can be further sequenced for the development of the Physa species specific markers to identify the introduced and native species in Pakistan.


Resumo Os físidos pertencem à classe Gastropoda; pertencem ao filo Mollusca e, sendo bioindicadores, hospedeiros intermediários de parasitas e pragas, ocupam uma posição-chave no ecossistema. Existem três espécies do gênero Physa, ou seja, P. fontinalis, Physa acuta e P. gyrina em corpos dágua do Punjab Central e foram caracterizadas com base em marcadores moleculares. Alto nível de diversidade genética foi revelado por RAPD polimórfico, no entanto os marcadores SSR não foram amplificados. A análise multivariada revelou polimorfismo variando de 9,09% a 50% entre as três espécies de Physid. Um número total de 79 loci foi observado para as três espécies em estudo e 24 loci foram observados como polimórficos. Esses fragmentos RAPD podem ser desenvolvidos em marcadores codominantes (SCAR) por clonagem e podem ser posteriormente sequenciados para o desenvolvimento de marcadores específicos da espécie Physa para identificar as espécies introduzidas e nativas no Paquistão.

2.
Rev. bras. reprod. anim ; 47(3): 607-615, jul.-set. 2023. graf, tab
Artigo em Português | VETINDEX | ID: biblio-1436796

Resumo

Estudos sobre a fisiologia espermática demonstram que padrões de fertilidade e funcionalidade espermática pós-criopreservação possuem relação importante com a eficiência do metabolismo energético destas células, bem como com a sua capacidade de manter a homeostase oxidativa. Os conhecimentos sobre a relação entre perfil fisiológico de espermatozoides e fertilidade foram e, ainda estão sendo, aprimorados, com o uso de análises de perfis moleculares, com destaque para a metabolômica. As análises moleculares permitiram a identificação de classes de metabólitos importantes na fisiologia espermática, bem como de potenciais biomarcadores de fertilidade, inclusive em bovinos. No entanto, ainda não há disponível uma avaliação isolada capaz de estimar o padrão de fertilidade de amostras seminais. Há vários desafios a serem superados para a validação de biomarcadores de fertilidade, principalmente considerando-se as diferenças entre perfis metabólicos de raças distintas de touros e a heterogeneidade dos ejaculados. A superação destes desafios pode ser iniciada com um maior aproveitamento dos resultados já obtidos e futuros, com a aplicação de análises mais avançadas e com eficácia em elevado número de dados. Para tal, podem ser utilizados modelos estatísticos de inteligência artificial, cuja aplicação pode aumentar a acurácia das observações obtidas, bem como aproximá-las da aplicação pelo setor de produção animal.(AU)


Studies on sperm physiology demonstrate that fertility outcomes and sperm post-cryopreservation have an important relation with sperm energy metabolism efficiency and ability to maintain oxidative homeostasis. Knowledge on sperm physiology has been enhanced, continually, with the application of molecular profiling analysis, focusing on metabolomics. Molecular analysis allowed the identification of important classes of metabolites in sperm physiology, as well as potential fertility biomarkers, including in bovine. Despite all developments, there is still no isolated assessment available capable of estimating fertility on sperm samples. There are several challenges to be overcome for the validation of fertility biomarkers, especially considering the metabolic profiles differences between bull breeds and the ejaculate heterogeneity. Overcoming these challenges could start with the application of more advanced and effective data analysis from research database already obtained, as well as future ones. To this end, statistical models of artificial intelligence can be used, whose application can increase the accuracy of the observations obtained, as well as bringing them closer to the application by the animal production sector.(AU)


Assuntos
Biomarcadores/análise , Criopreservação/veterinária , Fertilidade/fisiologia
3.
Braz. j. biol ; 83: 1-8, 2023. map, ilus, tab
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1468867

Resumo

Physids belong to Class Gastropoda; belong to Phylum Mollusca and being bioindicators, intermediate hosts of parasites and pests hold a key position in the ecosystem. There are three species of Genus Physa i.e. P. fontinalis, Physa acuta and P. gyrina water bodies of Central Punjab and were characterized on the basis of molecular markers High level of genetic diversity was revealed by polymorphic RAPD, however SSR markers were not amplified. The multivariate analysis revealed polymorphism ranging from 9.09 percent to 50 percent among the three Physid species. Total number of 79 loci were observed for the three species under study and 24 loci were observed to be polymorphic. These RAPD fragment(s) can be developed into co dominant markers (SCAR) by cloning and can be further sequenced for the development of the Physa species specific markers to identify the introduced and native species in Pakistan.


Os físidos pertencem à classe Gastropoda; pertencem ao filo Mollusca e, sendo bioindicadores, hospedeiros intermediários de parasitas e pragas, ocupam uma posição-chave no ecossistema. Existem três espécies do gênero Physa, ou seja, P. fontinalis, Physa acuta e P. gyrina em corpos d’água do Punjab Central e foram caracterizadas com base em marcadores moleculares. Alto nível de diversidade genética foi revelado por RAPD polimórfico, no entanto os marcadores SSR não foram amplificados. A análise multivariada revelou polimorfismo variando de 9,09% a 50% entre as três espécies de Physid. Um número total de 79 loci foi observado para as três espécies em estudo e 24 loci foram observados como polimórficos. Esses fragmentos RAPD podem ser desenvolvidos em marcadores codominantes (SCAR) por clonagem e podem ser posteriormente sequenciados para o desenvolvimento de marcadores específicos da espécie Physa para identificar as espécies introduzidas e nativas no Paquistão.


Assuntos
Animais , Moluscos/genética , Variação Genética
4.
Braz. J. Biol. ; 83: 1-8, 2023. mapas, ilus, tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-765444

Resumo

Physids belong to Class Gastropoda; belong to Phylum Mollusca and being bioindicators, intermediate hosts of parasites and pests hold a key position in the ecosystem. There are three species of Genus Physa i.e. P. fontinalis, Physa acuta and P. gyrina water bodies of Central Punjab and were characterized on the basis of molecular markers High level of genetic diversity was revealed by polymorphic RAPD, however SSR markers were not amplified. The multivariate analysis revealed polymorphism ranging from 9.09 percent to 50 percent among the three Physid species. Total number of 79 loci were observed for the three species under study and 24 loci were observed to be polymorphic. These RAPD fragment(s) can be developed into co dominant markers (SCAR) by cloning and can be further sequenced for the development of the Physa species specific markers to identify the introduced and native species in Pakistan.(AU)


Os físidos pertencem à classe Gastropoda; pertencem ao filo Mollusca e, sendo bioindicadores, hospedeiros intermediários de parasitas e pragas, ocupam uma posição-chave no ecossistema. Existem três espécies do gênero Physa, ou seja, P. fontinalis, Physa acuta e P. gyrina em corpos dágua do Punjab Central e foram caracterizadas com base em marcadores moleculares. Alto nível de diversidade genética foi revelado por RAPD polimórfico, no entanto os marcadores SSR não foram amplificados. A análise multivariada revelou polimorfismo variando de 9,09% a 50% entre as três espécies de Physid. Um número total de 79 loci foi observado para as três espécies em estudo e 24 loci foram observados como polimórficos. Esses fragmentos RAPD podem ser desenvolvidos em marcadores codominantes (SCAR) por clonagem e podem ser posteriormente sequenciados para o desenvolvimento de marcadores específicos da espécie Physa para identificar as espécies introduzidas e nativas no Paquistão.(AU)


Assuntos
Animais , Moluscos/genética , Variação Genética
5.
Pap. avulsos zool ; 63: e202363010, 2023. mapas, tab, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1424795

Resumo

Herein, we first report the comprehensive description of the terrestrial slug, Sarasinula plebeia (Gastropoda: Veronicellidae) by employing morphology, morpho­taxometrics and molecular analysis. A rapid survey on terrestrial slug inva­sive alien species (IAS) was conducted in La Dicha, Malangas, Zamboanga Sibugay, the Philippines. Obtained COI gene sequenc­es shared 100% similarities to S. plebeia from Brazil (JX532107, KM489378), Dominica (KM489500) and Vietnam (KM489367) and further supported using Bayesian analysis thus designated as S. plebeia isolate LDZS. Notably, the first reported S. plebe-ia in 2013 from Batan island, Batanes, northern Philippines, characterized through COI gene markers (JQ582277, JQ582278, JQ582279) showed 100% sequence similarities to a closely related veronicellid slug, Laevecaulisalte isolates (LC636101, LC636102, LC636103, and LC636104) from Japan. Taken this into account, our S. plebeia LDZS isolated from an agricultural field is the first report in the Philippines with combined diagnostic tools for the taxon.(AU)


Assuntos
Animais , Teorema de Bayes , Gastrópodes/anatomia & histologia , Gastrópodes/genética , Filipinas , Marcadores Genéticos , Espécies Introduzidas
6.
Rev. bras. zootec ; 52: e20220057, 2023. tab, graf, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1449866

Resumo

The objective of this study was to evaluate the effect of intronic single nucleotide polymorphisms (SNP) on temperament traits in a Brahman cattle population. The SNP located in CACNG4, EXOC4, NRXN3, and SLC9A4 candidate genes were genotyped in 250 animals with temperament records of exit velocity, pen score, and temperament score. Rs3423464051:G>A in the CACNG4 gene was associated with exit velocity and temperament score. An in silico analysis of the five intronic SNP showed that alternative alleles of CACNG4-rs3423464051, EXOC4-rs109393235, and SLC9A4-rs109722627 SNP could alter branch point sites during splicing, while a protein-protein interaction network analysis demonstrated a GRIA2 gene-mediated interaction between CACNG4 and NRXN3. The present results support previously reported evidence regarding bovine temperament-related candidate genes, particularly CACNG4, which is a confirmed candidate gene in need of more detailed analyses to reveal its role in temperament-related traits.(AU)


Assuntos
Animais , Comportamento Animal/fisiologia , Bovinos/genética , Polimorfismo de Nucleotídeo Único/genética , Temperamento , Marcadores Genéticos
7.
Braz. j. biol ; 83: e246984, 2023. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1285632

Resumo

Abstract Physids belong to Class Gastropoda; belong to Phylum Mollusca and being bioindicators, intermediate hosts of parasites and pests hold a key position in the ecosystem. There are three species of Genus Physa i.e. P. fontinalis, Physa acuta and P. gyrina water bodies of Central Punjab and were characterized on the basis of molecular markers High level of genetic diversity was revealed by polymorphic RAPD, however SSR markers were not amplified. The multivariate analysis revealed polymorphism ranging from 9.09 percent to 50 percent among the three Physid species. Total number of 79 loci were observed for the three species under study and 24 loci were observed to be polymorphic. These RAPD fragment(s) can be developed into co dominant markers (SCAR) by cloning and can be further sequenced for the development of the Physa species specific markers to identify the introduced and native species in Pakistan.


Resumo Os físidos pertencem à classe Gastropoda; pertencem ao filo Mollusca e, sendo bioindicadores, hospedeiros intermediários de parasitas e pragas, ocupam uma posição-chave no ecossistema. Existem três espécies do gênero Physa, ou seja, P. fontinalis, Physa acuta e P. gyrina em corpos d'água do Punjab Central e foram caracterizadas com base em marcadores moleculares. Alto nível de diversidade genética foi revelado por RAPD polimórfico, no entanto os marcadores SSR não foram amplificados. A análise multivariada revelou polimorfismo variando de 9,09% a 50% entre as três espécies de Physid. Um número total de 79 loci foi observado para as três espécies em estudo e 24 loci foram observados como polimórficos. Esses fragmentos RAPD podem ser desenvolvidos em marcadores codominantes (SCAR) por clonagem e podem ser posteriormente sequenciados para o desenvolvimento de marcadores específicos da espécie Physa para identificar as espécies introduzidas e nativas no Paquistão.


Assuntos
Animais , Gastrópodes , Espécies Introduzidas , Paquistão , Filogenia , Ecossistema , Técnica de Amplificação ao Acaso de DNA Polimórfico
8.
Neotrop. ichthyol ; 21(2): e220072, 2023. mapas, ilus, graf, tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1435606

Resumo

Pimelodus grosskopfii and Pimelodus yuma, two species endemic to the Magdalena-Cauca basin in Colombia, overlap in the ranges of some of their diagnostic characters, which hampers their correct morphological identification. Aiming to help discriminate these species, this study conducted an integrative analysis using traditional and geometric morphometrics, phylogenetic analysis based on partial sequences of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 gene (COI, cox1) and the identification of diagnostic Single Nucleotide Polymorphism markers (SNP). The species differ significantly in body geometry, allowing 100% discrimination, which was reinforced by a phylogenetic analysis that recovered well-supported monophyly of each species (posterior probability > 0.95). Additionally, the traditional morphometric results corroborated some previously reported diagnostic traits for both species and let us describe one non-overlapping ratio related to the adipose fin length. Three of five SNP markers had reciprocally exclusive alleles suitable for identifying each species. The morphometric and molecular methods conducted in this study constitute alternative tools for the correct discrimination of P. grosskopfii and P. yuma in the wild and in captive populations used for aquaculture.(AU)


Pimelodus grosskopfii y Pimelodus yuma, dos especies endémicas de la Cuenca Magdalena-Cauca en Colombia, se superponen en los rangos de variación de algunos de sus caracteres diagnósticos, lo que dificulta su correcta diferenciación morfológica. Con el objetivo de contribuir a la discriminación de estas especies, se realizó un análisis integrativo utilizando la morfometría geométrica y tradicional, análisis filogenético basado en secuencias parciales del gen mitocondrial citocromo c oxidasa subunidad I (COI, cox1) y la identificación de marcadores diagnósticos de polimorfismo de nucleótido único (SNP). Las especies difieren significativamente en la geometría del cuerpo, permitiendo una discriminación del 100%, lo que fue reforzado por un análisis filogenético que recuperó una monofilia bien soportada para cada especie (probabilidad posterior > 0,95). Además, los resultados de la morfometría tradicional corroboraron algunos rasgos diagnósticos previamente reportados para ambas especies y nos permitieron describir una proporción que no se sobrepone, relacionada con la longitud de la aleta adiposa. Tres de los cinco marcadores SNP poseían alelos recíprocamente exclusivos, adecuados para identificar cada especie. Los métodos morfométricos y moleculares implementados en este estudio constituyen herramientas alternativas para la correcta discriminación de P. grosskopfii y P. yuma tanto en la naturaleza como en poblaciones cautivas utilizadas para la acuicultura.(AU)


Assuntos
Animais , Filogenia , Peixes-Gato/anatomia & histologia , Polimorfismo de Nucleotídeo Único/genética , Complexo IV da Cadeia de Transporte de Elétrons/genética
9.
Neotrop. ichthyol ; 21(2): e230032, 2023. mapas, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1434061

Resumo

Molecular tools have been employed to improve the knowledge about freshwater Neotropical fishes. Such approaches supporting studies of groups including species complexes such as Astyanax, one of the most diversified and taxonomically complex genus of the family Characidae. Here, we employed species delimitation analyses in four Astyanax species described for the upper Paraguaçu River basin, a drainage within Northeastern Mata Atlântica freshwater ecoregion with high endemism. We implemented single and multilocus approaches based on two mitochondrial and one nuclear markers. Cytochrome c Oxidase I sequences previously available for Astyanax species were also added to our dataset. The single locus analyses showed A. epiagos, A. rupestris, and A. aff. rupestris as different Molecular Operational Taxonomic Units (MOTUs), while A. brucutu and A. lorien were grouped. However, the multilocus approach distinguished these two species and showed congruence for the remaining single locus results. Astyanax aff. rupestris was separated into two MOTUs using both approaches, highlighting the need for an integrative taxonomic revision including A. aff. rupestris. These findings contribute to a better understanding of the diversity of this fish group in the upper Paraguaçu, identifying hidden diversity and reinforcing the relevance of this hydrographic system as a notable hotspot for ichthyofauna biodiversity endemism.(AU)


Ferramentas moleculares têm sido empregadas para melhorar o conhecimento sobre os peixes Neotropicais. Tais abordagens apoiam estudos de grupos que incluem complexos de espécies, como Astyanax, um dos gêneros mais diversificados e taxonomicamente complexos dentro da família Characidae. Neste estudo, nós empregamos análises de delimitação de espécies em quatro espécies de Astyanax recentemente descritas da bacia do alto rio Paraguaçu, uma drenagem dentro da ecorregião Mata Atlântica Nordeste que apresenta alto endemismo. Nós realizamos abordagens de loco único e multilocos baseadas em dois marcadores mitocondriais e um nuclear. Sequências de Citocromo c Oxidase I anteriormente disponíveis para espécies de Astyanax foram adicionadas ao nosso conjunto de dados. As análises de loco único mostraram A. epiagos, A. rupestris e A. aff. rupestris como diferentes Unidades Taxonômicas Operacionais Moleculares (MOTUs), enquanto A. brucutu e A. lorien foram agrupadas. Entretanto, a abordagem multilocos distinguiu estas duas espécies e mostrou congruência com os demais resultados das análises de loco único. Astyanax aff. rupestris foi separada em duas MOTUs usando ambas as abordagens, sugerindo a necessidade de uma revisão taxonômica integrativa incluindo A. rupestris e ambas A. aff. rupestris. Esses achados contribuem para uma melhor compreensão da diversidade desse grupo de peixes na bacia do rio Paraguaçu, identificando diversidade oculta e reforçando a relevância desse sistema hidrográfico como um notável hotspot de endemismo da biodiversidade da ictiofauna.(AU)


Assuntos
Animais , Doenças Endêmicas/veterinária , Characidae/genética , Variação Genética , Biodiversidade
10.
Rev. bras. reprod. anim ; 47(3): 524-529, jul.-set. 2023. tab
Artigo em Português | VETINDEX | ID: biblio-1436653

Resumo

A presente revisão propôs analisar quais características são desejáveis para seleção de reprodutores caprinos e ovinos, visando à produção de sêmen. A escolha dos reprodutores deve ser feita de acordo com os padrões exigidos da raça, além da higidez reprodutiva dos animais. Biotecnologias reprodutivas oferecem oportunidades consideráveis para a produção animal, como a inseminação artificial, transferência de embriões e congelamento de sêmen. Análises da produção de espermatozoides são de grande importância, pois está diretamente relacionada com a atividade sexual. A genética do criatório é um fator crítico que influencia o resultado final e a saúde animal. A utilização de marcadores moleculares é uma ferramenta que temos para selecionar características desejáveis em uma prole, através da identificação de biomarcadores. Técnicas de genética molecular potencializam o efeito de biotécnicas reprodutivas e consequentemente a lucratividade da pecuária intensiva.(AU)


The present review proposed to analyze which characteristics are desirable for the selection of goat and sheep breeders, aiming at the production of semen. The choice of breeders must be made in accordance with the standards required for the breed, in addition to the reproductive health of the animals. Reproductive biotechnologies offer considerable opportunities for animal production, such as artificial insemination, embryo transfer and semen freezing. Analyzes of sperm production are of great importance, as it is directly related to sexual activity. Farm genetics is a critical factor that influences the end result and animal health. The use of molecular markers is a tool that we have to select desirable characteristics in an offspring, through the identification of biomarkers. Molecular genetic techniques enhance the effect of reproductive biotechniques and consequently the profitability of intensive livestock farming.(AU)


Assuntos
Animais , Masculino , Ruminantes/fisiologia , Análise do Sêmen , Biotecnologia , Fertilidade/genética
11.
Semina ciênc. agrar ; 44(2): 601-612, mar.-abr. 2023. ilus, tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1434497

Resumo

Wheat leaf rust (Puccinia triticina Eriks.), a devastating disease of wheat in the world, causes severe yield losses and therefore the development of resistant cultivars is very important. Here, a Chinese wheat line (Guinong08-6) showed adult-plant resistance against mixed fungal isolates of leaf rust, which is common in Guiyang region. It was crossed with a susceptible wheat line (Guinong19) to develop F1, F2, and F3 hybrids. Combined SSR and STS markers were used to map leaf rust resistance genes in Guinong08-6, and the resistance phenotype of Guinong08-6 was co-regulated by two complementary dominant genes, named LrGn08-6A and LrGn08-6B. LrGn08-6A was mapped to chromosome 2AS with markers URIC-LN2 and Xgpw2204, which flanked the gene at distances of 1.8 centimorgan (cM) and 14.83 cM, respectively. LrGn08-6B was mapped to chromosome 4DL with markers Xgpw342 and Xbarc93, which both flanked the gene at a distance of 26.57 cM. Genetic and molecular marker analyses demonstrated that LrGn08-6A, which was inherited from Aegilops ventricosa may be the resistance gene Lr37, while LrGn08-6B may be a newly discovered leaf rust resistance gene.(AU)


A ferrugem da folha do trigo (Puccinia triticina Eriks.), importante doença do trigo em todo o mundo, causa graves perdas de rendimento e, portanto, o desenvolvimento de cultivares resistentes é muito importante. Nesta pesquisa, uma linhagem chinesa de trigo (Guinong08-6) mostrou resistência de plantas adultas a uma mistura de isolados do patógeno, na região de Guiyang, China. Essa linhagem foi cruzada com uma linhagem suscetível de trigo (Guinong19) para desenvolver híbridos F1, F2 e F3. Combinados de marcadores SSR e STS foram usados para mapear genes de resistência à ferrugem da folha em Guinong08-6, e o fenótipo de resistência de Guinong08-6 foi co-regulado por dois genes dominantes complementares, chamados LrGn08-6A e LrGn08-6B. LrGn08-6A foi mapeado para o cromossomo 2AS com marcadores URIC-LN2 e Xgpw2204, que flanquearam o gene em distâncias de 1,8 centimorgano (cM) e 14,83 cM, respectivamente. LrGn08-6B foi mapeado para o cromossomo 4DL com marcadores Xgpw342 e Xbarc93, e ambos flanquearam o gene a uma distância de 26,57 cM. As análises genéticas e moleculares de marcadores demonstraram que LrGn08-6A, que foi herdado de Aegilops ventricosa, pode ser o gene de resistência Lr37, enquanto LrGn08-6B pode ser um gene recentemente descoberto de resistência à ferrugem da folha do trigo.(AU)


Assuntos
Triticum/genética , Genes Dominantes , China , Aegilops/química , Puccinia/química
12.
Acta sci. vet. (Impr.) ; 51: Pub. 1923, 2023. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1444000

Resumo

Background: Anaplasmosis, also called gall sickness or tropical bovine ehrlichiosis, is an infectious disease caused by species belonging to the genus Anaplasma in domestic and wild animals in tropical and subtropical regions. Anaplasma ovis and A. phagocytophilum are important pathogens of sheep. A. ovis is considered the most common species affecting sheep. The infection is usually subclinical and progresses with high fever, anaemia, icterus, weight loss and abortions. This study aimed to investigate changes in cardiac damage markers, oxidative stress and antioxidant status, cytokines, and acute phase proteins in sheep naturally infected with A. ovis. Materials, Methods & Results: For this purpose, a total of 40 animals, including 20 healthy sheep and 20 sheep infected with anaplasmosis, were used. A. ovis was diagnosed based on clinical findings and peripheral blood smear. Blood smears were prepared from the ear vein. The smears were stained with Giemsa and examined for the presence of Anaplasma spp. Infection was also confirmed by polymerase chain reaction (PCR) analysis. The genomic DNA was isolated from blood, and the MSP-4 gene region was amplified as A. ovis specific target gene. Twenty clinically healthy sheep of the same age group, reared under the same conditions and testing negative in the molecular assessment were used as controls. Blood samples were collected from the cephalic vein and and centrifuged to obtain serum. The serum stored at -20°C until the analysis stage. Serum samples were used for the analysis of cardiac damage markers [troponin I (cTnI), creatine kinase MB (CK-MB), lactate dehydrogenase (LDH) and aspartate transaminase (AST)], oxidative stress parameters [malondialdehyde (MDA), total antioxidant status (TAS), superoxide dismutase (SOD), catalase (CAT) and glutathione peroxidase (GPx)], cytokines [interleukins IL-6, IL-1ß and IL-10, tumour necrosis factor α (TNF-α), and interferon-γ (IFN-γ)] and acute phase proteins [C-reactive protein (CRP), serum amyloid A (SAA) and haptoglobin (Hp)]. cTnI and CK-MB levels were measured using a chemiluminescent immunoassay. MDA, TAS, SOD, CAT, GPx, TNF-α, IL-1ß, IL-6, IL-10, IFN-γ, SAA and Hp levels were measured by an ELISA reader. LDH, AST and CRP levels were measured in an autoanalyzer. cTnI and LDH levels were significantly increased in the infected animals compared to the healthy ones (P < 0.05). The concentration of AST was decreased in infected animals. MDA, TAS, SOD, CAT and GPx levels were significantly increased in the infected animals compared to the healthy ones (P < 0.05). The levels of the inflammatory parameters such as TNF-α, IL-1ß, IL-10 and IFN-γ were significantly increased in the infected animals compared to the healthy ones (P < 0.05). Hp level were significantly increased in the infected group compared with the control group (P < 0.05). However, there was no significant change in CK-MB, SAA and CRP concentrations in the infected animals (P > 0.05). Discussion: Ovine anaplasmosis is an obligate intracellular arthropod disease that causes widespread changes in haematobiochemical, immune response and oxidative stress parameters. Cardiac damage is often overlooked in field conditions due to the lack of adequate knowledge about the pathophysiology of the disease. Our results showed that A. ovis infection leads to significant changes in cardiac biomarkers and that the parasite can cause cardiac dysfunction. This is the first report on cardiac damage markers in Anaplasma-infected sheep. Additionally, the levels of proinflammatory and oxidative stress markers that may cause functional disorders were also found to be increased. Thus, measuring markers of cardiac function, oxidative stress and inflammation can be a useful tool in the early diagnosis of ovine anaplasmosis.


Assuntos
Animais , Ovinos , Citocinas/análise , Estresse Oxidativo , Anaplasma ovis/isolamento & purificação , Testes de Função Cardíaca/veterinária , Anaplasmose/diagnóstico , Proteínas de Fase Aguda/análise
13.
Acta sci., Biol. sci ; 45: e64296, 2023. mapas, tab, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1509482

Resumo

Infectious diseases caused by microorganisms are widespread health risks associated with drinking water. This study evaluated the physicochemical parameters and bacteriological quality of the stream and well water using standard protocols. The bacteria were identified by conventional and molecular methods. Antibiotic susceptibility and location of antibiotic resistance markers (ARMs) were determined using disc diffusion and acridine orange, respectively. The highest mean Total Heterotrophic Bacterial Counts (THBC), Total Coliform Counts (TCC) and Faecal Coliform Counts (FCC) from the stream water was 4.3 ± 0.3×106, 8.9 ± 0.0×105, and 3.5 ± 0.1×104 (CFU mL-1), respectively. The well water had mean TCC ranging between 2.8 ± 0.0×103 and 2.1 ± 0.1×104 (CFU mL-1). Six bacterial genera: Staphyloccocus, Pseudomonas, Escherichia, Enterobacter, Klebsiella, and Shigella were isolated. The mean temperature of the water ranged from 26.0 ± 0.3oC to 27.0 ± 0.1oC. The highest mean dissolved oxygen, total hardness, sulphate and magnesium was 24.0 ± 1.0, 40.1 ± 0.8, 11.0± 1.0, and 67.0 ± 1.5 (mg L-1), respectively. The results showed that ≥ 66.7 S. aureus were Levofloxacin and Streptomycin sensitive; between 45.5 and 68.1% of the isolates were Gentamycin and Chloramphenicol resistant, while 81.8% exhibited multidrug resistance. Escherichia coli EcSW3, E. aerogenes EeWW2, K. pneumoniae KpSW3, and S. aureus SaSW had their entire ARMs located on the plasmids with the molecular sizes ˂ 2.027 Kbp. This study showed that the stream and well water harboured bacteria with some ARMs on plasmids, indicating the possibility of horizontal transfer of antibiotic-resistant genes among the bacteria. In addition, it showed the necessity to enlighten the rural populace on the importance of cleaning the surroundings near water sources so as to prevent water-borne diseases.(AU)


Assuntos
Plasmídeos/análise , Microbiologia da Água , Rios/química , População Rural , Nigéria
14.
Neotrop. ichthyol ; 20(2): e210147, 2022. mapas, ilus, tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1380538

Resumo

This study aimed to identify species of Astyanax bimaculatus group from four Itaipu Reservoir tributaries (Paraná River Basin) by cytogenetics and molecular markers (COI) to investigate the possible occurrence of cryptic diversity in part of this basin. The four populations showed only one karyotype formula and simple AgNORs. FISH with 18S rDNA probe showed a high variation, and 5S rDNA probes evidenced simple sites in most of the specimens, although multiple sites are present in two specimens. The variations of 5S and 18S cistrons generated 13 cytotypes. The molecular data did not reveal cryptic diversity in the populations; however, its grouping with 82 sequences from other stretches of the Paraná River Basin originated three haplogroups (distances of 3.12% and 8.82%) and 33 haplotypes were identified. DNA Barcode suggests that cytogenetic variations represent a high polymorphism degree, and it identified the analyzed specimens as Astyanax lacustris, which confirms the morphological identification. Our data suggest that the cryptic diversity of this group in the tributaries of the Paraná River Basin is different than the proposed by the synonymizations of A. altiparanae and A. asuncionensis to A. lacustris. This study reinforces the importance of integrative cytogenetics and molecular methods for taxonomy.(AU)


Este trabalho teve como objetivo identificar espécies do complexo Astyanax bimaculatus de quatro afluentes do reservatório de Itaipu (bacia do Rio Paraná) por métodos citogenéticos e moleculares (COI), investigando a possibilidade de ocorrência de diversidade críptica em parte desta bacia. As quatro populações apresentaram apenas uma fórmula cariotípica e AgNORs simples. A FISH com rDNA 18S apresentou alto grau de variação e as sondas de rDNA 5S evidenciaram sítios simples na maioria dos exemplares, embora sítios múltiplos tenham sido evidenciados em dois espécimes. As variações dos cistrons 5S e 18S geraram 13 citótipos. Os dados moleculares não revelaram diversidade críptica nas populações, entretanto, seu agrupamento com 82 sequências de outros trechos da mesma bacia formou três haplogrupos (distâncias de 3,12% e 8,82%) e gerou 33 haplótipos. O DNA Barcode sugere que as variações citogenéticas representam um alto grau de polimorfismo e identificou os espécimes analisados como Astyanax lacustris, confirmando a identificação por caracteres morfológicos. Nossos dados sugerem que a diversidade críptica do grupo nos afluentes da bacia do Rio Paraná é diferente do proposto pelas sinonimizações de A. altiparanae e A. asuncionensis para A. lacustris, reforçando a importância da integração de métodos citogenéticos e moleculares para a taxonomia.(AU)


Assuntos
Animais , Polimorfismo Genético , Biomarcadores , Characidae/classificação , Characidae/genética , Variação Genética , DNA Ribossômico/análise , Análise Citogenética/veterinária
15.
Anim. Reprod. (Online) ; 19(1): e20220004, 2022. ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1367896

Resumo

Prediction of bull fertility is critical for the sustainability of both dairy and beef cattle production. Even though bulls produce ample amounts of sperm with normal parameters, some bulls may still suffer from subpar fertility. This causes major economic losses in the cattle industry because using artificial insemination, semen from one single bull can be used to inseminate hundreds of thousands of cows. Although there are several traditional methods to estimate bull fertility, such methods are not sufficient to explain and accurately predict the subfertility of individual bulls. Since fertility is a complex trait influenced by a number of factors including genetics, epigenetics, and environment, there is an urgent need for a comprehensive methodological approach to clarify uncertainty in male subfertility. The present review focuses on molecular and functional signatures of bull sperm associated with fertility. Potential roles of functional genomics (proteome, small noncoding RNAs, lipidome, metabolome) on determining male fertility and its potential as a fertility biomarker are discussed. This review provides a better understanding of the molecular signatures of viable and fertile sperm cells and their potential to be used as fertility biomarkers. This information will help uncover the underlying reasons for idiopathic subfertility.(AU)


Assuntos
Animais , Masculino , Bovinos , Sêmen , Inseminação Artificial , Biomarcadores , Genômica , Fertilidade , Proteoma
16.
Braz. j. biol ; 82: e260394, 2022. tab, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1384047

Resumo

Dendrobium nobile Lindl. is an orcid plant with important medicinal values. This is a colourful houseplant, and also a popular herb in traditional Chinese medicine (TCM). The variants of this plant from different geographic regions might be high, and in this study, we aimed to develop specific sequence characterized amplified region (SCAR) markers for the identification of specific variant of this plant. Different cultivars of D. nobile were collected from nine different places of China, and one cultivar from Myanmar. DNA materials were extracted from the plant samples, random amplified polymorphic DNA (RAPD) were developed, cloned and sequenced for the development of SCAR markers. We have developed four SCAR markers, which are specific to the cultivar from Luzhou China, and clearly distinguishable (genetically) from other cultivars. These SCAR markers are deposited in GenBank (accession number MZ417502, MZ484089, MZ417504 and MZ417505). Four SCAR markers for D. nobile are effective molecular technique to genetically identify the different cultivars or species, and this method is applicable for genetic characterization and identification of other plant species too.


Dendrobium nobile Lindl. é uma orquídea com importantes valores medicinais. Esta é uma colorida planta doméstica e também uma erva popular na Medicina Tradicional Chinesa (MTC). As variantes desta planta de diferentes regiões geográficas podem ser altas, e neste estudo, nosso objetivo foi desenvolver marcadores de região amplificada de sequência caracterizada (in English, Sequence Characterized Amplified Region (SCAR)) para a identificação de variante específica desta planta. Diferentes cultivares de D. nobile foram coletadas de nove locais diferentes da China e uma cultivar de Mianmar. Materiais de DNA foram extraídos das amostras de plantas, em que a Amplificação Aleatória de DNA Polimórfico (in English, Random Amplified Polymorphism DNA (RAPD)) foi desenvolvida, clonada e sequenciada para o desenvolvimento de marcadores SCAR. Desenvolvemos quatro marcadores SCAR, que são específicos para a cultivar de Luzhou na China e claramente distinguíveis (geneticamente) de outras cultivares. Esses marcadores SCAR estão depositados no GenBank (números de acesso MZ417502, MZ484089, MZ417504 e MZ417505). Quatro marcadores SCAR para D. nobile compreendem técnicas moleculares eficazes para identificar geneticamente as diferentes cultivares ou espécies, e este método é aplicável para caracterização genética e identificação de outras espécies de plantas também.


Assuntos
Marcadores Genéticos , Orchidaceae , Dendrobium/genética
17.
Neotrop. ichthyol ; 20(3): e220017, 2022. tab, ilus, mapas
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1394489

Resumo

A new species of Cyphocharax is described from the Upper Paraíba do Sul River basin, São Paulo, Brazil based on integrated morphological and molecular delimitation criteria. It is morphologically distinguished from its congeners by the presence of a round, dark blotch at the midlength of the caudal peduncle not extending to the proximal portions of the median caudal-fin rays, 19-20 circumpeduncular scales, 34-41 perforated lateral-line scales, 6-7 longitudinal scale rows above and below the lateral line, greatest body depth corresponding to 34.7-39.9% of standard length (SL), and the caudal peduncle depth corresponding to 13.3-15.2% of SL. The lowest genetic distances between the new species and other congeners are: 2.5% from C. gilbert, followed by 3.0% from C. santacatarinae, and 3.2% from C. aff. gilbert. All species delimitation criteria employed herein corroborated the recognition of the new species. In addition, comments on its conservation status are provided.(AU)


Uma nova espécie de Cyphocharax é descrita do alto rio Paraíba do Sul, São Paulo, Brasil, baseada em dados morfológicos e moleculares integrados. A espécie se distingue morfologicamente de seus congêneres por: apresentar uma mancha escura arredondada na porção média do pedúnculo caudal, não se estendendo à porção proximal dos raios medianos da nadadeira caudal, 19-20 escamas circunpedunculares, 34-41 escamas perfuradas na linha lateral, 6-7 escamas acima e abaixo da linha lateral, altura do corpo correspondendo à 34,7-39,9% do comprimento padrão (CP), e a altura do pedúnculo caudal correspondendo a 13,3-15,2% do CP. As menores distâncias genéticas entre a espécie nova e outras congêneres são: 2,5% de C gilbert, seguida de 3,0% de C. santacatarinae, e 3,2% de C. aff. gilbert. Todos os critérios de delimitação de espécies aqui empregados corroboraram o reconhecimento da nova espécie. Adicionalmente, comentários sobre seu estado de conservação são fornecidos.(AU)


Assuntos
Animais , Filogenia , Caraciformes/classificação , Caraciformes/genética , Brasil , Biomarcadores/análise
18.
Acta sci., Anim. sci ; 44: e52657, 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1390625

Resumo

With the rise of world fish farming, the national scenario is favorable for using native fish for intensive farming. Among the catfish, the Amazonian Jundiá (Leiarius marmoratus) is a robust candidate, easy to grow and with good organoleptic characteristics in its flesh. For productive success in captivity, it is necessary to consider some questions about the species, such as genetic variability, which must have an acceptable level in a breeding stock, in order to maintain a good diversity; this reduces losses due to inbreeding and low diversity. Therefore, the objective of this study was to characterize the genetic variability of commercial stocks of L. marmoratus from the State of Mato Grosso through microsatellite molecular markers. We analyzed 143 individuals from three stocks. The mean heterozygosity and the inbreeding coefficients observed were 0.060; 0.084; 0.141; and 0.539; 0.562; 0.514, respectively, for the stocks of Campo Verde, Juína, and Nova Mutum. The Deviation in the Hardy-Weinberg equilibrium was observed in most of the loci in the three populations. Considering the genetic differentiation, it is concluded that the three populations are very close genetically, which requires introduction of new genetic material in the stocks to enrich them genetically for a later reproductive program.(AU)


Assuntos
Animais , Variação Genética , Peixes-Gato/genética , Marcadores Genéticos , Pesqueiros
19.
Braz. j. biol ; 82: 1-9, 2022. tab, ilus
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1468513

Resumo

Molecular based identification of bat fauna in Pakistan has been relatively less explored. The current study was therefore planned to report for the first time the molecular classification of insectivorous bats (Pipistrellus coromandra) based on mitochondrion gene (COI) from Punjab, Pakistan. Specimens were collected from five different locations followed by DNA extraction with subsequent gene amplification and sequencing. All samples in the study had shown close identity matches with species (Pipistrellus coromandra) from India and (Pipistrellus tenuis) from Vietnam with percentage identity score of 96.11 and 95.58 respectively except one sequence which only revealed 86.78% identity match on Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) and could only be assigned to genus level Pipistrellus sp. The results indicated negligible intra-population genetic distance among collected samples whereas the comparison with species from other countries had shown high intraspecific (P. coromandra) and interspecific (P. tenuis) mean genetic distances. The current study hence successfully proved the efficiency of COI gene as a molecular marker for species identification and in analyzing the patterns of genetic variation with species from other countries.


A identificação com base molecular da fauna de morcegos no Paquistão tem sido relativamente menos explorada. Portanto, o estudo atual foi planejado para relatar pela primeira vez a classificação molecular de morcegos insetívoros (Pipistrellus coromandra) com base no gene da mitocôndria (COI) de Punjab, Paquistão. As amostras foram coletadas em cinco locais diferentes, seguidas pela extração de DNA com subsequente amplificação e sequenciamento do gene. Todas as amostras no estudo mostraram coincidências de identidade próximas com espécies (Pipistrellus coromandra) da Índia e (Pipistrellus tenuis) do Vietnã, com pontuação de identidade percentual de 96,11 e 95,58, respectivamente, exceto uma sequência que revelou apenas 86,78% de correspondência de identidade na Ferramenta de Pesquisa de Alinhamento Local Básico (BLAST), a qual só poderia ser atribuída ao nível de gênero Pipistrellus sp. Os resultados indicaram distância genética intrapopulacional desprezível entre as amostras coletadas, enquanto a comparação com espécies de outros países mostrou altas distâncias genéticas intraespecíficas (P. coromandra) e interespecíficas (P. tenuis) médias. O presente estudo, portanto, comprovou com sucesso a eficiência do gene COI como marcador molecular para identificação de espécies e análise dos padrões de variação genética com espécies de outros países.


Assuntos
Animais , Mapeamento Cromossômico/veterinária , Quirópteros/genética , Marcadores Genéticos
20.
Braz. J. Biol. ; 82: 1-9, 2022. tab, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-32754

Resumo

Molecular based identification of bat fauna in Pakistan has been relatively less explored. The current study was therefore planned to report for the first time the molecular classification of insectivorous bats (Pipistrellus coromandra) based on mitochondrion gene (COI) from Punjab, Pakistan. Specimens were collected from five different locations followed by DNA extraction with subsequent gene amplification and sequencing. All samples in the study had shown close identity matches with species (Pipistrellus coromandra) from India and (Pipistrellus tenuis) from Vietnam with percentage identity score of 96.11 and 95.58 respectively except one sequence which only revealed 86.78% identity match on Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) and could only be assigned to genus level Pipistrellus sp. The results indicated negligible intra-population genetic distance among collected samples whereas the comparison with species from other countries had shown high intraspecific (P. coromandra) and interspecific (P. tenuis) mean genetic distances. The current study hence successfully proved the efficiency of COI gene as a molecular marker for species identification and in analyzing the patterns of genetic variation with species from other countries.(AU)


A identificação com base molecular da fauna de morcegos no Paquistão tem sido relativamente menos explorada. Portanto, o estudo atual foi planejado para relatar pela primeira vez a classificação molecular de morcegos insetívoros (Pipistrellus coromandra) com base no gene da mitocôndria (COI) de Punjab, Paquistão. As amostras foram coletadas em cinco locais diferentes, seguidas pela extração de DNA com subsequente amplificação e sequenciamento do gene. Todas as amostras no estudo mostraram coincidências de identidade próximas com espécies (Pipistrellus coromandra) da Índia e (Pipistrellus tenuis) do Vietnã, com pontuação de identidade percentual de 96,11 e 95,58, respectivamente, exceto uma sequência que revelou apenas 86,78% de correspondência de identidade na Ferramenta de Pesquisa de Alinhamento Local Básico (BLAST), a qual só poderia ser atribuída ao nível de gênero Pipistrellus sp. Os resultados indicaram distância genética intrapopulacional desprezível entre as amostras coletadas, enquanto a comparação com espécies de outros países mostrou altas distâncias genéticas intraespecíficas (P. coromandra) e interespecíficas (P. tenuis) médias. O presente estudo, portanto, comprovou com sucesso a eficiência do gene COI como marcador molecular para identificação de espécies e análise dos padrões de variação genética com espécies de outros países.(AU)


Assuntos
Animais , Mapeamento Cromossômico/veterinária , Quirópteros/genética , Marcadores Genéticos
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